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Task1_train_7800
Given a variant located on Chromosome 3 and affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Gastric cancer
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAAAGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
Task1_train_7801
This sequence variant lies in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
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TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAAAGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
Task1_train_7802
Given a variant located on Chromosome 3 and affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Seborrheic keratosis
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAAAGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
Task1_train_7803
Here is a variant affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; CLAPO syndrome
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
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Task1_train_7804
A change on Chromosome 3 affects gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; CLOVES syndrome
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAAAGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
Task1_train_7805
This is a variant in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), located on Chromosome 3. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Cowden syndrome 5
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAAAGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
Task1_train_7806
Here is a genetic alteration in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Lung cancer
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAAAGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
Task1_train_7807
Here is a mutation in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Neoplasm
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
TGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGTTTTGCACCATGTTATCTAGGATAGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACTCTCCGTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGTATCTATTTTTAGGATATACTTCTTGATAAGTAATATTAGTAAATAGCGTTTGTAAGCTTATTCTTTTAATTCTGTGATTAATTCGAGAGGCTGAAAATGTTGGCAGTTACTCCAGCTCCCAAATATAGATATTCCATGGGGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTTCGAGACAGGGTCTCGCTTTGTCTCTCAGGCTGGAATGCAGTGGTATGATCATGGCTTACTGCAGCATCAGCCTCCCAGGCTCAAGCAGTCCTCTCACCTCAGCCTCCTAAGTGGCTGGGACCACATGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAGACAGAGTCTCATATTGTCCAGGTTGGTCTCGAATTCTGGGCACAAACAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCGCCCAGCCTATTTCGTGATTTTTATCCCCTCCAACCAGTGGCTGTGGAATGGAATTGAAATAGACATTTCAAAAAATCCATGACCTACTGTTAAGATATACTATTGATACTTTCCTACTCTCTTTTTCTGTTTATTAAATAAATACCTATAAGAAGCAACTACGTTTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAAAGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACT
Task1_train_7808
Consider this mutation in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Cowden syndrome 5
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Task1_train_7809
A variant affecting Chromosome 3, within the gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
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Task1_train_7810
A genetic alteration is present in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Cowden syndrome
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Task1_train_7811
This is a variant in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), located on Chromosome 3. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; PIK3CA-related disorder
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Task1_train_7812
With a mutation on Chromosome 3 in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Angioosteohypertrophic syndrome
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Task1_train_7813
This variant lies on Chromosome 3 and affects the gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
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Task1_train_7814
This genomic variant is located on Chromosome 3, within the PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; CLOVES syndrome
TTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACTTTATGATAAAATAACAATAGAGCTAACTAGTGACTCCTCCAGAAGTAAATCTCATAATGAATTTAGACTGAGTTCTAAGACATTCAAGAAAAAGTTCTGGTCTTGTTGCTAAAGATGGCCACCCTTTTAGAGCCTAGGTAAGGTTAAAAGAGATGGTAGCCTTGTCTGCCACAGGGAAGGAAGATAGTTCCTCAGCCTACCTAAACCACTGTAGGTCAGAAAACGTATCATTCAGGTCAGAAATGAGATTGTGACAACAAACAACTTCAGGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTGAAGTCTCACCCTGTGGCCCAGGCTGGAGTACAGTCAAGTGTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTGCGCCCAGCTTATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAGGTGATCCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATCATGCCCGGCCAGGATCTTTTTAAATTCTTGCTAAAACAAGAGTTTATATCCCACTCATACTGGTATGCCTCACACTGATTAGTGGGGTGGTTGTAGCAGGAAAAGAAAAACAACATTTGAGGAAATAATAGCCAGAATTTTTCCAAATTTGGTAAAAACTATAAACCCGTCAATCCAAGGAGTTCAACAAGCCCCAAGCAAAGACCCCAAAATAATACTGGATAGAATTATCCTAGCTAGCTGTTTCAAGTACCACAAGTTAAACTAGCTTTAT
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Task1_train_7815
This genomic variant is located on Chromosome 3, within the PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
TTGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACTTTATGATAAAATAACAATAGAGCTAACTAGTGACTCCTCCAGAAGTAAATCTCATAATGAATTTAGACTGAGTTCTAAGACATTCAAGAAAAAGTTCTGGTCTTGTTGCTAAAGATGGCCACCCTTTTAGAGCCTAGGTAAGGTTAAAAGAGATGGTAGCCTTGTCTGCCACAGGGAAGGAAGATAGTTCCTCAGCCTACCTAAACCACTGTAGGTCAGAAAACGTATCATTCAGGTCAGAAATGAGATTGTGACAACAAACAACTTCAGGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTGAAGTCTCACCCTGTGGCCCAGGCTGGAGTACAGTCAAGTGTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTGCGCCCAGCTTATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAGGTGATCCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATCATGCCCGGCCAGGATCTTTTTAAATTCTTGCTAAAACAAGAGTTTATATCCCACTCATACTGGTATGCCTCACACTGATTAGTGGGGTGGTTGTAGCAGGAAAAGAAAAACAACATTTGAGGAAATAATAGCCAGAATTTTTCCAAATTTGGTAAAAACTATAAACCCGTCAATCCAAGGAGTTCAACAAGCCCCAAGCAAAGACCCCAAAATAATACTGGATAGAATTATCCTAGCTAGCTGTTTCAAGTACCACAAGTTAAACTAGCTTTAT
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Task1_train_7816
This sequence variant lies in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
TGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACTTTATGATAAAATAACAATAGAGCTAACTAGTGACTCCTCCAGAAGTAAATCTCATAATGAATTTAGACTGAGTTCTAAGACATTCAAGAAAAAGTTCTGGTCTTGTTGCTAAAGATGGCCACCCTTTTAGAGCCTAGGTAAGGTTAAAAGAGATGGTAGCCTTGTCTGCCACAGGGAAGGAAGATAGTTCCTCAGCCTACCTAAACCACTGTAGGTCAGAAAACGTATCATTCAGGTCAGAAATGAGATTGTGACAACAAACAACTTCAGGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTGAAGTCTCACCCTGTGGCCCAGGCTGGAGTACAGTCAAGTGTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTGCGCCCAGCTTATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAGGTGATCCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATCATGCCCGGCCAGGATCTTTTTAAATTCTTGCTAAAACAAGAGTTTATATCCCACTCATACTGGTATGCCTCACACTGATTAGTGGGGTGGTTGTAGCAGGAAAAGAAAAACAACATTTGAGGAAATAATAGCCAGAATTTTTCCAAATTTGGTAAAAACTATAAACCCGTCAATCCAAGGAGTTCAACAAGCCCCAAGCAAAGACCCCAAAATAATACTGGATAGAATTATCCTAGCTAGCTGTTTCAAGTACCACAAGTTAAACTAGCTTTATA
TGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTATTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACTTTATGATAAAATAACAATAGAGCTAACTAGTGACTCCTCCAGAAGTAAATCTCATAATGAATTTAGACTGAGTTCTAAGACATTCAAGAAAAAGTTCTGGTCTTGTTGCTAAAGATGGCCACCCTTTTAGAGCCTAGGTAAGGTTAAAAGAGATGGTAGCCTTGTCTGCCACAGGGAAGGAAGATAGTTCCTCAGCCTACCTAAACCACTGTAGGTCAGAAAACGTATCATTCAGGTCAGAAATGAGATTGTGACAACAAACAACTTCAGGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTGAAGTCTCACCCTGTGGCCCAGGCTGGAGTACAGTCAAGTGTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTGCGCCCAGCTTATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAGGTGATCCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATCATGCCCGGCCAGGATCTTTTTAAATTCTTGCTAAAACAAGAGTTTATATCCCACTCATACTGGTATGCCTCACACTGATTAGTGGGGTGGTTGTAGCAGGAAAAGAAAAACAACATTTGAGGAAATAATAGCCAGAATTTTTCCAAATTTGGTAAAAACTATAAACCCGTCAATCCAAGGAGTTCAACAAGCCCCAAGCAAAGACCCCAAAATAATACTGGATAGAATTATCCTAGCTAGCTGTTTCAAGTACCACAAGTTAAACTAGCTTTATA
Task1_train_7817
This mutation is located in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; PIK3CA-related disorder
TGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACTTTATGATAAAATAACAATAGAGCTAACTAGTGACTCCTCCAGAAGTAAATCTCATAATGAATTTAGACTGAGTTCTAAGACATTCAAGAAAAAGTTCTGGTCTTGTTGCTAAAGATGGCCACCCTTTTAGAGCCTAGGTAAGGTTAAAAGAGATGGTAGCCTTGTCTGCCACAGGGAAGGAAGATAGTTCCTCAGCCTACCTAAACCACTGTAGGTCAGAAAACGTATCATTCAGGTCAGAAATGAGATTGTGACAACAAACAACTTCAGGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTGAAGTCTCACCCTGTGGCCCAGGCTGGAGTACAGTCAAGTGTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTGCGCCCAGCTTATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAGGTGATCCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATCATGCCCGGCCAGGATCTTTTTAAATTCTTGCTAAAACAAGAGTTTATATCCCACTCATACTGGTATGCCTCACACTGATTAGTGGGGTGGTTGTAGCAGGAAAAGAAAAACAACATTTGAGGAAATAATAGCCAGAATTTTTCCAAATTTGGTAAAAACTATAAACCCGTCAATCCAAGGAGTTCAACAAGCCCCAAGCAAAGACCCCAAAATAATACTGGATAGAATTATCCTAGCTAGCTGTTTCAAGTACCACAAGTTAAACTAGCTTTATA
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Task1_train_7818
A genetic alteration is present in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Cowden syndrome
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Task1_train_7819
A mutation found in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Epidermal nevus
TGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACTTTATGATAAAATAACAATAGAGCTAACTAGTGACTCCTCCAGAAGTAAATCTCATAATGAATTTAGACTGAGTTCTAAGACATTCAAGAAAAAGTTCTGGTCTTGTTGCTAAAGATGGCCACCCTTTTAGAGCCTAGGTAAGGTTAAAAGAGATGGTAGCCTTGTCTGCCACAGGGAAGGAAGATAGTTCCTCAGCCTACCTAAACCACTGTAGGTCAGAAAACGTATCATTCAGGTCAGAAATGAGATTGTGACAACAAACAACTTCAGGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTGAAGTCTCACCCTGTGGCCCAGGCTGGAGTACAGTCAAGTGTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTGCGCCCAGCTTATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAGGTGATCCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATCATGCCCGGCCAGGATCTTTTTAAATTCTTGCTAAAACAAGAGTTTATATCCCACTCATACTGGTATGCCTCACACTGATTAGTGGGGTGGTTGTAGCAGGAAAAGAAAAACAACATTTGAGGAAATAATAGCCAGAATTTTTCCAAATTTGGTAAAAACTATAAACCCGTCAATCCAAGGAGTTCAACAAGCCCCAAGCAAAGACCCCAAAATAATACTGGATAGAATTATCCTAGCTAGCTGTTTCAAGTACCACAAGTTAAACTAGCTTTATA
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Task1_train_7820
With a mutation on Chromosome 3 in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
TGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTGTTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACTTTATGATAAAATAACAATAGAGCTAACTAGTGACTCCTCCAGAAGTAAATCTCATAATGAATTTAGACTGAGTTCTAAGACATTCAAGAAAAAGTTCTGGTCTTGTTGCTAAAGATGGCCACCCTTTTAGAGCCTAGGTAAGGTTAAAAGAGATGGTAGCCTTGTCTGCCACAGGGAAGGAAGATAGTTCCTCAGCCTACCTAAACCACTGTAGGTCAGAAAACGTATCATTCAGGTCAGAAATGAGATTGTGACAACAAACAACTTCAGGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTGAAGTCTCACCCTGTGGCCCAGGCTGGAGTACAGTCAAGTGTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTGCGCCCAGCTTATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAGGTGATCCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATCATGCCCGGCCAGGATCTTTTTAAATTCTTGCTAAAACAAGAGTTTATATCCCACTCATACTGGTATGCCTCACACTGATTAGTGGGGTGGTTGTAGCAGGAAAAGAAAAACAACATTTGAGGAAATAATAGCCAGAATTTTTCCAAATTTGGTAAAAACTATAAACCCGTCAATCCAAGGAGTTCAACAAGCCCCAAGCAAAGACCCCAAAATAATACTGGATAGAATTATCCTAGCTAGCTGTTTCAAGTACCACAAGTTAAACTAGCTTTATA
TGTGCCAAGCATATGTCGAGTACTAATTTACATAACCAAGTAAAACCTGGGCCTGGCCTTCAGGTTGCTTATTTTCTAGTGGGGCTTATGGGTAAGAAAATAATGTGTATATAGTAACATTTATATTAAAAATCTCGTCTTAACTACCATTTCAAAATTCAGACCAGTATATTTTAACATTTTTTGTAAATATCCATAATGTTACTGGTCTCCACTATTTGTGGTTTTTTGTTTTAATTTTAGCAAAACTAATGTTTCTCAGGAAATGTTTGGACAAAAAAGCAAGTGAACAGCAGCCTTTGGATGGGACATCAGTATGACTTAATAGATTGAATGACAGAGGCGTCCTAAGTGATATTACTTTTCTGTTATCATATACAATGTTTTCATAATGAGTATCCTGTGATCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGATCCTTGTTTTTAATTCCTTTTTTTGCCTCCAGTTAAGGGTAGAACTACAGTTTCAAAAGTTGACCTTAATTTTTTTCTTTCGTGCAATTTATATTCAGAAGTGTTTGATTGATCTTGTGCTTCAACGTAAATCCTAAATGTTAGTATTTTAAATGTTATAGGAACTACTAGTAAATGTGGTCTATAATGTTTAATTTTTTATCACCTTTGCAGATTAATATGTAGTCATAATACTCTGACATGTTACTTTTAAAATGAAAAACCTTACAGGAAATGGCTCGCCCCCTTAATCTCTTACAGTATATAAGAAGCTGTATAATGCTTGGGAGGATGCCCAATTTGATGTTGATGGCTAAAGAAAGCCTTTATTCTCAACTGCCAATGGACTGTTTTACAATGCCATCTTATTCCAGACGCATTTCCACAGCTACACCATATATGAATGGAGAAACATCTACAAAATCCCTTTGGGTTATAAATAGTGCACTCAGAATAAAAATTCTTTGTGCAACCTACGTGAATGTAAATATTCGAGACATTGATAAGGTAAAGTCAAATGCTGATGCTTATTATTTTATAGAAATTATTTTAGATAACCTTTTTCTTGCACTATACAGTAATCTGTTGACCTGTAGTATGTTTTCAGATGGTTAGGAGAACATCCAAATCTCCGAATGTAAAAATATATCAAGAATTTTACTTGAGCTTCCATCTACCTTAGCTATTATACAGCTCACAGTCCTTTGTTAATAATTCTAATATTCACAATTCTAGCTCTTAAAATCAAAAGTTTTACAGAATTCGTTTGGCAGAAAGACCTGGGCCAACCTTAAGTGAGGGTTTTTATAATCTTTATTAACCCCACTTAGTATAAAATTCCGGTATCTTATTAAAGAAATATTAATGTCTTTATGAGGTACTGCTTCACCAGCTAAGGAAGTAGTATTTAGTAAGTACGTGTACCAATTTAGCTTTCTAAAATATGGAAAAACTCTGAATTACATACCTCCCTTAAGGGGATTGTGGGCCTATATTTATGTTTTAGTAGTCTGATGTCTCCATTGTTATTAGTGGATGAAGGCAGCAACTAATTTTGGTGAAGACTCTACATCAGTATTAACGTGTTACATATGTGAAAAAAAGGAGAACCAAGCTATATCTGAACAAAAATTCCGTGGTTTTATATTTGAGTCTATCGAGTGTGTGCATATGTGTATGTTGAGTGTATACATTAGTATATACCTACTTTTTTCTTTTAGATCTATGTTCGAACAGGTATCTACCATGGAGGAGAACCCTTATGTGACAATGTGAACACTCAAAGAGTACCTTATTCCAATCCCAGGTAAGGAAGTATATAGATTTATATTTCCAAAGGTTATATTAGTGTTTAGCAGTATGATCCATAAAAGTAGTATATTTTTTTAGACCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATTTCTACAAAAAGTTTTTCTTAAAAATTAGCTAGGCACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAAGTCGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAAGATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAACATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCACAGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCCATTAGGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGGAGAATTGCTTGATCCTGGAAGTTCCAGGCTGCAGTCAGCTATGATCGTGCCACTGCATTCCAGCATTAGTGAGACCTGATCTCAAAATATATATATATTTTACATCATTAGCTTTATACAAGCTATATATTAATAAATTACCAGAAATGTACATATAGACCAGCAAGACTTTCTGTCAAATGAGTATCAGTCACAGGATTATTTTATTGATTCTGTCTAAAGTTTTATCAGAATAGTTTCTGATTGTCTCTTTTCATTGTATCAAAGAGAGAACAGAGTATGGTTATAATTTTATGCTAATCATTCCCCACATTAGATTAAAAACCTAGCATTTTATTCTTTTCCTGTCTCCATCATCATTCACATGAAGGAGAAGTAAGAGTTGGCAAGCAACTCCATAACCAAACTACCCTGAGGCAGTTTCCTTCAAATCACTCCCAAGAATAGATATTTATGGCTTTCAAATAAAGGGTCTTTGGTAGCAAATTAATTTGTTAGTGGGAGAGGGAGTTATGGGGAACATTTTAAATTATTACTGCCTGGATGTGATGAAGAAATAAAAAGTAGTATAATCCAATAGCTGACTATCCTGCATTTCTTTGCTTCTCTCTATACAGTCATTTGGGAATAAGAGTACCCCTGAACGTAATAGCAGTAATATTTCAAGAGAACTCAAATTGTTATTGGACTTTATGATAAAATAACAATAGAGCTAACTAGTGACTCCTCCAGAAGTAAATCTCATAATGAATTTAGACTGAGTTCTAAGACATTCAAGAAAAAGTTCTGGTCTTGTTGCTAAAGATGGCCACCCTTTTAGAGCCTAGGTAAGGTTAAAAGAGATGGTAGCCTTGTCTGCCACAGGGAAGGAAGATAGTTCCTCAGCCTACCTAAACCACTGTAGGTCAGAAAACGTATCATTCAGGTCAGAAATGAGATTGTGACAACAAACAACTTCAGGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTGAAGTCTCACCCTGTGGCCCAGGCTGGAGTACAGTCAAGTGTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTGCGCCCAGCTTATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCAGGTGATCCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATCATGCCCGGCCAGGATCTTTTTAAATTCTTGCTAAAACAAGAGTTTATATCCCACTCATACTGGTATGCCTCACACTGATTAGTGGGGTGGTTGTAGCAGGAAAAGAAAAACAACATTTGAGGAAATAATAGCCAGAATTTTTCCAAATTTGGTAAAAACTATAAACCCGTCAATCCAAGGAGTTCAACAAGCCCCAAGCAAAGACCCCAAAATAATACTGGATAGAATTATCCTAGCTAGCTGTTTCAAGTACCACAAGTTAAACTAGCTTTATA
Task1_train_7821
This sequence variant lies in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Cowden syndrome
TTTCTATAAATAGACCATATTTTTAAAAATCTTTATCCATACTTGAGCAAAAATGCTAGAATAAATGGAACTTATTTTACTGATGAAGTTTATTACTTAGTTGGCTAATTAAAAATAGAATTGTTATACTATTTTATTGTTGATTAAGAATTATTTTATTTATAATCAAGATTAGACCAGAATGATAAGACATTTGAAAAGTTTTTAAAATTACTATCTAACATATGAGCTTCTATCATGGGACAATTGCTATTCTAATTCCTTTGCTTGTGTTATCTCATTTAATTTTATGAGATAGTTATCAACCTTATGAGGGTAGGTACTATTATTAGTCCCATTTCATAGAGGAGGCAAAAGACAAAGCAAGGGTCACACACTTAGTGAAAAAGGGGAAATAAGATTCTACTCCAGTCTGATTTCTGAGCCCATACTCTTTATCCATTGTTATAATGTTTTTTTAAAATACAAAACTGTTTATTGTATGTGGTTCTTTACAAATATGTTCACCAAAGACAGACATAATTTCACATGTAGCACCCAGTAAATTGAGGGAATTTATCATTAAAATTCAAATAATTTTTTATCTTGTTCACTTTTTGTAGCAGTGTTTTATTCTTCCCTTATGAATGTGAAGTTTCATTACCTTTTATAAAATAATTATTCTTCAATTCAAATACTTTATGTATCCATCATTTTATTTACCTACTGATTTATTTAGTGGATTCCTTTGGATAAAACTATATTATGTATAAAAGTAACTAAATGTAATCATAATAGGAAATCTTATTTTACCTTTAGTTTTCCTTTTGTTTGACTTTTATGAGCAAAATTATATATATAAATATATAGAAATAATAAATATATATTTATATTATGTATATAGTATATTATATAATATATATTATAAATATAAATAAGTTTTTTAGTGACGTATGTAGCACACATGCATAAAAGTATACAAATCATAATTGTATAGTTCAGTCACAAAGTAAATACCCATGTCTTCTGCTTTTAACAAATGCACACATTTCTGTGGTTTTATTCCTACAATTGGAGCTGGGTCACAGGGAATACATATGCTCACTTTTATTAGATTATGCTTTCCAAATTGGTTGTAACAAATTATACCCCAATACTCTTAGTGTATGAGATTTCCTATTACTGCATAACCTTACCACCCCTTGGCATCATCAGTCTTTATAGTTTAGCCATTCTTATGTATAGTGATATCTCCATGAGATTTTAATTTTCATTTTCTGTATGACTAATAATGACTCCCTTTTCATGTTTATTAACTATTTGAATATGACCTTATAAAGTGCCTTTTCCAATCAATCTCTTTCCTGTTTTTCGTTTGGTTGATCTTTGTCTTCGTGATTTGTAGGAGTCATTTATATACTTTGATGAAGACTTTTCTTGATGTATTATTTTTGCTTTAAAATTTTACATAGGTGGAATGAATGGCTGAATTATGATATATACATTCCTGATCTTCCTCGTGCTGCTCGACTTTGCCTTTCCATTTGCTCTGTTAAAGGCCGAAAGGGTGCTAAAGAGGTAAAGTATTTCAGAAGGAACAATTATGTTTACCTTTAAAAACTCCTGATTATACCGCTGATTGAATTTTTTCACAAATTGGATGTTATTTTATATTTAAGAAAATAATAATAAACCTATTTTTAAAATTTTAATAAATGTATCATGGAAGAATACCTTGGGAGAGCTTCAGGAATTTATGATGAATATGTTTTGAGTTCTTATTGATACCATTTTTAAAAATGCAAAGTGACTATATAACAGGGATTGCATGCAAATATCTCATGCTTGCTTTGGTTCATATTTTCTATTTATAATTAAAATACATGTAATTTCAAATGGGGAAAAAGGAAAGAATGGGCTTAAACCTTGAAAAATCAATTTTTTTTTTTTAGATATTCCCATTATTATAGAGATGATTGTTGAATTTTCCTTTTGGGGAAGAAAAGTGTTTTGAAATGTGTTTTATAATTTAGACTAGTGAATATTTTTCTTTGTTTTTTAAGGAACACTGTCCATTGGCATGGGGAAATATAAACTTGTTTGATTACACAGACACTCTAGTATCTGGAAAAATGGCTTTGAATCTTTGGCCAGTACCTCATGGATTAGAAGATTTGCTGAACCCTATTGGTGTTACTGGATCAAATCCAAATAAAGTAAGGTTTTTATTGTCATAAATTAGATATTTTTTATGGCAGTCAAACCTTCTCTCTTATGTATATATAATAGCTTTTCTTCCATCTCTTAGGAAACTCCATGCTTAGAGTTGGAGTTTGACTGGTTCAGCAGTGTGGTAAAGTTCCCAGATATGTCAGTGATTGAAGAGCATGCCAATTGGTCTGTATCCCGAGAAGCAGGATTTAGCTATTCCCACGCAGGACTGGTAAGGCAAATCACTGAGTTTATTAAGTATCAATTATAATCTGTGGATTTAGGTAGATACTTTCTCTATGGAAAAGGATCCATATATTTTACTGGCATAGATACTATGAACTCTAGGACCAATATTGCAATAGAATTAAGTTCTCTATATGCTAATATTTTTACTGCACCTCTGCTTTTTTAAAGCCCTAGCTTGCCTTCATTCATTTAACAAATATTTATTGAATGCCGACTATGTGTAAAGCACTGGGAAAGGCACTAGGTAATAAAGTCATGAACTAAACAGACCTTCATTGAGTATGCACTCTAACTGTGAAAACAGACATTAAGCAGATAAAAGCAGAAATATAAGATTACAGTTGACCCTTGAACAACATGGATATGAACTACACTGGTCTACTTATATGTGGATTTTTTTCAATAAATATATTGGAAAATTTTTTGGAGATTTGTGACAATTTGAAAAAAACTTGGAGATAAACTACATTGTCCAGAAGTATCAAAAAAATTGAAGTTAGGTATGTCATGAATCCATAAAATATGTATAGATACAAGTCTATTTTATCATTTACGACCATAAAATATACACAAATCTATTATAAAAAGTTAAAATTTATCAAAACATACACACACAAACACAGACCATACATGGTACCACTCATAGTCAAGAGAAATGCAAACATATATAAAGATGCAGTATTAAATTGTATCTGCATAAAATTAACTGTAGTACATACTGTACTACTGTAATAATTTCATAGCCACCTCCTGTTGCTATTGTAGTAAGCTCAAGCATTGCATATATCCACTTAAAATGCTATGTAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGTGAATCACCTGAGGTCAGAGTTCAAAACCAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGCCGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTAAGTTAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGTCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAACAAAACAAAATGCTATGTAATGCTGATCATCTCTACATGAGTACTTCATCACTTCAGTAAATTGTTTATTGCAGTGAAAAGTGATCTCTCACAGTTCTTGGATATTTTTCATCATGTTTAGTGCAATACCGTGAACCCTGAATAACACTATGAGGGCTGTAAGGAGTGCCTCTAGTGATGCTAGAGGTACTCTCAAGAAGCAGAGAAACGTCATGACGTTACAAGCAAAAGTTGAATTGCTTGATGTGTACCATATATTGAGGTCTGCAGCTGCAGTTGCCCTTATTTCAGACAGACAACTAATCTTGTAAACAGACAACATAAACTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCTCAGGCTAGAGTGCAATGGCACAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTGTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACT
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Task1_train_7822
This alteration in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Ovarian neoplasm
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Task1_train_7823
A genetic alteration is present in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Segmental undergrowth associated with lymphatic malformation
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Task1_train_7824
Given this context: Chromosome 3, gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Capillary malformation
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Task1_train_7825
Consider a variant on Chromosome 3 in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; CLOVES syndrome
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Task1_train_7826
This gene mutation involves PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; CLAPO syndrome
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Task1_train_7827
An alteration has been detected in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Neoplasm
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Task1_train_7828
A genetic alteration is present in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
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Task1_train_7829
Given this variant in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
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Task1_train_7830
Given a variant located on Chromosome 3 and affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Cowden syndrome
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Task1_train_7831
Here is a genetic alteration in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
GTTGGCTAATTAAAAATAGAATTGTTATACTATTTTATTGTTGATTAAGAATTATTTTATTTATAATCAAGATTAGACCAGAATGATAAGACATTTGAAAAGTTTTTAAAATTACTATCTAACATATGAGCTTCTATCATGGGACAATTGCTATTCTAATTCCTTTGCTTGTGTTATCTCATTTAATTTTATGAGATAGTTATCAACCTTATGAGGGTAGGTACTATTATTAGTCCCATTTCATAGAGGAGGCAAAAGACAAAGCAAGGGTCACACACTTAGTGAAAAAGGGGAAATAAGATTCTACTCCAGTCTGATTTCTGAGCCCATACTCTTTATCCATTGTTATAATGTTTTTTTAAAATACAAAACTGTTTATTGTATGTGGTTCTTTACAAATATGTTCACCAAAGACAGACATAATTTCACATGTAGCACCCAGTAAATTGAGGGAATTTATCATTAAAATTCAAATAATTTTTTATCTTGTTCACTTTTTGTAGCAGTGTTTTATTCTTCCCTTATGAATGTGAAGTTTCATTACCTTTTATAAAATAATTATTCTTCAATTCAAATACTTTATGTATCCATCATTTTATTTACCTACTGATTTATTTAGTGGATTCCTTTGGATAAAACTATATTATGTATAAAAGTAACTAAATGTAATCATAATAGGAAATCTTATTTTACCTTTAGTTTTCCTTTTGTTTGACTTTTATGAGCAAAATTATATATATAAATATATAGAAATAATAAATATATATTTATATTATGTATATAGTATATTATATAATATATATTATAAATATAAATAAGTTTTTTAGTGACGTATGTAGCACACATGCATAAAAGTATACAAATCATAATTGTATAGTTCAGTCACAAAGTAAATACCCATGTCTTCTGCTTTTAACAAATGCACACATTTCTGTGGTTTTATTCCTACAATTGGAGCTGGGTCACAGGGAATACATATGCTCACTTTTATTAGATTATGCTTTCCAAATTGGTTGTAACAAATTATACCCCAATACTCTTAGTGTATGAGATTTCCTATTACTGCATAACCTTACCACCCCTTGGCATCATCAGTCTTTATAGTTTAGCCATTCTTATGTATAGTGATATCTCCATGAGATTTTAATTTTCATTTTCTGTATGACTAATAATGACTCCCTTTTCATGTTTATTAACTATTTGAATATGACCTTATAAAGTGCCTTTTCCAATCAATCTCTTTCCTGTTTTTCGTTTGGTTGATCTTTGTCTTCGTGATTTGTAGGAGTCATTTATATACTTTGATGAAGACTTTTCTTGATGTATTATTTTTGCTTTAAAATTTTACATAGGTGGAATGAATGGCTGAATTATGATATATACATTCCTGATCTTCCTCGTGCTGCTCGACTTTGCCTTTCCATTTGCTCTGTTAAAGGCCGAAAGGGTGCTAAAGAGGTAAAGTATTTCAGAAGGAACAATTATGTTTACCTTTAAAAACTCCTGATTATACCGCTGATTGAATTTTTTCACAAATTGGATGTTATTTTATATTTAAGAAAATAATAATAAACCTATTTTTAAAATTTTAATAAATGTATCATGGAAGAATACCTTGGGAGAGCTTCAGGAATTTATGATGAATATGTTTTGAGTTCTTATTGATACCATTTTTAAAAATGCAAAGTGACTATATAACAGGGATTGCATGCAAATATCTCATGCTTGCTTTGGTTCATATTTTCTATTTATAATTAAAATACATGTAATTTCAAATGGGGAAAAAGGAAAGAATGGGCTTAAACCTTGAAAAATCAATTTTTTTTTTTTAGATATTCCCATTATTATAGAGATGATTGTTGAATTTTCCTTTTGGGGAAGAAAAGTGTTTTGAAATGTGTTTTATAATTTAGACTAGTGAATATTTTTCTTTGTTTTTTAAGGAACACTGTCCATTGGCATGGGGAAATATAAACTTGTTTGATTACACAGACACTCTAGTATCTGGAAAAATGGCTTTGAATCTTTGGCCAGTACCTCATGGATTAGAAGATTTGCTGAACCCTATTGGTGTTACTGGATCAAATCCAAATAAAGTAAGGTTTTTATTGTCATAAATTAGATATTTTTTATGGCAGTCAAACCTTCTCTCTTATGTATATATAATAGCTTTTCTTCCATCTCTTAGGAAACTCCATGCTTAGAGTTGGAGTTTGACTGGTTCAGCAGTGTGGTAAAGTTCCCAGATATGTCAGTGATTGAAGAGCATGCCAATTGGTCTGTATCCCGAGAAGCAGGATTTAGCTATTCCCACGCAGGACTGGTAAGGCAAATCACTGAGTTTATTAAGTATCAATTATAATCTGTGGATTTAGGTAGATACTTTCTCTATGGAAAAGGATCCATATATTTTACTGGCATAGATACTATGAACTCTAGGACCAATATTGCAATAGAATTAAGTTCTCTATATGCTAATATTTTTACTGCACCTCTGCTTTTTTAAAGCCCTAGCTTGCCTTCATTCATTTAACAAATATTTATTGAATGCCGACTATGTGTAAAGCACTGGGAAAGGCACTAGGTAATAAAGTCATGAACTAAACAGACCTTCATTGAGTATGCACTCTAACTGTGAAAACAGACATTAAGCAGATAAAAGCAGAAATATAAGATTACAGTTGACCCTTGAACAACATGGATATGAACTACACTGGTCTACTTATATGTGGATTTTTTTCAATAAATATATTGGAAAATTTTTTGGAGATTTGTGACAATTTGAAAAAAACTTGGAGATAAACTACATTGTCCAGAAGTATCAAAAAAATTGAAGTTAGGTATGTCATGAATCCATAAAATATGTATAGATACAAGTCTATTTTATCATTTACGACCATAAAATATACACAAATCTATTATAAAAAGTTAAAATTTATCAAAACATACACACACAAACACAGACCATACATGGTACCACTCATAGTCAAGAGAAATGCAAACATATATAAAGATGCAGTATTAAATTGTATCTGCATAAAATTAACTGTAGTACATACTGTACTACTGTAATAATTTCATAGCCACCTCCTGTTGCTATTGTAGTAAGCTCAAGCATTGCATATATCCACTTAAAATGCTATGTAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGTGAATCACCTGAGGTCAGAGTTCAAAACCAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGCCGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTAAGTTAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGTCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAACAAAACAAAATGCTATGTAATGCTGATCATCTCTACATGAGTACTTCATCACTTCAGTAAATTGTTTATTGCAGTGAAAAGTGATCTCTCACAGTTCTTGGATATTTTTCATCATGTTTAGTGCAATACCGTGAACCCTGAATAACACTATGAGGGCTGTAAGGAGTGCCTCTAGTGATGCTAGAGGTACTCTCAAGAAGCAGAGAAACGTCATGACGTTACAAGCAAAAGTTGAATTGCTTGATGTGTACCATATATTGAGGTCTGCAGCTGCAGTTGCCCTTATTTCAGACAGACAACTAATCTTGTAAACAGACAACATAAACTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCTCAGGCTAGAGTGCAATGGCACAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTGTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACTTCATGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAACTTTTTTTTTTTAATAAGAGATGGGGTA
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Task1_train_7832
Assess the clinical impact of this variant on gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), found on Chromosome 3. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; CLOVES syndrome
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Task1_train_7833
A genomic change on Chromosome 3 affects PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
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Task1_train_7834
The gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; PIK3CA-related disorder
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Task1_train_7835
A genomic change on Chromosome 3 affects PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Overgrowth syndrome and/or cerebral malformations due to abnormalities in MTOR pathway genes
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Task1_train_7836
This sequence variant lies in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Neoplasm
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Task1_train_7837
Here is a genetic alteration in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Ovarian neoplasm
AGACAAAAAGGAAATTTGTATTCACATTCAGTTAGTCATTCCACCAGAATGACTTCATCACACAATATTTTGTGACAAGAACCTGAACAGCCTGTTTTACAGTATTCTTTTCATCTTTTATTATATGCACCAAAATTTTTTTTTAAATTTTCTTGAACCTCTAAATCTACGTTAAAAATTTACCTGATACACTTTCTAAATGGACAAATGCCGAAGGTAGCTGTGTATACAAATGTGACTAGAAGGAAAAAGATGATATAGAAATAAAATAACTCCTTGAGTTGATCATTCTGATTGGCATTTATAGAGTAGAAATGTTTTGTAATTACAGAGGAAAAAAGATGGCCTTTCCTTCAACAGTTATGAGCCGTCAGAATTTTCAAAAATACTGCATTTTGACAATGTAGTTTCTAGTTTGACAATGATATATTTATCTTCAAAACCAGGAAAATGTAGATAAGAATTTGGTTTTATAATATTTAAATTCTTATTAAAATGTCTAATAAAATTGTTTTCCCCATCACTTTATTCTTCTGTAAGTTATTTTATATTTAAAATGTAAACAAATAAAAATAAGTAAATAAACAGTAGCAGCTTCTTTTCCTGATAAATCGAGGATTGAGTATGTATTATCTCTTTCCTGGACTACTGGAATAACCTCTCCCTCCTTCCACAGAGAAGCCATAATAATCTTTATGAAATACAAATCAAATCATGGTATTCATTCTTTAAATAGCTATCAATAAAAATAAAATCCCAACTTTATACCCTGTTCGCAAATTTTACGTGGTCTGAATTCAGCTTACATTTCTTCTTTCCCTTGTCTATTGCCCATCAGGCTCACTGGCTTTATTCCTTCACACCAAACTAGTTATTTCCGGGGTGGGAGGAAGGCTTGCAGTGTTTTCTCCATCTGCAATAGTCTTTCCCAAATCTTAGTGTGGATAAAGGTTCCTTCTTGTTACTTGAATCACAAATACTATGTTCTCAGTCATTCTCTGTTACATCATCCAGAGTACATTATATCAATTTTCCAATATTTTTATTTATTTGATTTCCCACTATAACAGAGGCTCTGTTAGTGCAGGGTCTTTTACTATTTTGTAATCCCAACAGCAAGAACAAAACAAGGTACATAGTACATATTTAATAAATACTTGTTGAACAAATATGTGCCGGTAATATTTCTTCATGCTGCTGAATAAGTTAACAGCATATAAACACATACAAACCAAGTGGCATGGATGTCTGCTTTCATTTTTAGCCTTTTAAAAATATATGTAACCCATCCTAAGGGGTTTATATTTGTTTTGCATAATACATTAATATGTACTCATTATTCATTACACAGTTAATATATCTATATTTGCAGGGAATATACATTGCTTGGAATTATACAAAAAAATATTATTTTTCGTTTTCTAATATTCAGGATACAGTGTTTTAATGGGGGTGTTTCTTCATTCTTTTTTTCTTACTGGTTTTTACTTTTTAAATTTGAAAGCTTTGCAGGGATCATAAGGATCTGTTCAGGCAAAGAACATGAAAGGGTTTACATTTTTATCATTTTAGTGTTTCTTATTCTCTATATCAAAAACATTCACAGATAAGTTAACAAGATCCTCATCAGGAGGAAAAGTAAATTGTTCACTACCATCCTCTAGTATCCTAATCTGGTCTTGTTGTTGGCTAACTTCAGCAGTTACTATTCTGTGACTGGTGTAATATTAACCAAATAAATTACTGGATTTGTTCTACAAATATTATGTCTTAGATTGGTTCTTTCCTGTCTCTGAAAATAAAGTCTTGCAATGAAAATAAATTATTTTACAACAGTTAATTAGCAATGTAAAATTTATTGAAAATGTATTTGCTTTTTCTGTAAATCATCTGTGAATCCAGAGGGGAAAAATATGACAAAGAAAGCTATATAAGATATTATTTTATTTTACAGAGTAACAGACTAGCTAGAGACAATGAATTAAGGGAAAATGACAAAGAACAGCTCAAAGCAATTTCTACACGAGATCCTCTCTCTGAAATCACTGAGCAGGAGAAAGATTTTCTATGGAGTCACAGGTAAGTGCTAAAATGGAGATTCTCTGTTTCTTTTTCTTTATTACAGAAAAAATAACTGAATTTGGCTGATCTCAGCATGTTTTTACCATACCTATTGGAATAAATAAAGCAGAATTTACATGATTTTTAAACTATAAACATTGCCTTTTTAAAAACAATGGTTGTAAATTGATATTTGTGGAAAATCATACTACATTGGTAGTTGGCACATTAAATGCTTTTTCTTACTCTGAATTCCTGATATGACTTTCTTTAGGATTGTTTAAAATATTCTAGTAGTTTTAGGTCAATTTAGATGTGATTTAGTTGGTCTAGATATTATAATTTTTAGGGGTTCCCTTTCATTTTTCTTTTTTCTTACGTTTCTTCAAATAGTATAATGCCTTATTTTCATTTATGAAGAAATTACCCTGCTGTTGGTGATACGGGTATATTTAAATAAACCAGTTGCAGTGCATTTCTGCAGAAAGTCCATTAAGACATAAATTTTGTCCAGTAACTACAGTAGAAGTGGTGACTCTATGATTCATTCATGTTGCATAAGTAGGTGAAAAATATGAGCTATATGAAGAGTGGTATAACATATATTCATAATTTTTCTTAACTGTTAACTAAATGTAAGTACTTATAATCCATTTGCATTTTCCTTTTGTGTTCTTTGCCATTATAACTGTGCCTAAGTATATATGTAAATATATTTCCAACTATAGTGTTAAACACTGATGTCTTTTGAATTTTAAAAAAGCTAGTAATGTAAGAAGTTTGGGACTTCTTAAGAAGATTCATATGGAGAAGTTAGACATGTCAACCTTTTGAACAGCATGCAAGAATGTTTATGTTTATTTTGTTTCTCCCACACAGACACTATTGTGTAACTATCCCCGAAATTCTACCCAAATTGCTTCTGTCTGTTAAATGGAATTCTAGAGATGAAGTAGCCCAGGTAAATGTATGTTTGAGATTACTAGATAACTGTTGTACAAATTGGTATGTCACTTAAATTGTTTTCTCTCAGAAAGTCCACATAAATAAATGAAATAGACTAATAGTAATATAGTGTAGAAAAAAACACCCTTAACATTATTTCCATAGATAAAACTAATTAGAACTGTAAATTCTAAGGAGATTATTTATCTAAACTAATTTTAAAATCAGAAGTTAAGGCAGTGTTTTAGATGGCTCATTCACAACTATCTTTCCCCTTTAAATATGATTTATTGTCTTTCTCATACACAGATGTATTGCTTGGTAAAAGATTGGCCTCCAATCAAACCTGAACAGGCTATGGAACTTCTGGACTGTAATTACCCAGATCCTATGGTTCGAGGTTTTGCTGTTCGGTGCTTGGAAAAATATTTAACAGATGACAAACTTTCTCAGTATTTAATTCAGCTAGTACAGGTAAAATAATGTAAAATAGTAAATAATGTTTAATTACAATAATAATTTATTCTAGATCCATACAACTTCCTTTTAAAAAACCTACTGCACTAACTAGTTTTATGCTTAAAAAAAAAAATTATTACCAGTAATATCCACTTTCTTTCTGAAAAAATTTTCTTTAGATCGGCCATGCAGAAACTGACCCTGATTTGTTTTTTTGGAATCACCTAGGTCCTAAAATATGAACAATATTTGGATAACTTGCTTGTGAGATTTTTACTGAAGAAAGCATTGACTAATCAAAGGATTGGGCACTTTTTCTTTTGGCATTTAAAGTAAGTCTAATTATTTTCCCATTAAATTCTTAAGGTACATATTACTTGCTTTCTTAATAGATTTATAAATATGTATTACTTATATACTTTTGTTTATGTTTGGCTGGAAGAGTTTTCCATACTAAAAGTATTTTGTACCAGTGATGAGCTTCTCAACTTTTGCTCTTTGAAATTTAAAAAGCAGTAAATTCAAAACTAAATTTTAGTCATGAATGAGAGCTTAAATATTTTTAAAGATTTTTGTTCTACTTAAGTCAAATTTTCTAGGTCCAGATGAATATTGCTGTAGGTTTCACTGT
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Task1_train_7838
This mutation is located in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
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Task1_train_7839
The gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), on Chromosome 3, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Ovarian neoplasm
CAAAAAGGAAATTTGTATTCACATTCAGTTAGTCATTCCACCAGAATGACTTCATCACACAATATTTTGTGACAAGAACCTGAACAGCCTGTTTTACAGTATTCTTTTCATCTTTTATTATATGCACCAAAATTTTTTTTTAAATTTTCTTGAACCTCTAAATCTACGTTAAAAATTTACCTGATACACTTTCTAAATGGACAAATGCCGAAGGTAGCTGTGTATACAAATGTGACTAGAAGGAAAAAGATGATATAGAAATAAAATAACTCCTTGAGTTGATCATTCTGATTGGCATTTATAGAGTAGAAATGTTTTGTAATTACAGAGGAAAAAAGATGGCCTTTCCTTCAACAGTTATGAGCCGTCAGAATTTTCAAAAATACTGCATTTTGACAATGTAGTTTCTAGTTTGACAATGATATATTTATCTTCAAAACCAGGAAAATGTAGATAAGAATTTGGTTTTATAATATTTAAATTCTTATTAAAATGTCTAATAAAATTGTTTTCCCCATCACTTTATTCTTCTGTAAGTTATTTTATATTTAAAATGTAAACAAATAAAAATAAGTAAATAAACAGTAGCAGCTTCTTTTCCTGATAAATCGAGGATTGAGTATGTATTATCTCTTTCCTGGACTACTGGAATAACCTCTCCCTCCTTCCACAGAGAAGCCATAATAATCTTTATGAAATACAAATCAAATCATGGTATTCATTCTTTAAATAGCTATCAATAAAAATAAAATCCCAACTTTATACCCTGTTCGCAAATTTTACGTGGTCTGAATTCAGCTTACATTTCTTCTTTCCCTTGTCTATTGCCCATCAGGCTCACTGGCTTTATTCCTTCACACCAAACTAGTTATTTCCGGGGTGGGAGGAAGGCTTGCAGTGTTTTCTCCATCTGCAATAGTCTTTCCCAAATCTTAGTGTGGATAAAGGTTCCTTCTTGTTACTTGAATCACAAATACTATGTTCTCAGTCATTCTCTGTTACATCATCCAGAGTACATTATATCAATTTTCCAATATTTTTATTTATTTGATTTCCCACTATAACAGAGGCTCTGTTAGTGCAGGGTCTTTTACTATTTTGTAATCCCAACAGCAAGAACAAAACAAGGTACATAGTACATATTTAATAAATACTTGTTGAACAAATATGTGCCGGTAATATTTCTTCATGCTGCTGAATAAGTTAACAGCATATAAACACATACAAACCAAGTGGCATGGATGTCTGCTTTCATTTTTAGCCTTTTAAAAATATATGTAACCCATCCTAAGGGGTTTATATTTGTTTTGCATAATACATTAATATGTACTCATTATTCATTACACAGTTAATATATCTATATTTGCAGGGAATATACATTGCTTGGAATTATACAAAAAAATATTATTTTTCGTTTTCTAATATTCAGGATACAGTGTTTTAATGGGGGTGTTTCTTCATTCTTTTTTTCTTACTGGTTTTTACTTTTTAAATTTGAAAGCTTTGCAGGGATCATAAGGATCTGTTCAGGCAAAGAACATGAAAGGGTTTACATTTTTATCATTTTAGTGTTTCTTATTCTCTATATCAAAAACATTCACAGATAAGTTAACAAGATCCTCATCAGGAGGAAAAGTAAATTGTTCACTACCATCCTCTAGTATCCTAATCTGGTCTTGTTGTTGGCTAACTTCAGCAGTTACTATTCTGTGACTGGTGTAATATTAACCAAATAAATTACTGGATTTGTTCTACAAATATTATGTCTTAGATTGGTTCTTTCCTGTCTCTGAAAATAAAGTCTTGCAATGAAAATAAATTATTTTACAACAGTTAATTAGCAATGTAAAATTTATTGAAAATGTATTTGCTTTTTCTGTAAATCATCTGTGAATCCAGAGGGGAAAAATATGACAAAGAAAGCTATATAAGATATTATTTTATTTTACAGAGTAACAGACTAGCTAGAGACAATGAATTAAGGGAAAATGACAAAGAACAGCTCAAAGCAATTTCTACACGAGATCCTCTCTCTGAAATCACTGAGCAGGAGAAAGATTTTCTATGGAGTCACAGGTAAGTGCTAAAATGGAGATTCTCTGTTTCTTTTTCTTTATTACAGAAAAAATAACTGAATTTGGCTGATCTCAGCATGTTTTTACCATACCTATTGGAATAAATAAAGCAGAATTTACATGATTTTTAAACTATAAACATTGCCTTTTTAAAAACAATGGTTGTAAATTGATATTTGTGGAAAATCATACTACATTGGTAGTTGGCACATTAAATGCTTTTTCTTACTCTGAATTCCTGATATGACTTTCTTTAGGATTGTTTAAAATATTCTAGTAGTTTTAGGTCAATTTAGATGTGATTTAGTTGGTCTAGATATTATAATTTTTAGGGGTTCCCTTTCATTTTTCTTTTTTCTTACGTTTCTTCAAATAGTATAATGCCTTATTTTCATTTATGAAGAAATTACCCTGCTGTTGGTGATACGGGTATATTTAAATAAACCAGTTGCAGTGCATTTCTGCAGAAAGTCCATTAAGACATAAATTTTGTCCAGTAACTACAGTAGAAGTGGTGACTCTATGATTCATTCATGTTGCATAAGTAGGTGAAAAATATGAGCTATATGAAGAGTGGTATAACATATATTCATAATTTTTCTTAACTGTTAACTAAATGTAAGTACTTATAATCCATTTGCATTTTCCTTTTGTGTTCTTTGCCATTATAACTGTGCCTAAGTATATATGTAAATATATTTCCAACTATAGTGTTAAACACTGATGTCTTTTGAATTTTAAAAAAGCTAGTAATGTAAGAAGTTTGGGACTTCTTAAGAAGATTCATATGGAGAAGTTAGACATGTCAACCTTTTGAACAGCATGCAAGAATGTTTATGTTTATTTTGTTTCTCCCACACAGACACTATTGTGTAACTATCCCCGAAATTCTACCCAAATTGCTTCTGTCTGTTAAATGGAATTCTAGAGATGAAGTAGCCCAGGTAAATGTATGTTTGAGATTACTAGATAACTGTTGTACAAATTGGTATGTCACTTAAATTGTTTTCTCTCAGAAAGTCCACATAAATAAATGAAATAGACTAATAGTAATATAGTGTAGAAAAAAACACCCTTAACATTATTTCCATAGATAAAACTAATTAGAACTGTAAATTCTAAGGAGATTATTTATCTAAACTAATTTTAAAATCAGAAGTTAAGGCAGTGTTTTAGATGGCTCATTCACAACTATCTTTCCCCTTTAAATATGATTTATTGTCTTTCTCATACACAGATGTATTGCTTGGTAAAAGATTGGCCTCCAATCAAACCTGAACAGGCTATGGAACTTCTGGACTGTAATTACCCAGATCCTATGGTTCGAGGTTTTGCTGTTCGGTGCTTGGAAAAATATTTAACAGATGACAAACTTTCTCAGTATTTAATTCAGCTAGTACAGGTAAAATAATGTAAAATAGTAAATAATGTTTAATTACAATAATAATTTATTCTAGATCCATACAACTTCCTTTTAAAAAACCTACTGCACTAACTAGTTTTATGCTTAAAAAAAAAAATTATTACCAGTAATATCCACTTTCTTTCTGAAAAAATTTTCTTTAGATCGGCCATGCAGAAACTGACCCTGATTTGTTTTTTTGGAATCACCTAGGTCCTAAAATATGAACAATATTTGGATAACTTGCTTGTGAGATTTTTACTGAAGAAAGCATTGACTAATCAAAGGATTGGGCACTTTTTCTTTTGGCATTTAAAGTAAGTCTAATTATTTTCCCATTAAATTCTTAAGGTACATATTACTTGCTTTCTTAATAGATTTATAAATATGTATTACTTATATACTTTTGTTTATGTTTGGCTGGAAGAGTTTTCCATACTAAAAGTATTTTGTACCAGTGATGAGCTTCTCAACTTTTGCTCTTTGAAATTTAAAAAGCAGTAAATTCAAAACTAAATTTTAGTCATGAATGAGAGCTTAAATATTTTTAAAGATTTTTGTTCTACTTAAGTCAAATTTTCTAGGTCCAGATGAATATTGCTGTAGGTTTCACTGTGTG
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Task1_train_7840
A mutation found in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Neoplasm
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Task1_train_7841
This alteration occurs within gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) located on Chromosome 3. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Overgrowth syndrome and/or cerebral malformations due to abnormalities in MTOR pathway genes
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Task1_train_7842
This genomic variant is located on Chromosome 3, within the PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
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Task1_train_7843
The gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) is located on Chromosome 3, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Overgrowth syndrome and/or cerebral malformations due to abnormalities in MTOR pathway genes
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Task1_train_7844
Here is a mutation in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Cowden syndrome
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Task1_train_7845
This variant impacts the gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
AAGTTATCTTCTAGAATTTTTATGGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCTTCGATCCATCTTGAGTTGATTTTTGTATAAGGTGAGAGACAGGGATCCAGTTTCATTCTTTTACATGTGGCTAGCTAGTTTTCCCACCACCATTTATTAAACAGAATGTCCTTTCTCCAATTTATGTTTTTATATGTCTAAGATCAGTTCGTTGTAAGTTTTTGGCTTTATTTCTAGGTTCTCCATTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGCTTTTGTGTGTATCTGCTGTTTTGGTAATTATAGTTTCCTGGTATAATTTGAAGTCCAGTAATGTGATGCCTCCAGATTTGTTCTTTTTGCTTAGTCTTGCTTTGGCTATTCAGACTCTTTTTGGTCGGTTTTATATGAATTTTAGGATTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAAAATGATGGTGACAGTGTTTTGTAGTTTTCCTTGAAAAGATCTTTCACCCCCTTGGTTAAGTACATTCCTAGGTATTTTTTTGAAGCTAAAAGGGCTTGTGTTCTTAATTTGATTCTCAGCTTGGTTGTTGTTGGTGTATAGCAATGCTGCTGATTTGTGTACACTGATTTTGTAACCTGAGACTTTACTGAATTCATTTATCAAATCTAGGAGTCTTTTTTTTTATCTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTAGAGCGTAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAATCTCGGGTGATCCTCCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGAAATGAGCCACCACACCTGGCTGAAATCTAGGAATTTTTTGGAGAACTCTTGGGTTTTCTAGGTATATGATTATGTCATTGGTAAACAGCTATAGTTTGACTTCCTCTTTTCCAATTTGGATGCCAATGTGGGCTTCCTTGTCTTGTTCTAGTTCTCAGGGGGAGTGCTTTCAGCTTTTCCCCATTCAGTATGATATTGGCCGTGGGTTTGTCACATGACTTTTATTATTTTGAGGTAAGTCCCTTCTATGCCTAGTTTGTTGAGTGAAAAACTATTTTAATTTTTTTTTTTTGTATTTATTTGTGTGATGCTGTGAAGGAAAATGGAAAGGGAATACAATTTAATTTGTTGAGCTAATTAAGGCCTAAAAAGAAAGTAATCCTTAAACTTCATAACACATTAAAGGTTTTTATTTACTGAGCTTTAAATAGTTGGACTCCACCTCTATATTGACAAATAATGTATAGTGCTTAATACGACATTTTTTGGTCATACACTTTGAGGAAAGTCAGTCAACCATAATCACCTTGTTTATTCATAACTTTTTTACCACCTTATGGTATCTCATTAGACTATATCAGACTTTAAAGTACTTTTTACAATCTTCTATAAAATTCTGCTTTGTCTACAACACAGTCCTGACTCTAGCTTAAGCACAAAAGGATTTAGTATGAACCAATTCATACATTTAATACTTATTAAACTCCTGACATGCCAGGCATTGTTGTAGGTGCTGGTAATAAAGCAGTTTTTAAAAAGTCCTTATTCTCTTGAAGTTTACATTCTAGTGGGGTAAAGGGAATCAAAAGATGTTGGTAAGAGAAGTGAGAGAGGAATGCTATTTTTTTATAGCTTTGTCTACGAAAGCCTCTCTAATTTTGTGACATTTGAGCAAAGACCTGAAGGTATTAACATCATTTGCTCCAAACTGACCAAACTGTTCTTATTACTTATAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAGCATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAATGCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAGCCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATGAATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCACACAATTAAACAGCATGCATTGAACTGAAAAGATAACTGAGAAAATGAAAGCTCACTCTGGATTCCACACTGCACTGTTAATAACTCTCAGCAGGCAAAGACCGATTGCATAGGAATTGCACAATCCATGAACAGCATTAGAATTTACAGCAAGAACAGAAATAAAATACTATATAATTTAAATAATGTAAACGCAAACAGGGTTTGATAGCACTTAAACTAGTTCATTTCAAAATTAAGCTTTAGAATAATGCGCAATTTCATGTTATGCCTTAAGTCCAAAAAGGTAAACTTTGAAGATTGTTTGTATCTTTTTTTAAAAAACAAAACAAAACAAAAATCCCCAAAATATATAGAAATGATGGAGAAGGAAAAAGTGATGGTTTTTTTTGTCTTGCAAATGTTCTATGTTTTGAAATGTGGACACAACAAAGGCTGTTATTGCATTAGGTGTAAGTAAACTGGAGTTTATGTTAAATTACATTGATTGGAAAAGAATGAAAATTTCTTATTTTTCCATTGCTGTTCAATTTATAGTTTGAAGTGGGTTTTTGACTGCTTGTTTAATGAAGAAAAATGCTTGGGGTGGAAGGGACTCTTGAGATTTCACCAGAGACTTTTTCTTTTTAATAAATCAAACCTTTTGATGATTTGAGGTTTTATCTGCAGTTTTGGAAGCAGTCACAAATGAGACCTGTTATAAGGTGGTATTTTTTTTTTTCTTCTGGACAGTATTTAAAGGATCTTATTCTTATTTCCCAGGGAAATTCTGGGCTCCCACAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATCATAGAAAAAGAATGAGCAGGAATAGTTCTTATTCCAGAATTGTACAGTATTCACCTTAAGTTGATTTTTTTTCTCCTTCTGCAATTGAACTGAATACATTTTTCATGCATGTTTTCCAGAAAATAGAAGTATTAATGTTATTAAAAAGATTATTTTTTTTATTAAAGGCTATTTATATTATAGAAACTATCATTAATATATATTCTTTATTTACATGATCTGTCCCATAGTCATGCATTGTTTTGCACCCCAAATTTTTTATTGTTCATAGCAGCATGGTCAGCTTTCTTCTTGATCTATAGATGAGGCTCAGGCACTATCCCATTTATACCAATAACCAGTGTATAACTACTTAAGGAAAACATAAAAACTTCATCTTCTTTCCTTTTATTTCTTATGTGAATCTCCCGTCTTCCATTCTCTTTTATAATTGAGAATGTCTCAATCATATGAAATTAGTTACCAGAATTAACACAATTTAGACTATCTTCCTGATTCCTTAAACCCCTTTACTGAAGTATACTCATGAATAATACTTTAAAATATGGGGGAATAGAAACCATGAACTTTTTACCTTTTTAAACTATTTATCCATATCTCCAAAGTAGAACATTAAACCATTTTAAGATATGTCTCATTCCCAAGTAGTCAGAGCTCACTCTCCAACTTTATTAAATACTATTTGAGCACAGGACACATTCTTAAACATTTTGAAAAACATTAACCCAAGATGTAGAGGCTACTGCTAGTCGTCATTCTAGAATCTGATATTTTACTCTGTATTTGAAATGAATGATTAATGTCCTAGGAAATTAGCTTTAGCAGATGTCCAGGTGCCACATCAAAAAAGTGCAATAATTATTGACAGTTTTTTAGATTAGGCATATTATTGGAAAACAACTTTATAAAGAGTGAACATTGTATACTCTAGTAAAACAGCATCACTTTAAAAATATTCATTTATGAAATCTGTTACCTATAGTTGAAGTCTTGAGTAGTGAACAAGGGACTCTAATACCAATACTCTTAATATCTGGCTATTTTAGATCCCTTAAAGGGCATAATTATTGGAAATTTAGGTATTTCACTAAAGCATGTATATAATATTGCCAACAAGAAAAGTAAATTTGAAGATTAAGGGAACTTACTTCTGCAAACTGTCTTGCGAT
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Task1_train_7846
Gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
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Task1_train_7847
A mutation found in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Cowden syndrome
TTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCTTCGATCCATCTTGAGTTGATTTTTGTATAAGGTGAGAGACAGGGATCCAGTTTCATTCTTTTACATGTGGCTAGCTAGTTTTCCCACCACCATTTATTAAACAGAATGTCCTTTCTCCAATTTATGTTTTTATATGTCTAAGATCAGTTCGTTGTAAGTTTTTGGCTTTATTTCTAGGTTCTCCATTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGCTTTTGTGTGTATCTGCTGTTTTGGTAATTATAGTTTCCTGGTATAATTTGAAGTCCAGTAATGTGATGCCTCCAGATTTGTTCTTTTTGCTTAGTCTTGCTTTGGCTATTCAGACTCTTTTTGGTCGGTTTTATATGAATTTTAGGATTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAAAATGATGGTGACAGTGTTTTGTAGTTTTCCTTGAAAAGATCTTTCACCCCCTTGGTTAAGTACATTCCTAGGTATTTTTTTGAAGCTAAAAGGGCTTGTGTTCTTAATTTGATTCTCAGCTTGGTTGTTGTTGGTGTATAGCAATGCTGCTGATTTGTGTACACTGATTTTGTAACCTGAGACTTTACTGAATTCATTTATCAAATCTAGGAGTCTTTTTTTTTATCTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTAGAGCGTAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAATCTCGGGTGATCCTCCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGAAATGAGCCACCACACCTGGCTGAAATCTAGGAATTTTTTGGAGAACTCTTGGGTTTTCTAGGTATATGATTATGTCATTGGTAAACAGCTATAGTTTGACTTCCTCTTTTCCAATTTGGATGCCAATGTGGGCTTCCTTGTCTTGTTCTAGTTCTCAGGGGGAGTGCTTTCAGCTTTTCCCCATTCAGTATGATATTGGCCGTGGGTTTGTCACATGACTTTTATTATTTTGAGGTAAGTCCCTTCTATGCCTAGTTTGTTGAGTGAAAAACTATTTTAATTTTTTTTTTTTGTATTTATTTGTGTGATGCTGTGAAGGAAAATGGAAAGGGAATACAATTTAATTTGTTGAGCTAATTAAGGCCTAAAAAGAAAGTAATCCTTAAACTTCATAACACATTAAAGGTTTTTATTTACTGAGCTTTAAATAGTTGGACTCCACCTCTATATTGACAAATAATGTATAGTGCTTAATACGACATTTTTTGGTCATACACTTTGAGGAAAGTCAGTCAACCATAATCACCTTGTTTATTCATAACTTTTTTACCACCTTATGGTATCTCATTAGACTATATCAGACTTTAAAGTACTTTTTACAATCTTCTATAAAATTCTGCTTTGTCTACAACACAGTCCTGACTCTAGCTTAAGCACAAAAGGATTTAGTATGAACCAATTCATACATTTAATACTTATTAAACTCCTGACATGCCAGGCATTGTTGTAGGTGCTGGTAATAAAGCAGTTTTTAAAAAGTCCTTATTCTCTTGAAGTTTACATTCTAGTGGGGTAAAGGGAATCAAAAGATGTTGGTAAGAGAAGTGAGAGAGGAATGCTATTTTTTTATAGCTTTGTCTACGAAAGCCTCTCTAATTTTGTGACATTTGAGCAAAGACCTGAAGGTATTAACATCATTTGCTCCAAACTGACCAAACTGTTCTTATTACTTATAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAGCATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAATGCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAGCCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATGAATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCACACAATTAAACAGCATGCATTGAACTGAAAAGATAACTGAGAAAATGAAAGCTCACTCTGGATTCCACACTGCACTGTTAATAACTCTCAGCAGGCAAAGACCGATTGCATAGGAATTGCACAATCCATGAACAGCATTAGAATTTACAGCAAGAACAGAAATAAAATACTATATAATTTAAATAATGTAAACGCAAACAGGGTTTGATAGCACTTAAACTAGTTCATTTCAAAATTAAGCTTTAGAATAATGCGCAATTTCATGTTATGCCTTAAGTCCAAAAAGGTAAACTTTGAAGATTGTTTGTATCTTTTTTTAAAAAACAAAACAAAACAAAAATCCCCAAAATATATAGAAATGATGGAGAAGGAAAAAGTGATGGTTTTTTTTGTCTTGCAAATGTTCTATGTTTTGAAATGTGGACACAACAAAGGCTGTTATTGCATTAGGTGTAAGTAAACTGGAGTTTATGTTAAATTACATTGATTGGAAAAGAATGAAAATTTCTTATTTTTCCATTGCTGTTCAATTTATAGTTTGAAGTGGGTTTTTGACTGCTTGTTTAATGAAGAAAAATGCTTGGGGTGGAAGGGACTCTTGAGATTTCACCAGAGACTTTTTCTTTTTAATAAATCAAACCTTTTGATGATTTGAGGTTTTATCTGCAGTTTTGGAAGCAGTCACAAATGAGACCTGTTATAAGGTGGTATTTTTTTTTTTCTTCTGGACAGTATTTAAAGGATCTTATTCTTATTTCCCAGGGAAATTCTGGGCTCCCACAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATCATAGAAAAAGAATGAGCAGGAATAGTTCTTATTCCAGAATTGTACAGTATTCACCTTAAGTTGATTTTTTTTCTCCTTCTGCAATTGAACTGAATACATTTTTCATGCATGTTTTCCAGAAAATAGAAGTATTAATGTTATTAAAAAGATTATTTTTTTTATTAAAGGCTATTTATATTATAGAAACTATCATTAATATATATTCTTTATTTACATGATCTGTCCCATAGTCATGCATTGTTTTGCACCCCAAATTTTTTATTGTTCATAGCAGCATGGTCAGCTTTCTTCTTGATCTATAGATGAGGCTCAGGCACTATCCCATTTATACCAATAACCAGTGTATAACTACTTAAGGAAAACATAAAAACTTCATCTTCTTTCCTTTTATTTCTTATGTGAATCTCCCGTCTTCCATTCTCTTTTATAATTGAGAATGTCTCAATCATATGAAATTAGTTACCAGAATTAACACAATTTAGACTATCTTCCTGATTCCTTAAACCCCTTTACTGAAGTATACTCATGAATAATACTTTAAAATATGGGGGAATAGAAACCATGAACTTTTTACCTTTTTAAACTATTTATCCATATCTCCAAAGTAGAACATTAAACCATTTTAAGATATGTCTCATTCCCAAGTAGTCAGAGCTCACTCTCCAACTTTATTAAATACTATTTGAGCACAGGACACATTCTTAAACATTTTGAAAAACATTAACCCAAGATGTAGAGGCTACTGCTAGTCGTCATTCTAGAATCTGATATTTTACTCTGTATTTGAAATGAATGATTAATGTCCTAGGAAATTAGCTTTAGCAGATGTCCAGGTGCCACATCAAAAAAGTGCAATAATTATTGACAGTTTTTTAGATTAGGCATATTATTGGAAAACAACTTTATAAAGAGTGAACATTGTATACTCTAGTAAAACAGCATCACTTTAAAAATATTCATTTATGAAATCTGTTACCTATAGTTGAAGTCTTGAGTAGTGAACAAGGGACTCTAATACCAATACTCTTAATATCTGGCTATTTTAGATCCCTTAAAGGGCATAATTATTGGAAATTTAGGTATTTCACTAAAGCATGTATATAATATTGCCAACAAGAAAAGTAAATTTGAAGATTAAGGGAACTTACTTCTGCAAACTGTCTTGCGATAGTTAAGCAGAATTTAAACTCTGTT
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Task1_train_7848
This is a variant in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), located on Chromosome 3. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Cowden syndrome
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Task1_train_7849
A variant has been detected on Chromosome 3 in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Cowden syndrome
TAGATTTAAGTCTTCGATCCATCTTGAGTTGATTTTTGTATAAGGTGAGAGACAGGGATCCAGTTTCATTCTTTTACATGTGGCTAGCTAGTTTTCCCACCACCATTTATTAAACAGAATGTCCTTTCTCCAATTTATGTTTTTATATGTCTAAGATCAGTTCGTTGTAAGTTTTTGGCTTTATTTCTAGGTTCTCCATTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGCTTTTGTGTGTATCTGCTGTTTTGGTAATTATAGTTTCCTGGTATAATTTGAAGTCCAGTAATGTGATGCCTCCAGATTTGTTCTTTTTGCTTAGTCTTGCTTTGGCTATTCAGACTCTTTTTGGTCGGTTTTATATGAATTTTAGGATTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAAAATGATGGTGACAGTGTTTTGTAGTTTTCCTTGAAAAGATCTTTCACCCCCTTGGTTAAGTACATTCCTAGGTATTTTTTTGAAGCTAAAAGGGCTTGTGTTCTTAATTTGATTCTCAGCTTGGTTGTTGTTGGTGTATAGCAATGCTGCTGATTTGTGTACACTGATTTTGTAACCTGAGACTTTACTGAATTCATTTATCAAATCTAGGAGTCTTTTTTTTTATCTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTAGAGCGTAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAATCTCGGGTGATCCTCCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGAAATGAGCCACCACACCTGGCTGAAATCTAGGAATTTTTTGGAGAACTCTTGGGTTTTCTAGGTATATGATTATGTCATTGGTAAACAGCTATAGTTTGACTTCCTCTTTTCCAATTTGGATGCCAATGTGGGCTTCCTTGTCTTGTTCTAGTTCTCAGGGGGAGTGCTTTCAGCTTTTCCCCATTCAGTATGATATTGGCCGTGGGTTTGTCACATGACTTTTATTATTTTGAGGTAAGTCCCTTCTATGCCTAGTTTGTTGAGTGAAAAACTATTTTAATTTTTTTTTTTTGTATTTATTTGTGTGATGCTGTGAAGGAAAATGGAAAGGGAATACAATTTAATTTGTTGAGCTAATTAAGGCCTAAAAAGAAAGTAATCCTTAAACTTCATAACACATTAAAGGTTTTTATTTACTGAGCTTTAAATAGTTGGACTCCACCTCTATATTGACAAATAATGTATAGTGCTTAATACGACATTTTTTGGTCATACACTTTGAGGAAAGTCAGTCAACCATAATCACCTTGTTTATTCATAACTTTTTTACCACCTTATGGTATCTCATTAGACTATATCAGACTTTAAAGTACTTTTTACAATCTTCTATAAAATTCTGCTTTGTCTACAACACAGTCCTGACTCTAGCTTAAGCACAAAAGGATTTAGTATGAACCAATTCATACATTTAATACTTATTAAACTCCTGACATGCCAGGCATTGTTGTAGGTGCTGGTAATAAAGCAGTTTTTAAAAAGTCCTTATTCTCTTGAAGTTTACATTCTAGTGGGGTAAAGGGAATCAAAAGATGTTGGTAAGAGAAGTGAGAGAGGAATGCTATTTTTTTATAGCTTTGTCTACGAAAGCCTCTCTAATTTTGTGACATTTGAGCAAAGACCTGAAGGTATTAACATCATTTGCTCCAAACTGACCAAACTGTTCTTATTACTTATAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAGCATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAATGCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAGCCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATGAATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCACACAATTAAACAGCATGCATTGAACTGAAAAGATAACTGAGAAAATGAAAGCTCACTCTGGATTCCACACTGCACTGTTAATAACTCTCAGCAGGCAAAGACCGATTGCATAGGAATTGCACAATCCATGAACAGCATTAGAATTTACAGCAAGAACAGAAATAAAATACTATATAATTTAAATAATGTAAACGCAAACAGGGTTTGATAGCACTTAAACTAGTTCATTTCAAAATTAAGCTTTAGAATAATGCGCAATTTCATGTTATGCCTTAAGTCCAAAAAGGTAAACTTTGAAGATTGTTTGTATCTTTTTTTAAAAAACAAAACAAAACAAAAATCCCCAAAATATATAGAAATGATGGAGAAGGAAAAAGTGATGGTTTTTTTTGTCTTGCAAATGTTCTATGTTTTGAAATGTGGACACAACAAAGGCTGTTATTGCATTAGGTGTAAGTAAACTGGAGTTTATGTTAAATTACATTGATTGGAAAAGAATGAAAATTTCTTATTTTTCCATTGCTGTTCAATTTATAGTTTGAAGTGGGTTTTTGACTGCTTGTTTAATGAAGAAAAATGCTTGGGGTGGAAGGGACTCTTGAGATTTCACCAGAGACTTTTTCTTTTTAATAAATCAAACCTTTTGATGATTTGAGGTTTTATCTGCAGTTTTGGAAGCAGTCACAAATGAGACCTGTTATAAGGTGGTATTTTTTTTTTTCTTCTGGACAGTATTTAAAGGATCTTATTCTTATTTCCCAGGGAAATTCTGGGCTCCCACAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATCATAGAAAAAGAATGAGCAGGAATAGTTCTTATTCCAGAATTGTACAGTATTCACCTTAAGTTGATTTTTTTTCTCCTTCTGCAATTGAACTGAATACATTTTTCATGCATGTTTTCCAGAAAATAGAAGTATTAATGTTATTAAAAAGATTATTTTTTTTATTAAAGGCTATTTATATTATAGAAACTATCATTAATATATATTCTTTATTTACATGATCTGTCCCATAGTCATGCATTGTTTTGCACCCCAAATTTTTTATTGTTCATAGCAGCATGGTCAGCTTTCTTCTTGATCTATAGATGAGGCTCAGGCACTATCCCATTTATACCAATAACCAGTGTATAACTACTTAAGGAAAACATAAAAACTTCATCTTCTTTCCTTTTATTTCTTATGTGAATCTCCCGTCTTCCATTCTCTTTTATAATTGAGAATGTCTCAATCATATGAAATTAGTTACCAGAATTAACACAATTTAGACTATCTTCCTGATTCCTTAAACCCCTTTACTGAAGTATACTCATGAATAATACTTTAAAATATGGGGGAATAGAAACCATGAACTTTTTACCTTTTTAAACTATTTATCCATATCTCCAAAGTAGAACATTAAACCATTTTAAGATATGTCTCATTCCCAAGTAGTCAGAGCTCACTCTCCAACTTTATTAAATACTATTTGAGCACAGGACACATTCTTAAACATTTTGAAAAACATTAACCCAAGATGTAGAGGCTACTGCTAGTCGTCATTCTAGAATCTGATATTTTACTCTGTATTTGAAATGAATGATTAATGTCCTAGGAAATTAGCTTTAGCAGATGTCCAGGTGCCACATCAAAAAAGTGCAATAATTATTGACAGTTTTTTAGATTAGGCATATTATTGGAAAACAACTTTATAAAGAGTGAACATTGTATACTCTAGTAAAACAGCATCACTTTAAAAATATTCATTTATGAAATCTGTTACCTATAGTTGAAGTCTTGAGTAGTGAACAAGGGACTCTAATACCAATACTCTTAATATCTGGCTATTTTAGATCCCTTAAAGGGCATAATTATTGGAAATTTAGGTATTTCACTAAAGCATGTATATAATATTGCCAACAAGAAAAGTAAATTTGAAGATTAAGGGAACTTACTTCTGCAAACTGTCTTGCGATAGTTAAGCAGAATTTAAACTCTGTTTTAAGCAGGA
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Task1_train_7850
This mutation occurs in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; PIK3CA related overgrowth syndrome
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Task1_train_7851
Here is a variant affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Segmental undergrowth associated with mainly venous malformation with capillary component
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Task1_train_7852
Assess the clinical impact of this variant on gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), found on Chromosome 3. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_7853
Given a variant located on Chromosome 3 and affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
TAGATTTAAGTCTTCGATCCATCTTGAGTTGATTTTTGTATAAGGTGAGAGACAGGGATCCAGTTTCATTCTTTTACATGTGGCTAGCTAGTTTTCCCACCACCATTTATTAAACAGAATGTCCTTTCTCCAATTTATGTTTTTATATGTCTAAGATCAGTTCGTTGTAAGTTTTTGGCTTTATTTCTAGGTTCTCCATTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGCTTTTGTGTGTATCTGCTGTTTTGGTAATTATAGTTTCCTGGTATAATTTGAAGTCCAGTAATGTGATGCCTCCAGATTTGTTCTTTTTGCTTAGTCTTGCTTTGGCTATTCAGACTCTTTTTGGTCGGTTTTATATGAATTTTAGGATTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAAAATGATGGTGACAGTGTTTTGTAGTTTTCCTTGAAAAGATCTTTCACCCCCTTGGTTAAGTACATTCCTAGGTATTTTTTTGAAGCTAAAAGGGCTTGTGTTCTTAATTTGATTCTCAGCTTGGTTGTTGTTGGTGTATAGCAATGCTGCTGATTTGTGTACACTGATTTTGTAACCTGAGACTTTACTGAATTCATTTATCAAATCTAGGAGTCTTTTTTTTTATCTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTAGAGCGTAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAATCTCGGGTGATCCTCCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGAAATGAGCCACCACACCTGGCTGAAATCTAGGAATTTTTTGGAGAACTCTTGGGTTTTCTAGGTATATGATTATGTCATTGGTAAACAGCTATAGTTTGACTTCCTCTTTTCCAATTTGGATGCCAATGTGGGCTTCCTTGTCTTGTTCTAGTTCTCAGGGGGAGTGCTTTCAGCTTTTCCCCATTCAGTATGATATTGGCCGTGGGTTTGTCACATGACTTTTATTATTTTGAGGTAAGTCCCTTCTATGCCTAGTTTGTTGAGTGAAAAACTATTTTAATTTTTTTTTTTTGTATTTATTTGTGTGATGCTGTGAAGGAAAATGGAAAGGGAATACAATTTAATTTGTTGAGCTAATTAAGGCCTAAAAAGAAAGTAATCCTTAAACTTCATAACACATTAAAGGTTTTTATTTACTGAGCTTTAAATAGTTGGACTCCACCTCTATATTGACAAATAATGTATAGTGCTTAATACGACATTTTTTGGTCATACACTTTGAGGAAAGTCAGTCAACCATAATCACCTTGTTTATTCATAACTTTTTTACCACCTTATGGTATCTCATTAGACTATATCAGACTTTAAAGTACTTTTTACAATCTTCTATAAAATTCTGCTTTGTCTACAACACAGTCCTGACTCTAGCTTAAGCACAAAAGGATTTAGTATGAACCAATTCATACATTTAATACTTATTAAACTCCTGACATGCCAGGCATTGTTGTAGGTGCTGGTAATAAAGCAGTTTTTAAAAAGTCCTTATTCTCTTGAAGTTTACATTCTAGTGGGGTAAAGGGAATCAAAAGATGTTGGTAAGAGAAGTGAGAGAGGAATGCTATTTTTTTATAGCTTTGTCTACGAAAGCCTCTCTAATTTTGTGACATTTGAGCAAAGACCTGAAGGTATTAACATCATTTGCTCCAAACTGACCAAACTGTTCTTATTACTTATAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAGCATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAATGCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAGCCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATGAATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCACACAATTAAACAGCATGCATTGAACTGAAAAGATAACTGAGAAAATGAAAGCTCACTCTGGATTCCACACTGCACTGTTAATAACTCTCAGCAGGCAAAGACCGATTGCATAGGAATTGCACAATCCATGAACAGCATTAGAATTTACAGCAAGAACAGAAATAAAATACTATATAATTTAAATAATGTAAACGCAAACAGGGTTTGATAGCACTTAAACTAGTTCATTTCAAAATTAAGCTTTAGAATAATGCGCAATTTCATGTTATGCCTTAAGTCCAAAAAGGTAAACTTTGAAGATTGTTTGTATCTTTTTTTAAAAAACAAAACAAAACAAAAATCCCCAAAATATATAGAAATGATGGAGAAGGAAAAAGTGATGGTTTTTTTTGTCTTGCAAATGTTCTATGTTTTGAAATGTGGACACAACAAAGGCTGTTATTGCATTAGGTGTAAGTAAACTGGAGTTTATGTTAAATTACATTGATTGGAAAAGAATGAAAATTTCTTATTTTTCCATTGCTGTTCAATTTATAGTTTGAAGTGGGTTTTTGACTGCTTGTTTAATGAAGAAAAATGCTTGGGGTGGAAGGGACTCTTGAGATTTCACCAGAGACTTTTTCTTTTTAATAAATCAAACCTTTTGATGATTTGAGGTTTTATCTGCAGTTTTGGAAGCAGTCACAAATGAGACCTGTTATAAGGTGGTATTTTTTTTTTTCTTCTGGACAGTATTTAAAGGATCTTATTCTTATTTCCCAGGGAAATTCTGGGCTCCCACAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATCATAGAAAAAGAATGAGCAGGAATAGTTCTTATTCCAGAATTGTACAGTATTCACCTTAAGTTGATTTTTTTTCTCCTTCTGCAATTGAACTGAATACATTTTTCATGCATGTTTTCCAGAAAATAGAAGTATTAATGTTATTAAAAAGATTATTTTTTTTATTAAAGGCTATTTATATTATAGAAACTATCATTAATATATATTCTTTATTTACATGATCTGTCCCATAGTCATGCATTGTTTTGCACCCCAAATTTTTTATTGTTCATAGCAGCATGGTCAGCTTTCTTCTTGATCTATAGATGAGGCTCAGGCACTATCCCATTTATACCAATAACCAGTGTATAACTACTTAAGGAAAACATAAAAACTTCATCTTCTTTCCTTTTATTTCTTATGTGAATCTCCCGTCTTCCATTCTCTTTTATAATTGAGAATGTCTCAATCATATGAAATTAGTTACCAGAATTAACACAATTTAGACTATCTTCCTGATTCCTTAAACCCCTTTACTGAAGTATACTCATGAATAATACTTTAAAATATGGGGGAATAGAAACCATGAACTTTTTACCTTTTTAAACTATTTATCCATATCTCCAAAGTAGAACATTAAACCATTTTAAGATATGTCTCATTCCCAAGTAGTCAGAGCTCACTCTCCAACTTTATTAAATACTATTTGAGCACAGGACACATTCTTAAACATTTTGAAAAACATTAACCCAAGATGTAGAGGCTACTGCTAGTCGTCATTCTAGAATCTGATATTTTACTCTGTATTTGAAATGAATGATTAATGTCCTAGGAAATTAGCTTTAGCAGATGTCCAGGTGCCACATCAAAAAAGTGCAATAATTATTGACAGTTTTTTAGATTAGGCATATTATTGGAAAACAACTTTATAAAGAGTGAACATTGTATACTCTAGTAAAACAGCATCACTTTAAAAATATTCATTTATGAAATCTGTTACCTATAGTTGAAGTCTTGAGTAGTGAACAAGGGACTCTAATACCAATACTCTTAATATCTGGCTATTTTAGATCCCTTAAAGGGCATAATTATTGGAAATTTAGGTATTTCACTAAAGCATGTATATAATATTGCCAACAAGAAAAGTAAATTTGAAGATTAAGGGAACTTACTTCTGCAAACTGTCTTGCGATAGTTAAGCAGAATTTAAACTCTGTTTTAAGCAGGA
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Task1_train_7854
This genomic variant is located on Chromosome 3, within the PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Non-small cell lung carcinoma
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Task1_train_7855
This variant impacts the gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; CLOVES syndrome
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Task1_train_7856
Consider a variant on Chromosome 3 in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; PIK3CA overgrowth syndrome
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Task1_train_7857
A variant was discovered in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), Chromosome 3. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Congenital macrodactylia
TAGATTTAAGTCTTCGATCCATCTTGAGTTGATTTTTGTATAAGGTGAGAGACAGGGATCCAGTTTCATTCTTTTACATGTGGCTAGCTAGTTTTCCCACCACCATTTATTAAACAGAATGTCCTTTCTCCAATTTATGTTTTTATATGTCTAAGATCAGTTCGTTGTAAGTTTTTGGCTTTATTTCTAGGTTCTCCATTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGCTTTTGTGTGTATCTGCTGTTTTGGTAATTATAGTTTCCTGGTATAATTTGAAGTCCAGTAATGTGATGCCTCCAGATTTGTTCTTTTTGCTTAGTCTTGCTTTGGCTATTCAGACTCTTTTTGGTCGGTTTTATATGAATTTTAGGATTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAAAATGATGGTGACAGTGTTTTGTAGTTTTCCTTGAAAAGATCTTTCACCCCCTTGGTTAAGTACATTCCTAGGTATTTTTTTGAAGCTAAAAGGGCTTGTGTTCTTAATTTGATTCTCAGCTTGGTTGTTGTTGGTGTATAGCAATGCTGCTGATTTGTGTACACTGATTTTGTAACCTGAGACTTTACTGAATTCATTTATCAAATCTAGGAGTCTTTTTTTTTATCTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTAGAGCGTAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAATCTCGGGTGATCCTCCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGAAATGAGCCACCACACCTGGCTGAAATCTAGGAATTTTTTGGAGAACTCTTGGGTTTTCTAGGTATATGATTATGTCATTGGTAAACAGCTATAGTTTGACTTCCTCTTTTCCAATTTGGATGCCAATGTGGGCTTCCTTGTCTTGTTCTAGTTCTCAGGGGGAGTGCTTTCAGCTTTTCCCCATTCAGTATGATATTGGCCGTGGGTTTGTCACATGACTTTTATTATTTTGAGGTAAGTCCCTTCTATGCCTAGTTTGTTGAGTGAAAAACTATTTTAATTTTTTTTTTTTGTATTTATTTGTGTGATGCTGTGAAGGAAAATGGAAAGGGAATACAATTTAATTTGTTGAGCTAATTAAGGCCTAAAAAGAAAGTAATCCTTAAACTTCATAACACATTAAAGGTTTTTATTTACTGAGCTTTAAATAGTTGGACTCCACCTCTATATTGACAAATAATGTATAGTGCTTAATACGACATTTTTTGGTCATACACTTTGAGGAAAGTCAGTCAACCATAATCACCTTGTTTATTCATAACTTTTTTACCACCTTATGGTATCTCATTAGACTATATCAGACTTTAAAGTACTTTTTACAATCTTCTATAAAATTCTGCTTTGTCTACAACACAGTCCTGACTCTAGCTTAAGCACAAAAGGATTTAGTATGAACCAATTCATACATTTAATACTTATTAAACTCCTGACATGCCAGGCATTGTTGTAGGTGCTGGTAATAAAGCAGTTTTTAAAAAGTCCTTATTCTCTTGAAGTTTACATTCTAGTGGGGTAAAGGGAATCAAAAGATGTTGGTAAGAGAAGTGAGAGAGGAATGCTATTTTTTTATAGCTTTGTCTACGAAAGCCTCTCTAATTTTGTGACATTTGAGCAAAGACCTGAAGGTATTAACATCATTTGCTCCAAACTGACCAAACTGTTCTTATTACTTATAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAGCATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAATGCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAGCCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATGAATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCACACAATTAAACAGCATGCATTGAACTGAAAAGATAACTGAGAAAATGAAAGCTCACTCTGGATTCCACACTGCACTGTTAATAACTCTCAGCAGGCAAAGACCGATTGCATAGGAATTGCACAATCCATGAACAGCATTAGAATTTACAGCAAGAACAGAAATAAAATACTATATAATTTAAATAATGTAAACGCAAACAGGGTTTGATAGCACTTAAACTAGTTCATTTCAAAATTAAGCTTTAGAATAATGCGCAATTTCATGTTATGCCTTAAGTCCAAAAAGGTAAACTTTGAAGATTGTTTGTATCTTTTTTTAAAAAACAAAACAAAACAAAAATCCCCAAAATATATAGAAATGATGGAGAAGGAAAAAGTGATGGTTTTTTTTGTCTTGCAAATGTTCTATGTTTTGAAATGTGGACACAACAAAGGCTGTTATTGCATTAGGTGTAAGTAAACTGGAGTTTATGTTAAATTACATTGATTGGAAAAGAATGAAAATTTCTTATTTTTCCATTGCTGTTCAATTTATAGTTTGAAGTGGGTTTTTGACTGCTTGTTTAATGAAGAAAAATGCTTGGGGTGGAAGGGACTCTTGAGATTTCACCAGAGACTTTTTCTTTTTAATAAATCAAACCTTTTGATGATTTGAGGTTTTATCTGCAGTTTTGGAAGCAGTCACAAATGAGACCTGTTATAAGGTGGTATTTTTTTTTTTCTTCTGGACAGTATTTAAAGGATCTTATTCTTATTTCCCAGGGAAATTCTGGGCTCCCACAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATCATAGAAAAAGAATGAGCAGGAATAGTTCTTATTCCAGAATTGTACAGTATTCACCTTAAGTTGATTTTTTTTCTCCTTCTGCAATTGAACTGAATACATTTTTCATGCATGTTTTCCAGAAAATAGAAGTATTAATGTTATTAAAAAGATTATTTTTTTTATTAAAGGCTATTTATATTATAGAAACTATCATTAATATATATTCTTTATTTACATGATCTGTCCCATAGTCATGCATTGTTTTGCACCCCAAATTTTTTATTGTTCATAGCAGCATGGTCAGCTTTCTTCTTGATCTATAGATGAGGCTCAGGCACTATCCCATTTATACCAATAACCAGTGTATAACTACTTAAGGAAAACATAAAAACTTCATCTTCTTTCCTTTTATTTCTTATGTGAATCTCCCGTCTTCCATTCTCTTTTATAATTGAGAATGTCTCAATCATATGAAATTAGTTACCAGAATTAACACAATTTAGACTATCTTCCTGATTCCTTAAACCCCTTTACTGAAGTATACTCATGAATAATACTTTAAAATATGGGGGAATAGAAACCATGAACTTTTTACCTTTTTAAACTATTTATCCATATCTCCAAAGTAGAACATTAAACCATTTTAAGATATGTCTCATTCCCAAGTAGTCAGAGCTCACTCTCCAACTTTATTAAATACTATTTGAGCACAGGACACATTCTTAAACATTTTGAAAAACATTAACCCAAGATGTAGAGGCTACTGCTAGTCGTCATTCTAGAATCTGATATTTTACTCTGTATTTGAAATGAATGATTAATGTCCTAGGAAATTAGCTTTAGCAGATGTCCAGGTGCCACATCAAAAAAGTGCAATAATTATTGACAGTTTTTTAGATTAGGCATATTATTGGAAAACAACTTTATAAAGAGTGAACATTGTATACTCTAGTAAAACAGCATCACTTTAAAAATATTCATTTATGAAATCTGTTACCTATAGTTGAAGTCTTGAGTAGTGAACAAGGGACTCTAATACCAATACTCTTAATATCTGGCTATTTTAGATCCCTTAAAGGGCATAATTATTGGAAATTTAGGTATTTCACTAAAGCATGTATATAATATTGCCAACAAGAAAAGTAAATTTGAAGATTAAGGGAACTTACTTCTGCAAACTGTCTTGCGATAGTTAAGCAGAATTTAAACTCTGTTTTAAGCAGGA
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Task1_train_7858
This variant affects gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) located on Chromosome 3. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Hepatocellular carcinoma
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Task1_train_7859
This variant affects gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) located on Chromosome 3. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Familial cancer of breast
TAGATTTAAGTCTTCGATCCATCTTGAGTTGATTTTTGTATAAGGTGAGAGACAGGGATCCAGTTTCATTCTTTTACATGTGGCTAGCTAGTTTTCCCACCACCATTTATTAAACAGAATGTCCTTTCTCCAATTTATGTTTTTATATGTCTAAGATCAGTTCGTTGTAAGTTTTTGGCTTTATTTCTAGGTTCTCCATTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGCTTTTGTGTGTATCTGCTGTTTTGGTAATTATAGTTTCCTGGTATAATTTGAAGTCCAGTAATGTGATGCCTCCAGATTTGTTCTTTTTGCTTAGTCTTGCTTTGGCTATTCAGACTCTTTTTGGTCGGTTTTATATGAATTTTAGGATTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAAAATGATGGTGACAGTGTTTTGTAGTTTTCCTTGAAAAGATCTTTCACCCCCTTGGTTAAGTACATTCCTAGGTATTTTTTTGAAGCTAAAAGGGCTTGTGTTCTTAATTTGATTCTCAGCTTGGTTGTTGTTGGTGTATAGCAATGCTGCTGATTTGTGTACACTGATTTTGTAACCTGAGACTTTACTGAATTCATTTATCAAATCTAGGAGTCTTTTTTTTTATCTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTAGAGCGTAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAATCTCGGGTGATCCTCCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGAAATGAGCCACCACACCTGGCTGAAATCTAGGAATTTTTTGGAGAACTCTTGGGTTTTCTAGGTATATGATTATGTCATTGGTAAACAGCTATAGTTTGACTTCCTCTTTTCCAATTTGGATGCCAATGTGGGCTTCCTTGTCTTGTTCTAGTTCTCAGGGGGAGTGCTTTCAGCTTTTCCCCATTCAGTATGATATTGGCCGTGGGTTTGTCACATGACTTTTATTATTTTGAGGTAAGTCCCTTCTATGCCTAGTTTGTTGAGTGAAAAACTATTTTAATTTTTTTTTTTTGTATTTATTTGTGTGATGCTGTGAAGGAAAATGGAAAGGGAATACAATTTAATTTGTTGAGCTAATTAAGGCCTAAAAAGAAAGTAATCCTTAAACTTCATAACACATTAAAGGTTTTTATTTACTGAGCTTTAAATAGTTGGACTCCACCTCTATATTGACAAATAATGTATAGTGCTTAATACGACATTTTTTGGTCATACACTTTGAGGAAAGTCAGTCAACCATAATCACCTTGTTTATTCATAACTTTTTTACCACCTTATGGTATCTCATTAGACTATATCAGACTTTAAAGTACTTTTTACAATCTTCTATAAAATTCTGCTTTGTCTACAACACAGTCCTGACTCTAGCTTAAGCACAAAAGGATTTAGTATGAACCAATTCATACATTTAATACTTATTAAACTCCTGACATGCCAGGCATTGTTGTAGGTGCTGGTAATAAAGCAGTTTTTAAAAAGTCCTTATTCTCTTGAAGTTTACATTCTAGTGGGGTAAAGGGAATCAAAAGATGTTGGTAAGAGAAGTGAGAGAGGAATGCTATTTTTTTATAGCTTTGTCTACGAAAGCCTCTCTAATTTTGTGACATTTGAGCAAAGACCTGAAGGTATTAACATCATTTGCTCCAAACTGACCAAACTGTTCTTATTACTTATAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAGCATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAATGCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAGCCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATGAATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCACACAATTAAACAGCATGCATTGAACTGAAAAGATAACTGAGAAAATGAAAGCTCACTCTGGATTCCACACTGCACTGTTAATAACTCTCAGCAGGCAAAGACCGATTGCATAGGAATTGCACAATCCATGAACAGCATTAGAATTTACAGCAAGAACAGAAATAAAATACTATATAATTTAAATAATGTAAACGCAAACAGGGTTTGATAGCACTTAAACTAGTTCATTTCAAAATTAAGCTTTAGAATAATGCGCAATTTCATGTTATGCCTTAAGTCCAAAAAGGTAAACTTTGAAGATTGTTTGTATCTTTTTTTAAAAAACAAAACAAAACAAAAATCCCCAAAATATATAGAAATGATGGAGAAGGAAAAAGTGATGGTTTTTTTTGTCTTGCAAATGTTCTATGTTTTGAAATGTGGACACAACAAAGGCTGTTATTGCATTAGGTGTAAGTAAACTGGAGTTTATGTTAAATTACATTGATTGGAAAAGAATGAAAATTTCTTATTTTTCCATTGCTGTTCAATTTATAGTTTGAAGTGGGTTTTTGACTGCTTGTTTAATGAAGAAAAATGCTTGGGGTGGAAGGGACTCTTGAGATTTCACCAGAGACTTTTTCTTTTTAATAAATCAAACCTTTTGATGATTTGAGGTTTTATCTGCAGTTTTGGAAGCAGTCACAAATGAGACCTGTTATAAGGTGGTATTTTTTTTTTTCTTCTGGACAGTATTTAAAGGATCTTATTCTTATTTCCCAGGGAAATTCTGGGCTCCCACAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATCATAGAAAAAGAATGAGCAGGAATAGTTCTTATTCCAGAATTGTACAGTATTCACCTTAAGTTGATTTTTTTTCTCCTTCTGCAATTGAACTGAATACATTTTTCATGCATGTTTTCCAGAAAATAGAAGTATTAATGTTATTAAAAAGATTATTTTTTTTATTAAAGGCTATTTATATTATAGAAACTATCATTAATATATATTCTTTATTTACATGATCTGTCCCATAGTCATGCATTGTTTTGCACCCCAAATTTTTTATTGTTCATAGCAGCATGGTCAGCTTTCTTCTTGATCTATAGATGAGGCTCAGGCACTATCCCATTTATACCAATAACCAGTGTATAACTACTTAAGGAAAACATAAAAACTTCATCTTCTTTCCTTTTATTTCTTATGTGAATCTCCCGTCTTCCATTCTCTTTTATAATTGAGAATGTCTCAATCATATGAAATTAGTTACCAGAATTAACACAATTTAGACTATCTTCCTGATTCCTTAAACCCCTTTACTGAAGTATACTCATGAATAATACTTTAAAATATGGGGGAATAGAAACCATGAACTTTTTACCTTTTTAAACTATTTATCCATATCTCCAAAGTAGAACATTAAACCATTTTAAGATATGTCTCATTCCCAAGTAGTCAGAGCTCACTCTCCAACTTTATTAAATACTATTTGAGCACAGGACACATTCTTAAACATTTTGAAAAACATTAACCCAAGATGTAGAGGCTACTGCTAGTCGTCATTCTAGAATCTGATATTTTACTCTGTATTTGAAATGAATGATTAATGTCCTAGGAAATTAGCTTTAGCAGATGTCCAGGTGCCACATCAAAAAAGTGCAATAATTATTGACAGTTTTTTAGATTAGGCATATTATTGGAAAACAACTTTATAAAGAGTGAACATTGTATACTCTAGTAAAACAGCATCACTTTAAAAATATTCATTTATGAAATCTGTTACCTATAGTTGAAGTCTTGAGTAGTGAACAAGGGACTCTAATACCAATACTCTTAATATCTGGCTATTTTAGATCCCTTAAAGGGCATAATTATTGGAAATTTAGGTATTTCACTAAAGCATGTATATAATATTGCCAACAAGAAAAGTAAATTTGAAGATTAAGGGAACTTACTTCTGCAAACTGTCTTGCGATAGTTAAGCAGAATTTAAACTCTGTTTTAAGCAGGA
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Task1_train_7860
Here is a variant affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Seborrheic keratosis
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Task1_train_7861
This mutation occurs in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Neoplasm of stomach
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Task1_train_7862
An alteration has been detected in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
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Task1_train_7863
Chromosome 3 houses a mutation in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Lung carcinoma
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Task1_train_7864
The following genetic variant occurs in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Epidermal nevus
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Task1_train_7865
The gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), on Chromosome 3, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Ovarian neoplasm
TAGATTTAAGTCTTCGATCCATCTTGAGTTGATTTTTGTATAAGGTGAGAGACAGGGATCCAGTTTCATTCTTTTACATGTGGCTAGCTAGTTTTCCCACCACCATTTATTAAACAGAATGTCCTTTCTCCAATTTATGTTTTTATATGTCTAAGATCAGTTCGTTGTAAGTTTTTGGCTTTATTTCTAGGTTCTCCATTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGCTTTTGTGTGTATCTGCTGTTTTGGTAATTATAGTTTCCTGGTATAATTTGAAGTCCAGTAATGTGATGCCTCCAGATTTGTTCTTTTTGCTTAGTCTTGCTTTGGCTATTCAGACTCTTTTTGGTCGGTTTTATATGAATTTTAGGATTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAAAATGATGGTGACAGTGTTTTGTAGTTTTCCTTGAAAAGATCTTTCACCCCCTTGGTTAAGTACATTCCTAGGTATTTTTTTGAAGCTAAAAGGGCTTGTGTTCTTAATTTGATTCTCAGCTTGGTTGTTGTTGGTGTATAGCAATGCTGCTGATTTGTGTACACTGATTTTGTAACCTGAGACTTTACTGAATTCATTTATCAAATCTAGGAGTCTTTTTTTTTATCTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTAGAGCGTAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAATCTCGGGTGATCCTCCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGAAATGAGCCACCACACCTGGCTGAAATCTAGGAATTTTTTGGAGAACTCTTGGGTTTTCTAGGTATATGATTATGTCATTGGTAAACAGCTATAGTTTGACTTCCTCTTTTCCAATTTGGATGCCAATGTGGGCTTCCTTGTCTTGTTCTAGTTCTCAGGGGGAGTGCTTTCAGCTTTTCCCCATTCAGTATGATATTGGCCGTGGGTTTGTCACATGACTTTTATTATTTTGAGGTAAGTCCCTTCTATGCCTAGTTTGTTGAGTGAAAAACTATTTTAATTTTTTTTTTTTGTATTTATTTGTGTGATGCTGTGAAGGAAAATGGAAAGGGAATACAATTTAATTTGTTGAGCTAATTAAGGCCTAAAAAGAAAGTAATCCTTAAACTTCATAACACATTAAAGGTTTTTATTTACTGAGCTTTAAATAGTTGGACTCCACCTCTATATTGACAAATAATGTATAGTGCTTAATACGACATTTTTTGGTCATACACTTTGAGGAAAGTCAGTCAACCATAATCACCTTGTTTATTCATAACTTTTTTACCACCTTATGGTATCTCATTAGACTATATCAGACTTTAAAGTACTTTTTACAATCTTCTATAAAATTCTGCTTTGTCTACAACACAGTCCTGACTCTAGCTTAAGCACAAAAGGATTTAGTATGAACCAATTCATACATTTAATACTTATTAAACTCCTGACATGCCAGGCATTGTTGTAGGTGCTGGTAATAAAGCAGTTTTTAAAAAGTCCTTATTCTCTTGAAGTTTACATTCTAGTGGGGTAAAGGGAATCAAAAGATGTTGGTAAGAGAAGTGAGAGAGGAATGCTATTTTTTTATAGCTTTGTCTACGAAAGCCTCTCTAATTTTGTGACATTTGAGCAAAGACCTGAAGGTATTAACATCATTTGCTCCAAACTGACCAAACTGTTCTTATTACTTATAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAGCATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAATGCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAGCCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATGAATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCACACAATTAAACAGCATGCATTGAACTGAAAAGATAACTGAGAAAATGAAAGCTCACTCTGGATTCCACACTGCACTGTTAATAACTCTCAGCAGGCAAAGACCGATTGCATAGGAATTGCACAATCCATGAACAGCATTAGAATTTACAGCAAGAACAGAAATAAAATACTATATAATTTAAATAATGTAAACGCAAACAGGGTTTGATAGCACTTAAACTAGTTCATTTCAAAATTAAGCTTTAGAATAATGCGCAATTTCATGTTATGCCTTAAGTCCAAAAAGGTAAACTTTGAAGATTGTTTGTATCTTTTTTTAAAAAACAAAACAAAACAAAAATCCCCAAAATATATAGAAATGATGGAGAAGGAAAAAGTGATGGTTTTTTTTGTCTTGCAAATGTTCTATGTTTTGAAATGTGGACACAACAAAGGCTGTTATTGCATTAGGTGTAAGTAAACTGGAGTTTATGTTAAATTACATTGATTGGAAAAGAATGAAAATTTCTTATTTTTCCATTGCTGTTCAATTTATAGTTTGAAGTGGGTTTTTGACTGCTTGTTTAATGAAGAAAAATGCTTGGGGTGGAAGGGACTCTTGAGATTTCACCAGAGACTTTTTCTTTTTAATAAATCAAACCTTTTGATGATTTGAGGTTTTATCTGCAGTTTTGGAAGCAGTCACAAATGAGACCTGTTATAAGGTGGTATTTTTTTTTTTCTTCTGGACAGTATTTAAAGGATCTTATTCTTATTTCCCAGGGAAATTCTGGGCTCCCACAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATCATAGAAAAAGAATGAGCAGGAATAGTTCTTATTCCAGAATTGTACAGTATTCACCTTAAGTTGATTTTTTTTCTCCTTCTGCAATTGAACTGAATACATTTTTCATGCATGTTTTCCAGAAAATAGAAGTATTAATGTTATTAAAAAGATTATTTTTTTTATTAAAGGCTATTTATATTATAGAAACTATCATTAATATATATTCTTTATTTACATGATCTGTCCCATAGTCATGCATTGTTTTGCACCCCAAATTTTTTATTGTTCATAGCAGCATGGTCAGCTTTCTTCTTGATCTATAGATGAGGCTCAGGCACTATCCCATTTATACCAATAACCAGTGTATAACTACTTAAGGAAAACATAAAAACTTCATCTTCTTTCCTTTTATTTCTTATGTGAATCTCCCGTCTTCCATTCTCTTTTATAATTGAGAATGTCTCAATCATATGAAATTAGTTACCAGAATTAACACAATTTAGACTATCTTCCTGATTCCTTAAACCCCTTTACTGAAGTATACTCATGAATAATACTTTAAAATATGGGGGAATAGAAACCATGAACTTTTTACCTTTTTAAACTATTTATCCATATCTCCAAAGTAGAACATTAAACCATTTTAAGATATGTCTCATTCCCAAGTAGTCAGAGCTCACTCTCCAACTTTATTAAATACTATTTGAGCACAGGACACATTCTTAAACATTTTGAAAAACATTAACCCAAGATGTAGAGGCTACTGCTAGTCGTCATTCTAGAATCTGATATTTTACTCTGTATTTGAAATGAATGATTAATGTCCTAGGAAATTAGCTTTAGCAGATGTCCAGGTGCCACATCAAAAAAGTGCAATAATTATTGACAGTTTTTTAGATTAGGCATATTATTGGAAAACAACTTTATAAAGAGTGAACATTGTATACTCTAGTAAAACAGCATCACTTTAAAAATATTCATTTATGAAATCTGTTACCTATAGTTGAAGTCTTGAGTAGTGAACAAGGGACTCTAATACCAATACTCTTAATATCTGGCTATTTTAGATCCCTTAAAGGGCATAATTATTGGAAATTTAGGTATTTCACTAAAGCATGTATATAATATTGCCAACAAGAAAAGTAAATTTGAAGATTAAGGGAACTTACTTCTGCAAACTGTCTTGCGATAGTTAAGCAGAATTTAAACTCTGTTTTAAGCAGGA
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Task1_train_7866
This genomic variant is located on Chromosome 3, within the PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Carcinoma of colon
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Task1_train_7867
A mutation found in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Cowden syndrome 5
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Task1_train_7868
A variant was discovered on Chromosome 3, affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; CLAPO syndrome
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Task1_train_7869
Given this variant in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; CLOVES syndrome
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Task1_train_7870
This gene mutation involves PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Overgrowth syndrome and/or cerebral malformations due to abnormalities in MTOR pathway genes
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Task1_train_7871
A genomic change on Chromosome 3 affects PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Neoplasm
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Task1_train_7872
This sequence change occurs on Chromosome 3, altering PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Hemihypertrophy
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Task1_train_7873
Gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
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Task1_train_7874
This genomic variant is located on Chromosome 3, within the PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_7875
The variant affects gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), which is on Chromosome 3. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Colorectal cancer
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Task1_train_7876
A mutation on Chromosome 3 affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Cowden syndrome 1
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Task1_train_7877
Here is a variant affecting PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Stroke disorder
AGATTTAAGTCTTCGATCCATCTTGAGTTGATTTTTGTATAAGGTGAGAGACAGGGATCCAGTTTCATTCTTTTACATGTGGCTAGCTAGTTTTCCCACCACCATTTATTAAACAGAATGTCCTTTCTCCAATTTATGTTTTTATATGTCTAAGATCAGTTCGTTGTAAGTTTTTGGCTTTATTTCTAGGTTCTCCATTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGCTTTTGTGTGTATCTGCTGTTTTGGTAATTATAGTTTCCTGGTATAATTTGAAGTCCAGTAATGTGATGCCTCCAGATTTGTTCTTTTTGCTTAGTCTTGCTTTGGCTATTCAGACTCTTTTTGGTCGGTTTTATATGAATTTTAGGATTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAAAATGATGGTGACAGTGTTTTGTAGTTTTCCTTGAAAAGATCTTTCACCCCCTTGGTTAAGTACATTCCTAGGTATTTTTTTGAAGCTAAAAGGGCTTGTGTTCTTAATTTGATTCTCAGCTTGGTTGTTGTTGGTGTATAGCAATGCTGCTGATTTGTGTACACTGATTTTGTAACCTGAGACTTTACTGAATTCATTTATCAAATCTAGGAGTCTTTTTTTTTATCTTTTTTAAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTAGAGCGTAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAATCTCGGGTGATCCTCCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGAAATGAGCCACCACACCTGGCTGAAATCTAGGAATTTTTTGGAGAACTCTTGGGTTTTCTAGGTATATGATTATGTCATTGGTAAACAGCTATAGTTTGACTTCCTCTTTTCCAATTTGGATGCCAATGTGGGCTTCCTTGTCTTGTTCTAGTTCTCAGGGGGAGTGCTTTCAGCTTTTCCCCATTCAGTATGATATTGGCCGTGGGTTTGTCACATGACTTTTATTATTTTGAGGTAAGTCCCTTCTATGCCTAGTTTGTTGAGTGAAAAACTATTTTAATTTTTTTTTTTTGTATTTATTTGTGTGATGCTGTGAAGGAAAATGGAAAGGGAATACAATTTAATTTGTTGAGCTAATTAAGGCCTAAAAAGAAAGTAATCCTTAAACTTCATAACACATTAAAGGTTTTTATTTACTGAGCTTTAAATAGTTGGACTCCACCTCTATATTGACAAATAATGTATAGTGCTTAATACGACATTTTTTGGTCATACACTTTGAGGAAAGTCAGTCAACCATAATCACCTTGTTTATTCATAACTTTTTTACCACCTTATGGTATCTCATTAGACTATATCAGACTTTAAAGTACTTTTTACAATCTTCTATAAAATTCTGCTTTGTCTACAACACAGTCCTGACTCTAGCTTAAGCACAAAAGGATTTAGTATGAACCAATTCATACATTTAATACTTATTAAACTCCTGACATGCCAGGCATTGTTGTAGGTGCTGGTAATAAAGCAGTTTTTAAAAAGTCCTTATTCTCTTGAAGTTTACATTCTAGTGGGGTAAAGGGAATCAAAAGATGTTGGTAAGAGAAGTGAGAGAGGAATGCTATTTTTTTATAGCTTTGTCTACGAAAGCCTCTCTAATTTTGTGACATTTGAGCAAAGACCTGAAGGTATTAACATCATTTGCTCCAAACTGACCAAACTGTTCTTATTACTTATAGGTTTCAGGAGATGTGTTACAAGGCTTATCTAGCTATTCGACAGCATGCCAATCTCTTCATAAATCTTTTCTCAATGATGCTTGGCTCTGGAATGCCAGAACTACAATCTTTTGATGACATTGCATACATTCGAAAGACCCTAGCCTTAGATAAAACTGAGCAAGAGGCTTTGGAGTATTTCATGAAACAAATGAATGATGCACATCATGGTGGCTGGACAACAAAAATGGATTGGATCTTCCACACAATTAAACAGCATGCATTGAACTGAAAAGATAACTGAGAAAATGAAAGCTCACTCTGGATTCCACACTGCACTGTTAATAACTCTCAGCAGGCAAAGACCGATTGCATAGGAATTGCACAATCCATGAACAGCATTAGAATTTACAGCAAGAACAGAAATAAAATACTATATAATTTAAATAATGTAAACGCAAACAGGGTTTGATAGCACTTAAACTAGTTCATTTCAAAATTAAGCTTTAGAATAATGCGCAATTTCATGTTATGCCTTAAGTCCAAAAAGGTAAACTTTGAAGATTGTTTGTATCTTTTTTTAAAAAACAAAACAAAACAAAAATCCCCAAAATATATAGAAATGATGGAGAAGGAAAAAGTGATGGTTTTTTTTGTCTTGCAAATGTTCTATGTTTTGAAATGTGGACACAACAAAGGCTGTTATTGCATTAGGTGTAAGTAAACTGGAGTTTATGTTAAATTACATTGATTGGAAAAGAATGAAAATTTCTTATTTTTCCATTGCTGTTCAATTTATAGTTTGAAGTGGGTTTTTGACTGCTTGTTTAATGAAGAAAAATGCTTGGGGTGGAAGGGACTCTTGAGATTTCACCAGAGACTTTTTCTTTTTAATAAATCAAACCTTTTGATGATTTGAGGTTTTATCTGCAGTTTTGGAAGCAGTCACAAATGAGACCTGTTATAAGGTGGTATTTTTTTTTTTCTTCTGGACAGTATTTAAAGGATCTTATTCTTATTTCCCAGGGAAATTCTGGGCTCCCACAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATCATAGAAAAAGAATGAGCAGGAATAGTTCTTATTCCAGAATTGTACAGTATTCACCTTAAGTTGATTTTTTTTCTCCTTCTGCAATTGAACTGAATACATTTTTCATGCATGTTTTCCAGAAAATAGAAGTATTAATGTTATTAAAAAGATTATTTTTTTTATTAAAGGCTATTTATATTATAGAAACTATCATTAATATATATTCTTTATTTACATGATCTGTCCCATAGTCATGCATTGTTTTGCACCCCAAATTTTTTATTGTTCATAGCAGCATGGTCAGCTTTCTTCTTGATCTATAGATGAGGCTCAGGCACTATCCCATTTATACCAATAACCAGTGTATAACTACTTAAGGAAAACATAAAAACTTCATCTTCTTTCCTTTTATTTCTTATGTGAATCTCCCGTCTTCCATTCTCTTTTATAATTGAGAATGTCTCAATCATATGAAATTAGTTACCAGAATTAACACAATTTAGACTATCTTCCTGATTCCTTAAACCCCTTTACTGAAGTATACTCATGAATAATACTTTAAAATATGGGGGAATAGAAACCATGAACTTTTTACCTTTTTAAACTATTTATCCATATCTCCAAAGTAGAACATTAAACCATTTTAAGATATGTCTCATTCCCAAGTAGTCAGAGCTCACTCTCCAACTTTATTAAATACTATTTGAGCACAGGACACATTCTTAAACATTTTGAAAAACATTAACCCAAGATGTAGAGGCTACTGCTAGTCGTCATTCTAGAATCTGATATTTTACTCTGTATTTGAAATGAATGATTAATGTCCTAGGAAATTAGCTTTAGCAGATGTCCAGGTGCCACATCAAAAAAGTGCAATAATTATTGACAGTTTTTTAGATTAGGCATATTATTGGAAAACAACTTTATAAAGAGTGAACATTGTATACTCTAGTAAAACAGCATCACTTTAAAAATATTCATTTATGAAATCTGTTACCTATAGTTGAAGTCTTGAGTAGTGAACAAGGGACTCTAATACCAATACTCTTAATATCTGGCTATTTTAGATCCCTTAAAGGGCATAATTATTGGAAATTTAGGTATTTCACTAAAGCATGTATATAATATTGCCAACAAGAAAAGTAAATTTGAAGATTAAGGGAACTTACTTCTGCAAACTGTCTTGCGATAGTTAAGCAGAATTTAAACTCTGTTTTAAGCAGGAA
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Task1_train_7878
This alteration in PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha) on Chromosome 3 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Macrodactyly of toe
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Task1_train_7879
With a mutation on Chromosome 3 in gene PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Neoplasm
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Task1_train_7880
This sequence change occurs on Chromosome 3, altering PIK3CA (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome
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Task1_train_7881
Here is a genetic alteration in GNB4 (G protein subunit beta 4) on Chromosome 3. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease dominant intermediate F
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Task1_train_7882
The gene CCDC39 (coiled-coil domain 39 molecular ruler complex subunit) on Chromosome 3 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Primary ciliary dyskinesia 14
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Task1_train_7883
This variant impacts the gene LOC108281177, SOX2, SOX2-OT (SOX2 5' regulatory region| SRY-box transcription factor 2| SOX2 overlapping transcript) on Chromosome 3. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Anophthalmia/microphthalmia-esophageal atresia syndrome
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Task1_train_7884
Here is a variant affecting LOC108281177, SOX2, SOX2-OT (SOX2 5' regulatory region| SRY-box transcription factor 2| SOX2 overlapping transcript) on Chromosome 3. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Anophthalmia/microphthalmia-esophageal atresia syndrome
GTAGCGACAACAAGAGAAACAAAACTACCTATTTGTAACGGACGTGCTGCCATTGCCCTCCGCATTGAGCGCCTACCTATTGAAATCTTTACGTCGGGACAATGGGAGAGCGGCTAAAATTACCCTCTTGGGTCCTGGGCGGGCAAGATTCCTGAGCCCCTACCCCCGCCCCCATCTCATCCTCCTCTAACCCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAATGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATACCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGT
GTAGCGACAACAAGAGAAACAAAACTACCTATTTGTAACGGACGTGCTGCCATTGCCCTCCGCATTGAGCGCCTACCTATTGAAATCTTTACGTCGGGACAATGGGAGAGCGGCTAAAATTACCCTCTTGGGTCCTGGGCGGGCAAGATTCCTGAGCCCCTACCCCCGCCCCCATCTCATCCTCCTCTAACCCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAAGGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATACCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGT
Task1_train_7885
This variant affects gene LOC108281177, SOX2, SOX2-OT (SOX2 5' regulatory region| SRY-box transcription factor 2| SOX2 overlapping transcript) located on Chromosome 3. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Anophthalmia/microphthalmia-esophageal atresia syndrome
CTATTTGTAACGGACGTGCTGCCATTGCCCTCCGCATTGAGCGCCTACCTATTGAAATCTTTACGTCGGGACAATGGGAGAGCGGCTAAAATTACCCTCTTGGGTCCTGGGCGGGCAAGATTCCTGAGCCCCTACCCCCGCCCCCATCTCATCCTCCTCTAACCCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAATGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATACCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGTATTACTAGTCCAGCATCATGTGCTAATG
CTATTTGTAACGGACGTGCTGCCATTGCCCTCCGCATTGAGCGCCTACCTATTGAAATCTTTACGTCGGGACAATGGGAGAGCGGCTAAAATTACCCTCTTGGGTCCTGGGCGGGCAAGATTCCTGAGCCCCTACCCCCGCCCCCATCTCATCCTCCTCTAACCCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAATGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGGGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATACCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGTATTACTAGTCCAGCATCATGTGCTAATG
Task1_train_7886
Given a variant located on Chromosome 3 and affecting LOC108281177, SOX2, SOX2-OT (SOX2 5' regulatory region| SRY-box transcription factor 2| SOX2 overlapping transcript), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Anophthalmia/microphthalmia-esophageal atresia syndrome
AATCTTTACGTCGGGACAATGGGAGAGCGGCTAAAATTACCCTCTTGGGTCCTGGGCGGGCAAGATTCCTGAGCCCCTACCCCCGCCCCCATCTCATCCTCCTCTAACCCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAATGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATACCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGTATTACTAGTCCAGCATCATGTGCTAATGTTAACTGCAAAAAAGAAACGGCTGGATGATTAATAAGTACTGGAAAAATTGAAAT
AATCTTTACGTCGGGACAATGGGAGAGCGGCTAAAATTACCCTCTTGGGTCCTGGGCGGGCAAGATTCCTGAGCCCCTACCCCCGCCCCCATCTCATCCTCCTCTAACCCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAATGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCCCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATACCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGTATTACTAGTCCAGCATCATGTGCTAATGTTAACTGCAAAAAAGAAACGGCTGGATGATTAATAAGTACTGGAAAAATTGAAAT
Task1_train_7887
This sequence variant lies in LOC108281177, SOX2, SOX2-OT (SOX2 5' regulatory region| SRY-box transcription factor 2| SOX2 overlapping transcript) on Chromosome 3. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Anophthalmia/microphthalmia-esophageal atresia syndrome
TGAGCCCCTACCCCCGCCCCCATCTCATCCTCCTCTAACCCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAATGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATACCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGTATTACTAGTCCAGCATCATGTGCTAATGTTAACTGCAAAAAAGAAACGGCTGGATGATTAATAAGTACTGGAAAAATTGAAATTTCTGTCATTTCTAAAATAGAAACTAGAGACATATATTGTAAATCCGCCCCCTCCTTTTCTAAGCAGCA
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Task1_train_7888
A genetic alteration is present in LOC108281177, SOX2, SOX2-OT (SOX2 5' regulatory region| SRY-box transcription factor 2| SOX2 overlapping transcript) on Chromosome 3. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Anophthalmia/microphthalmia-esophageal atresia syndrome
CCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAATGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATACCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGTATTACTAGTCCAGCATCATGTGCTAATGTTAACTGCAAAAAAGAAACGGCTGGATGATTAATAAGTACTGGAAAAATTGAAATTTCTGTCATTTCTAAAATAGAAACTAGAGACATATATTGTAAATCCGCCCCCTCCTTTTCTAAGCAGCATGAATAAGCATGATGGGGACCTATACTTAAAACTGATTT
CCGGGCCTTGCTGGGCTCCCCCTTCCCCAGTCCCGGCCGCCTTCTCCCAGTGTGCGCTGCCTGCACCTGTGCCTGGAGAGCATCGACCCCGCCTCCCAGGCCTTGAGCCCCTTTGCGGCGCAGCCCCAGCCTTGCGCGGCCTGGGCTTTGCGGCCACCACAATGGAAATCTACGGGGAAAATGCCAGGGCTGGTTCTGCTGGAGTCCTGGGAACTCTGCGTGGGAGGGAGTTTGTGACTGCGGCCCAAAAGCCACCTCCATACAGTGCCGTGGGATGCCAGGAAGTTGAAATCACCCTCCCCCATCGCCTGCACTTTTGAGCGCCCTTCCGTCTGTGTCTTTCCCCAGCCCCCATTTGAAAGCCGCACGACCGAAACCCTTCTTACGGGGAGGCATGGGATGGGAATGGGGAGTGGGGGCAGACAGTAGAAGCATCCCCTTTGCTACGGTTGAATGAAGACAGTCTAGTGGGAGATGTGGCTGGGGCTAAGAGGAAGAGCTGCAGTTTCCTGGGCCAAAGAGCTGAGTTGGACAGGGAGATGGCAGCTTACCAAGGCCTGCTGGTTCTCAGCTCTAGAGTCTGCCTTATGGTCCGAGCAGGATTTATTTTTAAGAACAGAGCAAGTTACGTGGAAGCAAGGAAGGTTTTGAGGACAGAGGTTTGGGTCTCCTAACTTCTAGTCGGGACTGTGAGAAGGGCGTGAGAGAGTGTTGGCACCTGTAAGGTAAGAGAGGAGAGCGGAAGAGCGCAGTACGGGAGCGGCACCAGAGGGGCTGGAGTTGGGGGGGAGTGCTGTGGATGAGCGGGAGAACAATGACACACCAACTCCTGCACTGGCTGTTTCCAGAAATACGAGTTGGACAGCCGCCCTGAGCCACCCACTGTGCCCTGCCCCACCCCCGCACCTTAGCTGCTTCCCGCGTCCCATCCTCATTTAAGTACCCTGCACCAAAAAGTAAATCAATATTAAGTTTAAAGAAAAAAAAACCCACGTAGTCTTAGTGCTGTTTACCCACTTCCTTCGAAAAGGCGTGTGGTGTGACCTGTTGCTGCGAGAGGGGATACAAAGGTTTCTCAGTGGCTGGCAGGCTGGCTCTGGGAGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCTGCCCCCTCCTCCCCCGGCCTCCCCCGCGCGGCCGGCGGCGCGGGAGGCCCCGCCCCCTTTCATGCAAAACCCGGCAGCGAGGCTGGGCTCGAGTGGAGGAGCCGCCGCGCGCTGATTGGTCGCTAGAAACCCATTTATTCCCTGACAGCCCCCGTCACATGGATGGTTGTCTATTAACTTGTTCAAAAAAGTATCAGGAGTTGTCAAGGCAGAGAAGAGAGTGTTTGCAAAAGGGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTCTTTAAGACTAGGACTGAGAGAAAGAAGAGGAGAGAGAAAGAAAGGGAGAGAAGTTTGAGCCCCAGGCTTAAGCCTTTCCAAAAAATAATAATAACAATCATCGGCGGCGGCAGGATCGGCCAGAGGAGGAGGGAAGCGCTTTTTTTGATCCTGATTCCAGTTTGCCTCTCTCTTTTTTTCCCCCAAATTATTCTTCGCCTGATTTTCCTCGCGGAGCCCTGCGCTCCCGACACCCCCGCCCGCCTCCCCTCCTCCTCTCCCCCCGCCCGCGGGCCCCCCAAAGTCCCGGCCGGGCCGAGGGTCGGCGGCCGCCGGCGGGCCGGGCCCGCGCACAGCGCCCGCATGTACAACATGATGGAGACGGAGCTGAAGCCGCCGGGCCCGCAGCAAACTTCGGGGGGCGGCGGCGGCAACTCCACCGCGGCGGCGGCCGGCGGCAACCAGAAAAACAGCCCGGACCGCGTCAAGCGGCCCATGAATGCCTTCATGGTGTGGTCCCGCGGGCAGCGGCGCAAGATGGCCCAGGAGAACCCCAAGATGCACAACTCGGAGATCAGCAAGCGCCTGGGCGCCGAGTGGAAACTTTTGTCGGAGACGGAGAAGCGGCCGTTCATCGACGAGGCTAAGCGGCTGCGAGCGCTGCACATGAAGGAGCACCCGGATTATAAATCCCGGCCCCGGCGGAAAACCAAGACGCTCATGAAGAAGGATAAGTACACGCTGCCCGGCGGGCTGCTGGCCCCCGGCGGCAATAGCATGGCGAGCGGGGTCGGGGTGGGCGCCGGCCTGGGCGCGGGCGTGAACCAGCGCATGGACAGTTACGCGCACATGAACGGCTGGAGCAACGGCAGCTACAGCATGATGCAGGACCAGCTGGGCTACCCGCAGCACCCGGGCCTCAATGCGCACGGCGCAGCGCAGATGCAGCCCATGCACCGCTACGACGTGAGCGCCCTGCAGTACAACTCCATGACCAGCTCGCAGACCTACATGAACGGCTCGCCCACCTACAGCATGTCCTACTCGCAGCAGGGCACCCCTGGCATGGCTCTTGGCTCCATGGGTTCGGTGGTCAAGTCCGAGGCCAGCTCCAGCCCCCCTGTGGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAGGGCGCCCTGCCAGGCCGGGGACCTCCGGGACATGATCAGCATGTATCTCCCCGGCGCCGAGGTGCCGGAACCCGCCGCCCCCAGCAGACTTCACATGTCCCAGCACTACCAGAGCGGCCCGGTGCCCGGCACGGCCATTAACGGCACACTGCCCCTCTCACACATGTGAGGGCCGGACAGCGAACTGGAGGGGGGAGAAATTTTCAAAGAAAAACGAGGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGGAGAGTAAGAAACAGCATGGAGAAAACCCGGTACGCTCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAATCCCATCACCCACAGCAAATGACAGCTGCAAAAGAGAACACCAATCCCATCCACACTCACGCAAAAACCGCGATGCCGACAAGAAAACTTTTATGAGAGAGATCCTGGACTTCTTTTTGGGGGACTATTTTTGTACAGAGAAAACCTGGGGAGGGTGGGGAGGGCGGGGGAATGGACCTTGTATAGATCTGGAGGAAAGAAAGCTACGAAAAACTTTTTAAAAGTTCTAGTGGTACGGTAGGAGCTTTGCAGGAAGTTTGCAAAAGTCTTTACCAATAATATTTAGAGCTAGTCTCCAAGCGACGAAAAAAATGTTTTAATATTTGCAAGCAACTTTTGTACAGTATTTATCGAGATAAACATGGCAATCAAAATGTCCATTGTTTATAAGCTGAGAATTTGCCAATATTTTTCAAGGAGAGGCTTCTTGCTGAATTTTGATTCTGCAGCTGAAATTTAGGACAGTTGCAAACGTGAAAAGAAGAAAATTATTCAAATTTGGACATTTTAATTGTTTAAAAATTGTACAAAAGGAAAAAATTAGAATAAGTACTGGCGAACCATCTCTGTGGTCTTGTTTAAAAAGGGCAAAAGTTTTAGACTGTACTAAATTTTATAACTTACTGTTAAAAGCAAAAATGGCCATGCAGGTTGACACCGTTGGTAATTTATAATAGCTTTTGTTCGATCCCAACTTTCCATTTTGTTCAGATAAAAAAAACCATGAAATTACTGTGTTTGAAATATTTTCTTATGGTTTGTAATATTTCTGTAAATTTATTGTGATATTTTAAGGTTTTCCCCCCTTTATTTTCCGTAGTTGTATTTTAAAAGATTCGGCTCTGTATTATTTGAATCAGTCTGCCGAGAATCCATGTATATATTTGAACTAATATCATCCTTATAACAGGTACATTTTCAACTTAAGTTTTTACTCCATTATGCACAGTTTGAGATAAATAAATTTTTGAAATATGGACACTGAAATTATTCTTGAGTCTTTCATTTATTTGGATAACACTGTGATTATACATAACTTTTCGGGGAATTATAATACTGTGCTCAGCCAAGAAAGCAAAATACCAAAAACCTTGGTATTACTAGTCCAGCATCATGTGCTAATGTTAACTGCAAAAAAGAAACGGCTGGATGATTAATAAGTACTGGAAAAATTGAAATTTCTGTCATTTCTAAAATAGAAACTAGAGACATATATTGTAAATCCGCCCCCTCCTTTTCTAAGCAGCATGAATAAGCATGATGGGGACCTATACTTAAAACTGATTT
Task1_train_7889
Here is a variant affecting MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1) on Chromosome 3. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 deficiency
TTATTAGCATTTTTTGGAGACTTAGCTATGTATCATTTTCTGAAAGCTCTTACATACAGACTTGGATTATTTTCATAGAATACTGCCAAAAGGGTGTAGTGAACAGCAATCATGTTGGCTTTTCAATTATGTATTTATTTTTTCATGAAAACTTTTTTTAATTCCAAAAAATGCAACATACTTCAAATCAGTGCTTGGTGCTTTAGTGAAGAGCCATGCCAAATAACACAGTTGGCCTATATGAATTACAATCAAATATGTAATTCTTCTGTTCAATTCAGGTTGAAGAAGCCAGTGAAACTTTACCGCTTTTGATATTTGCATTCAGCATATAGGAGTCTAGAATAAGATACTTCCAGATTTGGGGGGTTGTATTTTTTAGGATGAAATGAGCATAAATGGATGGGTTAACCATTTGCAGAATGCTACTATATAAAGATGTTTACAAATTTTCATTATAAAGGCTTAACAATATGCCCAATGCACTTAAGATAATGACCATCTAGGCTCAGGATTGAAAAATAACTGAAGAGCTGTAACCCAATAAACTTGTGTGAACAAAATATTTGTTACTGGCTGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGTGGATCATAAGGTCAGGAGATCGAGACTATCCTGGCTAAAATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAACTTAGCCGGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAGTCTCAGATACTCGGGAGGCTGAGGCATGAGAATGGCACGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGAGTCTGTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTGTTACTGGGTGAGTGTCTTCATAGAGGTGAAGTAAAAGAGATTTTCCTCTGTCCAAGGAAGAGCGTTCTGTGATCAGCTGGTGAAAGTATTCTGCTCTACCTGGGAGGCATATTTTTATACCAGAACTGTCACAGTTCAATGACATGTCACATTCAAGGTTAGCCAGGATTCTGAGCTCTGACTCTGCCCATTGGGCCTCCCACACAAACTGTCTCACAGCAGAAGGGATACAGTGACCAGCTATCATAGAATTCTGGTCCTGCTGCTACACTGCTCCAGCCAAAAGTTTATAAACTGCCTTCTGGCTTAAGCGTCAGCCTCTTTTGACATCAGTTAAAGAAAATCAGTCACTAAGTCGAGCCAACTCAAATTAGTTTACAATCAAAAATCAATTTTCTACTGGAAAAGTGGTGGAAACAGCCTAAGAGTCAATGTCACAAAGAGTAGGTGTGAATCCTAGTTCTGCCACTCACTAGCCTTGACTAAACTACTTCACTTCTGTGCCTTACCATCCATGCTTTCATCTTCCATACGTGGGTATAACAGCGACTCCCCCTCATTTACGTTGTGAAGATAAAAACTTACATCAGATAAGGCACTTAATAAATTACAGCTCTGCAGTGACCCACTTCCACCTGAAACCCCTGAAACACTGCATGGGCAGTGGGTAATCGTCCCTCTCTGACATAGTTTTGAAAACTGTTTTTCTTATTTAAAAGTAATACATTCTCGCTGCAGAAAAATTGCAAAGCAAAAAAAAAAGTACAAAGAATTGGGGAAAAAGAGGTTTTTTTGGGCATATTTCTAACATTCTGGCATATTTCATTTCAGCTGTTTTGCTATGTTTATTTTATGACATATTTTTAGAATATTTACAAAATTTTTAAAAAGTGTAAAGAAGAAAAGCAAATACCATCAACTCTACTACCCAGAGCCAATCAATTCTATTATATTGGCATATTTCCCTCCAATGTTTAGCCTAGGCATTTAAAAAATGTAACTGACTGATCATGGCCAGGCTGGAATCCTCTTTTTCAGATTAATGTGATACATTTCTATGACTCACATTTCTCTTTTAATGAAACATTACTTACTGTTTTTACCATCTTTAAGAGTCATGTTTCTGGTATACGAGATATTCAGTCTTCTTCCACTGCTAGACGAAAATGGAGAGAATTGATCTAGAAAAAATTTAAAATTCAGTAACAAACTTATGAGTATCAAGCCTATGAAATTTACACCTTACAAAAGAAAACATAAAATGCAAGTGCTGGCCGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTAGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGACGGGCGCCTCTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAATCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACCGGATCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAACACACGTCCTAAACTGGCAGCTCAGATGTGCTTTTTTTGTTCTTCTTGTTAAGTTTAAAGGGCTGGTTTTGTTTACATCTTATGAAATTTCATGTGAAAAATTCTAGCTTCTATTGAAGAATCTGAATATTTGCAATCTAAACTCTAATCCCATAGTGGCATAAACTGTACCACAGTCACCACCTTTTGATGGGGCAAATTCATTCCAGGTCACCAGTCTCTACTATTCACTATTTTTCTTTCACCTGGCCTCTTTTACTCTTTTATGTTTTTATGTTGTTGGCCCAGCCCTTATAGGCCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGAGACGAGTCTCGTTCTGTCGCCCAGGATGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGTGGGTGCCACCACAGCTGGCTAACTTTTCTATTTTTAGTGGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCACCCGCCCTGGGCCTCTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCTGGCCCCTTATAGGCATTTGGGTGTATATCCTCTATTGGACAATATCCAGGAGCTTCAGCATAGCTAAGCTGATGCAATTTATTCTGAACCTCATATCTGTACCAATTATAAACTTTCAAAAGGAAGGTCACAGTAAGACAACGTTCCATTCTAAAAACGTTAAGGTCAGGCTCAGGAATACCACATGGGACGTATTTAGATGCATTTTCATTCAATGTAAAAGGATAAAATGAGGATAGAGCACAAATCTTCTAAAGATGCAGTTTTCGGGACTTAAAACATTTTACATTTTAAGCTTTCCATACAGCTATCTTGAATGAATCTAAATGAATTCAGAAATTAAAGATTCTAATGATAGGATCCTATAATAATACGGGTTCAGTATCACTTACCCAAAATGCTTGGGACCAGAAGTGTTTTGAATTTCAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGGATTTTGGATTATTTGCATTATATTTAACTGGCTTAGCATCCCTGATCCAAGTATCTGGAATCTGAACTGTTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTAGTGCTGAAAAAGCTTCCGATTCTGGAGCATTTTGGATTTGGGGATTTGGGATGCTCAAACTGTATAGGGTAATATAATAATTACCAATAAAAGAGAAAAATAGATCAGATTTTTAAAAATTCTGTTTGCTCCGAAAGTCAGAGCTAGCCTGAAATGCAAAAAGTATGTGAGAGCTGAGATTTTGTATCAATTTAAAGGGCAGAACTTTTTTTTTTTAATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAAGGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGTCATGTTGGTGTGCTGCACCTATTAACTCGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACGACAGGCCCCGGTGTGTGATGTTCCCCACCCTGTGTCCAAGTGATCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTAAAGGCAGAACTTTCTAATGGAGAACTGACT
TTATTAGCATTTTTTGGAGACTTAGCTATGTATCATTTTCTGAAAGCTCTTACATACAGACTTGGATTATTTTCATAGAATACTGCCAAAAGGGTGTAGTGAACAGCAATCATGTTGGCTTTTCAATTATGTATTTATTTTTTCATGAAAACTTTTTTTAATTCCAAAAAATGCAACATACTTCAAATCAGTGCTTGGTGCTTTAGTGAAGAGCCATGCCAAATAACACAGTTGGCCTATATGAATTACAATCAAATATGTAATTCTTCTGTTCAATTCAGGTTGAAGAAGCCAGTGAAACTTTACCGCTTTTGATATTTGCATTCAGCATATAGGAGTCTAGAATAAGATACTTCCAGATTTGGGGGGTTGTATTTTTTAGGATGAAATGAGCATAAATGGATGGGTTAACCATTTGCAGAATGCTACTATATAAAGATGTTTACAAATTTTCATTATAAAGGCTTAACAATATGCCCAATGCACTTAAGATAATGACCATCTAGGCTCAGGATTGAAAAATAACTGAAGAGCTGTAACCCAATAAACTTGTGTGAACAAAATATTTGTTACTGGCTGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGTGGATCATAAGGTCAGGAGATCGAGACTATCCTGGCTAAAATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAACTTAGCCGGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAGTCTCAGATACTCGGGAGGCTGAGGCATGAGAATGGCACGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGAGTCTGTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTGTTACTGGGTGAGTGTCTTCATAGAGGTGAAGTAAAAGAGATTTTCCTCTGTCCAAGGAAGAGCGTTCTGTGATCAGCTGGTGAAAGTATTCTGCTCTACCTGGGAGGCATATTTTTATACCAGAACTGTCACAGTTCAATGACATGTCACATTCAAGGTTAGCCAGGATTCTGAGCTCTGACTCTGCCCATTGGGCCTCCCACACAAACTGTCTCACAGCAGAAGGGATACAGTGACCAGCTATCATAGAATTCTGGTCCTGCTGCTACACTGCTCCAGCCAAAAGTTTATAAACTGCCTTCTGGCTTAAGCGTCAGCCTCTTTTGACATCAGTTAAAGAAAATCAGTCACTAAGTCGAGCCAACTCAAATTAGTTTACAATCAAAAATCAATTTTCTACTGGAAAAGTGGTGGAAACAGCCTAAGAGTCAATGTCACAAAGAGTAGGTGTGAATCCTAGTTCTGCCACTCACTAGCCTTGACTAAACTACTTCACTTCTGTGCCTTACCATCCATGCTTTCATCTTCCATACGTGGGTATAACAGCGACTCCCCCTCATTTACGTTGTGAAGATAAAAACTTACATCAGATAAGGCACTTAATAAATTACAGCTCTGCAGTGACCCACTTCCACCTGAAACCCCTGAAACACTGCATGGGCAGTGGGTAATCGTCCCTCTCTGACATAGTTTTGAAAACTGTTTTTCTTATTTAAAAGTAATACATTCTCGCTGCAGAAAAATTGCAAAGCAAAAAAAAAAGTACAAAGAATTGGGGAAAAAGAGGTTTTTTTGGGCATATTTCTAACATTCTGGCATATTTCATTTCAGCTGTTTTGCTATGTTTATTTTATGACATATTTTTAGAATATTTACAAAATTTTTAAAAAGTGTAAAGAAGAAAAGCAAATACCATCAACTCTACTACCCAGAGCCAATCAATTCTATTATATTGGCATATTTCCCTCCAATGTTTAGCCTAGGCATTTAAAAAATGTAACTGACTGATCATGGCCAGGCTGGAATCCTCTTTTTCAGATTAATGTGATACATTTCTATGACTCACATTTCTCTTTTAATGAAACATTACTTACTGTTTTTACCATCTTTAAGAGTCATGTTTCTGGTATACGAGATATTCAGTCTTCTTCCACTGCTAGACGAAAATGGAAAGAATTGATCTAGAAAAAATTTAAAATTCAGTAACAAACTTATGAGTATCAAGCCTATGAAATTTACACCTTACAAAAGAAAACATAAAATGCAAGTGCTGGCCGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTAGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGACGGGCGCCTCTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAATCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACCGGATCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAACACACGTCCTAAACTGGCAGCTCAGATGTGCTTTTTTTGTTCTTCTTGTTAAGTTTAAAGGGCTGGTTTTGTTTACATCTTATGAAATTTCATGTGAAAAATTCTAGCTTCTATTGAAGAATCTGAATATTTGCAATCTAAACTCTAATCCCATAGTGGCATAAACTGTACCACAGTCACCACCTTTTGATGGGGCAAATTCATTCCAGGTCACCAGTCTCTACTATTCACTATTTTTCTTTCACCTGGCCTCTTTTACTCTTTTATGTTTTTATGTTGTTGGCCCAGCCCTTATAGGCCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGAGACGAGTCTCGTTCTGTCGCCCAGGATGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGTGGGTGCCACCACAGCTGGCTAACTTTTCTATTTTTAGTGGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCACCCGCCCTGGGCCTCTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCTGGCCCCTTATAGGCATTTGGGTGTATATCCTCTATTGGACAATATCCAGGAGCTTCAGCATAGCTAAGCTGATGCAATTTATTCTGAACCTCATATCTGTACCAATTATAAACTTTCAAAAGGAAGGTCACAGTAAGACAACGTTCCATTCTAAAAACGTTAAGGTCAGGCTCAGGAATACCACATGGGACGTATTTAGATGCATTTTCATTCAATGTAAAAGGATAAAATGAGGATAGAGCACAAATCTTCTAAAGATGCAGTTTTCGGGACTTAAAACATTTTACATTTTAAGCTTTCCATACAGCTATCTTGAATGAATCTAAATGAATTCAGAAATTAAAGATTCTAATGATAGGATCCTATAATAATACGGGTTCAGTATCACTTACCCAAAATGCTTGGGACCAGAAGTGTTTTGAATTTCAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGGATTTTGGATTATTTGCATTATATTTAACTGGCTTAGCATCCCTGATCCAAGTATCTGGAATCTGAACTGTTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTAGTGCTGAAAAAGCTTCCGATTCTGGAGCATTTTGGATTTGGGGATTTGGGATGCTCAAACTGTATAGGGTAATATAATAATTACCAATAAAAGAGAAAAATAGATCAGATTTTTAAAAATTCTGTTTGCTCCGAAAGTCAGAGCTAGCCTGAAATGCAAAAAGTATGTGAGAGCTGAGATTTTGTATCAATTTAAAGGGCAGAACTTTTTTTTTTTAATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAAGGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGTCATGTTGGTGTGCTGCACCTATTAACTCGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACGACAGGCCCCGGTGTGTGATGTTCCCCACCCTGTGTCCAAGTGATCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTAAAGGCAGAACTTTCTAATGGAGAACTGACT
Task1_train_7890
Chromosome 3 houses a mutation in gene MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 deficiency
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Task1_train_7891
Mutation context: Chromosome 3, Gene MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 deficiency
ATCTTGAATGAATCTAAATGAATTCAGAAATTAAAGATTCTAATGATAGGATCCTATAATAATACGGGTTCAGTATCACTTACCCAAAATGCTTGGGACCAGAAGTGTTTTGAATTTCAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGGATTTTGGATTATTTGCATTATATTTAACTGGCTTAGCATCCCTGATCCAAGTATCTGGAATCTGAACTGTTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTAGTGCTGAAAAAGCTTCCGATTCTGGAGCATTTTGGATTTGGGGATTTGGGATGCTCAAACTGTATAGGGTAATATAATAATTACCAATAAAAGAGAAAAATAGATCAGATTTTTAAAAATTCTGTTTGCTCCGAAAGTCAGAGCTAGCCTGAAATGCAAAAAGTATGTGAGAGCTGAGATTTTGTATCAATTTAAAGGGCAGAACTTTTTTTTTTTAATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAAGGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGTCATGTTGGTGTGCTGCACCTATTAACTCGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACGACAGGCCCCGGTGTGTGATGTTCCCCACCCTGTGTCCAAGTGATCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTAAAGGCAGAACTTTCTAATGGAGAACTGACTGAAACTGTAAGCTACCTGATGAGGTAATGAACTTCCAGTTTCCCAAGGTGTTAGGAAGAAGTTGGGCAACAGCTTAGTGGGTGTGCTGGGGTAGGGATGCAATGCATATGTGTGGTAGCCAGGATGAACCCCACTATGGCCCTTCCTATGCTTGGATTCTATGACACTATGAAGTCTCTAGGTAGACATTCAATCACAGGATGGAAAAAGCGGAAGTAATTCGACAATAAGTCATGGGTAACCCTGGGGAATCTAAGTCTCCAGTCTTAGATTGTCTTGAGACTCTGGGACAAAGGGAGTTGCTGCAGGTACAGAGGACAAAACAAAGTAGGGCTATGAGGAGTGGCGAACAAAAGAAGTGATAAGAAATTAGTGTAGGATGTGGGGAGAACAAGTGTTTGACTGAAAAGAGATCCATTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGATGAACTCTCGCCCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCTTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGTGCCACCACACCCAGCTTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACATCATGATCCGCCCACCCTGGCCTTCTAAAGTGCTGGGATCACAGGCACGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCATGATCCAGCCGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAAAGAGATCCATTTCTACAATGTTAGGTGATTAGTTACACTCCAGTTAATGGGTTAAATAGTGTTTATGGGTGCATCCATGGTAAGTGAAGAGCTTTCCTTCATACTAAAAAACACATCTGAAAAGAATGGTGTCAGTCACTGAGAGGAGAAAAGAGAGGTCAGTGTGCCATACAGAAAGAAAAGCATGTTCAATGATGATTTGCAAAACTTGACAAGCAGAGGAAAGAGAAAAGCCTTCCATACCATGTGCCTGAAGAGTGAAAGTGTCGGTCATGGCTTTCTCCTTGAGGATGAGACCCAGGGCTGCCTGGCATAAAGACTCTTTGGCTGCAGCCTTCCGACTGAGCAACAACTGTTTGTGGTGTTGAGGGATGAAATCAGTGTGCACGTTCCCAGCTTCAAACTCTGGGTGGCCAGACAGGTTGAGTAAGAAGTCAATGTTGGTGTGCAGTCCAACAATCTAGGAAGAGAATAAACCCCCAGTTCCTGCTGAGTGGGGAAAACAATATGTTCAGAAAACCATCTGCTCTTTTTATCTAAGTATTTTCTACTGTGAACAACTCTTAGGAAAAATAAAAAACCTACTAAGGTACCATGTGGCAACAGGACAATTCTCAGGAAAAAAAACACAAAAAAACCATCTCACTATCACTATGTCCATCCGCTATTACTATATCCATCTGGACTTGACACTAAAAATTACATTTTAATATGACAAAGAGGATGCTGGAAATACCGAGGCACTTACTTGACTCAGGTTAGGAACATAATAAATGTTAAGAAACATAAATGAAATTCATTTGCAAGGTATCGAAGACTTGCTGCTCAGAACACTTCCACAGAATAGGAAGACTGCAAACAGCAAGCTGGATTGCTATACTGGGGAGAGGATAGGATTAAATGCCCTCAAAAGAGCTTCTTTCCAACAATAAAATCCAAATTTTATATACCGATACAAAAATTTTAAAAGGTATAAAATTAACCCAAATACACCAATAAATGGGATCAAAAGTAAAACCAGCTATCTGAGCTTTGGGTTCATTCATTCACTCATCCATTCCTTCATTCATTTAACAGCCATTTCCTGAGCATCTCTTAAGTGCCAGGCTCTGATCCAGGCACTGGGGACATAGTGAGGAACAAAACATATGATGTCCCTGCCTTCACAGTCTCTGCTTACATTCTAGGGCAACAAGTAACAATATCTGTAAACAGGTATTGAATATAATGTTACATGCTATGAAGAAAATGAAGGCTGGCTAAGAGGATAAAGAATAACAAAAGGTCATACTTTAAATGGGGCAGCCTGGGAAAGGGCTCAGAGCAGGAGAGCAGGGTAGTCAGGAGGGAGCCCTGCAATCATGTGGGGGAAGAACATTCTGGAAGATTGGACAGGAATGCATGGCTCCATGCTGAGTGAGTCTCAGAAGCGGTGAGGCGGCCAGTGTGGTTGGAGCCACAGAGACCAGAGCTTTGATCAATTATTAACAATAACAAGTTGAATAACTGGGTTAATAAATCCTTCTATGAGCCAAATCAATGTGGTATGGGACTTTCTGCACCAAGGAAATTAATGTTCTACAGAAAAATAACAAACTCTATTAAAGGGATGAAACTGAACATAATTATTTTACTTTAGAGAAAAACTACTGGACTGCAGGCATACTGGGTAGCGAAAACAACATTCAGGAAAACATCTGCTTTTATTTCCTAAGTATTTTCTACTGTGGACAGCTCTTAGGAAAAATAAAAAACCTACGAAGGTACCATGTATAGCTGGCCTTATCTACAGAGTGAATAGGATTTCACCGAAGCATAGCACTGACACTAACAATTTTACTTCTGCAATCTTTCTTTTGTAACTGAAATGAAGAAGTCCTCAAACCCTGTTCTGGCCCACGCAAAATTCTCCCATGTGAAACTATTTTGTTTGGGCAATTGATGGAAATAGAAAATATGCTGACGAGACCAAGGCCCTGCCAAAGACAAAGGCTGACCTCTGGTGCTGACCAAACACATCAAGGTCACTGGCACGGTCTCAGATCACTCACATTGTACTGACGAAGGCTGTACCTCAGTTTTGTCAATGCCGCCTGGCGATCTGCTGCCCACACGACCAGCTTCGCAATCATGGGGTCATAATGCACGGAAACTTCGTCTCCTGAAATTGAAAACCACGGTAACCTCTTCAAGTCAAAACACGAAGGAATAAAATACAACGAGCAAGACATTTTGTTATGTACATTTCACGCTTAATCCTCATAAACCCCTGCATGATAAATAACAACACAAATTTATTCATGAGGACCCTGAGGTTCAGAGGGCTTTGAAAACTCACCAGGTGTAACGAGGTGGGCCACCCAACAGCACCAGGCCCTAACGTGGTGATTCAATGGCACACAAGCTGGCTTTCCCTGTCCTATCTTCTTCTGAATCTTCTTTTCCCTTCTCATTTTCAAAGTCAACACAATCTCCCTCCACCCTCTCACATTCCCCTCATTTCTG
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Task1_train_7892
A variant found in Chromosome 3 affects MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Methylcrotonyl-CoA carboxylase deficiency
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Task1_train_7893
This mutation is located in gene MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1) on Chromosome 3. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 deficiency
GGTTAAATAGTGTTTATGGGTGCATCCATGGTAAGTGAAGAGCTTTCCTTCATACTAAAAAACACATCTGAAAAGAATGGTGTCAGTCACTGAGAGGAGAAAAGAGAGGTCAGTGTGCCATACAGAAAGAAAAGCATGTTCAATGATGATTTGCAAAACTTGACAAGCAGAGGAAAGAGAAAAGCCTTCCATACCATGTGCCTGAAGAGTGAAAGTGTCGGTCATGGCTTTCTCCTTGAGGATGAGACCCAGGGCTGCCTGGCATAAAGACTCTTTGGCTGCAGCCTTCCGACTGAGCAACAACTGTTTGTGGTGTTGAGGGATGAAATCAGTGTGCACGTTCCCAGCTTCAAACTCTGGGTGGCCAGACAGGTTGAGTAAGAAGTCAATGTTGGTGTGCAGTCCAACAATCTAGGAAGAGAATAAACCCCCAGTTCCTGCTGAGTGGGGAAAACAATATGTTCAGAAAACCATCTGCTCTTTTTATCTAAGTATTTTCTACTGTGAACAACTCTTAGGAAAAATAAAAAACCTACTAAGGTACCATGTGGCAACAGGACAATTCTCAGGAAAAAAAACACAAAAAAACCATCTCACTATCACTATGTCCATCCGCTATTACTATATCCATCTGGACTTGACACTAAAAATTACATTTTAATATGACAAAGAGGATGCTGGAAATACCGAGGCACTTACTTGACTCAGGTTAGGAACATAATAAATGTTAAGAAACATAAATGAAATTCATTTGCAAGGTATCGAAGACTTGCTGCTCAGAACACTTCCACAGAATAGGAAGACTGCAAACAGCAAGCTGGATTGCTATACTGGGGAGAGGATAGGATTAAATGCCCTCAAAAGAGCTTCTTTCCAACAATAAAATCCAAATTTTATATACCGATACAAAAATTTTAAAAGGTATAAAATTAACCCAAATACACCAATAAATGGGATCAAAAGTAAAACCAGCTATCTGAGCTTTGGGTTCATTCATTCACTCATCCATTCCTTCATTCATTTAACAGCCATTTCCTGAGCATCTCTTAAGTGCCAGGCTCTGATCCAGGCACTGGGGACATAGTGAGGAACAAAACATATGATGTCCCTGCCTTCACAGTCTCTGCTTACATTCTAGGGCAACAAGTAACAATATCTGTAAACAGGTATTGAATATAATGTTACATGCTATGAAGAAAATGAAGGCTGGCTAAGAGGATAAAGAATAACAAAAGGTCATACTTTAAATGGGGCAGCCTGGGAAAGGGCTCAGAGCAGGAGAGCAGGGTAGTCAGGAGGGAGCCCTGCAATCATGTGGGGGAAGAACATTCTGGAAGATTGGACAGGAATGCATGGCTCCATGCTGAGTGAGTCTCAGAAGCGGTGAGGCGGCCAGTGTGGTTGGAGCCACAGAGACCAGAGCTTTGATCAATTATTAACAATAACAAGTTGAATAACTGGGTTAATAAATCCTTCTATGAGCCAAATCAATGTGGTATGGGACTTTCTGCACCAAGGAAATTAATGTTCTACAGAAAAATAACAAACTCTATTAAAGGGATGAAACTGAACATAATTATTTTACTTTAGAGAAAAACTACTGGACTGCAGGCATACTGGGTAGCGAAAACAACATTCAGGAAAACATCTGCTTTTATTTCCTAAGTATTTTCTACTGTGGACAGCTCTTAGGAAAAATAAAAAACCTACGAAGGTACCATGTATAGCTGGCCTTATCTACAGAGTGAATAGGATTTCACCGAAGCATAGCACTGACACTAACAATTTTACTTCTGCAATCTTTCTTTTGTAACTGAAATGAAGAAGTCCTCAAACCCTGTTCTGGCCCACGCAAAATTCTCCCATGTGAAACTATTTTGTTTGGGCAATTGATGGAAATAGAAAATATGCTGACGAGACCAAGGCCCTGCCAAAGACAAAGGCTGACCTCTGGTGCTGACCAAACACATCAAGGTCACTGGCACGGTCTCAGATCACTCACATTGTACTGACGAAGGCTGTACCTCAGTTTTGTCAATGCCGCCTGGCGATCTGCTGCCCACACGACCAGCTTCGCAATCATGGGGTCATAATGCACGGAAACTTCGTCTCCTGAAATTGAAAACCACGGTAACCTCTTCAAGTCAAAACACGAAGGAATAAAATACAACGAGCAAGACATTTTGTTATGTACATTTCACGCTTAATCCTCATAAACCCCTGCATGATAAATAACAACACAAATTTATTCATGAGGACCCTGAGGTTCAGAGGGCTTTGAAAACTCACCAGGTGTAACGAGGTGGGCCACCCAACAGCACCAGGCCCTAACGTGGTGATTCAATGGCACACAAGCTGGCTTTCCCTGTCCTATCTTCTTCTGAATCTTCTTTTCCCTTCTCATTTTCAAAGTCAACACAATCTCCCTCCACCCTCTCACATTCCCCTCATTTCTGCCCTTAGCATTCCCCTCCCCTCCACTCTTTCAGTTTCCGTACTAGTCAAGCAAGTTTAATAATTCCTCTGTCCTGCAGGGTTGCTGGGAGGAGTGACAATAAAGTGACAAGTGCCATACCTGGCAAAACTGATAAACCAATGGCAGCTATCATCACTGGGATGGTTACAGTCCTAGAGAACAAGAATCTGAACCAGGGCACATTCCACTGGTTAGAAATGGTTCAAGTAGAAAGGATGTGGTGTGTTGAAAAGAACGTTGTTGCAGGGTCTTTCCAGGATTTTGGCAGGTCACTTGACCTCTTTGAACCCCAGAGTCCTCGTTGATAAGATTAGAGGTGCCTACAGGTGGCTCACGCCTGTACTCCCAAGACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAACCGGTGGGGCAAGCAGAGTTAAGATGCTTTGCTAAGTTAAAAAGTCTACTAACTACCAAATCTTGCTGTGGCTTATCCAGAGCTCTCAAAATGCTGCCAATTTATTTTTAAGAAGATCTAAATCCTCATTTTGGCTTTTAGGACACTAGGATTTGCCTTCAACCCATGTCTCCAGTCATATATTTTCTTACTATTCTTCAAACATACCTTTTTCTCTTTTCTTCACTCTTCATTATGCTGTTTAAATCTACCTATCTAAATCCATTCCAGACATCCTCTTAAAAACTTGTCCTGGCCAGGCACGGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCACCTTGAAAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTAGCCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCATGGTGGTATACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCTGAGAACTGCTTAAGTCAGGGAGATAAAGGTTGTAGTGAGCTGAGATCACACCACTGTACTCCAGCCTGGGCACAGAGTGAGACCTTGTCTCAAAAACAAAAACAAACAAAAAAACAAACAAACAAAAAACTTGTCCTAATTATATCAGTCTAGTGTGACCTCTTACCCCTGAGAATTGCTATATCCCATCACTGTATAACTTATTCCAGCAATTGAAATTAAGATGACAGGAGACCGTGGAGGCTCAGAGCACTGACTCTGGAGCAAGACTGCCTGGGTCTGAATCTTGGCTCCAAGGATGACCTTGGACAAGTCACTTAACTCTTCTGTGCTCCAGTTTCCTCATCTAGAAAACAGGGATGATAATAATGCCTACTTACAGGGTACTTCTCATGGTGAAAGGAACACAAGTAGAAAAATCACCTAGAGCAGTGCCTGTAAGTAGGAAGTCCTAAATAATCACTAGTTATGACCACTGTTATTAATCAT
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Task1_train_7894
With a mutation on Chromosome 3 in gene MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 deficiency
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Task1_train_7895
Given this context: Chromosome 3, gene MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 deficiency
ATCACTGGGATGGTTACAGTCCTAGAGAACAAGAATCTGAACCAGGGCACATTCCACTGGTTAGAAATGGTTCAAGTAGAAAGGATGTGGTGTGTTGAAAAGAACGTTGTTGCAGGGTCTTTCCAGGATTTTGGCAGGTCACTTGACCTCTTTGAACCCCAGAGTCCTCGTTGATAAGATTAGAGGTGCCTACAGGTGGCTCACGCCTGTACTCCCAAGACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAACCGGTGGGGCAAGCAGAGTTAAGATGCTTTGCTAAGTTAAAAAGTCTACTAACTACCAAATCTTGCTGTGGCTTATCCAGAGCTCTCAAAATGCTGCCAATTTATTTTTAAGAAGATCTAAATCCTCATTTTGGCTTTTAGGACACTAGGATTTGCCTTCAACCCATGTCTCCAGTCATATATTTTCTTACTATTCTTCAAACATACCTTTTTCTCTTTTCTTCACTCTTCATTATGCTGTTTAAATCTACCTATCTAAATCCATTCCAGACATCCTCTTAAAAACTTGTCCTGGCCAGGCACGGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCACCTTGAAAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTAGCCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCATGGTGGTATACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCTGAGAACTGCTTAAGTCAGGGAGATAAAGGTTGTAGTGAGCTGAGATCACACCACTGTACTCCAGCCTGGGCACAGAGTGAGACCTTGTCTCAAAAACAAAAACAAACAAAAAAACAAACAAACAAAAAACTTGTCCTAATTATATCAGTCTAGTGTGACCTCTTACCCCTGAGAATTGCTATATCCCATCACTGTATAACTTATTCCAGCAATTGAAATTAAGATGACAGGAGACCGTGGAGGCTCAGAGCACTGACTCTGGAGCAAGACTGCCTGGGTCTGAATCTTGGCTCCAAGGATGACCTTGGACAAGTCACTTAACTCTTCTGTGCTCCAGTTTCCTCATCTAGAAAACAGGGATGATAATAATGCCTACTTACAGGGTACTTCTCATGGTGAAAGGAACACAAGTAGAAAAATCACCTAGAGCAGTGCCTGTAAGTAGGAAGTCCTAAATAATCACTAGTTATGACCACTGTTATTAATCATATGCTGAACTGTGATAGCTCTTCCACTGTTTCTTTACTTTAATTTTTTTATTGTTTAGCTTATACTAAGTTTATGTGTTAATTCTCCAACTTGACTTTATGTCCTTTGAAGGCAGTCTGCCTTGTGCATAGCAGATATCAGTCATCTTAAATCATTTTTGGAATGAGGCAAGGTCAAGAACAGTACACACAAAATATTTCCTGGTTAGGTTTGACCAAGTACTGCTGAATTTCAAAAAAAAGGAGTCCGTTGTTGAAAAATACTTGTTATTCTTTAAAAATAACAATTCCAGAGGCAAAAAGTAATGGTTACTGAGAAATCACTTAAATTCTTTATTTTAAAATATGCTAGACAGTTCTGTAAGACTCAGGGATAAGAATGTGTCCAAAAACAATAATGTACTAAAAACTTAAAAAGAGTGAGACTTTTCATTTTCTTTCACTTTACCTTGCCGTACTCCAGTTTCAATCCTGGTGGAAGGGTCTGCTCGAGGAGTAGAGAGGTGCACTAATGGGCCTGCCACAGGCATGAAGTTATTGCTAGGATCTTCTGCATATATTCTAGCTTCGAAGGCATGGCCCTGCAGAGTTATTTCTTCCTGGCTCAAAGGAATCTTCTCTCCTGCTGCAATCTGGCAATAGAATAGTGTTTCTTATGAAATCTACCGTATAGCGGCTACCAGACTTAGTAAATCAATGGTCTTGCTTTTTTTCTAGGTAAAATGTACATTTAGGTTTTGCAATGCAGCCAAATAAAAACTATTATTTTGTCTACTCATTTGAGTATTGGGCAAAACAAAAAATTAAAAAACAGATGCAGCTTGGCAACAGTCTATCATTTGGGGTATCGGAGTTTTTAAATGGCAAAAGCAGGCAAAGTGATGGCTAACTTACAAATATAAAAATCAGTGTTTGTTCAATATAATCAAAACCAAAACTTCTTACTAGCAACACACTCTCAGTTTTCATTTAAAACATTAGCACTTAATTCCCAAATCAATTTTTTTTAAAAAATAGTATATTATTAGTGTTTAGGACTAGATTCACAGCCAAGCAAAAAGTGTAGCTGACATTGTCATCCTACGCTGTAATCTTCACCAGTAAGTGGGTGATAAAGCAAAACAGAAAGGGGAAAATGATGGTTTTTCAATTTTGTTATGTTGATATGTACTGCATGATACCAGATTACAAACAGGGTGATCACTATTGTTTGTTGTTACTATAATTATTACTATTTTAGTTATTATGTACCAATACAACAAATCACTCTCTTCAATTAACTAGTATAAATTGGAAATGGCTATTGGAGGACACATTGCACTTTCTCTCTTTACTCTTAAGTTTTTTTCCAAGATGAGAAAATGACAACCTGAGAAAGCAATATAGATACAGGAAAATCTAGACTCTAAGTAACTTAGCATGACATTGAACTAAACCGGTAAGTATAAAACAGAAGCAAAAGTTTCATTTTTCTGAATCTGTAAATATGAAAGATCAGGATGCACAGCAGTTAAGAATGAAAGGAAACGGAACTAAGTTAAATACCTTTATGGCAGTATATTTTGAAAACACCTCAGGCTCTGCAGACAGATTGCCTAGGTTCAAATTTTGTCTCTATACTTACTTTGTCATCTAGACAAGTTTCTTAAGCTTTCCATGCTTCAGAGAAAAGTGTCTGGCATACAGTCAGCACTATGTTACCTATTATCATTCCATCCTTAGGATCTAGAACCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGATTACAAATCACTCTACTATAAAGACGCATGCATGTGTATGTTTATTGCAGCACTGTTCACAATAGACTTGGAACCAGTTTTTTAACGTTTTAATAAATAATTCTGGGTCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACACGCCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAGCCGGGAGGTAGAGGTTGCAGTGAGCTATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAAGAGCAAAACTCTGTCTCTTGTGTTCACCTTGACTTGTCTTTGCCTGTCCATTTTCCTCCAAGCTTGGCTTCCACTTGAGCCCAGAAAAGACAGGCCCCAATCATGCCTCTGGGTCTTTGGAGATATGTGCCATTTGAGTTCTCTCAGGCTGACACTGGCTCTCCGGAACCCCTAACCTTGACATTTTCACCAGCTTTCCCTGAACACTGTTAACTATCTGTATCTGCAGCCTGAACCCAGGACACTTACATCAGTCATCATTCAACCCTTGTTCTAGGAAGGCTTGACTGCACAGGCAGGTCCTCGAGCTTAGACTCTTGACTCACCAAATGGTGAGCCCCTTTGTTTTACCTCTGTTTGAAGGCCAGATGCCAAATGCCTTGAACTCTATAAACCAGGTCCAGCAGCTTCCCTAAGTTCTAGTGTCCCTCCCCAGATGATAAAAGCTGGCTTCTC
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Task1_train_7896
A change on Chromosome 3 affects gene MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
ATCACTGGGATGGTTACAGTCCTAGAGAACAAGAATCTGAACCAGGGCACATTCCACTGGTTAGAAATGGTTCAAGTAGAAAGGATGTGGTGTGTTGAAAAGAACGTTGTTGCAGGGTCTTTCCAGGATTTTGGCAGGTCACTTGACCTCTTTGAACCCCAGAGTCCTCGTTGATAAGATTAGAGGTGCCTACAGGTGGCTCACGCCTGTACTCCCAAGACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAACCGGTGGGGCAAGCAGAGTTAAGATGCTTTGCTAAGTTAAAAAGTCTACTAACTACCAAATCTTGCTGTGGCTTATCCAGAGCTCTCAAAATGCTGCCAATTTATTTTTAAGAAGATCTAAATCCTCATTTTGGCTTTTAGGACACTAGGATTTGCCTTCAACCCATGTCTCCAGTCATATATTTTCTTACTATTCTTCAAACATACCTTTTTCTCTTTTCTTCACTCTTCATTATGCTGTTTAAATCTACCTATCTAAATCCATTCCAGACATCCTCTTAAAAACTTGTCCTGGCCAGGCACGGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCACCTTGAAAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTAGCCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCATGGTGGTATACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCTGAGAACTGCTTAAGTCAGGGAGATAAAGGTTGTAGTGAGCTGAGATCACACCACTGTACTCCAGCCTGGGCACAGAGTGAGACCTTGTCTCAAAAACAAAAACAAACAAAAAAACAAACAAACAAAAAACTTGTCCTAATTATATCAGTCTAGTGTGACCTCTTACCCCTGAGAATTGCTATATCCCATCACTGTATAACTTATTCCAGCAATTGAAATTAAGATGACAGGAGACCGTGGAGGCTCAGAGCACTGACTCTGGAGCAAGACTGCCTGGGTCTGAATCTTGGCTCCAAGGATGACCTTGGACAAGTCACTTAACTCTTCTGTGCTCCAGTTTCCTCATCTAGAAAACAGGGATGATAATAATGCCTACTTACAGGGTACTTCTCATGGTGAAAGGAACACAAGTAGAAAAATCACCTAGAGCAGTGCCTGTAAGTAGGAAGTCCTAAATAATCACTAGTTATGACCACTGTTATTAATCATATGCTGAACTGTGATAGCTCTTCCACTGTTTCTTTACTTTAATTTTTTTATTGTTTAGCTTATACTAAGTTTATGTGTTAATTCTCCAACTTGACTTTATGTCCTTTGAAGGCAGTCTGCCTTGTGCATAGCAGATATCAGTCATCTTAAATCATTTTTGGAATGAGGCAAGGTCAAGAACAGTACACACAAAATATTTCCTGGTTAGGTTTGACCAAGTACTGCTGAATTTCAAAAAAAAGGAGTCCGTTGTTGAAAAATACTTGTTATTCTTTAAAAATAACAATTCCAGAGGCAAAAAGTAATGGTTACTGAGAAATCACTTAAATTCTTTATTTTAAAATATGCTAGACAGTTCTGTAAGACTCAGGGATAAGAATGTGTCCAAAAACAATAATGTACTAAAAACTTAAAAAGAGTGAGACTTTTCATTTTCTTTCACTTTACCTTGCCGTACTCCAGTTTCAATCCTGGTGGAAGGGTCTGCTCGAGGAGTAGAGAGGTGCACTAATGGGCCTGCCACAGGCATGAAGTTATTGCTAGGATCTTCTGCATATATTCTAGCTTCGAAGGCATGGCCCTGCAGAGTTATTTCTTCCTGGCTCAAAGGAATCTTCTCTCCTGCTGCAATCTGGCAATAGAATAGTGTTTCTTATGAAATCTACCGTATAGCGGCTACCAGACTTAGTAAATCAATGGTCTTGCTTTTTTTCTAGGTAAAATGTACATTTAGGTTTTGCAATGCAGCCAAATAAAAACTATTATTTTGTCTACTCATTTGAGTATTGGGCAAAACAAAAAATTAAAAAACAGATGCAGCTTGGCAACAGTCTATCATTTGGGGTATCGGAGTTTTTAAATGGCAAAAGCAGGCAAAGTGATGGCTAACTTACAAATATAAAAATCAGTGTTTGTTCAATATAATCAAAACCAAAACTTCTTACTAGCAACACACTCTCAGTTTTCATTTAAAACATTAGCACTTAATTCCCAAATCAATTTTTTTTAAAAAATAGTATATTATTAGTGTTTAGGACTAGATTCACAGCCAAGCAAAAAGTGTAGCTGACATTGTCATCCTACGCTGTAATCTTCACCAGTAAGTGGGTGATAAAGCAAAACAGAAAGGGGAAAATGATGGTTTTTCAATTTTGTTATGTTGATATGTACTGCATGATACCAGATTACAAACAGGGTGATCACTATTGTTTGTTGTTACTATAATTATTACTATTTTAGTTATTATGTACCAATACAACAAATCACTCTCTTCAATTAACTAGTATAAATTGGAAATGGCTATTGGAGGACACATTGCACTTTCTCTCTTTACTCTTAAGTTTTTTTCCAAGATGAGAAAATGACAACCTGAGAAAGCAATATAGATACAGGAAAATCTAGACTCTAAGTAACTTAGCATGACATTGAACTAAACCGGTAAGTATAAAACAGAAGCAAAAGTTTCATTTTTCTGAATCTGTAAATATGAAAGATCAGGATGCACAGCAGTTAAGAATGAAAGGAAACGGAACTAAGTTAAATACCTTTATGGCAGTATATTTTGAAAACACCTCAGGCTCTGCAGACAGATTGCCTAGGTTCAAATTTTGTCTCTATACTTACTTTGTCATCTAGACAAGTTTCTTAAGCTTTCCATGCTTCAGAGAAAAGTGTCTGGCATACAGTCAGCACTATGTTACCTATTATCATTCCATCCTTAGGATCTAGAACCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGATTACAAATCACTCTACTATAAAGACGCATGCATGTGTATGTTTATTGCAGCACTGTTCACAATAGACTTGGAACCAGTTTTTTAACGTTTTAATAAATAATTCTGGGTCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACACGCCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAGCCGGGAGGTAGAGGTTGCAGTGAGCTATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAAGAGCAAAACTCTGTCTCTTGTGTTCACCTTGACTTGTCTTTGCCTGTCCATTTTCCTCCAAGCTTGGCTTCCACTTGAGCCCAGAAAAGACAGGCCCCAATCATGCCTCTGGGTCTTTGGAGATATGTGCCATTTGAGTTCTCTCAGGCTGACACTGGCTCTCCGGAACCCCTAACCTTGACATTTTCACCAGCTTTCCCTGAACACTGTTAACTATCTGTATCTGCAGCCTGAACCCAGGACACTTACATCAGTCATCATTCAACCCTTGTTCTAGGAAGGCTTGACTGCACAGGCAGGTCCTCGAGCTTAGACTCTTGACTCACCAAATGGTGAGCCCCTTTGTTTTACCTCTGTTTGAAGGCCAGATGCCAAATGCCTTGAACTCTATAAACCAGGTCCAGCAGCTTCCCTAAGTTCTAGTGTCCCTCCCCAGATGATAAAAGCTGGCTTCTC
ATCACTGGGATGGTTACAGTCCTAGAGAACAAGAATCTGAACCAGGGCACATTCCACTGGTTAGAAATGGTTCAAGTAGAAAGGATGTGGTGTGTTGAAAAGAACGTTGTTGCAGGGTCTTTCCAGGATTTTGGCAGGTCACTTGACCTCTTTGAACCCCAGAGTCCTCGTTGATAAGATTAGAGGTGCCTACAGGTGGCTCACGCCTGTACTCCCAAGACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAACCGGTGGGGCAAGCAGAGTTAAGATGCTTTGCTAAGTTAAAAAGTCTACTAACTACCAAATCTTGCTGTGGCTTATCCAGAGCTCTCAAAATGCTGCCAATTTATTTTTAAGAAGATCTAAATCCTCATTTTGGCTTTTAGGACACTAGGATTTGCCTTCAACCCATGTCTCCAGTCATATATTTTCTTACTATTCTTCAAACATACCTTTTTCTCTTTTCTTCACTCTTCATTATGCTGTTTAAATCTACCTATCTAAATCCATTCCAGACATCCTCTTAAAAACTTGTCCTGGCCAGGCACGGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCACCTTGAAAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTAGCCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTAGGCATGGTGGTATACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCTGAGAACTGCTTAAGTCAGGGAGATAAAGGTTGTAGTGAGCTGAGATCACACCACTGTACTCCAGCCTGGGCACAGAGTGAGACCTTGTCTCAAAAACAAAAACAAACAAAAAAACAAACAAACAAAAAACTTGTCCTAATTATATCAGTCTAGTGTGACCTCTTACCCCTGAGAATTGCTATATCCCATCACTGTATAACTTATTCCAGCAATTGAAATTAAGATGACAGGAGACCGTGGAGGCTCAGAGCACTGACTCTGGAGCAAGACTGCCTGGGTCTGAATCTTGGCTCCAAGGATGACCTTGGACAAGTCACTTAACTCTTCTGTGCTCCAGTTTCCTCATCTAGAAAACAGGGATGATAATAATGCCTACTTACAGGGTACTTCTCATGGTGAAAGGAACACAAGTAGAAAAATCACCTAGAGCAGTGCCTGTAAGTAGGAAGTCCTAAATAATCACTAGTTATGACCACTGTTATTAATCATATGCTGAACTGTGATAGCTCTTCCACTGTTTCTTTACTTTAATTTTTTTATTGTTTAGCTTATACTAAGTTTATGTGTTAATTCTCCAACTTGACTTTATGTCCTTTGAAGGCAGTCTGCCTTGTGCATAGCAGATATCAGTCATCTTAAATCATTTTTGGAATGAGGCAAGGTCAAGAACAGTACACACAAAATATTTCCTGGTTAGGTTTGACCAAGTACTGCTGAATTTCAAAAAAAAGGAGTCCGTTGTTGAAAAATACTTGTTATTCTTTAAAAATAACAATTCCAGAGGCAAAAAGTAATGGTTACTGAGAAATCACTTAAATTCTTTATTTTAAAATATGCTAGACAGTTCTGTAAGACTCAGGGATAAGAATGTGTCCAAAAACAATAATGTACTAAAAACTTAAAAAGAGTGAGACTTTTCATTTTCTTTCACTTTACCTTGCCGTACTCCAGTTTCAATCCTGGTGGAAGGGTCTGCTCGAGGAGTAGAGAGGTGCACTAATGGGCCTGCCACAGGCATGAAGTTATTGCTAGGATCTTCTGCATATATGCTAGCTTCGAAGGCATGGCCCTGCAGAGTTATTTCTTCCTGGCTCAAAGGAATCTTCTCTCCTGCTGCAATCTGGCAATAGAATAGTGTTTCTTATGAAATCTACCGTATAGCGGCTACCAGACTTAGTAAATCAATGGTCTTGCTTTTTTTCTAGGTAAAATGTACATTTAGGTTTTGCAATGCAGCCAAATAAAAACTATTATTTTGTCTACTCATTTGAGTATTGGGCAAAACAAAAAATTAAAAAACAGATGCAGCTTGGCAACAGTCTATCATTTGGGGTATCGGAGTTTTTAAATGGCAAAAGCAGGCAAAGTGATGGCTAACTTACAAATATAAAAATCAGTGTTTGTTCAATATAATCAAAACCAAAACTTCTTACTAGCAACACACTCTCAGTTTTCATTTAAAACATTAGCACTTAATTCCCAAATCAATTTTTTTTAAAAAATAGTATATTATTAGTGTTTAGGACTAGATTCACAGCCAAGCAAAAAGTGTAGCTGACATTGTCATCCTACGCTGTAATCTTCACCAGTAAGTGGGTGATAAAGCAAAACAGAAAGGGGAAAATGATGGTTTTTCAATTTTGTTATGTTGATATGTACTGCATGATACCAGATTACAAACAGGGTGATCACTATTGTTTGTTGTTACTATAATTATTACTATTTTAGTTATTATGTACCAATACAACAAATCACTCTCTTCAATTAACTAGTATAAATTGGAAATGGCTATTGGAGGACACATTGCACTTTCTCTCTTTACTCTTAAGTTTTTTTCCAAGATGAGAAAATGACAACCTGAGAAAGCAATATAGATACAGGAAAATCTAGACTCTAAGTAACTTAGCATGACATTGAACTAAACCGGTAAGTATAAAACAGAAGCAAAAGTTTCATTTTTCTGAATCTGTAAATATGAAAGATCAGGATGCACAGCAGTTAAGAATGAAAGGAAACGGAACTAAGTTAAATACCTTTATGGCAGTATATTTTGAAAACACCTCAGGCTCTGCAGACAGATTGCCTAGGTTCAAATTTTGTCTCTATACTTACTTTGTCATCTAGACAAGTTTCTTAAGCTTTCCATGCTTCAGAGAAAAGTGTCTGGCATACAGTCAGCACTATGTTACCTATTATCATTCCATCCTTAGGATCTAGAACCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGATTACAAATCACTCTACTATAAAGACGCATGCATGTGTATGTTTATTGCAGCACTGTTCACAATAGACTTGGAACCAGTTTTTTAACGTTTTAATAAATAATTCTGGGTCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACACGCCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAGCCGGGAGGTAGAGGTTGCAGTGAGCTATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAAGAGCAAAACTCTGTCTCTTGTGTTCACCTTGACTTGTCTTTGCCTGTCCATTTTCCTCCAAGCTTGGCTTCCACTTGAGCCCAGAAAAGACAGGCCCCAATCATGCCTCTGGGTCTTTGGAGATATGTGCCATTTGAGTTCTCTCAGGCTGACACTGGCTCTCCGGAACCCCTAACCTTGACATTTTCACCAGCTTTCCCTGAACACTGTTAACTATCTGTATCTGCAGCCTGAACCCAGGACACTTACATCAGTCATCATTCAACCCTTGTTCTAGGAAGGCTTGACTGCACAGGCAGGTCCTCGAGCTTAGACTCTTGACTCACCAAATGGTGAGCCCCTTTGTTTTACCTCTGTTTGAAGGCCAGATGCCAAATGCCTTGAACTCTATAAACCAGGTCCAGCAGCTTCCCTAAGTTCTAGTGTCCCTCCCCAGATGATAAAAGCTGGCTTCTC
Task1_train_7897
This alteration occurs within gene MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1) located on Chromosome 3. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 deficiency
TGTATGGCTAACATTTCATAAGTAAAGAACTTACATATTCAAAAAATGCTGCAGGCATGGAGTTACATAATAACTCAAATAAGCTATTGATGTCTCTGAAATAAGTTACTGAAATAAGCTATTGATGTCTCCACAATTCTAACTTAAGAGCATGCTGATTTGGATGGCTAGCCTATTCTTTCTTGAAAGGAAGCCTTCAATGTACCTTAGAAATGCCCCCCCCTTTTTTTTTGCCTTAATTGAATTTCATTTACTATGCCATGCTCAGGACAGTTGTTTTATAGGGCCTGAAACAAAAAACAATTTGGGGGTCTTCTCTAAGGAGAAGAATACAAAACTGCAAATACAAAATTAGGTCAGGGTCTTGGAAGAGATTAATGTCAAAGAAGGGCCTGAAGTTTCAAGTCTGTTACCTTCAAGGTAAATCTCTTTCCAGTCATGGTTCCCAAATAAATTATTCTTTTCACTTGACTTACAGGTCACACACATATATATATAAAATTTAACAATTGTCATAAAAATCTATGAAATGAGAAACTTTATAATCAGCATCTTAAACAACAAACATGAAAATAAAATTCCAGAAAAAAAAATAGGGATTCACACTGCATTTGCTATAGTGGTACCCAGAGAAGTAGCTTAGTGCAGTGGCTTAGATATGAACTCTGGAGTCAAAGTGCCTGGGTTCAAATCTCAGCTTTACTACTTAACAGCTGAGTGACCTCAGAAAAGTAACACAACACAACCATTCTGTTGCTTAGTGTCCTCACCTGTAAAATGAAAACAGTACTTACCTAATGAGGTTGTTGTAAGAATTATATTAGAATTAGAAGGACAGCAAGATTATTTAGCATGTGTAAAATATTTAAAATCTGGCACATGGTAAGTGCAATGTAAGTGTTAGCTCCTATTAACAGCATATCACTTGTAATTCAATTTAGAAAATTACTTCCATTTCCTGAGCATCTCAACTGACAGAGTTCTATAAATATAGCTGAATTTATTACAATAATTTGCTAATATTGAAAAAAAACCCTAAATTTCATCAACAAGAAACATACTGAATGAATTAATGGTATATCAAGATCATAGAACCGCTAGGTCACCAACAAAAAGAATGAGGCTGATCTACAATTACTGACATGGAAAGATGTCTGTGATATAATATTAGTGTATAAGATTCTATTCACTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGACCAACATGGGAAAACCCCATCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGGGCATACCTGTAATTCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGACAATCGCTTGAACTCGGGAGGCAGAGGTTGCAATGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACTGAATGAGAGACTCCGTCCAAAAAAAAAAAAAAATTCTATTCACTGTTCTTAGGTATGTATTTTGTTTGCTGTATGTATATGTATATAGGTTTCTATTCACATAGAAAATGGCTGGAAGAATGCATACCATCCTACAATCAGTGGTTACATCACAGGACAGAACTGGGAAACTTGTAATAATATACTTATATACTACTACAGTTTTATATTTTATAGAATGTGCATGCATTATTTTTATAATTTAATTTTTAAACTCTGAGTCAGAAAAATAAGGCCAACCCACCTCGGTGTGTCTACAAACTTCTCGATCAGCATAGCATCATCATTGAAAGACTTCTTAGCTTCTCTCCGTGCTGACTCTAACTGTTCTTGAAATTCTTGTTCTGATCTAACAATCCTCATTCCCTAAGAGAGAAAAGATGATTATGACTACAACATAAATAAAACAAAGAAGACAAGCCTGAATTGGCAAACACAAGCATGCACAATCTTACTTTTCCTCCTCCACCCCGGACGGCTTTAATCATGACAGGATAGCCAATTCTCCTGGCGTGTTCCTTCAGGCACTGGTCTGATTGGTCCTCACCATGATAACCCTCCACAACAGGTACTCCAGCAGCAGCCATTATGGATTTGGATGTGCTTTAGAGTGGGAAAGAAAACAACATGCCCCAAATTCTACAAATTATTTCATTCAAGACAAACATAAATATAGCCCAGTCTATAAATTACAATGGAACTCTTTAAAGAAAACATCGAGTCTGAGACGACAAAATAATACAAATTTAATATGTCTATTAGTTAGTTTCCCTCATTTCATGTGGTAGCTCATCTCACCCTATTTTTTAATCCCAAAATACTAATATATTGATTAGAAACATTAAGTATTTTCTGTAACTCAATAGAATTTCTCTATGTCACAGATAAATAACTTATGCCTATGACAACAGAAGGGTAGAATTAAAATATTATAGGTAAAACAAACTATTTCTTTTTTTTTTTTAGAGACAGGGTCTCACAATGTTGCCCATGCCAGAGTGCAGTGGTGCAATTATACTTCACTACAGCCTTAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCTAAGCAGCTGGGACTACAGGTGTGTGTCACCATACCCAGCTGAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTCTTACTCTGTCACCCAGACTGAAGTATGATGGTGTGATCACAGCTCACTGCAGCCTTGATCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGATGCTGGACCCACAGGCACGTGCCACCATGCCTGGAATTTTTAAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAACTTCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCCAGGCCTGGCTGATTTAAAAAAAAGAATTTTGAGAGACAAGGTCTCACTAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGGCCTCAAGCTATCCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAAACACTGGTATTACAGGCATAGCCACATGCCTGGCCCAAACTATTTCAACTGACCTTCATACAGTTATATTTTAAAAGATATAAACTCATACCTCTTTATACCCATGTCTCTAATTGCAGATGGAGGAGGGCCTATAAAAATAATTCCTTCTTGCTTACAAAGTTCAGCAAATTCCATGTTTTCTGAGAGAAAACCGCATCCTGGATGGATAGCCTAGAAATGAGAAATAAAATAAAAAATTTACTCATCAGTGCTCAACTGGCAACACCTTAATGCAGGTGAAGCTGTCTTCCTCTGGGAGGCCTCTCCCTACACTGGTAATAGTATGGTCTCTATTAAACTCTGTTTCCAAAGAAATATCTGAAATATTCATATGAAAGCTCTGAAGGCTTACCTAAACCAGATGAATCTATATTTCTTTTTATTGTGATAATATATACATAGCAAAACACTGACCATTTTAGTTACTTGCAAGTATGTAATTCAGTGGCATTAAGTACACTCACAATGTTGGGCAACTGTCATCACCATCCATCCTCAGGATGTTTTAATCTCCAAACATAATTCTCCATTCCCTCCCTTTCCTTAGTCCCTAGTAACCAGGATTTTACTTTCTGTTTATGAATTTCTCTAGCCAAAGTACCTCATGTAAGTGGAAGCGTATAATAATTTGTCTGAGTTTGGCTTATTTCACCTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATTCATGTAACATGTATCAAAATTCCATTTGTTTTTAAGGTTGAATAATATCCAGTTTGTACACATTTTGTTTATCCATTAATCTCTTGATGGACATTGTGTTATTTCTACACATTGTGAATACTGCTGCTGTGAACAACAAGTATTGGTATACAAGTATCTGTTTTGAGTCCCTGCTTTAAATTCTTCTAGCTGTATACCAAAAGTGGAATTGCTGGATCATATGGTACAGAAGTTTCTATATACTTAAATTTAAAATAATATTGCAATTAGGGTAGAATGTCAAGAAGTAAAGGGCTTCAGAGTGGTAAGGGGAATTTGTCTATTCTGTCTCTGTGTAAAACTGGCCTAGAATTGAAATCATGG
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Task1_train_7898
Consider this mutation in MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1) on Chromosome 3. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; not specified
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Task1_train_7899
Here is a variant affecting MCCC1 (methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1) on Chromosome 3. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase 1 deficiency
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