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Task1_train_4100
This alteration occurs within gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) located on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
CAGCAGGAGTCTTATGTGTTTTGTTTCCTCTGTTGGCTGTTCCTATAAGGTTACCTGGCACACAGTAGGCGTTTCATCTACATTTCTGAAATTAAAAAACTGTGCCTTTACAAACAAATTGGATCAAACCAAAATTACCATGTTGGATTGAATCAGTGAGTTGCAGCAGTCTTTCTGGAACAAGGCAGGCTAAATTTATATTATCCAAATTTATGGTTGGTTTTACTGGAATGAGGAATGGCTCCCTGATAATTTCCTGCCCACCATGGATCTTGATTCTCTGCATGTGAATCTGGATTAAGCACAGTTCACTAAACAGAAACTTATAATTCAGCACAATTTTTGTCTGGAGAATGAGTCACAGAGATATCAATGGCAACCACATGCCGCCATTTTTAAATGAAAATCAAATTCAGAGGTGACCAACAATACCTTATGAGCATACTCCTCTGGTTTCATATTTTGAACACAATGTATAGCTTTATACATCATCTTCTCTCGGAAATCATTAACTGTCTCATGTTCGATAACTCCTGAACCACTGTGAGCAACCAGGACGTAGGTGCTCTCATCAGCTCTGGCTCGACCACGGGCCTGAAAACACAAATAAATCAAGTAAATGAAAGGGTACGTTGTGATACAAATCCTCCTGGTTTTTTCTGGGAATGATATTCTTGCTCAGAATGAAATGATATTGGGTTGTTCAGCATGCCAGTCTTCAAATGGGTAAAGTTAGTAAAGTTAGTTATTAATCCATTACTTGTAAGTCAGCTCTTTGAAACTTATAATATGCTTTAATACAGAAAAAGTGTTCTAGAGTGATGATGGTTAGGCCTCAATGACATAATATCATCCTGTCCAGGCTTTTTGCTCTCAGAACTTCTCTCTCAAACTATGAGAACCACGATCAATGACTTGGACTGAGGAGTCGTCTTTCTTGGTAGGAAGCTGGGAGGAATGAATGGAGAGAAGGGTCATCTCTGACCTTGACACTAGGGCTGGTGAGAAGGCAGGTCAGTTTCTGGCATCCTACATTACATTCTTAGCACATTTTCCCATGGGAACATATTTAACATGGTGATAACTTTCTACAAGCCTCTTTATGAAAGTGATATTCAGGTATATTTTGATTAATAGAAACTTCTGTGGCCTGGCCCAGGAGCCTATCAACTATAAAAGTATCCTCAAGGAAAAATGTATTCTAAGTTTGATTACTAAGCTTATCACTGACTTACAAATAGACTCCTGAAATAAAATTATTTGCTAATTTGATGGCAGTCTGGTTATCTTAGTCTTCTATGACTTGCCTTTTATTCAAGGATGCAATTTAAGTTATTTAAAAATCCCTTTAGTTAATTTTATAGGAAGAATAGTGTATCTATTAATCAGCATAACACCTATGCCTACTCAACAGGTTACAATAATGCCATTAACATAGGTGGGTAAGAGATAAAGTGAAATCTGAATGAAAACAGAACATTTCACTCTTTTATTTATTTTTACATTTATAAGTCTGCCCCCAACCAACATTTTATCATGAAAACTTCTAAACACACAGAAAATTGGAAAGGATAAGGGAAGAAAATGCAGAAACAGCAGGGCTCCCTCAGGTTTGGGCATGTTACTTCATCAGACATTTGTGGGACAGTGTACTTTAGATTCCTGGTCCAGCTGGGGGCTCACAGACATCCTAGGAAAGAGGAGGCTGCTTTTGACTCTTACAAATGGGGCTAGTGTCATGGTCCTGGAAAGCCTTAGGGTACAGAAATAGCTAAAGAGGAGTTGTTGTTTAAACATACAACAGGTATCTGGTTATTATATGAATTGACAGCAATATGAAAGGCAACAGTGCACAGCATTTTAAAAATGCTCTTTTAACAGGAAAAAGGCTTTGTTTTAAAAACTAAAAAGATGTTTTTGCTGTTTAACTAAAAGAAAGCAATTAAAATAGGAACACAACAAATAAAAATTAACATAGTAAGTAGAGGTATTTGAATGTACCTGGACCATGGCTATTTCATTGGTGACGAGACCATAACGGATAACAATGTTACATTCTTTAATATCCAGACCTTCTTCTGCCACTGTGGTAGCGATAAGCAGATTTATTTTTCCAGTGCGAAATTTACTAATGACTTCTTTTTGTTCATTCTGTAGAAACATTTTAATAAATTAAATTTTGTGATGCTAAACACATTAAAATCTTCTAATTAGAGGAAGAAATAATAAATTGCAACTGGTCAGTGTAAATCAAAGGATTAGATCATACATGGATTTGTTGCCATCTGTTTTTGGCATTGAACAAAGACATAATGGTGAGACAACATTTGATTTCCAATCTGGGATTACCACACAATAACAAAAATATTTCCATCATCCAGTCTGGAGGTGGGAAGACCACATTTTATGCCAAGGAAATAAATTGATGGGTGACTCCAGAGGAAGAAAGGAGGAGCTGTCGGTTGAGAAGAGGATATGACAATCAGAAGCTAAAATGGGCTTTTTTCCCCCACTACATTAACTTCAGAATCTTTGCTATTTAGAGGATAAGATGCAGAGATGCTTTGATATATTGTTTTCAGTCACAGAGAAAATGCACACTGTATATGCATTTGGTCACTTTAAGAATCATTTGAGTTAGAAGCTATGGAATATTCCCAAAAGGACACAAGAGAAACTGAAAACATCAGCTGCATCTAGGGAGGGGAGCTGGAAGACTAGAGGTCAGTGGTATGCCTTGTGCCTCATTAATTTTGAATGAGGTAAATATATTATCAATTCAAAGGGACAATATAAATAAAAATGAAAGAAGAGGTTATGCAACTGTAAATAAAACTATTTTCAAATGAAAAAACTCTGAATTTTGAAAGTCAATATAAATAAATTAAAATATGACCTCTCATCCTTACATGGGAGAAATGAGTGAGCACAAACCTAGCTTGATATGGACAATGTGGTTTTATTTTCATAACCACTCTCATCAAAGCTGTTGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAA
CAGCAGGAGTCTTATGTGTTTTGTTTCCTCTGTTGGCTGTTCCTATAAGGTTACCTGGCACACAGTAGGCGTTTCATCTACATTTCTGAAATTAAAAAACTGTGCCTTTACAAACAAATTGGATCAAACCAAAATTACCATGTTGGATTGAATCAGTGAGTTGCAGCAGTCTTTCTGGAACAAGGCAGGCTAAATTTATATTATCCAAATTTATGGTTGGTTTTACTGGAATGAGGAATGGCTCCCTGATAATTTCCTGCCCACCATGGATCTTGATTCTCTGCATGTGAATCTGGATTAAGCACAGTTCACTAAACAGAAACTTATAATTCAGCACAATTTTTGTCTGGAGAATGAGTCACAGAGATATCAATGGCAACCACATGCCGCCATTTTTAAATGAAAATCAAATTCAGAGGTGACCAACAATACCTTATGAGCATACTCCTCTGGTTTCATATTTTGAACACAATGTATAGCTTTATACATCATCTTCTCTCGGAAATCATTAACTGTCTCATGTTCGATAACTCCTGAACCACTGTGAGCAACCAGGACGTAGGTGCTCTCATCAGCTCTGGCTCGACCACGGGCCTGAAAACACAAATAAATCAAGTAAATGAAAGGGTACGTTGTGATACAAATCCTCCTGGTTTTTTCTGGGAATGATATTCTTGCTCAGAATGAAATGATATTGGGTTGTTCAGCATGCCAGTCTTCAAATGGGTAAAGTTAGTAAAGTTAGTTATTAATCCATTACTTGTAAGTCAGCTCTTTGAAACTTATAATATGCTTTAATACAGAAAAAGTGTTCTAGAGTGATGATGGTTAGGCCTCAATGACATAATATCATCCTGTCCAGGCTTTTTGCTCTCAGAACTTCTCTCTCAAACTATGAGAACCACGATCAATGACTTGGACTGAGGAGTCGTCTTTCTTGGTAGGAAGCTGGGAGGAATGAATGGAGAGAAGGGTCATCTCTGACCTTGACACTAGGGCTGGTGAGAAGGCAGGTCAGTTTCTGGCATCCTACATTACATTCTTAGCACATTTTCCCATGGGAACATATTTAACATGGTGATAACTTTCTACAAGCCTCTTTATGAAAGTGATATTCAGGTATATTTTGATTAATAGAAACTTCTGTGGCCTGGCCCAGGAGCCTATCAACTATAAAAGTATCCTCAAGGAAAAATGTATTCTAAGTTTGATTACTAAGCTTATCACTGACTTACAAATAGACTCCTGAAATAAAATTATTTGCTAATTTGATGGCAGTCTGGTTATCTTAGTCTTCTATGACTTGCCTTTTATTCAAGGATGCAATTTAAGTTATTTAAAAATCCCTTTAGTTAATTTTATAGGAAGAATAGTGTATCTATTAATCAGCATAACACCTATGCCTACTCAACAGGTTACAATAATGCCATTAACATAGGTGGGTAAGAGATAAAGTGAAATCTGAATGAAAACAGAACATTTCACTCTTTTATTTATTTTTACATTTATAAGTCTGCCCCCAACCAACATTTTATCATGAAAACTTCTAAACACACAGAAAATTGGAAAGGATAAGGGAAGAAAATGCAGAAACAGCAGGGCTCCCTCAGGTTTGGGCATGTTACTTCATCAGACATTTGTGGGACAGTGTACTTTAGATTCCTGGTCCAGCTGGGGGCTCACAGACATCCTAGGAAAGAGGAGGCTGCTTTTGACTCTTACAAATGGGGCTAGTGTCATGGTCCTGGAAAGCCTTAGGGTACAGAAATAGCTAAAGAGGAGTTGTTGTTTAAACATACAACAGGTATCTGGTTATTATATGAATTGACAGCAATATGAAAGGCAACAGTGCACAGCATTTTAAAAATGCTCTTTTAACAGGAAAAAGGCTTTGTTTTAAAAACTAAAAAGATGTTTTTGCTGTTTAACTAAAAGAAAGCAATTAAAATAGGAACACAACAAATAAAAATTAACATAGTAAGTAGAGGTATTTGAATGTACCTGGACCATGGCTATTTCATTGGTGACGAGACCATAACGGATAACAAAGTTACATTCTTTAATATCCAGACCTTCTTCTGCCACTGTGGTAGCGATAAGCAGATTTATTTTTCCAGTGCGAAATTTACTAATGACTTCTTTTTGTTCATTCTGTAGAAACATTTTAATAAATTAAATTTTGTGATGCTAAACACATTAAAATCTTCTAATTAGAGGAAGAAATAATAAATTGCAACTGGTCAGTGTAAATCAAAGGATTAGATCATACATGGATTTGTTGCCATCTGTTTTTGGCATTGAACAAAGACATAATGGTGAGACAACATTTGATTTCCAATCTGGGATTACCACACAATAACAAAAATATTTCCATCATCCAGTCTGGAGGTGGGAAGACCACATTTTATGCCAAGGAAATAAATTGATGGGTGACTCCAGAGGAAGAAAGGAGGAGCTGTCGGTTGAGAAGAGGATATGACAATCAGAAGCTAAAATGGGCTTTTTTCCCCCACTACATTAACTTCAGAATCTTTGCTATTTAGAGGATAAGATGCAGAGATGCTTTGATATATTGTTTTCAGTCACAGAGAAAATGCACACTGTATATGCATTTGGTCACTTTAAGAATCATTTGAGTTAGAAGCTATGGAATATTCCCAAAAGGACACAAGAGAAACTGAAAACATCAGCTGCATCTAGGGAGGGGAGCTGGAAGACTAGAGGTCAGTGGTATGCCTTGTGCCTCATTAATTTTGAATGAGGTAAATATATTATCAATTCAAAGGGACAATATAAATAAAAATGAAAGAAGAGGTTATGCAACTGTAAATAAAACTATTTTCAAATGAAAAAACTCTGAATTTTGAAAGTCAATATAAATAAATTAAAATATGACCTCTCATCCTTACATGGGAGAAATGAGTGAGCACAAACCTAGCTTGATATGGACAATGTGGTTTTATTTTCATAACCACTCTCATCAAAGCTGTTGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAA
Task1_train_4101
A mutation in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
CAGGAGTCTTATGTGTTTTGTTTCCTCTGTTGGCTGTTCCTATAAGGTTACCTGGCACACAGTAGGCGTTTCATCTACATTTCTGAAATTAAAAAACTGTGCCTTTACAAACAAATTGGATCAAACCAAAATTACCATGTTGGATTGAATCAGTGAGTTGCAGCAGTCTTTCTGGAACAAGGCAGGCTAAATTTATATTATCCAAATTTATGGTTGGTTTTACTGGAATGAGGAATGGCTCCCTGATAATTTCCTGCCCACCATGGATCTTGATTCTCTGCATGTGAATCTGGATTAAGCACAGTTCACTAAACAGAAACTTATAATTCAGCACAATTTTTGTCTGGAGAATGAGTCACAGAGATATCAATGGCAACCACATGCCGCCATTTTTAAATGAAAATCAAATTCAGAGGTGACCAACAATACCTTATGAGCATACTCCTCTGGTTTCATATTTTGAACACAATGTATAGCTTTATACATCATCTTCTCTCGGAAATCATTAACTGTCTCATGTTCGATAACTCCTGAACCACTGTGAGCAACCAGGACGTAGGTGCTCTCATCAGCTCTGGCTCGACCACGGGCCTGAAAACACAAATAAATCAAGTAAATGAAAGGGTACGTTGTGATACAAATCCTCCTGGTTTTTTCTGGGAATGATATTCTTGCTCAGAATGAAATGATATTGGGTTGTTCAGCATGCCAGTCTTCAAATGGGTAAAGTTAGTAAAGTTAGTTATTAATCCATTACTTGTAAGTCAGCTCTTTGAAACTTATAATATGCTTTAATACAGAAAAAGTGTTCTAGAGTGATGATGGTTAGGCCTCAATGACATAATATCATCCTGTCCAGGCTTTTTGCTCTCAGAACTTCTCTCTCAAACTATGAGAACCACGATCAATGACTTGGACTGAGGAGTCGTCTTTCTTGGTAGGAAGCTGGGAGGAATGAATGGAGAGAAGGGTCATCTCTGACCTTGACACTAGGGCTGGTGAGAAGGCAGGTCAGTTTCTGGCATCCTACATTACATTCTTAGCACATTTTCCCATGGGAACATATTTAACATGGTGATAACTTTCTACAAGCCTCTTTATGAAAGTGATATTCAGGTATATTTTGATTAATAGAAACTTCTGTGGCCTGGCCCAGGAGCCTATCAACTATAAAAGTATCCTCAAGGAAAAATGTATTCTAAGTTTGATTACTAAGCTTATCACTGACTTACAAATAGACTCCTGAAATAAAATTATTTGCTAATTTGATGGCAGTCTGGTTATCTTAGTCTTCTATGACTTGCCTTTTATTCAAGGATGCAATTTAAGTTATTTAAAAATCCCTTTAGTTAATTTTATAGGAAGAATAGTGTATCTATTAATCAGCATAACACCTATGCCTACTCAACAGGTTACAATAATGCCATTAACATAGGTGGGTAAGAGATAAAGTGAAATCTGAATGAAAACAGAACATTTCACTCTTTTATTTATTTTTACATTTATAAGTCTGCCCCCAACCAACATTTTATCATGAAAACTTCTAAACACACAGAAAATTGGAAAGGATAAGGGAAGAAAATGCAGAAACAGCAGGGCTCCCTCAGGTTTGGGCATGTTACTTCATCAGACATTTGTGGGACAGTGTACTTTAGATTCCTGGTCCAGCTGGGGGCTCACAGACATCCTAGGAAAGAGGAGGCTGCTTTTGACTCTTACAAATGGGGCTAGTGTCATGGTCCTGGAAAGCCTTAGGGTACAGAAATAGCTAAAGAGGAGTTGTTGTTTAAACATACAACAGGTATCTGGTTATTATATGAATTGACAGCAATATGAAAGGCAACAGTGCACAGCATTTTAAAAATGCTCTTTTAACAGGAAAAAGGCTTTGTTTTAAAAACTAAAAAGATGTTTTTGCTGTTTAACTAAAAGAAAGCAATTAAAATAGGAACACAACAAATAAAAATTAACATAGTAAGTAGAGGTATTTGAATGTACCTGGACCATGGCTATTTCATTGGTGACGAGACCATAACGGATAACAATGTTACATTCTTTAATATCCAGACCTTCTTCTGCCACTGTGGTAGCGATAAGCAGATTTATTTTTCCAGTGCGAAATTTACTAATGACTTCTTTTTGTTCATTCTGTAGAAACATTTTAATAAATTAAATTTTGTGATGCTAAACACATTAAAATCTTCTAATTAGAGGAAGAAATAATAAATTGCAACTGGTCAGTGTAAATCAAAGGATTAGATCATACATGGATTTGTTGCCATCTGTTTTTGGCATTGAACAAAGACATAATGGTGAGACAACATTTGATTTCCAATCTGGGATTACCACACAATAACAAAAATATTTCCATCATCCAGTCTGGAGGTGGGAAGACCACATTTTATGCCAAGGAAATAAATTGATGGGTGACTCCAGAGGAAGAAAGGAGGAGCTGTCGGTTGAGAAGAGGATATGACAATCAGAAGCTAAAATGGGCTTTTTTCCCCCACTACATTAACTTCAGAATCTTTGCTATTTAGAGGATAAGATGCAGAGATGCTTTGATATATTGTTTTCAGTCACAGAGAAAATGCACACTGTATATGCATTTGGTCACTTTAAGAATCATTTGAGTTAGAAGCTATGGAATATTCCCAAAAGGACACAAGAGAAACTGAAAACATCAGCTGCATCTAGGGAGGGGAGCTGGAAGACTAGAGGTCAGTGGTATGCCTTGTGCCTCATTAATTTTGAATGAGGTAAATATATTATCAATTCAAAGGGACAATATAAATAAAAATGAAAGAAGAGGTTATGCAACTGTAAATAAAACTATTTTCAAATGAAAAAACTCTGAATTTTGAAAGTCAATATAAATAAATTAAAATATGACCTCTCATCCTTACATGGGAGAAATGAGTGAGCACAAACCTAGCTTGATATGGACAATGTGGTTTTATTTTCATAACCACTCTCATCAAAGCTGTTGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACC
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Task1_train_4102
Given a variant located on Chromosome 2 and affecting IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
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TAGGCGTTTCATCTACATTTCTGAAATTAAAAAACTGTGCCTTTACAAACAAATTGGATCAAACCAAAATTACCATGTTGGATTGAATCAGTGAGTTGCAGCAGTCTTTCTGGAACAAGGCAGGCTAAATTTATATTATCCAAATTTATGGTTGGTTTTACTGGAATGAGGAATGGCTCCCTGATAATTTCCTGCCCACCATGGATCTTGATTCTCTGCATGTGAATCTGGATTAAGCACAGTTCACTAAACAGAAACTTATAATTCAGCACAATTTTTGTCTGGAGAATGAGTCACAGAGATATCAATGGCAACCACATGCCGCCATTTTTAAATGAAAATCAAATTCAGAGGTGACCAACAATACCTTATGAGCATACTCCTCTGGTTTCATATTTTGAACACAATGTATAGCTTTATACATCATCTTCTCTCGGAAATCATTAACTGTCTCATGTTCGATAACTCCTGAACCACTGTGAGCAACCAGGACGTAGGTGCTCTCATCAGCTCTGGCTCGACCACGGGCCTGAAAACACAAATAAATCAAGTAAATGAAAGGGTACGTTGTGATACAAATCCTCCTGGTTTTTTCTGGGAATGATATTCTTGCTCAGAATGAAATGATATTGGGTTGTTCAGCATGCCAGTCTTCAAATGGGTAAAGTTAGTAAAGTTAGTTATTAATCCATTACTTGTAAGTCAGCTCTTTGAAACTTATAATATGCTTTAATACAGAAAAAGTGTTCTAGAGTGATGATGGTTAGGCCTCAATGACATAATATCATCCTGTCCAGGCTTTTTGCTCTCAGAACTTCTCTCTCAAACTATGAGAACCACGATCAATGACTTGGACTGAGGAGTCGTCTTTCTTGGTAGGAAGCTGGGAGGAATGAATGGAGAGAAGGGTCATCTCTGACCTTGACACTAGGGCTGGTGAGAAGGCAGGTCAGTTTCTGGCATCCTACATTACATTCTTAGCACATTTTCCCATGGGAACATATTTAACATGGTGATAACTTTCTACAAGCCTCTTTATGAAAGTGATATTCAGGTATATTTTGATTAATAGAAACTTCTGTGGCCTGGCCCAGGAGCCTATCAACTATAAAAGTATCCTCAAGGAAAAATGTATTCTAAGTTTGATTACTAAGCTTATCACTGACTTACAAATAGACTCCTGAAATAAAATTATTTGCTAATTTGATGGCAGTCTGGTTATCTTAGTCTTCTATGACTTGCCTTTTATTCAAGGATGCAATTTAAGTTATTTAAAAATCCCTTTAGTTAATTTTATAGGAAGAATAGTGTATCTATTAATCAGCATAACACCTATGCCTACTCAACAGGTTACAATAATGCCATTAACATAGGTGGGTAAGAGATAAAGTGAAATCTGAATGAAAACAGAACATTTCACTCTTTTATTTATTTTTACATTTATAAGTCTGCCCCCAACCAACATTTTATCATGAAAACTTCTAAACACACAGAAAATTGGAAAGGATAAGGGAAGAAAATGCAGAAACAGCAGGGCTCCCTCAGGTTTGGGCATGTTACTTCATCAGACATTTGTGGGACAGTGTACTTTAGATTCCTGGTCCAGCTGGGGGCTCACAGACATCCTAGGAAAGAGGAGGCTGCTTTTGACTCTTACAAATGGGGCTAGTGTCATGGTCCTGGAAAGCCTTAGGGTACAGAAATAGCTAAAGAGGAGTTGTTGTTTAAACATACAACAGGTATCTGGTTATTATATGAATTGACAGCAATATGAAAGGCAACAGTGCACAGCATTTTAAAAATGCTCTTTTAACAGGAAAAAGGCTTTGTTTTAAAAACTAAAAAGATGTTTTTGCTGTTTAACTAAAAGAAAGCAATTAAAATAGGAACACAACAAATAAAAATTAACATAGTAAGTAGAGGTATTTGAATGTACCTGGACCATGGCTATTTCATTGGTGACGAGACCATAACGGATAACAATGTTACATTCTTTAATATCCAGACCTTCTTCTGCCACTGTGGTAGCGATAAGCAGATTTATTTTTTCAGTGCGAAATTTACTAATGACTTCTTTTTGTTCATTCTGTAGAAACATTTTAATAAATTAAATTTTGTGATGCTAAACACATTAAAATCTTCTAATTAGAGGAAGAAATAATAAATTGCAACTGGTCAGTGTAAATCAAAGGATTAGATCATACATGGATTTGTTGCCATCTGTTTTTGGCATTGAACAAAGACATAATGGTGAGACAACATTTGATTTCCAATCTGGGATTACCACACAATAACAAAAATATTTCCATCATCCAGTCTGGAGGTGGGAAGACCACATTTTATGCCAAGGAAATAAATTGATGGGTGACTCCAGAGGAAGAAAGGAGGAGCTGTCGGTTGAGAAGAGGATATGACAATCAGAAGCTAAAATGGGCTTTTTTCCCCCACTACATTAACTTCAGAATCTTTGCTATTTAGAGGATAAGATGCAGAGATGCTTTGATATATTGTTTTCAGTCACAGAGAAAATGCACACTGTATATGCATTTGGTCACTTTAAGAATCATTTGAGTTAGAAGCTATGGAATATTCCCAAAAGGACACAAGAGAAACTGAAAACATCAGCTGCATCTAGGGAGGGGAGCTGGAAGACTAGAGGTCAGTGGTATGCCTTGTGCCTCATTAATTTTGAATGAGGTAAATATATTATCAATTCAAAGGGACAATATAAATAAAAATGAAAGAAGAGGTTATGCAACTGTAAATAAAACTATTTTCAAATGAAAAAACTCTGAATTTTGAAAGTCAATATAAATAAATTAAAATATGACCTCTCATCCTTACATGGGAGAAATGAGTGAGCACAAACCTAGCTTGATATGGACAATGTGGTTTTATTTTCATAACCACTCTCATCAAAGCTGTTGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAG
Task1_train_4103
This sequence variant lies in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Singleton-Merten syndrome 1
TTCATCTACATTTCTGAAATTAAAAAACTGTGCCTTTACAAACAAATTGGATCAAACCAAAATTACCATGTTGGATTGAATCAGTGAGTTGCAGCAGTCTTTCTGGAACAAGGCAGGCTAAATTTATATTATCCAAATTTATGGTTGGTTTTACTGGAATGAGGAATGGCTCCCTGATAATTTCCTGCCCACCATGGATCTTGATTCTCTGCATGTGAATCTGGATTAAGCACAGTTCACTAAACAGAAACTTATAATTCAGCACAATTTTTGTCTGGAGAATGAGTCACAGAGATATCAATGGCAACCACATGCCGCCATTTTTAAATGAAAATCAAATTCAGAGGTGACCAACAATACCTTATGAGCATACTCCTCTGGTTTCATATTTTGAACACAATGTATAGCTTTATACATCATCTTCTCTCGGAAATCATTAACTGTCTCATGTTCGATAACTCCTGAACCACTGTGAGCAACCAGGACGTAGGTGCTCTCATCAGCTCTGGCTCGACCACGGGCCTGAAAACACAAATAAATCAAGTAAATGAAAGGGTACGTTGTGATACAAATCCTCCTGGTTTTTTCTGGGAATGATATTCTTGCTCAGAATGAAATGATATTGGGTTGTTCAGCATGCCAGTCTTCAAATGGGTAAAGTTAGTAAAGTTAGTTATTAATCCATTACTTGTAAGTCAGCTCTTTGAAACTTATAATATGCTTTAATACAGAAAAAGTGTTCTAGAGTGATGATGGTTAGGCCTCAATGACATAATATCATCCTGTCCAGGCTTTTTGCTCTCAGAACTTCTCTCTCAAACTATGAGAACCACGATCAATGACTTGGACTGAGGAGTCGTCTTTCTTGGTAGGAAGCTGGGAGGAATGAATGGAGAGAAGGGTCATCTCTGACCTTGACACTAGGGCTGGTGAGAAGGCAGGTCAGTTTCTGGCATCCTACATTACATTCTTAGCACATTTTCCCATGGGAACATATTTAACATGGTGATAACTTTCTACAAGCCTCTTTATGAAAGTGATATTCAGGTATATTTTGATTAATAGAAACTTCTGTGGCCTGGCCCAGGAGCCTATCAACTATAAAAGTATCCTCAAGGAAAAATGTATTCTAAGTTTGATTACTAAGCTTATCACTGACTTACAAATAGACTCCTGAAATAAAATTATTTGCTAATTTGATGGCAGTCTGGTTATCTTAGTCTTCTATGACTTGCCTTTTATTCAAGGATGCAATTTAAGTTATTTAAAAATCCCTTTAGTTAATTTTATAGGAAGAATAGTGTATCTATTAATCAGCATAACACCTATGCCTACTCAACAGGTTACAATAATGCCATTAACATAGGTGGGTAAGAGATAAAGTGAAATCTGAATGAAAACAGAACATTTCACTCTTTTATTTATTTTTACATTTATAAGTCTGCCCCCAACCAACATTTTATCATGAAAACTTCTAAACACACAGAAAATTGGAAAGGATAAGGGAAGAAAATGCAGAAACAGCAGGGCTCCCTCAGGTTTGGGCATGTTACTTCATCAGACATTTGTGGGACAGTGTACTTTAGATTCCTGGTCCAGCTGGGGGCTCACAGACATCCTAGGAAAGAGGAGGCTGCTTTTGACTCTTACAAATGGGGCTAGTGTCATGGTCCTGGAAAGCCTTAGGGTACAGAAATAGCTAAAGAGGAGTTGTTGTTTAAACATACAACAGGTATCTGGTTATTATATGAATTGACAGCAATATGAAAGGCAACAGTGCACAGCATTTTAAAAATGCTCTTTTAACAGGAAAAAGGCTTTGTTTTAAAAACTAAAAAGATGTTTTTGCTGTTTAACTAAAAGAAAGCAATTAAAATAGGAACACAACAAATAAAAATTAACATAGTAAGTAGAGGTATTTGAATGTACCTGGACCATGGCTATTTCATTGGTGACGAGACCATAACGGATAACAATGTTACATTCTTTAATATCCAGACCTTCTTCTGCCACTGTGGTAGCGATAAGCAGATTTATTTTTCCAGTGCGAAATTTACTAATGACTTCTTTTTGTTCATTCTGTAGAAACATTTTAATAAATTAAATTTTGTGATGCTAAACACATTAAAATCTTCTAATTAGAGGAAGAAATAATAAATTGCAACTGGTCAGTGTAAATCAAAGGATTAGATCATACATGGATTTGTTGCCATCTGTTTTTGGCATTGAACAAAGACATAATGGTGAGACAACATTTGATTTCCAATCTGGGATTACCACACAATAACAAAAATATTTCCATCATCCAGTCTGGAGGTGGGAAGACCACATTTTATGCCAAGGAAATAAATTGATGGGTGACTCCAGAGGAAGAAAGGAGGAGCTGTCGGTTGAGAAGAGGATATGACAATCAGAAGCTAAAATGGGCTTTTTTCCCCCACTACATTAACTTCAGAATCTTTGCTATTTAGAGGATAAGATGCAGAGATGCTTTGATATATTGTTTTCAGTCACAGAGAAAATGCACACTGTATATGCATTTGGTCACTTTAAGAATCATTTGAGTTAGAAGCTATGGAATATTCCCAAAAGGACACAAGAGAAACTGAAAACATCAGCTGCATCTAGGGAGGGGAGCTGGAAGACTAGAGGTCAGTGGTATGCCTTGTGCCTCATTAATTTTGAATGAGGTAAATATATTATCAATTCAAAGGGACAATATAAATAAAAATGAAAGAAGAGGTTATGCAACTGTAAATAAAACTATTTTCAAATGAAAAAACTCTGAATTTTGAAAGTCAATATAAATAAATTAAAATATGACCTCTCATCCTTACATGGGAGAAATGAGTGAGCACAAACCTAGCTTGATATGGACAATGTGGTTTTATTTTCATAACCACTCTCATCAAAGCTGTTGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTC
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Task1_train_4104
This is a variant in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
TTCATCTACATTTCTGAAATTAAAAAACTGTGCCTTTACAAACAAATTGGATCAAACCAAAATTACCATGTTGGATTGAATCAGTGAGTTGCAGCAGTCTTTCTGGAACAAGGCAGGCTAAATTTATATTATCCAAATTTATGGTTGGTTTTACTGGAATGAGGAATGGCTCCCTGATAATTTCCTGCCCACCATGGATCTTGATTCTCTGCATGTGAATCTGGATTAAGCACAGTTCACTAAACAGAAACTTATAATTCAGCACAATTTTTGTCTGGAGAATGAGTCACAGAGATATCAATGGCAACCACATGCCGCCATTTTTAAATGAAAATCAAATTCAGAGGTGACCAACAATACCTTATGAGCATACTCCTCTGGTTTCATATTTTGAACACAATGTATAGCTTTATACATCATCTTCTCTCGGAAATCATTAACTGTCTCATGTTCGATAACTCCTGAACCACTGTGAGCAACCAGGACGTAGGTGCTCTCATCAGCTCTGGCTCGACCACGGGCCTGAAAACACAAATAAATCAAGTAAATGAAAGGGTACGTTGTGATACAAATCCTCCTGGTTTTTTCTGGGAATGATATTCTTGCTCAGAATGAAATGATATTGGGTTGTTCAGCATGCCAGTCTTCAAATGGGTAAAGTTAGTAAAGTTAGTTATTAATCCATTACTTGTAAGTCAGCTCTTTGAAACTTATAATATGCTTTAATACAGAAAAAGTGTTCTAGAGTGATGATGGTTAGGCCTCAATGACATAATATCATCCTGTCCAGGCTTTTTGCTCTCAGAACTTCTCTCTCAAACTATGAGAACCACGATCAATGACTTGGACTGAGGAGTCGTCTTTCTTGGTAGGAAGCTGGGAGGAATGAATGGAGAGAAGGGTCATCTCTGACCTTGACACTAGGGCTGGTGAGAAGGCAGGTCAGTTTCTGGCATCCTACATTACATTCTTAGCACATTTTCCCATGGGAACATATTTAACATGGTGATAACTTTCTACAAGCCTCTTTATGAAAGTGATATTCAGGTATATTTTGATTAATAGAAACTTCTGTGGCCTGGCCCAGGAGCCTATCAACTATAAAAGTATCCTCAAGGAAAAATGTATTCTAAGTTTGATTACTAAGCTTATCACTGACTTACAAATAGACTCCTGAAATAAAATTATTTGCTAATTTGATGGCAGTCTGGTTATCTTAGTCTTCTATGACTTGCCTTTTATTCAAGGATGCAATTTAAGTTATTTAAAAATCCCTTTAGTTAATTTTATAGGAAGAATAGTGTATCTATTAATCAGCATAACACCTATGCCTACTCAACAGGTTACAATAATGCCATTAACATAGGTGGGTAAGAGATAAAGTGAAATCTGAATGAAAACAGAACATTTCACTCTTTTATTTATTTTTACATTTATAAGTCTGCCCCCAACCAACATTTTATCATGAAAACTTCTAAACACACAGAAAATTGGAAAGGATAAGGGAAGAAAATGCAGAAACAGCAGGGCTCCCTCAGGTTTGGGCATGTTACTTCATCAGACATTTGTGGGACAGTGTACTTTAGATTCCTGGTCCAGCTGGGGGCTCACAGACATCCTAGGAAAGAGGAGGCTGCTTTTGACTCTTACAAATGGGGCTAGTGTCATGGTCCTGGAAAGCCTTAGGGTACAGAAATAGCTAAAGAGGAGTTGTTGTTTAAACATACAACAGGTATCTGGTTATTATATGAATTGACAGCAATATGAAAGGCAACAGTGCACAGCATTTTAAAAATGCTCTTTTAACAGGAAAAAGGCTTTGTTTTAAAAACTAAAAAGATGTTTTTGCTGTTTAACTAAAAGAAAGCAATTAAAATAGGAACACAACAAATAAAAATTAACATAGTAAGTAGAGGTATTTGAATGTACCTGGACCATGGCTATTTCATTGGTGACGAGACCATAACGGATAACAATGTTACATTCTTTAATATCCAGACCTTCTTCTGCCACTGTGGTAGCGATAAGCAGATTTATTTTTCCAGTGCGAAATTTACTAATGACTTCTTTTTGTTCATTCTGTAGAAACATTTTAATAAATTAAATTTTGTGATGCTAAACACATTAAAATCTTCTAATTAGAGGAAGAAATAATAAATTGCAACTGGTCAGTGTAAATCAAAGGATTAGATCATACATGGATTTGTTGCCATCTGTTTTTGGCATTGAACAAAGACATAATGGTGAGACAACATTTGATTTCCAATCTGGGATTACCACACAATAACAAAAATATTTCCATCATCCAGTCTGGAGGTGGGAAGACCACATTTTATGCCAAGGAAATAAATTGATGGGTGACTCCAGAGGAAGAAAGGAGGAGCTGTCGGTTGAGAAGAGGATATGACAATCAGAAGCTAAAATGGGCTTTTTTCCCCCACTACATTAACTTCAGAATCTTTGCTATTTAGAGGATAAGATGCAGAGATGCTTTGATATATTGTTTTCAGTCACAGAGAAAATGCACACTGTATATGCATTTGGTCACTTTAAGAATCATTTGAGTTAGAAGCTATGGAATATTCCCAAAAGGACACAAGAGAAACTGAAAACATCAGCTGCATCTAGGGAGGGGAGCTGGAAGACTAGAGGTCAGTGGTATGCCTTGTGCCTCATTAATTTTGAATGAGGTAAATATATTATCAATTCAAAGGGACAATATAAATAAAAATGAAAGAAGAGGTTATGCAACTGTAAATAAAACTATTTTCAAATGAAAAAACTCTGAATTTTGAAAGTCAATATAAATAAATTAAAATATGACCTCTCATCCTTACATGGGAGAAATGAGTGAGCACAAACCTAGCTTGATATGGACAATGTGGTTTTATTTTCATAACCACTCTCATCAAAGCTGTTGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTC
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Task1_train_4105
A mutation in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
ATTAAAAAACTGTGCCTTTACAAACAAATTGGATCAAACCAAAATTACCATGTTGGATTGAATCAGTGAGTTGCAGCAGTCTTTCTGGAACAAGGCAGGCTAAATTTATATTATCCAAATTTATGGTTGGTTTTACTGGAATGAGGAATGGCTCCCTGATAATTTCCTGCCCACCATGGATCTTGATTCTCTGCATGTGAATCTGGATTAAGCACAGTTCACTAAACAGAAACTTATAATTCAGCACAATTTTTGTCTGGAGAATGAGTCACAGAGATATCAATGGCAACCACATGCCGCCATTTTTAAATGAAAATCAAATTCAGAGGTGACCAACAATACCTTATGAGCATACTCCTCTGGTTTCATATTTTGAACACAATGTATAGCTTTATACATCATCTTCTCTCGGAAATCATTAACTGTCTCATGTTCGATAACTCCTGAACCACTGTGAGCAACCAGGACGTAGGTGCTCTCATCAGCTCTGGCTCGACCACGGGCCTGAAAACACAAATAAATCAAGTAAATGAAAGGGTACGTTGTGATACAAATCCTCCTGGTTTTTTCTGGGAATGATATTCTTGCTCAGAATGAAATGATATTGGGTTGTTCAGCATGCCAGTCTTCAAATGGGTAAAGTTAGTAAAGTTAGTTATTAATCCATTACTTGTAAGTCAGCTCTTTGAAACTTATAATATGCTTTAATACAGAAAAAGTGTTCTAGAGTGATGATGGTTAGGCCTCAATGACATAATATCATCCTGTCCAGGCTTTTTGCTCTCAGAACTTCTCTCTCAAACTATGAGAACCACGATCAATGACTTGGACTGAGGAGTCGTCTTTCTTGGTAGGAAGCTGGGAGGAATGAATGGAGAGAAGGGTCATCTCTGACCTTGACACTAGGGCTGGTGAGAAGGCAGGTCAGTTTCTGGCATCCTACATTACATTCTTAGCACATTTTCCCATGGGAACATATTTAACATGGTGATAACTTTCTACAAGCCTCTTTATGAAAGTGATATTCAGGTATATTTTGATTAATAGAAACTTCTGTGGCCTGGCCCAGGAGCCTATCAACTATAAAAGTATCCTCAAGGAAAAATGTATTCTAAGTTTGATTACTAAGCTTATCACTGACTTACAAATAGACTCCTGAAATAAAATTATTTGCTAATTTGATGGCAGTCTGGTTATCTTAGTCTTCTATGACTTGCCTTTTATTCAAGGATGCAATTTAAGTTATTTAAAAATCCCTTTAGTTAATTTTATAGGAAGAATAGTGTATCTATTAATCAGCATAACACCTATGCCTACTCAACAGGTTACAATAATGCCATTAACATAGGTGGGTAAGAGATAAAGTGAAATCTGAATGAAAACAGAACATTTCACTCTTTTATTTATTTTTACATTTATAAGTCTGCCCCCAACCAACATTTTATCATGAAAACTTCTAAACACACAGAAAATTGGAAAGGATAAGGGAAGAAAATGCAGAAACAGCAGGGCTCCCTCAGGTTTGGGCATGTTACTTCATCAGACATTTGTGGGACAGTGTACTTTAGATTCCTGGTCCAGCTGGGGGCTCACAGACATCCTAGGAAAGAGGAGGCTGCTTTTGACTCTTACAAATGGGGCTAGTGTCATGGTCCTGGAAAGCCTTAGGGTACAGAAATAGCTAAAGAGGAGTTGTTGTTTAAACATACAACAGGTATCTGGTTATTATATGAATTGACAGCAATATGAAAGGCAACAGTGCACAGCATTTTAAAAATGCTCTTTTAACAGGAAAAAGGCTTTGTTTTAAAAACTAAAAAGATGTTTTTGCTGTTTAACTAAAAGAAAGCAATTAAAATAGGAACACAACAAATAAAAATTAACATAGTAAGTAGAGGTATTTGAATGTACCTGGACCATGGCTATTTCATTGGTGACGAGACCATAACGGATAACAATGTTACATTCTTTAATATCCAGACCTTCTTCTGCCACTGTGGTAGCGATAAGCAGATTTATTTTTCCAGTGCGAAATTTACTAATGACTTCTTTTTGTTCATTCTGTAGAAACATTTTAATAAATTAAATTTTGTGATGCTAAACACATTAAAATCTTCTAATTAGAGGAAGAAATAATAAATTGCAACTGGTCAGTGTAAATCAAAGGATTAGATCATACATGGATTTGTTGCCATCTGTTTTTGGCATTGAACAAAGACATAATGGTGAGACAACATTTGATTTCCAATCTGGGATTACCACACAATAACAAAAATATTTCCATCATCCAGTCTGGAGGTGGGAAGACCACATTTTATGCCAAGGAAATAAATTGATGGGTGACTCCAGAGGAAGAAAGGAGGAGCTGTCGGTTGAGAAGAGGATATGACAATCAGAAGCTAAAATGGGCTTTTTTCCCCCACTACATTAACTTCAGAATCTTTGCTATTTAGAGGATAAGATGCAGAGATGCTTTGATATATTGTTTTCAGTCACAGAGAAAATGCACACTGTATATGCATTTGGTCACTTTAAGAATCATTTGAGTTAGAAGCTATGGAATATTCCCAAAAGGACACAAGAGAAACTGAAAACATCAGCTGCATCTAGGGAGGGGAGCTGGAAGACTAGAGGTCAGTGGTATGCCTTGTGCCTCATTAATTTTGAATGAGGTAAATATATTATCAATTCAAAGGGACAATATAAATAAAAATGAAAGAAGAGGTTATGCAACTGTAAATAAAACTATTTTCAAATGAAAAAACTCTGAATTTTGAAAGTCAATATAAATAAATTAAAATATGACCTCTCATCCTTACATGGGAGAAATGAGTGAGCACAAACCTAGCTTGATATGGACAATGTGGTTTTATTTTCATAACCACTCTCATCAAAGCTGTTGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTCATTCTATGTAAATATATT
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Task1_train_4106
A mutation in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
TGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTCATTCTATGTAAATATATTTTGCATAGTTCTAGTTATAACGAACACATTTTTGTGGGAGTTTGAATTTTCCACTTGATACTACATGGCAATCATTTCTGAACTTTGTTGTTAAGCTTACATGTCACTTATTTTTGCAAGGGAAACTTAGAAAGTTCTTCCAATTATTATGTGGGAAAAATGACTCCTAAAACAACACTTAACCTCTCAAAAACCACAGATTTGATTGCTATTAGCCTTAGATTTTATTTCAAGAACAGGTGTTTTATCCTGTAAATGTATTCATGGGTGGTGAGAGGATTGGTAGAAAAAGACTAAAAACAATTTGAGAAGAGTAATAACAGCATAAGAAAAGAAGTCCAGGCTGAGCGCAGTGGCTCGTGCCTATAATCTCAATACTTTGGAAGGCAGAGGCAGAAGGATGGCTTGAGCCCAGGAGTTTAAGACAAGCCAGGACAACATAGTGGGACACCTTTTCTACAAAAAAGATAAAAAAATTAGTTGGGTGTGGTGGTGCACACCTAGAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGGGGCTGGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGGTCAAGGGTGCAGTGAATCTTGATCATGCCACTGCTCTTCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGGCCTCGTCTGAAAGAAAAGAAGAAGAGAAGAAGAGAAGAGAAGAAGAAAAGAGAAAGAAAAGAAAAGAAGTCGTCCAAAAGGATATTTATACCTGTGTCATGGGTTTGAACTCACTGCTGTGTCCAGCTCCAATCAGATGGTGGGCTTTGACTCCTACTTCAGCAAATTTTTCATTTTCAGTAATCCACTGGGAAAGCGCATATGCACTCTGTCGTGTTTTTGTAAAGATTATTCCTCGTGCTGATTCCTCAGTCCTAGTATATTGCTCCATTATGGTATTTCTTAATTTGGTCAGCTTTTCATTTTCATATTCTGGGTTTTCAGCCAGCCTTTTCAACATTTTATTGTTTTCTTTAAGAAATAATTAGAGTTGATATGTTAACAAGCTTGATTTAGCCACTCCACAATGTACAGATATATCAAACATTTTGTACACCAAAAATATACAGTTTTATTGATTAAAAATTAATTAATTTAAAAACTATTTGGAAGTATAAATTAGTAAAACATACAACGAATTACACTAGAAGGTTTCATGAATTGTGGCTCATCTACAATCTTGCGCTATATCTAATAATTAGGATGGTTTAATAAATAAATTCATTACAATTGTCTTGACAATAAAACTGAATGACCAAATGACTGACTGTGATCATACAACTGGTAGCTAATCTGGTCATATCATTAGAAATAGTTCCAATCTGAGTGGGATTTCTTCTTTCAAAAGATATTTCTCTTTTTGGAGAGCTTATGAGAAGCAGTAAGTTCATGTTGAAAAGGTAAATGAATGACACCAGTATATGTTACTTTGAATCTTACCAAAAAATAAAGTCATGAGAAATCTATCTGTTTCATCCAGTTTCAAAGGTTTCTTTAAATCATCCTCATCTTCATCACCATCACAATACTCATCATCACCACCCTCATCACTATCATCTTCTATGACTGCAAACTTCTTATCTTTCTCTTCATTATAGAAAGTTTCAAGATGAGTATACGCATCTATCATTCGAATTGTGTCATTAATTTGTAGGGCCTCATTGTACTTCCTCAAATGTTCTGCACAAACACGTTCTTTGCGATTTCCTTCTTTTGCAGCTGTGAAAAAATATATTATGTAAGTGAAATAATAAGCATATAAACCCCCTAAAATTGTGCCATGGACTTGAATATATGTTACTAACTGCAAAACTGGCTTCACCTTGGTTTTAAAATGGGCAAGTTAAGGCTCAAAATGTGTCCTGAGCTCTGAAACAGGGCAAGTTTTCCAACTCCTAGACTTGCTGCTTGAGTTCTGCCTCAGCAAAAACATGTAGCTGATGCACAGAGAAATGGCATGAAAATATATTAGTTGAGTTTGCCTTTGGAGACAGAGCTATTAAAGTTTATCTCAAGACTCTGGAGACAAAGAGAAAATTGGATAGCATTGGAATCTCTCTCCTTAGAAAAGGAATTAGAACATGTTTATTATGCTTGTCCTACAGAGAACACAGAAATTCTATTTGGAACTACTTTTGCTTTCCATTTTTTGGGGAATCTGTGATATAGTCATCTAAAATCTTGGTATAAACATGGGATAAACTAAGTGTTAGGTCCAAACCTAAATTACCTTTTTTTTCCATTTGAATGGCCCATTGTTCATAGGGTTGAGTTCCAAAATCTGACATTGGACTCATTTGACAATAAGTTTGAATCCTTGTCATTATTTCTAGAAGTTTCTCTTTAAATGGATCCTAAAAATAAAGTACACACTTATTCTTATGTATTCTTATTGTTAAAGGAATAACATTATCTTTGTTAGAATAATTTCTAGGTTATAATAAATCTGATTCATCTTTGTTTAGACAAAGTAACAGGTTAGTGTCCCATCACTTGTCTGTACATTTATTTTTGTCAGCTTCTCTTTTAAGCCTGCCATCAAGCCACACCCACACCAACACCCTGTTACCTCTGCTGGAATCTCCAACTTAAAAGGTTAACAAAAGTAAAGTTAATGAATTATATAAACCTTGTATGTTAAAGGTAACTTAGAAAACACATATTGCATTAATGCCACAATTATTTAGAAAGCTTACAGTGTAATTTAAGAAACATTCCTCCTTTGTAAAACTGGTTTCAGTATTATTTCGACCAAAATAAAAAGTTGAAGTAGAGTCTGAATAAAGCCAGAAATAAAGGAGTGCATGCTATATGATTCCATTTATATAAAGTTCAGAATCAGTGAAAACTCATTTTTTGTTTTAGAAGTCAAGATAGTAGTGATTCCTGGGGCATGGTGACTGGA
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Task1_train_4107
A genetic alteration is present in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Singleton-Merten syndrome 1
TGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTCATTCTATGTAAATATATTTTGCATAGTTCTAGTTATAACGAACACATTTTTGTGGGAGTTTGAATTTTCCACTTGATACTACATGGCAATCATTTCTGAACTTTGTTGTTAAGCTTACATGTCACTTATTTTTGCAAGGGAAACTTAGAAAGTTCTTCCAATTATTATGTGGGAAAAATGACTCCTAAAACAACACTTAACCTCTCAAAAACCACAGATTTGATTGCTATTAGCCTTAGATTTTATTTCAAGAACAGGTGTTTTATCCTGTAAATGTATTCATGGGTGGTGAGAGGATTGGTAGAAAAAGACTAAAAACAATTTGAGAAGAGTAATAACAGCATAAGAAAAGAAGTCCAGGCTGAGCGCAGTGGCTCGTGCCTATAATCTCAATACTTTGGAAGGCAGAGGCAGAAGGATGGCTTGAGCCCAGGAGTTTAAGACAAGCCAGGACAACATAGTGGGACACCTTTTCTACAAAAAAGATAAAAAAATTAGTTGGGTGTGGTGGTGCACACCTAGAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGGGGCTGGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGGTCAAGGGTGCAGTGAATCTTGATCATGCCACTGCTCTTCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGGCCTCGTCTGAAAGAAAAGAAGAAGAGAAGAAGAGAAGAGAAGAAGAAAAGAGAAAGAAAAGAAAAGAAGTCGTCCAAAAGGATATTTATACCTGTGTCATGGGTTTGAACTCACTGCTGTGTCCAGCTCCAATCAGATGGTGGGCTTTGACTCCTACTTCAGCAAATTTTTCATTTTCAGTAATCCACTGGGAAAGCGCATATGCACTCTGTCGTGTTTTTGTAAAGATTATTCCTCGTGCTGATTCCTCAGTCCTAGTATATTGCTCCATTATGGTATTTCTTAATTTGGTCAGCTTTTCATTTTCATATTCTGGGTTTTCAGCCAGCCTTTTCAACATTTTATTGTTTTCTTTAAGAAATAATTAGAGTTGATATGTTAACAAGCTTGATTTAGCCACTCCACAATGTACAGATATATCAAACATTTTGTACACCAAAAATATACAGTTTTATTGATTAAAAATTAATTAATTTAAAAACTATTTGGAAGTATAAATTAGTAAAACATACAACGAATTACACTAGAAGGTTTCATGAATTGTGGCTCATCTACAATCTTGCGCTATATCTAATAATTAGGATGGTTTAATAAATAAATTCATTACAATTGTCTTGACAATAAAACTGAATGACCAAATGACTGACTGTGATCATACAACTGGTAGCTAATCTGGTCATATCATTAGAAATAGTTCCAATCTGAGTGGGATTTCTTCTTTCAAAAGATATTTCTCTTTTTGGAGAGCTTATGAGAAGCAGTAAGTTCATGTTGAAAAGGTAAATGAATGACACCAGTATATGTTACTTTGAATCTTACCAAAAAATAAAGTCATGAGAAATCTATCTGTTTCATCCAGTTTCAAAGGTTTCTTTAAATCATCCTCATCTTCATCACCATCACAATACTCATCATCACCACCCTCATCACTATCATCTTCTATGACTGCAAACTTCTTATCTTTCTCTTCATTATAGAAAGTTTCAAGATGAGTATACGCATCTATCATTCGAATTGTGTCATTAATTTGTAGGGCCTCATTGTACTTCCTCAAATGTTCTGCACAAACACGTTCTTTGCGATTTCCTTCTTTTGCAGCTGTGAAAAAATATATTATGTAAGTGAAATAATAAGCATATAAACCCCCTAAAATTGTGCCATGGACTTGAATATATGTTACTAACTGCAAAACTGGCTTCACCTTGGTTTTAAAATGGGCAAGTTAAGGCTCAAAATGTGTCCTGAGCTCTGAAACAGGGCAAGTTTTCCAACTCCTAGACTTGCTGCTTGAGTTCTGCCTCAGCAAAAACATGTAGCTGATGCACAGAGAAATGGCATGAAAATATATTAGTTGAGTTTGCCTTTGGAGACAGAGCTATTAAAGTTTATCTCAAGACTCTGGAGACAAAGAGAAAATTGGATAGCATTGGAATCTCTCTCCTTAGAAAAGGAATTAGAACATGTTTATTATGCTTGTCCTACAGAGAACACAGAAATTCTATTTGGAACTACTTTTGCTTTCCATTTTTTGGGGAATCTGTGATATAGTCATCTAAAATCTTGGTATAAACATGGGATAAACTAAGTGTTAGGTCCAAACCTAAATTACCTTTTTTTTCCATTTGAATGGCCCATTGTTCATAGGGTTGAGTTCCAAAATCTGACATTGGACTCATTTGACAATAAGTTTGAATCCTTGTCATTATTTCTAGAAGTTTCTCTTTAAATGGATCCTAAAAATAAAGTACACACTTATTCTTATGTATTCTTATTGTTAAAGGAATAACATTATCTTTGTTAGAATAATTTCTAGGTTATAATAAATCTGATTCATCTTTGTTTAGACAAAGTAACAGGTTAGTGTCCCATCACTTGTCTGTACATTTATTTTTGTCAGCTTCTCTTTTAAGCCTGCCATCAAGCCACACCCACACCAACACCCTGTTACCTCTGCTGGAATCTCCAACTTAAAAGGTTAACAAAAGTAAAGTTAATGAATTATATAAACCTTGTATGTTAAAGGTAACTTAGAAAACACATATTGCATTAATGCCACAATTATTTAGAAAGCTTACAGTGTAATTTAAGAAACATTCCTCCTTTGTAAAACTGGTTTCAGTATTATTTCGACCAAAATAAAAAGTTGAAGTAGAGTCTGAATAAAGCCAGAAATAAAGGAGTGCATGCTATATGATTCCATTTATATAAAGTTCAGAATCAGTGAAAACTCATTTTTTGTTTTAGAAGTCAAGATAGTAGTGATTCCTGGGGCATGGTGACTGGA
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Task1_train_4108
A variant has been detected on Chromosome 2 in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
TGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTCATTCTATGTAAATATATTTTGCATAGTTCTAGTTATAACGAACACATTTTTGTGGGAGTTTGAATTTTCCACTTGATACTACATGGCAATCATTTCTGAACTTTGTTGTTAAGCTTACATGTCACTTATTTTTGCAAGGGAAACTTAGAAAGTTCTTCCAATTATTATGTGGGAAAAATGACTCCTAAAACAACACTTAACCTCTCAAAAACCACAGATTTGATTGCTATTAGCCTTAGATTTTATTTCAAGAACAGGTGTTTTATCCTGTAAATGTATTCATGGGTGGTGAGAGGATTGGTAGAAAAAGACTAAAAACAATTTGAGAAGAGTAATAACAGCATAAGAAAAGAAGTCCAGGCTGAGCGCAGTGGCTCGTGCCTATAATCTCAATACTTTGGAAGGCAGAGGCAGAAGGATGGCTTGAGCCCAGGAGTTTAAGACAAGCCAGGACAACATAGTGGGACACCTTTTCTACAAAAAAGATAAAAAAATTAGTTGGGTGTGGTGGTGCACACCTAGAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGGGGCTGGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGGTCAAGGGTGCAGTGAATCTTGATCATGCCACTGCTCTTCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGGCCTCGTCTGAAAGAAAAGAAGAAGAGAAGAAGAGAAGAGAAGAAGAAAAGAGAAAGAAAAGAAAAGAAGTCGTCCAAAAGGATATTTATACCTGTGTCATGGGTTTGAACTCACTGCTGTGTCCAGCTCCAATCAGATGGTGGGCTTTGACTCCTACTTCAGCAAATTTTTCATTTTCAGTAATCCACTGGGAAAGCGCATATGCACTCTGTCGTGTTTTTGTAAAGATTATTCCTCGTGCTGATTCCTCAGTCCTAGTATATTGCTCCATTATGGTATTTCTTAATTTGGTCAGCTTTTCATTTTCATATTCTGGGTTTTCAGCCAGCCTTTTCAACATTTTATTGTTTTCTTTAAGAAATAATTAGAGTTGATATGTTAACAAGCTTGATTTAGCCACTCCACAATGTACAGATATATCAAACATTTTGTACACCAAAAATATACAGTTTTATTGATTAAAAATTAATTAATTTAAAAACTATTTGGAAGTATAAATTAGTAAAACATACAACGAATTACACTAGAAGGTTTCATGAATTGTGGCTCATCTACAATCTTGCGCTATATCTAATAATTAGGATGGTTTAATAAATAAATTCATTACAATTGTCTTGACAATAAAACTGAATGACCAAATGACTGACTGTGATCATACAACTGGTAGCTAATCTGGTCATATCATTAGAAATAGTTCCAATCTGAGTGGGATTTCTTCTTTCAAAAGATATTTCTCTTTTTGGAGAGCTTATGAGAAGCAGTAAGTTCATGTTGAAAAGGTAAATGAATGACACCAGTATATGTTACTTTGAATCTTACCAAAAAATAAAGTCATGAGAAATCTATCTGTTTCATCCAGTTTCAAAGGTTTCTTTAAATCATCCTCATCTTCATCACCATCACAATACTCATCATCACCACCCTCATCACTATCATCTTCTATGACTGCAAACTTCTTATCTTTCTCTTCATTATAGAAAGTTTCAAGATGAGTATACGCATCTATCATTCGAATTGTGTCATTAATTTGTAGGGCCTCATTGTACTTCCTCAAATGTTCTGCACAAACACGTTCTTTGCGATTTCCTTCTTTTGCAGCTGTGAAAAAATATATTATGTAAGTGAAATAATAAGCATATAAACCCCCTAAAATTGTGCCATGGACTTGAATATATGTTACTAACTGCAAAACTGGCTTCACCTTGGTTTTAAAATGGGCAAGTTAAGGCTCAAAATGTGTCCTGAGCTCTGAAACAGGGCAAGTTTTCCAACTCCTAGACTTGCTGCTTGAGTTCTGCCTCAGCAAAAACATGTAGCTGATGCACAGAGAAATGGCATGAAAATATATTAGTTGAGTTTGCCTTTGGAGACAGAGCTATTAAAGTTTATCTCAAGACTCTGGAGACAAAGAGAAAATTGGATAGCATTGGAATCTCTCTCCTTAGAAAAGGAATTAGAACATGTTTATTATGCTTGTCCTACAGAGAACACAGAAATTCTATTTGGAACTACTTTTGCTTTCCATTTTTTGGGGAATCTGTGATATAGTCATCTAAAATCTTGGTATAAACATGGGATAAACTAAGTGTTAGGTCCAAACCTAAATTACCTTTTTTTTCCATTTGAATGGCCCATTGTTCATAGGGTTGAGTTCCAAAATCTGACATTGGACTCATTTGACAATAAGTTTGAATCCTTGTCATTATTTCTAGAAGTTTCTCTTTAAATGGATCCTAAAAATAAAGTACACACTTATTCTTATGTATTCTTATTGTTAAAGGAATAACATTATCTTTGTTAGAATAATTTCTAGGTTATAATAAATCTGATTCATCTTTGTTTAGACAAAGTAACAGGTTAGTGTCCCATCACTTGTCTGTACATTTATTTTTGTCAGCTTCTCTTTTAAGCCTGCCATCAAGCCACACCCACACCAACACCCTGTTACCTCTGCTGGAATCTCCAACTTAAAAGGTTAACAAAAGTAAAGTTAATGAATTATATAAACCTTGTATGTTAAAGGTAACTTAGAAAACACATATTGCATTAATGCCACAATTATTTAGAAAGCTTACAGTGTAATTTAAGAAACATTCCTCCTTTGTAAAACTGGTTTCAGTATTATTTCGACCAAAATAAAAAGTTGAAGTAGAGTCTGAATAAAGCCAGAAATAAAGGAGTGCATGCTATATGATTCCATTTATATAAAGTTCAGAATCAGTGAAAACTCATTTTTTGTTTTAGAAGTCAAGATAGTAGTGATTCCTGGGGCATGGTGACTGGA
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Task1_train_4109
Here is a variant affecting IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Singleton-Merten syndrome 1
TGGTCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTCATTCTATGTAAATATATTTTGCATAGTTCTAGTTATAACGAACACATTTTTGTGGGAGTTTGAATTTTCCACTTGATACTACATGGCAATCATTTCTGAACTTTGTTGTTAAGCTTACATGTCACTTATTTTTGCAAGGGAAACTTAGAAAGTTCTTCCAATTATTATGTGGGAAAAATGACTCCTAAAACAACACTTAACCTCTCAAAAACCACAGATTTGATTGCTATTAGCCTTAGATTTTATTTCAAGAACAGGTGTTTTATCCTGTAAATGTATTCATGGGTGGTGAGAGGATTGGTAGAAAAAGACTAAAAACAATTTGAGAAGAGTAATAACAGCATAAGAAAAGAAGTCCAGGCTGAGCGCAGTGGCTCGTGCCTATAATCTCAATACTTTGGAAGGCAGAGGCAGAAGGATGGCTTGAGCCCAGGAGTTTAAGACAAGCCAGGACAACATAGTGGGACACCTTTTCTACAAAAAAGATAAAAAAATTAGTTGGGTGTGGTGGTGCACACCTAGAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGGGGCTGGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGGTCAAGGGTGCAGTGAATCTTGATCATGCCACTGCTCTTCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGGCCTCGTCTGAAAGAAAAGAAGAAGAGAAGAAGAGAAGAGAAGAAGAAAAGAGAAAGAAAAGAAAAGAAGTCGTCCAAAAGGATATTTATACCTGTGTCATGGGTTTGAACTCACTGCTGTGTCCAGCTCCAATCAGATGGTGGGCTTTGACTCCTACTTCAGCAAATTTTTCATTTTCAGTAATCCACTGGGAAAGCGCATATGCACTCTGTCGTGTTTTTGTAAAGATTATTCCTCGTGCTGATTCCTCAGTCCTAGTATATTGCTCCATTATGGTATTTCTTAATTTGGTCAGCTTTTCATTTTCATATTCTGGGTTTTCAGCCAGCCTTTTCAACATTTTATTGTTTTCTTTAAGAAATAATTAGAGTTGATATGTTAACAAGCTTGATTTAGCCACTCCACAATGTACAGATATATCAAACATTTTGTACACCAAAAATATACAGTTTTATTGATTAAAAATTAATTAATTTAAAAACTATTTGGAAGTATAAATTAGTAAAACATACAACGAATTACACTAGAAGGTTTCATGAATTGTGGCTCATCTACAATCTTGCGCTATATCTAATAATTAGGATGGTTTAATAAATAAATTCATTACAATTGTCTTGACAATAAAACTGAATGACCAAATGACTGACTGTGATCATACAACTGGTAGCTAATCTGGTCATATCATTAGAAATAGTTCCAATCTGAGTGGGATTTCTTCTTTCAAAAGATATTTCTCTTTTTGGAGAGCTTATGAGAAGCAGTAAGTTCATGTTGAAAAGGTAAATGAATGACACCAGTATATGTTACTTTGAATCTTACCAAAAAATAAAGTCATGAGAAATCTATCTGTTTCATCCAGTTTCAAAGGTTTCTTTAAATCATCCTCATCTTCATCACCATCACAATACTCATCATCACCACCCTCATCACTATCATCTTCTATGACTGCAAACTTCTTATCTTTCTCTTCATTATAGAAAGTTTCAAGATGAGTATACGCATCTATCATTCGAATTGTGTCATTAATTTGTAGGGCCTCATTGTACTTCCTCAAATGTTCTGCACAAACACGTTCTTTGCGATTTCCTTCTTTTGCAGCTGTGAAAAAATATATTATGTAAGTGAAATAATAAGCATATAAACCCCCTAAAATTGTGCCATGGACTTGAATATATGTTACTAACTGCAAAACTGGCTTCACCTTGGTTTTAAAATGGGCAAGTTAAGGCTCAAAATGTGTCCTGAGCTCTGAAACAGGGCAAGTTTTCCAACTCCTAGACTTGCTGCTTGAGTTCTGCCTCAGCAAAAACATGTAGCTGATGCACAGAGAAATGGCATGAAAATATATTAGTTGAGTTTGCCTTTGGAGACAGAGCTATTAAAGTTTATCTCAAGACTCTGGAGACAAAGAGAAAATTGGATAGCATTGGAATCTCTCTCCTTAGAAAAGGAATTAGAACATGTTTATTATGCTTGTCCTACAGAGAACACAGAAATTCTATTTGGAACTACTTTTGCTTTCCATTTTTTGGGGAATCTGTGATATAGTCATCTAAAATCTTGGTATAAACATGGGATAAACTAAGTGTTAGGTCCAAACCTAAATTACCTTTTTTTTCCATTTGAATGGCCCATTGTTCATAGGGTTGAGTTCCAAAATCTGACATTGGACTCATTTGACAATAAGTTTGAATCCTTGTCATTATTTCTAGAAGTTTCTCTTTAAATGGATCCTAAAAATAAAGTACACACTTATTCTTATGTATTCTTATTGTTAAAGGAATAACATTATCTTTGTTAGAATAATTTCTAGGTTATAATAAATCTGATTCATCTTTGTTTAGACAAAGTAACAGGTTAGTGTCCCATCACTTGTCTGTACATTTATTTTTGTCAGCTTCTCTTTTAAGCCTGCCATCAAGCCACACCCACACCAACACCCTGTTACCTCTGCTGGAATCTCCAACTTAAAAGGTTAACAAAAGTAAAGTTAATGAATTATATAAACCTTGTATGTTAAAGGTAACTTAGAAAACACATATTGCATTAATGCCACAATTATTTAGAAAGCTTACAGTGTAATTTAAGAAACATTCCTCCTTTGTAAAACTGGTTTCAGTATTATTTCGACCAAAATAAAAAGTTGAAGTAGAGTCTGAATAAAGCCAGAAATAAAGGAGTGCATGCTATATGATTCCATTTATATAAAGTTCAGAATCAGTGAAAACTCATTTTTTGTTTTAGAAGTCAAGATAGTAGTGATTCCTGGGGCATGGTGACTGGA
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Task1_train_4110
An alteration has been detected in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
TCCAGTTGGCATTTGGTGCACATCCACACTGTCTATTGCCCCCATACATTAAACAAAAATAAAGCTGCCAGACCAAAAGTATGTTCTTCCATCCCCTTCCCTTTCTTCTCAGAGGCAGTGTGAGTCCTTATTTGACTCCTACTCCTAACTGTCGGAGAACCCTGTAGAAAGGCCTCTCTTGAGTCTTCTCTGAAAATTTCTCCCTCCGGCCCTCACATCTCCCGATAAAAACTTACATGTTCTTGGATTTTAGCAGAAGATGCCTGTGTCTTAATTTGAAGGAGTAACTTTAATAACAAAAATTCCAGACAGTGTCAGATCTTCAAGTCACATCACATAGATGCCTAACACCATTGCTAAGGAGTTTGTCCACCCCAGTTTACAAGGTGAGGATACAAGGAGTGGGGAAGGAAGGGAATATGTTCTGTATTTTGGCACACAGCCCCTTGGTTTGAAATGAATAAGGAGCAGAAAGTAGCTTGAACATAGGCTTTTCATTTGCACTCTACCTCTTTTTACAGAGAAGCTTAGCCCTCTTACAATAAAAGTCACAACGCTAAAGTTAATATAATAGAAATTTAAAAACAGAACTCATAAGAATCAACACAGAGGCTGTGAGACTGAACTTGAGTTTTTCCTGCTAGCTTTCTGGAAGCTAAGGCAAAAAGAAAAACATATAAAGCAAACTACATCTCATCAAAAAGAAGGAAGCAAACTTGTTACCCAAGGAAAACAGTACTTTCTCTGGCATTAATTTTATTGGCAATGCTCACAGGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTCATTCTATGTAAATATATTTTGCATAGTTCTAGTTATAACGAACACATTTTTGTGGGAGTTTGAATTTTCCACTTGATACTACATGGCAATCATTTCTGAACTTTGTTGTTAAGCTTACATGTCACTTATTTTTGCAAGGGAAACTTAGAAAGTTCTTCCAATTATTATGTGGGAAAAATGACTCCTAAAACAACACTTAACCTCTCAAAAACCACAGATTTGATTGCTATTAGCCTTAGATTTTATTTCAAGAACAGGTGTTTTATCCTGTAAATGTATTCATGGGTGGTGAGAGGATTGGTAGAAAAAGACTAAAAACAATTTGAGAAGAGTAATAACAGCATAAGAAAAGAAGTCCAGGCTGAGCGCAGTGGCTCGTGCCTATAATCTCAATACTTTGGAAGGCAGAGGCAGAAGGATGGCTTGAGCCCAGGAGTTTAAGACAAGCCAGGACAACATAGTGGGACACCTTTTCTACAAAAAAGATAAAAAAATTAGTTGGGTGTGGTGGTGCACACCTAGAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGGGGCTGGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGGTCAAGGGTGCAGTGAATCTTGATCATGCCACTGCTCTTCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGGCCTCGTCTGAAAGAAAAGAAGAAGAGAAGAAGAGAAGAGAAGAAGAAAAGAGAAAGAAAAGAAAAGAAGTCGTCCAAAAGGATATTTATACCTGTGTCATGGGTTTGAACTCACTGCTGTGTCCAGCTCCAATCAGATGGTGGGCTTTGACTCCTACTTCAGCAAATTTTTCATTTTCAGTAATCCACTGGGAAAGCGCATATGCACTCTGTCGTGTTTTTGTAAAGATTATTCCTCGTGCTGATTCCTCAGTCCTAGTATATTGCTCCATTATGGTATTTCTTAATTTGGTCAGCTTTTCATTTTCATATTCTGGGTTTTCAGCCAGCCTTTTCAACATTTTATTGTTTTCTTTAAGAAATAATTAGAGTTGATATGTTAACAAGCTTGATTTAGCCACTCCACAATGTACAGATATATCAAACATTTTGTACACCAAAAATATACAGTTTTATTGATTAAAAATTAATTAATTTAAAAACTATTTGGAAGTATAAATTAGTAAAACATACAACGAATTACACTAGAAGGTTTCATGAATTGTGGCTCATCTACAATCTTGCGCTATATCTAATAATTAGGATGGTTTAATAAATAAATTCATTACAATTGTCTTGACAATAAAACTGAATGACCAAATGACTGACTGTGATCATACAACTGGTAGCTAATCTGGTCATATCATTAGAAATAGTTCCAATCTGAGTGGGATTTCTTCTTTCAAAAGATATTTCTCTTTTTGGAGAGCTTATGAGAAGCAGTAAGTTCATGTTGAAAAGGTAAATGAATGACACCAGTATATGTTACTTTGAATCTTACCAAAAAATAAAGTCATGAGAAATCTATCTGTTTCATCCAGTTTCAAAGGTTTCTTTAAATCATCCTCATCTTCATCACCATCACAATACTCATCATCACCACCCTCATCACTATCATCTTCTATGACTGCAAACTTCTTATCTTTCTCTTCATTATAGAAAGTTTCAAGATGAGTATACGCATCTATCATTCGAATTGTGTCATTAATTTGTAGGGCCTCATTGTACTTCCTCAAATGTTCTGCACAAACACGTTCTTTGCGATTTCCTTCTTTTGCAGCTGTGAAAAAATATATTATGTAAGTGAAATAATAAGCATATAAACCCCCTAAAATTGTGCCATGGACTTGAATATATGTTACTAACTGCAAAACTGGCTTCACCTTGGTTTTAAAATGGGCAAGTTAAGGCTCAAAATGTGTCCTGAGCTCTGAAACAGGGCAAGTTTTCCAACTCCTAGACTTGCTGCTTGAGTTCTGCCTCAGCAAAAACATGTAGCTGATGCACAGAGAAATGGCATGAAAATATATTAGTTGAGTTTGCCTTTGGAGACAGAGCTATTAAAGTTTATCTCAAGACTCTGGAGACAAAGAGAAAATTGGATAGCATTGGAATCTCTCTCCTTAGAAAAGGAATTAGAACATGTTTATTATGCTTGTCCTACAGAGAACACAGAAATTCTATTTGGAACTACTTTTGCTTTCCATTTTTTGGGGAATCTGTGATATAGTCATCTAAAATCTTGGTATAAACATGGGATAAACTAAGTGTTAGGTCCAAACCTAAATTACCTTTTTTTTCCATTTGAATGGCCCATTGTTCATAGGGTTGAGTTCCAAAATCTGACATTGGACTCATTTGACAATAAGTTTGAATCCTTGTCATTATTTCTAGAAGTTTCTCTTTAAATGGATCCTAAAAATAAAGTACACACTTATTCTTATGTATTCTTATTGTTAAAGGAATAACATTATCTTTGTTAGAATAATTTCTAGGTTATAATAAATCTGATTCATCTTTGTTTAGACAAAGTAACAGGTTAGTGTCCCATCACTTGTCTGTACATTTATTTTTGTCAGCTTCTCTTTTAAGCCTGCCATCAAGCCACACCCACACCAACACCCTGTTACCTCTGCTGGAATCTCCAACTTAAAAGGTTAACAAAAGTAAAGTTAATGAATTATATAAACCTTGTATGTTAAAGGTAACTTAGAAAACACATATTGCATTAATGCCACAATTATTTAGAAAGCTTACAGTGTAATTTAAGAAACATTCCTCCTTTGTAAAACTGGTTTCAGTATTATTTCGACCAAAATAAAAAGTTGAAGTAGAGTCTGAATAAAGCCAGAAATAAAGGAGTGCATGCTATATGATTCCATTTATATAAAGTTCAGAATCAGTGAAAACTCATTTTTTGTTTTAGAAGTCAAGATAGTAGTGATTCCTGGGGCATGGTGACTGGAAGG
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Task1_train_4111
The following genetic variant occurs in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) on Chromosome 2. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Neurodevelopmental delay
GGAGTGCATGTAGAGGGTATATAAAGAGTTATAGTGAACCATTTCAAGAATTTTTTTCCAGCAAACACTGAAACAGAATTAATTTGCTCCATTGGCTTGAATAGTGATAACTATAATAGAAAGGAAGTATCCATTTGTCCAGAAAGACTCAGGGTCAATGTGATTTTAGCCCTCAGAAGAATATTTTACTCTAACAAGGCATCATTGCTTCATGCATGCTTGTAATGTCTACTAGTGCCTTTTTTTCTTACCCAAGTGTTTTTTTACTATGCCCACAGTAAGCAACATGTAAACAAAGTAAAACAAAACACCTTAAAATGGAACAGAAAACCTACTTACCAGAATCCCAAATCTCTAATATATCAAATTCTTTAGTTTTTTCAAGTTTCCCTAGAGGTCTCATTCTATGTAAATATATTTTGCATAGTTCTAGTTATAACGAACACATTTTTGTGGGAGTTTGAATTTTCCACTTGATACTACATGGCAATCATTTCTGAACTTTGTTGTTAAGCTTACATGTCACTTATTTTTGCAAGGGAAACTTAGAAAGTTCTTCCAATTATTATGTGGGAAAAATGACTCCTAAAACAACACTTAACCTCTCAAAAACCACAGATTTGATTGCTATTAGCCTTAGATTTTATTTCAAGAACAGGTGTTTTATCCTGTAAATGTATTCATGGGTGGTGAGAGGATTGGTAGAAAAAGACTAAAAACAATTTGAGAAGAGTAATAACAGCATAAGAAAAGAAGTCCAGGCTGAGCGCAGTGGCTCGTGCCTATAATCTCAATACTTTGGAAGGCAGAGGCAGAAGGATGGCTTGAGCCCAGGAGTTTAAGACAAGCCAGGACAACATAGTGGGACACCTTTTCTACAAAAAAGATAAAAAAATTAGTTGGGTGTGGTGGTGCACACCTAGAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGGGGCTGGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGGTCAAGGGTGCAGTGAATCTTGATCATGCCACTGCTCTTCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGGCCTCGTCTGAAAGAAAAGAAGAAGAGAAGAAGAGAAGAGAAGAAGAAAAGAGAAAGAAAAGAAAAGAAGTCGTCCAAAAGGATATTTATACCTGTGTCATGGGTTTGAACTCACTGCTGTGTCCAGCTCCAATCAGATGGTGGGCTTTGACTCCTACTTCAGCAAATTTTTCATTTTCAGTAATCCACTGGGAAAGCGCATATGCACTCTGTCGTGTTTTTGTAAAGATTATTCCTCGTGCTGATTCCTCAGTCCTAGTATATTGCTCCATTATGGTATTTCTTAATTTGGTCAGCTTTTCATTTTCATATTCTGGGTTTTCAGCCAGCCTTTTCAACATTTTATTGTTTTCTTTAAGAAATAATTAGAGTTGATATGTTAACAAGCTTGATTTAGCCACTCCACAATGTACAGATATATCAAACATTTTGTACACCAAAAATATACAGTTTTATTGATTAAAAATTAATTAATTTAAAAACTATTTGGAAGTATAAATTAGTAAAACATACAACGAATTACACTAGAAGGTTTCATGAATTGTGGCTCATCTACAATCTTGCGCTATATCTAATAATTAGGATGGTTTAATAAATAAATTCATTACAATTGTCTTGACAATAAAACTGAATGACCAAATGACTGACTGTGATCATACAACTGGTAGCTAATCTGGTCATATCATTAGAAATAGTTCCAATCTGAGTGGGATTTCTTCTTTCAAAAGATATTTCTCTTTTTGGAGAGCTTATGAGAAGCAGTAAGTTCATGTTGAAAAGGTAAATGAATGACACCAGTATATGTTACTTTGAATCTTACCAAAAAATAAAGTCATGAGAAATCTATCTGTTTCATCCAGTTTCAAAGGTTTCTTTAAATCATCCTCATCTTCATCACCATCACAATACTCATCATCACCACCCTCATCACTATCATCTTCTATGACTGCAAACTTCTTATCTTTCTCTTCATTATAGAAAGTTTCAAGATGAGTATACGCATCTATCATTCGAATTGTGTCATTAATTTGTAGGGCCTCATTGTACTTCCTCAAATGTTCTGCACAAACACGTTCTTTGCGATTTCCTTCTTTTGCAGCTGTGAAAAAATATATTATGTAAGTGAAATAATAAGCATATAAACCCCCTAAAATTGTGCCATGGACTTGAATATATGTTACTAACTGCAAAACTGGCTTCACCTTGGTTTTAAAATGGGCAAGTTAAGGCTCAAAATGTGTCCTGAGCTCTGAAACAGGGCAAGTTTTCCAACTCCTAGACTTGCTGCTTGAGTTCTGCCTCAGCAAAAACATGTAGCTGATGCACAGAGAAATGGCATGAAAATATATTAGTTGAGTTTGCCTTTGGAGACAGAGCTATTAAAGTTTATCTCAAGACTCTGGAGACAAAGAGAAAATTGGATAGCATTGGAATCTCTCTCCTTAGAAAAGGAATTAGAACATGTTTATTATGCTTGTCCTACAGAGAACACAGAAATTCTATTTGGAACTACTTTTGCTTTCCATTTTTTGGGGAATCTGTGATATAGTCATCTAAAATCTTGGTATAAACATGGGATAAACTAAGTGTTAGGTCCAAACCTAAATTACCTTTTTTTTCCATTTGAATGGCCCATTGTTCATAGGGTTGAGTTCCAAAATCTGACATTGGACTCATTTGACAATAAGTTTGAATCCTTGTCATTATTTCTAGAAGTTTCTCTTTAAATGGATCCTAAAAATAAAGTACACACTTATTCTTATGTATTCTTATTGTTAAAGGAATAACATTATCTTTGTTAGAATAATTTCTAGGTTATAATAAATCTGATTCATCTTTGTTTAGACAAAGTAACAGGTTAGTGTCCCATCACTTGTCTGTACATTTATTTTTGTCAGCTTCTCTTTTAAGCCTGCCATCAAGCCACACCCACACCAACACCCTGTTACCTCTGCTGGAATCTCCAACTTAAAAGGTTAACAAAAGTAAAGTTAATGAATTATATAAACCTTGTATGTTAAAGGTAACTTAGAAAACACATATTGCATTAATGCCACAATTATTTAGAAAGCTTACAGTGTAATTTAAGAAACATTCCTCCTTTGTAAAACTGGTTTCAGTATTATTTCGACCAAAATAAAAAGTTGAAGTAGAGTCTGAATAAAGCCAGAAATAAAGGAGTGCATGCTATATGATTCCATTTATATAAAGTTCAGAATCAGTGAAAACTCATTTTTTGTTTTAGAAGTCAAGATAGTAGTGATTCCTGGGGCATGGTGACTGGAAGGGGGAGCCAGGAGCTTTTAGGATACTGGCAGTGTGCTGTCTCTTGATTTGGATTTTGTTTACATATGTGTATTCAGTTTAGGAAAATTCAGCAATCAGTACACATATGAATTTGTACTTTTCTGTATGTATGTTATGCTTCAAGGTATATAAAAAAATTAAAGTAAGTTTAAAAAATGGCAAATTCTTTTAAAAAATGTACCTGAGAAATTTAGTTTTAAAAATCTTTATGAGTAGAAACATGCATTTAAAATTATCAAGTAAAACCAAATAAGTAACAAAAAAAGGAAAGTGAATAAAATATATTCAACTGTGCTAGTGCAGCTGGAGTAGATAGCAGTCTTTTTCAGAATTTAAAAAAAGAGATATACGGAGGCTAGTTACTAACATTGGTTTAGTGCCTACTATATTTCAAGCATTGTTTTATCTACTATGCATATTTCATATCATTTGATCCCAACATTCTTATTTTCAATGGTATTATCAAGTACATATGGCCAGAATTTGTAATGCTTTCTAAATTTTACAAAATAAAGTATTGACATAATTTACTGGCCATAATGTCCAAATTGACTCTCAGTTTATTCTTATAATTCCTGAAAAATTCATCAGAAAAGCATCATTAAAGTAAATATTTCACTTCTTTACCATTGCACTGTTTTCCTAAGAAAGTAAATATGCAAGTATGCAAATTAGATAGGATTCCCATTATCATTGCCAAATGTAATTTGATAGCAACAAAATGGCTCTGTGGAATGTCAGAAAATCAATCCTGG
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Task1_train_4112
This is a variant in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
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Task1_train_4113
Gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Spastic diplegia
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Task1_train_4114
This is a variant in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Singleton-Merten syndrome 1
AACATTCTTATTTTCAATGGTATTATCAAGTACATATGGCCAGAATTTGTAATGCTTTCTAAATTTTACAAAATAAAGTATTGACATAATTTACTGGCCATAATGTCCAAATTGACTCTCAGTTTATTCTTATAATTCCTGAAAAATTCATCAGAAAAGCATCATTAAAGTAAATATTTCACTTCTTTACCATTGCACTGTTTTCCTAAGAAAGTAAATATGCAAGTATGCAAATTAGATAGGATTCCCATTATCATTGCCAAATGTAATTTGATAGCAACAAAATGGCTCTGTGGAATGTCAGAAAATCAATCCTGGAATTCACGAAGAAAATTAAAAAGGCTAAAACGAACTGTCATAACCCCTCCAGCTTAGTTACACATCCCTCTGCCCATGGCCCCTCACTGTCCCTTTTAACTCATATGTACAAACAATGAATAAGCTATTCCTCATGTAAATTAGAAAACTAAAAGAGGTCTAGAGGCGAGAATTCACTGTAGTGCTTTACTGCCTAACATCAATTAAAAAAAAACCTGAAACTTGTTTGCTAAAATTTTTAAATAATATTTTTCAGATGGTCAGTATAAAATAGCCTTTGCCATCTTTCTACTGAATGTAGTATTGTCAATCAATAGATATAAAACATTAAGCCCATACTTCTCTGGTTGCATCTGCAATGGCAAACTTCTTGCATGGCTCCTGTATTTGGTTTTTCAGTTGATCAAGGTTTTCTTTAACAGTTTTAATAGTAAATGCATCAAGATTGGCACATAGCTGGAAAAGAGACATTTTTCAATATTTATGCAATTATTTTTCCCTTTCACTTTATTCAACGTAGAACTCTTTTTCATGTAAAAAATATGTAGCATTAAATTGTAGCATAAATATGTGGTATAAAATTTCATGAAAGTAATATGTAGCATTGCTTGCTAAATATAGCATTTTAACATTGTTTTATTATGGATCTCATTAACCCACAATCAGCAACATTTGTCCTAATATAGGAAAAAGGAGCTTCTAAATCAAGTTGGTGTAATAACAGAGAAAAAGGTGTATTGATATTCATTCCTTAAATTCCATTTTCCAAGTGGAAAACTGACATGGAAAGAGTATAACAATTTACCATCATTGACAGAGAATGATTTTGAGATAACCATGTTACATGAGGCATATCAAAGGTCAACTTGACATCCGTGGATCATACTACCACCTTCTTCTACACATAAAGCAGGCATCTACACATAAAGCTGGGAGCATCCTTAGTCATGTTCCTTGATTATTAGATTGGAATTAGTCCTTAATCCCAGTAATAAATTATATTTTGGAGCCTATAATTGCATCTCTGAATGTTGTGTCTACTCTACATAATTTGTATTGAATTCAACTTAAAGTAAGGGACTTAAAATTCAAATGCAATTGCCTTGGTACCAAAATACTTCTTGGGCTACTCTGATTTACTTAACACTCAAGATTAACAGTAGCACTGTATGTGGTGTTACCATTAGGGGGCAGCTGACAAGCTCATCTTTAAAGATCTTCATATCCCTATTTCCCTTTAATTTGAATTACCTAGATTCCTAGAATAACATATGAAGGACAGAAAATACGCAGTTTTGAAACTCATGGAGTAAGACTTTATTATGTGTGACAACTAGAAACTTTCATAGTTTATGCATATTTCTATATCAGGTAGATCATTAAATTTAACCATAAGAGTAGATGTTCAAAAGAAGGCATTCTATTTATCTCAACTTCCCATTAATTATATCACTCTCCATCATTTTTATGATATGATTTTGTGTTATTGATATTTATTAAGGCATATTAGTATTCTGTAGAAGACTGAGTATATTTATTGTACTAAAGCAAACAGATTTCACTTAACTGATGATCACAGCACTTGAACTCAATCTTATTTAATAAGACCAAGAAGTCCTGGCATTTGTTTTAGCTTTGCTTTCATTGGTTATACATAAAATTATGACTTACTTTTAAAATGTGTTCTTCAGCTTTGGCTTGCTTCGTGGCCCCTCCAACACCAGGTGAAGCTGTTAGTCCCAGTATCTGAGGAAGGGGAATCACTGGTTTGTTTTCTTTCTTGAGTCTATTGTTTTTCAACTTCTGCATCAAATAATGCCTCATGATGTTATTATACACTGCTTCTTTGTTGGTGTGATGACATTCATCAATGATAATGAGGGAAAAGTCTTAAAAGAAAATTCAAAGAGTTCATTTCTCCATATCAGCACACTACAGTGAGAAAATAGCTTTAGACCAGTAATTGAGCTGCCTTGGGGATGCCTTCTCTTGGGCACGACACAAGAGCAGTCCACTTTCAGTTTTTAGGAGGGAAATCTAACTATACTAGCACCTGTACACACAGACGTTCGTATATACTAATCATGAAACTCCCTGTTAGACATTCTCCTTCTTTAATAGATAAGATTCAGAAAGTTTACAGAGCTAAAAAGCGTTAGATGTGGAATTCACACCCTGGCTTATTACAAAACAAATCTCAGGATTTTACTTTTGTTCTTTAATAAAATATTTAATTTTAGGTTGGTGAATTTTATTTTTATTACATCAAGTGAAAAACACACTATTTAAAGAGGGAAAATTTTGCCTTGTTTTAACATTGCATTTAGTTATTATAAATTATTTTTATTTTTTTCCATTCTTTCTCCTACCTTCTCATCCTATACCCCATAAAAGACAAGATTTGTATTTTTATTCTATGGGAAAGGGAAGCAGATCTAACAACATTCAATAGCAAATAAAGGAACTTGTCAGAATAAATGGAAAGTCCAGCGAGTGCTTGCCTTAATAATGGTATTCTTATGCAGAATAAAGTGGTCTAATTAAAAACTTACTTTTTTTGTTTCCTCCAGGAAGTAGAAGGATTTTAATAAAACCATAAGCAATAAAAGACAATTTAAGCCACGAACATTTAAAAAATTAACAAATACAGCCTTTGTTATCATCAATATTACTATTAATTTTTTTAAAAAAATAAACACTTAAACTGACCTGACAATTGAACACCAGCATCTTCTCCATTTTCCAAGTTTAAGAGGGAGTTTTCAAGGATTTGAGCTGTACTGATAATAATATCACAGGACTTGACAACTTCTGGAAATGATATTTTCAGTTGGGTATCACCACTTAATCCAATAACACGATACCATTTCTTCAAAAATGGTTGGAACTCCTTGCGGAAGAGCTGTTCAACTAGCAGTACCTTAAAAAAATGTGAAGATTTTTTAAAAGAGAGAAAGTTAGTCGAAGCCAAAAGAGTGTTGATCAAAGGCCTGTTTGGCATCCAGCATGAAAAGAGGTGTTTACATTATCAGTGAATCAGGCATAACAACGTTCCCATCACTCCTTTCATTCATCTGTCAATAAGCACTGATTATACCCTTGTTAGGTGTGGGCATTTATGTCTGGGACACAAAGATATTTAACATATGGTTGACAACTCTGAGGAACTCTGTCTAGCTGATCATACAGACCAAGACTAAACAAAGCAAGACAAATTATTACAACACAATGTAATAATGCTCACCTAGAAACACACACAAAGTGACAGTTAAGAGAAGAAGCAACTGACGACTCAAAAAAGGGGAATTTGAAGGAATTTGAATCTAGTAAGCCATGAGTCAGTGAAAAGATAAACTGAAGCTAAGGTTGAATAAGAAATACATTTTTAAATTTGTAGAGCAGTGCCAGGTTATAAAGGGCTGCAAACATCAAGCAGAGTATTTTACATGTAGTATAACAGTTTACAGGATCCCTACAAGTTGTACTGTTGAAGTGATTTATTCCTGTTGTTTGTTTTGGATTAGACCAGAAGCAACAGGCCCACAGGACCGGAAGAATCAGGGAACCACAAGTGAGGAGTTAGGGCATTGACTAGGAGAACAGATGTGAAGTGAAGAAATGAGCTGCTGGAATAGCTGTGGTGGCTGAGAAAGAACAAACCCGAAAGTAGACCTGGCAAAAGAAGTGGAAACTTCGGGTCCTTCTCAGCTGATTCTGTATGTTATAACATCTGCTGAAGGTAGCTGGGTTGACACCTCAATGCTACACATTACTAGTC
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Task1_train_4115
The variant affects gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
AACATTCTTATTTTCAATGGTATTATCAAGTACATATGGCCAGAATTTGTAATGCTTTCTAAATTTTACAAAATAAAGTATTGACATAATTTACTGGCCATAATGTCCAAATTGACTCTCAGTTTATTCTTATAATTCCTGAAAAATTCATCAGAAAAGCATCATTAAAGTAAATATTTCACTTCTTTACCATTGCACTGTTTTCCTAAGAAAGTAAATATGCAAGTATGCAAATTAGATAGGATTCCCATTATCATTGCCAAATGTAATTTGATAGCAACAAAATGGCTCTGTGGAATGTCAGAAAATCAATCCTGGAATTCACGAAGAAAATTAAAAAGGCTAAAACGAACTGTCATAACCCCTCCAGCTTAGTTACACATCCCTCTGCCCATGGCCCCTCACTGTCCCTTTTAACTCATATGTACAAACAATGAATAAGCTATTCCTCATGTAAATTAGAAAACTAAAAGAGGTCTAGAGGCGAGAATTCACTGTAGTGCTTTACTGCCTAACATCAATTAAAAAAAAACCTGAAACTTGTTTGCTAAAATTTTTAAATAATATTTTTCAGATGGTCAGTATAAAATAGCCTTTGCCATCTTTCTACTGAATGTAGTATTGTCAATCAATAGATATAAAACATTAAGCCCATACTTCTCTGGTTGCATCTGCAATGGCAAACTTCTTGCATGGCTCCTGTATTTGGTTTTTCAGTTGATCAAGGTTTTCTTTAACAGTTTTAATAGTAAATGCATCAAGATTGGCACATAGCTGGAAAAGAGACATTTTTCAATATTTATGCAATTATTTTTCCCTTTCACTTTATTCAACGTAGAACTCTTTTTCATGTAAAAAATATGTAGCATTAAATTGTAGCATAAATATGTGGTATAAAATTTCATGAAAGTAATATGTAGCATTGCTTGCTAAATATAGCATTTTAACATTGTTTTATTATGGATCTCATTAACCCACAATCAGCAACATTTGTCCTAATATAGGAAAAAGGAGCTTCTAAATCAAGTTGGTGTAATAACAGAGAAAAAGGTGTATTGATATTCATTCCTTAAATTCCATTTTCCAAGTGGAAAACTGACATGGAAAGAGTATAACAATTTACCATCATTGACAGAGAATGATTTTGAGATAACCATGTTACATGAGGCATATCAAAGGTCAACTTGACATCCGTGGATCATACTACCACCTTCTTCTACACATAAAGCAGGCATCTACACATAAAGCTGGGAGCATCCTTAGTCATGTTCCTTGATTATTAGATTGGAATTAGTCCTTAATCCCAGTAATAAATTATATTTTGGAGCCTATAATTGCATCTCTGAATGTTGTGTCTACTCTACATAATTTGTATTGAATTCAACTTAAAGTAAGGGACTTAAAATTCAAATGCAATTGCCTTGGTACCAAAATACTTCTTGGGCTACTCTGATTTACTTAACACTCAAGATTAACAGTAGCACTGTATGTGGTGTTACCATTAGGGGGCAGCTGACAAGCTCATCTTTAAAGATCTTCATATCCCTATTTCCCTTTAATTTGAATTACCTAGATTCCTAGAATAACATATGAAGGACAGAAAATACGCAGTTTTGAAACTCATGGAGTAAGACTTTATTATGTGTGACAACTAGAAACTTTCATAGTTTATGCATATTTCTATATCAGGTAGATCATTAAATTTAACCATAAGAGTAGATGTTCAAAAGAAGGCATTCTATTTATCTCAACTTCCCATTAATTATATCACTCTCCATCATTTTTATGATATGATTTTGTGTTATTGATATTTATTAAGGCATATTAGTATTCTGTAGAAGACTGAGTATATTTATTGTACTAAAGCAAACAGATTTCACTTAACTGATGATCACAGCACTTGAACTCAATCTTATTTAATAAGACCAAGAAGTCCTGGCATTTGTTTTAGCTTTGCTTTCATTGGTTATACATAAAATTATGACTTACTTTTAAAATGTGTTCTTCAGCTTTGGCTTGCTTCGTGGCCCCTCCAACACCAGGTGAAGCTGTTAGTCCCAGTATCTGAGGAAGGGGAATCACTGGTTTGTTTTCTTTCTTGAGTCTATTGTTTTTCAACTTCTGCATCAAATAATGCCTCATGATGTTATTATACACTGCTTCTTTGTTGGTGTGATGACATTCATCAATGATAATGAGGGAAAAGTCTTAAAAGAAAATTCAAAGAGTTCATTTCTCCATATCAGCACACTACAGTGAGAAAATAGCTTTAGACCAGTAATTGAGCTGCCTTGGGGATGCCTTCTCTTGGGCACGACACAAGAGCAGTCCACTTTCAGTTTTTAGGAGGGAAATCTAACTATACTAGCACCTGTACACACAGACGTTCGTATATACTAATCATGAAACTCCCTGTTAGACATTCTCCTTCTTTAATAGATAAGATTCAGAAAGTTTACAGAGCTAAAAAGCGTTAGATGTGGAATTCACACCCTGGCTTATTACAAAACAAATCTCAGGATTTTACTTTTGTTCTTTAATAAAATATTTAATTTTAGGTTGGTGAATTTTATTTTTATTACATCAAGTGAAAAACACACTATTTAAAGAGGGAAAATTTTGCCTTGTTTTAACATTGCATTTAGTTATTATAAATTATTTTTATTTTTTTCCATTCTTTCTCCTACCTTCTCATCCTATACCCCATAAAAGACAAGATTTGTATTTTTATTCTATGGGAAAGGGAAGCAGATCTAACAACATTCAATAGCAAATAAAGGAACTTGTCAGAATAAATGGAAAGTCCAGCGAGTGCTTGCCTTAATAATGGTATTCTTATGCAGAATAAAGTGGTCTAATTAAAAACTTACTTTTTTTGTTTCCTCCAGGAAGTAGAAGGATTTTAATAAAACCATAAGCAATAAAAGACAATTTAAGCCACGAACATTTAAAAAATTAACAAATACAGCCTTTGTTATCATCAATATTACTATTAATTTTTTTAAAAAAATAAACACTTAAACTGACCTGACAATTGAACACCAGCATCTTCTCCATTTTCCAAGTTTAAGAGGGAGTTTTCAAGGATTTGAGCTGTACTGATAATAATATCACAGGACTTGACAACTTCTGGAAATGATATTTTCAGTTGGGTATCACCACTTAATCCAATAACACGATACCATTTCTTCAAAAATGGTTGGAACTCCTTGCGGAAGAGCTGTTCAACTAGCAGTACCTTAAAAAAATGTGAAGATTTTTTAAAAGAGAGAAAGTTAGTCGAAGCCAAAAGAGTGTTGATCAAAGGCCTGTTTGGCATCCAGCATGAAAAGAGGTGTTTACATTATCAGTGAATCAGGCATAACAACGTTCCCATCACTCCTTTCATTCATCTGTCAATAAGCACTGATTATACCCTTGTTAGGTGTGGGCATTTATGTCTGGGACACAAAGATATTTAACATATGGTTGACAACTCTGAGGAACTCTGTCTAGCTGATCATACAGACCAAGACTAAACAAAGCAAGACAAATTATTACAACACAATGTAATAATGCTCACCTAGAAACACACACAAAGTGACAGTTAAGAGAAGAAGCAACTGACGACTCAAAAAAGGGGAATTTGAAGGAATTTGAATCTAGTAAGCCATGAGTCAGTGAAAAGATAAACTGAAGCTAAGGTTGAATAAGAAATACATTTTTAAATTTGTAGAGCAGTGCCAGGTTATAAAGGGCTGCAAACATCAAGCAGAGTATTTTACATGTAGTATAACAGTTTACAGGATCCCTACAAGTTGTACTGTTGAAGTGATTTATTCCTGTTGTTTGTTTTGGATTAGACCAGAAGCAACAGGCCCACAGGACCGGAAGAATCAGGGAACCACAAGTGAGGAGTTAGGGCATTGACTAGGAGAACAGATGTGAAGTGAAGAAATGAGCTGCTGGAATAGCTGTGGTGGCTGAGAAAGAACAAACCCGAAAGTAGACCTGGCAAAAGAAGTGGAAACTTCGGGTCCTTCTCAGCTGATTCTGTATGTTATAACATCTGCTGAAGGTAGCTGGGTTGACACCTCAATGCTACACATTACTAGTC
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Task1_train_4116
Gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
TTGACTCTCAGTTTATTCTTATAATTCCTGAAAAATTCATCAGAAAAGCATCATTAAAGTAAATATTTCACTTCTTTACCATTGCACTGTTTTCCTAAGAAAGTAAATATGCAAGTATGCAAATTAGATAGGATTCCCATTATCATTGCCAAATGTAATTTGATAGCAACAAAATGGCTCTGTGGAATGTCAGAAAATCAATCCTGGAATTCACGAAGAAAATTAAAAAGGCTAAAACGAACTGTCATAACCCCTCCAGCTTAGTTACACATCCCTCTGCCCATGGCCCCTCACTGTCCCTTTTAACTCATATGTACAAACAATGAATAAGCTATTCCTCATGTAAATTAGAAAACTAAAAGAGGTCTAGAGGCGAGAATTCACTGTAGTGCTTTACTGCCTAACATCAATTAAAAAAAAACCTGAAACTTGTTTGCTAAAATTTTTAAATAATATTTTTCAGATGGTCAGTATAAAATAGCCTTTGCCATCTTTCTACTGAATGTAGTATTGTCAATCAATAGATATAAAACATTAAGCCCATACTTCTCTGGTTGCATCTGCAATGGCAAACTTCTTGCATGGCTCCTGTATTTGGTTTTTCAGTTGATCAAGGTTTTCTTTAACAGTTTTAATAGTAAATGCATCAAGATTGGCACATAGCTGGAAAAGAGACATTTTTCAATATTTATGCAATTATTTTTCCCTTTCACTTTATTCAACGTAGAACTCTTTTTCATGTAAAAAATATGTAGCATTAAATTGTAGCATAAATATGTGGTATAAAATTTCATGAAAGTAATATGTAGCATTGCTTGCTAAATATAGCATTTTAACATTGTTTTATTATGGATCTCATTAACCCACAATCAGCAACATTTGTCCTAATATAGGAAAAAGGAGCTTCTAAATCAAGTTGGTGTAATAACAGAGAAAAAGGTGTATTGATATTCATTCCTTAAATTCCATTTTCCAAGTGGAAAACTGACATGGAAAGAGTATAACAATTTACCATCATTGACAGAGAATGATTTTGAGATAACCATGTTACATGAGGCATATCAAAGGTCAACTTGACATCCGTGGATCATACTACCACCTTCTTCTACACATAAAGCAGGCATCTACACATAAAGCTGGGAGCATCCTTAGTCATGTTCCTTGATTATTAGATTGGAATTAGTCCTTAATCCCAGTAATAAATTATATTTTGGAGCCTATAATTGCATCTCTGAATGTTGTGTCTACTCTACATAATTTGTATTGAATTCAACTTAAAGTAAGGGACTTAAAATTCAAATGCAATTGCCTTGGTACCAAAATACTTCTTGGGCTACTCTGATTTACTTAACACTCAAGATTAACAGTAGCACTGTATGTGGTGTTACCATTAGGGGGCAGCTGACAAGCTCATCTTTAAAGATCTTCATATCCCTATTTCCCTTTAATTTGAATTACCTAGATTCCTAGAATAACATATGAAGGACAGAAAATACGCAGTTTTGAAACTCATGGAGTAAGACTTTATTATGTGTGACAACTAGAAACTTTCATAGTTTATGCATATTTCTATATCAGGTAGATCATTAAATTTAACCATAAGAGTAGATGTTCAAAAGAAGGCATTCTATTTATCTCAACTTCCCATTAATTATATCACTCTCCATCATTTTTATGATATGATTTTGTGTTATTGATATTTATTAAGGCATATTAGTATTCTGTAGAAGACTGAGTATATTTATTGTACTAAAGCAAACAGATTTCACTTAACTGATGATCACAGCACTTGAACTCAATCTTATTTAATAAGACCAAGAAGTCCTGGCATTTGTTTTAGCTTTGCTTTCATTGGTTATACATAAAATTATGACTTACTTTTAAAATGTGTTCTTCAGCTTTGGCTTGCTTCGTGGCCCCTCCAACACCAGGTGAAGCTGTTAGTCCCAGTATCTGAGGAAGGGGAATCACTGGTTTGTTTTCTTTCTTGAGTCTATTGTTTTTCAACTTCTGCATCAAATAATGCCTCATGATGTTATTATACACTGCTTCTTTGTTGGTGTGATGACATTCATCAATGATAATGAGGGAAAAGTCTTAAAAGAAAATTCAAAGAGTTCATTTCTCCATATCAGCACACTACAGTGAGAAAATAGCTTTAGACCAGTAATTGAGCTGCCTTGGGGATGCCTTCTCTTGGGCACGACACAAGAGCAGTCCACTTTCAGTTTTTAGGAGGGAAATCTAACTATACTAGCACCTGTACACACAGACGTTCGTATATACTAATCATGAAACTCCCTGTTAGACATTCTCCTTCTTTAATAGATAAGATTCAGAAAGTTTACAGAGCTAAAAAGCGTTAGATGTGGAATTCACACCCTGGCTTATTACAAAACAAATCTCAGGATTTTACTTTTGTTCTTTAATAAAATATTTAATTTTAGGTTGGTGAATTTTATTTTTATTACATCAAGTGAAAAACACACTATTTAAAGAGGGAAAATTTTGCCTTGTTTTAACATTGCATTTAGTTATTATAAATTATTTTTATTTTTTTCCATTCTTTCTCCTACCTTCTCATCCTATACCCCATAAAAGACAAGATTTGTATTTTTATTCTATGGGAAAGGGAAGCAGATCTAACAACATTCAATAGCAAATAAAGGAACTTGTCAGAATAAATGGAAAGTCCAGCGAGTGCTTGCCTTAATAATGGTATTCTTATGCAGAATAAAGTGGTCTAATTAAAAACTTACTTTTTTTGTTTCCTCCAGGAAGTAGAAGGATTTTAATAAAACCATAAGCAATAAAAGACAATTTAAGCCACGAACATTTAAAAAATTAACAAATACAGCCTTTGTTATCATCAATATTACTATTAATTTTTTTAAAAAAATAAACACTTAAACTGACCTGACAATTGAACACCAGCATCTTCTCCATTTTCCAAGTTTAAGAGGGAGTTTTCAAGGATTTGAGCTGTACTGATAATAATATCACAGGACTTGACAACTTCTGGAAATGATATTTTCAGTTGGGTATCACCACTTAATCCAATAACACGATACCATTTCTTCAAAAATGGTTGGAACTCCTTGCGGAAGAGCTGTTCAACTAGCAGTACCTTAAAAAAATGTGAAGATTTTTTAAAAGAGAGAAAGTTAGTCGAAGCCAAAAGAGTGTTGATCAAAGGCCTGTTTGGCATCCAGCATGAAAAGAGGTGTTTACATTATCAGTGAATCAGGCATAACAACGTTCCCATCACTCCTTTCATTCATCTGTCAATAAGCACTGATTATACCCTTGTTAGGTGTGGGCATTTATGTCTGGGACACAAAGATATTTAACATATGGTTGACAACTCTGAGGAACTCTGTCTAGCTGATCATACAGACCAAGACTAAACAAAGCAAGACAAATTATTACAACACAATGTAATAATGCTCACCTAGAAACACACACAAAGTGACAGTTAAGAGAAGAAGCAACTGACGACTCAAAAAAGGGGAATTTGAAGGAATTTGAATCTAGTAAGCCATGAGTCAGTGAAAAGATAAACTGAAGCTAAGGTTGAATAAGAAATACATTTTTAAATTTGTAGAGCAGTGCCAGGTTATAAAGGGCTGCAAACATCAAGCAGAGTATTTTACATGTAGTATAACAGTTTACAGGATCCCTACAAGTTGTACTGTTGAAGTGATTTATTCCTGTTGTTTGTTTTGGATTAGACCAGAAGCAACAGGCCCACAGGACCGGAAGAATCAGGGAACCACAAGTGAGGAGTTAGGGCATTGACTAGGAGAACAGATGTGAAGTGAAGAAATGAGCTGCTGGAATAGCTGTGGTGGCTGAGAAAGAACAAACCCGAAAGTAGACCTGGCAAAAGAAGTGGAAACTTCGGGTCCTTCTCAGCTGATTCTGTATGTTATAACATCTGCTGAAGGTAGCTGGGTTGACACCTCAATGCTACACATTACTAGTCACTCAAAATACCTTCTGGATTAGGAGAAAAAATATAAGGCCATCTTGAAGGTCATATCCTAGGAAGATTTATGCAATGGAAGCCCAGCAGTGTACAATATGGGAAACAGAG
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Task1_train_4117
A mutation in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
TCAGTTTATTCTTATAATTCCTGAAAAATTCATCAGAAAAGCATCATTAAAGTAAATATTTCACTTCTTTACCATTGCACTGTTTTCCTAAGAAAGTAAATATGCAAGTATGCAAATTAGATAGGATTCCCATTATCATTGCCAAATGTAATTTGATAGCAACAAAATGGCTCTGTGGAATGTCAGAAAATCAATCCTGGAATTCACGAAGAAAATTAAAAAGGCTAAAACGAACTGTCATAACCCCTCCAGCTTAGTTACACATCCCTCTGCCCATGGCCCCTCACTGTCCCTTTTAACTCATATGTACAAACAATGAATAAGCTATTCCTCATGTAAATTAGAAAACTAAAAGAGGTCTAGAGGCGAGAATTCACTGTAGTGCTTTACTGCCTAACATCAATTAAAAAAAAACCTGAAACTTGTTTGCTAAAATTTTTAAATAATATTTTTCAGATGGTCAGTATAAAATAGCCTTTGCCATCTTTCTACTGAATGTAGTATTGTCAATCAATAGATATAAAACATTAAGCCCATACTTCTCTGGTTGCATCTGCAATGGCAAACTTCTTGCATGGCTCCTGTATTTGGTTTTTCAGTTGATCAAGGTTTTCTTTAACAGTTTTAATAGTAAATGCATCAAGATTGGCACATAGCTGGAAAAGAGACATTTTTCAATATTTATGCAATTATTTTTCCCTTTCACTTTATTCAACGTAGAACTCTTTTTCATGTAAAAAATATGTAGCATTAAATTGTAGCATAAATATGTGGTATAAAATTTCATGAAAGTAATATGTAGCATTGCTTGCTAAATATAGCATTTTAACATTGTTTTATTATGGATCTCATTAACCCACAATCAGCAACATTTGTCCTAATATAGGAAAAAGGAGCTTCTAAATCAAGTTGGTGTAATAACAGAGAAAAAGGTGTATTGATATTCATTCCTTAAATTCCATTTTCCAAGTGGAAAACTGACATGGAAAGAGTATAACAATTTACCATCATTGACAGAGAATGATTTTGAGATAACCATGTTACATGAGGCATATCAAAGGTCAACTTGACATCCGTGGATCATACTACCACCTTCTTCTACACATAAAGCAGGCATCTACACATAAAGCTGGGAGCATCCTTAGTCATGTTCCTTGATTATTAGATTGGAATTAGTCCTTAATCCCAGTAATAAATTATATTTTGGAGCCTATAATTGCATCTCTGAATGTTGTGTCTACTCTACATAATTTGTATTGAATTCAACTTAAAGTAAGGGACTTAAAATTCAAATGCAATTGCCTTGGTACCAAAATACTTCTTGGGCTACTCTGATTTACTTAACACTCAAGATTAACAGTAGCACTGTATGTGGTGTTACCATTAGGGGGCAGCTGACAAGCTCATCTTTAAAGATCTTCATATCCCTATTTCCCTTTAATTTGAATTACCTAGATTCCTAGAATAACATATGAAGGACAGAAAATACGCAGTTTTGAAACTCATGGAGTAAGACTTTATTATGTGTGACAACTAGAAACTTTCATAGTTTATGCATATTTCTATATCAGGTAGATCATTAAATTTAACCATAAGAGTAGATGTTCAAAAGAAGGCATTCTATTTATCTCAACTTCCCATTAATTATATCACTCTCCATCATTTTTATGATATGATTTTGTGTTATTGATATTTATTAAGGCATATTAGTATTCTGTAGAAGACTGAGTATATTTATTGTACTAAAGCAAACAGATTTCACTTAACTGATGATCACAGCACTTGAACTCAATCTTATTTAATAAGACCAAGAAGTCCTGGCATTTGTTTTAGCTTTGCTTTCATTGGTTATACATAAAATTATGACTTACTTTTAAAATGTGTTCTTCAGCTTTGGCTTGCTTCGTGGCCCCTCCAACACCAGGTGAAGCTGTTAGTCCCAGTATCTGAGGAAGGGGAATCACTGGTTTGTTTTCTTTCTTGAGTCTATTGTTTTTCAACTTCTGCATCAAATAATGCCTCATGATGTTATTATACACTGCTTCTTTGTTGGTGTGATGACATTCATCAATGATAATGAGGGAAAAGTCTTAAAAGAAAATTCAAAGAGTTCATTTCTCCATATCAGCACACTACAGTGAGAAAATAGCTTTAGACCAGTAATTGAGCTGCCTTGGGGATGCCTTCTCTTGGGCACGACACAAGAGCAGTCCACTTTCAGTTTTTAGGAGGGAAATCTAACTATACTAGCACCTGTACACACAGACGTTCGTATATACTAATCATGAAACTCCCTGTTAGACATTCTCCTTCTTTAATAGATAAGATTCAGAAAGTTTACAGAGCTAAAAAGCGTTAGATGTGGAATTCACACCCTGGCTTATTACAAAACAAATCTCAGGATTTTACTTTTGTTCTTTAATAAAATATTTAATTTTAGGTTGGTGAATTTTATTTTTATTACATCAAGTGAAAAACACACTATTTAAAGAGGGAAAATTTTGCCTTGTTTTAACATTGCATTTAGTTATTATAAATTATTTTTATTTTTTTCCATTCTTTCTCCTACCTTCTCATCCTATACCCCATAAAAGACAAGATTTGTATTTTTATTCTATGGGAAAGGGAAGCAGATCTAACAACATTCAATAGCAAATAAAGGAACTTGTCAGAATAAATGGAAAGTCCAGCGAGTGCTTGCCTTAATAATGGTATTCTTATGCAGAATAAAGTGGTCTAATTAAAAACTTACTTTTTTTGTTTCCTCCAGGAAGTAGAAGGATTTTAATAAAACCATAAGCAATAAAAGACAATTTAAGCCACGAACATTTAAAAAATTAACAAATACAGCCTTTGTTATCATCAATATTACTATTAATTTTTTTAAAAAAATAAACACTTAAACTGACCTGACAATTGAACACCAGCATCTTCTCCATTTTCCAAGTTTAAGAGGGAGTTTTCAAGGATTTGAGCTGTACTGATAATAATATCACAGGACTTGACAACTTCTGGAAATGATATTTTCAGTTGGGTATCACCACTTAATCCAATAACACGATACCATTTCTTCAAAAATGGTTGGAACTCCTTGCGGAAGAGCTGTTCAACTAGCAGTACCTTAAAAAAATGTGAAGATTTTTTAAAAGAGAGAAAGTTAGTCGAAGCCAAAAGAGTGTTGATCAAAGGCCTGTTTGGCATCCAGCATGAAAAGAGGTGTTTACATTATCAGTGAATCAGGCATAACAACGTTCCCATCACTCCTTTCATTCATCTGTCAATAAGCACTGATTATACCCTTGTTAGGTGTGGGCATTTATGTCTGGGACACAAAGATATTTAACATATGGTTGACAACTCTGAGGAACTCTGTCTAGCTGATCATACAGACCAAGACTAAACAAAGCAAGACAAATTATTACAACACAATGTAATAATGCTCACCTAGAAACACACACAAAGTGACAGTTAAGAGAAGAAGCAACTGACGACTCAAAAAAGGGGAATTTGAAGGAATTTGAATCTAGTAAGCCATGAGTCAGTGAAAAGATAAACTGAAGCTAAGGTTGAATAAGAAATACATTTTTAAATTTGTAGAGCAGTGCCAGGTTATAAAGGGCTGCAAACATCAAGCAGAGTATTTTACATGTAGTATAACAGTTTACAGGATCCCTACAAGTTGTACTGTTGAAGTGATTTATTCCTGTTGTTTGTTTTGGATTAGACCAGAAGCAACAGGCCCACAGGACCGGAAGAATCAGGGAACCACAAGTGAGGAGTTAGGGCATTGACTAGGAGAACAGATGTGAAGTGAAGAAATGAGCTGCTGGAATAGCTGTGGTGGCTGAGAAAGAACAAACCCGAAAGTAGACCTGGCAAAAGAAGTGGAAACTTCGGGTCCTTCTCAGCTGATTCTGTATGTTATAACATCTGCTGAAGGTAGCTGGGTTGACACCTCAATGCTACACATTACTAGTCACTCAAAATACCTTCTGGATTAGGAGAAAAAATATAAGGCCATCTTGAAGGTCATATCCTAGGAAGATTTATGCAATGGAAGCCCAGCAGTGTACAATATGGGAAACAGAGAGTTGGC
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Task1_train_4118
A variant was discovered in gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
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Task1_train_4119
Given a variant located on Chromosome 2 and affecting IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
CCTGAAAAATTCATCAGAAAAGCATCATTAAAGTAAATATTTCACTTCTTTACCATTGCACTGTTTTCCTAAGAAAGTAAATATGCAAGTATGCAAATTAGATAGGATTCCCATTATCATTGCCAAATGTAATTTGATAGCAACAAAATGGCTCTGTGGAATGTCAGAAAATCAATCCTGGAATTCACGAAGAAAATTAAAAAGGCTAAAACGAACTGTCATAACCCCTCCAGCTTAGTTACACATCCCTCTGCCCATGGCCCCTCACTGTCCCTTTTAACTCATATGTACAAACAATGAATAAGCTATTCCTCATGTAAATTAGAAAACTAAAAGAGGTCTAGAGGCGAGAATTCACTGTAGTGCTTTACTGCCTAACATCAATTAAAAAAAAACCTGAAACTTGTTTGCTAAAATTTTTAAATAATATTTTTCAGATGGTCAGTATAAAATAGCCTTTGCCATCTTTCTACTGAATGTAGTATTGTCAATCAATAGATATAAAACATTAAGCCCATACTTCTCTGGTTGCATCTGCAATGGCAAACTTCTTGCATGGCTCCTGTATTTGGTTTTTCAGTTGATCAAGGTTTTCTTTAACAGTTTTAATAGTAAATGCATCAAGATTGGCACATAGCTGGAAAAGAGACATTTTTCAATATTTATGCAATTATTTTTCCCTTTCACTTTATTCAACGTAGAACTCTTTTTCATGTAAAAAATATGTAGCATTAAATTGTAGCATAAATATGTGGTATAAAATTTCATGAAAGTAATATGTAGCATTGCTTGCTAAATATAGCATTTTAACATTGTTTTATTATGGATCTCATTAACCCACAATCAGCAACATTTGTCCTAATATAGGAAAAAGGAGCTTCTAAATCAAGTTGGTGTAATAACAGAGAAAAAGGTGTATTGATATTCATTCCTTAAATTCCATTTTCCAAGTGGAAAACTGACATGGAAAGAGTATAACAATTTACCATCATTGACAGAGAATGATTTTGAGATAACCATGTTACATGAGGCATATCAAAGGTCAACTTGACATCCGTGGATCATACTACCACCTTCTTCTACACATAAAGCAGGCATCTACACATAAAGCTGGGAGCATCCTTAGTCATGTTCCTTGATTATTAGATTGGAATTAGTCCTTAATCCCAGTAATAAATTATATTTTGGAGCCTATAATTGCATCTCTGAATGTTGTGTCTACTCTACATAATTTGTATTGAATTCAACTTAAAGTAAGGGACTTAAAATTCAAATGCAATTGCCTTGGTACCAAAATACTTCTTGGGCTACTCTGATTTACTTAACACTCAAGATTAACAGTAGCACTGTATGTGGTGTTACCATTAGGGGGCAGCTGACAAGCTCATCTTTAAAGATCTTCATATCCCTATTTCCCTTTAATTTGAATTACCTAGATTCCTAGAATAACATATGAAGGACAGAAAATACGCAGTTTTGAAACTCATGGAGTAAGACTTTATTATGTGTGACAACTAGAAACTTTCATAGTTTATGCATATTTCTATATCAGGTAGATCATTAAATTTAACCATAAGAGTAGATGTTCAAAAGAAGGCATTCTATTTATCTCAACTTCCCATTAATTATATCACTCTCCATCATTTTTATGATATGATTTTGTGTTATTGATATTTATTAAGGCATATTAGTATTCTGTAGAAGACTGAGTATATTTATTGTACTAAAGCAAACAGATTTCACTTAACTGATGATCACAGCACTTGAACTCAATCTTATTTAATAAGACCAAGAAGTCCTGGCATTTGTTTTAGCTTTGCTTTCATTGGTTATACATAAAATTATGACTTACTTTTAAAATGTGTTCTTCAGCTTTGGCTTGCTTCGTGGCCCCTCCAACACCAGGTGAAGCTGTTAGTCCCAGTATCTGAGGAAGGGGAATCACTGGTTTGTTTTCTTTCTTGAGTCTATTGTTTTTCAACTTCTGCATCAAATAATGCCTCATGATGTTATTATACACTGCTTCTTTGTTGGTGTGATGACATTCATCAATGATAATGAGGGAAAAGTCTTAAAAGAAAATTCAAAGAGTTCATTTCTCCATATCAGCACACTACAGTGAGAAAATAGCTTTAGACCAGTAATTGAGCTGCCTTGGGGATGCCTTCTCTTGGGCACGACACAAGAGCAGTCCACTTTCAGTTTTTAGGAGGGAAATCTAACTATACTAGCACCTGTACACACAGACGTTCGTATATACTAATCATGAAACTCCCTGTTAGACATTCTCCTTCTTTAATAGATAAGATTCAGAAAGTTTACAGAGCTAAAAAGCGTTAGATGTGGAATTCACACCCTGGCTTATTACAAAACAAATCTCAGGATTTTACTTTTGTTCTTTAATAAAATATTTAATTTTAGGTTGGTGAATTTTATTTTTATTACATCAAGTGAAAAACACACTATTTAAAGAGGGAAAATTTTGCCTTGTTTTAACATTGCATTTAGTTATTATAAATTATTTTTATTTTTTTCCATTCTTTCTCCTACCTTCTCATCCTATACCCCATAAAAGACAAGATTTGTATTTTTATTCTATGGGAAAGGGAAGCAGATCTAACAACATTCAATAGCAAATAAAGGAACTTGTCAGAATAAATGGAAAGTCCAGCGAGTGCTTGCCTTAATAATGGTATTCTTATGCAGAATAAAGTGGTCTAATTAAAAACTTACTTTTTTTGTTTCCTCCAGGAAGTAGAAGGATTTTAATAAAACCATAAGCAATAAAAGACAATTTAAGCCACGAACATTTAAAAAATTAACAAATACAGCCTTTGTTATCATCAATATTACTATTAATTTTTTTAAAAAAATAAACACTTAAACTGACCTGACAATTGAACACCAGCATCTTCTCCATTTTCCAAGTTTAAGAGGGAGTTTTCAAGGATTTGAGCTGTACTGATAATAATATCACAGGACTTGACAACTTCTGGAAATGATATTTTCAGTTGGGTATCACCACTTAATCCAATAACACGATACCATTTCTTCAAAAATGGTTGGAACTCCTTGCGGAAGAGCTGTTCAACTAGCAGTACCTTAAAAAAATGTGAAGATTTTTTAAAAGAGAGAAAGTTAGTCGAAGCCAAAAGAGTGTTGATCAAAGGCCTGTTTGGCATCCAGCATGAAAAGAGGTGTTTACATTATCAGTGAATCAGGCATAACAACGTTCCCATCACTCCTTTCATTCATCTGTCAATAAGCACTGATTATACCCTTGTTAGGTGTGGGCATTTATGTCTGGGACACAAAGATATTTAACATATGGTTGACAACTCTGAGGAACTCTGTCTAGCTGATCATACAGACCAAGACTAAACAAAGCAAGACAAATTATTACAACACAATGTAATAATGCTCACCTAGAAACACACACAAAGTGACAGTTAAGAGAAGAAGCAACTGACGACTCAAAAAAGGGGAATTTGAAGGAATTTGAATCTAGTAAGCCATGAGTCAGTGAAAAGATAAACTGAAGCTAAGGTTGAATAAGAAATACATTTTTAAATTTGTAGAGCAGTGCCAGGTTATAAAGGGCTGCAAACATCAAGCAGAGTATTTTACATGTAGTATAACAGTTTACAGGATCCCTACAAGTTGTACTGTTGAAGTGATTTATTCCTGTTGTTTGTTTTGGATTAGACCAGAAGCAACAGGCCCACAGGACCGGAAGAATCAGGGAACCACAAGTGAGGAGTTAGGGCATTGACTAGGAGAACAGATGTGAAGTGAAGAAATGAGCTGCTGGAATAGCTGTGGTGGCTGAGAAAGAACAAACCCGAAAGTAGACCTGGCAAAAGAAGTGGAAACTTCGGGTCCTTCTCAGCTGATTCTGTATGTTATAACATCTGCTGAAGGTAGCTGGGTTGACACCTCAATGCTACACATTACTAGTCACTCAAAATACCTTCTGGATTAGGAGAAAAAATATAAGGCCATCTTGAAGGTCATATCCTAGGAAGATTTATGCAATGGAAGCCCAGCAGTGTACAATATGGGAAACAGAGAGTTGGCAGGAAGAGTTTCAAGGGCA
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Task1_train_4120
A variant on Chromosome 2 in gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
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Task1_train_4121
Gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
ATCAAAGGTCAACTTGACATCCGTGGATCATACTACCACCTTCTTCTACACATAAAGCAGGCATCTACACATAAAGCTGGGAGCATCCTTAGTCATGTTCCTTGATTATTAGATTGGAATTAGTCCTTAATCCCAGTAATAAATTATATTTTGGAGCCTATAATTGCATCTCTGAATGTTGTGTCTACTCTACATAATTTGTATTGAATTCAACTTAAAGTAAGGGACTTAAAATTCAAATGCAATTGCCTTGGTACCAAAATACTTCTTGGGCTACTCTGATTTACTTAACACTCAAGATTAACAGTAGCACTGTATGTGGTGTTACCATTAGGGGGCAGCTGACAAGCTCATCTTTAAAGATCTTCATATCCCTATTTCCCTTTAATTTGAATTACCTAGATTCCTAGAATAACATATGAAGGACAGAAAATACGCAGTTTTGAAACTCATGGAGTAAGACTTTATTATGTGTGACAACTAGAAACTTTCATAGTTTATGCATATTTCTATATCAGGTAGATCATTAAATTTAACCATAAGAGTAGATGTTCAAAAGAAGGCATTCTATTTATCTCAACTTCCCATTAATTATATCACTCTCCATCATTTTTATGATATGATTTTGTGTTATTGATATTTATTAAGGCATATTAGTATTCTGTAGAAGACTGAGTATATTTATTGTACTAAAGCAAACAGATTTCACTTAACTGATGATCACAGCACTTGAACTCAATCTTATTTAATAAGACCAAGAAGTCCTGGCATTTGTTTTAGCTTTGCTTTCATTGGTTATACATAAAATTATGACTTACTTTTAAAATGTGTTCTTCAGCTTTGGCTTGCTTCGTGGCCCCTCCAACACCAGGTGAAGCTGTTAGTCCCAGTATCTGAGGAAGGGGAATCACTGGTTTGTTTTCTTTCTTGAGTCTATTGTTTTTCAACTTCTGCATCAAATAATGCCTCATGATGTTATTATACACTGCTTCTTTGTTGGTGTGATGACATTCATCAATGATAATGAGGGAAAAGTCTTAAAAGAAAATTCAAAGAGTTCATTTCTCCATATCAGCACACTACAGTGAGAAAATAGCTTTAGACCAGTAATTGAGCTGCCTTGGGGATGCCTTCTCTTGGGCACGACACAAGAGCAGTCCACTTTCAGTTTTTAGGAGGGAAATCTAACTATACTAGCACCTGTACACACAGACGTTCGTATATACTAATCATGAAACTCCCTGTTAGACATTCTCCTTCTTTAATAGATAAGATTCAGAAAGTTTACAGAGCTAAAAAGCGTTAGATGTGGAATTCACACCCTGGCTTATTACAAAACAAATCTCAGGATTTTACTTTTGTTCTTTAATAAAATATTTAATTTTAGGTTGGTGAATTTTATTTTTATTACATCAAGTGAAAAACACACTATTTAAAGAGGGAAAATTTTGCCTTGTTTTAACATTGCATTTAGTTATTATAAATTATTTTTATTTTTTTCCATTCTTTCTCCTACCTTCTCATCCTATACCCCATAAAAGACAAGATTTGTATTTTTATTCTATGGGAAAGGGAAGCAGATCTAACAACATTCAATAGCAAATAAAGGAACTTGTCAGAATAAATGGAAAGTCCAGCGAGTGCTTGCCTTAATAATGGTATTCTTATGCAGAATAAAGTGGTCTAATTAAAAACTTACTTTTTTTGTTTCCTCCAGGAAGTAGAAGGATTTTAATAAAACCATAAGCAATAAAAGACAATTTAAGCCACGAACATTTAAAAAATTAACAAATACAGCCTTTGTTATCATCAATATTACTATTAATTTTTTTAAAAAAATAAACACTTAAACTGACCTGACAATTGAACACCAGCATCTTCTCCATTTTCCAAGTTTAAGAGGGAGTTTTCAAGGATTTGAGCTGTACTGATAATAATATCACAGGACTTGACAACTTCTGGAAATGATATTTTCAGTTGGGTATCACCACTTAATCCAATAACACGATACCATTTCTTCAAAAATGGTTGGAACTCCTTGCGGAAGAGCTGTTCAACTAGCAGTACCTTAAAAAAATGTGAAGATTTTTTAAAAGAGAGAAAGTTAGTCGAAGCCAAAAGAGTGTTGATCAAAGGCCTGTTTGGCATCCAGCATGAAAAGAGGTGTTTACATTATCAGTGAATCAGGCATAACAACGTTCCCATCACTCCTTTCATTCATCTGTCAATAAGCACTGATTATACCCTTGTTAGGTGTGGGCATTTATGTCTGGGACACAAAGATATTTAACATATGGTTGACAACTCTGAGGAACTCTGTCTAGCTGATCATACAGACCAAGACTAAACAAAGCAAGACAAATTATTACAACACAATGTAATAATGCTCACCTAGAAACACACACAAAGTGACAGTTAAGAGAAGAAGCAACTGACGACTCAAAAAAGGGGAATTTGAAGGAATTTGAATCTAGTAAGCCATGAGTCAGTGAAAAGATAAACTGAAGCTAAGGTTGAATAAGAAATACATTTTTAAATTTGTAGAGCAGTGCCAGGTTATAAAGGGCTGCAAACATCAAGCAGAGTATTTTACATGTAGTATAACAGTTTACAGGATCCCTACAAGTTGTACTGTTGAAGTGATTTATTCCTGTTGTTTGTTTTGGATTAGACCAGAAGCAACAGGCCCACAGGACCGGAAGAATCAGGGAACCACAAGTGAGGAGTTAGGGCATTGACTAGGAGAACAGATGTGAAGTGAAGAAATGAGCTGCTGGAATAGCTGTGGTGGCTGAGAAAGAACAAACCCGAAAGTAGACCTGGCAAAAGAAGTGGAAACTTCGGGTCCTTCTCAGCTGATTCTGTATGTTATAACATCTGCTGAAGGTAGCTGGGTTGACACCTCAATGCTACACATTACTAGTCACTCAAAATACCTTCTGGATTAGGAGAAAAAATATAAGGCCATCTTGAAGGTCATATCCTAGGAAGATTTATGCAATGGAAGCCCAGCAGTGTACAATATGGGAAACAGAGAGTTGGCAGGAAGAGTTTCAAGGGCAAGCTTCAAAGAATGCCCATTATATTATTCACTCTCCATAATTCTACCAGAAATGCAATCAGTGGTTACCTTTCTCCTAGTCTGTAGGGTTTGTGTTATTCATCTTTTTACTTGAGGTAAGTCCCACTTAGGTGTTAAATAAGGAATGGCTGATCCCCCTGGCTAAAGGGAACAGCTACCTTATGAAGAACACTGGTTTACTTTATTATTTAGTGGAAATGATGGAGGCTTCCAAAAGTAGGTGTCTGGGGGGCTGGAAGAAGGGGTGGGGAAGAGTTAAAATGAAATCCATAAATTCTAAGGAAGCAAAGTGGACTTAAAATCAGTAATCAAGTTGGTGAGTGAAAGAACATTACCTTACCACAAGGTGGAAAGGGTAGAAAGAGTAAGAAGAGAAACTTTCATTTAGTTCTTTTTTTTTTTCAAAGTAAAGTCTCTCTAATCTACCTGTTACAAACACGCTTGAGAAGTTTAGAAAATGCAGACTCCTAAGTCCCACTCAAGAATTACTGAATCTAGGGACAATCTCTGGGGGGCAGAGGCTTGAAACCTTCACTTTAATGACATTTAAGCCTTTAAAATTTGAGAGTCACAGCTCTGCTCTTCTCTCTCTCTTCCACAAAGCCGTTCTTGAATCATTTTCTAGAAGTATTCTTTCCATTTCATTTATGCAAGACAGAAGGCTTCTGAGGAAAAGAATGGAAATTAAGTTTAGTGGAAAGAGACAGCATGATGCAGAGGGAAGAAAGCCCTGAAAACAGCTACTCCAGCCACTTACTTCTTTGTACCTTGGACAAGGTCTCAATCATCTTAATGCTCTCAATTTCCAGATTAATAAAATGAGGATAATGTTAACCTATTATAGGGTTGTGAAAATTAAATGAAATAGAGGATGCTGTATTGTCAGTACTAAAACTTCCACGATATTTCACCAATCCTTTTATTCTAGAAGGAGGGTGCAGTGGCAAAGGAAGACCAGTGGACTCAGAAGATAAAAGTTCGTGTCTCATTTCTGCTGTTTCTTGGCTGGATGAT
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Task1_train_4122
The following genetic variant occurs in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) on Chromosome 2. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
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Task1_train_4123
Mutation context: Chromosome 2, Gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Singleton-Merten syndrome 1
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Task1_train_4124
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
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Task1_train_4125
Here is a genetic alteration in IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Singleton-Merten syndrome 1
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Task1_train_4126
Consider a variant on Chromosome 2 in gene IFIH1 (interferon induced with helicase C domain 1). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Aicardi-Goutieres syndrome 7
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Task1_train_4127
Given this context: Chromosome 2, gene SCN3A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 3) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Epilepsy, familial focal, with variable foci 4
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Task1_train_4128
Given this context: Chromosome 2, gene SCN3A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 3) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_4129
A genomic change on Chromosome 2 affects SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
ATATGGAAAAGGGAGATAAGGCTGTAGTAGTTAAGGAGGGTTGTGAGTCATAGGAGAGAAATATCCTTTCCCCTATGCCAGGACAAGGGAGACGTAAGCAAGTTTGTGTTGCTGGGAAAAAGCCAGTAAGGTGGGAGCCATTAAGGATAAGAAAAGAGAGAGATAAGAGATTGCTGAAGTCTTCTGGAATGGGGAAGGTGTCCAGAATACCGGTGGAGGGATTGGAAACCTCCCCACTGTAACAGGAAGGAGGAAAGAATTGGTCTCAATGTGGAAAAGTTTGTTGATTTGGGGGTGGGAAGTGGAGGCGGGGCATTGTGATGCTGTCTCTTCTCTGTAAAGTAGAAAATAAGTTTTCAGCTTGAAATGGAGCCGGAAGAAAGAAGAGGGTTGGAAGCTGGAGGAAAGTGGAGAATATTTGAAATTTTTCTTTGCAGAGAGTGGGAGATGGAGCCTAGTAGGAAAATACAGGACTGTGTTGAGGACCACTGAGGTTTGTGACCATAAATTTAGAATGGTGCCAATCTGCCACGGGGTGTTATTTTTCCCCAATAGGGCTCAGCAGACCAACAAGCACAGGGGACCCTCTAGTTTTATATACCAATAGCAAGTCATTCTTTATTTAATTTAGTTTTTTGTTTGTTATAGCAATAAAGAAAAATTGTGTTTCTTTGAAATGGTATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTCTAGATTATAGTGCCCTCACGTGGCTGATGCACATCATTTACTTATGAGTGTTTTCATATGGATGAAAAAACTGAGAATTAAGCATGGGCCTTACAGCACAGCTACTAAAATTAAAAAATAATAATTATTATTATTGTTTTGACTAAAACCAGTACTAGATGCAAATGAACTTTCTTTCTAGATCAACACAACATTGTCCAGTTGTAATAGTGTTGATATTTCATTATGTGTAAGTAATGTGATCATTTATAGTAAAAACATTAGGAGTGAGAAAAGATATGAAGAGCACGTATTTCCTCTCTGGAATTTCTATAATTGTGTCCAGATTCACAATGATAAAGAGTGCCACTTTACATAATGGCAACTAAATCTTTATTATGCTTTTTATTAAATATGAAAGTCATTACTATTATCTGATACTGAATATTTTCTTAAATAGTTGTTTTGGTTTTTGTCTTTTGCTGTTTTTTAATGTCAAGGAAAGTGAAGGGCATTGGCTATACCTGCAAAGACAAAGTGGGATAGGGTGAAACCAACCCAATATTTGTAATAAACTGTGTTCTGTATGATCCAGGAAGCAATTCATTGAGCATCTATTACGCACTAGGGCCATTAAGTTGAAGGAGACTTACATATTTTAACAAATTTGATCTTCATAGCAATCCTGTTACATGATTACTTTTTCTTACTTTTATAACCAAGTCAATTGAGATTCAGGGAACTTAATAAGTAATTTTGCCTTAGTTACAAACCCCAGAAATGCCAGTGCTAACACCTGCCATCTTCTCTCATAGTTCAGGATTTTATGAGCAATTACAGTATATTATACCCTCTGTTTAGAAAGGACCTTATTATAAGACATTCCACCAGGGTAACTTTTAGAATGATGTTATAATACATTTAATTAATTACTTGAATTGTCTTGTTGAATTTTTGCCAGGGTTTACATATGTGCTGAACTTGCAGTTTTAATGTTCAGTTGAGTCTGTCGTTAAGAAAATTTAAGTTGATAAATTATTCACTGATGAACTACTTTCTTTGCATTTAATCTTTTTAATTGCTAAAGGTACCTAAATAGCCTCAAAATAGTTGATGGCTTGGCCTGAAGACAAGATCTAAATATGAGGTTGCTGAGTTATAGAAATGGCAAAAAAAAGGGTCAATAATAGAATAATAAGCAACAAAATAATAGTAAGCACTAAAGTTTTAAACTTCATGGTGGTGAAGGCATGGTAGTGCATAAAAGTAAGATTTTTCCATTGAACTTTGTCTTCCTTGACGATATTCTACTTTATTCAATATGCTCATTATGTGCACGATTCTTACCAACTGTGTATTTATGACCATGAGTAACCCTCCAGACTGGACAAAGAATGTGGAGTAAGTATAAATATTTTTCAATATTGACCTCCCTTTATGTTTCATATTGTGCTTTTAACACCTTGAGACCTCCTCAATTTCTTTAACAAATCATGCTAGCTACTGTTAACCAGACCCTGATTCAAATTCATTTCTGTCACTAAATGTCTTCTAGGACAAAGCTTGTAGTGGGCTCACTTAGTTGTGTAAATTACTGCAGTAGTTTGACTGCTATTATCTGCAGCCCTTTATCTTCTTTGTGAGTCTTATGTTCTTTTGAAGATCACCAGTGATTTACTAATATCTACTGATAAAAAGTATACCTAGTTTTTATGTTCCTTTTTTAATGACTACCACAGTTCTGTGTTACTAGTATATGTTTGATGGCTTTTAATGGTGCATATTTTATGAAATACAAATGCTTCACTCATTTTTGTATTAATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCAT
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Task1_train_4130
A genomic change on Chromosome 2 affects SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4131
The variant affects gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4132
Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4133
Assess the clinical impact of this variant on gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4134
This variant impacts the gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4135
Consider this mutation in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
GGATTTTATGAGCAATTACAGTATATTATACCCTCTGTTTAGAAAGGACCTTATTATAAGACATTCCACCAGGGTAACTTTTAGAATGATGTTATAATACATTTAATTAATTACTTGAATTGTCTTGTTGAATTTTTGCCAGGGTTTACATATGTGCTGAACTTGCAGTTTTAATGTTCAGTTGAGTCTGTCGTTAAGAAAATTTAAGTTGATAAATTATTCACTGATGAACTACTTTCTTTGCATTTAATCTTTTTAATTGCTAAAGGTACCTAAATAGCCTCAAAATAGTTGATGGCTTGGCCTGAAGACAAGATCTAAATATGAGGTTGCTGAGTTATAGAAATGGCAAAAAAAAGGGTCAATAATAGAATAATAAGCAACAAAATAATAGTAAGCACTAAAGTTTTAAACTTCATGGTGGTGAAGGCATGGTAGTGCATAAAAGTAAGATTTTTCCATTGAACTTTGTCTTCCTTGACGATATTCTACTTTATTCAATATGCTCATTATGTGCACGATTCTTACCAACTGTGTATTTATGACCATGAGTAACCCTCCAGACTGGACAAAGAATGTGGAGTAAGTATAAATATTTTTCAATATTGACCTCCCTTTATGTTTCATATTGTGCTTTTAACACCTTGAGACCTCCTCAATTTCTTTAACAAATCATGCTAGCTACTGTTAACCAGACCCTGATTCAAATTCATTTCTGTCACTAAATGTCTTCTAGGACAAAGCTTGTAGTGGGCTCACTTAGTTGTGTAAATTACTGCAGTAGTTTGACTGCTATTATCTGCAGCCCTTTATCTTCTTTGTGAGTCTTATGTTCTTTTGAAGATCACCAGTGATTTACTAATATCTACTGATAAAAAGTATACCTAGTTTTTATGTTCCTTTTTTAATGACTACCACAGTTCTGTGTTACTAGTATATGTTTGATGGCTTTTAATGGTGCATATTTTATGAAATACAAATGCTTCACTCATTTTTGTATTAATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAAC
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Task1_train_4136
Mutation context: Chromosome 2, Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; West syndrome
TACTAGTATATGTTTGATGGCTTTTAATGGTGCATATTTTATGAAATACAAATGCTTCACTCATTTTTGTATTAATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTA
TACTAGTATATGTTTGATGGCTTTTAATGGTGCATATTTTATGAAATACAAATGCTTCACTCATTTTTGTATTAATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGAGCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTA
Task1_train_4137
A genetic alteration is present in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Early infantile epileptic encephalopathy with suppression bursts
TACTAGTATATGTTTGATGGCTTTTAATGGTGCATATTTTATGAAATACAAATGCTTCACTCATTTTTGTATTAATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTA
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Task1_train_4138
Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4139
This variant affects the gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) found on Chromosome 2. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4140
This gene mutation involves SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4141
A sequence alteration has been identified in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Benign familial infantile epilepsy
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Task1_train_4142
The gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
ACAAATGCTTCACTCATTTTTGTATTAATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTT
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Task1_train_4143
A sequence alteration has been identified in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
ATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCT
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Task1_train_4144
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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ATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCATGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCT
Task1_train_4145
With a mutation on Chromosome 2 in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4146
Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Seizure
ATACCTATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCT
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Task1_train_4147
A mutation in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
ATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAAT
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Task1_train_4148
This is a variant in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
ATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAAT
ATTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTACGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAAT
Task1_train_4149
Here is a genetic alteration in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
TTTGCTCAAATCGGACTGAATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATA
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Task1_train_4150
Assess the clinical impact of this variant on gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4151
The gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Epileptic encephalopathy
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Task1_train_4152
This variant impacts the gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4153
A genomic change on Chromosome 2 affects SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Infantile spasms
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Task1_train_4154
This variant impacts the gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4155
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; SCN2A-related disorder
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Task1_train_4156
This alteration in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_4157
A genetic alteration is present in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; West syndrome
ATGCCAGTGTATTTCAGATTATGTCTTCATATAGAGCCACATTATTTGGATCCTTTAAATTAATTAATGTGGAAAATGCAATATACATTTATTTACAGTCAATGAGAATGTCTTTTGGAATTTAATGTTTCTTTTTTGACTTAAGCCCCACCTAAACTCTATATCGTAGGGGGACCAACCTGGAAGTGTCTAATTTTTGTTTGCTGTTTATGTCATCTTTAAGATATGTACTTGTAAATTAACCACTAGATTTTTAATGTGAGCTTGGCTATTTTCTCTCAGGTATACCTTTACAGGAATTTATACTTTTGAATCACTTATTAAAATACTTGCAAGGGGCTTTTGTTTAGAAGATTTCACATTTTTACGGGATCCATGGAATTGGTTGGATTTCACAGTCATTACTTTTGCGTAAGTATCTTAATACATTTTCTATCCTGGAAGAGTAAATCACTGGTGGGAGCCTATACTATATTTTCCTTGGTGGCTTGCCTTGACAGACCAAGCATTTTTCTTAGTAATCATAGTTTTCTTCCAATCAAATTATCCAGTTTGGAGAAATTAGGAACTATCATAGTAAATTACATGGCTTTGGTTTCAATTAGCACTGTAAAGTAATAAAGTTTCCCAAATAACAGAGATTATGATTGATGACAATGCCATTTTCCTCTTAATTGGGAAAGCTGATGGCGACACTCATGAAATTAAAAAGGTCTTGATGAAAGACCAAGGAAGACGTAGATTTCCCTAAATTCTGAATAACTCTGATTTAATTCTACAGGTATGTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTCTTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATTCCAGGTAAGAAGAAAATGGTATAAGGTGGTAGGCCCCTTATATCTCCAACTGTTTCTTGTGTTCTGTCATTGTGTTTGTGTGTGAACCCCCTATTACAGATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCATTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTGAGAGCTAGGTTAAACACCGAGGCTGACTTTAGCTACAGTGGTGCTACAATCACAGCTTTTGTGCAGAAGCCTTGTTGCTAGTTGCATATTGCAAATAAATATGTAAAAAAGCAAGAATTGGTACATCATTTTTTGGATGGATTTGATTCTTTGCTTTTTACTCGTTGCTTTCTTTAAAACTATTCTAAATCAGCCTTTGAGTTTAACAAGTGTTGCATGAGGCATTTGCAGTAACAGGCTACATGGTTTGCATCCTATAACATCAAGCTTTCCGCATAGAAGCTAGACTAAGAGACATTCAGACTGATGCAAATTTGACAGTTTAGGCCTAAAACTGGCAATCTTTTAAGCTGCAGATAAATGAAAGAGCAAGGGATAGCATGAGTGCTGCATGGGGCTCAGATTTCAGATGTCTTCCTTTTTTTAACCCATACTCAAGCTTGCAGAATTCACAAATATATAACCTCATAATTCATCGACTTCAAGATTTCTTACTACTCTATTCACATAGACTTTTCTAAAACCAATAAGGGGTTAGGGAGTAAGACATCTGCAAATAAAAGCAAAATATTTACACAAGGTTGATGTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACAT
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Task1_train_4158
A variant was discovered in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; not provided
GTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACG
GTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCACATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACG
Task1_train_4159
The following genetic variant occurs in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; not provided
GTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACG
GTTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCATATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACG
Task1_train_4160
Given this variant in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; not provided
TTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGG
TTTAAGCATGAATAACAAAATCATTCTTTTGCTCTAAAGAGTGTTTGGAAATACACATTTGGTTCATTTCCATTCACAGTTTTCTAATGAACATACAAGTTCTGCTTTCATTCATTTTCACCAGCTAGCAGGCTTTTCATGAAAATGTTATTCAATCACAAACATTAAACTAATATTGTTGGCATTCTGCATGACATTTTTATTTTCCAGGACAAGCTCATGATATTTTTGCCGGTAAAATAGCTGTTGAGTAGTATATTTAAATTCCCCCTTCTGATTTTGTTTGTAGGCCTGAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCTTGACTGTGTTCTGTCTAAGCGTGTTTGCGCTAATAGGATTGCAGTTGTTCATGGGCAACCTACGAAATAAATGTTTGCAATGGCCTCCAGATAATTCTTCCTTTGAAATAAATATCACTTCCTTCTTTAACAATTCATTGGATGGGAATGGTACTACTTTCAATAGGACAGTGAGCATATTTAACTGGGATGAATATATTGAGGATAAAAGTAAGATATACTCTATAAACCATTAAGTTGTTTAGTTCTCTAAATATTAAATATTATATATAATGGAAATTATCTCAATTTAGATGTGAATCAAGTGACTTAGACTAATTTAAGATGATTTAATACATATAAAAGAGATATCAAATGATACCTTATTCTATTTTTCTTATCTGTCCATTGATATAGTAAAAGTTCTCATTTGAAAATGTGTTGTCTTATACTCATGTTGAAAGTAATTTCATATTATGCCATATTAAAAAATGTTTATTTGGTAGACATTAATCAGGTTTTTCAGTCATTTTAATAAATAAGTCAGTAGTTTGAACTATTCAGTGTATTCCACTGAAATGTGTTAAGAAGACTGAGGGGAAATAATTTGGCCCTATTTGGTTGATGCAACATATGTATTGAGTACATATGCTATATCTGAAAATAGAGAAACCATTTATCAAGATGAAATAAGAATTTGTGTGCTCCTCAGAAGGTTAAGTAACCCTGATTTAGCCATTCACTTATTCATATTCTAATTAGTCCCTTTAGTGTCATCATTGTATTGTAGTTACCAGTTTAGTTTGATTATATTTAAGGTATGAACATCAGAATAAGCTTATGCCATATACTTCAGCATGATTTCTTAACATTGAGCCCAGCCCCTCTGTCATTTTTCATATGTGTGTGCATGTTTGTATGTGAATATAAAAATACGTATGTTTGCATGTGTGTGCATGTTTTCTGAGATCATCTTTGCAACTTACTGAAGTTATATGTCATGCCTTAAAAATAAAAACTAGATAGCTCTCCATAGCTTAAAAATAAAAACTAGATATACTCAGACAACATATCTCTCCAAAGAAACAAGTTTATTTTCTTCATTTGAAAGGCAGAAATCAAGCAAAAATTTCAAACAAAACACTTATTTACAGTATCATAAGAGGGAATAAATACCTAATCCCACTTCTCACAGGAAATTAAGTTAAAATTGGCGGGAAAAAATGTCTGAATCTATTTTGAGCCTGGGGAGAAAAGTATATGTAAGGTAAAATTTATTTGCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGTTGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGG
Task1_train_4161
A variant has been detected on Chromosome 2 in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Complex neurodevelopmental disorder
GCATGAAAACACCTAGAAACAACAAGGCTTTCTTCTTTCTTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGA
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Task1_train_4162
An alteration has been detected in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
TTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATG
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Task1_train_4163
Located on Chromosome 2, this mutation impacts SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
TTACTTTTTGTGCCCAGCAATAGACTGGCAGCTCTTTCTTAATGTATCCCATGCAATTTGAGCTTATATTTGCAATGAATGCTGATATAAGAATGTTATCATAGTAATTCCTTCTGAACATTTTTCTTTTTAACATAGATTTGCTAACCATTTGTATAATCAAAAATGTTATATATTGATATTTGTTCAATATTGTGAAAAATCTCTTTAGCCATATATATTTATTAGTTTATCCATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATG
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Task1_train_4164
The gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), on Chromosome 2, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4165
Located on Chromosome 2, this mutation impacts SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
ATCTCATTATGATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAAT
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Task1_train_4166
Mutation context: Chromosome 2, Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Early infantile epileptic encephalopathy with suppression bursts
ATTGAAAACATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAAT
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Task1_train_4167
Chromosome 2 houses a mutation in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; West syndrome
CATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACA
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Task1_train_4168
Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Early infantile epileptic encephalopathy with suppression bursts
CATTTGTGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACA
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Task1_train_4169
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
TGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGA
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Task1_train_4170
This mutation is located in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
TGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGA
TGAGCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTTTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGA
Task1_train_4171
A variant was discovered in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
GCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGAATT
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Task1_train_4172
Here is a variant affecting SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
GCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGAATT
GCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGATGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGAATT
Task1_train_4173
A genomic change on Chromosome 2 affects SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
GCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGAATT
GCTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGATGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGAATT
Task1_train_4174
A variant has been detected on Chromosome 2 in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
CTTTGCCACCTAAACAGGGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGAATTA
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Task1_train_4175
A mutation found in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; West syndrome
GGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGAATTATCAGCAGATGGTTCCCA
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Task1_train_4176
This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Early infantile epileptic encephalopathy with suppression bursts
GGTGGCTGAAGTGTTTTACAGGATTTTAATGATTCTTTCTATTCCTTTCTCTTTAAATAGGTCACTTTTATTTTTTAGAGGGGCAAAATGATGCTCTGCTTTGTGGCAACAGCTCAGATGCAGGGTAAGTGATGCTTCCTACTGAGTTTCAGTCCACACTGCTCCATCAGTGTCAATAACCTGCCACCTCCCACTCATCCAGTCCCACTCACTCCTCACTCAAAACCCTCCATAAATTCTACTTCACGGTGACTCTCAGAATAGCCAGGATAAGTGTAGATTCTCACCTCTTTCACACAGTCATTTACTGCAATTATTTTTCTATGCTAGGTCACATCTAATCTTCCAAATTAGTTCAATGTAAAATAGAGAATAAAGCAGTATAATATGCATCTGAAGCTTAATAGAATTCTTAAGCACATACTTTTTATAAGTGTCATATTTTATATATACTAATGTGTTCTCCATAGCTTAAAATGTAAGATCTCTGAAAATAATGTTAATATCTGAGACATGGGGAGTATTTAGCATATTTTAGCAAAGTGGTTACAAACATAAACTGGAGAGTCTGCATAGAGTCAGACTTTGACTCCATCATATAATCTCATTTCTTCTTGCCTTCGTTTCCTTATATGACAAATGGGTATAATAATAGGGTTTTTGTGATGATGAAGTGGATTAATAAATGTATAGCTATTTAGATCGCTCAATAAGTGCTTGTAATTGTTATTATTGGGATCATGCAAATGTTTGCTATTAAGAAACATGGAGCTAAATCCTAGGAAAATTTAAAAACACAGTTAATTTTCTTTATTTAGCAAGATTTTAGAGCCACACACAAAAGTCTAATGCACTTTCTTTGGACGATGATACTGTGGACATTAGTAGCTAATACCTGTAGCAAAATTCCCAGTGATAATAGGCTTTCCATTTGGCTCCTACGATCAGTGCTATGCTGCCTTTATCTTCAGATTCCAATGATAAGTAAATCAATTGATTTTCATTCCTTGTTTGTACTGTACTAAATGCGTTACATACAGTATCTTCTTCAATGTTTGCAAATTTGTGAGACAGGTTCTCTTATTAGCCCATTCTCACATGCGAGGTGCCTGAAGATTAGCAAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCGTTCAGCTCAGAAGTGTCAGGCAAGACATTGAAGCCAGGTCTGCTTGATCTTCAAGGTCCTCCTATGACATTTTTACCACACAGTGTCATTCACTCCTTGCAGCATGCCCCACCTATCCTTTTCTCACTTCTTTACCCTGTTCCCACACTTACACACATTTCTGCCTCAAGACATCCTCAGTGAAAATCAACTTTTTCCTTACAGACTTTTTTAACTGCCCTTAAGTCCCAGAAGATATTAATCATGATATGATTGCTTTTATATGGAGACATAATAAATATAATAATGACAATTATGAATCACAGAGGAATCCACAAAGTAGACCTTATAGATTCTGTTATTATATAAATCAGTCCACTTAGTGCTGAGTTAAGTACTGGGTAAGGTGAGAGAAATCGGCTTTTTTCTAGTGCCTGTATAAAACAGACATTGGCATATATTAAAACAGGAAAACCAATTAGCAGACTTGCCGTTATTGACTTCCTTTCTTTCCTCTAACCTAATTATAGCCAGTGTCCTGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTAGAAACCCCAACTATGGCTACACGAGCTTTGACACCTTTAGTTGGGCCTTTTTGTCCTTATTTCGTCTCATGACTCAAGACTTCTGGGAAAACCTTTATCAACTGGTGAGAACAGATAAAATCATTTTTCTGAGAATCATAAAACACCGAACTCAAGAGAATTGCTGTAGAATATTTTATTACTTAGAGTGTAAGTTTGTAACATCCTATATAAAATTTATTAAAATCTCTCTTCCATTTTGCAGACACTACGTGCTGCTGGGAAAACGTACATGATATTTTTTGTGCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTCTATCTAATAAATTTGATCTTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAACAGAATCAGGCCACATTGGAAGAGGCTGAACAGAAGGAAGCTGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGTTGAAAAAGCAACAAGAAGAAGCTCAGGTATAGTGAACAAGCATACGGTCCTTTGTTTTTCTTTATCTAAATTCTTTAACCTAAATGTTGAGGTCAGTGGCAAGGTAGTTGACATTAGAAATAGGTCATATGTGTTTGGTAAGTGCTAGGAGCCTGTTTGGTTATTAAGAAGTTATTACTTTATTGCAATGATCTCTGTCAATAGTGTCAATAGTAATGGCATCAAAAAATGGATAATTATAATTGCTTTACTGACATTTTTTTCTCCCTTGTGACTCCTTGAGGAAATTAATGATTAACAAAGGCCTCATGTACTCAAACTTGCAGAGTAGATAAACCTACATGTCCTCAGTTGAAGTATTTTCTTAGGGGAAGAGGAATTCAGTTACACTTGCTTCTTCATTGCAGTATCACCAGAGGTGGTAAGGGTCAGAAAACCAGAATCAAACTAAGAAAATTATTTCATTGAGTCTGGAAAGGCAAAGGCTTATTCAATATTTGTTCTCTTTTATATAAAGTGTACAAATGCAAGTTTGTGGGTTACATCAGTAAATCACTAGTGTGTAAACATATTAAAACATTAGCACTCTCTGCCTCCTACTCTACAAATCCTTTAATTTGGACTTGACAAGCCTTCAAAATAAGGCAAGAATTTCTCTAATTATATTTGCTTGACTTAATGGCATTAACTAATCCAATTGCCTATTTTTGTCTTTTCATGTATGGTGAATACAATTCCCTTTTATTACCGAGTATTCCTAAATATGTAATAAAGGTCAAAGTATATTGCTGTAATAGCAACAAAACTACTGTTATACTTTACAAGTTCATGCAGATGCCATGATCTAGGATTCTCAAATAAACACTCTGTATTATGTCTTTGCTGTGCATTTCTTAGTGAAATACCCAATTTAAATCACGGAGAAAAATGTCATTAAAATAAAATACTTGACTGAATTACATTTAATAATTCAGACTAGCACTAAATTTCTTTATTGTGTGAAAATGGAATCAAAGGCAAATGTCTACCAGGTTTAAATAGGAAGTCTTTAATTCCCATATTATTTCCTTCTTAAAATATTGTTTGAATTATAGAACATGTTATTATGATCTTTAAGTGTCTTGCTCATATTATTAGATAATTAGATATCATAGTGTGAGGACAGAGCTTGAAGGTTCTCATAAAAGTCGTATGTATCATCTTCCATATGAATGCCCATTTTACTCTTTGATTGGTCTAATAACAATGTACTGTTTTCTAAAACACAGAATAAAATGGAGAATTGTTTTTCAAGATTATCTTCATGATATTGAAGCTCAATTAAGCAGTAACATGATAATTACTTTTTAAGTTTATATGCAACTTCCACATACTTTGCGCCCTTCTAGGCGGCAGCTGCAGCCGCATCTGCTGAATCAAGAGACTTCAGTGGTGCTGGTGGGATAGGAGTTTTTTCAGAGAGTTCTTCAGTAGCATCTAAGTTGAGCTCCAAAAGTGAAAAAGAGCTGAAAAACAGAAGAAAGAAAAAGAAACAGAAAGAACAGTCTGGAGAAGAAGAGAAAAATGACAGAGTCCGAAAATCGGAATCTGAAGACAGCATAAGAAGAAAAGGTTTCCGTTTTTCCTTGGAAGGAAGTAGGCTGACATATGAAAAGAGATTTTCTTCTCCACACCAGGTAAAAATATTAAATTACATGAATTGTGTTCTCATAAATTTTTTAAAAAAATATGCCAGAATTTAATGGAGAGAAAACCGCCTTCCACCTGGATGGCACAATGCTTTCAGAGTAGTGATGATTATCAAGTGTTTTGGCTATCACTTCAGAGAATTTGTGAGTTTTGCAACTTTTTGGAATCCCAGGAAGGAAATTTTAGATCCCTCTGGGTTTGGAAAAATTTGCGGTTTTGAGGTTTTCTTAAAGACTGAAAAATCTTGGAGAAATTTTCCACATCAGGAATTATCAGCAGATGGTTCCCA
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Task1_train_4177
Given a variant located on Chromosome 2 and affecting SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_4178
Here is a mutation in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Benign familial infantile epilepsy
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Task1_train_4179
The gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), on Chromosome 2, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4180
Located on Chromosome 2, this mutation impacts SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4181
The following genetic variant occurs in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Benign familial infantile epilepsy
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Task1_train_4182
Consider this mutation in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Self-limited epilepsy with centrotemporal spikes
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Task1_train_4183
This is a variant in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4184
Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
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Task1_train_4185
This variant affects gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4186
Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4187
The variant affects gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
CTTCTAAAACAAATTGGATTGCCATACCACCAAATGGTAGTTTCTTCTTCATCATAGCTTTAATAAAGTTCACTTAAATGAATAGTCTACACTTCTCTTCTTAGTTATTGAATGGAAGGCTAATAGAGAGGAGGAAACAGGGAGTCACAGATAAACTCGAATCACAATTAAACAACACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTA
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Task1_train_4188
This is a variant in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_4189
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_4190
This variant impacts the gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
ACACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTAATATCCAGAATCTACAAAAAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAACACAACCCTATCAAAAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACATATGAATAAAAGCTCAT
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Task1_train_4191
Chromosome 2 houses a mutation in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
ACACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTAATATCCAGAATCTACAAAAAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAACACAACCCTATCAAAAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACATATGAATAAAAGCTCAT
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Task1_train_4192
This gene mutation involves SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
ACACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTAATATCCAGAATCTACAAAAAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAACACAACCCTATCAAAAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACATATGAATAAAAGCTCAT
ACACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCTGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTAATATCCAGAATCTACAAAAAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAACACAACCCTATCAAAAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACATATGAATAAAAGCTCAT
Task1_train_4193
With a mutation on Chromosome 2 in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
CACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTAATATCCAGAATCTACAAAAAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAACACAACCCTATCAAAAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACATATGAATAAAAGCTCATC
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Task1_train_4194
A sequence alteration has been identified in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
CACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTAATATCCAGAATCTACAAAAAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAACACAACCCTATCAAAAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACATATGAATAAAAGCTCATC
CACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCCACGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTAATATCCAGAATCTACAAAAAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAACACAACCCTATCAAAAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACATATGAATAAAAGCTCATC
Task1_train_4195
A variant was discovered in gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Episodic ataxia, type 9
CACCATAGTCAACTCTCAGTTATCTGAGGTTTGCATAACTGCGTACAAAGCTTCCTTGGGACCTAGGATGAGCTCCCCTTTCTGCCAGGAACTAAAGAATTATGGAATTGTTCATTGCTCACCTTGTCCCCGTAGAGGAAAGAGTTAAGACAGGGGATAGTGTACAAAGGAGAAGGATAAGCAAACAGAGCTCCCCATATGACTGCTGCCACATCAGAAAATCACCAAATCACTCTTTGAAAGAGTTAACTGTACTATATTTTGTTAATTTTAAAGAAAGTATCTTTCTTTGATCTTTTATAAAAACTATTAGATCTTAAAATTCAGAGATAAAATATCACTTGACACATTTCCAGTGAAAGTTTGATATGTTTTGTTATACTATTACTTTGAGTTGGCTCTAAGTTAGTGATTTATTTTCAAATAACAGAGGCTGTACACGGTTACTAAGGACACGTTCCTATAGATGATTTACCTTAGTAGTGATTAGGCTGAAGACTTTTTCATGAAATCTGTTTACAATTTCCCTTTCTGCTTTCAATGTTCAAATTTGAGTTGTAATCCTTAGAACTATATTTCCTTCCCTAATCCTCAAAGATAGTTATGAATCTAATTTGAATCTAGAAGGATGCAAAAAACAGAACAAAAATTTAAAATGATAAAACAAGTAATATGGGCAAGAACTTAAAAAAATATATTTAGTAAACCTTCATGATAGTGTGATGCAGTTAAGGGAAATAGGAAGCATAGTATCACTAGAATCTTACTTAGTGTGTCAGGCTCTTTTGCATAAATTATTCTCTGGAATAAATTAAATACTTTGGTGCATGTATTTACTCCTTTGGGTCACTTTGATGCCATTAAATAATGCACTACTTTCAGCCTGACATTTACTGAAGCATCAGAAATAAAATGCTGCTGCTCTTTAACCATAAATGGTACTTCAGTGAACTCTAAAGCTAATACAACCAATATGTCAAACACAATGAGAAAGACATTTACACACTACACTGAATTAAGTCTATGAAGATATAAAGGTTAAAAAGAAGCCTAGCGTTTTACTTAAGTTTAAGTATTTTTGTATTTGAATATAATATATGTTTAAAATATAGCCTAAAGTTACAGCAAGCTAAAGATATAGCTAGATTAAAACAATCTAAAGACAAAGAAATTAGTTCATTTCTGCTTCCACTTTATGTAATTTAAGTGTTGATATTATTCTCACCTGTGCATTTCAGCATATTTAAAGTACACTGAAAACTATATCTGCTTTGGCCTTTTAAAAATAATGAGAGTTCCTACTTCTCTGAAACTGGATCTCTGCTAATTAACCACCATTAATCTGAAATATCTTAATTCCTTAAGGAGAAACAAAAGTGTATATTACATATGCTTATGTAGGATACTTGAAAATTTGGTGTATCTTATTAAACTGCCAATTTAAAAACTGTATAATTTAATTATTTCATTTACAGTATGGACCATTTCAAAATGAAAAAAAGAATGCTCTATGGTAGCAAGTCACTGCTATATTTGTTAGTGATCATTTGACAAATAAATAATTCATCATTCTATAATTGAGACAGTTACCTGTACATTTGCCCTGTTAATAAAATTACAGATTTTTCCCTTCCTGTGTCCATGTGACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAATAAAATTGCAGATTTTTTTAGAAATGCAGAGCATTAACACTGTTCTTGCTTTTATTTCCAGCTCCGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCTTGGCCAACTCTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTATTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATTTCCAATGATTGTGAACTCCCACGCTGGCACATGCATGACTTTTTCCACTCCTTCCTGATCGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTACTGTCTTCATGATGGTCATGGTGATTGGAAATCTAGTGGTATGTAGCAAAAACATTTTCCTCATTTTCATTAAAAGATAATGTAATCATTAAAAAGTGTGTTCAACTGAAGAATATTTTGTATTTTTTAAATCAAGGCCACTTCCTATTGTCTATTACTCATGACTGTAAGAGCCATGTATAGTTTAGACCATTGTAATCCACACAAACCCTTAAACTACCTTTTGAACCAAAGTTATTCTTTCTTTCATTATCCTTCTTGCTACAAGGAGAGAAACTTTTCTGTTATTTATCTTTCAGTTCTTGTACTAGAGCATGGAAGTGTTACTTAGAACACTCATTTTATTTATAAGTACTAGCAATAACACCTGAAAACGTTTCAGATTTGGTTTTCTACAAATTTAAAAACTAGCAACAATCTCAGTTTATTAAGAGCTCATGGGGTTTTCGGTGCCTAGAAACTATGGTATGAGCAAGTAACATTGTCTCTAAAAACATTAATTGTCATTTCTGCATAAAATTAACCACCCCTAACACCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTGTTGCATTGATCCCTTTTACCATTATGTAGTGTCTTTCTTTGTCTTTTTTTAATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAAAGACTAGGATTGCAAACCCTGCTTTTTTTTTTTCTTTCCATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCGTTTTTTTTGTGCCTATGTGTGTCTTTGCATGTGAGATGGGTCACAGCACACCGATGGGTCTTGACTCTATCCAATTTGCCAGTCTGTGTCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGACCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGCTATTTTGCTCATTAGCTGCTGCGGTTTTTTCATAATGTTGATGGTCTTAACAATTTGGTATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACTGGTTTTTCCTTGCCATATTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGTCAGGCCTGGTGGTGGCAAAATCTCTTGGCATTTGCTTGTCTGTAAATGATTTTATTTCTCCTTTGCTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAATAATGTTTAATATTGGCTCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCCGAGAGATCTGCTGTTAGTCTGGTGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCATTAACATTTTTTCCTTCATTTCTACCTTGGTGTATCTGACAATTATGTGTCTTGGGGTTGCTTTTCTCAAGGAGCTTCTTTGTGGTGTTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGTTATCCTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCAGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACTTAGGGTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGACTTTGTTCGTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTTATCTTCATGCTTTACAAATTTAACTCAACATGGATTAAAGACTTAAATGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCTTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATTGGCATGGGCAAAGACTTCATGACTGAAACACCAAAAGCAATGGTAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTAATATCCAGAATCTACAAAAAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAACACAACCCTATCAAAAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACATATGAATAAAAGCTCATC
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Task1_train_4196
The following genetic variant occurs in SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Seizures, benign familial infantile, 3
AAAAATTTTACATGCAATTTTTTCTTCCTTTGTCTGTTTTTTTAATCCAAATAATAAGTTCAAAAGCAAATTACAATAAAACATAATTTTATTGGTAAATTCCAGAGGCAAAGGAGCAGGTCTGGTCTTAATGTGATTATCAGGAGTCATAGTATAGAGACTGACAGATTGTCAGTACACTCTCAAAATCAAACGTGGTCTTCATTGGATCTTACATATTTTTACTTTAAAAAAAATCACCATTGGTTAGACTAACTTACAACTAATTAGACAAAGGTGCTGTAAGCCTCATTAGCATGATAGAAGCATGAGAATATAGCAAGAATGTAGAATCCTTTTTATTGAAGTTTTACTTAAAAATTTTCCTAAGATTCTACTTTTGTACTACAGTTTGAGCATCCCTAATCTGAAAATTTGAAATCCAAAATGCTCGGAAGTTCAAAGCTTTTGAGCACCAACCTGATACTACAAGAGGAAAATTCACATCTGGCCTCCTGTAATGAATCGCAGTTAAACCACAGTCAAAATGTTGTTTCCTGAACTAAATTATTAAAAATATTGTATAATATTACCTTCAGGCTATGTGTATGTGTATGAAACTTAAATGAATTTTATGTTTACACATGTGTCTCATTCTCAAGACTTGTCATTATGTACATGCAAATATTTTAAAATCTAAAATCCAAAACACTTCTGGCCCCAAGCATTTCAAATAAGGGATATGCAACTTGTATTTACTTTGTGCATTTGCCCCCCTTTACTGCTATATCTTTCTTTTGTTCTGTATGTTATGTGTGCTTAAATAATCAGGAATTCATTGATATTGTCAATCAAATCCTGAAAAAAAATTATATGACTCAGTCTTGTACCCCTGAGAATGTCTGATTTCTTCGTAAGTTGTCTTTTTTTTTTTTTCCACAATAGTGAGTTTAATGTCATGAATCTTTTCACTCATTCATACTGGTGGAGCCTATTTTTAAAGACCCAATTTGCAGACTGATTACTGTCCTTATTCATGGCAATACTTCAACTCCACAATCTTTAATTCAACAATAACATCATAATTATTGTATAATAACCATTTTATAGTATTTCTCACTATTGTATAATTATAGTAGCCATAATTGTCTTAATAAAAATTGGGACTTTTCATCCAGCAATAAATACGTTTTTGTCTGATTTGTCCAGTTATCTAGGTACAAAAAATGGTACAAAGGCACAAAAATAAAATCATATTTAAATATATTGGGATAATTGTTGATTTTAGGAATAAATTATCAGTGTTTCCGGAAATCCAAATTACATAGTCAAAATAGCATCTGTATTAGGCCATTCTTGCATTGTTACAGATAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGATTTAATTAGCTCATGGTTCTGCAGTGAGCTTGGTGCTGGCATCTGCTTGGCTTCTGGTGAAGTCTCAAAGAGCTTTCAATCATGGCAGAAGGCAAAGTGGAGCAAGCATTTCACATGATGAAAGCAGGAACAAGCAAGAGAGAATGTGGGCAGGAGGCACTACAAACTTTTAAATAACAACATCTCATGAGAACTCACTAACATGAGGACAGCACCAAGGCATGAGGGATCTGACCCCATCATCCAAACACCTACCACCAGGCCCCACGTCTAGTGCTGGGGATTACAATTCCACATGAGACTTGGGAGGGGGCAAATGTCCAAAATATATCAGCATCCCAAATAAAAGGGTTTTTTTTGTACAGTTGTCTATATTTATCTTTTGGAACTGAGCTTAATAGAAATGTTTCATTTAGCAATGATTTCAGTATTTTCTGCAATGACTAAAAAGCAAATAGTGATAATAGTATTATTTTATATTGACCAAGCATTTTTATTTCATTCACTTTTTTTCAGAATAGTGTATCATGAATTAGCAGAAATGCATGTTAGAATAAAATAAGGTGTCAAGAACAATCTTAGAAAACTAATGATGGAAAGCAATTGAAGCAATAGAATGTTTTGATCACCTGTTTTTCCTGCTGTGTTTCAGGTTCTGAACCTCTTCTTGGCCTTGCTTTTGAGTTCCTTCAGTTCTGACAATCTTGCTGCCACTGATGATGATAACGAAATGAATAATCTCCAGATTGCTGTGGGAAGGATGCAGAAAGGAATCGATTTTGTTAAAAGAAAAATACGTGAATTTATTCAGAAAGCCTTTGTTAGGAAGCAGAAAGCTTTAGATGAAATTAAACCGCTTGAAGATCTAAATAATAAAAAAGACAGCTGTATTTCCAACCATACCACCATAGAAATAGGCAAAGACCTCAATTATCTCAAAGACGGAAATGGAACTACTAGTGGCATAGGCAGCAGTGTAGAAAAATATGTCGTGGATGAAAGTGATTACATGTCATTTATAAACAACCCTAGCCTCACTGTGACAGTACCAATTGCTGTTGGAGAATCTGACTTTGAAAATTTAAATACTGAAGAATTCAGCAGCGAGTCAGATATGGAGGAAAGCAAAGAGGTAAAAATGTTTAAATAAGGAGATATTTTGGTGTTATATAATTCTGTTGTTTAAAATTATCAGGTGTTTTTAAATTGCGTGTTTCCTTCCTGTTAAGAAAATAGAAAATATCTGTCTAGCAATATATTTTCCATGGAAAAGTTGGTAATAAATAAATTAATGATAGATTAAAATATAGCTAGATTAACAATATGCTGACTTATGTTTCCAATACTGACATTTTGAATTCTTGACAGTATTCTTGATATGAATTTTTTCAGTATTTATAAATAATTTTAAATTTCTCAAAATGCCTCAATTTCTCCACTTTCTTCCTTGTAATTTGCCCACAACAGTGTTTTTTGTACGTACTGGAAAAATATCTGATGAGAGGGTAGTTGCAATTCTCATCTTGCTATGTTCTTAGTTCTTAATTCTTACGAAATACGTCATAAAATAGTATTGTATTTTGTTTGCACAGACATATTTACTCAAGGAAGATCTGATTGGGATCTTGGCTTGATATTTATGTATAGTTTATCTTTCCTGAAGTCAGTCAGTTTTTTTGAAGAGAAGGTATTGATGAGGAATCACACTAAAAACATATTTAACCCTACTGAGCTCAGTGTTCACTGTTTAAAGAAACAAAAATCCTTAATACATTATAGAATGTAAAATTCTGAATTTACCAACTCAGTAAGTCCTGGTAACTTAATGTATTCTTTGATTTACAAGAAGGGTATGAGCAACAGAATATATTTTTTGTTTTGTTTGCTATTAACCTGTTGCTCAATAAGTACAGAGTTGGAGGTAAAGAGAGGAATTTAAAACCTTGATATTTAATTGTTTATACAAAAATGAAGACAAGATTTCCAGTAATTAAAGTTTGCACTAACTAACAAAAATAACAAGGAAAAACAAAGATTCGTTCCTTCCTCATACGAACTGTTTGGCGAGGAAGATAAAAGCTTCTATTCCTGATGTCGGGAAAGAAAGAATGACGACATGGGGGAGTGTGGGCACTGAAAGGTAAAATTTAAGTAGCACAACATGATCATGATAATTAACAATCAGCCAAAATTATGAGGGAAAATATAGTTATAAAAAAAGAACAAAGATGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCGTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAGAGATTCAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCACCCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGATGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAACTAGCTATTTCAGACACTTTTTCTGTATTTATTTGATAAAATTACTAAAGAGTATGTTATTTTCCATTTTTTCTTGTTTGTAAGTTACGTAGTATTGCTGTTAGTGATTAGGTAGAAGTAGATGTTTAATGGGAAATTCAGACAATCTTTGAATATAGGAAGGTATAAATAACAGGGACATAGGTATCAGTTTCACAAGAAATAACTGATGAGATTCAAGGGAAAAGTAAT
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Task1_train_4197
This gene mutation involves SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 11
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Task1_train_4198
Gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Early infantile epileptic encephalopathy with suppression bursts
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Task1_train_4199
This variant affects gene SCN2A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 2) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; not provided
CCTTTTTAGATTTAAGAAAACTATTATGATAGTATATGAAACTGATCAACACTTTGCCTTAAATCAAATATGCTTATTGCTCATCTATTTCATTATGAAAGATACAAATATAAATAAGTCATTTTTCTAGTCCTGCAGTAGCTTACAGTTGAAAAGTGAGGACAGCTGCGTACACAGTAAGTCGACACCTGTATTACAAGTGCCACCTCTTTACTTGAGGAAGGAGGAAAGGCTTCAATAGGGAAGTGGAGTGTGAGCTGGAGCTTGAGAGATGTGAATGCTAGCAGGCACAGCTGAGGGAGGAACACGGATTCGTTAAAACGTTGGTGCATGACATGCAGGGCGGGTTCCAGAAACAAGTAGATAGGGTGAGGTAAGCCTTTGTAATGGGATGATAAGGTAAGAAAGATAAGTTAGAAAAGATCTGAAGAACCTGAGATGCCATCCAAGGAAATTTGGACTTATTATTTAATACAGAGGAAGCTATTGAAGAATTACATATAGGGAAGTGACAAGACCTGCTTGTTCTTTTAGTGAGGGAAGTTAGGTGGAGGTGAGAATGACGGAATAGAAAGGAGATTTATTTAGAGATCAAAACACCAATTAGGAGATTGCTGCAATGTCCCAGAAAGAGAAGGCCTATATGTATCTTCTTTTCCACATTTAGCTACACAAGTCACATAAAACTGAATATTTTACAACTTCTTTTCAGCCAGTAAATACTACCCCATTCAAAATATTTTCCTCTGTCTAACTTTTATCTTTCATCCTTTAACTTATGCTTATCTCTTTTTGGTTCTGTCTTCAGAGAAGGTAAAGTACTACAGGTCCTTATATCTTAAATACAGAAAAGCTTCACAACTCATGATAATTCAGTAACTATTTTTCAATTATCTGTTAAAAAGGGACTTACAAAGCCTAAGAGTTTGGATTTTAAGGGAACTATATGAACTATGTAAGACATAATTTTACAACTCATTGTTTTCTGTATTCAAGAGGCTTCACTTTCAAATTGCATGTGCAAAATTATTTTGAATAAGTTGTTTTTTGTAACAACTTTCAATGTGCTTCACTTATTTTCCTTAAAAAATATATTTTTCAAATATATTAACACCATACTCTTAAAAGCTGTATTGCATATTTATTTTTATTTATCTGCTTTTGAAATTCAGGTGTACTTTAGAACAAAATAGCTTATATAATTTTAATAATTTTTCTATATGTTTTCAAGGAAATTGGACATGTGTATGTCCCCCGACCGTTTTTCTTTTTCTTTTTAGCTAAGACTTTATAATTTTTCTCAACTACATTAGTCAACTGTATGAATAACTAAAGACAACATTGTTCTTGCAATTTCTAATTTATCATAAAATCTCAACTTTTTTTATTCACTAATTTTGTCTGACCTAATTAATGATATTATGCCCTTCAAACTGAAATTTACAAAAGTCAAAGCTGCTTTTTAGAGGCCTATTCCTTTTTAAATGTGTTCATGCTCATATTCACCAGTGGTTTGTATAGTTTACTTGTGTATCAAATGTTACTTTCCATTTCAGATCTGCTCAATATTATTAGAAATGATACAGAAATAAGTTTTACAGATCTGTAGAGGAAGATCACATTTCTCTCTCTTTTTTTTCTTTACTTTTAATTTTTTAAAAACATTTCCTACCAAGAATCTTGAAAAAGAGCACATATATGGGCTTCTTTTTTATAAGTGTTCGCAGACTAGTATCATTAACTTCACCCTGGGAACCTGTAGAAATGCAAATTCTTAGGCCTTTCCCCAAACTTACTAAGTCAGACTCTGCTATTGGTGTTTTTAACAAGACCCCTGGGTGATTTTGAAACTCATGAAAGTTCGAGAATTACTGATTCATTGCATAGAGCAAGGCTGAACTGTGTAGACATTTTTATATGTAAATAAGAAAATTGTGTTGCTTTTTCTGTATAGGTCTCACTGGTTAGCTTAACTGCAAATGCCTTGGGTTACTCAGAACTTGGTGCCATCAAATCCCTCAGAACACTAAGAGCTCTGAGGCCACTGAGAGCTTTGTCCCGGTTTGAAGGAATGAGGGTAAGACTGAATGCCTTAGAGTTTGTCAGAATTATTATTGAGAGCAGACTGACACTTTGTACCATGGAAATGTCAAATTTATGGAGAATTTGTGTCTTACACATTCATACTGACATAGCTAATCAATCAAAAATAATATTTACCAGATGCCCATAATACTTGGCACTGCTGGAGTCACTCACAGAGTAGTATATTGCCAGAGGGATTGTTTCTGATTAGCTAGATTTTCACTTCTTGGAAAATCTCTATAGTTATGCTGCTGATTTGAATCAAGATTATTTATGTTCACTTCATTTATAAATGTGCAGGAAATCCTACTCGCTGTAGTTTAAGCCTACCAAATCATTGCTCATCATTTCTTCACTACTCCGCTGTGATACACTTTGAGCCTTTTGATGTTTGAATCAGGCCTTTTAGTTCTTAAACACAGGCTGAAATGGCTAAAAAGTAGGTCAACTGGAAATCTAACGCTCATTTAGAAGGGTGGTACAAAAGAACAGAGGAGTTTGTGCTGACATTTGTCGTCCCCTGAGGCACAAAACCTGAGACCACATACCCTCACCACCTAGAAAATGATGATGCCTTGTCTCAGTTGTTTTAGCTGGTTCAAAGAGGATTTTAAAAAAATGATACTTTTTGTGATATTTGAAAATAAGTTGCTTAGACTTTATCTGCATGTTATAGTGATACTAGCTCATATTTTCTAACTAAGAAAATAGTTACTTAGACTTTATCTAGTGTTACAATCACAACTAGAGATGAATGGTGTGTGTAGATGTGTGTCTGTATATGCATGGTTACATAGAAAAGTGTTATTAGCGGTAAAATTCTTTTTACTTTACCAATTAGAAAGAACAGTTTTTGCAGTAGAAGGCTTAATAAACAAAAGGTATCAATCTTTCAGTACCAGAATACTGTTTATATTTTCTGTGTGGAATTTGATCCCCAAGTGGTCTCTTTTACTCTCAAATTTTGGACAGCAAATTGTATGGTTTGTATGATTTTTTGAAAGTGATGTTCACTTCTATATTCATGCCACTGTTTATACTCTTAATTATTTTTGGCATTTGCTGTTAGTTCCATCCTTTGAGGTAAATTTGCTACATGTGTGTTATTACCTCTTGAGAAAACATTCTCCAATATAAAATTCGTTGTATACTCTTCTGATTTATAATTTTAAAATTCTTAGTTGGAGCTACCAGAGTCTAGTTTCTACCCAATATTCAACTTTGAAACAGATTTTTTTAATCATTTGACTGTTCTTTTAATAATGTTTAAAAATAAGTAAATATTTGTTGTTGGCTTTTCACTTATTTTTCCTTCTCATCCTGTGCCAGGTTGTTGTAAATGCTCTTTTAGGAGCCATTCCATCTATCATGAATGTACTTCTGGTTTGTCTGATCTTTTGGCTAATATTCAGTATCATGGGAGTGAATCTCTTTGCTGGCAAGTTTTACCATTGTATTAATTACACCACTGGAGAGATGTTTGATGTAAGCGTGGTCAACAACTACAGTGAGTGCAAAGCTCTCATTGAGAGCAATCAAACTGCCAGGTGGAAAAATGTGAAAGTAAACTTTGATAACGTAGGACTTGGATATCTGTCTCTACTTCAAGTAGTAAGTAATCACTTTATTATTTTCCATGATGTGTAATTAAAATGAGTCTAAAGTTTTTCTTCCTCATAATGAGATATCCACCTGTTAGAATGGCTATTATCAAACAGATAAATGACAATAAATGCTGGCAAGAATGTGAAGAAAAGGGAACCCTTGTACATTGTTGGCAGGGATGTAAATTAGTATAGCTTTTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTCAAAAAACTAAAAATAGAACCACTATGTGATCCAACAATTCCATTACTGGGTATATATACAAAGGAAATTAAATCAACATGTCAAAGAGATGTCTGCACTCTCACACTCACTGCAGCACTATTCACAATAGCCAAAATATGGAAACAACCTAATTGTCCATCAACAGATATGTGGATAAAGAA
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