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Task1_train_3400
A variant has been detected on Chromosome 2 in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Primary congenital glaucoma
CGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAG
CGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTTGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAG
Task1_train_3401
This is a variant in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Congenital glaucoma
TGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACC
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Task1_train_3402
Here is a mutation in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
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Task1_train_3403
The gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Glaucoma 3A
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Task1_train_3404
Located on Chromosome 2, this mutation impacts CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Glaucoma 3, primary infantile, B
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Task1_train_3405
A variant on Chromosome 2 in gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Primary congenital glaucoma
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Task1_train_3406
Here is a variant affecting CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Congenital glaucoma
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
Task1_train_3407
Given this context: Chromosome 2, gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3408
This sequence change occurs on Chromosome 2, altering CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Glaucoma 3A
TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
Task1_train_3409
Here is a variant affecting CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3410
Chromosome 2 houses a mutation in gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Glaucoma 3A
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Task1_train_3411
The gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
AATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCAC
AATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCTGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCAC
Task1_train_3412
A genetic alteration is present in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Glaucoma 3A
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AATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCTGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCAC
Task1_train_3413
A variant affecting Chromosome 2, within the gene GALM (galactose mutarotase), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; GALM-related disorder
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Task1_train_3414
The variant affects gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
GTAGCTGGGACTACAGGTGCACACCTCTCCTCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTAGGAGAGATGGGGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAAGTCCTGGCCTCAAGTGATTTTCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGTTGAAATTACAGGTGTGAGACACCATGCCCAGCCCAAATATACTTTAGATGGCCCAAAGACAACAAAGACTACTGGGTAACTACAGACGTATGTATACTACAGGAATAAACAAATAGGATTCTGGACCAAATTTCAAAATAATATACTACCAAAGAATTATTTTAAGTATATTTTTAGTTAGATTTCTTCCAACTGAGAGAATCTTAAAAATCGAATTTGACCCCCAGAAGGCACAGAAAAAGTATTTTGTCTTAAATCAGAAAGCTAATTAGCAGACTGGGATGACAAACCAGAAATTCTAACTTCGAGGTTAGTGCTTCTCAACCTCCTCCCCCATAATAATGTCATGCTGCCTCTAGTATTAGATTCTAGTATGTCAAATTAGGGGGAACTTGATTAGCACATCGAGCTAAGATAGCCAACGGTAAGGGCATGTGGAAATGGTCATGAAAGAGTTAAAGGTGACTGGATTGAAGTTTTGATTTAATAACGAACAAATGAAAAAGGGTTCTTAGAAGAGCTTTAAAGTTTCACATGAAATTAATTTAAAAAATTATTGGTGATCTAGATTGAAAAGGTAGCCTTTCAAAAGGTGAGCTGTACAGTCCGGCAACCACTAGCCACATGTGATTATTGAGCATCTGACTGTGGCTTGTCTGAACTGAGATGTGCTGTAAGTGTAAAATGCACGCTGGATTTTAAAGATTTAGAACAAAAGGAATGTAAAATATCTCAATCATAAATTTTTATATTGATTTCATGTTGAAATGACAATATTTCTGATATACTGGGTTAAATAAAATGTATTAAAGTTATTTTTGCTTTTCCTAATGAGGCTAACTAGACAATTGAAGTTATACATGTGGCTCACATATTTCTATAGGACAGTGCTGGTCTAGAAATAAGAGATGGATAAGCAGTAGTGTGCAGTCTGTGAGATTTGTTTCGCTGCACTGAAAAGCACAGATAGTGTATTAGCAGCCATTATATACCATCAGGGGACCACTGGGTAGACGAAAAGGGCTTAAATCTGATACATTGCAAAATTAAAAGCTACTAAAGAATTTGGTGGAGAGTAGATGGTGTACCCTGACTAGTATTCAAATACATGTTAAGTATCCTTTATCTGAAATGCTTGGGACCAAAAGTGTTCTGGACTTCAGAATATTACATCATACTTACTGGTTTAGCATCCCTAACTGAAAAATCTCAAAACTTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATTATGTTGACACTCAAAAAGTTTTGGGTTTTAGAACATTTTGGATTTTGGGTTTTTGGATGAGGGATATTCAGCCTGTATAATAATTTTGGAGCCAGGCAGCATTTGAAACATGGGACTAAAATTACTTGCAGATTTTAAGACTGATCTTTGTCTCCTCTGGATAAGAGGAATGCATTTGAAAAGCTCAAATGAAATTTAAGCTGCCAATTTTACCACTAGGCCTTTCATTAACGTATAATAAATTTAAAGAGGGCTGTTCCAGCAGATTTTTTAGAAATTTCAAGTTGGTGGAGTTTAGAATTTGTCTTATATTTTTATAATATTATCTTTTGAAATGGCATTTGACTTAACTACAAGTTCACACATACAAAAAAATAACAGAGATTCTTTTTTACCTCTAGCATGTATAGTACTAACAAATACCTTAATGCACTTAGAATTTTTGCACCTACTTGAGTGAAAAGGGCTCGAATGATCGGAATCAAATACACTGCAAACATCTGTGGTACTGGAAGCACCAGAAGCAGGCGGAGGTGTTAACGGTGTTCTTGGAGAATTTGGTGCAGATGCTGTACTTTCTGTTTCACTTTCAGGGATCCTACTATAACTAATTTTCCTTGGCTCCTGCTGCAGAGGTGTGGGATGCCTCATGGTACCTGGTCTTGGGTTTGATGGACGAACACCAGGAGATTTTAGGGGATAGCTATATTTTTTTGGCTGTAGACATATCAAAAGAAACACAATACTTTAAACACTGTAGTAGAAAGGAAAGTTTTTCTATATGTGCCTGGTAAAATTCAGCTAATATACAGGAAAATCATAAATCACTAATAAGGACATAATTATTCAAATAAAAGTAGAACATTTAAAGCATTAACATTCTATTTTGCTAAAGCCCTGGTATCTAAATTGTTAAAGAATGCATTTCTTTAAATAACTAAGTTTTAGTCCTATAAATACTAGAGTATTTGTTATTTTAATACATTTGGGTAGAAGTTTTTCTAAAATGTATTGTATATTTCCCTGGTTTTTAAAACAGACTATTTTGAGCAAATTTAACCTTGTTGAAAAGCCAGGATCATCACTGTGAATTACAATACCTTTCTATTCTGTAATACAGTGATGCCATCAGGACCATTTGAGATATTTACGAATACATTAAATTGCCCAATTTTCATTTGTGTATGTATGTTGGTTTTATTGCATTTTCCTTGCAAAATGATCATTTCTCAGTGAGTGCTTCATTGGATCAGATTATATACCTATTTATAATTTTCTATTTTTAATCCATCTTATTAAAAACTGAACAAGGGCTTGAGAAATTTTGCTGTCAGGCAATTGCATACACTTTAATTAAAAGACATTATGTGATTTATCTTGGTCACTTAGAAGCCATCTATGTTTAATTCAGGATTCTTGACTTTTTTTTTTTGAGACGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGCTGGATAGCCATGGCACGATCTTGGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGGACTACAGGCTCCCGCCACCATGTCTGGCTAAGTTTTGTATTTCATTAGAGACAGGGTTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCACGAGCCACCGCACCTGGCAGACTTTTGACTTTTTTATGAACAAGAGAGTACATAGTCAAATCAGTGAGTTGGTGATTCTATTCATAAATTTGGCTGGGCACTGACAAGTAACAAAAAACAATGGAAACTTTATTTTCCCAAGAAAGTATTGTTAGCAAAACTTGGTATTTTATGGCTCATGATTCATGGTTGAAAGTTCTAATAAGTCATTACTTTTAAAATGTCATAAGTAGATATTTTATTACAAGTGAATTAGTATAAATTCATTAAAATTCCTGTCTTTAAAATCTTAACATTTTTTGGGGTAAAAAAAATTAAAAACTTACATAATATTTGCTCAATTTCATCATCTTTGATATCAGGATTTACTCAAATTAATACTAACATTCATTTATTTGGAAGGAAGTGGGATATTCCTGGACATAATTATTAAGTACTTTTTCATTACTTTTAACTATCACATGTATACTTCATCCCTGAATACCTTTATGGAAAACTATATAACACATATGGTAGTAATGACATCACCAGACAAATATACAAATGCTTACAAATCTTGGGAGAGGCTTAGGGTTTCGTGGTTCTATTTCTAGGGATTTGTTGAAAAGATAATCTGTAAATTCCTTCTCCATGCTATTTCCCATCGGATTCAAGTTTTCAAAGAACCTCTAAAATAAATGCAAAGAAAAAATTATTAATATTCAAAATTATAAATTCAGTTTGAAATTCATGGAAAGTTAAGAAAACATTTAATACAAGTAAATTTGAATTATTTCTTTTAAGGTTTATTTTACTTTTTCTCCCCTATAAAATAAACCTGCCTTTTATTAAGTAGTTTAGAAACTTAATCAGAAGTATGAATCTTTAAATAATTCAACTTACTTTGATATCTGATTCTACTCGTAAACAGTAAGGCTGATTTTGGTACTGCTGGATCTCTCCTGTTATTTCTGCTACTTTCCTCCTTTTGCTAAAGTTTATAAGCTCTTTTCCATGTCTTTTTAGGACCTCA
GTAGCTGGGACTACAGGTGCACACCTCTCCTCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTAGGAGAGATGGGGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAAGTCCTGGCCTCAAGTGATTTTCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGTTGAAATTACAGGTGTGAGACACCATGCCCAGCCCAAATATACTTTAGATGGCCCAAAGACAACAAAGACTACTGGGTAACTACAGACGTATGTATACTACAGGAATAAACAAATAGGATTCTGGACCAAATTTCAAAATAATATACTACCAAAGAATTATTTTAAGTATATTTTTAGTTAGATTTCTTCCAACTGAGAGAATCTTAAAAATCGAATTTGACCCCCAGAAGGCACAGAAAAAGTATTTTGTCTTAAATCAGAAAGCTAATTAGCAGACTGGGATGACAAACCAGAAATTCTAACTTCGAGGTTAGTGCTTCTCAACCTCCTCCCCCATAATAATGTCATGCTGCCTCTAGTATTAGATTCTAGTATGTCAAATTAGGGGGAACTTGATTAGCACATCGAGCTAAGATAGCCAACGGTAAGGGCATGTGGAAATGGTCATGAAAGAGTTAAAGGTGACTGGATTGAAGTTTTGATTTAATAACGAACAAATGAAAAAGGGTTCTTAGAAGAGCTTTAAAGTTTCACATGAAATTAATTTAAAAAATTATTGGTGATCTAGATTGAAAAGGTAGCCTTTCAAAAGGTGAGCTGTACAGTCCGGCAACCACTAGCCACATGTGATTATTGAGCATCTGACTGTGGCTTGTCTGAACTGAGATGTGCTGTAAGTGTAAAATGCACGCTGGATTTTAAAGATTTAGAACAAAAGGAATGTAAAATATCTCAATCATAAATTTTTATATTGATTTCATGTTGAAATGACAATATTTCTGATATACTGGGTTAAATAAAATGTATTAAAGTTATTTTTGCTTTTCCTAATGAGGCTAACTAGACAATTGAAGTTATACATGTGGCTCACATATTTCTATAGGACAGTGCTGGTCTAGAAATAAGAGATGGATAAGCAGTAGTGTGCAGTCTGTGAGATTTGTTTCGCTGCACTGAAAAGCACAGATAGTGTATTAGCAGCCATTATATACCATCAGGGGACCACTGGGTAGACGAAAAGGGCTTAAATCTGATACATTGCAAAATTAAAAGCTACTAAAGAATTTGGTGGAGAGTAGATGGTGTACCCTGACTAGTATTCAAATACATGTTAAGTATCCTTTATCTGAAATGCTTGGGACCAAAAGTGTTCTGGACTTCAGAATATTACATCATACTTACTGGTTTAGCATCCCTAACTGAAAAATCTCAAAACTTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATTATGTTGACACTCAAAAAGTTTTGGGTTTTAGAACATTTTGGATTTTGGGTTTTTGGATGAGGGATATTCAGCCTGTATAATAATTTTGGAGCCAGGCAGCATTTGAAACATGGGACTAAAATTACTTGCAGATTTTAAGACTGATCTTTGTCTCCTCTGGATAAGAGGAATGCATTTGAAAAGCTCAAATGAAATTTAAGCTGCCAATTTTACCACTAGGCCTTTCATTAACGTATAATAAATTTAAAGAGGGCTGTTCCAGCAGATTTTTTAGAAATTTCAAGTTGGTGGAGTTTAGAATTTGTCTTATATTTTTATAATATTATCTTTTGAAATGGCATTTGACTTAACTACAAGTTCACACATACAAAAAAATAACAGAGATTCTTTTTTACCTCTAGCATGTATAGTACTAACAAATACCTTAATGCACTTAGAATTTTTGCACCTACTTGAGTGAAAAGGGCTCGAATGATCGGAATCAAATACACTGCAAACATCTGTGGTACTGGAAGCACCAGAAGCAGGCGGAGGTGTTAACGGTGTTCTTGGAGAATTTGGTGCAGATGCTGTACTTTCTGTTTCACTTTCAGGGATCCTACTATAACTAATTTTCCTTGGCTCCTGCTGCAGAGGTGTGGGATGCCTCATGGTACCTGGTCTTCGGTTTGATGGACGAACACCAGGAGATTTTAGGGGATAGCTATATTTTTTTGGCTGTAGACATATCAAAAGAAACACAATACTTTAAACACTGTAGTAGAAAGGAAAGTTTTTCTATATGTGCCTGGTAAAATTCAGCTAATATACAGGAAAATCATAAATCACTAATAAGGACATAATTATTCAAATAAAAGTAGAACATTTAAAGCATTAACATTCTATTTTGCTAAAGCCCTGGTATCTAAATTGTTAAAGAATGCATTTCTTTAAATAACTAAGTTTTAGTCCTATAAATACTAGAGTATTTGTTATTTTAATACATTTGGGTAGAAGTTTTTCTAAAATGTATTGTATATTTCCCTGGTTTTTAAAACAGACTATTTTGAGCAAATTTAACCTTGTTGAAAAGCCAGGATCATCACTGTGAATTACAATACCTTTCTATTCTGTAATACAGTGATGCCATCAGGACCATTTGAGATATTTACGAATACATTAAATTGCCCAATTTTCATTTGTGTATGTATGTTGGTTTTATTGCATTTTCCTTGCAAAATGATCATTTCTCAGTGAGTGCTTCATTGGATCAGATTATATACCTATTTATAATTTTCTATTTTTAATCCATCTTATTAAAAACTGAACAAGGGCTTGAGAAATTTTGCTGTCAGGCAATTGCATACACTTTAATTAAAAGACATTATGTGATTTATCTTGGTCACTTAGAAGCCATCTATGTTTAATTCAGGATTCTTGACTTTTTTTTTTTGAGACGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGCTGGATAGCCATGGCACGATCTTGGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGGACTACAGGCTCCCGCCACCATGTCTGGCTAAGTTTTGTATTTCATTAGAGACAGGGTTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCACGAGCCACCGCACCTGGCAGACTTTTGACTTTTTTATGAACAAGAGAGTACATAGTCAAATCAGTGAGTTGGTGATTCTATTCATAAATTTGGCTGGGCACTGACAAGTAACAAAAAACAATGGAAACTTTATTTTCCCAAGAAAGTATTGTTAGCAAAACTTGGTATTTTATGGCTCATGATTCATGGTTGAAAGTTCTAATAAGTCATTACTTTTAAAATGTCATAAGTAGATATTTTATTACAAGTGAATTAGTATAAATTCATTAAAATTCCTGTCTTTAAAATCTTAACATTTTTTGGGGTAAAAAAAATTAAAAACTTACATAATATTTGCTCAATTTCATCATCTTTGATATCAGGATTTACTCAAATTAATACTAACATTCATTTATTTGGAAGGAAGTGGGATATTCCTGGACATAATTATTAAGTACTTTTTCATTACTTTTAACTATCACATGTATACTTCATCCCTGAATACCTTTATGGAAAACTATATAACACATATGGTAGTAATGACATCACCAGACAAATATACAAATGCTTACAAATCTTGGGAGAGGCTTAGGGTTTCGTGGTTCTATTTCTAGGGATTTGTTGAAAAGATAATCTGTAAATTCCTTCTCCATGCTATTTCCCATCGGATTCAAGTTTTCAAAGAACCTCTAAAATAAATGCAAAGAAAAAATTATTAATATTCAAAATTATAAATTCAGTTTGAAATTCATGGAAAGTTAAGAAAACATTTAATACAAGTAAATTTGAATTATTTCTTTTAAGGTTTATTTTACTTTTTCTCCCCTATAAAATAAACCTGCCTTTTATTAAGTAGTTTAGAAACTTAATCAGAAGTATGAATCTTTAAATAATTCAACTTACTTTGATATCTGATTCTACTCGTAAACAGTAAGGCTGATTTTGGTACTGCTGGATCTCTCCTGTTATTTCTGCTACTTTCCTCCTTTTGCTAAAGTTTATAAGCTCTTTTCCATGTCTTTTTAGGACCTCA
Task1_train_3415
This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Noonan syndrome
ACATACATACATACGTATGAGCTTAATTTATAAATTAGGCACAGTAAGATTAAAAATAGCTAAAAGTTACATGAATGTGGTCTTTCTCTCCCAAAATATCTCATGTTTTTGGACCAAAGCTGACCATGGATAACTGAAACCGTGGAAAGTGAAACCGTGGAGATGGGAGCACTACTGTAATTCCTCCTCTGGTTATTTGTCTCAAGAAGATATTTTCAAATACAGAAAAATAGTATAAATGAAAATGTGAATCAGAAAATCATGTGGAAAGCAAAAAAGCTGGAAACAATGTGTCCAATCACAGGGTAATGGTTAAAACAAATTGTCCAACTTTATGGAATATTATGCAGCCATTATAAATAATTAAGATTATTTAATAAAATACAAAAATATAAGATATGATAAGTGAATAACCTTAATATGCACATCATACAATTACAATTATATACAATGTGCACAGCAAAAAGATTAGAAGTAAATACAAAAATGGTTGCTATAAAGCCCAAACAATAAAATGTGGGAAAATATATTAAAAGTATCAGGACATAACATTGTTATATGCAGTGGGATTTAAAACTATATAAAAAATATAGATGAGGAAAAGGCTAGAAGAAACTATAGCACATACTAAAGAGACTATAGAGAGATCATAATTTCTATAAGCATTCAAAAGAAGGATCATCAGAGCATATACTCAGGCAGAGAAAAGATGAGAGTAGGAAAGAGATATTGAATACATGAAAATAAAGGAAATAAAGAACGGAAAAAGATAGAGGAACCTACAGAAAGGGAGATTCAGGTGGTAGATTCAGTCCTAAAAAGGAAGGAAAAGGTACTTCCTTCCTCTGATGCAGAAGGGGAAAAATAGGAGAGGATGAAGAGAATAAAATTTTGATGTGCCAGAGGTGTGGGCCCAAAGGCACAGCAGGCACACTATGATTTTTAGCCATGTGAAACTGTTTACAAAAATGATTATAAATATAGTTGAGTTTGGCTATGCCTCTGCTGTATTTAGTTTATTAAAATGCAATTAAAAAGGCTTTTATAAATATAAAAACACAAGTATTAAATAATATCTAATGGCTGCCTAAGATGAAAATAGAAAATGAAATGTATATTAGACTTCACCTTAAGTCTTAATGAGAAAAATTCTAAAGGGCTTCAGGTGCTAAATATTGATCAAACAAGTATTTTCTGCTGGCATATTACACATGTAATTATTCAGTCATTTAATGAAATGAGTGTTTTGTTTTATCCAGAAATGCAATAAAAATTCAGAAAGAAATACTTACCAAAGAAAGGCACACATGGTGGATTAATAGACCTGAGTTTTGCCAAATATTTCTTATAGTGATCTTCACTCAATTCATGAGCTTCTTCTAAAATTTTCTTCTGGCGACTTGGTATTTGCTATAAGGAAAAAAAATAGGCGTAAGTTTACAAAAGGAATCAAAGGTCTTGTCAAAAAAAATACTAGGCTAACAGAAACGCCCAAATACAACAGTATCAATTTGATTTTATGACTGTAACATTGCTTCAAATATTGCTTCAAATAAATTATCTTCATAGACCTCAGTATAAACTTAAAGTATGTGTGTGTGTGAGAGAGATCTAGTTTATCATGTCATTCCTTACACAATTATGTGAACATTTAACTGTACATTATCTTACAAATTAAGTGCCGAAAGTTTTTTCTTCTAGCTTAGGCTGGGACCTGTGAATACATTTTAATAGGAATGCTTAAATTTTAAAAAGCAACCAATTCATTACAAAACTTAGATAATTCAGTCTTTTAATCTACTACTGAAAAGACAAATGAGACATTTAAAAATTAAAGATAATAATTGTTAAAAATCTAATTTTTCTAATAGGGAATGAAAGTTCATTTTAAAAACACATGTAGAAACCTACCTCAAATGTGTGGTCTAGTCTGTAAACAGGTGATGAATTCATAGCACTGACAACCTCAAGGACACCATTAAAGTTGTTCAACTCTTGAAAGACTTGTAGAATCTCAATAATTCGACTCACCACAGCTACTCTTTCTTCTAAATTTTCAGTTTCTACAATACATCTGGGAATAAAAAAAAAGTGAACTAAAGGTTTTAGAGTTTTTCCAATAAAGTTATAGCTTAAAGAATTTAGTAAATAAAATAATGTAGAGAGTAGGGGGGTGGCGATAGTATAACTACTATAGAGAAGACACATTCAGGGTGACTGATAGAAGGAAGGCAGTGCCTCCAGTCAGGCATACTGCTCTTTCCCGTCTTCTAGACTGGTACAGTCAAACAATCATTTTCCTACTATATTTGGTGCATCCTCTATTAGCATCAGAATTAACTGGTGAGGCCACTATCTTGTGGAATGTATGGAGGTCTTTGTGAGGTCTTTGTGATGTGGGTGTATTCTAGTAGAATTCAAGAATTCTGTTGTGTTCTATTCTTCATCTAATTGCAAGATTTTAGTGATTAATGCTCAATTTCTTTCTTTCATATATTATTGGCTACATACATTTCTAGGAACAGCTCTGTTCCTATGTTTCCTACATTTCTACGAACAGCATTAAATGTAATGGCAAAAACTGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATATATAATTGCATTGAGATTCTGGACTTGTGGTATGATAGTATGAGGAGCTTCACTGAGTGAAACTGGTAAAAATTATTAAAACACACATACACACAAACACACACATGCACACGCACACACACACATTTAAAGTCTCTAGTAATGGCCCTGAGAGCAAATGGCAAAAGAAACATCTATTCAGGAAAATCTACAAAAATTTGGTAAGAGAGGGGAGAGAGTCTGTGGTATTTGAACCAAGACTGGTCCCTCCCTTCTTTCTCCCAGCTCAGTGAGGGTGAACTGAGCATCTACTCCAGATTCCTGCAGTCAAGAACACCTAGCTCCCGGTGAGGTGCAGGAGCAGGACTTCAGTTTTCTCATCCTGTCCCTGCTGCCTGTTGCTGAGGCCAAGTCCCAGTTGAGTGCAGCTGAGAAGTAGGAATACCCTTTTTTGCCCAACTTCCACTTATGGAATGGAGACGCTACCTTGGGTGTGATGTTTTGAGCATACTGAGAAAAGAGCCCTTCCTCTGGTTCCTGAGGGCGTGGTTCCATGCCAGAAGAGGCGGGTAAGAAGACCTCAGGCTGCAGTAGCATCCGTCTGCCACTCTACCTGCTCAACCAAGCACTTAGCTCCTAGGGCAGAAGTGTCACTCAGAGAAAAGCTTGCCATTGTTGCCCAGCCCCAGAGCCCTGTTTCAAACAGATAGCTCCTAATTTCTTGTCATTTGCAACAAAGTATAAAGTAGTTTAAATTTAATGGTGCCCTTAGGAACAGTGGAAATTGTGGTGAAAGGCAATGGGGAAGAGATTTGTGGATCTAATGAAGATACACCCTAGACTGTAGGCAGAGTAGTTTGCAGGAGACAACTAGGAAATAAGACGGCTGAGAGGAGCCCTCCTGGGGTCAGAACAAGTATCAAACAGAAATCTCAGAAACCATTCCTTCAAAGGAGCCACAATTTGATTGCATTATTTTGTATAGCATTTATGCCACCAGAAAATTGTTGAAAACATCAGAGCAATCAGCTGGCAAATTGTGGAGTTTCATAGCTGGGTGTGTGTGGTCAGGTAAGGAGTGGATGAGTCTTTCCAGTACCACTGCCATGCAATAAGAAGCCCTGGAAAGGGGGCTGGGGAAGGAGGAGCAGTACTCAGAGTTGCTACACTATATTATCTGAAATGTCAGGTTTCCAGCAAAAACAGATGAGGTATGCAAACCAATAGGAAAGTATGACTCTTACAAGGGGTGGGGGTGGGGCGGAGGGGGTGGAAGGAACAGAAACTGCCTGTGAGAGCAACCAAATGTCAGATTTAACAACAGTAACAAAAAAGATTTCTAAGTAGCCATTATGAATACGGTCACGGAATTAAAGGAAAGCATGAAAAAGAAGGAAAGGAAGGTATTGATGACAATGTGCATCGAAGAGAGGATATCATTAAAGAGATAGAAACTATAAAAAGGAACCAAAGGGAAATTCTGGAATTAAAAAGTACAATAACTGAAA
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Task1_train_3416
Here is a mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Fibromatosis, gingival, 1
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Task1_train_3417
Mutation context: Chromosome 2, Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
GGTCCTAGGAAATAAAATAGATTCTAACACTGTAATTTTCAGAAATACGATTTTCAGTGGGAGATCTATAAATTTATCTCATTTTCTCATTTAGTTATTAAAAAGTGAATAATTTAAGATTCTAAGTAGTCTCCATTTAAAATCAGAAGGACATTTTTGAGATAATTACATCAATGTAGTATGATTAAAAAAGACTATAATGGCTGTAAGTTCACAATAAAGCAGTAGCTAACATTTATTGAGCCCTTACTTTGTGCTAGGTAATGTACATATATTGACTTGCAAACCTCAAAACAGCCCCAGGAGTAGGTACTATCAGTAGCCCCATTTTACTCTTGAGGAAAATAAGGGGCAGAAGGATAAAGTCACACAAGGAGGTTAAAGTTGCCCAGGGCCAGCAATTGGTAAAGCCAGGATTTGAACCTAGCCTTACCAACTAGGGGTGAACACAGAAAGACAGAAGGTGTAAATTCAGCTAGAGGGACCAGGGGAGTAAAAGAACAGGAACTGCCTGCCTGGCCTTATTACTAGACACTTCATGTAATATTTCAGTTAAGTCTTATGAAAACCCTATAAGGCAGAAATCAGTATTTCATTTTAAAAGTTAACTCTTTTGAAATGACTTTTCAACTTGAATGTTAAATTACATACCGGTATAGATCTGATTCAAGTAAAGTGAGTTGTCGAGCAATTTCTATTGGGTGTAAGGTGAGCAGGTCAAAAGTCTCTATGTGCCCAGGTCTGCTTATATGCCACTCAACTGTGGGAGGTGAACTCTGAAATGTAATATTATGACCTGGTCCATTGTCTCTTGCAATTTTTTTCCTTTGGATTATTTTAGTGATGGATTCAACCCATTTTTTCATTGCTTTACCTGCAATACATTATATTTTAAATAACATTTAAATATTCTTTATTTAATATTTTATATTTTAAAAATGGTTTAAAGTCACACGGATGACACCTGAATGTATCTTTGCTATAAAAAGTTCAAATGATCAAAATGAAAAATGCAAGTTCTCCTTTTCCATTTCCCGGTCCCCAATCCTAATCTTATTCTTCTTCATTTGGGTAACCACTGTTAATAGCCTGGTATGTATTCTTCCAGATCCTTTCCAAATAAAATTAGAAAGTACTTAATTTGTAGAGACTGTCCATCCCATTGTTCTGATCTTCAGTTTAATGTATTATTTTATAATCCTCCAAGAAAAGGTATATCTTATGTAAATCACAAGATTTATAAGGATAGATTATACACAATATTCATCTAATTAACACTGCATTTTATAAACCAATAAATATCAGTGCCAGAGGACTGATTCCTTAGTGTGAGTTTTGATGTGGCTCTGTTTTATATTGTACATGAAAGTACTATTATTTAACTATTTTCTGATTATCATTTAGAGCATACAAAGGAAATAAAAATAAGTTTGTCTAAGATATCCTTAGAGCCATACACTCACGTAATCTTTAAAACTAGAAGGAAAACCTTAGAGATCGACAAACCTAGCTCCTTATGTTATTGATAAGAAAACTGAAGTCTAAAGAATCTAAGTGATTTTGCCCAAAGTCACGTATCTGATTAGTGGCAGTGTTAGACATAGAGTCTCAATTTAATCCACTCTGCTTCCTCTCTGATTCTATTTGCCTGTGGCCCACTCGACCTCCATCAGTGGTGTTATAATGGCACAACGTAATTCCCAAATGCCCTCATACTTTGGGATATATATGAAGACTTGGCTTAATCAACTCTAAAATAATCAGTAAGTTGAGTCACTAAATGAAAATACATTGGATCAACAGGGTGACTTGAGCCATTTGCAGGTCTAAATGCTATTTGATGAAAATTTTTAACTTTTTGAAATGGTTATGCTGGTACTATTATAAACATCTTACATTACTGAGCCCCAATGACATCAATTGATAGTCACCGTGTTGGTACTTTTATTACATATAAAACTAGGCACCTAAAAAAAAAAACATACCTCTTACTGTTCCAATAAATTCTTCCATTCGTTGCAAAAGATATGCATCTCTTTCAAAATCATAGAAGTGGTGCTCTACCCAGTGCCGACATACATTTAATACTCTATGGCATTAACACAGAATTGAATTACATGGGAATCAAACATAAATGTTTATCACAATGCACAGTACAATACAAATGAAAATGCAGTAACTCTTACCAAATTAATCTTATCAGTGTGCTTAACACTTCCAAAATTCTATGTTAAGGCTTATACTATAATTTCTGATAACTGCTCTAATTAGTAAATTTAATTTACTAATTTTATTGTCACCCCTCTCCTTGTTTGGGAAAGGTCCTTATATACTTCAACATTGAAACGAAAGTTTGATAAAGACTTATTTACTTCATTTATTTAATGCTTACCGCAGTTGCACAGGCTGTATATATTCTTTTCTAAATCTTTTCAGTTCTGCACTCAAGGGTTGATCTCCATTCTCTATAGCTATGCGATCAGCTTCTGTTGGCTCAGGCTCTGGAATTTCAAACCTAACATAAAATAGAACAAATTAATGAAAAGACTAATTATATCGAGTTATACAAATAGAAAACCACAAACGTTTTCACCAGTCAGCAAAATCAAGAGAATACTGTAAAAAATTACTGAAGATATGCATATCAGTGTAAACAAGTGAGACTCCTATAGTATTAAAGGCTAATAAAATTATTTTAAAATTTTTAAAAGAAATTAGTACTTGCCAATATAGATAAAACTAACTACAAACAAAATAAAGAATACATGCAAATTCTAAAAATAAATGTGACTATAAAGTTACGGGACTGATATTCATTTTTGGTCTGTGGAATTACTCTAAATCAGGTGACATAATCACTGTTAAGGGTAATTCCAGAAAAACTGACTGCTCTTTGTTTGGGTACATGAAATATTTTCCTTCCATCACAGTATTTGTTCACTGACAAGTTCCATTTTACTCAACATGAAGTATGTTTGAAAACTTACTTAGAACATCTAACTCATCAGAATTTGAATTTCTTGACTCTATAAATTTTATATAGGTCTTTAGTTCTGTAAATTTGAAATTTCAAATACTGAGTTTTCACATACAAAAAAGAATATTTTTGTATTGAAATAATAAAAGCTAACATTATTATAAAATAAATGTTCATCTAAGAGATTTTATTTATTGAAAAAGTGCTTGTGAAGTATATTTTAAAGCTCATCTAACATTTCTGAAAAGGATCTTAGCTCAATCTCTTTTTTAACAAAAAATAATGAATTTAAATATTTTTTAAATGGACAGACCTTTCTATTATAAGACTCAGTAGTTCTTGAGGTTTGCAAAAGGATCTGTATGTTGTAAGAAATGTCCGAACAAAATTGGGATCTAAGAAGAAAAAGGAAAAATATCTTATTAAACTCTATGATTCAAAATGATTAAAACTGTTATGTACATTTTCAAAATAGATCAAATAGTCAAGTTTAAAAGTTCCAAAATGTTTTGCCAAGTAGAAGGCTTTGGACTTGGTAATGCACTGCTAGCTTAGTGCCTCCTAAATTAGTGGTGATATTAAAACTTTACATCAACTTATTTCTTGCCCTCTGCACACTGACAAGATGATCTTAAACTCATCGGCCACAGGAATGAGCAAGAAAGAAAAGCAAAGGTAAAGCAGGGAACCAGGCTCCCCTCCCACCTGCTACCAGGATCTCAAAGTATCACCAGTTGGTTTATCCCCCTTATAAAGAGAAAGGCCACAGCAATAACCCATTACTTTTCCTTACATCAAGATGAGTTTATCTAGGATGACTTATCTAGCTTTCTTTAAATCATGTTAACAGAGCATGCAACTGGAAATTGGAACTTATAAAGTAGTAGCTAAAGTTAAATACAGTTTTTAAATTATTTGCTAAAAATCTCACAACTACTTAAAGATGCTTACAAATACTTATAAGCTATTAAAACTATTAAATGTGATAGAATATGTTGGTTTGGTCCTATTCCAACCTTTAATTGCCTTTATTTCAAGTAGTCACAATGAGAGGTCAATCATAAATATAGGAGTCTCCAATCCCTTCCATGAAAGGACCTACTTTTCATTCACATCTCC
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Task1_train_3418
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_3419
The variant affects gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
GGTCCTAGGAAATAAAATAGATTCTAACACTGTAATTTTCAGAAATACGATTTTCAGTGGGAGATCTATAAATTTATCTCATTTTCTCATTTAGTTATTAAAAAGTGAATAATTTAAGATTCTAAGTAGTCTCCATTTAAAATCAGAAGGACATTTTTGAGATAATTACATCAATGTAGTATGATTAAAAAAGACTATAATGGCTGTAAGTTCACAATAAAGCAGTAGCTAACATTTATTGAGCCCTTACTTTGTGCTAGGTAATGTACATATATTGACTTGCAAACCTCAAAACAGCCCCAGGAGTAGGTACTATCAGTAGCCCCATTTTACTCTTGAGGAAAATAAGGGGCAGAAGGATAAAGTCACACAAGGAGGTTAAAGTTGCCCAGGGCCAGCAATTGGTAAAGCCAGGATTTGAACCTAGCCTTACCAACTAGGGGTGAACACAGAAAGACAGAAGGTGTAAATTCAGCTAGAGGGACCAGGGGAGTAAAAGAACAGGAACTGCCTGCCTGGCCTTATTACTAGACACTTCATGTAATATTTCAGTTAAGTCTTATGAAAACCCTATAAGGCAGAAATCAGTATTTCATTTTAAAAGTTAACTCTTTTGAAATGACTTTTCAACTTGAATGTTAAATTACATACCGGTATAGATCTGATTCAAGTAAAGTGAGTTGTCGAGCAATTTCTATTGGGTGTAAGGTGAGCAGGTCAAAAGTCTCTATGTGCCCAGGTCTGCTTATATGCCACTCAACTGTGGGAGGTGAACTCTGAAATGTAATATTATGACCTGGTCCATTGTCTCTTGCAATTTTTTTCCTTTGGATTATTTTAGTGATGGATTCAACCCATTTTTTCATTGCTTTACCTGCAATACATTATATTTTAAATAACATTTAAATATTCTTTATTTAATATTTTATATTTTAAAAATGGTTTAAAGTCACACGGATGACACCTGAATGTATCTTTGCTATAAAAAGTTCAAATGATCAAAATGAAAAATGCAAGTTCTCCTTTTCCATTTCCCGGTCCCCAATCCTAATCTTATTCTTCTTCATTTGGGTAACCACTGTTAATAGCCTGGTATGTATTCTTCCAGATCCTTTCCAAATAAAATTAGAAAGTACTTAATTTGTAGAGACTGTCCATCCCATTGTTCTGATCTTCAGTTTAATGTATTATTTTATAATCCTCCAAGAAAAGGTATATCTTATGTAAATCACAAGATTTATAAGGATAGATTATACACAATATTCATCTAATTAACACTGCATTTTATAAACCAATAAATATCAGTGCCAGAGGACTGATTCCTTAGTGTGAGTTTTGATGTGGCTCTGTTTTATATTGTACATGAAAGTACTATTATTTAACTATTTTCTGATTATCATTTAGAGCATACAAAGGAAATAAAAATAAGTTTGTCTAAGATATCCTTAGAGCCATACACTCACGTAATCTTTAAAACTAGAAGGAAAACCTTAGAGATCGACAAACCTAGCTCCTTATGTTATTGATAAGAAAACTGAAGTCTAAAGAATCTAAGTGATTTTGCCCAAAGTCACGTATCTGATTAGTGGCAGTGTTAGACATAGAGTCTCAATTTAATCCACTCTGCTTCCTCTCTGATTCTATTTGCCTGTGGCCCACTCGACCTCCATCAGTGGTGTTATAATGGCACAACGTAATTCCCAAATGCCCTCATACTTTGGGATATATATGAAGACTTGGCTTAATCAACTCTAAAATAATCAGTAAGTTGAGTCACTAAATGAAAATACATTGGATCAACAGGGTGACTTGAGCCATTTGCAGGTCTAAATGCTATTTGATGAAAATTTTTAACTTTTTGAAATGGTTATGCTGGTACTATTATAAACATCTTACATTACTGAGCCCCAATGACATCAATTGATAGTCACCGTGTTGGTACTTTTATTACATATAAAACTAGGCACCTAAAAAAAAAAACATACCTCTTACTGTTCCAATAAATTCTTCCATTCGTTGCAAAAGATATGCATCTCTTTCAAAATCATAGAAGTGGTGCTCTACCCAGTGCCGACATACATTTAATACTCTATGGCATTAACACAGAATTGAATTACATGGGAATCAAACATAAATGTTTATCACAATGCACAGTACAATACAAATGAAAATGCAGTAACTCTTACCAAATTAATCTTATCAGTGTGCTTAACACTTCCAAAATTCTATGTTAAGGCTTATACTATAATTTCTGATAACTGCTCTAATTAGTAAATTTAATTTACTAATTTTATTGTCACCCCTCTCCTTGTTTGGGAAAGGTCCTTATATACTTCAACATTGAAACGAAAGTTTGATAAAGACTTATTTACTTCATTTATTTAATGCTTACCGCAGTTGCACAGGCTGTATATATTCTTTTCTAAATCTTTTCAGTTCTGCACTCAAGGGTTGATCTCCATTCTCTATAGCTATGCGATCAGCTTCTGTTGGCTCAGGCTCTGGAATTTCAAACCTAACATAAAATAGAACAAATTAATGAAAAGACTAATTATATCGAGTTATACAAATAGAAAACCACAAACGTTTTCACCAGTCAGCAAAATCAAGAGAATACTGTAAAAAATTACTGAAGATATGCATATCAGTGTAAACAAGTGAGACTCCTATAGTATTAAAGGCTAATAAAATTATTTTAAAATTTTTAAAAGAAATTAGTACTTGCCAATATAGATAAAACTAACTACAAACAAAATAAAGAATACATGCAAATTCTAAAAATAAATGTGACTATAAAGTTACGGGACTGATATTCATTTTTGGTCTGTGGAATTACTCTAAATCAGGTGACATAATCACTGTTAAGGGTAATTCCAGAAAAACTGACTGCTCTTTGTTTGGGTACATGAAATATTTTCCTTCCATCACAGTATTTGTTCACTGACAAGTTCCATTTTACTCAACATGAAGTATGTTTGAAAACTTACTTAGAACATCTAACTCATCAGAATTTGAATTTCTTGACTCTATAAATTTTATATAGGTCTTTAGTTCTGTAAATTTGAAATTTCAAATACTGAGTTTTCACATACAAAAAAGAATATTTTTGTATTGAAATAATAAAAGCTAACATTATTATAAAATAAATGTTCATCTAAGAGATTTTATTTATTGAAAAAGTGCTTGTGAAGTATATTTTAAAGCTCATCTAACATTTCTGAAAAGGATCTTAGCTCAATCTCTTTTTTAACAAAAAATAATGAATTTAAATATTTTTTAAATGGACAGACCTTTCTATTATAAGACTCAGTAGTTCTTGAGGTTTGCAAAAGGATCTGTATGTTGTAAGAAATGTCCGAACAAAATTGGGATCTAAGAAGAAAAAGGAAAAATATCTTATTAAACTCTATGATTCAAAATGATTAAAACTGTTATGTACATTTTCAAAATAGATCAAATAGTCAAGTTTAAAAGTTCCAAAATGTTTTGCCAAGTAGAAGGCTTTGGACTTGGTAATGCACTGCTAGCTTAGTGCCTCCTAAATTAGTGGTGATATTAAAACTTTACATCAACTTATTTCTTGCCCTCTGCACACTGACAAGATGATCTTAAACTCATCGGCCACAGGAATGAGCAAGAAAGAAAAGCAAAGGTAAAGCAGGGAACCAGGCTCCCCTCCCACCTGCTACCAGGATCTCAAAGTATCACCAGTTGGTTTATCCCCCTTATAAAGAGAAAGGCCACAGCAATAACCCATTACTTTTCCTTACATCAAGATGAGTTTATCTAGGATGACTTATCTAGCTTTCTTTAAATCATGTTAACAGAGCATGCAACTGGAAATTGGAACTTATAAAGTAGTAGCTAAAGTTAAATACAGTTTTTAAATTATTTGCTAAAAATCTCACAACTACTTAAAGATGCTTACAAATACTTATAAGCTATTAAAACTATTAAATGTGATAGAATATGTTGGTTTGGTCCTATTCCAACCTTTAATTGCCTTTATTTCAAGTAGTCACAATGAGAGGTCAATCATAAATATAGGAGTCTCCAATCCCTTCCATGAAAGGACCTACTTTTCATTCACATCTCC
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Task1_train_3420
This gene mutation involves SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
CTTCAGTAACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACT
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Task1_train_3421
A mutation on Chromosome 2 affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
CTTCAGTAACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACT
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Task1_train_3422
A variant has been detected on Chromosome 2 in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3423
Here’s a variant in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) located on Chromosome 2. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Noonan syndrome
TTCAGTAACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTA
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Task1_train_3424
The variant affects gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Noonan syndrome
TCAGTAACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTAC
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Task1_train_3425
Assess the clinical impact of this variant on gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
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Task1_train_3426
A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; RASopathy
AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
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Task1_train_3427
A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; SOS1-related disorder
AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
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Task1_train_3428
A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCGGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
Task1_train_3429
A mutation on Chromosome 2 affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; RASopathy
ACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACA
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Task1_train_3430
A variant affecting Chromosome 2, within the gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3431
Here is a variant affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Noonan syndrome
CTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATT
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Task1_train_3432
Given this context: Chromosome 2, gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3433
Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_3434
Here is a variant affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3435
This variant affects the gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) found on Chromosome 2. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
AGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGT
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Task1_train_3436
A genomic change on Chromosome 2 affects SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Fibromatosis, gingival, 1
AGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGT
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Task1_train_3437
Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; not specified
AGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGT
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Task1_train_3438
Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_3439
A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; RASopathy
AGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGT
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Task1_train_3440
Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; RASopathy
ACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGG
ACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTTCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGG
Task1_train_3441
A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
ACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGG
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Task1_train_3442
An alteration has been detected in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
ACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGG
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Task1_train_3443
This variant affects gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Noonan syndrome
ACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGG
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Task1_train_3444
Here is a genetic alteration in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; RASopathy
CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCGACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
Task1_train_3445
A variant found in Chromosome 2 affects SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome 4
CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
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Task1_train_3446
Given a variant located on Chromosome 2 and affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Noonan syndrome
CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCGACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
Task1_train_3447
Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; RASopathy
CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
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Task1_train_3448
A genetic alteration is present in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_3449
This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3450
An alteration has been detected in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3451
This mutation is located in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_3452
This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Noonan syndrome 4
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCCTTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
Task1_train_3453
A variant on Chromosome 2 in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Noonan syndrome
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCCTTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
Task1_train_3454
Here is a variant affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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Task1_train_3455
A genomic change on Chromosome 2 affects SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; RASopathy
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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Task1_train_3456
Here is a variant affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCCTTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
Task1_train_3457
Given this variant in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Noonan syndrome
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCGTTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
Task1_train_3458
Here’s a variant in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) located on Chromosome 2. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Noonan syndrome
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
Task1_train_3459
Located on Chromosome 2, this mutation impacts SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Noonan syndrome 4
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
Task1_train_3460
Consider this mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Noonan syndrome 4
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
Task1_train_3461
Chromosome 2 houses a mutation in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Fibromatosis, gingival, 1
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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Task1_train_3462
Assess the clinical impact of this variant on gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; RASopathy
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
Task1_train_3463
A variant found in Chromosome 2 affects SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome
AAAAACTTTTATAATTAGATTTAGTTCCCTTATATATTGTCGAATTTCTGCCATAAATGCTTTTACCAAATCATAGTAAGTTTGTTCTCCTGAGGTGGAAGGCTCTTCGTCAGTTAAAGATAATATATTAATATCTTCTACATCTTGATGAAACATATCCATCAATACCTATACAGTCAGAGATATAAAAAAGTATAATAAAATATGAAGCTTTCGTAGAATTTGATGTGAAATGCTCTAAGTTCTCTGAATAAAGTTCTTAAATGATAAAAAAGCAGACAAACAAATTTCTCTTCTTGGATATATTGCCAGCATCCCTCCACAGCTTCTCTAAAACAGAATTCAACATGTGATATAACTTACTACACTCCTCCAAGTTCTCTATCACTACTAGTATTTATCTGTCTGTCTCTCTTGTTAACCTATTACTTCCAATTTGTTTCCAGATCCTGTCTTTAATTTCCCTGACTTGGTTTTCTCTGTTTTATACCCTGCCATCATCACTTTATTCCATGGCCTCAGTATCTCATATTTAAATGTTTATAGCTGTCTATTCGGCCGATTTTCCTACATTTGTTGGGAATAGGTCAAAATAAGCTATTATTTTCTGCAAGAAGTCTACTGTTACTACTCTTGCTACAACACATCTTTCCCCTTCTTGAGAACTTCTACAGCATCATATCTCTATAACACAATAAAATATTATTTTATCTTGTGTGCTTTCTGATTGTTTCATGAATATAAGTATACCTTCATCAACTCTGGAGCCTTGTTTTATATATACTTATCTTGCATCTCCTCTCTGTGTAAACATGTAGTAGGTACTCAAAAATATTTTATTTATCTGATTCATTAAAAAGCATCAAGTATTTCGTATTCGTGTCTTCAGTTAAAAATACCCAAACATTTGAAATTCTTCTTCAAATCAGGTGGGTTTTTTCACTCTATATGGCCACATTCTCAAAGAACAAATAAATACTAAAACATAATTTAGTGGAATCAGCAATCAGAAATAATATTCCAAATCAGTAAGAGTATAATGAGGAAAATGGAATGAAATGCTTCATCAGAAAACATTTTCCTTTCTGCAAAGTTGTTTTCATAAAGTGAACATCCTTAGGTAATGACTAAAAGCTTTAGACTCAGAGAGACCTGGAGTTCAAGTCTAGGCTTTGAAACTTCTCAGAAAATTCTGGACCAATTTCTTTATCCCTGTGAATTTCAGTCTCCCTTTTATAAAATGTAGCTAAGATCACTTACCTTAGAGGAATATCATAAGGACCAACGGAGATAAGCCACATATATGCTTAACCTTCAATAAGTGTTTGCTCTTATTATTATTATTGTAAAACCACAAAGTAGTATCTGAAGAAAGCTAGGTGCTGAAGTAAAACTATCGTTTTGTGGTTTTACATTTTGAAAAATTGTTTTTAAGTAAATCCGTAACCTTACAAATCTTTCAATCCAAATAAATTTTAAGAAATTAACTACTAGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGGAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTAGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGACAATCACTTGAATCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTCCGTCTCAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAATTAACTATTAAGAGATTACTCTAATTAACCCTAGTTGCAACAGCACAGAAGAAAAAAACTGCATGACATATTTAAACACATTTTAATATTATATATCTAATGTCTTATTTCTATAAAGTGGTATCTTGAATCCCTACTATTAGGTTACTGGAGATATTCCCCAACACATAATACAATTTTATTCTATATGAATAGTACGTTAGCATCTAATAAGTCATAAAAAGAAACTTAAGAAAAAAATAGAAAAGCTCAGTTTCCTACCTTGTCAGCACACATTGCCACTTTAATATCTTGTTTTGTAATTTCATAATGCCGTATATTTCTTACATAATTCCCAACCAGCTTTAAAATGTCTGCAGAAATGTATTCTAAGACTGCTACTATGTAAACAGAAACCTGGTGGTCAATTTTATAACCTAGGACCTCCTGCAAAATTAAAAGAAAAGCATGTTTAAACATCATATACTGTACATTTAACACACTGATTAAAAATAAAAAACATATTTGCACCTTAACTTACACTTTTTTTCCTGAGGCCTGTGCTTACCAACAACATTTAATTGTAAGTGGTTCAACAATGAATAATATATGTATTACTATTGAAAATGTAAGCTAAGAAAAGGCAAGGCAAAATTACCTCTAATGATGTAAAATACTTAAGCGGAGATTACAAATAGATAATCCCTAACCTATAAAGGAAGGCCCAAGTTTGGGGAAGGGAGCAAATGCTCTTTGTTACCTAATTCAGAATACCTGGAAGTAACTATAACAAACAAGTTTTTTCTTTTACAAAAAATGAGAGTTAATATATTATTGGTATCTAGGAATCTCTACCAGGCTTATACTTTTAACTTTTCCAAGGGAAGATGAGCTCCCCAAAACCACAGCGGGCATATTCCTGGTATTCCTGGCAATTTCTACGAAAATAAAATTCATGTTATGTCCTACTGAATAATGGTTGCTGTTAAGAAAATGTTAAATAGCCCTAATATTAAACTTCAAAGAGAATATGGGCTTTTGTGGGACTGGTCTGTTCATACAGAATAACAAATTCTATTTTCCAAACAACCCATTTAAGGGAAAAAAACAACTTTGAAATAAGAAGTTTGTTACAAATTGGAGACAGGCTGCATTTACCTTTTAGGGTATATAAAAACTAATAAGGGTATCATGATAAAGGTGTATTAAAATAAATTGAAATGATATTCACAATTAGCACATAAAACTCAAAATTTAGGATTATTAACATAATATTTATATACCTCAATTTGTTAATTCCCTTAGAATACAATTCAACATATGGCCAATGAAAATCATGAAGAGAATGATGAATGCCTTTTCCATAAGGCAGGTATTTCTATTCAAAGAACTGAATGCAAAATACAACCTTAAACTCATTCAAGTGTTTAACTTTAAATTTTGGACAACATCAAGCAAACCTGAACTTTCTAACACTATCACTTAAGAGTCTTGTGAACTTGGCATAGAAGTTACTTAATCACTTTCTGCCTCTGTCACCTCATTTACAAACTGTGGATAATAATAACTTTGTTGAATAATAAAACTCAGACAATGTATACAAGTATTAGCATTTTGTCTGTATTATAGTATGTACAAAATTACTGGCATCTAAGTTTTTAATTATTATAATACCTATATTTTTGTTGTGAAAGGTAATAGTAGTTCGTTACATTAACTAAAATAGAAATAGCATTATTCGAGCTTCCGGCAGTTATTCTATTAGTTCTATAGAGATTCAACTGACTGACTGACTTATTTACATGATAAGTAGGACTGGAGAGTTTAGGTTATCTTTTTGTTCCAAGATTACACATAGCCTTGTAGCCTTTTCACAGAGGTCTCTACACAAAGTACTAACATCAAAAGGATTTATAGGAACACTTAGGTCTAACCAACAAGAAAGGAGGAGTTTTATAAATTCTCTTTGTGGTCCTAATTACATCTGAGATAAACAAAATCCACAATAACTTTCTTAGTCCTCTCAACTTGCTTATTACTATTGATATGAAATTACTTTAAATCATGTTGCCCAGTTTATATTTTCTTATTATCATAGCATCCCTTCTCACCACATAAATCTCTGGAAAACTTAGAATGAGAGAATTTTACTCTTAAGTTGACTCAATTATCCATAAAATATATTCTTATTGTATAAAAATGGTGGGTTTTATTTTTCCCTTAAAAGGCAAGAAGGCAGTAGTTCAGCATTACCTTTAATAAAGGATGAATTTTTTCTACTGGGAGAGATAAAGGGTTTCTTCGCTTCCTCTTTTCAATAGCTGATTGGGCA
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Task1_train_3464
A mutation found in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3465
This mutation is located in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; RASopathy
TGCCACTTTAATATCTTGTTTTGTAATTTCATAATGCCGTATATTTCTTACATAATTCCCAACCAGCTTTAAAATGTCTGCAGAAATGTATTCTAAGACTGCTACTATGTAAACAGAAACCTGGTGGTCAATTTTATAACCTAGGACCTCCTGCAAAATTAAAAGAAAAGCATGTTTAAACATCATATACTGTACATTTAACACACTGATTAAAAATAAAAAACATATTTGCACCTTAACTTACACTTTTTTTCCTGAGGCCTGTGCTTACCAACAACATTTAATTGTAAGTGGTTCAACAATGAATAATATATGTATTACTATTGAAAATGTAAGCTAAGAAAAGGCAAGGCAAAATTACCTCTAATGATGTAAAATACTTAAGCGGAGATTACAAATAGATAATCCCTAACCTATAAAGGAAGGCCCAAGTTTGGGGAAGGGAGCAAATGCTCTTTGTTACCTAATTCAGAATACCTGGAAGTAACTATAACAAACAAGTTTTTTCTTTTACAAAAAATGAGAGTTAATATATTATTGGTATCTAGGAATCTCTACCAGGCTTATACTTTTAACTTTTCCAAGGGAAGATGAGCTCCCCAAAACCACAGCGGGCATATTCCTGGTATTCCTGGCAATTTCTACGAAAATAAAATTCATGTTATGTCCTACTGAATAATGGTTGCTGTTAAGAAAATGTTAAATAGCCCTAATATTAAACTTCAAAGAGAATATGGGCTTTTGTGGGACTGGTCTGTTCATACAGAATAACAAATTCTATTTTCCAAACAACCCATTTAAGGGAAAAAAACAACTTTGAAATAAGAAGTTTGTTACAAATTGGAGACAGGCTGCATTTACCTTTTAGGGTATATAAAAACTAATAAGGGTATCATGATAAAGGTGTATTAAAATAAATTGAAATGATATTCACAATTAGCACATAAAACTCAAAATTTAGGATTATTAACATAATATTTATATACCTCAATTTGTTAATTCCCTTAGAATACAATTCAACATATGGCCAATGAAAATCATGAAGAGAATGATGAATGCCTTTTCCATAAGGCAGGTATTTCTATTCAAAGAACTGAATGCAAAATACAACCTTAAACTCATTCAAGTGTTTAACTTTAAATTTTGGACAACATCAAGCAAACCTGAACTTTCTAACACTATCACTTAAGAGTCTTGTGAACTTGGCATAGAAGTTACTTAATCACTTTCTGCCTCTGTCACCTCATTTACAAACTGTGGATAATAATAACTTTGTTGAATAATAAAACTCAGACAATGTATACAAGTATTAGCATTTTGTCTGTATTATAGTATGTACAAAATTACTGGCATCTAAGTTTTTAATTATTATAATACCTATATTTTTGTTGTGAAAGGTAATAGTAGTTCGTTACATTAACTAAAATAGAAATAGCATTATTCGAGCTTCCGGCAGTTATTCTATTAGTTCTATAGAGATTCAACTGACTGACTGACTTATTTACATGATAAGTAGGACTGGAGAGTTTAGGTTATCTTTTTGTTCCAAGATTACACATAGCCTTGTAGCCTTTTCACAGAGGTCTCTACACAAAGTACTAACATCAAAAGGATTTATAGGAACACTTAGGTCTAACCAACAAGAAAGGAGGAGTTTTATAAATTCTCTTTGTGGTCCTAATTACATCTGAGATAAACAAAATCCACAATAACTTTCTTAGTCCTCTCAACTTGCTTATTACTATTGATATGAAATTACTTTAAATCATGTTGCCCAGTTTATATTTTCTTATTATCATAGCATCCCTTCTCACCACATAAATCTCTGGAAAACTTAGAATGAGAGAATTTTACTCTTAAGTTGACTCAATTATCCATAAAATATATTCTTATTGTATAAAAATGGTGGGTTTTATTTTTCCCTTAAAAGGCAAGAAGGCAGTAGTTCAGCATTACCTTTAATAAAGGATGAATTTTTTCTACTGGGAGAGATAAAGGGTTTCTTCGCTTCCTCTTTTCAATAGCTGATTGGGCATCAGCTATTGCCCATTTATCAATTGGATGAGGGAAACTTTTTTGAACACGTTCCTTGGAAAATAGGAAAATAACAACTAAGCAAAAAATATATTAAATAGTGCTCTTCACTTAAAATTTACTTTTAAAATCAAAGAATACCAAAAGTAGAGCTTTTCACATGTGGTATAATTTACATTACAAACATATGAAGCTAAGAGAAAACAGTAATTGTCAATGTATTAGTTCCTTAATTAGACAATAAGAGACTAAACATTCTTTCTATTATCTAGGGGGAATATCACATCCTGAATTTCAACTTCACTGTGATAAAGCTAATTACAAGAATGAGTAGAAGCTACTTTAAATAGTACTTGTATAAAATTTCAAGGAACAACACCCAAGATCAAGAAGTAAATATCTAAATCCAGTTCTCACTCACTTGTCCTTACTTTCAGTGGTAATTACATGCAGCATTTTTCAATTGAAACCTCTATGAATATTCTTTATCCACCATGCAAAGGCACTTCAAAACTATTTACAAATCATGGAAAGCAATGGTTTGCATTGGTGACAGCAATTTTAATACATTGTAGTTTCTTTAAAGTCCTCCCATAGTCATTCGTTTTTAACAAAATACTTCAATTTAATTTCCAGAAATTCTTTAGTTAAAATTTCCACTGAGAGTGAAAGAACTCAGGTTACTATCACAGCTGAATTTCCTTCCTTATTAAACTAATATAATTCACTTCAAAAAGGCGCTTTCATCCTCTCAAAACTTTAAAAAATCCACTTGCAGGATACCATAACTAAAACCAGTAGAGGTCGCTATTACATAACTTTTACACATGTGTTTTGAATAAATGAGTATTCAACTAGTATGTAAAAACTACTAGATGAAATTAAACATCATCATAATTATAAATCTGAATAAAAAGTTTTATTATTTGCTAGTAAAATGGAAAATTAAAAAAGTGTGATGCCATGTGATGCCCTTGGTGGTGAGGGAGGGGTGGAGAACACAATGATTCTTGGAAATCTTAAGAGCAAATCTATAAATTAAGGAGTGTAATCCATTCAATTTTAATAAATTTCCATTATGTCCAAGGCTAAGTCAGCTTCCAAATAAAGTTATTTTAATTCTAATTAATGGAATTAGAAGCATGTTGAAAGAAATTATAGCAGTTAAAAATGGGGTTTACAAACCTTTTCAACTGTCTAGTTGAAAAGCTGTTTGCCAGGACACCAGCCTCATGCAGTAAAACGCAATACAAAGGCCCAAAATATTGAGGAGGCATCGCAGGTGAAAAGGGAGAAAAGGGAAGGGGTAAAGGGAGAGAAGGGAACATCCAAAACAAGAATTCTTTTCTTTTTTCCAAGTTTATTTTACAGACTTGTTAATCCAAAAATGACAAGATATTTAGGACTAACTTACGTGGTTTTCAGTTAAAATGTTTATAGTGATGGGTTTAACCCATGATTAACTAAGTGCAACCATGGTACAAACCTAATCATGTTATGACCCTGTGGCTTTCCAACATTTTTTAAAACCTCAACTCATAGTAAGAATAAATTTTCAACACATTTTTACATTATACCCTTACATACTGCACACATACTCAAATGAAACAGTTTCCTAAAACAAACCTGTCCTTATTATATGTAGCACACTGGCATTTGCTATTCTGTTTTTTATTTGTATATTTATTTATTCTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCGCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGTTCACTGCGACCACCACTCTCAGGTTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGCATTACAGGCGTGTGCTACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCCCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCCGGCCTGTTTTATTTTTTAAAATGAGGGTTGGGCAATGCACTAAAGTAATTTTATGACTTACTAATGGCCATGACCTGGAGTCTAAAAACACT
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Task1_train_3466
A variant was discovered in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3467
The gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Fibromatosis, gingival, 1
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Task1_train_3468
With a mutation on Chromosome 2 in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_3469
Here is a genetic alteration in HAAO (3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Congenital NAD deficiency disorder
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Task1_train_3470
The gene HAAO (3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Vertebral, cardiac, renal, and limb defects syndrome 1
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CACCAACTCTGCACCAGGCTGTGTGCACATACTCTATGCACATTGAATTCTTCCACCAGACAGGGGCTGTTGTCCCCATGTGCTTATGGAAACAGGCTTGGAGAGGTGACATGATGTGCCCTGTCCAAGATCCCGGGGTTAGTAAGCGGCAGAGAATTCCCCCAATGCAAGTTCATCTGCCTCTGGCCCCCCTGCACCTGCACGCTCCAAGAAAGGAGTGAGGTAGGTGGAGTATAGGTGGTAGGTGGCGCTGGGGAGTGGGGAGCCGGGCCAGGGAGCTGGAGGTACCCTGACCGCTATTGCAGAGGCAGAGCTCAGTGAGGAGGAAAGTGTGGTTTGGTAAGAGGTGTGATTTGAACCCAGGTCTGAGCAACTCCCCTTTTCTCACTATTCAGGAGGAGCCCGGACCCTGAGTTACGCCACTTCCACAGCGCATCCTGGAGTCTCCCCAGGCTCCAGCTGGGTGAGGATAGGCAGGGACAGAGAGGAGGCCGACCCTCAGCCCTGAGGCTGCCCAAGTGCTGCACCACCCCGCCACCAAAACCTCAGCAGGGTGGGACCAAGCCCTGTCACAAGCCCACCTCCAGCCAGATTCCTCCCAGACACCTGGGCGTCCCTCCAGAGTGAGGACACCTGTGCTGGCCAGCTCTCCTTATCACTCAATCCCTCAGCTGCCATCTGAGTCAGGACGTGAGCTGCTGGCCAGGCCCCTCAGGGGACACTCAGGCACCTGAGCTTGGAGAAACCATGGGATGGGGCATGGAGCAGAGGCAGCAGGGGGCGAGAAGGGAAGCAAAGACAGAGGGAGACAGGAGAGGCGGGTGCTGAGACCAGGGCCAACAGAGAAGGCAGAAGCCTCTGGAAGACTCCGCAGCCAGCTGTGCCTCCCATGCCATAGCCATGCCAGGTCTACCCACCTCCTCAGTATAGTTTTAGATTTTCCTATTGACTTTTTCCACCAAGGAAACGGTCTCCAGTGAGGTGTGTTTGTGAGAAGGGGGTGGCCAGGGGAGGTGCAGGGCCCCTGGAGCGTGAGAGGTGAGGAGTTGGCTGGTTCTGCTGGCCCAGGGCCCATCGTTCCTCCACACAGCCTTGGGTGTCCCAGTGCACACATGAGGTGCTCAGCAAATATTTATTGAACAAGTGATTCTCCCATGCTCACCACAGTCCCTGGCTGTGGCCTGGATGCCCTCAGTGGGGACAGAGGCTGTTGATCAAGCTGGACTCTGGATCCTGAACCCCCAGAATGAGGCTCCCTGAGAGGATGGGGAGCCCCTCTACTGATCCTTTTCCACCAGAGGAGATTCTGTGTCTCTCCTTAAGGGGACACACCTTTCTCTTTAAATTTTGCTTTTGTTTATTTATTTTGGGGTAGGTAGTAGAGAAGCACAGTCCAAACTTCAAGGTGCAAAAGGTGATTCAAGGCAAATTCCCCCTCCCACCTGCCCCAGCCACAAGCCACGAATGGGTTTTGCAGCCTCTAGTTAAGGAAGGGCCACCCTGCCCCAACTCCTCCTTCAGCTCCAGGCACCTCCCTACCATGCCTACCCCTCAGCCACTAGCTCCTCCTCCCTCAGCCCCTCGAACTCCCTCTGCCACCCACTCAGCCCAGCCCTCACCCACGGTGTTTTTGCACTTTGCCCCCGTCTGCGGGGGAGGATCTCATTTTGGAGACCAATTGAATCTGTCAAGTTTGTGGGGAGGGGACCAGGACGTCCCCCTTCACATGGCCAGCCCCTATATCCAGGGGGAGGATGCCCCATGGCTAAAACCTCTCACCCGCAGGGCATGGGTTGTTTCCTGGGGCTCCCCCAGCAGAGGTGCTAGCTGTGGAGGCGTCACTGCCTGACCACCAGCTTGGAGGCAGCAGTCGTGCCCTGTGATTTCAGCTGTGCCCCCTCCACTCATCAGCCACATGTCCACCCCTCTCCAGTCCATCATCTCTGGGCCTCGAGTGGGAAGCGCCCCCTCCCGCTAGGGCCAGGCTCCTTGCCCGCAGGCCTAGATCCAGGGAGACCAGTCAAACCTACCTCTTCACCCTCTTCGATTTGATAGTCCTTCCTGGTGTTGGGGCCTCCGATGAACATGACTTTGAGCTGCTCCTGGTGCCTGCAATGCGCAAAGTGGGGGAGACGTTCTAAACCATCTCCTAGGAGTGAAGAGAGCACGGGTCCCGTGGGGGCCAGGAGGGAGCCTGAGGGCCCCTGGGAGAGGAGCAGGGCTGTTTTGGCCTCACTGTCCCTGTTCCCCAACTCTCATCCCCGGTTCATGCCTGCGTGCATCTAAGTGTCTATGTGTCTGGGATCGTGTCTGTGTGTCTGTCTGTCATTGTTTGTGTGTCCCCCCACATCGTCTGACCCAACAAGGGAAATGATGTGGTGGTGAATCTATGGCTTCATCAACCAGGATCACAGGATCAAGATCTCGAATTACAGGAGAGTAGCAAATTGAAGACCCCTTCCCAGGATGGGGCAGTGTAGGGGCAAAACGACCTTGACCTGCCACTCACCCATGCTGTCTGACTATAGGACCCTGCACTCTCCCCTGGCTGGAGGCATGGCTCAGTGGATGCAGGAGACCGTGACATCTAGCAGGGGCCTCAGGCGGTGTCAAGTCAGTGTGGCATGTGTTTATAAGCACAGGCCCTGGGGCATGTTACTAACCTTATCTGTAAAATAGAGGAACAGTTCTTACCTCACAGAGTTTAAACAGAATACATGAATTAATATTTGGAAGCTCTCAGAATGGTGCCTAGCATATAGTAAGCACTATTTAAGTATTTGATAAAATAAATAAACCCGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCAGAGGCGGATGTATTGCTTGAGGCCACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCCTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAAGCACGAGAATCGCTTGAACCTGAGAGGTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCTACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGGGGGAGACTCTGTCTTAAATAAATAAATAAATAAATAAACTCAATACAACCCTCTCATTTTACAGCCGATTTAGCCAGCCAAGAGAGGGTCACAAAGCCAGGGAATGACTGAACCTGAGCCAGGTCTCAGGCTCCTTGACTCCCACGCTGGCGTTGGGTCTGTGGGGCATCTAGTCAGCTGTTTGGAACAAAAGGGTTCCCAAACTCCTCAGTCTTTCTGCTGTTGGTGTGGTGTTACCTTTTTATGCAAAAAATACCTCAGCACCTCCTGAGAACAGCCTGCCCCATCCCCACAGCAGGGTCCCCTTTCAGGGTGCAGACACTGGGGTGAATAAGCAGCAGAATGTGTCTGTGTAGGGCTTCAGGGTGTTCTCAGGTGGCCCTGCCACAGAGGGCAGGGGCAAGGGCTTTCCTCTGGGAAGGGGAGGCGCTGGGTCTGGGACCATTTGTACACACAGGGCACAGCAGCCTAGAGGCTGCCTGCATGGATGACGATGGTGTGGATGGCAGGGGAGGGGCTATGGGGGAGGTCTGAGCCCCCAAACTAGACTGGCAGGTCCTTTCTGAGTGTCCTGTCCTGTGGGCTGCTTTCCAGCCCAGCTGGGAGGCATGGAGGCAAGACGGAAGAGCCAGTCTCTTTCCTTTTCCTTCCCTTTTGGGAGGCTGGGCCCAATAAACCGGAAACACACGTGTGGACCTGATGTTTGGAAAGGTGGATGAGGTTGCAGGGCAGGAGAAGGCTGTCATGAACAGTCCATGCTTAAAGAACTTAAAGCTGCATAGAGCTTCAAGGAGGGGAGGGAAGCCGCAAGGAACTTGACTGGGGAAGAGTGTGCACAGGAGAGCTGGGTGCAGAGGCTCTGAGATTAGAAGCACTGGGGGTGAGCTTGGGGAACGATTGAGAAGGCTGGTCCAGGAGGGTGGACCAGCCATGGAGTCTGGTCTTGGCCTAAGGGGTGCTGGGGAACCTGGAAAGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGATAGAGTCTTGCTTGCCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGCAC
Task1_train_3471
This is a variant in ZFP36L2 (ZFP36 ring finger protein like 2), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Oocyte maturation defect 13
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Task1_train_3472
This variant affects gene DYNC2LI1 (dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; not provided
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TACATCCTGCACACGCCTTTACCCTTCTGCACTGTTGCTCATTCCATCCAGAAAGCAGCATAAAATTGTCTCCTTCTCCTTCCATTCTTACCTTAAGAACAATCTTCATCTACCCAGGAAAGTCACTTTCTTTGCCCAAGTATGAAGGCCTCAAGAGGAATGAGGGAAGAAAGGGGAACTCACCTGCTCAGTCAGATCAACTGAATCAACCCTGAATCAATGCTGCTGATCAGGGCCCAGCCGGATCACCTTCACTTTCCTGGTTACCAAGCTCCCTCCTTCAAACACCTCTCCCCGTTATTCAAACAAGTGTACTTTTGAAGTACTCGTACTGAGTATTGTGCCCAGTACATAGCAAGCACTTGGCAAAAATGTTAGCTGTCGTTATTGCTATCAATATCAACAGGCCTTCCTAACTAGCATGCAAAAGTATTCTGAAGTTCTAGAACCCAAATCATTACAATTCATTACAATCTGTCCCATATCAGTTTGTGAGCTTAAAGTCTGGCTTAGCACCAGGCTATAGCTGTTGATTCAATGACAGATGTATAAGCCTCCTTTGAAAAATCATCCTTTCTTCGGTGAGCTCTACTCCCATTAATTCCCTTCCTATGTGCAGCTTAGTGTTCTTTACGTCTCCAAAATATACCTAGGTGTTGGGAGGATTTTGTTCCCAATGACTTTATTTGAAATAAACACCCTTTTATCAACCATCAGCCTTGTTTCCAGGAATGTGTTCCTTGTGTTTCTTTGTTCGAAGTTGCTGACCAGCAGCTTATCACACAATAATAACAAGCATTAAGCAGTTATAATGTGTCAGACACCCACGTAAGTTATGTTTTACCTACATTTATCTCATTTAAGATTCACAATCTTTCCCGCTTTACAGGATCAGAAATTCAGTGATTTACCCGATGTGGCAATGTGACAACTTAGCCAGCGTGGCCAAGTCAGAACTTGAACCTAGGTCCATCTCACGCCAAAGCCCATGTACTTGAACATCGCACCATAGAAATCAAGCCGAATAGTAGAGGACTGGAGGGAGGGTATCTCCTTCAAATATTCAGGGCATCTTAGGCTAGAAAGCCTGAGTCTACTCAGCATTCAATACAGACCAAATACTATCAGTGCCATGGTTTCACCATCTCCTTCAGGCATAATTGGTCACTTGCCCTCATGCAATTTTTGTACCTCTATACAATAGTTTAGATCACTCACTTCCTTAGGTGCTTATAATTAGCTGAGTGTGTGTCTTTCTTAAGGGCAGCGATCTTTTCTTACTCATCTCTTTATTCCTTATTCTGTGTAGCATAGGGCCTTGCATATTCAATGATTGTTATTTATTTCAATGCTCGTTATTTATTTGGACACTCCTGCAGATCTATAAAGAGACCACAAAGTTCCAAAAGAAAATAATCTACATTCACAAAGTAAATGAAGTATGTAGGAGATGCACTTGCTTCATTAATTTATTAATAAATACACAATGTGCTATTGAATAAAACTTGAAACAACTAAACATCTAGAAAGTTGGAAAATATTAAAATTACGTGCCTTATTTTAAATTTTAAAGTCCGAATATTCCTTGCTTCTAGTAAATTAGCAGAAAACAGCTCAAGAGATTGTTACACCCTCTATTCCTAAATCATGGCGATTGGGAAGAAAAAAGTGAAAGATGAGAGAGAGAGAGAGCAGAGACCCTTGGCATATAGTTGACACCCAGTAAAAAAATTTTAAAATAAAAGAAAATTGCTTTTAGATCCCAGGTTTGTAACCCCTTATCATCTCGTTCTAGGAGGTAACAAGGAGTTACTAACTTGGGATCTAAAAGCAATCCTAAGGCTTGAGGCCGAGAATGAGATGTAAAAGGACTCCTGAAAACTACATTTCCCATGATGCCCGTCTCCCCACGCAACCGCGGCCGCGACGTCGCTCCCATGGCAACCCAGAAGGCCTCACTCCCAGACTCCTTGCGGAGCTCGCCGCCTGATTCTAGGCTGGTCACTACTCCGAGCCTGTGACGTTTGCGGCAGCCAGGCCGTCGACGACGCCCAGGTATTCCCTGAACCCGGCTTGCGTGGGAAAGGCTACTGAGAGTATTCCTGGAGAGAGGAAGCCCAGGCGGGACCAGCTGTTGGAAGATTGTGGGGGTGGCTACTTGCCACCAGGATATGCAGGGTCGGGGACCTAGGAATCAGCCTTGAGCATAAAGATTCTGCCGCAAACAGGAAAGAAAAGAAAGTTCCCTAGGTAGAAAAGTGAGAGATTTGGAAAGATCAGCAACTCCACCCATTCAATGATTGAATAAAAGTTTCTTGCAGGCCAGAGACTACTTCCGGAGCAGGACATTCGGCGATGAGCTAGACCACAAAGCCTCCTCTCCCCAGGGGCCTCCCCTCCTGGTGCGGGGGTTCGCAGTAATAAGCGAGGGGAAACTTGGAAGGCACTGTGGAAAGTATAACATCACTTTTAAGGGGGGAAACGGGAGAGGGTTTGTAAACTATATTCTAGCTGTTCAATTCTATGATATTCATTTTAATTACCTGTTCACAAGATATTCCTAAACCTTTTCTCAACAATTTATGCTTAAGCACGTCGGGGAGAGGGGTCAGGGAGTGCATCACAGAGCAGGATAAATCTTTTTCTCTCCTTGGGATAGTGTGGAGAATTGTCAGCTTTCCATCAAGGGATAATTGGTTAGTTATAAAGCTATGGTTATACTTCCCGATTTCCGCAGGTGTCGTGGCTGACTGCAGCACCTCCGTCTTTCCTCTCTGCTAGGTATTTGGAAAGCAGATCCTCATATTTTGAAAGAATGTTGTGTAAATGAAGAGCAAACAGCCCGAAACTGAGTTCTGAAGGCTCACCTGTGAAATAAATGCATGAATTTTAGTGCAAACATTTAAGGACTCCTGTTTTGACCCTTTTTCTTATTCCTGGTTCTTGAATAGTATAATTACAAGCCCTCAATAATTTTTGTAATTGTATAGGCCATGCCCTAAACTACATATATATTTTAACAATTATGACAATCCTATAAAGCTGATACTCTTTTTTATTGGCTTTTTAGAGATAGAGAAACAATTGAGCCTGGGGAATAGCACAGAGGATTGCATATATTAGGTGCTCAATAAATATTTGTTTAATTAATAAAGGAATGAAGGATTTAAAGAGGTTAGGTAGTTTTCCCAAGTTCACATACATAGGAAGTAGCAGAATCAGGCTAGGACCTATCAGGTCTTGCCCATGGTTAGTTTTTAGTTTAATATTCCATTTTCACTTAGGCTTTAATTAATATATATATGATTTTATCGTGTAAAGTTATATATCTGTGTAAAGAAATCAATGAAAGGATTGTTTTCAAAATGTTTGTGGTTTTAGGGTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTATGGTTTTTTTTTGGCGGGGGGAGACAAGGTCTTGCTGTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTCAACATGCTTACTGCAGCCTCGACCTCCAGGGCTCAGGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACCACGAGTGCATGTCACCACACCCAGCTAATTTCTTTTCTTTTTCTTTTTTTATTTTCTTTTTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCAATACAACATCCACCTCCTGAGTTCAGGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAGTTACAGACACCCGCCACCACACCTGGCCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCACTCCCAGCCTCAGCCAATTTTTTTTGTTTGTTTTCTTTTCTTCTTCTTCTTTTTTTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGCACAACGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTTTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACATTAGGTATTTCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCATG
Task1_train_3473
The gene DYNC2LI1 (dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1), on Chromosome 2, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; not provided
TCAAGGATTATGGTTCTACATACTTATTATAACCATTTTTAAAAATACTCCTAGATTTACAAATGTTTAGTTTTTATTGTCGTAAAATATACATAGCGTAAAATTTTAGTCATTTTTAACTGTGCAGTTCAGTAACATCAAGTATATTCTCATCACCATACATCTCCAGAACTTTTTGATCTTCTCAAACTGAAACTCTTTACCTATTAAACAATAACTCCTTGTTTTTCCTTCCCCAGCTCCTGGCAACTATCATCCCTACTGCCTGTCTCTATGAATTTGACCACTCCAGTACCTCATATAAATGAAATCATTCATTATTTGTCCTTTTGTTATTTATTTCATTTAGCATAACGTCTTCAGGGTTCTTCCGTTTGTAGTATGTGTCAGGATTTCCCTCACTTCTAAGGCTAAATAATGTTCCATTGTGTAAACAAATACCACAGTTCAGTTATCCGTTAATCCATGCAGAACATTTGGGTTGTTTTCATCTTTTGACTATTGTGAGTAATGCTGGTATGAACATTGGTGTACATTATCTGTTTAAATCTCTTCCTTCAGTTCTTTTGGGTTTAGACTCAGAAGTGGAATTGCTGGATCATCTGGTAATTCTATGGTGAATTTTTTGAGGAATCACTATACTATTTTACACAGTGGCTGCACCATTTTACATTCCCATAAGCAATGTACAGGGGTTCTAATTTCTCTGTATCCTCACTAATACTTGTTATCTTCTCATTTAAAAAAATGTTTTAGGCCAGGAGTGGTGGCTTACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGATGTGGTGGTGCATGCCTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTACTCCAGCCTGGACAATAGAGACTCCTCCTCCAAAAACAACAACAAAAAAATGTTTTGACAATAGCTAGCCTAATGGATAGGAAGTTGGACATCTTTTCATGTGTTAATTGGCCATCTGTATATCTTCTTTGGCGAAATGTCTATTTGAGTCTTTTGCCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAATATAGTTGAGTTGGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAAGCTCTAGAATTACAGACATGAGCCACCATCCCTGGCCTCTTTGCCCATTTTTGAACAGGAATGTTTGTTTTTGTTGCCGAGTCTAGGTTTATGTTTGATGGGCATGAACAGAATACAAGTGCATGTGGTGATGGTGGTCATGTATCTGGTGGTCAGGAGTGTGCTTTCAGAGAGACAGAATGGTATTGCAGAAAAACGTGTAACTTTGGATCTAAATACCAGTTCTACAATTTACTAATTATATAAATCTGTGCCTCAGACTTCTAATCTATAAAATGGACATTATAACATCTTCTGGAGAGGGTTATTGTGGAGATTAACTAGGTAGTTCCCTAGCAAGGTCCACCCATATATCTATTTTCTTCTCCTTTACCTGATTATTGTGTTACTGTTTTTGCTTCTTTTATTATTTTTGCTTCCCTTTTTTGGAGCACACAGTAAAACTGGATGTAAACGTGGCATTGTCGATGCAAATGCTTGGAGCTTCTCTATTTGAACTAAACTACTTTTAATTTTAGTTCAAACAGAAACTTAGTTCCACTATTGTAACACTTAAATATTACTAGAGGAAAGTATTGGAATAAATAAGGCTATGACTTTGGTTTTTTGTTTTTGGGAGTCTTAGAATAATGCTACGGTTTTTTTTTCCCCTTAAGGTATATTTTAGTTATTCTTAGATAAATTTCAGTACATTAGGATTTCAAAATGGTAATTATTTTGAGTCTTTTTTGAAAAGTGTTTTTATTTCTTTAGGACGTTTTCTCTTGTTCTCGTTCTGGATCTTTCAAAACCTAATGATCTCTGGCCCACCATGGAAAATCTCTTGCAAGCCACAAAAAGCCATGTAGACAAAGTGATAATGAAACTGGGAAAGACAAATGCTAAAGCAGTTTCTGAAATGAGACAGAAGATCTGGAATAATATGCCGAAGGATCATCCTGTGAGTTGCTGTTTGGGATTATTACTGGAATCCTTAGTCCCATTTATAGTTAATGATAACATCACAAACAACTTCTTTAGATTTTTATGCATGACTTGAAATTCATTTGATGTAGATGAACCTGTTCACTGGAAAATTACAGCAATTTATTAAAACCTCAGTAAGAGCAAAACAAGGAAGAAGATTCCTTATATCTTCTTGTTAGACATCTTCTGTGATTGTTATGGCATATTACACCAATCAGAGAAATAGAGTTTTAAAGTAGTGGTTTGATATTGATTTTATAATCTCTGTAAAAATGAAGATAAAAAGCCAGATTGTACAAAAGTCACCTGACAAAGACTAGATGAAGCTACAACTTTAAGCAAGGGGTAGAGTTGTAATAGCCTTCACCATCACTCTGTATTTTACATTCATTTCGTTTCTGTCACTTATTCAGTATCTTTTTATCATCTGACAGCTAATTAAATTATAAAGTTGCTATGATGGTAACACAAGTTCTTCAAATACAATAATAAATATCATCATCTGGAAAACTGAGAGCAGCATTTTATATTATCCAGAGTTTATAAGAAAGTGTAGCAGGGTGCGATGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGTGGCCGAGGCGGGCGGATCACGACGTCAAGAGATCAAGACCATCCTGGCCGACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTTAAGATACTAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTACACTCCAGCCTGACTCCAGAGGGAGACTCTGCCTCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGGAAGTGTTTTTCATAGGAAATAATGGAACAAAACAAATCTATGCTGGATAAATGCTGTTCCAACAGTCAACATAAAATAGAATAAAAAAAAACCAGGAAGGTAATATGTTATATAAGGAAATAAAAGGGTAGAAAAAGGAAAATAATAAATATCATAGTAATTTAGGGAATTGCCATTTCTAGTTTTACACTTATGAAATATAGCTTAGGAAGTGAAAGTTAAATATTAGAACAAATTCTATGTCAAGCAAATTAAGTAAACATCTATGAAGAGACTGAAAATGGAATGTTTTTGGAAGTAAATAGAAATTGCTAAGCACCTAGCAATAAAGAATTACAACAACTCAAGGAAATATGTTTATTAGCAGGATCATGAATTAATTGACCCATTTCCGGTACCTCTGGTCATAATTGGAAGTAAATATGATGTTTTTCAGGTAAGCTCTTCCGCTTCTAGCTGAGTTTGTTGTACATATATGGCTGTGCTTTTTATGAGGGAGGTACAAAAATAATATCAAAATAAGAAAAATAATTATTGAAGGAATCGGTTAAGTCATGCATCTTAAAGATTTTGGAAAAGACATAGTTGGGACAGAAAAAAATAGGTAAAGAAAATAAATGCAGTGATTAGAATGGGGATAAGGCAGATTTAGAAAATGAATCTTGCCGGGCACAGTGGCTTATGCCAGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGGGGGAGGATCAATTGAGCCCAGGAATTTGAGGTTACAGTGAGCTGTAATCACACCACTATACTCCAGCCTGGGTTACACAGTGAGACACTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTTCAACCCAGTCACTGGGGAATATGACTTACTTCCCAACTTTTAAATGGAAGAAAGTAGAAAATTAGTTCCTTCTTATCTTTGCTTGTCAGAGAATCGTTAGAATTCCACACTATGAAATGTGTGCTTATATCTAAATTCTATTGAGCTAAGTATTTAAACAAAGAAAGATCTGTTAGCT
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Task1_train_3474
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting DYNC2LI1 (dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_3475
This variant affects gene ABCG5, DYNC2LI1 (ATP binding cassette subfamily G member 5| dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Sitosterolemia 2
GATCCCATGTTATTCTGATTCCCCTATCCCTACCTTGGTCTACTCTGGGAACTTCCTCTTTGACTTATCCAAATTTTGGCTGCATTTTCATCTACTCTCAATCTGATGTTTTTTGATGGTCTTATTTACCACATCCTAAAATAACCATTTTTTGAACTTGATCATCATTTAAGTAACTGCCCCTCTTCATCCTACCCTGTAACACCAAGTTTCTCAAAACAGAATCTGCTTCCTCCATCTTACACCTTCCCTTCTTGTAAACCTGACTTGCACCCCCATGACTCTACCGAAGCTCTTTTTTGGGAAATTGCAATGGCCTTCTCCCTTTATGCTTCACCTCCTTTAACCCCTGCAATATTGAAGTGTTTATGACACTTCCTTGAAACTCTCTCCTTCCTCATCCTCTCTGATGCTGCCCAATCCTGCTTCTCTTTCTACCTCCCTGATCACCCTCTGCCTCCTCTGTTGGTTGCTGTCCTCTTCCCACCCTCTGAATGTGTCTGTTTTAAGGTTTTACATTCAGGCTGCTTTCTCCCCTCCCCCAGGCCCCCCCCCATGCACCTGGGTCCTAGCTACTTCAGAGTCCTCTCTTCTCTGGCCCAGGCCCTGCCGTGAATGTGGGACAGGTCATTCCCAGGCACATGTCATCTTGTTGGTTTGTTCTCAGGTCTCCTGCAACCCACAGTTGGGCTATTTACAATAAAATTAATGTCCTGGAAGATACGACATTGCACTAGACACTGATGGGCAAAGTGTAGATCCTCCAGAGCAGAGAACTTCACCCTGGAGCTCTCCCTGCACGAGTCCCACTAGCTCCATGACTCCATGGGAGCCCGGCCCTGGGTGAACTGAACAACCCCTCACCAGTAGCACACACTGCTGAAAATCATGGTGGCAACAACGCTGAAGGGGAGGACGTGCAGTGCATAGGCCAGCATCATCTGCCACTTCTGGTAGAGGCCGTCCTGACTCTCCTGGTCGCTGACAGCTCGCAGCACGGGAACTGGGGATGGAAGGCAGGTTTCAGAACAGTCAGTCACCACCCAGCTGAAAAAGGGAGGGCTAGCCCAAGCTGAATGTGAGGTCTGTCAGGGCTGGATGGTGAGGACCAGCTAGGGGGGTTCCCTAGTCATAGAAGGAGGGGACCTGCCATCCACAGGACAATAAATCCCCACCCCGGAAATCTACACTCTACCAGAATTGCAATACAATTGCAAAAGATGTCATTTATTTCCTTCTCTCTAAAGTGGGGAGTTGTCACCAATTCACGAAAAGTACATGCAAAAGGGGCATGAATAAGTGATTTGAAGCACTTTGTCTTCTTTCTGTGCAGGATTCCCCCCACCCCACCCCGCCCCCACCACCAGCAGCCTGCATTTTAGACTTGCTCTCGGAAGGCCAGGCAAACCCCACAGATGCAGACACTTAGCATTGCCCCTCATGTCAAGCTCTAGAGCAACTTCACAATAGCGAAGTCCTTCCCTCTTATTCCCTAACAGTGTTGCCTTTGGGGAATCCCTCTAACACCTGCTTCCTGCAACGTTAGGCAACCAGGTTTTGTCTCTGGAATTCCACTGAATTTGAAAATTAGGTGCTGGCTGTCCTAAAATCAGCTCCAAAGAGAAGCTAACGGTACAAAGTTGGCCTGGTCGCTGAGCACCCCATGGGCTGTGCATCTGAGATGGCCAAGATGAGATAGGAGGAATGATCTTTTGAAAAACTCCTCAAACTCTCCCCACCAGTACATTGTCACTTCATGTTTCCCTGGATCCTTAGCCCTCAGAGAGATCCACCTGGTGAGCTCATTCATATTAACGTGTTGGTAACTCAATAGTTGCCTTTCCCCAGAGAGGGAACCTGGAGAGGGCTGGGTTTAGCTCAGAGAAAAACCCTTATAATGGTAGACTTTTGTAAGGTTACAGCTGGAGAAGGGAGGTATTTAGGGAGAAAGAGGTGCACCTCCAGCACGTGGGCACTTACACAGATTCACAGCGTTCAGCATGCCTGTGTACGGGGTGGCGCCCACAAACTGGTAAAGGAGACCTACGCGGTCCTGGATAGCACCCTTTAGCACATTGCTTCGGACCCGCAGAACGAAGAAAAGGAGGAACAAACCCATGATCAGATTCTGAAGGAGACGCGTAATCACTGCCAGCTTATTTCTCACCAAGTTTCTTGTCACTCTCCTGAAAACAAACAACCCTGTTTTAATTCCTTTTCAGAATTGTTATTGGGGGATGGCTAAAGACCTCTAACAGGCATTTCTCACATTTGTGAGCCTCTTACCTCAGGAGAACACCCAGTTTAGAGAAAACTCCAGGAGAATCTTTGGTTTTGAAAGGAACCATTGGTAACGTTTTCAGGTGTTTCATTCTTTCAATATTCTTCAAAGTTTTATGACAAATTGCTGATTTCTTGTAGGCAGATTCTATCATCTGGACTCTCTTGGAGGTTTCTATTTCCCGTTCCTTGCTTTGGGTATCCACTGACGTCAGGTCCACTAAAAGTTTTTCCCAAAAGATGTCACCCATGTGTTTTTAAATGCATGTATGTACATGGATATACAATTGGTACAGGAGTACTGGCCATAATACCTCATCCCATCAAGATAAAATTTGTGGTTAATGCCCACCTATAAAATCAGAATACTTTAAAGCATCCCAGCAGGGCCTTGAGGATCCCATTGGGATTGTCTGGGAGAATTCAGAAGCTCAGCTAATTATGCTCTGATAAAGTAGTAGCAGTGCGCCAGTTTGTTTGAGAGAGATCCCTGACCTCATTCTGATAGTCATCTCTGGCAAGTTCATTGACCCGGCCAAATTGATTCCTTGAAGAGTATAAAACACAAAAACAAAAGCAAAAATCAAATCCACTAGACTGGTGTCATCCAGGCAGAAGTCTGAGATGAGAAAGTTTAAAAAACATTCATGATGGGGAATGTGAAAGAAAAACTTACTATAGAAGTCAAAAGGGTTTGAATGTTCAGGACAAGGGTAACCGCAGTCATTGAAGAAATCAAGCATTTCCGCTGGCGTGCCACAGAAAATCAGCTCTCCGAAGCTCAGGATGGCAATTTTGTCAAAGAGCTGACCAGACAACAGACGTAGTTAGTGTGTGATCACAAGGGTAGCGATGCACTTTGAATGTCTCTGGGAACACTGATGCAGGGCCAAGGTCAGGTATTCCTTATGGTCACCAAGTCCTTATGGGAAATGCATTTCCCATAAGCAGTCAGTCCTTCGATGACCTTGGCCCTGCATCAGTATTCTTGGAGACATTCGAAATGCATCCCTACCCTTGTGAGCCTAGGCTACCACTGTGGGTCATGCTGCCTCCCATCCTGACGCCCAGCTTCATATCTGGGATAGACAAGCATGACTGGACCTGGGCGTAAGTCCCAGCCAAGCCAAGTGAGTGACCTCGGGCGAGCAGGGGTGGGTCTTAGTTTGTTTTTTTGTTTTCATTTTAAATCTCAGCTCCTCCTCTGTAAAAAGCAAATAATAGCTAACTAAAGGGATACTGGGCGGAGAAAGTGAGTTTTTTTGGAAGGAAATCAGTATGATTTCGTGGAAAAACACAGCCTTTGAAGCCAACTTGGCTGTGAAAGGCTAATGCTAGCTTTTTACTATTAACAACTGTGTGATCTTGGCTTAATTTGTTGTTGTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTCTGAGACCGAATCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCCCAGCTCTCTGCAACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGCGCACACCACCACGCCCAACTATCAATTTTGAATCATTGCTAAGTTTCACTCTTTTCCTCTGTAAGGTGAATACACTGAAACACACCTCATAGGAGTGTTGTGCAGATGAAATGAGCTATGTACAGAAAGTATTTGGAACATGGTAGGTGCTGAAAGAAGTGAGTTTTCATCCTTTGCTCTTCCCCTCTCAGGAGCTGTTGGCTCCAATTCTCTAGCACTAACGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGAGATGAGGTCTTCCTCTGTCACCCAGGCTAGAGT
GATCCCATGTTATTCTGATTCCCCTATCCCTACCTTGGTCTACTCTGGGAACTTCCTCTTTGACTTATCCAAATTTTGGCTGCATTTTCATCTACTCTCAATCTGATGTTTTTTGATGGTCTTATTTACCACATCCTAAAATAACCATTTTTTGAACTTGATCATCATTTAAGTAACTGCCCCTCTTCATCCTACCCTGTAACACCAAGTTTCTCAAAACAGAATCTGCTTCCTCCATCTTACACCTTCCCTTCTTGTAAACCTGACTTGCACCCCCATGACTCTACCGAAGCTCTTTTTTGGGAAATTGCAATGGCCTTCTCCCTTTATGCTTCACCTCCTTTAACCCCTGCAATATTGAAGTGTTTATGACACTTCCTTGAAACTCTCTCCTTCCTCATCCTCTCTGATGCTGCCCAATCCTGCTTCTCTTTCTACCTCCCTGATCACCCTCTGCCTCCTCTGTTGGTTGCTGTCCTCTTCCCACCCTCTGAATGTGTCTGTTTTAAGGTTTTACATTCAGGCTGCTTTCTCCCCTCCCCCAGGCCCCCCCCCATGCACCTGGGTCCTAGCTACTTCAGAGTCCTCTCTTCTCTGGCCCAGGCCCTGCCGTGAATGTGGGACAGGTCATTCCCAGGCACATGTCATCTTGTTGGTTTGTTCTCAGGTCTCCTGCAACCCACAGTTGGGCTATTTACAATAAAATTAATGTCCTGGAAGATACGACATTGCACTAGACACTGATGGGCAAAGTGTAGATCCTCCAGAGCAGAGAACTTCACCCTGGAGCTCTCCCTGCACGAGTCCCACTAGCTCCATGACTCCATGGGAGCCCGGCCCTGGGTGAACTGAACAACCCCTCACCAGTAGCACACACTGCTGAAAATCATGGTGGCAACAACGCTGAAGGGGAGGACGTGCAGTGCATAGGCCAGCATCATCTGCCACTTCTGGTAGAGGCCGTCCTGACTCTCCTGGTCGCTGACAGCTCGCAGCACGGGAACTGGGGATGGAAGGCAGGTTTCAGAACAGTCAGTCACCACCCAGCTGAAAAAGGGAGGGCTAGCCCAAGCTGAATGTGAGGTCTGTCAGGGCTGGATGGTGAGGACCAGCTAGGGGGGTTCCCTAGTCATAGAAGGAGGGGACCTGCCATCCACAGGACAATAAATCCCCACCCCGGAAATCTACACTCTACCAGAATTGCAATACAATTGCAAAAGATGTCATTTATTTCCTTCTCTCTAAAGTGGGGAGTTGTCACCAATTCACGAAAAGTACATGCAAAAGGGGCATGAATAAGTGATTTGAAGCACTTTGTCTTCTTTCTGTGCAGGATTCCCCCCACCCCACCCCGCCCCCACCACCAGCAGCCTGCATTTTAGACTTGCTCTCGGAAGGCCAGGCAAACCCCACAGATGCAGACACTTAGCATTGCCCCTCATGTCAAGCTCTAGAGCAACTTCACAATAGCGAAGTCCTTCCCTCTTATTCCCTAACAGTGTTGCCTTTGGGGAATCCCTCTAACACCTGCTTCCTGCAACGTTAGGCAACCAGGTTTTGTCTCTGGAATTCCACTGAATTTGAAAATTAGGTGCTGGCTGTCCTAAAATCAGCTCCAAAGAGAAGCTAACGGTACAAAGTTGGCCTGGTCGCTGAGCACCCCATGGGCTGTGCATCTGAGATGGCCAAGATGAGATAGGAGGAATGATCTTTTGAAAAACTCCTCAAACTCTCCCCACCAGTACATTGTCACTTCATGTTTCCCTGGATCCTTAGCCCTCAGAGAGATCCACCTGGTGAGCTCATTCATATTAACGTGTTGGTAACTCAATAGTTGCCTTTCCCCAGAGAGGGAACCTGGAGAGGGCTGGGTTTAGCTCAGAGAAAAACCCTTATAATGGTAGACTTTTGTAAGGTTACAGCTGGAGAAGGGAGGTATTTAGGGAGAAAGAGGTGCACCTCCAGCACGTGGGCACTTACACAGATTCACAGCGTTCAGCATGCCTGTGTACGGGGTGGCGCCCACAAACTGGTAAAGGAGACCTACGGGGTCCTGGATAGCACCCTTTAGCACATTGCTTCGGACCCGCAGAACGAAGAAAAGGAGGAACAAACCCATGATCAGATTCTGAAGGAGACGCGTAATCACTGCCAGCTTATTTCTCACCAAGTTTCTTGTCACTCTCCTGAAAACAAACAACCCTGTTTTAATTCCTTTTCAGAATTGTTATTGGGGGATGGCTAAAGACCTCTAACAGGCATTTCTCACATTTGTGAGCCTCTTACCTCAGGAGAACACCCAGTTTAGAGAAAACTCCAGGAGAATCTTTGGTTTTGAAAGGAACCATTGGTAACGTTTTCAGGTGTTTCATTCTTTCAATATTCTTCAAAGTTTTATGACAAATTGCTGATTTCTTGTAGGCAGATTCTATCATCTGGACTCTCTTGGAGGTTTCTATTTCCCGTTCCTTGCTTTGGGTATCCACTGACGTCAGGTCCACTAAAAGTTTTTCCCAAAAGATGTCACCCATGTGTTTTTAAATGCATGTATGTACATGGATATACAATTGGTACAGGAGTACTGGCCATAATACCTCATCCCATCAAGATAAAATTTGTGGTTAATGCCCACCTATAAAATCAGAATACTTTAAAGCATCCCAGCAGGGCCTTGAGGATCCCATTGGGATTGTCTGGGAGAATTCAGAAGCTCAGCTAATTATGCTCTGATAAAGTAGTAGCAGTGCGCCAGTTTGTTTGAGAGAGATCCCTGACCTCATTCTGATAGTCATCTCTGGCAAGTTCATTGACCCGGCCAAATTGATTCCTTGAAGAGTATAAAACACAAAAACAAAAGCAAAAATCAAATCCACTAGACTGGTGTCATCCAGGCAGAAGTCTGAGATGAGAAAGTTTAAAAAACATTCATGATGGGGAATGTGAAAGAAAAACTTACTATAGAAGTCAAAAGGGTTTGAATGTTCAGGACAAGGGTAACCGCAGTCATTGAAGAAATCAAGCATTTCCGCTGGCGTGCCACAGAAAATCAGCTCTCCGAAGCTCAGGATGGCAATTTTGTCAAAGAGCTGACCAGACAACAGACGTAGTTAGTGTGTGATCACAAGGGTAGCGATGCACTTTGAATGTCTCTGGGAACACTGATGCAGGGCCAAGGTCAGGTATTCCTTATGGTCACCAAGTCCTTATGGGAAATGCATTTCCCATAAGCAGTCAGTCCTTCGATGACCTTGGCCCTGCATCAGTATTCTTGGAGACATTCGAAATGCATCCCTACCCTTGTGAGCCTAGGCTACCACTGTGGGTCATGCTGCCTCCCATCCTGACGCCCAGCTTCATATCTGGGATAGACAAGCATGACTGGACCTGGGCGTAAGTCCCAGCCAAGCCAAGTGAGTGACCTCGGGCGAGCAGGGGTGGGTCTTAGTTTGTTTTTTTGTTTTCATTTTAAATCTCAGCTCCTCCTCTGTAAAAAGCAAATAATAGCTAACTAAAGGGATACTGGGCGGAGAAAGTGAGTTTTTTTGGAAGGAAATCAGTATGATTTCGTGGAAAAACACAGCCTTTGAAGCCAACTTGGCTGTGAAAGGCTAATGCTAGCTTTTTACTATTAACAACTGTGTGATCTTGGCTTAATTTGTTGTTGTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTCTGAGACCGAATCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCCCAGCTCTCTGCAACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGCGCACACCACCACGCCCAACTATCAATTTTGAATCATTGCTAAGTTTCACTCTTTTCCTCTGTAAGGTGAATACACTGAAACACACCTCATAGGAGTGTTGTGCAGATGAAATGAGCTATGTACAGAAAGTATTTGGAACATGGTAGGTGCTGAAAGAAGTGAGTTTTCATCCTTTGCTCTTCCCCTCTCAGGAGCTGTTGGCTCCAATTCTCTAGCACTAACGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGAGATGAGGTCTTCCTCTGTCACCCAGGCTAGAGT
Task1_train_3476
A genomic change on Chromosome 2 affects ABCG5, DYNC2LI1 (ATP binding cassette subfamily G member 5| dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Sitosterolemia 2
GATCCCATGTTATTCTGATTCCCCTATCCCTACCTTGGTCTACTCTGGGAACTTCCTCTTTGACTTATCCAAATTTTGGCTGCATTTTCATCTACTCTCAATCTGATGTTTTTTGATGGTCTTATTTACCACATCCTAAAATAACCATTTTTTGAACTTGATCATCATTTAAGTAACTGCCCCTCTTCATCCTACCCTGTAACACCAAGTTTCTCAAAACAGAATCTGCTTCCTCCATCTTACACCTTCCCTTCTTGTAAACCTGACTTGCACCCCCATGACTCTACCGAAGCTCTTTTTTGGGAAATTGCAATGGCCTTCTCCCTTTATGCTTCACCTCCTTTAACCCCTGCAATATTGAAGTGTTTATGACACTTCCTTGAAACTCTCTCCTTCCTCATCCTCTCTGATGCTGCCCAATCCTGCTTCTCTTTCTACCTCCCTGATCACCCTCTGCCTCCTCTGTTGGTTGCTGTCCTCTTCCCACCCTCTGAATGTGTCTGTTTTAAGGTTTTACATTCAGGCTGCTTTCTCCCCTCCCCCAGGCCCCCCCCCATGCACCTGGGTCCTAGCTACTTCAGAGTCCTCTCTTCTCTGGCCCAGGCCCTGCCGTGAATGTGGGACAGGTCATTCCCAGGCACATGTCATCTTGTTGGTTTGTTCTCAGGTCTCCTGCAACCCACAGTTGGGCTATTTACAATAAAATTAATGTCCTGGAAGATACGACATTGCACTAGACACTGATGGGCAAAGTGTAGATCCTCCAGAGCAGAGAACTTCACCCTGGAGCTCTCCCTGCACGAGTCCCACTAGCTCCATGACTCCATGGGAGCCCGGCCCTGGGTGAACTGAACAACCCCTCACCAGTAGCACACACTGCTGAAAATCATGGTGGCAACAACGCTGAAGGGGAGGACGTGCAGTGCATAGGCCAGCATCATCTGCCACTTCTGGTAGAGGCCGTCCTGACTCTCCTGGTCGCTGACAGCTCGCAGCACGGGAACTGGGGATGGAAGGCAGGTTTCAGAACAGTCAGTCACCACCCAGCTGAAAAAGGGAGGGCTAGCCCAAGCTGAATGTGAGGTCTGTCAGGGCTGGATGGTGAGGACCAGCTAGGGGGGTTCCCTAGTCATAGAAGGAGGGGACCTGCCATCCACAGGACAATAAATCCCCACCCCGGAAATCTACACTCTACCAGAATTGCAATACAATTGCAAAAGATGTCATTTATTTCCTTCTCTCTAAAGTGGGGAGTTGTCACCAATTCACGAAAAGTACATGCAAAAGGGGCATGAATAAGTGATTTGAAGCACTTTGTCTTCTTTCTGTGCAGGATTCCCCCCACCCCACCCCGCCCCCACCACCAGCAGCCTGCATTTTAGACTTGCTCTCGGAAGGCCAGGCAAACCCCACAGATGCAGACACTTAGCATTGCCCCTCATGTCAAGCTCTAGAGCAACTTCACAATAGCGAAGTCCTTCCCTCTTATTCCCTAACAGTGTTGCCTTTGGGGAATCCCTCTAACACCTGCTTCCTGCAACGTTAGGCAACCAGGTTTTGTCTCTGGAATTCCACTGAATTTGAAAATTAGGTGCTGGCTGTCCTAAAATCAGCTCCAAAGAGAAGCTAACGGTACAAAGTTGGCCTGGTCGCTGAGCACCCCATGGGCTGTGCATCTGAGATGGCCAAGATGAGATAGGAGGAATGATCTTTTGAAAAACTCCTCAAACTCTCCCCACCAGTACATTGTCACTTCATGTTTCCCTGGATCCTTAGCCCTCAGAGAGATCCACCTGGTGAGCTCATTCATATTAACGTGTTGGTAACTCAATAGTTGCCTTTCCCCAGAGAGGGAACCTGGAGAGGGCTGGGTTTAGCTCAGAGAAAAACCCTTATAATGGTAGACTTTTGTAAGGTTACAGCTGGAGAAGGGAGGTATTTAGGGAGAAAGAGGTGCACCTCCAGCACGTGGGCACTTACACAGATTCACAGCGTTCAGCATGCCTGTGTACGGGGTGGCGCCCACAAACTGGTAAAGGAGACCTACGCGGTCCTGGATAGCACCCTTTAGCACATTGCTTCGGACCCGCAGAACGAAGAAAAGGAGGAACAAACCCATGATCAGATTCTGAAGGAGACGCGTAATCACTGCCAGCTTATTTCTCACCAAGTTTCTTGTCACTCTCCTGAAAACAAACAACCCTGTTTTAATTCCTTTTCAGAATTGTTATTGGGGGATGGCTAAAGACCTCTAACAGGCATTTCTCACATTTGTGAGCCTCTTACCTCAGGAGAACACCCAGTTTAGAGAAAACTCCAGGAGAATCTTTGGTTTTGAAAGGAACCATTGGTAACGTTTTCAGGTGTTTCATTCTTTCAATATTCTTCAAAGTTTTATGACAAATTGCTGATTTCTTGTAGGCAGATTCTATCATCTGGACTCTCTTGGAGGTTTCTATTTCCCGTTCCTTGCTTTGGGTATCCACTGACGTCAGGTCCACTAAAAGTTTTTCCCAAAAGATGTCACCCATGTGTTTTTAAATGCATGTATGTACATGGATATACAATTGGTACAGGAGTACTGGCCATAATACCTCATCCCATCAAGATAAAATTTGTGGTTAATGCCCACCTATAAAATCAGAATACTTTAAAGCATCCCAGCAGGGCCTTGAGGATCCCATTGGGATTGTCTGGGAGAATTCAGAAGCTCAGCTAATTATGCTCTGATAAAGTAGTAGCAGTGCGCCAGTTTGTTTGAGAGAGATCCCTGACCTCATTCTGATAGTCATCTCTGGCAAGTTCATTGACCCGGCCAAATTGATTCCTTGAAGAGTATAAAACACAAAAACAAAAGCAAAAATCAAATCCACTAGACTGGTGTCATCCAGGCAGAAGTCTGAGATGAGAAAGTTTAAAAAACATTCATGATGGGGAATGTGAAAGAAAAACTTACTATAGAAGTCAAAAGGGTTTGAATGTTCAGGACAAGGGTAACCGCAGTCATTGAAGAAATCAAGCATTTCCGCTGGCGTGCCACAGAAAATCAGCTCTCCGAAGCTCAGGATGGCAATTTTGTCAAAGAGCTGACCAGACAACAGACGTAGTTAGTGTGTGATCACAAGGGTAGCGATGCACTTTGAATGTCTCTGGGAACACTGATGCAGGGCCAAGGTCAGGTATTCCTTATGGTCACCAAGTCCTTATGGGAAATGCATTTCCCATAAGCAGTCAGTCCTTCGATGACCTTGGCCCTGCATCAGTATTCTTGGAGACATTCGAAATGCATCCCTACCCTTGTGAGCCTAGGCTACCACTGTGGGTCATGCTGCCTCCCATCCTGACGCCCAGCTTCATATCTGGGATAGACAAGCATGACTGGACCTGGGCGTAAGTCCCAGCCAAGCCAAGTGAGTGACCTCGGGCGAGCAGGGGTGGGTCTTAGTTTGTTTTTTTGTTTTCATTTTAAATCTCAGCTCCTCCTCTGTAAAAAGCAAATAATAGCTAACTAAAGGGATACTGGGCGGAGAAAGTGAGTTTTTTTGGAAGGAAATCAGTATGATTTCGTGGAAAAACACAGCCTTTGAAGCCAACTTGGCTGTGAAAGGCTAATGCTAGCTTTTTACTATTAACAACTGTGTGATCTTGGCTTAATTTGTTGTTGTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTCTGAGACCGAATCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCCCAGCTCTCTGCAACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGCGCACACCACCACGCCCAACTATCAATTTTGAATCATTGCTAAGTTTCACTCTTTTCCTCTGTAAGGTGAATACACTGAAACACACCTCATAGGAGTGTTGTGCAGATGAAATGAGCTATGTACAGAAAGTATTTGGAACATGGTAGGTGCTGAAAGAAGTGAGTTTTCATCCTTTGCTCTTCCCCTCTCAGGAGCTGTTGGCTCCAATTCTCTAGCACTAACGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGAGATGAGGTCTTCCTCTGTCACCCAGGCTAGAGT
GATCCCATGTTATTCTGATTCCCCTATCCCTACCTTGGTCTACTCTGGGAACTTCCTCTTTGACTTATCCAAATTTTGGCTGCATTTTCATCTACTCTCAATCTGATGTTTTTTGATGGTCTTATTTACCACATCCTAAAATAACCATTTTTTGAACTTGATCATCATTTAAGTAACTGCCCCTCTTCATCCTACCCTGTAACACCAAGTTTCTCAAAACAGAATCTGCTTCCTCCATCTTACACCTTCCCTTCTTGTAAACCTGACTTGCACCCCCATGACTCTACCGAAGCTCTTTTTTGGGAAATTGCAATGGCCTTCTCCCTTTATGCTTCACCTCCTTTAACCCCTGCAATATTGAAGTGTTTATGACACTTCCTTGAAACTCTCTCCTTCCTCATCCTCTCTGATGCTGCCCAATCCTGCTTCTCTTTCTACCTCCCTGATCACCCTCTGCCTCCTCTGTTGGTTGCTGTCCTCTTCCCACCCTCTGAATGTGTCTGTTTTAAGGTTTTACATTCAGGCTGCTTTCTCCCCTCCCCCAGGCCCCCCCCCATGCACCTGGGTCCTAGCTACTTCAGAGTCCTCTCTTCTCTGGCCCAGGCCCTGCCGTGAATGTGGGACAGGTCATTCCCAGGCACATGTCATCTTGTTGGTTTGTTCTCAGGTCTCCTGCAACCCACAGTTGGGCTATTTACAATAAAATTAATGTCCTGGAAGATACGACATTGCACTAGACACTGATGGGCAAAGTGTAGATCCTCCAGAGCAGAGAACTTCACCCTGGAGCTCTCCCTGCACGAGTCCCACTAGCTCCATGACTCCATGGGAGCCCGGCCCTGGGTGAACTGAACAACCCCTCACCAGTAGCACACACTGCTGAAAATCATGGTGGCAACAACGCTGAAGGGGAGGACGTGCAGTGCATAGGCCAGCATCATCTGCCACTTCTGGTAGAGGCCGTCCTGACTCTCCTGGTCGCTGACAGCTCGCAGCACGGGAACTGGGGATGGAAGGCAGGTTTCAGAACAGTCAGTCACCACCCAGCTGAAAAAGGGAGGGCTAGCCCAAGCTGAATGTGAGGTCTGTCAGGGCTGGATGGTGAGGACCAGCTAGGGGGGTTCCCTAGTCATAGAAGGAGGGGACCTGCCATCCACAGGACAATAAATCCCCACCCCGGAAATCTACACTCTACCAGAATTGCAATACAATTGCAAAAGATGTCATTTATTTCCTTCTCTCTAAAGTGGGGAGTTGTCACCAATTCACGAAAAGTACATGCAAAAGGGGCATGAATAAGTGATTTGAAGCACTTTGTCTTCTTTCTGTGCAGGATTCCCCCCACCCCACCCCGCCCCCACCACCAGCAGCCTGCATTTTAGACTTGCTCTCGGAAGGCCAGGCAAACCCCACAGATGCAGACACTTAGCATTGCCCCTCATGTCAAGCTCTAGAGCAACTTCACAATAGCGAAGTCCTTCCCTCTTATTCCCTAACAGTGTTGCCTTTGGGGAATCCCTCTAACACCTGCTTCCTGCAACGTTAGGCAACCAGGTTTTGTCTCTGGAATTCCACTGAATTTGAAAATTAGGTGCTGGCTGTCCTAAAATCAGCTCCAAAGAGAAGCTAACGGTACAAAGTTGGCCTGGTCGCTGAGCACCCCATGGGCTGTGCATCTGAGATGGCCAAGATGAGATAGGAGGAATGATCTTTTGAAAAACTCCTCAAACTCTCCCCACCAGTACATTGTCACTTCATGTTTCCCTGGATCCTTAGCCCTCAGAGAGATCCACCTGGTGAGCTCATTCATATTAACGTGTTGGTAACTCAATAGTTGCCTTTCCCCAGAGAGGGAACCTGGAGAGGGCTGGGTTTAGCTCAGAGAAAAACCCTTATAATGGTAGACTTTTGTAAGGTTACAGCTGGAGAAGGGAGGTATTTAGGGAGAAAGAGGTGCACCTCCAGCACGTGGGCACTTACACAGATTCACAGCGTTCAGCATGCCTGTGTACGGGGTGGCGCCCACAAACTGGTAAAGGAGACCTACGTGGTCCTGGATAGCACCCTTTAGCACATTGCTTCGGACCCGCAGAACGAAGAAAAGGAGGAACAAACCCATGATCAGATTCTGAAGGAGACGCGTAATCACTGCCAGCTTATTTCTCACCAAGTTTCTTGTCACTCTCCTGAAAACAAACAACCCTGTTTTAATTCCTTTTCAGAATTGTTATTGGGGGATGGCTAAAGACCTCTAACAGGCATTTCTCACATTTGTGAGCCTCTTACCTCAGGAGAACACCCAGTTTAGAGAAAACTCCAGGAGAATCTTTGGTTTTGAAAGGAACCATTGGTAACGTTTTCAGGTGTTTCATTCTTTCAATATTCTTCAAAGTTTTATGACAAATTGCTGATTTCTTGTAGGCAGATTCTATCATCTGGACTCTCTTGGAGGTTTCTATTTCCCGTTCCTTGCTTTGGGTATCCACTGACGTCAGGTCCACTAAAAGTTTTTCCCAAAAGATGTCACCCATGTGTTTTTAAATGCATGTATGTACATGGATATACAATTGGTACAGGAGTACTGGCCATAATACCTCATCCCATCAAGATAAAATTTGTGGTTAATGCCCACCTATAAAATCAGAATACTTTAAAGCATCCCAGCAGGGCCTTGAGGATCCCATTGGGATTGTCTGGGAGAATTCAGAAGCTCAGCTAATTATGCTCTGATAAAGTAGTAGCAGTGCGCCAGTTTGTTTGAGAGAGATCCCTGACCTCATTCTGATAGTCATCTCTGGCAAGTTCATTGACCCGGCCAAATTGATTCCTTGAAGAGTATAAAACACAAAAACAAAAGCAAAAATCAAATCCACTAGACTGGTGTCATCCAGGCAGAAGTCTGAGATGAGAAAGTTTAAAAAACATTCATGATGGGGAATGTGAAAGAAAAACTTACTATAGAAGTCAAAAGGGTTTGAATGTTCAGGACAAGGGTAACCGCAGTCATTGAAGAAATCAAGCATTTCCGCTGGCGTGCCACAGAAAATCAGCTCTCCGAAGCTCAGGATGGCAATTTTGTCAAAGAGCTGACCAGACAACAGACGTAGTTAGTGTGTGATCACAAGGGTAGCGATGCACTTTGAATGTCTCTGGGAACACTGATGCAGGGCCAAGGTCAGGTATTCCTTATGGTCACCAAGTCCTTATGGGAAATGCATTTCCCATAAGCAGTCAGTCCTTCGATGACCTTGGCCCTGCATCAGTATTCTTGGAGACATTCGAAATGCATCCCTACCCTTGTGAGCCTAGGCTACCACTGTGGGTCATGCTGCCTCCCATCCTGACGCCCAGCTTCATATCTGGGATAGACAAGCATGACTGGACCTGGGCGTAAGTCCCAGCCAAGCCAAGTGAGTGACCTCGGGCGAGCAGGGGTGGGTCTTAGTTTGTTTTTTTGTTTTCATTTTAAATCTCAGCTCCTCCTCTGTAAAAAGCAAATAATAGCTAACTAAAGGGATACTGGGCGGAGAAAGTGAGTTTTTTTGGAAGGAAATCAGTATGATTTCGTGGAAAAACACAGCCTTTGAAGCCAACTTGGCTGTGAAAGGCTAATGCTAGCTTTTTACTATTAACAACTGTGTGATCTTGGCTTAATTTGTTGTTGTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTCTGAGACCGAATCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCCCAGCTCTCTGCAACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGCGCACACCACCACGCCCAACTATCAATTTTGAATCATTGCTAAGTTTCACTCTTTTCCTCTGTAAGGTGAATACACTGAAACACACCTCATAGGAGTGTTGTGCAGATGAAATGAGCTATGTACAGAAAGTATTTGGAACATGGTAGGTGCTGAAAGAAGTGAGTTTTCATCCTTTGCTCTTCCCCTCTCAGGAGCTGTTGGCTCCAATTCTCTAGCACTAACGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGAGATGAGGTCTTCCTCTGTCACCCAGGCTAGAGT
Task1_train_3477
Here is a genetic alteration in ABCG8 (ATP binding cassette subfamily G member 8) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Sitosterolemia 1
ACTTGAGTGCAATGAATCTTTTTTTAACTTTTATTTTAGGTTTGGGGATGCACAAGTAGGTTTGTTATATAGGTAAACTAGTGTCACGGGGTTTTGTTGTACAGATTATTTAATCACCCAGGTAGTAAGCTTTGTACCCAAGTGTTTTTTCCTGCTCTCCCTCCTCCCATCCTCCACCCTCAGTTAGGTGAATCCTTTTTTAAAAAAGAGTATTAAAAATACCACTGATGCACTTTGGGAGGCCCAGGCGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTCGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTAGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGGAGAATTGCTTGAACTCGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGTGGGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGTAAAAGTACCACTGATGAAAAGAAGAGAGATGGGTGTAGATACAGTCAGAACATATATGTACACTGTGCTGTAGTTTTAAATTGTTTCCACTTCTATTATTTCTCTATTTTTTTCTCCATTATTTCTCAAAATAGATTTGGTTTTGCATGTTTAAAAGACGCTCTATAAATGCTCCAAATTAGTCCTCACAAAGCCAGCTTCTGAGCCAACCGACATTGAATAATGAGACATTGCTGGCATGTTTGCCAGCCAAAAATAGTTATGTTAACACCAGCCTGCCTTGGGGAGAAAGGGCCTTGGTGGGTGGCAGGAGGGGACAAATGCTCCAGGCACCAGCTGGCCCTGTGGCATCTAGGACTCTAGCTTTCTCCTGTCAGGCCACCACTGGCTGGCCTGGCCTGAACCCCCAGCGCCATCATGCCTTGCAGCCCCACAGGGGTGCTCACGTTGGCTGCAGACAGAAGGCTTGGAGCTCCATGTCCTGGGCCCACCCCATCTAGGTCCAGGGACTATGCCACCTCTCTAGGGGCTGGTCACATCTGCACGGACAGAGTAGTCCGGGGTCCTGGAGAGTGTATGGGGAGCAGTGGCTGACAGCCTGGCCCCCACAGAAGCTCCGCTCTCAGGGATATCCCTGGTGGCTTTGCAGGTTGTGGGAGAGCCTCCTTGCTAGATGTGATCACTGGCCGAGGTCACGGCGGCAAGATCAAGTCAGGCCAGATCTGGATCAATGGGCAGCCCAGCTCGCCTCAGCTGGTGAGGAAGTGTGTGGCCCACGTGCGCCAGCACAACCAGCTGCTCCCCAACTTGACTGTGCGAGAGACCTTGGCCTTCATTGCCCAGATGCGGCTGCCCAGAACCTTCTCCCAGGCCCAGCGTGACAAAAGGGTAACTAACTGGCCCCAGTGGTGACCCCCAGGTCCAAGAAGCTACAGTGTCCATGCCCCGCTCCTCCCCTGCTGCCTTGCCTCAGGACCCAGCCGCAGGTCGAGTTTGAACAACTCAGCTTGCCTTCCGCCAGCCCTGGGCTGCAGCCCACCCTCCACCCTCCTTTCAAACCCCACAGCCCGCCAGAAGCTAGCTCAGCCCATTGGTTCCCTTCACTGCACTTGTCAAGATGTGGGATGAGTGTATTTGTTTGTGTGTTTTCTGGGCCTCCATGTGGGTAGAGAGCCATGGTCCCCAATACACTGCCACGTTCCTAACACAGGGCACCATGCCCAGCACGTCGAGGCCCCTCGGGACCTGTGGAAAGAATCAGGGGAACCAATGTTGCAGCTTGGAACTCAAGTGCTGGAGCTGTCTCCCTTCACTTTCAAACCCAGCCGGAGGAGCGGGCGCCTTTATCCTTGGGGTCACAATGTGTCCAGCCCTGAAGGAGGCCCCTGAGGTGGCCTCAAAGCTCCTTCTGGCCCACAGGTGGAGGACGTGATCGCGGAGCTGCGGCTTAGGCAGTGCGCTGACACCCGCGTGGGCAACATGTACGTGCGGGGGTTGTCGGGGGGTGAGCGCAGGAGAGTCAGCATTGGGGTGCAGCTCCTGTGGAACCCAGGTGAGGGCCTGGGGGGCAGATGGGGGCAGAGGGACCTGTGCGGTCCCCTCAGGCTTGGCTTGGTCTGGCCAGAGCCCCACCGACTCACCAGGCTCCTCTCTGTGTTGGAAAGGAATCCTTATTCTCGACGAACCCACCTCTGGGCTCGACAGCTTCACAGCCCACAACCTGGTGAAGACCTTGTCCAGGCTGGCCAAAGGCAACCGGCTGGTGCTCATCTCCCTCCACCAGCCTCGCTCTGACATCTTCAGGCTGTTTGATCTGGTCCTCCTGATGACGTCTGGCACCCCCATCTACTTAGGGGCGGCCCAGCACATGGTCCAGTATTTCACAGCCATCGGCTACCCCTGTCCTCGCTACAGCAATCCTGCTGACTTCTATGGTGAGTCCCCAAGGCCAGCAGCCAGGGCCCTGGCACACAGGGCCTCCCCGATGCTTAAACCCTGCCCAAGCTTGCTGGAAAGATTCAGGGGAGAAACTCCCAGAGGTTTCAGGAGAGGAGGAGCAATGATGGGGAAGAACATGGGGTGGTTTGCCAGGTATCAAATGCTAGAAATGAGGGCCTGGAAATAGAAGCTTCTGACAAAGAGCTACCCTTCTGTGCATGATAGATTAGAAACTTGCAAACTCCAAAGATGGGAGGGCATGGAATTCAAGAGGGTGGGGATCAATAAATATCAGAGTCTTTATTCAGACTCAGTAGGGAAACAACCTTTAAGGTCAAGAAGTCACCAGATCTTAAAACATGCCCTGGTGTTCCCACAGTGGCAGGGAGCCTGAAGGTGCAGGGTGGCAGAGGGGGGCCCAGGGTGGTGGCCTTGGCCAGGGAATCTCTAGATGTGAAAATTGCTCTGGCAGCCCCAGGCTTGCCCTTTGCTTGGGTCCTGAACACTCAGCATATTACACTCAGGGAGCATGAGCCGCTTCCTTCATTCTGCAGGGGACAGTTGCCTTCCCAGGTACCTGGCCTGAAATCCTGAGTGCTGAGGAAGGGCATGGCTGCTGGACAGGCGTCATGGTTGTACCAGGTCCCAGGGAGACAGCTGTCATGGCTTATGCTATAGGTCGCCTGAGCCCCCAGCTTCCACCCAGGATGGCAAACTGTAGCAAGGACCCCACCAGTAAACAGGACAACAGCGATCATCTCCTTGAAGGCAAACATGGGGCCCAAACATGCCAGGCTCAAAGGGTCTCCTGTTTGACTCTCAAGCCCCGGCCAGGCCAAGGCCATCTCCATCTTTACAGATGAGAAGCCTGGAGCTTGCAGAGCTAAACACCTGTTCCAGCACAGTTGTAAGGCACAGAACTGGGACTGGTGCCCAGCCCTGGCTGTGACTCCTCGTCCAGCAGCCCACACCCTCCTCCTAGTGTCCCAAGTTCTCCACCATCCTTCCCCCAGGAGGACAGGCCGCCCCTTGCCCTCTGTACTCACATTCTGCATGAACTCACAGAAAGGTCACCTCCCTCCCTGTGCTCAGGTGGCAGCCTGGCTTCCTGACGGTGTGTCATCCTCAGGCCAGCCATCCCCAGAATAGGGGCCAAAAGGCACCTGCCGACCTGGCCATCGGGGAATAATTTAAAGTAACCCCAGAGAGGGGTTACCAGAAGTCAAGTGTCCACAGCAAACCTGAAAACTCTTTTTTACATTTTATATTGTTACTGGAAGGGGCTCTGGCCTGCAAGCCCTGGGGCAGGAACCTCTCACCAACCTGGGATGCAAGAGCTACACGGGGCCTGGGTTACCCAAAAATCTGATGTTTTGAGCTACAGTGCTGCACACTAGGGGGCCACATCATGGTTTATAAGACCCCACCTAGACATTATCTTGTCTTGAGATGTGTTATGAAAATGGGAGGAAGGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTAATAAAAATATATGAATTAGCTGGGTGCGTGACGCTTGCCTATAGTACCAGCTACTTGGGAGGCTGAG
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Task1_train_3478
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting ABCG8 (ATP binding cassette subfamily G member 8). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Sitosterolemia 1
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GCCTTTGCCCACTGCCCTGGAGGCCAAAGGAATGATTCCATTAGAGATTCCAGATGCACCTCCTCCTATCCCACAGCTGATATCCAGAAGTCGCCCTTGACTGTCTCCCTCCCTCTCCACATCCACCTGTGAGCCAGGTCGATTCTGCCTCCTGTTTCTCTGAAATGTCTGCTTGGCTGTGTCTCCATCCCTGGCCACCATTGTTTGAGCCTGGGCCACTGCCATAGCCTGGTCTCTGTAACCTGGGCCCCTCCACATCCCTCTCGACTCAGCCACGCAGAGTGAGCTTTCCAAGGTGCAAACCCATGCCCCCCTTTGTTCAAATCTTCCCAGGGTTGCTCAATCCCTGCGGCCTCCCCAGCTTTCTGAAGCCCCCAGCACACCCCACCCTCTCACCTCTGAGCCTGCCCAGCTATTGTCTCTGGGAATGTCATGCCCGCCTTCCATGGGGCATCTCTTCTGCCAGGGCTTTCCTGATGCACCCAGGCAGGGCTCATTGCCTCCTTCCCCTCCCCATACCATGCCACCTCCATAGGATCAGGGCACAGGCTCCATTGTCTCTGGTGTGGGGCCGCTGAGTCTCCTCAGCCCACACAGTCCATGAAGCTGAGCACGTGCAGGGATGCCTCATCACATCCCTCTCGAGAATTGCTATGGATCAAATGTGTGGGTGACCCCGTGGCCTCTCAGCTCCCTCGGCCCCAGTCCATGTCCCCAGCAACCCCTCTGCCCTTTTGCCTCTTGGTCTCTGGTCTCTCTCCCCTCCTTGCTCATCAGAGAACTTGGGCCAGAGCCACCATGGCCCTGTCTCAGAGAGTGGGATGTGCCCTTGTGCAGGTAAGAGAGACTGTGTGACTGTGGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTGAATACGGGGGAGACTGTGTCGATATAAAGGAGATCATGGGAATACGGGGAGACCATGAGAATAGGAGGAGACCGTGGGAATATGGGGAGACGGTGAGAATATGGGAAGACTGCAAGAATATAGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTATGGGAATATGGGGAGATCACATGAATATGCAGGAGACTGTGAGAATATGGGGAGACCGTGAGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGAGGAAAGTGTGAATATGGGGGAGACCATGTCAATATAAAGGAGCCGTGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGGGAGAGAGAGTGTCAATATAAAGGAGACTGTGGGAATAGGGGGAGACCGTGGGAATATGAAGAGACTGTGTGAATATGGGGGAGACCATGTCAATATAAAGGAGATCGTCGGAATATGGGGAGATTGTGCGAATATGGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGATCATGTGAATATGCAGGAGACCGTGTCAATATAAAGGAGACAGTGGGGATATGGGGAGACCATGAGAATATAGGGAGACCATGGGAATATGAAGAAACTGTGTGAATATGGGGGAGACTGGGAGTATGGGGAGACTCTAGTAATATGGGGAGACTGGGAATATGAGGAAACTGTGAATATGGGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGACCGTGGGAATATGAGGAGACTGTGTGAATATGGGGAAGACCATGTCAATATAAAGAAGACCATGGGAATATGGGGAGACCATGGGAATATGAGGAAACTGGATATGGGGGAGGCCGTGTCAATATAAAGGAGACCGTGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGAGCAGACTGTGTGAATATGGGGGAGACCACATCAATATAAAGGAGATCGTGGGAATATGGGGAGATCGTGCGAATATGGGGAGCCCATGGGAATATGGGGAGACTGAATATATGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGATCATGCAAATATGGGCAGACCATGGGAATATGGGGAGACTCTGTGAATATGGGGGAGACCATGCGAATATGGGGAAACCATGAGAATATGAGGGACACCTGTGAGTAACGCGGCTGTCTGTCTCCAGTGCCCGCGTGGATTTCCAAAGTGTCCTTCCGGCGGTGGTGTTTTGAAGGGCTGATGAAGATTCAGTTCAGCAGAAGAACTTATAAAATGCCTCTCGGGAACCTCACCATCGCGGTCTCAGGAGATAAAGTAAGCGGGGAAGGCCTCGGGTTCTAAATTATTGGACGTCCGGCTTTCCATCCTCCTCATGAGCCCACTGCATGTCTGTGTCTCCAGATCCTCAGTGTCATGGAGCTGGACTCGTACCCTCTCTACGCCATCTACCTCATCGTCATTGGCCTCAGCGGTGGCTTCATGGTCCTGTACTACGTGTCCTTAAGGTTCATCAAACAGAAACCAAGTCAAGACTGGTGATTCACGCCAGACGTCTGCCCGCTGGTGGGGGACCTGAGCAGACCCTTCAACTGCACTCCCTCCTCAGGAGCCCCTTCCTGGGGACAGTGAGGACAATGACCCTACAGATGCTCAGCTACATCCGGCCCAGGGTGCTGCAGTGGCACAGACCAGCCACAGGATGGCAGTAGAATAAAGACAGTCGAAAGGGATTTCTGCTCACTGGCAGGAGACTGCGATGACTGGGAGAAAACCTGCACTCGGTGGCACCTACAACGTTGCTAATTTATTTCCTTTTGATATGCATTTATATAGGCAACTCGATATAGGATGGGAGCAAACTAGGAATGAATTGGGTAGCTAGACTGTGCAGGAATTGTTGGAACCTGGAGGGAACAATAACAGTAGCTAGCAGATTTGGCTTCATCTTCCAGGGGCCCCACACTCCGTGGTGAGCCACCATCAATACAGAAAGTGACCTAAGATGTACCAGCAAGATGCCATCCCTTCTTTTTGTGTGGGGTCATGGGCTCCAAAAGCCAACGTGAACAATTAAAAATGTATTGAGCATCTACTCTGTAGCAGGTCCTGTGAAAACACTTTAGGTGGACAATCCCTTGAGGTAAGTGGTATCCCATTTTATAGGTGTGAAAACTGAAGCAAAAATTCATTTTCCTAAGGGCACATGGATACTTTGTGGTGGAGTCATATGGGGATCAGAAAAGCCTTTGAGGCCTTTGGAGTTAGAGGGCAGAAGGCAAGGCCTGAGCCGCTGTAAGCCTTAGGAGTTTAGGAAGGCTCCAGAAGACAAATGGGGTCTGTAGAGGCTGTTAACTCAGCCAGGCTTCTTAGAGTTGCATTTCACTAACTGATATGGTTTGGCTCTGCGTCCTCACCCAAATCTCACCTTGAATTGTAATAATCCCCAAGTGTCAAGGGCGGGACCAGATGGAGATAATTGAATCATAGGGGTGGTTTCTCTGATGCTGTTCTCCTGAGAGTGAGTGAGTTCTGATGAGATCCGACGGTTTTATAAGGGGCTTCCCTCTTCGCTCGGCTCTCATTCTCTCTCCCGCTACCCTGTGAAGAGGAGCCTTCCACCACGACTGCAAGTTTCCTGAGGCTGCCCCAGCCGTGCTGAACTGTGAGTCAGTTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCAGTCTTGGGTATTTCTTCATAGCAGTGTGAGAGCAGATGAATACACTGGCCCTGCCTGGGTTTCAGAACCAGCCTTGAACCTTTCACAGTGGCCAGAGGATGGGGAGGCAGAGGCCCAGGTTGCACACTTCTTGCCTGAGTGTTGGGGACTATCTGACCCAAAACAGGTGCACAGAGGGCAGGAGAGGATGTTCCCAAAGGAAAATTAGAGTTTAGAATCAAAAGAAGGGGAAGGTGCGTGTTTGGGAGGTAAATAGCAAATACTCTTCATAGGTTCACTAGAGTCTTGCTACTCCAAGTACGATCCCTGGGCCAGCAGAATGGGCACAGCTGGAGCTGATTGGATAGGTCCCATGAGCCTCAGGCCCCACCCAGGCTCAATGAGTCAGAGTCTGCGTCTTAAGAAGACCCCCTGGTGATCTGTGCACATTCAAGCATGCTGCCGTTTTCCAAAGCACTTGCAACACTCAGGATGCTTGCACGGTCATGTTGCCACCATCCAACCTGCAGACCCCATTCTTGAGATTGACTGGGAGTTCCTATCATGTCCTCCATAGCAAGGGGA
Task1_train_3479
Chromosome 2 houses a mutation in gene LRPPRC (leucine rich pentatricopeptide repeat containing). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Congenital lactic acidosis, Saguenay-Lac-Saint-Jean type
CACTGAATGTCTGTGTGGCCCTCAGTTCCTTCATTCACGTAATGTGAGCTTTCAGTACAGCACTTTTAAAATCTAAATTCTGAGATTCTAAGACAAGATGGATTTGAGATAAAGCCCATTTTCTACTATTTCAACTGCTACAACCATAGAAAGAAATTACCTAACTCTTTTATGTTTACTAAGTAGTAAAAATGTAGTAATCAATTCAACTGTGACATGGTTGTGGAAAGCAGATTAACCTGATGAACAAACATTTCAACTGGTACCAAAAAAATTTTCATACTTGTGTAAAGGTGGACAATACTAACATGCCTGAAGAGTTTGATGGAATGATGTAAACTTTCTGTGGTTCCAAAACACTGGGTTATAGGTTACCTTTTGGAGCTTTCAGACTGGAGGATATACAAAGAGTTAATCAAACTAGCATATTGTTTTCACAAAGATTTTTCTAAAAAGGATTTAGAGACTTTTATAGCCAGAAACAATTAGGGAATACTTGTTTCACTATTTCCTTTAAACCAGAAGACGGCTGTACATTTAAAATAAAATTGCAATATGAAAGTCTGCTAAAAGCACTTTTTTTGTTGTTTGTGCATTCTGTTTGTCACCCAATGTCACACTAACAATTCTGCATCTCATTCCAAAGCACATTATACTTCGAGATAAAATGAAAAAGACCATTTTTTGTTTCCCCAAGGGGAAAGTACTTCTGTTAAAAGCATCTTTTTATGAGACTACTCTTTCTGAATTACCAATAATGCAAACCGAAGAATTAGATACTGTACTCTAAAATTTAATATTTGTTCAATTCTTATTCATATCCTATAGACATCCCATGTGTACAAGGGAAAAGTATGATAAATGCTTAAACGTACTTAAGAACCTGAAAGATTGAACATTTTTGTCCTTCAATCAGCAGGCTGTCAGGTCATGAGTACTCATTTCACAATAAAAGTTTTCCTGCCTTTCCTATTATTCTAACTAAGCTCAGTTAAAAAGAAATAGATTGGCCCACAAAGAAAATGACCATACTTTTTGTTTTCATGAACCTAATTGTATATACAACTTTATCTTTATTAAAGGTAGACAATCTGATTTCAAACACTATATATAAAATCAAGAACTAAAGAGTTTTTTTAAGAACTTAAAAAAACTACGTTCATTAAGTTTGAATATCAAGATCAGAGATGAAATAAGAAATGAAATTAATGAAATTCAGATGAAAGAAATCCATCATGTTTTGTTTTTTAAAATGCTTACACATAATACTTCATGATGACTTAAAACAATTCCATTATCTCATAATACTCAGGAATAAGTATGCTTTTCCAAAGAATCCAATTAGATGTGCGTGCAAACTGTCATACTGGCTCTGGGAACCATTACAAATCGGTAAAAGGCAAAATCTAACCTTGAACATTTTTTTCCTTCCGACGTCCAACTAGCAATGGCCAGAAATAGTGAGGTCTGATAGGAAAACCTTCCTCCTTCACAGCCTTCATTAAGGCTTTTGCCAAATCTGAAAGAGATATCATAAAAGATCACAAAGCTACCTCAGCAAAACTTCCTTACTTGGCTTTAACTTTAAGAATGTAGTACCAGTTTTATTGGCGAGTAAAGCACAATGGAGGGTGAACTGCAGAGGAAAGGAGTGCATCTGGACTTCCTTTAACTTCTTACAGTAGTCTGTTAGCTTCTCCACAGGCTGTGGGAAAAAAGTCACCACATTAGCTGGATTGGCAAACACCCCACCGTTTGACCTGCTGCAAATATTCTACCACTTCTGAGATGAGCATTTTAAACCCCGCATCCTCTTTCTACCCAAAAATCTTGCAACACAAGAACATTGTTATGATGTTTACAACTGGTCTAATCTTATAAATGTTCCTATACTTTAAAGAATCTTATTTCACTGCCAATTACATTGTCTACAAAGTAAAAGTGGACAGAATACCGTATTCATAGTCACACAGTGTTGTAAAAAGAAACTGCCAAAGACACTTGGGCCATCTTCCTTTGATACGGGGCATGCTAGTAAAATTTGCAACGCTACATCTTCCAATTTTTCAGTGACTAAAAGTAAAATGAGGTTCATTGCATCTGGGAAGAAAACAAAGACATCTTTTGTTAATAAACTGAACAATATTTTTACACTGCAACCAATGTTCCAATACTGAAGACAAAATAAGAATTGCAAACATCAAAAGCATATAACTGCCTAAATAACAATAAAACACCTGCAAATCAAATCATCCCCATGTGTTCATTAACTCATGTTTTTGGGCTTATTTAACTGACTTTAAGAGTTCTATGTTCAACTCCCACAATGCCCATTGTTAGAAAATGTCCTTTCCATCATGTAAGAATAGCAATTCAGATTTTTATAAAAATCATGTAAATAGATTTTTTTAAAACTACCTGGAATATATCTTCTTTCACATGTAACTTTTTCCAAAATTTCTGAGACATACTGAGGATACCCAGCTTTACTGAAGCTAAAAATAATTTGCAGTAAATCACGGTCCATAAGGTGAAGCTCGGACTTCTCCACCTTCTCCAGAGTCTATAGAGAGTTCCAGAAATTAGAAGACAAAGTTAGAGTGTTTTTATTTAAGTATTAAAGCTAAATAAAATATCCAGATTCAAAAAACTAGGGAAAAATACCACCTAAAGGTTTACGACTTCTTTTAAAAAACAGGAAATACTCTACTTCAACAGTAACTGTTACATACCAGCACCGAGATACTAAACTATAATAATTCTCCATAAATACTACTTTCTGCAAGGAAACATCTTTGAAAACAGGTATAAACTTCACTTTCCTGCCTCATGTAAAACATAACACAAATTTTTACAAATGATTTTAAAGTATGTTTATTTAGACATAAGTCATACCTGCTTAACATGGTCAATGTCGCCCTTCTCAGCATATGCATTCAATAATGCGAGGTATGTGTCTGGACCAGGCTCAATTCCGGCATCTCTCATCACTGTGAGAATGTTTTCTGCATTCTCCATATCACTACAAGTTAATTCAAAAAACAGATTATTATGCTTTTGCCAAATTTAATATAGTTATTCAAACTAAAACATATGCTTATTAAAATAAAAAATGCTAAGTACCATTTGGAATTATGATGTCAGAAAAGAACTAATGTATATTAAACTGGATATATGTTTCTGAAATAATAAAGATCATAAACATCTGATCCCCCATTAAAAAATAATAATAATTACATAGACATTAAATAACATACCCTCTTAATATTATGTAGGTTATGACTCAGACTTAACTTTCGAGGTAAGAATAACATTTAGTAAATTACTCTTCAAAAATAAAAATATTTTCCAGAGCAGTTACTTCAGATCAGATCAAGCCCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAACGCTCCTGCCTCAGACTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCATCATGCCCGGCTAAATTTTTATATTTTTGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCGGCTTCAAGCCCAATTTCTAAAAATTCAAATAAAAGAAAGATTTGTGGAACAAATGTAAAAGCTCATTATAAAAATATTAGTATGCTCTACCTCATATACTACAGATTTTTTTTTGAAGGGATAGACAAATGTATTTTAAGAACTGTCTACAATAATTTTCTCTAATTTAAACCCCACTTAACAAACAAAAAAGGAGTAAAATGACCACTTTAGCATCTCAGCCATCTATCACTTAAGAACCAAAACCTTAGGTTGAACATTACCCAGCTCTGGCATGCCCTGTCACAAGGGCACTGAATACTGCCTCTGTAACTGGGAGATCCTTAGTTTTCATAAATCCAAGAATCTTGCTGCAAAGGAAAAACGAAGATACTCATTGAAAGTATTTATAAGAACACTCTTTACAACATGT
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Task1_train_3480
The gene SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Cystinuria
CTCTTCTGTATAAATTCCTGGGTTCCTATATAAGTGAACAAGGGAAATAGTCCAAATTTAGCAAGTTCAAAGGCAGTCTGAGAGTGGAAACAAAGACTCCTCAAATATTGGCACAAACTTACCTTCTGTGTTGAGGTTGCACTCCTTCTCAGACCCCGTGCACTGACAACATTTATCACCTTTTTAAATTAATTGATGCATTTACTTATTTATTTATATTTATTATTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCACCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGAATGCACCATCGTCCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAAATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGTCTCAGCCTCCCTAAGTGTTGGGATTACAGGCGTAAGCCACTGTGTCCTGCCTTCTCACCCTTTTTTAGACATGCCCTGTCTATTCTTGCTCCCTCCTTTCCTTTGCTGTGCCTGGAAGCCCTTCACTCTGATCCCCTTTGCCCACACCATCCTGGACCTTCTCTGTCCTTACCCTCAGGGGTCATCAGCTTCCTCTGCCCCTGGGGGTCAAGGGCCAATGCCCTGATGCCCTTAAAGCACTTTCTGCAGCTCTTCCTTAGCTCTTCAGTCTGATCATCATCCCACCCCTGCCTGCAGACACTTCCGAGACCAACACCGCCCAAAAGAAATACAATGGGAGCCACATAAGAAATTGTAAATTTTGTAGTAGCCACATTAAAAAAAGGAAAAAAGAAGCAGGTGAAATTAATTTTCATATGTTCTGTTTAATCCAATGTATCATTTCAACACATAATCAGTATAAAAATATATACATATTGTTATTTTTTTTTGTATTTTAAGACGGGGTTTTATCATGTTACCCAGACTGGTCTCGAACACCTGAGCCCAAACAATCTGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACCATGCCCGGCCCAGTATAAAAATATTAATGAGATTTTTACATTCTTTCTTTTTGTACAGGGTCTTCAAAATCCAATACATGTTGTTCCCTTACAGCACATCTCAATTCCAACCAGCCACCCTGCAAGTGCTCAGTAGCCACATGTGGCTCTTAGACAGAACAGTGCAGTGTAGACCACATGACCGACAGGGGCCATGCGTTACTCTGCTCTGTTCCTTGACACTTAGCCCAGCAGCTGGCATAGATTAGCTGCTCAAAAACCATGTGTAGAATAAATGAACAATACCACAGTCTTGGTTTTAAATATAAAATATGAGTAAGTCACAGAGATTTTTTTTAATGCTATGTTAAATGTCATCGATTACTGATAGATGACTAATTTGATTTTCTCTTTCTTTTTTTTTTGAGAAAGGGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTACAGTGGTGTGATCTTGAGTCATTGTAGCCTCCGATTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATCATAGGCATGTGGTACTGTACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAGCTCTTGACCTTAGGTATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCACTACACCCGACCTAATTTGATATTTTTTGTAGAGCTAGATCTTCCTATTTGAATTATACTCAAATTCAACAAAATTCTAAGTATTTTTGCCTTCATGTAAATATTTCTATCTTAGGCATATTTGTTATATTTTTTGTCCTTTAACTAAAACAAAGTAGGGTTTATTCATGACTTTGACTTTTTTCTTCAGGTATTCAAGATAAACTGGACTACATCACAGCTTTAAATATAAAAACTGTTTGGATTACTTCATTTTATAAATCGTCCCTTAAAGATTTCAGATATGGTGTTGAAGATTTCCGGGAAGTTGATCCCATTTTTGGAACGATGGAAGATTTTGAGAATCTGGTTGCAGCCATACATGATAAAGGTAAGTTGAATGGAAAGTGGGCAAGATGGGGATGAGGTTTGAGAGAAGCACTTTTTCAAATGTTTACTTAAAGCATTTCTTCTCCTTAACTGTCATATACTATTTCTTTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCTTTCTTTCCTTCCCGCTTTCTCTTTCTTCCTTTCCTTCCCTTCCCTTCTGTTTCCTTTTTTCCTTTCTCCTTTCCTTTTTCCTTCCCTATCTCCTTTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTTTCCCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGGCAGGGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCATGGCTCACTTCAGCCTCCACCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTTAGCCTCCCAGTGTATTGGGGTTACAGGCGTTAGCCATTACTGTGCCTGGCCTGTCATATGTTATTCTAATACAATCTTTCCCTAGCATTTGAAATGTCTTTTACTCATTAGGTTTAAAATTAATCATCGATTTCATACCAAACCACACGAGTGATAAACATATTTGGTTTCAATTGAGTCGGACACGGACAGGAAAATATACTGATTATTATATCTGGCATGACTGTACCCATGAAAATGGCAAAACCATTCCACCCAACAACTGGGTAAGTATCAACCTGTCTGACTTACAAAGGGGTAAAAGGCAGATATGTAGTGATTGAACTGATTTAGTAAAACCCTTTTGAGGGAAAAATGAATGAATATAGTTTATCGGAAGGGGGCAAGTTTCTGAAAGAAATAGAAATAAGGTTTCCAGTTGTTATTTACTCAGGCTTCCAATTATTATTTAGATTTCTGATTTCATCATAGAGATGATGTGTTCTAGCAAATTCAAACCTATTTTCTCTCCTTCCACCCTTCCTTCACTTCCTACCCGGTCCAACTTGGATTCCATGTCCCATTAGTTTGATAACCATTTTTCTACTATCCATACCCCTTTGCATTTTTTTTTCTTGAGATGTAGTTTTGCTCTTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCACAATCTCAGCTCACTGCAAACTCCACCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTTACCAGTAGCTATGATTACAGGCGCGCGTCATCATACTCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGTAGGGTTTCACCATGTTGGCCACTCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACCGCTCCTGGCCCCCTTTGCCTTTCTGACTTTTTGTCTCCTCTGTCTGACAAAACCCTAGCCATGAATGAACCCAATTATCTATTTTCTTTTTGCCTAAACCTTAGTAGTTGAGTCTCTGGAGACATCACACCTTCATTGTCCCCACCTGAACTGAGCCATCCACTCTTCTTGGGAATTTTGCTAATTTCAACCGATCAACTTTCCCTCCCTCCCTCATTTCAAACATCGTATCTGCCTCTACCCCATCTTATCACTCTCAGCAGCAAACTCGACTTCACAGAGAAAACAGAAGCCATCAAGCCTGCCTGCCCCATTCCCACCCTCTTCCTACTCACTCCTTTTACAACAGAAGCCAGATCCCTCCTTTCTGGGGTGACCAGATTTAGCAAATAAAAATTCAGAATGCCCAGTTAAATCTGAATTTTGGACAAGCAGTGCATAAAAAATTTTTTAGTGTGGACCATACTTTCTTTTTTATTTTTATTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTTTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGATCATGGCTTACTGCAGTGGCTTGATCATGGCTCACCGCAGTCTTTGCCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCAGCTATTCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAAATGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATATTTTATTTTTTTGTAAAGACAGGGCCTCACTCTGTTGTCCAGGCTGGT
CTCTTCTGTATAAATTCCTGGGTTCCTATATAAGTGAACAAGGGAAATAGTCCAAATTTAGCAAGTTCAAAGGCAGTCTGAGAGTGGAAACAAAGACTCCTCAAATATTGGCACAAACTTACCTTCTGTGTTGAGGTTGCACTCCTTCTCAGACCCCGTGCACTGACAACATTTATCACCTTTTTAAATTAATTGATGCATTTACTTATTTATTTATATTTATTATTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCACCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGAATGCACCATCGTCCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAAATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGTCTCAGCCTCCCTAAGTGTTGGGATTACAGGCGTAAGCCACTGTGTCCTGCCTTCTCACCCTTTTTTAGACATGCCCTGTCTATTCTTGCTCCCTCCTTTCCTTTGCTGTGCCTGGAAGCCCTTCACTCTGATCCCCTTTGCCCACACCATCCTGGACCTTCTCTGTCCTTACCCTCAGGGGTCATCAGCTTCCTCTGCCCCTGGGGGTCAAGGGCCAATGCCCTGATGCCCTTAAAGCACTTTCTGCAGCTCTTCCTTAGCTCTTCAGTCTGATCATCATCCCACCCCTGCCTGCAGACACTTCCGAGACCAACACCGCCCAAAAGAAATACAATGGGAGCCACATAAGAAATTGTAAATTTTGTAGTAGCCACATTAAAAAAAGGAAAAAAGAAGCAGGTGAAATTAATTTTCATATGTTCTGTTTAATCCAATGTATCATTTCAACACATAATCAGTATAAAAATATATACATATTGTTATTTTTTTTTGTATTTTAAGACGGGGTTTTATCATGTTACCCAGACTGGTCTCGAACACCTGAGCCCAAACAATCTGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACCATGCCCGGCCCAGTATAAAAATATTAATGAGATTTTTACATTCTTTCTTTTTGTACAGGGTCTTCAAAATCCAATACATGTTGTTCCCTTACAGCACATCTCAATTCCAACCAGCCACCCTGCAAGTGCTCAGTAGCCACATGTGGCTCTTAGACAGAACAGTGCAGTGTAGACCACATGACCGACAGGGGCCATGCGTTACTCTGCTCTGTTCCTTGACACTTAGCCCAGCAGCTGGCATAGATTAGCTGCTCAAAAACCATGTGTAGAATAAATGAACAATACCACAGTCTTGGTTTTAAATATAAAATATGAGTAAGTCACAGAGATTTTTTTTAATGCTATGTTAAATGTCATCGATTACTGATAGATGACTAATTTGATTTTCTCTTTCTTTTTTTTTTGAGAAAGGGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTACAGTGGTGTGATCTTGAGTCATTGTAGCCTCCGATTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATCATAGGCATGTGGTACTGTACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAGCTCTTGACCTTAGGTATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCACTACACCCGACCTAATTTGATATTTTTTGTAGAGCTAGATCTTCCTATTTGAATTATACTCAAATTCAACAAAATTCTAAGTATTTTTGCCTTCATGTAAATATTTCTATCTTAGGCATATTTGTTATATTTTTTGTCCTTTAACTAAAACAAAGTAGGGTTTATTCATGACTTTGACTTTTTTCTTCAGGTATTCAAGATAAACTGGACTACATCACAGCTTTAAATATAAAAACTGTTTGGATTACTTCATTTTATAAATCGTCCCTTAAAGATTTCAGATATGGTGTTGAAGATTTCCAGGAAGTTGATCCCATTTTTGGAACGATGGAAGATTTTGAGAATCTGGTTGCAGCCATACATGATAAAGGTAAGTTGAATGGAAAGTGGGCAAGATGGGGATGAGGTTTGAGAGAAGCACTTTTTCAAATGTTTACTTAAAGCATTTCTTCTCCTTAACTGTCATATACTATTTCTTTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCTTTCTTTCCTTCCCGCTTTCTCTTTCTTCCTTTCCTTCCCTTCCCTTCTGTTTCCTTTTTTCCTTTCTCCTTTCCTTTTTCCTTCCCTATCTCCTTTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTTTCCCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGGCAGGGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCATGGCTCACTTCAGCCTCCACCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTTAGCCTCCCAGTGTATTGGGGTTACAGGCGTTAGCCATTACTGTGCCTGGCCTGTCATATGTTATTCTAATACAATCTTTCCCTAGCATTTGAAATGTCTTTTACTCATTAGGTTTAAAATTAATCATCGATTTCATACCAAACCACACGAGTGATAAACATATTTGGTTTCAATTGAGTCGGACACGGACAGGAAAATATACTGATTATTATATCTGGCATGACTGTACCCATGAAAATGGCAAAACCATTCCACCCAACAACTGGGTAAGTATCAACCTGTCTGACTTACAAAGGGGTAAAAGGCAGATATGTAGTGATTGAACTGATTTAGTAAAACCCTTTTGAGGGAAAAATGAATGAATATAGTTTATCGGAAGGGGGCAAGTTTCTGAAAGAAATAGAAATAAGGTTTCCAGTTGTTATTTACTCAGGCTTCCAATTATTATTTAGATTTCTGATTTCATCATAGAGATGATGTGTTCTAGCAAATTCAAACCTATTTTCTCTCCTTCCACCCTTCCTTCACTTCCTACCCGGTCCAACTTGGATTCCATGTCCCATTAGTTTGATAACCATTTTTCTACTATCCATACCCCTTTGCATTTTTTTTTCTTGAGATGTAGTTTTGCTCTTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCACAATCTCAGCTCACTGCAAACTCCACCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTTACCAGTAGCTATGATTACAGGCGCGCGTCATCATACTCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGTAGGGTTTCACCATGTTGGCCACTCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACCGCTCCTGGCCCCCTTTGCCTTTCTGACTTTTTGTCTCCTCTGTCTGACAAAACCCTAGCCATGAATGAACCCAATTATCTATTTTCTTTTTGCCTAAACCTTAGTAGTTGAGTCTCTGGAGACATCACACCTTCATTGTCCCCACCTGAACTGAGCCATCCACTCTTCTTGGGAATTTTGCTAATTTCAACCGATCAACTTTCCCTCCCTCCCTCATTTCAAACATCGTATCTGCCTCTACCCCATCTTATCACTCTCAGCAGCAAACTCGACTTCACAGAGAAAACAGAAGCCATCAAGCCTGCCTGCCCCATTCCCACCCTCTTCCTACTCACTCCTTTTACAACAGAAGCCAGATCCCTCCTTTCTGGGGTGACCAGATTTAGCAAATAAAAATTCAGAATGCCCAGTTAAATCTGAATTTTGGACAAGCAGTGCATAAAAAATTTTTTAGTGTGGACCATACTTTCTTTTTTATTTTTATTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTTTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGATCATGGCTTACTGCAGTGGCTTGATCATGGCTCACCGCAGTCTTTGCCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCAGCTATTCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAAATGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATATTTTATTTTTTTGTAAAGACAGGGCCTCACTCTGTTGTCCAGGCTGGT
Task1_train_3481
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Cystinuria
GCCCTTCACTCTGATCCCCTTTGCCCACACCATCCTGGACCTTCTCTGTCCTTACCCTCAGGGGTCATCAGCTTCCTCTGCCCCTGGGGGTCAAGGGCCAATGCCCTGATGCCCTTAAAGCACTTTCTGCAGCTCTTCCTTAGCTCTTCAGTCTGATCATCATCCCACCCCTGCCTGCAGACACTTCCGAGACCAACACCGCCCAAAAGAAATACAATGGGAGCCACATAAGAAATTGTAAATTTTGTAGTAGCCACATTAAAAAAAGGAAAAAAGAAGCAGGTGAAATTAATTTTCATATGTTCTGTTTAATCCAATGTATCATTTCAACACATAATCAGTATAAAAATATATACATATTGTTATTTTTTTTTGTATTTTAAGACGGGGTTTTATCATGTTACCCAGACTGGTCTCGAACACCTGAGCCCAAACAATCTGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACCATGCCCGGCCCAGTATAAAAATATTAATGAGATTTTTACATTCTTTCTTTTTGTACAGGGTCTTCAAAATCCAATACATGTTGTTCCCTTACAGCACATCTCAATTCCAACCAGCCACCCTGCAAGTGCTCAGTAGCCACATGTGGCTCTTAGACAGAACAGTGCAGTGTAGACCACATGACCGACAGGGGCCATGCGTTACTCTGCTCTGTTCCTTGACACTTAGCCCAGCAGCTGGCATAGATTAGCTGCTCAAAAACCATGTGTAGAATAAATGAACAATACCACAGTCTTGGTTTTAAATATAAAATATGAGTAAGTCACAGAGATTTTTTTTAATGCTATGTTAAATGTCATCGATTACTGATAGATGACTAATTTGATTTTCTCTTTCTTTTTTTTTTGAGAAAGGGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTACAGTGGTGTGATCTTGAGTCATTGTAGCCTCCGATTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATCATAGGCATGTGGTACTGTACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAGCTCTTGACCTTAGGTATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCACTACACCCGACCTAATTTGATATTTTTTGTAGAGCTAGATCTTCCTATTTGAATTATACTCAAATTCAACAAAATTCTAAGTATTTTTGCCTTCATGTAAATATTTCTATCTTAGGCATATTTGTTATATTTTTTGTCCTTTAACTAAAACAAAGTAGGGTTTATTCATGACTTTGACTTTTTTCTTCAGGTATTCAAGATAAACTGGACTACATCACAGCTTTAAATATAAAAACTGTTTGGATTACTTCATTTTATAAATCGTCCCTTAAAGATTTCAGATATGGTGTTGAAGATTTCCGGGAAGTTGATCCCATTTTTGGAACGATGGAAGATTTTGAGAATCTGGTTGCAGCCATACATGATAAAGGTAAGTTGAATGGAAAGTGGGCAAGATGGGGATGAGGTTTGAGAGAAGCACTTTTTCAAATGTTTACTTAAAGCATTTCTTCTCCTTAACTGTCATATACTATTTCTTTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCTTTCTTTCCTTCCCGCTTTCTCTTTCTTCCTTTCCTTCCCTTCCCTTCTGTTTCCTTTTTTCCTTTCTCCTTTCCTTTTTCCTTCCCTATCTCCTTTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTTTCCCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGGCAGGGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCATGGCTCACTTCAGCCTCCACCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTTAGCCTCCCAGTGTATTGGGGTTACAGGCGTTAGCCATTACTGTGCCTGGCCTGTCATATGTTATTCTAATACAATCTTTCCCTAGCATTTGAAATGTCTTTTACTCATTAGGTTTAAAATTAATCATCGATTTCATACCAAACCACACGAGTGATAAACATATTTGGTTTCAATTGAGTCGGACACGGACAGGAAAATATACTGATTATTATATCTGGCATGACTGTACCCATGAAAATGGCAAAACCATTCCACCCAACAACTGGGTAAGTATCAACCTGTCTGACTTACAAAGGGGTAAAAGGCAGATATGTAGTGATTGAACTGATTTAGTAAAACCCTTTTGAGGGAAAAATGAATGAATATAGTTTATCGGAAGGGGGCAAGTTTCTGAAAGAAATAGAAATAAGGTTTCCAGTTGTTATTTACTCAGGCTTCCAATTATTATTTAGATTTCTGATTTCATCATAGAGATGATGTGTTCTAGCAAATTCAAACCTATTTTCTCTCCTTCCACCCTTCCTTCACTTCCTACCCGGTCCAACTTGGATTCCATGTCCCATTAGTTTGATAACCATTTTTCTACTATCCATACCCCTTTGCATTTTTTTTTCTTGAGATGTAGTTTTGCTCTTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCACAATCTCAGCTCACTGCAAACTCCACCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTTACCAGTAGCTATGATTACAGGCGCGCGTCATCATACTCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGTAGGGTTTCACCATGTTGGCCACTCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACCGCTCCTGGCCCCCTTTGCCTTTCTGACTTTTTGTCTCCTCTGTCTGACAAAACCCTAGCCATGAATGAACCCAATTATCTATTTTCTTTTTGCCTAAACCTTAGTAGTTGAGTCTCTGGAGACATCACACCTTCATTGTCCCCACCTGAACTGAGCCATCCACTCTTCTTGGGAATTTTGCTAATTTCAACCGATCAACTTTCCCTCCCTCCCTCATTTCAAACATCGTATCTGCCTCTACCCCATCTTATCACTCTCAGCAGCAAACTCGACTTCACAGAGAAAACAGAAGCCATCAAGCCTGCCTGCCCCATTCCCACCCTCTTCCTACTCACTCCTTTTACAACAGAAGCCAGATCCCTCCTTTCTGGGGTGACCAGATTTAGCAAATAAAAATTCAGAATGCCCAGTTAAATCTGAATTTTGGACAAGCAGTGCATAAAAAATTTTTTAGTGTGGACCATACTTTCTTTTTTATTTTTATTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTTTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGATCATGGCTTACTGCAGTGGCTTGATCATGGCTCACCGCAGTCTTTGCCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCAGCTATTCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAAATGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATATTTTATTTTTTTGTAAAGACAGGGCCTCACTCTGTTGTCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCGGCCTTGCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTGTGCCCGGCCACATGAGTAATACTTATACTCAACAATATGCGTGTTGATCTGAATTCAGATGTAACTGGGCATCCTGCACTTCATCTGGCAGTTCTGCTTCTGTCTCAGGCCAGAGCTTCCCCTTGCCCGGGTTTGTGTTCTCTCCTGCCTTTATTCTGGATCATCCCTCCCTCCTCCAGTCCCTCCTTCTCTCTTCTGGACCTTCTCCATAAATATTTAAACATCAACTTTTAGGTGATCCAAGGACACTCAGAATTGATATATTTGCAGGTCAACTTTGTGATGTGTGATTTTCTCCCTATAACCTTCCGTCTCCCAGGTTCAGTGAATGGTACTACCATGCAGCCTGAGGAACAGGCTGTCAGCAAGTCCTGGCAGTTTCACCTCTTTTTTTCCTCCAGTTCACTGACTTGTTAAAATTGCAATGACATTAGCAAACATTTACAAAATACTTACTCTGTGCCAGGCTCTGTGCTAAGTGTTTTATATTCATTAATTTAGTTAATCCACTCT
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Task1_train_3482
This alteration occurs within gene SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) located on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Cystine urolithiasis
ATTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCCCAATCTCGGCTCACCACAACTTCCACCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATGGGCACCCGCCACCATGCCTGGCTACTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCCATTTCATCTTTTATTATCTGAGTGTATTCAAGACAACACTAGTATCTGAGTTTTACCACAGGATCGTCACTATTCTTAGTTATTTACTTGGTTGATGGTTGATTCTATTTTTTTTCTGTGTGTTCCTTCCATATTACTCCTAGCAGGAGATCCTTTAATATCTAAGCACTTCACCTCTCATCTGCCTTCCTAGTAAGGAGTGAAATATTTAACTATTGAACAATGTGTTATTTTCTTTGAGTTTGCAGTGACAGTTAAGGAGTTGGGCATGAGGGAGATGAGAAACTTTCCTAGTTTATTCTGAGTCCTATCTTTTCTTATGGTTTCATTCTTTCATTTTTAGTAGACTCTCTAAACTTTGAAAACATCCTTATAACATCCATTACAAATGTAACTAATTGTAATTCTGAATTCACATATGAAGGAGGTGTGGGAGTCGCTAAATGCAGTTAGAGTGCATTTTAGTAAGACAGTTATGCTAAATAGATAAAAATAGACTGTGAATACTGTGCTTGTTCTGTATGTAGATATCTGTTTTATGATGCCAAGTTGTTAACAGTCAAAACTTTGATTAAACGTTGTGATAATAACGTAGTTAATGTAACCAAGCATTTTGCTTCTTCATCTTTAGGAAATTTTACGGTTCTGGCTCACAAAGGGTGTTGATGGTTTTAGTTTGGATGCTGTTAAATTCCTCCTAGAAGCAAAGCACCTGAGAGATGAGATCCAAGTAAATAAGACCCAAATCCCGGTAAAGTTTTATTTTAAACGTTTTTCTTTTGCCTTTTCTGAAAATGTCATCAGAGTGTTTTCTTTCTCAGCCTGAGATACCAGTTACAAAGATGAGTTTTGTCCTGTGTCTAGCAAGTACCCTGATTTATTTCTTTAGGAAATGTGCAAGAGTTTGAAATGCATATGCACTCGATGTTTTTTTCCACTGGTTCCCTCCAGAGCGAGGGATCCCTTGAGGAGTCCTTCAGTGACAAGGGTTCTGAAGACATGGACAGTGTGGGCTCTACCAAGGGCCACAAAATAGAGGACATTTACTCCTGCAATTTTATCATCTGACATAGGCTCAAGTGAGGAGGCCTTGGCTTGGATGAGATGTAATTTTTTGTTTTGATTCTAGGAGATTATTGTCATCCTAGAAAGACATAGAAATGAGACACTGACATAGAAATCCTACAAAGATACAGAAACTAGGAAAAATTTACTGAAACCCCGAGAAAGTATAACAGTTAGGAGAAAGGATAGTGATGGTAAAGAAACAAATTTAAGTGCATGATGTTAATAGTTTTGTGAGCAGATAAAGTATACATGTAATAATGAGCTCTATAACCACTAAGATCTTTTTTTTTGTTTTTAAAAGGGTCTGAAACATTTTGACAATTACGTGTTGAGAACTTTGTAATCAGTGTTTTGCTTGGTAAAATTTATTTGCTAAAATGGGTGACAGTTTATTAGAGAAATATTGCTTAGTAGATTTATAAAGTTAACAACTTGAGCATCAAATGAAGCATTCTTCTCCATCCACAAAACCATGTTTGAGTGTGCGTCTCGCTTGGCTTGAGCCCTTTGAAGAGGTTGTCTACATTCATATAGAGCGAGCTGTGGGCATGCAATGTATGAAATGAGGGTAACCATGTCGTCCTGGTTTTCAAAGGACACGGTCACACAATACTCGGAGCTGTACCATGACTTCACCACCACGCAGGTGGGAATGCACGACATTGTCCGCAGCTTCCGGCAGACCATGGACCAATACAGCACGGAGCCCGGCAGATACAGGTTGACCACGGCATATGCTCTCATTTCTTCCCAGGCTTAGTGTGTGATCTGCAGTGTATCCCTCACAACCAAGTGTATTTGGAGGTTCAAGTAATAATGTAACAAGCCTGCATAACTCTAATTGATTACAGTTTGGTTGTACCAGGGCCTGCCATATTCCTTTCCTGTTTGCTTATTTTGCTGACTTTCAGTTTCCTCTTTTGTAAAATGATGCAGATCACACTACGTACTTCACAGGAGTTTTGTGAAAATTAGGTTAATGAAAAAGAGATTATATTAGCTAAATGTTAGCCATGAGCTATTATTTTTTCTTTTTCAAAAACCAGTTCCAGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAAACCCAGCACTGTAGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAAGCAGAGGTTGCAGCGAGTCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACCAAAAAAACAAAACCAGCTCCACCTGGGTGCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTGTGTGAGGTCGAGGCTGGTGGATCACCTGACGGTGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCTCCTCTACTAGAACTACAAAAATGGGCAAGGTGGCACATGCCTGTAATACCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCGGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTGCTCCAGTCTGGGCAACAGAGCAATACTCCATCTCAAGAAAAAAATAAAAATACCAGCTCCTTCTCTGCAGTATTATTTTTATCATTGTTATTGGATCTATAGTTTCCTAGTACAGTATATAAATCCATATGTTTCAGCTAAAGTATCAGGAACACAGCTTTGGAATCAGGTAGGTCTGAAGGAGTCCTGCTCTGTAGCTGTGTGACCTAGGGCCAGTTAATTAACATAAGTCTCAGTTGTCTCATCAATAAAAAAGTGATAGCAATAACCTCTATAAGGCTGTTGTGAGATTAAATTAGATAATGTATATAAAGTAGTGCCTGGATCATAGTAAACACTCAATAAAATTACCCATCATTAAGTTTACATAGATCACTCAACAGAATCAATAGGAAGGAATTAAAGAAATTTCATCTCCTTAAAGTAGGTACTCCGATTACTCTGTCTCCATTTTATAGACAAGGAAACTGAGGCTCTGAGCATGTAAGTAATGTCCACAGGTAGGAGTGGCAGCTATGGGATTTGAACTGAAGCAGTTGGGCTCCAGAGACCATGCACTTATCCATAAATATGCTGCCTCAAATAGCTAAAGCCAGCATTGATCGGAGTCATTTCAGGTGAATGTGTCTTCCCCCAGGGTTTTGCTTTCAGCAATTGAGAGTGCACACCAATAATAAGGCAAGATGTTATAGGGACTCCAATACAAGGGGGAAGTTCTTTTGAAGAAAATACCCCACCTAATTTGCAGACATAAACTTTAGATTCTAAATGGAGTGATGAGAATTGCTAAAGAAAGTCTTCATGGATGTCAACGAGTTTTAGTGTCAGGATGTTACTGAATTTTGATTCTAGGAGATTATTTCTCCTAGGATTCTAGGTTTAGAAAGAAAAGAACAGGCTTGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAATAGTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCACATCATCAGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTGTCTACTAAAAACACAAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGCA
ATTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCCCAATCTCGGCTCACCACAACTTCCACCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATGGGCACCCGCCACCATGCCTGGCTACTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCCATTTCATCTTTTATTATCTGAGTGTATTCAAGACAACACTAGTATCTGAGTTTTACCACAGGATCGTCACTATTCTTAGTTATTTACTTGGTTGATGGTTGATTCTATTTTTTTTCTGTGTGTTCCTTCCATATTACTCCTAGCAGGAGATCCTTTAATATCTAAGCACTTCACCTCTCATCTGCCTTCCTAGTAAGGAGTGAAATATTTAACTATTGAACAATGTGTTATTTTCTTTGAGTTTGCAGTGACAGTTAAGGAGTTGGGCATGAGGGAGATGAGAAACTTTCCTAGTTTATTCTGAGTCCTATCTTTTCTTATGGTTTCATTCTTTCATTTTTAGTAGACTCTCTAAACTTTGAAAACATCCTTATAACATCCATTACAAATGTAACTAATTGTAATTCTGAATTCACATATGAAGGAGGTGTGGGAGTCGCTAAATGCAGTTAGAGTGCATTTTAGTAAGACAGTTATGCTAAATAGATAAAAATAGACTGTGAATACTGTGCTTGTTCTGTATGTAGATATCTGTTTTATGATGCCAAGTTGTTAACAGTCAAAACTTTGATTAAACGTTGTGATAATAACGTAGTTAATGTAACCAAGCATTTTGCTTCTTCATCTTTAGGAAATTTTACGGTTCTGGCTCACAAAGGGTGTTGATGGTTTTAGTTTGGATGCTGTTAAATTCCTCCTAGAAGCAAAGCACCTGAGAGATGAGATCCAAGTAAATAAGACCCAAATCCCGGTAAAGTTTTATTTTAAACGTTTTTCTTTTGCCTTTTCTGAAAATGTCATCAGAGTGTTTTCTTTCTCAGCCTGAGATACCAGTTACAAAGATGAGTTTTGTCCTGTGTCTAGCAAGTACCCTGATTTATTTCTTTAGGAAATGTGCAAGAGTTTGAAATGCATATGCACTCGATGTTTTTTTCCACTGGTTCCCTCCAGAGCGAGGGATCCCTTGAGGAGTCCTTCAGTGACAAGGGTTCTGAAGACATGGACAGTGTGGGCTCTACCAAGGGCCACAAAATAGAGGACATTTACTCCTGCAATTTTATCATCTGACATAGGCTCAAGTGAGGAGGCCTTGGCTTGGATGAGATGTAATTTTTTGTTTTGATTCTAGGAGATTATTGTCATCCTAGAAAGACATAGAAATGAGACACTGACATAGAAATCCTACAAAGATACAGAAACTAGGAAAAATTTACTGAAACCCCGAGAAAGTATAACAGTTAGGAGAAAGGATAGTGATGGTAAAGAAACAAATTTAAGTGCATGATGTTAATAGTTTTGTGAGCAGATAAAGTATACATGTAATAATGAGCTCTATAACCACTAAGATCTTTTTTTTTGTTTTTAAAAGGGTCTGAAACATTTTGACAATTACGTGTTGAGAACTTTGTAATCAGTGTTTTGCTTGGTAAAATTTATTTGCTAAAATGGGTGACAGTTTATTAGAGAAATATTGCTTAGTAGATTTATAAAGTTAACAACTTGAGCATCAAATGAAGCATTCTTCTCCATCCACAAAACCATGTTTGAGTGTGCGTCTCGCTTGGCTTGAGCCCTTTGAAGAGGTTGTCTACATTCATATAGAGCGAGCTGTGGGCATGCAATGTATGAAATGAGGGTAACCATGTCGTCCTGGTTTTCAAAGGACACGGTCACACAATACTCGGAGCTGTACCATGACTTCACCACCACGCAGGTGGGAATGCACGACATTGTCGGCAGCTTCCGGCAGACCATGGACCAATACAGCACGGAGCCCGGCAGATACAGGTTGACCACGGCATATGCTCTCATTTCTTCCCAGGCTTAGTGTGTGATCTGCAGTGTATCCCTCACAACCAAGTGTATTTGGAGGTTCAAGTAATAATGTAACAAGCCTGCATAACTCTAATTGATTACAGTTTGGTTGTACCAGGGCCTGCCATATTCCTTTCCTGTTTGCTTATTTTGCTGACTTTCAGTTTCCTCTTTTGTAAAATGATGCAGATCACACTACGTACTTCACAGGAGTTTTGTGAAAATTAGGTTAATGAAAAAGAGATTATATTAGCTAAATGTTAGCCATGAGCTATTATTTTTTCTTTTTCAAAAACCAGTTCCAGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAAACCCAGCACTGTAGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAAGCAGAGGTTGCAGCGAGTCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACCAAAAAAACAAAACCAGCTCCACCTGGGTGCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTGTGTGAGGTCGAGGCTGGTGGATCACCTGACGGTGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCTCCTCTACTAGAACTACAAAAATGGGCAAGGTGGCACATGCCTGTAATACCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCGGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTGCTCCAGTCTGGGCAACAGAGCAATACTCCATCTCAAGAAAAAAATAAAAATACCAGCTCCTTCTCTGCAGTATTATTTTTATCATTGTTATTGGATCTATAGTTTCCTAGTACAGTATATAAATCCATATGTTTCAGCTAAAGTATCAGGAACACAGCTTTGGAATCAGGTAGGTCTGAAGGAGTCCTGCTCTGTAGCTGTGTGACCTAGGGCCAGTTAATTAACATAAGTCTCAGTTGTCTCATCAATAAAAAAGTGATAGCAATAACCTCTATAAGGCTGTTGTGAGATTAAATTAGATAATGTATATAAAGTAGTGCCTGGATCATAGTAAACACTCAATAAAATTACCCATCATTAAGTTTACATAGATCACTCAACAGAATCAATAGGAAGGAATTAAAGAAATTTCATCTCCTTAAAGTAGGTACTCCGATTACTCTGTCTCCATTTTATAGACAAGGAAACTGAGGCTCTGAGCATGTAAGTAATGTCCACAGGTAGGAGTGGCAGCTATGGGATTTGAACTGAAGCAGTTGGGCTCCAGAGACCATGCACTTATCCATAAATATGCTGCCTCAAATAGCTAAAGCCAGCATTGATCGGAGTCATTTCAGGTGAATGTGTCTTCCCCCAGGGTTTTGCTTTCAGCAATTGAGAGTGCACACCAATAATAAGGCAAGATGTTATAGGGACTCCAATACAAGGGGGAAGTTCTTTTGAAGAAAATACCCCACCTAATTTGCAGACATAAACTTTAGATTCTAAATGGAGTGATGAGAATTGCTAAAGAAAGTCTTCATGGATGTCAACGAGTTTTAGTGTCAGGATGTTACTGAATTTTGATTCTAGGAGATTATTTCTCCTAGGATTCTAGGTTTAGAAAGAAAAGAACAGGCTTGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAATAGTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCACATCATCAGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTGTCTACTAAAAACACAAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGCA
Task1_train_3483
Consider this mutation in SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Cystinuria
TTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCCCAATCTCGGCTCACCACAACTTCCACCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATGGGCACCCGCCACCATGCCTGGCTACTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCCATTTCATCTTTTATTATCTGAGTGTATTCAAGACAACACTAGTATCTGAGTTTTACCACAGGATCGTCACTATTCTTAGTTATTTACTTGGTTGATGGTTGATTCTATTTTTTTTCTGTGTGTTCCTTCCATATTACTCCTAGCAGGAGATCCTTTAATATCTAAGCACTTCACCTCTCATCTGCCTTCCTAGTAAGGAGTGAAATATTTAACTATTGAACAATGTGTTATTTTCTTTGAGTTTGCAGTGACAGTTAAGGAGTTGGGCATGAGGGAGATGAGAAACTTTCCTAGTTTATTCTGAGTCCTATCTTTTCTTATGGTTTCATTCTTTCATTTTTAGTAGACTCTCTAAACTTTGAAAACATCCTTATAACATCCATTACAAATGTAACTAATTGTAATTCTGAATTCACATATGAAGGAGGTGTGGGAGTCGCTAAATGCAGTTAGAGTGCATTTTAGTAAGACAGTTATGCTAAATAGATAAAAATAGACTGTGAATACTGTGCTTGTTCTGTATGTAGATATCTGTTTTATGATGCCAAGTTGTTAACAGTCAAAACTTTGATTAAACGTTGTGATAATAACGTAGTTAATGTAACCAAGCATTTTGCTTCTTCATCTTTAGGAAATTTTACGGTTCTGGCTCACAAAGGGTGTTGATGGTTTTAGTTTGGATGCTGTTAAATTCCTCCTAGAAGCAAAGCACCTGAGAGATGAGATCCAAGTAAATAAGACCCAAATCCCGGTAAAGTTTTATTTTAAACGTTTTTCTTTTGCCTTTTCTGAAAATGTCATCAGAGTGTTTTCTTTCTCAGCCTGAGATACCAGTTACAAAGATGAGTTTTGTCCTGTGTCTAGCAAGTACCCTGATTTATTTCTTTAGGAAATGTGCAAGAGTTTGAAATGCATATGCACTCGATGTTTTTTTCCACTGGTTCCCTCCAGAGCGAGGGATCCCTTGAGGAGTCCTTCAGTGACAAGGGTTCTGAAGACATGGACAGTGTGGGCTCTACCAAGGGCCACAAAATAGAGGACATTTACTCCTGCAATTTTATCATCTGACATAGGCTCAAGTGAGGAGGCCTTGGCTTGGATGAGATGTAATTTTTTGTTTTGATTCTAGGAGATTATTGTCATCCTAGAAAGACATAGAAATGAGACACTGACATAGAAATCCTACAAAGATACAGAAACTAGGAAAAATTTACTGAAACCCCGAGAAAGTATAACAGTTAGGAGAAAGGATAGTGATGGTAAAGAAACAAATTTAAGTGCATGATGTTAATAGTTTTGTGAGCAGATAAAGTATACATGTAATAATGAGCTCTATAACCACTAAGATCTTTTTTTTTGTTTTTAAAAGGGTCTGAAACATTTTGACAATTACGTGTTGAGAACTTTGTAATCAGTGTTTTGCTTGGTAAAATTTATTTGCTAAAATGGGTGACAGTTTATTAGAGAAATATTGCTTAGTAGATTTATAAAGTTAACAACTTGAGCATCAAATGAAGCATTCTTCTCCATCCACAAAACCATGTTTGAGTGTGCGTCTCGCTTGGCTTGAGCCCTTTGAAGAGGTTGTCTACATTCATATAGAGCGAGCTGTGGGCATGCAATGTATGAAATGAGGGTAACCATGTCGTCCTGGTTTTCAAAGGACACGGTCACACAATACTCGGAGCTGTACCATGACTTCACCACCACGCAGGTGGGAATGCACGACATTGTCCGCAGCTTCCGGCAGACCATGGACCAATACAGCACGGAGCCCGGCAGATACAGGTTGACCACGGCATATGCTCTCATTTCTTCCCAGGCTTAGTGTGTGATCTGCAGTGTATCCCTCACAACCAAGTGTATTTGGAGGTTCAAGTAATAATGTAACAAGCCTGCATAACTCTAATTGATTACAGTTTGGTTGTACCAGGGCCTGCCATATTCCTTTCCTGTTTGCTTATTTTGCTGACTTTCAGTTTCCTCTTTTGTAAAATGATGCAGATCACACTACGTACTTCACAGGAGTTTTGTGAAAATTAGGTTAATGAAAAAGAGATTATATTAGCTAAATGTTAGCCATGAGCTATTATTTTTTCTTTTTCAAAAACCAGTTCCAGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAAACCCAGCACTGTAGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAAGCAGAGGTTGCAGCGAGTCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACCAAAAAAACAAAACCAGCTCCACCTGGGTGCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTGTGTGAGGTCGAGGCTGGTGGATCACCTGACGGTGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCTCCTCTACTAGAACTACAAAAATGGGCAAGGTGGCACATGCCTGTAATACCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCGGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTGCTCCAGTCTGGGCAACAGAGCAATACTCCATCTCAAGAAAAAAATAAAAATACCAGCTCCTTCTCTGCAGTATTATTTTTATCATTGTTATTGGATCTATAGTTTCCTAGTACAGTATATAAATCCATATGTTTCAGCTAAAGTATCAGGAACACAGCTTTGGAATCAGGTAGGTCTGAAGGAGTCCTGCTCTGTAGCTGTGTGACCTAGGGCCAGTTAATTAACATAAGTCTCAGTTGTCTCATCAATAAAAAAGTGATAGCAATAACCTCTATAAGGCTGTTGTGAGATTAAATTAGATAATGTATATAAAGTAGTGCCTGGATCATAGTAAACACTCAATAAAATTACCCATCATTAAGTTTACATAGATCACTCAACAGAATCAATAGGAAGGAATTAAAGAAATTTCATCTCCTTAAAGTAGGTACTCCGATTACTCTGTCTCCATTTTATAGACAAGGAAACTGAGGCTCTGAGCATGTAAGTAATGTCCACAGGTAGGAGTGGCAGCTATGGGATTTGAACTGAAGCAGTTGGGCTCCAGAGACCATGCACTTATCCATAAATATGCTGCCTCAAATAGCTAAAGCCAGCATTGATCGGAGTCATTTCAGGTGAATGTGTCTTCCCCCAGGGTTTTGCTTTCAGCAATTGAGAGTGCACACCAATAATAAGGCAAGATGTTATAGGGACTCCAATACAAGGGGGAAGTTCTTTTGAAGAAAATACCCCACCTAATTTGCAGACATAAACTTTAGATTCTAAATGGAGTGATGAGAATTGCTAAAGAAAGTCTTCATGGATGTCAACGAGTTTTAGTGTCAGGATGTTACTGAATTTTGATTCTAGGAGATTATTTCTCCTAGGATTCTAGGTTTAGAAAGAAAAGAACAGGCTTGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAATAGTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCACATCATCAGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTGTCTACTAAAAACACAAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGCACCTGGGAGGT
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Task1_train_3484
With a mutation on Chromosome 2 in gene SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Cystinuria
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Task1_train_3485
A mutation on Chromosome 2 affecting SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Cystine urolithiasis
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Task1_train_3486
A mutation found in SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Cystinuria
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Task1_train_3487
Assess the clinical impact of this variant on gene PREPL, SLC3A1 (prolyl endopeptidase like| solute carrier family 3 member 1), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Cystinuria
TAAAAATGACAGTTCTATATACATTGATATGAGACCATTTCAAACAGGTATTCAATAAAGTATAGAATGGTAACATATCACCAACTGTGTAAAGAAAAATATATAAACATATGAAATGATACATTCTGTGCCTATGCAAACATATGATACATTAAAAACAAAAGAACATATAGTGCCTGTCTCTGAGGGGAACTGTGAAGCTATGGAAAGGTGTTGAAGAAAACCTTTTTATAGTATGTATTCTTGTAATTGAATAAAAAATAAAATTACAAAAATCAGGCTTGGAAGTATTTAATAGCAGACAAAATATAGTTCAATATGAAAAGCATTATATGAGACAAAGGCAATTTTCAAAAATTGATAAAACATTCCACCAAAAATCATGACTACGCATCTAACAGCTTCAAAATATAGAAAATACTCAAATGCAAAATCAACAAATCTGCAATTACAGAAAAAGACTTCAACATACTTTTAGAAAGTAGTAACTCAAGTAGACAATAATAGCTAACACTTACCGGGCACTTCTTATGTGAGTGGCACTGAAACATGTGCTTTCATGCATTACCTAAGGCTAGAGAAAATGTTAATAACTTAGACAAGTCATACATGTATCATAAATATCTTTGTACCTGACAAACAGAATAAACATCTTTTTAAACACCATTAGATAATTATTTAAAGACCACATATTGGGAACCTACCCCTAAAGAACAATAACAACCACAATAACAACTATCACCCCAGTAAACATGGCTGGCAAGAATACAATTAAATGAACATTATCACTGATTTGGCAACAGCTCTTATGAAGAATAATTTGGCATTATGTATCAAGTGCCCATACTCTTTGACAAAGTAACTGTCTTTCTGATAATCTATCTTAAGTAATACAAAAATGGGGGGAGGGGAATAAAAATACAAAATATTAGAAACACTATCGTCAAAATGAAAGGGCATGGCTGAGTATGGTACAACCGTTCAACAGAATATTGTCATTAAAAACATTTATGGAGGCTATATTATATAGTCAATAACAGAAAATGCTTGAAAGGTTAGAAGTACATCATCAAATTATGTTTTATATAGCTGTAAAATAAACCCAAATCATCTTTAATGAACACATACTATTATGGTAAAAAAAAGTCTACAATTTCTAACTTTCACCTTAGGCAGCTTTTTATTTTGCATCCTTTTTTTCAACTTTGTCTTCTATTAGCTGTGCAAGAAATACATGTCTGCTAAAGTTACACGATCTTCGCACAACAGCAACCTACACATTAGTCTACAAAGGGGAACAAACCCAAATTCCTCAGAAGTCTGAGTCCACTGTTGCCTTCTTTCTGGCCATCTGGCAGTTACAATATAGCACAGAATGACTATGCAAGTTAAATATTCATCTTAGACATGGACATTTGCTTTGGGACTCCTAAAGTGGAGTCAAATTTGATCTCTACAGAAACTCTACAATGTAGCAGAGCACTGTGCGTACTTATTGACTCCCAGACAAGCCGAAACCCCGAATTTGTCATTTCTATCAGTTTTTATATAAATTGTTCTTACCTACTTATTGATGCTTACAATTTGGCAATTATAAGGGGCAAAATTGGAGCAAGTGTTTTGGGTAAATAACTCCTTACAATATATTAAAAATACTTACAAACAATTCTTAGAATCAAACACTTACGTAAATACTTTTTTAAAAAAATAGGTCCAAAAGACTCAGCCCAGATCGGCTTTGAAGTTATATCAAGATTTAAGTCTACTTCATGCCAATGAGCTACTCCTCAACAGGGGCTGGTTTTGCCATTTGAGGAATGACAGCCACTATGTTGTGTACACAAGAGAGCTGGATGGCATCGACAGAATCTTTATCGTGGTTCTGAATTTTGGAGAATCAACACTGTTAAATCTACATAATATGATTTCGGGCCTTCCCGCTAAAATGAGAATAAGGTTAAGTACCAATTCTGCCGACAAAGGCAGTAAAGTTGATACAAGTGGCATTTTTCTGGACAAGGGAGAGGGACTCATCTTTGAACACAACACGAAGAATCTCCTTCATCGCCAAACAGCTTTCAGAGATAGATGCTTTGTTTCCAATCGAGCATGCTATTCCAGTGTACTGAACATACTGTATACCTCGTGTTAGGCACCTTTATGAAGAGATGAAGACACTGGCATTTCAGTGGGATTGTAAGCATTTGTAATAGCTTCATGTACAGCATGCTGCTTGGTGAACAATCATTAATTCTTCGATATTTCTGTAGCTTGAATGTAACTGCTTTAAGAAAGGTTCTCAAATGTTTTGAAAAAAATAAAATGTTTAAAAGTAAATTATGGCTTATAGGAGCTTATAACTTTATTCAGATAGCATCAATCAGGGATGACCAGAACACATTAGGACCCCAGATTATTCAAAAACTTTAACGAATTTTAAGGGGAAGAATTTTATCTTTTCCCTTAAAATGCAGTCATAGAAATTAGAGGATGACTCACTGCCACAGTGTCTAAAAGCATTTGCTAGCAAAGAGGCAGGACACTAATTTGTAAACTGCTCAACTGTTCTGACTGGAAGGGAGGCCTGGAGCTCTGCTATCACCAATCCTTCCCTTCCCTCTACTCCACATCCTTCTAAGGAGCATGATTTGAAAATTACTTTCCTAGGTTAATGGGCATGTGCATCAATGGAGAGAATAGTATAAGCAAGTGAGATGTAGACTAAGCAAAATTTAGATGGAGAAGCACATTTTAAAAAATTAATAACTTAAAAGTCTCAAGTTATTAATTTTTTTTTTGCTAACTCAATTGGAAGTAAGACTATGAAATATTTCAGTGTGTTTCCAATTCCCAGTTGAATGCAGTGTTTCAGAATTTCAGGTATTTCTTAAGATCCTCGAAAACACTGGTGCTGTCAAGTCCAAGTTCCTCGTACAGGAATTTAATTTGGGCTGTAATCTAAAAGAAACACATTAAAAAAATTAAATAGAAGGCCTTTGTAGTAAAATGCCACTGTTTAAGCTTCTCTTTATCTATCCATCTTTACCTAACCGTGAAGTCAGCAATTTATGGCAAGAATACTTTCATTCGAGAGAGAGGCAGAAGGCTTCCAACAATTAAGATTAAATTATTTTCTTTAACAGAGCTCACGTATCAAGTACAAGAGAGAGACATTTCTCTTGATTGACACAGTGTCCCTCCCTCCCCTCCTGGGTCTCACCCATAGATAGGACATTTGTGAAGTGGCTTTGTCATAAACCTGCTGCAACCACTGAAAATGTGAAAACAACATGTATCTAGTTCGGGAATCTGTCCACTGAGAGGGCCTTGATAACATACCTTTTTGTGAGAATCCTCAATTACATGATTGCCTCCAGGCTGAATATCTAGAATAATATTAGGGGTCTGATAGCCTGGAAGAGTTAACATGTAGAACAATTAGAAGATTGTATGGGATCTTCTTTGGAAGATCGAGACCCATTCCTCCCCTCTTCTTTGAGTACTCAGTTCAAATAATAGTAAAGGAATAAAAAGCAAAAACCACCATCATCAACAAAAAGATGGGAGGGGACAAGCAACAGAAGACAAACTTCTGACACAGCGAAAGCAGGAAGAGGCCGTATGGAAAAGACTATATGGTGCCACACGGACAAGGTTGAAACCCAGGAGATCATCAACCTGCCCTGTGGAATCTGAGAGTCTTATGCCCTGGAAACACCAACTACAGCAATGGATGGGGGTGACAAATGGAGATGAATACAGGGAGACTGATATGGCATGTAGTTTCAAGGCAAAAGGGAGGGATTCTTATCTCATAAAGCTGAAACAGCTAGCTAGAGGAAATTCATGCAGCTAAACAGTTTGGGCACTGATGGCCCAAAACAAAAATCTCAGAATCTGTCTTTTAGAGATTCCCAAGAATAACGGCTCAATAAATATTGTTAAATGAATTAATAATTGTATGGCAGTGCATCTCCAAGTTATATCTGATTCTTAAATTTCCTGTTTCCTTTGTGTCCTGCCTATCTATTTTAATACTGTCCTTTGAAAAAGAGGTGAGGCAGTGTATGTATAGACATGTAGTTACGTACACTTT
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Task1_train_3488
Given this variant in gene PREPL, SLC3A1 (prolyl endopeptidase like| solute carrier family 3 member 1) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Cystinuria
CACCAACTGTGTAAAGAAAAATATATAAACATATGAAATGATACATTCTGTGCCTATGCAAACATATGATACATTAAAAACAAAAGAACATATAGTGCCTGTCTCTGAGGGGAACTGTGAAGCTATGGAAAGGTGTTGAAGAAAACCTTTTTATAGTATGTATTCTTGTAATTGAATAAAAAATAAAATTACAAAAATCAGGCTTGGAAGTATTTAATAGCAGACAAAATATAGTTCAATATGAAAAGCATTATATGAGACAAAGGCAATTTTCAAAAATTGATAAAACATTCCACCAAAAATCATGACTACGCATCTAACAGCTTCAAAATATAGAAAATACTCAAATGCAAAATCAACAAATCTGCAATTACAGAAAAAGACTTCAACATACTTTTAGAAAGTAGTAACTCAAGTAGACAATAATAGCTAACACTTACCGGGCACTTCTTATGTGAGTGGCACTGAAACATGTGCTTTCATGCATTACCTAAGGCTAGAGAAAATGTTAATAACTTAGACAAGTCATACATGTATCATAAATATCTTTGTACCTGACAAACAGAATAAACATCTTTTTAAACACCATTAGATAATTATTTAAAGACCACATATTGGGAACCTACCCCTAAAGAACAATAACAACCACAATAACAACTATCACCCCAGTAAACATGGCTGGCAAGAATACAATTAAATGAACATTATCACTGATTTGGCAACAGCTCTTATGAAGAATAATTTGGCATTATGTATCAAGTGCCCATACTCTTTGACAAAGTAACTGTCTTTCTGATAATCTATCTTAAGTAATACAAAAATGGGGGGAGGGGAATAAAAATACAAAATATTAGAAACACTATCGTCAAAATGAAAGGGCATGGCTGAGTATGGTACAACCGTTCAACAGAATATTGTCATTAAAAACATTTATGGAGGCTATATTATATAGTCAATAACAGAAAATGCTTGAAAGGTTAGAAGTACATCATCAAATTATGTTTTATATAGCTGTAAAATAAACCCAAATCATCTTTAATGAACACATACTATTATGGTAAAAAAAAGTCTACAATTTCTAACTTTCACCTTAGGCAGCTTTTTATTTTGCATCCTTTTTTTCAACTTTGTCTTCTATTAGCTGTGCAAGAAATACATGTCTGCTAAAGTTACACGATCTTCGCACAACAGCAACCTACACATTAGTCTACAAAGGGGAACAAACCCAAATTCCTCAGAAGTCTGAGTCCACTGTTGCCTTCTTTCTGGCCATCTGGCAGTTACAATATAGCACAGAATGACTATGCAAGTTAAATATTCATCTTAGACATGGACATTTGCTTTGGGACTCCTAAAGTGGAGTCAAATTTGATCTCTACAGAAACTCTACAATGTAGCAGAGCACTGTGCGTACTTATTGACTCCCAGACAAGCCGAAACCCCGAATTTGTCATTTCTATCAGTTTTTATATAAATTGTTCTTACCTACTTATTGATGCTTACAATTTGGCAATTATAAGGGGCAAAATTGGAGCAAGTGTTTTGGGTAAATAACTCCTTACAATATATTAAAAATACTTACAAACAATTCTTAGAATCAAACACTTACGTAAATACTTTTTTAAAAAAATAGGTCCAAAAGACTCAGCCCAGATCGGCTTTGAAGTTATATCAAGATTTAAGTCTACTTCATGCCAATGAGCTACTCCTCAACAGGGGCTGGTTTTGCCATTTGAGGAATGACAGCCACTATGTTGTGTACACAAGAGAGCTGGATGGCATCGACAGAATCTTTATCGTGGTTCTGAATTTTGGAGAATCAACACTGTTAAATCTACATAATATGATTTCGGGCCTTCCCGCTAAAATGAGAATAAGGTTAAGTACCAATTCTGCCGACAAAGGCAGTAAAGTTGATACAAGTGGCATTTTTCTGGACAAGGGAGAGGGACTCATCTTTGAACACAACACGAAGAATCTCCTTCATCGCCAAACAGCTTTCAGAGATAGATGCTTTGTTTCCAATCGAGCATGCTATTCCAGTGTACTGAACATACTGTATACCTCGTGTTAGGCACCTTTATGAAGAGATGAAGACACTGGCATTTCAGTGGGATTGTAAGCATTTGTAATAGCTTCATGTACAGCATGCTGCTTGGTGAACAATCATTAATTCTTCGATATTTCTGTAGCTTGAATGTAACTGCTTTAAGAAAGGTTCTCAAATGTTTTGAAAAAAATAAAATGTTTAAAAGTAAATTATGGCTTATAGGAGCTTATAACTTTATTCAGATAGCATCAATCAGGGATGACCAGAACACATTAGGACCCCAGATTATTCAAAAACTTTAACGAATTTTAAGGGGAAGAATTTTATCTTTTCCCTTAAAATGCAGTCATAGAAATTAGAGGATGACTCACTGCCACAGTGTCTAAAAGCATTTGCTAGCAAAGAGGCAGGACACTAATTTGTAAACTGCTCAACTGTTCTGACTGGAAGGGAGGCCTGGAGCTCTGCTATCACCAATCCTTCCCTTCCCTCTACTCCACATCCTTCTAAGGAGCATGATTTGAAAATTACTTTCCTAGGTTAATGGGCATGTGCATCAATGGAGAGAATAGTATAAGCAAGTGAGATGTAGACTAAGCAAAATTTAGATGGAGAAGCACATTTTAAAAAATTAATAACTTAAAAGTCTCAAGTTATTAATTTTTTTTTTGCTAACTCAATTGGAAGTAAGACTATGAAATATTTCAGTGTGTTTCCAATTCCCAGTTGAATGCAGTGTTTCAGAATTTCAGGTATTTCTTAAGATCCTCGAAAACACTGGTGCTGTCAAGTCCAAGTTCCTCGTACAGGAATTTAATTTGGGCTGTAATCTAAAAGAAACACATTAAAAAAATTAAATAGAAGGCCTTTGTAGTAAAATGCCACTGTTTAAGCTTCTCTTTATCTATCCATCTTTACCTAACCGTGAAGTCAGCAATTTATGGCAAGAATACTTTCATTCGAGAGAGAGGCAGAAGGCTTCCAACAATTAAGATTAAATTATTTTCTTTAACAGAGCTCACGTATCAAGTACAAGAGAGAGACATTTCTCTTGATTGACACAGTGTCCCTCCCTCCCCTCCTGGGTCTCACCCATAGATAGGACATTTGTGAAGTGGCTTTGTCATAAACCTGCTGCAACCACTGAAAATGTGAAAACAACATGTATCTAGTTCGGGAATCTGTCCACTGAGAGGGCCTTGATAACATACCTTTTTGTGAGAATCCTCAATTACATGATTGCCTCCAGGCTGAATATCTAGAATAATATTAGGGGTCTGATAGCCTGGAAGAGTTAACATGTAGAACAATTAGAAGATTGTATGGGATCTTCTTTGGAAGATCGAGACCCATTCCTCCCCTCTTCTTTGAGTACTCAGTTCAAATAATAGTAAAGGAATAAAAAGCAAAAACCACCATCATCAACAAAAAGATGGGAGGGGACAAGCAACAGAAGACAAACTTCTGACACAGCGAAAGCAGGAAGAGGCCGTATGGAAAAGACTATATGGTGCCACACGGACAAGGTTGAAACCCAGGAGATCATCAACCTGCCCTGTGGAATCTGAGAGTCTTATGCCCTGGAAACACCAACTACAGCAATGGATGGGGGTGACAAATGGAGATGAATACAGGGAGACTGATATGGCATGTAGTTTCAAGGCAAAAGGGAGGGATTCTTATCTCATAAAGCTGAAACAGCTAGCTAGAGGAAATTCATGCAGCTAAACAGTTTGGGCACTGATGGCCCAAAACAAAAATCTCAGAATCTGTCTTTTAGAGATTCCCAAGAATAACGGCTCAATAAATATTGTTAAATGAATTAATAATTGTATGGCAGTGCATCTCCAAGTTATATCTGATTCTTAAATTTCCTGTTTCCTTTGTGTCCTGCCTATCTATTTTAATACTGTCCTTTGAAAAAGAGGTGAGGCAGTGTATGTATAGACATGTAGTTACGTACACTTTAACTGGGGAGTCAACATAGCAAAATAATTGTTTGCCCTAAATCCTGGGCAGATGATTTGGCTACAGCCTGAAATATAT
CACCAACTGTGTAAAGAAAAATATATAAACATATGAAATGATACATTCTGTGCCTATGCAAACATATGATACATTAAAAACAAAAGAACATATAGTGCCTGTCTCTGAGGGGAACTGTGAAGCTATGGAAAGGTGTTGAAGAAAACCTTTTTATAGTATGTATTCTTGTAATTGAATAAAAAATAAAATTACAAAAATCAGGCTTGGAAGTATTTAATAGCAGACAAAATATAGTTCAATATGAAAAGCATTATATGAGACAAAGGCAATTTTCAAAAATTGATAAAACATTCCACCAAAAATCATGACTACGCATCTAACAGCTTCAAAATATAGAAAATACTCAAATGCAAAATCAACAAATCTGCAATTACAGAAAAAGACTTCAACATACTTTTAGAAAGTAGTAACTCAAGTAGACAATAATAGCTAACACTTACCGGGCACTTCTTATGTGAGTGGCACTGAAACATGTGCTTTCATGCATTACCTAAGGCTAGAGAAAATGTTAATAACTTAGACAAGTCATACATGTATCATAAATATCTTTGTACCTGACAAACAGAATAAACATCTTTTTAAACACCATTAGATAATTATTTAAAGACCACATATTGGGAACCTACCCCTAAAGAACAATAACAACCACAATAACAACTATCACCCCAGTAAACATGGCTGGCAAGAATACAATTAAATGAACATTATCACTGATTTGGCAACAGCTCTTATGAAGAATAATTTGGCATTATGTATCAAGTGCCCATACTCTTTGACAAAGTAACTGTCTTTCTGATAATCTATCTTAAGTAATACAAAAATGGGGGGAGGGGAATAAAAATACAAAATATTAGAAACACTATCGTCAAAATGAAAGGGCATGGCTGAGTATGGTACAACCGTTCAACAGAATATTGTCATTAAAAACATTTATGGAGGCTATATTATATAGTCAATAACAGAAAATGCTTGAAAGGTTAGAAGTACATCATCAAATTATGTTTTATATAGCTGTAAAATAAACCCAAATCATCTTTAATGAACACATACTATTATGGTAAAAAAAAGTCTACAATTTCTAACTTTCACCTTAGGCAGCTTTTTATTTTGCATCCTTTTTTTCAACTTTGTCTTCTATTAGCTGTGCAAGAAATACATGTCTGCTAAAGTTACACGATCTTCGCACAACAGCAACCTACACATTAGTCTACAAAGGGGAACAAACCCAAATTCCTCAGAAGTCTGAGTCCACTGTTGCCTTCTTTCTGGCCATCTGGCAGTTACAATATAGCACAGAATGACTATGCAAGTTAAATATTCATCTTAGACATGGACATTTGCTTTGGGACTCCTAAAGTGGAGTCAAATTTGATCTCTACAGAAACTCTACAATGTAGCAGAGCACTGTGCGTACTTATTGACTCCCAGACAAGCCGAAACCCCGAATTTGTCATTTCTATCAGTTTTTATATAAATTGTTCTTACCTACTTATTGATGCTTACAATTTGGCAATTATAAGGGGCAAAATTGGAGCAAGTGTTTTGGGTAAATAACTCCTTACAATATATTAAAAATACTTACAAACAATTCTTAGAATCAAACACTTACGTAAATACTTTTTTAAAAAAATAGGTCCAAAAGACTCAGCCCAGATCGGCTTTGAAGTTATATCAAGATTTAAGTCTACTTCATGCCAATGAGCTACTCCTCAACAGGGGCTGGTTTTGCCATTTGAGGAATGACAGCCACTATGTTGTGTACACAAGAGAGCTGGATGGCATCGACAGAATCTTTATCGTGGTTCTGAATTTTGGAGAATCAACACTGTTAAATCTACATAATATGATTTCGGGCCTTCCCGCTAAAATGAGAATAAGGTTAAGTACCAATTCTGCCGACAAAGGCAGTAAAGTTGATACAAGTGGCATTTTTCTGGACAAGGGAGAGGGACTCATCTTTGAACACAACACGAAGAATCTCCTTCATCGCCAAACAGCTTTCAGAGATAGATGCTTTGTTTCCAATCGAGCATGCTATTCCAGTGTACCGAACATACTGTATACCTCGTGTTAGGCACCTTTATGAAGAGATGAAGACACTGGCATTTCAGTGGGATTGTAAGCATTTGTAATAGCTTCATGTACAGCATGCTGCTTGGTGAACAATCATTAATTCTTCGATATTTCTGTAGCTTGAATGTAACTGCTTTAAGAAAGGTTCTCAAATGTTTTGAAAAAAATAAAATGTTTAAAAGTAAATTATGGCTTATAGGAGCTTATAACTTTATTCAGATAGCATCAATCAGGGATGACCAGAACACATTAGGACCCCAGATTATTCAAAAACTTTAACGAATTTTAAGGGGAAGAATTTTATCTTTTCCCTTAAAATGCAGTCATAGAAATTAGAGGATGACTCACTGCCACAGTGTCTAAAAGCATTTGCTAGCAAAGAGGCAGGACACTAATTTGTAAACTGCTCAACTGTTCTGACTGGAAGGGAGGCCTGGAGCTCTGCTATCACCAATCCTTCCCTTCCCTCTACTCCACATCCTTCTAAGGAGCATGATTTGAAAATTACTTTCCTAGGTTAATGGGCATGTGCATCAATGGAGAGAATAGTATAAGCAAGTGAGATGTAGACTAAGCAAAATTTAGATGGAGAAGCACATTTTAAAAAATTAATAACTTAAAAGTCTCAAGTTATTAATTTTTTTTTTGCTAACTCAATTGGAAGTAAGACTATGAAATATTTCAGTGTGTTTCCAATTCCCAGTTGAATGCAGTGTTTCAGAATTTCAGGTATTTCTTAAGATCCTCGAAAACACTGGTGCTGTCAAGTCCAAGTTCCTCGTACAGGAATTTAATTTGGGCTGTAATCTAAAAGAAACACATTAAAAAAATTAAATAGAAGGCCTTTGTAGTAAAATGCCACTGTTTAAGCTTCTCTTTATCTATCCATCTTTACCTAACCGTGAAGTCAGCAATTTATGGCAAGAATACTTTCATTCGAGAGAGAGGCAGAAGGCTTCCAACAATTAAGATTAAATTATTTTCTTTAACAGAGCTCACGTATCAAGTACAAGAGAGAGACATTTCTCTTGATTGACACAGTGTCCCTCCCTCCCCTCCTGGGTCTCACCCATAGATAGGACATTTGTGAAGTGGCTTTGTCATAAACCTGCTGCAACCACTGAAAATGTGAAAACAACATGTATCTAGTTCGGGAATCTGTCCACTGAGAGGGCCTTGATAACATACCTTTTTGTGAGAATCCTCAATTACATGATTGCCTCCAGGCTGAATATCTAGAATAATATTAGGGGTCTGATAGCCTGGAAGAGTTAACATGTAGAACAATTAGAAGATTGTATGGGATCTTCTTTGGAAGATCGAGACCCATTCCTCCCCTCTTCTTTGAGTACTCAGTTCAAATAATAGTAAAGGAATAAAAAGCAAAAACCACCATCATCAACAAAAAGATGGGAGGGGACAAGCAACAGAAGACAAACTTCTGACACAGCGAAAGCAGGAAGAGGCCGTATGGAAAAGACTATATGGTGCCACACGGACAAGGTTGAAACCCAGGAGATCATCAACCTGCCCTGTGGAATCTGAGAGTCTTATGCCCTGGAAACACCAACTACAGCAATGGATGGGGGTGACAAATGGAGATGAATACAGGGAGACTGATATGGCATGTAGTTTCAAGGCAAAAGGGAGGGATTCTTATCTCATAAAGCTGAAACAGCTAGCTAGAGGAAATTCATGCAGCTAAACAGTTTGGGCACTGATGGCCCAAAACAAAAATCTCAGAATCTGTCTTTTAGAGATTCCCAAGAATAACGGCTCAATAAATATTGTTAAATGAATTAATAATTGTATGGCAGTGCATCTCCAAGTTATATCTGATTCTTAAATTTCCTGTTTCCTTTGTGTCCTGCCTATCTATTTTAATACTGTCCTTTGAAAAAGAGGTGAGGCAGTGTATGTATAGACATGTAGTTACGTACACTTTAACTGGGGAGTCAACATAGCAAAATAATTGTTTGCCCTAAATCCTGGGCAGATGATTTGGCTACAGCCTGAAATATAT
Task1_train_3489
The variant affects gene SIX3 (SIX homeobox 3), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; not specified
TCACAAAGGGAGGCCCGGCTCAAGATGCTGATTACAGCTTCTTAAAAGCAACATACCTAAGAATAAATACCCATGCCTGGCCTAGGGGCTGTGGTGGCCAGAGGCAGAGAGGGCCCTCTGTGTTCTATGGGCCTTTTGGCGTCTGTTTTAGGCTTTCGATGTTACTTTCCCTAGAGAAATTAGACAGTTTAAAAATAATAATGGTAATTATTATTATTTTACAATACGAGCAAACAAGCAATTTTCAGGCCTTATTCACTTCATCCGGGTGGCTGGCCTCCAAAGTTTGAGTGCCCTCTGGGGCTGGCAGGCAGGACCAGAGCTCCTTCTGTTGTGTGGTGAGGAGTGGGCATCTGTAGGACTTTTCTGGGTCCAGAGGGCTCTTGGGCTTCTCGGCTCCCGCAGCTCCTCCACCACTCCTCAGAGAGGCAGCTGAATTCTGGGAAGAAACAAAGAGTTGAGTTGCTTCTTAAGATGGAAAGAAGTGTACTGTTTGGACTGTTATTTTAAAATACAGGGTGGTGGGGGAAATCGAGGCTCCTTGGCCGGGGAGGGAGTAAAGAGAAGCCTAATTGATGAAGAGGGAGTTGAGGTGAATGCGGTCCATGGGCACCGATGGGGGAGGCAAGAGCGGCCTCCAGCACCCTGGGAATTGGGCTCAGGCTCCCTGGCGCCAGATACCCTCGGAATCCGGGATCCCCGGCTGGCGCCACGGCCCGCTGGGCCAAGGTCGGTGCTTGGTGGGCCCCATGATCTCATCTCTCCTTTCTTCCTTGCCACTATTAGTGCTCACATAGGCAGAAAGAGGCGGCCCGACGTGCAAACCATGTGCAAACCGCGCCCGCTGGGCTGGTCAGCCGTCTTTCCTTGCCTGCCGACCTGGACTATGTGGAGCCTGGGGGACCCTCTTGCCTCCCAACAAAATCCCCTCTCTAATTGCACATCCCATTCAACAACTCTGCCCAGGGCTTTTCGAATTTCTGGATCAACTTCTTTAGGAAAAAGGGAAGAAGAAGTCTCAGAGACAGCGGTAGAGAAAAGAGGAGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAGAGAGGAGGGGGAGGTAGCGAGATTAAGAGTTGCAAAGATAAAAAAAATTCTCTTTATCCCCCCACTTCTCCCTCCTTCCCTGCTCTCCCCCTCCCCCCGCCCTCTGGCTAAGTGGTAAAACCGTCCTTACGTTCTCGGTATTGATTGGCAGGGCTGACAGTGATTGGCAGTGGTTGCCGTGGCAACGCCACAACGACACGCCACAGACCAATAGAAAAGCGAAACAAAATGTTTCAATGCTGCACTCACTGTGGATTTAGGGGAGATATTATGAGGCTGTTGTCATTAGGGCGATTGCGGTGGAATCGCTGAATCTTGACTCGGCGGTGGTTGGCTCTCCCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTGTCTCGGGTTCTCTCTCTGCGCGCGCGCACCGGGCCGCTCTCCTACCTCCCTCTCTATGTGGCTGCGCGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGTGTGTGGGGTGTGGGTGTCCCTTACGCCCTTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCCTGCTCCCCCCTCCTTTCCTTCTCCTCCTCCCCCCTCTCCTCTCCCTCCTCCTGGTCCTCATCGCCCCTCTCCTCCTCTTCCTCCCCTCTCTCTTCCTCTCCCTGAATTTTCTCCTCTCCTCTCAGGTCAGTCCATGGTATTCCGCTCCCCCCTAGACCTCTATTCCTCCCACTTCTTGTTGCCAAACTTCGCCGATTCTCACCACCGCTCCATACTTCTGGCGAGTAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGCGGCGCGGGAGGCGGCAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGTGCTGGCGGAGCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCAGGGCCCCCCCGGAAGAGTTGTCCATGTTCCAGCTGCCCACCCTCAACTTCTCGCCGGAGCAGGTGGCCAGCGTCTGTGAGACGCTGGAGGAGACGGGCGACATCGAGCGGCTGGGCCGCTTCCTCTGGTCGCTGCCCGTGGCCCCCGGGGCGTGCGAGGCCATCAACAAACACGAGTCGATCCTGCGCGCGCGCGCCGTGGTCGCCTTCCACACGGGCAACTTCCGCGACCTCTACCACATCCTTGAGAACCACAAGTTCACCAAGGAGTCTCACGGCAAGCTGCAGGCCATGTGGCTCGAGGCGCACTACCAGGAGGCCGAGAAGCTGCGCGGCCGCCCACTCGGCCCGGTGGACAAGTACCGCGTGCGCAAGAAGTTCCCGCTGCCACGCACCATCTGGGACGGCGAGCAGAAGACGCATTGCTTCAAGGAGCGGACTCGGAGCCTGTTGCGGGAGTGGTACCTACAGGACCCCTACCCCAACCCCAGCAAGAAACGCGAACTGGCGCAGGCCACCGGCCTCACTCCCACACAAGTAGGCAACTGGTTTAAGAACCGGCGGCAGCGCGACCGCGCCGCGGCGGCCAAGAACAGGTTAGTGGCGGGGCCCGCGGCCTGGCTACAGCCTCAGAGGCCTGGGAAGGGGAGAGGGGTTGAGATGGGGCTAGCGGAGCGGCCGCTGAGAGCCAGGGAAGCCGTGACTCCTGGCCAGTCGGAGAAAGTTTCCGCTTGTCCGGGACGCGCGGAAGAGGGGGCCGGGCTGGCTGTGGGTGTATTGATTGCTTTGACCAAGAGGGGCTTTCGTCAGGGCAGAGAGTGTGTGCTTGCGACCCGAGTACCCGCAGCCCCTGGGAGACTTAGCCCTGCGCTGCACCCGTGCCTGCCTCCTCAGCCCTGCCGCCAGCTCGGCGATCCTCTGGAGCCTAGAGACAGGGAGGGAAGGAAAGCACTCTTTGCCATCTGGTTCTTATTTCTGTGCGTTGCAAAACCCCGAGAGAAATCCACTAGCGTCAGAGAGAGGAAAGTGAACCTGGGTCCCTATCACAAGGGGAAAAGGCCAGAGGCCACTGCGCAGCGGGCCTGTTTCCCCGCAACGCTGCACGTTGCCTGACCGGGAGCAGGAGAGCCGGGCTGGGAGTGGAGAGGCCTAGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGCACGCCCGTGTGCATGTACTCGCCCTCCTGTTTCAGCCGAGGAGAATCCCTTTGGTCCTCTAAGCTGGGAAGCGGGCACGAGCAGCCTCGTTGCCGGCAAGTTGGCCACAAAGTCACAAAATTGTATAGGGCTTGACCAACATCACAGGAGCTGGGCCTGGGGGAAGGAGAAAAAGAACCAGAGGGAAAGAAGTGGATAGGCGAAAGGAGTGGGGAGAGAAGGGAGAAAGAAAAGAGGAAGTTGGGTGAAAGCCCTGATGTGGAGCCTGTGTCTTTCTCTATCCAGCCAGGAAGGCCCAGGGCCTGGTGTACTTCAGGGAGCAGGACCCCCAGCTGCTGACAGCTGCCCGTGGGTGGGGGCTGGGTGTGAGTTTCTGGAGGTGTGTTCGAGTTTAGGCGGCCGGGACCTGAGCCCATGGCCCTCTCACCCCTGCCGTGGAGCCCACTTTTCGTCTGATGAGGGGAGCGCCCAGGGTCAAGCCAAGGCCTCCTTGTGGAGAGAATTCCAGACACCAGGTCCAGGCAGAAGGTTCCCGGTGGGGGAAAGGGCAGCTGGAGACTGCTCTGTGCGCCTCTCTTGCCTTCTCCTTTGCCCCTTTTCTGTCTCCCTGCTCTTTCCCCACTTTTCCACCGCCAGCTTTCCTATTTTCTCTACCCTCGGTCCTGCGCTCTGCGCTGGCATCCAGAGAGCAAAGTATGCAGTTCTACCCGGAGACTGGCCGGGCGGTGGGGAACCCGCAGCTCCCGGTGTGTGTTTGAGGGAGCAGGGACGGGGTTACTAGGGGAACTCGACCGGTCGCGGGGCAGCCGGCTCAGTTTGAAGAGCCCCAGGGACTGCGGAGGGAAGAAGCGCCCGGCTCCTCTCCGACTTCTGCTTCTCCAGGGCTTGGCGTACTTTGTCGCTTGCACCCAGGCCTCCCCAAGCGGCCGGGCTCGGGTTCTGCCTCTCCTCCGAGGCCAGCCTCTATCTGAGAAGACTTGGGATGCTCCCGAAAGCGG
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Task1_train_3490
This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SIX3 (SIX homeobox 3) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Holoprosencephaly 2
GGTGAGGAGTGGGCATCTGTAGGACTTTTCTGGGTCCAGAGGGCTCTTGGGCTTCTCGGCTCCCGCAGCTCCTCCACCACTCCTCAGAGAGGCAGCTGAATTCTGGGAAGAAACAAAGAGTTGAGTTGCTTCTTAAGATGGAAAGAAGTGTACTGTTTGGACTGTTATTTTAAAATACAGGGTGGTGGGGGAAATCGAGGCTCCTTGGCCGGGGAGGGAGTAAAGAGAAGCCTAATTGATGAAGAGGGAGTTGAGGTGAATGCGGTCCATGGGCACCGATGGGGGAGGCAAGAGCGGCCTCCAGCACCCTGGGAATTGGGCTCAGGCTCCCTGGCGCCAGATACCCTCGGAATCCGGGATCCCCGGCTGGCGCCACGGCCCGCTGGGCCAAGGTCGGTGCTTGGTGGGCCCCATGATCTCATCTCTCCTTTCTTCCTTGCCACTATTAGTGCTCACATAGGCAGAAAGAGGCGGCCCGACGTGCAAACCATGTGCAAACCGCGCCCGCTGGGCTGGTCAGCCGTCTTTCCTTGCCTGCCGACCTGGACTATGTGGAGCCTGGGGGACCCTCTTGCCTCCCAACAAAATCCCCTCTCTAATTGCACATCCCATTCAACAACTCTGCCCAGGGCTTTTCGAATTTCTGGATCAACTTCTTTAGGAAAAAGGGAAGAAGAAGTCTCAGAGACAGCGGTAGAGAAAAGAGGAGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAGAGAGGAGGGGGAGGTAGCGAGATTAAGAGTTGCAAAGATAAAAAAAATTCTCTTTATCCCCCCACTTCTCCCTCCTTCCCTGCTCTCCCCCTCCCCCCGCCCTCTGGCTAAGTGGTAAAACCGTCCTTACGTTCTCGGTATTGATTGGCAGGGCTGACAGTGATTGGCAGTGGTTGCCGTGGCAACGCCACAACGACACGCCACAGACCAATAGAAAAGCGAAACAAAATGTTTCAATGCTGCACTCACTGTGGATTTAGGGGAGATATTATGAGGCTGTTGTCATTAGGGCGATTGCGGTGGAATCGCTGAATCTTGACTCGGCGGTGGTTGGCTCTCCCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTGTCTCGGGTTCTCTCTCTGCGCGCGCGCACCGGGCCGCTCTCCTACCTCCCTCTCTATGTGGCTGCGCGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGTGTGTGGGGTGTGGGTGTCCCTTACGCCCTTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCCTGCTCCCCCCTCCTTTCCTTCTCCTCCTCCCCCCTCTCCTCTCCCTCCTCCTGGTCCTCATCGCCCCTCTCCTCCTCTTCCTCCCCTCTCTCTTCCTCTCCCTGAATTTTCTCCTCTCCTCTCAGGTCAGTCCATGGTATTCCGCTCCCCCCTAGACCTCTATTCCTCCCACTTCTTGTTGCCAAACTTCGCCGATTCTCACCACCGCTCCATACTTCTGGCGAGTAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGCGGCGCGGGAGGCGGCAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGTGCTGGCGGAGCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCAGGGCCCCCCCGGAAGAGTTGTCCATGTTCCAGCTGCCCACCCTCAACTTCTCGCCGGAGCAGGTGGCCAGCGTCTGTGAGACGCTGGAGGAGACGGGCGACATCGAGCGGCTGGGCCGCTTCCTCTGGTCGCTGCCCGTGGCCCCCGGGGCGTGCGAGGCCATCAACAAACACGAGTCGATCCTGCGCGCGCGCGCCGTGGTCGCCTTCCACACGGGCAACTTCCGCGACCTCTACCACATCCTTGAGAACCACAAGTTCACCAAGGAGTCTCACGGCAAGCTGCAGGCCATGTGGCTCGAGGCGCACTACCAGGAGGCCGAGAAGCTGCGCGGCCGCCCACTCGGCCCGGTGGACAAGTACCGCGTGCGCAAGAAGTTCCCGCTGCCACGCACCATCTGGGACGGCGAGCAGAAGACGCATTGCTTCAAGGAGCGGACTCGGAGCCTGTTGCGGGAGTGGTACCTACAGGACCCCTACCCCAACCCCAGCAAGAAACGCGAACTGGCGCAGGCCACCGGCCTCACTCCCACACAAGTAGGCAACTGGTTTAAGAACCGGCGGCAGCGCGACCGCGCCGCGGCGGCCAAGAACAGGTTAGTGGCGGGGCCCGCGGCCTGGCTACAGCCTCAGAGGCCTGGGAAGGGGAGAGGGGTTGAGATGGGGCTAGCGGAGCGGCCGCTGAGAGCCAGGGAAGCCGTGACTCCTGGCCAGTCGGAGAAAGTTTCCGCTTGTCCGGGACGCGCGGAAGAGGGGGCCGGGCTGGCTGTGGGTGTATTGATTGCTTTGACCAAGAGGGGCTTTCGTCAGGGCAGAGAGTGTGTGCTTGCGACCCGAGTACCCGCAGCCCCTGGGAGACTTAGCCCTGCGCTGCACCCGTGCCTGCCTCCTCAGCCCTGCCGCCAGCTCGGCGATCCTCTGGAGCCTAGAGACAGGGAGGGAAGGAAAGCACTCTTTGCCATCTGGTTCTTATTTCTGTGCGTTGCAAAACCCCGAGAGAAATCCACTAGCGTCAGAGAGAGGAAAGTGAACCTGGGTCCCTATCACAAGGGGAAAAGGCCAGAGGCCACTGCGCAGCGGGCCTGTTTCCCCGCAACGCTGCACGTTGCCTGACCGGGAGCAGGAGAGCCGGGCTGGGAGTGGAGAGGCCTAGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGCACGCCCGTGTGCATGTACTCGCCCTCCTGTTTCAGCCGAGGAGAATCCCTTTGGTCCTCTAAGCTGGGAAGCGGGCACGAGCAGCCTCGTTGCCGGCAAGTTGGCCACAAAGTCACAAAATTGTATAGGGCTTGACCAACATCACAGGAGCTGGGCCTGGGGGAAGGAGAAAAAGAACCAGAGGGAAAGAAGTGGATAGGCGAAAGGAGTGGGGAGAGAAGGGAGAAAGAAAAGAGGAAGTTGGGTGAAAGCCCTGATGTGGAGCCTGTGTCTTTCTCTATCCAGCCAGGAAGGCCCAGGGCCTGGTGTACTTCAGGGAGCAGGACCCCCAGCTGCTGACAGCTGCCCGTGGGTGGGGGCTGGGTGTGAGTTTCTGGAGGTGTGTTCGAGTTTAGGCGGCCGGGACCTGAGCCCATGGCCCTCTCACCCCTGCCGTGGAGCCCACTTTTCGTCTGATGAGGGGAGCGCCCAGGGTCAAGCCAAGGCCTCCTTGTGGAGAGAATTCCAGACACCAGGTCCAGGCAGAAGGTTCCCGGTGGGGGAAAGGGCAGCTGGAGACTGCTCTGTGCGCCTCTCTTGCCTTCTCCTTTGCCCCTTTTCTGTCTCCCTGCTCTTTCCCCACTTTTCCACCGCCAGCTTTCCTATTTTCTCTACCCTCGGTCCTGCGCTCTGCGCTGGCATCCAGAGAGCAAAGTATGCAGTTCTACCCGGAGACTGGCCGGGCGGTGGGGAACCCGCAGCTCCCGGTGTGTGTTTGAGGGAGCAGGGACGGGGTTACTAGGGGAACTCGACCGGTCGCGGGGCAGCCGGCTCAGTTTGAAGAGCCCCAGGGACTGCGGAGGGAAGAAGCGCCCGGCTCCTCTCCGACTTCTGCTTCTCCAGGGCTTGGCGTACTTTGTCGCTTGCACCCAGGCCTCCCCAAGCGGCCGGGCTCGGGTTCTGCCTCTCCTCCGAGGCCAGCCTCTATCTGAGAAGACTTGGGATGCTCCCGAAAGCGGAATGGGGAGCGGCGGCGCGGGGGAGCCGGGTGGCGGGCCTCTGTGTCAGGGCGGGCGCGGATCTCTTTCTCCCGCAGGCTCCAGCACCAGGCCATTGGACCGAGCGGCATGCGCTCGCTGGCCGAGCCCGGCTGCCCCACGCACGGCTCGGCAGAGTCGCCGTCCACGGCGGCCAGCCCGACCACCAGCGTGTCCAGCCTGACGGAGCGCGCAGACACCGGCACCTCCATCCTCTCGGTAACCTCCAGCGACTCGGAATGTGATGTATGATAGCCAAGGCCGCCCTCCTCCCTCTCCTTCCCCTCCTCCCCCACTCCTTCCCCTCCGCCTCCTAGCC
GGTGAGGAGTGGGCATCTGTAGGACTTTTCTGGGTCCAGAGGGCTCTTGGGCTTCTCGGCTCCCGCAGCTCCTCCACCACTCCTCAGAGAGGCAGCTGAATTCTGGGAAGAAACAAAGAGTTGAGTTGCTTCTTAAGATGGAAAGAAGTGTACTGTTTGGACTGTTATTTTAAAATACAGGGTGGTGGGGGAAATCGAGGCTCCTTGGCCGGGGAGGGAGTAAAGAGAAGCCTAATTGATGAAGAGGGAGTTGAGGTGAATGCGGTCCATGGGCACCGATGGGGGAGGCAAGAGCGGCCTCCAGCACCCTGGGAATTGGGCTCAGGCTCCCTGGCGCCAGATACCCTCGGAATCCGGGATCCCCGGCTGGCGCCACGGCCCGCTGGGCCAAGGTCGGTGCTTGGTGGGCCCCATGATCTCATCTCTCCTTTCTTCCTTGCCACTATTAGTGCTCACATAGGCAGAAAGAGGCGGCCCGACGTGCAAACCATGTGCAAACCGCGCCCGCTGGGCTGGTCAGCCGTCTTTCCTTGCCTGCCGACCTGGACTATGTGGAGCCTGGGGGACCCTCTTGCCTCCCAACAAAATCCCCTCTCTAATTGCACATCCCATTCAACAACTCTGCCCAGGGCTTTTCGAATTTCTGGATCAACTTCTTTAGGAAAAAGGGAAGAAGAAGTCTCAGAGACAGCGGTAGAGAAAAGAGGAGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAGAGAGGAGGGGGAGGTAGCGAGATTAAGAGTTGCAAAGATAAAAAAAATTCTCTTTATCCCCCCACTTCTCCCTCCTTCCCTGCTCTCCCCCTCCCCCCGCCCTCTGGCTAAGTGGTAAAACCGTCCTTACGTTCTCGGTATTGATTGGCAGGGCTGACAGTGATTGGCAGTGGTTGCCGTGGCAACGCCACAACGACACGCCACAGACCAATAGAAAAGCGAAACAAAATGTTTCAATGCTGCACTCACTGTGGATTTAGGGGAGATATTATGAGGCTGTTGTCATTAGGGCGATTGCGGTGGAATCGCTGAATCTTGACTCGGCGGTGGTTGGCTCTCCCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTGTCTCGGGTTCTCTCTCTGCGCGCGCGCACCGGGCCGCTCTCCTACCTCCCTCTCTATGTGGCTGCGCGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGTGTGTGGGGTGTGGGTGTCCCTTACGCCCTTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCCTGCTCCCCCCTCCTTTCCTTCTCCTCCTCCCCCCTCTCCTCTCCCTCCTCCTGGTCCTCATCGCCCCTCTCCTCCTCTTCCTCCCCTCTCTCTTCCTCTCCCTGAATTTTCTCCTCTCCTCTCAGGTCAGTCCATGGTATTCCGCTCCCCCCTAGACCTCTATTCCTCCCACTTCTTGTTGCCAAACTTCGCCGATTCTCACCACCGCTCCATACTTCTGGCGAGTAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGCGGCGCGGGAGGCGGCAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGTGCTGGCGGAGCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCAGGGCCCCCCCGGAAGAGTTGTCCATGTTCCAGCTGCCCACCCTCAACTTCTCGCCGGAGCAGGTGGCCAGCGTCTGTGAGACGCTGGAGGAGACGGGCGACATCGAGCGGCTGGGCCGCTTCCTCTGGTCGCTGCCCGTGGCCCCCGGGGCGTGCGAGGCCATCAACAAACACGAGTCGATCCTGCGCGCGCGCGCCGTGGTCGCCTTCCACACGGGCAACTTCCGCGACCTCTACCACATCCTTGAGAACCACAAGTTCACCAAGGAGTCTCACGGCAAGCTGCAGGCCATGTGGCTCGAGGCGCACTACCAGGAGGCCGAGAAGCTGCGCGGCCGCCCACTCGGCCCGGTGGACAAGTACCGCGTGCGCAAGAAGTTCCCGCTGCCACGCACCATCTGGGACGGCGAGCAGAAGACGCATTGCTTCAAGGAGCGGACTCGGAGCCTGTTGCGGGAGTGGTACGTACAGGACCCCTACCCCAACCCCAGCAAGAAACGCGAACTGGCGCAGGCCACCGGCCTCACTCCCACACAAGTAGGCAACTGGTTTAAGAACCGGCGGCAGCGCGACCGCGCCGCGGCGGCCAAGAACAGGTTAGTGGCGGGGCCCGCGGCCTGGCTACAGCCTCAGAGGCCTGGGAAGGGGAGAGGGGTTGAGATGGGGCTAGCGGAGCGGCCGCTGAGAGCCAGGGAAGCCGTGACTCCTGGCCAGTCGGAGAAAGTTTCCGCTTGTCCGGGACGCGCGGAAGAGGGGGCCGGGCTGGCTGTGGGTGTATTGATTGCTTTGACCAAGAGGGGCTTTCGTCAGGGCAGAGAGTGTGTGCTTGCGACCCGAGTACCCGCAGCCCCTGGGAGACTTAGCCCTGCGCTGCACCCGTGCCTGCCTCCTCAGCCCTGCCGCCAGCTCGGCGATCCTCTGGAGCCTAGAGACAGGGAGGGAAGGAAAGCACTCTTTGCCATCTGGTTCTTATTTCTGTGCGTTGCAAAACCCCGAGAGAAATCCACTAGCGTCAGAGAGAGGAAAGTGAACCTGGGTCCCTATCACAAGGGGAAAAGGCCAGAGGCCACTGCGCAGCGGGCCTGTTTCCCCGCAACGCTGCACGTTGCCTGACCGGGAGCAGGAGAGCCGGGCTGGGAGTGGAGAGGCCTAGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGCACGCCCGTGTGCATGTACTCGCCCTCCTGTTTCAGCCGAGGAGAATCCCTTTGGTCCTCTAAGCTGGGAAGCGGGCACGAGCAGCCTCGTTGCCGGCAAGTTGGCCACAAAGTCACAAAATTGTATAGGGCTTGACCAACATCACAGGAGCTGGGCCTGGGGGAAGGAGAAAAAGAACCAGAGGGAAAGAAGTGGATAGGCGAAAGGAGTGGGGAGAGAAGGGAGAAAGAAAAGAGGAAGTTGGGTGAAAGCCCTGATGTGGAGCCTGTGTCTTTCTCTATCCAGCCAGGAAGGCCCAGGGCCTGGTGTACTTCAGGGAGCAGGACCCCCAGCTGCTGACAGCTGCCCGTGGGTGGGGGCTGGGTGTGAGTTTCTGGAGGTGTGTTCGAGTTTAGGCGGCCGGGACCTGAGCCCATGGCCCTCTCACCCCTGCCGTGGAGCCCACTTTTCGTCTGATGAGGGGAGCGCCCAGGGTCAAGCCAAGGCCTCCTTGTGGAGAGAATTCCAGACACCAGGTCCAGGCAGAAGGTTCCCGGTGGGGGAAAGGGCAGCTGGAGACTGCTCTGTGCGCCTCTCTTGCCTTCTCCTTTGCCCCTTTTCTGTCTCCCTGCTCTTTCCCCACTTTTCCACCGCCAGCTTTCCTATTTTCTCTACCCTCGGTCCTGCGCTCTGCGCTGGCATCCAGAGAGCAAAGTATGCAGTTCTACCCGGAGACTGGCCGGGCGGTGGGGAACCCGCAGCTCCCGGTGTGTGTTTGAGGGAGCAGGGACGGGGTTACTAGGGGAACTCGACCGGTCGCGGGGCAGCCGGCTCAGTTTGAAGAGCCCCAGGGACTGCGGAGGGAAGAAGCGCCCGGCTCCTCTCCGACTTCTGCTTCTCCAGGGCTTGGCGTACTTTGTCGCTTGCACCCAGGCCTCCCCAAGCGGCCGGGCTCGGGTTCTGCCTCTCCTCCGAGGCCAGCCTCTATCTGAGAAGACTTGGGATGCTCCCGAAAGCGGAATGGGGAGCGGCGGCGCGGGGGAGCCGGGTGGCGGGCCTCTGTGTCAGGGCGGGCGCGGATCTCTTTCTCCCGCAGGCTCCAGCACCAGGCCATTGGACCGAGCGGCATGCGCTCGCTGGCCGAGCCCGGCTGCCCCACGCACGGCTCGGCAGAGTCGCCGTCCACGGCGGCCAGCCCGACCACCAGCGTGTCCAGCCTGACGGAGCGCGCAGACACCGGCACCTCCATCCTCTCGGTAACCTCCAGCGACTCGGAATGTGATGTATGATAGCCAAGGCCGCCCTCCTCCCTCTCCTTCCCCTCCTCCCCCACTCCTTCCCCTCCGCCTCCTAGCC
Task1_train_3491
This mutation occurs in SIX3 (SIX homeobox 3) on Chromosome 2. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Holoprosencephaly 2
CCACCACTCCTCAGAGAGGCAGCTGAATTCTGGGAAGAAACAAAGAGTTGAGTTGCTTCTTAAGATGGAAAGAAGTGTACTGTTTGGACTGTTATTTTAAAATACAGGGTGGTGGGGGAAATCGAGGCTCCTTGGCCGGGGAGGGAGTAAAGAGAAGCCTAATTGATGAAGAGGGAGTTGAGGTGAATGCGGTCCATGGGCACCGATGGGGGAGGCAAGAGCGGCCTCCAGCACCCTGGGAATTGGGCTCAGGCTCCCTGGCGCCAGATACCCTCGGAATCCGGGATCCCCGGCTGGCGCCACGGCCCGCTGGGCCAAGGTCGGTGCTTGGTGGGCCCCATGATCTCATCTCTCCTTTCTTCCTTGCCACTATTAGTGCTCACATAGGCAGAAAGAGGCGGCCCGACGTGCAAACCATGTGCAAACCGCGCCCGCTGGGCTGGTCAGCCGTCTTTCCTTGCCTGCCGACCTGGACTATGTGGAGCCTGGGGGACCCTCTTGCCTCCCAACAAAATCCCCTCTCTAATTGCACATCCCATTCAACAACTCTGCCCAGGGCTTTTCGAATTTCTGGATCAACTTCTTTAGGAAAAAGGGAAGAAGAAGTCTCAGAGACAGCGGTAGAGAAAAGAGGAGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAGAGAGGAGGGGGAGGTAGCGAGATTAAGAGTTGCAAAGATAAAAAAAATTCTCTTTATCCCCCCACTTCTCCCTCCTTCCCTGCTCTCCCCCTCCCCCCGCCCTCTGGCTAAGTGGTAAAACCGTCCTTACGTTCTCGGTATTGATTGGCAGGGCTGACAGTGATTGGCAGTGGTTGCCGTGGCAACGCCACAACGACACGCCACAGACCAATAGAAAAGCGAAACAAAATGTTTCAATGCTGCACTCACTGTGGATTTAGGGGAGATATTATGAGGCTGTTGTCATTAGGGCGATTGCGGTGGAATCGCTGAATCTTGACTCGGCGGTGGTTGGCTCTCCCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTGTCTCGGGTTCTCTCTCTGCGCGCGCGCACCGGGCCGCTCTCCTACCTCCCTCTCTATGTGGCTGCGCGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGTGTGTGGGGTGTGGGTGTCCCTTACGCCCTTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCCTGCTCCCCCCTCCTTTCCTTCTCCTCCTCCCCCCTCTCCTCTCCCTCCTCCTGGTCCTCATCGCCCCTCTCCTCCTCTTCCTCCCCTCTCTCTTCCTCTCCCTGAATTTTCTCCTCTCCTCTCAGGTCAGTCCATGGTATTCCGCTCCCCCCTAGACCTCTATTCCTCCCACTTCTTGTTGCCAAACTTCGCCGATTCTCACCACCGCTCCATACTTCTGGCGAGTAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGCGGCGCGGGAGGCGGCAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGTGCTGGCGGAGCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCAGGGCCCCCCCGGAAGAGTTGTCCATGTTCCAGCTGCCCACCCTCAACTTCTCGCCGGAGCAGGTGGCCAGCGTCTGTGAGACGCTGGAGGAGACGGGCGACATCGAGCGGCTGGGCCGCTTCCTCTGGTCGCTGCCCGTGGCCCCCGGGGCGTGCGAGGCCATCAACAAACACGAGTCGATCCTGCGCGCGCGCGCCGTGGTCGCCTTCCACACGGGCAACTTCCGCGACCTCTACCACATCCTTGAGAACCACAAGTTCACCAAGGAGTCTCACGGCAAGCTGCAGGCCATGTGGCTCGAGGCGCACTACCAGGAGGCCGAGAAGCTGCGCGGCCGCCCACTCGGCCCGGTGGACAAGTACCGCGTGCGCAAGAAGTTCCCGCTGCCACGCACCATCTGGGACGGCGAGCAGAAGACGCATTGCTTCAAGGAGCGGACTCGGAGCCTGTTGCGGGAGTGGTACCTACAGGACCCCTACCCCAACCCCAGCAAGAAACGCGAACTGGCGCAGGCCACCGGCCTCACTCCCACACAAGTAGGCAACTGGTTTAAGAACCGGCGGCAGCGCGACCGCGCCGCGGCGGCCAAGAACAGGTTAGTGGCGGGGCCCGCGGCCTGGCTACAGCCTCAGAGGCCTGGGAAGGGGAGAGGGGTTGAGATGGGGCTAGCGGAGCGGCCGCTGAGAGCCAGGGAAGCCGTGACTCCTGGCCAGTCGGAGAAAGTTTCCGCTTGTCCGGGACGCGCGGAAGAGGGGGCCGGGCTGGCTGTGGGTGTATTGATTGCTTTGACCAAGAGGGGCTTTCGTCAGGGCAGAGAGTGTGTGCTTGCGACCCGAGTACCCGCAGCCCCTGGGAGACTTAGCCCTGCGCTGCACCCGTGCCTGCCTCCTCAGCCCTGCCGCCAGCTCGGCGATCCTCTGGAGCCTAGAGACAGGGAGGGAAGGAAAGCACTCTTTGCCATCTGGTTCTTATTTCTGTGCGTTGCAAAACCCCGAGAGAAATCCACTAGCGTCAGAGAGAGGAAAGTGAACCTGGGTCCCTATCACAAGGGGAAAAGGCCAGAGGCCACTGCGCAGCGGGCCTGTTTCCCCGCAACGCTGCACGTTGCCTGACCGGGAGCAGGAGAGCCGGGCTGGGAGTGGAGAGGCCTAGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGCACGCCCGTGTGCATGTACTCGCCCTCCTGTTTCAGCCGAGGAGAATCCCTTTGGTCCTCTAAGCTGGGAAGCGGGCACGAGCAGCCTCGTTGCCGGCAAGTTGGCCACAAAGTCACAAAATTGTATAGGGCTTGACCAACATCACAGGAGCTGGGCCTGGGGGAAGGAGAAAAAGAACCAGAGGGAAAGAAGTGGATAGGCGAAAGGAGTGGGGAGAGAAGGGAGAAAGAAAAGAGGAAGTTGGGTGAAAGCCCTGATGTGGAGCCTGTGTCTTTCTCTATCCAGCCAGGAAGGCCCAGGGCCTGGTGTACTTCAGGGAGCAGGACCCCCAGCTGCTGACAGCTGCCCGTGGGTGGGGGCTGGGTGTGAGTTTCTGGAGGTGTGTTCGAGTTTAGGCGGCCGGGACCTGAGCCCATGGCCCTCTCACCCCTGCCGTGGAGCCCACTTTTCGTCTGATGAGGGGAGCGCCCAGGGTCAAGCCAAGGCCTCCTTGTGGAGAGAATTCCAGACACCAGGTCCAGGCAGAAGGTTCCCGGTGGGGGAAAGGGCAGCTGGAGACTGCTCTGTGCGCCTCTCTTGCCTTCTCCTTTGCCCCTTTTCTGTCTCCCTGCTCTTTCCCCACTTTTCCACCGCCAGCTTTCCTATTTTCTCTACCCTCGGTCCTGCGCTCTGCGCTGGCATCCAGAGAGCAAAGTATGCAGTTCTACCCGGAGACTGGCCGGGCGGTGGGGAACCCGCAGCTCCCGGTGTGTGTTTGAGGGAGCAGGGACGGGGTTACTAGGGGAACTCGACCGGTCGCGGGGCAGCCGGCTCAGTTTGAAGAGCCCCAGGGACTGCGGAGGGAAGAAGCGCCCGGCTCCTCTCCGACTTCTGCTTCTCCAGGGCTTGGCGTACTTTGTCGCTTGCACCCAGGCCTCCCCAAGCGGCCGGGCTCGGGTTCTGCCTCTCCTCCGAGGCCAGCCTCTATCTGAGAAGACTTGGGATGCTCCCGAAAGCGGAATGGGGAGCGGCGGCGCGGGGGAGCCGGGTGGCGGGCCTCTGTGTCAGGGCGGGCGCGGATCTCTTTCTCCCGCAGGCTCCAGCACCAGGCCATTGGACCGAGCGGCATGCGCTCGCTGGCCGAGCCCGGCTGCCCCACGCACGGCTCGGCAGAGTCGCCGTCCACGGCGGCCAGCCCGACCACCAGCGTGTCCAGCCTGACGGAGCGCGCAGACACCGGCACCTCCATCCTCTCGGTAACCTCCAGCGACTCGGAATGTGATGTATGATAGCCAAGGCCGCCCTCCTCCCTCTCCTTCCCCTCCTCCCCCACTCCTTCCCCTCCGCCTCCTAGCCCTCCTCCTCTTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCATCCCCAGAACAAACCGAAATCAGGATACCCAACCATAC
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Task1_train_3492
Here is a mutation in PRKCE (protein kinase C epsilon) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; not provided
TCTAAACTGTGAGTGTTTTAACTGTTTCTAAATGCTTCTTCTATCCAAATCTTTCTAGTTCATCCTAAGCAATTTGTAACCTCTAGAAGGGTATTTTGAGCAGACCACAGAAAGTCCAGATACTTGAATTCAGCCTCCTCTTCCCTGGCCACCATGAAATCTGAGAACTAAATTGGAGCCTTGTCCCCAGCCTGAGATATTATCTGCCCAAGGTGTCCCATGGGCTGGAATGACTAGGCATGAACTTTGCCTTTTTTTTTCAGGGTCCTCAAAGTGTTCCCCCTTGCAGGATATGCACTCCAACCTTGTTTCTCCTTCCCTTTTTAAAATTCTTTATAGAATTATGGACCTGGATAGGTCATCTCATCCACCCTCCTGTTTCTGGGCAGAGCCATGCCTAATCCCACTCTAATAAGAAGAGAAAATAATTGTGGAATGGGAATGTCACCTCATGATCTCTTCCTTGTAGAGTGGACAGCTCAGCATTTATTTTTCCTCTGAGCCAAACACATCATTGATCTGCTACATATTTATTTTATTTATATATGTTATATTTTAAAGGCATACTGTAAAATACAAAGCTCTATACAGCTGAAAGGTGATATTAAATTCTAGTCTTTTCTATTGGATGTCATCTCCATATATATATATATGTATTTTTATATATATGTATTTATATATATGTATTTATATATATATGTCATTGACATGCTACATATTTATATGTGCGTGTGTGTGTATCATGTATTTATGACATATGTGTATGGAGAGCAGATCAAATAGAATAGCCAATCAGAAAAGATCCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGGTCTCACTCTGTTACCCAGGTTGAAGTGCAGTCGCATGATTATGACTCACTACAGCCTCAAACTCCCGGGCTCAAGTGATTTTTCCACCTCAGCCTTCTGAGAAGGTGAGACTACAGACACGTACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTTAAGAGACAGGGTCTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAAGTCCTGGACTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCATTGCGCCCAGCCAGAAAAGATGTCTTGTATTCAGTAGCATCATGTCATACATGCATTTAATCTAAGTGAATTTGACTCTACATATTTGGCTAGAGGAAAAAGAGAGACAGCATAGATAAGACAAGTGACCATTGTCAAAGACAAAATGCACCAGACAATCAAGGAGATGGTTCGATTCTGGCTATTGCAATAGGGGGTTCATTAGTGAAGGTGGCCCCAAAGGAAGGGGGCCTACGGTTTTGTAGAGGCAGGCAAAGTGGGGGATTCTTCAGTGGATCTTATGGGAATCATGATGAACAATAGAGATGGGTTTTTTCTTAGAATATGCAAGAGTATAGTGGTCCTTTATAGGGAGACCATTACAGGGTGGGGGAGACTTATTCATTGCAGTTTCCTCTCCAGGAGCACAGGGCTCAGGTAAATTGAGTGTTGCACCATTTAAAGAAGACCTCTGCTCACCTTTCCACTCAGGCAGTGAGCTGTGCCCTGGACTGTGTGAGATGGGAGACCTGACCTCGCTGCACTCTGAGTCACTTACAGCTTGTTCTCTCAGTATGCATCGTGCTCCCCTGACCCTGATTTTAGTGTCAAAATATGCAGTTTTTTAAAATGTGGCCCTCATGCCAGTCAGGAACTTTATCTGGTGCTCAAAGAAATAGGAATTTGTTCCCACTGGAAGACAGACTGTCGATGTTGACTTTGGAAAGATGATAGCTGGCCCCCAGCATAGTGCCTCCAAACTCAACTGTCACTGAATTTGCTGATTTAGAACTTCTAGGACTAGGACTCAACTGTAGGGAGGAGCAAGTTGGAATTGAAGTCCTTCCCATGGGCGTTCGTAGCACGGGTGTCACTGGGGTGGGAGCCTTTGATGGTGCCTGACATTGCTGGTTTCCTGAACAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGACTGGTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACGACCTATTTGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTGAAAGCTGTGAGTCACTGCCCCTCACCCATGGCTGTGCTCTCCTGGGCTCCTCCCCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCCCTTCTCCCTTTCTCTGTCCAGCTTTCTCCCTCCCACCTCTGCTCATCACCACGGAATGGGAAGGATTAAGGGCAGTTGCCACTGGGAGTTCAGGCACAGTGCAGAGGACTGCTGCCAAGAGAATGGGGCCTGAGATGACTTGCTCTTCTGGTGGGAAGAGGAGCGCATGTCTGTGCTTCCTGAGATGAGGCACTGTGTACATCTGTGTCCTCCAGCATTTCAGAGGGAACAGAAGCAACTCAACTGTGCTGACATCACCTCTGCCACTTCCATACCTTCCTTACCTGTGGCCTGTCTTCATCAGGGACCTGTGATGGAGAACAGAGAGGAGGGGAGGGAGGGTGGGCACCGCCCACCTGTGTCCACGACAGCATCACTGTGGCTCAAGAGCCAATCAGAAAAGATCTGGTACACTGGAAATTCATGCAGTCCTGCTGGATTTAGATACATAATACAGAGACTGACCCTGCCCTAGGAATCATCCCTCACATGGGAAAACCCCTTATGCTTTCTCAGCACAGCCATCTCTACGATGTAACAATGCTTGTACTGTGTCAAGCAAGTGATGTTACCTGTCCCCTTTTGAAATCCGTGAAAGCTGAGGTACAGGGAAGTTAAGCAAGCAGTCTGCCCAGGGTCACCCCTCTGAGCTAAGATAGGATGAGGGTGACAACCCAGGGACCATGACTTCTAGACTTGGCTTCTTCCACTCATCTGAATGCCCCAAAATTCAATCATTTGCACATTATAGTCACAAAATTTGCCATCTTCAAGTGTCTTCTGCACTATTACTAGCTTTTCTTGTTCTTTTAATCAACTTCCAATATTTACCTGATTATATGTATTTTACAAAGAAATTTTTTTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTCACTGCAATGGCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCTATCTTGGCTCACTGCAATCTCCTCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGTGACAAGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGCCTTGAACTCTTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACTGCGCCCAGCCTGTATTTTACAAAGAAATTTTATACCATTATCGTAGGTAGAAAATCAGTATCACTTGCCATAATGAATTAATGTAATTTTTTTTCAAGATGGAGTGTTGCTTTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCGCCCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTTCCGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTACACCCTACCTAATGTAAATTATTGTATAAAAATTTTTGAAAGATCTAAAACCATTTTGTAGGTATCTGAGGGTGCATGTACCATGTTTTAGAAAACTCCACATCAGAACATGTTACCCTTTTCTGTAGTTTTTTTTTCCTCCTTCCTTTCCTCTTTCCCTCACCTCATTCCTTCTCTCCCCTCTGCCCTTACTCTCCTCCCTCTCTCTTTCATTCATTCATTCAATGAACTACTATCTATTGAGCACTTCCAACATGCTAGGCATGGTGCTAGATGCTGAATAAGTATTGGTGAGACCTGGTCTCTGCCTTGTG
TCTAAACTGTGAGTGTTTTAACTGTTTCTAAATGCTTCTTCTATCCAAATCTTTCTAGTTCATCCTAAGCAATTTGTAACCTCTAGAAGGGTATTTTGAGCAGACCACAGAAAGTCCAGATACTTGAATTCAGCCTCCTCTTCCCTGGCCACCATGAAATCTGAGAACTAAATTGGAGCCTTGTCCCCAGCCTGAGATATTATCTGCCCAAGGTGTCCCATGGGCTGGAATGACTAGGCATGAACTTTGCCTTTTTTTTTCAGGGTCCTCAAAGTGTTCCCCCTTGCAGGATATGCACTCCAACCTTGTTTCTCCTTCCCTTTTTAAAATTCTTTATAGAATTATGGACCTGGATAGGTCATCTCATCCACCCTCCTGTTTCTGGGCAGAGCCATGCCTAATCCCACTCTAATAAGAAGAGAAAATAATTGTGGAATGGGAATGTCACCTCATGATCTCTTCCTTGTAGAGTGGACAGCTCAGCATTTATTTTTCCTCTGAGCCAAACACATCATTGATCTGCTACATATTTATTTTATTTATATATGTTATATTTTAAAGGCATACTGTAAAATACAAAGCTCTATACAGCTGAAAGGTGATATTAAATTCTAGTCTTTTCTATTGGATGTCATCTCCATATATATATATATGTATTTTTATATATATGTATTTATATATATGTATTTATATATATATGTCATTGACATGCTACATATTTATATGTGCGTGTGTGTGTATCATGTATTTATGACATATGTGTATGGAGAGCAGATCAAATAGAATAGCCAATCAGAAAAGATCCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGGTCTCACTCTGTTACCCAGGTTGAAGTGCAGTCGCATGATTATGACTCACTACAGCCTCAAACTCCCGGGCTCAAGTGATTTTTCCACCTCAGCCTTCTGAGAAGGTGAGACTACAGACACGTACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTTAAGAGACAGGGTCTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAAGTCCTGGACTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCATTGCGCCCAGCCAGAAAAGATGTCTTGTATTCAGTAGCATCATGTCATACATGCATTTAATCTAAGTGAATTTGACTCTACATATTTGGCTAGAGGAAAAAGAGAGACAGCATAGATAAGACAAGTGACCATTGTCAAAGACAAAATGCACCAGACAATCAAGGAGATGGTTCGATTCTGGCTATTGCAATAGGGGGTTCATTAGTGAAGGTGGCCCCAAAGGAAGGGGGCCTACGGTTTTGTAGAGGCAGGCAAAGTGGGGGATTCTTCAGTGGATCTTATGGGAATCATGATGAACAATAGAGATGGGTTTTTTCTTAGAATATGCAAGAGTATAGTGGTCCTTTATAGGGAGACCATTACAGGGTGGGGGAGACTTATTCATTGCAGTTTCCTCTCCAGGAGCACAGGGCTCAGGTAAATTGAGTGTTGCACCATTTAAAGAAGACCTCTGCTCACCTTTCCACTCAGGCAGTGAGCTGTGCCCTGGACTGTGTGAGATGGGAGACCTGACCTCGCTGCACTCTGAGTCACTTACAGCTTGTTCTCTCAGTATGCATCGTGCTCCCCTGACCCTGATTTTAGTGTCAAAATATGCAGTTTTTTAAAATGTGGCCCTCATGCCAGTCAGGAACTTTATCTGGTGCTCAAAGAAATAGGAATTTGTTCCCACTGGAAGACAGACTGTCGATGTTGACTTTGGAAAGATGATAGCTGGCCCCCAGCATAGTGCCTCCAAACTCAACTGTCACTGAATTTGCTGATTTAGAACTTCTAGGACTAGGACTCAACTGTAGGGAGGAGCAAGTTGGAATTGAAGTCCTTCCCATGGGCGTTCGTAGCACGGGTGTCACTGGGGTGGGAGCCTTTGATGGTGCCTGACATTGCTGGTTTCCTGAACAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGACTGGTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACAAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACGACCTATTTGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTGAAAGCTGTGAGTCACTGCCCCTCACCCATGGCTGTGCTCTCCTGGGCTCCTCCCCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCCCTTCTCCCTTTCTCTGTCCAGCTTTCTCCCTCCCACCTCTGCTCATCACCACGGAATGGGAAGGATTAAGGGCAGTTGCCACTGGGAGTTCAGGCACAGTGCAGAGGACTGCTGCCAAGAGAATGGGGCCTGAGATGACTTGCTCTTCTGGTGGGAAGAGGAGCGCATGTCTGTGCTTCCTGAGATGAGGCACTGTGTACATCTGTGTCCTCCAGCATTTCAGAGGGAACAGAAGCAACTCAACTGTGCTGACATCACCTCTGCCACTTCCATACCTTCCTTACCTGTGGCCTGTCTTCATCAGGGACCTGTGATGGAGAACAGAGAGGAGGGGAGGGAGGGTGGGCACCGCCCACCTGTGTCCACGACAGCATCACTGTGGCTCAAGAGCCAATCAGAAAAGATCTGGTACACTGGAAATTCATGCAGTCCTGCTGGATTTAGATACATAATACAGAGACTGACCCTGCCCTAGGAATCATCCCTCACATGGGAAAACCCCTTATGCTTTCTCAGCACAGCCATCTCTACGATGTAACAATGCTTGTACTGTGTCAAGCAAGTGATGTTACCTGTCCCCTTTTGAAATCCGTGAAAGCTGAGGTACAGGGAAGTTAAGCAAGCAGTCTGCCCAGGGTCACCCCTCTGAGCTAAGATAGGATGAGGGTGACAACCCAGGGACCATGACTTCTAGACTTGGCTTCTTCCACTCATCTGAATGCCCCAAAATTCAATCATTTGCACATTATAGTCACAAAATTTGCCATCTTCAAGTGTCTTCTGCACTATTACTAGCTTTTCTTGTTCTTTTAATCAACTTCCAATATTTACCTGATTATATGTATTTTACAAAGAAATTTTTTTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTCACTGCAATGGCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCTATCTTGGCTCACTGCAATCTCCTCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGTGACAAGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGCCTTGAACTCTTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACTGCGCCCAGCCTGTATTTTACAAAGAAATTTTATACCATTATCGTAGGTAGAAAATCAGTATCACTTGCCATAATGAATTAATGTAATTTTTTTTCAAGATGGAGTGTTGCTTTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCGCCCACCACCATGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTTCCGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTACACCCTACCTAATGTAAATTATTGTATAAAAATTTTTGAAAGATCTAAAACCATTTTGTAGGTATCTGAGGGTGCATGTACCATGTTTTAGAAAACTCCACATCAGAACATGTTACCCTTTTCTGTAGTTTTTTTTTCCTCCTTCCTTTCCTCTTTCCCTCACCTCATTCCTTCTCTCCCCTCTGCCCTTACTCTCCTCCCTCTCTCTTTCATTCATTCATTCAATGAACTACTATCTATTGAGCACTTCCAACATGCTAGGCATGGTGCTAGATGCTGAATAAGTATTGGTGAGACCTGGTCTCTGCCTTGTG
Task1_train_3493
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene EPAS1 (endothelial PAS domain protein 1). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Erythrocytosis, familial, 4
CTACCAGGTATCAGAGCTGTTTTCTTCCTTTTAGTGTTCATCCCCCAACTCCATTGAAATAAGCTCCTTGAAGGGCTTTGAGCCCCCAGCTCAGTCCCCATACAGGGCAGTAACATCCCGTATGTGGCACAGAGCTGCACAGTTTGCACAGCCCTGCTGGCCACAGCCTGTATCCTGTTTGGTCCTCAAGACAGGACAACCTGTGAAGCGACAGTAGCCTCATTTTATGATGAGGAGACTGGAATTTAGAGAGGTTGATGAATTGACCTAATTCATACAGCTTGTTAATTAGCAGCCCCTCTACAAATAGTTGTGTGGTGGAATGGAATTGAACCTTTGGGTCCAGGAAGGTATTTCTTCTTCCATGCTGGACTTCTGGGGAGACCAGTGCCATATCTTTGACTCTGTCCCCCTCCTTCCTGGCCCCTAGCCCAATAGCCCTGAAGACTATTACACATCTTTGGATAACGACCTGAAGATTGAAGTGATTGAGAAGCTCTTCGCCATGGACACAGAGGCCAAGGACCAATGCAGTACCCAGGTAGATGGCTGTGGAGATCAGGCTAGGGTGTGTGCCTGCTGTCTGGTGGACAGCAAAGGCTCACATCCATTCTTGTAGCCTCATCCCTTTGTTGTAAAGAGCAGTGGAGACGTTTGGCCAAGGCCCAGGTCCCCTAAAGAGGTAGGGGTACAGGGTAATGGAGCCTGTGGTCACCCCCTCCTCCCACTGTCAAATCCAGCTCTTCCAGCATATGTGTCTCCTACTTAGATAGCTTTCTTAGCACACATGAAAACCGAAATGATACCACTGCACCTTTCTTTAAACAGGCCCTACATTTAACAAGCATAGCCAGATGTATAAAACATGTATAAACATAGGGGACAATTAATCCCTTTATAAACACATTCATCTTGTGATTTTAAAAAAATAATCATTTTTATATGAAATGCACTTTAAAATAAATAACATCTGTTTGACAATTTTTCATTTACATAAAACTTTTCAGGAACACATTTATTACATAAGGCCAATGTTCTTGCAAAAACTATGTAAACAAGGATAAGGTAGAGGGAGGGGTACGTGTTTTACAAAACCCCAGGGAAAACCATTAATCCCCCATTTGTCTTAGTCTTGAGTTCAACCAGATTTCTGCCTTGCCACTTAGTTTGTTTCTTGATCCTACTTGGCACAAATCCCAGCTACTCTGCAAAACATGCCCAATTTTAGCTTTTCTATCACCCTCCCTCCTCAGCACTCCTGTAGTATATATCATGTGGCACTTAATCACAGCTATCTGCTTCTGCTCCTTAAAGATTGCTTAGTATTGCAGTCATTAGTCAGCTGACACCCACTGAGGGTGTCAGTCTCTGAAGTTAGAAACTGTTTTCCGCATCTGCTTGTATTCCCCTGCTTGTATCATGCGTCCGTCATGATACTGCCACCCTAAGGGATGATCTGAGTATCTGCTGATTGGAACCAAAGTCTCTGTCCCTGGGGTCTGGCTGTTAGGCTGTTACTCTGCGAGAGTCCACAGATGGACCTGGGCACTTACTGCTTGCTTAGGCCCGTGCCAGCTTACAGGAGGGAGAAGAGGACAAAAAAAAGCCACAGTGTGCACCACAGGCCTAAGCATTGTAGGACAAGGATAACCACCACAGGCTGGAGTAGGCAGGGCTGACTCTGTGGAAGAGGGGCTGCCTCGGCTTCAAGAGAGAAGGCGGGCTCCGGACAGGTGGGATGGGGAGAGGAGAACATTTCTCAATGTGCAGGGTGAAGAGGGGATAAACATGGGGGAAGGCTGGTACATGATACAAGGTCGTGTACATGACACAGCCAAGTCTGAGGTTTTCCTGATAGGCCCTCGGGAGCCAGTGGAGGCGTTTGAGCAGCACTGTGAAACAGTGCTTGAGATGAATGGCTCTGCAGGAGCTGAGTTGGAATAGTGTTTGTGAGGTCGTACCAACCCCCTTGCCTCTTTGCCGGTGCTGTCTCCCCTCAGACGGATTTCAATGAGCTGGACTTGGAGACACTGGCACCCTATATCCCCATGGACGGGGAAGACTTCCAGCTAAGCCCCATCTGCCCCGAGGAGCGGCTCTTGGCGGAGAACCCACAGTCCACCCCCCAGCACTGCTTCAGTGCCATGACAAACATCTTCCAGCCACTGGCCCCTGTAGCCCCGCACAGTCCCTTCCTCCTGGACAAGTTTCAGCAGCAGCTGGAGAGCAAGAAGACAGAGCCCGAGCACCGGCCCATGTCCTCCATCTTCTTTGATGCCGGAAGCAAAGCATCCCTGCCACCGTGCTGTGGCCAGGCCAGCACCCCTCTCTCTTCCATGGGGGGCAGATCCAATACCCAGTGGCCCCCAGATCCACCATTACATTTTGGGCCCACAAAGTGGGCCGTCGGGGATCAGCGCACAGAGTTCTTGGGAGCAGCGCCGTTGGGGCCCCCTGTCTCTCCACCCCATGTCTCCACCTTCAAGACAAGGTAAGTGGCAGATACTCAGCTGTACCAGCAGGGCCGAACCGAGAGGCACCCACTAGTAAGATAGCTGGACCCCCAGGGAGGCCCCTGCCCCTCTCCCCAGCCATCTGATACCCCATTTAGCCCTTCTCTGAGCTCAGACTTTGGGGAATCACCTCAAGCCATGTGAGGCCTAGTGTAGGATGGGTTTTTATCTGGGCTGCCACTGAGGGCAGGCAAAGAAGTGGCTTGTTGAGAGCCCTGTACCTCAGTGTCTCCCTTCGGACCACCACCAGAGTGCCTTTCGTATCTCGGTTCATCATCTGAGCCACACAGAAAATTGAGTGATGATTTTCCCTGGTTGAAAACAGCAAAAAGATACCCCTGCCTCCCCTTGCCTTTTGGCTGCCCCCGGGTCCTCGCCACTGCAGCCTCTCCCAGCTGTGCCTAGGCTCCAGAAATGCCTTCCCATCTCCCCAGCATGCTCATTTCACCAGCTGCGAGCTCACTGGGCTAAGGCACAGGGGTTGGTACATGACCTGCCACTCCCAGGGGCCGCTGGTACTTGCCCTTTATAGAGCAGCCAAACTAGTTTTCAGTGGGAGCAAAAGGCAGAGGAGAGACATGGGCAGAAGAAACCCTCCTAAGGACTAACATTGCCCAGCCAGGCAGCCATCCCCCAGACCAGGAGGCTTGAGCCCTTCAGCATCTTATAGCTGAGGAAGGAGACAGAGCTCGAGCTCGGCCTGCAGGTGCACAGCCTGCCTCTGAGACTCTGCCTTTTGGGTCTTTGAGTCATCACAGGCATCAGCATTGGGACTGGAAGGGCCCCTAAGATGAGAAGGCACTGAGTGGCATGTGGCTCCAGACTCCCTCATAGCCTGCTCTCTCGGGCTTGGCAGGTCTGCAAAGGGTTTTGGGGCTCGAGGCCCAGACGTGCTGAGTCCGGCCATGGTAGCCCTCTCCAACAAGCTGAAGCTGAAGCGACAGCTGGAGTATGAAGAGCAAGCCTTCCAGGACCTGAGCGGGGTGAGTCATCCCCACTGGCCACAGGGGCCTCTCCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCAAGTGCCAGCCCTGTTCCAGGCCCACCCAACCCACCCAGTCTGGGGACCTGGTTCTCTGGCCATTTCCCCTTTCCATCTGCCCTTCTTACTCCCAGGGGGACCCACCTGGTGGCAGCACCTCACATTTGATGTGGAAACGGATGAAGAACCTCAGGGGTGGGAGCTGCCCTTTGATGCCGGACAAGCCACTGAGCGCAAATGTACCCAATGGTGAGCAGCGGCCACAGGCCTGGGCCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAGGACTGGGGCTCGGGAGCCCATCCTGGTTCTTCCATTCACCACAGGCCGTACCTGCCTCTCTGAGCCTTGTTAGAATGGGGCGATGTCCTCTGTCTCTCCCGCAGTCCCACACACCCAACTTTTCCATCTCCACTCTGACTTAGATGATGCCATCAGAGGGTCCTGAAGGTTGGCTGTAGTTCTGGT
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Task1_train_3494
A variant found in Chromosome 2 affects EPAS1 (endothelial PAS domain protein 1). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Erythrocytosis, familial, 4
TACCAGGTATCAGAGCTGTTTTCTTCCTTTTAGTGTTCATCCCCCAACTCCATTGAAATAAGCTCCTTGAAGGGCTTTGAGCCCCCAGCTCAGTCCCCATACAGGGCAGTAACATCCCGTATGTGGCACAGAGCTGCACAGTTTGCACAGCCCTGCTGGCCACAGCCTGTATCCTGTTTGGTCCTCAAGACAGGACAACCTGTGAAGCGACAGTAGCCTCATTTTATGATGAGGAGACTGGAATTTAGAGAGGTTGATGAATTGACCTAATTCATACAGCTTGTTAATTAGCAGCCCCTCTACAAATAGTTGTGTGGTGGAATGGAATTGAACCTTTGGGTCCAGGAAGGTATTTCTTCTTCCATGCTGGACTTCTGGGGAGACCAGTGCCATATCTTTGACTCTGTCCCCCTCCTTCCTGGCCCCTAGCCCAATAGCCCTGAAGACTATTACACATCTTTGGATAACGACCTGAAGATTGAAGTGATTGAGAAGCTCTTCGCCATGGACACAGAGGCCAAGGACCAATGCAGTACCCAGGTAGATGGCTGTGGAGATCAGGCTAGGGTGTGTGCCTGCTGTCTGGTGGACAGCAAAGGCTCACATCCATTCTTGTAGCCTCATCCCTTTGTTGTAAAGAGCAGTGGAGACGTTTGGCCAAGGCCCAGGTCCCCTAAAGAGGTAGGGGTACAGGGTAATGGAGCCTGTGGTCACCCCCTCCTCCCACTGTCAAATCCAGCTCTTCCAGCATATGTGTCTCCTACTTAGATAGCTTTCTTAGCACACATGAAAACCGAAATGATACCACTGCACCTTTCTTTAAACAGGCCCTACATTTAACAAGCATAGCCAGATGTATAAAACATGTATAAACATAGGGGACAATTAATCCCTTTATAAACACATTCATCTTGTGATTTTAAAAAAATAATCATTTTTATATGAAATGCACTTTAAAATAAATAACATCTGTTTGACAATTTTTCATTTACATAAAACTTTTCAGGAACACATTTATTACATAAGGCCAATGTTCTTGCAAAAACTATGTAAACAAGGATAAGGTAGAGGGAGGGGTACGTGTTTTACAAAACCCCAGGGAAAACCATTAATCCCCCATTTGTCTTAGTCTTGAGTTCAACCAGATTTCTGCCTTGCCACTTAGTTTGTTTCTTGATCCTACTTGGCACAAATCCCAGCTACTCTGCAAAACATGCCCAATTTTAGCTTTTCTATCACCCTCCCTCCTCAGCACTCCTGTAGTATATATCATGTGGCACTTAATCACAGCTATCTGCTTCTGCTCCTTAAAGATTGCTTAGTATTGCAGTCATTAGTCAGCTGACACCCACTGAGGGTGTCAGTCTCTGAAGTTAGAAACTGTTTTCCGCATCTGCTTGTATTCCCCTGCTTGTATCATGCGTCCGTCATGATACTGCCACCCTAAGGGATGATCTGAGTATCTGCTGATTGGAACCAAAGTCTCTGTCCCTGGGGTCTGGCTGTTAGGCTGTTACTCTGCGAGAGTCCACAGATGGACCTGGGCACTTACTGCTTGCTTAGGCCCGTGCCAGCTTACAGGAGGGAGAAGAGGACAAAAAAAAGCCACAGTGTGCACCACAGGCCTAAGCATTGTAGGACAAGGATAACCACCACAGGCTGGAGTAGGCAGGGCTGACTCTGTGGAAGAGGGGCTGCCTCGGCTTCAAGAGAGAAGGCGGGCTCCGGACAGGTGGGATGGGGAGAGGAGAACATTTCTCAATGTGCAGGGTGAAGAGGGGATAAACATGGGGGAAGGCTGGTACATGATACAAGGTCGTGTACATGACACAGCCAAGTCTGAGGTTTTCCTGATAGGCCCTCGGGAGCCAGTGGAGGCGTTTGAGCAGCACTGTGAAACAGTGCTTGAGATGAATGGCTCTGCAGGAGCTGAGTTGGAATAGTGTTTGTGAGGTCGTACCAACCCCCTTGCCTCTTTGCCGGTGCTGTCTCCCCTCAGACGGATTTCAATGAGCTGGACTTGGAGACACTGGCACCCTATATCCCCATGGACGGGGAAGACTTCCAGCTAAGCCCCATCTGCCCCGAGGAGCGGCTCTTGGCGGAGAACCCACAGTCCACCCCCCAGCACTGCTTCAGTGCCATGACAAACATCTTCCAGCCACTGGCCCCTGTAGCCCCGCACAGTCCCTTCCTCCTGGACAAGTTTCAGCAGCAGCTGGAGAGCAAGAAGACAGAGCCCGAGCACCGGCCCATGTCCTCCATCTTCTTTGATGCCGGAAGCAAAGCATCCCTGCCACCGTGCTGTGGCCAGGCCAGCACCCCTCTCTCTTCCATGGGGGGCAGATCCAATACCCAGTGGCCCCCAGATCCACCATTACATTTTGGGCCCACAAAGTGGGCCGTCGGGGATCAGCGCACAGAGTTCTTGGGAGCAGCGCCGTTGGGGCCCCCTGTCTCTCCACCCCATGTCTCCACCTTCAAGACAAGGTAAGTGGCAGATACTCAGCTGTACCAGCAGGGCCGAACCGAGAGGCACCCACTAGTAAGATAGCTGGACCCCCAGGGAGGCCCCTGCCCCTCTCCCCAGCCATCTGATACCCCATTTAGCCCTTCTCTGAGCTCAGACTTTGGGGAATCACCTCAAGCCATGTGAGGCCTAGTGTAGGATGGGTTTTTATCTGGGCTGCCACTGAGGGCAGGCAAAGAAGTGGCTTGTTGAGAGCCCTGTACCTCAGTGTCTCCCTTCGGACCACCACCAGAGTGCCTTTCGTATCTCGGTTCATCATCTGAGCCACACAGAAAATTGAGTGATGATTTTCCCTGGTTGAAAACAGCAAAAAGATACCCCTGCCTCCCCTTGCCTTTTGGCTGCCCCCGGGTCCTCGCCACTGCAGCCTCTCCCAGCTGTGCCTAGGCTCCAGAAATGCCTTCCCATCTCCCCAGCATGCTCATTTCACCAGCTGCGAGCTCACTGGGCTAAGGCACAGGGGTTGGTACATGACCTGCCACTCCCAGGGGCCGCTGGTACTTGCCCTTTATAGAGCAGCCAAACTAGTTTTCAGTGGGAGCAAAAGGCAGAGGAGAGACATGGGCAGAAGAAACCCTCCTAAGGACTAACATTGCCCAGCCAGGCAGCCATCCCCCAGACCAGGAGGCTTGAGCCCTTCAGCATCTTATAGCTGAGGAAGGAGACAGAGCTCGAGCTCGGCCTGCAGGTGCACAGCCTGCCTCTGAGACTCTGCCTTTTGGGTCTTTGAGTCATCACAGGCATCAGCATTGGGACTGGAAGGGCCCCTAAGATGAGAAGGCACTGAGTGGCATGTGGCTCCAGACTCCCTCATAGCCTGCTCTCTCGGGCTTGGCAGGTCTGCAAAGGGTTTTGGGGCTCGAGGCCCAGACGTGCTGAGTCCGGCCATGGTAGCCCTCTCCAACAAGCTGAAGCTGAAGCGACAGCTGGAGTATGAAGAGCAAGCCTTCCAGGACCTGAGCGGGGTGAGTCATCCCCACTGGCCACAGGGGCCTCTCCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCAAGTGCCAGCCCTGTTCCAGGCCCACCCAACCCACCCAGTCTGGGGACCTGGTTCTCTGGCCATTTCCCCTTTCCATCTGCCCTTCTTACTCCCAGGGGGACCCACCTGGTGGCAGCACCTCACATTTGATGTGGAAACGGATGAAGAACCTCAGGGGTGGGAGCTGCCCTTTGATGCCGGACAAGCCACTGAGCGCAAATGTACCCAATGGTGAGCAGCGGCCACAGGCCTGGGCCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAGGACTGGGGCTCGGGAGCCCATCCTGGTTCTTCCATTCACCACAGGCCGTACCTGCCTCTCTGAGCCTTGTTAGAATGGGGCGATGTCCTCTGTCTCTCCCGCAGTCCCACACACCCAACTTTTCCATCTCCACTCTGACTTAGATGATGCCATCAGAGGGTCCTGAAGGTTGGCTGTAGTTCTGGTG
TACCAGGTATCAGAGCTGTTTTCTTCCTTTTAGTGTTCATCCCCCAACTCCATTGAAATAAGCTCCTTGAAGGGCTTTGAGCCCCCAGCTCAGTCCCCATACAGGGCAGTAACATCCCGTATGTGGCACAGAGCTGCACAGTTTGCACAGCCCTGCTGGCCACAGCCTGTATCCTGTTTGGTCCTCAAGACAGGACAACCTGTGAAGCGACAGTAGCCTCATTTTATGATGAGGAGACTGGAATTTAGAGAGGTTGATGAATTGACCTAATTCATACAGCTTGTTAATTAGCAGCCCCTCTACAAATAGTTGTGTGGTGGAATGGAATTGAACCTTTGGGTCCAGGAAGGTATTTCTTCTTCCATGCTGGACTTCTGGGGAGACCAGTGCCATATCTTTGACTCTGTCCCCCTCCTTCCTGGCCCCTAGCCCAATAGCCCTGAAGACTATTACACATCTTTGGATAACGACCTGAAGATTGAAGTGATTGAGAAGCTCTTCGCCATGGACACAGAGGCCAAGGACCAATGCAGTACCCAGGTAGATGGCTGTGGAGATCAGGCTAGGGTGTGTGCCTGCTGTCTGGTGGACAGCAAAGGCTCACATCCATTCTTGTAGCCTCATCCCTTTGTTGTAAAGAGCAGTGGAGACGTTTGGCCAAGGCCCAGGTCCCCTAAAGAGGTAGGGGTACAGGGTAATGGAGCCTGTGGTCACCCCCTCCTCCCACTGTCAAATCCAGCTCTTCCAGCATATGTGTCTCCTACTTAGATAGCTTTCTTAGCACACATGAAAACCGAAATGATACCACTGCACCTTTCTTTAAACAGGCCCTACATTTAACAAGCATAGCCAGATGTATAAAACATGTATAAACATAGGGGACAATTAATCCCTTTATAAACACATTCATCTTGTGATTTTAAAAAAATAATCATTTTTATATGAAATGCACTTTAAAATAAATAACATCTGTTTGACAATTTTTCATTTACATAAAACTTTTCAGGAACACATTTATTACATAAGGCCAATGTTCTTGCAAAAACTATGTAAACAAGGATAAGGTAGAGGGAGGGGTACGTGTTTTACAAAACCCCAGGGAAAACCATTAATCCCCCATTTGTCTTAGTCTTGAGTTCAACCAGATTTCTGCCTTGCCACTTAGTTTGTTTCTTGATCCTACTTGGCACAAATCCCAGCTACTCTGCAAAACATGCCCAATTTTAGCTTTTCTATCACCCTCCCTCCTCAGCACTCCTGTAGTATATATCATGTGGCACTTAATCACAGCTATCTGCTTCTGCTCCTTAAAGATTGCTTAGTATTGCAGTCATTAGTCAGCTGACACCCACTGAGGGTGTCAGTCTCTGAAGTTAGAAACTGTTTTCCGCATCTGCTTGTATTCCCCTGCTTGTATCATGCGTCCGTCATGATACTGCCACCCTAAGGGATGATCTGAGTATCTGCTGATTGGAACCAAAGTCTCTGTCCCTGGGGTCTGGCTGTTAGGCTGTTACTCTGCGAGAGTCCACAGATGGACCTGGGCACTTACTGCTTGCTTAGGCCCGTGCCAGCTTACAGGAGGGAGAAGAGGACAAAAAAAAGCCACAGTGTGCACCACAGGCCTAAGCATTGTAGGACAAGGATAACCACCACAGGCTGGAGTAGGCAGGGCTGACTCTGTGGAAGAGGGGCTGCCTCGGCTTCAAGAGAGAAGGCGGGCTCCGGACAGGTGGGATGGGGAGAGGAGAACATTTCTCAATGTGCAGGGTGAAGAGGGGATAAACATGGGGGAAGGCTGGTACATGATACAAGGTCGTGTACATGACACAGCCAAGTCTGAGGTTTTCCTGATAGGCCCTCGGGAGCCAGTGGAGGCGTTTGAGCAGCACTGTGAAACAGTGCTTGAGATGAATGGCTCTGCAGGAGCTGAGTTGGAATAGTGTTTGTGAGGTCGTACCAACCCCCTTGCCTCTTTGCCGGTGCTGTCTCCCCTCAGACGGATTTCAATGAGCTGGACTTGGAGACACTGGCACCCTATATCCCCACGGACGGGGAAGACTTCCAGCTAAGCCCCATCTGCCCCGAGGAGCGGCTCTTGGCGGAGAACCCACAGTCCACCCCCCAGCACTGCTTCAGTGCCATGACAAACATCTTCCAGCCACTGGCCCCTGTAGCCCCGCACAGTCCCTTCCTCCTGGACAAGTTTCAGCAGCAGCTGGAGAGCAAGAAGACAGAGCCCGAGCACCGGCCCATGTCCTCCATCTTCTTTGATGCCGGAAGCAAAGCATCCCTGCCACCGTGCTGTGGCCAGGCCAGCACCCCTCTCTCTTCCATGGGGGGCAGATCCAATACCCAGTGGCCCCCAGATCCACCATTACATTTTGGGCCCACAAAGTGGGCCGTCGGGGATCAGCGCACAGAGTTCTTGGGAGCAGCGCCGTTGGGGCCCCCTGTCTCTCCACCCCATGTCTCCACCTTCAAGACAAGGTAAGTGGCAGATACTCAGCTGTACCAGCAGGGCCGAACCGAGAGGCACCCACTAGTAAGATAGCTGGACCCCCAGGGAGGCCCCTGCCCCTCTCCCCAGCCATCTGATACCCCATTTAGCCCTTCTCTGAGCTCAGACTTTGGGGAATCACCTCAAGCCATGTGAGGCCTAGTGTAGGATGGGTTTTTATCTGGGCTGCCACTGAGGGCAGGCAAAGAAGTGGCTTGTTGAGAGCCCTGTACCTCAGTGTCTCCCTTCGGACCACCACCAGAGTGCCTTTCGTATCTCGGTTCATCATCTGAGCCACACAGAAAATTGAGTGATGATTTTCCCTGGTTGAAAACAGCAAAAAGATACCCCTGCCTCCCCTTGCCTTTTGGCTGCCCCCGGGTCCTCGCCACTGCAGCCTCTCCCAGCTGTGCCTAGGCTCCAGAAATGCCTTCCCATCTCCCCAGCATGCTCATTTCACCAGCTGCGAGCTCACTGGGCTAAGGCACAGGGGTTGGTACATGACCTGCCACTCCCAGGGGCCGCTGGTACTTGCCCTTTATAGAGCAGCCAAACTAGTTTTCAGTGGGAGCAAAAGGCAGAGGAGAGACATGGGCAGAAGAAACCCTCCTAAGGACTAACATTGCCCAGCCAGGCAGCCATCCCCCAGACCAGGAGGCTTGAGCCCTTCAGCATCTTATAGCTGAGGAAGGAGACAGAGCTCGAGCTCGGCCTGCAGGTGCACAGCCTGCCTCTGAGACTCTGCCTTTTGGGTCTTTGAGTCATCACAGGCATCAGCATTGGGACTGGAAGGGCCCCTAAGATGAGAAGGCACTGAGTGGCATGTGGCTCCAGACTCCCTCATAGCCTGCTCTCTCGGGCTTGGCAGGTCTGCAAAGGGTTTTGGGGCTCGAGGCCCAGACGTGCTGAGTCCGGCCATGGTAGCCCTCTCCAACAAGCTGAAGCTGAAGCGACAGCTGGAGTATGAAGAGCAAGCCTTCCAGGACCTGAGCGGGGTGAGTCATCCCCACTGGCCACAGGGGCCTCTCCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCAAGTGCCAGCCCTGTTCCAGGCCCACCCAACCCACCCAGTCTGGGGACCTGGTTCTCTGGCCATTTCCCCTTTCCATCTGCCCTTCTTACTCCCAGGGGGACCCACCTGGTGGCAGCACCTCACATTTGATGTGGAAACGGATGAAGAACCTCAGGGGTGGGAGCTGCCCTTTGATGCCGGACAAGCCACTGAGCGCAAATGTACCCAATGGTGAGCAGCGGCCACAGGCCTGGGCCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAGGACTGGGGCTCGGGAGCCCATCCTGGTTCTTCCATTCACCACAGGCCGTACCTGCCTCTCTGAGCCTTGTTAGAATGGGGCGATGTCCTCTGTCTCTCCCGCAGTCCCACACACCCAACTTTTCCATCTCCACTCTGACTTAGATGATGCCATCAGAGGGTCCTGAAGGTTGGCTGTAGTTCTGGTG
Task1_train_3495
This alteration in EPAS1 (endothelial PAS domain protein 1) on Chromosome 2 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Erythrocytosis, familial, 4
GGTATCAGAGCTGTTTTCTTCCTTTTAGTGTTCATCCCCCAACTCCATTGAAATAAGCTCCTTGAAGGGCTTTGAGCCCCCAGCTCAGTCCCCATACAGGGCAGTAACATCCCGTATGTGGCACAGAGCTGCACAGTTTGCACAGCCCTGCTGGCCACAGCCTGTATCCTGTTTGGTCCTCAAGACAGGACAACCTGTGAAGCGACAGTAGCCTCATTTTATGATGAGGAGACTGGAATTTAGAGAGGTTGATGAATTGACCTAATTCATACAGCTTGTTAATTAGCAGCCCCTCTACAAATAGTTGTGTGGTGGAATGGAATTGAACCTTTGGGTCCAGGAAGGTATTTCTTCTTCCATGCTGGACTTCTGGGGAGACCAGTGCCATATCTTTGACTCTGTCCCCCTCCTTCCTGGCCCCTAGCCCAATAGCCCTGAAGACTATTACACATCTTTGGATAACGACCTGAAGATTGAAGTGATTGAGAAGCTCTTCGCCATGGACACAGAGGCCAAGGACCAATGCAGTACCCAGGTAGATGGCTGTGGAGATCAGGCTAGGGTGTGTGCCTGCTGTCTGGTGGACAGCAAAGGCTCACATCCATTCTTGTAGCCTCATCCCTTTGTTGTAAAGAGCAGTGGAGACGTTTGGCCAAGGCCCAGGTCCCCTAAAGAGGTAGGGGTACAGGGTAATGGAGCCTGTGGTCACCCCCTCCTCCCACTGTCAAATCCAGCTCTTCCAGCATATGTGTCTCCTACTTAGATAGCTTTCTTAGCACACATGAAAACCGAAATGATACCACTGCACCTTTCTTTAAACAGGCCCTACATTTAACAAGCATAGCCAGATGTATAAAACATGTATAAACATAGGGGACAATTAATCCCTTTATAAACACATTCATCTTGTGATTTTAAAAAAATAATCATTTTTATATGAAATGCACTTTAAAATAAATAACATCTGTTTGACAATTTTTCATTTACATAAAACTTTTCAGGAACACATTTATTACATAAGGCCAATGTTCTTGCAAAAACTATGTAAACAAGGATAAGGTAGAGGGAGGGGTACGTGTTTTACAAAACCCCAGGGAAAACCATTAATCCCCCATTTGTCTTAGTCTTGAGTTCAACCAGATTTCTGCCTTGCCACTTAGTTTGTTTCTTGATCCTACTTGGCACAAATCCCAGCTACTCTGCAAAACATGCCCAATTTTAGCTTTTCTATCACCCTCCCTCCTCAGCACTCCTGTAGTATATATCATGTGGCACTTAATCACAGCTATCTGCTTCTGCTCCTTAAAGATTGCTTAGTATTGCAGTCATTAGTCAGCTGACACCCACTGAGGGTGTCAGTCTCTGAAGTTAGAAACTGTTTTCCGCATCTGCTTGTATTCCCCTGCTTGTATCATGCGTCCGTCATGATACTGCCACCCTAAGGGATGATCTGAGTATCTGCTGATTGGAACCAAAGTCTCTGTCCCTGGGGTCTGGCTGTTAGGCTGTTACTCTGCGAGAGTCCACAGATGGACCTGGGCACTTACTGCTTGCTTAGGCCCGTGCCAGCTTACAGGAGGGAGAAGAGGACAAAAAAAAGCCACAGTGTGCACCACAGGCCTAAGCATTGTAGGACAAGGATAACCACCACAGGCTGGAGTAGGCAGGGCTGACTCTGTGGAAGAGGGGCTGCCTCGGCTTCAAGAGAGAAGGCGGGCTCCGGACAGGTGGGATGGGGAGAGGAGAACATTTCTCAATGTGCAGGGTGAAGAGGGGATAAACATGGGGGAAGGCTGGTACATGATACAAGGTCGTGTACATGACACAGCCAAGTCTGAGGTTTTCCTGATAGGCCCTCGGGAGCCAGTGGAGGCGTTTGAGCAGCACTGTGAAACAGTGCTTGAGATGAATGGCTCTGCAGGAGCTGAGTTGGAATAGTGTTTGTGAGGTCGTACCAACCCCCTTGCCTCTTTGCCGGTGCTGTCTCCCCTCAGACGGATTTCAATGAGCTGGACTTGGAGACACTGGCACCCTATATCCCCATGGACGGGGAAGACTTCCAGCTAAGCCCCATCTGCCCCGAGGAGCGGCTCTTGGCGGAGAACCCACAGTCCACCCCCCAGCACTGCTTCAGTGCCATGACAAACATCTTCCAGCCACTGGCCCCTGTAGCCCCGCACAGTCCCTTCCTCCTGGACAAGTTTCAGCAGCAGCTGGAGAGCAAGAAGACAGAGCCCGAGCACCGGCCCATGTCCTCCATCTTCTTTGATGCCGGAAGCAAAGCATCCCTGCCACCGTGCTGTGGCCAGGCCAGCACCCCTCTCTCTTCCATGGGGGGCAGATCCAATACCCAGTGGCCCCCAGATCCACCATTACATTTTGGGCCCACAAAGTGGGCCGTCGGGGATCAGCGCACAGAGTTCTTGGGAGCAGCGCCGTTGGGGCCCCCTGTCTCTCCACCCCATGTCTCCACCTTCAAGACAAGGTAAGTGGCAGATACTCAGCTGTACCAGCAGGGCCGAACCGAGAGGCACCCACTAGTAAGATAGCTGGACCCCCAGGGAGGCCCCTGCCCCTCTCCCCAGCCATCTGATACCCCATTTAGCCCTTCTCTGAGCTCAGACTTTGGGGAATCACCTCAAGCCATGTGAGGCCTAGTGTAGGATGGGTTTTTATCTGGGCTGCCACTGAGGGCAGGCAAAGAAGTGGCTTGTTGAGAGCCCTGTACCTCAGTGTCTCCCTTCGGACCACCACCAGAGTGCCTTTCGTATCTCGGTTCATCATCTGAGCCACACAGAAAATTGAGTGATGATTTTCCCTGGTTGAAAACAGCAAAAAGATACCCCTGCCTCCCCTTGCCTTTTGGCTGCCCCCGGGTCCTCGCCACTGCAGCCTCTCCCAGCTGTGCCTAGGCTCCAGAAATGCCTTCCCATCTCCCCAGCATGCTCATTTCACCAGCTGCGAGCTCACTGGGCTAAGGCACAGGGGTTGGTACATGACCTGCCACTCCCAGGGGCCGCTGGTACTTGCCCTTTATAGAGCAGCCAAACTAGTTTTCAGTGGGAGCAAAAGGCAGAGGAGAGACATGGGCAGAAGAAACCCTCCTAAGGACTAACATTGCCCAGCCAGGCAGCCATCCCCCAGACCAGGAGGCTTGAGCCCTTCAGCATCTTATAGCTGAGGAAGGAGACAGAGCTCGAGCTCGGCCTGCAGGTGCACAGCCTGCCTCTGAGACTCTGCCTTTTGGGTCTTTGAGTCATCACAGGCATCAGCATTGGGACTGGAAGGGCCCCTAAGATGAGAAGGCACTGAGTGGCATGTGGCTCCAGACTCCCTCATAGCCTGCTCTCTCGGGCTTGGCAGGTCTGCAAAGGGTTTTGGGGCTCGAGGCCCAGACGTGCTGAGTCCGGCCATGGTAGCCCTCTCCAACAAGCTGAAGCTGAAGCGACAGCTGGAGTATGAAGAGCAAGCCTTCCAGGACCTGAGCGGGGTGAGTCATCCCCACTGGCCACAGGGGCCTCTCCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCAAGTGCCAGCCCTGTTCCAGGCCCACCCAACCCACCCAGTCTGGGGACCTGGTTCTCTGGCCATTTCCCCTTTCCATCTGCCCTTCTTACTCCCAGGGGGACCCACCTGGTGGCAGCACCTCACATTTGATGTGGAAACGGATGAAGAACCTCAGGGGTGGGAGCTGCCCTTTGATGCCGGACAAGCCACTGAGCGCAAATGTACCCAATGGTGAGCAGCGGCCACAGGCCTGGGCCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAGGACTGGGGCTCGGGAGCCCATCCTGGTTCTTCCATTCACCACAGGCCGTACCTGCCTCTCTGAGCCTTGTTAGAATGGGGCGATGTCCTCTGTCTCTCCCGCAGTCCCACACACCCAACTTTTCCATCTCCACTCTGACTTAGATGATGCCATCAGAGGGTCCTGAAGGTTGGCTGTAGTTCTGGTGACTCT
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Task1_train_3496
The gene EPAS1 (endothelial PAS domain protein 1) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Erythrocytosis, familial, 4
GGTATCAGAGCTGTTTTCTTCCTTTTAGTGTTCATCCCCCAACTCCATTGAAATAAGCTCCTTGAAGGGCTTTGAGCCCCCAGCTCAGTCCCCATACAGGGCAGTAACATCCCGTATGTGGCACAGAGCTGCACAGTTTGCACAGCCCTGCTGGCCACAGCCTGTATCCTGTTTGGTCCTCAAGACAGGACAACCTGTGAAGCGACAGTAGCCTCATTTTATGATGAGGAGACTGGAATTTAGAGAGGTTGATGAATTGACCTAATTCATACAGCTTGTTAATTAGCAGCCCCTCTACAAATAGTTGTGTGGTGGAATGGAATTGAACCTTTGGGTCCAGGAAGGTATTTCTTCTTCCATGCTGGACTTCTGGGGAGACCAGTGCCATATCTTTGACTCTGTCCCCCTCCTTCCTGGCCCCTAGCCCAATAGCCCTGAAGACTATTACACATCTTTGGATAACGACCTGAAGATTGAAGTGATTGAGAAGCTCTTCGCCATGGACACAGAGGCCAAGGACCAATGCAGTACCCAGGTAGATGGCTGTGGAGATCAGGCTAGGGTGTGTGCCTGCTGTCTGGTGGACAGCAAAGGCTCACATCCATTCTTGTAGCCTCATCCCTTTGTTGTAAAGAGCAGTGGAGACGTTTGGCCAAGGCCCAGGTCCCCTAAAGAGGTAGGGGTACAGGGTAATGGAGCCTGTGGTCACCCCCTCCTCCCACTGTCAAATCCAGCTCTTCCAGCATATGTGTCTCCTACTTAGATAGCTTTCTTAGCACACATGAAAACCGAAATGATACCACTGCACCTTTCTTTAAACAGGCCCTACATTTAACAAGCATAGCCAGATGTATAAAACATGTATAAACATAGGGGACAATTAATCCCTTTATAAACACATTCATCTTGTGATTTTAAAAAAATAATCATTTTTATATGAAATGCACTTTAAAATAAATAACATCTGTTTGACAATTTTTCATTTACATAAAACTTTTCAGGAACACATTTATTACATAAGGCCAATGTTCTTGCAAAAACTATGTAAACAAGGATAAGGTAGAGGGAGGGGTACGTGTTTTACAAAACCCCAGGGAAAACCATTAATCCCCCATTTGTCTTAGTCTTGAGTTCAACCAGATTTCTGCCTTGCCACTTAGTTTGTTTCTTGATCCTACTTGGCACAAATCCCAGCTACTCTGCAAAACATGCCCAATTTTAGCTTTTCTATCACCCTCCCTCCTCAGCACTCCTGTAGTATATATCATGTGGCACTTAATCACAGCTATCTGCTTCTGCTCCTTAAAGATTGCTTAGTATTGCAGTCATTAGTCAGCTGACACCCACTGAGGGTGTCAGTCTCTGAAGTTAGAAACTGTTTTCCGCATCTGCTTGTATTCCCCTGCTTGTATCATGCGTCCGTCATGATACTGCCACCCTAAGGGATGATCTGAGTATCTGCTGATTGGAACCAAAGTCTCTGTCCCTGGGGTCTGGCTGTTAGGCTGTTACTCTGCGAGAGTCCACAGATGGACCTGGGCACTTACTGCTTGCTTAGGCCCGTGCCAGCTTACAGGAGGGAGAAGAGGACAAAAAAAAGCCACAGTGTGCACCACAGGCCTAAGCATTGTAGGACAAGGATAACCACCACAGGCTGGAGTAGGCAGGGCTGACTCTGTGGAAGAGGGGCTGCCTCGGCTTCAAGAGAGAAGGCGGGCTCCGGACAGGTGGGATGGGGAGAGGAGAACATTTCTCAATGTGCAGGGTGAAGAGGGGATAAACATGGGGGAAGGCTGGTACATGATACAAGGTCGTGTACATGACACAGCCAAGTCTGAGGTTTTCCTGATAGGCCCTCGGGAGCCAGTGGAGGCGTTTGAGCAGCACTGTGAAACAGTGCTTGAGATGAATGGCTCTGCAGGAGCTGAGTTGGAATAGTGTTTGTGAGGTCGTACCAACCCCCTTGCCTCTTTGCCGGTGCTGTCTCCCCTCAGACGGATTTCAATGAGCTGGACTTGGAGACACTGGCACCCTATATCCCCATGGACGGGGAAGACTTCCAGCTAAGCCCCATCTGCCCCGAGGAGCGGCTCTTGGCGGAGAACCCACAGTCCACCCCCCAGCACTGCTTCAGTGCCATGACAAACATCTTCCAGCCACTGGCCCCTGTAGCCCCGCACAGTCCCTTCCTCCTGGACAAGTTTCAGCAGCAGCTGGAGAGCAAGAAGACAGAGCCCGAGCACCGGCCCATGTCCTCCATCTTCTTTGATGCCGGAAGCAAAGCATCCCTGCCACCGTGCTGTGGCCAGGCCAGCACCCCTCTCTCTTCCATGGGGGGCAGATCCAATACCCAGTGGCCCCCAGATCCACCATTACATTTTGGGCCCACAAAGTGGGCCGTCGGGGATCAGCGCACAGAGTTCTTGGGAGCAGCGCCGTTGGGGCCCCCTGTCTCTCCACCCCATGTCTCCACCTTCAAGACAAGGTAAGTGGCAGATACTCAGCTGTACCAGCAGGGCCGAACCGAGAGGCACCCACTAGTAAGATAGCTGGACCCCCAGGGAGGCCCCTGCCCCTCTCCCCAGCCATCTGATACCCCATTTAGCCCTTCTCTGAGCTCAGACTTTGGGGAATCACCTCAAGCCATGTGAGGCCTAGTGTAGGATGGGTTTTTATCTGGGCTGCCACTGAGGGCAGGCAAAGAAGTGGCTTGTTGAGAGCCCTGTACCTCAGTGTCTCCCTTCGGACCACCACCAGAGTGCCTTTCGTATCTCGGTTCATCATCTGAGCCACACAGAAAATTGAGTGATGATTTTCCCTGGTTGAAAACAGCAAAAAGATACCCCTGCCTCCCCTTGCCTTTTGGCTGCCCCCGGGTCCTCGCCACTGCAGCCTCTCCCAGCTGTGCCTAGGCTCCAGAAATGCCTTCCCATCTCCCCAGCATGCTCATTTCACCAGCTGCGAGCTCACTGGGCTAAGGCACAGGGGTTGGTACATGACCTGCCACTCCCAGGGGCCGCTGGTACTTGCCCTTTATAGAGCAGCCAAACTAGTTTTCAGTGGGAGCAAAAGGCAGAGGAGAGACATGGGCAGAAGAAACCCTCCTAAGGACTAACATTGCCCAGCCAGGCAGCCATCCCCCAGACCAGGAGGCTTGAGCCCTTCAGCATCTTATAGCTGAGGAAGGAGACAGAGCTCGAGCTCGGCCTGCAGGTGCACAGCCTGCCTCTGAGACTCTGCCTTTTGGGTCTTTGAGTCATCACAGGCATCAGCATTGGGACTGGAAGGGCCCCTAAGATGAGAAGGCACTGAGTGGCATGTGGCTCCAGACTCCCTCATAGCCTGCTCTCTCGGGCTTGGCAGGTCTGCAAAGGGTTTTGGGGCTCGAGGCCCAGACGTGCTGAGTCCGGCCATGGTAGCCCTCTCCAACAAGCTGAAGCTGAAGCGACAGCTGGAGTATGAAGAGCAAGCCTTCCAGGACCTGAGCGGGGTGAGTCATCCCCACTGGCCACAGGGGCCTCTCCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCAAGTGCCAGCCCTGTTCCAGGCCCACCCAACCCACCCAGTCTGGGGACCTGGTTCTCTGGCCATTTCCCCTTTCCATCTGCCCTTCTTACTCCCAGGGGGACCCACCTGGTGGCAGCACCTCACATTTGATGTGGAAACGGATGAAGAACCTCAGGGGTGGGAGCTGCCCTTTGATGCCGGACAAGCCACTGAGCGCAAATGTACCCAATGGTGAGCAGCGGCCACAGGCCTGGGCCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAGGACTGGGGCTCGGGAGCCCATCCTGGTTCTTCCATTCACCACAGGCCGTACCTGCCTCTCTGAGCCTTGTTAGAATGGGGCGATGTCCTCTGTCTCTCCCGCAGTCCCACACACCCAACTTTTCCATCTCCACTCTGACTTAGATGATGCCATCAGAGGGTCCTGAAGGTTGGCTGTAGTTCTGGTGACTCT
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Task1_train_3497
This sequence variant lies in PIGF (phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class F) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Onychodystrophy, osteodystrophy, impaired intellectual development, and seizures syndrome
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Task1_train_3498
Here is a genetic alteration in MCFD2 (multiple coagulation factor deficiency 2, ER cargo receptor complex subunit) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Factor 5 and Factor VIII, combined deficiency of, 2
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Task1_train_3499
A variant was discovered in gene MCFD2 (multiple coagulation factor deficiency 2, ER cargo receptor complex subunit), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Factor 5 and Factor VIII, combined deficiency of, 2
AGGAAAATGTGGGAAAGTTTGGAACTTCCTACAGACTTGTTGAATGGCTTTGCCCCAAATGCTGATAGCAATATGGACAACAAAGTCCAGGCTGAGGTGGCCTCAGATGAAGATGAGGAACTTGTTGGGAACTGGAGTAAAGGTGACTCTTGTTATGTTTTAGCAAAGAGACTGGCAGCATTTTGCCCCTTCCATAGGGATTTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGATGATTTAGGTTAACTAGCGGAAGAAATTTCTAAGCAGCAAAGTGTTCAACAGGTGACTTGGGTGCTTTTAAAGGCATTCCCTTATAAATAAGGGAAGCAAAGCATAAAAGTTTGGAAATTTGCAGCCTGACTATGCAATAGAAAAGAAAAACCCATTTTCTGGGGAGAAATTCAAGCCAGCTGCAGAAATTTGCATAAGTAGCAAGGAGCCTAATGTTAATCCCCAACACCATGGGGAAAATGTCTCCAGGCCATGTCAGGGCAGCCCCTGACATGTGTGTGCAGCCTAGGGACTTGGTGTCTTGTGTCCCAGCCACTCCAGCCATGGCTGAAAGGGGCCAACATACAGCTCGGGCTGTGGCTTCAGAGTGGAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCTATGTGCTGTTAAGCCTGCAGGTGCACAGAAGTCAAGAATTGAGATTTGGAAACCTCCGCCTAGTTTTCAGAAGATGTATGGAAATGCCTCAATGCCCAGGCAAACGTTTGCTGCAGGGGAGAGGCCCTCTCAGCGGCAGGGGAGAGAACCTCTGCTAGGGCAGTGCAGAAGGGAAATGTGGTGTGGGAGCCCCCACACAGAGTCCCTACTGGGGCACTGCCTAGTGGAGCTGTGAGAAGAGGGCCACCGTCCTCCAGACCCCAGAATGGTAGATCCACCAACAGCTTGCACCGTGCACCTGGAAAAGCCGCAGGCACTGAACAACAGCCGTGAAAGCAGCCAGGAGGGAGGCTGTACCCTACAAAGCCACAGGGGCAGAGCTGCCCAAGACCATGGGAACCCACTTCTTGCATCAGTATGACCTGGATGTGAGACCTGGAGTCAAAGGAGATTATTCTGGAACTTTAAAATTTGACAGCCCTGCTGGATTTCGGACTTGCATGGGCCCTGTAACCCCTTTATTTTGGCCAATTTCTCCCATTTGGAACAGCCGTCTTTAATCAATACCTGTACCCCTGTTGGTATCTAGGAAGTAACTAGCTTGCTTTTGATTTTACAGGCTCATAGGTGGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAGATGAGACTTTGGACTGTGGATTTTTGCGTTAATGCTGAAAAGAGTTAAGACTTTGGGGGACTGTTAGGAAGGCATGATTGGTTTTGAATAGTGAGGACATGAGATTTGGAGGGGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGGCTATGTCCCCACCCAAATCTCAACTTGAAATTGTATCTACCAGAATTCCCACGTGTTGTGGGAGAGACCCAAGGGGAGGTAATTGAATCATGGGGGCCAGTCTTTCCCATGCTATTCTTGTGATAGTGAATAAGTTTCACAAGATCTGATGGCTTATCAGGGGTTTCCACTTTTGCTTCTTCCTCATTTTCTCTTGCTGCCATGTAAGAAGTGCCTTTCACCTCCCGCCATGATTCTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTAAGTCCAAGTAAACCTCTTTTTCTTCCCAGTCTCGGGTACGTCTTTATCAGCAGCATTAATACAGACTAATACAGATGCTTGAAGCAAGCCCTTGTCCAATAAGGTATTTAATAGCACTTAGGGACTATTAGATGTCCCATTTCTCTTCTCTTTCATTTCTCTTATCTCTTCTCACCCCAGTGTAACGAATCGCTACAGGTTTTTACCAAAATGCTGCAGCAGTAGTTGGAAATGAGTTATTTTGCATTACTAAAGTGTTCAATCACATTATCACGGGTCACATTTGTATATAACCAGGAGATGGCCAAATAACATCTACTGCAGTGATTTTGCAAATTCAGCATAGTCAATGTATCCATCATTGTTCTTGTCATCATCTCTCAAAACACCATCTATTATGTTAATCAGTTCATCTTCACTCATTAGTGGTGCCTGTTCACTCCCTTCCTACAAAATACAAATTAGACAATGATGAGTTGCGCATTTTACCGGAAGAAGTGCTTAACTAACGTCCAAAATATCCATGTTCTTTCATGGCACTGTTTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAACAAAACAACAAAATATCCACGCTCATATGTGTCCAAAAACTTTCAATGGAGTATGGGGCTACTTCTAGGAATCTAGATATATAGAGAGAGAATATGTATTATTGAGTCAATTTATCATAATCCAGTTTAGAAATTACATTTGCCAGTTAAAAGAAGGCCCTTCAAAATAGGCTTTTGCTTATTTGTTTCATTATGGCTCATTCTTCTTTAATTGGAAAAGTGCCAGTCCTCCTGAGGGTCAGCTCTGTGCACAAATTTGCCTGATAAAATAGAAACAGTGACGAATTGGACAACAAGTTGGCATCAAAACAAGAGGAAGAAGGCACTGCCGATGAGCAGAACCTGTTATGATCTTTGAGGAGAAAGTATTTCCCATGCTCCAAGAGCAGGGTTAGTGGGCTGAGGCTGTTCACATCCTTGGCTGGTTCTTCCTTTGCCACATCTCCCACATTCACCATTCCCTCTCCTGTCACCACCACTATCCTCATCTGCCAGGACTGCTGACCCCTAATTCCTCCGCCTAACACTAGTCTCTCCTCATGTCCTTCAGTCTGTCTCCCACAACCAAGGATCTTCCCTAAACAATGCCATTCTCCTGTGCAAAATCATTCATGCTCCCTGCTGCCTTCAAACCTCACCTGCACTCCTAGCAGCGAATGTAATCCCACTCACCTGGCTAACTTTGCCTTGCTTCCTCTCTATAGAGGGCAGTGTGGCAGAAGGGGAATGACATTAAATGTGGAGGCACGAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTGACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCCAGTAGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCGACCTCCCAGGCTCAGGTGTTCCTCCCCACTACCCTCCCACCCCGTCACCCCAGCAGCTGGGATTACAGGCAAGCATCACTATGTCCAGCTAATTTTTGTAGAGACGGGATATCACCATGCTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTCAACCTCCCAAAGTGCTGGGATAATAGGCATGAGCCACTGTGCTTAGCCTGGCACAAGATCTTGATTTCAGTGTCTTCACCTAGAAAATGGGAGGGTTTTGTTTGTTTTTTGTTTTCTGAGACAGGATCTCGCTCTATTGCCCAGGCTGGAATTCAGTGGCAACATCGCAGCTTGCCACAGCCTCAACCTCTCAGGTTCAAGTGATCCTCCTACTTCAGCATCATGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACTGAAAATGGAAGTATTAACAATGCCTGCCACTGCCTACTCAAGATGTTGCAAAGATCCAACGAGATCTCTAACCTACTTGAAAGGGCTTCAGAAACTTTGGAGCACCATACAGTATCACACAAGCCCTCAATTACTGCCACGTCCCTGAATCCCTTGGTGTCAATTCACCATTAAACAACTTCTCCCTTGCTCTGCAGTTTGAATACGGTCTGTCTTTTAGGCACTGATTCTCATACTCTGGTGTGTAACAGAAATGCCTGTAGCACTTAAAGATACAAATGCCCAGCCCTGGGACTTCTGCCTCAGCAAGTTATCCTTTGCGGGAAGGATCGTTGGACAGAAAGAGGCAGAACACAGAAGAGAAAGAAGCAGCAGCACCTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTCTCTTTTTGAGACAAGGCCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCGGTGGCATGATTATGGCTCACTATAGCCTCGACATCCTGGACTCAAGCAATCCTCCCACCTTAGCCTCCTGAGTACGTAGAACTACGGGCATGCACTACCAGGCCTGGCTAATTTTTTAATTTTT
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