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A mutation in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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ATATGAATGGTTCAAAGTAAAAAAAATAGAGTAAAATTGCACTATCAGGAAAAATAATTGTTATATTTAATGAACAAAAACTCAATCCTTCTCCATGTAGGGTGAACCTGGTGCCCCTGGTGAAAATGGAACTCCAGGTCAAACAGTAAGTATTGACTACTTCATTGTAAATTTAAATGTGTACACTCTTTATGAGATGGAACTTCTTTAATGTTTTTGCTAATCACTGTATCCTTCAGCATTGTATTCTTTGATGTTTTTCTAATAGCCTTCTGATACTTAATTGAAATCCACTACTGTTTAGTTGGAATTAGAAGGCAACTTATTTATTTTTAGTGTATTCTTGTACAGGTTGGAAACTGAACAAAGCAAATGATGCCTGTGACTTTTTTTAAATTAGCATTCTGGATTTTATTGAAAATATTTCTGCTTCTAGGGAGCCCGTGGGCTTCCTGGTGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGA
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ATATGAATGGTTCAAAGTAAAAAAAATAGAGTAAAATTGCACTATCAGGAAAAATAATTGTTATATTTAATGAACAAAAACTCAATCCTTCTCCATGTAGGGTGAACCTGGTGCCCCTGGTGAAAATGGAACTCCAGGTCAAACAGTAAGTATTGACTACTTCATTGTAAATTTAAATGTGTACACTCTTTATGAGATGGAACTTCTTTAATGTTTTTGCTAATCACTGTATCCTTCAGCATTGTATTCTTTGATGTTTTTCTAATAGCCTTCTGATACTTAATTGAAATCCACTACTGTTTAGTTGGAATTAGAAGGCAACTTATTTATTTTTAGTGTATTCTTGTACAGGTTGGAAACTGAACAAAGCAAATGATGCCTGTGACTTTTTTTAAATTAGCATTCTGGATTTTATTGAAAATATTTCTGCTTCTAGGGAGCCCGTGGGCTTCCTGGTGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCAGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGA
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Task1_train_11501
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Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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ATATGAATGGTTCAAAGTAAAAAAAATAGAGTAAAATTGCACTATCAGGAAAAATAATTGTTATATTTAATGAACAAAAACTCAATCCTTCTCCATGTAGGGTGAACCTGGTGCCCCTGGTGAAAATGGAACTCCAGGTCAAACAGTAAGTATTGACTACTTCATTGTAAATTTAAATGTGTACACTCTTTATGAGATGGAACTTCTTTAATGTTTTTGCTAATCACTGTATCCTTCAGCATTGTATTCTTTGATGTTTTTCTAATAGCCTTCTGATACTTAATTGAAATCCACTACTGTTTAGTTGGAATTAGAAGGCAACTTATTTATTTTTAGTGTATTCTTGTACAGGTTGGAAACTGAACAAAGCAAATGATGCCTGTGACTTTTTTTAAATTAGCATTCTGGATTTTATTGAAAATATTTCTGCTTCTAGGGAGCCCGTGGGCTTCCTGGTGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGA
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Task1_train_11502
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Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11503
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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ATATGAATGGTTCAAAGTAAAAAAAATAGAGTAAAATTGCACTATCAGGAAAAATAATTGTTATATTTAATGAACAAAAACTCAATCCTTCTCCATGTAGGGTGAACCTGGTGCCCCTGGTGAAAATGGAACTCCAGGTCAAACAGTAAGTATTGACTACTTCATTGTAAATTTAAATGTGTACACTCTTTATGAGATGGAACTTCTTTAATGTTTTTGCTAATCACTGTATCCTTCAGCATTGTATTCTTTGATGTTTTTCTAATAGCCTTCTGATACTTAATTGAAATCCACTACTGTTTAGTTGGAATTAGAAGGCAACTTATTTATTTTTAGTGTATTCTTGTACAGGTTGGAAACTGAACAAAGCAAATGATGCCTGTGACTTTTTTTAAATTAGCATTCTGGATTTTATTGAAAATATTTCTGCTTCTAGGGAGCCCGTGGGCTTCCTGGTGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGA
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Task1_train_11504
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A mutation found in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11505
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A sequence alteration has been identified in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it disease-inducing or harmless?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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TATGAATGGTTCAAAGTAAAAAAAATAGAGTAAAATTGCACTATCAGGAAAAATAATTGTTATATTTAATGAACAAAAACTCAATCCTTCTCCATGTAGGGTGAACCTGGTGCCCCTGGTGAAAATGGAACTCCAGGTCAAACAGTAAGTATTGACTACTTCATTGTAAATTTAAATGTGTACACTCTTTATGAGATGGAACTTCTTTAATGTTTTTGCTAATCACTGTATCCTTCAGCATTGTATTCTTTGATGTTTTTCTAATAGCCTTCTGATACTTAATTGAAATCCACTACTGTTTAGTTGGAATTAGAAGGCAACTTATTTATTTTTAGTGTATTCTTGTACAGGTTGGAAACTGAACAAAGCAAATGATGCCTGTGACTTTTTTTAAATTAGCATTCTGGATTTTATTGAAAATATTTCTGCTTCTAGGGAGCCCGTGGGCTTCCTGGTGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGAT
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Task1_train_11506
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Consider this mutation in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this a benign change or a disease-causing variant?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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Task1_train_11507
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Consider this mutation in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this a benign change or a disease-causing variant?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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TGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAA
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Task1_train_11508
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Given this variant in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11509
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This mutation occurs in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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TGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAA
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Task1_train_11510
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Here is a variant affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11511
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), on Chromosome 7, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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TGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAA
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Task1_train_11512
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Given this variant in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11513
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An alteration has been detected in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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ACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCA
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Task1_train_11514
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Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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ACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCA
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ACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTAGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCA
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Task1_train_11515
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A sequence alteration has been identified in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it disease-inducing or harmless?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11516
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Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11517
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This genomic variant is located on Chromosome 7, within the COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11518
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Given this variant in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11519
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This gene mutation involves COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11520
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A variant affecting Chromosome 7, within the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11521
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Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11522
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This is a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Combined osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome 2
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11523
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Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
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Pathogenic; Osteoporosis
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11524
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A variant on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11525
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Here’s a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11526
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11527
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This mutation occurs in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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GTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAG
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Task1_train_11528
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This alteration in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2
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Task1_train_11529
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This sequence variant lies in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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GTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAG
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Task1_train_11530
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This alteration in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
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Pathogenic; not provided
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Task1_train_11531
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This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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ACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCAT
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Task1_train_11532
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This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11533
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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GGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTT
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Task1_train_11534
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Here’s a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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Task1_train_11535
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This sequence variant lies in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
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Pathogenic; Combined osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome 2
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GGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTT
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Task1_train_11536
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Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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GGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGTTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTT
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Task1_train_11537
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This genomic variant is located on Chromosome 7, within the COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type
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GGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTT
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Task1_train_11538
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This variant affects the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) found on Chromosome 7. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2
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Task1_train_11539
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This variant lies on Chromosome 7 and affects the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; Osteoporosis
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GGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTT
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Task1_train_11540
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A variant has been detected on Chromosome 7 in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11541
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This is a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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GGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTT
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Task1_train_11542
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This sequence variant lies in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
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Pathogenic; Osteoporosis
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Task1_train_11543
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Mutation context: Chromosome 7, Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2
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AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
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Task1_train_11544
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Consider a variant on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine its clinical classification and disease relevance.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11545
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Located on Chromosome 7, this mutation impacts COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
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Task1_train_11546
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A genetic alteration is present in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type
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Task1_train_11547
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An alteration has been detected in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; Combined osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome 2
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AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
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Task1_train_11548
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A variant affecting Chromosome 7, within the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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Task1_train_11549
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A mutation found in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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GTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATC
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Task1_train_11550
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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GTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAAGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATC
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Task1_train_11551
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The variant affects gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), which is on Chromosome 7. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; not provided
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GTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTG
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Task1_train_11552
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Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11553
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Here is a mutation in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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GTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTG
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Task1_train_11554
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Mutation context: Chromosome 7, Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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Task1_train_11555
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An alteration has been detected in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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TTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAG
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Task1_train_11556
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Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), found on Chromosome 7, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11557
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With a mutation on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11558
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A mutation on Chromosome 7 affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta
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Task1_train_11559
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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TACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTT
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Task1_train_11560
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11561
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Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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AAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAG
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Task1_train_11562
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This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; not provided
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Task1_train_11563
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This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Task1_train_11564
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This mutation is located in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11565
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A mutation on Chromosome 7 affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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TCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGT
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Task1_train_11566
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Mutation context: Chromosome 7, Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type
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GGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGAAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAG
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Task1_train_11567
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A genomic change on Chromosome 7 affects COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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GGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAG
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Task1_train_11568
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A variant affecting Chromosome 7, within the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11569
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Assess the clinical impact of this variant on gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), found on Chromosome 7. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; not provided
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AGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCA
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Task1_train_11570
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A variant was discovered in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), Chromosome 7. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11571
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A mutation found in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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CTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCAT
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Task1_train_11572
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Given this context: Chromosome 7, gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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Task1_train_11573
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This gene mutation involves COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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CATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAAT
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Task1_train_11574
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Consider a variant on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine its clinical classification and disease relevance.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11575
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This mutation is located in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
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Pathogenic; Inborn genetic diseases
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AAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCAT
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Task1_train_11576
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Here is a variant affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11577
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A variant affecting Chromosome 7, within the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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GTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCC
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Task1_train_11578
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This variant lies on Chromosome 7 and affects the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11579
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Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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ATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCA
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Task1_train_11580
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This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11581
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With a mutation on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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AAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGA
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Task1_train_11582
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A mutation found in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11583
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This is a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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AAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGA
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Task1_train_11584
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A change on Chromosome 7 affects gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta
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Task1_train_11585
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Given this variant in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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CCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCC
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Task1_train_11586
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This is a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11587
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A variant on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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TTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACA
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Task1_train_11588
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A genetic alteration is present in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11589
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An alteration has been detected in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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GGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAA
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Task1_train_11590
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), on Chromosome 7, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11591
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This variant lies on Chromosome 7 and affects the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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TGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAG
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Task1_train_11592
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A genetic alteration is present in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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TGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGTATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAG
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Task1_train_11593
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The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), on Chromosome 7, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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TGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAG
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TGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGTATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAG
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Task1_train_11594
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This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11595
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This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11596
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Assess the clinical impact of this variant on gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), found on Chromosome 7. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11597
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Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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CCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAGTCATTTTCTCTCTAATTGTGATGAATGTGCCCCTATTTAGTTACATTCTGTGGCCTGGTCTCCTTTGTCAACAGTAGGACATATTAAGGAGACAGCTGGTCAGTAATAAAAGAGATACACTTGGGTATACAATTAACTAGGCAATGTACAGAATATGATAATTTCTCTTAAGAAGACGATCTGTTATACAGCTAAAAATAGGCAATGTCTAATATTCATTATTATTTATCTTATTATTGAAGGAAATAGTCTGTCACTTTTTAAAAAGCAATAAACTAAATAATGGGAAACAAATTTTTTGATACCAAGTTCTGGGATGGATACATTTTTGTCACCAATAAAATTCTCTCTTTCTGTATCTTTCCATACTAAAAGTTGTTCTTATTAGCCTGTGTACTTATGCACTCATGTAGATACTGCCAGGTTTATTTCACTCTTTCCAAATTTTTCAAA
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Task1_train_11598
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This sequence change occurs on Chromosome 7, altering COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
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Pathogenic; Combined osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome 2
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Task1_train_11599
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This mutation occurs in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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CCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAGTCATTTTCTCTCTAATTGTGATGAATGTGCCCCTATTTAGTTACATTCTGTGGCCTGGTCTCCTTTGTCAACAGTAGGACATATTAAGGAGACAGCTGGTCAGTAATAAAAGAGATACACTTGGGTATACAATTAACTAGGCAATGTACAGAATATGATAATTTCTCTTAAGAAGACGATCTGTTATACAGCTAAAAATAGGCAATGTCTAATATTCATTATTATTTATCTTATTATTGAAGGAAATAGTCTGTCACTTTTTAAAAAGCAATAAACTAAATAATGGGAAACAAATTTTTTGATACCAAGTTCTGGGATGGATACATTTTTGTCACCAATAAAATTCTCTCTTTCTGTATCTTTCCATACTAAAAGTTGTTCTTATTAGCCTGTGTACTTATGCACTCATGTAGATACTGCCAGGTTTATTTCACTCTTTCCAAATTTTTCAAA
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