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Task1_train_3300
An alteration has been detected in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
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TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCCTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTAGGCAACATAGTGAGTGAGACCCTGTTTCTATAAAAAAAATTTTTAATTAGTCCGGTCTGGTGGTGCACAACTGATGTCCCAGCTACTTGGGAGTTTGAGGTGGGAGGATGGATCACTTGAGCCCAGGAAGATTAAGGCCACAATGAGCTGTGATCATGCCACTGCACTCCAGCCCAGGCCACAGGTTTCAAAAAAAGAGAAAATTAGAATTATACGTTAGGGGGAAAAAACCTAATAACCATATTCCTATCTACCTAGTGACCACCCCTATGAAGATCCTGGTACATGTTCTCATTGAAATCTTATTTTGAAATATTTTTGAATTAAAAAAATATATTATTACCTTGGTTTTACAAATGTTTGCTTGTCTTTATGTTCAGCTACAATTTTCTAATCACAATGGTTTTACTTTTTCCTTGTCAGAAAGTGGAGCTGTTCCAAAAAGAAAAGACCCCTTAACACACACTAGTAATTCACTGCCTCGTTCAAAAACAGTTATGAAAACTGGATCTGCAGGCCTTTCAGGCCACCATAGAGCACCTAGTTACAGTGGTTTATCCATGGTTTCTGGAGTGAAACAGGGATCTGGTCCTGCTCCTACCACTCATAAGGTATTCTGGGACAGTAACTTTAATTGCTGTCTTTTTGCAAATAGAAAAATTTTTAAGATACTATTCCTGCTTAAGTTGATCATAAGTACTTTATAATACTTTAGAGAATGGATAAGTTTCCATAAAGTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTCTTGTTTTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCATTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACGTCGAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAAAGTTAATTTTTTTTTAAATCCACAGGGCAACTTGCTATAAAACTTTTTTTGGACCTCATTAGACATTTAATACCAAGTTTTGCTTACCCAGTCTGTTTTATATAATGCTGTATATTTCATTTTAAATTTATTTTTAAAATTATTTCAATCTTTGTAAATGTTTTATACCAGTAACATACCTAGAGTTTTGTCATGATTCTAACAAGGGTTAAAATTTGTTTTTATTTTGTAAAAACTAAATCTCTGGATAAAATCCTCTATAACTGACTTAATGCCAAATATAGTTCTCTAGTGAATACAGTTTTACCTTCAGGTAAATAAATATACAATTTATGGATTTTTATACCCTTTTTCCTATTTTTAAAGCTTGAATTCTGTGAACTTTAAGGTTAACTTATTTATGAAAAGTGTAAATGTTAGGTTGTATTTTCATATTAAAATTTTGTATCCTTTAAGGGTACTCCGAAAACAAATAGGACAAATAAACCTTCTACCCCTACAACTGCTACTCGTAAGAAAAAAGACTTGAAGAATTTTAGGAATGTGGACAGCAACCTTGCTAACCTTATAATGAATGAAATTGTGGACAAGTAAGTTTTGCCATCTAAATGTTTTATTTTATAGTTTTTATATTTTAATTTTACTTATAAAACATGTCAGGAGTGAAATAGATAATAAATACCTTGTCTGGTTTACATACTTAATTTTTATGATAGTTTTCAATTATAAATGTAGAAAACCATTGCTTTACTGATTTAACTATAGTTTAACAGTTAACATTAAAAATAACTATATGTCATAGGGCTTAGGCTTCATCTTGTAATAACTGGGCCCTGTTTGTATCGTAGAACTAACTGAGGTCTTGTTTCTTAGTGGAACAGCTGTTAAATTTGATGATATAGCTGGTCAAGACTTGGCAAAACAAGCATTGCAAGAAATTGTTATTCTTCCTTTTCTGAGGCCTGAGGTAAGAACTTTATATTATCATTTTTCTATAATACCATCTGTTACTGAATCCATAGTAGTAGTAGTAGTAAAGAAATATTTGAGCTATACTAAAATAATTAATTCATATAAGGTAACAATAGATTTAATGTTTTAAAAAAGATAAAACATTAACAATTGATGTTGAGAAGTTATTATAGAATAGGAAAATGGATATGAGTTCCTAATTTCCAATCCTTTTATATTTTTAGGAAAAGTGGGTAGTATGATATAATTTTGTTTTGTTTTGGAGACGGAGTCTCACTCATTGTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCGTCCCAGAATTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTGTAATTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCTATATTGGCCAGGCTGGTCTTTCATACCTGATGTCAAGTTATCCACCCATTTCGGCCTCCCAGAGTGTTAGGATTACAAGTGTGAGTCACTACATCTGGCCAAATTTTGATATCAAGGTGAGAGAGATTTAAAATTAAGATAAGGTACAAAAATTAGCCTAGTGTGGGGGCGCACGCTTGTAGTCCCAACTACTGGGGAGGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATGGCACCACTGCACTCCATCCTGGGTGACAGAGCGAGATGTCATCTCAAAAACAAAACAGGCCGGGTACGGTAGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAATATGGTGAAACCCTGTCTTTACTAAAATTACAAAAATTAGCTGGGCTTGGTGGTGTGTAACCCCAGCTACTCGGGATGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAATAAATAAAAATTTAAAAAGATAAATACATAAAAATAAATAAATAATATTAAGAGAAGGAAATCAGGCAGGTAGTGGCCCCTGACACAATGAGTTTTCCCAGAATTGGATTGCTTGGAAATGCCGCTCAAAGAGTGTGGTAAACTCCATCGAAGGCTAAATACCAACGTGACAGTGATAATAAACAAGTACTTTATGGGAAAGTTTTTTTTTTAATTATTTTTAAAAAGAGAGAAATTGTACTGGAGAAAAGAGGAATTCAGGTAGAATAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAATTTTGCTCCTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGATGTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTTTGGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCATCCTCCTGAGTAGCTGGGTCTATAGGCATGCACCCCAACACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATAGGGTTTTACCATTTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCTTCAGATGATCCGCCCACCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGAGGCCACTGTGCCTGGCATGAAGAACAATTTTTAAAAGAATGACTTTTAAGGATATTAAGTCATCAAAGTAGATAGAGCCATTAAATGATGGGTAGAAACCTAATCTTCCATCCCATATTTTATGACTTATTAAGGAAGATAGGCAATCTTGCAGTTGATAATAAATATTTGGCTTTCCATACTTAGCACCGTTTTGAATTTTTCCAGTTCACAGATGGTATATTTAGTGCTGTTCCAATAATATTGCAAAAAATAAATCTGAAGACTCACTTCTGGGTCACAGTTATTTCACTATTAACATTAAAATCTTACGGACCTACCTGCAACATGTAGTGGAAATAAGTTGTGTGGCACGTTGTGGTGGGTGCATTATTAAATAAATGTGCAAAGGTTTTATGGCTGTCTCAATTTTTCCATAGTCTTGAGTCATTC
Task1_train_3301
Given this context: Chromosome 2, gene SPAST (spastin) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_3302
A genetic alteration is present in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GCACAGTGGATTTTTAAGGCAGTGAAACTGTTCTTTATGATAATCCAATGGTGGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTT
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Task1_train_3303
Here is a genetic alteration in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
AGGCAGTGAAACTGTTCTTTATGATAATCCAATGGTGGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATT
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Task1_train_3304
Gene SPAST (spastin) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia
TGTTCTTTATGATAATCCAATGGTGGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAAT
TGTTCTTTATGATAATCCAATGGTGGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCAGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAAT
Task1_train_3305
This sequence variant lies in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TCCAATGGTGGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATA
TCCAATGGTGGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCGACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATA
Task1_train_3306
This variant affects gene SPAST (spastin) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
AATGGTGGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGT
AATGGTGGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACTTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGT
Task1_train_3307
Gene SPAST (spastin) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia
GGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGG
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Task1_train_3308
Given this variant in gene SPAST (spastin) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGG
GGATACATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAGTGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGG
Task1_train_3309
A sequence alteration has been identified in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
ATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGG
ATGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAGGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGG
Task1_train_3310
A genomic change on Chromosome 2 affects SPAST (spastin). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
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Task1_train_3311
Here is a variant affecting SPAST (spastin) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TGTCATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGA
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Task1_train_3312
Gene SPAST (spastin) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
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Task1_train_3313
The gene SPAST (spastin) is located on Chromosome 2, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_3314
Located on Chromosome 2, this mutation impacts SPAST (spastin). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
ATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGACTTC
ATTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAGTGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGACTTC
Task1_train_3315
A variant affecting Chromosome 2, within the gene SPAST (spastin), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TTATACCTTTGTCAAAACCCACAGAATATAAAACATAAGAGTGAACCCTAATGTAAAATATGGACTTCAGTTAATAATAATATATGAATATTTTTTCATTAGTTCTAACAAGTGTACTACACTAATACAAGATATTCAGAGTAGGGGAAATTGGAAAGGAATGAGAGGTTATATGGGAACTCTGTACTTTCTGCTCAATTTTCTGTAAACCTAAAATCACTAAAAAAAAAGTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATACAATGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGCAGTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGGGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCAGGTTTTTTTTTTTAAGTTGGATATTAGCCATTTCATATGATTCAACTTAAAAGTACATACACCTTCACTGTTATTAAAGTGTAGGTGAGATGTTTTCAGTCTGGAGCTCTACCCTTGATTCCTGCCATGCCTAGTGTCCCTGAATCTGGAGACTCTGACTTATTTCTTTAGAGAACGAAACTCCTGCCTTCTGCTTTGGTGGTGATTGGTACCTGCTTGACTGCCTTTGGTGGGGAGTTCCTCATACCAACTTTCAATCAGTTCCTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCGCCCGGGTTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAATACACGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACGACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTAAGCCACCGTGCCCGGCCAGTTCCTCTGTTTTTGACTGCCTGCCTTACTACTGCTTTCTGTGGTGCCTGATAACATCCAATTCCTGAACCTTCCTGGGATTTTTGTTCACGTCAGCGTGCTTCTTGCATTTAGGTATCCCTTCACAAGTAGGCATTTAGGTTTTAAGCTCTGCTAAGTGATTTACCACACTTTATCAGTTCTCCATTTTGTGGAATTCATTGTGTTAATCTCCTTTTCTATTTTTGTTTGGAAGATTCATATATTTTTTATTCATTTAGTATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGACTTCA
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Task1_train_3316
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SPAST (spastin). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
ATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGACTTCAACACGTTTTTGGAGAACACAGTTCAACCCATTAACAAATACTATCACTTTCCACTTAAGCTTCAAGTAAAGTGGATTTTATCTCAAGGAGCCACCAGATAGGAACACAGATCTGATGGCATAAACTGAGTATTTCTGGCCTTCTGATTCTGATCTAAAATATGACAGAAGATTTTCCCTGTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTATAATAGAGACACAGTCTCGCTATGTTGCCAGGCTACTTTCAAATTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCTGCCTCGGACTCTCAAAGTGCTGGAATTACAAGTGTGAGCCACCACACCTGGCCAGTAGATTTTCCCTGCTTTCTTTTGATTGTTTATAATTTTGTTTTCTTTTTCCATTCACCCTCTGCTGACCCTATAGTATTATTCAAAGAAGTGTTCAGTCTAGTTTTGGGGTAGGGCAAGCATAACTACAGTGCTTAAAGAGAGTAATTTGTCTGGTGTGCAGAACTAGTGTGTAAATATAACTGGTGCATTGCAAAACTGTGAAGTAGTTTCTGTCAAACCTTACACTGCTTTGTCTTTCTCCCTCTCTCCCTTTCTCTTGGTTGCCCCCTCCCCCTCCCAATGATACCTTAGTCTCTGCTTGCCTTTATCAAAACCTTTATGATTGGCCGGGCACAGTGGCCCATGCCTATAATCCTAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCACCTGAGCCCAGAAGTTGGAGACCAGCCTAGGCAACATGGTGAAACCCCATCTCTTCCAAAAATAAAAAATAGAGCCAGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCGAGAGGATCTCTTGAGCCTGAGAGGTTGAGGCTGCAGTGAACTGTGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGTGTGAGACCCTGTCTCAAAGAAACAAAACAAGGGGGGGCATGGTGGCTAACTCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGACTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAATACCACCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAATTTAGCTGGACATGCCAGCGAATACGTGGTCCCAGCAAATCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGTCAAGGAGGTTGAGGTTGCAGTGAGCCACGATCATGCCAATGCATTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACCACGTCTCAAAAACAAAACAAAACAAACTTTTATGGTTGAAAGTGTTTTGGCAAACATACTTAAACTGAAATGTGAATCTCTGATGAAAGAACATGTTACCTGTAAAAGTTTGAAGTGTCAGCATTTGTTGCACCGAAATCCAGAGGTGAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGT
ATTTTTTGGTGGGATTTCTAAGTAGAGAAACATGCCTATGTTCAATATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGAAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGACTTCAACACGTTTTTGGAGAACACAGTTCAACCCATTAACAAATACTATCACTTTCCACTTAAGCTTCAAGTAAAGTGGATTTTATCTCAAGGAGCCACCAGATAGGAACACAGATCTGATGGCATAAACTGAGTATTTCTGGCCTTCTGATTCTGATCTAAAATATGACAGAAGATTTTCCCTGTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTATAATAGAGACACAGTCTCGCTATGTTGCCAGGCTACTTTCAAATTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCTGCCTCGGACTCTCAAAGTGCTGGAATTACAAGTGTGAGCCACCACACCTGGCCAGTAGATTTTCCCTGCTTTCTTTTGATTGTTTATAATTTTGTTTTCTTTTTCCATTCACCCTCTGCTGACCCTATAGTATTATTCAAAGAAGTGTTCAGTCTAGTTTTGGGGTAGGGCAAGCATAACTACAGTGCTTAAAGAGAGTAATTTGTCTGGTGTGCAGAACTAGTGTGTAAATATAACTGGTGCATTGCAAAACTGTGAAGTAGTTTCTGTCAAACCTTACACTGCTTTGTCTTTCTCCCTCTCTCCCTTTCTCTTGGTTGCCCCCTCCCCCTCCCAATGATACCTTAGTCTCTGCTTGCCTTTATCAAAACCTTTATGATTGGCCGGGCACAGTGGCCCATGCCTATAATCCTAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCACCTGAGCCCAGAAGTTGGAGACCAGCCTAGGCAACATGGTGAAACCCCATCTCTTCCAAAAATAAAAAATAGAGCCAGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCGAGAGGATCTCTTGAGCCTGAGAGGTTGAGGCTGCAGTGAACTGTGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGTGTGAGACCCTGTCTCAAAGAAACAAAACAAGGGGGGGCATGGTGGCTAACTCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGACTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAATACCACCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAATTTAGCTGGACATGCCAGCGAATACGTGGTCCCAGCAAATCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGTCAAGGAGGTTGAGGTTGCAGTGAGCCACGATCATGCCAATGCATTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACCACGTCTCAAAAACAAAACAAAACAAACTTTTATGGTTGAAAGTGTTTTGGCAAACATACTTAAACTGAAATGTGAATCTCTGATGAAAGAACATGTTACCTGTAAAAGTTTGAAGTGTCAGCATTTGTTGCACCGAAATCCAGAGGTGAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGT
Task1_train_3317
Here’s a variant in SPAST (spastin) located on Chromosome 2. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
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Task1_train_3318
A variant found in Chromosome 2 affects SPAST (spastin). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGACTTCAACACGTTTTTGGAGAACACAGTTCAACCCATTAACAAATACTATCACTTTCCACTTAAGCTTCAAGTAAAGTGGATTTTATCTCAAGGAGCCACCAGATAGGAACACAGATCTGATGGCATAAACTGAGTATTTCTGGCCTTCTGATTCTGATCTAAAATATGACAGAAGATTTTCCCTGTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTATAATAGAGACACAGTCTCGCTATGTTGCCAGGCTACTTTCAAATTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCTGCCTCGGACTCTCAAAGTGCTGGAATTACAAGTGTGAGCCACCACACCTGGCCAGTAGATTTTCCCTGCTTTCTTTTGATTGTTTATAATTTTGTTTTCTTTTTCCATTCACCCTCTGCTGACCCTATAGTATTATTCAAAGAAGTGTTCAGTCTAGTTTTGGGGTAGGGCAAGCATAACTACAGTGCTTAAAGAGAGTAATTTGTCTGGTGTGCAGAACTAGTGTGTAAATATAACTGGTGCATTGCAAAACTGTGAAGTAGTTTCTGTCAAACCTTACACTGCTTTGTCTTTCTCCCTCTCTCCCTTTCTCTTGGTTGCCCCCTCCCCCTCCCAATGATACCTTAGTCTCTGCTTGCCTTTATCAAAACCTTTATGATTGGCCGGGCACAGTGGCCCATGCCTATAATCCTAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCACCTGAGCCCAGAAGTTGGAGACCAGCCTAGGCAACATGGTGAAACCCCATCTCTTCCAAAAATAAAAAATAGAGCCAGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCGAGAGGATCTCTTGAGCCTGAGAGGTTGAGGCTGCAGTGAACTGTGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGTGTGAGACCCTGTCTCAAAGAAACAAAACAAGGGGGGGCATGGTGGCTAACTCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGACTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAATACCACCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAATTTAGCTGGACATGCCAGCGAATACGTGGTCCCAGCAAATCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGTCAAGGAGGTTGAGGTTGCAGTGAGCCACGATCATGCCAATGCATTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACCACGTCTCAAAAACAAAACAAAACAAACTTTTATGGTTGAAAGTGTTTTGGCAAACATACTTAAACTGAAATGTGAATCTCTGATGAAAGAACATGTTACCTGTAAAAGTTTGAAGTGTCAGCATTTGTTGCACCGAAATCCAGAGGTGAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGCTGGCAGATCACCTGAGGT
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Task1_train_3319
Chromosome 2 houses a mutation in gene SPAST (spastin). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TATGTCTTGTTTAAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGACTTCAACACGTTTTTGGAGAACACAGTTCAACCCATTAACAAATACTATCACTTTCCACTTAAGCTTCAAGTAAAGTGGATTTTATCTCAAGGAGCCACCAGATAGGAACACAGATCTGATGGCATAAACTGAGTATTTCTGGCCTTCTGATTCTGATCTAAAATATGACAGAAGATTTTCCCTGTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTATAATAGAGACACAGTCTCGCTATGTTGCCAGGCTACTTTCAAATTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCTGCCTCGGACTCTCAAAGTGCTGGAATTACAAGTGTGAGCCACCACACCTGGCCAGTAGATTTTCCCTGCTTTCTTTTGATTGTTTATAATTTTGTTTTCTTTTTCCATTCACCCTCTGCTGACCCTATAGTATTATTCAAAGAAGTGTTCAGTCTAGTTTTGGGGTAGGGCAAGCATAACTACAGTGCTTAAAGAGAGTAATTTGTCTGGTGTGCAGAACTAGTGTGTAAATATAACTGGTGCATTGCAAAACTGTGAAGTAGTTTCTGTCAAACCTTACACTGCTTTGTCTTTCTCCCTCTCTCCCTTTCTCTTGGTTGCCCCCTCCCCCTCCCAATGATACCTTAGTCTCTGCTTGCCTTTATCAAAACCTTTATGATTGGCCGGGCACAGTGGCCCATGCCTATAATCCTAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCACCTGAGCCCAGAAGTTGGAGACCAGCCTAGGCAACATGGTGAAACCCCATCTCTTCCAAAAATAAAAAATAGAGCCAGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCGAGAGGATCTCTTGAGCCTGAGAGGTTGAGGCTGCAGTGAACTGTGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGTGTGAGACCCTGTCTCAAAGAAACAAAACAAGGGGGGGCATGGTGGCTAACTCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGACTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAATACCACCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAATTTAGCTGGACATGCCAGCGAATACGTGGTCCCAGCAAATCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGTCAAGGAGGTTGAGGTTGCAGTGAGCCACGATCATGCCAATGCATTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACCACGTCTCAAAAACAAAACAAAACAAACTTTTATGGTTGAAAGTGTTTTGGCAAACATACTTAAACTGAAATGTGAATCTCTGATGAAAGAACATGTTACCTGTAAAAGTTTGAAGTGTCAGCATTTGTTGCACCGAAATCCAGAGGTGAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGCTGGCAGATCACCTGAGGT
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Task1_train_3320
This variant affects the gene SPAST (spastin) found on Chromosome 2. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
AAGCAGTCTGCTTTCATTTTTACCACCGAGGAGTTGGTTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTTTGTCAGCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACAATCAAAGCTCACTGCACCCTTGGCCTCCCAAGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAGCTCAGGTGATCCAGCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTGTAGAAGCAGAGTTCCCCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCTTGGGCTCATGTAATCCTCCTGTCTTTGCCCCCTAAAGTCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTGTTTTTAATTATTACATTAATTTATGATTATGTGTTTCCTTTAAAGCTATGGGCAGCTCTGTTTGGGAAGATGCTACTGAAAAAAGGATGCTTTTTAGATGGCAAAGAGTACTTAAAATGTCTCTAGAATCATAGTTGTAAACTAAAGTATATATTTTTTAGTTGTTCACAGGGCTTAGAGCTCCTGCCAGAGGGCTGTTACTCTTTGGTCCACCTGGGAATGGGAAGACAATGCTGGTAAGGGTTCTCTTCAAATTTGAGTTTTCTGTTGAGATATTTGGGATAATATGAAAAAAAGAAACTTTATCTTGTCCTTGAGTCTATTATTTACGACTTGCTTTTTGCTATTGTACACTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGTGATCTGGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTTTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCACACCTGTCTAGGTTTTTTATTTTTGGCAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTCAAGCAGTCCTCCTACCTGGGCCTCCTAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCTGATACACTTTTAAGTTTTTCAGCTACTTTTCAATGTAGAAGTAGATGGAAAACCATGTACGTTATCTTCAGTAGTGTGTTTTTGGTTGGTTAAATTTGACAGTATGATTGTCATTATTTTTTGTAAATTAAATTTTTACCTGGAAGAGCTTACCTTACTATATTGAGTATCTTTCTAACCCCTGATTTTTGCTTCTACTATCATAATAACTTTATTTAAGTAATCAGTATGTTATAGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTCTTTTGCCAGAAGTTTTTATCAGGCTCTGGATACCTCTTTCCTCTGCATAGTCCTCCTGGATGGAAGAAACAAAGAGGGAAAGAGTAACTTTTCCTTAGATGTTTGTCTTTCTCAAAGCAGTTATCTTTGTATATCTAAGAAGAGAGGAGAATAACACTGTCTCTCTTTTTTTTTAAATCTCTCTCTACTCATTCTCTCTCAGGAGGAGAGTAGAAAGAAGCACAGCTCTTCCTATAACCTGTCCTTATTACTGAGAAAGGAACACATTGATTGCCATGTATTGGGGATTGTATTATACCTTACATTTTTATTTTTATTTTTTATTAATTTTTTTTTTTAGACAGTCTTACTCTATCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGATGTGATCTCGGCTCACTACCATCTCTTCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTGCCACGTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTGATGCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGCCTCATAGCTTACATTTTTAGAGAATCTTTTCTAGTACTTAAATCGGTAAATATGGTTATCTTTTAAATGTAATATATTGAACTAATTTAATATTTGCTCTTGTGATTTTTAAAGGCTAAAGCAGTAGCTGCAGAATCGAATGCAACCTTCTTTAATATAAGTGCTGCAAGTTTAACTTCAAAATACGTGAGTGCTCTGTTTCCAATATTGTCGTATTTTAAGTTACTGTCTAAATGTTACTGTGTTAACTGTAAATGGTAATATTTCATGAAAATATTTTTCTAGGAGCTTATCTATTGTATCTATTATTTACATATGATGAATATCTATCTTCAGAGTAGAAAGTTATGTACATTTGTGTTGTCAAATACTGTATTAGTTTACTGGGGCCATGTAATAAAATACCGTAAACTGGCTGGCTTAAACATCAGCAATTTATTGTCTCACAGTTGTGGAAGGTAGAAGTCTAAGATCAGTCAAAATGTTGGCAGGGTTGCTTCCTCCTGAGGGCTGTGAGGGAAAATGTATGTTGTGTGCCTCTCTCCTGGCTTCTGGTGGCTTGCTGGCAATCTTTTGTATTCCTTGGCTTGTAGATGCATCCCTCCTATCTCTGTCTTTATCTTTATGTGGCATTCTCCCTGTGTCTGTCACCATGTCCAAATTTCCCCTGTGGATTAGGACCCACCCTAATGATCTCAATTTAAGTTTGTCATCAGCAACAATTCTATGTCCAAATAATGTCACATTCATAGGTACTAGGGATAGGACTTCAACACGTTTTTGGAGAACACAGTTCAACCCATTAACAAATACTATCACTTTCCACTTAAGCTTCAAGTAAAGTGGATTTTATCTCAAGGAGCCACCAGATAGGAACACAGATCTGATGGCATAAACTGAGTATTTCTGGCCTTCTGATTCTGATCTAAAATATGACAGAAGATTTTCCCTGTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTATAATAGAGACACAGTCTCGCTATGTTGCCAGGCTACTTTCAAATTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCTGCCTCGGACTCTCAAAGTGCTGGAATTACAAGTGTGAGCCACCACACCTGGCCAGTAGATTTTCCCTGCTTTCTTTTGATTGTTTATAATTTTGTTTTCTTTTTCCATTCACCCTCTGCTGACCCTATAGTATTATTCAAAGAAGTGTTCAGTCTAGTTTTGGGGTAGGGCAAGCATAACTACAGTGCTTAAAGAGAGTAATTTGTCTGGTGTGCAGAACTAGTGTGTAAATATAACTGGTGCATTGCAAAACTGTGAAGTAGTTTCTGTCAAACCTTACACTGCTTTGTCTTTCTCCCTCTCTCCCTTTCTCTTGGTTGCCCCCTCCCCCTCCCAATGATACCTTAGTCTCTGCTTGCCTTTATCAAAACCTTTATGATTGGCCGGGCACAGTGGCCCATGCCTATAATCCTAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCACCTGAGCCCAGAAGTTGGAGACCAGCCTAGGCAACATGGTGAAACCCCATCTCTTCCAAAAATAAAAAATAGAGCCAGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCGAGAGGATCTCTTGAGCCTGAGAGGTTGAGGCTGCAGTGAACTGTGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGTGTGAGACCCTGTCTCAAAGAAACAAAACAAGGGGGGGCATGGTGGCTAACTCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGACTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAATACCACCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAATTTAGCTGGACATGCCAGCGAATACGTGGTCCCAGCAAATCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGTCAAGGAGGTTGAGGTTGCAGTGAGCCACGATCATGCCAATGCATTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACCACGTCTCAAAAACAAAACAAAACAAACTTTTATGGTTGAAAGTGTTTTGGCAAACATACTTAAACTGAAATGTGAATCTCTGATGAAAGAACATGTTACCTGTAAAAGTTTGAAGTGTCAGCATTTGTTGCACCGAAATCCAGAGGTGAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGCTGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAA
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Task1_train_3321
A genomic change on Chromosome 2 affects SPAST (spastin). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GTCTCAAACTTCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTC
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Task1_train_3322
The variant affects gene SPAST (spastin), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TCAAACTTCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGT
TCAAACTTCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGGAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGT
Task1_train_3323
Given this context: Chromosome 2, gene SPAST (spastin) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TTCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTC
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Task1_train_3324
A genomic change on Chromosome 2 affects SPAST (spastin). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CTCAAGTGATCCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGAT
CTCAAGTGATCCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTCGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGAT
Task1_train_3325
The variant affects gene SPAST (spastin), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GTGATCCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTC
GTGATCCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGACGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTC
Task1_train_3326
A variant has been detected on Chromosome 2 in SPAST (spastin). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTT
CCTCCCATTTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTGTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTT
Task1_train_3327
A mutation on Chromosome 2 affecting SPAST (spastin) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GGATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTA
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Task1_train_3328
Gene SPAST (spastin), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
ATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGG
ATCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTCCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGG
Task1_train_3329
This is a variant in SPAST (spastin), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGT
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Task1_train_3330
Here is a mutation in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGT
TCACAGGCATGAGTCACTGTGCCTGGTCTTCAAGTTGTTATTAAAGCATGTTTACCCACATTATGCACATGGTATAATGGAAAGTATTGTTGTGGAAGTTAGGAGATAGGGATTCTAGCCTAGCTTTTTATTTTTTTGGGACAAGGTCTCACTTTTTCGCCCCAGGCCGAAGTGCAGTTGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCTCAGGTTCAAGCAATTCTCCCACGTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTTTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGT
Task1_train_3331
The gene SPAST (spastin), on Chromosome 2, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTT
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Task1_train_3332
Consider a variant on Chromosome 2 in gene SPAST (spastin). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGC
GGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGGTAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGC
Task1_train_3333
This is a variant in SPAST (spastin), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGT
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Task1_train_3334
Here is a genetic alteration in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CACGCCCGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCA
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Task1_train_3335
Here is a mutation in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TGTAGTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAG
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Task1_train_3336
Given this variant in gene SPAST (spastin) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTG
CACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTGGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTG
Task1_train_3337
A variant found in Chromosome 2 affects SPAST (spastin). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
AGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGG
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Task1_train_3338
The following genetic variant occurs in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia
AGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGG
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Task1_train_3339
A variant has been detected on Chromosome 2 in SPAST (spastin). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGC
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Task1_train_3340
Gene SPAST (spastin) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_3341
A variant has been detected on Chromosome 2 in SPAST (spastin). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTAT
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Task1_train_3342
The gene SPAST (spastin) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTC
CCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTGTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTC
Task1_train_3343
Assess the clinical impact of this variant on gene SPAST (spastin), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTT
TCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAAGTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTT
Task1_train_3344
A sequence alteration has been identified in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
GAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTTCCTT
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Task1_train_3345
With a mutation on Chromosome 2 in gene SPAST (spastin), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCTCTAGCGTAACTTTTACATCCTGAACTGACCTTAAGAAAGTATAACTTTAGGCCTGTTTCATCTGTAAAATGTTAATGTCATAGGAGATGATCTTTTGAGATTTCTTTCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTTCCTTTGG
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Task1_train_3346
Given this variant in gene SPAST (spastin) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTTCCTTTGGTTTGTGTGTCTGTTTTTATACCAGAATTATGCTGTTTGGGCTGCTGTGTAGTTCGGTTTAAAGTCAGGTAACGTGATACTTACAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGTCTATTTGGACTCTTTTTTTGCTTCCATATGAATTTTAGAATATTTTTTTCTAATTTTGTGAAAAACAAC
TCAGCTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAGCTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTTCCTTTGGTTTGTGTGTCTGTTTTTATACCAGAATTATGCTGTTTGGGCTGCTGTGTAGTTCGGTTTAAAGTCAGGTAACGTGATACTTACAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGTCTATTTGGACTCTTTTTTTGCTTCCATATGAATTTTAGAATATTTTTTTCTAATTTTGTGAAAAACAAC
Task1_train_3347
A genomic change on Chromosome 2 affects SPAST (spastin). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; not provided
CTCTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTTCCTTTGGTTTGTGTGTCTGTTTTTATACCAGAATTATGCTGTTTGGGCTGCTGTGTAGTTCGGTTTAAAGTCAGGTAACGTGATACTTACAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGTCTATTTGGACTCTTTTTTTGCTTCCATATGAATTTTAGAATATTTTTTTCTAATTTTGTGAAAAACAACATTG
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Task1_train_3348
A variant was discovered in gene SPAST (spastin), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
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CTGATAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATGGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTTCCTTTGGTTTGTGTGTCTGTTTTTATACCAGAATTATGCTGTTTGGGCTGCTGTGTAGTTCGGTTTAAAGTCAGGTAACGTGATACTTACAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGTCTATTTGGACTCTTTTTTTGCTTCCATATGAATTTTAGAATATTTTTTTCTAATTTTGTGAAAAACAACATTGAT
Task1_train_3349
A variant found in Chromosome 2 affects SPAST (spastin). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Spastic paraparesis
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Task1_train_3350
An alteration has been detected in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
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Task1_train_3351
Mutation context: Chromosome 2, Gene SPAST (spastin). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTCTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAATATTTGTTTCGATTATTCTAAATCTGGTGACATTTCTTTTGTTTTTAAGTTAAATCTTCAGTAAAAAGAATAAATGCCACCTAGAGGACAGAAAAATTTTTACAGTAGATTATCACAGACCTCATGACTCATTACTTTGGTGTATAAAATGGCCTTTGTATGGTGTCAGCACCTGGGAATGTCTCAAGGGGTGTTCATTGACCTTCTGGACTATCTGGAAATATTTTGATATTTATTGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACCTCGGGAGGCCAAGTTAGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGCCAACTAAGTTAGTTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATAGGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAGGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTACCAATATGGTAAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGATGTTGAGGGATGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAAAAGTCACAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGGGCTATAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGAAATTTTGATATTTATGTGAGAATGACTTTTCACGGTGTTCTTAATAGCGCAAGTTTTGTTTAGGAGAGCACATTCCAACTTACTTGCTTCTATAAATATACCGTGTAATCTAGGGCTTAAAGAATATGTACAATGTCTTTTTCTCTCCCCTAGTCTTCCCCTTTTCTCACTAGTTATATCCTTGACTGAAGAGCTATTTCATTCTCAAGTCTTAGGAATGCAGGGTGAAGCAAAACAGATGAATTTTTAAAGCACTTAACCAGGCTGTATGAAATCACAGTCTGTTGTCTAAAATTGTAAGGGACGGTTAGTAGTACTCTCCCCTTTCTCAAACCAAATCTTTGGTTGTTTTAAGGAAGGGAAATTAAATTCCTGTGTGCTAGATTTTCAACATAAAATTTAAAAAACTGGAATAATGTTGCATTTTATGTGTATAACAGTATAATGCTTTGTTTTAGGTGGGAGAAGGAGAGAAATTGGTGAGGGCTCTTTTTGCTGTGGCTCGAGAACTTCAACCTTCTATAATTTTTATAGGTAAGAACATATTTTCCAACTAAGTTATTGACTATTTGTGAAATTTCCCTCTCCAAATAGGAAAGATACGATTGGAAACATTATTCAGAAGGAAGAAGTTTTAAAGAAGGGCAAGCTTAAAGACTATCTAATGAATTTAGTAGGACCCACTATATTAATAAGTAGTAAACTAGATTAATCTCAGATGACTCACATAGCTTGGTCTTTAATTAAAGTCTTATACTTGTATTTCCTCTAGATGAAGTTGATAGCCTTTTGTGTGAAAGAAGAGAAGGGGAGCACGATGCTAGTAGACGCCTAAAAACTGAATTTCTAATAGAATTTGATGGTGTAAGTGTTGATTATGATATTTTTAATGTGGCAGCATTTTAGTATATTTTCCTATTAAATGGCCAAGGTTAAAAATACAAATATCTTTATATTTGTTATTACTTTTCTAAATGAATTGAAAAAAGATTTTTTGCTTGTAGGTACAGTCTGCTGGAGATGACAGAGTACTTGTAATGGGTGCAACTAATAGGCCACAAGAGCTTGATGAGGCTGTTCTCAGGTAGGGAGATTTATATGGAAATACATGCATTTATTACAGACAATATTTACTCATGTGTCCATCTTACATATTATTTCCTTACTCTCAGTTTTAAGACTAAATTCACTATTTTCTTCCAGTACTATCTCTAGCCTCTTGTTACCAACTACATAAGGATTTTGAGGTCAACAGCTTGATATCAGGAGAATTAGTCTAGTAAAGGTTTAGTTACGGTTTTAGGCAAATTGGTCAGTTCTTCTGGGTTGCATTAAATTATCTTTAAACTTGAAAATTGATTCTTACCGTCTTTTATTGGGCTTCATGAGAAAATAATCAAATCAGGGTTCATGGAAAATGTGTTTTCTGTTCTTGTGTGTTTGAGCAGTTTATTCCCTTCATACTGGAAGGACGGTTTGGGTCAGCATAAAATTCTTGGGCATCCTTTCCCAAGGAATTTACAATATTGCTCCATTGTTTCTAGATTGGCTGTAGTAGTGTAAAAGTCTGAATCCAAATTGATTTTTTCAAATTTGTAAAATAACTTGATTTTTTTCTCTCTTTACTGGATGGGTTACGTGGGTATATTGCACCCAGGTAGTGAGCATAGGGTGCAGTAGGTAGTTTTTCAACCCACACCTCACTGCTTTCTTCCCCCATGTAGTAGTCCGCAGTGTGTATTGTTCCCATGTTTATGTCCATGTGTACTCAATTTTTAGCTCCCCACTTATGAGAACATGAGCTATTTGGTTTACTGTTCCCACATTAATTGGCGTAGTATTAAGGCCTCCACCTCCATCCATGTTGCTGCAAAGGACATTATTTCATTCTTTTTTATGGCTGCGTAGTACATAGTATTCCATGGTGTGTACGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCATTGATGGACACTTAGATTGATTCTATGTCTGCTGTCATGAATAGTACAGCAATAAACATGAAATGCATGTCTTTTTGGTATAATGATCTATTTTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTTCAGGGTCAAAGGTAGATTTGTTTTATGTTTTTTGAGAAATCTTCAAACTGCTTTCTACAATGACTGAACTTTACATTCCTACCAGCAGTACATACGCTCCACAACCTCACCAACATCTGTTATTTTTTTACTTTTTCCCGCCAATCTGTAGACAATATGGGATTTTTTTTGCCATTTTATTAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATATCTCATTGTGATTTTGATTTGCATTTTTCTGATGGTTAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTTTGTTGTCCCCTCGTATGTCTTTTGAGAAGTGTCTATTCATTTCCTTTTTACCCATTTTTTAATAGGGTTGTGTGTTTTTAGCTTGTTCAATTGTTTGAATTCCTTATAGATTCTGGATATCAGACCATTGTTAGATGCAGTTCTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGTTGATGGTTCTTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTATTTTTGTTGCAATTGTGTTTGGGGACTTAGCCAAAATTTCTTTCTGAGGCTGATGTCAAGAAGTGTATTTCCTAGTTTTCTTCTAGCATTTTTATACTTTGAGATCTTACATTTAAATCTTTAATCCACCTTGAGTTAATTTTTGTATATGGTGAAAAGTAAGGGTCCAGTTTCATTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTAATCCCCATGCCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTTCCTCATTGCTTGTTTTTGTCAGTCTTATCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGTGGCTTTATTTCTCAATTTTCTGTCCTGTTCCTTTGGTTTGTGTGTCTGTTTTTATACCAGAATTATGCTGTTTGGGCTGCTGTGTAGTTCGGTTTAAAGTCAGGTAACGTGATACTTACAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGTCTATTTGGACTCTTTTTTTGCTTCCATATGAATTTTAGAATATTTTTTTCTAATTTTGTGAAAAACAACATTGATAGTTTGATAG
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Task1_train_3352
The following genetic variant occurs in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
AAAAAAAGACAATGGAGTACCTAGGAATACGGCTGATGAAGGAGGTGAAAGAATCTGTATGAGGAGAAGTGTAAAGCACTGCTAAAATAAATCAGAGGTGACACAAATAAATGGAAAAACACTCCATGCTCATGGATTGGAAGAATCAATATCGTTAAAATGGGAAATTTATCTTAATTTTTTTCCCTAGTTCATTTTTCTGTTTTCTTTTGCACATAAATTATGTGTTATGTTGCGTCCTTTTGTTTTCCCTATCTGTAATTTTCTTCTTCATCCTTTTAAACTCTTAGGTCTTTTTGTTTTGTTCTGTTTTCCCAAGCCTGTTGCCTTTATTTCTTACTGGGTTAGTATCTAATCTCCTTTCTGCTATATCTTTTGTAACTCTTCTTTCCTTGGTGGTTTTTTATTCATTACTTTCCTGACATCTGTTATTCTACTTTTCATCTTCTGTTTTATTTCTTTGAGCATCTGTATGTTATTTCCATAAGCTCTTACATTTCACTGGGCTCTTGTTTCATAGAAAACAATTTTTTGGCAAGGACAGACCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTACAACCCTGTCTCTGCTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTCACACACACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGATAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACGGCGGCACTGTACTCTAGCCTGGGGGACAGAGCAAGGCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAATTTTTTGGTCAGGCGTCATGGTGGGTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGATCACTTGAGGCCGGGAATTCCAGACCAGCCTCGCCAACGTGGCAAAACCCCATATCTATAAAAAAAACTTAAGGATAAAAAAAATTAAATTTTTAAAAAATTAAATTATTTTATTTCGTGGAAAGATACTTGGTCATAATTTTAGTTTGCTCTATGGCAAAATCTTCTCATGCATGTTCTTCATTTTATCTAGTTTATGTTTATTGTGTTTTGTTTGCTCTTTTTTGGGGGCAGGTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGAGCCCTGTCCTGGTTTTTCCTTTTTTGCTTATTATTTTTCTTTGAATAAAAGGAGTTTTCTTGGAAAACCTAGTTTTGGAAGGATATTGTAGGGGAAGGGATAGGTATCTTGAGTAGTCCATGTATACACTAAACTAGCATGCAGCCTCCCTCACTTACAGTGAAGCCCTACCTAATAATGAAGTATATGTGTATGTAAATAAGAGATAGGGTTGATTTATTCTTCTACTAAAAAATATTGGTCACTGCAAGACATTGTCTTCCCGCCAGACTGTTAGATGCCTTCTTATAAAGATAATTCGTCTTAGAGTTTCTTTGTTCATTCTCACCTTCCTTGCCATTCCTATGCTATCAATTAGGGTTTATATGGTCTGCAGAGCCAGGCTTCATATGCTTGTTTAAATGTGGAGGGACTGGCCTTATTACCCTTTAGGGTGTGCTATCTCTTTTTGGGAGGAAAACTGTACTCTGACAGTCATGTCCATGATCTTTAGCGGCAGATCCTTTGTGTGTCTTCCTTTGTCAGTGTAATTTTCACTGCCCTAGGCAGTTCACCTTTATGTATTTTAGTTCCATAAATGTTACCTAGTTTGTTGATGAAGTGTATGTTTCTGTTTCTATTATCCTTGCTGATTTTAGTTTTTTTCAGATTCAAGAAGACAGATCTACTTATATCAGATATTTTGTTTGTTTTAAAGCATTACTGCTATTAAAAACATATACATACATAAATGATTAATTCTAACAATACCGAATTAAGGATTTTAAACATTAACTAGAGTTTTAAAAGAGTAACAAAAATATTTTTACATTGATAACTACCAAAATGCATTCCAGTGCCTTGAATATTATATTTTAAAAGCTTTTCCTGTCATTTGCTGTTTCAGCTTTAAATTCAAAATTATATTTCTAAAAGTGCTGGATTTTTTTTTTTAGGCGTTTCATCAAACGGGTATATGTGTCTTTACCAAATGAGGAGGTATGTATCTGTGTTTGAATTTTTTTTGTTTTAGAGCAGAAACAAGAACTACCATCTTGACAATATTAAGTCTTCCAATCCATGGTACAGCTACTTTGGAAAACAGTTTAGTGGTTTCTTAAAAAGATGTACATAAGCTTACTGTCAGAGCCAGCAATTTCACTCCTAAGAATTTACCCCAGAGAAACAAAAATGTATGTCCACACAAAGACTTGTACAAGAATTTTTATAGCAGCAATATTAATAATAGCCAGAACTACAAATGATCTAAAATGTTTATTTTGGTGAATAAACAAATGTGGTATATTCATTTAATGGATACTGTTATCCATTATACATGCTGCATACTCACTTCATATATTAAGTTTTATGAATGAAACTCCAAAACATTATAAGTGAAAGAAGCAAGATGATATATGTCGCATATCATAGGATTCTGTTTATATGCAGAAAACGCAAATTTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGTGCCACCAGGCCTGGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACCGTGCCCGGCCAGAAATCGAAAATTTCTAGAAACGTAAAGCAGATCAGTGGGTTGTCAGGGTGAGAGTTGGGAATGAGGATTAACTGCAAACAGGTATGAGTGAACTAAAAAGTGTTCTAAAACTGGATTGTGGTGATGATTGCACATCTATAAATGTATTAAAACTCATTGAATTATATACTTACAATGGGTGAAATTCATAGTAGATGAATTCATACCTCTATAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTT
AAAAAAAGACAATGGAGTACCTAGGAATACGGCTGATGAAGGAGGTGAAAGAATCTGTATGAGGAGAAGTGTAAAGCACTGCTAAAATAAATCAGAGGTGACACAAATAAATGGAAAAACACTCCATGCTCATGGATTGGAAGAATCAATATCGTTAAAATGGGAAATTTATCTTAATTTTTTTCCCTAGTTCATTTTTCTGTTTTCTTTTGCACATAAATTATGTGTTATGTTGCGTCCTTTTGTTTTCCCTATCTGTAATTTTCTTCTTCATCCTTTTAAACTCTTAGGTCTTTTTGTTTTGTTCTGTTTTCCCAAGCCTGTTGCCTTTATTTCTTACTGGGTTAGTATCTAATCTCCTTTCTGCTATATCTTTTGTAACTCTTCTTTCCTTGGTGGTTTTTTATTCATTACTTTCCTGACATCTGTTATTCTACTTTTCATCTTCTGTTTTATTTCTTTGAGCATCTGTATGTTATTTCCATAAGCTCTTACATTTCACTGGGCTCTTGTTTCATAGAAAACAATTTTTTGGCAAGGACAGACCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTACAACCCTGTCTCTGCTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTCACACACACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGATAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACGGCGGCACTGTACTCTAGCCTGGGGGACAGAGCAAGGCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAATTTTTTGGTCAGGCGTCATGGTGGGTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGATCACTTGAGGCCGGGAATTCCAGACCAGCCTCGCCAACGTGGCAAAACCCCATATCTATAAAAAAAACTTAAGGATAAAAAAAATTAAATTTTTAAAAAATTAAATTATTTTATTTCGTGGAAAGATACTTGGTCATAATTTTAGTTTGCTCTATGGCAAAATCTTCTCATGCATGTTCTTCATTTTATCTAGTTTATGTTTATTGTGTTTTGTTTGCTCTTTTTTGGGGGCAGGTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGAGCCCTGTCCTGGTTTTTCCTTTTTTGCTTATTATTTTTCTTTGAATAAAAGGAGTTTTCTTGGAAAACCTAGTTTTGGAAGGATATTGTAGGGGAAGGGATAGGTATCTTGAGTAGTCCATGTATACACTAAACTAGCATGCAGCCTCCCTCACTTACAGTGAAGCCCTACCTAATAATGAAGTATATGTGTATGTAAATAAGAGATAGGGTTGATTTATTCTTCTACTAAAAAATATTGGTCACTGCAAGACATTGTCTTCCCGCCAGACTGTTAGATGCCTTCTTATAAAGATAATTCGTCTTAGAGTTTCTTTGTTCATTCTCACCTTCCTTGCCATTCCTATGCTATCAATTAGGGTTTATATGGTCTGCAGAGCCAGGCTTCATATGCTTGTTTAAATGTGGAGGGACTGGCCTTATTACCCTTTAGGGTGTGCTATCTCTTTTTGGGAGGAAAACTGTACTCTGACAGTCATGTCCATGATCTTTAGCGGCAGATCCTTTGTGTGTCTTCCTTTGTCAGTGTAATTTTCACTGCCCTAGGCAGTTCACCTTTATGTATTTTAGTTCCATAAATGTTACCTAGTTTGTTGATGAAGTGTATGTTTCTGTTTCTATTATCCTTGCTGATTTTAGTTTTTTTCAGATTCAAGAAGACAGATCTACTTATATCAGATATTTTGTTTGTTTTAAAGCATTACTGCTATTAAAAACATATACATACATAAATGATTAATTCTAACAATACCGAATTAAGGATTTTAAACATTAACTAGAGTTTTAAAAGAGTAACAAAAATATTTTTACATTGATAACTACCAAAATGCATTCCAGTGCCTTGAATATTATATTTTAAAAGCTTTTCCTGTCATTTGCTGTTTCAGCTTTAAATTCAAAATTATATTTCTAAAAGTGCTGGATTTTTTTTTTTAGCCGTTTCATCAAACGGGTATATGTGTCTTTACCAAATGAGGAGGTATGTATCTGTGTTTGAATTTTTTTTGTTTTAGAGCAGAAACAAGAACTACCATCTTGACAATATTAAGTCTTCCAATCCATGGTACAGCTACTTTGGAAAACAGTTTAGTGGTTTCTTAAAAAGATGTACATAAGCTTACTGTCAGAGCCAGCAATTTCACTCCTAAGAATTTACCCCAGAGAAACAAAAATGTATGTCCACACAAAGACTTGTACAAGAATTTTTATAGCAGCAATATTAATAATAGCCAGAACTACAAATGATCTAAAATGTTTATTTTGGTGAATAAACAAATGTGGTATATTCATTTAATGGATACTGTTATCCATTATACATGCTGCATACTCACTTCATATATTAAGTTTTATGAATGAAACTCCAAAACATTATAAGTGAAAGAAGCAAGATGATATATGTCGCATATCATAGGATTCTGTTTATATGCAGAAAACGCAAATTTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGTGCCACCAGGCCTGGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACCGTGCCCGGCCAGAAATCGAAAATTTCTAGAAACGTAAAGCAGATCAGTGGGTTGTCAGGGTGAGAGTTGGGAATGAGGATTAACTGCAAACAGGTATGAGTGAACTAAAAAGTGTTCTAAAACTGGATTGTGGTGATGATTGCACATCTATAAATGTATTAAAACTCATTGAATTATATACTTACAATGGGTGAAATTCATAGTAGATGAATTCATACCTCTATAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTT
Task1_train_3353
Gene SPAST (spastin) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TCTCACCTTCCTTGCCATTCCTATGCTATCAATTAGGGTTTATATGGTCTGCAGAGCCAGGCTTCATATGCTTGTTTAAATGTGGAGGGACTGGCCTTATTACCCTTTAGGGTGTGCTATCTCTTTTTGGGAGGAAAACTGTACTCTGACAGTCATGTCCATGATCTTTAGCGGCAGATCCTTTGTGTGTCTTCCTTTGTCAGTGTAATTTTCACTGCCCTAGGCAGTTCACCTTTATGTATTTTAGTTCCATAAATGTTACCTAGTTTGTTGATGAAGTGTATGTTTCTGTTTCTATTATCCTTGCTGATTTTAGTTTTTTTCAGATTCAAGAAGACAGATCTACTTATATCAGATATTTTGTTTGTTTTAAAGCATTACTGCTATTAAAAACATATACATACATAAATGATTAATTCTAACAATACCGAATTAAGGATTTTAAACATTAACTAGAGTTTTAAAAGAGTAACAAAAATATTTTTACATTGATAACTACCAAAATGCATTCCAGTGCCTTGAATATTATATTTTAAAAGCTTTTCCTGTCATTTGCTGTTTCAGCTTTAAATTCAAAATTATATTTCTAAAAGTGCTGGATTTTTTTTTTTAGGCGTTTCATCAAACGGGTATATGTGTCTTTACCAAATGAGGAGGTATGTATCTGTGTTTGAATTTTTTTTGTTTTAGAGCAGAAACAAGAACTACCATCTTGACAATATTAAGTCTTCCAATCCATGGTACAGCTACTTTGGAAAACAGTTTAGTGGTTTCTTAAAAAGATGTACATAAGCTTACTGTCAGAGCCAGCAATTTCACTCCTAAGAATTTACCCCAGAGAAACAAAAATGTATGTCCACACAAAGACTTGTACAAGAATTTTTATAGCAGCAATATTAATAATAGCCAGAACTACAAATGATCTAAAATGTTTATTTTGGTGAATAAACAAATGTGGTATATTCATTTAATGGATACTGTTATCCATTATACATGCTGCATACTCACTTCATATATTAAGTTTTATGAATGAAACTCCAAAACATTATAAGTGAAAGAAGCAAGATGATATATGTCGCATATCATAGGATTCTGTTTATATGCAGAAAACGCAAATTTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGTGCCACCAGGCCTGGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACCGTGCCCGGCCAGAAATCGAAAATTTCTAGAAACGTAAAGCAGATCAGTGGGTTGTCAGGGTGAGAGTTGGGAATGAGGATTAACTGCAAACAGGTATGAGTGAACTAAAAAGTGTTCTAAAACTGGATTGTGGTGATGATTGCACATCTATAAATGTATTAAAACTCATTGAATTATATACTTACAATGGGTGAAATTCATAGTAGATGAATTCATACCTCTATAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACC
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Task1_train_3354
A variant has been detected on Chromosome 2 in SPAST (spastin). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CTTGCCATTCCTATGCTATCAATTAGGGTTTATATGGTCTGCAGAGCCAGGCTTCATATGCTTGTTTAAATGTGGAGGGACTGGCCTTATTACCCTTTAGGGTGTGCTATCTCTTTTTGGGAGGAAAACTGTACTCTGACAGTCATGTCCATGATCTTTAGCGGCAGATCCTTTGTGTGTCTTCCTTTGTCAGTGTAATTTTCACTGCCCTAGGCAGTTCACCTTTATGTATTTTAGTTCCATAAATGTTACCTAGTTTGTTGATGAAGTGTATGTTTCTGTTTCTATTATCCTTGCTGATTTTAGTTTTTTTCAGATTCAAGAAGACAGATCTACTTATATCAGATATTTTGTTTGTTTTAAAGCATTACTGCTATTAAAAACATATACATACATAAATGATTAATTCTAACAATACCGAATTAAGGATTTTAAACATTAACTAGAGTTTTAAAAGAGTAACAAAAATATTTTTACATTGATAACTACCAAAATGCATTCCAGTGCCTTGAATATTATATTTTAAAAGCTTTTCCTGTCATTTGCTGTTTCAGCTTTAAATTCAAAATTATATTTCTAAAAGTGCTGGATTTTTTTTTTTAGGCGTTTCATCAAACGGGTATATGTGTCTTTACCAAATGAGGAGGTATGTATCTGTGTTTGAATTTTTTTTGTTTTAGAGCAGAAACAAGAACTACCATCTTGACAATATTAAGTCTTCCAATCCATGGTACAGCTACTTTGGAAAACAGTTTAGTGGTTTCTTAAAAAGATGTACATAAGCTTACTGTCAGAGCCAGCAATTTCACTCCTAAGAATTTACCCCAGAGAAACAAAAATGTATGTCCACACAAAGACTTGTACAAGAATTTTTATAGCAGCAATATTAATAATAGCCAGAACTACAAATGATCTAAAATGTTTATTTTGGTGAATAAACAAATGTGGTATATTCATTTAATGGATACTGTTATCCATTATACATGCTGCATACTCACTTCATATATTAAGTTTTATGAATGAAACTCCAAAACATTATAAGTGAAAGAAGCAAGATGATATATGTCGCATATCATAGGATTCTGTTTATATGCAGAAAACGCAAATTTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGTGCCACCAGGCCTGGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACCGTGCCCGGCCAGAAATCGAAAATTTCTAGAAACGTAAAGCAGATCAGTGGGTTGTCAGGGTGAGAGTTGGGAATGAGGATTAACTGCAAACAGGTATGAGTGAACTAAAAAGTGTTCTAAAACTGGATTGTGGTGATGATTGCACATCTATAAATGTATTAAAACTCATTGAATTATATACTTACAATGGGTGAAATTCATAGTAGATGAATTCATACCTCTATAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCC
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Task1_train_3355
This variant affects gene SPAST (spastin) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CTTGCCATTCCTATGCTATCAATTAGGGTTTATATGGTCTGCAGAGCCAGGCTTCATATGCTTGTTTAAATGTGGAGGGACTGGCCTTATTACCCTTTAGGGTGTGCTATCTCTTTTTGGGAGGAAAACTGTACTCTGACAGTCATGTCCATGATCTTTAGCGGCAGATCCTTTGTGTGTCTTCCTTTGTCAGTGTAATTTTCACTGCCCTAGGCAGTTCACCTTTATGTATTTTAGTTCCATAAATGTTACCTAGTTTGTTGATGAAGTGTATGTTTCTGTTTCTATTATCCTTGCTGATTTTAGTTTTTTTCAGATTCAAGAAGACAGATCTACTTATATCAGATATTTTGTTTGTTTTAAAGCATTACTGCTATTAAAAACATATACATACATAAATGATTAATTCTAACAATACCGAATTAAGGATTTTAAACATTAACTAGAGTTTTAAAAGAGTAACAAAAATATTTTTACATTGATAACTACCAAAATGCATTCCAGTGCCTTGAATATTATATTTTAAAAGCTTTTCCTGTCATTTGCTGTTTCAGCTTTAAATTCAAAATTATATTTCTAAAAGTGCTGGATTTTTTTTTTTAGGCGTTTCATCAAACGGGTATATGTGTCTTTACCAAATGAGGAGGTATGTATCTGTGTTTGAATTTTTTTTGTTTTAGAGCAGAAACAAGAACTACCATCTTGACAATATTAAGTCTTCCAATCCATGGTACAGCTACTTTGGAAAACAGTTTAGTGGTTTCTTAAAAAGATGTACATAAGCTTACTGTCAGAGCCAGCAATTTCACTCCTAAGAATTTACCCCAGAGAAACAAAAATGTATGTCCACACAAAGACTTGTACAAGAATTTTTATAGCAGCAATATTAATAATAGCCAGAACTACAAATGATCTAAAATGTTTATTTTGGTGAATAAACAAATGTGGTATATTCATTTAATGGATACTGTTATCCATTATACATGCTGCATACTCACTTCATATATTAAGTTTTATGAATGAAACTCCAAAACATTATAAGTGAAAGAAGCAAGATGATATATGTCGCATATCATAGGATTCTGTTTATATGCAGAAAACGCAAATTTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGTGCCACCAGGCCTGGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACCGTGCCCGGCCAGAAATCGAAAATTTCTAGAAACGTAAAGCAGATCAGTGGGTTGTCAGGGTGAGAGTTGGGAATGAGGATTAACTGCAAACAGGTATGAGTGAACTAAAAAGTGTTCTAAAACTGGATTGTGGTGATGATTGCACATCTATAAATGTATTAAAACTCATTGAATTATATACTTACAATGGGTGAAATTCATAGTAGATGAATTCATACCTCTATAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCC
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Task1_train_3356
Consider this mutation in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CTTCATATGCTTGTTTAAATGTGGAGGGACTGGCCTTATTACCCTTTAGGGTGTGCTATCTCTTTTTGGGAGGAAAACTGTACTCTGACAGTCATGTCCATGATCTTTAGCGGCAGATCCTTTGTGTGTCTTCCTTTGTCAGTGTAATTTTCACTGCCCTAGGCAGTTCACCTTTATGTATTTTAGTTCCATAAATGTTACCTAGTTTGTTGATGAAGTGTATGTTTCTGTTTCTATTATCCTTGCTGATTTTAGTTTTTTTCAGATTCAAGAAGACAGATCTACTTATATCAGATATTTTGTTTGTTTTAAAGCATTACTGCTATTAAAAACATATACATACATAAATGATTAATTCTAACAATACCGAATTAAGGATTTTAAACATTAACTAGAGTTTTAAAAGAGTAACAAAAATATTTTTACATTGATAACTACCAAAATGCATTCCAGTGCCTTGAATATTATATTTTAAAAGCTTTTCCTGTCATTTGCTGTTTCAGCTTTAAATTCAAAATTATATTTCTAAAAGTGCTGGATTTTTTTTTTTAGGCGTTTCATCAAACGGGTATATGTGTCTTTACCAAATGAGGAGGTATGTATCTGTGTTTGAATTTTTTTTGTTTTAGAGCAGAAACAAGAACTACCATCTTGACAATATTAAGTCTTCCAATCCATGGTACAGCTACTTTGGAAAACAGTTTAGTGGTTTCTTAAAAAGATGTACATAAGCTTACTGTCAGAGCCAGCAATTTCACTCCTAAGAATTTACCCCAGAGAAACAAAAATGTATGTCCACACAAAGACTTGTACAAGAATTTTTATAGCAGCAATATTAATAATAGCCAGAACTACAAATGATCTAAAATGTTTATTTTGGTGAATAAACAAATGTGGTATATTCATTTAATGGATACTGTTATCCATTATACATGCTGCATACTCACTTCATATATTAAGTTTTATGAATGAAACTCCAAAACATTATAAGTGAAAGAAGCAAGATGATATATGTCGCATATCATAGGATTCTGTTTATATGCAGAAAACGCAAATTTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGTGCCACCAGGCCTGGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACCGTGCCCGGCCAGAAATCGAAAATTTCTAGAAACGTAAAGCAGATCAGTGGGTTGTCAGGGTGAGAGTTGGGAATGAGGATTAACTGCAAACAGGTATGAGTGAACTAAAAAGTGTTCTAAAACTGGATTGTGGTGATGATTGCACATCTATAAATGTATTAAAACTCATTGAATTATATACTTACAATGGGTGAAATTCATAGTAGATGAATTCATACCTCTATAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGT
CTTCATATGCTTGTTTAAATGTGGAGGGACTGGCCTTATTACCCTTTAGGGTGTGCTATCTCTTTTTGGGAGGAAAACTGTACTCTGACAGTCATGTCCATGATCTTTAGCGGCAGATCCTTTGTGTGTCTTCCTTTGTCAGTGTAATTTTCACTGCCCTAGGCAGTTCACCTTTATGTATTTTAGTTCCATAAATGTTACCTAGTTTGTTGATGAAGTGTATGTTTCTGTTTCTATTATCCTTGCTGATTTTAGTTTTTTTCAGATTCAAGAAGACAGATCTACTTATATCAGATATTTTGTTTGTTTTAAAGCATTACTGCTATTAAAAACATATACATACATAAATGATTAATTCTAACAATACCGAATTAAGGATTTTAAACATTAACTAGAGTTTTAAAAGAGTAACAAAAATATTTTTACATTGATAACTACCAAAATGCATTCCAGTGCCTTGAATATTATATTTTAAAAGCTTTTCCTGTCATTTGCTGTTTCAGCTTTAAATTCAAAATTATATTTCTAAAAGTGCTGGATTTTTTTTTTTAGGCGTTTCATCAAACGGGTATATGTGTCTTTACCAAATGAGGAGGTATGTATCTGTGTTTGAATTTTTTTTGTTTTAGAGCAGAAACAAGAACTACCATCTTGACAATATTAAGTCTTCCAATCCATGGTACAGCTACTTTGGAAAACAGTTTAGTGGTTTCTTAAAAAGATGTACATAAGCTTACTGTCAGAGCCAGCAATTTCACTCCTAAGAATTTACCCCAGAGAAACAAAAATGTATGTCCACACAAAGACTTGTACAAGAATTTTTATAGCAGCAATATTAATAATAGCCAGAACTACAAATGATCTAAAATGTTTATTTTGGTGAATAAACAAATGTGGTATATTCATTTAATGGATACTGTTATCCATTATACATGCTGCATACTCACTTCATATATTAAGTTTTATGAATGAAACTCCAAAACATTATAAGTGAAAGAAGCAAGATGATATATGTCGCATATCATAGGATTCTGTTTATATGCAGAAAACGCAAATTTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGTGCCACCAGGCCTGGCTAATTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACCGTGCCCGGCCAGAAATCGAAAATTTCTAGAAACGTAAAGCAGATCAGTGGGTTGTCAGGGTGAGAGTTGGGAATGAGGATTAACTGCAAACAGGTATGAGTGAACTAAAAAGTGTTCTAAAACTGGATTGTGGTGATGATTGCACATCTATAAATGTATTAAAACTCATTGAATTATATACTTACAATGGGTGAAATTCATAGTAGATGAATTCATACCTCTATAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACCAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGT
Task1_train_3357
Given a variant located on Chromosome 2 and affecting SPAST (spastin), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
ATAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGTAGACTGTGACCCCTGTTCTAGGCAAGAGGTTTCATTTCTTGATAGTAAGTAAGCAGCAGAAAACTCAAAAAGAAAACTTTAAACAAAAAAGAATAATGTAAGGAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTGGCTCTTTTCAGTATTCTGACATCATTTGAAATTAATGTGTCTAAAGGAAATTCTATAAGAGAAGTTTTCACTTTTTTAATTATATCTTTTGAGGGATTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAGGTTACTTGGTTGATTCTGAAATACCACGACCAATTCTTTTTAGGTTAGGTTAGGATAAACTCACACAGATATTTTCAGCTACATTTCCACAGCCAGCATCGGTAGTGGATGGTTGATGCTCTCAGGTATGCACTCAGATTATTAGCTATGATGATAAAGTAATCATAATAGCTCCATCCCTTTCTCTCATTCAAGAAAGTACAATTGAATGTAGTTGTACGAGAAAGATGTTATCATAGTGTCTACTGTAATTTGCATTAAAAGCCTACATTATACAAACCTTTTTGTTTTACTAGTTAAAAATTACCAGTAACACCTCCCGTAGTGAAATAGGGTGCTGATTAAGAACTGCTACTTTGCAAAATAAAAAATGTAATCTTGAGAGTATATTTTGAAACTCTGGATGAACAAATTTTCTTGCTGCTGGAGCTTAAATCTTGTTCAGTTAGTGGATTTAGAAACAGTAGCTAATGCATAAATGAGTTGTATTTTCTTAGAACGTTTTGGCTATTCTAAGGTAGACAAAATTTGGGTTTAAAAAAAGATTCGCATCCATTAAAGTACAGAAAATGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGTGTGGGCCTAATAGTTTGAGACTAGACTGGGCAACATAGGGAGATCCTGTCTCTACAAAAAAATATAATAAATTAACCAGGCCCGTTGGCATGAGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAAGTAGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAGGTGCAGGCAGCAGTGAGCCATGGTCATGCCACTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGGGTGACATAGTGAGGTGCTGTCTTAAAAAGTAAATAAATAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAATATGGTGAAACCGCATCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTGTGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGTATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAGGTTGCAGTAAGCCGAGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATACATAAAGTGCAGAGTAAAAACAAAAAAAGACTAATGCATTTTGTAAAGAACAAGTTGCATTCTTTTAAGTTCCCTTTCAAATTTGTGAACTATTGTTTTTGGGCAGTATGCAAGAA
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Task1_train_3358
This is a variant in SPAST (spastin), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TAAAACTGGTTTTTTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGTAGACTGTGACCCCTGTTCTAGGCAAGAGGTTTCATTTCTTGATAGTAAGTAAGCAGCAGAAAACTCAAAAAGAAAACTTTAAACAAAAAAGAATAATGTAAGGAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTGGCTCTTTTCAGTATTCTGACATCATTTGAAATTAATGTGTCTAAAGGAAATTCTATAAGAGAAGTTTTCACTTTTTTAATTATATCTTTTGAGGGATTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAGGTTACTTGGTTGATTCTGAAATACCACGACCAATTCTTTTTAGGTTAGGTTAGGATAAACTCACACAGATATTTTCAGCTACATTTCCACAGCCAGCATCGGTAGTGGATGGTTGATGCTCTCAGGTATGCACTCAGATTATTAGCTATGATGATAAAGTAATCATAATAGCTCCATCCCTTTCTCTCATTCAAGAAAGTACAATTGAATGTAGTTGTACGAGAAAGATGTTATCATAGTGTCTACTGTAATTTGCATTAAAAGCCTACATTATACAAACCTTTTTGTTTTACTAGTTAAAAATTACCAGTAACACCTCCCGTAGTGAAATAGGGTGCTGATTAAGAACTGCTACTTTGCAAAATAAAAAATGTAATCTTGAGAGTATATTTTGAAACTCTGGATGAACAAATTTTCTTGCTGCTGGAGCTTAAATCTTGTTCAGTTAGTGGATTTAGAAACAGTAGCTAATGCATAAATGAGTTGTATTTTCTTAGAACGTTTTGGCTATTCTAAGGTAGACAAAATTTGGGTTTAAAAAAAGATTCGCATCCATTAAAGTACAGAAAATGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGTGTGGGCCTAATAGTTTGAGACTAGACTGGGCAACATAGGGAGATCCTGTCTCTACAAAAAAATATAATAAATTAACCAGGCCCGTTGGCATGAGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAAGTAGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAGGTGCAGGCAGCAGTGAGCCATGGTCATGCCACTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGGGTGACATAGTGAGGTGCTGTCTTAAAAAGTAAATAAATAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAATATGGTGAAACCGCATCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTGTGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGTATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAGGTTGCAGTAAGCCGAGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATACATAAAGTGCAGAGTAAAAACAAAAAAAGACTAATGCATTTTGTAAAGAACAAGTTGCATTCTTTTAAGTTCCCTTTCAAATTTGTGAACTATTGTTTTTGGGCAGTATGCAAGAAA
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Task1_train_3359
A variant on Chromosome 2 in gene SPAST (spastin) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
ATTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGTAGACTGTGACCCCTGTTCTAGGCAAGAGGTTTCATTTCTTGATAGTAAGTAAGCAGCAGAAAACTCAAAAAGAAAACTTTAAACAAAAAAGAATAATGTAAGGAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTGGCTCTTTTCAGTATTCTGACATCATTTGAAATTAATGTGTCTAAAGGAAATTCTATAAGAGAAGTTTTCACTTTTTTAATTATATCTTTTGAGGGATTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAGGTTACTTGGTTGATTCTGAAATACCACGACCAATTCTTTTTAGGTTAGGTTAGGATAAACTCACACAGATATTTTCAGCTACATTTCCACAGCCAGCATCGGTAGTGGATGGTTGATGCTCTCAGGTATGCACTCAGATTATTAGCTATGATGATAAAGTAATCATAATAGCTCCATCCCTTTCTCTCATTCAAGAAAGTACAATTGAATGTAGTTGTACGAGAAAGATGTTATCATAGTGTCTACTGTAATTTGCATTAAAAGCCTACATTATACAAACCTTTTTGTTTTACTAGTTAAAAATTACCAGTAACACCTCCCGTAGTGAAATAGGGTGCTGATTAAGAACTGCTACTTTGCAAAATAAAAAATGTAATCTTGAGAGTATATTTTGAAACTCTGGATGAACAAATTTTCTTGCTGCTGGAGCTTAAATCTTGTTCAGTTAGTGGATTTAGAAACAGTAGCTAATGCATAAATGAGTTGTATTTTCTTAGAACGTTTTGGCTATTCTAAGGTAGACAAAATTTGGGTTTAAAAAAAGATTCGCATCCATTAAAGTACAGAAAATGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGTGTGGGCCTAATAGTTTGAGACTAGACTGGGCAACATAGGGAGATCCTGTCTCTACAAAAAAATATAATAAATTAACCAGGCCCGTTGGCATGAGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAAGTAGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAGGTGCAGGCAGCAGTGAGCCATGGTCATGCCACTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGGGTGACATAGTGAGGTGCTGTCTTAAAAAGTAAATAAATAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAATATGGTGAAACCGCATCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTGTGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGTATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAGGTTGCAGTAAGCCGAGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATACATAAAGTGCAGAGTAAAAACAAAAAAAGACTAATGCATTTTGTAAAGAACAAGTTGCATTCTTTTAAGTTCCCTTTCAAATTTGTGAACTATTGTTTTTGGGCAGTATGCAAGAAATTGAACACTTTCCAGTTATTCCAAAGAAG
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Task1_train_3360
This alteration in SPAST (spastin) on Chromosome 2 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
TTGCTATGTTTTTATTCAAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGTAGACTGTGACCCCTGTTCTAGGCAAGAGGTTTCATTTCTTGATAGTAAGTAAGCAGCAGAAAACTCAAAAAGAAAACTTTAAACAAAAAAGAATAATGTAAGGAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTGGCTCTTTTCAGTATTCTGACATCATTTGAAATTAATGTGTCTAAAGGAAATTCTATAAGAGAAGTTTTCACTTTTTTAATTATATCTTTTGAGGGATTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAGGTTACTTGGTTGATTCTGAAATACCACGACCAATTCTTTTTAGGTTAGGTTAGGATAAACTCACACAGATATTTTCAGCTACATTTCCACAGCCAGCATCGGTAGTGGATGGTTGATGCTCTCAGGTATGCACTCAGATTATTAGCTATGATGATAAAGTAATCATAATAGCTCCATCCCTTTCTCTCATTCAAGAAAGTACAATTGAATGTAGTTGTACGAGAAAGATGTTATCATAGTGTCTACTGTAATTTGCATTAAAAGCCTACATTATACAAACCTTTTTGTTTTACTAGTTAAAAATTACCAGTAACACCTCCCGTAGTGAAATAGGGTGCTGATTAAGAACTGCTACTTTGCAAAATAAAAAATGTAATCTTGAGAGTATATTTTGAAACTCTGGATGAACAAATTTTCTTGCTGCTGGAGCTTAAATCTTGTTCAGTTAGTGGATTTAGAAACAGTAGCTAATGCATAAATGAGTTGTATTTTCTTAGAACGTTTTGGCTATTCTAAGGTAGACAAAATTTGGGTTTAAAAAAAGATTCGCATCCATTAAAGTACAGAAAATGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGTGTGGGCCTAATAGTTTGAGACTAGACTGGGCAACATAGGGAGATCCTGTCTCTACAAAAAAATATAATAAATTAACCAGGCCCGTTGGCATGAGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAAGTAGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAGGTGCAGGCAGCAGTGAGCCATGGTCATGCCACTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGGGTGACATAGTGAGGTGCTGTCTTAAAAAGTAAATAAATAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAATATGGTGAAACCGCATCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTGTGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGTATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAGGTTGCAGTAAGCCGAGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATACATAAAGTGCAGAGTAAAAACAAAAAAAGACTAATGCATTTTGTAAAGAACAAGTTGCATTCTTTTAAGTTCCCTTTCAAATTTGTGAACTATTGTTTTTGGGCAGTATGCAAGAAATTGAACACTTTCCAGTTATTCCAAAGAAGG
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Task1_train_3361
A genetic alteration is present in SPAST (spastin) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
AAGTGTGGTGAATTATTGCTATGTTTTTATCCAGGTGTGGTGTCTCACGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCCTGTCTCTACAAAAACTTTTTTAGAAATTAACCAGGCATGGTGGCACGTGCCTTTGGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGATATCGAGGCTATAGTGAGCTATGATTGTGCCCTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGCACAAGACCCTGTCTCAATATAAAAAAAGAAAAGAATCATTAATTCTGAAATTAGACTGAATGATCATTTTTTAATATTTTTCAGACAAGACTACTTTTGCTTAAAAATCTGTTATGTAAACAAGGAAGTCCATTGACCCAAAAAGAACTAGCACAACTTGCTAGGTGAGTAATTTGGATTTGGTTTATCTTACAGCTTTTATTTATTTTTTGTAAATAATTCTTTTTTTAGTTATTTAAAGTAATCTTAAGTATGAAATGAGTAATTCATTGATCAGAAGACTTTCTCTCATCCTCTACCTCCTTTGCCTTTTTCTTACCTCTTGTTCTTATATATATATGTGGAATCTAAATTTCACTGGCTATGTCCTTTGCAAGACGTGATCTAATGATGATAGTATATTCTTTTTATAAATTTATTAAAACCTGTAAGTGGTATTAAAGTAATTTAAACATTTACACCTTAGGCAACATGGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAATGAGTCAGGAATGGTGGCACATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGATGTGGGAGGATCGCTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGAGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAATTTTAAACATTTCATATTGCACACTAACACAGATATTTTTATATAAACTTGTTCTTGGCATATGCTGAATACTTTTCAGCTCTTTTAATAATTTTAATTATTTGATAATTTTAATAATTTTAATTTCAGCTATTTGAATAATCTTAAACTTTATGAACAGTGTGAAGTAGAAACTGAGTATAGGAGATGCGCTCATGAATTTTATTCCCTGAAAAATGTCATAAAGTAATATAAAGTATTCAATGAGTATGTGAGTATTGAATAATTTTAACAAGAACTCTGAGTTCCCAGATACCTATGACAAAAGAACAAATTACTTGGAAGTCTCTTCTACTCCAGACCTTTCTGTCTATCCCCTTATTTAAAAAAATGTACATTGATTGTCCCTTATCCCATCAAGAGAGTGTTCTTTGCCAAGATAAACGCTAATTAGAGAAGTAATTGTGTTTATGTGTCAGTTGGCCACCAGTAGTTTGTAGATGTTACCTTTCCAGGTGACATGTTTACAATTTAATGAAGCCTCTGGAGATAGTATGCCTTAATCTAAAGGAATGGTTCTAATGATTAAAATTTGAGGCATTACTACATTTGTTTTCAGCAAATGGGCCTTTCTATTCCCTTAAAATCAAACCCTCATAACTATGGGTTTGCTGACAAAGGGAAACTAGTTTTTACTCTTATTATATGGAGATTTTAAATCTGCAGAGATGAAAATAATTTGCTGTTTCAGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCACTACTTTGGGAGGCTGTGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGCGAAACGCCATCTATACTAAATACAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGCTACCTGAGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTCCAGGAGGTGGAGATCACAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAGCGGGAGGGGAAATAATTTGCTGTTTCTTCCTTCCCTTCCTCAGAATGACTGATGGATACTCAGGAAGTGACCTAACAGCTTTGGCAAAAGATGCAGCACTGGGTCCTATCCGAGGTAGGTATACAAGAGCTTAAAACATTTAGAACTATTTATTATACCACCTTAGAAGTTTAAGAAGTCCAAAAAAATCTACCAAGAGATTTTTTTTTTCTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACAATCATAGTTCACTGCAGCCTCGAACCCCCCAGGCTCAGGTGATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGTAGACTGTGACCCCTGTTCTAGGCAAGAGGTTTCATTTCTTGATAGTAAGTAAGCAGCAGAAAACTCAAAAAGAAAACTTTAAACAAAAAAGAATAATGTAAGGAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTGGCTCTTTTCAGTATTCTGACATCATTTGAAATTAATGTGTCTAAAGGAAATTCTATAAGAGAAGTTTTCACTTTTTTAATTATATCTTTTGAGGGATTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAGGTTACTTGGTTGATTCTGAAATACCACGACCAATTCTTTTTAGGTTAGGTTAGGATAAACTCACACAGATATTTTCAGCTACATTTCCACAGCCAGCATCGGTAGTGGATGGTTGATGCTCTCAGGTATGCACTCAGATTATTAGCTATGATGATAAAGTAATCATAATAGCTCCATCCCTTTCTCTCATTCAAGAAAGTACAATTGAATGTAGTTGTACGAGAAAGATGTTATCATAGTGTCTACTGTAATTTGCATTAAAAGCCTACATTATACAAACCTTTTTGTTTTACTAGTTAAAAATTACCAGTAACACCTCCCGTAGTGAAATAGGGTGCTGATTAAGAACTGCTACTTTGCAAAATAAAAAATGTAATCTTGAGAGTATATTTTGAAACTCTGGATGAACAAATTTTCTTGCTGCTGGAGCTTAAATCTTGTTCAGTTAGTGGATTTAGAAACAGTAGCTAATGCATAAATGAGTTGTATTTTCTTAGAACGTTTTGGCTATTCTAAGGTAGACAAAATTTGGGTTTAAAAAAAGATTCGCATCCATTAAAGTACAGAAAATGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGTGTGGGCCTAATAGTTTGAGACTAGACTGGGCAACATAGGGAGATCCTGTCTCTACAAAAAAATATAATAAATTAACCAGGCCCGTTGGCATGAGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAAGTAGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAGGTGCAGGCAGCAGTGAGCCATGGTCATGCCACTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGGGTGACATAGTGAGGTGCTGTCTTAAAAAGTAAATAAATAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAATATGGTGAAACCGCATCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTGTGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGTATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAGGTTGCAGTAAGCCGAGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATACATAAAGTGCAGAGTAAAAACAAAAAAAGACTAATGCATTTTGTAAAGAACAAGTTGCATTCTTTTAAGTTCCCTTTCAAATTTGTGAACTATTGTTTTTGGGCAGTATGCAAGAAATTGAACACTTTCCAGTTATTCCAAAGAAGGAATATTCTCTTCTCAGC
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Task1_train_3362
Given a variant located on Chromosome 2 and affecting SPAST (spastin), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
ATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGTAGACTGTGACCCCTGTTCTAGGCAAGAGGTTTCATTTCTTGATAGTAAGTAAGCAGCAGAAAACTCAAAAAGAAAACTTTAAACAAAAAAGAATAATGTAAGGAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTGGCTCTTTTCAGTATTCTGACATCATTTGAAATTAATGTGTCTAAAGGAAATTCTATAAGAGAAGTTTTCACTTTTTTAATTATATCTTTTGAGGGATTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAGGTTACTTGGTTGATTCTGAAATACCACGACCAATTCTTTTTAGGTTAGGTTAGGATAAACTCACACAGATATTTTCAGCTACATTTCCACAGCCAGCATCGGTAGTGGATGGTTGATGCTCTCAGGTATGCACTCAGATTATTAGCTATGATGATAAAGTAATCATAATAGCTCCATCCCTTTCTCTCATTCAAGAAAGTACAATTGAATGTAGTTGTACGAGAAAGATGTTATCATAGTGTCTACTGTAATTTGCATTAAAAGCCTACATTATACAAACCTTTTTGTTTTACTAGTTAAAAATTACCAGTAACACCTCCCGTAGTGAAATAGGGTGCTGATTAAGAACTGCTACTTTGCAAAATAAAAAATGTAATCTTGAGAGTATATTTTGAAACTCTGGATGAACAAATTTTCTTGCTGCTGGAGCTTAAATCTTGTTCAGTTAGTGGATTTAGAAACAGTAGCTAATGCATAAATGAGTTGTATTTTCTTAGAACGTTTTGGCTATTCTAAGGTAGACAAAATTTGGGTTTAAAAAAAGATTCGCATCCATTAAAGTACAGAAAATGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGTGTGGGCCTAATAGTTTGAGACTAGACTGGGCAACATAGGGAGATCCTGTCTCTACAAAAAAATATAATAAATTAACCAGGCCCGTTGGCATGAGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAAGTAGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAGGTGCAGGCAGCAGTGAGCCATGGTCATGCCACTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGGGTGACATAGTGAGGTGCTGTCTTAAAAAGTAAATAAATAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAATATGGTGAAACCGCATCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTGTGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGTATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAGGTTGCAGTAAGCCGAGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATACATAAAGTGCAGAGTAAAAACAAAAAAAGACTAATGCATTTTGTAAAGAACAAGTTGCATTCTTTTAAGTTCCCTTTCAAATTTGTGAACTATTGTTTTTGGGCAGTATGCAAGAAATTGAACACTTTCCAGTTATTCCAAAGAAGGAATATTCTCTTCTCAGCATTTATAAATTGTATTTGCTCTCAAAGTTAACATGTGTCTCTTTTTTTTAATATAATGATTTGTACTGAATAGATACATGTAGATCATTGTACTTGGTTTTGCCCTTCAACAATTTCAACTGCAAAATGTATGTATTTTTAAGTGCCTGACTTTTATGTTTTACAGAACTAAAACCAGAACAGGTGAAGAATATGTCTGCCAGTGAGGTATAGTATTTTACAATGATATTTTCTTTGTCTTCTATATTGTAAGACATATATAAGACATACATATATGAATGTGTGTGTGTGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTGGCATGATATCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAAGCTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTACAGGCATGTACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGCATTTCACCATGTTGGCCAGTCTGGCCTCAGACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCAACTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCGCTGCATCTGGCTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCTGTCTCCTGATCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACACAGGGTCTTGCTCTGTTCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCGTGGCTGACTGTAGCCTTGACCTCTTGGTCTCAAGCAGTCCTCTTGTCTCAAACTTTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACAACGCCCCACTAATTTTTTAATTTTCTGTAGAGATGGTGTCTCTCCCTGTTGCCCAGGGTGGTCTCAGACTCTTGGCCTCAAGTAATCCTCCTGCCTCAGTCTCTCAGAGTGCTTGGGACTAATTTTTTTTAATGGATTTTTCTAGTTGATTAGAAGCTAGAAAAAATTAACTTTGCTTCATTTCAAAATATGGAAACCTATGAAATAGTCAAAATTTTTTTTGGTAATAGACAAAACATATATACATAAAGTCATTTTCTATCAAATCATATTACATAAATACCAAACAGAAGAAAATTACAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTATCAAAAATACAAAAAAATTAGGCCGGGGGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATGCTGGCTAACATGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAAATACAAAAAAATTACCGGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGCTGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTGGTCCTGGCTACTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACTTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCCCCATTGCACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACCCAGTCTCAAAAAAAAAAAAATTACATGAAACTTGTGGGGGTTTATACAATAAAAATAACCTATAACTATACGTTAATCCTTTAATAATGTTCTATTTTGTTTTTCAATAACCTTTATTTTTTTAATTAATTTCTTTTTTTTGAGAAGGACTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGCAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGCGTAGCTGAGATTACAGGCATGGGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT
ATTCTCCCACCCAGCCTTCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCATCATGCCCAGATAATTATTTTATTTTATTTCTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGGGCTCAAGTGAGCAGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTTAAAACCATTCTTAGCTCACAGATCATACAAAAACAGTCTATGAGCCAGTAGACTGTGACCCCTGTTCTAGGCAAGAGGTTTCATTTCTTGATAGTAAGTAAGCAGCAGAAAACTCAAAAAGAAAACTTTAAACAAAAAAGAATAATGTAAGGAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTGGCTCTTTTCAGTATTCTGACATCATTTGAAATTAATGTGTCTAAAGGAAATTCTATAAGAGAAGTTTTCACTTTTTTAATTATATCTTTTGAGGGATTGCAGCAAAATATTTATTGCTATGTTTTTATTCAGGTTACTTGGTTGATTCTGAAATACCACGACCAATTCTTTTTAGGTTAGGTTAGGATAAACTCACACAGATATTTTCAGCTACATTTCCACAGCCAGCATCGGTAGTGGATGGTTGATGCTCTCAGGTATGCACTCAGATTATTAGCTATGATGATAAAGTAATCATAATAGCTCCATCCCTTTCTCTCATTCAAGAAAGTACAATTGAATGTAGTTGTACGAGAAAGATGTTATCATAGTGTCTACTGTAATTTGCATTAAAAGCCTACATTATACAAACCTTTTTGTTTTACTAGTTAAAAATTACCAGTAACACCTCCCGTAGTGAAATAGGGTGCTGATTAAGAACTGCTACTTTGCAAAATAAAAAATGTAATCTTGAGAGTATATTTTGAAACTCTGGATGAACAAATTTTCTTGCTGCTGGAGCTTAAATCTTGTTCAGTTAGTGGATTTAGAAACAGTAGCTAATGCATAAATGAGTTGTATTTTCTTAGAACGTTTTGGCTATTCTAAGGTAGACAAAATTTGGGTTTAAAAAAAGATTCGCATCCATTAAAGTACAGAAAATGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGTGTGGGCCTAATAGTTTGAGACTAGACTGGGCAACATAGGGAGATCCTGTCTCTACAAAAAAATATAATAAATTAACCAGGCCCGTTGGCATGAGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAAGTAGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAGGTGCAGGCAGCAGTGAGCCATGGTCATGCCACTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGGGTGACATAGTGAGGTGCTGTCTTAAAAAGTAAATAAATAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAATATGGTGAAACCGCATCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTGTGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGTATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAGGTTGCAGTAAGCCGAGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATACATAAAGTGCAGAGTAAAAACAAAAAAAGACTAATGCATTTTGTAAAGAACAAGTTGCATTCTTTTAAGTTCCCTTTCAAATTTGTGAACTATTGTTTTTGGGCAGTATGCAAGAAATTGAACACTTTCCAGTTATTCCAAAGAAGGAATATTCTCTTCTCAGCATTTATAAATTGTATTTGCTCTCAAAGTTAACATGTGTCTCTTTTTTTTAATATAATGATTTGTACTGAATAGATACATGTAGATCATTGTACTTGGTTTTGCCCTTCAACAATTTCAACTGCAAAATGTATGTATTTTTAAGTGCCTGACTTTTATGTTTTACAGAACTAAAACCAGAACAGGTGAAGAATACGTCTGCCAGTGAGGTATAGTATTTTACAATGATATTTTCTTTGTCTTCTATATTGTAAGACATATATAAGACATACATATATGAATGTGTGTGTGTGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTGGCATGATATCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAAGCTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTACAGGCATGTACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGCATTTCACCATGTTGGCCAGTCTGGCCTCAGACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCAACTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCGCTGCATCTGGCTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCTGTCTCCTGATCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACACAGGGTCTTGCTCTGTTCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCGTGGCTGACTGTAGCCTTGACCTCTTGGTCTCAAGCAGTCCTCTTGTCTCAAACTTTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACAACGCCCCACTAATTTTTTAATTTTCTGTAGAGATGGTGTCTCTCCCTGTTGCCCAGGGTGGTCTCAGACTCTTGGCCTCAAGTAATCCTCCTGCCTCAGTCTCTCAGAGTGCTTGGGACTAATTTTTTTTAATGGATTTTTCTAGTTGATTAGAAGCTAGAAAAAATTAACTTTGCTTCATTTCAAAATATGGAAACCTATGAAATAGTCAAAATTTTTTTTGGTAATAGACAAAACATATATACATAAAGTCATTTTCTATCAAATCATATTACATAAATACCAAACAGAAGAAAATTACAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTATCAAAAATACAAAAAAATTAGGCCGGGGGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATGCTGGCTAACATGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAAATACAAAAAAATTACCGGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGCTGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTGGTCCTGGCTACTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACTTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCCCCATTGCACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACCCAGTCTCAAAAAAAAAAAAATTACATGAAACTTGTGGGGGTTTATACAATAAAAATAACCTATAACTATACGTTAATCCTTTAATAATGTTCTATTTTGTTTTTCAATAACCTTTATTTTTTTAATTAATTTCTTTTTTTTGAGAAGGACTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGCAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGCGTAGCTGAGATTACAGGCATGGGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT
Task1_train_3363
A variant on Chromosome 2 in gene SPAST (spastin) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 4
CATTGGATCCCTTGAGCTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGATAACATGGTGAAATCCTCATCTCTACAAAAATTACAAAAAGTTAGCTGGGCGTGGTGGCGCACACCTATAGTCCTAGCTACTTGGGAGGATCTCTTAAGCCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAAAAATATTAATTTCTATAACAAATAAATTTTATTTAGTAATATCATGTTTAATACCCATGTTACATTCATTATTCTTCTACACTTTGGCCTTTAGGAAGAGGCAGTGTGTGTGTTACAGTTAAATAGGAAACAAGTAGGGTTCATATAGTGCTTATGGGGTTTTCTTTGGTGGGGGGTTGCTGGGTTTTTGGGGTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTATCACTCTGTCTCCCAGGCTGAAATACATTGGCATGCTCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGACTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCCTAGTAGCTGAGACTACAGGCGTGCGCCACCATGCCTAGCTAAATTTTGTACATTTTGTAGAGATGAGGCTTTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCACTTGCTTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTAACAGGTGCGAGCCACTGCAGCCAGCCTATATTTTAACTATATGTTTTTTTCTTTTTGGCTAAAATTTTTCAGATTAGTTTACAAGTTACAAGTGTAGGTGATATCTCATGGAGATATCAAAGATGATATGAAGTTAGATTGGGTTTTTAAGAGTAGTTTTTAAAATACGGATAAATACCAGTTGTTGGAGTTTTGTTTAAAGTTCTTTAACTTCTTATTTTTGGGCCAAAATACAGGTATACGCTAGAAATGATTTTTAACACAGGTCATTTATGCCAAACTGCATTTTGCCTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTCACTCATTGCCCAAGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCACTTACAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCTTGGCCAAAATTTTTATTAATTTTTCTATTGCCTGGACTCTGTGAACCTATCCATTTTGCCTTTTAAAAATACTTAGGTGTAAATATAGATATTCATTAACTCAGCATTGTTTTAATCTATATTTCCAAAGGCAATTTAAAAGATCAGAAAATAAGACCAAATTAATATAAAAATGCATACTTTAGGCTGGGCAAAGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAGGACCAACCTGGCCATCATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGAGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGAAGAATTGCTTGAACCTTGGAGGGGGAGGTTGCATATCTGAGTGGTGAAATTGTGATTCTTTTTTTCTCTTTGTCTGTATTTTTGAACTTTTCTATAAATGATTGTGTTTTGTTTTTATATTGGAAAAATATTATGCTTTCAAATGTTAATACCTATGAAACTAAACACAAGTAATAAATATATTAGTATAGCATTTATTAAGGTTTCTTGTGTAGCAGATCAACATAGAAAATATATTTAAATGGCTGACATAATTTTCTAAGAATACATACACGTATATTTTTTATAACATTAAGAAACAGCAGCATCATTACTTTAATCCATCATTTCGTTAACCACCATATACCTGTTGATCATTTGTATTGTCATGTGCTTTTTAAAAATCTAGATGAGAAATATTCGATTATCTGACTTCACTGAATCCTTGAAAAAAATAAAACGCAGCGTCAGCCCTCAAACTTTAGAAGCGTACATACGTTGGAACAAGGACTTTGGAGATACCACTGTTTAAGGAAATACCTTTGTAAACCTGCAGAACATTTTACTTAAAAGAGGAAACACAAGATCTTCAATGAACGTCATCGGCTACAGAAACAGCCTAAGTTTACAGGACTTTTTAGAGTCTTACATATTTGTGCACCAAACTTGAAGATGAACCAGAAAACAGACTTAAACAAAATATACAATGCAAATGTAATTTTTTGTTGTTTAAGGCCTTGCCTTGATGGTCACAGTTATCCCAATGGACACTAAGTTAGAGCACAACAAAACCTGATTCTGGTCTTCTTTACCAATATAATCATAATGTAAATAATAATTTGTATATTGTGTTGCAGATGAAAGTATTCCAGGAACAGTGAATGGTAGAAGACACAAGAACATTTGTTTGTTTGTCTTCTGATGTTTTTTCTTAAAATAGTAATTTCTCCTACTTTTCTTTTCTACTGTTGTCTTAACTACAGGTGATTGGAATGCCAAACACTCTTAAGTTTATTTTCTTTTTTCGTTTTATAAATTCAGTGTGCCAAATGAAACTTTTTTCCTAAGTAACTGTAATAGGAAAAAGTTTATTTTGAGAGTTTCTTCTTCATAAATCTACAGACATTAAACAATTGTTGTGTTCTTTTTACCTTTTATTTTTCTATTACCTTGCTACCAAACAGTTTAGATAGCAATATAATAGCAAAAAAGCAAATATGGTAAAATAGAGAAGGTTTGAAGGTTTGAGTTACTCTGTCATATAACATGTAGATCAGTCTTCATGTGACCTGCAGTATTTTTTTTTCTAATGTATTTGTCAGAAATCTGTTGTAGACTGTTAACTTCTTCCTGATGGAATTTATTTTCTGCAAGAATTATTCTGATATTTAAGAGAGCCAATTTTAACTGCTGTGAAAATGTTTCCAGTGCAAGAGAAGGGAAATACTAGGAACTAAGACATTTCTAATTTATTGCTTATTACTTTCTTAATTTTACAGGATAATTATAAGCAAGTGGAACTACCATCTTTTATTCTTAATAATTATTAATCCCTTCAATGAAACTTTAAAAAAACTGAATTTTTATACATGGCATACATTTTTCTAGTTCCTTCTGCTTGCTTTATTAACTCAAAAGTTCTAGTTCTAGTCTGTTGATCTGCCTTTTGTTCTCCCAAAATGTACAGTAATTCCATTTGTTTGTATAAATATGCCTGGATTTTCATTATAAAAATGTCATTGTAGGGAGTAGAGACTCATATCATGGCCTTTTAAATATTGTAATAAAGGCAAATAGATATTTGCCCTTAGTTTACTGGTTAAAAGTTTGTTTACAGAACTTTTCTCTGGTGCTTAAATGATGCTATGTAAAATGTCATGAGTGGAAAGAATATTTGTAGTAGTAACAAGAATTTTTCATTTAGGAAAGATTTCTTAGGTTTTGAAAGAATACATTAAAATAAAAAACTTGCCCCTACTAGGTAAGAACTTTATAATGAAGACATACATTCTTCTTAATTTTACTCTTGCTCTTGTTAAAGATTTGTTTGAATATAGAAGATGCATGATTTCTGGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGACTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACTACCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACTGCGCCCAGCCAGAAGATGCATGATTTCTTAGGATCATATGCTGTTTGTAGCCATAAGGTAAATCATGTCTCTTCCAATCATGACTTTGGAACTCCCTGAATAATAAAA
CATTGGATCCCTTGAGCTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGATAACATGGTGAAATCCTCATCTCTACAAAAATTACAAAAAGTTAGCTGGGCGTGGTGGCGCACACCTATAGTCCTAGCTACTTGGGAGGATCTCTTAAGCCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAAAAATATTAATTTCTATAACAAATAAATTTTATTTAGTAATATCATGTTTAATACCCATGTTACATTCATTATTCTTCTACACTTTGGCCTTTAGGAAGAGGCAGTGTGTGTGTTACAGTTAAATAGGAAACAAGTAGGGTTCATATAGTGCTTATGGGGTTTTCTTTGGTGGGGGGTTGCTGGGTTTTTGGGGTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTATCACTCTGTCTCCCAGGCTGAAATACATTGGCATGCTCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGACTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCCTAGTAGCTGAGACTACAGGCGTGCGCCACCATGCCTAGCTAAATTTTGTACATTTTGTAGAGATGAGGCTTTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCACTTGCTTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTAACAGGTGCGAGCCACTGCAGCCAGCCTATATTTTAACTATATGTTTTTTTCTTTTTGGCTAAAATTTTTCAGATTAGTTTACAAGTTACAAGTGTAGGTGATATCTCATGGAGATATCAAAGATGATATGAAGTTAGATTGGGTTTTTAAGAGTAGTTTTTAAAATACGGATAAATACCAGTTGTTGGAGTTTTGTTTAAAGTTCTTTAACTTCTTATTTTTGGGCCAAAATACAGGTATACGCTAGAAATGATTTTTAACACAGGTCATTTATGCCAAACTGCATTTTGCCTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTCACTCATTGCCCAAGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCACTTACAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCTTGGCCAAAATTTTTATTAATTTTTCTATTGCCTGGACTCTGTGAACCTATCCATTTTGCCTTTTAAAAATACTTAGGTGTAAATATAGATATTCATTAACTCAGCATTGTTTTAATCTATATTTCCAAAGGCAATTTAAAAGATCAGAAAATAAGACCAAATTAATATAAAAATGCATACTTTAGGCTGGGCAAAGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAGGACCAACCTGGCCATCATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGAGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGAAGAATTGCTTGAACCTTGGAGGGGGAGGTTGCATATCTGAGTGGTGAAATTGTGATTCTTTTTTTCTCTTTGTCTGTATTTTTGAACTTTTCTATAAATGATTGTGTTTTGTTTTTATATTGGAAAAATATTATGCTTTCAAATGTTAATACCTATGAAACTAAACACAAGTAATAAATATATTAGTATAGCATTTATTAAGGTTTCTTGTGTAGCAGATCAACATAGAAAATATATTTAAATGGCTGACATAATTTTCTAAGAATACATACACGTATATTTTTTATAACATTAAGAAACAGCAGCATCATTACTTTAATCCATCATTTCGTTAACCACCATATACCTGTTGATCATTTGTATTGTCATGTGCTTTTTAAAAATCTAGATGAGAAATATTCCATTATCTGACTTCACTGAATCCTTGAAAAAAATAAAACGCAGCGTCAGCCCTCAAACTTTAGAAGCGTACATACGTTGGAACAAGGACTTTGGAGATACCACTGTTTAAGGAAATACCTTTGTAAACCTGCAGAACATTTTACTTAAAAGAGGAAACACAAGATCTTCAATGAACGTCATCGGCTACAGAAACAGCCTAAGTTTACAGGACTTTTTAGAGTCTTACATATTTGTGCACCAAACTTGAAGATGAACCAGAAAACAGACTTAAACAAAATATACAATGCAAATGTAATTTTTTGTTGTTTAAGGCCTTGCCTTGATGGTCACAGTTATCCCAATGGACACTAAGTTAGAGCACAACAAAACCTGATTCTGGTCTTCTTTACCAATATAATCATAATGTAAATAATAATTTGTATATTGTGTTGCAGATGAAAGTATTCCAGGAACAGTGAATGGTAGAAGACACAAGAACATTTGTTTGTTTGTCTTCTGATGTTTTTTCTTAAAATAGTAATTTCTCCTACTTTTCTTTTCTACTGTTGTCTTAACTACAGGTGATTGGAATGCCAAACACTCTTAAGTTTATTTTCTTTTTTCGTTTTATAAATTCAGTGTGCCAAATGAAACTTTTTTCCTAAGTAACTGTAATAGGAAAAAGTTTATTTTGAGAGTTTCTTCTTCATAAATCTACAGACATTAAACAATTGTTGTGTTCTTTTTACCTTTTATTTTTCTATTACCTTGCTACCAAACAGTTTAGATAGCAATATAATAGCAAAAAAGCAAATATGGTAAAATAGAGAAGGTTTGAAGGTTTGAGTTACTCTGTCATATAACATGTAGATCAGTCTTCATGTGACCTGCAGTATTTTTTTTTCTAATGTATTTGTCAGAAATCTGTTGTAGACTGTTAACTTCTTCCTGATGGAATTTATTTTCTGCAAGAATTATTCTGATATTTAAGAGAGCCAATTTTAACTGCTGTGAAAATGTTTCCAGTGCAAGAGAAGGGAAATACTAGGAACTAAGACATTTCTAATTTATTGCTTATTACTTTCTTAATTTTACAGGATAATTATAAGCAAGTGGAACTACCATCTTTTATTCTTAATAATTATTAATCCCTTCAATGAAACTTTAAAAAAACTGAATTTTTATACATGGCATACATTTTTCTAGTTCCTTCTGCTTGCTTTATTAACTCAAAAGTTCTAGTTCTAGTCTGTTGATCTGCCTTTTGTTCTCCCAAAATGTACAGTAATTCCATTTGTTTGTATAAATATGCCTGGATTTTCATTATAAAAATGTCATTGTAGGGAGTAGAGACTCATATCATGGCCTTTTAAATATTGTAATAAAGGCAAATAGATATTTGCCCTTAGTTTACTGGTTAAAAGTTTGTTTACAGAACTTTTCTCTGGTGCTTAAATGATGCTATGTAAAATGTCATGAGTGGAAAGAATATTTGTAGTAGTAACAAGAATTTTTCATTTAGGAAAGATTTCTTAGGTTTTGAAAGAATACATTAAAATAAAAAACTTGCCCCTACTAGGTAAGAACTTTATAATGAAGACATACATTCTTCTTAATTTTACTCTTGCTCTTGTTAAAGATTTGTTTGAATATAGAAGATGCATGATTTCTGGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGACTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACTACCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACTGCGCCCAGCCAGAAGATGCATGATTTCTTAGGATCATATGCTGTTTGTAGCCATAAGGTAAATCATGTCTCTTCCAATCATGACTTTGGAACTCCCTGAATAATAAAA
Task1_train_3364
Assess the clinical impact of this variant on gene NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Familial cold autoinflammatory syndrome 4
AGGCAAAGGCTAAGTCATTCAGCTCTACGCTTAAAGAATAAACTGTCCTAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACAGTTTGGAAGGTGGAGGCAGTAGAACTGCTTGATCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGAAACATAGTGAGACCTCATCTCCCCATAAAAAATCAAACAATGAGGATCAACTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCTGTGATCGCACCACTGCACTCCCACCTGGGTGACAGAGCAAGACCCAACCTCGAAAAAAAAAAAAAATTTAAAAAGAATAAACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCA
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Task1_train_3365
Here is a genetic alteration in NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Periodic fever-infantile enterocolitis-autoinflammatory syndrome
AGGCAAAGGCTAAGTCATTCAGCTCTACGCTTAAAGAATAAACTGTCCTAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACAGTTTGGAAGGTGGAGGCAGTAGAACTGCTTGATCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGAAACATAGTGAGACCTCATCTCCCCATAAAAAATCAAACAATGAGGATCAACTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCTGTGATCGCACCACTGCACTCCCACCTGGGTGACAGAGCAAGACCCAACCTCGAAAAAAAAAAAAAATTTAAAAAGAATAAACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCA
AGGCAAAGGCTAAGTCATTCAGCTCTACGCTTAAAGAATAAACTGTCCTAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACAGTTTGGAAGGTGGAGGCAGTAGAACTGCTTGATCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGAAACATAGTGAGACCTCATCTCCCCATAAAAAATCAAACAATGAGGATCAACTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCTGTGATCGCACCACTGCACTCCCACCTGGGTGACAGAGCAAGACCCAACCTCGAAAAAAAAAAAAAATTTAAAAAGAATAAACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGGGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCA
Task1_train_3366
The gene NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4), on Chromosome 2, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Familial cold autoinflammatory syndrome 4
AACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGG
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Task1_train_3367
A mutation in NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Periodic fever-infantile enterocolitis-autoinflammatory syndrome
AACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGG
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Task1_train_3368
The gene NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Syndrome of entercolitis and autoinflmmation caused by mutation of NLRC4 (SCAN4)
AACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGG
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Task1_train_3369
Here is a mutation in NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Periodic fever-infantile enterocolitis-autoinflammatory syndrome
ACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGC
ACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCAAAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGC
Task1_train_3370
The gene NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Periodic fever-infantile enterocolitis-autoinflammatory syndrome
ACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGC
ACTCTGTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCAGAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGC
Task1_train_3371
A mutation on Chromosome 2 affecting NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Familial cold autoinflammatory syndrome 4
GTCGTAACTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTG
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Task1_train_3372
This mutation is located in gene NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4) on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Familial cold autoinflammatory syndrome 4
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CTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGACTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCC
Task1_train_3373
The gene NLRC4 (NLR family CARD domain containing 4) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Periodic fever-infantile enterocolitis-autoinflammatory syndrome
CTGCCACAGATTTTTCTTCTTTGGTAGCTAAACAAGCATTGGTCTCAAGATAAGCAATATTGATAGTTGTGAATATTAAACAATTCGCAACTCATCCAGCTCACAAATGCTAACAATCCCTGTTCCATCTGCCATAACTACAGCTTTGATTGGAGAAGAGAGTGATTTCAGTAACTTTCTCCTGATCAGAGGACCACCAACCACAGACTGGTTCTGGCTGGTTTACAGAGATTGCGTACCTGCTTACCTTTGTGCTCTGAAAAGAACTTCTGAAGTATAGGCCTAATTGTAATACATTTAAATCATTTAAAGGGGTGTACAATCTTTTGGTTTCCCTGGGCCACATTGGAAGAATTGTCTTGGGCTACACAAAAATGAATTTGTGCTGGGCCACATTCAAAGCCGTCTTGGGCTATGTGCAGCCCACGGACTGCAGGTTGGATAAGCTTGATTTAATGCTAAATCTCCACCCCAAAGTGAACATGGGTTGTATGTTACATGCATGTTTATTCAATATGCATGTATCAAGACCACCTTCATGAATATTCATAGCTCCTCCTGTAATCTGTTGAATATGTATGTTTAGCCAACCCATTCAACATAAAGTGTCTACCCCAACCCCTCCTTCGAGGTGCCTGTCTCTGGTCTTGGTTGGAGGCATGTTTCTCAGCCTGTGGGATGGCCACCTTGCAGGCTGTAACCCTTTAGAAGAAATAAAGTCTCCTCTCTCCTTTTCCAAATTTATACACTGTTATTTTTTTTTAAGTGAACAAAGCACAAACCACTGATATTTACAATACCCGGCAGCCGTTGATTCTGTAGGTCATGAATACTCAAGGTTTTCAGGTTTGTTACAGATGTGATGTGCCTCTCATCTTCTATGGTGAGGGGACTGGCTTCCACCATGAGAGAATAAATGTTCTTACAGGTGCTGAGGACCAAACTGAGGCTTCCAGCCACACCAGCACATCTCTTTATTTGCAGCCTGAGGCTTGTGGCAGAGCTGAATATTTTCCCCAGATATCTGATATCTTGCTTATTCAACTTGCTGAAATCCCGGAGTGTGACCTCCAGAGTCCTGAATTCCTGCTTCCAGTTGAAGAACAAAGATACAGCCCTGCTGGGAATGTAGGTTTCTGGGGCCTCTTCCATGTGGATTCCACCTGTGTCTTCTGCAGCCTTTTCCCATGAAGCCATAGCTCCCCCATAAAAGTCCAGTTTAATGAAGTCCAGGGCACTTGCACAATTGGGCAAATGTTCAAAGAAGTCAAATAAGTAATCGGGGATGTTCCCTGAGTTGATATATAAGCTTTTACCTTGAAAGAAAGCTTCAAATTCTTGGCTCAGGGCTGATTTGGATGTACTCTCTTGATATAAATGGATGCCACACTCTACAAAGGAATTGATGTTTATGGCTTTCAGAATTTCTTGCTCAGTGGTGTTTTTCACACTTTGCAAAGATTCCTGTCTCCAGAGAGGCCTCTTGGCGATGGAAAGTCCGAGAAGGCAGCCGTGTTGATACACTGCTGCGAGGTGCTTCATAACAGCCCTGGTGGCTTCCACAGATGACCCACAGGTGTACCGGAGCAGGCTGCTATAAGTGGATGTAATGTCCGAAATGGAAACCATTTTCTGCAAGTAACCATTCCCCTTGGTCACCTCCTCTGGCTCATGAGACGTCAATAAACTGCTGAGTCTTCGTCCTGCTGTGTACTCCTGGAATGACTTGTGAAAGAATTTATACTTTGGCTTGAACCTTTGAGCTGTATATTTACAGAGGAGCCCAGTTGTCAGCAGGACATCCTCATTCACGCTGGACACATCCTGCAGTTCGAAATCAAACTTGTGGGAGAACACACCCTCCAGAGCTAGGTCTCCACAGTGGTCCAGGCTCCGAATGAAGTCACTTGCAGCCACACCTTTATGTTTGTGTTTGTTTTTCTGTATCAACAGATCATAGAAGGTATGGAACAGCGTTGTTTGTGTGTGAGAGTGGAACTCACTTTCACCCATCTGGATTGCACAAGTGATGACCACAAAGAGAGGGGTCTTCATGAGATTCCTCAAGCACCTGGATTTCTGAATTTGGAGCAACAAGCCTTCAGCAAGCTCCTTGATCAGCACTTCTCGGATGAGAGCCTGGGCGCTGTCTTCTGTCATATCCCCCACCTCAGCAGTCAGGGCACCAAACTGCCGTATGTGCCTCAGGCACTCAGTGGTAGTGGTGACGATGACCATGTTCTTGAAGCGGTGGTTTTCCTTTATCAGGGCTTCGATTTCTGGGCAGTTCTGGGGCTTGAATTCATTGTAGCCATCAAGAAGGAAAAGAACCCTCTGCCGCAGCTTCAGCAGCATGGCCATGAATGTCTGCTTCCTGATTGTGCCAGGTATATCCAGGAGTTGATCACAGAGGGTTTCAAAAAGTCCACCCTGGGCCCTGCTGAGACGGAGGAAGAAGACGAATTTGAACTTGGTCAGAGCCTTGCACTTTCCGGAGCCCCAGAGCATGGCAATTCGCTGCAGCAGAGTGGACTTGCCTTTGCCAGATTCCCCTTCAATGATGCAGGGGCTCTGAAGAGCCTGCAGGAGGCCATTCAGGGTCAGCTGCTCCACGCGGTGATGGTGTTGGTCCTTCCTCCACAGGACAGGTTCTGTGAAGGTGCTTTTCAAGTTAAAAATAATGTCAATATCTTCACCAAGGGGATAAAAGTTCAGAAAAGATGGGGTATGGTACAAGTCCTTTAAATCCTGAGCCAAATCGTCCAAGTCTCCTTCTGATGTCTGATGAAAAAGACCTATTAGAGAAGAGGTGATGTTAAAGAAGACCCAATTCTGTGTCTCCTCAAAACCTAGAGTTCAGGAGGATGAACGGGGGGGTGAGGCTGAGAATCTGCCATTGGTGAATGTAATGTCCTTTCCCAGTTCTGAGCTGGCACAAAGGGTTCTGTCTGCTCCCCCTTTCCCCAGCATCCTTTACCCCACTCCCCTTTTTGCTTTCTGTTTCCTCCTTTCCACAACCAAATCTTATAGCAGCTGGTTGGAAAAGGGAGGAGCTTGTTTTTGGGTTAAGGAAAGTAAAGAATTTGGCAGAGAAAGATGGTTAGGGATAATTGTCATCATAGTAGGCCTTCACTCTGAGTAAAATCTGTCATGACCTTATTTACTAATTAAAAAAATAAAAACAATATTTTATGAAACATAGAATCATGGTTCTGTGTCAGTCAGGCTGTCTTTACCAGGAGGCCTGGACATGGAGTAGGTAGTCAGCTGGGCCTCTCTCCCATAGGTAGATCTCATCCAACCAGGGAATGCTGAGAACCACTGCTGCACTGGAAGCTTAACTAGTGCACTTATTCTCCAGTTTTATCTTGCAGTGAGACAATACTCAATCATTTATTTCCTGGCCTTGGGGTTATTTGTTTGGCTTCACCATCAATTGATCTACTATGAGTTTTTCCTAAAATCATCTAAGCTTTTCCTTAGCAGGTATCAAAGGCCACTGCCAGGTGATATGAAGAGAAGGAAAAGCAGAGGCTCTGCCATGGGGAAGATGGATCTTTGTTGTGGTCTATTCTACTTGCAGAAACAGATGCAAAACTAACTGATACTTACTTTGTCCATTCAAGTCCTGAAATAGAGGATAGTTCCACTCCTTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTACAGGACTCTGAACCCTTTTTCAAAATCATGTGAATGATCCCTCTAGCAGCATCCTGCTCCACCTTCTCGCAGCAAATGATGTTTACTTCTTCGCGATTCAGAACATTCCATACAAATAGGTCATCTGTGATTTGCTTTATAACAGTCATTCCCATTCTTTGAATAAGGGCTCGGCTATTGTCCTTTATGAAATTCACTGAGGAGATGGGGAGAAATATACATATTTATTTACTTATATAAAATGTGCATATCCGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCC
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Task1_train_3374
Consider this mutation in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Glaucoma 3A
AGAATGAGTGGGAAAATGTTTAACCATCTTTCCTTCTTTTCAGTGTTTCTCTCTTTTCTCTTACCATCCCCCCACCCCACACACACATACACACAACTATCAAAAACTCCCTTTTTTAAAATTTTGGTACAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAA
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Task1_train_3375
This sequence change occurs on Chromosome 2, altering CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
TTCTCTTACCATCCCCCCACCCCACACACACATACACACAACTATCAAAAACTCCCTTTTTTAAAATTTTGGTACAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTC
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Task1_train_3376
With a mutation on Chromosome 2 in gene CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Primary congenital glaucoma
TTCTCTTACCATCCCCCCACCCCACACACACATACACACAACTATCAAAAACTCCCTTTTTTAAAATTTTGGTACAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTC
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Task1_train_3377
A mutation in CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Congenital glaucoma
TTCTCTTACCATCCCCCCACCCCACACACACATACACACAACTATCAAAAACTCCCTTTTTTAAAATTTTGGTACAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTC
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Task1_train_3378
Gene CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
TTCTCTTACCATCCCCCCACCCCACACACACATACACACAACTATCAAAAACTCCCTTTTTTAAAATTTTGGTACAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTC
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Task1_train_3379
A genetic alteration is present in CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Glaucoma 3A
TTCTCTTACCATCCCCCCACCCCACACACACATACACACAACTATCAAAAACTCCCTTTTTTAAAATTTTGGTACAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTC
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Task1_train_3380
This genomic variant is located on Chromosome 2, within the CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Glaucoma 3A
TTCTCTTACCATCCCCCCACCCCACACACACATACACACAACTATCAAAAACTCCCTTTTTTAAAATTTTGGTACAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTC
TTCTCTTACCATCCCCCCACCCCACACACACATACACACAACTATCAAAAACTCCCTTTTTTAAAATTTTGGTACAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCACCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTC
Task1_train_3381
A mutation in CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Congenital glaucoma
CAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTC
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Task1_train_3382
A genomic change on Chromosome 2 affects CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
CAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTC
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Task1_train_3383
A mutation in CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Glaucoma 3A
CAAAGATTCCAAAAAGCTTAATAAAATGTAATAAGCACTTAGCACTTAGGACACTGTAGAACTTTCTTTGGAAGTTTAATTGCAATGAACTTTAAAACTTGAAACTTCAATTCACTTTTCTAAATGTGAATGCATACATTTCATTTGAGCTTTATGCTTTCCCAGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTC
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Task1_train_3384
A mutation found in CYP1B1, LOC128772254 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1| melanoma risk locus-associated MPRA allelic enhancer 2:38298139) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
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Task1_train_3385
Consider a variant on Chromosome 2 in gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Congenital glaucoma
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Task1_train_3386
Given this variant in gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
AGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATA
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Task1_train_3387
Mutation context: Chromosome 2, Gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Primary congenital glaucoma
AGCTACCAAAGTAATTGCCATCTTAAAAAACACAACTGACCTCATCTCCACTGTCTTTTCCAAACAGCTTCCAAGACTATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATA
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Task1_train_3388
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Glaucoma 3A
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Task1_train_3389
A variant was discovered in gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
ATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAG
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Task1_train_3390
Here is a mutation in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Primary congenital glaucoma
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Task1_train_3391
This alteration in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Congenital glaucoma
ATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAG
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Task1_train_3392
A variant on Chromosome 2 in gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Glaucoma 3A
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Task1_train_3393
This variant affects gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
ATCTTCTGATTCTGACTTTCCAAAAAGCAGGCATTAATGTTAACTTTCAAAAAATCATCTAGAAGAGAAACTTGGTCAGTTGTAATGGGAGTTCTGTCCCCAACTCTTGTCACCTCGTAAAAAGAACATCCAGGTAATTCATGGCATTTTCCATTATTCATTGGGCAGACACAGCTTAGATTTCTCTGCCTTCCACAGGAGAATGTTCAGATTTCCACTAACTTCAACTGGAACTCAATAATCAGAATGGCTTTAAAATTTAGTTAAAATTTAAGCATGCCATGAATTTGGAATTTTAATATATTAATTAGGTTATTTTCAAAACAAGATTCTGTATTATAAATAGAATTTCAATAAAGATGTTATAAAAATAAGAACACATCTTAGGATCTAATTTTGAGATTCGCCAAAATTTGAGTGAAGAAAAGAAACCCTGCTTCATTTCCATGTCAAAAATAGGTGGTTGATTTAATCAAGCTCATTTTTAGCACACTTGGTTGCGTTAGTTGTACTTTTCAATTTTCAATATTATACAAGGCATATATTATTCAACCTTTTCCTGAACAAGATAATACTAATATACTGCTTACGGACAGTTAAGTAATATATTTCACACTATTTGGTGACTTTTTTTTTTAACCTATGAGACTTACTGAAATCAGTACATTATGGTCACATAATTTAAAGCTTGGCTGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGCTGATAATTCAAATTCTGTACTTTGGCAAGCAAAAGAGGTACAACATCACCTTGGAGTTTTACAATTTAATAATGCATACTTTAAAATTCATGATAACTCATGGAACCCCACTATACTCACTAATTCAACTATTGATTTCTTTTTGAGCAACTGACTTTATGATTTATCCTTAAAAGTAAGGAAGTATACCAGAAGGCAAAAGGATAAATCCACCCATAAATACTAGAGTCTAAGTTATTTTCCTGAAAAGGTGAAAAGGGAATTTCTGGTCTTTATCTTTTCCCTTATCACCTTCAATCACACACTTTACACTGAAATTACTTGTCTCTGTCTCTTCAACAATATACTCTGAAACTTTGTTTAATATACTTTTTGTCTATTTCTGCATATGGGAGACCAATCTTGGATTCCCACCAAAAATGGCCTGGTTACCAAAATACTGCTTCATTCAGTAGTTTGGTGTAAGTGTTTGGGTGTATGTGTCTATATGTGCATTTTAACTCCAAAGAATGCTACCTTCAGAAATAACCAAGATGCAGTATGTATATAATAATTCATTGGGCCCTTTAAGTCTTTGACTCAAAAAAATCTCCCAGAAGCTCCTGCATAGCCCACTACTCATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTTATGCTCACCTTAAACGCTAATTGAGAAGCAGCACAAAAGAGGAACTGGAAAAAAACTGAATTTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTTCTAAAATTTCAGCTTGCCTCTTGCTTCTTATTGGCAAGTTTCCTTGGCTTGTAAATTTTGGACAGCACTATCAAGGAGCTCCATGGACTCTCTGAGAGTGACATTGACTTTAAATGACTTGGGTTTAATGGTTAGACCATAACTGAAATTCATTTTCGCAGGCTCATTTGGGTTGGCCCTGAAATCGCACTGGTGAGCCAGGATGGAGATGAAGAGAAAAAGCTGCATCTTAGAAAGTTCTTCGCCAATGCACCGCCTTTTGCCCACTGAAAAAATCATCACTCTGCTGGTCAGGTCCTTGTTGATGAGGCCATCCTTGTCCAAGAATCGAGCTGGATCAAAGTTCTCCGGGTTAGGCCACTTCAGTGGGTCATGATTCACAGACCACTGGTTGACAAAAACCACAGTGTCCTTGGGAATGTGGTAGCCCAAGACAGAGGTGTTGGCAGTGGTGGCATGAGGAATAGTGACAGGCACAAAGCTGGAGAAGCGCATGGCTTCATAAAGGAAGGCCAGGACATAGGGCAGGTTGGGCTGGTCACCCATACAAGGCAGACGGTCCCTCCCCACGACCTGATCCAATTCTGCCTGCACTCGAGTCTGCACATCAGGATACCTGTTTGGTGTTTAATGTGGAGAGAGAAAAGCAAGTGAGCAAAATTCTTATTTCATCTAGAAAGCACATTATAATTTATTTTAATTCCACTTTTTCTTAAATAGGCTATCTAGCTCAGTGACTAAATTAATATTTCTGGGAAAAAAATCTAAAACAGCTTCCTAATTTCTCACTAAATTACAAGATGGACTTTAAGAATTATATTTCCTGTAATAGGCCTTGCATGACTAATGCTGTCTTTCCCATTATAAGTCAAAAAACTCTTAAGTTTTCCCAGCCTCAAAAAGCACAATAGTAGATAAGGCTGACTTTTCCATTGGGTACCGCAGGGACAGTGCCTAGGGCTCACAACACTTTTTAGGGGCCCATGAAAATATTTTTACGTCTTTTACAATCTTCAGACCTAAAAAAACTCACTTTTAGTTAGAAGAAAATATTTTCATACATCATTTTAATGCATTCATCTTTATATCAGGGTAGTCATGAAATTTAATTTTTAATTTTTTTATAGTATAAGGAATCTACAAAGGCAAAAGCACCCAGGGCCCACGAAAGTTACAATGTGAAAGTAAATTTTTTTTCTCCCTCATTTCCCTGGACAATTCCAACAGACATGCTGTTCTCATTTTATACAAAGATAATTGGTGTCCTGATGGATAAAGCTACATACTGTATTTTTTAAATTTGAAAGCAAATACCCAATGTTCATAAAATTATGGTACAAACTGTAGTACTTATTCACTGTTGATGATACAAACTGATACAATCTTTTTAAAAAACAAAATCTTAATACGAGGCAAGAGACATGAAGGTAACCTCTTCCCGCCTCATTTTAAACCCAGTAATCCATGCCTAGAAATGTATTTTCAGAAAATAATTTAAGAGATACAAAAATATGTAACCACAACAGGACCTAAAATTCTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTACACGCCTGTAGCCCCAGCTACCTGCCAGACAGCGGCGGGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGGGACCAGCCTGGGTAAGGTAGTGAGACCCTGTCTCTAAGGTAAGTAAATACATAAAATTAAAATAAAAATTTTAAAAATGCAATCAAGGCCAATGACCAACATTAAAGTTCAATAAATGATTATATATAACTATACATTATCATAGCAAAATACTATATAGCCATCAAAAATTACCAAAATAAATATTAAAAGATTAGAAATGTCCACTACCTTGAGTCAAAGTGTTAGAAGTCAAAAAACAAGTAACTGATTGTTTGCAACTCCGAAAAAAAATGTATACACGTATGTGATGAAGTGGAGTTATTTTTAGAATCGCTTCTTCAACATTATATTGCAGGAGTCTGCCAACTTTTTTCATAGAAACATGTATGGTGGGGAGAGCCAGAGAGTATCTATTTTAGACTTTGTGGACCAAACCCTCTTTGTTGCACTACTCTGCTCTGCCTTGTGTTGTAGAGTGAACGCAGCCATCGACAATGTATAAATGAATGGGCATGACTGCGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAG
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Task1_train_3394
This alteration in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
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Task1_train_3395
A change on Chromosome 2 affects gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Primary congenital glaucoma
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Task1_train_3396
A sequence alteration has been identified in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Congenital glaucoma
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Task1_train_3397
Gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Glaucoma 3A
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Task1_train_3398
This sequence change occurs on Chromosome 2, altering CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
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Task1_train_3399
Given this context: Chromosome 2, gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
CGTCAATAAAACGTATATACAAAAACAGATCGTGTAATTTGCCAAGCCCTGTCATACGTCTTTTCACTAAAAAGGAAAAAAAAAGTATCAGCATATTGAATTGAAAGTGACCTCCAAATTGTTTTATTTCTTTTTGCCGCCTAATTGGAGTACTCGGAGAACTATTGTGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAG
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