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A mutation in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
ATATGAATGGTTCAAAGTAAAAAAAATAGAGTAAAATTGCACTATCAGGAAAAATAATTGTTATATTTAATGAACAAAAACTCAATCCTTCTCCATGTAGGGTGAACCTGGTGCCCCTGGTGAAAATGGAACTCCAGGTCAAACAGTAAGTATTGACTACTTCATTGTAAATTTAAATGTGTACACTCTTTATGAGATGGAACTTCTTTAATGTTTTTGCTAATCACTGTATCCTTCAGCATTGTATTCTTTGATGTTTTTCTAATAGCCTTCTGATACTTAATTGAAATCCACTACTGTTTAGTTGGAATTAGAAGGCAACTTATTTATTTTTAGTGTATTCTTGTACAGGTTGGAAACTGAACAAAGCAAATGATGCCTGTGACTTTTTTTAAATTAGCATTCTGGATTTTATTGAAAATATTTCTGCTTCTAGGGAGCCCGTGGGCTTCCTGGTGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGA
ATATGAATGGTTCAAAGTAAAAAAAATAGAGTAAAATTGCACTATCAGGAAAAATAATTGTTATATTTAATGAACAAAAACTCAATCCTTCTCCATGTAGGGTGAACCTGGTGCCCCTGGTGAAAATGGAACTCCAGGTCAAACAGTAAGTATTGACTACTTCATTGTAAATTTAAATGTGTACACTCTTTATGAGATGGAACTTCTTTAATGTTTTTGCTAATCACTGTATCCTTCAGCATTGTATTCTTTGATGTTTTTCTAATAGCCTTCTGATACTTAATTGAAATCCACTACTGTTTAGTTGGAATTAGAAGGCAACTTATTTATTTTTAGTGTATTCTTGTACAGGTTGGAAACTGAACAAAGCAAATGATGCCTGTGACTTTTTTTAAATTAGCATTCTGGATTTTATTGAAAATATTTCTGCTTCTAGGGAGCCCGTGGGCTTCCTGGTGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCAGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGA
Task1_train_11501
Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
ATATGAATGGTTCAAAGTAAAAAAAATAGAGTAAAATTGCACTATCAGGAAAAATAATTGTTATATTTAATGAACAAAAACTCAATCCTTCTCCATGTAGGGTGAACCTGGTGCCCCTGGTGAAAATGGAACTCCAGGTCAAACAGTAAGTATTGACTACTTCATTGTAAATTTAAATGTGTACACTCTTTATGAGATGGAACTTCTTTAATGTTTTTGCTAATCACTGTATCCTTCAGCATTGTATTCTTTGATGTTTTTCTAATAGCCTTCTGATACTTAATTGAAATCCACTACTGTTTAGTTGGAATTAGAAGGCAACTTATTTATTTTTAGTGTATTCTTGTACAGGTTGGAAACTGAACAAAGCAAATGATGCCTGTGACTTTTTTTAAATTAGCATTCTGGATTTTATTGAAAATATTTCTGCTTCTAGGGAGCCCGTGGGCTTCCTGGTGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGA
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Task1_train_11502
Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11503
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11504
A mutation found in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11505
A sequence alteration has been identified in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11506
Consider this mutation in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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Task1_train_11507
Consider this mutation in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
TGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAA
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Task1_train_11508
Given this variant in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
TGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAA
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Task1_train_11509
This mutation occurs in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
TGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAA
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Task1_train_11510
Here is a variant affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
TGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAA
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Task1_train_11511
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), on Chromosome 7, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
TGAGAGAGGACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAA
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Task1_train_11512
Given this variant in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11513
An alteration has been detected in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
ACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCA
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Task1_train_11514
Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
ACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCA
ACGTGTTGGTGCCCCTGGCCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTAGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCA
Task1_train_11515
A sequence alteration has been identified in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
Task1_train_11516
Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
Task1_train_11517
This genomic variant is located on Chromosome 7, within the COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11518
Given this variant in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
Task1_train_11519
This gene mutation involves COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCAGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
Task1_train_11520
A variant affecting Chromosome 7, within the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11521
Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11522
This is a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Combined osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome 2
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11523
Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Osteoporosis
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11524
A variant on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11525
Here’s a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
CCCAGCTGTAAGTGCTTCCATTTTTGTTCAGTTTCATCCTTTTAAAAAATCTTCTAATGGCTGTCATTTAAGTTTCCACCTGATCTTCCCTTTATTTTCTTCTTAGGGTGCCCGTGGCAGTGATGGAAGTGTGGGTCCCGTGGGTCCTGCTGTAAGTTTTGACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGG
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Task1_train_11526
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11527
This mutation occurs in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11528
This alteration in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2
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Task1_train_11529
This sequence variant lies in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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Task1_train_11530
This alteration in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_11531
This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
ACACTGGGGAGTTTGAAAGGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCAT
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Task1_train_11532
This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11533
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11534
Here’s a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
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Task1_train_11535
This sequence variant lies in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Combined osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome 2
GGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTT
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Task1_train_11536
Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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Task1_train_11537
This genomic variant is located on Chromosome 7, within the COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type
GGAGTTGAGAATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTT
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Task1_train_11538
This variant affects the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) found on Chromosome 7. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2
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Task1_train_11539
This variant lies on Chromosome 7 and affects the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Osteoporosis
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Task1_train_11540
A variant has been detected on Chromosome 7 in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11541
This is a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11542
This sequence variant lies in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Osteoporosis
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGAAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
Task1_train_11543
Mutation context: Chromosome 7, Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGAAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
Task1_train_11544
Consider a variant on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGAAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
Task1_train_11545
Located on Chromosome 7, this mutation impacts COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
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Task1_train_11546
A genetic alteration is present in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
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Task1_train_11547
An alteration has been detected in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Combined osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome 2
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
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Task1_train_11548
A variant affecting Chromosome 7, within the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
AATGTGGGGTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGAAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTG
Task1_train_11549
A mutation found in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
GTGGGTGCTGTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATC
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Task1_train_11550
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11551
The variant affects gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), which is on Chromosome 7. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; not provided
GTCTTCTTCATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTG
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Task1_train_11552
Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11553
Here is a mutation in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11554
Mutation context: Chromosome 7, Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
ATTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGA
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Task1_train_11555
An alteration has been detected in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
TTAATCTCTTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAG
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Task1_train_11556
Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), found on Chromosome 7, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11557
With a mutation on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
TTACGAAATAGCATCATTTCAGACACTTTACCAAATGTTCTGTGAGGTCTTTTGAAGGCTCCATTTATAAGTAGTGTAAGCCATTTATAAGTACCTGAACTTTTGATTGATGTATAAAGCAAAATATCCCCACCCTGGATACCATGAATGTCTTGCCTTTGATGAGATCCTAACGACAACAGACTGGTTGTCAGTTTTTTTCTTTACTAATATAAACAGTGTCATGCCACTGTAAGCAACTTCAATCTTCTGCCATTGTTATTGTTTTCTTAATTTACTTGGAGGAAATTTCTTACCACCTTCTGCTTTGATTTCAGGGTCCCATTGGGTCTGCTGGCCCTCCAGGCTTCCCAGGTGCCCCTGGCCCCAAGGTAAAAACACTGGTGACCATTGTCACTACTTTGATAAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTT
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Task1_train_11558
A mutation on Chromosome 7 affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta
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Task1_train_11559
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11560
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11561
Given a variant located on Chromosome 7 and affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
AAACTTTTTACTGTGATGTGAAAGATTGGAACTGTGTTTGCAGATAAAGAGATAATTACGAAACAGTTACCTTAATTATTCCTTCCCTTCAAAATGGACATAGAATGACCAGTTTTCTCACTCTACATTTGAAATAGATCATTTCTCTGCACTGTGCACTGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAG
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Task1_train_11562
This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_11563
This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
TGTGCCCATCGATATAGATGACAACATGGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTC
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Task1_train_11564
This mutation is located in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11565
A mutation on Chromosome 7 affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11566
Mutation context: Chromosome 7, Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type
GGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAG
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Task1_train_11567
A genomic change on Chromosome 7 affects COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
GGAAATTGTCTCTAGGACTAGTTAGTTAGGACTGACTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAG
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Task1_train_11568
A variant affecting Chromosome 7, within the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11569
Assess the clinical impact of this variant on gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), found on Chromosome 7. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_11570
A variant was discovered in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), Chromosome 7. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11571
A mutation found in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
CTGAGAACCAGAGTCAACCACAGAGAGACAGAAGGAGAGGGAAGGTAGTAACAGTAGCCAAGATGGCAGAATCAAGCAAGGAAAATAGGAAACCAAACTCAAATCTTGTAATAAAACGGATAAGAAAAATAATTGCAATTTTGAAGTTTTATGAAGACATTTCATAAAACTTGGCATCTTAAAAACAGATATGCTGTTTCATTATTTGCTGGTTAATTCCTTGGTTTAATTTCCTCTTTTAGGGTGAAATTGGAGCTGTTGGTAACGCTGGTCCTGCTGGTCCCGCCGGTCCCCGTGGTGAAGTGGGTCTTCCAGGCCTCTCCGGCCCCGTTGGACCTCCTGTAAGTAGCCACTGTCTTTAAACTTTATTGAGTAAAAGAAAACAAAGGTGGAGTATGGGGAAGAAGAAGAATGAAGATGGGGTCAAAGAAGAACCGAAATATTCCAATTAACTGATATCCTTCTCCTTTCCTTTTCCTCATAGGGTAATCCTGGAGCAAACGGCCTTACTGGTGCCAAGGGTGCTGCTGTGAGTATACCTGCGTAGCTAAAATGTGCTGCTATGATTTTAAAGGCATTTAATGTGTGCTGCCTCTACAGCCCATCACCTCCCTAATGGACCACACTGCATTTTCCTTCACAGGGCCTTCCCGGCGTTGCTGGGGCTCCCGGCCTCCCTGGACCCCGCGGTATTCCTGGCCCTGTTGGTGCTGCCGGTGCTACTGGTGCCAGAGGACTTGTTGTAAGTGGTCATGACTGTGGTTCTCATCATCCTGAAATACCACCTCTGCCATCATTTCATCACTATCTAGACTTCCACTTGTAGTTTTATTATTCCTATTTTTCTCTTCCTTAGCATTTTTAGTTTATATTTCTTATATATATATGTACACTCCCGTCTGCTATATGCACACAGACATGCCCTTCCTGTTATCTTAAATCATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCAT
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Task1_train_11572
Given this context: Chromosome 7, gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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Task1_train_11573
This gene mutation involves COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
CATTACCTCAAGGTAAATGAGGCAAAGTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAAT
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Task1_train_11574
Consider a variant on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11575
This mutation is located in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_11576
Here is a variant affecting COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11577
A variant affecting Chromosome 7, within the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
GTTCTACAATATCAGTTTTGTCCCTTCGACCAATAATACCATTCCCCTGTACTCAATTTAAATATGAACAGGGTACATTTCCTAGAGAACTTGAGCTTCTCTTTACCTTGACCCACAAATATTCTAAGAGATTTGTCTGCAAGAGAGTTTCAACAAATGTTTGTCCTTTGACCACTGTTCTGTATTGAACCCTAGGGTGAGCCTGGTCCAGCTGGCTCCAAAGGAGAGAGCGGTAACAAGGGTGAGCCCGTAAGTAGCTCTATCATCACACTTTTATAAAGTTAATTGTTTTTCTCATTCCAGTTTCTCCAGCTGGACATAGTATTAAAATTATTTTTTTACTCCCTCTTCTTTTGTTCTTTTCATTAAACAGGGCTCTGCTGGGCCCCAAGGTCCTCCTGGTCCCAGTGGTGAAGAAGGAAAGAGAGGCCCTAATGGGGAAGCTGGATCTGCCGGCCCTCCAGGACCTCCTGGGCTGAGAGTAGGTTTCAAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCC
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Task1_train_11578
This variant lies on Chromosome 7 and affects the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11579
Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11580
This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11581
With a mutation on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
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Task1_train_11582
A mutation found in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
AAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGA
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Task1_train_11583
This is a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
AAATGCTCCCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGA
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Task1_train_11584
A change on Chromosome 7 affects gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta
CCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCC
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Task1_train_11585
Given this variant in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
CCAACACCCTAACACACCAGAGGCAGATTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCC
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Task1_train_11586
This is a variant in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), located on Chromosome 7. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
TTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACA
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Task1_train_11587
A variant on Chromosome 7 in gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
TTATGATACCCCTTCACTGGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACA
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Task1_train_11588
A genetic alteration is present in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
GGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAA
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Task1_train_11589
An alteration has been detected in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
GGGAATTGGTCAAAATTACTGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAA
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Task1_train_11590
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), on Chromosome 7, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11591
This variant lies on Chromosome 7 and affects the gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
TGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAG
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Task1_train_11592
A genetic alteration is present in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11593
The gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), on Chromosome 7, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
TGACTGTGTTTTCTTAGGCAAAAAAAGCATCTGCTTTCCATCTGCCTTATTAAATCAGTGACTCTCAATTTAATATGTTATAAAATTGGCCTGGAAACAATGTTGACCTACTTTTGCAGGATGCTCATCTATGAATTCCTCTAGGGGTTGGGTGAAGTGTTTTGGCTTGGTTTGTGTCTGTATCTCCCCTGTAAGGAGATCATGCTATTTTTTACAAACTCTACCTTATCAAAGCCAAGAGATTTCTTTAATTCTCTCTATTTCATGTACTTTCTTGCAGGGTAGTCCTGGTTCTCGTGGTCTTCCTGGAGCTGATGGCAGAGCTGGCGTCATGGTAAGCTGTCTATCACTTACTTCCTAGAAAGGGGCTTGCTGCTTCTGGTGGTGGGTGTGTCATTAGCTTTAGCATCCTCCTCCTCTATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGGCCCTCCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAG
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This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type I
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Task1_train_11595
This alteration occurs within gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) located on Chromosome 7. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Ehlers-Danlos syndrome, classic type, 1
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Task1_train_11596
Assess the clinical impact of this variant on gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain), found on Chromosome 7. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta, perinatal lethal
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Task1_train_11597
Gene COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta type III
CCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAGTCATTTTCTCTCTAATTGTGATGAATGTGCCCCTATTTAGTTACATTCTGTGGCCTGGTCTCCTTTGTCAACAGTAGGACATATTAAGGAGACAGCTGGTCAGTAATAAAAGAGATACACTTGGGTATACAATTAACTAGGCAATGTACAGAATATGATAATTTCTCTTAAGAAGACGATCTGTTATACAGCTAAAAATAGGCAATGTCTAATATTCATTATTATTTATCTTATTATTGAAGGAAATAGTCTGTCACTTTTTAAAAAGCAATAAACTAAATAATGGGAAACAAATTTTTTGATACCAAGTTCTGGGATGGATACATTTTTGTCACCAATAAAATTCTCTCTTTCTGTATCTTTCCATACTAAAAGTTGTTCTTATTAGCCTGTGTACTTATGCACTCATGTAGATACTGCCAGGTTTATTTCACTCTTTCCAAATTTTTCAAA
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Task1_train_11598
This sequence change occurs on Chromosome 7, altering COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Combined osteogenesis imperfecta and Ehlers-Danlos syndrome 2
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Task1_train_11599
This mutation occurs in COL1A2 (collagen type I alpha 2 chain) on Chromosome 7. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Osteogenesis imperfecta with normal sclerae, dominant form
CCTGGTAGTCGTGGTGCAAGTGGCCCTGCTGGAGTCCGAGGACCTAATGGAGATGCTGGTCGCCCTGGGGAGCCTGGTCTCATGGGACCCAGAGTAAGTTTCAAACTGATTCTGAGCAAATCACACCTGGCATTACTTCCTTCTTTAAAGGGTTGGTTAATATTGAAGATAACAATAAAAACATCAAAAGTAAATTTGTTAGTAGTCTTGCTGACAGTTGCATTTTTGACTTTATCAAAGCTCAGTAGATATTTTCATGCATTTAATTAGTTCATAAATTTTCTATTTATTACTTGATACAATGGCTATGAGGTTTTTGGAAGAATAGATCTATTTTAATATATCCAAATTAGATTGGTCCTCCTATCAGCATGAATCTTTTATCTTAATTTGTGAGTTTTATATAAGGTGTTCATGAAATATATTAGGACTATACATTTTTGGTTTATTAGATTCATAAGTGAAGTCTTTTTCCTAGCAATCACAAAGTGCTGTAATGTATTCAGCATCACACTAGCTATGGAGAAATAACCTCTAGGTCCATAGACACACTAATCCATAGCAATAGAGTAATTTTTTTGCCTCCATTGCCTCTTATGGGTGAATATCAACTGTAATTGTACCATAAACAAGTAATAGGGACACCAAATATAGCAATAAGAAATCCACTTTGGAAATTGTTTACTAAAAGTATTAGTTTTTCTATTATGAGGTAAATAACGTGATACATTTTGCCCATATACATGTTGCTTAACAGTTTCTTGAGATATCTATAAAAGGATGAGTTGCACTAAATTTCAATAAAAGGAAAGCCACAAAAAAATAGAAGAAAAATTTCAGAACTCTTTTCACACTTCCCAGCTAGTGGCTAATATTCCTAATGATTTACCCTAGGCAACAAACAAAAAGTCGGGGGAAAAGGTGCCTTTGTTAGACTTCAGTTAATCTAAGGCTTGAGTATGTAAGTTAAAGTGCCAATATAAAAACATCCTCATTTATTTTATAGGGTCTTCCTGGTTCCCCTGGAAATATCGGCCCCGCTGGAAAAGAAGGTCCTGTCGTAAGTATTGCTCATTTTCCATTATATTTTCAAGGACACTTATTGCACCCTTATCAAGTCTATTTTGTGGCTTATTTATACATGAACACATTGAAAATAAATATCAGACACATACATCATCTGGGAATGCAGAGTAATAGATTGTAATTATGGAGTCCAAATGAATACAGGACTGAAAGCAGAGCAGGGGAGAGAAAAACATGGCAGGGAAAATTGAAGCAGGTGACAAGGGGATGCAAGAGAAGGGAATGAGGGAAATTGCATACATACGAGATTGAATTGGCTATGTGTGTACTGACATCCTAGTTAGAAAAGGAAAATGGATTCATAATTTATTAACGCTTTATACAAGAAGCTCTATGCATTCAGAAAACTATTCTGTTTCATCCGTGGCAGCATCATAAGCTTGAGGTTGTGAGAATATGTTGACACTGAGTAAACTTGAAATAACTCTGCTTTCAGGGCCTCCCTGGCATCGACGGCAGGCCTGGCCCAATTGGCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGAGCCTGGCAACATTGGATTCCCTGGACCCAAAGGCCCCACTGTAAGAATCACCACAACTTTCTTACCCTCAGCACTTTCTGTAGCCAAATTTTACCAAACTCTAGTATTTATCTCCTGCGAATCAGTCCAGTCTCAGGGAGTTTCCTTTCAACACAGGAAAACTGCAGGCCACTTATCACATTAAAAGTTTACCTCTAGTGTATCCTTATATCCCTGCTAAAAATCCATCTCCTGAGCCCCATGCTTCCACAGACACAGGGACATCTTACTGTACATGGAGCTGCATGGTGATGGATCATCCTTAGATAACAGAAACCACAGACTAGGGATCTCAAAAGAACACAAAAACAAGCAGGATTCAACATTGCAAAATCACCGTGGTTAATTTGACATTAAATGTGCAAAGCTGTTCTTTGTTTTGTTTTTCATTTTTACTCTAGGGTGATCCTGGCAAAAACGGTGATAAAGGTCATGCTGGTCTTGCTGGTGCTCGGGTAGGTGCTAACTTGTGTACAGATCTATTCACATAGCATTCATCTAAGAACCACACTTTTTTTTTTACACCATCTGATATCATTTTGTCACTTTCTTTTCAAGATGGCATCCCCAGGGGTCCTTTTACTATCATAAAATGCCTTTTTAAAAACCAAACTTATAAAACAGTGAGCAAAAACAAATCAGAATATACATTAGGTCAAAAATACAGAAGCACTTGGCTTTTATTTTATTCATTTTGTAATTAAAAGGGTATGAATATGTAGTAGCATTCTCTGGCCTTTATAAATTGCCTTGTGTCGCATACTTCGCTTGAGTCATATCAAAAGTTAGTAGGCAAACCCATAAATATATATACCTACTATGTACCCACACAAATTAAAAATTTAAAAAGTTAGTAGGCAGTATTTGGGCTTTCGTGGGAACCCACAATGAGTTTAATTCATGCTAAAATGACAAACTTGTTTTAAGGAAGTAATACCTGAGGCTTTGAGACATCTTAAACTACCTGGCTTGCAGCTAACCATCAGCCTTTCTGTTAAATATTTTTAGGGTGCTCCAGGTCCTGATGGAAACAATGGTGCTCAGGGACCTCCTGGACCACAGGTGAGTATTTCTCCCACTCTTGTGCTCTTCTGCACTAGAATGTATATAGTCCTCAAACTGGCCATCTCCATTTTCAGTCCAAAAGTTATACAGCTAGACAACAGTGGTGACATACGTTGCTATTTATGCTCTCTTTCCTGTCACTTTCAGGGTGTTCAAGGTGGAAAAGGTGAACAGGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGCTTCCAGGTAAGTCAACTCAAACATATACAATACTGCCTTTGGTCAGCCTATTGAGCTGTAAATCACCATACCGTACCTCTCTTCTCCACCACAATAAACATGATTTCAGGACTGAAGCAAAGAAAGGTGCATTTTTTTCAAACAAACTTTTGTGTAATGCTTAATAACATACAATCGTGCTCATGTTGATATTTGGTAGCCACCACCCCCAAACTCAATTATTAGCAAATCTCCTGAACGTAGCCATGGGATTGAGATTTGTATTTCTTTTCATTTTTAGGGTCTGCCTGGCCCCTCAGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGTGAGTAAAACAAGTAATAGTAAGTAGTAACTACTAAACTTGAGAATTTCCCCCTGTTTAATACCCCACTGCTATGCAATTATAATATGTAAAAGAAAATTTCGTATTTCATATGTTAATGATAGTGTTTTACATACTTTGGTGCTGATGGAGAGAATGAGCCAAATTACTTTAGTTCTGATTACTTTGTTTTACAGATTTAATGAAACATCACCTTATGAAAGTAAAATCTATCAATGAATATTTTATTTAATAGCCTTACTTTTTGTATTGTTCTTGATAACGTTAAGATACAAATTATTTCCTTCCCCATAGTGAAAAAGTAAATGCACAATTTTCAATCAAACTAGATCCCGAAAAATTCCTTTTGTGTTTTTCTTGGCATTCAGACATGACACTACTATACACAATCAGGGCATGAGTTCTGAGTCATTTTCTCTCTAATTGTGATGAATGTGCCCCTATTTAGTTACATTCTGTGGCCTGGTCTCCTTTGTCAACAGTAGGACATATTAAGGAGACAGCTGGTCAGTAATAAAAGAGATACACTTGGGTATACAATTAACTAGGCAATGTACAGAATATGATAATTTCTCTTAAGAAGACGATCTGTTATACAGCTAAAAATAGGCAATGTCTAATATTCATTATTATTTATCTTATTATTGAAGGAAATAGTCTGTCACTTTTTAAAAAGCAATAAACTAAATAATGGGAAACAAATTTTTTGATACCAAGTTCTGGGATGGATACATTTTTGTCACCAATAAAATTCTCTCTTTCTGTATCTTTCCATACTAAAAGTTGTTCTTATTAGCCTGTGTACTTATGCACTCATGTAGATACTGCCAGGTTTATTTCACTCTTTCCAAATTTTTCAAA
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