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This variant impacts the gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
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Task1_train_10501
This mutation is located in gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
AAGCTGTTTCACTTCCTCATGATAGAATGGCATGCCCCACATATATGTGTGTATATATCTAAACTTGTGCTGGATCCACTCTCTGCTGGTTTTCTTCTGATGTACCTCTATTGCTTCTACTCATTGACTTTTCTCTGTTTCTAGTTAAAAGCACAATATTAACTGAGTCGTCTTTTATATATAATATAAAATCAGTCATTTTGGAATTACGACCTATTAGAAAGCTCAGTACTGTAAAATCTAAATAAAATTAAGCAATAAACTGACTCTCTTTCTCTCTAGACAAAAATTATTCATGTATGTATACTTATAATATACTTACAAGAACTCAGTGGGATCTAAATAAAATTGGGCAAAAGGAAAGATATTTCAATGTAAGCTAAGATGCATCAGCATCATTTCTTTAAGCATTCTAATTCTCATACCACCATACACAATATTATAATAATGTCACTAACATGGTGAAGGTTTGGTAGTTGACAAAAATATCCAAAACTGAATAAATTTTGAATAATAATAAGCTATGAGTACCTTTTAATTTTAAGTTAACAATTCCCAAAGGCCTTAAATCAACCAGATCCAGAAAAATTTGCTTGCATTTTTTCTCATCCTCTTTATATATCAATGTATAACAGGAAAGAGGAACATCCATCTCTATTATAAACACAAAAACACTAGCTAAACTTTCACTTGGATATGTTGCTCTGTGTACAAAAAGACAATCAATGTATTAGCTGAATATTTCTCCAAGTGTGAGGACGTGGTTTTCTTTTTAGTTTTGCTTTTTATTTAAGTTCTACCAAATTCCACATTCACTGGAGATGGTTGTATAGAAGTAGTCACTACCCATTAAATACTAATAGCTTATTAGCACTATCACAAATAAAATGATATAGCAGTAGCAACAGAATAACATCTATTTCACTTTACCAACCCTAGAACCTAGCCCATTGCTTAAATTCATTAAATAAATAAATAAACAATCAAATGAACTAAAAACAAGTTGCTTCAAAAATATCTCTTCCTACATGCTTTTCACCTTAAGGAATCAAAATATAATGTTTTCTACCACCTTGGAAATAGAATAATCATGAAAAACATGAATTTAATATAGAATCTAAAAACTAAGAATTTAAGTCTTTAAATGACTCTTTGAATTTTTATTCTTATCTTAAAAAGCAGATGAGTTATATGATTCAGTGTAAGTAGATTGACATTTGCAACATATGTCAATATGGACCTAAAAAATCAGCCCTCATTTGGATGTGAATATAATTAGTACTTACCCATAGCCAATGACTCCCTTTGACTGAGTAACTAGTAAGGCCCCGATAGTCATATTCAGAACATTCTCTAGTACCCCAGTCTGTTGAGCAGTGATGACTCGATGAGCCAAATTCTGTAATTTGTTACTTGATAAGGATGAAATCATTCCAGTGCTCCTTACTGTTGGCGAATCACCAATTTCAATGACAATCACTTTTGAGATAGTTTCCACAGTCATTGGGGGTGAAGCCCTATGTGAGTTCATTTCCATCATGAGAGGCCTACGTTGACCAACTCTTCTATAATGACTAGTGCAAGTCACAGTAGGGCAATTGCGCTTTCTTTTTGCTCTACTGTCAGCAATGGCCTTTAAGGTCTCTTCATGGCCAGGCATCTCGTGAATAAACCTGATTTGGTTTTGGCCAATCTGTAAGAAGTTAGTTAGTCTTTCGAGTATTACTATTTCCCAGCCTTTTTCTAAGACTGAAACCATCACAGTGAGGGCCAAGTGAATGGAAACACCTGAGCGTATTTCAATGGGCTCCTCTCCTTGTAGGACAACATACAAGAGGTTATCCATGATGTTGAAATAGTTGGCACCAATAGATTCATTCAGCAATAAGGAAGCTGACTGAACCAGAGTGGGTGGAATAAAACTTTCCCCTAAGAAGACGTGGGGGCTCTGGAGCTCATGGTAGAATACAGCCAAGAGAAGCTTGGAGGTACTTTTGTTCCCCAATAGAAAAAAGCGCAAAACTTGAGGAGTTTGATCCATGAAGCAGACTTTGGTGATTTGCCTGATGGGTAAGATAGAATAGAAAGTAGACACTGACCCAGAAGTAGAGCAGGGAATATTGGCATTTACACTGCTAAAGACATCAACAAAACCACTAGTCACAGATACAACTGGATATAACTTCTGAATTGCCCAAATGGCATCAGCGCTATCAAGAATTAGGACCACTTGGTCAGTCTGTTTGCAGATGAATCCTTGCATCAGAAATTGGTATGTACATTTCTGTTCTTCTCTAAATGTACCTATAAAAGAAAAGAAGCAAAACAAGTGATATATGAATTATAATCTGTCAATGATTATTTGTAATCCATCACTCTTGCCATCATCTATAACTGGATAAAATATTTATTAAACATCTAATTGTGCCAGATACTGAGAGTGCAAGGAAGATTGCGGCAAAATATTTTTAAAAATTAAATAATAGTTCTTTAATATATTTTAAAAGTATATGTTACATAATATGTTATTTAAAGTTAATAATGGAGATAATAACTGAGAAAAGGAGTTGAAGAAGTAAAAGAATCAAGACAATGAAATAATCATTAAGGGCCCTTGAGAGAAAAGCAAGATAAACTGCTTTTTACTACTCTCACACACTCCATATAACACAAAATACCTCACCTCTGGTCACCAAAATGTGTAGGTATTTCACCACACCAGCAACCAATTCTCCAGTGGATACAAACTGGGTGTCACATAATTTAACCAAATTCTGATACTAAACAAAGTTAGTGCAGACTCCACAAGGTAAGGGCTCAGTCTTACAAGCATGCCCCTATTTCAGATGCCAATTGCAAGTCCTAGGCTGTGACCTCTGCTTCTGAACAACTGGCTATATAAATCAGGGCTCTCAGGACTCCATCCTTGAATTCAATTAACTCGCTAGAGAGGCTTACAAAACTCAGGGAAACATTTACTTATGTTTTTTCATTTATTATAAAGGATATTACAAAAGACGCAGATGAACAGACAGATGGAAGAGACGCATAGGACAAGGCATGTGGGAAGGGCATGGAGCTTCCATGCCCTCTGCATGTGCCACCCTCAAGACACTTCCATGCGTTCAGCCACCTGAAAGCTCTCCCAATCCTGTCCTTTCAGCCTTTCATGGAGGCTCCATTATGTAGGTATGATTGACTAAGTTATTGGTTGTTGGTGATCGACTCAACCTTCAGACTCTCTCCCTTCCCCTGAAATGGGGATGGTGAGGAGATGAGGCTTGATGTTCCAACCCTCTAGTCACGTGATTGGTTCCCCTGGCAACCAGCCTCCATCCTGAGGCTATCCAGTAGTTGAGGCATTAGCTCATTAGAAAAAAAAGATATTCCTATCACCCAGGAAATTCCAAGGGATTTAGGAACTGTGTATCCAATGTTTCTGTCACTTAGGGAATTACAAATATCTTAGGGCTTCTGTGTCAGCAACCAGAGTCAAAGATCAAATATTCGAACAAAAGAGTCTCCTAGCACTACTGATTTTAGTAGCTCTGCCTCAGGAACCAGAAATATAGATACAGATATAGATTAGATATAGATATAGATATATAGATATAGATACAGATTTAGATAGATATAGATATAGAAAGAATCTCACAATATCATAGCTCCATAATAGAAATAGGGTATAAGAGAAGGGGTAGTAACATCCAAGCGAATGGGAGAAGAGGTAGATGGAGGGGAATGGGTGGAACAGAGAAATTATGAAGGCATATTAAAATTGAAGAGGTGTGTCTGACCAGATTGTGAAAGAGTTTGGATGTCAAACTATATAATTTTCTCATACTCTATTTTTCCCTAAACATAAAAAGTAAAGAAATACAAGAAGAAGGAAAGAAGAAAGTAGTAACTTCGGAAGTTGTTGATATTAAAGAGTCCAAGTTGAGGATGGTGAGGGTTAATAAAACATTTAAAGGAACAGCGTTATTCATTATTTCTACCATTCCTAATACCTCCTATATGAACCCAGAATAGTTCTTGTTTTGAATCCATAGGGATATTTTATCTTTCAATAAAGAATTTCTTTGATTTAAAATTT
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Task1_train_10502
This genomic variant is located on Chromosome 6, within the PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
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Task1_train_10503
An alteration has been detected in PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
ATCCTATCTAATTTTCACATATTTGAATGAAACTCTTAGATCATATGTCAGAAAACAGTATTTACACCTGGTCTGAAATACCAATATCTGCTAGACCTCATCGTTCAGTTCAGAGATTCCTGTCAGCAGACACAATCTCCTTCTATCTACTAGTTCCTGCACAAAAGGCTCCCAAGGTCTCCTTCTGAAGACCACTGACACTTTACTCCAATGAAGAATGAAGAATTAGAGTCAATTTATTACCAGCAAGTTTGAAAACATCCCAAAGAAGTCTCTCTAATTAAGACAAAACAATAAAACAATATCAATAAAACTTGCACTTCATTACTTCTGCCTCTTTCATCAGCTAAAGAAAATCACATGGCTGAGTCCAGATTCAAGGGGGAGGGAAATAGCCCCTGCCTCTTTAGTGAGAGATATTTTAAAAATCATATATCACAAGGCGTGAATATAGGAGGGGTAAAGAATTGGTCATTAAGTTAATGTACCTTACCATTCTAAGATTCATTTCTATTTCTTTGATGATTTTATTCCTTTCAAAAAACATGTTTAGGGTTTGAAGAATTGCCAAGTACTTCATAAATATGGCTTATTATAAATACTAAAAATTATACCTGGGTTGTAATGAAGGAAAGTAGAACTTGTTTTTATCTTTTATCTTTAGCATCCTGGTCCTCTCTGCTGTTATTGGGTGCATAATTCCACTGTTCTCTGCATTTGGTAGAATGCAGACATCCAGGTCATCGCTATAGCAACTCTTCACAAAACTAGAAAAGGTAACATCTGAAATTTTAAAAATATGTATCATAATATTATATCATATAAACCACCAGCCACAAATATCGAATATACAACTAAATATTGTTATAATAATGTATACCCTAAGTTAGTTAAAGCTATCCAGGATAGCCTTAGGAGTTTACATACATCTTGATATAAAATATCAGTAGTTCTTCAATACATGGACATTGCATGCAACAGAGAAGAGTATTTCAATACGTTAAACCTTTAAGAGCAATATGGCTTTTCATTTGAGGCTTAATCAAAATCCATTCATTTTACAGAAAGACAAACCCACTGCCAGATAAACTAAGTAACAGGGGAGAGACTACAATGGTGGTACAAGAGATCTAATAGAAGATGAACTGCACCAGTCGTGTCACAACTTTGATTTTAACCCTCGTTGCTCAACCATCTACTAAGCAACTTCAGATGAGACACAACTTCTACATTTCAATTTCCTCACTTGTATAATAGGAAAAATAACACCTAACCAAGAGAGTTCTTATGTAATCAAGTTAAATAATTGCTGTGTTAGCCGGGAGTGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGATGGGAGGACTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGTCAAGATAGCAAGATCCCATCTCATTATATTCAAATTTTTTAAATTTTATTAAAAAATAATAGTTGTTGTAGAAAGCTCTTCAATATGTATAAAGCAGTGACTTTTGTAAGAAATTATAAACTACCATTGTGGCTATCAATACTCAGCAGGTTGGACAGCAAGCACTAGACCACAATGTACCTTTTTGTTGATAAAATTTCAGAATGCCATTAAAAATTTTATGCATGGATGTATGAAATGGCACTGCCTAGATAAAATAAAACATCCTACCTTGAAGTTTCATGATTCCTGAAATTGAATGATCATTCCTCACTTTGTGCCATGGCTCCTGAGGCCACTGATTTGGTTCTGAGGTGAATACAGGCCACAGAATACCAATTCGACCTCCTCTTGGATTGGAGGGAGCTCTATCTGTTGATGTCAAGTTGGCTGAGTGCGGCTTCACTTTGTCCTGAATGCAGTCAAAAGAAGAGCTGGTGGCCACAATGACTGAATTCCTAAGCACAATCTGCACTTTTTTGACGGAATTTTGTGGAGCAGAAAATACATACACTACTGCCAAAAGACCAATAGTATTGTCTACCAGAGTAATGTTCTCTATCTCCACGCTGTTCTCTACATGTAACATGGCACCATAGTCAAAGTTCTTGAAAGCCAAGAAGCCAGAGATTCTGGTACAGTTGTCAAGTCCACTTTCCTTATAGAGATGAAGGCCATGAAGACTTGAATGCGCCACATTGTCAGACCAAAGCAGTTCACAAGAGGAGCACTTGTGGCCTCGGATGTGAAAGCCAAGTCTCTCTGATCCTGCCACAACGTTGCCATGGAGGTTGATGTCCTTTACCTGGTTCACTTTGATTCCCGCCACCCAAATGGTGGACCACGCTGGCTGTGTCATCAGAACCACAAGGTTATTAGTGACAGTATAGGCCTGACCCTCTAAATCTATGCCATGGCCAGCTGTGCCAAACACAATATTGTCATTTAAAAGTACTCCATGACTGGCAGCTGCATGAATGCCCCCGCCACAGCTCTGGTGCAGAGTAGATGATATGATCCAGGATCCTGCTGACACATTACTGAATTCAACAGATGAGTACAATGGTGACCCGAAGTTCTGAATTTCCACATTAAGAAGTTGAAGGACACCTATAAACAAATGCATGTCATCAGGTACTTTCCTCTTCCCCACAAAAGGCTGAAGAATGGCCCATTTTGGGGCATTAAGATATGAACATTTTTAATGAAAATGTAAGTTTATTCTCAACACCAACATTATATTTCACACCATAGATTCTCAACTAAAAATGTAGGAATCATTACAAGTATCACATTAATGCCTGAATTGCATGTGCAGTCTGAAGAGTCTGGTGACAGGACAGGGAAAGATGAGAGGAGAAATAGGAAAGAGGCAAACTTTGGGGATGGGCATGGCCAAGTTTAACGATTCTGTGTATTTGTCGGGGGCCGGGTCAAAGAACTGGGTAAGAATAGATTCTGGGTTTCTGGCCCTTCACCTCAAAGTCAAGTCTCCCTCTCAGTGTCTCAGTGACACCACGTGAAAGGCCACAGCCATTCCCAAGAAGACACTGCACAAATGAATATTAAGCATTTCTGAAGAAGAGTATGAGTGCGAAATTTCCTTCTGCTCAGTTGATGTCCAGAAGCCTGATATTCCATACATGCTTCTGATTAAAACATGGTAGGAGCAATAACATGCTTTTAAAATCACTTTAAAGATTCTGTAAAATGTTTTCTATATTTTTATCCTGACTACACTTTATTCACTGTTTCATTTTTATAAGATTTTCTATATCTTTTATGTGAGGAGAAAATAGTGAATTATTTACTCTCATTTGTAGTTTTATTTGTACTGTTTTAAATAGATATTGTTAAAACACACTATAAAATACACCCAGTAAGTTGATTTAAAAATACAATGATTCAGCATACATACTTTTGGTAAAATTAATAATAACATGATTATAGATGAATTAATATGCAATAATAATGAGGTGAATTAAATACTTTAACTCTCACATAACACTCATTATTTGCAGACACCGTTCTAATTCTTATTCATTTATTTATTCATACTCCTAATTTTCAAAAAAATCCTATGAGGTAGGTACAATTATTATCCCCATTTTACAGATAAGGAAATTGAGGCAGAGAAGAGTGAACTAACAAACTAGGACTTAAACTTAGGCATATGGATGAGAAGCCGCACTATTAACCCCATGCAGGCATCCTGGAAAGACAGAAAGACTTTGTGGTACAAAAGTAGCATCTCTGCATTATGATTCAGATAACTGCCCTATAGCTATGAGCCAATAATTAGTTGTGTGTCCTTTGCTAGGTAGGTCACAACTTTGGCTCCTTTTATTTCATTTTTAAGGTACTGACTAAAGTAAACTATAAAGTTATTTATCTCATTAAAAATAAAGGAAGCAATACATTTGAAGTTTCTGTTTCACTGTTTCAATAATAGTATTAATAGTATTTAAGTTTCAAAGGCAGTACAGCCTAAACCCCTCATTTCTCCACTACCTTTTCAGAAATGAGAAACTAGAACCCTTGCAAATCGGCTGCCATGAAGAAGCAAGTCCTTTTGAGAAAGACAGGCTAAGTAAAGGAACCTATACGTCTACTTGGGGCCAGGCAACAGGATTCCGAAGTATCTAAA
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Task1_train_10504
The variant affects gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin), which is on Chromosome 6. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
ATCCTATCTAATTTTCACATATTTGAATGAAACTCTTAGATCATATGTCAGAAAACAGTATTTACACCTGGTCTGAAATACCAATATCTGCTAGACCTCATCGTTCAGTTCAGAGATTCCTGTCAGCAGACACAATCTCCTTCTATCTACTAGTTCCTGCACAAAAGGCTCCCAAGGTCTCCTTCTGAAGACCACTGACACTTTACTCCAATGAAGAATGAAGAATTAGAGTCAATTTATTACCAGCAAGTTTGAAAACATCCCAAAGAAGTCTCTCTAATTAAGACAAAACAATAAAACAATATCAATAAAACTTGCACTTCATTACTTCTGCCTCTTTCATCAGCTAAAGAAAATCACATGGCTGAGTCCAGATTCAAGGGGGAGGGAAATAGCCCCTGCCTCTTTAGTGAGAGATATTTTAAAAATCATATATCACAAGGCGTGAATATAGGAGGGGTAAAGAATTGGTCATTAAGTTAATGTACCTTACCATTCTAAGATTCATTTCTATTTCTTTGATGATTTTATTCCTTTCAAAAAACATGTTTAGGGTTTGAAGAATTGCCAAGTACTTCATAAATATGGCTTATTATAAATACTAAAAATTATACCTGGGTTGTAATGAAGGAAAGTAGAACTTGTTTTTATCTTTTATCTTTAGCATCCTGGTCCTCTCTGCTGTTATTGGGTGCATAATTCCACTGTTCTCTGCATTTGGTAGAATGCAGACATCCAGGTCATCGCTATAGCAACTCTTCACAAAACTAGAAAAGGTAACATCTGAAATTTTAAAAATATGTATCATAATATTATATCATATAAACCACCAGCCACAAATATCGAATATACAACTAAATATTGTTATAATAATGTATACCCTAAGTTAGTTAAAGCTATCCAGGATAGCCTTAGGAGTTTACATACATCTTGATATAAAATATCAGTAGTTCTTCAATACATGGACATTGCATGCAACAGAGAAGAGTATTTCAATACGTTAAACCTTTAAGAGCAATATGGCTTTTCATTTGAGGCTTAATCAAAATCCATTCATTTTACAGAAAGACAAACCCACTGCCAGATAAACTAAGTAACAGGGGAGAGACTACAATGGTGGTACAAGAGATCTAATAGAAGATGAACTGCACCAGTCGTGTCACAACTTTGATTTTAACCCTCGTTGCTCAACCATCTACTAAGCAACTTCAGATGAGACACAACTTCTACATTTCAATTTCCTCACTTGTATAATAGGAAAAATAACACCTAACCAAGAGAGTTCTTATGTAATCAAGTTAAATAATTGCTGTGTTAGCCGGGAGTGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGATGGGAGGACTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGTCAAGATAGCAAGATCCCATCTCATTATATTCAAATTTTTTAAATTTTATTAAAAAATAATAGTTGTTGTAGAAAGCTCTTCAATATGTATAAAGCAGTGACTTTTGTAAGAAATTATAAACTACCATTGTGGCTATCAATACTCAGCAGGTTGGACAGCAAGCACTAGACCACAATGTACCTTTTTGTTGATAAAATTTCAGAATGCCATTAAAAATTTTATGCATGGATGTATGAAATGGCACTGCCTAGATAAAATAAAACATCCTACCTTGAAGTTTCATGATTCCTGAAATTGAATGATCATTCCTCACTTTGTGCCATGGCTCCTGAGGCCACTGATTTGGTTCTGAGGTGAATACAGGCCACAGAATACCAATTCGACCTCCTCTTGGATTGGAGGGAGCTCTATCTGTTGATGTCAAGTTGGCTGAGTGCGGCTTCACTTTGTCCTGAATGCAGTCAAAAGAAGAGCTGGTGGCCACAATGACTGAATTCCTAAGCACAATCTGCACTTTTTTGACGGAATTTTGTGGAGCAGAAAATACATACACTACTGCCAAAAGACCAATAGTATTGTCTACCAGAGTAATGTTCTCTATCTCCACGCTGTTCTCTACATGTAACATGGCACCATAGTCAAAGTTCTTGAAAGCCAAGAAGCCAGAGATTCTGGTACAGTTGTCAAGTCCACTTTCCTTATAGAGATGAAGGCCATGAAGACTTGAATGCGCCACATTGTCAGACCAAAGCAGTTCACAAGAGGAGCACTTGTGGCCTCGGATGTGAAAGCCAAGTCTCTCTGATCCTGCCACAACGTTGCCATGGAGGTTGATGTCCTTTACCTGGTTCACTTTGATTCCCGCCACCCAAATGGTGGACCACGCTGGCTGTGTCATCAGAACCACAAGGTTATTAGTGACAGTATAGGCCTGACCCTCTAAATCTATGCCATGGCCAGCTGTGCCAAACACAATATTGTCATTTAAAAGTACTCCATGACTGGCAGCTGCATGAATGCCCCCGCCACAGCTCTGGTGCAGAGTAGATGATATGATCCAGGATCCTGCTGACACATTACTGAATTCAACAGATGAGTACAATGGTGACCCGAAGTTCTGAATTTCCACATTAAGAAGTTGAAGGACACCTATAAACAAATGCATGTCATCAGGTACTTTCCTCTTCCCCACAAAAGGCTGAAGAATGGCCCATTTTGGGGCATTAAGATATGAACATTTTTAATGAAAATGTAAGTTTATTCTCAACACCAACATTATATTTCACACCATAGATTCTCAACTAAAAATGTAGGAATCATTACAAGTATCACATTAATGCCTGAATTGCATGTGCAGTCTGAAGAGTCTGGTGACAGGACAGGGAAAGATGAGAGGAGAAATAGGAAAGAGGCAAACTTTGGGGATGGGCATGGCCAAGTTTAACGATTCTGTGTATTTGTCGGGGGCCGGGTCAAAGAACTGGGTAAGAATAGATTCTGGGTTTCTGGCCCTTCACCTCAAAGTCAAGTCTCCCTCTCAGTGTCTCAGTGACACCACGTGAAAGGCCACAGCCATTCCCAAGAAGACACTGCACAAATGAATATTAAGCATTTCTGAAGAAGAGTATGAGTGCGAAATTTCCTTCTGCTCAGTTGATGTCCAGAAGCCTGATATTCCATACATGCTTCTGATTAAAACATGGTAGGAGCAATAACATGCTTTTAAAATCACTTTAAAGATTCTGTAAAATGTTTTCTATATTTTTATCCTGACTACACTTTATTCACTGTTTCATTTTTATAAGATTTTCTATATCTTTTATGTGAGGAGAAAATAGTGAATTATTTACTCTCATTTGTAGTTTTATTTGTACTGTTTTAAATAGATATTGTTAAAACACACTATAAAATACACCCAGTAAGTTGATTTAAAAATACAATGATTCAGCATACATACTTTTGGTAAAATTAATAATAACATGATTATAGATGAATTAATATGCAATAATAATGAGGTGAATTAAATACTTTAACTCTCACATAACACTCATTATTTGCAGACACCGTTCTAATTCTTATTCATTTATTTATTCATACTCCTAATTTTCAAAAAAATCCTATGAGGTAGGTACAATTATTATCCCCATTTTACAGATAAGGAAATTGAGGCAGAGAAGAGTGAACTAACAAACTAGGACTTAAACTTAGGCATATGGATGAGAAGCCGCACTATTAACCCCATGCAGGCATCCTGGAAAGACAGAAAGACTTTGTGGTACAAAAGTAGCATCTCTGCATTATGATTCAGATAACTGCCCTATAGCTATGAGCCAATAATTAGTTGTGTGTCCTTTGCTAGGTAGGTCACAACTTTGGCTCCTTTTATTTCATTTTTAAGGTACTGACTAAAGTAAACTATAAAGTTATTTATCTCATTAAAAATAAAGGAAGCAATACATTTGAAGTTTCTGTTTCACTGTTTCAATAATAGTATTAATAGTATTTAAGTTTCAAAGGCAGTACAGCCTAAACCCCTCATTTCTCCACTACCTTTTCAGAAATGAGAAACTAGAACCCTTGCAAATCGGCTGCCATGAAGAAGCAAGTCCTTTTGAGAAAGACAGGCTAAGTAAAGGAACCTATACGTCTACTTGGGGCCAGGCAACAGGATTCCGAAGTATCTAAA
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Task1_train_10505
A variant affecting Chromosome 6, within the gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; not specified
ATCCTATCTAATTTTCACATATTTGAATGAAACTCTTAGATCATATGTCAGAAAACAGTATTTACACCTGGTCTGAAATACCAATATCTGCTAGACCTCATCGTTCAGTTCAGAGATTCCTGTCAGCAGACACAATCTCCTTCTATCTACTAGTTCCTGCACAAAAGGCTCCCAAGGTCTCCTTCTGAAGACCACTGACACTTTACTCCAATGAAGAATGAAGAATTAGAGTCAATTTATTACCAGCAAGTTTGAAAACATCCCAAAGAAGTCTCTCTAATTAAGACAAAACAATAAAACAATATCAATAAAACTTGCACTTCATTACTTCTGCCTCTTTCATCAGCTAAAGAAAATCACATGGCTGAGTCCAGATTCAAGGGGGAGGGAAATAGCCCCTGCCTCTTTAGTGAGAGATATTTTAAAAATCATATATCACAAGGCGTGAATATAGGAGGGGTAAAGAATTGGTCATTAAGTTAATGTACCTTACCATTCTAAGATTCATTTCTATTTCTTTGATGATTTTATTCCTTTCAAAAAACATGTTTAGGGTTTGAAGAATTGCCAAGTACTTCATAAATATGGCTTATTATAAATACTAAAAATTATACCTGGGTTGTAATGAAGGAAAGTAGAACTTGTTTTTATCTTTTATCTTTAGCATCCTGGTCCTCTCTGCTGTTATTGGGTGCATAATTCCACTGTTCTCTGCATTTGGTAGAATGCAGACATCCAGGTCATCGCTATAGCAACTCTTCACAAAACTAGAAAAGGTAACATCTGAAATTTTAAAAATATGTATCATAATATTATATCATATAAACCACCAGCCACAAATATCGAATATACAACTAAATATTGTTATAATAATGTATACCCTAAGTTAGTTAAAGCTATCCAGGATAGCCTTAGGAGTTTACATACATCTTGATATAAAATATCAGTAGTTCTTCAATACATGGACATTGCATGCAACAGAGAAGAGTATTTCAATACGTTAAACCTTTAAGAGCAATATGGCTTTTCATTTGAGGCTTAATCAAAATCCATTCATTTTACAGAAAGACAAACCCACTGCCAGATAAACTAAGTAACAGGGGAGAGACTACAATGGTGGTACAAGAGATCTAATAGAAGATGAACTGCACCAGTCGTGTCACAACTTTGATTTTAACCCTCGTTGCTCAACCATCTACTAAGCAACTTCAGATGAGACACAACTTCTACATTTCAATTTCCTCACTTGTATAATAGGAAAAATAACACCTAACCAAGAGAGTTCTTATGTAATCAAGTTAAATAATTGCTGTGTTAGCCGGGAGTGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGATGGGAGGACTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGTCAAGATAGCAAGATCCCATCTCATTATATTCAAATTTTTTAAATTTTATTAAAAAATAATAGTTGTTGTAGAAAGCTCTTCAATATGTATAAAGCAGTGACTTTTGTAAGAAATTATAAACTACCATTGTGGCTATCAATACTCAGCAGGTTGGACAGCAAGCACTAGACCACAATGTACCTTTTTGTTGATAAAATTTCAGAATGCCATTAAAAATTTTATGCATGGATGTATGAAATGGCACTGCCTAGATAAAATAAAACATCCTACCTTGAAGTTTCATGATTCCTGAAATTGAATGATCATTCCTCACTTTGTGCCATGGCTCCTGAGGCCACTGATTTGGTTCTGAGGTGAATACAGGCCACAGAATACCAATTCGACCTCCTCTTGGATTGGAGGGAGCTCTATCTGTTGATGTCAAGTTGGCTGAGTGCGGCTTCACTTTGTCCTGAATGCAGTCAAAAGAAGAGCTGGTGGCCACAATGACTGAATTCCTAAGCACAATCTGCACTTTTTTGACGGAATTTTGTGGAGCAGAAAATACATACACTACTGCCAAAAGACCAATAGTATTGTCTACCAGAGTAATGTTCTCTATCTCCACGCTGTTCTCTACATGTAACATGGCACCATAGTCAAAGTTCTTGAAAGCCAAGAAGCCAGAGATTCTGGTACAGTTGTCAAGTCCACTTTCCTTATAGAGATGAAGGCCATGAAGACTTGAATGCGCCACATTGTCAGACCAAAGCAGTTCACAAGAGGAGCACTTGTGGCCTCGGATGTGAAAGCCAAGTCTCTCTGATCCTGCCACAACGTTGCCATGGAGGTTGATGTCCTTTACCTGGTTCACTTTGATTCCCGCCACCCAAATGGTGGACCACGCTGGCTGTGTCATCAGAACCACAAGGTTATTAGTGACAGTATAGGCCTGACCCTCTAAATCTATGCCATGGCCAGCTGTGCCAAACACAATATTGTCATTTAAAAGTACTCCATGACTGGCAGCTGCATGAATGCCCCCGCCACAGCTCTGGTGCAGAGTAGATGATATGATCCAGGATCCTGCTGACACATTACTGAATTCAACAGATGAGTACAATGGTGACCCGAAGTTCTGAATTTCCACATTAAGAAGTTGAAGGACACCTATAAACAAATGCATGTCATCAGGTACTTTCCTCTTCCCCACAAAAGGCTGAAGAATGGCCCATTTTGGGGCATTAAGATATGAACATTTTTAATGAAAATGTAAGTTTATTCTCAACACCAACATTATATTTCACACCATAGATTCTCAACTAAAAATGTAGGAATCATTACAAGTATCACATTAATGCCTGAATTGCATGTGCAGTCTGAAGAGTCTGGTGACAGGACAGGGAAAGATGAGAGGAGAAATAGGAAAGAGGCAAACTTTGGGGATGGGCATGGCCAAGTTTAACGATTCTGTGTATTTGTCGGGGGCCGGGTCAAAGAACTGGGTAAGAATAGATTCTGGGTTTCTGGCCCTTCACCTCAAAGTCAAGTCTCCCTCTCAGTGTCTCAGTGACACCACGTGAAAGGCCACAGCCATTCCCAAGAAGACACTGCACAAATGAATATTAAGCATTTCTGAAGAAGAGTATGAGTGCGAAATTTCCTTCTGCTCAGTTGATGTCCAGAAGCCTGATATTCCATACATGCTTCTGATTAAAACATGGTAGGAGCAATAACATGCTTTTAAAATCACTTTAAAGATTCTGTAAAATGTTTTCTATATTTTTATCCTGACTACACTTTATTCACTGTTTCATTTTTATAAGATTTTCTATATCTTTTATGTGAGGAGAAAATAGTGAATTATTTACTCTCATTTGTAGTTTTATTTGTACTGTTTTAAATAGATATTGTTAAAACACACTATAAAATACACCCAGTAAGTTGATTTAAAAATACAATGATTCAGCATACATACTTTTGGTAAAATTAATAATAACATGATTATAGATGAATTAATATGCAATAATAATGAGGTGAATTAAATACTTTAACTCTCACATAACACTCATTATTTGCAGACACCGTTCTAATTCTTATTCATTTATTTATTCATACTCCTAATTTTCAAAAAAATCCTATGAGGTAGGTACAATTATTATCCCCATTTTACAGATAAGGAAATTGAGGCAGAGAAGAGTGAACTAACAAACTAGGACTTAAACTTAGGCATATGGATGAGAAGCCGCACTATTAACCCCATGCAGGCATCCTGGAAAGACAGAAAGACTTTGTGGTACAAAAGTAGCATCTCTGCATTATGATTCAGATAACTGCCCTATAGCTATGAGCCAATAATTAGTTGTGTGTCCTTTGCTAGGTAGGTCACAACTTTGGCTCCTTTTATTTCATTTTTAAGGTACTGACTAAAGTAAACTATAAAGTTATTTATCTCATTAAAAATAAAGGAAGCAATACATTTGAAGTTTCTGTTTCACTGTTTCAATAATAGTATTAATAGTATTTAAGTTTCAAAGGCAGTACAGCCTAAACCCCTCATTTCTCCACTACCTTTTCAGAAATGAGAAACTAGAACCCTTGCAAATCGGCTGCCATGAAGAAGCAAGTCCTTTTGAGAAAGACAGGCTAAGTAAAGGAACCTATACGTCTACTTGGGGCCAGGCAACAGGATTCCGAAGTATCTAAA
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Task1_train_10506
The gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
GTCTTGGCCTGCTTTTCTGGTCTATAACAAATCAGTACCCATATCTGCCATCCCTGACCTACACCTGCAGATCCCTTCTTATTCAGGCCCTGGACTATGTTATAGAAAAATGTAAGCATTCTTAATGCAGGGTATAAACCTGAATTGAATTCTGGAACAGAAAAAAACTGATAAAATTTGAAGAAAGTCTTGAGTTTAGTTCATGGTCATGTACCAATGTTAATGTCTTTGTTTTGACAAATATACTAGTATTATATCAGCTATTAATGGAAGAAAATTGAGTGAAAGGTATACAGGATCTCTCTATACTACCTTTGCAGCTTTTCTATAAATCCAAAATTATTACAAAATTAAAAGTTTAATTAACAAGAACCAGGCTCGAATCTACCACTTACTACTTGAATGACTTTCCTTACTCTTCATTAATATTTTTCATTCATATTTATTAAGTACCTAATGTACAGCAGTTACCACACTAGGAAAACAGATGAAAGACCTATTTTTCACCTCAAGGAGTTTATAAGCTAATGAAGGAGCTACATAAATAAATAGGCAATTGTACTATAGACTCTATTTCCTGTAATAGGAATATAAATTTCTCTTATGAGGATTTTAGGATTAAATAAGATAAAATTTTCACTGTATGAAAACCAGCACAGTTTCTGGTCCACAAGAAACACAAAATAGAGTTTCTGTTTCCCTTCCCCAGGGGATGATTTAAGGATCAGCATTGTTAGAAGTTTAGGATCAGGTCAGTCTTGCTGCTGGTTCTGCTCTGGCTTGGTGCTCAGCTGTAAGAACTGGCCTTCTGTCCTGTTCCTGTGACCATGCTCCAGCTTGCCCTGTGGCTTCAGTTAACTGGGGGCTTATCTTGCTCTCTCCTTCCTGATTCCCCATCTTCCTCAACCTTAGAATGGGGTTCTTAAAAGAATGGTTCAATTCTTAAAAGATTTGAACCAGCCTTTGTCTCCATCATCTAGAGCAGGGTTCTCAACCTCAACACTATTGACATTTGGAGCCAGATACTCCTTTCCTATGGGTGGTCGTCCTGTGCATGCAAGATGTTTGGCACTACCCATACATGCCAGAAGCTCCCTCAAGTTGTGACAAGTAAAAATGTCTCTAGATATTGCCAAATATCACCTGGGGTAGCGGGCAGAAATCACCACTGATAACGGCTTATGGAGACAGAGCTTGCTCTATTAACTAGAAATCTTAAATGTCTGATTTAAGGTCCAAACACTGCCCTTTACAAAACTGGTAAAATAGTTGTGCCAACAAAGAGTGTCCCATACTGAATATATTTGGGAAGTGTTTAGATCCTTTATTCTCGGCCTTCTCCAGGCCTTTATATATTCATGTACACCACGATTTTATAAGTTGGAGCTACAGTGACAACCAAACTATTTGATCAGGAAAGAACTTTGGAATAATGTATAAGGAACACAAGTTTAAGAAACGAGGTCCTAATCAAATAATTTTGCAGCATTCCAAAAGGGCTAAAACTTGAAAGAAACAAGAAAGATTGAACTGATCCTTAAAGCAGTCTGAAATATGGAAATCATTTTTATTTAAATTTACGCTATTAATTTATAGCATGAACTGATGCCTGCCATCAGATATAGCATGCTACTGGGAAAGAGTAACAGAAATTCAGGAAAGAGATAAAATTGAAGTGGTCATTAAATCATCTATAATTTCAAAGCAGTGGAAATTTCACATCTGCTGAAGATGTTTTCTTTGAGGTAAAATGTGCATATGTGCTGACCACTAGTATATTATTTTAACATCACACTGATAATTAAGCACAGATTAGGACTGAAAATTCATAGCTTCTCCAAGCACAAAGGAACTATCTCATTTGAACATTTTGTTTTATAAATGAAAATTCTCACAGTTGGGATTTCTGGGTGTCCCAGATGAATAGGCTCCAACTGGTAATGGCCAATTACTTAAAATTTCATTTACCTGAAAATTCTTCTCGGCTGGACTTCCTGAAGGACCCCACAAACAGTCTCCCCCTACATGATACGTCAGGCTGAATTTGTATATTTCGGGTCAACAGTCCAACCTCAGCAGCCAAACGAATGTGTCGGCCATCCTCCGTGACATGTACACTTCCTGGGGCAATAGGAGTTGTGGGAAAAAAAAACTTTAAAAACCTGTTTCAAAAATCACTAGCTGGGGACCCAGCAAACCTGAGAAATGAAAACATCCTTTCCCCTCAGAAGTTCTACCAACATTAAGGTCTGCTTTTCCTGGGGCATTCTCCACAAAGGTCAGCTGAGAAATAAAATAACCCATTCACTTGTCTCTCTTTGGGATCAGAGTCAGAGTGTTTGAGCAAGAATTCATTTCTTCTTAATAACTGTGGGTACTGGAACAGGTCACTGGTTCAGGGAAGTCAGGGCAGACCTGTCCAATTAGTGGGGTCCCCAACCTGCCTTAAATAGGTCAGCGTGAGACTTCAGTGTTGGGTTGTACATTGTCCGTGGACCTCTTTCATGAGAGTGAGGAGTCCCACATCAACTGAGGCAGTGACAGAGCAAAAGCAGCTGTGTGTAAAAGGAAAGCGAGAAGCAGCACCAGGCAGCAGCAGCGCCCTCTCATGGTGGATCTTCCACTCATCACGGCCTGAACAGCTTCCACAGCAGTGGGAACTAAGCGTCTTGCTAGTTTGTTTCACTGTCTACCATTTGCATTTCACCTTGCATTTTACTGAAATCATTGCTGAAGATTTCTTTTTTCTTTGCCACTTACTAAAAAAGAAATGCTCCTGGGAACATTGATTTAGACAGAGCTTTAGATATTCCTGGTGAAACCATGGATTTGCCTCTCAAGTATCAGAGACAAAAAGACATTCTCCATCCCCTTTATTTCCACAGTTTATTACTGATTAGCTATATCTCCTGGATTAGATTTATTTATTAGACTGAATCAGGAAGGTTATTGTGATTTATTATTTATATGTAGTACATTCTAACTGTGTATTGTGTATAAAAATATTTGGTACCTTTTTTATTTAAAAAAAGGTCTGGGCTTTTTTCTTTCATTTTTTGCAGTAATAGTAATAGTAGTAGTTAATACATAAAATGTACTTCATGTCAGGAAGGACACATTTCTAAGTATGGAAAATGAAATCATTATTTACAGTAACTACAATATTCTAAGGGATTATAATTCAATGTGTCAGGAAATAAACTGGAAACTCAGTGCCCATAAGTTTTATTCTGGCTTAGCCAGAAAACTGCCCAGTGACCTTGAACAAGACTCTCAACCCTTCTGCTCTTAGATTTGCCATTATAAATAAAAAGCAAAATGTGTGTGCATGTGTATGTGTGTATGTGTATAACATCCAAGTATTCTTTAAAAATAAAGCAACAAAATTAATGAGGGAATAGAGATAAGGCCACGTAGCATGAGTCTAGGTCAACAGGAAGGCATTGTTCTTCCCCTCTGAATGGCAATCAGATCCGAGGTCCCCAGCTAGGTTACCAAACATGGTCTTCCTAGCTCATTCACTTACCTTAACCAACAAACCAAAGCCTTACCAATATGCCGGTGTTTGAGCCGTTCATAGATCCTCACATGGTGGCCCTTGACTTCTTTCACAGTGAGGACCTCTGCTTCATGAGGCTCATAAGAAGAGGAGCTAAGGACTATTTTGTCATGGGGGCGCCAATCCACTGCATCTTCTACTATAATTCTGTAACAGCATAACAATGGCATTGGATATACTAACAGTGCAGCACAAATCATCTATTAACTCCAGAGCAAGAAAAGGAAATCCACTGTGACCAACATATCCCACCAGAGAAACTGAAATAGAAATAAGACATGGCAGTGGAAAAAGGCTTTCGCAAACAGTTTAATTTAGCTAATGGAGTCAGTTTTCTGGCTTGAAAATGTATATGTTACAGAGACAGTGAAGATATTCGATGACCCCTGAAATACAGCAAAGGAATAAAAAACAATAAAAGTTCCAGAGGTTAGTACACATGTCTACATCAGCAACCTTCTTTCTGGATTAGGGAACAGATTCAATAATAACAGCATTTCAGAAAAGAACTTTTCTCTAATTTTCTAGAGAAATATA
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Task1_train_10507
This gene mutation involves PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
GTCTTGGCCTGCTTTTCTGGTCTATAACAAATCAGTACCCATATCTGCCATCCCTGACCTACACCTGCAGATCCCTTCTTATTCAGGCCCTGGACTATGTTATAGAAAAATGTAAGCATTCTTAATGCAGGGTATAAACCTGAATTGAATTCTGGAACAGAAAAAAACTGATAAAATTTGAAGAAAGTCTTGAGTTTAGTTCATGGTCATGTACCAATGTTAATGTCTTTGTTTTGACAAATATACTAGTATTATATCAGCTATTAATGGAAGAAAATTGAGTGAAAGGTATACAGGATCTCTCTATACTACCTTTGCAGCTTTTCTATAAATCCAAAATTATTACAAAATTAAAAGTTTAATTAACAAGAACCAGGCTCGAATCTACCACTTACTACTTGAATGACTTTCCTTACTCTTCATTAATATTTTTCATTCATATTTATTAAGTACCTAATGTACAGCAGTTACCACACTAGGAAAACAGATGAAAGACCTATTTTTCACCTCAAGGAGTTTATAAGCTAATGAAGGAGCTACATAAATAAATAGGCAATTGTACTATAGACTCTATTTCCTGTAATAGGAATATAAATTTCTCTTATGAGGATTTTAGGATTAAATAAGATAAAATTTTCACTGTATGAAAACCAGCACAGTTTCTGGTCCACAAGAAACACAAAATAGAGTTTCTGTTTCCCTTCCCCAGGGGATGATTTAAGGATCAGCATTGTTAGAAGTTTAGGATCAGGTCAGTCTTGCTGCTGGTTCTGCTCTGGCTTGGTGCTCAGCTGTAAGAACTGGCCTTCTGTCCTGTTCCTGTGACCATGCTCCAGCTTGCCCTGTGGCTTCAGTTAACTGGGGGCTTATCTTGCTCTCTCCTTCCTGATTCCCCATCTTCCTCAACCTTAGAATGGGGTTCTTAAAAGAATGGTTCAATTCTTAAAAGATTTGAACCAGCCTTTGTCTCCATCATCTAGAGCAGGGTTCTCAACCTCAACACTATTGACATTTGGAGCCAGATACTCCTTTCCTATGGGTGGTCGTCCTGTGCATGCAAGATGTTTGGCACTACCCATACATGCCAGAAGCTCCCTCAAGTTGTGACAAGTAAAAATGTCTCTAGATATTGCCAAATATCACCTGGGGTAGCGGGCAGAAATCACCACTGATAACGGCTTATGGAGACAGAGCTTGCTCTATTAACTAGAAATCTTAAATGTCTGATTTAAGGTCCAAACACTGCCCTTTACAAAACTGGTAAAATAGTTGTGCCAACAAAGAGTGTCCCATACTGAATATATTTGGGAAGTGTTTAGATCCTTTATTCTCGGCCTTCTCCAGGCCTTTATATATTCATGTACACCACGATTTTATAAGTTGGAGCTACAGTGACAACCAAACTATTTGATCAGGAAAGAACTTTGGAATAATGTATAAGGAACACAAGTTTAAGAAACGAGGTCCTAATCAAATAATTTTGCAGCATTCCAAAAGGGCTAAAACTTGAAAGAAACAAGAAAGATTGAACTGATCCTTAAAGCAGTCTGAAATATGGAAATCATTTTTATTTAAATTTACGCTATTAATTTATAGCATGAACTGATGCCTGCCATCAGATATAGCATGCTACTGGGAAAGAGTAACAGAAATTCAGGAAAGAGATAAAATTGAAGTGGTCATTAAATCATCTATAATTTCAAAGCAGTGGAAATTTCACATCTGCTGAAGATGTTTTCTTTGAGGTAAAATGTGCATATGTGCTGACCACTAGTATATTATTTTAACATCACACTGATAATTAAGCACAGATTAGGACTGAAAATTCATAGCTTCTCCAAGCACAAAGGAACTATCTCATTTGAACATTTTGTTTTATAAATGAAAATTCTCACAGTTGGGATTTCTGGGTGTCCCAGATGAATAGGCTCCAACTGGTAATGGCCAATTACTTAAAATTTCATTTACCTGAAAATTCTTCTCGGCTGGACTTCCTGAAGGACCCCACAAACAGTCTCCCCCTACATGATACGTCAGGCTGAATTTGTATATTTCGGGTCAACAGTCCAACCTCAGCAGCCAAACGAATGTGTCGGCCATCCTCCGTGACATGTACACTTCCTGGGGCAATAGGAGTTGTGGGAAAAAAAAACTTTAAAAACCTGTTTCAAAAATCACTAGCTGGGGACCCAGCAAACCTGAGAAATGAAAACATCCTTTCCCCTCAGAAGTTCTACCAACATTAAGGTCTGCTTTTCCTGGGGCATTCTCCACAAAGGTCAGCTGAGAAATAAAATAACCCATTCACTTGTCTCTCTTTGGGATCAGAGTCAGAGTGTTTGAGCAAGAATTCATTTCTTCTTAATAACTGTGGGTACTGGAACAGGTCACTGGTTCAGGGAAGTCAGGGCAGACCTGTCCAATTAGTGGGGTCCCCAACCTGCCTTAAATAGGTCAGCGTGAGACTTCAGTGTTGGGTTGTACATTGTCCGTGGACCTCTTTCATGAGAGTGAGGAGTCCCACATCAACTGAGGCAGTGACAGAGCAAAAGCAGCTGTGTGTAAAAGGAAAGCGAGAAGCAGCACCAGGCAGCAGCAGCGCCCTCTCATGGTGGATCTTCCACTCATCACGGCCTGAACAGCTTCCACAGCAGTGGGAACTAAGCGTCTTGCTAGTTTGTTTCACTGTCTACCATTTGCATTTCACCTTGCATTTTACTGAAATCATTGCTGAAGATTTCTTTTTTCTTTGCCACTTACTAAAAAAGAAATGCTCCTGGGAACATTGATTTAGACAGAGCTTTAGATATTCCTGGTGAAACCATGGATTTGCCTCTCAAGTATCAGAGACAAAAAGACATTCTCCATCCCCTTTATTTCCACAGTTTATTACTGATTAGCTATATCTCCTGGATTAGATTTATTTATTAGACTGAATCAGGAAGGTTATTGTGATTTATTATTTATATGTAGTACATTCTAACTGTGTATTGTGTATAAAAATATTTGGTACCTTTTTTATTTAAAAAAAGGTCTGGGCTTTTTTCTTTCATTTTTTGCAGTAATAGTAATAGTAGTAGTTAATACATAAAATGTACTTCATGTCAGGAAGGACACATTTCTAAGTATGGAAAATGAAATCATTATTTACAGTAACTACAATATTCTAAGGGATTATAATTCAATGTGTCAGGAAATAAACTGGAAACTCAGTGCCCATAAGTTTTATTCTGGCTTAGCCAGAAAACTGCCCAGTGACCTTGAACAAGACTCTCAACCCTTCTGCTCTTAGATTTGCCATTATAAATAAAAAGCAAAATGTGTGTGCATGTGTATGTGTGTATGTGTATAACATCCAAGTATTCTTTAAAAATAAAGCAACAAAATTAATGAGGGAATAGAGATAAGGCCACGTAGCATGAGTCTAGGTCAACAGGAAGGCATTGTTCTTCCCCTCTGAATGGCAATCAGATCCGAGGTCCCCAGCTAGGTTACCAAACATGGTCTTCCTAGCTCATTCACTTACCTTAACCAACAAACCAAAGCCTTACCAATATGCCGGTGTTTGAGCCGTTCATAGATCCTCACATGGTGGCCCTTGACTTCTTTCACAGTGAGGACCTCTGCTTCATGAGGCTCATAAGAAGAGGAGCTAAGGACTATTTTGTCATGGGGGCGCCAATCCACTGCATCTTCTACTATAATTCTGTAACAGCATAACAATGGCATTGGATATACTAACAGTGCAGCACAAATCATCTATTAACTCCAGAGCAAGAAAAGGAAATCCACTGTGACCAACATATCCCACCAGAGAAACTGAAATAGAAATAAGACATGGCAGTGGAAAAAGGCTTTCGCAAACAGTTTAATTTAGCTAATGGAGTCAGTTTTCTGGCTTGAAAATGTATATGTTACAGAGACAGTGAAGATATTCGATGACCCCTGAAATACAGCAAAGGAATAAAAAACAATAAAAGTTCCAGAGGTTAGTACACATGTCTACATCAGCAACCTTCTTTCTGGATTAGGGAACAGATTCAATAATAACAGCATTTCAGAAAAGAACTTTTCTCTAATTTTCTAGAGAAATATA
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Task1_train_10508
This gene mutation involves PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
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Task1_train_10509
A mutation on Chromosome 6 affecting PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
GGTTTTTATTACGTTTAGTTTATTTGAGTATTCAGATTATTTTGCAGTTCATGAACAGAATATGACCTATGGACAAGACAGCCTCTTCAGAAGCAGGCTAAGTAATGGAAAGAGAGCAATTCAGATTAAAATTTTGTTCCAGAATACATATCAAGTGAATAGCCATAAAGTTAATGGTAACTATTTACTCTTATTTATGGCTGTATTCGGCTGAAGTGGTAAAACAATCTCAGGAATCTCTGTCCGTCTCAAGTTTTTATAGTTTTAGGTTACATTTATGAATGGATCAAATCAGAAATAAAATTTGAATGGTATAATTCAGTGCAAATAAAATATACGACAATCCTTTTGGCAAAGACATAAAAAAAGACCAAGGGAGCACCAGACTCTCTCTCTGATGCTATTAAAATTTAACAGTTCTGGGGCTAGCCTGTAGGTCCGACTCACTGGACTTATGGTTAGGCACAAGTGAAAGAGGCAAAGGGTGGACTCAGGACCATTGCCTCGCCCTCTAAATCCATGGCCACCTTGGGCTTGTGGCAGGGGCTAGAACTTGTTATGCTAATAAGATCCCCTGGATTTGACCAGGATCTACTAAGAGCAATTTATAACAAAATTGTCACTCTTGAGACCTATTTAGCCAGATTCTCCTTTTTACTGTAAGAAGTGGCCTCACAGTGAGCTGCGATTGGAACAAGCAGGTACCATGGTGCTCAGAGAGACCAATGCTGACATGGTATAGAAAAGGAATATGAAATAAACTCCAGGAAATCAAAAGAAGTGGATGGTCCTGACACACTGGTATCCTGAGAAACATGCACAGTAAGAAGATAAGGAAAAACCTTTGGCCTCTGTGACTCTGCAGTCACAGTAGGGTTCCTGATTACTTCAACCTCATGTTAATCTTGACGTAAAACAGACACAGCCCACCCCTAGTGCTCATATCAGCCCTCCATGCTACTCATCTTCCTGACCTCAGATTCTCATCAGAAGTTTTCCTTCTCACCTTCTACATAAACTTCCGTCTTAATTCAGCCTCTCTCTGCATTGGTACTCTCTACCTTGGACTCTCTACTGTTCCTCATACCAATGGTCATAATCAGCCATCCATTTTTTTCTCTTTCTTTTTTTTATTTTTGAGATGGGGTCTCAATCTCTTGCCCAGGTTGAAGTGCAGTGGCATGCTCATGGCTCACTGCAGGCTCAACTTCCTGGGCTCAAGCTATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGAGACTACAGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTATTTAATTTTTTGTAGAGATTAGGTCTCACTCTGTTGTCTAGGCTGATATCAAACTCCTGGCCTCAACTGATCCTCCCACCTTAGCCTTCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACCATGCCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGAGATGGGGTCTCACTTTGCTGCCCTGGCTGGTCTCAAACTCCTAGACTAAAGCACAGCCATCCATCTTTACATGTGCAGTTGTTCCACTACAAACAAATATGACACTGCCCTAAGATGAATTAAAGATATTATTAGTACTAACTACCAATGTCTAGTAAGCATTTTTTGTGGGCTAGGCCTTCTGCTCAAGAGTTTTACATGTTATTCTTTATTTAATTTCCTATCCTTTGAGGTAGGCCCTATGGTCATACTTCTCTATAGAGGAGGAGGCTGAGCCTTAGAGAGGCTCTGTGTATGCTAGCTGGTGAGTGTTGGAGCTGGGATTTAAACCCAGGCAATCAGACTTCAGGGAACATTCACTCAACCATAACACACAGCTGTCCCTTTCAGTTCCTCAGCACTTCACAGCACAAATGTCTGGAATTGAAGGGTGATTGGTGATTTCTGACTATGTGCTCTCAAAACATTCATCCAATTGGATACTTACCCAGATAGGTGAGTTGCCTCAGCTGGCTATTGAAGAACCAGTCACAGCCTTGGTTCTGACCTGGTGATGGAAGAAATGGAAAAGACAGACCCACTCGACTCCCACATCTTAGGAGGATGTCAGGGTAAGGCGGCAAATCTGTGTGCACCAGCAGTAGGTAATTACCAGGAGCAAAGTTGTCAAAGGTTGCTGAGTACTTGAAGTGAAAGAAAAACACAATAGTGCTCATTTAGTAAGGAACCCCATCATTCCACCTACTCCACCACACCACCCTGCCAAAACAACTACAGAGAACGCAGATGGAGTAGTTTAGAAATCATACAATTTAGACCCAGATTGTACTTTTCTTGTGGGAAATGGGAATACTTAAATCTACTTCATAAAAAATTCATAACTAGAGCTACAAAATCAGACTATGAAGACTGAAAGATGCCATAAGGTTCATCTCGTTTAACAATCTCAATTACCAGAGGAGAAAGCCAAGGCCCAGACATATGAATTGACACGTCTCAGGTCAAACAGCTAGAAGAGACAAGGCCAGGTCTAGAATTCCTTTCCAGCTTTTCCCACGACTTGAAGCGACAGGCAATGATAGGCATGTCATCCATTTATCACAGTAATAGCTAACATTGTGGGAGCATTTACTATGCAATCAGCACTATTCAGTCCTCGAAAGGCACCCCTGTCATTGTTACTCTTACTGTCCCATTTTTACATTGAGGAAACTGAGGCAGGCAGAGGTTCAGTAGCTTGCCCCATATCACAAAGCAGAAGAGTGCAGTGTCAGGACATAAACCTAGGGTATCCACCTCCAGAGGCACACCCTACTGTTTTCACTGCATGAAAATTCTCCAGAGTGCTCTCACGGGAATCTCAAGGCAAGAAAAGAGAGGCGTACATCCTTTCTGAAAGCCATGGAGAGAAGATCAAAAGTGATTCTGTTCTGAATTCCTCATGACCATGGCAGGGCTTCTGTCTCCCTAAGATAGGCTCTCAGGACTGTTAGCAAGAATGTGTATGATAAGATAGGAAGAAATATATGTGTTAAAAGTATGAAAATAAGCTTAGGGAATTCCACTGGATTGCTGTTTAAAAATATGGAAAAATGTACCCACTTTCCTCATGGCCATTTTTTTTTTTTTAGTTTTTTTTTTTATTTCTTCTGAAAAAAAAAAAAACAGGATACAGGTGCAGAACGTGCAGGTTTGTTACACAGGTATACGTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATTGACCCATCCTCTAAGTTCCCTCCCCTCACCTCCTACCCCCAAACAGGCCCTGGTGAGTGTTGTTCCCCTCTCCATGTCCATGTGTTCTCAATGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCAGTGTTTGGTTTTCTATTCCTGTGTTAGTTTGCTAACGATGATGGCTTCTAGCTTCATCCATGTCCCTGAAAAGGACATGATCTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGATGTGTATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTTCCATGTCTTTGCTATTGTAAATAGTGTGGCAATAAACATACATGTGCATGTGTCTTTACAGTAGAATAATTTATAATCCTTTGGGTACATACCCTGCAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCCTTGAGGAATTGCCATACTGTCTTCCACAATGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGCGTTCCTGTTTCTCCACAGCCTCACCAGCTTTCATTGTTTCCTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATAGCGGTTTTGATGTGCATTTCTCTGATGATCAATGATGTTGAGCTTTTTTTCATGTTTGTTGGCCGCGTAAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTCTTTTTCTTGTAAATATGTTTAAGTTCCTTGTAAATTCTGGATATTAGACTTCTGTCAGATGGGTAGATTGCAGAAATATTCTCCCATTCTGTAGGTTGCTTGTTCACTCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGCAATT
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Task1_train_10510
The following genetic variant occurs in LOC126859690, PKHD1 (MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr6:51888848-51890047| PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
ACACATAGAGAAATTAGTAGTCAGTACAGCATTAATCACAAAAATAGAATTAACCAAAGAATATCATTTCCATATATATGCTTTAAAATATATGTGTGTGGCATCTTTACTCACCATCCAGGGGCAGAACCAAGCAGCTGAAGGCAGACACTGTAGCATTAGCCAGGACTCGGCAGGGAGCACCACACACAGCAGCTGAGACATTCCCTGGAGAAAATCCCGCTCCAAACACATGCACCAGCCTTCCACCCAGGCAGCCTTTAAAGACAAAGGTACAAGTTCTTGATCATACAGGCAAATCTCCCTTCTTTACTCAACTCAAAATTCAAACATTTGCTTCCTCACTACCCATTCTTCTTTTCACATCCTCAGAATCCGCACAACTGGCTTGAGGTGGCTGCTGGCCTCAGTTTCCTCTCCACTTAGGCTCTGGCCTTGTCTGACTCCAATCACATTCAATATCCTATTGTGTTAAAGAGGTTTTTTTTTAATGTAACAATTTTTATATGGAAAATTAATGCTTATTTATAGTTTTTAAACTTTTTATTCAAAGAGCCATAAAATGAAAATAAAAATTCCCCCAACCATCTGACTCCCTCCCCGGAGGTACCCAGGTATAGAGTTTCTTATGGCTCCTTCCAGAATTTTTAAGCATCTATGTTTCTGATTCAAAGCATTATTCTATCCATATTATTCTGGAACTTGCTTTTTTGCTTCAAAGTATAGCATAGATGTTTTTTCAAAACTCTATGGATCCAGTTCATTTTAGTAGCTACTTAGAATTCCATTATAGGGCCCTGCTACAATTTATTTGACAATTTTCCTATTTATTGAAATTTCCATTTTTTCTCCTCTTTTGCTATTGTTAATAGTGATGCAATAACTGTACATGTTTTGGGACATTTGTATGAGTAAAACCAGTCCACATTTCTAGTTTACACTGAGATACAGAGTTCCCCTCACTACTGCCTTCATACCAGGTCTAGGTGGTACTTAGCCACTTGACTAACTCAAAAATAATGCTTTTGGTTTAAGATGCATTTCTTATTTCCCTGCTCTTCCATCATAAAAAAACATGGAATCTTAGGGAGTAGTGCCTTTATCAAATAAGGAAGCTGAGTCTCAGAAAAGTCAAGCATAAATTAGCAAAATTAGTGATAGACTAGAGCCAAATCCTAGTCCCCACAGTGTTCCACCAAGCTGAGACCAAATTTTTTCTAAGAAATGTCTTAGTTAGTACTCCAACAGTCTAAGATTCTGTTTCTATAGTTTTTTTCCTTACTTTCTAAATCACAACCAAATTTGAACTATCTCAAGTGCAACAAGGCTTTAAGTGAATAGAAATTGAAAGCTTTTCTTCACTGGAGGGAAAGGCTAGGCAATTTTTGGTATATCTAAACGGAGAAAACAGTCCAACCAATTTAATTGTTCTGTGCATTTGGCTTATTATTGTTGAAATATGAGTCCACCTGTGAAATATTACAAAATGATAAAAATTTAATCATACTTAATAAATTTTAAACAACGCAAATTGGCAGATAGGGTCTAAAACTAGGTGAAGGCATTTACGTTCTTAAATGATCAAATTATGAGCTCTTACAAATGGTGTTATTTAATTTAAAATACAAATCCAGTTAATGCATCAAATTAAAATACAATCAAACATTTAGAGAATATGCACAGTTTCCTTGATAAAAATAAAAAAAATCTTCATAAACAGAGCATAACAAAGACAAGCCTCAGGAAGGAATTGGGATTGTAAGAAGCCAGTGGGCTTCTCTTTCCTTCCATCAGGCAGATTGTGTTAATTTTCTACTTTCCAGAAGTGAAAGGAGCTACCAATTCATTTACATAAAGAAAGTGTGCTGTCTTATTTGCTTGACTTACCGAAGTTCTCCGTCACTGCTGTAATAATAACTCTTGAGGTGAACACCAGGGCAGATGAGGCCCACCCTCTGATGCAGTCATAGCCTCTGACGTGGTACTCCCCGGCCGGAAGGGAAGGGACCACGCACTGAAGAACGGTGTGGTTACCAGAGACACCCACACAGGGTGACATTCCTATAAAAATGTCAATGTTTGCAGCTCCTGAGATCTGGGCCACTGCAAAGGTTAAGATGTCATCGCTCTGAGAAATAGAGATCAATTCTGGGGTAAAGGCCTTGTTATAACCAATGACTCCTATGTGATACCAAAGTCCATCTACCTCTATTTCCAGGGCAACAGAGCCATTCCCTGTGGGAACAATGCACCGGATGAGCTCAGCACCGATGTTCACCGTCAGGCAGGTCTGCTGGTCAATATAGACTGACGTGGTGTTCTGTCCTCTCAGGCCTGTGCCCTCTATGGTCAAGAGGCTTCCACCATGTAAGCTGAAATTCTTAGGAAAATAATGAAACACTTGGGGCATAATGTAGAAGTGTCTGGAAACATTACCAGAACAAGCATACCCATTTCTTGTATAAAAAACTGACAGGTAGTGGGGTCCTGGGGCCAAGTCTCTTGTCTGGCACACAACGTGGCTTGCATTAAAAAAAGTTACATTGCAAGGAAGTTGATCATCCACAAATACCATCGGCTCATCAGCTGTGGTGGCTAACCTCTGACCCCTAATCAGCACAGTGGTCAGAGACCCACTGGTGTTTGTGGACAAGGCATCCATGACAGGACTTGCCTCTTCCCTTATGAAAAGAGTGCAATTCCCCTGACACTCGCTGGTTAGCCCATTGACCAGGACTGTGACGTTCAGGGAGAAGGAAGCTCCAGGCAAGGGGTCACCCTCCAGGCTAACCTGGCAGAGAATGGTGTGGTCTCCCAAACTCAAAATCACACAAGTAAAAGGACCCGAGAGGTCAACCCGAACTGACCTCCTTCTAGAGTTAAGAAGCAACCCCCTCACAGTAAGTATGGTCCCACCACATGCCGAACCCTGCGATGGGAAGATGGCCATTATCCGAGGCATCACTGCAAATTGCTGGAGCACCACAGACATATTAGCAAATCCCATCTGCTTCTGACGTACTTGGAGAGGATAGATGCCAGCCTCCAGACTGTGAAGAGGGATGGAGCATCCAGACAGGCTCACGTTGCCCTGGAAGGACTGTGTCTCAACATCACAGTTCAGGTTCCCCAGAAGGATGACTGAGTTGGAGAGGTTACTTCCTCCCACATGCAGGCTCAGGCTGCTATTTGTGATTTCTCCTTGCATGGCAGTGACTACTGGTGTTGCTGCCGCTTCATACATGAAGGTGAAGCCTTTCCCCACCAAGCTTGGTGAAGGACCACGGGCGAAGAACCTGTTGCCAGCCCAGACCTCCACGGCAGCTGGAACAGTGGGAGCGCCCGCATCGGGTATCTGGGGGGCTGGCAGGGTTTCACACCAGATGCTCGCCTCCGTTAAGTTCACAATGTCACAGGACCGATTGCCCACAAGTACCCAAACCAAAGCTGGGTCCCTGCTGAAGCCTATTCCTGAGATGCTGAGGATGGTCCCTCCTAAAGTATGAATACGGAAAGCAAAATATTATAGCTGATATTCTGAACTAAGAATTCATAGCACCTGTGGAAGTCCTAGGTCAATTAAGTGGAAGGTAGGGCATGTGTTAGTGAAACCTCAATTATTTTTTCTCACCCCCACCAAAGCTAAATTTGTGATTATTTAGACAGGAGTCAGATGTGGTAAATTCACATAACAGTAAAATAATACAAATTGTTATATAGGAAGGACGTCTTCAACACAAACTTTTCAAGTACCTTTGTATATCCCAGAAGCCACCACTTTAATCAACTTACACACTAATGAAAAATCAAATTTCTTAGTCTTCTTATCATGTATTATATTATTGGAAATATTATCCTGTATGCTATATATAGACTATTTGTACATTGTCCTGTATACATTCAACTTATATGCTAATGAAAAATCAAATTCATTGAAGTCTTCTATCATTTATATTGTTCTATATAATATTCCAATATTCCATATATTATACATTCTAATATATTCTATTTATTGTACCATATATTCTATATTCCATATACGTGAGAGACATTAAAAGTCATTGAATCTTGCTGGTGAATTTGCTGCTACCTTCAT
ACACATAGAGAAATTAGTAGTCAGTACAGCATTAATCACAAAAATAGAATTAACCAAAGAATATCATTTCCATATATATGCTTTAAAATATATGTGTGTGGCATCTTTACTCACCATCCAGGGGCAGAACCAAGCAGCTGAAGGCAGACACTGTAGCATTAGCCAGGACTCGGCAGGGAGCACCACACACAGCAGCTGAGACATTCCCTGGAGAAAATCCCGCTCCAAACACATGCACCAGCCTTCCACCCAGGCAGCCTTTAAAGACAAAGGTACAAGTTCTTGATCATACAGGCAAATCTCCCTTCTTTACTCAACTCAAAATTCAAACATTTGCTTCCTCACTACCCATTCTTCTTTTCACATCCTCAGAATCCGCACAACTGGCTTGAGGTGGCTGCTGGCCTCAGTTTCCTCTCCACTTAGGCTCTGGCCTTGTCTGACTCCAATCACATTCAATATCCTATTGTGTTAAAGAGGTTTTTTTTTAATGTAACAATTTTTATATGGAAAATTAATGCTTATTTATAGTTTTTAAACTTTTTATTCAAAGAGCCATAAAATGAAAATAAAAATTCCCCCAACCATCTGACTCCCTCCCCGGAGGTACCCAGGTATAGAGTTTCTTATGGCTCCTTCCAGAATTTTTAAGCATCTATGTTTCTGATTCAAAGCATTATTCTATCCATATTATTCTGGAACTTGCTTTTTTGCTTCAAAGTATAGCATAGATGTTTTTTCAAAACTCTATGGATCCAGTTCATTTTAGTAGCTACTTAGAATTCCATTATAGGGCCCTGCTACAATTTATTTGACAATTTTCCTATTTATTGAAATTTCCATTTTTTCTCCTCTTTTGCTATTGTTAATAGTGATGCAATAACTGTACATGTTTTGGGACATTTGTATGAGTAAAACCAGTCCACATTTCTAGTTTACACTGAGATACAGAGTTCCCCTCACTACTGCCTTCATACCAGGTCTAGGTGGTACTTAGCCACTTGACTAACTCAAAAATAATGCTTTTGGTTTAAGATGCATTTCTTATTTCCCTGCTCTTCCATCATAAAAAAACATGGAATCTTAGGGAGTAGTGCCTTTATCAAATAAGGAAGCTGAGTCTCAGAAAAGTCAAGCATAAATTAGCAAAATTAGTGATAGACTAGAGCCAAATCCTAGTCCCCACAGTGTTCCACCAAGCTGAGACCAAATTTTTTCTAAGAAATGTCTTAGTTAGTACTCCAACAGTCTAAGATTCTGTTTCTATAGTTTTTTTCCTTACTTTCTAAATCACAACCAAATTTGAACTATCTCAAGTGCAACAAGGCTTTAAGTGAATAGAAATTGAAAGCTTTTCTTCACTGGAGGGAAAGGCTAGGCAATTTTTGGTATATCTAAACGGAGAAAACAGTCCAACCAATTTAATTGTTCTGTGCATTTGGCTTATTATTGTTGAAATATGAGTCCACCTGTGAAATATTACAAAATGATAAAAATTTAATCATACTTAATAAATTTTAAACAACGCAAATTGGCAGATAGGGTCTAAAACTAGGTGAAGGCATTTACGTTCTTAAATGATCAAATTATGAGCTCTTACAAATGGTGTTATTTAATTTAAAATACAAATCCAGTTAATGCATCAAATTAAAATACAATCAAACATTTAGAGAATATGCACAGTTTCCTTGATAAAAATAAAAAAAATCTTCATAAACAGAGCATAACAAAGACAAGCCTCAGGAAGGAATTGGGATTGTAAGAAGCCAGTGGGCTTCTCTTTCCTTCCATCAGGCAGATTGTGTTAATTTTCTACTTTCCAGAAGTGAAAGGAGCTACCAATTCATTTACATAAAGAAAGTGTGCTGTCTTATTTGCTTGACTTACCGAAGTTCTCCGTCACTGCTGTAATAATAACTCTTGAGGTGAACACCAGGGCAGATGAGGCCCACCCTCTGATGCAGTCATAGCCTCTGACGTGGTACTCCCCGGCCGGAAGGGAAGGGACCACGCACTGAAGAACGGTGTGGTTACCAGAGACACCCACAGAGGGTGACATTCCTATAAAAATGTCAATGTTTGCAGCTCCTGAGATCTGGGCCACTGCAAAGGTTAAGATGTCATCGCTCTGAGAAATAGAGATCAATTCTGGGGTAAAGGCCTTGTTATAACCAATGACTCCTATGTGATACCAAAGTCCATCTACCTCTATTTCCAGGGCAACAGAGCCATTCCCTGTGGGAACAATGCACCGGATGAGCTCAGCACCGATGTTCACCGTCAGGCAGGTCTGCTGGTCAATATAGACTGACGTGGTGTTCTGTCCTCTCAGGCCTGTGCCCTCTATGGTCAAGAGGCTTCCACCATGTAAGCTGAAATTCTTAGGAAAATAATGAAACACTTGGGGCATAATGTAGAAGTGTCTGGAAACATTACCAGAACAAGCATACCCATTTCTTGTATAAAAAACTGACAGGTAGTGGGGTCCTGGGGCCAAGTCTCTTGTCTGGCACACAACGTGGCTTGCATTAAAAAAAGTTACATTGCAAGGAAGTTGATCATCCACAAATACCATCGGCTCATCAGCTGTGGTGGCTAACCTCTGACCCCTAATCAGCACAGTGGTCAGAGACCCACTGGTGTTTGTGGACAAGGCATCCATGACAGGACTTGCCTCTTCCCTTATGAAAAGAGTGCAATTCCCCTGACACTCGCTGGTTAGCCCATTGACCAGGACTGTGACGTTCAGGGAGAAGGAAGCTCCAGGCAAGGGGTCACCCTCCAGGCTAACCTGGCAGAGAATGGTGTGGTCTCCCAAACTCAAAATCACACAAGTAAAAGGACCCGAGAGGTCAACCCGAACTGACCTCCTTCTAGAGTTAAGAAGCAACCCCCTCACAGTAAGTATGGTCCCACCACATGCCGAACCCTGCGATGGGAAGATGGCCATTATCCGAGGCATCACTGCAAATTGCTGGAGCACCACAGACATATTAGCAAATCCCATCTGCTTCTGACGTACTTGGAGAGGATAGATGCCAGCCTCCAGACTGTGAAGAGGGATGGAGCATCCAGACAGGCTCACGTTGCCCTGGAAGGACTGTGTCTCAACATCACAGTTCAGGTTCCCCAGAAGGATGACTGAGTTGGAGAGGTTACTTCCTCCCACATGCAGGCTCAGGCTGCTATTTGTGATTTCTCCTTGCATGGCAGTGACTACTGGTGTTGCTGCCGCTTCATACATGAAGGTGAAGCCTTTCCCCACCAAGCTTGGTGAAGGACCACGGGCGAAGAACCTGTTGCCAGCCCAGACCTCCACGGCAGCTGGAACAGTGGGAGCGCCCGCATCGGGTATCTGGGGGGCTGGCAGGGTTTCACACCAGATGCTCGCCTCCGTTAAGTTCACAATGTCACAGGACCGATTGCCCACAAGTACCCAAACCAAAGCTGGGTCCCTGCTGAAGCCTATTCCTGAGATGCTGAGGATGGTCCCTCCTAAAGTATGAATACGGAAAGCAAAATATTATAGCTGATATTCTGAACTAAGAATTCATAGCACCTGTGGAAGTCCTAGGTCAATTAAGTGGAAGGTAGGGCATGTGTTAGTGAAACCTCAATTATTTTTTCTCACCCCCACCAAAGCTAAATTTGTGATTATTTAGACAGGAGTCAGATGTGGTAAATTCACATAACAGTAAAATAATACAAATTGTTATATAGGAAGGACGTCTTCAACACAAACTTTTCAAGTACCTTTGTATATCCCAGAAGCCACCACTTTAATCAACTTACACACTAATGAAAAATCAAATTTCTTAGTCTTCTTATCATGTATTATATTATTGGAAATATTATCCTGTATGCTATATATAGACTATTTGTACATTGTCCTGTATACATTCAACTTATATGCTAATGAAAAATCAAATTCATTGAAGTCTTCTATCATTTATATTGTTCTATATAATATTCCAATATTCCATATATTATACATTCTAATATATTCTATTTATTGTACCATATATTCTATATTCCATATACGTGAGAGACATTAAAAGTCATTGAATCTTGCTGGTGAATTTGCTGCTACCTTCAT
Task1_train_10511
This mutation occurs in LOC126859690, PKHD1 (MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr6:51888848-51890047| PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
ACACATAGAGAAATTAGTAGTCAGTACAGCATTAATCACAAAAATAGAATTAACCAAAGAATATCATTTCCATATATATGCTTTAAAATATATGTGTGTGGCATCTTTACTCACCATCCAGGGGCAGAACCAAGCAGCTGAAGGCAGACACTGTAGCATTAGCCAGGACTCGGCAGGGAGCACCACACACAGCAGCTGAGACATTCCCTGGAGAAAATCCCGCTCCAAACACATGCACCAGCCTTCCACCCAGGCAGCCTTTAAAGACAAAGGTACAAGTTCTTGATCATACAGGCAAATCTCCCTTCTTTACTCAACTCAAAATTCAAACATTTGCTTCCTCACTACCCATTCTTCTTTTCACATCCTCAGAATCCGCACAACTGGCTTGAGGTGGCTGCTGGCCTCAGTTTCCTCTCCACTTAGGCTCTGGCCTTGTCTGACTCCAATCACATTCAATATCCTATTGTGTTAAAGAGGTTTTTTTTTAATGTAACAATTTTTATATGGAAAATTAATGCTTATTTATAGTTTTTAAACTTTTTATTCAAAGAGCCATAAAATGAAAATAAAAATTCCCCCAACCATCTGACTCCCTCCCCGGAGGTACCCAGGTATAGAGTTTCTTATGGCTCCTTCCAGAATTTTTAAGCATCTATGTTTCTGATTCAAAGCATTATTCTATCCATATTATTCTGGAACTTGCTTTTTTGCTTCAAAGTATAGCATAGATGTTTTTTCAAAACTCTATGGATCCAGTTCATTTTAGTAGCTACTTAGAATTCCATTATAGGGCCCTGCTACAATTTATTTGACAATTTTCCTATTTATTGAAATTTCCATTTTTTCTCCTCTTTTGCTATTGTTAATAGTGATGCAATAACTGTACATGTTTTGGGACATTTGTATGAGTAAAACCAGTCCACATTTCTAGTTTACACTGAGATACAGAGTTCCCCTCACTACTGCCTTCATACCAGGTCTAGGTGGTACTTAGCCACTTGACTAACTCAAAAATAATGCTTTTGGTTTAAGATGCATTTCTTATTTCCCTGCTCTTCCATCATAAAAAAACATGGAATCTTAGGGAGTAGTGCCTTTATCAAATAAGGAAGCTGAGTCTCAGAAAAGTCAAGCATAAATTAGCAAAATTAGTGATAGACTAGAGCCAAATCCTAGTCCCCACAGTGTTCCACCAAGCTGAGACCAAATTTTTTCTAAGAAATGTCTTAGTTAGTACTCCAACAGTCTAAGATTCTGTTTCTATAGTTTTTTTCCTTACTTTCTAAATCACAACCAAATTTGAACTATCTCAAGTGCAACAAGGCTTTAAGTGAATAGAAATTGAAAGCTTTTCTTCACTGGAGGGAAAGGCTAGGCAATTTTTGGTATATCTAAACGGAGAAAACAGTCCAACCAATTTAATTGTTCTGTGCATTTGGCTTATTATTGTTGAAATATGAGTCCACCTGTGAAATATTACAAAATGATAAAAATTTAATCATACTTAATAAATTTTAAACAACGCAAATTGGCAGATAGGGTCTAAAACTAGGTGAAGGCATTTACGTTCTTAAATGATCAAATTATGAGCTCTTACAAATGGTGTTATTTAATTTAAAATACAAATCCAGTTAATGCATCAAATTAAAATACAATCAAACATTTAGAGAATATGCACAGTTTCCTTGATAAAAATAAAAAAAATCTTCATAAACAGAGCATAACAAAGACAAGCCTCAGGAAGGAATTGGGATTGTAAGAAGCCAGTGGGCTTCTCTTTCCTTCCATCAGGCAGATTGTGTTAATTTTCTACTTTCCAGAAGTGAAAGGAGCTACCAATTCATTTACATAAAGAAAGTGTGCTGTCTTATTTGCTTGACTTACCGAAGTTCTCCGTCACTGCTGTAATAATAACTCTTGAGGTGAACACCAGGGCAGATGAGGCCCACCCTCTGATGCAGTCATAGCCTCTGACGTGGTACTCCCCGGCCGGAAGGGAAGGGACCACGCACTGAAGAACGGTGTGGTTACCAGAGACACCCACACAGGGTGACATTCCTATAAAAATGTCAATGTTTGCAGCTCCTGAGATCTGGGCCACTGCAAAGGTTAAGATGTCATCGCTCTGAGAAATAGAGATCAATTCTGGGGTAAAGGCCTTGTTATAACCAATGACTCCTATGTGATACCAAAGTCCATCTACCTCTATTTCCAGGGCAACAGAGCCATTCCCTGTGGGAACAATGCACCGGATGAGCTCAGCACCGATGTTCACCGTCAGGCAGGTCTGCTGGTCAATATAGACTGACGTGGTGTTCTGTCCTCTCAGGCCTGTGCCCTCTATGGTCAAGAGGCTTCCACCATGTAAGCTGAAATTCTTAGGAAAATAATGAAACACTTGGGGCATAATGTAGAAGTGTCTGGAAACATTACCAGAACAAGCATACCCATTTCTTGTATAAAAAACTGACAGGTAGTGGGGTCCTGGGGCCAAGTCTCTTGTCTGGCACACAACGTGGCTTGCATTAAAAAAAGTTACATTGCAAGGAAGTTGATCATCCACAAATACCATCGGCTCATCAGCTGTGGTGGCTAACCTCTGACCCCTAATCAGCACAGTGGTCAGAGACCCACTGGTGTTTGTGGACAAGGCATCCATGACAGGACTTGCCTCTTCCCTTATGAAAAGAGTGCAATTCCCCTGACACTCGCTGGTTAGCCCATTGACCAGGACTGTGACGTTCAGGGAGAAGGAAGCTCCAGGCAAGGGGTCACCCTCCAGGCTAACCTGGCAGAGAATGGTGTGGTCTCCCAAACTCAAAATCACACAAGTAAAAGGACCCGAGAGGTCAACCCGAACTGACCTCCTTCTAGAGTTAAGAAGCAACCCCCTCACAGTAAGTATGGTCCCACCACATGCCGAACCCTGCGATGGGAAGATGGCCATTATCCGAGGCATCACTGCAAATTGCTGGAGCACCACAGACATATTAGCAAATCCCATCTGCTTCTGACGTACTTGGAGAGGATAGATGCCAGCCTCCAGACTGTGAAGAGGGATGGAGCATCCAGACAGGCTCACGTTGCCCTGGAAGGACTGTGTCTCAACATCACAGTTCAGGTTCCCCAGAAGGATGACTGAGTTGGAGAGGTTACTTCCTCCCACATGCAGGCTCAGGCTGCTATTTGTGATTTCTCCTTGCATGGCAGTGACTACTGGTGTTGCTGCCGCTTCATACATGAAGGTGAAGCCTTTCCCCACCAAGCTTGGTGAAGGACCACGGGCGAAGAACCTGTTGCCAGCCCAGACCTCCACGGCAGCTGGAACAGTGGGAGCGCCCGCATCGGGTATCTGGGGGGCTGGCAGGGTTTCACACCAGATGCTCGCCTCCGTTAAGTTCACAATGTCACAGGACCGATTGCCCACAAGTACCCAAACCAAAGCTGGGTCCCTGCTGAAGCCTATTCCTGAGATGCTGAGGATGGTCCCTCCTAAAGTATGAATACGGAAAGCAAAATATTATAGCTGATATTCTGAACTAAGAATTCATAGCACCTGTGGAAGTCCTAGGTCAATTAAGTGGAAGGTAGGGCATGTGTTAGTGAAACCTCAATTATTTTTTCTCACCCCCACCAAAGCTAAATTTGTGATTATTTAGACAGGAGTCAGATGTGGTAAATTCACATAACAGTAAAATAATACAAATTGTTATATAGGAAGGACGTCTTCAACACAAACTTTTCAAGTACCTTTGTATATCCCAGAAGCCACCACTTTAATCAACTTACACACTAATGAAAAATCAAATTTCTTAGTCTTCTTATCATGTATTATATTATTGGAAATATTATCCTGTATGCTATATATAGACTATTTGTACATTGTCCTGTATACATTCAACTTATATGCTAATGAAAAATCAAATTCATTGAAGTCTTCTATCATTTATATTGTTCTATATAATATTCCAATATTCCATATATTATACATTCTAATATATTCTATTTATTGTACCATATATTCTATATTCCATATACGTGAGAGACATTAAAAGTCATTGAATCTTGCTGGTGAATTTGCTGCTACCTTCAT
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This alteration occurs within gene LOC126859690, PKHD1 (MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr6:51888848-51890047| PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) located on Chromosome 6. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
AAAATATATGTGTGTGGCATCTTTACTCACCATCCAGGGGCAGAACCAAGCAGCTGAAGGCAGACACTGTAGCATTAGCCAGGACTCGGCAGGGAGCACCACACACAGCAGCTGAGACATTCCCTGGAGAAAATCCCGCTCCAAACACATGCACCAGCCTTCCACCCAGGCAGCCTTTAAAGACAAAGGTACAAGTTCTTGATCATACAGGCAAATCTCCCTTCTTTACTCAACTCAAAATTCAAACATTTGCTTCCTCACTACCCATTCTTCTTTTCACATCCTCAGAATCCGCACAACTGGCTTGAGGTGGCTGCTGGCCTCAGTTTCCTCTCCACTTAGGCTCTGGCCTTGTCTGACTCCAATCACATTCAATATCCTATTGTGTTAAAGAGGTTTTTTTTTAATGTAACAATTTTTATATGGAAAATTAATGCTTATTTATAGTTTTTAAACTTTTTATTCAAAGAGCCATAAAATGAAAATAAAAATTCCCCCAACCATCTGACTCCCTCCCCGGAGGTACCCAGGTATAGAGTTTCTTATGGCTCCTTCCAGAATTTTTAAGCATCTATGTTTCTGATTCAAAGCATTATTCTATCCATATTATTCTGGAACTTGCTTTTTTGCTTCAAAGTATAGCATAGATGTTTTTTCAAAACTCTATGGATCCAGTTCATTTTAGTAGCTACTTAGAATTCCATTATAGGGCCCTGCTACAATTTATTTGACAATTTTCCTATTTATTGAAATTTCCATTTTTTCTCCTCTTTTGCTATTGTTAATAGTGATGCAATAACTGTACATGTTTTGGGACATTTGTATGAGTAAAACCAGTCCACATTTCTAGTTTACACTGAGATACAGAGTTCCCCTCACTACTGCCTTCATACCAGGTCTAGGTGGTACTTAGCCACTTGACTAACTCAAAAATAATGCTTTTGGTTTAAGATGCATTTCTTATTTCCCTGCTCTTCCATCATAAAAAAACATGGAATCTTAGGGAGTAGTGCCTTTATCAAATAAGGAAGCTGAGTCTCAGAAAAGTCAAGCATAAATTAGCAAAATTAGTGATAGACTAGAGCCAAATCCTAGTCCCCACAGTGTTCCACCAAGCTGAGACCAAATTTTTTCTAAGAAATGTCTTAGTTAGTACTCCAACAGTCTAAGATTCTGTTTCTATAGTTTTTTTCCTTACTTTCTAAATCACAACCAAATTTGAACTATCTCAAGTGCAACAAGGCTTTAAGTGAATAGAAATTGAAAGCTTTTCTTCACTGGAGGGAAAGGCTAGGCAATTTTTGGTATATCTAAACGGAGAAAACAGTCCAACCAATTTAATTGTTCTGTGCATTTGGCTTATTATTGTTGAAATATGAGTCCACCTGTGAAATATTACAAAATGATAAAAATTTAATCATACTTAATAAATTTTAAACAACGCAAATTGGCAGATAGGGTCTAAAACTAGGTGAAGGCATTTACGTTCTTAAATGATCAAATTATGAGCTCTTACAAATGGTGTTATTTAATTTAAAATACAAATCCAGTTAATGCATCAAATTAAAATACAATCAAACATTTAGAGAATATGCACAGTTTCCTTGATAAAAATAAAAAAAATCTTCATAAACAGAGCATAACAAAGACAAGCCTCAGGAAGGAATTGGGATTGTAAGAAGCCAGTGGGCTTCTCTTTCCTTCCATCAGGCAGATTGTGTTAATTTTCTACTTTCCAGAAGTGAAAGGAGCTACCAATTCATTTACATAAAGAAAGTGTGCTGTCTTATTTGCTTGACTTACCGAAGTTCTCCGTCACTGCTGTAATAATAACTCTTGAGGTGAACACCAGGGCAGATGAGGCCCACCCTCTGATGCAGTCATAGCCTCTGACGTGGTACTCCCCGGCCGGAAGGGAAGGGACCACGCACTGAAGAACGGTGTGGTTACCAGAGACACCCACACAGGGTGACATTCCTATAAAAATGTCAATGTTTGCAGCTCCTGAGATCTGGGCCACTGCAAAGGTTAAGATGTCATCGCTCTGAGAAATAGAGATCAATTCTGGGGTAAAGGCCTTGTTATAACCAATGACTCCTATGTGATACCAAAGTCCATCTACCTCTATTTCCAGGGCAACAGAGCCATTCCCTGTGGGAACAATGCACCGGATGAGCTCAGCACCGATGTTCACCGTCAGGCAGGTCTGCTGGTCAATATAGACTGACGTGGTGTTCTGTCCTCTCAGGCCTGTGCCCTCTATGGTCAAGAGGCTTCCACCATGTAAGCTGAAATTCTTAGGAAAATAATGAAACACTTGGGGCATAATGTAGAAGTGTCTGGAAACATTACCAGAACAAGCATACCCATTTCTTGTATAAAAAACTGACAGGTAGTGGGGTCCTGGGGCCAAGTCTCTTGTCTGGCACACAACGTGGCTTGCATTAAAAAAAGTTACATTGCAAGGAAGTTGATCATCCACAAATACCATCGGCTCATCAGCTGTGGTGGCTAACCTCTGACCCCTAATCAGCACAGTGGTCAGAGACCCACTGGTGTTTGTGGACAAGGCATCCATGACAGGACTTGCCTCTTCCCTTATGAAAAGAGTGCAATTCCCCTGACACTCGCTGGTTAGCCCATTGACCAGGACTGTGACGTTCAGGGAGAAGGAAGCTCCAGGCAAGGGGTCACCCTCCAGGCTAACCTGGCAGAGAATGGTGTGGTCTCCCAAACTCAAAATCACACAAGTAAAAGGACCCGAGAGGTCAACCCGAACTGACCTCCTTCTAGAGTTAAGAAGCAACCCCCTCACAGTAAGTATGGTCCCACCACATGCCGAACCCTGCGATGGGAAGATGGCCATTATCCGAGGCATCACTGCAAATTGCTGGAGCACCACAGACATATTAGCAAATCCCATCTGCTTCTGACGTACTTGGAGAGGATAGATGCCAGCCTCCAGACTGTGAAGAGGGATGGAGCATCCAGACAGGCTCACGTTGCCCTGGAAGGACTGTGTCTCAACATCACAGTTCAGGTTCCCCAGAAGGATGACTGAGTTGGAGAGGTTACTTCCTCCCACATGCAGGCTCAGGCTGCTATTTGTGATTTCTCCTTGCATGGCAGTGACTACTGGTGTTGCTGCCGCTTCATACATGAAGGTGAAGCCTTTCCCCACCAAGCTTGGTGAAGGACCACGGGCGAAGAACCTGTTGCCAGCCCAGACCTCCACGGCAGCTGGAACAGTGGGAGCGCCCGCATCGGGTATCTGGGGGGCTGGCAGGGTTTCACACCAGATGCTCGCCTCCGTTAAGTTCACAATGTCACAGGACCGATTGCCCACAAGTACCCAAACCAAAGCTGGGTCCCTGCTGAAGCCTATTCCTGAGATGCTGAGGATGGTCCCTCCTAAAGTATGAATACGGAAAGCAAAATATTATAGCTGATATTCTGAACTAAGAATTCATAGCACCTGTGGAAGTCCTAGGTCAATTAAGTGGAAGGTAGGGCATGTGTTAGTGAAACCTCAATTATTTTTTCTCACCCCCACCAAAGCTAAATTTGTGATTATTTAGACAGGAGTCAGATGTGGTAAATTCACATAACAGTAAAATAATACAAATTGTTATATAGGAAGGACGTCTTCAACACAAACTTTTCAAGTACCTTTGTATATCCCAGAAGCCACCACTTTAATCAACTTACACACTAATGAAAAATCAAATTTCTTAGTCTTCTTATCATGTATTATATTATTGGAAATATTATCCTGTATGCTATATATAGACTATTTGTACATTGTCCTGTATACATTCAACTTATATGCTAATGAAAAATCAAATTCATTGAAGTCTTCTATCATTTATATTGTTCTATATAATATTCCAATATTCCATATATTATACATTCTAATATATTCTATTTATTGTACCATATATTCTATATTCCATATACGTGAGAGACATTAAAAGTCATTGAATCTTGCTGGTGAATTTGCTGCTACCTTCATAGAATCTTTGCCTTACTCTCCAGTAGAGAGGCCACCAAAGATCAAACCCCATCTTCAGGACAGGATTGGAGCAACATGACCCAC
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Task1_train_10513
This variant impacts the gene LOC126859690, PKHD1 (MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr6:51888848-51890047| PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
CCAGCCTTCCACCCAGGCAGCCTTTAAAGACAAAGGTACAAGTTCTTGATCATACAGGCAAATCTCCCTTCTTTACTCAACTCAAAATTCAAACATTTGCTTCCTCACTACCCATTCTTCTTTTCACATCCTCAGAATCCGCACAACTGGCTTGAGGTGGCTGCTGGCCTCAGTTTCCTCTCCACTTAGGCTCTGGCCTTGTCTGACTCCAATCACATTCAATATCCTATTGTGTTAAAGAGGTTTTTTTTTAATGTAACAATTTTTATATGGAAAATTAATGCTTATTTATAGTTTTTAAACTTTTTATTCAAAGAGCCATAAAATGAAAATAAAAATTCCCCCAACCATCTGACTCCCTCCCCGGAGGTACCCAGGTATAGAGTTTCTTATGGCTCCTTCCAGAATTTTTAAGCATCTATGTTTCTGATTCAAAGCATTATTCTATCCATATTATTCTGGAACTTGCTTTTTTGCTTCAAAGTATAGCATAGATGTTTTTTCAAAACTCTATGGATCCAGTTCATTTTAGTAGCTACTTAGAATTCCATTATAGGGCCCTGCTACAATTTATTTGACAATTTTCCTATTTATTGAAATTTCCATTTTTTCTCCTCTTTTGCTATTGTTAATAGTGATGCAATAACTGTACATGTTTTGGGACATTTGTATGAGTAAAACCAGTCCACATTTCTAGTTTACACTGAGATACAGAGTTCCCCTCACTACTGCCTTCATACCAGGTCTAGGTGGTACTTAGCCACTTGACTAACTCAAAAATAATGCTTTTGGTTTAAGATGCATTTCTTATTTCCCTGCTCTTCCATCATAAAAAAACATGGAATCTTAGGGAGTAGTGCCTTTATCAAATAAGGAAGCTGAGTCTCAGAAAAGTCAAGCATAAATTAGCAAAATTAGTGATAGACTAGAGCCAAATCCTAGTCCCCACAGTGTTCCACCAAGCTGAGACCAAATTTTTTCTAAGAAATGTCTTAGTTAGTACTCCAACAGTCTAAGATTCTGTTTCTATAGTTTTTTTCCTTACTTTCTAAATCACAACCAAATTTGAACTATCTCAAGTGCAACAAGGCTTTAAGTGAATAGAAATTGAAAGCTTTTCTTCACTGGAGGGAAAGGCTAGGCAATTTTTGGTATATCTAAACGGAGAAAACAGTCCAACCAATTTAATTGTTCTGTGCATTTGGCTTATTATTGTTGAAATATGAGTCCACCTGTGAAATATTACAAAATGATAAAAATTTAATCATACTTAATAAATTTTAAACAACGCAAATTGGCAGATAGGGTCTAAAACTAGGTGAAGGCATTTACGTTCTTAAATGATCAAATTATGAGCTCTTACAAATGGTGTTATTTAATTTAAAATACAAATCCAGTTAATGCATCAAATTAAAATACAATCAAACATTTAGAGAATATGCACAGTTTCCTTGATAAAAATAAAAAAAATCTTCATAAACAGAGCATAACAAAGACAAGCCTCAGGAAGGAATTGGGATTGTAAGAAGCCAGTGGGCTTCTCTTTCCTTCCATCAGGCAGATTGTGTTAATTTTCTACTTTCCAGAAGTGAAAGGAGCTACCAATTCATTTACATAAAGAAAGTGTGCTGTCTTATTTGCTTGACTTACCGAAGTTCTCCGTCACTGCTGTAATAATAACTCTTGAGGTGAACACCAGGGCAGATGAGGCCCACCCTCTGATGCAGTCATAGCCTCTGACGTGGTACTCCCCGGCCGGAAGGGAAGGGACCACGCACTGAAGAACGGTGTGGTTACCAGAGACACCCACACAGGGTGACATTCCTATAAAAATGTCAATGTTTGCAGCTCCTGAGATCTGGGCCACTGCAAAGGTTAAGATGTCATCGCTCTGAGAAATAGAGATCAATTCTGGGGTAAAGGCCTTGTTATAACCAATGACTCCTATGTGATACCAAAGTCCATCTACCTCTATTTCCAGGGCAACAGAGCCATTCCCTGTGGGAACAATGCACCGGATGAGCTCAGCACCGATGTTCACCGTCAGGCAGGTCTGCTGGTCAATATAGACTGACGTGGTGTTCTGTCCTCTCAGGCCTGTGCCCTCTATGGTCAAGAGGCTTCCACCATGTAAGCTGAAATTCTTAGGAAAATAATGAAACACTTGGGGCATAATGTAGAAGTGTCTGGAAACATTACCAGAACAAGCATACCCATTTCTTGTATAAAAAACTGACAGGTAGTGGGGTCCTGGGGCCAAGTCTCTTGTCTGGCACACAACGTGGCTTGCATTAAAAAAAGTTACATTGCAAGGAAGTTGATCATCCACAAATACCATCGGCTCATCAGCTGTGGTGGCTAACCTCTGACCCCTAATCAGCACAGTGGTCAGAGACCCACTGGTGTTTGTGGACAAGGCATCCATGACAGGACTTGCCTCTTCCCTTATGAAAAGAGTGCAATTCCCCTGACACTCGCTGGTTAGCCCATTGACCAGGACTGTGACGTTCAGGGAGAAGGAAGCTCCAGGCAAGGGGTCACCCTCCAGGCTAACCTGGCAGAGAATGGTGTGGTCTCCCAAACTCAAAATCACACAAGTAAAAGGACCCGAGAGGTCAACCCGAACTGACCTCCTTCTAGAGTTAAGAAGCAACCCCCTCACAGTAAGTATGGTCCCACCACATGCCGAACCCTGCGATGGGAAGATGGCCATTATCCGAGGCATCACTGCAAATTGCTGGAGCACCACAGACATATTAGCAAATCCCATCTGCTTCTGACGTACTTGGAGAGGATAGATGCCAGCCTCCAGACTGTGAAGAGGGATGGAGCATCCAGACAGGCTCACGTTGCCCTGGAAGGACTGTGTCTCAACATCACAGTTCAGGTTCCCCAGAAGGATGACTGAGTTGGAGAGGTTACTTCCTCCCACATGCAGGCTCAGGCTGCTATTTGTGATTTCTCCTTGCATGGCAGTGACTACTGGTGTTGCTGCCGCTTCATACATGAAGGTGAAGCCTTTCCCCACCAAGCTTGGTGAAGGACCACGGGCGAAGAACCTGTTGCCAGCCCAGACCTCCACGGCAGCTGGAACAGTGGGAGCGCCCGCATCGGGTATCTGGGGGGCTGGCAGGGTTTCACACCAGATGCTCGCCTCCGTTAAGTTCACAATGTCACAGGACCGATTGCCCACAAGTACCCAAACCAAAGCTGGGTCCCTGCTGAAGCCTATTCCTGAGATGCTGAGGATGGTCCCTCCTAAAGTATGAATACGGAAAGCAAAATATTATAGCTGATATTCTGAACTAAGAATTCATAGCACCTGTGGAAGTCCTAGGTCAATTAAGTGGAAGGTAGGGCATGTGTTAGTGAAACCTCAATTATTTTTTCTCACCCCCACCAAAGCTAAATTTGTGATTATTTAGACAGGAGTCAGATGTGGTAAATTCACATAACAGTAAAATAATACAAATTGTTATATAGGAAGGACGTCTTCAACACAAACTTTTCAAGTACCTTTGTATATCCCAGAAGCCACCACTTTAATCAACTTACACACTAATGAAAAATCAAATTTCTTAGTCTTCTTATCATGTATTATATTATTGGAAATATTATCCTGTATGCTATATATAGACTATTTGTACATTGTCCTGTATACATTCAACTTATATGCTAATGAAAAATCAAATTCATTGAAGTCTTCTATCATTTATATTGTTCTATATAATATTCCAATATTCCATATATTATACATTCTAATATATTCTATTTATTGTACCATATATTCTATATTCCATATACGTGAGAGACATTAAAAGTCATTGAATCTTGCTGGTGAATTTGCTGCTACCTTCATAGAATCTTTGCCTTACTCTCCAGTAGAGAGGCCACCAAAGATCAAACCCCATCTTCAGGACAGGATTGGAGCAACATGACCCACAGCATAACCAAACTGTACAACGTGGCTTTTAAGAGGATTTTACTATACCCAAAAAGGATAATGTGCTATCTTACACATGATCACAACTATTATTGACATGCCACTAGATTGTTTTCCATTCTTTCTGAAAATAGTTTTAGAGATTGGTCTATT
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Task1_train_10514
Here’s a variant in LOC126859690, PKHD1 (MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr6:51888848-51890047| PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) located on Chromosome 6. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
CCAGCCTTCCACCCAGGCAGCCTTTAAAGACAAAGGTACAAGTTCTTGATCATACAGGCAAATCTCCCTTCTTTACTCAACTCAAAATTCAAACATTTGCTTCCTCACTACCCATTCTTCTTTTCACATCCTCAGAATCCGCACAACTGGCTTGAGGTGGCTGCTGGCCTCAGTTTCCTCTCCACTTAGGCTCTGGCCTTGTCTGACTCCAATCACATTCAATATCCTATTGTGTTAAAGAGGTTTTTTTTTAATGTAACAATTTTTATATGGAAAATTAATGCTTATTTATAGTTTTTAAACTTTTTATTCAAAGAGCCATAAAATGAAAATAAAAATTCCCCCAACCATCTGACTCCCTCCCCGGAGGTACCCAGGTATAGAGTTTCTTATGGCTCCTTCCAGAATTTTTAAGCATCTATGTTTCTGATTCAAAGCATTATTCTATCCATATTATTCTGGAACTTGCTTTTTTGCTTCAAAGTATAGCATAGATGTTTTTTCAAAACTCTATGGATCCAGTTCATTTTAGTAGCTACTTAGAATTCCATTATAGGGCCCTGCTACAATTTATTTGACAATTTTCCTATTTATTGAAATTTCCATTTTTTCTCCTCTTTTGCTATTGTTAATAGTGATGCAATAACTGTACATGTTTTGGGACATTTGTATGAGTAAAACCAGTCCACATTTCTAGTTTACACTGAGATACAGAGTTCCCCTCACTACTGCCTTCATACCAGGTCTAGGTGGTACTTAGCCACTTGACTAACTCAAAAATAATGCTTTTGGTTTAAGATGCATTTCTTATTTCCCTGCTCTTCCATCATAAAAAAACATGGAATCTTAGGGAGTAGTGCCTTTATCAAATAAGGAAGCTGAGTCTCAGAAAAGTCAAGCATAAATTAGCAAAATTAGTGATAGACTAGAGCCAAATCCTAGTCCCCACAGTGTTCCACCAAGCTGAGACCAAATTTTTTCTAAGAAATGTCTTAGTTAGTACTCCAACAGTCTAAGATTCTGTTTCTATAGTTTTTTTCCTTACTTTCTAAATCACAACCAAATTTGAACTATCTCAAGTGCAACAAGGCTTTAAGTGAATAGAAATTGAAAGCTTTTCTTCACTGGAGGGAAAGGCTAGGCAATTTTTGGTATATCTAAACGGAGAAAACAGTCCAACCAATTTAATTGTTCTGTGCATTTGGCTTATTATTGTTGAAATATGAGTCCACCTGTGAAATATTACAAAATGATAAAAATTTAATCATACTTAATAAATTTTAAACAACGCAAATTGGCAGATAGGGTCTAAAACTAGGTGAAGGCATTTACGTTCTTAAATGATCAAATTATGAGCTCTTACAAATGGTGTTATTTAATTTAAAATACAAATCCAGTTAATGCATCAAATTAAAATACAATCAAACATTTAGAGAATATGCACAGTTTCCTTGATAAAAATAAAAAAAATCTTCATAAACAGAGCATAACAAAGACAAGCCTCAGGAAGGAATTGGGATTGTAAGAAGCCAGTGGGCTTCTCTTTCCTTCCATCAGGCAGATTGTGTTAATTTTCTACTTTCCAGAAGTGAAAGGAGCTACCAATTCATTTACATAAAGAAAGTGTGCTGTCTTATTTGCTTGACTTACCGAAGTTCTCCGTCACTGCTGTAATAATAACTCTTGAGGTGAACACCAGGGCAGATGAGGCCCACCCTCTGATGCAGTCATAGCCTCTGACGTGGTACTCCCCGGCCGGAAGGGAAGGGACCACGCACTGAAGAACGGTGTGGTTACCAGAGACACCCACACAGGGTGACATTCCTATAAAAATGTCAATGTTTGCAGCTCCTGAGATCTGGGCCACTGCAAAGGTTAAGATGTCATCGCTCTGAGAAATAGAGATCAATTCTGGGGTAAAGGCCTTGTTATAACCAATGACTCCTATGTGATACCAAAGTCCATCTACCTCTATTTCCAGGGCAACAGAGCCATTCCCTGTGGGAACAATGCACCGGATGAGCTCAGCACCGATGTTCACCGTCAGGCAGGTCTGCTGGTCAATATAGACTGACGTGGTGTTCTGTCCTCTCAGGCCTGTGCCCTCTATGGTCAAGAGGCTTCCACCATGTAAGCTGAAATTCTTAGGAAAATAATGAAACACTTGGGGCATAATGTAGAAGTGTCTGGAAACATTACCAGAACAAGCATACCCATTTCTTGTATAAAAAACTGACAGGTAGTGGGGTCCTGGGGCCAAGTCTCTTGTCTGGCACACAACGTGGCTTGCATTAAAAAAAGTTACATTGCAAGGAAGTTGATCATCCACAAATACCATCGGCTCATCAGCTGTGGTGGCTAACCTCTGACCCCTAATCAGCACAGTGGTCAGAGACCCACTGGTGTTTGTGGACAAGGCATCCATGACAGGACTTGCCTCTTCCCTTATGAAAAGAGTGCAATTCCCCTGACACTCGCTGGTTAGCCCATTGACCAGGACTGTGACGTTCAGGGAGAAGGAAGCTCCAGGCAAGGGGTCACCCTCCAGGCTAACCTGGCAGAGAATGGTGTGGTCTCCCAAACTCAAAATCACACAAGTAAAAGGACCCGAGAGGTCAACCCGAACTGACCTCCTTCTAGAGTTAAGAAGCAACCCCCTCACAGTAAGTATGGTCCCACCACATGCCGAACCCTGCGATGGGAAGATGGCCATTATCCGAGGCATCACTGCAAATTGCTGGAGCACCACAGACATATTAGCAAATCCCATCTGCTTCTGACGTACTTGGAGAGGATAGATGCCAGCCTCCAGACTGTGAAGAGGGATGGAGCATCCAGACAGGCTCACGTTGCCCTGGAAGGACTGTGTCTCAACATCACAGTTCAGGTTCCCCAGAAGGATGACTGAGTTGGAGAGGTTACTTCCTCCCACATGCAGGCTCAGGCTGCTATTTGTGATTTCTCCTTGCATGGCAGTGACTACTGGTGTTGCTGCCGCTTCATACATGAAGGTGAAGCCTTTCCCCACCAAGCTTGGTGAAGGACCACGGGCGAAGAACCTGTTGCCAGCCCAGACCTCCACGGCAGCTGGAACAGTGGGAGCGCCCGCATCGGGTATCTGGGGGGCTGGCAGGGTTTCACACCAGATGCTCGCCTCCGTTAAGTTCACAATGTCACAGGACCGATTGCCCACAAGTACCCAAACCAAAGCTGGGTCCCTGCTGAAGCCTATTCCTGAGATGCTGAGGATGGTCCCTCCTAAAGTATGAATACGGAAAGCAAAATATTATAGCTGATATTCTGAACTAAGAATTCATAGCACCTGTGGAAGTCCTAGGTCAATTAAGTGGAAGGTAGGGCATGTGTTAGTGAAACCTCAATTATTTTTTCTCACCCCCACCAAAGCTAAATTTGTGATTATTTAGACAGGAGTCAGATGTGGTAAATTCACATAACAGTAAAATAATACAAATTGTTATATAGGAAGGACGTCTTCAACACAAACTTTTCAAGTACCTTTGTATATCCCAGAAGCCACCACTTTAATCAACTTACACACTAATGAAAAATCAAATTTCTTAGTCTTCTTATCATGTATTATATTATTGGAAATATTATCCTGTATGCTATATATAGACTATTTGTACATTGTCCTGTATACATTCAACTTATATGCTAATGAAAAATCAAATTCATTGAAGTCTTCTATCATTTATATTGTTCTATATAATATTCCAATATTCCATATATTATACATTCTAATATATTCTATTTATTGTACCATATATTCTATATTCCATATACGTGAGAGACATTAAAAGTCATTGAATCTTGCTGGTGAATTTGCTGCTACCTTCATAGAATCTTTGCCTTACTCTCCAGTAGAGAGGCCACCAAAGATCAAACCCCATCTTCAGGACAGGATTGGAGCAACATGACCCACAGCATAACCAAACTGTACAACGTGGCTTTTAAGAGGATTTTACTATACCCAAAAAGGATAATGTGCTATCTTACACATGATCACAACTATTATTGACATGCCACTAGATTGTTTTCCATTCTTTCTGAAAATAGTTTTAGAGATTGGTCTATT
CCAGCCTTCCACCCAGGCAGCCTTTAAAGACAAAGGTACAAGTTCTTGATCATACAGGCAAATCTCCCTTCTTTACTCAACTCAAAATTCAAACATTTGCTTCCTCACTACCCATTCTTCTTTTCACATCCTCAGAATCCGCACAACTGGCTTGAGGTGGCTGCTGGCCTCAGTTTCCTCTCCACTTAGGCTCTGGCCTTGTCTGACTCCAATCACATTCAATATCCTATTGTGTTAAAGAGGTTTTTTTTTAATGTAACAATTTTTATATGGAAAATTAATGCTTATTTATAGTTTTTAAACTTTTTATTCAAAGAGCCATAAAATGAAAATAAAAATTCCCCCAACCATCTGACTCCCTCCCCGGAGGTACCCAGGTATAGAGTTTCTTATGGCTCCTTCCAGAATTTTTAAGCATCTATGTTTCTGATTCAAAGCATTATTCTATCCATATTATTCTGGAACTTGCTTTTTTGCTTCAAAGTATAGCATAGATGTTTTTTCAAAACTCTATGGATCCAGTTCATTTTAGTAGCTACTTAGAATTCCATTATAGGGCCCTGCTACAATTTATTTGACAATTTTCCTATTTATTGAAATTTCCATTTTTTCTCCTCTTTTGCTATTGTTAATAGTGATGCAATAACTGTACATGTTTTGGGACATTTGTATGAGTAAAACCAGTCCACATTTCTAGTTTACACTGAGATACAGAGTTCCCCTCACTACTGCCTTCATACCAGGTCTAGGTGGTACTTAGCCACTTGACTAACTCAAAAATAATGCTTTTGGTTTAAGATGCATTTCTTATTTCCCTGCTCTTCCATCATAAAAAAACATGGAATCTTAGGGAGTAGTGCCTTTATCAAATAAGGAAGCTGAGTCTCAGAAAAGTCAAGCATAAATTAGCAAAATTAGTGATAGACTAGAGCCAAATCCTAGTCCCCACAGTGTTCCACCAAGCTGAGACCAAATTTTTTCTAAGAAATGTCTTAGTTAGTACTCCAACAGTCTAAGATTCTGTTTCTATAGTTTTTTTCCTTACTTTCTAAATCACAACCAAATTTGAACTATCTCAAGTGCAACAAGGCTTTAAGTGAATAGAAATTGAAAGCTTTTCTTCACTGGAGGGAAAGGCTAGGCAATTTTTGGTATATCTAAACGGAGAAAACAGTCCAACCAATTTAATTGTTCTGTGCATTTGGCTTATTATTGTTGAAATATGAGTCCACCTGTGAAATATTACAAAATGATAAAAATTTAATCATACTTAATAAATTTTAAACAACGCAAATTGGCAGATAGGGTCTAAAACTAGGTGAAGGCATTTACGTTCTTAAATGATCAAATTATGAGCTCTTACAAATGGTGTTATTTAATTTAAAATACAAATCCAGTTAATGCATCAAATTAAAATACAATCAAACATTTAGAGAATATGCACAGTTTCCTTGATAAAAATAAAAAAAATCTTCATAAACAGAGCATAACAAAGACAAGCCTCAGGAAGGAATTGGGATTGTAAGAAGCCAGTGGGCTTCTCTTTCCTTCCATCAGGCAGATTGTGTTAATTTTCTACTTTCCAGAAGTGAAAGGAGCTACCAATTCATTTACATAAAGAAAGTGTGCTGTCTTATTTGCTTGACTTACCGAAGTTCTCCGTCACTGCTGTAATAATAACTCTTGAGGTGAACACCAGGGCAGATGAGGCCCACCCTCTGATGCAGTCATAGCCTCTGACGTGGTACTCCCCGGCCGGAAGGGAAGGGACCACGCACTGAAGAACGGTGTGGTTACCAGAGACACCCACACAGGGTGACATTCCTATAAAAATGTCAATGTTTGCAGCTCCTGAGATCTGGGCCACTGCAAAGGTTAAGATGTCATCGCTCTGAGAAATAGAGATCAATTCTGGGGTAAAGGCCTTGTTATAACCAATGACTCCTATGTGATACCAAAGTCCATCTACCTCTATTTCCAGGGCAACAGAGCCATTCCCTGTGGGAACAATGCACCGGATGAGCTCAGCACCGATGTTCACCGTCAGGTAGGTCTGCTGGTCAATATAGACTGACGTGGTGTTCTGTCCTCTCAGGCCTGTGCCCTCTATGGTCAAGAGGCTTCCACCATGTAAGCTGAAATTCTTAGGAAAATAATGAAACACTTGGGGCATAATGTAGAAGTGTCTGGAAACATTACCAGAACAAGCATACCCATTTCTTGTATAAAAAACTGACAGGTAGTGGGGTCCTGGGGCCAAGTCTCTTGTCTGGCACACAACGTGGCTTGCATTAAAAAAAGTTACATTGCAAGGAAGTTGATCATCCACAAATACCATCGGCTCATCAGCTGTGGTGGCTAACCTCTGACCCCTAATCAGCACAGTGGTCAGAGACCCACTGGTGTTTGTGGACAAGGCATCCATGACAGGACTTGCCTCTTCCCTTATGAAAAGAGTGCAATTCCCCTGACACTCGCTGGTTAGCCCATTGACCAGGACTGTGACGTTCAGGGAGAAGGAAGCTCCAGGCAAGGGGTCACCCTCCAGGCTAACCTGGCAGAGAATGGTGTGGTCTCCCAAACTCAAAATCACACAAGTAAAAGGACCCGAGAGGTCAACCCGAACTGACCTCCTTCTAGAGTTAAGAAGCAACCCCCTCACAGTAAGTATGGTCCCACCACATGCCGAACCCTGCGATGGGAAGATGGCCATTATCCGAGGCATCACTGCAAATTGCTGGAGCACCACAGACATATTAGCAAATCCCATCTGCTTCTGACGTACTTGGAGAGGATAGATGCCAGCCTCCAGACTGTGAAGAGGGATGGAGCATCCAGACAGGCTCACGTTGCCCTGGAAGGACTGTGTCTCAACATCACAGTTCAGGTTCCCCAGAAGGATGACTGAGTTGGAGAGGTTACTTCCTCCCACATGCAGGCTCAGGCTGCTATTTGTGATTTCTCCTTGCATGGCAGTGACTACTGGTGTTGCTGCCGCTTCATACATGAAGGTGAAGCCTTTCCCCACCAAGCTTGGTGAAGGACCACGGGCGAAGAACCTGTTGCCAGCCCAGACCTCCACGGCAGCTGGAACAGTGGGAGCGCCCGCATCGGGTATCTGGGGGGCTGGCAGGGTTTCACACCAGATGCTCGCCTCCGTTAAGTTCACAATGTCACAGGACCGATTGCCCACAAGTACCCAAACCAAAGCTGGGTCCCTGCTGAAGCCTATTCCTGAGATGCTGAGGATGGTCCCTCCTAAAGTATGAATACGGAAAGCAAAATATTATAGCTGATATTCTGAACTAAGAATTCATAGCACCTGTGGAAGTCCTAGGTCAATTAAGTGGAAGGTAGGGCATGTGTTAGTGAAACCTCAATTATTTTTTCTCACCCCCACCAAAGCTAAATTTGTGATTATTTAGACAGGAGTCAGATGTGGTAAATTCACATAACAGTAAAATAATACAAATTGTTATATAGGAAGGACGTCTTCAACACAAACTTTTCAAGTACCTTTGTATATCCCAGAAGCCACCACTTTAATCAACTTACACACTAATGAAAAATCAAATTTCTTAGTCTTCTTATCATGTATTATATTATTGGAAATATTATCCTGTATGCTATATATAGACTATTTGTACATTGTCCTGTATACATTCAACTTATATGCTAATGAAAAATCAAATTCATTGAAGTCTTCTATCATTTATATTGTTCTATATAATATTCCAATATTCCATATATTATACATTCTAATATATTCTATTTATTGTACCATATATTCTATATTCCATATACGTGAGAGACATTAAAAGTCATTGAATCTTGCTGGTGAATTTGCTGCTACCTTCATAGAATCTTTGCCTTACTCTCCAGTAGAGAGGCCACCAAAGATCAAACCCCATCTTCAGGACAGGATTGGAGCAACATGACCCACAGCATAACCAAACTGTACAACGTGGCTTTTAAGAGGATTTTACTATACCCAAAAAGGATAATGTGCTATCTTACACATGATCACAACTATTATTGACATGCCACTAGATTGTTTTCCATTCTTTCTGAAAATAGTTTTAGAGATTGGTCTATT
Task1_train_10515
A variant was discovered on Chromosome 6, affecting PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
TTTCTGATTCAAAGCATTATTCTATCCATATTATTCTGGAACTTGCTTTTTTGCTTCAAAGTATAGCATAGATGTTTTTTCAAAACTCTATGGATCCAGTTCATTTTAGTAGCTACTTAGAATTCCATTATAGGGCCCTGCTACAATTTATTTGACAATTTTCCTATTTATTGAAATTTCCATTTTTTCTCCTCTTTTGCTATTGTTAATAGTGATGCAATAACTGTACATGTTTTGGGACATTTGTATGAGTAAAACCAGTCCACATTTCTAGTTTACACTGAGATACAGAGTTCCCCTCACTACTGCCTTCATACCAGGTCTAGGTGGTACTTAGCCACTTGACTAACTCAAAAATAATGCTTTTGGTTTAAGATGCATTTCTTATTTCCCTGCTCTTCCATCATAAAAAAACATGGAATCTTAGGGAGTAGTGCCTTTATCAAATAAGGAAGCTGAGTCTCAGAAAAGTCAAGCATAAATTAGCAAAATTAGTGATAGACTAGAGCCAAATCCTAGTCCCCACAGTGTTCCACCAAGCTGAGACCAAATTTTTTCTAAGAAATGTCTTAGTTAGTACTCCAACAGTCTAAGATTCTGTTTCTATAGTTTTTTTCCTTACTTTCTAAATCACAACCAAATTTGAACTATCTCAAGTGCAACAAGGCTTTAAGTGAATAGAAATTGAAAGCTTTTCTTCACTGGAGGGAAAGGCTAGGCAATTTTTGGTATATCTAAACGGAGAAAACAGTCCAACCAATTTAATTGTTCTGTGCATTTGGCTTATTATTGTTGAAATATGAGTCCACCTGTGAAATATTACAAAATGATAAAAATTTAATCATACTTAATAAATTTTAAACAACGCAAATTGGCAGATAGGGTCTAAAACTAGGTGAAGGCATTTACGTTCTTAAATGATCAAATTATGAGCTCTTACAAATGGTGTTATTTAATTTAAAATACAAATCCAGTTAATGCATCAAATTAAAATACAATCAAACATTTAGAGAATATGCACAGTTTCCTTGATAAAAATAAAAAAAATCTTCATAAACAGAGCATAACAAAGACAAGCCTCAGGAAGGAATTGGGATTGTAAGAAGCCAGTGGGCTTCTCTTTCCTTCCATCAGGCAGATTGTGTTAATTTTCTACTTTCCAGAAGTGAAAGGAGCTACCAATTCATTTACATAAAGAAAGTGTGCTGTCTTATTTGCTTGACTTACCGAAGTTCTCCGTCACTGCTGTAATAATAACTCTTGAGGTGAACACCAGGGCAGATGAGGCCCACCCTCTGATGCAGTCATAGCCTCTGACGTGGTACTCCCCGGCCGGAAGGGAAGGGACCACGCACTGAAGAACGGTGTGGTTACCAGAGACACCCACACAGGGTGACATTCCTATAAAAATGTCAATGTTTGCAGCTCCTGAGATCTGGGCCACTGCAAAGGTTAAGATGTCATCGCTCTGAGAAATAGAGATCAATTCTGGGGTAAAGGCCTTGTTATAACCAATGACTCCTATGTGATACCAAAGTCCATCTACCTCTATTTCCAGGGCAACAGAGCCATTCCCTGTGGGAACAATGCACCGGATGAGCTCAGCACCGATGTTCACCGTCAGGCAGGTCTGCTGGTCAATATAGACTGACGTGGTGTTCTGTCCTCTCAGGCCTGTGCCCTCTATGGTCAAGAGGCTTCCACCATGTAAGCTGAAATTCTTAGGAAAATAATGAAACACTTGGGGCATAATGTAGAAGTGTCTGGAAACATTACCAGAACAAGCATACCCATTTCTTGTATAAAAAACTGACAGGTAGTGGGGTCCTGGGGCCAAGTCTCTTGTCTGGCACACAACGTGGCTTGCATTAAAAAAAGTTACATTGCAAGGAAGTTGATCATCCACAAATACCATCGGCTCATCAGCTGTGGTGGCTAACCTCTGACCCCTAATCAGCACAGTGGTCAGAGACCCACTGGTGTTTGTGGACAAGGCATCCATGACAGGACTTGCCTCTTCCCTTATGAAAAGAGTGCAATTCCCCTGACACTCGCTGGTTAGCCCATTGACCAGGACTGTGACGTTCAGGGAGAAGGAAGCTCCAGGCAAGGGGTCACCCTCCAGGCTAACCTGGCAGAGAATGGTGTGGTCTCCCAAACTCAAAATCACACAAGTAAAAGGACCCGAGAGGTCAACCCGAACTGACCTCCTTCTAGAGTTAAGAAGCAACCCCCTCACAGTAAGTATGGTCCCACCACATGCCGAACCCTGCGATGGGAAGATGGCCATTATCCGAGGCATCACTGCAAATTGCTGGAGCACCACAGACATATTAGCAAATCCCATCTGCTTCTGACGTACTTGGAGAGGATAGATGCCAGCCTCCAGACTGTGAAGAGGGATGGAGCATCCAGACAGGCTCACGTTGCCCTGGAAGGACTGTGTCTCAACATCACAGTTCAGGTTCCCCAGAAGGATGACTGAGTTGGAGAGGTTACTTCCTCCCACATGCAGGCTCAGGCTGCTATTTGTGATTTCTCCTTGCATGGCAGTGACTACTGGTGTTGCTGCCGCTTCATACATGAAGGTGAAGCCTTTCCCCACCAAGCTTGGTGAAGGACCACGGGCGAAGAACCTGTTGCCAGCCCAGACCTCCACGGCAGCTGGAACAGTGGGAGCGCCCGCATCGGGTATCTGGGGGGCTGGCAGGGTTTCACACCAGATGCTCGCCTCCGTTAAGTTCACAATGTCACAGGACCGATTGCCCACAAGTACCCAAACCAAAGCTGGGTCCCTGCTGAAGCCTATTCCTGAGATGCTGAGGATGGTCCCTCCTAAAGTATGAATACGGAAAGCAAAATATTATAGCTGATATTCTGAACTAAGAATTCATAGCACCTGTGGAAGTCCTAGGTCAATTAAGTGGAAGGTAGGGCATGTGTTAGTGAAACCTCAATTATTTTTTCTCACCCCCACCAAAGCTAAATTTGTGATTATTTAGACAGGAGTCAGATGTGGTAAATTCACATAACAGTAAAATAATACAAATTGTTATATAGGAAGGACGTCTTCAACACAAACTTTTCAAGTACCTTTGTATATCCCAGAAGCCACCACTTTAATCAACTTACACACTAATGAAAAATCAAATTTCTTAGTCTTCTTATCATGTATTATATTATTGGAAATATTATCCTGTATGCTATATATAGACTATTTGTACATTGTCCTGTATACATTCAACTTATATGCTAATGAAAAATCAAATTCATTGAAGTCTTCTATCATTTATATTGTTCTATATAATATTCCAATATTCCATATATTATACATTCTAATATATTCTATTTATTGTACCATATATTCTATATTCCATATACGTGAGAGACATTAAAAGTCATTGAATCTTGCTGGTGAATTTGCTGCTACCTTCATAGAATCTTTGCCTTACTCTCCAGTAGAGAGGCCACCAAAGATCAAACCCCATCTTCAGGACAGGATTGGAGCAACATGACCCACAGCATAACCAAACTGTACAACGTGGCTTTTAAGAGGATTTTACTATACCCAAAAAGGATAATGTGCTATCTTACACATGATCACAACTATTATTGACATGCCACTAGATTGTTTTCCATTCTTTCTGAAAATAGTTTTAGAGATTGGTCTATTTGTCTTGTTCTTCCATCTCCCATATCAGCATGTGTGTTTCTATTTCTGAGTCTTTCATCTGTCTCTCTCATGGAAAGTGAAGACCCGCAGATTCAATCCTCCCCTCCTTGCATGCACAGCATCTAAATGGCGAATGCAGGACATGTTGCCCTTGTTTTTCTCATATCCACTCTAGAGTGTCACCCATCAGACGTTTCATCCTCTTTTCATTAGAAAAGCAGGCACATCTCGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAGAAAAATTAGCCAGGCATGATGGAGGGCACCTGTAATTCCAGCTACTTAGGAGACTGAGGCTGGAT
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Task1_train_10516
A variant was discovered in gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin), Chromosome 6. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
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Task1_train_10517
An alteration has been detected in PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
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Task1_train_10518
Given this variant in gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; not specified
CCCTCTTCATCCCCTTCCCTTCTTGATTTTTATCCTATACACTTACCATCACTGCCCCAAGAACAGAGGATTTGTTTTTATTTACTGTATCCCCAGCATTAATAATGCCTGGTAATAAAAGCTAAATAAATTGTCATTATGATTATTGTTGATGGTAACAATTAAAGGTTGAAGAGGTGATGATATCTTGCCATTCTCATTTGAAAGTTTAGACTATGGCCACACAAGAGTCCGTACCTTAAAGAAGACAATGCTATCTCAGCACAAAAATGAATGAAGAAAGTATGTAAAGCAAAGCCAAGATTTTCCTCAAAAAAATCCTTTCAAGGGTTTTGCTTCTGCAAATGGGTAGGTGGTGATTTATCACATTATTGTATCCATTCATTACATATGCAAATATTCTGTAAATTTCTTGCTGATAGGCCCCAGCCTGGTTCTCTTTAAATACCCCAGAGCATCATTTCTCAAACTGTACTCTTCATAGAGATTGCCTGAGGACATGTTAAAATGCAGATTAATTCAGAAGGTCTGGGGTGGAGCCTGAGACTCTGCATCTCTAACAAGCTCATGGGTATTACAGATACTGCTTGTCCAGGACCACACTTTAAGGACCAAGGTCTTCAGCACCTCACACAGGGCTAAATGGGATGGGCCAATCAGTGTTGAGTGAGTGAGTACTGATTAACTCATAGGTGGCAGGGCAAAGGAAGAATTAATAGAAAAAGTTTAAATCCAGTAATAAGGAAAGCAGCAGCTAGAGCCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTTTCCCCATAGTCTTAATAAAAGATAATTTCTACCCGCTTGGCATATCCCTTCTCAGAGTTTTCCATCTTTTGCTAAAATAATGTACAATCCTCCTAGAAATCCCTTCACTGAACAGCATGTTCTGATAGGGTAACCAACTCACTCCAATTTTCCTAGGACCAAGTTTTAGCACTAAGAGTTCTGCATTCCAGTTTTAAAACTGAGTCTTGTGTCCTGGGAACCCCCTCAGTCCCAAGCAAACTGGGAAAGTTGGCCAACCTACCTGTGCAAAGCACTTTGTCTAGGGGAAACAAAAATGACTGAGTCACCTGTTTGCCTTAAGGTGGAGGGAGCTGAAGAAGGTATGTGTGGCCTGAACAGCAAAGGTAACTTTGAAAGAAGATCAAAGCCCCTTATAACTCTATAGAGAAAACTACACTATGCCCTACACTCAAACCAATAATTACTGGGTTAATACAGAATATGATCTTTCACTCTGAGCTCCATATATCATCTGACCTTCCTTAAATCATGGAGAAATAAGTGCAAGTTATGCTTGCTTTGTTTTATGTGCAGAAACAAGGTGGGGTGGGCCTCATAATTCACTCTTCTAGGCAAAATAGGGTCAGAAAAAAATCTGTTCTTTTGAACAATGAGTTTGTGGCCAAACCACACTGCTTTTAAATATGTTCTAAGCTGCAGTCCTCTGGACTCCAGAATAAACCATGACAAAAATCCAAAGCATTAAGGAAAAGGGCTTTATGCTCTAATGTTTATTCGTTAACAAACATAAGCATCAGTATTCCTGAGATTCTTGCAATCTGGCTGGGTTGTTTTTAACTGGCTGTGTCCCTCAGAAAGCAGAAAGTCATGGAGAAATATTTGATTTTCCATAGAACTAACCCAATTCATAAGGCTATGTTGACAAGACCCACCACCCTCTGTATTGCCCACTACTCAAATGGCAATCAGTTTTCCATGCTAGCCAAGTATCCCAGTGTGCATCAGTTCACAAACTTATGAAATATCAAACATGTATGAAAGTTATGTAGGACCCAATTATGCCTGACACCACCAGCCAAACTATAATCCTTTATGTGGCAAGTGAGTTCATTTAAGGGCTCAAATGTTTGTTGCTCATTTAAATACTTATGTCAGTAAACAAAAGACAGTGAGTCACAGTGAATATGGAATTCATTACACAGAAGGACTAGATTCCTATCAGCAAGAACACTAGCTTCAGAGGGTCAGACATACTGTGAGACCCTCCCCAGATTACCAATATCCGCAGCTCTGGAAGGCTCCACCATATCCAGTCTAGGTTTCACATTTAGGAAGAGGTCTTCTCCAGTGGCACTGATGGCAAGACCAGAGGGTCTCACCAACATCAAGATCCGATGCATTCCAACAGGTAGCAAATCTGTCTGACAGACTACATTGGTCTGGTTTGAGAAAATAACTTTGCAACTCGTTTTGTTCACTGTAACCTGCAAGAACTGGGAGTCACCAGAGAAACCAGTTCCGGTAATGTAAATCATTAGGTTGATGTCACCATCTTAAAGGAGAAAAGAAATTAAAAAACAAATAAAATAATCTCTCAGTGATATTACTTCATTTGAGAGACCTCTCACTATCATCAAATGTTCCTTCTCTGCCCCCATCCCCTCCCAAAATTCAAGGAGCTGAATGCTGAATTAAATATTGGCCATCTGTATTTGTTATTGTAGTACACAGCCCCGATCTTAAATTTTCTCTAACTAGTGAGAAGTGATCACTGCTCAATTTTTTAAAAGAACATAATATTTCAAAATAAAGGACAAAGACAATAAAACATTTTTAGTCATCAAAAGTCCATCTCTCCCCATTTCAAATCATGACCATATCCCTTAGATGGACCAAAAAATACACTTTCTGCTACGTCACTCAACCTCTGCCTAATGAACTAATTTATCTTCTACCCACCCATCACCAGCTACATGGCCTCTAACAAAATCACTGCAAGTCTCCGGCTTAAGCCCATCTCAGAGCCAAGTGACAAATCATACCAATGGAGTACCACACAGAATGGACACAGGGAGTTGACCCTTGGAGGTACTGGAAAGAGCAGGAACCTGGGCAATGAGCTGGTACATCATTCACTCGCACAACCACCTGAAATGAGGCAAAATTTCTTTTCCATTTTATGCATTTCATATCTACCAGGGTATTCATAAAGTATATGTGAAGTGCTCCCAAGCTGACACGTGTTCATGATTCGCTAATTCTTATTCCTTTTTTCTATTTTTCCAGTAATTAATCTTAAATTGCAATGAATGGCTCAAAACACATGAAGCTTTCTTAAAATGATGGTGGACATGCTGAACCCCATTTCTGTAATTAAATGTGATAAATATTGAGTAAATTTATCTCTGTCATATAGAAGTAAACTTCATAAACTTAAACTGCATAAGGACTTCTTATCACTCTGTATTTCCAACCAGGTACCTACTTTATGTGACAAGCTCTTTATTTGCTAGTAAAGACCAACAAATTTGGTGCATTCCTTCCACCACTCTGTGAATATATAACTAAAGACTAGAGTGTATTTGGACACTTTACTTGGGGTCTCTTTTGTCACAGAATGGTAGATTCCTAAAGAGAGACTATATATCTTTCCCTTTCACTGGAACTAATGTTAATCTAATAGAACTCAAAAACTACTTGGAAATGAGAAAGGTAAAAAAGATGTGACCCCACTGATTCTCTATGTATAAAAAATGCATTAATAGCATACAGATTATATTCATGACAGTGTTTCCTTATTAAAGGAAGAGGTATTGCAATGGCATGGACAATAAAGAACACTTCAATTTTATCTGTACTGTTTCATTTTTTCCATAAAGACAAAAAATATAAATATATCAGAATGTTGACAATGTCAATTTTCAGTTTGGGTCCCCAGGTGTTGATAATATTATTCTTTATTGTTTTTGTATTTTAAAACTTTATCAAATTGAAAGTAGATGACCTATAACAGAAATATGGAAAGATAGGAAAAAAATAAAAGGACTTTTTAAAGACAAAAAGAATGACTTAGCTCATTTACTTTTTGATACCACCAGGTAGAAGCATAAATCATATTTAGCTATAGAAATTATCAATTTTTTGTACCATAACAACAGTATCAATAATTATAATAGAATATTGTGGTTACAAGGCATTTATATTTTCAGGGAACTGTACATACCCTGTGGAGGTAGAAAAAGGACAGCCATAAGTACCCCTGTTTTACACATTGGCAAAATGACCCTTAAGAGCTAAATCAATGAGTCCATGTTACAAATCAGTGAGGAGTG
CCCTCTTCATCCCCTTCCCTTCTTGATTTTTATCCTATACACTTACCATCACTGCCCCAAGAACAGAGGATTTGTTTTTATTTACTGTATCCCCAGCATTAATAATGCCTGGTAATAAAAGCTAAATAAATTGTCATTATGATTATTGTTGATGGTAACAATTAAAGGTTGAAGAGGTGATGATATCTTGCCATTCTCATTTGAAAGTTTAGACTATGGCCACACAAGAGTCCGTACCTTAAAGAAGACAATGCTATCTCAGCACAAAAATGAATGAAGAAAGTATGTAAAGCAAAGCCAAGATTTTCCTCAAAAAAATCCTTTCAAGGGTTTTGCTTCTGCAAATGGGTAGGTGGTGATTTATCACATTATTGTATCCATTCATTACATATGCAAATATTCTGTAAATTTCTTGCTGATAGGCCCCAGCCTGGTTCTCTTTAAATACCCCAGAGCATCATTTCTCAAACTGTACTCTTCATAGAGATTGCCTGAGGACATGTTAAAATGCAGATTAATTCAGAAGGTCTGGGGTGGAGCCTGAGACTCTGCATCTCTAACAAGCTCATGGGTATTACAGATACTGCTTGTCCAGGACCACACTTTAAGGACCAAGGTCTTCAGCACCTCACACAGGGCTAAATGGGATGGGCCAATCAGTGTTGAGTGAGTGAGTACTGATTAACTCATAGGTGGCAGGGCAAAGGAAGAATTAATAGAAAAAGTTTAAATCCAGTAATAAGGAAAGCAGCAGCTAGAGCCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTTTCCCCATAGTCTTAATAAAAGATAATTTCTACCCGCTTGGCATATCCCTTCTCAGAGTTTTCCATCTTTTGCTAAAATAATGTACAATCCTCCTAGAAATCCCTTCACTGAACAGCATGTTCTGATAGGGTAACCAACTCACTCCAATTTTCCTAGGACCAAGTTTTAGCACTAAGAGTTCTGCATTCCAGTTTTAAAACTGAGTCTTGTGTCCTGGGAACCCCCTCAGTCCCAAGCAAACTGGGAAAGTTGGCCAACCTACCTGTGCAAAGCACTTTGTCTAGGGGAAACAAAAATGACTGAGTCACCTGTTTGCCTTAAGGTGGAGGGAGCTGAAGAAGGTATGTGTGGCCTGAACAGCAAAGGTAACTTTGAAAGAAGATCAAAGCCCCTTATAACTCTATAGAGAAAACTACACTATGCCCTACACTCAAACCAATAATTACTGGGTTAATACAGAATATGATCTTTCACTCTGAGCTCCATATATCATCTGACCTTCCTTAAATCATGGAGAAATAAGTGCAAGTTATGCTTGCTTTGTTTTATGTGCAGAAACAAGGTGGGGTGGGCCTCATAATTCACTCTTCTAGGCAAAATAGGGTCAGAAAAAAATCTGTTCTTTTGAACAATGAGTTTGTGGCCAAACCACACTGCTTTTAAATATGTTCTAAGCTGCAGTCCTCTGGACTCCAGAATAAACCATGACAAAAATCCAAAGCATTAAGGAAAAGGGCTTTATGCTCTAATGTTTATTCGTTAACAAACATAAGCATCAGTATTCCTGAGATTCTTGCAATCTGGCTGGGTTGTTTTTAACTGGCTGTGTCCCTCAGAAAGCAGAAAGTCATGGAGAAATATTTGATTTTCCATAGAACTAACCCAATTCATAAGGCTATGTTGACAAGACCCACCACCCTCTGTATTGCCCACTACTCAAATGGCAATCAGTTTTCCATGCTAGCCAAGTATCCCAGTGTGCATCAGTTCACAAACTTATGAAATATCAAACATGTATGAAAGTTATGTAGGACCCAATTATGCCTGACACCACCAGCCAAACTATAATCCTTTATGTGGCAAGTGAGTTCATTTAAGGGCTCAAATGTTTGTTGCTCATTTAAATACTTATGTCAGTAAACAAAAGACAGTGAGTCACAGTGAATATGGAATTCATTACACAGAAGGACTAGATTCCTATCAGCAAGAACACTAGCTTCAGAGGGTCAGACATACTGTGAGACCCTCCCCAGATTACCAATATCCTCAGCTCTGGAAGGCTCCACCATATCCAGTCTAGGTTTCACATTTAGGAAGAGGTCTTCTCCAGTGGCACTGATGGCAAGACCAGAGGGTCTCACCAACATCAAGATCCGATGCATTCCAACAGGTAGCAAATCTGTCTGACAGACTACATTGGTCTGGTTTGAGAAAATAACTTTGCAACTCGTTTTGTTCACTGTAACCTGCAAGAACTGGGAGTCACCAGAGAAACCAGTTCCGGTAATGTAAATCATTAGGTTGATGTCACCATCTTAAAGGAGAAAAGAAATTAAAAAACAAATAAAATAATCTCTCAGTGATATTACTTCATTTGAGAGACCTCTCACTATCATCAAATGTTCCTTCTCTGCCCCCATCCCCTCCCAAAATTCAAGGAGCTGAATGCTGAATTAAATATTGGCCATCTGTATTTGTTATTGTAGTACACAGCCCCGATCTTAAATTTTCTCTAACTAGTGAGAAGTGATCACTGCTCAATTTTTTAAAAGAACATAATATTTCAAAATAAAGGACAAAGACAATAAAACATTTTTAGTCATCAAAAGTCCATCTCTCCCCATTTCAAATCATGACCATATCCCTTAGATGGACCAAAAAATACACTTTCTGCTACGTCACTCAACCTCTGCCTAATGAACTAATTTATCTTCTACCCACCCATCACCAGCTACATGGCCTCTAACAAAATCACTGCAAGTCTCCGGCTTAAGCCCATCTCAGAGCCAAGTGACAAATCATACCAATGGAGTACCACACAGAATGGACACAGGGAGTTGACCCTTGGAGGTACTGGAAAGAGCAGGAACCTGGGCAATGAGCTGGTACATCATTCACTCGCACAACCACCTGAAATGAGGCAAAATTTCTTTTCCATTTTATGCATTTCATATCTACCAGGGTATTCATAAAGTATATGTGAAGTGCTCCCAAGCTGACACGTGTTCATGATTCGCTAATTCTTATTCCTTTTTTCTATTTTTCCAGTAATTAATCTTAAATTGCAATGAATGGCTCAAAACACATGAAGCTTTCTTAAAATGATGGTGGACATGCTGAACCCCATTTCTGTAATTAAATGTGATAAATATTGAGTAAATTTATCTCTGTCATATAGAAGTAAACTTCATAAACTTAAACTGCATAAGGACTTCTTATCACTCTGTATTTCCAACCAGGTACCTACTTTATGTGACAAGCTCTTTATTTGCTAGTAAAGACCAACAAATTTGGTGCATTCCTTCCACCACTCTGTGAATATATAACTAAAGACTAGAGTGTATTTGGACACTTTACTTGGGGTCTCTTTTGTCACAGAATGGTAGATTCCTAAAGAGAGACTATATATCTTTCCCTTTCACTGGAACTAATGTTAATCTAATAGAACTCAAAAACTACTTGGAAATGAGAAAGGTAAAAAAGATGTGACCCCACTGATTCTCTATGTATAAAAAATGCATTAATAGCATACAGATTATATTCATGACAGTGTTTCCTTATTAAAGGAAGAGGTATTGCAATGGCATGGACAATAAAGAACACTTCAATTTTATCTGTACTGTTTCATTTTTTCCATAAAGACAAAAAATATAAATATATCAGAATGTTGACAATGTCAATTTTCAGTTTGGGTCCCCAGGTGTTGATAATATTATTCTTTATTGTTTTTGTATTTTAAAACTTTATCAAATTGAAAGTAGATGACCTATAACAGAAATATGGAAAGATAGGAAAAAAATAAAAGGACTTTTTAAAGACAAAAAGAATGACTTAGCTCATTTACTTTTTGATACCACCAGGTAGAAGCATAAATCATATTTAGCTATAGAAATTATCAATTTTTTGTACCATAACAACAGTATCAATAATTATAATAGAATATTGTGGTTACAAGGCATTTATATTTTCAGGGAACTGTACATACCCTGTGGAGGTAGAAAAAGGACAGCCATAAGTACCCCTGTTTTACACATTGGCAAAATGACCCTTAAGAGCTAAATCAATGAGTCCATGTTACAAATCAGTGAGGAGTG
Task1_train_10519
Here is a genetic alteration in PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
CCCTCTTCATCCCCTTCCCTTCTTGATTTTTATCCTATACACTTACCATCACTGCCCCAAGAACAGAGGATTTGTTTTTATTTACTGTATCCCCAGCATTAATAATGCCTGGTAATAAAAGCTAAATAAATTGTCATTATGATTATTGTTGATGGTAACAATTAAAGGTTGAAGAGGTGATGATATCTTGCCATTCTCATTTGAAAGTTTAGACTATGGCCACACAAGAGTCCGTACCTTAAAGAAGACAATGCTATCTCAGCACAAAAATGAATGAAGAAAGTATGTAAAGCAAAGCCAAGATTTTCCTCAAAAAAATCCTTTCAAGGGTTTTGCTTCTGCAAATGGGTAGGTGGTGATTTATCACATTATTGTATCCATTCATTACATATGCAAATATTCTGTAAATTTCTTGCTGATAGGCCCCAGCCTGGTTCTCTTTAAATACCCCAGAGCATCATTTCTCAAACTGTACTCTTCATAGAGATTGCCTGAGGACATGTTAAAATGCAGATTAATTCAGAAGGTCTGGGGTGGAGCCTGAGACTCTGCATCTCTAACAAGCTCATGGGTATTACAGATACTGCTTGTCCAGGACCACACTTTAAGGACCAAGGTCTTCAGCACCTCACACAGGGCTAAATGGGATGGGCCAATCAGTGTTGAGTGAGTGAGTACTGATTAACTCATAGGTGGCAGGGCAAAGGAAGAATTAATAGAAAAAGTTTAAATCCAGTAATAAGGAAAGCAGCAGCTAGAGCCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTTTCCCCATAGTCTTAATAAAAGATAATTTCTACCCGCTTGGCATATCCCTTCTCAGAGTTTTCCATCTTTTGCTAAAATAATGTACAATCCTCCTAGAAATCCCTTCACTGAACAGCATGTTCTGATAGGGTAACCAACTCACTCCAATTTTCCTAGGACCAAGTTTTAGCACTAAGAGTTCTGCATTCCAGTTTTAAAACTGAGTCTTGTGTCCTGGGAACCCCCTCAGTCCCAAGCAAACTGGGAAAGTTGGCCAACCTACCTGTGCAAAGCACTTTGTCTAGGGGAAACAAAAATGACTGAGTCACCTGTTTGCCTTAAGGTGGAGGGAGCTGAAGAAGGTATGTGTGGCCTGAACAGCAAAGGTAACTTTGAAAGAAGATCAAAGCCCCTTATAACTCTATAGAGAAAACTACACTATGCCCTACACTCAAACCAATAATTACTGGGTTAATACAGAATATGATCTTTCACTCTGAGCTCCATATATCATCTGACCTTCCTTAAATCATGGAGAAATAAGTGCAAGTTATGCTTGCTTTGTTTTATGTGCAGAAACAAGGTGGGGTGGGCCTCATAATTCACTCTTCTAGGCAAAATAGGGTCAGAAAAAAATCTGTTCTTTTGAACAATGAGTTTGTGGCCAAACCACACTGCTTTTAAATATGTTCTAAGCTGCAGTCCTCTGGACTCCAGAATAAACCATGACAAAAATCCAAAGCATTAAGGAAAAGGGCTTTATGCTCTAATGTTTATTCGTTAACAAACATAAGCATCAGTATTCCTGAGATTCTTGCAATCTGGCTGGGTTGTTTTTAACTGGCTGTGTCCCTCAGAAAGCAGAAAGTCATGGAGAAATATTTGATTTTCCATAGAACTAACCCAATTCATAAGGCTATGTTGACAAGACCCACCACCCTCTGTATTGCCCACTACTCAAATGGCAATCAGTTTTCCATGCTAGCCAAGTATCCCAGTGTGCATCAGTTCACAAACTTATGAAATATCAAACATGTATGAAAGTTATGTAGGACCCAATTATGCCTGACACCACCAGCCAAACTATAATCCTTTATGTGGCAAGTGAGTTCATTTAAGGGCTCAAATGTTTGTTGCTCATTTAAATACTTATGTCAGTAAACAAAAGACAGTGAGTCACAGTGAATATGGAATTCATTACACAGAAGGACTAGATTCCTATCAGCAAGAACACTAGCTTCAGAGGGTCAGACATACTGTGAGACCCTCCCCAGATTACCAATATCCGCAGCTCTGGAAGGCTCCACCATATCCAGTCTAGGTTTCACATTTAGGAAGAGGTCTTCTCCAGTGGCACTGATGGCAAGACCAGAGGGTCTCACCAACATCAAGATCCGATGCATTCCAACAGGTAGCAAATCTGTCTGACAGACTACATTGGTCTGGTTTGAGAAAATAACTTTGCAACTCGTTTTGTTCACTGTAACCTGCAAGAACTGGGAGTCACCAGAGAAACCAGTTCCGGTAATGTAAATCATTAGGTTGATGTCACCATCTTAAAGGAGAAAAGAAATTAAAAAACAAATAAAATAATCTCTCAGTGATATTACTTCATTTGAGAGACCTCTCACTATCATCAAATGTTCCTTCTCTGCCCCCATCCCCTCCCAAAATTCAAGGAGCTGAATGCTGAATTAAATATTGGCCATCTGTATTTGTTATTGTAGTACACAGCCCCGATCTTAAATTTTCTCTAACTAGTGAGAAGTGATCACTGCTCAATTTTTTAAAAGAACATAATATTTCAAAATAAAGGACAAAGACAATAAAACATTTTTAGTCATCAAAAGTCCATCTCTCCCCATTTCAAATCATGACCATATCCCTTAGATGGACCAAAAAATACACTTTCTGCTACGTCACTCAACCTCTGCCTAATGAACTAATTTATCTTCTACCCACCCATCACCAGCTACATGGCCTCTAACAAAATCACTGCAAGTCTCCGGCTTAAGCCCATCTCAGAGCCAAGTGACAAATCATACCAATGGAGTACCACACAGAATGGACACAGGGAGTTGACCCTTGGAGGTACTGGAAAGAGCAGGAACCTGGGCAATGAGCTGGTACATCATTCACTCGCACAACCACCTGAAATGAGGCAAAATTTCTTTTCCATTTTATGCATTTCATATCTACCAGGGTATTCATAAAGTATATGTGAAGTGCTCCCAAGCTGACACGTGTTCATGATTCGCTAATTCTTATTCCTTTTTTCTATTTTTCCAGTAATTAATCTTAAATTGCAATGAATGGCTCAAAACACATGAAGCTTTCTTAAAATGATGGTGGACATGCTGAACCCCATTTCTGTAATTAAATGTGATAAATATTGAGTAAATTTATCTCTGTCATATAGAAGTAAACTTCATAAACTTAAACTGCATAAGGACTTCTTATCACTCTGTATTTCCAACCAGGTACCTACTTTATGTGACAAGCTCTTTATTTGCTAGTAAAGACCAACAAATTTGGTGCATTCCTTCCACCACTCTGTGAATATATAACTAAAGACTAGAGTGTATTTGGACACTTTACTTGGGGTCTCTTTTGTCACAGAATGGTAGATTCCTAAAGAGAGACTATATATCTTTCCCTTTCACTGGAACTAATGTTAATCTAATAGAACTCAAAAACTACTTGGAAATGAGAAAGGTAAAAAAGATGTGACCCCACTGATTCTCTATGTATAAAAAATGCATTAATAGCATACAGATTATATTCATGACAGTGTTTCCTTATTAAAGGAAGAGGTATTGCAATGGCATGGACAATAAAGAACACTTCAATTTTATCTGTACTGTTTCATTTTTTCCATAAAGACAAAAAATATAAATATATCAGAATGTTGACAATGTCAATTTTCAGTTTGGGTCCCCAGGTGTTGATAATATTATTCTTTATTGTTTTTGTATTTTAAAACTTTATCAAATTGAAAGTAGATGACCTATAACAGAAATATGGAAAGATAGGAAAAAAATAAAAGGACTTTTTAAAGACAAAAAGAATGACTTAGCTCATTTACTTTTTGATACCACCAGGTAGAAGCATAAATCATATTTAGCTATAGAAATTATCAATTTTTTGTACCATAACAACAGTATCAATAATTATAATAGAATATTGTGGTTACAAGGCATTTATATTTTCAGGGAACTGTACATACCCTGTGGAGGTAGAAAAAGGACAGCCATAAGTACCCCTGTTTTACACATTGGCAAAATGACCCTTAAGAGCTAAATCAATGAGTCCATGTTACAAATCAGTGAGGAGTG
CCCTCTTCATCCCCTTCCCTTCTTGATTTTTATCCTATACACTTACCATCACTGCCCCAAGAACAGAGGATTTGTTTTTATTTACTGTATCCCCAGCATTAATAATGCCTGGTAATAAAAGCTAAATAAATTGTCATTATGATTATTGTTGATGGTAACAATTAAAGGTTGAAGAGGTGATGATATCTTGCCATTCTCATTTGAAAGTTTAGACTATGGCCACACAAGAGTCCGTACCTTAAAGAAGACAATGCTATCTCAGCACAAAAATGAATGAAGAAAGTATGTAAAGCAAAGCCAAGATTTTCCTCAAAAAAATCCTTTCAAGGGTTTTGCTTCTGCAAATGGGTAGGTGGTGATTTATCACATTATTGTATCCATTCATTACATATGCAAATATTCTGTAAATTTCTTGCTGATAGGCCCCAGCCTGGTTCTCTTTAAATACCCCAGAGCATCATTTCTCAAACTGTACTCTTCATAGAGATTGCCTGAGGACATGTTAAAATGCAGATTAATTCAGAAGGTCTGGGGTGGAGCCTGAGACTCTGCATCTCTAACAAGCTCATGGGTATTACAGATACTGCTTGTCCAGGACCACACTTTAAGGACCAAGGTCTTCAGCACCTCACACAGGGCTAAATGGGATGGGCCAATCAGTGTTGAGTGAGTGAGTACTGATTAACTCATAGGTGGCAGGGCAAAGGAAGAATTAATAGAAAAAGTTTAAATCCAGTAATAAGGAAAGCAGCAGCTAGAGCCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTTTCCCCATAGTCTTAATAAAAGATAATTTCTACCCGCTTGGCATATCCCTTCTCAGAGTTTTCCATCTTTTGCTAAAATAATGTACAATCCTCCTAGAAATCCCTTCACTGAACAGCATGTTCTGATAGGGTAACCAACTCACTCCAATTTTCCTAGGACCAAGTTTTAGCACTAAGAGTTCTGCATTCCAGTTTTAAAACTGAGTCTTGTGTCCTGGGAACCCCCTCAGTCCCAAGCAAACTGGGAAAGTTGGCCAACCTACCTGTGCAAAGCACTTTGTCTAGGGGAAACAAAAATGACTGAGTCACCTGTTTGCCTTAAGGTGGAGGGAGCTGAAGAAGGTATGTGTGGCCTGAACAGCAAAGGTAACTTTGAAAGAAGATCAAAGCCCCTTATAACTCTATAGAGAAAACTACACTATGCCCTACACTCAAACCAATAATTACTGGGTTAATACAGAATATGATCTTTCACTCTGAGCTCCATATATCATCTGACCTTCCTTAAATCATGGAGAAATAAGTGCAAGTTATGCTTGCTTTGTTTTATGTGCAGAAACAAGGTGGGGTGGGCCTCATAATTCACTCTTCTAGGCAAAATAGGGTCAGAAAAAAATCTGTTCTTTTGAACAATGAGTTTGTGGCCAAACCACACTGCTTTTAAATATGTTCTAAGCTGCAGTCCTCTGGACTCCAGAATAAACCATGACAAAAATCCAAAGCATTAAGGAAAAGGGCTTTATGCTCTAATGTTTATTCGTTAACAAACATAAGCATCAGTATTCCTGAGATTCTTGCAATCTGGCTGGGTTGTTTTTAACTGGCTGTGTCCCTCAGAAAGCAGAAAGTCATGGAGAAATATTTGATTTTCCATAGAACTAACCCAATTCATAAGGCTATGTTGACAAGACCCACCACCCTCTGTATTGCCCACTACTCAAATGGCAATCAGTTTTCCATGCTAGCCAAGTATCCCAGTGTGCATCAGTTCACAAACTTATGAAATATCAAACATGTATGAAAGTTATGTAGGACCCAATTATGCCTGACACCACCAGCCAAACTATAATCCTTTATGTGGCAAGTGAGTTCATTTAAGGGCTCAAATGTTTGTTGCTCATTTAAATACTTATGTCAGTAAACAAAAGACAGTGAGTCACAGTGAATATGGAATTCATTACACAGAAGGACTAGATTCCTATCAGCAAGAACACTAGCTTCAGAGGGTCAGACATACTGTGAGACCCTCCCCAGATTACCAATATCCTCAGCTCTGGAAGGCTCCACCATATCCAGTCTAGGTTTCACATTTAGGAAGAGGTCTTCTCCAGTGGCACTGATGGCAAGACCAGAGGGTCTCACCAACATCAAGATCCGATGCATTCCAACAGGTAGCAAATCTGTCTGACAGACTACATTGGTCTGGTTTGAGAAAATAACTTTGCAACTCGTTTTGTTCACTGTAACCTGCAAGAACTGGGAGTCACCAGAGAAACCAGTTCCGGTAATGTAAATCATTAGGTTGATGTCACCATCTTAAAGGAGAAAAGAAATTAAAAAACAAATAAAATAATCTCTCAGTGATATTACTTCATTTGAGAGACCTCTCACTATCATCAAATGTTCCTTCTCTGCCCCCATCCCCTCCCAAAATTCAAGGAGCTGAATGCTGAATTAAATATTGGCCATCTGTATTTGTTATTGTAGTACACAGCCCCGATCTTAAATTTTCTCTAACTAGTGAGAAGTGATCACTGCTCAATTTTTTAAAAGAACATAATATTTCAAAATAAAGGACAAAGACAATAAAACATTTTTAGTCATCAAAAGTCCATCTCTCCCCATTTCAAATCATGACCATATCCCTTAGATGGACCAAAAAATACACTTTCTGCTACGTCACTCAACCTCTGCCTAATGAACTAATTTATCTTCTACCCACCCATCACCAGCTACATGGCCTCTAACAAAATCACTGCAAGTCTCCGGCTTAAGCCCATCTCAGAGCCAAGTGACAAATCATACCAATGGAGTACCACACAGAATGGACACAGGGAGTTGACCCTTGGAGGTACTGGAAAGAGCAGGAACCTGGGCAATGAGCTGGTACATCATTCACTCGCACAACCACCTGAAATGAGGCAAAATTTCTTTTCCATTTTATGCATTTCATATCTACCAGGGTATTCATAAAGTATATGTGAAGTGCTCCCAAGCTGACACGTGTTCATGATTCGCTAATTCTTATTCCTTTTTTCTATTTTTCCAGTAATTAATCTTAAATTGCAATGAATGGCTCAAAACACATGAAGCTTTCTTAAAATGATGGTGGACATGCTGAACCCCATTTCTGTAATTAAATGTGATAAATATTGAGTAAATTTATCTCTGTCATATAGAAGTAAACTTCATAAACTTAAACTGCATAAGGACTTCTTATCACTCTGTATTTCCAACCAGGTACCTACTTTATGTGACAAGCTCTTTATTTGCTAGTAAAGACCAACAAATTTGGTGCATTCCTTCCACCACTCTGTGAATATATAACTAAAGACTAGAGTGTATTTGGACACTTTACTTGGGGTCTCTTTTGTCACAGAATGGTAGATTCCTAAAGAGAGACTATATATCTTTCCCTTTCACTGGAACTAATGTTAATCTAATAGAACTCAAAAACTACTTGGAAATGAGAAAGGTAAAAAAGATGTGACCCCACTGATTCTCTATGTATAAAAAATGCATTAATAGCATACAGATTATATTCATGACAGTGTTTCCTTATTAAAGGAAGAGGTATTGCAATGGCATGGACAATAAAGAACACTTCAATTTTATCTGTACTGTTTCATTTTTTCCATAAAGACAAAAAATATAAATATATCAGAATGTTGACAATGTCAATTTTCAGTTTGGGTCCCCAGGTGTTGATAATATTATTCTTTATTGTTTTTGTATTTTAAAACTTTATCAAATTGAAAGTAGATGACCTATAACAGAAATATGGAAAGATAGGAAAAAAATAAAAGGACTTTTTAAAGACAAAAAGAATGACTTAGCTCATTTACTTTTTGATACCACCAGGTAGAAGCATAAATCATATTTAGCTATAGAAATTATCAATTTTTTGTACCATAACAACAGTATCAATAATTATAATAGAATATTGTGGTTACAAGGCATTTATATTTTCAGGGAACTGTACATACCCTGTGGAGGTAGAAAAAGGACAGCCATAAGTACCCCTGTTTTACACATTGGCAAAATGACCCTTAAGAGCTAAATCAATGAGTCCATGTTACAAATCAGTGAGGAGTG
Task1_train_10520
This variant lies on Chromosome 6 and affects the gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
TAATAATGCCTGGTAATAAAAGCTAAATAAATTGTCATTATGATTATTGTTGATGGTAACAATTAAAGGTTGAAGAGGTGATGATATCTTGCCATTCTCATTTGAAAGTTTAGACTATGGCCACACAAGAGTCCGTACCTTAAAGAAGACAATGCTATCTCAGCACAAAAATGAATGAAGAAAGTATGTAAAGCAAAGCCAAGATTTTCCTCAAAAAAATCCTTTCAAGGGTTTTGCTTCTGCAAATGGGTAGGTGGTGATTTATCACATTATTGTATCCATTCATTACATATGCAAATATTCTGTAAATTTCTTGCTGATAGGCCCCAGCCTGGTTCTCTTTAAATACCCCAGAGCATCATTTCTCAAACTGTACTCTTCATAGAGATTGCCTGAGGACATGTTAAAATGCAGATTAATTCAGAAGGTCTGGGGTGGAGCCTGAGACTCTGCATCTCTAACAAGCTCATGGGTATTACAGATACTGCTTGTCCAGGACCACACTTTAAGGACCAAGGTCTTCAGCACCTCACACAGGGCTAAATGGGATGGGCCAATCAGTGTTGAGTGAGTGAGTACTGATTAACTCATAGGTGGCAGGGCAAAGGAAGAATTAATAGAAAAAGTTTAAATCCAGTAATAAGGAAAGCAGCAGCTAGAGCCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTTTCCCCATAGTCTTAATAAAAGATAATTTCTACCCGCTTGGCATATCCCTTCTCAGAGTTTTCCATCTTTTGCTAAAATAATGTACAATCCTCCTAGAAATCCCTTCACTGAACAGCATGTTCTGATAGGGTAACCAACTCACTCCAATTTTCCTAGGACCAAGTTTTAGCACTAAGAGTTCTGCATTCCAGTTTTAAAACTGAGTCTTGTGTCCTGGGAACCCCCTCAGTCCCAAGCAAACTGGGAAAGTTGGCCAACCTACCTGTGCAAAGCACTTTGTCTAGGGGAAACAAAAATGACTGAGTCACCTGTTTGCCTTAAGGTGGAGGGAGCTGAAGAAGGTATGTGTGGCCTGAACAGCAAAGGTAACTTTGAAAGAAGATCAAAGCCCCTTATAACTCTATAGAGAAAACTACACTATGCCCTACACTCAAACCAATAATTACTGGGTTAATACAGAATATGATCTTTCACTCTGAGCTCCATATATCATCTGACCTTCCTTAAATCATGGAGAAATAAGTGCAAGTTATGCTTGCTTTGTTTTATGTGCAGAAACAAGGTGGGGTGGGCCTCATAATTCACTCTTCTAGGCAAAATAGGGTCAGAAAAAAATCTGTTCTTTTGAACAATGAGTTTGTGGCCAAACCACACTGCTTTTAAATATGTTCTAAGCTGCAGTCCTCTGGACTCCAGAATAAACCATGACAAAAATCCAAAGCATTAAGGAAAAGGGCTTTATGCTCTAATGTTTATTCGTTAACAAACATAAGCATCAGTATTCCTGAGATTCTTGCAATCTGGCTGGGTTGTTTTTAACTGGCTGTGTCCCTCAGAAAGCAGAAAGTCATGGAGAAATATTTGATTTTCCATAGAACTAACCCAATTCATAAGGCTATGTTGACAAGACCCACCACCCTCTGTATTGCCCACTACTCAAATGGCAATCAGTTTTCCATGCTAGCCAAGTATCCCAGTGTGCATCAGTTCACAAACTTATGAAATATCAAACATGTATGAAAGTTATGTAGGACCCAATTATGCCTGACACCACCAGCCAAACTATAATCCTTTATGTGGCAAGTGAGTTCATTTAAGGGCTCAAATGTTTGTTGCTCATTTAAATACTTATGTCAGTAAACAAAAGACAGTGAGTCACAGTGAATATGGAATTCATTACACAGAAGGACTAGATTCCTATCAGCAAGAACACTAGCTTCAGAGGGTCAGACATACTGTGAGACCCTCCCCAGATTACCAATATCCGCAGCTCTGGAAGGCTCCACCATATCCAGTCTAGGTTTCACATTTAGGAAGAGGTCTTCTCCAGTGGCACTGATGGCAAGACCAGAGGGTCTCACCAACATCAAGATCCGATGCATTCCAACAGGTAGCAAATCTGTCTGACAGACTACATTGGTCTGGTTTGAGAAAATAACTTTGCAACTCGTTTTGTTCACTGTAACCTGCAAGAACTGGGAGTCACCAGAGAAACCAGTTCCGGTAATGTAAATCATTAGGTTGATGTCACCATCTTAAAGGAGAAAAGAAATTAAAAAACAAATAAAATAATCTCTCAGTGATATTACTTCATTTGAGAGACCTCTCACTATCATCAAATGTTCCTTCTCTGCCCCCATCCCCTCCCAAAATTCAAGGAGCTGAATGCTGAATTAAATATTGGCCATCTGTATTTGTTATTGTAGTACACAGCCCCGATCTTAAATTTTCTCTAACTAGTGAGAAGTGATCACTGCTCAATTTTTTAAAAGAACATAATATTTCAAAATAAAGGACAAAGACAATAAAACATTTTTAGTCATCAAAAGTCCATCTCTCCCCATTTCAAATCATGACCATATCCCTTAGATGGACCAAAAAATACACTTTCTGCTACGTCACTCAACCTCTGCCTAATGAACTAATTTATCTTCTACCCACCCATCACCAGCTACATGGCCTCTAACAAAATCACTGCAAGTCTCCGGCTTAAGCCCATCTCAGAGCCAAGTGACAAATCATACCAATGGAGTACCACACAGAATGGACACAGGGAGTTGACCCTTGGAGGTACTGGAAAGAGCAGGAACCTGGGCAATGAGCTGGTACATCATTCACTCGCACAACCACCTGAAATGAGGCAAAATTTCTTTTCCATTTTATGCATTTCATATCTACCAGGGTATTCATAAAGTATATGTGAAGTGCTCCCAAGCTGACACGTGTTCATGATTCGCTAATTCTTATTCCTTTTTTCTATTTTTCCAGTAATTAATCTTAAATTGCAATGAATGGCTCAAAACACATGAAGCTTTCTTAAAATGATGGTGGACATGCTGAACCCCATTTCTGTAATTAAATGTGATAAATATTGAGTAAATTTATCTCTGTCATATAGAAGTAAACTTCATAAACTTAAACTGCATAAGGACTTCTTATCACTCTGTATTTCCAACCAGGTACCTACTTTATGTGACAAGCTCTTTATTTGCTAGTAAAGACCAACAAATTTGGTGCATTCCTTCCACCACTCTGTGAATATATAACTAAAGACTAGAGTGTATTTGGACACTTTACTTGGGGTCTCTTTTGTCACAGAATGGTAGATTCCTAAAGAGAGACTATATATCTTTCCCTTTCACTGGAACTAATGTTAATCTAATAGAACTCAAAAACTACTTGGAAATGAGAAAGGTAAAAAAGATGTGACCCCACTGATTCTCTATGTATAAAAAATGCATTAATAGCATACAGATTATATTCATGACAGTGTTTCCTTATTAAAGGAAGAGGTATTGCAATGGCATGGACAATAAAGAACACTTCAATTTTATCTGTACTGTTTCATTTTTTCCATAAAGACAAAAAATATAAATATATCAGAATGTTGACAATGTCAATTTTCAGTTTGGGTCCCCAGGTGTTGATAATATTATTCTTTATTGTTTTTGTATTTTAAAACTTTATCAAATTGAAAGTAGATGACCTATAACAGAAATATGGAAAGATAGGAAAAAAATAAAAGGACTTTTTAAAGACAAAAAGAATGACTTAGCTCATTTACTTTTTGATACCACCAGGTAGAAGCATAAATCATATTTAGCTATAGAAATTATCAATTTTTTGTACCATAACAACAGTATCAATAATTATAATAGAATATTGTGGTTACAAGGCATTTATATTTTCAGGGAACTGTACATACCCTGTGGAGGTAGAAAAAGGACAGCCATAAGTACCCCTGTTTTACACATTGGCAAAATGACCCTTAAGAGCTAAATCAATGAGTCCATGTTACAAATCAGTGAGGAGTGAGTTAGACTTGAAACTGGAGCTTGCACTTAGGGTGGCCCATTCACTCTCACCTGAGTATGCTGGTTGGCAGTAGCCAACATGTCTCCAAATATGGGTCC
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Task1_train_10521
A change on Chromosome 6 affects gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
TAATAATGCCTGGTAATAAAAGCTAAATAAATTGTCATTATGATTATTGTTGATGGTAACAATTAAAGGTTGAAGAGGTGATGATATCTTGCCATTCTCATTTGAAAGTTTAGACTATGGCCACACAAGAGTCCGTACCTTAAAGAAGACAATGCTATCTCAGCACAAAAATGAATGAAGAAAGTATGTAAAGCAAAGCCAAGATTTTCCTCAAAAAAATCCTTTCAAGGGTTTTGCTTCTGCAAATGGGTAGGTGGTGATTTATCACATTATTGTATCCATTCATTACATATGCAAATATTCTGTAAATTTCTTGCTGATAGGCCCCAGCCTGGTTCTCTTTAAATACCCCAGAGCATCATTTCTCAAACTGTACTCTTCATAGAGATTGCCTGAGGACATGTTAAAATGCAGATTAATTCAGAAGGTCTGGGGTGGAGCCTGAGACTCTGCATCTCTAACAAGCTCATGGGTATTACAGATACTGCTTGTCCAGGACCACACTTTAAGGACCAAGGTCTTCAGCACCTCACACAGGGCTAAATGGGATGGGCCAATCAGTGTTGAGTGAGTGAGTACTGATTAACTCATAGGTGGCAGGGCAAAGGAAGAATTAATAGAAAAAGTTTAAATCCAGTAATAAGGAAAGCAGCAGCTAGAGCCTCTCTCTCTCCCTCTCCCTTTCCCCATAGTCTTAATAAAAGATAATTTCTACCCGCTTGGCATATCCCTTCTCAGAGTTTTCCATCTTTTGCTAAAATAATGTACAATCCTCCTAGAAATCCCTTCACTGAACAGCATGTTCTGATAGGGTAACCAACTCACTCCAATTTTCCTAGGACCAAGTTTTAGCACTAAGAGTTCTGCATTCCAGTTTTAAAACTGAGTCTTGTGTCCTGGGAACCCCCTCAGTCCCAAGCAAACTGGGAAAGTTGGCCAACCTACCTGTGCAAAGCACTTTGTCTAGGGGAAACAAAAATGACTGAGTCACCTGTTTGCCTTAAGGTGGAGGGAGCTGAAGAAGGTATGTGTGGCCTGAACAGCAAAGGTAACTTTGAAAGAAGATCAAAGCCCCTTATAACTCTATAGAGAAAACTACACTATGCCCTACACTCAAACCAATAATTACTGGGTTAATACAGAATATGATCTTTCACTCTGAGCTCCATATATCATCTGACCTTCCTTAAATCATGGAGAAATAAGTGCAAGTTATGCTTGCTTTGTTTTATGTGCAGAAACAAGGTGGGGTGGGCCTCATAATTCACTCTTCTAGGCAAAATAGGGTCAGAAAAAAATCTGTTCTTTTGAACAATGAGTTTGTGGCCAAACCACACTGCTTTTAAATATGTTCTAAGCTGCAGTCCTCTGGACTCCAGAATAAACCATGACAAAAATCCAAAGCATTAAGGAAAAGGGCTTTATGCTCTAATGTTTATTCGTTAACAAACATAAGCATCAGTATTCCTGAGATTCTTGCAATCTGGCTGGGTTGTTTTTAACTGGCTGTGTCCCTCAGAAAGCAGAAAGTCATGGAGAAATATTTGATTTTCCATAGAACTAACCCAATTCATAAGGCTATGTTGACAAGACCCACCACCCTCTGTATTGCCCACTACTCAAATGGCAATCAGTTTTCCATGCTAGCCAAGTATCCCAGTGTGCATCAGTTCACAAACTTATGAAATATCAAACATGTATGAAAGTTATGTAGGACCCAATTATGCCTGACACCACCAGCCAAACTATAATCCTTTATGTGGCAAGTGAGTTCATTTAAGGGCTCAAATGTTTGTTGCTCATTTAAATACTTATGTCAGTAAACAAAAGACAGTGAGTCACAGTGAATATGGAATTCATTACACAGAAGGACTAGATTCCTATCAGCAAGAACACTAGCTTCAGAGGGTCAGACATACTGTGAGACCCTCCCCAGATTACCAATATCCGCAGCTCTGGAAGGCTCCACCATATCCAGTCTAGGTTTCACATTTAGGAAGAGGTCTTCTCCAGTGGCACTGATGGCAAGACCAGAGGGTCTCACCAACATCAAGATCCGATGCATTCCAACAGGTAGCAAATCTGTCTGACAGACTACATTGGTCTGGTTTGAGAAAATAACTTTGCAACTCGTTTTGTTCACTGTAACCTGCAAGAACTGGGAGTCACCAGAGAAACCAGTTCCGGTAATGTAAATCATTAGGTTGATGTCACCATCTTAAAGGAGAAAAGAAATTAAAAAACAAATAAAATAATCTCTCAGTGATATTACTTCATTTGAGAGACCTCTCACTATCATCAAATGTTCCTTCTCTGCCCCCATCCCCTCCCAAAATTCAAGGAGCTGAATGCTGAATTAAATATTGGCCATCTGTATTTGTTATTGTAGTACACAGCCCCGATCTTAAATTTTCTCTAACTAGTGAGAAGTGATCACTGCTCAATTTTTTAAAAGAACATAATATTTCAAAATAAAGGACAAAGACAATAAAACATTTTTAGTCATCAAAAGTCCATCTCTCCCCATTTCAAATCATGACCATATCCCTTAGATGGACCAAAAAATACACTTTCTGCTACGTCACTCAACCTCTGCCTAATGAACTAATTTATCTTCTACCCACCCATCACCAGCTACATGGCCTCTAACAAAATCACTGCAAGTCTCCGGCTTAAGCCCATCTCAGAGCCAAGTGACAAATCATACCAATGGAGTACCACACAGAATGGACACAGGGAGTTGACCCTTGGAGGTACTGGAAAGAGCAGGAACCTGGGCAATGAGCTGGTACATCATTCACTCGCACAACCACCTGAAATGAGGCAAAATTTCTTTTCCATTTTATGCATTTCATATCTACCAGGGTATTCATAAAGTATATGTGAAGTGCTCCCAAGCTGACACGTGTTCATGATTCGCTAATTCTTATTCCTTTTTTCTATTTTTCCAGTAATTAATCTTAAATTGCAATGAATGGCTCAAAACACATGAAGCTTTCTTAAAATGATGGTGGACATGCTGAACCCCATTTCTGTAATTAAATGTGATAAATATTGAGTAAATTTATCTCTGTCATATAGAAGTAAACTTCATAAACTTAAACTGCATAAGGACTTCTTATCACTCTGTATTTCCAACCAGGTACCTACTTTATGTGACAAGCTCTTTATTTGCTAGTAAAGACCAACAAATTTGGTGCATTCCTTCCACCACTCTGTGAATATATAACTAAAGACTAGAGTGTATTTGGACACTTTACTTGGGGTCTCTTTTGTCACAGAATGGTAGATTCCTAAAGAGAGACTATATATCTTTCCCTTTCACTGGAACTAATGTTAATCTAATAGAACTCAAAAACTACTTGGAAATGAGAAAGGTAAAAAAGATGTGACCCCACTGATTCTCTATGTATAAAAAATGCATTAATAGCATACAGATTATATTCATGACAGTGTTTCCTTATTAAAGGAAGAGGTATTGCAATGGCATGGACAATAAAGAACACTTCAATTTTATCTGTACTGTTTCATTTTTTCCATAAAGACAAAAAATATAAATATATCAGAATGTTGACAATGTCAATTTTCAGTTTGGGTCCCCAGGTGTTGATAATATTATTCTTTATTGTTTTTGTATTTTAAAACTTTATCAAATTGAAAGTAGATGACCTATAACAGAAATATGGAAAGATAGGAAAAAAATAAAAGGACTTTTTAAAGACAAAAAGAATGACTTAGCTCATTTACTTTTTGATACCACCAGGTAGAAGCATAAATCATATTTAGCTATAGAAATTATCAATTTTTTGTACCATAACAACAGTATCAATAATTATAATAGAATATTGTGGTTACAAGGCATTTATATTTTCAGGGAACTGTACATACCCTGTGGAGGTAGAAAAAGGACAGCCATAAGTACCCCTGTTTTACACATTGGCAAAATGACCCTTAAGAGCTAAATCAATGAGTCCATGTTACAAATCAGTGAGGAGTGAGTTAGACTTGAAACTGGAGCTTGCACTTAGGGTGGCCCATTCACTCTCACCTGAGTATGCTGGTTGGCAGTAGCCAACATGTCTCCAAATATGGGTCC
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Task1_train_10522
Consider a variant on Chromosome 6 in gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
TTCGTCTTCTCATGCTTGATGCTTAGCACATGCTAGGCATAGACTAGGTGGTCAATAAATGATTACTTGCTCAGCTGGGTAGATCAGTTCGAGGGTCAGTGATCATTAGATTCCGATCTCCTCCACAGCTCCGCTGTGTGAATTGGGGCAAAATACTCCACTCCTTTTAGCCTTGGTTTCCCCACCCATAGGTGGGGATAACAGGACCAACTCATGGGCTTCTGAGAACTAAACGAGAAATAAATGGAAGCTACCACTATCCAGTGGTAGTGGGAGATACAAAGAAGTTTCATAGAGGACATTAGTCAGGGGAATATCATCAAGTATAAAATTGAGATCAGATAAATGATATACAATTAACTATGAATATTGAGCCCAATTGTGTAGTTTATGTTGCCATTAAATAATTCTGAAAACAAAGCCATTGCCAGCAGGGTTAATGTGATAAAGTGGGAGGCAGACCGTTTCATGTATGCTACCCCCATCTTCCCTCTTGTCTCCGCCCTCTCCCTTCCTGCTCCCACCTCACCTCACCCCTGGATGATTCCAGATACACAGAGAATTTGGTGGCAAAGAGGTGAGGGCAGTAAGAAAAAGTTCTGAATCCTTGGCTTCAAGTGTTTGGCGAGGCAGAATGGCATTAAAGGGAGAGAAAAGAAAACTGAACAGCACCTATTATCCAGTCCTGAGTTTTCCAACTAGTGGACTCCAGTGTATGAAATATTGATTCCCTCAGCCTTCTGGAAATTGAGGCAGCACTTGGGGTCACCAAAGACCCCCAGCCAGTTGTCTTGGGCACCAAAAAATTCAGGCAGTCACCCAGCACGTCACTTGAGTAGTGTCATTTTCTAAGTGTGCCAGAGCACAAACAGGTTTGGAACAATAAGCAATGACCCAGATGTCCCCAAAACACTTAAACTATGGAAACAGAGGAGAGATGGGATTTTGATGAGAATCAAAGATGATGTAATTTCAAGGCTGATAAAGAGTCCTCTTGCCACCCATCCCCAAGTTCCCCTGCCTTCAGTACTGCAATGTTTAGGCAAAAGACTGAAAAGTTGTACATTTTCTAAATCAAAATGTAAATTAAGGTATCATCTTTTTCTTCTTGGAGAGGGAAATAAACTATAAAAAGTAGGCTAGCTGAGCCCCAAAGCCACAAGGGATTTGACAGAGAAGGAAACATGAGCAAAAGTTGGAAGCCTGAAGACACTGAGGGCAAACTGCACCATTCTGCCTTGGCTGTGGGCGCACATCACACACAGACACCTCAGCAGGGCCCAGGAGGAGGACTTTGTCCCTAAGACTAGCGGGCAAGAGCCAGGTGAGACCACTGTGCCCAAGAGTGGTCAAGGGAGAGTTCGGGAAGGAAGAGCCGGGCCTGATCTCTAAATAATGAGTAGGAAGAGTCTGGAGAGACAGAAAGGACAAGGGCCTTCTCTCTGAAGAAGATGATTACCTTCTAACTCTCACTGCGTCTGTCTTGAAGGTTGTAAATCAGACTCTTGGCCCATTTACAGAGACAGACACTGCTGAGTTCCTTCCAGCACCTGGTATGACATATTAACTCATGGAAAGGTGGAGAAATCCTGCTAGTCTAATGATAACAATAATAATAACAATAATTGCTTATATTTATTAGACACCTTCTATGGACAAGACCAGTAAGGAGTACTTTATATTAAACTTTAGTTAATCTTCACCGTAATCTAATGAAGTAGGGTCCTTATTATACCCATTTTACAGATGAAGAAACCAAGACTTCCCAGCAAGAAAGTGGGAAAACTGGAGTAAGAATACAGACACCAGAAGTAAGAGAAAATCGTGGGGAAAATAGGAAAGAAGAGGGACTAGAGAGACATAGTACCAAAGACACATAATCCCAGCCCCATCTGTTTTCTAGAGCCAAGGCAGGCAAAAAGGAGGATCACCTGTTCTCTCCTCATTAAAAAAAACAGTAACCCCTAGCAGGAAAGTTTGAGGTAGGCATGTGACCGGCTTGTGGAGGAGAGAGAATTTGATGATTACCTGTTACGTTTGTGTCTGCAATAATAATTTCATCCACATAGAACAGGCCCGTCTCCTGGGCCAGAGGGAGAAGGTTGATCTGATGAACCAGCACTGGGGAGTTTGCCGGAGGGGGCTGGAGATCCCCGAAGCAACGCACACAAGTCTCCCAGAGGTCAGTGCAATCGAACTGCCAGCTGAAAAACAGCATGGAGCAGAACTGGGCTCTCAGGGAGCACTTGCAGTCCTCTCCGGTTAGAGCCCTTGTTCCCAACCTGGGGGGCCTGTGAGCTATGCAGCCAGGAGAGAGACCCCATGAACCCCTGCACCCAAGCAGTCCTGGGTGCCAAGGCTACAAACATCCCACCCAAGATGGGATCAGCTCAGCCTTGGTTATAATGCTAGTAGTCACCTTTTAAGTCAATCATTCATCCATGACATGCAATGTCAGCAGCATTTTCAAATTACAGTTTAACTGTGTGTCTTAAGCAAATTATAATGTGAGGCTGTAACCACAGAGAAGATTGATACTTCTGGACATTACCAGTTTCATTTAGGTTTAAGACCATTTACAAGACCCATGAGAATTATGTGGAAAGCACTGAATCAAGGGATCAAGACAGCTGAATTTTATTCCAGGGTCACTAGCTGAATGAATTTTGATGAATCACAAATTCTTGGGGCCCCAAATTTCCTCTTTCTGTCATGTCAAAGAATGTTCTCTAAGGTTTCCCCCAACTACGCTGTTCTACAATTCTATCCCTATGAGAAATGTCAGACTCCCTCTAGGGAGTAGTATATTCTTAACAACTAACTGCTCTGGAGTCAAACTTTTTTGTCAAATAAAATATATTCAAATCCCCAAATTAGTGTATGAGGCCCAAATATAAGACCATTAGTGCCTGAGGTGGGTAACTGTCCCCAAAACAGTGAATCCTCCCAGCTGACTGAATTCCCACCACGCCTCCCCACCGATTAGCTACCTCTCGGGGCTGGTCCTCGTGAGACTCCAGTCACAGGTGGTATTCTTTACCATGTTTTGAAAGCCGATTGTGAAGGACACAATCATCTTCAGGATCTTGTTCATGTGGCCTTTGTATGCAAGACACAGCTATGGACACCAAATAAGTCCTTCAGTTCTATTAGTGCAAGAAGCAGTCATTCAAACAATACGTAGTGAGGAGTCCACATCCCTAGAACCCTGCCATAGGCTCTGAGAGAGTCAGCACAGTTCCTGCCCTTCCAGAGCTTACCAGTGTAGCCAGAGAGACAAATAACTTAAATTGTTATTTCCCTACCTAAATAAAGCTAAGGAAAAATACAATAAATACTTTTTCTGAGACCAAAAAAATGTCATCAAACAGAGTTTTTAAATGCTTAGCACTGTGCTTGGCAGTGAGGATTTTAGAGTATCTCACTTAAGAAAACCCCTGTTCTAACCCAATTACCCGTGCAACCTCGAGCAAGTAACTCAACCTCTCTGAGCCTCAGTTCCTCAACTCTAACTCCCCAGCATCCTTGGTTTCTAACTCAGTTAAAGGCAAAGCTGTTGCCACAAGAAGACTTTAGAGCAGGAGTTTTCAGCCTCGGCACTATCAATATTCTAGGGGCTGGATAATTCTTTGTCATAGGGGCTGTTCTGTGCATTATAGGATGTTCAACAGCTTCCCTGGCCTCCACCCACCAGATGCCAATAGCACTTCCCCAGTTGCAACAACGAAAACTGTCTCCATACATTGCCAACTCTTCCCTGGGGGGCAAAATCACCTCCACTGGGCGCCCCTGCAGAAGAGATGAGGCTGAAGAAGGGAGGAGCTCAAGCCTGAAACATTTAGCCCCAACTCCCACAGCAGCCCAACTAGGAAAAGACTAGAAACTACTGCCATGAGCTCCACCACTCCAGCAAAACTCACTCTGGTTCCCAAAGGGCAAATCAGCTGCACTTCTTTTACAAGGGTGGTGGAGCTATCGAAGCAAAGGATTTAAGAAGTGTTTGCGAAATGCATCAGACAATTCAATCCATCAATAATGACAACAACTAGAGTAATAATAATTAGCCTTCACTGGGTCCTAACTGTGCAGGCACTTT
TTCGTCTTCTCATGCTTGATGCTTAGCACATGCTAGGCATAGACTAGGTGGTCAATAAATGATTACTTGCTCAGCTGGGTAGATCAGTTCGAGGGTCAGTGATCATTAGATTCCGATCTCCTCCACAGCTCCGCTGTGTGAATTGGGGCAAAATACTCCACTCCTTTTAGCCTTGGTTTCCCCACCCATAGGTGGGGATAACAGGACCAACTCATGGGCTTCTGAGAACTAAACGAGAAATAAATGGAAGCTACCACTATCCAGTGGTAGTGGGAGATACAAAGAAGTTTCATAGAGGACATTAGTCAGGGGAATATCATCAAGTATAAAATTGAGATCAGATAAATGATATACAATTAACTATGAATATTGAGCCCAATTGTGTAGTTTATGTTGCCATTAAATAATTCTGAAAACAAAGCCATTGCCAGCAGGGTTAATGTGATAAAGTGGGAGGCAGACCGTTTCATGTATGCTACCCCCATCTTCCCTCTTGTCTCCGCCCTCTCCCTTCCTGCTCCCACCTCACCTCACCCCTGGATGATTCCAGATACACAGAGAATTTGGTGGCAAAGAGGTGAGGGCAGTAAGAAAAAGTTCTGAATCCTTGGCTTCAAGTGTTTGGCGAGGCAGAATGGCATTAAAGGGAGAGAAAAGAAAACTGAACAGCACCTATTATCCAGTCCTGAGTTTTCCAACTAGTGGACTCCAGTGTATGAAATATTGATTCCCTCAGCCTTCTGGAAATTGAGGCAGCACTTGGGGTCACCAAAGACCCCCAGCCAGTTGTCTTGGGCACCAAAAAATTCAGGCAGTCACCCAGCACGTCACTTGAGTAGTGTCATTTTCTAAGTGTGCCAGAGCACAAACAGGTTTGGAACAATAAGCAATGACCCAGATGTCCCCAAAACACTTAAACTATGGAAACAGAGGAGAGATGGGATTTTGATGAGAATCAAAGATGATGTAATTTCAAGGCTGATAAAGAGTCCTCTTGCCACCCATCCCCAAGTTCCCCTGCCTTCAGTACTGCAATGTTTAGGCAAAAGACTGAAAAGTTGTACATTTTCTAAATCAAAATGTAAATTAAGGTATCATCTTTTTCTTCTTGGAGAGGGAAATAAACTATAAAAAGTAGGCTAGCTGAGCCCCAAAGCCACAAGGGATTTGACAGAGAAGGAAACATGAGCAAAAGTTGGAAGCCTGAAGACACTGAGGGCAAACTGCACCATTCTGCCTTGGCTGTGGGCGCACATCACACACAGACACCTCAGCAGGGCCCAGGAGGAGGACTTTGTCCCTAAGACTAGCGGGCAAGAGCCAGGTGAGACCACTGTGCCCAAGAGTGGTCAAGGGAGAGTTCGGGAAGGAAGAGCCGGGCCTGATCTCTAAATAATGAGTAGGAAGAGTCTGGAGAGACAGAAAGGACAAGGGCCTTCTCTCTGAAGAAGATGATTACCTTCTAACTCTCACTGCGTCTGTCTTGAAGGTTGTAAATCAGACTCTTGGCCCATTTACAGAGACAGACACTGCTGAGTTCCTTCCAGCACCTGGTATGACATATTAACTCATGGAAAGGTGGAGAAATCCTGCTAGTCTAATGATAACAATAATAATAACAATAATTGCTTATATTTATTAGACACCTTCTATGGACAAGACCAGTAAGGAGTACTTTATATTAAACTTTAGTTAATCTTCACCGTAATCTAATGAAGTAGGGTCCTTATTATACCCATTTTACAGATGAAGAAACCAAGACTTCCCAGCAAGAAAGTGGGAAAACTGGAGTAAGAATACAGACACCAGAAGTAAGAGAAAATCGTGGGGAAAATAGGAAAGAAGAGGGACTAGAGAGACATAGTACCAAAGACACATAATCCCAGCCCCATCTGTTTTCTAGAGCCAAGGCAGGCAAAAAGGAGGATCACCTGTTCTCTCCTCATTAAAAAAAACAGTAACCCCTAGCAGGAAAGTTTGAGGTAGGCATGTGACCGGCTTGTGGAGGAGAGAGAATTTGATGATTACCTGTTACGTTTGTGTCTGCAGTAATAATTTCATCCACATAGAACAGGCCCGTCTCCTGGGCCAGAGGGAGAAGGTTGATCTGATGAACCAGCACTGGGGAGTTTGCCGGAGGGGGCTGGAGATCCCCGAAGCAACGCACACAAGTCTCCCAGAGGTCAGTGCAATCGAACTGCCAGCTGAAAAACAGCATGGAGCAGAACTGGGCTCTCAGGGAGCACTTGCAGTCCTCTCCGGTTAGAGCCCTTGTTCCCAACCTGGGGGGCCTGTGAGCTATGCAGCCAGGAGAGAGACCCCATGAACCCCTGCACCCAAGCAGTCCTGGGTGCCAAGGCTACAAACATCCCACCCAAGATGGGATCAGCTCAGCCTTGGTTATAATGCTAGTAGTCACCTTTTAAGTCAATCATTCATCCATGACATGCAATGTCAGCAGCATTTTCAAATTACAGTTTAACTGTGTGTCTTAAGCAAATTATAATGTGAGGCTGTAACCACAGAGAAGATTGATACTTCTGGACATTACCAGTTTCATTTAGGTTTAAGACCATTTACAAGACCCATGAGAATTATGTGGAAAGCACTGAATCAAGGGATCAAGACAGCTGAATTTTATTCCAGGGTCACTAGCTGAATGAATTTTGATGAATCACAAATTCTTGGGGCCCCAAATTTCCTCTTTCTGTCATGTCAAAGAATGTTCTCTAAGGTTTCCCCCAACTACGCTGTTCTACAATTCTATCCCTATGAGAAATGTCAGACTCCCTCTAGGGAGTAGTATATTCTTAACAACTAACTGCTCTGGAGTCAAACTTTTTTGTCAAATAAAATATATTCAAATCCCCAAATTAGTGTATGAGGCCCAAATATAAGACCATTAGTGCCTGAGGTGGGTAACTGTCCCCAAAACAGTGAATCCTCCCAGCTGACTGAATTCCCACCACGCCTCCCCACCGATTAGCTACCTCTCGGGGCTGGTCCTCGTGAGACTCCAGTCACAGGTGGTATTCTTTACCATGTTTTGAAAGCCGATTGTGAAGGACACAATCATCTTCAGGATCTTGTTCATGTGGCCTTTGTATGCAAGACACAGCTATGGACACCAAATAAGTCCTTCAGTTCTATTAGTGCAAGAAGCAGTCATTCAAACAATACGTAGTGAGGAGTCCACATCCCTAGAACCCTGCCATAGGCTCTGAGAGAGTCAGCACAGTTCCTGCCCTTCCAGAGCTTACCAGTGTAGCCAGAGAGACAAATAACTTAAATTGTTATTTCCCTACCTAAATAAAGCTAAGGAAAAATACAATAAATACTTTTTCTGAGACCAAAAAAATGTCATCAAACAGAGTTTTTAAATGCTTAGCACTGTGCTTGGCAGTGAGGATTTTAGAGTATCTCACTTAAGAAAACCCCTGTTCTAACCCAATTACCCGTGCAACCTCGAGCAAGTAACTCAACCTCTCTGAGCCTCAGTTCCTCAACTCTAACTCCCCAGCATCCTTGGTTTCTAACTCAGTTAAAGGCAAAGCTGTTGCCACAAGAAGACTTTAGAGCAGGAGTTTTCAGCCTCGGCACTATCAATATTCTAGGGGCTGGATAATTCTTTGTCATAGGGGCTGTTCTGTGCATTATAGGATGTTCAACAGCTTCCCTGGCCTCCACCCACCAGATGCCAATAGCACTTCCCCAGTTGCAACAACGAAAACTGTCTCCATACATTGCCAACTCTTCCCTGGGGGGCAAAATCACCTCCACTGGGCGCCCCTGCAGAAGAGATGAGGCTGAAGAAGGGAGGAGCTCAAGCCTGAAACATTTAGCCCCAACTCCCACAGCAGCCCAACTAGGAAAAGACTAGAAACTACTGCCATGAGCTCCACCACTCCAGCAAAACTCACTCTGGTTCCCAAAGGGCAAATCAGCTGCACTTCTTTTACAAGGGTGGTGGAGCTATCGAAGCAAAGGATTTAAGAAGTGTTTGCGAAATGCATCAGACAATTCAATCCATCAATAATGACAACAACTAGAGTAATAATAATTAGCCTTCACTGGGTCCTAACTGTGCAGGCACTTT
Task1_train_10523
This variant impacts the gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
GCTTGATGCTTAGCACATGCTAGGCATAGACTAGGTGGTCAATAAATGATTACTTGCTCAGCTGGGTAGATCAGTTCGAGGGTCAGTGATCATTAGATTCCGATCTCCTCCACAGCTCCGCTGTGTGAATTGGGGCAAAATACTCCACTCCTTTTAGCCTTGGTTTCCCCACCCATAGGTGGGGATAACAGGACCAACTCATGGGCTTCTGAGAACTAAACGAGAAATAAATGGAAGCTACCACTATCCAGTGGTAGTGGGAGATACAAAGAAGTTTCATAGAGGACATTAGTCAGGGGAATATCATCAAGTATAAAATTGAGATCAGATAAATGATATACAATTAACTATGAATATTGAGCCCAATTGTGTAGTTTATGTTGCCATTAAATAATTCTGAAAACAAAGCCATTGCCAGCAGGGTTAATGTGATAAAGTGGGAGGCAGACCGTTTCATGTATGCTACCCCCATCTTCCCTCTTGTCTCCGCCCTCTCCCTTCCTGCTCCCACCTCACCTCACCCCTGGATGATTCCAGATACACAGAGAATTTGGTGGCAAAGAGGTGAGGGCAGTAAGAAAAAGTTCTGAATCCTTGGCTTCAAGTGTTTGGCGAGGCAGAATGGCATTAAAGGGAGAGAAAAGAAAACTGAACAGCACCTATTATCCAGTCCTGAGTTTTCCAACTAGTGGACTCCAGTGTATGAAATATTGATTCCCTCAGCCTTCTGGAAATTGAGGCAGCACTTGGGGTCACCAAAGACCCCCAGCCAGTTGTCTTGGGCACCAAAAAATTCAGGCAGTCACCCAGCACGTCACTTGAGTAGTGTCATTTTCTAAGTGTGCCAGAGCACAAACAGGTTTGGAACAATAAGCAATGACCCAGATGTCCCCAAAACACTTAAACTATGGAAACAGAGGAGAGATGGGATTTTGATGAGAATCAAAGATGATGTAATTTCAAGGCTGATAAAGAGTCCTCTTGCCACCCATCCCCAAGTTCCCCTGCCTTCAGTACTGCAATGTTTAGGCAAAAGACTGAAAAGTTGTACATTTTCTAAATCAAAATGTAAATTAAGGTATCATCTTTTTCTTCTTGGAGAGGGAAATAAACTATAAAAAGTAGGCTAGCTGAGCCCCAAAGCCACAAGGGATTTGACAGAGAAGGAAACATGAGCAAAAGTTGGAAGCCTGAAGACACTGAGGGCAAACTGCACCATTCTGCCTTGGCTGTGGGCGCACATCACACACAGACACCTCAGCAGGGCCCAGGAGGAGGACTTTGTCCCTAAGACTAGCGGGCAAGAGCCAGGTGAGACCACTGTGCCCAAGAGTGGTCAAGGGAGAGTTCGGGAAGGAAGAGCCGGGCCTGATCTCTAAATAATGAGTAGGAAGAGTCTGGAGAGACAGAAAGGACAAGGGCCTTCTCTCTGAAGAAGATGATTACCTTCTAACTCTCACTGCGTCTGTCTTGAAGGTTGTAAATCAGACTCTTGGCCCATTTACAGAGACAGACACTGCTGAGTTCCTTCCAGCACCTGGTATGACATATTAACTCATGGAAAGGTGGAGAAATCCTGCTAGTCTAATGATAACAATAATAATAACAATAATTGCTTATATTTATTAGACACCTTCTATGGACAAGACCAGTAAGGAGTACTTTATATTAAACTTTAGTTAATCTTCACCGTAATCTAATGAAGTAGGGTCCTTATTATACCCATTTTACAGATGAAGAAACCAAGACTTCCCAGCAAGAAAGTGGGAAAACTGGAGTAAGAATACAGACACCAGAAGTAAGAGAAAATCGTGGGGAAAATAGGAAAGAAGAGGGACTAGAGAGACATAGTACCAAAGACACATAATCCCAGCCCCATCTGTTTTCTAGAGCCAAGGCAGGCAAAAAGGAGGATCACCTGTTCTCTCCTCATTAAAAAAAACAGTAACCCCTAGCAGGAAAGTTTGAGGTAGGCATGTGACCGGCTTGTGGAGGAGAGAGAATTTGATGATTACCTGTTACGTTTGTGTCTGCAATAATAATTTCATCCACATAGAACAGGCCCGTCTCCTGGGCCAGAGGGAGAAGGTTGATCTGATGAACCAGCACTGGGGAGTTTGCCGGAGGGGGCTGGAGATCCCCGAAGCAACGCACACAAGTCTCCCAGAGGTCAGTGCAATCGAACTGCCAGCTGAAAAACAGCATGGAGCAGAACTGGGCTCTCAGGGAGCACTTGCAGTCCTCTCCGGTTAGAGCCCTTGTTCCCAACCTGGGGGGCCTGTGAGCTATGCAGCCAGGAGAGAGACCCCATGAACCCCTGCACCCAAGCAGTCCTGGGTGCCAAGGCTACAAACATCCCACCCAAGATGGGATCAGCTCAGCCTTGGTTATAATGCTAGTAGTCACCTTTTAAGTCAATCATTCATCCATGACATGCAATGTCAGCAGCATTTTCAAATTACAGTTTAACTGTGTGTCTTAAGCAAATTATAATGTGAGGCTGTAACCACAGAGAAGATTGATACTTCTGGACATTACCAGTTTCATTTAGGTTTAAGACCATTTACAAGACCCATGAGAATTATGTGGAAAGCACTGAATCAAGGGATCAAGACAGCTGAATTTTATTCCAGGGTCACTAGCTGAATGAATTTTGATGAATCACAAATTCTTGGGGCCCCAAATTTCCTCTTTCTGTCATGTCAAAGAATGTTCTCTAAGGTTTCCCCCAACTACGCTGTTCTACAATTCTATCCCTATGAGAAATGTCAGACTCCCTCTAGGGAGTAGTATATTCTTAACAACTAACTGCTCTGGAGTCAAACTTTTTTGTCAAATAAAATATATTCAAATCCCCAAATTAGTGTATGAGGCCCAAATATAAGACCATTAGTGCCTGAGGTGGGTAACTGTCCCCAAAACAGTGAATCCTCCCAGCTGACTGAATTCCCACCACGCCTCCCCACCGATTAGCTACCTCTCGGGGCTGGTCCTCGTGAGACTCCAGTCACAGGTGGTATTCTTTACCATGTTTTGAAAGCCGATTGTGAAGGACACAATCATCTTCAGGATCTTGTTCATGTGGCCTTTGTATGCAAGACACAGCTATGGACACCAAATAAGTCCTTCAGTTCTATTAGTGCAAGAAGCAGTCATTCAAACAATACGTAGTGAGGAGTCCACATCCCTAGAACCCTGCCATAGGCTCTGAGAGAGTCAGCACAGTTCCTGCCCTTCCAGAGCTTACCAGTGTAGCCAGAGAGACAAATAACTTAAATTGTTATTTCCCTACCTAAATAAAGCTAAGGAAAAATACAATAAATACTTTTTCTGAGACCAAAAAAATGTCATCAAACAGAGTTTTTAAATGCTTAGCACTGTGCTTGGCAGTGAGGATTTTAGAGTATCTCACTTAAGAAAACCCCTGTTCTAACCCAATTACCCGTGCAACCTCGAGCAAGTAACTCAACCTCTCTGAGCCTCAGTTCCTCAACTCTAACTCCCCAGCATCCTTGGTTTCTAACTCAGTTAAAGGCAAAGCTGTTGCCACAAGAAGACTTTAGAGCAGGAGTTTTCAGCCTCGGCACTATCAATATTCTAGGGGCTGGATAATTCTTTGTCATAGGGGCTGTTCTGTGCATTATAGGATGTTCAACAGCTTCCCTGGCCTCCACCCACCAGATGCCAATAGCACTTCCCCAGTTGCAACAACGAAAACTGTCTCCATACATTGCCAACTCTTCCCTGGGGGGCAAAATCACCTCCACTGGGCGCCCCTGCAGAAGAGATGAGGCTGAAGAAGGGAGGAGCTCAAGCCTGAAACATTTAGCCCCAACTCCCACAGCAGCCCAACTAGGAAAAGACTAGAAACTACTGCCATGAGCTCCACCACTCCAGCAAAACTCACTCTGGTTCCCAAAGGGCAAATCAGCTGCACTTCTTTTACAAGGGTGGTGGAGCTATCGAAGCAAAGGATTTAAGAAGTGTTTGCGAAATGCATCAGACAATTCAATCCATCAATAATGACAACAACTAGAGTAATAATAATTAGCCTTCACTGGGTCCTAACTGTGCAGGCACTTTACTAGATTATCTC
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Task1_train_10524
Chromosome 6 houses a mutation in gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
GCTTGATGCTTAGCACATGCTAGGCATAGACTAGGTGGTCAATAAATGATTACTTGCTCAGCTGGGTAGATCAGTTCGAGGGTCAGTGATCATTAGATTCCGATCTCCTCCACAGCTCCGCTGTGTGAATTGGGGCAAAATACTCCACTCCTTTTAGCCTTGGTTTCCCCACCCATAGGTGGGGATAACAGGACCAACTCATGGGCTTCTGAGAACTAAACGAGAAATAAATGGAAGCTACCACTATCCAGTGGTAGTGGGAGATACAAAGAAGTTTCATAGAGGACATTAGTCAGGGGAATATCATCAAGTATAAAATTGAGATCAGATAAATGATATACAATTAACTATGAATATTGAGCCCAATTGTGTAGTTTATGTTGCCATTAAATAATTCTGAAAACAAAGCCATTGCCAGCAGGGTTAATGTGATAAAGTGGGAGGCAGACCGTTTCATGTATGCTACCCCCATCTTCCCTCTTGTCTCCGCCCTCTCCCTTCCTGCTCCCACCTCACCTCACCCCTGGATGATTCCAGATACACAGAGAATTTGGTGGCAAAGAGGTGAGGGCAGTAAGAAAAAGTTCTGAATCCTTGGCTTCAAGTGTTTGGCGAGGCAGAATGGCATTAAAGGGAGAGAAAAGAAAACTGAACAGCACCTATTATCCAGTCCTGAGTTTTCCAACTAGTGGACTCCAGTGTATGAAATATTGATTCCCTCAGCCTTCTGGAAATTGAGGCAGCACTTGGGGTCACCAAAGACCCCCAGCCAGTTGTCTTGGGCACCAAAAAATTCAGGCAGTCACCCAGCACGTCACTTGAGTAGTGTCATTTTCTAAGTGTGCCAGAGCACAAACAGGTTTGGAACAATAAGCAATGACCCAGATGTCCCCAAAACACTTAAACTATGGAAACAGAGGAGAGATGGGATTTTGATGAGAATCAAAGATGATGTAATTTCAAGGCTGATAAAGAGTCCTCTTGCCACCCATCCCCAAGTTCCCCTGCCTTCAGTACTGCAATGTTTAGGCAAAAGACTGAAAAGTTGTACATTTTCTAAATCAAAATGTAAATTAAGGTATCATCTTTTTCTTCTTGGAGAGGGAAATAAACTATAAAAAGTAGGCTAGCTGAGCCCCAAAGCCACAAGGGATTTGACAGAGAAGGAAACATGAGCAAAAGTTGGAAGCCTGAAGACACTGAGGGCAAACTGCACCATTCTGCCTTGGCTGTGGGCGCACATCACACACAGACACCTCAGCAGGGCCCAGGAGGAGGACTTTGTCCCTAAGACTAGCGGGCAAGAGCCAGGTGAGACCACTGTGCCCAAGAGTGGTCAAGGGAGAGTTCGGGAAGGAAGAGCCGGGCCTGATCTCTAAATAATGAGTAGGAAGAGTCTGGAGAGACAGAAAGGACAAGGGCCTTCTCTCTGAAGAAGATGATTACCTTCTAACTCTCACTGCGTCTGTCTTGAAGGTTGTAAATCAGACTCTTGGCCCATTTACAGAGACAGACACTGCTGAGTTCCTTCCAGCACCTGGTATGACATATTAACTCATGGAAAGGTGGAGAAATCCTGCTAGTCTAATGATAACAATAATAATAACAATAATTGCTTATATTTATTAGACACCTTCTATGGACAAGACCAGTAAGGAGTACTTTATATTAAACTTTAGTTAATCTTCACCGTAATCTAATGAAGTAGGGTCCTTATTATACCCATTTTACAGATGAAGAAACCAAGACTTCCCAGCAAGAAAGTGGGAAAACTGGAGTAAGAATACAGACACCAGAAGTAAGAGAAAATCGTGGGGAAAATAGGAAAGAAGAGGGACTAGAGAGACATAGTACCAAAGACACATAATCCCAGCCCCATCTGTTTTCTAGAGCCAAGGCAGGCAAAAAGGAGGATCACCTGTTCTCTCCTCATTAAAAAAAACAGTAACCCCTAGCAGGAAAGTTTGAGGTAGGCATGTGACCGGCTTGTGGAGGAGAGAGAATTTGATGATTACCTGTTACGTTTGTGTCTGCAATAATAATTTCATCCACATAGAACAGGCCCGTCTCCTGGGCCAGAGGGAGAAGGTTGATCTGATGAACCAGCACTGGGGAGTTTGCCGGAGGGGGCTGGAGATCCCCGAAGCAACGCACACAAGTCTCCCAGAGGTCAGTGCAATCGAACTGCCAGCTGAAAAACAGCATGGAGCAGAACTGGGCTCTCAGGGAGCACTTGCAGTCCTCTCCGGTTAGAGCCCTTGTTCCCAACCTGGGGGGCCTGTGAGCTATGCAGCCAGGAGAGAGACCCCATGAACCCCTGCACCCAAGCAGTCCTGGGTGCCAAGGCTACAAACATCCCACCCAAGATGGGATCAGCTCAGCCTTGGTTATAATGCTAGTAGTCACCTTTTAAGTCAATCATTCATCCATGACATGCAATGTCAGCAGCATTTTCAAATTACAGTTTAACTGTGTGTCTTAAGCAAATTATAATGTGAGGCTGTAACCACAGAGAAGATTGATACTTCTGGACATTACCAGTTTCATTTAGGTTTAAGACCATTTACAAGACCCATGAGAATTATGTGGAAAGCACTGAATCAAGGGATCAAGACAGCTGAATTTTATTCCAGGGTCACTAGCTGAATGAATTTTGATGAATCACAAATTCTTGGGGCCCCAAATTTCCTCTTTCTGTCATGTCAAAGAATGTTCTCTAAGGTTTCCCCCAACTACGCTGTTCTACAATTCTATCCCTATGAGAAATGTCAGACTCCCTCTAGGGAGTAGTATATTCTTAACAACTAACTGCTCTGGAGTCAAACTTTTTTGTCAAATAAAATATATTCAAATCCCCAAATTAGTGTATGAGGCCCAAATATAAGACCATTAGTGCCTGAGGTGGGTAACTGTCCCCAAAACAGTGAATCCTCCCAGCTGACTGAATTCCCACCACGCCTCCCCACCGATTAGCTACCTCTCGGGGCTGGTCCTCGTGAGACTCCAGTCACAGGTGGTATTCTTTACCATGTTTTGAAAGCCGATTGTGAAGGACACAATCATCTTCAGGATCTTGTTCATGTGGCCTTTGTATGCAAGACACAGCTATGGACACCAAATAAGTCCTTCAGTTCTATTAGTGCAAGAAGCAGTCATTCAAACAATACGTAGTGAGGAGTCCACATCCCTAGAACCCTGCCATAGGCTCTGAGAGAGTCAGCACAGTTCCTGCCCTTCCAGAGCTTACCAGTGTAGCCAGAGAGACAAATAACTTAAATTGTTATTTCCCTACCTAAATAAAGCTAAGGAAAAATACAATAAATACTTTTTCTGAGACCAAAAAAATGTCATCAAACAGAGTTTTTAAATGCTTAGCACTGTGCTTGGCAGTGAGGATTTTAGAGTATCTCACTTAAGAAAACCCCTGTTCTAACCCAATTACCCGTGCAACCTCGAGCAAGTAACTCAACCTCTCTGAGCCTCAGTTCCTCAACTCTAACTCCCCAGCATCCTTGGTTTCTAACTCAGTTAAAGGCAAAGCTGTTGCCACAAGAAGACTTTAGAGCAGGAGTTTTCAGCCTCGGCACTATCAATATTCTAGGGGCTGGATAATTCTTTGTCATAGGGGCTGTTCTGTGCATTATAGGATGTTCAACAGCTTCCCTGGCCTCCACCCACCAGATGCCAATAGCACTTCCCCAGTTGCAACAACGAAAACTGTCTCCATACATTGCCAACTCTTCCCTGGGGGGCAAAATCACCTCCACTGGGCGCCCCTGCAGAAGAGATGAGGCTGAAGAAGGGAGGAGCTCAAGCCTGAAACATTTAGCCCCAACTCCCACAGCAGCCCAACTAGGAAAAGACTAGAAACTACTGCCATGAGCTCCACCACTCCAGCAAAACTCACTCTGGTTCCCAAAGGGCAAATCAGCTGCACTTCTTTTACAAGGGTGGTGGAGCTATCGAAGCAAAGGATTTAAGAAGTGTTTGCGAAATGCATCAGACAATTCAATCCATCAATAATGACAACAACTAGAGTAATAATAATTAGCCTTCACTGGGTCCTAACTGTGCAGGCACTTTACTAGATTATCTC
GCTTGATGCTTAGCACATGCTAGGCATAGACTAGGTGGTCAATAAATGATTACTTGCTCAGCTGGGTAGATCAGTTCGAGGGTCAGTGATCATTAGATTCCGATCTCCTCCACAGCTCCGCTGTGTGAATTGGGGCAAAATACTCCACTCCTTTTAGCCTTGGTTTCCCCACCCATAGGTGGGGATAACAGGACCAACTCATGGGCTTCTGAGAACTAAACGAGAAATAAATGGAAGCTACCACTATCCAGTGGTAGTGGGAGATACAAAGAAGTTTCATAGAGGACATTAGTCAGGGGAATATCATCAAGTATAAAATTGAGATCAGATAAATGATATACAATTAACTATGAATATTGAGCCCAATTGTGTAGTTTATGTTGCCATTAAATAATTCTGAAAACAAAGCCATTGCCAGCAGGGTTAATGTGATAAAGTGGGAGGCAGACCGTTTCATGTATGCTACCCCCATCTTCCCTCTTGTCTCCGCCCTCTCCCTTCCTGCTCCCACCTCACCTCACCCCTGGATGATTCCAGATACACAGAGAATTTGGTGGCAAAGAGGTGAGGGCAGTAAGAAAAAGTTCTGAATCCTTGGCTTCAAGTGTTTGGCGAGGCAGAATGGCATTAAAGGGAGAGAAAAGAAAACTGAACAGCACCTATTATCCAGTCCTGAGTTTTCCAACTAGTGGACTCCAGTGTATGAAATATTGATTCCCTCAGCCTTCTGGAAATTGAGGCAGCACTTGGGGTCACCAAAGACCCCCAGCCAGTTGTCTTGGGCACCAAAAAATTCAGGCAGTCACCCAGCACGTCACTTGAGTAGTGTCATTTTCTAAGTGTGCCAGAGCACAAACAGGTTTGGAACAATAAGCAATGACCCAGATGTCCCCAAAACACTTAAACTATGGAAACAGAGGAGAGATGGGATTTTGATGAGAATCAAAGATGATGTAATTTCAAGGCTGATAAAGAGTCCTCTTGCCACCCATCCCCAAGTTCCCCTGCCTTCAGTACTGCAATGTTTAGGCAAAAGACTGAAAAGTTGTACATTTTCTAAATCAAAATGTAAATTAAGGTATCATCTTTTTCTTCTTGGAGAGGGAAATAAACTATAAAAAGTAGGCTAGCTGAGCCCCAAAGCCACAAGGGATTTGACAGAGAAGGAAACATGAGCAAAAGTTGGAAGCCTGAAGACACTGAGGGCAAACTGCACCATTCTGCCTTGGCTGTGGGCGCACATCACACACAGACACCTCAGCAGGGCCCAGGAGGAGGACTTTGTCCCTAAGACTAGCGGGCAAGAGCCAGGTGAGACCACTGTGCCCAAGAGTGGTCAAGGGAGAGTTCGGGAAGGAAGAGCCGGGCCTGATCTCTAAATAATGAGTAGGAAGAGTCTGGAGAGACAGAAAGGACAAGGGCCTTCTCTCTGAAGAAGATGATTACCTTCTAACTCTCACTGCGTCTGTCTTGAAGGTTGTAAATCAGACTCTTGGCCCATTTACAGAGACAGACACTGCTGAGTTCCTTCCAGCACCTGGTATGACATATTAACTCATGGAAAGGTGGAGAAATCCTGCTAGTCTAATGATAACAATAATAATAACAATAATTGCTTATATTTATTAGACACCTTCTATGGACAAGACCAGTAAGGAGTACTTTATATTAAACTTTAGTTAATCTTCACCGTAATCTAATGAAGTAGGGTCCTTATTATACCCATTTTACAGATGAAGAAACCAAGACTTCCCAGCAAGAAAGTGGGAAAACTGGAGTAAGAATACAGACACCAGAAGTAAGAGAAAATCGTGGGGAAAATAGGAAAGAAGAGGGACTAGAGAGACATAGTACCAAAGACACATAATCCCAGCCCCATCTGTTTTCTAGAGCCAAGGCAGGCAAAAAGGAGGATCACCTGTTCTCTCCTCATTAAAAAAAACAGTAACCCCTAGCAGGAAAGTTTGAGGTAGGCATGTGACCGGCTTGTGGAGGAGAGAGAATTTGATGATTACCTGTTACGTTTGTGTCTGCAATAATAATTTCATTCACATAGAACAGGCCCGTCTCCTGGGCCAGAGGGAGAAGGTTGATCTGATGAACCAGCACTGGGGAGTTTGCCGGAGGGGGCTGGAGATCCCCGAAGCAACGCACACAAGTCTCCCAGAGGTCAGTGCAATCGAACTGCCAGCTGAAAAACAGCATGGAGCAGAACTGGGCTCTCAGGGAGCACTTGCAGTCCTCTCCGGTTAGAGCCCTTGTTCCCAACCTGGGGGGCCTGTGAGCTATGCAGCCAGGAGAGAGACCCCATGAACCCCTGCACCCAAGCAGTCCTGGGTGCCAAGGCTACAAACATCCCACCCAAGATGGGATCAGCTCAGCCTTGGTTATAATGCTAGTAGTCACCTTTTAAGTCAATCATTCATCCATGACATGCAATGTCAGCAGCATTTTCAAATTACAGTTTAACTGTGTGTCTTAAGCAAATTATAATGTGAGGCTGTAACCACAGAGAAGATTGATACTTCTGGACATTACCAGTTTCATTTAGGTTTAAGACCATTTACAAGACCCATGAGAATTATGTGGAAAGCACTGAATCAAGGGATCAAGACAGCTGAATTTTATTCCAGGGTCACTAGCTGAATGAATTTTGATGAATCACAAATTCTTGGGGCCCCAAATTTCCTCTTTCTGTCATGTCAAAGAATGTTCTCTAAGGTTTCCCCCAACTACGCTGTTCTACAATTCTATCCCTATGAGAAATGTCAGACTCCCTCTAGGGAGTAGTATATTCTTAACAACTAACTGCTCTGGAGTCAAACTTTTTTGTCAAATAAAATATATTCAAATCCCCAAATTAGTGTATGAGGCCCAAATATAAGACCATTAGTGCCTGAGGTGGGTAACTGTCCCCAAAACAGTGAATCCTCCCAGCTGACTGAATTCCCACCACGCCTCCCCACCGATTAGCTACCTCTCGGGGCTGGTCCTCGTGAGACTCCAGTCACAGGTGGTATTCTTTACCATGTTTTGAAAGCCGATTGTGAAGGACACAATCATCTTCAGGATCTTGTTCATGTGGCCTTTGTATGCAAGACACAGCTATGGACACCAAATAAGTCCTTCAGTTCTATTAGTGCAAGAAGCAGTCATTCAAACAATACGTAGTGAGGAGTCCACATCCCTAGAACCCTGCCATAGGCTCTGAGAGAGTCAGCACAGTTCCTGCCCTTCCAGAGCTTACCAGTGTAGCCAGAGAGACAAATAACTTAAATTGTTATTTCCCTACCTAAATAAAGCTAAGGAAAAATACAATAAATACTTTTTCTGAGACCAAAAAAATGTCATCAAACAGAGTTTTTAAATGCTTAGCACTGTGCTTGGCAGTGAGGATTTTAGAGTATCTCACTTAAGAAAACCCCTGTTCTAACCCAATTACCCGTGCAACCTCGAGCAAGTAACTCAACCTCTCTGAGCCTCAGTTCCTCAACTCTAACTCCCCAGCATCCTTGGTTTCTAACTCAGTTAAAGGCAAAGCTGTTGCCACAAGAAGACTTTAGAGCAGGAGTTTTCAGCCTCGGCACTATCAATATTCTAGGGGCTGGATAATTCTTTGTCATAGGGGCTGTTCTGTGCATTATAGGATGTTCAACAGCTTCCCTGGCCTCCACCCACCAGATGCCAATAGCACTTCCCCAGTTGCAACAACGAAAACTGTCTCCATACATTGCCAACTCTTCCCTGGGGGGCAAAATCACCTCCACTGGGCGCCCCTGCAGAAGAGATGAGGCTGAAGAAGGGAGGAGCTCAAGCCTGAAACATTTAGCCCCAACTCCCACAGCAGCCCAACTAGGAAAAGACTAGAAACTACTGCCATGAGCTCCACCACTCCAGCAAAACTCACTCTGGTTCCCAAAGGGCAAATCAGCTGCACTTCTTTTACAAGGGTGGTGGAGCTATCGAAGCAAAGGATTTAAGAAGTGTTTGCGAAATGCATCAGACAATTCAATCCATCAATAATGACAACAACTAGAGTAATAATAATTAGCCTTCACTGGGTCCTAACTGTGCAGGCACTTTACTAGATTATCTC
Task1_train_10525
This gene mutation involves PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
ATACTCCACTCCTTTTAGCCTTGGTTTCCCCACCCATAGGTGGGGATAACAGGACCAACTCATGGGCTTCTGAGAACTAAACGAGAAATAAATGGAAGCTACCACTATCCAGTGGTAGTGGGAGATACAAAGAAGTTTCATAGAGGACATTAGTCAGGGGAATATCATCAAGTATAAAATTGAGATCAGATAAATGATATACAATTAACTATGAATATTGAGCCCAATTGTGTAGTTTATGTTGCCATTAAATAATTCTGAAAACAAAGCCATTGCCAGCAGGGTTAATGTGATAAAGTGGGAGGCAGACCGTTTCATGTATGCTACCCCCATCTTCCCTCTTGTCTCCGCCCTCTCCCTTCCTGCTCCCACCTCACCTCACCCCTGGATGATTCCAGATACACAGAGAATTTGGTGGCAAAGAGGTGAGGGCAGTAAGAAAAAGTTCTGAATCCTTGGCTTCAAGTGTTTGGCGAGGCAGAATGGCATTAAAGGGAGAGAAAAGAAAACTGAACAGCACCTATTATCCAGTCCTGAGTTTTCCAACTAGTGGACTCCAGTGTATGAAATATTGATTCCCTCAGCCTTCTGGAAATTGAGGCAGCACTTGGGGTCACCAAAGACCCCCAGCCAGTTGTCTTGGGCACCAAAAAATTCAGGCAGTCACCCAGCACGTCACTTGAGTAGTGTCATTTTCTAAGTGTGCCAGAGCACAAACAGGTTTGGAACAATAAGCAATGACCCAGATGTCCCCAAAACACTTAAACTATGGAAACAGAGGAGAGATGGGATTTTGATGAGAATCAAAGATGATGTAATTTCAAGGCTGATAAAGAGTCCTCTTGCCACCCATCCCCAAGTTCCCCTGCCTTCAGTACTGCAATGTTTAGGCAAAAGACTGAAAAGTTGTACATTTTCTAAATCAAAATGTAAATTAAGGTATCATCTTTTTCTTCTTGGAGAGGGAAATAAACTATAAAAAGTAGGCTAGCTGAGCCCCAAAGCCACAAGGGATTTGACAGAGAAGGAAACATGAGCAAAAGTTGGAAGCCTGAAGACACTGAGGGCAAACTGCACCATTCTGCCTTGGCTGTGGGCGCACATCACACACAGACACCTCAGCAGGGCCCAGGAGGAGGACTTTGTCCCTAAGACTAGCGGGCAAGAGCCAGGTGAGACCACTGTGCCCAAGAGTGGTCAAGGGAGAGTTCGGGAAGGAAGAGCCGGGCCTGATCTCTAAATAATGAGTAGGAAGAGTCTGGAGAGACAGAAAGGACAAGGGCCTTCTCTCTGAAGAAGATGATTACCTTCTAACTCTCACTGCGTCTGTCTTGAAGGTTGTAAATCAGACTCTTGGCCCATTTACAGAGACAGACACTGCTGAGTTCCTTCCAGCACCTGGTATGACATATTAACTCATGGAAAGGTGGAGAAATCCTGCTAGTCTAATGATAACAATAATAATAACAATAATTGCTTATATTTATTAGACACCTTCTATGGACAAGACCAGTAAGGAGTACTTTATATTAAACTTTAGTTAATCTTCACCGTAATCTAATGAAGTAGGGTCCTTATTATACCCATTTTACAGATGAAGAAACCAAGACTTCCCAGCAAGAAAGTGGGAAAACTGGAGTAAGAATACAGACACCAGAAGTAAGAGAAAATCGTGGGGAAAATAGGAAAGAAGAGGGACTAGAGAGACATAGTACCAAAGACACATAATCCCAGCCCCATCTGTTTTCTAGAGCCAAGGCAGGCAAAAAGGAGGATCACCTGTTCTCTCCTCATTAAAAAAAACAGTAACCCCTAGCAGGAAAGTTTGAGGTAGGCATGTGACCGGCTTGTGGAGGAGAGAGAATTTGATGATTACCTGTTACGTTTGTGTCTGCAATAATAATTTCATCCACATAGAACAGGCCCGTCTCCTGGGCCAGAGGGAGAAGGTTGATCTGATGAACCAGCACTGGGGAGTTTGCCGGAGGGGGCTGGAGATCCCCGAAGCAACGCACACAAGTCTCCCAGAGGTCAGTGCAATCGAACTGCCAGCTGAAAAACAGCATGGAGCAGAACTGGGCTCTCAGGGAGCACTTGCAGTCCTCTCCGGTTAGAGCCCTTGTTCCCAACCTGGGGGGCCTGTGAGCTATGCAGCCAGGAGAGAGACCCCATGAACCCCTGCACCCAAGCAGTCCTGGGTGCCAAGGCTACAAACATCCCACCCAAGATGGGATCAGCTCAGCCTTGGTTATAATGCTAGTAGTCACCTTTTAAGTCAATCATTCATCCATGACATGCAATGTCAGCAGCATTTTCAAATTACAGTTTAACTGTGTGTCTTAAGCAAATTATAATGTGAGGCTGTAACCACAGAGAAGATTGATACTTCTGGACATTACCAGTTTCATTTAGGTTTAAGACCATTTACAAGACCCATGAGAATTATGTGGAAAGCACTGAATCAAGGGATCAAGACAGCTGAATTTTATTCCAGGGTCACTAGCTGAATGAATTTTGATGAATCACAAATTCTTGGGGCCCCAAATTTCCTCTTTCTGTCATGTCAAAGAATGTTCTCTAAGGTTTCCCCCAACTACGCTGTTCTACAATTCTATCCCTATGAGAAATGTCAGACTCCCTCTAGGGAGTAGTATATTCTTAACAACTAACTGCTCTGGAGTCAAACTTTTTTGTCAAATAAAATATATTCAAATCCCCAAATTAGTGTATGAGGCCCAAATATAAGACCATTAGTGCCTGAGGTGGGTAACTGTCCCCAAAACAGTGAATCCTCCCAGCTGACTGAATTCCCACCACGCCTCCCCACCGATTAGCTACCTCTCGGGGCTGGTCCTCGTGAGACTCCAGTCACAGGTGGTATTCTTTACCATGTTTTGAAAGCCGATTGTGAAGGACACAATCATCTTCAGGATCTTGTTCATGTGGCCTTTGTATGCAAGACACAGCTATGGACACCAAATAAGTCCTTCAGTTCTATTAGTGCAAGAAGCAGTCATTCAAACAATACGTAGTGAGGAGTCCACATCCCTAGAACCCTGCCATAGGCTCTGAGAGAGTCAGCACAGTTCCTGCCCTTCCAGAGCTTACCAGTGTAGCCAGAGAGACAAATAACTTAAATTGTTATTTCCCTACCTAAATAAAGCTAAGGAAAAATACAATAAATACTTTTTCTGAGACCAAAAAAATGTCATCAAACAGAGTTTTTAAATGCTTAGCACTGTGCTTGGCAGTGAGGATTTTAGAGTATCTCACTTAAGAAAACCCCTGTTCTAACCCAATTACCCGTGCAACCTCGAGCAAGTAACTCAACCTCTCTGAGCCTCAGTTCCTCAACTCTAACTCCCCAGCATCCTTGGTTTCTAACTCAGTTAAAGGCAAAGCTGTTGCCACAAGAAGACTTTAGAGCAGGAGTTTTCAGCCTCGGCACTATCAATATTCTAGGGGCTGGATAATTCTTTGTCATAGGGGCTGTTCTGTGCATTATAGGATGTTCAACAGCTTCCCTGGCCTCCACCCACCAGATGCCAATAGCACTTCCCCAGTTGCAACAACGAAAACTGTCTCCATACATTGCCAACTCTTCCCTGGGGGGCAAAATCACCTCCACTGGGCGCCCCTGCAGAAGAGATGAGGCTGAAGAAGGGAGGAGCTCAAGCCTGAAACATTTAGCCCCAACTCCCACAGCAGCCCAACTAGGAAAAGACTAGAAACTACTGCCATGAGCTCCACCACTCCAGCAAAACTCACTCTGGTTCCCAAAGGGCAAATCAGCTGCACTTCTTTTACAAGGGTGGTGGAGCTATCGAAGCAAAGGATTTAAGAAGTGTTTGCGAAATGCATCAGACAATTCAATCCATCAATAATGACAACAACTAGAGTAATAATAATTAGCCTTCACTGGGTCCTAACTGTGCAGGCACTTTACTAGATTATCTCATTTAATCTATACCACAGTCCTGAGAGATAGACCACATTACTGTCCATTTTACAGATGAGTAAATGAAGGCATACTGTACTTAAGACAGACATGGAAGGTACATTGGGTGTGGAATCAGGATTTAAAACCAGATAGTCC
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Task1_train_10526
A variant found in Chromosome 6 affects PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
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Task1_train_10527
The variant affects gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin), which is on Chromosome 6. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
GTACTGCAATGTTTAGGCAAAAGACTGAAAAGTTGTACATTTTCTAAATCAAAATGTAAATTAAGGTATCATCTTTTTCTTCTTGGAGAGGGAAATAAACTATAAAAAGTAGGCTAGCTGAGCCCCAAAGCCACAAGGGATTTGACAGAGAAGGAAACATGAGCAAAAGTTGGAAGCCTGAAGACACTGAGGGCAAACTGCACCATTCTGCCTTGGCTGTGGGCGCACATCACACACAGACACCTCAGCAGGGCCCAGGAGGAGGACTTTGTCCCTAAGACTAGCGGGCAAGAGCCAGGTGAGACCACTGTGCCCAAGAGTGGTCAAGGGAGAGTTCGGGAAGGAAGAGCCGGGCCTGATCTCTAAATAATGAGTAGGAAGAGTCTGGAGAGACAGAAAGGACAAGGGCCTTCTCTCTGAAGAAGATGATTACCTTCTAACTCTCACTGCGTCTGTCTTGAAGGTTGTAAATCAGACTCTTGGCCCATTTACAGAGACAGACACTGCTGAGTTCCTTCCAGCACCTGGTATGACATATTAACTCATGGAAAGGTGGAGAAATCCTGCTAGTCTAATGATAACAATAATAATAACAATAATTGCTTATATTTATTAGACACCTTCTATGGACAAGACCAGTAAGGAGTACTTTATATTAAACTTTAGTTAATCTTCACCGTAATCTAATGAAGTAGGGTCCTTATTATACCCATTTTACAGATGAAGAAACCAAGACTTCCCAGCAAGAAAGTGGGAAAACTGGAGTAAGAATACAGACACCAGAAGTAAGAGAAAATCGTGGGGAAAATAGGAAAGAAGAGGGACTAGAGAGACATAGTACCAAAGACACATAATCCCAGCCCCATCTGTTTTCTAGAGCCAAGGCAGGCAAAAAGGAGGATCACCTGTTCTCTCCTCATTAAAAAAAACAGTAACCCCTAGCAGGAAAGTTTGAGGTAGGCATGTGACCGGCTTGTGGAGGAGAGAGAATTTGATGATTACCTGTTACGTTTGTGTCTGCAATAATAATTTCATCCACATAGAACAGGCCCGTCTCCTGGGCCAGAGGGAGAAGGTTGATCTGATGAACCAGCACTGGGGAGTTTGCCGGAGGGGGCTGGAGATCCCCGAAGCAACGCACACAAGTCTCCCAGAGGTCAGTGCAATCGAACTGCCAGCTGAAAAACAGCATGGAGCAGAACTGGGCTCTCAGGGAGCACTTGCAGTCCTCTCCGGTTAGAGCCCTTGTTCCCAACCTGGGGGGCCTGTGAGCTATGCAGCCAGGAGAGAGACCCCATGAACCCCTGCACCCAAGCAGTCCTGGGTGCCAAGGCTACAAACATCCCACCCAAGATGGGATCAGCTCAGCCTTGGTTATAATGCTAGTAGTCACCTTTTAAGTCAATCATTCATCCATGACATGCAATGTCAGCAGCATTTTCAAATTACAGTTTAACTGTGTGTCTTAAGCAAATTATAATGTGAGGCTGTAACCACAGAGAAGATTGATACTTCTGGACATTACCAGTTTCATTTAGGTTTAAGACCATTTACAAGACCCATGAGAATTATGTGGAAAGCACTGAATCAAGGGATCAAGACAGCTGAATTTTATTCCAGGGTCACTAGCTGAATGAATTTTGATGAATCACAAATTCTTGGGGCCCCAAATTTCCTCTTTCTGTCATGTCAAAGAATGTTCTCTAAGGTTTCCCCCAACTACGCTGTTCTACAATTCTATCCCTATGAGAAATGTCAGACTCCCTCTAGGGAGTAGTATATTCTTAACAACTAACTGCTCTGGAGTCAAACTTTTTTGTCAAATAAAATATATTCAAATCCCCAAATTAGTGTATGAGGCCCAAATATAAGACCATTAGTGCCTGAGGTGGGTAACTGTCCCCAAAACAGTGAATCCTCCCAGCTGACTGAATTCCCACCACGCCTCCCCACCGATTAGCTACCTCTCGGGGCTGGTCCTCGTGAGACTCCAGTCACAGGTGGTATTCTTTACCATGTTTTGAAAGCCGATTGTGAAGGACACAATCATCTTCAGGATCTTGTTCATGTGGCCTTTGTATGCAAGACACAGCTATGGACACCAAATAAGTCCTTCAGTTCTATTAGTGCAAGAAGCAGTCATTCAAACAATACGTAGTGAGGAGTCCACATCCCTAGAACCCTGCCATAGGCTCTGAGAGAGTCAGCACAGTTCCTGCCCTTCCAGAGCTTACCAGTGTAGCCAGAGAGACAAATAACTTAAATTGTTATTTCCCTACCTAAATAAAGCTAAGGAAAAATACAATAAATACTTTTTCTGAGACCAAAAAAATGTCATCAAACAGAGTTTTTAAATGCTTAGCACTGTGCTTGGCAGTGAGGATTTTAGAGTATCTCACTTAAGAAAACCCCTGTTCTAACCCAATTACCCGTGCAACCTCGAGCAAGTAACTCAACCTCTCTGAGCCTCAGTTCCTCAACTCTAACTCCCCAGCATCCTTGGTTTCTAACTCAGTTAAAGGCAAAGCTGTTGCCACAAGAAGACTTTAGAGCAGGAGTTTTCAGCCTCGGCACTATCAATATTCTAGGGGCTGGATAATTCTTTGTCATAGGGGCTGTTCTGTGCATTATAGGATGTTCAACAGCTTCCCTGGCCTCCACCCACCAGATGCCAATAGCACTTCCCCAGTTGCAACAACGAAAACTGTCTCCATACATTGCCAACTCTTCCCTGGGGGGCAAAATCACCTCCACTGGGCGCCCCTGCAGAAGAGATGAGGCTGAAGAAGGGAGGAGCTCAAGCCTGAAACATTTAGCCCCAACTCCCACAGCAGCCCAACTAGGAAAAGACTAGAAACTACTGCCATGAGCTCCACCACTCCAGCAAAACTCACTCTGGTTCCCAAAGGGCAAATCAGCTGCACTTCTTTTACAAGGGTGGTGGAGCTATCGAAGCAAAGGATTTAAGAAGTGTTTGCGAAATGCATCAGACAATTCAATCCATCAATAATGACAACAACTAGAGTAATAATAATTAGCCTTCACTGGGTCCTAACTGTGCAGGCACTTTACTAGATTATCTCATTTAATCTATACCACAGTCCTGAGAGATAGACCACATTACTGTCCATTTTACAGATGAGTAAATGAAGGCATACTGTACTTAAGACAGACATGGAAGGTACATTGGGTGTGGAATCAGGATTTAAAACCAGATAGTCCAATGACACAGTCTGTACTCTTAGAGATCAAAGAAAATATTGTAGCAAATAAAAACTTTCACAAGTCTCACAGCTAATACAAAGGCATTTCCAGGTAACAACACACAAGTGGGGGCCAGTGGTGTCCATTCATACCTGAAACAGCAGTCGAGAGACCTAGAACCTCAGCCTGAAACACCTTGGGCAGATCACAGCAATCACTCCTTTGTGCTTCTGAGTTTTCAGTCTTGAATCCAGAGAGCAATACCAATACCTACCCACCTGACCCAGAAGCACAAAGACTGCTACTCACGTGTGTATACTGATCTAGCCGATAGCCCTTCTGGGCAGCCGGGGGAGTAAGGACAAGGTGTCGAGGCTGACGGAGGCTGAACCTGCCACAGAAGGGCTCCGTCCCACTGGTGAGGTCCCCATCAGAGTTGGAAACTTCTGGGCCTGGATGCAGTTCAGATAAAATAGAAAGGCAGGCATAGATATTAAAAAAGACAGAGCTTCCCTACATGTGTGCATGAGGATTTTAGAGTATCTCACTTAAGAAAACCCCCGTTCTAACCCAATTACCCATGCAACCTTGAGTAAGTAACTCAACCTCTCTGAGCCTCAGTTCCTCAACTCTAACTCCCCCAGCATCCTTGGTTTCTAACTCAGGGACAAAGTTGTTGGCACAAGAAGACTTTAGAGCAGGAGTTTTCAACCTCAGCACTATTAATATTTTAGGGGCTGGATAATTCTTTGTTGTAGGGGCTGTCCTGTTCACCATGATATGGGCCCCTCAGCCCTGGGAGGAATGGCCACAGCATGAGTGGTCAGCACCCCTGGCTTGAAAGCTCCAGCTATAAGAAACTCATTCTGTGTTCCCTGGAGCCTTGAAAACC
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Task1_train_10528
A mutation in PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin), located on Chromosome 6, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
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Task1_train_10529
A genomic change on Chromosome 6 affects PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Polycystic kidney disease 4
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Task1_train_10530
A variant was discovered on Chromosome 6, affecting PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
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Task1_train_10531
This variant impacts the gene PKHD1 (PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin) on Chromosome 6. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Autosomal recessive polycystic kidney disease
ATTGCTGAGCACTATGCTACACACTTCCATATCATCTCATGTAGAAATCCCAGAGTCCCATCCCACAGCCTGGAATGGGAAAGTGGACACAGAGTTGTCATGGTATGCTGTGCTTTGCTTCTGTGACATTAGCAAGCCAGTATCTAGAAAGACAGAAGTTGGTCAGTCTGTTCGTCTCCCTTCAGGCCCACTTTTACACCTGTCCTTAGAAAAGGAAGAAAACCAAAGACTCATAGTCTTTAGGATTGTGGGTCAATACATAAGAAATGTGCACTTGGTAAAACCCCAACCTACCATCAAAAATGACTGTGATCCACGTTCCCCCTGCAAGGCTACCTTCTTCAGGTTCAATATGTAAACTCAGGTGACGTACTGTAAGTAAGTGAAAAAAAACATTGGTTTTGAAGGTCAGATTCAAACCACTACCTTCTGCAATATTTTAAGCAATATTTAACCTGCCTCAGAATCACCAGAAAGGCTTGATTAAGCACAGGTGGTTGCACCACATCCCCAGAGTTTCTGGTTCCGTAGGTCTGGGGCAGGCCCAAGAATCTACATTTCTAACCAGGTGCTGCTGGTGTGGGAAACACATCATCAGAAGCCCCATTTTAAGGAAAATTTTGACAAATTCTTCTTATCTTAGACATTCAAAAACCCTGCACTCATCAGGACAATTCTGAATTTCTACTTCCTTTGGAAAGAGCCTCAAGGACATATTTGGGTCCTAATCAAACCCATACTGTCTCTCTCTGCTCTCTTTCCCACTCTTTAATCAGGTGGCCATATTTCCCTGTAAAGATCATCAATCATTTCCAGTCCTGGAGAGAAAAAAGGACTTCCATTAGGTTGGTGCAAAAGCAATTGCTGTTTTGCATTCCTTTTAATGGCAAAACCGCGATTACTTTTGCACCAACCTAATAGAAGCTGTTCCTATTTCAATTCTCCTGCTCAATATACTGCTTAATATACTAGTTTTCCCTCATGATCAGAATGACTTCCCAAATGAATACAAAATTATCTAGATTCTTGCCTTGCCTGCTTAGAGAGGGGGTGAAGCATGGATCATTGCTGGAATTTCCTTTTGTTTAAAAAAAAAAAAGGCAGTATAGAATTTATATACTAGGCTAGATTGGATTCTCCTGTATAGATCACCAGCTAAGCATGGGCCTTAATCTATCCCTCCATCTTTGAAGATGTTCCTGGACAAGTCTTGATGAAGGAAAGGCCAAGTTAAGGAAGCCAGCAAAAATCATGCAGCTGCTCAGTGAGGTAATAAACAAGGAAAGTGTTACCGACAGAATTATTTATAGTTTCTTTAGAAGAAACTGTGTCTAGCCCAGGACTTCCCTGTACAGTTATTCTCATGATGCACTTCACATCTGAAGGTGGTGGGGAACCACGTCACATTAGCACAACCATTTATGGCAGCCCCAGCCAGACTAGACCATCTTCCAAAGATGATTAGATACTTCTATCTAAAGAAGCCCCAAAACAAAGGCCATAAAAAGATACAGAGGATAACCAAATTCGCAGAGAAAATTGAACAGATGATTTGAGATAATACAAGCAATCTAATGATTATGACAAGTTAATCTCTTTGGGAAAGTCCGACAGCAAAATCTAAAAAGAATTACATCACATAGCCCAAAAGGAATTATAAAAGAAAGGTTATAAGTTATTATTAAAAGCTCTGCACTACAACAATAATCTTCACTGACCATTAAAAATTGAAGTATATAGTCATAACATTTCAGTATATAACCTCAGCTGTTAAACAGAAAATAAAAACAATTATTCAACATATAATTTAAACCCAAAAGCAAATACCTTAACACCTGCTCTGAAAACAGTATTTTTAACTCAATTTTTTGATTGGCAAGTTAAAAATGCATATATTTATGGTATACAACCAAAATATTACTTTAAGTTTCAATAATAGTTCTCAAGGTAACCTATTGTGTTCTTACCTATAATTCCTTCAAAACACATTCTACTGACCTGCCAAAAGTAGTACTTCAATACTCATCAGAGAGATCAGCCAGGCAGTCATTCTGTCCACTTAAATCAATACTCTTAAGATTGCTCAGACATTAAAAGCATTTTCAGTTTTGATTGGAGCAGCATAGCTTTTGTGCTTTATAAAAACAAAAAAAGCAAAAAAAAATTATCATTTTGTTTACATACGATTATTTTGCTGTTCTGAAACCTGGGAAATTAAGGAGATGAGATAAACATGGCCTTAGTGTCTTCAAATGGAGCCACCATTTTTCCAAGCTCAGGAGAAAAGGATCATCTGAGAACCTTGCATAAAATCATCCCCACTCTGCCCTCCTTGTCCCACCAACTTATTTTAAGCTGGATAAATAATAACCTCTTTCATTAACTCATTATTGAACAGAAGCTGAGTTTTAAAAAGAATTCTAGAAATTAAAATTCTAGTTCGTGATAGGGTGAAGTCTGTTTTGCTTTGCCCTGTGCTGGCGTCCAGCTTTCCCTCGTGCTGCTCTCCAGTTTGAACCCTACACTGCAGCCACACGCCGTTCTCACCGTCACTCAGACAAGCCTTCCACACATCAGCCTCTGCCTTGGCCCCTGCTGGTCCCTTCCTGGATGCCCTCAACTCTCTCCGTGGCCTCAGGAGATCCTGGCGCACCTTCGTGGTGCTGCTCAGGAGCCCCTCCTCAGCTGATTCTTTCCTCCGCCATTCCAGTGCTCACCACCTTCCCCCTGAACCTCTAACTTCCGTGCTGTAGAGCCTAGACCAGATAATGTGGCACACATAGGCCTCTTCTTCCAGACGGCACGTTCCTTGAAGAGACCCAGGAACCAGTCTTCTATTTCCACAGCCTTCCTAGTGTGAAAGTGTGAAGGTCCCACACAGCGCTCAGTACATTGGAGTGGATGAAGACATATTTGAATACCCTAAATCTGGGTTTACCTAATCTGAGATGAACAGCTTTCACTCTCATGCCTGCTCTAAGGAAAGTGCTGAGCTGCTCTCCAGCACCTCATGGCAGAGGGCATCGACAAAATCCTCTTAAAAATAGTGCCTCTGAAATTTTCTGAAAGTTTGAAAATTACAGAATTAAACACCCACATGTACTACTAAATACACGTTTAATATATATTTAATTATGTTTATGTTTATTACATATAAATATATAAATATATTTAATATATATATACATACCTACATACACACACACACATACACACACACAAAGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGCAGGGTCTCATTCTGTCATTTGGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATGTCAGTTCACTGCAACCTCCATCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTTATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGAATTTTTTGTAGAGACAGGTTTTCACCATGATAGCCAGACTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCACACCTGGCCATTTAATTTATATTTTTAAGAAAACACTGAGATTAGCAGAAGTAGTTACATCATTTCTGAAAATATAAAAGCTACAATATACTCCCCCCCTCAAAAAAAAAATCTGCAAAAACTTTGCAATAAACTCACCTTACGGGCATGTTCTGATTGAGACAGCTGGAAATCTATAATCATTTCTATTTAATTCAACACTGCAAACATTTATTGTATGCCCACTACGTGCTAAGCACTATACTAAAAGTTGGGAAAACAAACAATCTATGTACCTGCCCCCGAGTCATTACCAGATAGGGTAAGTGTGGAGGCTACTTGGATTTAAGAAAGGAATTCTAGTATTTTCAAGTGGATTCAGCAAGTGTTCCTTTTCGTTGCAAAATTCCCAAACTTTTACGTCTATTTGAAATAGAATTCAACTTATAAATATACAACTTTCAGAATACATCTACCACATAGGGAAAAGTACCCAAGCGTATTTGCTGCTTAGTCCAAAAGCATGAGATCTGACTTGCTTGTTACACAGACAAAATATACTCAGCACAGGAGAGTCTATTTTCAATCTGGCTACGTGA
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Task1_train_10532
With a mutation on Chromosome 6 in gene CILK1 (ciliogenesis associated kinase 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Endocrine-cerebro-osteodysplasia syndrome
GCTATATTTCATTGTGACCAGTTTACTACTGTTTCTTAGCCCAATTAGAAAACAGTACCTTGAATTTTTAACACCCCTTGTGATTTTTCTTATCTAAGATACCATAAAATATATGTAATGATTGCAACACAAAGTTATTTATATATAGTAGCCAGTTACACTGCTGTTACCCTGGCTACTTCTAAAAAGCATTCTGGATCAACACAGATCCTGGTTTTGTAACTTATTTGCTATGTGTCTTAAATAGAGTATTTCATCCTTCCAAGCCTATTTCCTCATTCCACAGAAGAAGAAAAAAATAATACAAAACTGAAAGAGCCAAACATAATGATCCTGGAAGACTCTGAAGAATTGAGTACAAAATAAGCAGGCACATATGCTTTTATCCCAAAAGTGCCAAGAGTGTAATACATGATATAGTTAACCCTTCCCTATCAAGAACAAAACCGTGTCAGTTGTTCTGGATAACTGAGTTTTCTGGATAGCCAAGAGATAACTTAAAGTTTAGGGGGTTACAATTCTTTCTGAAATATTTCCTATATTCTCTTGTCTTTCTGAATGAAAGTTATTAAGCATAACATAATCTTTCTGAGTAGGCCTGGGACAGTTATAAACATCTGTAATGATTATATGCAAGTGTAGATACAGAGGCAATTAATGGGAATAGCCTGGTAGAGGTCCCAGACTCTAGCATCTATTATAACTTGAAAGCCTTCTCTGTAGTCACAGACATTTTTGCAAGTCTTAACTGATTTGGGGGGTATTTTTAGCTTTTCACACTATTCTTAAAAGCATACATTCCTCTCTTGCTTCCTTGTTACAGAATCTTTTTCTTTCCATTTCTTACATGCATCTGTTAAAAAACTGGGTTCATCCAAAAGCTTCTTTTCTGCCCTGCAGCCATTTGTGAATTTCACCACCAGAACTGCATTCCTGAGAGCTTTCCAGCCCTTGAGCCATCCAAAGTCTTACGGCACCAAATTGTAGTTCTTTTTTCCTTGAGCTTTCAGAAAATTGCTTTTCTACACTCCTTAATTATTCCTCCAACTATCATCTCCCCAGCTATCACAAATTCTACCACCACATTGGCACTTTTCTTCAAATATCCTCATCACTCTTCTTCTGAACATCTTCTCTGATTAGAATTGGTCACTTATATGATCCTCTGAGCAATGTAATTGTCAGTGAGACAAGTTGAGAAGGGGCCAGATGTAACTACCACAAAAGGAGGCTTGCAAGATGCCTGTGAGTGATAAGAGCCCCCAGCGTTACCATACCTCTTTTGGGTATATTTCATTATTTAAGTCTAAGTGGCCCATGGGAGGATGGATTGGGAAAGGAGCTATGAAACCAGTGGACCTGACTTCATACTTCCGGTCAGTTGGTTGAATTGTAGTTAGTTGCACTATTTGAACTAATTAATGGATGAGTGATTAGAGCAAATTGCTTAAACTTTCCAAGATTGAGTTTTCTCACTCACAGAATTGAAAACAATAATGCCTGTCTCATGGAGTCTTTATTGGATTAAAAATCATATAAAATATATTCAAGCATTTGCACACTGTAAAGTGCTATGAAATACTAAGTGCAGTTACTATCCTAGGTCTATCTCATCTGTCAATCTCTTCAGGTTATGAGTCAGTTGGACTTTTACATAATATGAAGTTGCCTTTCAACAACCAGTACCGGCTTATAAACAAACTACTATATAATTGTAACTCATAGAGAATAGATTTGAAAACATTCTCCAAAGACAGATAAATATATGTTTATTTCCATTTCCATATAAATGGTGATATATCATGTGAATTACATGCCAATTTTCAAAGCAACTATATTGTTTACATTGTAACTACTTTATACCCAGTAAGTTTCAAACTATTTTAAGTTCTCATACCTTATATAGTACACCATTAGTGGTATTCTGTACTATTTCTCACCCATAATACTAAATACTAAATATTTCCTGTGCAATTCATAGAAATTATTCAGAGTTAGATATGAACGTTATAACAAGAAAATGGAAGAAAACCTGACTAGCTGTTGGTCGTTTCTTGGGATCCCACTGAAGCATGTCTCTCAGGAGCTGGACTGCTTCACTGCTAGCATTGGGAATCAAGGTCTTTAAGTTATTGGGTACACACTGTGGCCAACGGAAGTTCATTGCACTTGAAAGTTGATAGCCTTCAGGCCAGTCAGTCTGAAAGAAGGAAAAGATAGAAAATCTTGCTCAGCCAATTGCTGTGATATAAGTTTGTATTCTGGCATGTGTGCCCCAAATGGAAAGGCAACCATGTCATTACCCACCCACATTCATTAACCACCCACATTCACTACTGTGGCACTGTATGGAATGAGACATAGATTTAGATTAATAGAGAGACCACCAAGACCATGAAATCTGGGGGAATAGTGGAAAAGACACTGGATTTGCCAACTTAATTATCTTTACATAAGAGATTCTCTTGAGATTTTGGGATTGAAACAAATTAATATTTCCCCAACTGTGTTCCATGAGACAGAGGTTCTGAAAACTGCCAATGAGATATTCTTTTGGGGAAAACAAAATAAAACAAAACATTTTGTTCCTGGACAAATAAATTTGTGAAACTCTACCTACAGTATCTTCAACTTGGTGATTGAAAGTATACATGTGGAGAAAACCAGCAGTAAAGAAAGGTGTTTCACCCAGTCTCAAGCTTTCCACTTTTTCATGCATCATTTCTATGGGACACTAAATGCTGGAGGGAATGATGGAAAATGCTAAAGAAATGGTCTTTAAGGTTCCTTCTAGTTCTAACACTCTACTATTTTATAACATACAGCCTAAGGTAATTGTTCCTCCACTCCTTTTTAAAGCCAAGTGGCAATACATATAGCTTTTATCGTTCATTCACTTGACAGTTCTGGAATGCCTACTATATGCTTAGTGTTGTTGGAGATCCAAAAATGATCCAATATAAATCCTGCGCTTAAGAGTATTACTGTTCTTAAAAGAGAAAAGAGCATTTATTTAAAAATGGTATAATGCAGAGTAAAAACTGACAAAAGCTGCAAGAGATGTGCAGGTACAGATATGCAGAGGAGAAAGATTCCAGCATTGGACTCAGGAAACTTTCTTGAAGAGGTGGCATTAATAATTCATTCAAATGATTAAAAAATTTTTTTGAGGATCTAGTTTGCACCAGCAATGGTGCTGGGACCTGGGAAAATAAACATACAGCAAATCCTTGTCCTGAGTGAGCTTATGGTCTAGGAAACAACTATGTACGCAAATAATAATATTAATAACATAGGACACAGCTGAAGATGGGGAGGAGATTAGAGAAACAGTGAGGAGGGGGATTACTGACGGCCATGTGACAGATATCACTCAGGCAGAGGGTGTTATGTGCAGAGCACAGAAGCAGGGAAATTTCAGGGCATGCAGCTGTTAGGTGTATAGGTATGAAGTGAGCGATAGGAATAGGAGTTATGAGGCTGGGCAATGGGGAGTCAACCAATACTTTTATGAGGGGAAGTCAGTACCAGAGCTGTTCTTTAGGAAGCTGAATCTGGCCACAGACTGAACAAGAAGCCAGAGTGAAAATACTTCAAGGCAGAAAGATGGGGAAGATGACATTAGACACAGGGGGGTGACTGTGGTCCAGTCTGTAATGGCAGCAGTGGACTTGAAGGAACAAGAGCCATGTGGCAATATTCAACAGGATTTACCCACCAACCGCTTAGATGAAGGGAAAGGGGAGCAAGAGAAAGACAGAAGGTAAAGCTGAAATTCAGCCTCAAGGTGGGGGCTCTGGGATTATGATCAGACCACAAATGAAAATGGAGAATGAAAGAAGGAAGCTAGTAGGGTGTTAAACAAAAGGCAATGATGAGTTTGAGGTGATGGTGAGGGAGTCAGGAGAAAATCCCATAGAGCGTTGTAAACATGTGAGTGTAGTAATAATGGAGGGAGGCAGCGGCTAAGGATTACATTCAGGAGACTTCTGAACAGGCGTAGGAGTTGTAGCAATGAGAACTGAGAAGTTCTGCAAGGGAGGTGAGATGATACAGAGAGGAAGGCAGAAGGAGCCATGACAGATGTCATACTTAA
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Task1_train_10533
An alteration has been detected in CILK1 (ciliogenesis associated kinase 1) on Chromosome 6. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Endocrine-cerebro-osteodysplasia syndrome
TCTGGCAACAAGTATCTGGGTCTAAAGAATAGCAACAAAAATGAGAAAGAAGAAAAAACCAAAGAATATTAACTTTTGTTTAAGTCTACCACTCAGTTCCCAGTACTGAGAAAATAGCCTGAAAAACTGAGACACTATGACTGGTCTCTATCTGAAAATGTGTTATCTCTTTTGAGAATCCCATTGAATTCTCATTATTTCTTTTCCCTGAGCTCTTAATCTAATAAGTGACCTTTCTCCTATTTGTCCCTAAGATACCATGCCAGAAGTTTTTAATGTTTTGCAAATTCACACCATCTCTTGTGAATTCTTGTGAATAAAGGCCCAAGTACTAGTTCCACAAATGTCAGTGGAATCAGAGAAAACTTGTACTAGAAACTTTTGACTAGAACTGGTTCACAATTTGACTCAGTCTTGCATAGTACATGCTGATTACTCAGTATGTGCCTGAGGCAGACTAGGATTTGCAGATAGCCTAGGTTTGTCTGTGTTTCATTTAGTCTCTAATTGTAAGCAGCTACCTCAGAAGTAAAGGACAGGCTGGTAATGATCCCAGATGCACTATGCCACCTTCTTCAGCACAAGGTCTTTTCTACTCACTGTTAATTTACATCAAATCTAAACTAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCAGGAGGATCGCTAGAGCCCAGGAGTCCAAGGCCAGCCTGGGCAGCATATTGAGACCTTCTCTTAAAAAAAGTTTAAAAATCTGAACTGACTATATTATCAAAGGGCTTCCACCCAGTCTCCTTGAGTAATAAAACTTATTTGTTGGTGCAATATTTACAATGGCAACAACATCCTTGGACTGAGAGTAAATGGATTTCTACCTATGCAAAATCAGCTTCGCCCATCTGTCTGTATATTACAATGACCTCAAATGACCTCCTGAGAAGACTTCTGGCCCACCTGTGGATACGTCCATCTGGTGGCTCTGTGCTCACAAGAAGTATTGATCCAACCCCAGCTGGGTCTGTGTCTAGTTAGTAACAACAAGCAGCAATACTCCAGGTAGTTGCTGGAAAATAGAACCTCAAACTCTTTGCTGCTTAATACCTTTCAAAAGCTCAGCTAAGAACAACAGTGATGGGGGATTTCCAGAATGGTATGTGGTCATCGTTCCTTTGGATATTCTAAATTTCTCCCCAGCCTAACCAGACCATCTGTAGAACAACTCAGACTGGCCCCCGTAGAAATGTTTTCTCTGATTAGGTGATGTAATTGGCCTCCATTGAGGGATATGACAAAAAACTGCCCTCTAAAACCCATCACTGTGTTTATGATAAAGTCATGTTACATACCGTCCTCTCTAAAGGGTCCATGAAAAAAGCTTCTCTCTGGTCTTGGTATCAAGAATAGTTCTGCTTTTCTTGGGTAACTGGTCTCTTTTTACCTATGTGTGTTGTAACTGGTAATATTTCACATTTTGCATGGTCTGACAACGAGCTCACAATCAAATCTTAGCCTGCTTCTTCTATTGAAATAAAACTTGCTGGCATGCATTTTGAGGACTAACCTCACCTCTGGCTATATCCACATCTTGTTTTGCCTTTGTCTCTTTTTTTAGTTTGCTAATTTTTAATTTATTCTATTTTCCTGTGTCGCATACATTTTGTTAGACTACTTTTAAACTCGCTTGAAACAAGTTGAAATATAAATACATTAGAAAAATGAGAAGTAACAGTGAAGCACTGTTAGTGGACCAAACATAATACATGAAACTGCTCAGAATTCTAATTGTAGGTTTCTCATTTAACATACTACTCAATGGTCAGAAACAATATTTAGATCTATAACCAACAAGCTTAATGTTAAAGCCTACAGAATAAAAACATGCAGACACAATAAGTAATGAGGGAAATTCAGAGATCAAGTTATAAAAGTTAATATATTTTAAAATCCATTGTCAGCCTCTCAACTCTTCAACCTTTTCTGGGAGTCAGCTACAAAAAATATTAATGTTTCCTACAACTTCTACTTGATAACAACATTTCACTGCTCTTCAAAAGCACAACACTCCGAATCACCTACCGTGTTTGTGAATAAATGCGAGTCCTTGTAATATCTGATACATGATATTCCTTATAGCAGACTCAGGAAACAACTTATTTCTGTATGAGGCAGAGGAAAACAAAGTTATAAATCAAAGGCCAGATCCTTTGATAATAAATACTAAAGAATACCATTTGTCCATACAGGGGAGCTACCTTATAAACACCAAATATAGTCACATGTTACAAAAACAAAAAGATTAAACATTTGATAGTAAGCCAAAAAAAAGTTTTTCCTCCAACATAGCATATAAATATCAAAAAATCTCCTCTTTCCATGATACAAACTAAAACTTTAAAAATTTTTGGTGGGGAAAATTTGAGGTCTTCCAGATGAAGCCCTTATGCAATGCAATGGCTAACATTTTCCTCCTGGCTGGGCAAAACACACAGCACACTGCCGTCATTGTCAATAAAGATGATATTTGTTCATTCAGATCACTCAGAGGAGTACTGTGAATGGCATTCATTTTGCCACAAAAAATGTGCCCAAGAGGCTCCATACGGTTCACCTTTGAAGTTCAAAATTACCGTCGCAGGTAAATTTCTTATTAGCCTCCTCTTGCCAGCATGCAATTACCTGAGTACTGCAGCAAGAGAGGAACTGAAATAAACCTAGAACTTTTCAACAGAGGTCTCAAAATCCAGGAAGCTGTGTCCACCCTTGACTTCTAGTTGCTCTGCCCATATGTCCTAGTGATAATGGAAAACTGCAATGTCTATTAAGTCTGAGCTTCTTTGGATGAATAACTCTTCTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCCGTTGTTGACCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATGTCCGCTCACCCCAACCTCTGCCTCCCATGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGTATCCCTAGTAACTGGGATTACAGGCATGCCCCACCATGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCATGTTGATGAGGCTGGTCGTGACCTCCTGACCTCAGGTGATCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTCAGCCACTGTGCCCAACCTGGATGAATAACTCTAAAATAAGAAAATGACTGCATTGAGAACAGCTTCTCTGAAGCTATCAGAGGGCCTCTAAAGTAGAAATATGGGTGGGCCCCACACCTAACTGGCAGCTTTCAACATGAAAGCCCAGTAGCGTGAATGTTAAAGGATTGGAGAAAAAATCAGAATAATGCAATAAGAAAAGAAAAGCACACCAGCATGGCACATGTATACATATGCAACTAACCTACACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAAGGAGAGAAAGAAAACACAAAAGCAGAAAGAAAACACATCTGCTTTGCCTATTTATTTCTATAATAAGATAATGATGACCAAACTGTACCTCTCTTTAATGAGCTGGTAAAGATTTTCCTTCATGTACTCGAAGATAAAATAAAGATGATCATTTTCCCTGATAACTTCTTTTAATTTGACTACATTGGCATGGTTGAGCTTCTTTAAAGACTAAAAGGCAAGGAATAAACACAAAACAAAACAAATATTAGAGAAAATCTGTTGTTGAAAAAGAAAAGTAATCCTATGTATACTTGGAAAGAAACAACTAATTTTAGAACCTCAGAAATGTGCTAAATTATATTTTATTGACAGTTTAATAGTATACCTCTGAAATTTATAATAACTTTACATAGAAAAACTACTTCAATGAACTGAGTAGAAGGTATGTATTCGACCAGTAACTGGTATTTCTGGCTGCCCCCAGCACCAGGCAATGTACCAAGGCTATTTTGGGCCCACCCCCTCCAGATGATGGAATTCAGGCTGTGGAAGAAGCCAGAGGGGAATCAATAAAAGAAGCTTAGATTTTTCTAGCACTGGAGAATTTGCAGCTGCAGTGGGCTGAGATCACCAGCTAACAGTTTGCAGACACTCTGAATAGGAAATTGTTCAAAACGACGAAGGGT
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Task1_train_10534
Gene ELOVL5 (ELOVL fatty acid elongase 5) on Chromosome 6 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Spinocerebellar ataxia type 38
CTTTGATTTTTTCTAAACAGAGCTATTACAAATTAATACAAACTTGAAACATACCCTAATTTAAACTAATAAGCTTTGGGCCCTGCTTTTTAAATTTTAAGGCATGTGTGTTTCTCTACCATAACAACATTGTACAAATTTACATTTACAATCACATGCATGATCTACAGTTAAAAAAAAAAGTTTGGATTACAGTGTTTTTAAATTGTGAATCACAATTCAGCACCTATCATGTTATAACTAATAAGGCAACAGCAGTGTTGTATACTATAATAATACTCCCTTTCCACAGTCTAGCGCAGGGGTCAGAGAGCCCAGAAATGTTAGAAATCTTATCCCTACTTATATAATCTGTATACGTTTTCTAGGGGTTTTGAATTGATGAAAGAAGTCCTACATGAATCACACTATTGTAGGCCAGACTAGTTACAGCAGCTGTTAACGAGCATTGGGGCACAACTCATATTGTGCTTACAATCAGATGACGTGGTTTGGAGGGTTTCAATTCTTTGACTTCAATCCTTCCGCAGCTTCCTTGGCTTCACATTGTTTTCCAGGGGTGAAAAGCTGTTGGTGTGTCCATTCACAGCAGCCATGGACCCATTCTGGTGGTCCTTCAGGTGGTCTTTCCTTCGGGAGGCCCCTTTCTTGTTGTAGGTCTAAAATGTGTAAGGGCAGATGAGAACCAAATGACCACAGTTTTCTTTATAGGGAACTTTACTGAGAATTGCATCCCTAACACTAGGCCTAGTTTCAAGATCAAATCTTATCAAGGAGAAACTCCTGAGGTCAAGTCCTCATTGACTAAATCTTTTGTCACTGGTTTCAATCATTCTTCCTTTTTTTTTTTGAGGCTTAGCCTGAGGTAAGTTAACTGAATCACAGGCTGCAACAGAAATACTATTTAAAATGTCACATAGAAAATTCAATTTACACTTTGCTTTGCCTTTTAGTATCTGGATGGCAGATGACAGGGGTTATGTGGCCAAATTGGTCTTTCCCACCTGGCAGCAGCTCTCTTGACACCCACATCCCTTGTTCGTCTTCAAAAGTTCCTCACTGCCTCGGCGACTATCTCAGCCTTCATGAACAAAGTGCTATGCTGCTATAAGTAGTTAGAATAAATGTGATTTCAGCTTCATCGGGTCCTATCCTTTCACCTTCCTTGTAGCTGGTGTATGTCCCACAGTGCAGCCATAAACTATGAAGCCCAGAAGTATATGACTTCCACTGAAACTCAACATGCCACACACAGGTGCTTGTGGGCACAGAAGAAGAAAGGACAAATGTCTGAGCCTCGGGACTTGCAGCCTCTGCCCTTGCTCCTGACCTCCGTGTTTTGCCCAGATCAGCAGGCCTTATGGCTACCAGGCACTGGCAACAAAGGCAGGACACATGTCATCTGGGGGGTGACGCATGGCAGGAGAATCAGCAGTGGCTGCAACGTGGTCAGGCTCCACTGGAAATTATCTGCCCTAAATGGATCTTTCTGTGAGCAAAGACCTACATCACCACATCATATGCTTAGGAATGAACCGAATCCTCACACCTGAAGACTGAATGTATAAGAAAGCTGGGACAAAAAAGCAGATCTCCATATCTGAGGACTGTGATAAAAATCTCTTCTGAAATTTCATTTGGCCATGACGTTCAGGGTAGTGAACTGAGAGATTTCTGATTGAAATCACCTCTCACGTCTCTGCTGCAGGTCAGAGGGAAGCAACATAGGGTCCTGCTGCACAGTTTTCCATTTCCCAGGGGAATCCCAAGACTTCCTCACCCAGGCTCTAGAACAGGATTCTAGTGTCTTCCAGTGAGCTGTGAGCCCCCCAGAGGCAGGGGCTGCTCTTGTCATAGTGACTCCATTAGAGGCCAGAGCCTGTCACCCAGCAAGGGCTCCACATGCCCATTAAGTAAATAGATGAGGGCCTTTGTTGGTAAAGGCCCCAGATTCCAAGTCCCAGAGAAGGGTGAGATTTACCTGAATGTAGAAGTTTGTGAAGAGAGCAATCAGGGAAATCATGTATCCAATCTGGAAATACAACCAACCAAGAGGGAATGTGCACGGCCAGATGACCCCGCAGCTGGTCTGGATGATTGTCAGCACAAACTGAAGCTAGGGGAACAGAGGGGATGCAGCTGAACAGGGACAGTGCATGGACGAGGCCCCACACCAGGCAGACTTTTTAACCAGCATCACCTAAATTTCTGAATTAACACTTACTACCCTTGCTGCAGGTACAGCAGTCACTTCATGAACACAACACATACACTATACTTATCCTAAACTCTAGGTGTGTTTGTCTTATATATATTCTTCCTCTGCCCTCCAAGCTATTTAAACTACCTTCTCCAAATTTCAAGGATACACTATAGAGACATCCAAGACTTTTTGTTTTTATTTTTTGAGAAGGAAGAGCAAGTGTGTATGTTGAAAGGGCACTGATAACATCACTGCAGGATGTGCCACCTGGCTGGACATCCTTCCAACTCCTTATCCATGGACGCTTCTGGTTTGGTGAAGGCTGATGAGTAGATTTAAACCTTTACTGGCAAACAACACTAAGTGCATTGATTAATTTTGATGAATAAACCTTGAAACGCATGTGAACTGGTTAGAGAAATGGTGGAAAGATGTTTTAAAAAGGGCTAGGCTCAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATCAACACCATCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGCACACGCCGGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGATAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGCGAACCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCGAGACTCCAGCTCAACCCCTGCCCCTCCCCCCAAAAAAAGGGCTAGGCTCTGCACACTGTATTTCTAGCAGCTCCAATGTTTCTATGTAGAGTTTTTTGTTTTTAATTTTTGAGACAGGGTCTATGTTGCCCAGGGTGGCCTCAAACTCTCAGGTTCAAGAGATCCTTCTACCTCAGCCTCCCGAGTGACCGGGACTCCAAGCCATGACCCACTGTGCCTGGCTGTTTGCCTTCTCTTTTTTAAGGTTAGTACTGCAGACTGAGGAATAACTAGGAGTGGTGCTTAAAATAAATCCTGACAACCTGGGTAGGTTTAATCTTCCACCTCAAAGTACAGAGCCTAACGGGAGACCAACTTTGCCAGTCTGTTCTTTTAAATTCTGCTTCCGCCAGACCCAAAACTGTGGTATAAATCAATTTCTGCATCATTTCTCCTCAAGTATAACAAGGAGGTTAATCAACAATTTTCCTTTTTCACAGGTGGGTGAGAAAAAATTAACAAGGACCATATAGCAGCTGGCAGAGAGGTGAAAATGAAACATCAAACACTTCAGTCTCTAAGATTTTCTCAGACTTTTTTTTCAGATTGTTATTTTTAAATATTGAAAAATCATAATTGACTTGAAGGGATCTGAATCAGCTTGGTGTGTTTAGAAAAATGTGTTAATAATGCAAGGACAGGGCAAAGGGTTTAATGTCCACACCCCTCAGTCAGCTAGCTTTGGCCTATTGACTCAGTGTCATCTATAAAATAGGGACAATAATATGTGTTTTTCTTTTTGGTAGAGACAGGGCCTCACTATGTTCCCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGTGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCTTGGGGACAATAATATGAAATCAGGCTACTGGAACAATCTATGTAAAATCATGTACTTAGTATGAGTACCCAACATGTGCTAAACACTTAGGAAATGTCAGTGTTTAATATGAGCAGTAGTAGTATTAATTAGTTCATAGACGAATTCATGAGAGGAGAGAAAGAGGTTACCTATAATATACTGATGAATGCAGAAGGCTTAATCAAGGATGGTGAGAAGTATCAGGTGAAGTGGCCTGGCCCTGGCAGTAAACCAGGGGAGGAGCTGTTAA
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Task1_train_10535
This variant impacts the gene ELOVL5 (ELOVL fatty acid elongase 5) on Chromosome 6. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Spinocerebellar ataxia type 38
GAAGTTTGAAAAAGGACACATGACAATGGAATTATTGATGGGTTTTACAATATGTACAGGAGAAAACTCGGACAAAAACCAAATGTGAATACCATCAACTTGGAGCACTAGGGCTTATTTTCAACTTGGGTATATCTGACCTGGATAGCTTTTTGTAAACTTGATTTAATTTAAGGAAACATTGCCTCTTTGTCTATTACCTCTCTATGTACTCTAAACTGTGAGTTAAAAATGTAGTTTCCCTATTCTGTATATTTCTTAAATTTCTGTATTCAGTGCTTAGTCACTGCTCAAAGTCTTCTCTTCTCACCAAGCTATCAGAGGAAAATCTGTACCTTCTATTACAATGTGTTCAGAACCCCCCACATCCACTCAGATGCACACAGCTGTACTTTATACAGTGTTTTTCTTCTCTTTACCAGGGAATCATCTGTTTAAGAGAGGATAAATAATGAAATTATAGCTATATTTCTAGGGCTTAAGAAACATTTAAGGCAAATGCTTAAGTTCTCTAAAAATCACATGAAATATTTTTCTCTATTAATATTGCCATGTATAATAATAAACTCTGTAAGAGTTCTCTTAAAGACATGGCTGTATTATCTATCAATTATGGAAAAGTAAGCAGTTCACTCAGAAACCTGACAGCTTGCTGTGGTTTTGTCCCTTGAACACAGAAATGTGCATAGTGCTGGGGCCAGGAGTCACTCCTGTGCACTTCCCCTGGCTCCAGTCCTGAACTCTCCATCTTGGAGTCTAATTAAACTGACTTCATTCTAGAATAGGACAGAAAAAAAAGCAAAAAAAGGAGTTGTAAGCATTTCTTGGCATGTCAAGCATAAAAGTAATGCTAGGAACATCTACCATTCTATTCAGAATATCTGTACCTTGGCTTATGAAACATACATGGGAGAACAAGACACAGATATCCCACAGCTGCAACACCTCTGATAATCAAATATGCCTGCACACGCCCACACTCCTGCACACCACCACACGTAGACAGGGAGACACCATCATGGCCTGAGGCTGATGGAGAATTCATTTTGACCCCTGAACACTAATTTTAAGATTCATGTTTCTATCTCTCCTCTTCCTCCCACCTCTACCTTCTTCTTTACTACTCCTTGAAGAACTAAAACCAAAATGAAACCCTGAAAACCTATACAGGAGTGCCTGTATAGGTTTTATCCAGGGCTTAATTCTCCAGAAGAGTTAGAAATAGGTTGGTGCTGTAAGAATGAAAAGTGGGTAGGCTTTCCTGGAAAAATGTACACAAACTGCTTACCACCAGAGGGAAGCTTTCCTCCCCCTTTTAGCTTTAAAGGCTATAGTGTTACCCCTTCAAAATAGGGAGAAGAGAAGGGTTGATTCTGATTTTTCTTTCATTTTTAAGCTATAACATTTGCCTTTGAGATCATCAAATGTGATTTTCAACATTGCAGTGATATAAAATAACTGGGCCTGAACTCAGACAGACAATTCAAAACCTAAATGCAGATCTCACCAGTCACACTCCTCTTAGCTTTTAAAAAACAACTGAGATTTGACAAGTTATCCAATCAGAGAGGGTGATGTGCCACAAAACATACCAAACACAAGTGCCACCCACTTCCTTCCTCCCCTACCTTCAAACAAGAAGCAGGCACTTATTAGATGCTTAATAATAAAATGCTTTCACATGTGTTTTTCACATTTTGTTCATTTTCCACTCTGTATTTTGCTTGCATGAGAGTATTTCTGAAAATACTTTAATTTTGAATATCATACGAAACATAATAGAAGAATCAATAACAAAGGCTTCTATTTTAGATATTCTAGAAGGCATACTTGTACAAACAACTCTGACATTTTGAAAAATCGATTTTAAAACACACTCATAACGCATTAAGATACTTGCTTGCCCAGTTGTCTCTACACCCCAAGCGGCCACCTTTCCTCATTTAGGAATACAATTTAGGACAGCAATATGAGTGCATTTATGTGAAAGGAAGACTGTGTTAACCTTTGACTTACCTCACAGAACATATACAGAGACAGCAGTGTGAGTCCAAGGTTATACACCACTAAAATCCCCCGGCAAGAGAATGGCTGTTTATTCCTCATGTATTTTGGTCCCAGCCATACAATTAGTAAATATATGACAGAGCAGATAAATGTGGGTATATAATTGTCCAGAAGAAACCATCCTTTTACTCTAGTATCTGAAAAATTAAAAAAAATTAATGATATATAAAAACATTCACAACTTTTCAAACGTTGAAAAAATTTCTCTAACCATGATGATATAAAAGTCACCTGGTATTCATGTTCTTAATTCCAATAAAGCAATCAGGAGAGGAGGCATGGATTTTCAATACATATCAAACAAGGTGAAGCTCCTTGTTACATGCTCTGAATAACAATGTATTATTCATGATTTTTGCTCAGTAAAATAATAATACAAATATTCTTTCCAAAGAACTTAAGAAGAAAACAAGGAGAAGGCTACACTTCCCATTAATTGGATTTATTAACCAGGTATACCAGATTACACATAGGGTGATAAAACCCAAGAAATGGCAGTCATTGAACTCTGAAGTCCTCCATCTCAGCTGTGTGTCAGTCGGCAAGTGTGGCCAGCACATGCAGACTCAGAAAACGTGCTGCTTAGCCACGTTAGTGAAACTGGCACTAATTAGAAAGGCAGCCTTTGCTATGAGTGTAATGGTCAACAGCAGAGAGGACAATGATTTAAAAACAAAACAAGGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGATGCCAAGGCGGGTGGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACACTATCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGCCAGGCATGGTGCTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTGAAATTGGGAGGAAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCGTACCACTGCACCCCAGCGTGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAATGAAAATAAAAACAAAACAAAACATGAAGGTGAAGCAGCAATGATCAGATAAATGCCTATTTAAAGGGCAGTATTTAACAAACTGAGGAGTAGTAGCATGAGAGCGAAGACCTAGGCGGATCCAGAGGAGATACTGGTATAGGAAGGGCCTCTCCTGCCCCTATTCCTTTTCTTAGGCAGGGAGGAGGGAGAGGGAAACAGGTCAGCCGCCAGCAGCAAACTGACAACCTCTTCTTGGATGGCGGGAAACTCCTTGGCAGCCAGAGCCCCTAAGTGTTATGTGTCCCCTGAAAGATTCAGCTTCATACTCTGGCTGACCCCAGGAAGCTACCTCTGAAAAGCATGCTCCCCTTTGAACCCTGCTATGATGTTCCCCGAAAACCTGTGGCTCCTCAATCTTAACTACCCGCCAAGGCTCACAACTCCAGAACATGAGGCACATGCAGCATTCACCTACTGCGTCTTCAGAGAAGCAGCAGTTGGGAGGACAGCCTTTGCCATTTCTTTAATTTTTTTATTATTCATTTATTTATTTATTCTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTAGGGTCCAAGCGATTCTCCTGCCTTAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTATAGACACACACCACCACACCCCGCTAATTTTTGTAATTTTAGTAGAGACCAGGTTTCACCATATTGGTCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAGGGGACCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGAGTGAACCACCACACCCGGCTCTGCCCTTTCTTTGACCCCTCCCAGACTGGACCATCTTGCTACTCTCTCCAGTCGTTTTCACCTTGATTTCACAGAACAAGAACAGGCTCAATAAAGCATATGTCCACGTGGGGAACTGTCAGTCAGTCTTCCTTTCTTGCACTGTACACACTAAACTTTCCCAGCATTTCTCTCATGGCTGGCTTGCTTTGGCTTCAGAGGGACATGCCCTCCACACCCTCCCCACTAGTTATGCTA
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Task1_train_10536
Located on Chromosome 6, this mutation impacts GCLC (glutamate-cysteine ligase catalytic subunit). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Gamma-glutamylcysteine synthetase deficiency
GGCAAACTCCTCCCAGAAAGCTTGTTTTTTGGTCTTTTGGGGGGCAGATTAACTCCAATTTGTTTTTCTGAGAGTTCAATCCCATCCGAATTCTTCAGAAATATCTCAAGTTCAGTTCTACTGAGGAGACTTTTACCGGCATTCCAGCAGTTACACTTTCCCTCCCCATCCTAATTTAACATTGTAATCAACCTGGGATTTTGTGGTGGATGAAATCAATGTGTAGGACTACTTCTAGCCATCAATCATCTTGAATGGAAAGCGTCTAGAAATTAAGCTTAGGTTTAAAAGAAAATAAAGAATAGGGCTGATGGAGAAACATTTTATTGCAAAGGGTAAACAATTTCAAATGAAATTAGGTGGGAAATAAATAGCATATATAAATAAATATATCTACAGATAGATCTATACCCATCACCATAAAGAAACATATCCTTACCTTTGACAGTGGAATGAGAAAATCCAATTTGTAGGAAAGGATCACTCTGGTGAGCAGTACCACAAACACCACATAGGCAGAGTTCTCAAAGTCTGTTAATTGCACCTAGACAAGCAGAAGCCCAGAGAAGTTATGAACCAACTACACAAACATGCTCTTCCCTGACCCAGGCCCTTCCTCAGATCATGTCATTCCCAAGCCATCTCCTAATTCCCCATCTGGGTCTGGAAGCCCTTTGCCCACATCTATTCTCAGAAATCAACCCTCCTTAACTTGGACTGACTTGCTACCATGCACATACTTAATTTTTATTTTATATATAAGAGCCTTCTCATAGCAGCATCAGAAGGGTGATGAACAGCTGGCGAAAGAGTACTTTTGAGTCAGTTCTTGCTGATGCATGTGTCTTACCTCCATGGGTCGAAATTCTACTCTCCATCCAATGTCTGAGTTTGGAGGAGGGGGCTTAAATCTCATTGTCTGCCAATTTGTGGACTGAATATTCTGTGATACAAAAGCAGAGAAGAAAACCAACTTTTCACACATCCAGGAAAATATTAAGATGATCTGGTATTTAATTAAGGAAGAAGACTGCTCACTGTCCATACCAAATTTCAATTGACAAAGACAAAAAGGTACAATTGAAGATTTTCTTCGAGTGTGCTCTTTTAGGAAAACAAAACAGCCAAGTGTTTAACAAAAGCTATGAGGCCCTATCACTGCAAGCTTAATCTCACCCAGCTCCTACTCCCTATCTCCCAGCTACAGAGCAGCATCTGAAGAGCCACGGGGCCCCCACCTTCATCCCTGAGAATTTTAGGAGCCAGCCTGCCTTTCCAGGTGACACTGGACACTTTCATCTGAGAACCCTGTCACATGACAGTTGTTTCCTTTCTTCCTCCTCTCCTGGGAATGCTGCTGCTTCGATGACCCAAGAGCCTAAGAAGGGTAGCTGTTTCTCAATACACTGAGAGAGAGTTCTTTCTCCGTCCTGACCATCTTGGGACCCGATGGCAAGACTGGAAGGATTTATATCTCCTTTTGTGAGTTTGGTGGGGGAAAGAAAGGGGATATAGATGGTATTTCAAAAGGTATATATGTCAATGTCTACATATAACATGACACAGAAATAAATCTATGAGAAGTCTATCTACAAAAAAAAAAGGTGATATGTCTGAAGCACTGAAATAACTGATCAGGTTATTTTTTGTGCAGTGTATGTTTGAATTTTTCACCACTAGGCAAATAAGAAAATACTGAACAATAAAAAAAAAAATTAGAATCAGTGAGATAAACAGTAAGAATCGTAAAATAAGAGTACTTGAAACCGATTTTTTATTTGTCCAAGTTCTTTACTGCACTGGGTAAATGAAAGTCTTATGAAATTTCTTTTGTGTTCTCCACAGGTACAGAAAACTGCCTCCCCATGTTGGTTTGTGAAGTGAAATGCATATAAAACAGAGGATTCCAGACTCTCAGAAGTCAATACATAAATAAATAAAAATAAAACTGAGAAGATACCTCAAAATGGTCAGACTCATTAGCATCATCCAGGTGTATTTTCTCTTCAAACAGTGTCAGTGGGTCTCTAATAAAGAGATGAGCAACATGCTGGGCCAGGAGATGATCAATGCCTGCAAAAAGAGATCACATGGGAACTCACTGCAAAGCGAGAGATACCACTTCCTCTTAGTCCAGAAAGACGACAGGATAGCTCAGGAAGTTTGAAGAAAGGGTGTCTAGAAGCTTGAAATAGCTGGTTTGATTAGTATCCTCACCTCACCCAGTATTTTATCCTGCGGACACTGCGGGAGTGTCAGCGTTTTATTCACTACTTACACAATGCCTGCTGGGGCACTGGTGTGGACCTAGACACAGACCTCCAAAGTAAGCTCCTTTTGCTAAAAATCAAGAAAATCTCACAAGTATTTGGAACCTGAAACTTTAGGAACAAGTAGCCTCATGAGAGAAGTTAAAGACTTTGCACTAAAAATAGAAACCAGACCAGGAGTCAGCAAAAAAGTGTAAAAGAGCTTTGAAGAACTAAAGGCGTACATTCAAACCCAGAAAGATGGAGTAGAAACCCACCTTCCTGCAACAGCTGTTCGTAGATCTCTTTATCTATCGTCAAGTCGATGTCATTATATTTCTCACCACACTTAGATAAATAGCTGTCTATTGAGTCATATCGGGATTTACTGATCCTATAGTTATTGTTCTTCAATGGCTAAAGATTAAAAATATATATAAATGAATATGCTATATAAAATGAGTGGAATATATTTTTATATATGATAATTATATAAAAACCTCAACATAAGATACAGAAAAAAAGTTAGTGAGCCCTAAAAAGTATTATTAAGGAAAATTATGTTTTTTAAAATCTGAAGGCAATTTAAATACCCTTTTTTTCTGGTATGATTTAAATATACTTTTATCTTTTAAAAGCAGATCACTTTCATTCTTATTAAGCTAGGGAAAATAAATACTAAGGTTAAAAGCAAATAAATAAATAAATCTATAACGTAAGATAAACCTATCAAAATAATTATCCTTTAAAGTTTATTTCTACTTAGAAAGCATGTTCAACAATTTATGAACAATTACATGAAGACCAGAGCAGTAGTAGTATAGCCCTGGTTGAGAATATCAAAACCACTTATGAGGGCTCCTTTAAAAACACCCTTGTTCGGGTCCCATCCTAGAGATTCTTATTTAGTAGGTCTAGGATAGGGTCTGGGTGTCTATTTTCAAAGATTTCCATGGGTGGTTCTGATGCACACCCCTTGTTGGAGAGATGCAAGGGTTACTTTACAGTTCAACATGCAAACAAGAGGTGCCATCTCACCCTTATTAGTCAATGCCTAACCTTTTACATGGAAAAAGAATCTCTGACAACAAATTATACTTTCCACAGCAGAAAGCACCATATACAAAACACTCATGTGGCACCAAAAAGCCTTTTGGTAAAAACAGCCATCAGCACTTCCAAAATATAGAAAAATCGGACTACTAATTTTAAATGAAGCTAAAACAAATACAGACATCAACATACGATAAAAATTAACTCCCCACCTAGACCAAATCTTTTTCCCCATTTCAGATAAAAATTGCAGGGAGACATCCTGAAATTGCAAGTAGTTACAAAAGATCCATTTTACCTGCTTGACTTAAAAGGGCTATTAAGGAAAAACAATTCCCACCTCCAGTCCTCGCTCCTCCCGAGTTCTATCATCTACAGATGCAGAAATCACTCCCCAGCGACAATCAATGTCTGACACATAGCCTCGGTAAAAGGGAGATGCAGCACTCAAAGCCATCTAAAAACAAACAAAAGTCAGCTCCTGCAAATTCAAAGTGTCACTTACATGCTAAAAAAAGCTCCATGCAGTTATATTTCTGATCAAAAAGCATGTTTATGCAACCCATACAGAGCACATGTACCTGTGCCTATCTTACAGTGAAATATACCAGGAAGAATCCAGTTCCTTGGGTTTGATTCACTTAAATCATCCTCTCTCTAATGTGAGGACATGAAGTATGGGGGAGGGAAAATGGCCACATTCAAACTTCACATTTAACAAATCAATGTTGTACTAGCAAGAGTAAACTTCTACAGTGTAGACTCTCAGTTCATTATACCTAAACCTACATACT
GGCAAACTCCTCCCAGAAAGCTTGTTTTTTGGTCTTTTGGGGGGCAGATTAACTCCAATTTGTTTTTCTGAGAGTTCAATCCCATCCGAATTCTTCAGAAATATCTCAAGTTCAGTTCTACTGAGGAGACTTTTACCGGCATTCCAGCAGTTACACTTTCCCTCCCCATCCTAATTTAACATTGTAATCAACCTGGGATTTTGTGGTGGATGAAATCAATGTGTAGGACTACTTCTAGCCATCAATCATCTTGAATGGAAAGCGTCTAGAAATTAAGCTTAGGTTTAAAAGAAAATAAAGAATAGGGCTGATGGAGAAACATTTTATTGCAAAGGGTAAACAATTTCAAATGAAATTAGGTGGGAAATAAATAGCATATATAAATAAATATATCTACAGATAGATCTATACCCATCACCATAAAGAAACATATCCTTACCTTTGACAGTGGAATGAGAAAATCCAATTTGTAGGAAAGGATCACTCTGGTGAGCAGTACCACAAACACCACATAGGCAGAGTTCTCAAAGTCTGTTAATTGCACCTAGACAAGCAGAAGCCCAGAGAAGTTATGAACCAACTACACAAACATGCTCTTCCCTGACCCAGGCCCTTCCTCAGATCATGTCATTCCCAAGCCATCTCCTAATTCCCCATCTGGGTCTGGAAGCCCTTTGCCCACATCTATTCTCAGAAATCAACCCTCCTTAACTTGGACTGACTTGCTACCATGCACATACTTAATTTTTATTTTATATATAAGAGCCTTCTCATAGCAGCATCAGAAGGGTGATGAACAGCTGGCGAAAGAGTACTTTTGAGTCAGTTCTTGCTGATGCATGTGTCTTACCTCCATGGGTCGAAATTCTACTCTCCATCCAATGTCTGAGTTTGGAGGAGGGGGCTTAAATCTCATTGTCTGCCAATTTGTGGACTGAATATTCTGTGATACAAAAGCAGAGAAGAAAACCAACTTTTCACACATCCAGGAAAATATTAAGATGATCTGGTATTTAATTAAGGAAGAAGACTGCTCACTGTCCATACCAAATTTCAATTGACAAAGACAAAAAGGTACAATTGAAGATTTTCTTCGAGTGTGCTCTTTTAGGAAAACAAAACAGCCAAGTGTTTAACAAAAGCTATGAGGCCCTATCACTGCAAGCTTAATCTCACCCAGCTCCTACTCCCTATCTCCCAGCTACAGAGCAGCATCTGAAGAGCCACGGGGCCCCCACCTTCATCCCTGAGAATTTTAGGAGCCAGCCTGCCTTTCCAGGTGACACTGGACACTTTCATCTGAGAACCCTGTCACATGACAGTTGTTTCCTTTCTTCCTCCTCTCCTGGGAATGCTGCTGCTTCGATGACCCAAGAGCCTAAGAAGGGTAGCTGTTTCTCAATACACTGAGAGAGAGTTCTTTCTCCGTCCTGACCATCTTGGGACCCGATGGCAAGACTGGAAGGATTTATATCTCCTTTTGTGAGTTTGGTGGGGGAAAGAAAGGGGATATAGATGGTATTTCAAAAGGTATATATGTCAATGTCTACATATAACATGACACAGAAATAAATCTATGAGAAGTCTATCTACAAAAAAAAAAGGTGATATGTCTGAAGCACTGAAATAACTGATCAGGTTATTTTTTGTGCAGTGTATGTTTGAATTTTTCACCACTAGGCAAATAAGAAAATACTGAACAATAAAAAAAAAAATTAGAATCAGTGAGATAAACAGTAAGAATCGTAAAATAAGAGTACTTGAAACCGATTTTTTATTTGTCCAAGTTCTTTACTGCACTGGGTAAATGAAAGTCTTATGAAATTTCTTTTGTGTTCTCCACAGGTACAGAAAACTGCCTCCCCATGTTGGTTTGTGAAGTGAAATGCATATAAAACAGAGGATTCCAGACTCTCAGAAGTCAATACATAAATAAATAAAAATAAAACTGAGAAGATACCTCAAAATGGTCAGACTCATTAGCATCATCCAGGTGTATTTTCTCTTCAAACAGTGTCAGTGGGTCTCTAATAAAGAGATGAGCAACAAGCTGGGCCAGGAGATGATCAATGCCTGCAAAAAGAGATCACATGGGAACTCACTGCAAAGCGAGAGATACCACTTCCTCTTAGTCCAGAAAGACGACAGGATAGCTCAGGAAGTTTGAAGAAAGGGTGTCTAGAAGCTTGAAATAGCTGGTTTGATTAGTATCCTCACCTCACCCAGTATTTTATCCTGCGGACACTGCGGGAGTGTCAGCGTTTTATTCACTACTTACACAATGCCTGCTGGGGCACTGGTGTGGACCTAGACACAGACCTCCAAAGTAAGCTCCTTTTGCTAAAAATCAAGAAAATCTCACAAGTATTTGGAACCTGAAACTTTAGGAACAAGTAGCCTCATGAGAGAAGTTAAAGACTTTGCACTAAAAATAGAAACCAGACCAGGAGTCAGCAAAAAAGTGTAAAAGAGCTTTGAAGAACTAAAGGCGTACATTCAAACCCAGAAAGATGGAGTAGAAACCCACCTTCCTGCAACAGCTGTTCGTAGATCTCTTTATCTATCGTCAAGTCGATGTCATTATATTTCTCACCACACTTAGATAAATAGCTGTCTATTGAGTCATATCGGGATTTACTGATCCTATAGTTATTGTTCTTCAATGGCTAAAGATTAAAAATATATATAAATGAATATGCTATATAAAATGAGTGGAATATATTTTTATATATGATAATTATATAAAAACCTCAACATAAGATACAGAAAAAAAGTTAGTGAGCCCTAAAAAGTATTATTAAGGAAAATTATGTTTTTTAAAATCTGAAGGCAATTTAAATACCCTTTTTTTCTGGTATGATTTAAATATACTTTTATCTTTTAAAAGCAGATCACTTTCATTCTTATTAAGCTAGGGAAAATAAATACTAAGGTTAAAAGCAAATAAATAAATAAATCTATAACGTAAGATAAACCTATCAAAATAATTATCCTTTAAAGTTTATTTCTACTTAGAAAGCATGTTCAACAATTTATGAACAATTACATGAAGACCAGAGCAGTAGTAGTATAGCCCTGGTTGAGAATATCAAAACCACTTATGAGGGCTCCTTTAAAAACACCCTTGTTCGGGTCCCATCCTAGAGATTCTTATTTAGTAGGTCTAGGATAGGGTCTGGGTGTCTATTTTCAAAGATTTCCATGGGTGGTTCTGATGCACACCCCTTGTTGGAGAGATGCAAGGGTTACTTTACAGTTCAACATGCAAACAAGAGGTGCCATCTCACCCTTATTAGTCAATGCCTAACCTTTTACATGGAAAAAGAATCTCTGACAACAAATTATACTTTCCACAGCAGAAAGCACCATATACAAAACACTCATGTGGCACCAAAAAGCCTTTTGGTAAAAACAGCCATCAGCACTTCCAAAATATAGAAAAATCGGACTACTAATTTTAAATGAAGCTAAAACAAATACAGACATCAACATACGATAAAAATTAACTCCCCACCTAGACCAAATCTTTTTCCCCATTTCAGATAAAAATTGCAGGGAGACATCCTGAAATTGCAAGTAGTTACAAAAGATCCATTTTACCTGCTTGACTTAAAAGGGCTATTAAGGAAAAACAATTCCCACCTCCAGTCCTCGCTCCTCCCGAGTTCTATCATCTACAGATGCAGAAATCACTCCCCAGCGACAATCAATGTCTGACACATAGCCTCGGTAAAAGGGAGATGCAGCACTCAAAGCCATCTAAAAACAAACAAAAGTCAGCTCCTGCAAATTCAAAGTGTCACTTACATGCTAAAAAAAGCTCCATGCAGTTATATTTCTGATCAAAAAGCATGTTTATGCAACCCATACAGAGCACATGTACCTGTGCCTATCTTACAGTGAAATATACCAGGAAGAATCCAGTTCCTTGGGTTTGATTCACTTAAATCATCCTCTCTCTAATGTGAGGACATGAAGTATGGGGGAGGGAAAATGGCCACATTCAAACTTCACATTTAACAAATCAATGTTGTACTAGCAAGAGTAAACTTCTACAGTGTAGACTCTCAGTTCATTATACCTAAACCTACATACT
Task1_train_10537
The variant affects gene DST, DST-AS1 (dystonin| DST antisense RNA 1), which is on Chromosome 6. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Hereditary sensory and autonomic neuropathy type 6
ATCTCTTGACCTCATGATCCGCCCACGGGGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGACACCTGGCCTGTAAATTCTAAAGAATGGAATTTTGAGATCCCCAGTGCATCACCTGCCACCAACTTCACAGCTATCCCTACAAACTCAGTGAACATTTTACAATTAACAAGCGATGGCCCCTGCATCAATGACTCCACAGTCTACTAATAGCATCAGCACCTTCATGTACACTGCATCCCATTAGAACATAGAGTTCTTCAATATCTTCCCCACCTGCAGTGTACAATGATGGTTAGTACTACCAATTTCTCATGACTTCCTGCCCAGTAGAGTTTTTCCCAATTTATCTAATTTCATTCCCCCTAACAAACACCTGCCCTGTCTTTCTGTCATAACTCCCTCCTTCATTACTGAAAGCAAAATATCCATCTCTGCCACTACTATCAAAACTCTCAGCCCAGAAGCACCTTCTACCTTCCAAAAAATACATAGAACAGGTATCCCATTTTGATGCCCTAAGTGGGCCATCAGCCCCCAGTAACTTCTCACTCACACCCTCCTTTCATCTATCTTCCCTTTCTGCTGAGTCAAACATCTGGTATGGGCAGTGTCATCTGTATAGGCATTCATTTCGCTGGAGCCTCAGACCTGCGGGAAAGTTCTCAACAGGGCAAGGAGGCAGGCCTCAGTGACTAAACATTTTCTGGTCTGCCTTGACTCTCCAAGTCTACCCCTGCTCACTCTCAGTCTCCATCCTCCCTCCACCTCCCCTTTCTCACTCCACCCCTTGCTCTTCAAAGGCCTGGGTGAGACCAGCCAGCATCTCACAGCGGAAGCCAGAAGAAGCTCAAGGCTGTTGCCCCAGAAACCCTGACTAGAGAATGGCTGGCTAGGCACTGTTTGTTTTTCCCGTAATCAGAAAATCCCACTGGGGGGACAAAAAGGGGGTTCTCAGCTGCCTTGATGGCCGGAATCTGGGCTGGTCCCCTCCAGCCCCCTTGGAGGAAGAGAAAGTACCAACTTTGCAATACAGTATAGGAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACTGTGGAAAGGGACCCCCAGAGTTAAGAGTGGAAGAGAGGGAAGGAAAGGAAGCCTGAACCACTGGATGCAGAAACAAACTTAAAGAACACCTGGCCTTCTGCCTTTGCAAGAAAGTCCCCAAGGACACATTCCATCCTGCCCTGTTACCATTTCCAAGAAAGAAAGAAAAAAAAAATATTGAGGGAAGAAAGGAACAACACCCCTGGAAGCACCTCTCATGCACAGGACACATACACACAAACCACGCAGGGGTTGGAAGGTTGATTTCCACAGTGTTCTCAGCTTTCAGCTGGGTAAAACAAGCCATCACTTCTGGTTCAGCTTTTAGGGCCAATGCAAGGGAACACCGGGTAACACAGAACAGAAACATTGGCACATCTCATGTATTAATTAATCAGGAAGGCGTGATGGCCAAACCCTCAAAAGCACTAAGGACAGAAAGCTGCTATGGATACAATGATGCAGACAGAGATGCTACATTTAAAGAAAAACAACATCCAAGTTGCTGGAATATGCTTTGCAATCCTGGGTACCAAAAACCATGGATCTTCTCAATCTGCGTAGCTCAGTGCCCCTGGGCAAAAATGAAAATAAAGGCTGCTCACTTCCAGCTTCCCGCAAATATACTAGCAATCACTGGAGCTAATACTTTCAGAATGTTATGGTAACTAATGCAGTAATTAGGAAAGTTTAGTGCAAATGTCTGTAAATATTTCCTTGCATTTCAAAGGAATCGATTCGTCCAACCAGAAGGCAGGGCCAAACAGCTTAGTCACCAGCAGGCAGGGCAAATGGCTCTATCGGTAAAACAAGGCATAAAGTAAACATGGTCATCATCCTCCCCCACCTTGAGCACAGATTCCTGCCCAGTGCATCAGCTCCCGCTATGGCCCCCCAGGAGGTAGATGGGCGAATTTCCGCAACTCTCTTCCCCCACTCCATCCCCTTCCCCAGATGCTCTTACCTGCTATCCGAAGCACTGCCCTCTCGGCAGGGTCCAGCACTGAGCCCCCTTGAATCTTTCTTTTCGATCTCTCATGTTTAGGCAAATTCCAGGGTAAGGTGTCTCCCGGAGCTGGGGATGCGGAGCCAGATTTCTGGCTGAAATCATCCTCATCGGAAAAATCCGCAGAGGAAGACATAGAGCAGCGATAGGACGCGTTCCCGGAACTCTACAGAGAATGACACAGAAAAAGCATTAACAGCAAAATACTCACATATGCTCAATGATTTAAACATCTCCCCCACCAACCACCGCCGCCCTCCCTGCCCCCAAACTGGGTCTGGCATATCCTGCACCATCCTCGGAGCTGAGGGAATATGCAGAAACCAAAAAAATAAAACCCGGAGCTCACCATCTTTTCTTGGCCAAGTCTCCAATCGTAAAAACAATACACAGGCAGTTTCAATACATGAAGATTTGCACGGAAGAAGTGTGTGGCCTGTGGTCCGGCCACCAGCTCACAAATGACTGGCCCAACAATGAAGCCAGAATCAACAGCCTTCCTGTTACAAACCTATAGTATTTGGCTCCCCCACCAGGACAGTAGAAATATTTTCCATTACTAGCCTGCTGCTTAATTCATCAATGCAACTAACTCGAAGTTTCGAAAACAAAGCACAAATGCAGGATGTTGAGTCCCAACTCCTTTCCGCTTCAAGTCACCTCACCACTGGAGACTCCGTTCTGACCAGTTTTAAGCCCCTGTCCTCTTTATTTAATTTTCTTCATGAGACTGAAGCAGGTTCCCAGAAAAGAGCAAGGAGGGAGGAAGGGCTGATTCTGAGAAGAGCCTTTTCTTAAGACTGGGAGAACACAAAAGACTGTTTTCAGAAGCCTATGGCAGCACCAATAAACAAACATCTGAACTCGGTTTAGAGTTCTCAAGATAATTTAAACTTCCAGCAAAGTAACAGCTGCCAATAATGTAAATGAGAATGATGCTGCGCAGTGACAGGAAACAGAGCTCTTCTCAGCTCCTGGTCATTACACAGTGAAATGAGAAACAGGATGCTTTTGCCAAAGCACTTTGCCTGAAGGTTAGTCCTCCCTTCATCTAGCTGGAGCAAATCTGTAGGGTCATGTCTTGCATAAAAGTGTTAATATCTTCCATAGAGGGAAAAGGCACAAGATGTTATTCCTTCCTTCTTTGTTGGGTTGTGTTTGTGATTATTTACAGAGCCACTGGCTTACTAAGGAAACAAGGATGTTGACTATCTCTGCTGCAAAATTATAAACATAACGACATATCAAAAGGAAGTCTTGACTTTCCTACTGAGAATTCTACTTCGCTGAGACTCATGGTAAAGATGCAAAACTGGTATAACTCGAATTCCTGAAATGTAACTTGCAGCCATGGATTCCTAAGAAGCAAGTTACAGGCAGAAATCAGTGAGGCATGCTCCAATTTGAGCAAAAACACTGGGCTTCCCACAAAAGCAGTGGCAACTGCAGCACAAACAGGCTGTGTGAGCCACATCCCAAAACACTCACCCTAGGTACGTGAAATAAACTCTAATTGCATCAGGACTACCAACCTTACCTCAATCTGTTTAGGCCTGTGGCTATGCATGGTCAACACCATTATTTTATTTTATTTATTTTTCTTTTTTGTGGGCACATAGTAGGTGTAAACCCCATTATTTTAGAAGTTCACGTAATATTTCCCACAAAGTGAGGTATGTAAGACGTAGCTCTCTATTCTTTCCCCCCAAAAAAGCTGTCTTCCATTTTATTTTACATAAAATTTCATCATCTTGGCTAATTTATTTATTTACAGTCTGTATATTTTTCTAATGACAATAAGGCATTAGGCAAACTTGAGGCAAAAAGTAAATAAAATTGATTTTCTGTATTGTAGCTACAATCCATAGGGAGTTGTGAGTGGCATTAGGTCAGTCACAGCATGCTATTATCAACCCAGTTTATTTTCCATGCTTTTCTGAAAATCCATCTTGAGCTTTCTGAGATTTTGTTTTTGGCTGGCTCTGCATAAAAGGGTGACATTCTTAAAGACTTTT
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Task1_train_10538
A change on Chromosome 6 affects gene RAB23 (RAB23, member RAS oncogene family). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Carpenter syndrome
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Task1_train_10539
This variant affects the gene EYS, PHF3 (eyes shut homolog| PHD finger protein 3) found on Chromosome 6. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Retinitis pigmentosa 25
TGGTCGTAGGTCCTTTTAGGAATGTCTGTAGCCTTTTGATTGGAATGGAGTGGCTAAAATAAGACAAAAATCTCTAATAGTTTTTGAATGATAAATTACTACCTCGTTACTTTGTATAGACTGGAATCTGCACAGAAATGTGTATTCATCAGCCCTTATTTTTTGTAAATCTTTTCTCTAATTACTTGATGATTAATTTCATATTTTTCCTTTTGAACATTACATGCTGCTTATTACTAAGATTTTTTTCTCCAGATGACCTATTCTACCTGTTAGTTCACCAAGTCAGTCATATGTTGCCGGTTGCCAAGTGGCAAAATTATCACAGATATCAAACTCAGAAAATGTCAGGTAACAACAGCAGTAACTGCTTTCCAACCTGCAGTGGTGGACTGGGAGTGGGAAGTGAAAGTTCTGTTCACAATTGTATCAGTAACTGTTTTGGGAAAAATAATATTTTTTCAAGTTATGCTATCAACAGTACTAAATTGTTAGGATAGTAATTTTCCATGGCATTGTTTAGAACCTATTTTATGCCCAATTTTGAGATCTGTATAGACTTGAAAGCAGTTAAACACAAATTAAGGTTAATTTTTTAATTTGATCAGTTAATATGAGTACATGGTTTTAAAAAGTCAAATAGTTCTACAAGGTTCATAAGCAAAAAGCAACAGGCTTCTGCACTACTCTTCTCTCCAGAGGCAACCATTTTTAATTCTTTTAGATATTTAGGATATTTGCCTTCATGTTTGTGATATGCATATGCTATGTTTTAAGTTGCACATATTGTAATATCTATTGATGTCTTACTATAAAAGATAAGGATTTAGCTCTTACCAGCCTGTTCTCCTCTCCTCTCACCTTCTCTTTCTACATTCATGCAATAATTTTTGGTTTAAATCTATGTTCAAGTTTTACATTGTTGAATCATATAAATAAGTTGTAGCTAAGCCATGTAATACAATATGGTTACATTGCTTTGTATAATTTTTATTTTTCCTTTGATTAATAACTTGATTTTTTTCTTATTTGTACCTATCCCTAATTCATTCCCAACTGAATTTTAAACATTTTAAAGTTCAGCTTACACATTGATTTTTAAAATTGTGTTTACACGTTGATTTTAAAATGTAAGCATTAGGGATAGGTAAAAAGTGAATAAGCAAAGTGAATAAGCACATTCTGTGAATAAGCACTGAACTAATGGAGTTAAAACATGAATCAAAATATATACAGATAAATTAGATGTAGGAAAAACAATCAGAACCTTCAGTGACATTTTACAATCTTATCAAAAAGATATGTTAGCATTTAGACTATTTCAGGTAATATAGTAAACAGTTGATTCCCCGTAAGCAATGTATCAAAGAAATAACTATCAAAATAACTGCATTTATGTATAGTGTGTACTAAAATCTCTAGTGTTAACTTATGTAACCTCATTTTGTTCATCTCCATCATAAACATTGTATCCTTCTAATTTAATTAGTTCAATGTTTTTTGGTTCCTGAAAAAATACAACATCTTTAATTTTGCCAACAAAATTGGTTTTAAAAATCTCTTGAGTAACGATATTTACCTTTCTACCATATTCAAAGCCCCCTAGATAACAAATGCCATCATAGTTTAGAGCCACAAAGTTTTTATGTGGATCAATATCCTCGGAAAGAATTAGACTGTTATTTATGTAGGCCTTGATAAGAGTCTGATTTTGAATTACAACTACATGGTGCCATTTATTACAACAGAATGTGCCATTGTTATAGCTCATAGGCACAGAGATTCTTTCTCCCAAGTTAACTGCTATTTTCAAGGTCTGATTATGGAGACCAATTGCCAGAAAATCATTTTCTTCATTTTGAGCTATTCCCATCCATACAATTAGACCTTCTGTTTTAGTGGTACTGAAATTTAAGGATATAGTAGTGAACTGGAGGTTTCTCATTCTATAATTTGGATCAATGTATTTAATGTAAGAATTACCCATAAATTTTGCAGTTGAAAATGAAGTTTTGTTTTCACAATACCTTCCCACCCAACCCAAAGTACACAGGCAACTGTAAGAAAATGATTGGTCAGGTATACATAAAGATTGGTGGAGGCAAAGATTATTCAAACAGGACACAGACTGGTTACATGTATTTCCAGCCCAATCTGGCAAACATCTGCAAGAAAAAGTTGTGCCATTTACTGTACATTCACCTCCATTTCTGCATGTGTTGTACCCACAGGCTGTCCCATCACAGTCACCTACATTTGAGCCACCTTTTGCTCCAAATTCAGTTAATTGTAATTCTTGATTATTTATGATAACTTGTCGGATACAGCCTTGAAAACCTACAGGTTCATTTTCTATTGCCATGGGATTTACAAGATTTAAAGAAGATACTCCTCCAATATAGAAGTCTGTATTTGTGTCCAGAGAACTCATTTTAGTGGAGGCCTTTTCTGTTACATTTATCCCATCTAGATCCAGGTAGCCTTCTGCACCAACTCTTCCTGCTTTTATTATATGCCAAGTACTTCCGTTTATAGTTACTTTTTGGAGAGTTTCTAGAATGATAGTTCTGTCGCCAAGGTTGTAGCGAAGTTGAACGGAACTATTTACTAAAGAGATGCATAAAAAATCACCTGCAAGAAAGCAAACAGTAAGTTTGATTAGCAACAGTAAAAGTTTCCATTGAAAACTTTTGCTGTTTCTGGCCAAGTTGGATAAGTTTTAGTTATGGGGAAAAAAGTAACAGATCTTGAGCACAATTGTGTTAGTTTTGTTTCCACTCACAGAGCAAAATGCATATATCCTGTATTCTTTCATTTTGTTCAGCAATTGGCTACATAAATTTTCTCTAGTTGTGGACAGTTCTCATTGAATGAATATATTGTGGTAGTAAGTTAAAGTGAGGTTTTTCTTCAAATGAAAGCCTGTTCCTTATGATACCATTTAATGGCATTCACTATTGTCAGGCTAGGTACCTATAAATTCTCTGCACATTCCTGGCTCCTTTCCTGTCTCTCCAACCTTACCTGGAATGTTCTCTTTCCCCATCCTTACACTCTCTTTACTTCAACAACACTGACTTTGTTAATTAAGGATTTCATTCGCCTGTTTTCTAGGAACACTCCGCCACCCCATTCCACCTCAACTAGATAACTCCTACCTGTCCTTCAGGTTTCAGATCAAGTGTCACTTCCTCAGAGAAGTTTTCCTTGATTTCCCAGAGCTGGTCAGGAATTTTTTTCTGTCAGTGCCTTAATATCACTAGGTTTCCCTCCATTACAGTATATCTCATTTTATAATTATATAGTCGTGTGAAGAAATAGGAACAAATACCATCCAGCATCTGAAGTTGCAATGAGGCATTCAGAAGAAAAGTAAAGGCAATTCTGCAAGCTTGGAAAAAGCATGTTCTTCACTGTAAGATTGCTTGAAGAGGATAGCAAAATGACTTATTAATAATGAACCACGCAGAAGTCTCCACGAAACATTTTCTTCTCCCTCTGAAATTTCCCAACCTTTTTCTTTTCTCATCCAGGGATATTCGGCATTATGCTACACTACTTCTTCCTCCCTCCAGAGTGCCTATTTCCACACCTCCCTCCTGCAAATGGTGTTCTTTCCTTCTATTCTCCATTGTGGTCTATACCAAGCCATTCTAGACTGGTTGGAATGTTTGGCAGCTCTATAGTTCTTCACCTATCAAACTACGTTCTCTAGCTTTATTTTCCTCATAGGGAATTTTTAGTGAGTATACTATGTCGTTACATATGTGATATTTGGTTAACAGCTGCTTTATCCACTAGGTTGTAAGCTTTATGAGAACAGGGTCTGTGTTTGGTTTGGTCCAACAGTTGATTCCCAGCACCCAAAACGGTATCTGGCCCATAAATAGATGCTAAATAATTATTAAATAAAGAAATACGTTTGTAGGGTTGTGGGTTGAGATGACTCAGAATATTTCTCAAATAATAGTTTTAGCTTGAAAGCAAAAACTTTTTTCCTATAATGACATGAAAATTGTTTTAAAAATTCATAACAAAGAAACTCAGTTTATTTGCATAATTTCTAACATGTATAGCATTTTTAACTATAAGGAAA
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Task1_train_10540
This variant affects the gene EYS, PHF3 (eyes shut homolog| PHD finger protein 3) found on Chromosome 6. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Retinitis pigmentosa 25
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Task1_train_10541
This alteration occurs within gene EYS (eyes shut homolog) located on Chromosome 6. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; not specified
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Task1_train_10542
Chromosome 6 houses a mutation in gene EYS (eyes shut homolog). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Retinal dystrophy
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Task1_train_10543
Here is a mutation in EYS (eyes shut homolog) on Chromosome 6. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Retinitis pigmentosa 25
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Task1_train_10544
A mutation on Chromosome 6 affecting EYS (eyes shut homolog) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Retinitis pigmentosa
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TTGCCCAAGATTCCCATACTCACTAAAGACTGTGGCAGTTGACATACTTCCAGGAGTGTGCAATCTTAATGTTTCTGTAAGAGAAAGGGCCAGCTCTGTGTGTGCTGATCTCATTTGAACACGGAACTATTTGAACACAGGAAGACAGACTGTGGCAATAAGATTGCTCACCCAAGCACAATGTTGTCCTTAATCCTCTTGGCTTGCTCTGGCCTCTGTGGGCTACCCCTTGGTGGTATGGATGGGTTGACTGCAGTCTGTCTCTTGCCTTTTGAACTTCAAAGTTAGATGGACTTTCAATTTTTACTGTGACTCTTTGAAGTCTACCCTGCTCAGCCTATTTTAAAAAGCACCCTGTATAAACAATTACCCATAATCCTGATTCCTTTAAATCATGCTCTCCATTTCCCTTTTCCCATTGAACTTATCACATTATATGACTATATAATTAACTAATTACATTTAGTGTTTATCTCTCCAACTAGTTATAAGTGCAGAAATCTTTGATTTGTTCATTAAAACATCCTAAACATCTAGTACATATGTAGTAAGTGGTCAATAAATAGTAAATGAGGCTGGGCATGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCCTAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTTGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCCAGATTGCATCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCATCTAAAAAAAAAATAGTAAATGAATGTTTCTGATTAAAATCAAACTTTGTTCAAGTCTGAAAGCAATCCATATAGCTGGTTTGGGAAATAGAAGTATACTCTTTAAAATATTTTTTTCCCTCAACATTTGAAATAAGTAGGTATAATATAAAAAATGTCCATGCCTTACCTTGAAAACCATTTTTAAAATCTGCTCCATTTGGTAAGAGATCTGGAGTGTATTCACTGTAGCCACCTACATAAAACTGACTGAAGACATTGAGACCAACCAGTCTTCCTGGGGCGATAATGGATTTATTTTTATGATCATCTACCTTCGAAAGGGAAAAAAAACCTATTAAAAAAGGAATTAATTCCCCAGGGTGAAATGTTAAGATACTCTTTTGTTATTTCCCATTAACTTGGCATGAAAAATTTACAAAGACCTGAATTTTGAAGAAATAACATGATACCACTCAATTCTCTGCTTCTCTGCTGGTGTCTGTTACCAGGGATATATTAATATAGCAGTCATGGTTTTGCATTTCAATCAAAATCAAAGTTCTTCAAAGATTAGGTGCTGGCATCCTGCTGATTCCCCTCCATTTAGCCTTCCTCCTCTGCTATCAATTCTCCATAGAACCACCAGAGTCCTTTATCAAAAATTAGAAATCAACATGGTACCCACCTTCCTAAGTAGCTCTTCATAGTTCTTTAGATAAAAATATAAACTTCTTAGCACATCTAAGCCCTTTGATAATATAGACCTTATCTGTCTCTAACCACTTCTCTAGCTCCCCCATCCCCCAACCTAAAAACCATGCTGAACTACTTGCATTCCTTAAGCTAATACTGGCCATTGTTCTCTTTCTTAACTCCTATTTGAAGTTACGCTCAAGCATCACCTTCTCTGGGAAGCACTTTCTGAATCCTCTCTCTCACCCTTATCTGTGTTAGTAATCCCTCTTATTTGTTCTCACACCACTTAATTGTAATCATCTCTCTATTCCCCTAGTTGGTACAATAGTCTGTGAACTTCGTGGATGTAGGCATCATGGGCTATTCACCTCTGTATCTTAGCACAGATCTGACAATATACTAGTGCTCTCAGTTTGTGGAAGTGACGAAGGAATGACTCTTTACCTTCAGCCAGCCCTCTTGGAAGAACTTGCCCAGATGAACAGTGTGGACTCCAAGGCTCAGATTGAGGGGCTCGCTCCTGATGCTTGGTATGCCAGACCCCAGGTTATAACTATAAACCACACTGCCATTGAGCAGGCCCACAGCCAGGAAGTCATCGCCATTCAACCCTGGAATGAGAAGACACATGGGGAATGCTCACTGAGAGGAAATTCAGGAGTTCCGTCAGCTTTATTTTACTGACTGGTTCTGAATTACAGATCAGTATGGTAAGTTATAATACATATTTAGTCTCTAGTCAGCATTTAGGTATATGTGCAACTGGCTGTTGTTATTCCCAGCCCCAGAAACAGAGCACCAAGAGTTTATGTCTTTGAAGCCATGAGGGTTCTGGTCAACCTGGGGAATGATCAATGATCAACTAAAAAGTTGAATGGGATTAAAATCTCCTTTTGTCGGAGTGAAATTCAGTGTGCACTTTACAATAAGGAGAACTTCACAATGGAGTAGAATTGCTCCGGTAGCTAACGAGATTCAAAAGGCTGAGATGACCTAGCATCAGCTTTGAAGTTCTTTCTATGATTTGAGAATAGGATAAAGACCAATTTATTCCTATGATTGCTAAGAATATGTTATCATTATTCTATTACAAAAGCTCTTAACCATGCCCCATGACCATTTAAAGGTGGATTGTTTCTGTGTTCCCTCTTCTCTCTCTCCTTCCATTAGTTCAGAGCCATCCATGCAGTACAGTGAGTTCCAGGACCCAGAACACTCAGGAGACAGTTCTTAAAGACCCACGGGACAAAGGAAGTGGTTGGGAGTGACCCAGCATTAATCACTAGGGGAAGGTGCTAGCAGTATCCTTGGCGGGATTAAGAAGTTCTGGGATGATCCATCAGTATATAGCAAGAGATCTGTTCACAGGAAGCAGAGACCCAAATACGTCACCCAGCTTCTGAAAGGTGTGTTAGTGGGTGGGGCAAAAGAAGAATTCAATACTGAGGCTAGCAGTCAGGAAACTGAGGCAAAGACTTCTGCTTAGAGGAAGAACGTAAGAACCCCCTAGAAGTAAGAGGTTTAAGCATGGGAGAAAAAGCTGAATTGAGTCCTTGACATAGAAAAAATTTATTATGAGTATGCACAGCCTCCTCCTTCTGCATTTATAGGAATGATGCTTTGTCTGTTGACTGGGCTTCTAGTATTACTTTGATCAGGGTAAAGGAGAGAAAGATCTACAGGGAGGTAGGTTTCCAGATAGGGTGGAGAGGTGGGCTTCCTGAGGCACTGGAAAGTGGAAGACAGAAATATTATTTAGAGATACTTGAACGCTGCCTCTGCTTTTCTAAAGGGTCTGCCATGGGCCCTGAGCAGGGTTACTTTTGAAAGCTCTCTAGGTGAGTCTAATATATACAGTCATGGTTAAGAGCAACTGTATTAAGTGACCTACCATAGACCGAGTACATTGGGAACTTATGGCAAGTCTCTTTTTCACTTCCTCACATTCTGGTGATTTCTTCCCACCTGCAATGCTGCATCAGGTTAGCTGGGTTGTATATTTAAAACGGAAAGTTCAATGTTTCAAGAGAAAACATAGATTCAGGAAGGCAGTTAGAAAGGCAGAAAGGAGAAAACAATACTAGAGATTGGAGATAGTCTTTCAGGCAGCTGTTGGGATATAGAAGAAATTGGGAGGGGTGGAGGAGGAAACATGAGATTTTTCTGTGGGTTGTGAATGGGAATTTTTCTGAGAGATTCTGGAGGGGATCTGAATTGTCTTTCAAATTGTCCAGGTTATGGGAGTGGAGCCAGTATTGTGCCAGCCGAGCTGTAAGGTAGTGGGAGGGCATATTCATTTCAGCTGTATCCTTCCTTTCTGTCTTGTGCTCTCCTTCCTCCAGTTATGGAGAACCCATTTCATGCCAGGAGCATCATTATTATCCTTAGGTCCTTGACAGCCTGGTCAGGAGGAGATAGGAGGTTTGTTTCAAGTTCCACGAAGAGCAGAATAGAAACAAATGGGGGCAGCCATTAAGACATGGTGAGGAAGAGGGTTAGGAAAGCAAAAAGGTGGTTTTTGAGTCAGTTTCTGAGCTCACCCAGAAAATGACAAGCAAGAGCTTGTTAGATGAAAAAA
Task1_train_10545
Gene EYS (eyes shut homolog) on Chromosome 6 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Retinal dystrophy
TTGCCCAAGATTCCCATACTCACTAAAGACTGTGGCAGTTGACATACTTCCAGGAGTGTGCAATCTTAATGTTTCTGTAAGAGAAAGGGCCAGCTCTGTGTGTGCTGATCTCATTTGAACACGGAACTATTTGAACACAGGAAGACAGACTGTGGCAATAAGATTGCTCACCCAAGCACAATGTTGTCCTTAATCCTCTTGGCTTGCTCTGGCCTCTGTGGGCTACCCCTTGGTGGTATGGATGGGTTGACTGCAGTCTGTCTCTTGCCTTTTGAACTTCAAAGTTAGATGGACTTTCAATTTTTACTGTGACTCTTTGAAGTCTACCCTGCTCAGCCTATTTTAAAAAGCACCCTGTATAAACAATTACCCATAATCCTGATTCCTTTAAATCATGCTCTCCATTTCCCTTTTCCCATTGAACTTATCACATTATATGACTATATAATTAACTAATTACATTTAGTGTTTATCTCTCCAACTAGTTATAAGTGCAGAAATCTTTGATTTGTTCATTAAAACATCCTAAACATCTAGTACATATGTAGTAAGTGGTCAATAAATAGTAAATGAGGCTGGGCATGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCCTAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTTGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCCAGATTGCATCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCATCTAAAAAAAAAATAGTAAATGAATGTTTCTGATTAAAATCAAACTTTGTTCAAGTCTGAAAGCAATCCATATAGCTGGTTTGGGAAATAGAAGTATACTCTTTAAAATATTTTTTTCCCTCAACATTTGAAATAAGTAGGTATAATATAAAAAATGTCCATGCCTTACCTTGAAAACCATTTTTAAAATCTGCTCCATTTGGTAAGAGATCTGGAGTGTATTCACTGTAGCCACCTACATAAAACTGACTGAAGACATTGAGACCAACCAGTCTTCCTGGGGCGATAATGGATTTATTTTTATGATCATCTACCTTCGAAAGGGAAAAAAAACCTATTAAAAAAGGAATTAATTCCCCAGGGTGAAATGTTAAGATACTCTTTTGTTATTTCCCATTAACTTGGCATGAAAAATTTACAAAGACCTGAATTTTGAAGAAATAACATGATACCACTCAATTCTCTGCTTCTCTGCTGGTGTCTGTTACCAGGGATATATTAATATAGCAGTCATGGTTTTGCATTTCAATCAAAATCAAAGTTCTTCAAAGATTAGGTGCTGGCATCCTGCTGATTCCCCTCCATTTAGCCTTCCTCCTCTGCTATCAATTCTCCATAGAACCACCAGAGTCCTTTATCAAAAATTAGAAATCAACATGGTACCCACCTTCCTAAGTAGCTCTTCATAGTTCTTTAGATAAAAATATAAACTTCTTAGCACATCTAAGCCCTTTGATAATATAGACCTTATCTGTCTCTAACCACTTCTCTAGCTCCCCCATCCCCCAACCTAAAAACCATGCTGAACTACTTGCATTCCTTAAGCTAATACTGGCCATTGTTCTCTTTCTTAACTCCTATTTGAAGTTACGCTCAAGCATCACCTTCTCTGGGAAGCACTTTCTGAATCCTCTCTCTCACCCTTATCTGTGTTAGTAATCCCTCTTATTTGTTCTCACACCACTTAATTGTAATCATCTCTCTATTCCCCTAGTTGGTACAATAGTCTGTGAACTTCGTGGATGTAGGCATCATGGGCTATTCACCTCTGTATCTTAGCACAGATCTGACAATATACTAGTGCTCTCAGTTTGTGGAAGTGACGAAGGAATGACTCTTTACCTTCAGCCAGCCCTCTTGGAAGAACTTGCCCAGATGAACAGTGTGGACTCCAAGGCTCAGATTGAGGGGCTCGCTCCTGATGCTTGCTATGCCAGACCCCAGGTTATAACTATAAACCACACTGCCATTGAGCAGGCCCACAGCCAGGAAGTCATCGCCATTCAACCCTGGAATGAGAAGACACATGGGGAATGCTCACTGAGAGGAAATTCAGGAGTTCCGTCAGCTTTATTTTACTGACTGGTTCTGAATTACAGATCAGTATGGTAAGTTATAATACATATTTAGTCTCTAGTCAGCATTTAGGTATATGTGCAACTGGCTGTTGTTATTCCCAGCCCCAGAAACAGAGCACCAAGAGTTTATGTCTTTGAAGCCATGAGGGTTCTGGTCAACCTGGGGAATGATCAATGATCAACTAAAAAGTTGAATGGGATTAAAATCTCCTTTTGTCGGAGTGAAATTCAGTGTGCACTTTACAATAAGGAGAACTTCACAATGGAGTAGAATTGCTCCGGTAGCTAACGAGATTCAAAAGGCTGAGATGACCTAGCATCAGCTTTGAAGTTCTTTCTATGATTTGAGAATAGGATAAAGACCAATTTATTCCTATGATTGCTAAGAATATGTTATCATTATTCTATTACAAAAGCTCTTAACCATGCCCCATGACCATTTAAAGGTGGATTGTTTCTGTGTTCCCTCTTCTCTCTCTCCTTCCATTAGTTCAGAGCCATCCATGCAGTACAGTGAGTTCCAGGACCCAGAACACTCAGGAGACAGTTCTTAAAGACCCACGGGACAAAGGAAGTGGTTGGGAGTGACCCAGCATTAATCACTAGGGGAAGGTGCTAGCAGTATCCTTGGCGGGATTAAGAAGTTCTGGGATGATCCATCAGTATATAGCAAGAGATCTGTTCACAGGAAGCAGAGACCCAAATACGTCACCCAGCTTCTGAAAGGTGTGTTAGTGGGTGGGGCAAAAGAAGAATTCAATACTGAGGCTAGCAGTCAGGAAACTGAGGCAAAGACTTCTGCTTAGAGGAAGAACGTAAGAACCCCCTAGAAGTAAGAGGTTTAAGCATGGGAGAAAAAGCTGAATTGAGTCCTTGACATAGAAAAAATTTATTATGAGTATGCACAGCCTCCTCCTTCTGCATTTATAGGAATGATGCTTTGTCTGTTGACTGGGCTTCTAGTATTACTTTGATCAGGGTAAAGGAGAGAAAGATCTACAGGGAGGTAGGTTTCCAGATAGGGTGGAGAGGTGGGCTTCCTGAGGCACTGGAAAGTGGAAGACAGAAATATTATTTAGAGATACTTGAACGCTGCCTCTGCTTTTCTAAAGGGTCTGCCATGGGCCCTGAGCAGGGTTACTTTTGAAAGCTCTCTAGGTGAGTCTAATATATACAGTCATGGTTAAGAGCAACTGTATTAAGTGACCTACCATAGACCGAGTACATTGGGAACTTATGGCAAGTCTCTTTTTCACTTCCTCACATTCTGGTGATTTCTTCCCACCTGCAATGCTGCATCAGGTTAGCTGGGTTGTATATTTAAAACGGAAAGTTCAATGTTTCAAGAGAAAACATAGATTCAGGAAGGCAGTTAGAAAGGCAGAAAGGAGAAAACAATACTAGAGATTGGAGATAGTCTTTCAGGCAGCTGTTGGGATATAGAAGAAATTGGGAGGGGTGGAGGAGGAAACATGAGATTTTTCTGTGGGTTGTGAATGGGAATTTTTCTGAGAGATTCTGGAGGGGATCTGAATTGTCTTTCAAATTGTCCAGGTTATGGGAGTGGAGCCAGTATTGTGCCAGCCGAGCTGTAAGGTAGTGGGAGGGCATATTCATTTCAGCTGTATCCTTCCTTTCTGTCTTGTGCTCTCCTTCCTCCAGTTATGGAGAACCCATTTCATGCCAGGAGCATCATTATTATCCTTAGGTCCTTGACAGCCTGGTCAGGAGGAGATAGGAGGTTTGTTTCAAGTTCCACGAAGAGCAGAATAGAAACAAATGGGGGCAGCCATTAAGACATGGTGAGGAAGAGGGTTAGGAAAGCAAAAAGGTGGTTTTTGAGTCAGTTTCTGAGCTCACCCAGAAAATGACAAGCAAGAGCTTGTTAGATGAAAAAA
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Task1_train_10546
This variant lies on Chromosome 6 and affects the gene EYS (eyes shut homolog). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Retinal dystrophy
ATGTTTGGTTTTTTGTCCTTGCCATAGTTTGCTGAGAAGGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCAACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTGTTCCATGGTTTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAATATACGTGTTCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATACTTTGGGTATTACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCACCACACTGTCTTCCTCAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAATTCTCCACATCCTCTCCAGTACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCCGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTGTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTTCTTGTAAATTTGAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTACATCCCATTGGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTCTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTTGCCCCTGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGATTTGTCAAATATCAGATAGTTGTAGATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTGTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGGATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAGGATTGACTTGACAATGTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTGACTTTATGGGGATGGCAGAAAGTGGCCATACTGTCCAAGGGATAATCTGTTAAGGTACTAAAGACATTACACCTCCAATATGAGGAATTGTTAAAATGATTGTGCATTTATTTCAAAAGAGAAAACAATTGTCAAATTTTGAATACTGCTGGTAATACACCTTAGTGATGTTCATTCACAGAAGAAAGAAGCCCATACATTCTGCTTATAGAGACCTTTATGAGCAAATTGCATAATAATGCAGAGAACTCTGGATGTAAAGACATTTCCTTAAGCAAATACTGTTAATACTACTTAAAAAAAAACCAGCTTATATCAAGATAATAGATGTTACTAAAAGAGTGGTAGGAATTTACTTGATTGTCAAATGAACCCCAGCTTTGGAATGCCTTTTCCCAAGTTATCAAGTATTGAATGTAATTCATATTTAGTGATTTATATCATAAAAGTATGCTCTGAAACATTTGCAGCATTTGTTTTACTGCTATAGCCATATGCTGTCAAATTCATATGCTTGCTAAATTCTGTCTTGTCAGCTCAGATCCTGTTTGTAAGTCACGTTCCATTGAATGACTCATAAAGAAACTTCTAGAGAAACTACAAAGAACTAAAATTTCTCTTTGGTAATGCTTCATGCACTGGTCTGGAAAAATTCTCTCACAATATTTAAATGAATAAATCATTGATTCAATAGATCAACGTTTGAGAAAGAAACATGACATACAAGAAGTCAAACATTTAATACTCACTGTAAAGAATAGTTCCATTTAAACTGTTTGTTTTTATAGTCAAGTAGATGGTAACAGTTCTGTTATGTTCCTTCTCCAGGACAAACTTCAAAAAGGGCAGTTCTAAATAGGAATTCCCATTGAAAGATGGAAAGAATAAACCTGCATCTAAAAAAGAAAATGGTATTAATATGTTCTGATAGCATTATATTGCTACTCAAGTAGATAAAAACTTAGCATTTATAGTTAGCATTCATTTGAAAAGGTAACACTAGTATTTAAAATGTTAGGTCCAATTTTAAGAACTTTAGATATAAAGTGTAATAAATTTATATTTATTGCCTCAAATAATTCACTACCAGTACAGAGGAAAAGACTGAATAAGAGTTATAATTTGATGTTTATGGATGGGTTTTAAGACATAACAAACACTCTAAAATTGTCTGAAAAAAATTTGTGTACTTGCATTGTGAAATCAGTGTTTCACCAGATTCTTTTGCGATATTTTGTGATGTGAAGGTTGTATTGTTTGTTAATTTTTAATTTTTGTGTTTACATTGTAGGTATATATATTTATGGGTTTCATGAGATATTTTGATACAGGAATACAATGTATCATAATCACATCAGGGTCAATGGAGTATCCATCACCTTAAGCATTTATCCTTTGGGTTACAAACATCAAGATATACACTTAAAATTGATAAATTTTATTTGATGTAATTATATGTCAATAAAGTGAAAAAAATTCTGTGACACACAAAGGTTAGAGAACTGTCACACAGAGGAATTTTATTAATGTTCATTAATATTTAGTGCTTTTCAATAATACTTAGTTATTTTATAAGTAGTATTACTATAATATGCAAGGTTATTAGTTTTAGACTTATAGAATTATTTGTATTTTAAATAATCTCACAAAATCTTGGTGCACATAAAATTTAAAACATTTCATTGTTATAGATCTATATTCATATCTATTAAAATATAATTGGTACATAGAACAAGTGTAACACATGGTATGTTGAAAATGCAACTTCTTTAACATTTGGTAATAAAAAAAAGAAAATGCAACTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGTGTCTCATTTTATCAGCACAACTGAAGTGCAATGGAGCAATCTCGGCTCACTTCAGCCTCAAACTCTCAGGCTCAGGTCATCCATCTGCCTCAGCCTCTGAAGTAATTGGGACTACAGGTGTGTGCCAACACGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGATTGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGATGTGAGCCACCATGCCCAGCCAACTTTCTTTTTTGTCTTTCTCACAATGGGGGGAATTTTCTCTGCCACTGGACGGAAATTTAGTATTTCCGATTATTTTTACCATCTCTCTAAGTCATACAGTGAGTGAGAAACTAATATCCAGTCTAAGAAATTTAGTAACAGTTAAATCTTCCATCAGAGATATGATTTCTCCTATCCTCCTTCACCAGCCTATCTCTGTAGGGTGGCCTGACACCTGCTGTCTTCCTTGAGGGGCAGAAGTAACCTGGTTTCTGTTCTTCTTTTTATCACCTCTCCTAAGGTTAGCTGCTGTTTCTGACCCTTCCAGCTTTGAATGGGGAGAAAGTAAGGTGGGGTGGAAAGGAAAGACTACACAGTAAAGAAGAGCTGTTAGAAATGGCAATTGTACTGTTGTAACCAGGCATCTTGCTCTTTAGGAAGGGAACATGTTTAAAACTGGTTGTTTCTTTCATGGTAGGGATGCCAGATAAAATACAGGATGCTCAGTTAAATTCAAATTTCAGATAAATAACAAATAAGTTTTTTGTTGTTATTTGTTTGTTTTTTGAGACAGTCTTGCTTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGCTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGTCATGTGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGT
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Task1_train_10547
This gene mutation involves EYS (eyes shut homolog) on Chromosome 6. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Retinitis pigmentosa 25
ATGTTTGGTTTTTTGTCCTTGCCATAGTTTGCTGAGAAGGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCAACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTGTTCCATGGTTTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAATATACGTGTTCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATACTTTGGGTATTACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCACCACACTGTCTTCCTCAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAATTCTCCACATCCTCTCCAGTACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCCGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTGTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTTCTTGTAAATTTGAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTACATCCCATTGGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTCTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTTGCCCCTGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGATTTGTCAAATATCAGATAGTTGTAGATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTGTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGGATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAGGATTGACTTGACAATGTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTGACTTTATGGGGATGGCAGAAAGTGGCCATACTGTCCAAGGGATAATCTGTTAAGGTACTAAAGACATTACACCTCCAATATGAGGAATTGTTAAAATGATTGTGCATTTATTTCAAAAGAGAAAACAATTGTCAAATTTTGAATACTGCTGGTAATACACCTTAGTGATGTTCATTCACAGAAGAAAGAAGCCCATACATTCTGCTTATAGAGACCTTTATGAGCAAATTGCATAATAATGCAGAGAACTCTGGATGTAAAGACATTTCCTTAAGCAAATACTGTTAATACTACTTAAAAAAAAACCAGCTTATATCAAGATAATAGATGTTACTAAAAGAGTGGTAGGAATTTACTTGATTGTCAAATGAACCCCAGCTTTGGAATGCCTTTTCCCAAGTTATCAAGTATTGAATGTAATTCATATTTAGTGATTTATATCATAAAAGTATGCTCTGAAACATTTGCAGCATTTGTTTTACTGCTATAGCCATATGCTGTCAAATTCATATGCTTGCTAAATTCTGTCTTGTCAGCTCAGATCCTGTTTGTAAGTCACGTTCCATTGAATGACTCATAAAGAAACTTCTAGAGAAACTACAAAGAACTAAAATTTCTCTTTGGTAATGCTTCATGCACTGGTCTGGAAAAATTCTCTCACAATATTTAAATGAATAAATCATTGATTCAATAGATCAACGTTTGAGAAAGAAACATGACATACAAGAAGTCAAACATTTAATACTCACTGTAAAGAATAGTTCCATTTAAACTGTTTGTTTTTATAGTCAAGTAGATGGTAACAGTTCTGTTATGTTCCTTCTCCAGGACAAACTTCAAAAAGGGCAGTTCTAAATAGGAATTCCCATTGAAAGATGGAAAGAATAAACCTGCATCTAAAAAAGAAAATGGTATTAATATGTTCTGATAGCATTATATTGCTACTCAAGTAGATAAAAACTTAGCATTTATAGTTAGCATTCATTTGAAAAGGTAACACTAGTATTTAAAATGTTAGGTCCAATTTTAAGAACTTTAGATATAAAGTGTAATAAATTTATATTTATTGCCTCAAATAATTCACTACCAGTACAGAGGAAAAGACTGAATAAGAGTTATAATTTGATGTTTATGGATGGGTTTTAAGACATAACAAACACTCTAAAATTGTCTGAAAAAAATTTGTGTACTTGCATTGTGAAATCAGTGTTTCACCAGATTCTTTTGCGATATTTTGTGATGTGAAGGTTGTATTGTTTGTTAATTTTTAATTTTTGTGTTTACATTGTAGGTATATATATTTATGGGTTTCATGAGATATTTTGATACAGGAATACAATGTATCATAATCACATCAGGGTCAATGGAGTATCCATCACCTTAAGCATTTATCCTTTGGGTTACAAACATCAAGATATACACTTAAAATTGATAAATTTTATTTGATGTAATTATATGTCAATAAAGTGAAAAAAATTCTGTGACACACAAAGGTTAGAGAACTGTCACACAGAGGAATTTTATTAATGTTCATTAATATTTAGTGCTTTTCAATAATACTTAGTTATTTTATAAGTAGTATTACTATAATATGCAAGGTTATTAGTTTTAGACTTATAGAATTATTTGTATTTTAAATAATCTCACAAAATCTTGGTGCACATAAAATTTAAAACATTTCATTGTTATAGATCTATATTCATATCTATTAAAATATAATTGGTACATAGAACAAGTGTAACACATGGTATGTTGAAAATGCAACTTCTTTAACATTTGGTAATAAAAAAAAGAAAATGCAACTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGTGTCTCATTTTATCAGCACAACTGAAGTGCAATGGAGCAATCTCGGCTCACTTCAGCCTCAAACTCTCAGGCTCAGGTCATCCATCTGCCTCAGCCTCTGAAGTAATTGGGACTACAGGTGTGTGCCAACACGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGATTGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGATGTGAGCCACCATGCCCAGCCAACTTTCTTTTTTGTCTTTCTCACAATGGGGGGAATTTTCTCTGCCACTGGACGGAAATTTAGTATTTCCGATTATTTTTACCATCTCTCTAAGTCATACAGTGAGTGAGAAACTAATATCCAGTCTAAGAAATTTAGTAACAGTTAAATCTTCCATCAGAGATATGATTTCTCCTATCCTCCTTCACCAGCCTATCTCTGTAGGGTGGCCTGACACCTGCTGTCTTCCTTGAGGGGCAGAAGTAACCTGGTTTCTGTTCTTCTTTTTATCACCTCTCCTAAGGTTAGCTGCTGTTTCTGACCCTTCCAGCTTTGAATGGGGAGAAAGTAAGGTGGGGTGGAAAGGAAAGACTACACAGTAAAGAAGAGCTGTTAGAAATGGCAATTGTACTGTTGTAACCAGGCATCTTGCTCTTTAGGAAGGGAACATGTTTAAAACTGGTTGTTTCTTTCATGGTAGGGATGCCAGATAAAATACAGGATGCTCAGTTAAATTCAAATTTCAGATAAATAACAAATAAGTTTTTTGTTGTTATTTGTTTGTTTTTTGAGACAGTCTTGCTTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGCTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGTCATGTGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGT
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Task1_train_10548
Consider this mutation in EYS (eyes shut homolog) on Chromosome 6. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Retinal dystrophy
GGTTTTTTGTCCTTGCCATAGTTTGCTGAGAAGGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCAACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTGTTCCATGGTTTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAATATACGTGTTCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATACTTTGGGTATTACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCACCACACTGTCTTCCTCAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAATTCTCCACATCCTCTCCAGTACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCCGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTGTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTTCTTGTAAATTTGAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTACATCCCATTGGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTCTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTTGCCCCTGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGATTTGTCAAATATCAGATAGTTGTAGATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTGTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGGATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAGGATTGACTTGACAATGTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTGACTTTATGGGGATGGCAGAAAGTGGCCATACTGTCCAAGGGATAATCTGTTAAGGTACTAAAGACATTACACCTCCAATATGAGGAATTGTTAAAATGATTGTGCATTTATTTCAAAAGAGAAAACAATTGTCAAATTTTGAATACTGCTGGTAATACACCTTAGTGATGTTCATTCACAGAAGAAAGAAGCCCATACATTCTGCTTATAGAGACCTTTATGAGCAAATTGCATAATAATGCAGAGAACTCTGGATGTAAAGACATTTCCTTAAGCAAATACTGTTAATACTACTTAAAAAAAAACCAGCTTATATCAAGATAATAGATGTTACTAAAAGAGTGGTAGGAATTTACTTGATTGTCAAATGAACCCCAGCTTTGGAATGCCTTTTCCCAAGTTATCAAGTATTGAATGTAATTCATATTTAGTGATTTATATCATAAAAGTATGCTCTGAAACATTTGCAGCATTTGTTTTACTGCTATAGCCATATGCTGTCAAATTCATATGCTTGCTAAATTCTGTCTTGTCAGCTCAGATCCTGTTTGTAAGTCACGTTCCATTGAATGACTCATAAAGAAACTTCTAGAGAAACTACAAAGAACTAAAATTTCTCTTTGGTAATGCTTCATGCACTGGTCTGGAAAAATTCTCTCACAATATTTAAATGAATAAATCATTGATTCAATAGATCAACGTTTGAGAAAGAAACATGACATACAAGAAGTCAAACATTTAATACTCACTGTAAAGAATAGTTCCATTTAAACTGTTTGTTTTTATAGTCAAGTAGATGGTAACAGTTCTGTTATGTTCCTTCTCCAGGACAAACTTCAAAAAGGGCAGTTCTAAATAGGAATTCCCATTGAAAGATGGAAAGAATAAACCTGCATCTAAAAAAGAAAATGGTATTAATATGTTCTGATAGCATTATATTGCTACTCAAGTAGATAAAAACTTAGCATTTATAGTTAGCATTCATTTGAAAAGGTAACACTAGTATTTAAAATGTTAGGTCCAATTTTAAGAACTTTAGATATAAAGTGTAATAAATTTATATTTATTGCCTCAAATAATTCACTACCAGTACAGAGGAAAAGACTGAATAAGAGTTATAATTTGATGTTTATGGATGGGTTTTAAGACATAACAAACACTCTAAAATTGTCTGAAAAAAATTTGTGTACTTGCATTGTGAAATCAGTGTTTCACCAGATTCTTTTGCGATATTTTGTGATGTGAAGGTTGTATTGTTTGTTAATTTTTAATTTTTGTGTTTACATTGTAGGTATATATATTTATGGGTTTCATGAGATATTTTGATACAGGAATACAATGTATCATAATCACATCAGGGTCAATGGAGTATCCATCACCTTAAGCATTTATCCTTTGGGTTACAAACATCAAGATATACACTTAAAATTGATAAATTTTATTTGATGTAATTATATGTCAATAAAGTGAAAAAAATTCTGTGACACACAAAGGTTAGAGAACTGTCACACAGAGGAATTTTATTAATGTTCATTAATATTTAGTGCTTTTCAATAATACTTAGTTATTTTATAAGTAGTATTACTATAATATGCAAGGTTATTAGTTTTAGACTTATAGAATTATTTGTATTTTAAATAATCTCACAAAATCTTGGTGCACATAAAATTTAAAACATTTCATTGTTATAGATCTATATTCATATCTATTAAAATATAATTGGTACATAGAACAAGTGTAACACATGGTATGTTGAAAATGCAACTTCTTTAACATTTGGTAATAAAAAAAAGAAAATGCAACTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGTGTCTCATTTTATCAGCACAACTGAAGTGCAATGGAGCAATCTCGGCTCACTTCAGCCTCAAACTCTCAGGCTCAGGTCATCCATCTGCCTCAGCCTCTGAAGTAATTGGGACTACAGGTGTGTGCCAACACGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGATTGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGATGTGAGCCACCATGCCCAGCCAACTTTCTTTTTTGTCTTTCTCACAATGGGGGGAATTTTCTCTGCCACTGGACGGAAATTTAGTATTTCCGATTATTTTTACCATCTCTCTAAGTCATACAGTGAGTGAGAAACTAATATCCAGTCTAAGAAATTTAGTAACAGTTAAATCTTCCATCAGAGATATGATTTCTCCTATCCTCCTTCACCAGCCTATCTCTGTAGGGTGGCCTGACACCTGCTGTCTTCCTTGAGGGGCAGAAGTAACCTGGTTTCTGTTCTTCTTTTTATCACCTCTCCTAAGGTTAGCTGCTGTTTCTGACCCTTCCAGCTTTGAATGGGGAGAAAGTAAGGTGGGGTGGAAAGGAAAGACTACACAGTAAAGAAGAGCTGTTAGAAATGGCAATTGTACTGTTGTAACCAGGCATCTTGCTCTTTAGGAAGGGAACATGTTTAAAACTGGTTGTTTCTTTCATGGTAGGGATGCCAGATAAAATACAGGATGCTCAGTTAAATTCAAATTTCAGATAAATAACAAATAAGTTTTTTGTTGTTATTTGTTTGTTTTTTGAGACAGTCTTGCTTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGCTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGTCATGTGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTT
GGTTTTTTGTCCTTGCCATAGTTTGCTGAGAAGGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCAACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTGTTCCATGGTTTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAATATACGTGTTCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATACTTTGGGTATTACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCACCACACTGTCTTCCTCAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAATTCTCCACATCCTCTCCAGTACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCCGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTGTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTTCTTGTAAATTTGAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTACATCCCATTGGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTCTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTTGCCCCTGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGATTTGTCAAATATCAGATAGTTGTAGATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTGTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGGATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAGGATTGACTTGACAATGTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTGACTTTATGGGGATGGCAGAAAGTGGCCATACTGTCCAAGGGATAATCTGTTAAGGTACTAAAGACATTACACCTCCAATATGAGGAATTGTTAAAATGATTGTGCATTTATTTCAAAAGAGAAAACAATTGTCAAATTTTGAATACTGCTGGTAATACACCTTAGTGATGTTCATTCACAGAAGAAAGAAGCCCATACATTCTGCTTATAGAGACCTTTATGAGCAAATTGCATAATAATGCAGAGAACTCTGGATGTAAAGACATTTCCTTAAGCAAATACTGTTAATACTACTTAAAAAAAAACCAGCTTATATCAAGATAATAGATGTTACTAAAAGAGTGGTAGGAATTTACTTGATTGTCAAATGAACCCCAGCTTTGGAATGCCTTTTCCCAAGTTATCAAGTATTGAATGTAATTCATATTTAGTGATTTATATCATAAAAGTATGCTCTGAAACATTTGCAGCATTTGTTTTACTGCTATAGCCATATGCTGTCAAATTCATATGCTTGCTAAATTCTGTCTTGTCAGCTCAGATCCTGTTTGTAAGTCACGTTCCATTGAATGACTCATAAAGAAACTTCTAGAGAAACTACAAAGAACTAAAATTTCTCTTTGGTAATGCTTCATGCACTGGTCTGGAAAAATTCTCTCACAATATTTAAATGAATAAATCATTGATTCAATAGATCAACGTTTGAGAAAGAAACATGACATACAAGAAGTCAAACATTTAATACTCACTGTAAAGAATAGTTTCATTTAAACTGTTTGTTTTTATAGTCAAGTAGATGGTAACAGTTCTGTTATGTTCCTTCTCCAGGACAAACTTCAAAAAGGGCAGTTCTAAATAGGAATTCCCATTGAAAGATGGAAAGAATAAACCTGCATCTAAAAAAGAAAATGGTATTAATATGTTCTGATAGCATTATATTGCTACTCAAGTAGATAAAAACTTAGCATTTATAGTTAGCATTCATTTGAAAAGGTAACACTAGTATTTAAAATGTTAGGTCCAATTTTAAGAACTTTAGATATAAAGTGTAATAAATTTATATTTATTGCCTCAAATAATTCACTACCAGTACAGAGGAAAAGACTGAATAAGAGTTATAATTTGATGTTTATGGATGGGTTTTAAGACATAACAAACACTCTAAAATTGTCTGAAAAAAATTTGTGTACTTGCATTGTGAAATCAGTGTTTCACCAGATTCTTTTGCGATATTTTGTGATGTGAAGGTTGTATTGTTTGTTAATTTTTAATTTTTGTGTTTACATTGTAGGTATATATATTTATGGGTTTCATGAGATATTTTGATACAGGAATACAATGTATCATAATCACATCAGGGTCAATGGAGTATCCATCACCTTAAGCATTTATCCTTTGGGTTACAAACATCAAGATATACACTTAAAATTGATAAATTTTATTTGATGTAATTATATGTCAATAAAGTGAAAAAAATTCTGTGACACACAAAGGTTAGAGAACTGTCACACAGAGGAATTTTATTAATGTTCATTAATATTTAGTGCTTTTCAATAATACTTAGTTATTTTATAAGTAGTATTACTATAATATGCAAGGTTATTAGTTTTAGACTTATAGAATTATTTGTATTTTAAATAATCTCACAAAATCTTGGTGCACATAAAATTTAAAACATTTCATTGTTATAGATCTATATTCATATCTATTAAAATATAATTGGTACATAGAACAAGTGTAACACATGGTATGTTGAAAATGCAACTTCTTTAACATTTGGTAATAAAAAAAAGAAAATGCAACTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGTGTCTCATTTTATCAGCACAACTGAAGTGCAATGGAGCAATCTCGGCTCACTTCAGCCTCAAACTCTCAGGCTCAGGTCATCCATCTGCCTCAGCCTCTGAAGTAATTGGGACTACAGGTGTGTGCCAACACGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGATTGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGATGTGAGCCACCATGCCCAGCCAACTTTCTTTTTTGTCTTTCTCACAATGGGGGGAATTTTCTCTGCCACTGGACGGAAATTTAGTATTTCCGATTATTTTTACCATCTCTCTAAGTCATACAGTGAGTGAGAAACTAATATCCAGTCTAAGAAATTTAGTAACAGTTAAATCTTCCATCAGAGATATGATTTCTCCTATCCTCCTTCACCAGCCTATCTCTGTAGGGTGGCCTGACACCTGCTGTCTTCCTTGAGGGGCAGAAGTAACCTGGTTTCTGTTCTTCTTTTTATCACCTCTCCTAAGGTTAGCTGCTGTTTCTGACCCTTCCAGCTTTGAATGGGGAGAAAGTAAGGTGGGGTGGAAAGGAAAGACTACACAGTAAAGAAGAGCTGTTAGAAATGGCAATTGTACTGTTGTAACCAGGCATCTTGCTCTTTAGGAAGGGAACATGTTTAAAACTGGTTGTTTCTTTCATGGTAGGGATGCCAGATAAAATACAGGATGCTCAGTTAAATTCAAATTTCAGATAAATAACAAATAAGTTTTTTGTTGTTATTTGTTTGTTTTTTGAGACAGTCTTGCTTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGCTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGTCATGTGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTT
Task1_train_10549
The variant affects gene EYS (eyes shut homolog), which is on Chromosome 6. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Retinitis pigmentosa 25
GGTTTTTTGTCCTTGCCATAGTTTGCTGAGAAGGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCAACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTGTTCCATGGTTTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAATATACGTGTTCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATACTTTGGGTATTACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCACCACACTGTCTTCCTCAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAATTCTCCACATCCTCTCCAGTACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCCGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTGTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTTCTTGTAAATTTGAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTACATCCCATTGGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTCTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTTGCCCCTGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGATTTGTCAAATATCAGATAGTTGTAGATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTGTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGGATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAGGATTGACTTGACAATGTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTGACTTTATGGGGATGGCAGAAAGTGGCCATACTGTCCAAGGGATAATCTGTTAAGGTACTAAAGACATTACACCTCCAATATGAGGAATTGTTAAAATGATTGTGCATTTATTTCAAAAGAGAAAACAATTGTCAAATTTTGAATACTGCTGGTAATACACCTTAGTGATGTTCATTCACAGAAGAAAGAAGCCCATACATTCTGCTTATAGAGACCTTTATGAGCAAATTGCATAATAATGCAGAGAACTCTGGATGTAAAGACATTTCCTTAAGCAAATACTGTTAATACTACTTAAAAAAAAACCAGCTTATATCAAGATAATAGATGTTACTAAAAGAGTGGTAGGAATTTACTTGATTGTCAAATGAACCCCAGCTTTGGAATGCCTTTTCCCAAGTTATCAAGTATTGAATGTAATTCATATTTAGTGATTTATATCATAAAAGTATGCTCTGAAACATTTGCAGCATTTGTTTTACTGCTATAGCCATATGCTGTCAAATTCATATGCTTGCTAAATTCTGTCTTGTCAGCTCAGATCCTGTTTGTAAGTCACGTTCCATTGAATGACTCATAAAGAAACTTCTAGAGAAACTACAAAGAACTAAAATTTCTCTTTGGTAATGCTTCATGCACTGGTCTGGAAAAATTCTCTCACAATATTTAAATGAATAAATCATTGATTCAATAGATCAACGTTTGAGAAAGAAACATGACATACAAGAAGTCAAACATTTAATACTCACTGTAAAGAATAGTTCCATTTAAACTGTTTGTTTTTATAGTCAAGTAGATGGTAACAGTTCTGTTATGTTCCTTCTCCAGGACAAACTTCAAAAAGGGCAGTTCTAAATAGGAATTCCCATTGAAAGATGGAAAGAATAAACCTGCATCTAAAAAAGAAAATGGTATTAATATGTTCTGATAGCATTATATTGCTACTCAAGTAGATAAAAACTTAGCATTTATAGTTAGCATTCATTTGAAAAGGTAACACTAGTATTTAAAATGTTAGGTCCAATTTTAAGAACTTTAGATATAAAGTGTAATAAATTTATATTTATTGCCTCAAATAATTCACTACCAGTACAGAGGAAAAGACTGAATAAGAGTTATAATTTGATGTTTATGGATGGGTTTTAAGACATAACAAACACTCTAAAATTGTCTGAAAAAAATTTGTGTACTTGCATTGTGAAATCAGTGTTTCACCAGATTCTTTTGCGATATTTTGTGATGTGAAGGTTGTATTGTTTGTTAATTTTTAATTTTTGTGTTTACATTGTAGGTATATATATTTATGGGTTTCATGAGATATTTTGATACAGGAATACAATGTATCATAATCACATCAGGGTCAATGGAGTATCCATCACCTTAAGCATTTATCCTTTGGGTTACAAACATCAAGATATACACTTAAAATTGATAAATTTTATTTGATGTAATTATATGTCAATAAAGTGAAAAAAATTCTGTGACACACAAAGGTTAGAGAACTGTCACACAGAGGAATTTTATTAATGTTCATTAATATTTAGTGCTTTTCAATAATACTTAGTTATTTTATAAGTAGTATTACTATAATATGCAAGGTTATTAGTTTTAGACTTATAGAATTATTTGTATTTTAAATAATCTCACAAAATCTTGGTGCACATAAAATTTAAAACATTTCATTGTTATAGATCTATATTCATATCTATTAAAATATAATTGGTACATAGAACAAGTGTAACACATGGTATGTTGAAAATGCAACTTCTTTAACATTTGGTAATAAAAAAAAGAAAATGCAACTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGTGTCTCATTTTATCAGCACAACTGAAGTGCAATGGAGCAATCTCGGCTCACTTCAGCCTCAAACTCTCAGGCTCAGGTCATCCATCTGCCTCAGCCTCTGAAGTAATTGGGACTACAGGTGTGTGCCAACACGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGATTGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGATGTGAGCCACCATGCCCAGCCAACTTTCTTTTTTGTCTTTCTCACAATGGGGGGAATTTTCTCTGCCACTGGACGGAAATTTAGTATTTCCGATTATTTTTACCATCTCTCTAAGTCATACAGTGAGTGAGAAACTAATATCCAGTCTAAGAAATTTAGTAACAGTTAAATCTTCCATCAGAGATATGATTTCTCCTATCCTCCTTCACCAGCCTATCTCTGTAGGGTGGCCTGACACCTGCTGTCTTCCTTGAGGGGCAGAAGTAACCTGGTTTCTGTTCTTCTTTTTATCACCTCTCCTAAGGTTAGCTGCTGTTTCTGACCCTTCCAGCTTTGAATGGGGAGAAAGTAAGGTGGGGTGGAAAGGAAAGACTACACAGTAAAGAAGAGCTGTTAGAAATGGCAATTGTACTGTTGTAACCAGGCATCTTGCTCTTTAGGAAGGGAACATGTTTAAAACTGGTTGTTTCTTTCATGGTAGGGATGCCAGATAAAATACAGGATGCTCAGTTAAATTCAAATTTCAGATAAATAACAAATAAGTTTTTTGTTGTTATTTGTTTGTTTTTTGAGACAGTCTTGCTTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGCTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGTCATGTGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTT
GGTTTTTTGTCCTTGCCATAGTTTGCTGAGAAGGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCAACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTGTTCCATGGTTTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAATATACGTGTTCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATACTTTGGGTATTACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCACCACACTGTCTTCCTCAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAATTCTCCACATCCTCTCCAGTACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCCGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTGTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTTCTTGTAAATTTGAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTACATCCCATTGGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTCTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTTGCCCCTGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGATTTGTCAAATATCAGATAGTTGTAGATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTGTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGGATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAGGATTGACTTGACAATGTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTGACTTTATGGGGATGGCAGAAAGTGGCCATACTGTCCAAGGGATAATCTGTTAAGGTACTAAAGACATTACACCTCCAATATGAGGAATTGTTAAAATGATTGTGCATTTATTTCAAAAGAGAAAACAATTGTCAAATTTTGAATACTGCTGGTAATACACCTTAGTGATGTTCATTCACAGAAGAAAGAAGCCCATACATTCTGCTTATAGAGACCTTTATGAGCAAATTGCATAATAATGCAGAGAACTCTGGATGTAAAGACATTTCCTTAAGCAAATACTGTTAATACTACTTAAAAAAAAACCAGCTTATATCAAGATAATAGATGTTACTAAAAGAGTGGTAGGAATTTACTTGATTGTCAAATGAACCCCAGCTTTGGAATGCCTTTTCCCAAGTTATCAAGTATTGAATGTAATTCATATTTAGTGATTTATATCATAAAAGTATGCTCTGAAACATTTGCAGCATTTGTTTTACTGCTATAGCCATATGCTGTCAAATTCATATGCTTGCTAAATTCTGTCTTGTCAGCTCAGATCCTGTTTGTAAGTCACGTTCCATTGAATGACTCATAAAGAAACTTCTAGAGAAACTACAAAGAACTAAAATTTCTCTTTGGTAATGCTTCATGCACTGGTCTGGAAAAATTCTCTCACAATATTTAAATGAATAAATCATTGATTCAATAGATCAACGTTTGAGAAAGAAACATGACATACAAGAAGTCAAACATTTAATACTCACTGTAAAGAATAGTTTCATTTAAACTGTTTGTTTTTATAGTCAAGTAGATGGTAACAGTTCTGTTATGTTCCTTCTCCAGGACAAACTTCAAAAAGGGCAGTTCTAAATAGGAATTCCCATTGAAAGATGGAAAGAATAAACCTGCATCTAAAAAAGAAAATGGTATTAATATGTTCTGATAGCATTATATTGCTACTCAAGTAGATAAAAACTTAGCATTTATAGTTAGCATTCATTTGAAAAGGTAACACTAGTATTTAAAATGTTAGGTCCAATTTTAAGAACTTTAGATATAAAGTGTAATAAATTTATATTTATTGCCTCAAATAATTCACTACCAGTACAGAGGAAAAGACTGAATAAGAGTTATAATTTGATGTTTATGGATGGGTTTTAAGACATAACAAACACTCTAAAATTGTCTGAAAAAAATTTGTGTACTTGCATTGTGAAATCAGTGTTTCACCAGATTCTTTTGCGATATTTTGTGATGTGAAGGTTGTATTGTTTGTTAATTTTTAATTTTTGTGTTTACATTGTAGGTATATATATTTATGGGTTTCATGAGATATTTTGATACAGGAATACAATGTATCATAATCACATCAGGGTCAATGGAGTATCCATCACCTTAAGCATTTATCCTTTGGGTTACAAACATCAAGATATACACTTAAAATTGATAAATTTTATTTGATGTAATTATATGTCAATAAAGTGAAAAAAATTCTGTGACACACAAAGGTTAGAGAACTGTCACACAGAGGAATTTTATTAATGTTCATTAATATTTAGTGCTTTTCAATAATACTTAGTTATTTTATAAGTAGTATTACTATAATATGCAAGGTTATTAGTTTTAGACTTATAGAATTATTTGTATTTTAAATAATCTCACAAAATCTTGGTGCACATAAAATTTAAAACATTTCATTGTTATAGATCTATATTCATATCTATTAAAATATAATTGGTACATAGAACAAGTGTAACACATGGTATGTTGAAAATGCAACTTCTTTAACATTTGGTAATAAAAAAAAGAAAATGCAACTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGTGTCTCATTTTATCAGCACAACTGAAGTGCAATGGAGCAATCTCGGCTCACTTCAGCCTCAAACTCTCAGGCTCAGGTCATCCATCTGCCTCAGCCTCTGAAGTAATTGGGACTACAGGTGTGTGCCAACACGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGATTGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGATGTGAGCCACCATGCCCAGCCAACTTTCTTTTTTGTCTTTCTCACAATGGGGGGAATTTTCTCTGCCACTGGACGGAAATTTAGTATTTCCGATTATTTTTACCATCTCTCTAAGTCATACAGTGAGTGAGAAACTAATATCCAGTCTAAGAAATTTAGTAACAGTTAAATCTTCCATCAGAGATATGATTTCTCCTATCCTCCTTCACCAGCCTATCTCTGTAGGGTGGCCTGACACCTGCTGTCTTCCTTGAGGGGCAGAAGTAACCTGGTTTCTGTTCTTCTTTTTATCACCTCTCCTAAGGTTAGCTGCTGTTTCTGACCCTTCCAGCTTTGAATGGGGAGAAAGTAAGGTGGGGTGGAAAGGAAAGACTACACAGTAAAGAAGAGCTGTTAGAAATGGCAATTGTACTGTTGTAACCAGGCATCTTGCTCTTTAGGAAGGGAACATGTTTAAAACTGGTTGTTTCTTTCATGGTAGGGATGCCAGATAAAATACAGGATGCTCAGTTAAATTCAAATTTCAGATAAATAACAAATAAGTTTTTTGTTGTTATTTGTTTGTTTTTTGAGACAGTCTTGCTTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGCTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGTCATGTGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTT
Task1_train_10550
A variant affecting Chromosome 6, within the gene EYS (eyes shut homolog), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_10551
The variant affects gene KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5), which is on Chromosome 6. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Intellectual disability, autosomal dominant 46
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Task1_train_10552
This alteration in KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5) on Chromosome 6 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_10553
Here is a variant affecting KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5) on Chromosome 6. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Intellectual disability, autosomal dominant 46
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Task1_train_10554
This gene mutation involves KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5) on Chromosome 6. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Intellectual disability, autosomal dominant 46
CAGGATGAGTTCGTGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTATCGCAAGGACAGAAAATCAAACACCACATGTTCTCATTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGAACACTTGGACACAGGATGGGGAACATCACATACTGGGGCCTGTCATGGGGGGGGGGGAGAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATATAACAAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAATTAAAAAAAATTAACAGTTAAACTCACAAAGATAGAGAGTAGAATGATGGGTACCAGAGTATGAGAAGGGTAGTGGAGAGAGTGAGCAGAGAGGGAAGCGGAGATGGTTAATGGACACCAAAAAAAAACCAGAAAGAGTGAATAACGTCTAGTATTTGAAAGTACAAAAGTGTGACTATAGTCAGTAATAATTTAATTGTACATTTTAAAATAATTAAGAGTATAATTGGATTATTTGTAACACAAAGGATAAATGCTTGAGGTGATGGATACCCCTTTTACCCTGATATCATCATTACATATCGCATGCCAGTATCAAAATATCCCACATAACTCATAAATATATATACCTACTGTGTACCCACAAAAATTAAAAATTATTAATAAATTATTAGTTTGATTTAAAAAAAACAAGGATGCTCACTTTTGCCACTTCTATTCAATATAGTAGTGGAAGTCCATGCCAGAGCAGTTAGACAAGAGAAAGAAATAAAAGGCATCCAAATAAGAAAGGAAGAAAGGAAATTTTTGCTGTTTGCTGACAACATAATCTTATATATAGAAAACCCTAAAGATTCCAGAAAAAAACTGCTAGAACTAATAAATTCAGTACAGTTACAGGAGACACAATCAACACCACAAAAATCACTAGCATTTCTATACATTAACAACAAACTTTCCAAAAAAGAAATCAAGAGAGCAATCCCATTTACAGTAGCTACAAAAATTAAAATACTTAGGAATAAATTTAACCAAGGAGCTGAAAGACCTGTACACAGTAGTCTATAAAATATTAAAAAAATAAATTGAAGAAGTCACTAATCCTTTTTAAATCCACCATGCCCCAGTCCAGCTGAACAACTCATACTTTTCAGAATCTACTCTATGTGTTCTCACTGTTCTGCAGCTAGCCACCTCTTTCTCCTCCCTAGATCACCTTCTTTATCATTTCTGCTTCTCAAAATGTTACCCCTCTTTCAAAGCCCAGGTATGATGACATCTCCCTAGTAAAGCTCCCTCAACACCTCAAGCTTATAATAACTAATCTCTTCCTTGAATTCCCATAGCAGGTTATTTGTACCTCCATTATAATACCTCTCTCATCCTGTTTTGCATTTTAATTATTCATGTGTGGCATGTTTCTCTTATTAGGCCATAAATATCTTAGGACAAGAACTATGCCCTCATTTTTGTTCCACTACAAATCTTAACACATACCTTGCACACACCAGACCTTCAGGAAATGCCTGCTAAGGTAACGAAGGGACAGCCTAAATTAACATAAATTATTATTTGTGTACTGATCCAGTCCTAAATCCATGGTGCTATCATTTCTGTATCACTGATGGTTATCCACTTACTTAAATAATCTTTCCTTAAATACACTTAGAAAAGACGGAAAACTGTGTTATAAGGGAGGAACAAGTATGTAGGTTATTCCTTTCCTTAAACAAAGAGAAGTTCTGTCATGCGTCATGGAAAATTAAAGCACAGTAATAAAAAGCACGAACAAGATTTGTTGAATAATGATTTAGTGGAAACGTTGCTTGCCTCCTGTTCATAGGTCCTAACTTTCCTCTCAAGTACTTAAGCTGCACATTCTATTTATTTTGTTTCTAGATTACATTGACAACTATTGGCTATGGAGACAAAACTCCCCTAACTTGGCTGGGAAGATTGCTTTCTGCAGGCTTTGCACTCCTTGGCATTTCTTTCTTTGCACTTCCTGCCGTGAGTATCTTTGCACCAATAAAGCAGTTTAAATTAGATCTTAGAGACTTATTAGAGTGAGCTCTCACAAATTCGTATGCTTGGGAACATATCTATATCATTTACAAATATAATTTTTCCGATATAATGTTGACTTTTCTAAATATATCTACTTGGATAATTTATAAAATATGGTCTTCCCTTGGAGACACTTAATCTGAGACTTTATTTAATGTAGGCTCATACTTTGTGACCAAATAATCATTCAGATGGCTCACTTTTTAGGCAACATGCTACTAAGACATTTAAAATATTTGCAAAGATTTAAAGCTATATTCTTTTAAAACTGATCCTTCCAATTTGGTTTATAATGTGTGCTACTTAAGAGACAGATGTGCACAATGGAGTATTTTTCTCTTCAGATCCATTTGAGTGAAAAGCATATGACCTTAAAGGGTGTTAAACATGTCAGATGATTTATTCATTGTGTCATCATCATTGATTTTTTTAATGAGCAGTTTCTGTATCTTATCAGAATAAAGGGCACATTTATCTGCCCCCAAGCTTCTGATTATTTTCTCCTTAGTGAATGAAGCCTGCCTTTCTCATACTTTTATTCTCTTGTGTCTTTAAAGGCAGCTGTTCAAAATATTACAGTTTGCCCCCATTTCCAAGTTCTTGCTTTTGTTCGCTCCATCTGGGGTAGGGAAGGAGGAGCCAATAAAAAGGAGGGTTAACGCGGTGGGAGCAGAAGTGCTTAAGGAAAATAGATCCAGTCTTGCTCCAGACACAGCTCAAGCTGTGCCAACCAGAGACCCCAGAGCACCTCTCCAAAGCTCTTTTAGGTGGTAGGGCTTCTCCTCTGCCTATTAATAAGTGCAGAGAACACCCTTGTCCCACCAGTGCCCAACTTGAGATTCACCAGATCGTTCTGCCCCAGAACACTCAAAATCACAGAAAAGAGACTGAAAAGGCCATGCATATGCTTGGGTACTAGACCTCAGTTTGAATACATCTTTGTCACATACTAACTATATGACTGCTTTAGTTTACTAGGGCTGCCTTAACAAGTACCACAGACTGGGTGACTTAAACAATAGAAAGGTATTGTCTCACAGTTCCCAAGACTGGACGTCCAAAATCAAAGCATTGAGAAACCACGAGAGCCATGAGAGAAAGAACTGTTCCAGGCCTCTCTTCTTGGCTTATAGATGGCTCTTCTTCCTGTGTCTTCACATCATCTGTGTCCAAATTTCTACTTCCTAGAAGAACACCAGTCATATTTGATTAGGGTCCATCCTAATGACCTCGTTTTAACTTGATTACCTCTGTAAGGACCCTATTTTCAAACAAGGTCACATTCTGAGGTCATGGGGATTAGGACTTCAACATATGAATTTTGGAAGGACGCAATTCAGCCTGAACAGTGACCCTGAATAAGTTTCTTTTTTAATAGAATGGAGGAAGAATTATTGAGCCCAGAGAAATTTTGTGCGGACCAATGTAATAATGTAAGTCAAGTGCTTGTCATGAAGAGAACTCTCAATAAATGTTACTTCCCTTTGCCTGTATGAATCTAGAAATACATGTTTCCTGGAACAAAATGATGAAATCCAGGAGAATTAAAAAAAAAAAAATCTTACGTATCCAAGGCAACTTCATCTGGCAATCTCAACAATTCAGAACAGAGAAGAGATTCACTCAATAATCAGATTCCCTACAGGAAAATACCTTTAGAAACAATACAACGCAGTCTTGGGTTTTTTCCCAAAATAATGGCACAAAATAATTGCAGCTTTTGTGTTTATATTTATCCTGAGGCCACATGTAGAGCAACCTCTATGATTCAGTGAAAAACTATGAACAAGGAGGTAGGCAACCTCTGGGCTGTTGAAATAGACAACAGGCTATGTTCTGTCCTCATAGGAGAGCCACTTGAGACCTAATTCATAACCTAGTCTTCATTCAGAGAAAATTCTGATAAACTCACCTATATGGTTTCACAATTCTTTGAAGATTATAAACAACAAATATAGAGGAAGATGATAGAACAAACACTG
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Task1_train_10555
This gene mutation involves KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5) on Chromosome 6. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; not provided
TGCTCAAAATGGTAGCTAGTGCTGTTAATTCAATGTCTGCAAAATCTAAATTATGCTCCATACAAGTGGATTATACACATATATGCACATAAATGCATGTATATATACTACATATTATAAATATATGCCAGAAATTTTGGTATTTCATATTCTCTTACATGTCTACACTTTATGAAAAGTAGTATTAAAGGGAAAATAAAGAAATCTTTCCTAAATGATCTTACACAGCAGAAAAAAATTAGAAGTTACAAATGACTTAAGTTGTTCTGGATTTAGAAATGGAGGGGCATTTTTATAACACCTAAATGGAGGGAAATGTTGTTTAAATCTATAAACCAGATCACAGAGACCAGGTTTTTATAAAGCTTAGTTTGTACAATCACAACCTGTATGAGATAGAGATCTTAGACAGCGTAAGACAGTCACTGAAAAGGAGAGATGGAAAACAGAACCTATGATGTAATTTCTAATTTCATAGTACAGTCATTTATACTAATTAATAATGGAGTAGATCATTGCTCACGAATAGCAAATAGTATTATCAGACCACTGCGTATTTTAAACATGATTGCATTACTTATTGTCTGGTTATTGTCACTGATGTACTCAGAAGTGTGGAATCTCAAGATAAGAAGGAAGGTTAAAGGTTATCTAGAGCCCAAAAATATCTCAGCCAAGTTGTTATTCAGTTGAGACTTAACACCTTCTAGAAATGAAAAACCCACCACCTCTCCAGACAGCCTATAGCATCTTTGAACCATCTTTGAGCTACTCTAAAAATAAAAAGAAAAGAAAAGCAACCATTCCTTACCTGTAGCAAATACTGACTTAGTGCTTATAAAATGTCCATCTCTAACCAAAGGGTTAGACTCCTTGAAGTTTAATAAAAAACTAATAATTTATAGCTAGCAAGTAAAATCCACAGACTTGAAAGCAGCAGAGCTCCCAGCCCCATGCTAATAAACTCAAGAGTTAAAGACAAAGCCCAGAGACTGAATTTAGCAAGCTCCAAAAGCCAACCCAAGGCTGAGACAAAGCATCTTGTTTTTACAAATGTTAGTAGACCAGAGCAAATTGAAAAGAGTGGGGGACATCAAAGAACCAGAATTTTGGCAGATCAAGATGATAAGCAGAAGAAAAGCAAACTGGCCCAAAACTAATGTAAACCTAGAAGGGAATACTAATCTTACTAATCCCAAAAACTGAATAGGTGAGCCAAAATAAAAAAGGCAAGGAATGGTAAAAGTGTGAATTAAAATGGGAATGTGCTTTGCAATGATCCACGTTCTTGTCTCTAGTGTACAAATGGGCAAAATAGAAAACCTTCTACTCTATATCTTCAAAACTGAGTATCCCTGCTCTCCATTTTACTTTTCTTTTAGTAGGTGTACAGTTATAACATTATAAAGAACTACAGCTGGGACAGATTTTATACAGTCCTCTCTCCTCCATTTCATGAATAGAGAATCTAACTTTCAGAGTCTCATCAAAGTGCTAGAAGTATTCCCATGTTCACAGCAGTGAGACTTTAACTCCCTCAGATTTAAAATCCAGCTCTGTCCCAAGTTGAAATTCATGTTCTCTACATTCCATCACTGGATGAGACCATTCAATCTAACTTAGGCAAAAAGAAATGTCACAGAGAAGGCCACACACACACAAAAAAATTTTATTGTGATTTTATTTATAATCATGGTGCCTATGCTATACCACAAAAGATAATAAATGACAATGCCTAATTGACTTACTAAAGAACAGAAGTTGTATCTCCTGGCAGTATTGCCCAACAATTTGCCATTGGCTATTGGTATTATAATGGAGATAAATACTGCTTATTTTAATAAGTAACATGTTTATGGACAGGTTACATACCGTTTGTCTTCTCTCAGACTCATTTTAGTGACTTTTTAATATTTGTATTATTTAACAGTGCTTTTGAAATTTTTGAGTGCCATTTTTGTATTTTGTTCCAGGGCATTCTTGGCTCAGGTTTTGCATTAAAAGTACAAGAACAACACCGCCAGAAACACTTTGAGAAAAGAAGGAACCCAGCTGCCAACCTCATTCAGGTAAATGTCAATGTAATAGGTAGATGGCAACATTTGTGTCCATAGTGCTTGATGGGTCATTTTCCAATCTCTGTGCTTCATTGCTTGGTAGAACTACTGCTTTGTTCCTTTTTATAAAATGAAGTCAGAACTTAATGTACAGTCTTGGATTTGGACAGTCTTGGATTTGTTCCTCCTCTCCCAAACTGAAACACATGTATTTTTAGCAAATGGTCCATGCATTGTTCAGACTAAGTAACCATGTCAGCAAGGCCATGCAAAGGTTAGCAGTTGTGTGGCTCGTGGAATTATCTAATATGTCTTATGAATTACTTGATGAAACGTAATTGATCATTAAGTGATGGAGCAGAACAGGGCATTGTTCCCTGCATTCCAATTACTTTCTCCAGCCAGATGTATGTTGCTGTTTTAAAGAACAACATATTTGTTTAGAATGTCAAGGTTTAATACCTGTGAAATTGCTTTTAGTGCCATCTAGGGCAGTTAGCGGAAATAGCTATCCTATTTTGAGAGCTGATGGGACTATGGAATACATCAGTGTTTGAGAATATTAAACAATAAGTATATAATTTGAAGCTAGCTCCTAATACATAGGTTGTTATTTAGTATTTCATTTTCTTTTCACTAACTCAGGATTAGCTTCAGCACTAAAAGGAATGCTTCTCCTTTTGCCATCCATATATTTTCCATCCTAGATCCAGGTTAAGAATCACAAAATATATTTTTTGTTAGATTCATAATGTAGAGTTGACATTTAGTTATGGACAAAATAATTCTACAATCTAAAGTTTCTCCCCTCCTGCTAGGGAAGTGGAAGCTACCGAATTTCTAAACTGGAGGGTCTTGAAGTGGTGCTCCAAGGCCCTAGGAAACTTGCCTTAAAGCTGCAGTAACGGGCACACTGTTTTGTTGCTGTTGTTGTTTTGTTTTATTTTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCGCTTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCGCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCTCAACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCTCCCGGCCACAAGCACACTGTTTTAATTTAGATTGTAGGTTTGGGTGGGTGGGTTGGTGGGAGATAACCACCACAACCCCTACCTTTAGTGTTTATCTGTGACTGTGATATATGCAGTGCCTCCCACAGACATGGAGCTGGGGAAAGAAGGGGGCAGTATGGTTCAGTTATATCATGAAGGAGATCTGTTTATATCTAATCATTAAATGAGGATATTAATTTTTAAATCAAGCTATTCTGCAACTGTTGACAAGAAAGTAGACCATCAGGCATGACTTCCAGTGCAAATCACTGAGAATCTCTATTTTTTTACATTATTTTTTACAATTTTTTTTTTTTACATATTCTTTACAGGTTTTAAAAGGTCACTAAAGAGAAAGTAAACTCTATTTTCTTATATGAAGTTGGAGTTTAAGATCTGATGCCAAACAATAATCAGCAGAATGAAAAGAGGAGTCACACACTTTAGGACACACGCAAAATACCCCAAGGTCCAGAATTCATAGGCTTTCATCCTTTAGCACTCCTTAACTGGTTACACATGTTCCAATACTTCTAATAAGTTTTTCTCTTTACTGTTCTTATCCTTTAATTTTCCTTCACTCTAGAACAACGTTTTCCAACCTGTGAGTGCAGAAGTTATTGCATGGGTTCCTTTCATCCGTCTGAGCACCAAGCTCTGTCTACATATGGAACCAATAATACATTTTACACAATAAAACCTCTTGGAATATCAGCTGTTTTGTTAGAAAGTGAGCTCTTTGAGGAATTTCTCATGCACATATCAATTGTGA
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Task1_train_10556
The gene KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5) is located on Chromosome 6, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Intellectual disability, autosomal dominant 46
GCTCAAAATGGTAGCTAGTGCTGTTAATTCAATGTCTGCAAAATCTAAATTATGCTCCATACAAGTGGATTATACACATATATGCACATAAATGCATGTATATATACTACATATTATAAATATATGCCAGAAATTTTGGTATTTCATATTCTCTTACATGTCTACACTTTATGAAAAGTAGTATTAAAGGGAAAATAAAGAAATCTTTCCTAAATGATCTTACACAGCAGAAAAAAATTAGAAGTTACAAATGACTTAAGTTGTTCTGGATTTAGAAATGGAGGGGCATTTTTATAACACCTAAATGGAGGGAAATGTTGTTTAAATCTATAAACCAGATCACAGAGACCAGGTTTTTATAAAGCTTAGTTTGTACAATCACAACCTGTATGAGATAGAGATCTTAGACAGCGTAAGACAGTCACTGAAAAGGAGAGATGGAAAACAGAACCTATGATGTAATTTCTAATTTCATAGTACAGTCATTTATACTAATTAATAATGGAGTAGATCATTGCTCACGAATAGCAAATAGTATTATCAGACCACTGCGTATTTTAAACATGATTGCATTACTTATTGTCTGGTTATTGTCACTGATGTACTCAGAAGTGTGGAATCTCAAGATAAGAAGGAAGGTTAAAGGTTATCTAGAGCCCAAAAATATCTCAGCCAAGTTGTTATTCAGTTGAGACTTAACACCTTCTAGAAATGAAAAACCCACCACCTCTCCAGACAGCCTATAGCATCTTTGAACCATCTTTGAGCTACTCTAAAAATAAAAAGAAAAGAAAAGCAACCATTCCTTACCTGTAGCAAATACTGACTTAGTGCTTATAAAATGTCCATCTCTAACCAAAGGGTTAGACTCCTTGAAGTTTAATAAAAAACTAATAATTTATAGCTAGCAAGTAAAATCCACAGACTTGAAAGCAGCAGAGCTCCCAGCCCCATGCTAATAAACTCAAGAGTTAAAGACAAAGCCCAGAGACTGAATTTAGCAAGCTCCAAAAGCCAACCCAAGGCTGAGACAAAGCATCTTGTTTTTACAAATGTTAGTAGACCAGAGCAAATTGAAAAGAGTGGGGGACATCAAAGAACCAGAATTTTGGCAGATCAAGATGATAAGCAGAAGAAAAGCAAACTGGCCCAAAACTAATGTAAACCTAGAAGGGAATACTAATCTTACTAATCCCAAAAACTGAATAGGTGAGCCAAAATAAAAAAGGCAAGGAATGGTAAAAGTGTGAATTAAAATGGGAATGTGCTTTGCAATGATCCACGTTCTTGTCTCTAGTGTACAAATGGGCAAAATAGAAAACCTTCTACTCTATATCTTCAAAACTGAGTATCCCTGCTCTCCATTTTACTTTTCTTTTAGTAGGTGTACAGTTATAACATTATAAAGAACTACAGCTGGGACAGATTTTATACAGTCCTCTCTCCTCCATTTCATGAATAGAGAATCTAACTTTCAGAGTCTCATCAAAGTGCTAGAAGTATTCCCATGTTCACAGCAGTGAGACTTTAACTCCCTCAGATTTAAAATCCAGCTCTGTCCCAAGTTGAAATTCATGTTCTCTACATTCCATCACTGGATGAGACCATTCAATCTAACTTAGGCAAAAAGAAATGTCACAGAGAAGGCCACACACACACAAAAAAATTTTATTGTGATTTTATTTATAATCATGGTGCCTATGCTATACCACAAAAGATAATAAATGACAATGCCTAATTGACTTACTAAAGAACAGAAGTTGTATCTCCTGGCAGTATTGCCCAACAATTTGCCATTGGCTATTGGTATTATAATGGAGATAAATACTGCTTATTTTAATAAGTAACATGTTTATGGACAGGTTACATACCGTTTGTCTTCTCTCAGACTCATTTTAGTGACTTTTTAATATTTGTATTATTTAACAGTGCTTTTGAAATTTTTGAGTGCCATTTTTGTATTTTGTTCCAGGGCATTCTTGGCTCAGGTTTTGCATTAAAAGTACAAGAACAACACCGCCAGAAACACTTTGAGAAAAGAAGGAACCCAGCTGCCAACCTCATTCAGGTAAATGTCAATGTAATAGGTAGATGGCAACATTTGTGTCCATAGTGCTTGATGGGTCATTTTCCAATCTCTGTGCTTCATTGCTTGGTAGAACTACTGCTTTGTTCCTTTTTATAAAATGAAGTCAGAACTTAATGTACAGTCTTGGATTTGGACAGTCTTGGATTTGTTCCTCCTCTCCCAAACTGAAACACATGTATTTTTAGCAAATGGTCCATGCATTGTTCAGACTAAGTAACCATGTCAGCAAGGCCATGCAAAGGTTAGCAGTTGTGTGGCTCGTGGAATTATCTAATATGTCTTATGAATTACTTGATGAAACGTAATTGATCATTAAGTGATGGAGCAGAACAGGGCATTGTTCCCTGCATTCCAATTACTTTCTCCAGCCAGATGTATGTTGCTGTTTTAAAGAACAACATATTTGTTTAGAATGTCAAGGTTTAATACCTGTGAAATTGCTTTTAGTGCCATCTAGGGCAGTTAGCGGAAATAGCTATCCTATTTTGAGAGCTGATGGGACTATGGAATACATCAGTGTTTGAGAATATTAAACAATAAGTATATAATTTGAAGCTAGCTCCTAATACATAGGTTGTTATTTAGTATTTCATTTTCTTTTCACTAACTCAGGATTAGCTTCAGCACTAAAAGGAATGCTTCTCCTTTTGCCATCCATATATTTTCCATCCTAGATCCAGGTTAAGAATCACAAAATATATTTTTTGTTAGATTCATAATGTAGAGTTGACATTTAGTTATGGACAAAATAATTCTACAATCTAAAGTTTCTCCCCTCCTGCTAGGGAAGTGGAAGCTACCGAATTTCTAAACTGGAGGGTCTTGAAGTGGTGCTCCAAGGCCCTAGGAAACTTGCCTTAAAGCTGCAGTAACGGGCACACTGTTTTGTTGCTGTTGTTGTTTTGTTTTATTTTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCGCTTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCGCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCTCAACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCTCCCGGCCACAAGCACACTGTTTTAATTTAGATTGTAGGTTTGGGTGGGTGGGTTGGTGGGAGATAACCACCACAACCCCTACCTTTAGTGTTTATCTGTGACTGTGATATATGCAGTGCCTCCCACAGACATGGAGCTGGGGAAAGAAGGGGGCAGTATGGTTCAGTTATATCATGAAGGAGATCTGTTTATATCTAATCATTAAATGAGGATATTAATTTTTAAATCAAGCTATTCTGCAACTGTTGACAAGAAAGTAGACCATCAGGCATGACTTCCAGTGCAAATCACTGAGAATCTCTATTTTTTTACATTATTTTTTACAATTTTTTTTTTTTACATATTCTTTACAGGTTTTAAAAGGTCACTAAAGAGAAAGTAAACTCTATTTTCTTATATGAAGTTGGAGTTTAAGATCTGATGCCAAACAATAATCAGCAGAATGAAAAGAGGAGTCACACACTTTAGGACACACGCAAAATACCCCAAGGTCCAGAATTCATAGGCTTTCATCCTTTAGCACTCCTTAACTGGTTACACATGTTCCAATACTTCTAATAAGTTTTTCTCTTTACTGTTCTTATCCTTTAATTTTCCTTCACTCTAGAACAACGTTTTCCAACCTGTGAGTGCAGAAGTTATTGCATGGGTTCCTTTCATCCGTCTGAGCACCAAGCTCTGTCTACATATGGAACCAATAATACATTTTACACAATAAAACCTCTTGGAATATCAGCTGTTTTGTTAGAAAGTGAGCTCTTTGAGGAATTTCTCATGCACATATCAATTGTGAT
GCTCAAAATGGTAGCTAGTGCTGTTAATTCAATGTCTGCAAAATCTAAATTATGCTCCATACAAGTGGATTATACACATATATGCACATAAATGCATGTATATATACTACATATTATAAATATATGCCAGAAATTTTGGTATTTCATATTCTCTTACATGTCTACACTTTATGAAAAGTAGTATTAAAGGGAAAATAAAGAAATCTTTCCTAAATGATCTTACACAGCAGAAAAAAATTAGAAGTTACAAATGACTTAAGTTGTTCTGGATTTAGAAATGGAGGGGCATTTTTATAACACCTAAATGGAGGGAAATGTTGTTTAAATCTATAAACCAGATCACAGAGACCAGGTTTTTATAAAGCTTAGTTTGTACAATCACAACCTGTATGAGATAGAGATCTTAGACAGCGTAAGACAGTCACTGAAAAGGAGAGATGGAAAACAGAACCTATGATGTAATTTCTAATTTCATAGTACAGTCATTTATACTAATTAATAATGGAGTAGATCATTGCTCACGAATAGCAAATAGTATTATCAGACCACTGCGTATTTTAAACATGATTGCATTACTTATTGTCTGGTTATTGTCACTGATGTACTCAGAAGTGTGGAATCTCAAGATAAGAAGGAAGGTTAAAGGTTATCTAGAGCCCAAAAATATCTCAGCCAAGTTGTTATTCAGTTGAGACTTAACACCTTCTAGAAATGAAAAACCCACCACCTCTCCAGACAGCCTATAGCATCTTTGAACCATCTTTGAGCTACTCTAAAAATAAAAAGAAAAGAAAAGCAACCATTCCTTACCTGTAGCAAATACTGACTTAGTGCTTATAAAATGTCCATCTCTAACCAAAGGGTTAGACTCCTTGAAGTTTAATAAAAAACTAATAATTTATAGCTAGCAAGTAAAATCCACAGACTTGAAAGCAGCAGAGCTCCCAGCCCCATGCTAATAAACTCAAGAGTTAAAGACAAAGCCCAGAGACTGAATTTAGCAAGCTCCAAAAGCCAACCCAAGGCTGAGACAAAGCATCTTGTTTTTACAAATGTTAGTAGACCAGAGCAAATTGAAAAGAGTGGGGGACATCAAAGAACCAGAATTTTGGCAGATCAAGATGATAAGCAGAAGAAAAGCAAACTGGCCCAAAACTAATGTAAACCTAGAAGGGAATACTAATCTTACTAATCCCAAAAACTGAATAGGTGAGCCAAAATAAAAAAGGCAAGGAATGGTAAAAGTGTGAATTAAAATGGGAATGTGCTTTGCAATGATCCACGTTCTTGTCTCTAGTGTACAAATGGGCAAAATAGAAAACCTTCTACTCTATATCTTCAAAACTGAGTATCCCTGCTCTCCATTTTACTTTTCTTTTAGTAGGTGTACAGTTATAACATTATAAAGAACTACAGCTGGGACAGATTTTATACAGTCCTCTCTCCTCCATTTCATGAATAGAGAATCTAACTTTCAGAGTCTCATCAAAGTGCTAGAAGTATTCCCATGTTCACAGCAGTGAGACTTTAACTCCCTCAGATTTAAAATCCAGCTCTGTCCCAAGTTGAAATTCATGTTCTCTACATTCCATCACTGGATGAGACCATTCAATCTAACTTAGGCAAAAAGAAATGTCACAGAGAAGGCCACACACACACAAAAAAATTTTATTGTGATTTTATTTATAATCATGGTGCCTATGCTATACCACAAAAGATAATAAATGACAATGCCTAATTGACTTACTAAAGAACAGAAGTTGTATCTCCTGGCAGTATTGCCCAACAATTTGCCATTGGCTATTGGTATTATAATGGAGATAAATACTGCTTATTTTAATAAGTAACATGTTTATGGACAGGTTACATACCGTTTGTCTTCTCTCAGACTCATTTTAGTGACTTTTTAATATTTGTATTATTTAACAGTGCTTTTGAAATTTTTGAGTGCCATTTTTGTATTTTGTTCCAGGGCATTCTTGGCTCAGGTTTTGCATTAAAAGTACAAGAACAACACCGCCAGAAACACTTTGAGAAAAGAAGGAACCAAGCTGCCAACCTCATTCAGGTAAATGTCAATGTAATAGGTAGATGGCAACATTTGTGTCCATAGTGCTTGATGGGTCATTTTCCAATCTCTGTGCTTCATTGCTTGGTAGAACTACTGCTTTGTTCCTTTTTATAAAATGAAGTCAGAACTTAATGTACAGTCTTGGATTTGGACAGTCTTGGATTTGTTCCTCCTCTCCCAAACTGAAACACATGTATTTTTAGCAAATGGTCCATGCATTGTTCAGACTAAGTAACCATGTCAGCAAGGCCATGCAAAGGTTAGCAGTTGTGTGGCTCGTGGAATTATCTAATATGTCTTATGAATTACTTGATGAAACGTAATTGATCATTAAGTGATGGAGCAGAACAGGGCATTGTTCCCTGCATTCCAATTACTTTCTCCAGCCAGATGTATGTTGCTGTTTTAAAGAACAACATATTTGTTTAGAATGTCAAGGTTTAATACCTGTGAAATTGCTTTTAGTGCCATCTAGGGCAGTTAGCGGAAATAGCTATCCTATTTTGAGAGCTGATGGGACTATGGAATACATCAGTGTTTGAGAATATTAAACAATAAGTATATAATTTGAAGCTAGCTCCTAATACATAGGTTGTTATTTAGTATTTCATTTTCTTTTCACTAACTCAGGATTAGCTTCAGCACTAAAAGGAATGCTTCTCCTTTTGCCATCCATATATTTTCCATCCTAGATCCAGGTTAAGAATCACAAAATATATTTTTTGTTAGATTCATAATGTAGAGTTGACATTTAGTTATGGACAAAATAATTCTACAATCTAAAGTTTCTCCCCTCCTGCTAGGGAAGTGGAAGCTACCGAATTTCTAAACTGGAGGGTCTTGAAGTGGTGCTCCAAGGCCCTAGGAAACTTGCCTTAAAGCTGCAGTAACGGGCACACTGTTTTGTTGCTGTTGTTGTTTTGTTTTATTTTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCGCTTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCGCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCTCAACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCTCCCGGCCACAAGCACACTGTTTTAATTTAGATTGTAGGTTTGGGTGGGTGGGTTGGTGGGAGATAACCACCACAACCCCTACCTTTAGTGTTTATCTGTGACTGTGATATATGCAGTGCCTCCCACAGACATGGAGCTGGGGAAAGAAGGGGGCAGTATGGTTCAGTTATATCATGAAGGAGATCTGTTTATATCTAATCATTAAATGAGGATATTAATTTTTAAATCAAGCTATTCTGCAACTGTTGACAAGAAAGTAGACCATCAGGCATGACTTCCAGTGCAAATCACTGAGAATCTCTATTTTTTTACATTATTTTTTACAATTTTTTTTTTTTACATATTCTTTACAGGTTTTAAAAGGTCACTAAAGAGAAAGTAAACTCTATTTTCTTATATGAAGTTGGAGTTTAAGATCTGATGCCAAACAATAATCAGCAGAATGAAAAGAGGAGTCACACACTTTAGGACACACGCAAAATACCCCAAGGTCCAGAATTCATAGGCTTTCATCCTTTAGCACTCCTTAACTGGTTACACATGTTCCAATACTTCTAATAAGTTTTTCTCTTTACTGTTCTTATCCTTTAATTTTCCTTCACTCTAGAACAACGTTTTCCAACCTGTGAGTGCAGAAGTTATTGCATGGGTTCCTTTCATCCGTCTGAGCACCAAGCTCTGTCTACATATGGAACCAATAATACATTTTACACAATAAAACCTCTTGGAATATCAGCTGTTTTGTTAGAAAGTGAGCTCTTTGAGGAATTTCTCATGCACATATCAATTGTGAT
Task1_train_10557
A variant affecting Chromosome 6, within the gene KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Intellectual disability, autosomal dominant 46
GCTCAAAATGGTAGCTAGTGCTGTTAATTCAATGTCTGCAAAATCTAAATTATGCTCCATACAAGTGGATTATACACATATATGCACATAAATGCATGTATATATACTACATATTATAAATATATGCCAGAAATTTTGGTATTTCATATTCTCTTACATGTCTACACTTTATGAAAAGTAGTATTAAAGGGAAAATAAAGAAATCTTTCCTAAATGATCTTACACAGCAGAAAAAAATTAGAAGTTACAAATGACTTAAGTTGTTCTGGATTTAGAAATGGAGGGGCATTTTTATAACACCTAAATGGAGGGAAATGTTGTTTAAATCTATAAACCAGATCACAGAGACCAGGTTTTTATAAAGCTTAGTTTGTACAATCACAACCTGTATGAGATAGAGATCTTAGACAGCGTAAGACAGTCACTGAAAAGGAGAGATGGAAAACAGAACCTATGATGTAATTTCTAATTTCATAGTACAGTCATTTATACTAATTAATAATGGAGTAGATCATTGCTCACGAATAGCAAATAGTATTATCAGACCACTGCGTATTTTAAACATGATTGCATTACTTATTGTCTGGTTATTGTCACTGATGTACTCAGAAGTGTGGAATCTCAAGATAAGAAGGAAGGTTAAAGGTTATCTAGAGCCCAAAAATATCTCAGCCAAGTTGTTATTCAGTTGAGACTTAACACCTTCTAGAAATGAAAAACCCACCACCTCTCCAGACAGCCTATAGCATCTTTGAACCATCTTTGAGCTACTCTAAAAATAAAAAGAAAAGAAAAGCAACCATTCCTTACCTGTAGCAAATACTGACTTAGTGCTTATAAAATGTCCATCTCTAACCAAAGGGTTAGACTCCTTGAAGTTTAATAAAAAACTAATAATTTATAGCTAGCAAGTAAAATCCACAGACTTGAAAGCAGCAGAGCTCCCAGCCCCATGCTAATAAACTCAAGAGTTAAAGACAAAGCCCAGAGACTGAATTTAGCAAGCTCCAAAAGCCAACCCAAGGCTGAGACAAAGCATCTTGTTTTTACAAATGTTAGTAGACCAGAGCAAATTGAAAAGAGTGGGGGACATCAAAGAACCAGAATTTTGGCAGATCAAGATGATAAGCAGAAGAAAAGCAAACTGGCCCAAAACTAATGTAAACCTAGAAGGGAATACTAATCTTACTAATCCCAAAAACTGAATAGGTGAGCCAAAATAAAAAAGGCAAGGAATGGTAAAAGTGTGAATTAAAATGGGAATGTGCTTTGCAATGATCCACGTTCTTGTCTCTAGTGTACAAATGGGCAAAATAGAAAACCTTCTACTCTATATCTTCAAAACTGAGTATCCCTGCTCTCCATTTTACTTTTCTTTTAGTAGGTGTACAGTTATAACATTATAAAGAACTACAGCTGGGACAGATTTTATACAGTCCTCTCTCCTCCATTTCATGAATAGAGAATCTAACTTTCAGAGTCTCATCAAAGTGCTAGAAGTATTCCCATGTTCACAGCAGTGAGACTTTAACTCCCTCAGATTTAAAATCCAGCTCTGTCCCAAGTTGAAATTCATGTTCTCTACATTCCATCACTGGATGAGACCATTCAATCTAACTTAGGCAAAAAGAAATGTCACAGAGAAGGCCACACACACACAAAAAAATTTTATTGTGATTTTATTTATAATCATGGTGCCTATGCTATACCACAAAAGATAATAAATGACAATGCCTAATTGACTTACTAAAGAACAGAAGTTGTATCTCCTGGCAGTATTGCCCAACAATTTGCCATTGGCTATTGGTATTATAATGGAGATAAATACTGCTTATTTTAATAAGTAACATGTTTATGGACAGGTTACATACCGTTTGTCTTCTCTCAGACTCATTTTAGTGACTTTTTAATATTTGTATTATTTAACAGTGCTTTTGAAATTTTTGAGTGCCATTTTTGTATTTTGTTCCAGGGCATTCTTGGCTCAGGTTTTGCATTAAAAGTACAAGAACAACACCGCCAGAAACACTTTGAGAAAAGAAGGAACCCAGCTGCCAACCTCATTCAGGTAAATGTCAATGTAATAGGTAGATGGCAACATTTGTGTCCATAGTGCTTGATGGGTCATTTTCCAATCTCTGTGCTTCATTGCTTGGTAGAACTACTGCTTTGTTCCTTTTTATAAAATGAAGTCAGAACTTAATGTACAGTCTTGGATTTGGACAGTCTTGGATTTGTTCCTCCTCTCCCAAACTGAAACACATGTATTTTTAGCAAATGGTCCATGCATTGTTCAGACTAAGTAACCATGTCAGCAAGGCCATGCAAAGGTTAGCAGTTGTGTGGCTCGTGGAATTATCTAATATGTCTTATGAATTACTTGATGAAACGTAATTGATCATTAAGTGATGGAGCAGAACAGGGCATTGTTCCCTGCATTCCAATTACTTTCTCCAGCCAGATGTATGTTGCTGTTTTAAAGAACAACATATTTGTTTAGAATGTCAAGGTTTAATACCTGTGAAATTGCTTTTAGTGCCATCTAGGGCAGTTAGCGGAAATAGCTATCCTATTTTGAGAGCTGATGGGACTATGGAATACATCAGTGTTTGAGAATATTAAACAATAAGTATATAATTTGAAGCTAGCTCCTAATACATAGGTTGTTATTTAGTATTTCATTTTCTTTTCACTAACTCAGGATTAGCTTCAGCACTAAAAGGAATGCTTCTCCTTTTGCCATCCATATATTTTCCATCCTAGATCCAGGTTAAGAATCACAAAATATATTTTTTGTTAGATTCATAATGTAGAGTTGACATTTAGTTATGGACAAAATAATTCTACAATCTAAAGTTTCTCCCCTCCTGCTAGGGAAGTGGAAGCTACCGAATTTCTAAACTGGAGGGTCTTGAAGTGGTGCTCCAAGGCCCTAGGAAACTTGCCTTAAAGCTGCAGTAACGGGCACACTGTTTTGTTGCTGTTGTTGTTTTGTTTTATTTTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCGCTTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCGCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCTCAACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCTCCCGGCCACAAGCACACTGTTTTAATTTAGATTGTAGGTTTGGGTGGGTGGGTTGGTGGGAGATAACCACCACAACCCCTACCTTTAGTGTTTATCTGTGACTGTGATATATGCAGTGCCTCCCACAGACATGGAGCTGGGGAAAGAAGGGGGCAGTATGGTTCAGTTATATCATGAAGGAGATCTGTTTATATCTAATCATTAAATGAGGATATTAATTTTTAAATCAAGCTATTCTGCAACTGTTGACAAGAAAGTAGACCATCAGGCATGACTTCCAGTGCAAATCACTGAGAATCTCTATTTTTTTACATTATTTTTTACAATTTTTTTTTTTTACATATTCTTTACAGGTTTTAAAAGGTCACTAAAGAGAAAGTAAACTCTATTTTCTTATATGAAGTTGGAGTTTAAGATCTGATGCCAAACAATAATCAGCAGAATGAAAAGAGGAGTCACACACTTTAGGACACACGCAAAATACCCCAAGGTCCAGAATTCATAGGCTTTCATCCTTTAGCACTCCTTAACTGGTTACACATGTTCCAATACTTCTAATAAGTTTTTCTCTTTACTGTTCTTATCCTTTAATTTTCCTTCACTCTAGAACAACGTTTTCCAACCTGTGAGTGCAGAAGTTATTGCATGGGTTCCTTTCATCCGTCTGAGCACCAAGCTCTGTCTACATATGGAACCAATAATACATTTTACACAATAAAACCTCTTGGAATATCAGCTGTTTTGTTAGAAAGTGAGCTCTTTGAGGAATTTCTCATGCACATATCAATTGTGAT
GCTCAAAATGGTAGCTAGTGCTGTTAATTCAATGTCTGCAAAATCTAAATTATGCTCCATACAAGTGGATTATACACATATATGCACATAAATGCATGTATATATACTACATATTATAAATATATGCCAGAAATTTTGGTATTTCATATTCTCTTACATGTCTACACTTTATGAAAAGTAGTATTAAAGGGAAAATAAAGAAATCTTTCCTAAATGATCTTACACAGCAGAAAAAAATTAGAAGTTACAAATGACTTAAGTTGTTCTGGATTTAGAAATGGAGGGGCATTTTTATAACACCTAAATGGAGGGAAATGTTGTTTAAATCTATAAACCAGATCACAGAGACCAGGTTTTTATAAAGCTTAGTTTGTACAATCACAACCTGTATGAGATAGAGATCTTAGACAGCGTAAGACAGTCACTGAAAAGGAGAGATGGAAAACAGAACCTATGATGTAATTTCTAATTTCATAGTACAGTCATTTATACTAATTAATAATGGAGTAGATCATTGCTCACGAATAGCAAATAGTATTATCAGACCACTGCGTATTTTAAACATGATTGCATTACTTATTGTCTGGTTATTGTCACTGATGTACTCAGAAGTGTGGAATCTCAAGATAAGAAGGAAGGTTAAAGGTTATCTAGAGCCCAAAAATATCTCAGCCAAGTTGTTATTCAGTTGAGACTTAACACCTTCTAGAAATGAAAAACCCACCACCTCTCCAGACAGCCTATAGCATCTTTGAACCATCTTTGAGCTACTCTAAAAATAAAAAGAAAAGAAAAGCAACCATTCCTTACCTGTAGCAAATACTGACTTAGTGCTTATAAAATGTCCATCTCTAACCAAAGGGTTAGACTCCTTGAAGTTTAATAAAAAACTAATAATTTATAGCTAGCAAGTAAAATCCACAGACTTGAAAGCAGCAGAGCTCCCAGCCCCATGCTAATAAACTCAAGAGTTAAAGACAAAGCCCAGAGACTGAATTTAGCAAGCTCCAAAAGCCAACCCAAGGCTGAGACAAAGCATCTTGTTTTTACAAATGTTAGTAGACCAGAGCAAATTGAAAAGAGTGGGGGACATCAAAGAACCAGAATTTTGGCAGATCAAGATGATAAGCAGAAGAAAAGCAAACTGGCCCAAAACTAATGTAAACCTAGAAGGGAATACTAATCTTACTAATCCCAAAAACTGAATAGGTGAGCCAAAATAAAAAAGGCAAGGAATGGTAAAAGTGTGAATTAAAATGGGAATGTGCTTTGCAATGATCCACGTTCTTGTCTCTAGTGTACAAATGGGCAAAATAGAAAACCTTCTACTCTATATCTTCAAAACTGAGTATCCCTGCTCTCCATTTTACTTTTCTTTTAGTAGGTGTACAGTTATAACATTATAAAGAACTACAGCTGGGACAGATTTTATACAGTCCTCTCTCCTCCATTTCATGAATAGAGAATCTAACTTTCAGAGTCTCATCAAAGTGCTAGAAGTATTCCCATGTTCACAGCAGTGAGACTTTAACTCCCTCAGATTTAAAATCCAGCTCTGTCCCAAGTTGAAATTCATGTTCTCTACATTCCATCACTGGATGAGACCATTCAATCTAACTTAGGCAAAAAGAAATGTCACAGAGAAGGCCACACACACACAAAAAAATTTTATTGTGATTTTATTTATAATCATGGTGCCTATGCTATACCACAAAAGATAATAAATGACAATGCCTAATTGACTTACTAAAGAACAGAAGTTGTATCTCCTGGCAGTATTGCCCAACAATTTGCCATTGGCTATTGGTATTATAATGGAGATAAATACTGCTTATTTTAATAAGTAACATGTTTATGGACAGGTTACATACCGTTTGTCTTCTCTCAGACTCATTTTAGTGACTTTTTAATATTTGTATTATTTAACAGTGCTTTTGAAATTTTTGAGTGCCATTTTTGTATTTTGTTCCAGGGCATTCTTGGCTCAGGTTTTGCATTAAAAGTACAAGAACAACACCGCCAGAAACACTTTGAGAAAAGAAGGAACCGAGCTGCCAACCTCATTCAGGTAAATGTCAATGTAATAGGTAGATGGCAACATTTGTGTCCATAGTGCTTGATGGGTCATTTTCCAATCTCTGTGCTTCATTGCTTGGTAGAACTACTGCTTTGTTCCTTTTTATAAAATGAAGTCAGAACTTAATGTACAGTCTTGGATTTGGACAGTCTTGGATTTGTTCCTCCTCTCCCAAACTGAAACACATGTATTTTTAGCAAATGGTCCATGCATTGTTCAGACTAAGTAACCATGTCAGCAAGGCCATGCAAAGGTTAGCAGTTGTGTGGCTCGTGGAATTATCTAATATGTCTTATGAATTACTTGATGAAACGTAATTGATCATTAAGTGATGGAGCAGAACAGGGCATTGTTCCCTGCATTCCAATTACTTTCTCCAGCCAGATGTATGTTGCTGTTTTAAAGAACAACATATTTGTTTAGAATGTCAAGGTTTAATACCTGTGAAATTGCTTTTAGTGCCATCTAGGGCAGTTAGCGGAAATAGCTATCCTATTTTGAGAGCTGATGGGACTATGGAATACATCAGTGTTTGAGAATATTAAACAATAAGTATATAATTTGAAGCTAGCTCCTAATACATAGGTTGTTATTTAGTATTTCATTTTCTTTTCACTAACTCAGGATTAGCTTCAGCACTAAAAGGAATGCTTCTCCTTTTGCCATCCATATATTTTCCATCCTAGATCCAGGTTAAGAATCACAAAATATATTTTTTGTTAGATTCATAATGTAGAGTTGACATTTAGTTATGGACAAAATAATTCTACAATCTAAAGTTTCTCCCCTCCTGCTAGGGAAGTGGAAGCTACCGAATTTCTAAACTGGAGGGTCTTGAAGTGGTGCTCCAAGGCCCTAGGAAACTTGCCTTAAAGCTGCAGTAACGGGCACACTGTTTTGTTGCTGTTGTTGTTTTGTTTTATTTTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCGCTTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCGCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCTCAACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCTCCCGGCCACAAGCACACTGTTTTAATTTAGATTGTAGGTTTGGGTGGGTGGGTTGGTGGGAGATAACCACCACAACCCCTACCTTTAGTGTTTATCTGTGACTGTGATATATGCAGTGCCTCCCACAGACATGGAGCTGGGGAAAGAAGGGGGCAGTATGGTTCAGTTATATCATGAAGGAGATCTGTTTATATCTAATCATTAAATGAGGATATTAATTTTTAAATCAAGCTATTCTGCAACTGTTGACAAGAAAGTAGACCATCAGGCATGACTTCCAGTGCAAATCACTGAGAATCTCTATTTTTTTACATTATTTTTTACAATTTTTTTTTTTTACATATTCTTTACAGGTTTTAAAAGGTCACTAAAGAGAAAGTAAACTCTATTTTCTTATATGAAGTTGGAGTTTAAGATCTGATGCCAAACAATAATCAGCAGAATGAAAAGAGGAGTCACACACTTTAGGACACACGCAAAATACCCCAAGGTCCAGAATTCATAGGCTTTCATCCTTTAGCACTCCTTAACTGGTTACACATGTTCCAATACTTCTAATAAGTTTTTCTCTTTACTGTTCTTATCCTTTAATTTTCCTTCACTCTAGAACAACGTTTTCCAACCTGTGAGTGCAGAAGTTATTGCATGGGTTCCTTTCATCCGTCTGAGCACCAAGCTCTGTCTACATATGGAACCAATAATACATTTTACACAATAAAACCTCTTGGAATATCAGCTGTTTTGTTAGAAAGTGAGCTCTTTGAGGAATTTCTCATGCACATATCAATTGTGAT
Task1_train_10558
Given this context: Chromosome 6, gene KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_10559
Gene KCNQ5 (potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5) on Chromosome 6 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Intellectual disability, autosomal dominant 46
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Task1_train_10560
Given this context: Chromosome 6, gene KHDC3L (KH domain containing 3 like, subcortical maternal complex member) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Hydatidiform mole, recurrent, 2
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Task1_train_10561
A variant affecting Chromosome 6, within the gene KHDC3L (KH domain containing 3 like, subcortical maternal complex member), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Hydatidiform mole, recurrent, 2
AGCCACCATGCCCGCCCTGTTTTTTGAGTTTTTAATAAAAGTCATTGTGACTGGTGTATGATGGTATATCGGTGTGATTTTAATTTGCATTCCTCTTCTGATTAGTGATGCGGAGCATTTTTTCATGTGTTTGTAGGCTGCCTGTATTTCTTCTTTTGAGAAATATCTCTTCATGCTCCTTGCCCAGTTTTGTTTGTTTGTTTTGTGGAGACAGTCTCGCTCTATCCAGCAGGCTGCAGTTCAGTAGCCTGATATCGGCTCATTGCAACCTCCGCCTCAGGAGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGTCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACAGGATTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTAGAACTCCTGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCTTTGCCCCATTTTTAATGGTTTTTTTTTTTCTTGTTGTTTTGCAAAGTACTTTAATCATCTCAATTAGCAAGTAAGAATTTCCCAACTACTAAATCATTCCTACATATGAAATATATTCAGCCGGTTGGGCATGGTCTGAATATATACATTCGGCCTATTAATGTGGCAAACCTGAAGTTCTCTTCAGTGTTTCAATACTGAATAAAAATAAATTATAAATTATAATTTGTCTTATAGCAACACATCTAAAACAGTTATTATTATTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGGGGGAGTGCAGAGGCACCATCACTGCTTACTGTAGACTCAGCCTCTCTGGGATCAAGGGATTGTCCCACCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGTGCCACCTAGTCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGGGATAGGGTTTTATCATTTTGCCCAGGCCAGAAGGATTGCTTGAGACCAGCTTGGGCAACATAACGAACCCTTGTCAGAAAGGGAAGGGGAAAAGAAAGGAAAGGAAAAGGGAAAGGAAAAAAGAAAGGAAGGAAGAAAGAGACAAATATAATTGTGTTATTTAGAGAACAGAGGCATCACTGGGCATGGTGTCGGGAGCTTGTAGTCCCAGCTACTGGGGGAGCTGAGGAGGGAGGATCTCTTGAGCCCAGGAGATGGAGGCTGCAGTGAGCTATAATCACACCACCGCCCCCTAGCCTGGGTGACACAGAGAGACCCTGCAGCAAATTTTAAAAATTAAAAATAAAAAAGAGAATAGAGATGTCAAAAATTTTCAAGGAATCTCATCTTGTGTCCAAACCACGAGAACTATCTGTGGTTAGGTGTGTTCATGGCTGCATTAATTAAAAGCGTGCTATAGTCCCACTACTGGGGAGGCTAAAGAGGGAGGATTTTTTTGAGCCCTGGAGTTCGAAGCCAACCTGGGCAACATAGCCAGGCCCCATAACTTTTTTTCTATCCATTTTTTTTTTTTACTATGCAAATCTCACTACACAGACCCTATAACAGAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAGAAAAAAGGCGGGCGCTTATTCTGCTCTGTACTCAGCAGTCTCAGGCAAGTGACAGAATAATCTGAAAACCTGGTCCAGAGGGAGGAAACGTAGTGGCCAGGGATCAGAAGCGCGTGAGGGACCTATGAAGTATTCATTCTGCAAGTATTAGTTCTTTCCTCTGGGAGAGATACTGGGCTTGCCCACGCCTTCCTGAGTCCATGGTTAAGACTCCCGCTGGGCACCAGCGGATTCCTGGTGCCCAGAGCCCGGTTCCTCCTACCGGGTGCGCTGGGAAAAGGGCTGCTCCTGACAGAAGGGACACTCTAAGAGCAGCCCAGGAACCGGTGCACTTGGGCGGCCTCGGAAGAAGCCGGGGCTCCTGGAGGCGGAGGCGAGGCCTGGGACCCAATAAGAAGGGCGCGGCTAGAGAGGAGGGGCTGGCCAAAAGCCCTTGAAATAAGGCCCAGGCAGAACCGCGGTTCTAGTCTCCCAGCTCCAGCTCGGCCTTTGGGTTTGCTGTGGTGTCCTTGTCTCCTGCAGGACCGGCCGCAGCATGGACGCTCCCAGGCGGTTTCCGACGCTCGTGCAACTGATGCAGCCAAAAGCAATGCCAGTGGAGGTGCTCGGTCACCTCCCTAAGCGGTTCTCCTGGTTCCACTCTGAGTTCCTGAAGAATCCGAAGGTAGTTCGCCTTGAGGTTTGGCTGGTGGAAAAGATCTTCGGTGAGTGGACCAAGAAGGGGCAGCCCCCATGCGGCTTCTTTCTGCCACCCATACCCACAGCCCACATATTCTGGCTGCGTTCCAGGGCGATCCTCACCAGTAGCCAATGCCCTCTGGCTGTCTCCTCCTTCCACCTTCCCCTCCCAAGACCCCCGGGAGCCACCGGTCCCTCACAGCCTCTCTGCTACCCGCGCAGGCCGGGGCGGAGAACGCATCCCGCACGTCCAGGGTATGTCCCAAATCTTGATTCACGTGAATCGATTGGACCCTAACGGCGAGGCTGAGATCTTGGTATTTGGGAGGCCTTCTTACCAGGAGGACACAATCAAGATGATCATGAACCTGGCTGACTATCACCGCCAGCTCCAGGCGAAAGGTACGGGGCTGGGAATAGGGCTACCTGGAGCAAACCCTGGCTCCGTAGGAGTGATCCTGGGGTTTCCTGGCTGCTGGGGCGGCAGTCTCGCCCTCCCAGTCGGCCTGCGGTTGGTGGGTGGGGGAGGGGGCGGTTCTCGCTGCCACGGATCCAGAAGGCCAAATTGAACCCTCGTTCTGGGATTTCTGGCTCCTACTCCCGCAGGCCGCTTGGGTGACTGTCCTTTTTTGGAGAGGATATAGAGACACAGCTGTGGCCTCTGCACACTGCTCTTCTTCCAGGCTCAGGAAAGGCCCTCGCCCAGGATGTCGCCACTCAGAAGGCCGAGACCCAGCGGTCTTCAATAGAAGTCCGGGAGGCCGGGACGCAGCGTTCGGTGGAGGTCCGGGAGGCCGGGACCCAGCGTTCGGTGGAAGTCCAGGAGGTCGGGACACAGGGTTCTCCGGTGGAGGTGCAGGAGGCCGGGACCCAGCAGTCTCTCCAGGCTGCCAACAAGTCGGGGACCCAGCGATCCCCCGAAGCTGCCAGCAAGGCAGTGACCCAGCGGTTTCGCGAGGATGCCCGGGACCCAGTTACTAGATTATGAAGGCATCTCAGGCCCTGGAGCCAGAGCCAGTCAGGGGTTAAAGTGAAAGCCCGTATTTCCGCCCAGAAGCTGGGGTTGGGGAGAGGATGTGGATTTTTTGTTTTACCCTTTCTGTTGCATGGTTGCAAACACAAACTTGAGTTCTAATAAAGAATTGCAAAGTGGAAGCCCGCCCCCCGCCTCCCCCCCGCCTCACTTAAGTCCAGGAAGCTGGGGTGGCGAGGAAGGATGATGTGGATTGTTTTTGTTTTACACCTTCTGTTGAATGGTTGCCAACACAAACTTGAGTTCTAATAAATAATTGCATTTCCCTAACGTCTGTATTTTGGAAGGTAGAGGGGAGGGAAAGGCGCATTCCTCCAACAGCCCAGTTCTGCCCTGCGCAGCCCTCTACCTCGAGGCAGGTGGGGCCTGTGGTTCCTAGCCGCCCGAGGTGGCCATCTTCCCCGGCTGTGGTCCGGTGTGCCCCTTGTACTCCTTAACCGCGCGCATCTGGCTTTAACAGGTGAGAAGCCTCTCTGGCCCACTAGGAAATCTCTCCAAGCCCGCTGTCGTTCTACTCAAGGTGACTTGGGATGAGAAAACTGGGTCGCTTGGGGGCCAGCTGGATTTGGAAGGCCCTGGGTGTATTGCTACTCTGTCACAGAACACTTTCTCAGCTGGGGAAAATGACATCGGGGAAGGGGGAAACGAAGAGACCCGAGCTGCACTCTTGGGCTGCACTGTTGCAGTCTTCAGGTCTTGCTTGGGTCACCCACCTTCCACGAAGGTCGTGGACACCAGCAAGATACAGGCATCGGCTACTCTTTCCTCAGTTACTATGGCAGCGAGAAGCCCCAGCAGAGAACACTTTGGCTTCCCTAGGGTCACAGCTTTGGTCAGGGCGCTGGGATGCAGGTCCCTGAGCCTGCGAATTAAT
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Here is a mutation in MTO1 (mitochondrial tRNA translation optimization 1) on Chromosome 6. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Mitochondrial hypertrophic cardiomyopathy with lactic acidosis due to MTO1 deficiency
ACAGAGTTTTACCATGTTGACCAGGCTGTTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACACACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACGGCGCCCAGCCCAAACAAAGCAAGGAGTCCCTGGGTGGGCACAAAAACACTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAATCTCGCCCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTCTTTTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTTCTGACCTCGTGCTCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGATATTACAGGTGTGAGCCACTTGCACTTGGCAATAACTTTTTTAAAAAAGTAACCATGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCGCCTGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCCGAACGTAGTGGTGCATGCCTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGACACAGAGGTTGGAGTGAGCTGAGATCACGCTACTGCCCTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAATAAAAACATTAAAAAAAAATTAAACTGCTAGTTAGATTTAGAGTTTTGCTTAAATTTAACTTCATCTTTTGGGATGTTTATTTTTGGCAAGAATACTTCATAAGTAATACTAGGCATTATGCACAAGTTTAGTGTCTATTAAAGTCAGTACGTATCATGTGGAATTTATTTGGATAAGAGAGAAACTAGTAGATAAGCAAATCAGTATTGCATCTGGTTACTGTTTTTTAGCCAGAAGATCAGCTGCCATGTTACTTGACTCACACCAACCCTAGAGTGGATGAGATTGTCCTTAAGAACCTTCACCTTAATAGTCATGTTAAAGAAACGACAAGAGGACCTCGGTAAGGACAAAATGTCAGTGCTCAGTTACTTTAAGGAATGACGTCAATCCTCTTTTGTTCATTTCAAGTTTATTTAAATGTTCTATTCTAGATACTGTCCCTCCATTGAATCAAAAGTTTTGCGTTTTCCAAACCGTCTACATCAGGTTTGGTTGGAACCTGAAGGAATGGATTCTGACCTTATCTACCCACAGGGGTTATCTATGACGCTACCAGCTGAGTTACAAGAGAAAATGATCACATGCATCAGAGGCTTGGAGAAAGCTAAAGTGATTCAGCCAGGTAAAGAAGATCACAAGTGCCCTTCAGTATAAGGTCAGCATTGTTTTAATGGTCAGTGAGGAGGCCTTAGCTACAGTCATTGTTGTTCAGAGCCTCAGAAGATGAAGCCCAACACCTATACATTTTAAATAGTCTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGATGGAGTGCAATGGTGCGATCTCGGCTCACCACAACCTCCCCCTGCCAGGTTCGTGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGATTACAGGCATGCATCACCATGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCCTGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCCCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAGCCACTGCTCCTGACCTAAATAGTCTGTTTTTAAAGGGCATTTAAGGGTAATGCTTGCATCTCTACCTTGAGCAAATCCAGCTCTGTATTTACTTATTTAATGTCTTTGTTCTTTGGTCAGGCTACGGTGTTCAGTATGATTACTTAGATCCCCGTCAGATCACCCCTTCCTTGGAGACTCATTTGGTTCAACGACTCTTCTTTGCTGGACAGATCAATGGCACCACTGGTTATGAGGAAGCTGCAGCTCAAGTAAGAAGTTAAGATATTAATGTAAACTGAAAGGGACTATTTAACTGGTATTTCTCCTTTTAATGTCTGTTGTGTTAACTATGTAGATCTTAGATACAATTCATACTAATAGAAGACAATTTATGTTTCAGGGTGTTTGGAGATGGCTTTTGTAGATAATAGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTGTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGATATGATCTCCCAGCTTCAAGCGATCCTCCTGCCTCAGCCCTCCCTAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGCACCACAACACCCAGGTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGATATGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCTTGCCCAGCCAATAATAGGATTATTAAAACACTATGGCTTTATTACTCTTTTCTGAGCTCCTGTGTGATATCATATTTTGATTAGATGTATTGCTTGTGAAGTTTAAAATTTATTTTAATATACTTCATTAGAAATTATTATATTATTATTCCTTGTAAGTCAGAAATTATTTTATTTTTATTTGCAAGTGGGAAAAGGCTAGAGAAGTTTCACAGGTGGGTTTTAAAAAAAAGATTAACCGGCTGGGCATGGTGCGTCACACCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGAGAGAGAATTGCTTGAGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGAGTGATGTAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAATATGTAAAAATTAGCCAGGTGTGACGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGGGGATGAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAAGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATTATGCCATTACACCCCAGCCTAGGTAACAGGGGAAGACCCTGTCTCCGGATAAAAAAAAGATTAGTCCCCGCAGAGTGCAGCTTATCAGGAAGATTAGATGGATATCTCTGAAAACAATGAATCATAGCCTTCTAAAGTGATATATTACCCATATTCTATTTCTGAATATGGATCACATTTTCTACCTCTATTATATCCCTTAGGGGCAATACTTGCTTTCTTCCTGTCCCATGCCATTGTTTCTGAGTAGTGTTCTGAATGGGATAGCCGTTTGTTTAGTTCATAATGGCCTTTTAAACATTTCAGTGCTCTTGTAGGGTGTGATAGCCGGAATCAACGCCAGTCTTCGGGTCAGTCGCAAGCCTCCCTTTGTGGTTAGCCGAACAGAAGGTTACATAGGAGTCTTGATTGATGACCTCACTACTCTGGGCACCAGTGAACCATACCGCATGTTTACCAGCCGAGTAGAGTTCCGTTTGTCACTGCGCCCTGATAATGCTGACAGCCGGCTCACACTGCGAGGTAACTCTTTCCTGAGTCCTGCAATCCAGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTATAATCCAAGCAATTTGAGAGACCAAGGCAAGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTAGGACTAGCCTGGGCAACATAGTGAGACACTGTCTCTACAAAAAAATTTGCTTTAAAAACCACACTTCTCATTATATTCTCTTTCTCCCTTCCCTAGGGTATAAAGACGCTGGCTGTGTGTCCCAACAACGATATGAAAGAGCTTGTTGGATGAAGTCTTCTTTAGAAGAAGGCATTTCTGTGTTGAAATCTATTGAGTTTTTGAGCTCTAAATGGAAAAAATTAATCCCAGAGGCTTCTATAAGTACTAGTAGAAGTCTGCCTGTCAGGTATGCATTTTTAATATAGACCTTTCTCACTTTTTATAGAAAAATAAGATCATAAGATCATTTCATAGAGACATTACCTATGTGTTCCTACCTACACATTTCAAATGAATGTAGCTTGTTTTTGGCTTCTTTTCAAAATCCGTTAGCTGTAACTCATCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTCGC
ACAGAGTTTTACCATGTTGACCAGGCTGTTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACACACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACGGCGCCCAGCCCAAACAAAGCAAGGAGTCCCTGGGTGGGCACAAAAACACTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAATCTCGCCCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTCTTTTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTTCTGACCTCGTGCTCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGATATTACAGGTGTGAGCCACTTGCACTTGGCAATAACTTTTTTAAAAAAGTAACCATGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCGCCTGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCCGAACGTAGTGGTGCATGCCTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGACACAGAGGTTGGAGTGAGCTGAGATCACGCTACTGCCCTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAATAAAAACATTAAAAAAAAATTAAACTGCTAGTTAGATTTAGAGTTTTGCTTAAATTTAACTTCATCTTTTGGGATGTTTATTTTTGGCAAGAATACTTCATAAGTAATACTAGGCATTATGCACAAGTTTAGTGTCTATTAAAGTCAGTACGTATCATGTGGAATTTATTTGGATAAGAGAGAAACTAGTAGATAAGCAAATCAGTATTGCATCTGGTTACTGTTTTTTAGCCAGAAGATCAGCTGCCATGTTACTTGACTCACACCAACCCTAGAGTGGATGAGATTGTCCTTAAGAACCTTCACCTTAATAGTCATGTTAAAGAAACGACAAGAGGACCTCGGTAAGGACAAAATGTCAGTGCTCAGTTACTTTAAGGAATGACGTCAATCCTCTTTTGTTCATTTCAAGTTTATTTAAATGTTCTATTCTAGATACTGTCCCTCCATTGAATCAAAAGTTTTGCGTTTTCCAAACCGTCTACATCAGGTTTGGTTGGAACCTGAAGGAATGGATTCTGACCTTATCTACCCACAGGGGTTATCTATGACGCTACCAGCTGAGTTACAAGAGAAAATGATCACATGCATCAGAGGCTTGGAGAAAGCTAAAGTGATTCAGCCAGGTAAAGAAGATCACAAGTGCCCTTCAGTATAAGGTCAGCATTGTTTTAATGGTCAGTGAGGAGGCCTTAGCTACAGTCATTGTTGTTCAGAGCCTCAGAAGATGAAGCCCAACACCTATACATTTTAAATAGTCTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGATGGAGTGCAATGGTGCGATCTCGGCTCACCACAACCTCCCCCTGCCAGGTTCGTGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGATTACAGGCATGCATCACCATGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCCTGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCCCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAGCCACTGCTCCTGACCTAAATAGTCTGTTTTTAAAGGGCATTTAAGGGTAATGCTTGCATCTCTACCTTGAGCAAATCCAGCTCTGTATTTACTTATTTAATGTCTTTGTTCTTTGGTCAGGCTACGGTGTTCAGTATGATTACTTAGATCCCCGTCAGATCACCCCTTCCTTGGAGACTCATTTGGTTCAACGACTCTTCTTTGCTGGACAGATCAATGGCATCACTGGTTATGAGGAAGCTGCAGCTCAAGTAAGAAGTTAAGATATTAATGTAAACTGAAAGGGACTATTTAACTGGTATTTCTCCTTTTAATGTCTGTTGTGTTAACTATGTAGATCTTAGATACAATTCATACTAATAGAAGACAATTTATGTTTCAGGGTGTTTGGAGATGGCTTTTGTAGATAATAGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTGTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGATATGATCTCCCAGCTTCAAGCGATCCTCCTGCCTCAGCCCTCCCTAGTAGCTGGGACTGCAGGCATGCACCACAACACCCAGGTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGATATGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCTTGCCCAGCCAATAATAGGATTATTAAAACACTATGGCTTTATTACTCTTTTCTGAGCTCCTGTGTGATATCATATTTTGATTAGATGTATTGCTTGTGAAGTTTAAAATTTATTTTAATATACTTCATTAGAAATTATTATATTATTATTCCTTGTAAGTCAGAAATTATTTTATTTTTATTTGCAAGTGGGAAAAGGCTAGAGAAGTTTCACAGGTGGGTTTTAAAAAAAAGATTAACCGGCTGGGCATGGTGCGTCACACCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGAGAGAGAATTGCTTGAGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGAGTGATGTAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAATATGTAAAAATTAGCCAGGTGTGACGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGGGGATGAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAAGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATTATGCCATTACACCCCAGCCTAGGTAACAGGGGAAGACCCTGTCTCCGGATAAAAAAAAGATTAGTCCCCGCAGAGTGCAGCTTATCAGGAAGATTAGATGGATATCTCTGAAAACAATGAATCATAGCCTTCTAAAGTGATATATTACCCATATTCTATTTCTGAATATGGATCACATTTTCTACCTCTATTATATCCCTTAGGGGCAATACTTGCTTTCTTCCTGTCCCATGCCATTGTTTCTGAGTAGTGTTCTGAATGGGATAGCCGTTTGTTTAGTTCATAATGGCCTTTTAAACATTTCAGTGCTCTTGTAGGGTGTGATAGCCGGAATCAACGCCAGTCTTCGGGTCAGTCGCAAGCCTCCCTTTGTGGTTAGCCGAACAGAAGGTTACATAGGAGTCTTGATTGATGACCTCACTACTCTGGGCACCAGTGAACCATACCGCATGTTTACCAGCCGAGTAGAGTTCCGTTTGTCACTGCGCCCTGATAATGCTGACAGCCGGCTCACACTGCGAGGTAACTCTTTCCTGAGTCCTGCAATCCAGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTATAATCCAAGCAATTTGAGAGACCAAGGCAAGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTAGGACTAGCCTGGGCAACATAGTGAGACACTGTCTCTACAAAAAAATTTGCTTTAAAAACCACACTTCTCATTATATTCTCTTTCTCCCTTCCCTAGGGTATAAAGACGCTGGCTGTGTGTCCCAACAACGATATGAAAGAGCTTGTTGGATGAAGTCTTCTTTAGAAGAAGGCATTTCTGTGTTGAAATCTATTGAGTTTTTGAGCTCTAAATGGAAAAAATTAATCCCAGAGGCTTCTATAAGTACTAGTAGAAGTCTGCCTGTCAGGTATGCATTTTTAATATAGACCTTTCTCACTTTTTATAGAAAAATAAGATCATAAGATCATTTCATAGAGACATTACCTATGTGTTCCTACCTACACATTTCAAATGAATGTAGCTTGTTTTTGGCTTCTTTTCAAAATCCGTTAGCTGTAACTCATCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTCGC
Task1_train_10563
A change on Chromosome 6 affects gene SLC17A5 (solute carrier family 17 member 5). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Salla disease
TTCCAAAACTAACATCAGCTCGTAACTCAAATAGGTCAAGTAAATCATACCAACTTGAAAAACAGGTTATCAGGAAGTGTTTCAGAACTGTGGTTCAGTGATTTGGAAGATATATTTTTAAAACATTATTAGGCTACTATTATTACATTTTGAATTTGTTACATTATAATTTAGTTAAAATTTTAAACTTACCAAAAAAGTAGAAGACATAAGTCCAATTCATATAGTAGCAAATTATTCCAGAAAGAGGAAGAGAAATTACTGTCCCAAGCTGTGCTCCTAGAACAACACATAAGACTATTTTATAAACTTTGGAGAGAGAAACAAGGATAGGACAGACAAGTCTACTGCTTACAGAGGATGGGTAACAGGCTGGGCACAGTGGCTCATTCCTGTAATCCCTGCACTTTGGGAGGCTGATGTGGGTGGATCACCTGAGCCTAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAATATGGCAAACTCCTATCTGTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTATGGTGGTGATGCACGCCTGTAGTACCAGCTACTTAGCTACTTGGGAGGTTGAGGTGGGACGATCGCTTCAGCTGTTGAGGCTGCAGTGAGGGGCGATTGTGCCACTGCCTTCCAGCCTGGAGTGAGACCCTGGCTCAAAAAAAAAAAAAAGGCTAAAATGTGGTCCCATAGAAACAAGATTAGAAAAAAGATATAGAGGTAGTATAACAGGACAAGCAAAGGAATGGAAGTAGTAAAGCAGAGAGTAGGCTTGGGAACTTCATTTGGGTAAAGGAAAGGAAAAGCAGATAAAGCTGGAAAAATAGGTTGGACAGTTGAACAGTTACTGAGTACCTACTCCATGCTAGGCACTATCTGCCAGAGATATAAGGCTAGCTGCAACAAAGTAGTGAAGACTGTAAAGAATCTTGCCCCTAGTTCAAGGAGTTTGGGATTTATTCAATAGGTAAAAGGGAACCTTAGATAGTACCTGTTCTTGAACCTATCATCAGATTTCTCATGTCAATCTCAACATAGCTGCAAGAATAATCTTCTTAAAATGTAATTGAATCATGCCTCTTAAAAAACAATCTACATTTTTTCCTGTAGCCTGTAAGACCTGATATAACCCGGCTCTTATCTCTTTCTCTAACCTCATCTTATGCCATCATCCTCCTTACTCACTGAGTTCTAGCCATCCAAGGTAGTTTTCCACTTCTTTTAACCCTTATGTTATTTCTTGCCTGAGTGCCCTCGTACATGCTGTTCTGATTGGCTGAAATGCTCTTCTCCCTGCATGAATGGTTTGTTCTTATCCTTCAGATTTTAGCTTAAAAGTACCACAGAGAGGCCTTTTCTCAACTACTGTATTTAAAAAGCAGTCCGGTGGAAAAATTTTAATTTAGTCAATGAAAGAAAGGCTAGAATTTCTTATGCAATCTGATAAAATTATAATTCACATATATAAAACTCATGTTATCTCACCTGTAGATCAAAATGATGGCAAATAAAGATGCAATAGAAAAAAGATGCATGAAGAGAGGGGTTGAGAATCATGATACATTCATTAGTTAATCAAAACAGAAATCACAATTTAAGGACAAAAACACTCAATTTTCTAGCTACTGGCCTTTTTTTTTCTTTTTTTTAAATAGCATCTCTAAACAAACAAAAATAAAATTTAAAACCCCCAAAAAAGTAAACAGAAAAAGAAAAAAAATAGCATCTCTATACCAATATCTGAAAACACAACATACTTTGAAATAGATGATGGCAGATGGGGAAAATGACATTAGTCAATTAAGCTGCATTACTATAAGTTGTTGAGCCAAAGAGAAAAATTGGTAATAAAGTTATACTACCGAAACTTAATGTTCTCCCCAAAGGGGCATCCAATCCAACATTGCATCGTTCTGGTATGCAGGCCCTTTTTCCCAAAGGTTGATATATACATAACATATTACAGCAAAATTTGGTAATTGTTATCTCACCTGCATATGAAATGCTAAGAAGTTTGCTTCTTTCAAGAGGGGGAGCCCAAGAAGACCACATGGCATGCATGGCTGGAAATGTAACACCCTGAGAGAAGGGAACATGATATTTCTGATGAAATGTAAGGTAGTTTTGTTAATGCTTTAAAGTAAGTTAAGTATTTTGCTACAAAAGCATTTTCTGGATAAGAATCAAACGAATCAGGTTCCATGAAATGAGAAATTTTTACAGTGTTAAGTGAAAATATCTTATAATGAAGTACTTTCAGAATTTGAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGGTAACGTAGTGAGACACCATCTCTTAAAAAAAAAAAGTAAAACTCCCCAAAGATTCATGGATTTTGGAACTGGTTTTAAGACAACAAGATAAGGGTTACAATAAATCTAAAATAATTGTACTGAGTGAGGACATAAAGGGATCTTGCTCAAGGTTAATTTTACTCATTCACTTTATTAATCACCTGAATGAAAGGGAATATTACTAACTTATAACTTTAAAAAATACTGAGCTAATATTTTGGGATACTGAAAAAAAATTCAAGCTGACAATCAACCAGAAAAACAGTCCTATTAAAAAAAGGATGAATTCAATTAGCATGTTTACAGCCTTTCTTCTTTTTTTTCCTGTGATAACAAGCCTAGTAGATGCCAATTACTGACACGGAGAGCTAACAGGATGTGGAAACAGGGAGTTTCATAGAGACTGGGTAAATGAGGAGATACCACAGGACAGTGAGAGAGAACGGCTCTCCTTGGACACTCTCTGTGTCACTTCAGAAAGATTAGTTAACCTCCCTGAACTTCAAGGCGGTTGCATAATTGTTGTAAAGATAAATGGTAACTAGTGCTATTATTAGTGGAGAGAAGAATAAATGTTTTAATACTTTGTACTTTCCGCTGACTCTTTCAAAAACAAAAACAAAAGGAATTAAAAAAAAGTAATACCAATGGAAGGCAAAGATGATTTAGGTACATTGCAAATCAATAAGAATCTATATGATGGAGCATCCACAGGATGAGTCATTATAGAAGAAAACTTGAGATGTTTGGAAATGCCCACAGAGATTATGTTGTAGAAAACTTTATTATAAAACCTAGGGACAATGTAGGTATATTTATGGTGAATCAGATGGTAGGAATGCAAGATAGTAATCTAAGTGTCCTTTATGAATGAGGAAATGCACCTGTGATACATATTGAAGGGATGAAGAAGGACGAGAGAACCTGAGTATAAATACAACTTAAATTCTATTTAGTTGTTGGCTGGACACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCAGGTGGATCACTTGATGCCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAATATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCACCTACTTGGGAGGCTGAGGAAGGAGAATTGCTTGAACTCAGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAGACTAGAAAAAAATAAATAAATGAATAAATAAAATGTCACCTGAGATAACAGTGGTAATATGATCAATATGCCGTAATGTTAAATTAGTGGCATAAACTGGAAGTAAAATATGGGAATACATTCAGCAAGGAGATTGAATACTAGGATCAGAGAAAATATGCTAGATTTAAGTATATTTTACTTTGTCAAGAAGAACAGGAACCTGGTAATAGAGGAGTAATTTTAATTTTGTGATCAGGAAGGGTTTACTTAATGGACCTCTACTGATAAGAACAAAATAAAAACATTCAGATGAATGAAAAATCTTTTAATAGTACCTGGCAATTTCCAAAGTATTCTAGCAATCCTTATCACATATGAATTTTATATCTAATCTGTGACTGAAAACAGGGAAGGTATTTTAGTCCCAGTTTAAAAAATGATGGGACTGAGATCTAGAGATTAGAGCTTACCTAAGGTTTCACTGTTAGATACA
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Task1_train_10564
Consider a variant on Chromosome 6 in gene SLC17A5 (solute carrier family 17 member 5). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Salla disease
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CCATTTCAGACGAAGCACTTAAACAAGCACATGGAACAATTCCAAAGAGCAAGAATTTAAATCAAGCCACAAACTTCATGTGAATAGAACCTGTGTTTTCATTAGTAACAGCACACAGCAAGGTACTAATGAAGATTTAGTGACTGATCTGAGTATCTGACATTTTTAATGCAGTGTAGCTGTATAACAAAGCCAACATGTCAAGAACCATTCCGGGATTTCTTTCTACTGCTGATATAAGGCAGATGAAGATAAGTAGCAGGGTCAACAAAAGCACTTTGCAAAGAAAAAGACACAAAGCAAACTCTTACTTTTCCTTATTTAGGGTACCAATTTGCAGTTTATCTGTGGAATTCTAGGATTTCATGTACATTCCAGCAGTATTGTCCCTGAAGGTCACAGGTTGGAGTGGAGAAAGTGAGTGATGTGTACCCAAATGTTACTCAGCAACATTATTAAAGTCAAATATAAAGATTTTCGGAGAGATTTATTTTGTTTAGAGAGAAACCCTCTTTCCTGCTTGAATGCTCTGCTTGTGAATGATAGAGGAGATTCATCTAAGTATGAACTAGTATCTTCGTGAGCACTGAAAATGGGTGAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTTTTGAGACGGAATCTCGCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAGGCTCCACCCCTTGGGGTTCACACCATTCCCCCGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCCACCACCTCGCCCGTCTAATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCATGTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAAAATTTATTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACGAAGTCTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGGAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAAACTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGTGTGTGCTACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACAGGGTTTCACCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTACTCACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACTGCACCCAGCCTGCAAATGTACTTCTAAAAAGAATACTAGCTTTTCTTTCTGTACTATCTCCTCGTGTGATAAGCAACATAAAATGAAGTATATATAACTTAATTATAAACAAATGATGAATACACATTTATTAATACCACTATAACATAAGGCAGGCAAAATGACTTATGTGGCTTAGGTTGGGCATGTGTACATTCAGAAAAGAATGTCCTAAGAAACTGGCCAGTTCTTGTTTTTCATCTTGCAACTGAGATTACCTAAACTCTCTTGCAGCTGTAACTCTATAAGTGATATAGGGTTATAAATAATACTCCTATAAAAGCTATTTAGAAAATTTAAAACAGTTTAATTTTCTGTTATATAAAACAGGTTTTTCCAAATTTTCTTTAAGCATGGTATGTTTATAGAGGGAATGGAAGAACTACTTTTCAAACAGATGAAGGTGTATTACGGCATAGCAGTAGTAGCTATAGTTACAAGTTATTGCCCAATCAGTTCCTGGGAAAACACAAAAAGAAAGTGATTCAGAGTATACACAAACAAAGTATAGTTTCTGTAGGATGAAAAAAGACCTTTTAATATTTTTACTTGCAAGTATTTTAGGATAATTAAAATTGTTTCCTTAAAAAATAGCACCTACCGTTTGATTATGATGAACTTTTATGGGAGCAGAATGCTCTGGACACGCCTTGGAAGTTCTATTATCTTCTAAAGTTGTATTTGAATCTACCATATCCACTAACGCAACACTCAGATTCACACGTAATGCATACACAATGAAGAAACCAAAAAAGGCCAAAATTGCTAAGTTGTAACAAGCAGAGCAGCACACTGGAGCTGAAATAAAGATTGGGGAAAATTTTTATTTATTTTTAAATTTTTATTTTTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGCTTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCATTGGCCACCATACCCGGCTGCTTTAATTAAAAAAGTTAATTACATGATATTGTCTAAATAATGAAAAAGGTTGCTTTTTAAAAGTACAAAAATAATTATGAAAAAATGTTAAAGAATATTCTTAGATTAAGCAAATCTAAGAAACATTTGTCAAAGATTAGCTGTTTCTCATATCTGTAGTTTTGGTAAAAATTTCACACATGAGAGCCTGAACTATAAAAAAGTTCATTAAAACATGGAGGTAGTAGTTTTATCACCTTTGCTGAGAAAAAGATCTATTCCAGATTCAAACTGAACCCCTACTCCTTGTCAGCTGGCAAAGATATACGGCATGAGAAAAGCAGGTAAGGAGGTTTAATGGCATTACTATTTCTGAAAAACTATCTGAAACATGGTCAATAAGTACTTGAGTACTTACAATGACATGATATATTACTGATTATGAGTTAGTAGCCATCTCATTGTTAAATGTAGCATAGCAAAAAAAATTTACTGCCAAGGGTAGGGCATGAAATTTCTCTTGATAAATTTCTTACCTCGAAGAGTATCCTCAAAGGCTGGGTTTGAATCAGAAGCCATGATTAATACTTAAAGCCATCGTAAACTAAATGCATTTAAGAATCTAGAAGCAAACTTGCAGAACCTATGACAGTTGCAGCATCTGTGACAGTTGCTCAGTAGTTATCAAGCGTAAAGGGCTCACAGTAAAAAGGGAAATCAGTGAATGTACCACCATGATTAAAAAAAAAGGATGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTCGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGCGAGAGGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGACAGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCAGAGTAGGTTGGAGGAACCAATAAAAGGATCATGTGAGAGGAGGAGTTTGACCTATTTATTACTCTAACTGTGGGCTTATGCATAGTTTCTCTTTTTTCTTCTTTTATTGAGTTGCAGAATTGGAGAGGGATAGGATTCAGGATGCTGACTAAGGATAATCAACCTCTTAGTAACAAAGAGAAATTAGCTAATCCAGAGTCTGAACATCTTTAAGTTTAGTAAACTCTGAGTGGCTGATAAATACCTCTTTAAAGATATAAACATGTATTTCATTAAGCAATGACATATTAAAATTAAATGAAAATATGTGTGCTTTTATTTGGTAATGACACATCAACATCATATAAATGTGTGTATGTTTTTCCCCTACTTAAGAATCCTGGTGTTTTCATTAACCTAGCATCAAAGGAGAGAATATATTTTACAGAATACAAAAGTCTTGATACTGGCTCAGATGAACTGATTTAGACTGAAACATTAATGAATATGCACAACTATACTTAGGTTTATATTAATATATTATGATCCAACTCACTTTTCTGTATGCCCTCCTATGTTTAACAACTGCTATTATTTTTTTTTCCCTGTGTAAGATTAACTTCTTTTAACAGGAAACTTTTCATTTGGCATTCTTAAATCCTTTCTTCAGGGGTACAGCTATGAAATTTATGGTACCACTACCATAGTTAGATCCAGATCTGTAAGAACTGAATTTCTAAAGTTCTATTCACATTGTCTCTATTACTAGAATCTAGGCGAATTTGCTTTCTGCTGCAACCAAATGGGCAGTTGTCCAGTTAATGACGGTTTG
Task1_train_10565
Assess the clinical impact of this variant on gene SLC17A5 (solute carrier family 17 member 5), found on Chromosome 6. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Sialic acid storage disease, severe infantile type
CCATTTCAGACGAAGCACTTAAACAAGCACATGGAACAATTCCAAAGAGCAAGAATTTAAATCAAGCCACAAACTTCATGTGAATAGAACCTGTGTTTTCATTAGTAACAGCACACAGCAAGGTACTAATGAAGATTTAGTGACTGATCTGAGTATCTGACATTTTTAATGCAGTGTAGCTGTATAACAAAGCCAACATGTCAAGAACCATTCCGGGATTTCTTTCTACTGCTGATATAAGGCAGATGAAGATAAGTAGCAGGGTCAACAAAAGCACTTTGCAAAGAAAAAGACACAAAGCAAACTCTTACTTTTCCTTATTTAGGGTACCAATTTGCAGTTTATCTGTGGAATTCTAGGATTTCATGTACATTCCAGCAGTATTGTCCCTGAAGGTCACAGGTTGGAGTGGAGAAAGTGAGTGATGTGTACCCAAATGTTACTCAGCAACATTATTAAAGTCAAATATAAAGATTTTCGGAGAGATTTATTTTGTTTAGAGAGAAACCCTCTTTCCTGCTTGAATGCTCTGCTTGTGAATGATAGAGGAGATTCATCTAAGTATGAACTAGTATCTTCGTGAGCACTGAAAATGGGTGAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTTTTGAGACGGAATCTCGCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAGGCTCCACCCCTTGGGGTTCACACCATTCCCCCGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCCACCACCTCGCCCGTCTAATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCATGTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAAAATTTATTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACGAAGTCTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGGAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAAACTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGTGTGTGCTACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACAGGGTTTCACCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTACTCACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACTGCACCCAGCCTGCAAATGTACTTCTAAAAAGAATACTAGCTTTTCTTTCTGTACTATCTCCTCGTGTGATAAGCAACATAAAATGAAGTATATATAACTTAATTATAAACAAATGATGAATACACATTTATTAATACCACTATAACATAAGGCAGGCAAAATGACTTATGTGGCTTAGGTTGGGCATGTGTACATTCAGAAAAGAATGTCCTAAGAAACTGGCCAGTTCTTGTTTTTCATCTTGCAACTGAGATTACCTAAACTCTCTTGCAGCTGTAACTCTATAAGTGATATAGGGTTATAAATAATACTCCTATAAAAGCTATTTAGAAAATTTAAAACAGTTTAATTTTCTGTTATATAAAACAGGTTTTTCCAAATTTTCTTTAAGCATGGTATGTTTATAGAGGGAATGGAAGAACTACTTTTCAAACAGATGAAGGTGTATTACGGCATAGCAGTAGTAGCTATAGTTACAAGTTATTGCCCAATCAGTTCCTGGGAAAACACAAAAAGAAAGTGATTCAGAGTATACACAAACAAAGTATAGTTTCTGTAGGATGAAAAAAGACCTTTTAATATTTTTACTTGCAAGTATTTTAGGATAATTAAAATTGTTTCCTTAAAAAATAGCACCTACCGTTTGATTATGATGAACTTTTATGGGAGCAGAATGCTCTGGACACGCCTTGGAAGTTCTATTATCTTCTAAAGTTGTATTTGAATCTACCATATCCACTAACGCAACACTCAGATTCACACGTAATGCATACACAATGAAGAAACCAAAAAAGGCCAAAATTGCTAAGTTGTAACGAGCAGAGCAGCACACTGGAGCTGAAATAAAGATTGGGGAAAATTTTTATTTATTTTTAAATTTTTATTTTTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGCTTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCATTGGCCACCATACCCGGCTGCTTTAATTAAAAAAGTTAATTACATGATATTGTCTAAATAATGAAAAAGGTTGCTTTTTAAAAGTACAAAAATAATTATGAAAAAATGTTAAAGAATATTCTTAGATTAAGCAAATCTAAGAAACATTTGTCAAAGATTAGCTGTTTCTCATATCTGTAGTTTTGGTAAAAATTTCACACATGAGAGCCTGAACTATAAAAAAGTTCATTAAAACATGGAGGTAGTAGTTTTATCACCTTTGCTGAGAAAAAGATCTATTCCAGATTCAAACTGAACCCCTACTCCTTGTCAGCTGGCAAAGATATACGGCATGAGAAAAGCAGGTAAGGAGGTTTAATGGCATTACTATTTCTGAAAAACTATCTGAAACATGGTCAATAAGTACTTGAGTACTTACAATGACATGATATATTACTGATTATGAGTTAGTAGCCATCTCATTGTTAAATGTAGCATAGCAAAAAAAATTTACTGCCAAGGGTAGGGCATGAAATTTCTCTTGATAAATTTCTTACCTCGAAGAGTATCCTCAAAGGCTGGGTTTGAATCAGAAGCCATGATTAATACTTAAAGCCATCGTAAACTAAATGCATTTAAGAATCTAGAAGCAAACTTGCAGAACCTATGACAGTTGCAGCATCTGTGACAGTTGCTCAGTAGTTATCAAGCGTAAAGGGCTCACAGTAAAAAGGGAAATCAGTGAATGTACCACCATGATTAAAAAAAAAGGATGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTCGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGCGAGAGGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGACAGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCAGAGTAGGTTGGAGGAACCAATAAAAGGATCATGTGAGAGGAGGAGTTTGACCTATTTATTACTCTAACTGTGGGCTTATGCATAGTTTCTCTTTTTTCTTCTTTTATTGAGTTGCAGAATTGGAGAGGGATAGGATTCAGGATGCTGACTAAGGATAATCAACCTCTTAGTAACAAAGAGAAATTAGCTAATCCAGAGTCTGAACATCTTTAAGTTTAGTAAACTCTGAGTGGCTGATAAATACCTCTTTAAAGATATAAACATGTATTTCATTAAGCAATGACATATTAAAATTAAATGAAAATATGTGTGCTTTTATTTGGTAATGACACATCAACATCATATAAATGTGTGTATGTTTTTCCCCTACTTAAGAATCCTGGTGTTTTCATTAACCTAGCATCAAAGGAGAGAATATATTTTACAGAATACAAAAGTCTTGATACTGGCTCAGATGAACTGATTTAGACTGAAACATTAATGAATATGCACAACTATACTTAGGTTTATATTAATATATTATGATCCAACTCACTTTTCTGTATGCCCTCCTATGTTTAACAACTGCTATTATTTTTTTTTCCCTGTGTAAGATTAACTTCTTTTAACAGGAAACTTTTCATTTGGCATTCTTAAATCCTTTCTTCAGGGGTACAGCTATGAAATTTATGGTACCACTACCATAGTTAGATCCAGATCTGTAAGAACTGAATTTCTAAAGTTCTATTCACATTGTCTCTATTACTAGAATCTAGGCGAATTTGCTTTCTGCTGCAACCAAATGGGCAGTTGTCCAGTTAATGACGGTTTG
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Task1_train_10566
The gene SLC17A5 (solute carrier family 17 member 5) is located on Chromosome 6, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Salla disease
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CCATTTCAGACGAAGCACTTAAACAAGCACATGGAACAATTCCAAAGAGCAAGAATTTAAATCAAGCCACAAACTTCATGTGAATAGAACCTGTGTTTTCATTAGTAACAGCACACAGCAAGGTACTAATGAAGATTTAGTGACTGATCTGAGTATCTGACATTTTTAATGCAGTGTAGCTGTATAACAAAGCCAACATGTCAAGAACCATTCCGGGATTTCTTTCTACTGCTGATATAAGGCAGATGAAGATAAGTAGCAGGGTCAACAAAAGCACTTTGCAAAGAAAAAGACACAAAGCAAACTCTTACTTTTCCTTATTTAGGGTACCAATTTGCAGTTTATCTGTGGAATTCTAGGATTTCATGTACATTCCAGCAGTATTGTCCCTGAAGGTCACAGGTTGGAGTGGAGAAAGTGAGTGATGTGTACCCAAATGTTACTCAGCAACATTATTAAAGTCAAATATAAAGATTTTCGGAGAGATTTATTTTGTTTAGAGAGAAACCCTCTTTCCTGCTTGAATGCTCTGCTTGTGAATGATAGAGGAGATTCATCTAAGTATGAACTAGTATCTTCGTGAGCACTGAAAATGGGTGAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTTTTGAGACGGAATCTCGCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAGGCTCCACCCCTTGGGGTTCACACCATTCCCCCGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCCACCACCTCGCCCGTCTAATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCATGTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAAAATTTATTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACGAAGTCTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGGAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAAACTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGTGTGTGCTACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACAGGGTTTCACCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTACTCACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACTGCACCCAGCCTGCAAATGTACTTCTAAAAAGAATACTAGCTTTTCTTTCTGTACTATCTCCTCGTGTGATAAGCAACATAAAATGAAGTATATATAACTTAATTATAAACAAATGATGAATACACATTTATTAATACCACTATAACATAAGGCAGGCAAAATGACTTATGTGGCTTAGGTTGGGCATGTGTACATTCAGAAAAGAATGTCCTAAGAAACTGGCCAGTTCTTGTTTTTCATCTTGCAACTGAGATTACCTAAACTCTCTTGCAGCTGTAACTCTATAAGTGATATAGGGTTATAAATAATACTCCTATAAAAGCTATTTAGAAAATTTAAAACAGTTTAATTTTCTGTTATATAAAACAGGTTTTTCCAAATTTTCTTTAAGCATGGTATGTTTATAGAGGGAATGGAAGAACTACTTTTCAAACAGATGAAGGTGTATTACGGCATAGCAGTAGTAGCTATAGTTACAAGTTATTGCCCAATCAGTTCCTGGGAAAACACAAAAAGAAAGTGATTCAGAGTATACACAAACAAAGTATAGTTTCTGTAGGATGAAAAAAGACCTTTTAATATTTTTACTTGCAAGTATTTTAGGATAATTAAAATTGTTTCCTTAAAAAATAGCACCTACCGTTTGATTATGATGAACTTTTATGGGAGCAGAATGCTCTGGACACGCCTTGGAAGTTCTATTATCTTCTAAAGTTGTATTTGAATCTACCATATCCACTAACGCAACACTCAGATTCACACGTAATGCATACACAATGAAGAAACCAAAAAAGGCCAAAATTGCTAAGTTGTAACAAGCAGAGCAGCACACTGGAGCTGAAATAAAGATTGGGGAAAATTTTTATTTATTTTTAAATTTTTATTTTTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGCTTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCATTGGCCACCATACCCGGCTGCTTTAATTAAAAAAGTTAATTACATGATATTGTCTAAATAATGAAAAAGGTTGCTTTTTAAAAGTACAAAAATAATTATGAAAAAATGTTAAAGAATATTCTTAGATTAAGCAAATCTAAGAAACATTTGTCAAAGATTAGCTGTTTCTCATATCTGTAGTTTTGGTAAAAATTTCACACATGAGAGCCTGAACTATAAAAAAGTTCATTAAAACATGGAGGTAGTAGTTTTATCACCTTTGCTGAGAAAAAGATCTATTCCAGATTCAAACTGAACCCCTACTCCTTGTCAGCTGGCAAAGATATACGGCATGAGAAAAGCAGGTAAGGAGGTTTAATGGCATTACTATTTCTGAAAAACTATCTGAAACATGGTCAATAAGTACTTGAGTACTTACAATGACATGATATATTACTGATTATGAGTTAGTAGCCATCTCATTGTTAAATGTAGCATAGCAAAAAAAATTTACTGCCAAGGGTAGGGCATGAAATTTCTCTTGATAAATTTCTTACCTCGAAGAGTATCCTCAAAGGCTGGGTTTGAATCAGAAGCCATGATTAATACTTAAAGCCATCGTAAACTAAATGCATTTAAGAATCTAGAAGCAAACTTGCAGAACCTATGACAGTTGCAGCATCTGTGACAGTTGCTCAGTAGTTATCAAGCGTAAAGGGCTCACAGTAAAAAGGGAAATCAGTGAATGTACCACCATGATTAAAAAAAAAGGATGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTCGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGCGAGAGGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGACAGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCAGAGTAGGTTGGAGGAACCAATAAAAGGATCATGTGAGAGGAGGAGTTTGACCTATTTATTACTCTAACTGTGGGCTTATGCATAGTTTCTCTTTTTTCTTCTTTTATTGAGTTGCAGAATTGGAGAGGGATAGGATTCAGGATGCTGACTAAGGATAATCAACCTCTTAGTAACAAAGAGAAATTAGCTAATCCAGAGTCTGAACATCTTTAAGTTTAGTAAACTCTGAGTGGCTGATAAATACCTCTTTAAAGATATAAACATGTATTTCATTAAGCAATGACATATTAAAATTAAATGAAAATATGTGTGCTTTTATTTGGTAATGACACATCAACATCATATAAATGTGTGTATGTTTTTCCCCTACTTAAGAATCCTGGTGTTTTCATTAACCTAGCATCAAAGGAGAGAATATATTTTACAGAATACAAAAGTCTTGATACTGGCTCAGATGAACTGATTTAGACTGAAACATTAATGAATATGCACAACTATACTTAGGTTTATATTAATATATTATGATCCAACTCACTTTTCTGTATGCCCTCCTATGTTTAACAACTGCTATTATTTTTTTTTCCCTGTGTAAGATTAACTTCTTTTAACAGGAAACTTTTCATTTGGCATTCTTAAATCCTTTCTTCAGGGGTACAGCTATGAAATTTATGGTACCACTACCATAGTTAGATCCAGATCTGTAAGAACTGAATTTCTAAAGTTCTATTCACATTGTCTCTATTACTAGAATCTAGGCGAATTTGCTTTCTGCTGCAACCAAATGGGCAGTTGTCCAGTTAATGACGGTTTG
Task1_train_10567
Here is a mutation in SLC17A5 (solute carrier family 17 member 5) on Chromosome 6. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Sialic acid storage disease, severe infantile type
CCATTTCAGACGAAGCACTTAAACAAGCACATGGAACAATTCCAAAGAGCAAGAATTTAAATCAAGCCACAAACTTCATGTGAATAGAACCTGTGTTTTCATTAGTAACAGCACACAGCAAGGTACTAATGAAGATTTAGTGACTGATCTGAGTATCTGACATTTTTAATGCAGTGTAGCTGTATAACAAAGCCAACATGTCAAGAACCATTCCGGGATTTCTTTCTACTGCTGATATAAGGCAGATGAAGATAAGTAGCAGGGTCAACAAAAGCACTTTGCAAAGAAAAAGACACAAAGCAAACTCTTACTTTTCCTTATTTAGGGTACCAATTTGCAGTTTATCTGTGGAATTCTAGGATTTCATGTACATTCCAGCAGTATTGTCCCTGAAGGTCACAGGTTGGAGTGGAGAAAGTGAGTGATGTGTACCCAAATGTTACTCAGCAACATTATTAAAGTCAAATATAAAGATTTTCGGAGAGATTTATTTTGTTTAGAGAGAAACCCTCTTTCCTGCTTGAATGCTCTGCTTGTGAATGATAGAGGAGATTCATCTAAGTATGAACTAGTATCTTCGTGAGCACTGAAAATGGGTGAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTTTTGAGACGGAATCTCGCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAGGCTCCACCCCTTGGGGTTCACACCATTCCCCCGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCCACCACCTCGCCCGTCTAATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCATGTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAAAATTTATTATTTTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACGAAGTCTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGGAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAAACTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGTGTGTGCTACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACAGGGTTTCACCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTACTCACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACTGCACCCAGCCTGCAAATGTACTTCTAAAAAGAATACTAGCTTTTCTTTCTGTACTATCTCCTCGTGTGATAAGCAACATAAAATGAAGTATATATAACTTAATTATAAACAAATGATGAATACACATTTATTAATACCACTATAACATAAGGCAGGCAAAATGACTTATGTGGCTTAGGTTGGGCATGTGTACATTCAGAAAAGAATGTCCTAAGAAACTGGCCAGTTCTTGTTTTTCATCTTGCAACTGAGATTACCTAAACTCTCTTGCAGCTGTAACTCTATAAGTGATATAGGGTTATAAATAATACTCCTATAAAAGCTATTTAGAAAATTTAAAACAGTTTAATTTTCTGTTATATAAAACAGGTTTTTCCAAATTTTCTTTAAGCATGGTATGTTTATAGAGGGAATGGAAGAACTACTTTTCAAACAGATGAAGGTGTATTACGGCATAGCAGTAGTAGCTATAGTTACAAGTTATTGCCCAATCAGTTCCTGGGAAAACACAAAAAGAAAGTGATTCAGAGTATACACAAACAAAGTATAGTTTCTGTAGGATGAAAAAAGACCTTTTAATATTTTTACTTGCAAGTATTTTAGGATAATTAAAATTGTTTCCTTAAAAAATAGCACCTACCGTTTGATTATGATGAACTTTTATGGGAGCAGAATGCTCTGGACACGCCTTGGAAGTTCTATTATCTTCTAAAGTTGTATTTGAATCTACCATATCCACTAACGCAACACTCAGATTCACACGTAATGCATACACAATGAAGAAACCAAAAAAGGCCAAAATTGCTAAGTTGTAACGAGCAGAGCAGCACACTGGAGCTGAAATAAAGATTGGGGAAAATTTTTATTTATTTTTAAATTTTTATTTTTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGCTTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTATAGGCATTGGCCACCATACCCGGCTGCTTTAATTAAAAAAGTTAATTACATGATATTGTCTAAATAATGAAAAAGGTTGCTTTTTAAAAGTACAAAAATAATTATGAAAAAATGTTAAAGAATATTCTTAGATTAAGCAAATCTAAGAAACATTTGTCAAAGATTAGCTGTTTCTCATATCTGTAGTTTTGGTAAAAATTTCACACATGAGAGCCTGAACTATAAAAAAGTTCATTAAAACATGGAGGTAGTAGTTTTATCACCTTTGCTGAGAAAAAGATCTATTCCAGATTCAAACTGAACCCCTACTCCTTGTCAGCTGGCAAAGATATACGGCATGAGAAAAGCAGGTAAGGAGGTTTAATGGCATTACTATTTCTGAAAAACTATCTGAAACATGGTCAATAAGTACTTGAGTACTTACAATGACATGATATATTACTGATTATGAGTTAGTAGCCATCTCATTGTTAAATGTAGCATAGCAAAAAAAATTTACTGCCAAGGGTAGGGCATGAAATTTCTCTTGATAAATTTCTTACCTCGAAGAGTATCCTCAAAGGCTGGGTTTGAATCAGAAGCCATGATTAATACTTAAAGCCATCGTAAACTAAATGCATTTAAGAATCTAGAAGCAAACTTGCAGAACCTATGACAGTTGCAGCATCTGTGACAGTTGCTCAGTAGTTATCAAGCGTAAAGGGCTCACAGTAAAAAGGGAAATCAGTGAATGTACCACCATGATTAAAAAAAAAGGATGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTCGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGCGAGAGGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGACAGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCAGAGTAGGTTGGAGGAACCAATAAAAGGATCATGTGAGAGGAGGAGTTTGACCTATTTATTACTCTAACTGTGGGCTTATGCATAGTTTCTCTTTTTTCTTCTTTTATTGAGTTGCAGAATTGGAGAGGGATAGGATTCAGGATGCTGACTAAGGATAATCAACCTCTTAGTAACAAAGAGAAATTAGCTAATCCAGAGTCTGAACATCTTTAAGTTTAGTAAACTCTGAGTGGCTGATAAATACCTCTTTAAAGATATAAACATGTATTTCATTAAGCAATGACATATTAAAATTAAATGAAAATATGTGTGCTTTTATTTGGTAATGACACATCAACATCATATAAATGTGTGTATGTTTTTCCCCTACTTAAGAATCCTGGTGTTTTCATTAACCTAGCATCAAAGGAGAGAATATATTTTACAGAATACAAAAGTCTTGATACTGGCTCAGATGAACTGATTTAGACTGAAACATTAATGAATATGCACAACTATACTTAGGTTTATATTAATATATTATGATCCAACTCACTTTTCTGTATGCCCTCCTATGTTTAACAACTGCTATTATTTTTTTTTCCCTGTGTAAGATTAACTTCTTTTAACAGGAAACTTTTCATTTGGCATTCTTAAATCCTTTCTTCAGGGGTACAGCTATGAAATTTATGGTACCACTACCATAGTTAGATCCAGATCTGTAAGAACTGAATTTCTAAAGTTCTATTCACATTGTCTCTATTACTAGAATCTAGGCGAATTTGCTTTCTGCTGCAACCAAATGGGCAGTTGTCCAGTTAATGACGGTTTG
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Task1_train_10568
A change on Chromosome 6 affects gene LOC129996727, SLC17A5 (ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 17338| solute carrier family 17 member 5). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Sialic acid storage disease, severe infantile type
TGCTGTGATAATAGTACTGTAGTTATGTTAAAAAGAGTCCTTATCTTTTAGAGGTAAATAATTGAAATATTTACATATGAAATGACATGGTATCTGGGATTTGCTTCAAAATACACAGTATGTATGAGCATAAGGCAAGACTGGCCATGAATTGATAACTTTAATCTGGGTGCTGGTTACATGGGGGCTCATTATATACTTCTCTTAATTGCCATATATGCTCCTTCTCTATAAAACTTATCATATTCTAAATAGCAAAAACAGTATGTTACTATTATTTCCACTTCACTTGCTCTCCAGTGGGTATGTAAAGAGGGAAAATAAAAAAGGAAATGGTTGTAACAAACGTAGCCACCTAAAGCCAGGAAGGACAGGGCCAGTACCATAAGATCCATACACTCAACACATGAATCAAGTAGGGATTGTTTTTAAAAGGGATGCTATAAGCTACTTTTTTAAAAATCAACTTTATTGAAGTATAATTTACGTGATAAATGTATACATTTGTCCATCTCAATCTTTATTGAGATGTATAACTTTTCTATCCACATCTCTGCTAACATTTGGTATTATCAGCCTTTTGGATTTTAGCTATTCTAGTGGGTGTATAGTGCCTCGTTGTAATTTTAATCTGCATTTTCCTGAGAATAATGTTTAACATTTGTGCTAAATTTTGATTATACATATACATATTTTTCAATTGTAACAATGTAATAATCTCTGGCAAATATCTTTATTATAACTTTTATTTCTGTATTTCTATATTATTTTATGAGGAATATTATACAATTTGAACACTACAAGCCACAGAAAATGATCAGTTTATGGAACTAAGTCCGACTTCCAGGTAAAACGTAACTATGGTATGGTATTTACAGTTTGTGTTGACTAAAATAAGCTCCCGGCTGCCAGATGGAGCTATAAGGTTGCCACCTCTACTGCCACCATCTGGTAACATTAAAAACAAATAAAAATATAGAAACTATACAATTCTGGGTTAGCCAAAGTCAAATTTCCAACACAACTCTTTCTCACGCACAGATCTTTGAAACTATAGAATGCATTCAAACTGATTTGTTCTTTAGTTTTCGTTACTTTTAAATAAACTATATTACAAAAGTGTCAAATAGCAAAATATTTTAATTTTCTCAAATTCAGGGAAGATGCTTTATGACGTACCTGCTTTTCGATTTGTTCCAAGACCTTTGGCAAATTACTTTAGAACTCCATAGGTATCTTGAGGATAACTGAACCTTTTCCTAACTTAAATCATAGACTGCCAGACGGAAAAAAAATGTCCTCGATGTTTTTAGTCTCTTACTGCACAATGTCAAGATATCAGCTGGGTTATACAATAGTTGCCCTCTGCATACTCACAAATGTTAACTCCAGTCCTTTTTTGTCTTCCCTCCCCGCCTAAGAAGCTACCAGGTCACATGCTGGCGGATACGCAGTGGCGGAAACCTAGCGGTGACAGGGAAGGACAGCCCTCTGCCTACTGATCTGCAGGTTTCTCCTCCAGTTTGCTCTTACACCGGGGTCCTCCGCTCGGACCTTAGCCCATTCATTTGATGATTCTCTCCCAGTTCGTTCTTCCACTGGGTCCCTTGCTCAGCACTACCCAAAATAACCACCAGCTCAGCGCCGGCTGCACCGCCGCTCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCGGTGGGGCTGCACCTGCCGAGGCCCCGGCTCGGCTCCGCGATCACGGTCGCGGCCCCCGGGGTTCCCGAGGGGCTTCTGCGCACCGAGGCAGGCGGGACTGAGCGGCACTCTGAACGGGCTCCCCTCTTAATGTCCCCTCGCGCCTGAGCAGCTCCGGTCCCGCCGGCGCAGGGTGCGGGTACCCGGGCCATGCCGGCCCAGAGACCGCCGCCCCCGGTACCGCTGCCCACTCGAAGCCCCTGGACGACCCCGCCGCTTACCGGCTTCGGCCCGTGGGGCGCCCGGTAGAAGAGGCGTGCGGTCCGTGCTCTCCTCGCCATCGTTCCGGGCCAGGTCTCGAACCGGAGACCTCATGACGCCTACGTGAGCAGGTGTACTCGCCACCTGGCAGAGAAGGGAGCGCCGGCCCGACAGCCCGAAGCCCCCGGGCCGAGCTGGCTGGACCGGGCGGGGCGGGGGCGATGACACCGCCCCGCGGCCACGTCTAGTCCCCGCGGTCCCGCCCAGAGGCGGCCGCGCCGACTCCGCCCCCGCCGCCATCTTAGGTGTGGGCAACTCTGGCTTGGGTTGGACTAGGGAAGCGGAGTTCTGGGAGTTCTCGTAGGATTGGCGCAAAGTGAGCCCGCTCCGCCCGCCGGTCTACGCATGCCGGGGAGCCGGTGTTCGGACGACCGTCTCCCGCTCCTGCACCCCCTTGTAAAGTGCAGGGGCCACCCTGCCCGCAGCGAGGATGAGTGGGGGCTTGCGGGCGGGCAGTGGGGACTTGAATTGCACATAATTAAGGGGAGGGCTTCGACCGAACTAGGGAAGTGGGTGGTGTGCATTTCACAACTTGACATTCGCTTGTTAGCGGTCAGTTGCCATACTGTTAGCAACCTTTGTACGATCTACCTCGTGACTGTGGCGGCATATTTACCTCGTGACTGTGGCGGCATATTGTCCCTAAAATAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCCCAGGCAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAAGCTGGAATGCAGTGGCGCAATCGCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGGACTCAAGCGATTCTCTTCAGCTCCCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGAGCATGCCACCACATCTGGCTAATTTTGTTTCTACTTTTTATTTTTGTAGAGGCTTGGTCTTATTATATTGCCCAAGCTGGTTTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCTCCTGGTCCTAAAATAGCTTTTAGGCGGAAAAACAGCAATGGAAATTTGTTGAGTCCTATGATGTTGCTGGTTTTATAGGTAAAAGTAATCAACATAGGTAGTTTCATATGGTTCGACCTATGGAATCCTCTGATGTATGTGTGCATGCTTTATCTCCACGATAGAATTTGGATAGATTGTGCTAGCATTTGCGGACTCTGAAAGTGAAACTAGGAAAACCCAGCTTGCCTTGGCAGGGCAGATCTGGATCCGCCAATAAAGGCTGTCTCTGTGGAGGTAGAAAATAAGATGTAGATGCTCTCGGAGAGTTTGGTGTAGACAGGGAAGACCCACAAGCCACTAATTCAGTAAACCAGGTTAGAAGCTTAGTGAGGTTCACGTGAGAACAAAGGGGAGGGTCCTTTACCTAGAAGGGAGGGCGAGGATTTCTGTAGGCATCCCTACCTCCAGATCAGTAAATGCTAGAAAAGTTCTCAAGTTAAAGCAGCAAATCAAGCCTTGTTTCTGAGTTACTGAATTACCATGTAGATTTTTACACTCTCTAAGGGTTGTAGAAAAATGCAATTTTCAAACTGGATTATGCAGAGTCACCTGGCAAATCCTTTTAAAATGTAGATTCAGATTCAGCAGATCTGGTGTGATGGTTAATTTTATGTGTTAACTTGCTGGTTGTCTTTGGATGAGGTTAACACTAAAATCATTGAACTCTGGGTAAAGATGGCTGCCTTCCATAATCTGGGTGGGCTTCCTTCAATCAGTTGAAGGCCTATCTAGAATAAAAAATCCGACTCCCCCACTTCTCTTGCCCAAGCAAGGGAGACTTCTCCAGCAGAGTGTCCTCAGACTTCATCTGCACCACAGGTCCTCCTGGGTCTCCAGGCATGTGCACCATCATCTGTTTTGGGTCGAGTTGGCCAGCCTATATTGTGAAAGCCAAAACTTTATTACCCAAACTACCCAATTGGGGCTGTTTCTCTGAGAAGCCCAGTACATCTGGGATGTGCCTGAGATTCTGTATTGCTAACAAGCTCCCAGATGACCAAGGTTATAGATAACTTGGGCCAGGGAATATAGTTGCAACAGACTTGAAAGACTTCAAACCAGAGGAATTCTTTTTTTTAATATTTTTTATTTTAGAAATTTTAGGT
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Task1_train_10569
Consider a variant on Chromosome 6 in gene LOC129996727, SLC17A5 (ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 17338| solute carrier family 17 member 5). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Salla disease
TGCTGTGATAATAGTACTGTAGTTATGTTAAAAAGAGTCCTTATCTTTTAGAGGTAAATAATTGAAATATTTACATATGAAATGACATGGTATCTGGGATTTGCTTCAAAATACACAGTATGTATGAGCATAAGGCAAGACTGGCCATGAATTGATAACTTTAATCTGGGTGCTGGTTACATGGGGGCTCATTATATACTTCTCTTAATTGCCATATATGCTCCTTCTCTATAAAACTTATCATATTCTAAATAGCAAAAACAGTATGTTACTATTATTTCCACTTCACTTGCTCTCCAGTGGGTATGTAAAGAGGGAAAATAAAAAAGGAAATGGTTGTAACAAACGTAGCCACCTAAAGCCAGGAAGGACAGGGCCAGTACCATAAGATCCATACACTCAACACATGAATCAAGTAGGGATTGTTTTTAAAAGGGATGCTATAAGCTACTTTTTTAAAAATCAACTTTATTGAAGTATAATTTACGTGATAAATGTATACATTTGTCCATCTCAATCTTTATTGAGATGTATAACTTTTCTATCCACATCTCTGCTAACATTTGGTATTATCAGCCTTTTGGATTTTAGCTATTCTAGTGGGTGTATAGTGCCTCGTTGTAATTTTAATCTGCATTTTCCTGAGAATAATGTTTAACATTTGTGCTAAATTTTGATTATACATATACATATTTTTCAATTGTAACAATGTAATAATCTCTGGCAAATATCTTTATTATAACTTTTATTTCTGTATTTCTATATTATTTTATGAGGAATATTATACAATTTGAACACTACAAGCCACAGAAAATGATCAGTTTATGGAACTAAGTCCGACTTCCAGGTAAAACGTAACTATGGTATGGTATTTACAGTTTGTGTTGACTAAAATAAGCTCCCGGCTGCCAGATGGAGCTATAAGGTTGCCACCTCTACTGCCACCATCTGGTAACATTAAAAACAAATAAAAATATAGAAACTATACAATTCTGGGTTAGCCAAAGTCAAATTTCCAACACAACTCTTTCTCACGCACAGATCTTTGAAACTATAGAATGCATTCAAACTGATTTGTTCTTTAGTTTTCGTTACTTTTAAATAAACTATATTACAAAAGTGTCAAATAGCAAAATATTTTAATTTTCTCAAATTCAGGGAAGATGCTTTATGACGTACCTGCTTTTCGATTTGTTCCAAGACCTTTGGCAAATTACTTTAGAACTCCATAGGTATCTTGAGGATAACTGAACCTTTTCCTAACTTAAATCATAGACTGCCAGACGGAAAAAAAATGTCCTCGATGTTTTTAGTCTCTTACTGCACAATGTCAAGATATCAGCTGGGTTATACAATAGTTGCCCTCTGCATACTCACAAATGTTAACTCCAGTCCTTTTTTGTCTTCCCTCCCCGCCTAAGAAGCTACCAGGTCACATGCTGGCGGATACGCAGTGGCGGAAACCTAGCGGTGACAGGGAAGGACAGCCCTCTGCCTACTGATCTGCAGGTTTCTCCTCCAGTTTGCTCTTACACCGGGGTCCTCCGCTCGGACCTTAGCCCATTCATTTGATGATTCTCTCCCAGTTCGTTCTTCCACTGGGTCCCTTGCTCAGCACTACCCAAAATAACCACCAGCTCAGCGCCGGCTGCACCGCCGCTCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCGGTGGGGCTGCACCTGCCGAGGCCCCGGCTCGGCTCCGCGATCACGGTCGCGGCCCCCGGGGTTCCCGAGGGGCTTCTGCGCACCGAGGCAGGCGGGACTGAGCGGCACTCTGAACGGGCTCCCCTCTTAATGTCCCCTCGCGCCTGAGCAGCTCCGGTCCCGCCGGCGCAGGGTGCGGGTACCCGGGCCATGCCGGCCCAGAGACCGCCGCCCCCGGTACCGCTGCCCACTCGAAGCCCCTGGACGACCCCGCCGCTTACCGGCTTCGGCCCGTGGGGCGCCCGGTAGAAGAGGCGTGCGGTCCGTGCTCTCCTCGCCATCGTTCCGGGCCAGGTCTCGAACCGGAGACCTCATGACGCCTACGTGAGCAGGTGTACTCGCCACCTGGCAGAGAAGGGAGCGCCGGCCCGACAGCCCGAAGCCCCCGGGCCGAGCTGGCTGGACCGGGCGGGGCGGGGGCGATGACACCGCCCCGCGGCCACGTCTAGTCCCCGCGGTCCCGCCCAGAGGCGGCCGCGCCGACTCCGCCCCCGCCGCCATCTTAGGTGTGGGCAACTCTGGCTTGGGTTGGACTAGGGAAGCGGAGTTCTGGGAGTTCTCGTAGGATTGGCGCAAAGTGAGCCCGCTCCGCCCGCCGGTCTACGCATGCCGGGGAGCCGGTGTTCGGACGACCGTCTCCCGCTCCTGCACCCCCTTGTAAAGTGCAGGGGCCACCCTGCCCGCAGCGAGGATGAGTGGGGGCTTGCGGGCGGGCAGTGGGGACTTGAATTGCACATAATTAAGGGGAGGGCTTCGACCGAACTAGGGAAGTGGGTGGTGTGCATTTCACAACTTGACATTCGCTTGTTAGCGGTCAGTTGCCATACTGTTAGCAACCTTTGTACGATCTACCTCGTGACTGTGGCGGCATATTTACCTCGTGACTGTGGCGGCATATTGTCCCTAAAATAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCCCAGGCAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAAGCTGGAATGCAGTGGCGCAATCGCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGGACTCAAGCGATTCTCTTCAGCTCCCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGAGCATGCCACCACATCTGGCTAATTTTGTTTCTACTTTTTATTTTTGTAGAGGCTTGGTCTTATTATATTGCCCAAGCTGGTTTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCTCCTGGTCCTAAAATAGCTTTTAGGCGGAAAAACAGCAATGGAAATTTGTTGAGTCCTATGATGTTGCTGGTTTTATAGGTAAAAGTAATCAACATAGGTAGTTTCATATGGTTCGACCTATGGAATCCTCTGATGTATGTGTGCATGCTTTATCTCCACGATAGAATTTGGATAGATTGTGCTAGCATTTGCGGACTCTGAAAGTGAAACTAGGAAAACCCAGCTTGCCTTGGCAGGGCAGATCTGGATCCGCCAATAAAGGCTGTCTCTGTGGAGGTAGAAAATAAGATGTAGATGCTCTCGGAGAGTTTGGTGTAGACAGGGAAGACCCACAAGCCACTAATTCAGTAAACCAGGTTAGAAGCTTAGTGAGGTTCACGTGAGAACAAAGGGGAGGGTCCTTTACCTAGAAGGGAGGGCGAGGATTTCTGTAGGCATCCCTACCTCCAGATCAGTAAATGCTAGAAAAGTTCTCAAGTTAAAGCAGCAAATCAAGCCTTGTTTCTGAGTTACTGAATTACCATGTAGATTTTTACACTCTCTAAGGGTTGTAGAAAAATGCAATTTTCAAACTGGATTATGCAGAGTCACCTGGCAAATCCTTTTAAAATGTAGATTCAGATTCAGCAGATCTGGTGTGATGGTTAATTTTATGTGTTAACTTGCTGGTTGTCTTTGGATGAGGTTAACACTAAAATCATTGAACTCTGGGTAAAGATGGCTGCCTTCCATAATCTGGGTGGGCTTCCTTCAATCAGTTGAAGGCCTATCTAGAATAAAAAATCCGACTCCCCCACTTCTCTTGCCCAAGCAAGGGAGACTTCTCCAGCAGAGTGTCCTCAGACTTCATCTGCACCACAGGTCCTCCTGGGTCTCCAGGCATGTGCACCATCATCTGTTTTGGGTCGAGTTGGCCAGCCTATATTGTGAAAGCCAAAACTTTATTACCCAAACTACCCAATTGGGGCTGTTTCTCTGAGAAGCCCAGTACATCTGGGATGTGCCTGAGATTCTGTATTGCTAACAAGCTCCCAGATGACCAAGGTTATAGATAACTTGGGCCAGGGAATATAGTTGCAACAGACTTGAAAGACTTCAAACCAGAGGAATTCTTTTTTTTAATATTTTTTATTTTAGAAATTTTAGGT
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Task1_train_10570
This alteration in LOC129996727, SLC17A5 (ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 17338| solute carrier family 17 member 5) on Chromosome 6 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Salla disease
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Task1_train_10571
Mutation context: Chromosome 6, Gene LOC129996727, SLC17A5 (ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 17338| solute carrier family 17 member 5). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Salla disease
TGCTGTGATAATAGTACTGTAGTTATGTTAAAAAGAGTCCTTATCTTTTAGAGGTAAATAATTGAAATATTTACATATGAAATGACATGGTATCTGGGATTTGCTTCAAAATACACAGTATGTATGAGCATAAGGCAAGACTGGCCATGAATTGATAACTTTAATCTGGGTGCTGGTTACATGGGGGCTCATTATATACTTCTCTTAATTGCCATATATGCTCCTTCTCTATAAAACTTATCATATTCTAAATAGCAAAAACAGTATGTTACTATTATTTCCACTTCACTTGCTCTCCAGTGGGTATGTAAAGAGGGAAAATAAAAAAGGAAATGGTTGTAACAAACGTAGCCACCTAAAGCCAGGAAGGACAGGGCCAGTACCATAAGATCCATACACTCAACACATGAATCAAGTAGGGATTGTTTTTAAAAGGGATGCTATAAGCTACTTTTTTAAAAATCAACTTTATTGAAGTATAATTTACGTGATAAATGTATACATTTGTCCATCTCAATCTTTATTGAGATGTATAACTTTTCTATCCACATCTCTGCTAACATTTGGTATTATCAGCCTTTTGGATTTTAGCTATTCTAGTGGGTGTATAGTGCCTCGTTGTAATTTTAATCTGCATTTTCCTGAGAATAATGTTTAACATTTGTGCTAAATTTTGATTATACATATACATATTTTTCAATTGTAACAATGTAATAATCTCTGGCAAATATCTTTATTATAACTTTTATTTCTGTATTTCTATATTATTTTATGAGGAATATTATACAATTTGAACACTACAAGCCACAGAAAATGATCAGTTTATGGAACTAAGTCCGACTTCCAGGTAAAACGTAACTATGGTATGGTATTTACAGTTTGTGTTGACTAAAATAAGCTCCCGGCTGCCAGATGGAGCTATAAGGTTGCCACCTCTACTGCCACCATCTGGTAACATTAAAAACAAATAAAAATATAGAAACTATACAATTCTGGGTTAGCCAAAGTCAAATTTCCAACACAACTCTTTCTCACGCACAGATCTTTGAAACTATAGAATGCATTCAAACTGATTTGTTCTTTAGTTTTCGTTACTTTTAAATAAACTATATTACAAAAGTGTCAAATAGCAAAATATTTTAATTTTCTCAAATTCAGGGAAGATGCTTTATGACGTACCTGCTTTTCGATTTGTTCCAAGACCTTTGGCAAATTACTTTAGAACTCCATAGGTATCTTGAGGATAACTGAACCTTTTCCTAACTTAAATCATAGACTGCCAGACGGAAAAAAAATGTCCTCGATGTTTTTAGTCTCTTACTGCACAATGTCAAGATATCAGCTGGGTTATACAATAGTTGCCCTCTGCATACTCACAAATGTTAACTCCAGTCCTTTTTTGTCTTCCCTCCCCGCCTAAGAAGCTACCAGGTCACATGCTGGCGGATACGCAGTGGCGGAAACCTAGCGGTGACAGGGAAGGACAGCCCTCTGCCTACTGATCTGCAGGTTTCTCCTCCAGTTTGCTCTTACACCGGGGTCCTCCGCTCGGACCTTAGCCCATTCATTTGATGATTCTCTCCCAGTTCGTTCTTCCACTGGGTCCCTTGCTCAGCACTACCCAAAATAACCACCAGCTCAGCGCCGGCTGCACCGCCGCTCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCGGTGGGGCTGCACCTGCCGAGGCCCCGGCTCGGCTCCGCGATCACGGTCGCGGCCCCCGGGGTTCCCGAGGGGCTTCTGCGCACCGAGGCAGGCGGGACTGAGCGGCACTCTGAACGGGCTCCCCTCTTAATGTCCCCTCGCGCCTGAGCAGCTCCGGTCCCGCCGGCGCAGGGTGCGGGTACCCGGGCCATGCCGGCCCAGAGACCGCCGCCCCCGGTACCGCTGCCCACTCGAAGCCCCTGGACGACCCCGCCGCTTACCGGCTTCGGCCCGTGGGGCGCCCGGTAGAAGAGGCGTGCGGTCCGTGCTCTCCTCGCCATCGTTCCGGGCCAGGTCTCGAACCGGAGACCTCATGACGCCTACGTGAGCAGGTGTACTCGCCACCTGGCAGAGAAGGGAGCGCCGGCCCGACAGCCCGAAGCCCCCGGGCCGAGCTGGCTGGACCGGGCGGGGCGGGGGCGATGACACCGCCCCGCGGCCACGTCTAGTCCCCGCGGTCCCGCCCAGAGGCGGCCGCGCCGACTCCGCCCCCGCCGCCATCTTAGGTGTGGGCAACTCTGGCTTGGGTTGGACTAGGGAAGCGGAGTTCTGGGAGTTCTCGTAGGATTGGCGCAAAGTGAGCCCGCTCCGCCCGCCGGTCTACGCATGCCGGGGAGCCGGTGTTCGGACGACCGTCTCCCGCTCCTGCACCCCCTTGTAAAGTGCAGGGGCCACCCTGCCCGCAGCGAGGATGAGTGGGGGCTTGCGGGCGGGCAGTGGGGACTTGAATTGCACATAATTAAGGGGAGGGCTTCGACCGAACTAGGGAAGTGGGTGGTGTGCATTTCACAACTTGACATTCGCTTGTTAGCGGTCAGTTGCCATACTGTTAGCAACCTTTGTACGATCTACCTCGTGACTGTGGCGGCATATTTACCTCGTGACTGTGGCGGCATATTGTCCCTAAAATAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCCCAGGCAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAAGCTGGAATGCAGTGGCGCAATCGCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGGACTCAAGCGATTCTCTTCAGCTCCCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGAGCATGCCACCACATCTGGCTAATTTTGTTTCTACTTTTTATTTTTGTAGAGGCTTGGTCTTATTATATTGCCCAAGCTGGTTTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCTCCTGGTCCTAAAATAGCTTTTAGGCGGAAAAACAGCAATGGAAATTTGTTGAGTCCTATGATGTTGCTGGTTTTATAGGTAAAAGTAATCAACATAGGTAGTTTCATATGGTTCGACCTATGGAATCCTCTGATGTATGTGTGCATGCTTTATCTCCACGATAGAATTTGGATAGATTGTGCTAGCATTTGCGGACTCTGAAAGTGAAACTAGGAAAACCCAGCTTGCCTTGGCAGGGCAGATCTGGATCCGCCAATAAAGGCTGTCTCTGTGGAGGTAGAAAATAAGATGTAGATGCTCTCGGAGAGTTTGGTGTAGACAGGGAAGACCCACAAGCCACTAATTCAGTAAACCAGGTTAGAAGCTTAGTGAGGTTCACGTGAGAACAAAGGGGAGGGTCCTTTACCTAGAAGGGAGGGCGAGGATTTCTGTAGGCATCCCTACCTCCAGATCAGTAAATGCTAGAAAAGTTCTCAAGTTAAAGCAGCAAATCAAGCCTTGTTTCTGAGTTACTGAATTACCATGTAGATTTTTACACTCTCTAAGGGTTGTAGAAAAATGCAATTTTCAAACTGGATTATGCAGAGTCACCTGGCAAATCCTTTTAAAATGTAGATTCAGATTCAGCAGATCTGGTGTGATGGTTAATTTTATGTGTTAACTTGCTGGTTGTCTTTGGATGAGGTTAACACTAAAATCATTGAACTCTGGGTAAAGATGGCTGCCTTCCATAATCTGGGTGGGCTTCCTTCAATCAGTTGAAGGCCTATCTAGAATAAAAAATCCGACTCCCCCACTTCTCTTGCCCAAGCAAGGGAGACTTCTCCAGCAGAGTGTCCTCAGACTTCATCTGCACCACAGGTCCTCCTGGGTCTCCAGGCATGTGCACCATCATCTGTTTTGGGTCGAGTTGGCCAGCCTATATTGTGAAAGCCAAAACTTTATTACCCAAACTACCCAATTGGGGCTGTTTCTCTGAGAAGCCCAGTACATCTGGGATGTGCCTGAGATTCTGTATTGCTAACAAGCTCCCAGATGACCAAGGTTATAGATAACTTGGGCCAGGGAATATAGTTGCAACAGACTTGAAAGACTTCAAACCAGAGGAATTCTTTTTTTTAATATTTTTTATTTTAGAAATTTTAGGT
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Task1_train_10572
Here is a genetic alteration in COL12A1 (collagen type XII alpha 1 chain) on Chromosome 6. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Bethlem myopathy 2
AAACTCAAAAGGAGGCATGGGAACAAATAAAGTTCACTGGCATATCATCTACCATTTTGTATTATCTTAGGGCAAATCTTTGCTCCCTCTGAATGGCCTACCTCTCTGCCCAATGGTGTCTTGGAGGTGTTAAGGTTGATAGATTTATGTTTAGTGACAGCTGTTATAGTACTGGCTTCCTCAGATCCTGCTGCTAGTCATATATTTTAACTTGATTGATTAATCAAAATACAAACTACTCTCAGACTATTATTGGAACCATAAGATGCTGGAAAGTCATTAGTTCCTTTGTTCTGAGAAACTCTTAAAATTTCTGGGTTCTTTTTATTAAAGCATTTGTGGTCTCCTATGGAACCAAATATTTCACATTATTGATGAACAGAACATAGAGGTCATGTTCACCATGCTTCTTATTAACTTATCCTAGAGAAGACTGGGTTTCCTGTACTGCTTTCATGCTAAGTCAAGACCAAACCTGAAAGCTGCTACCAACAGGCAAATTCCCTACTAAATACCAGCTGTCTACCCCACCATCAAGGCCTAGAAGTGGTATTTGAGTTCTAAAGGTGTAGACAGGATGTCTTGAGTTTGTAGAAAGTGCTATGGGAGTCAAGGCTACCCTCATGGTTACAGAAAAGCTGCCTCACAACTAAGATTTTAATTTTAAGATTTAAAACAATTTGCTGAGATTCTTGAATCTCTTTTTAATCAGCTAAAATTCCTTTTCTGGACTTCTTTTTATGAATATGATATGGTAAGAAATTTTCTGAAAATTAAAATTTCAAAGACTCCCCTGGAGTCCCACCACTTTATTTCAAAGACCTTGAGATTGATCTGATGTTGGATGGTCCACTGACATTAGCTTTGCAGCTTTGCAGCTTTCCACAAGATATATTACCAGCCTTGCAAACTGGATTTTGAAGGGTTCTTAATTAATAGGCAACCATATGACATCATTTCCAACATCATTGTAGCCTGCTCAAGAAAACTTACTCTGTCTCCTGGAGGTCCCATTGGTCCTGGTGGGCCAGGTAATCCTGGGGTTCCCTGCACAGAAGGAAACAAACAAGTGAAACATTATAATATACTTCCTGTGTGGGAGAGAATCTTTGTTATTTTCCAAATTTTTTTTTTAATTCCAGAGACTCTGAATAGAAACAGGAGAACAGAGCCAAGCACATTGCCAAGCATACAGTAGATGCTCAGTCAACAAGCAGATACCTGAATTGAATAGCACCAACTTGAAGGTTAAGACCAGGGTATGAAATGGAAATGAGGTGAAACACATATCCAGGCTTCTGCTTTGCTACTTAATCTGGGTTCACCTTTTGAGGCACTAGAAAAGGAAATTTTCAAATAGCACATGACAGGGCAACTTAGAGACCAACTCACTGTTCGGCCTGGAAGTCCTGGCTCTCCAGCATCACCTTTCATCCCTTGGCGACCCTAGAGTGAGCAATGGGAAAACAGTTCTCAGGCGTTTCACAGAGATTAAGCAAAAAAGGAAGACATGAGTCACTTATGAAATCTTCATCACTTCATAAATCCAGTGTAAGCGTTCAGAATGAGCACAGAAGGGTATTTTTGAAAGGAGATGAATAAACCTTTTTTGAATTAATGCTCACTCTTTAAACTACAAATGCTGTGTTATAATTTCTACTTACAATGTTATGGGGTAATTTTATATAATTATGGGATATTATACCTACCTTAAAAGAATATAGTTTAACATAGGGGATATCTACTTTACTTATAAGAAAATGTTTAATAAAGTCAAATAAGTAGCAGTAATTTTTTCTACACAGTTTTATATTATTACATAGTCTATTTACGTATCTAAAATAACAGTCATCATAGAGGCTGCTATCTCGGTGACTAACCTCGTTGAATTATCTGAGAAAACATTTGATTTGGCAAAATGTAGAAAAGATTCATTTAACTAAATGTTTATCCACCACTCTCATTTAATACAGAAAGGCTTTGTGCTTACTTGCTCTCCCGGAATAGAGAGTCCATTGGGTCCCTGAGGGCCTGGAGGACCCTGGGGGCCTGGAGGACCTATGTCTCCACGAGGACCAGGGGGCCCCTAAAATACACAAGAGAGAGACAACCACAAAGTAATGTAATACCTTTTCAGTGCTGACATTTAGTCAGACACTTGTCATCATAACTCTAAGACATCAATCATATAATCTTTGTAAACTTTTAAGAATCTACATCTATGAATATATTCATTAATGTAATTTCTTCCCTTTACTATTGAAAAGTACGATAAATTTACAAGAACACTTACATTTCCATAAAAGTCCTATTAGAAATAGATTTTTTAAATAAAATACATTGCATATAATATATTCATATATTAATTTTCATAGATTTATATGAGATTAAATGCTTAAGTTTCACTGGATTTGATTTATTTTAAGCTAGTCCTCATTTCTCTTAGACTTCAGCTTATTTCTGGGACTAAAGGATATATAAATCAAGCAAGGAAAGAAAAGATGCCCATGGATGAGGTGCCCTGTGCTGGAGCTCTTTTACAATCTGTCTAGATGGAAAAGGCACAACCTTGGCATCAGGCCTGGGTTAGCATCCTAATCTTGCCCTTTCCTAATGGGGTTATTTTATCATTAATTATATTATGACCAAAAACTACACATTATCTTCATAAAATATTCCCCTGAGAAGCTTGAGTTGTCTTACAGAAAACCAGTGTGGAGCTGGCAGAAGGGGCAGGTGACCCCTTGTGAGCACATACGCAGCCACTCAGCATTTTTTTTCTGAGACTGGTGAAAAAAGCAGCAGCAGTAGTGCTCCCAACAGGCTCCAGCTCTCTAGCGGGTCTCTGCTCCCTGTGGGGTGTGGGTACCCCCTCTGCTTCCCCATGTTCTGGCCAAGGCCTTAAAGATCTTCTGCAGCTTCCCCATGTGTAATTGTTACAGCTATGACATGCATCCTATGCATTTCTTTCTCTGGCTAGTCTAATCCATCATTATGACATCCAGAGATAAGACAGAGGTAATTATATTACCTGAGGCACACTGAACCTGAGCTGACTTGCTCAAGATCACATACCCCCTTTGTGAAAATTTGAACAACCAGATTTCAACATATAGATAAGAATTTAAATGCACTCTAAAATATACTTACAATTGCCCCACTGATACCTCTTTCACCTCTGGGACCTTTAGCACCAGGTCCTCCCTAAAATACATAGAGCACATAGTAGTGTGAACATAGGAAAATAGGAGGAAGTTGATATACAAAAAGTCCTTCAAGAAAAAGTGCAATTTCCAGACAATTATTATTCTACAGCTGCTTGCAAAATACTGAAGCAAATATTTCATGTCATACAAATATGCGAGGCAAGAGAATTTCAAAACTTTGTACATTCTGAGTGTCTTTAATTATATTTCAAATTTCAAATTTTCATTTGAAAATTTGAGGTTTATTGGGAAAAGCAAACATTATACTACTTGTGTACAATAAAGAGAAAAATGAGCTTTGGATTTATGTGAATTACATTCCTTGGGGAAAATGATGGGCAAAAAGAAGAGTATCTTAAATCGCTCAGAGTATTAGAACATGTACTTAACAGGAATTCAGAAACAACTGAACAAAGAGGAAATAAATATCACAGTGACATTCAAGCATGTTACCTCACTACTACAGGGGAAAAAATCCCAACATCTCAAAAACATCTAAGTCACATCCAGGACATAATTTCATGATTATAAATATAAATCACTGTTACTAGAAAAAAAGAATGGTAACCCCAGTGACATTTTGATTCTATATATGAGGAGCTGGCTTGTAATTAACCTAAAATCGGTCTACATTATTTGCTATGACCCAAGAATAGTAAATTTTCATGTTCTGTGAATCCCTGAGCTCCTCCTGTGTTAATTACATATTTTCTTAAAAGAAGCCAAGGGAGATTAGAGCTATCCTCAAAACTGGCCCAGATCAGATACTGGATCGACTAACTCAAGGGGTTTCACATTGATCAATGAACTCTATCACTGCAATCTTCAATGTTTTGCCTTGCACTTTCTTGGTTTTCCCTCCCAACCAATGCATAAATCTGGTCATAGTC
AAACTCAAAAGGAGGCATGGGAACAAATAAAGTTCACTGGCATATCATCTACCATTTTGTATTATCTTAGGGCAAATCTTTGCTCCCTCTGAATGGCCTACCTCTCTGCCCAATGGTGTCTTGGAGGTGTTAAGGTTGATAGATTTATGTTTAGTGACAGCTGTTATAGTACTGGCTTCCTCAGATCCTGCTGCTAGTCATATATTTTAACTTGATTGATTAATCAAAATACAAACTACTCTCAGACTATTATTGGAACCATAAGATGCTGGAAAGTCATTAGTTCCTTTGTTCTGAGAAACTCTTAAAATTTCTGGGTTCTTTTTATTAAAGCATTTGTGGTCTCCTATGGAACCAAATATTTCACATTATTGATGAACAGAACATAGAGGTCATGTTCACCATGCTTCTTATTAACTTATCCTAGAGAAGACTGGGTTTCCTGTACTGCTTTCATGCTAAGTCAAGACCAAACCTGAAAGCTGCTACCAACAGGCAAATTCCCTACTAAATACCAGCTGTCTACCCCACCATCAAGGCCTAGAAGTGGTATTTGAGTTCTAAAGGTGTAGACAGGATGTCTTGAGTTTGTAGAAAGTGCTATGGGAGTCAAGGCTACCCTCATGGTTACAGAAAAGCTGCCTCACAACTAAGATTTTAATTTTAAGATTTAAAACAATTTGCTGAGATTCTTGAATCTCTTTTTAATCAGCTAAAATTCCTTTTCTGGACTTCTTTTTATGAATATGATATGGTAAGAAATTTTCTGAAAATTAAAATTTCAAAGACTCCCCTGGAGTCCCACCACTTTATTTCAAAGACCTTGAGATTGATCTGATGTTGGATGGTCCACTGACATTAGCTTTGCAGCTTTGCAGCTTTCCACAAGATATATTACCAGCCTTGCAAACTGGATTTTGAAGGGTTCTTAATTAATAGGCAACCATATGACATCATTTCCAACATCATTGTAGCCTGCTCAAGAAAACTTACTCTGTCTCCTGGAGGTCCCATTGGTCCTGGTGGGCCAGGTAATCCTGGGGTTCCCTGCACAGAAGGAAACAAACAAGTGAAACATTATAATATACTTCCTGTGTGGGAGAGAATCTTTGTTATTTTCCAAATTTTTTTTTTAATTCCAGAGACTCTGAATAGAAACAGGAGAACAGAGCCAAGCACATTGCCAAGCATACAGTAGATGCTCAGTCAACAAGCAGATACCTGAATTGAATAGCACCAACTTGAAGGTTAAGACCAGGGTATGAAATGGAAATGAGGTGAAACACATATCCAGGCTTCTGCTTTGCTACTTAATCTGGGTTCACCTTTTGAGGCACTAGAAAAGGAAATTTTCAAATAGCACATGACAGGGCAACTTAGAGACCAACTCACTGTTCGGCCTGGAAGTCCTGGCTCTCCAGCATCACCTTTCATCCCTTGGCGACCCTAGAGTGAGCAATGGGAAAACAGTTCTCAGGCGTTTCACAGAGATTAAGCAAAAAAGGAAGACATGAGTCACTTATGAAATCTTCATCACTTCATAAATCCAGTGTAAGCGTTCAGAATGAGCACAGAAGGGTATTTTTGAAAGGAGATGAATAAACCTTTTTTGAATTAATGCTCACTCTTTAAACTACAAATGCTGTGTTATAATTTCTACTTACAATGTTATGGGGTAATTTTATATAATTATGGGATATTATACCTACCTTAAAAGAATATAGTTTAACATAGGGGATATCTACTTTACTTATAAGAAAATGTTTAATAAAGTCAAATAAGTAGCAGTAATTTTTTCTACACAGTTTTATATTATTACATAGTCTATTTACGTATCTAAAATAACAGTCATCATAGAGGCTGCTATCTCGGTGACTAACCTCGTTGAATTATCTGAGAAAACATTTGATTTGGCAAAATGTAGAAAAGATTCATTTAACTAAATGTTTATCCACCACTCTCATTTAATACAGAAAGGCTTTGTGCTTACTTGCTCTCCCGGAATAGAGAGTCCATTGGGTCCCTGAGGGCCTGGAGGACCCTGGGGGTCTGGAGGACCTATGTCTCCACGAGGACCAGGGGGCCCCTAAAATACACAAGAGAGAGACAACCACAAAGTAATGTAATACCTTTTCAGTGCTGACATTTAGTCAGACACTTGTCATCATAACTCTAAGACATCAATCATATAATCTTTGTAAACTTTTAAGAATCTACATCTATGAATATATTCATTAATGTAATTTCTTCCCTTTACTATTGAAAAGTACGATAAATTTACAAGAACACTTACATTTCCATAAAAGTCCTATTAGAAATAGATTTTTTAAATAAAATACATTGCATATAATATATTCATATATTAATTTTCATAGATTTATATGAGATTAAATGCTTAAGTTTCACTGGATTTGATTTATTTTAAGCTAGTCCTCATTTCTCTTAGACTTCAGCTTATTTCTGGGACTAAAGGATATATAAATCAAGCAAGGAAAGAAAAGATGCCCATGGATGAGGTGCCCTGTGCTGGAGCTCTTTTACAATCTGTCTAGATGGAAAAGGCACAACCTTGGCATCAGGCCTGGGTTAGCATCCTAATCTTGCCCTTTCCTAATGGGGTTATTTTATCATTAATTATATTATGACCAAAAACTACACATTATCTTCATAAAATATTCCCCTGAGAAGCTTGAGTTGTCTTACAGAAAACCAGTGTGGAGCTGGCAGAAGGGGCAGGTGACCCCTTGTGAGCACATACGCAGCCACTCAGCATTTTTTTTCTGAGACTGGTGAAAAAAGCAGCAGCAGTAGTGCTCCCAACAGGCTCCAGCTCTCTAGCGGGTCTCTGCTCCCTGTGGGGTGTGGGTACCCCCTCTGCTTCCCCATGTTCTGGCCAAGGCCTTAAAGATCTTCTGCAGCTTCCCCATGTGTAATTGTTACAGCTATGACATGCATCCTATGCATTTCTTTCTCTGGCTAGTCTAATCCATCATTATGACATCCAGAGATAAGACAGAGGTAATTATATTACCTGAGGCACACTGAACCTGAGCTGACTTGCTCAAGATCACATACCCCCTTTGTGAAAATTTGAACAACCAGATTTCAACATATAGATAAGAATTTAAATGCACTCTAAAATATACTTACAATTGCCCCACTGATACCTCTTTCACCTCTGGGACCTTTAGCACCAGGTCCTCCCTAAAATACATAGAGCACATAGTAGTGTGAACATAGGAAAATAGGAGGAAGTTGATATACAAAAAGTCCTTCAAGAAAAAGTGCAATTTCCAGACAATTATTATTCTACAGCTGCTTGCAAAATACTGAAGCAAATATTTCATGTCATACAAATATGCGAGGCAAGAGAATTTCAAAACTTTGTACATTCTGAGTGTCTTTAATTATATTTCAAATTTCAAATTTTCATTTGAAAATTTGAGGTTTATTGGGAAAAGCAAACATTATACTACTTGTGTACAATAAAGAGAAAAATGAGCTTTGGATTTATGTGAATTACATTCCTTGGGGAAAATGATGGGCAAAAAGAAGAGTATCTTAAATCGCTCAGAGTATTAGAACATGTACTTAACAGGAATTCAGAAACAACTGAACAAAGAGGAAATAAATATCACAGTGACATTCAAGCATGTTACCTCACTACTACAGGGGAAAAAATCCCAACATCTCAAAAACATCTAAGTCACATCCAGGACATAATTTCATGATTATAAATATAAATCACTGTTACTAGAAAAAAAGAATGGTAACCCCAGTGACATTTTGATTCTATATATGAGGAGCTGGCTTGTAATTAACCTAAAATCGGTCTACATTATTTGCTATGACCCAAGAATAGTAAATTTTCATGTTCTGTGAATCCCTGAGCTCCTCCTGTGTTAATTACATATTTTCTTAAAAGAAGCCAAGGGAGATTAGAGCTATCCTCAAAACTGGCCCAGATCAGATACTGGATCGACTAACTCAAGGGGTTTCACATTGATCAATGAACTCTATCACTGCAATCTTCAATGTTTTGCCTTGCACTTTCTTGGTTTTCCCTCCCAACCAATGCATAAATCTGGTCATAGTC
Task1_train_10573
Given a variant located on Chromosome 6 and affecting COL12A1 (collagen type XII alpha 1 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Bethlem myopathy 2
AAAGTTCACTGGCATATCATCTACCATTTTGTATTATCTTAGGGCAAATCTTTGCTCCCTCTGAATGGCCTACCTCTCTGCCCAATGGTGTCTTGGAGGTGTTAAGGTTGATAGATTTATGTTTAGTGACAGCTGTTATAGTACTGGCTTCCTCAGATCCTGCTGCTAGTCATATATTTTAACTTGATTGATTAATCAAAATACAAACTACTCTCAGACTATTATTGGAACCATAAGATGCTGGAAAGTCATTAGTTCCTTTGTTCTGAGAAACTCTTAAAATTTCTGGGTTCTTTTTATTAAAGCATTTGTGGTCTCCTATGGAACCAAATATTTCACATTATTGATGAACAGAACATAGAGGTCATGTTCACCATGCTTCTTATTAACTTATCCTAGAGAAGACTGGGTTTCCTGTACTGCTTTCATGCTAAGTCAAGACCAAACCTGAAAGCTGCTACCAACAGGCAAATTCCCTACTAAATACCAGCTGTCTACCCCACCATCAAGGCCTAGAAGTGGTATTTGAGTTCTAAAGGTGTAGACAGGATGTCTTGAGTTTGTAGAAAGTGCTATGGGAGTCAAGGCTACCCTCATGGTTACAGAAAAGCTGCCTCACAACTAAGATTTTAATTTTAAGATTTAAAACAATTTGCTGAGATTCTTGAATCTCTTTTTAATCAGCTAAAATTCCTTTTCTGGACTTCTTTTTATGAATATGATATGGTAAGAAATTTTCTGAAAATTAAAATTTCAAAGACTCCCCTGGAGTCCCACCACTTTATTTCAAAGACCTTGAGATTGATCTGATGTTGGATGGTCCACTGACATTAGCTTTGCAGCTTTGCAGCTTTCCACAAGATATATTACCAGCCTTGCAAACTGGATTTTGAAGGGTTCTTAATTAATAGGCAACCATATGACATCATTTCCAACATCATTGTAGCCTGCTCAAGAAAACTTACTCTGTCTCCTGGAGGTCCCATTGGTCCTGGTGGGCCAGGTAATCCTGGGGTTCCCTGCACAGAAGGAAACAAACAAGTGAAACATTATAATATACTTCCTGTGTGGGAGAGAATCTTTGTTATTTTCCAAATTTTTTTTTTAATTCCAGAGACTCTGAATAGAAACAGGAGAACAGAGCCAAGCACATTGCCAAGCATACAGTAGATGCTCAGTCAACAAGCAGATACCTGAATTGAATAGCACCAACTTGAAGGTTAAGACCAGGGTATGAAATGGAAATGAGGTGAAACACATATCCAGGCTTCTGCTTTGCTACTTAATCTGGGTTCACCTTTTGAGGCACTAGAAAAGGAAATTTTCAAATAGCACATGACAGGGCAACTTAGAGACCAACTCACTGTTCGGCCTGGAAGTCCTGGCTCTCCAGCATCACCTTTCATCCCTTGGCGACCCTAGAGTGAGCAATGGGAAAACAGTTCTCAGGCGTTTCACAGAGATTAAGCAAAAAAGGAAGACATGAGTCACTTATGAAATCTTCATCACTTCATAAATCCAGTGTAAGCGTTCAGAATGAGCACAGAAGGGTATTTTTGAAAGGAGATGAATAAACCTTTTTTGAATTAATGCTCACTCTTTAAACTACAAATGCTGTGTTATAATTTCTACTTACAATGTTATGGGGTAATTTTATATAATTATGGGATATTATACCTACCTTAAAAGAATATAGTTTAACATAGGGGATATCTACTTTACTTATAAGAAAATGTTTAATAAAGTCAAATAAGTAGCAGTAATTTTTTCTACACAGTTTTATATTATTACATAGTCTATTTACGTATCTAAAATAACAGTCATCATAGAGGCTGCTATCTCGGTGACTAACCTCGTTGAATTATCTGAGAAAACATTTGATTTGGCAAAATGTAGAAAAGATTCATTTAACTAAATGTTTATCCACCACTCTCATTTAATACAGAAAGGCTTTGTGCTTACTTGCTCTCCCGGAATAGAGAGTCCATTGGGTCCCTGAGGGCCTGGAGGACCCTGGGGGCCTGGAGGACCTATGTCTCCACGAGGACCAGGGGGCCCCTAAAATACACAAGAGAGAGACAACCACAAAGTAATGTAATACCTTTTCAGTGCTGACATTTAGTCAGACACTTGTCATCATAACTCTAAGACATCAATCATATAATCTTTGTAAACTTTTAAGAATCTACATCTATGAATATATTCATTAATGTAATTTCTTCCCTTTACTATTGAAAAGTACGATAAATTTACAAGAACACTTACATTTCCATAAAAGTCCTATTAGAAATAGATTTTTTAAATAAAATACATTGCATATAATATATTCATATATTAATTTTCATAGATTTATATGAGATTAAATGCTTAAGTTTCACTGGATTTGATTTATTTTAAGCTAGTCCTCATTTCTCTTAGACTTCAGCTTATTTCTGGGACTAAAGGATATATAAATCAAGCAAGGAAAGAAAAGATGCCCATGGATGAGGTGCCCTGTGCTGGAGCTCTTTTACAATCTGTCTAGATGGAAAAGGCACAACCTTGGCATCAGGCCTGGGTTAGCATCCTAATCTTGCCCTTTCCTAATGGGGTTATTTTATCATTAATTATATTATGACCAAAAACTACACATTATCTTCATAAAATATTCCCCTGAGAAGCTTGAGTTGTCTTACAGAAAACCAGTGTGGAGCTGGCAGAAGGGGCAGGTGACCCCTTGTGAGCACATACGCAGCCACTCAGCATTTTTTTTCTGAGACTGGTGAAAAAAGCAGCAGCAGTAGTGCTCCCAACAGGCTCCAGCTCTCTAGCGGGTCTCTGCTCCCTGTGGGGTGTGGGTACCCCCTCTGCTTCCCCATGTTCTGGCCAAGGCCTTAAAGATCTTCTGCAGCTTCCCCATGTGTAATTGTTACAGCTATGACATGCATCCTATGCATTTCTTTCTCTGGCTAGTCTAATCCATCATTATGACATCCAGAGATAAGACAGAGGTAATTATATTACCTGAGGCACACTGAACCTGAGCTGACTTGCTCAAGATCACATACCCCCTTTGTGAAAATTTGAACAACCAGATTTCAACATATAGATAAGAATTTAAATGCACTCTAAAATATACTTACAATTGCCCCACTGATACCTCTTTCACCTCTGGGACCTTTAGCACCAGGTCCTCCCTAAAATACATAGAGCACATAGTAGTGTGAACATAGGAAAATAGGAGGAAGTTGATATACAAAAAGTCCTTCAAGAAAAAGTGCAATTTCCAGACAATTATTATTCTACAGCTGCTTGCAAAATACTGAAGCAAATATTTCATGTCATACAAATATGCGAGGCAAGAGAATTTCAAAACTTTGTACATTCTGAGTGTCTTTAATTATATTTCAAATTTCAAATTTTCATTTGAAAATTTGAGGTTTATTGGGAAAAGCAAACATTATACTACTTGTGTACAATAAAGAGAAAAATGAGCTTTGGATTTATGTGAATTACATTCCTTGGGGAAAATGATGGGCAAAAAGAAGAGTATCTTAAATCGCTCAGAGTATTAGAACATGTACTTAACAGGAATTCAGAAACAACTGAACAAAGAGGAAATAAATATCACAGTGACATTCAAGCATGTTACCTCACTACTACAGGGGAAAAAATCCCAACATCTCAAAAACATCTAAGTCACATCCAGGACATAATTTCATGATTATAAATATAAATCACTGTTACTAGAAAAAAAGAATGGTAACCCCAGTGACATTTTGATTCTATATATGAGGAGCTGGCTTGTAATTAACCTAAAATCGGTCTACATTATTTGCTATGACCCAAGAATAGTAAATTTTCATGTTCTGTGAATCCCTGAGCTCCTCCTGTGTTAATTACATATTTTCTTAAAAGAAGCCAAGGGAGATTAGAGCTATCCTCAAAACTGGCCCAGATCAGATACTGGATCGACTAACTCAAGGGGTTTCACATTGATCAATGAACTCTATCACTGCAATCTTCAATGTTTTGCCTTGCACTTTCTTGGTTTTCCCTCCCAACCAATGCATAAATCTGGTCATAGTCTTCTCACTCAAGTTATTCCAAACCCAGA
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Task1_train_10574
A variant affecting Chromosome 6, within the gene MYO6 (myosin VI), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Autosomal dominant nonsyndromic hearing loss 22
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Task1_train_10575
A change on Chromosome 6 affects gene IMPG1 (interphotoreceptor matrix proteoglycan 1). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Vitelliform macular dystrophy 4
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Task1_train_10576
Gene IMPG1 (interphotoreceptor matrix proteoglycan 1), found on Chromosome 6, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Vitelliform macular dystrophy 4
TCAGTTGCATTTATACAAACAATTACTGAGTAGTTAACTGCATCCCAAACTCTGTATTAGAAGGTTAGGCATCAGAGATTAAAAGAACAGCTCCTGTTCTCTAGGAGAAGCTCATAGCCTGGTGGTGATGAGTGGGGTGAATGAAGAGGAAGGAGTAGAGATAGCAAAGGCCATAGACACATAAGCAAGCAGTCTCAAGAAAGGGTGTTGTGAAAGCAATGAGTGAGCCCAGGAGAGACACTGGATGCAGAATGGATAGAGGGAACTTTCCATGTTGAAGTATGTAAAACAAGACTTGGAGAAGGGCATTCTAGACAGAGCAGACAGCACATGTAAAGGCTAAATGGGGGGACAAATTGGAAATAGTTTGCATTCCTGGAAACTAGAGTGAAAAGGAGGGGGATGATAAGGAACTGGTATATGGTGAGGCTCAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAGATCTTATTATGGTATATAGATGCCACACTCAGCATAGTAGCTGGATTTATCCTGCAGGGAATTGAAGAGATTTGAATTTAATTAGAGACAGACAGATATAACAAAGGTCAGAGATGGAAGAGACATCTTGGGAAAGCTCCTCAGTTTATTAATTGATGACATGGACAATATAATTGCCTTCCTCTTATCACCCATGAAAAATATTGTGTCTTTAAATTGCATCAAACTGTAAAAATAGAAATATTATATAAAGACAAAGTATTATGAATTAATAATTTATACTTTAACCCAGCATCTTCTCTACTTGGTGCCTACATAGTCATTTTGTTTTATTTAAATCTACTTTATTGAGGTATAATTGACATATCAAAAGCTGTACATATTTAATATATACATCTTGATGAATTTGTCTATAAGTATATACCAGTGAAACCATCACCATAATGGTCATCTAGGCATAGAGCAGCTGCATAATGTCTTTCAGTTCAATGAGATTTTAAAACCTACTAATTTTTATTTATTTATTTATTTTACATTTGTTTACTTATCTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCCACCTCTGCCCCCCGGGTTCAAGCGGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAATTCCTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGGTTGGCAAAACCTACTAATTTTTGAAGAAAGATAAATGTAAACACAGTGGTCCCTTTTTATCCTTGGTGGAGGGTATATTCCAAGACCCTATGGATGCCTGAAATTGTGGAGAGTACCTAATCCCATATATACTACATTTTTTTTCCATACACACATACCTATGATAAAGTTTAATTTATAAATTAGGCACAGCAAAGGATTTACAACAATAACTAATAATGAAATAGAACAATTGTAACAATACACTACAAGAAAAGTTATGTGAATGTGGTCTCTCTCTCTCAATATAATGCCTATGTGATGAGACGAAGTAAGGTAAATGGTATAGAAGTTGTGACATATGTTAGGCTACTATTGACCTTCTTAATGAATTGTTTATTTCTGGAATTTTCAATTTAATATTTTTGGACTATGGTTGACAGGGTAACCGAAACTGTGGATAGAGGGGGCAGGTGGGGACCACTGCAAGTTTTGAGAATAGAAAGGCTGGAATGAAAAACTTTCCTGGAGATCCATTTGTTCTAACATGTTAGGGCCCATTGTAATTTTGGTTTTCTTTTAAATGGTTAAACATGAATGCCAGGAGAAGCTGGAACTGTTCGCCGTAAGGGTTTATGTCCTATCGGCTCCCACCTCTCAGTCACAGCTTGAGGTGTGGTTGTATGGGCCGGGTCTACTCACCTGAAGTTGGGACTTTCCTGCTAGCTCCTGGTAATATGGGGACTGGGAGTCAGCGAGCTCTGCCTTGAACTTCTGGTTTACCAGAGAGACGCTGAGCTCCACCCTCTGCTCCTCCAACACAGCGAATTCTGTTTCTCTTTCCTGAGTTTAAAAAAAAAAAAAAGGACTTCTGTTAACCTAAACCACAAATAAATGGTTATTTTAGATAATATATGTTGATACTGTCTCAAGAAGTGGATTATGAAGGCTTAAGTGTTTTGCAATCAAAATCCTTTTAACTAGAACTTAGAGAAGAGCCTAGACTGGTTTAATGAGAAAATTTGTGCTTAAATTTCACATTGAAACTAGTTAGAAAATACTATCAAGCCAAGAGAAAGTTTGAAATTTCTCTCAGAAGGAATGATGTATTTGGGCCACCTTTGGAAGCAGGTGGCTAAGAACGGAGGCATGGTTCTGAGGATCTGGACTTGGTCTCCATCACTAAGGGCCAAGAGGTCATCCTTCTTGCCTGTTGGTCTGGAAACCAGCAGGGGTTTCTCATTGCTCTGAATTCATATGGGCTTCCAGGACACAGAGCAAGCCCAGAGCTCAGTTTCAAACTTGGGTTTGACAGAGTTTTCAACCTTGGATACCCAGAAGATACTAAGGCCCATTAGTTTTCTTAAAAAAGTAAAATTATCTCTGCGGAAAATTGAATATCTCTGGTTACGTACATGGTCTCTTATAGTGAAATCAGAGTTACAGAAGCTGAAAGAAGAGAACAGTTAATGGAAATTGCCCTGAGGGACAGAGCTCAACTGGATAAATGGTAGCATATGTATTTCCTCCTCATTTCTTGTCACAAACTCCCCTCCACCATGGGCATGGACAATACTACAGCCTCTCTCTAACTTTAGTAGGACACAAGGAGGATGTGGATTCACATTTAAAAGACTTCTGATGTTTGTTTAAAAGACTTTCATTCATTCAAAAAAACACACATTGAGCATCTGTATGGGTGTAGCATGGTGCTAGGATCAATGGGACACTGAAAAGTCTGACATGCAGTATTCTTTAGAAGTATTCCATTTTGTTAGGCAAATTGGAAGTTTCATGGAACATTTAAATGACTGTGAAATGAAATATTCTGGGGATATTTAACCAGAGAGAAGAACTTATATTAGCTTTTGAAGAAGATGGGACAGAGGGGTTGTGAGAAAAGAGATGAGAGATGAGTTGTCTTAGAAATTTTATAGTGAATATATACTGAATTATGGTCAACAATTTTTTCCAACAGTACTTTTCACTGTTGAGGGAAGAACATTTTTCAGAAAAATACAATATTTTATTTATTTCTTTTATTTATTTATTTTTTTGACACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGATCACAACTCACTGCAGCCTCAACCTCCCGGGCTCAAGCAATCCTCCCTCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGGACCACCATGCCCAGGTAATTTTTAAATTTTTTGTGAAGATGGGGTCTCCCAGTCTCGCCTAGGCTGATCTTGAGCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCTATGTTGGTCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCGAAATACAATATTTTCATTCTTTATTCATGCCAGCAGTTCAACCAAAACTGGAACCATGTGGCCTAATGGGCAGATAGGATGGCCAGCAAGGTCTAATCTCTGATTTATCTTGTAGAGCTGGTGAGGCTGAACTTTGTGCCTTTGCCCTGAAGCTTTGACCTGTGCCTTGGAGAGAGGTTGTAATGAAGGGGAAAGGGTTAGAGGAGTCACCTCTCAGGCCCCAGGGGTGGTAGGTCTGGTGGTAGTGGCAGTGTGAGATGCCAGGTTCTAGTCTGCCACTCCTTATACTACTGCCTCCTTTGGGGCCTACTGCCTACTTTGTGCAGCCAAAGCTCTACACACATGGCTAATGAGTGAGGACTAAGCTCTGAGTTTTTCTTATCTTGCCCAAATTCCTATCTAAGGGGTTTGGGGAGTCATGCCCTACAAACCATAAATTCTCATCAGATGGGTTTTATTTAACCCTATATATATAGTGTGACTTACTTTCCAATCTGACTCTGGCA
TCAGTTGCATTTATACAAACAATTACTGAGTAGTTAACTGCATCCCAAACTCTGTATTAGAAGGTTAGGCATCAGAGATTAAAAGAACAGCTCCTGTTCTCTAGGAGAAGCTCATAGCCTGGTGGTGATGAGTGGGGTGAATGAAGAGGAAGGAGTAGAGATAGCAAAGGCCATAGACACATAAGCAAGCAGTCTCAAGAAAGGGTGTTGTGAAAGCAATGAGTGAGCCCAGGAGAGACACTGGATGCAGAATGGATAGAGGGAACTTTCCATGTTGAAGTATGTAAAACAAGACTTGGAGAAGGGCATTCTAGACAGAGCAGACAGCACATGTAAAGGCTAAATGGGGGGACAAATTGGAAATAGTTTGCATTCCTGGAAACTAGAGTGAAAAGGAGGGGGATGATAAGGAACTGGTATATGGTGAGGCTCAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAGATCTTATTATGGTATATAGATGCCACACTCAGCATAGTAGCTGGATTTATCCTGCAGGGAATTGAAGAGATTTGAATTTAATTAGAGACAGACAGATATAACAAAGGTCAGAGATGGAAGAGACATCTTGGGAAAGCTCCTCAGTTTATTAATTGATGACATGGACAATATAATTGCCTTCCTCTTATCACCCATGAAAAATATTGTGTCTTTAAATTGCATCAAACTGTAAAAATAGAAATATTATATAAAGACAAAGTATTATGAATTAATAATTTATACTTTAACCCAGCATCTTCTCTACTTGGTGCCTACATAGTCATTTTGTTTTATTTAAATCTACTTTATTGAGGTATAATTGACATATCAAAAGCTGTACATATTTAATATATACATCTTGATGAATTTGTCTATAAGTATATACCAGTGAAACCATCACCATAATGGTCATCTAGGCATAGAGCAGCTGCATAATGTCTTTCAGTTCAATGAGATTTTAAAACCTACTAATTTTTATTTATTTATTTATTTTACATTTGTTTACTTATCTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCCACCTCTGCCCCCCGGGTTCAAGCGGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAATTCCTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGGTTGGCAAAACCTACTAATTTTTGAAGAAAGATAAATGTAAACACAGTGGTCCCTTTTTATCCTTGGTGGAGGGTATATTCCAAGACCCTATGGATGCCTGAAATTGTGGAGAGTACCTAATCCCATATATACTACATTTTTTTTCCATACACACATACCTATGATAAAGTTTAATTTATAAATTAGGCACAGCAAAGGATTTACAACAATAACTAATAATGAAATAGAACAATTGTAACAATACACTACAAGAAAAGTTATGTGAATGTGGTCTCTCTCTCTCAATATAATGCCTATGTGATGAGACGAAGTAAGGTAAATGGTATAGAAGTTGTGACATATGTTAGGCTACTATTGACCTTCTTAATGAATTGTTTATTTCTGGAATTTTCAATTTAATATTTTTGGACTATGGTTGACAGGGTAACCGAAACTGTGGATAGAGGGGGCAGGTGGGGACCACTGCAAGTTTTGAGAATAGAAAGGCTGGAATGAAAAACTTTCCTGGAGATCCATTTGTTCTAACATGTTAGGGCCCATTGTAATTTTGGTTTTCTTTTAAATGGTTAAACATGAATGCCAGGAGAAGCTGGAACTGTTCGCCGTAAGGGTTTATGTCCTATCGGCTCCCACCTCTCAGTCACAGCTTGAGGTGTGGTTGTATGGGCCGGGTCTACTCACCTGAAGTTGGGACTTTCCTGCTAGCTCCTGGTAATATGGGGACTGGGAGTCAGCGAGCTCTGCCTTGAACTTCTGGTTTACCAGAGAGACGCTGCGCTCCACCCTCTGCTCCTCCAACACAGCGAATTCTGTTTCTCTTTCCTGAGTTTAAAAAAAAAAAAAAGGACTTCTGTTAACCTAAACCACAAATAAATGGTTATTTTAGATAATATATGTTGATACTGTCTCAAGAAGTGGATTATGAAGGCTTAAGTGTTTTGCAATCAAAATCCTTTTAACTAGAACTTAGAGAAGAGCCTAGACTGGTTTAATGAGAAAATTTGTGCTTAAATTTCACATTGAAACTAGTTAGAAAATACTATCAAGCCAAGAGAAAGTTTGAAATTTCTCTCAGAAGGAATGATGTATTTGGGCCACCTTTGGAAGCAGGTGGCTAAGAACGGAGGCATGGTTCTGAGGATCTGGACTTGGTCTCCATCACTAAGGGCCAAGAGGTCATCCTTCTTGCCTGTTGGTCTGGAAACCAGCAGGGGTTTCTCATTGCTCTGAATTCATATGGGCTTCCAGGACACAGAGCAAGCCCAGAGCTCAGTTTCAAACTTGGGTTTGACAGAGTTTTCAACCTTGGATACCCAGAAGATACTAAGGCCCATTAGTTTTCTTAAAAAAGTAAAATTATCTCTGCGGAAAATTGAATATCTCTGGTTACGTACATGGTCTCTTATAGTGAAATCAGAGTTACAGAAGCTGAAAGAAGAGAACAGTTAATGGAAATTGCCCTGAGGGACAGAGCTCAACTGGATAAATGGTAGCATATGTATTTCCTCCTCATTTCTTGTCACAAACTCCCCTCCACCATGGGCATGGACAATACTACAGCCTCTCTCTAACTTTAGTAGGACACAAGGAGGATGTGGATTCACATTTAAAAGACTTCTGATGTTTGTTTAAAAGACTTTCATTCATTCAAAAAAACACACATTGAGCATCTGTATGGGTGTAGCATGGTGCTAGGATCAATGGGACACTGAAAAGTCTGACATGCAGTATTCTTTAGAAGTATTCCATTTTGTTAGGCAAATTGGAAGTTTCATGGAACATTTAAATGACTGTGAAATGAAATATTCTGGGGATATTTAACCAGAGAGAAGAACTTATATTAGCTTTTGAAGAAGATGGGACAGAGGGGTTGTGAGAAAAGAGATGAGAGATGAGTTGTCTTAGAAATTTTATAGTGAATATATACTGAATTATGGTCAACAATTTTTTCCAACAGTACTTTTCACTGTTGAGGGAAGAACATTTTTCAGAAAAATACAATATTTTATTTATTTCTTTTATTTATTTATTTTTTTGACACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGATCACAACTCACTGCAGCCTCAACCTCCCGGGCTCAAGCAATCCTCCCTCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGGACCACCATGCCCAGGTAATTTTTAAATTTTTTGTGAAGATGGGGTCTCCCAGTCTCGCCTAGGCTGATCTTGAGCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCTATGTTGGTCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCGAAATACAATATTTTCATTCTTTATTCATGCCAGCAGTTCAACCAAAACTGGAACCATGTGGCCTAATGGGCAGATAGGATGGCCAGCAAGGTCTAATCTCTGATTTATCTTGTAGAGCTGGTGAGGCTGAACTTTGTGCCTTTGCCCTGAAGCTTTGACCTGTGCCTTGGAGAGAGGTTGTAATGAAGGGGAAAGGGTTAGAGGAGTCACCTCTCAGGCCCCAGGGGTGGTAGGTCTGGTGGTAGTGGCAGTGTGAGATGCCAGGTTCTAGTCTGCCACTCCTTATACTACTGCCTCCTTTGGGGCCTACTGCCTACTTTGTGCAGCCAAAGCTCTACACACATGGCTAATGAGTGAGGACTAAGCTCTGAGTTTTTCTTATCTTGCCCAAATTCCTATCTAAGGGGTTTGGGGAGTCATGCCCTACAAACCATAAATTCTCATCAGATGGGTTTTATTTAACCCTATATATATAGTGTGACTTACTTTCCAATCTGACTCTGGCA
Task1_train_10577
This sequence variant lies in PHIP (PHIP subunit of CUL4-Ring ligase complex) on Chromosome 6. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; PHIP-related behavioral problems-intellectual disability-obesity-dysmorphic features syndrome
TCTGTAAAATAAGCATAATAGTTCCTACCTATAGAACATTTAAGGTTTTAAAAGAGTAAATAAATAGAAAATGCTTAGAACAGTGTCTGGCATACAGGAATTACTCACAAAGCAAATGTTATTTACCATCAATCATTCTTACACTTTCATTACCTACCACAGGCCTGACTGACAATGTACTGAAAGAACAAGCATAACGTGTTCTCCTTATTATGTGGATCTATAGTTTTTCAAAGACAGGATAAACTTTTCCTAAATGGGAAAACTCCTATAATATTTTATCTTTCCCTTCTTGCAGGAATCCTATTATACCACCTTAGAATACTTTTCTAAGTACAAATATACCCTCGTCTCTCAAATTTTTTTGTTGTTTTAATGGTTGTTTATTATAGCAAGATTATATATTGAAATTATTTAAACAGGACAATCTTATGTTTTAAAAAAAATCATAGATGATTACCCACCACGCAGATATCACATACGTTATCTCTGAAAAGTAAGTCAGAGCAAACAATTCAGAATACATCAGAGAGTCAAAAACATGTAAAACATAGAAGAAAGGATAACGAAGCAGATAAAGTGTTTAAGTCCCATAGGAAAGGAGAGAGAAAGGAACACAGAGGTTATTTTAAGATAATGACTGAGAATTTTTCAATGTCAATAAAAGACATTTCCAGAATCTAAGCAAGACAAATTTTTAAAAAATTAACATCAAGACATATCATACTCAAACTGCAGAAAACCAGAAAGAGAAAAAATCTTAAAAACAATTAGAGAAAAAGGGATTGCCTTCAAAGTAGCAAGTTAGATAGTAGATTTAAACCCAAGTACATCAATGATTATATGTAAATGACTAAATGTTCCAGATAAAACACAGATTATCATATTGTATTTTTAAAAGCCACTTTTATATTTTTAAAAGACAAGAAATAAAAGGAAACAAAAAGTTGAAAGCAAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAATGCCAAACAAAAGTCATATAAACTTACGATCTGTATAATAAGTATCCAGAAAAGGAAGAATTAAGTAAGATTTGAACAGGTGGAAGAAAGAAGAGTAACATTCCTGGCTAGGCAGGAACATGAGAGTGGAAAAGAAGCTATGATTGAACTTTGAAGGTCTCTGAAAATTAGGAGTACACTTAGAGAAAGTACAACACTATTAAAATATCTTAACCTCTTTATACTATCTTCAGCAGAAGAGTGACACAACAAAGGTAGAACTGAATAAGGTTACTATTACAGTGTTACACACTATACTGGGAGGGAGAGAGAGATAGAAGACACCATAGGCAAGAAGATTAGTTTGGATGATGCTGTATTAATCCGGGTAAGGCAAGGGCCTGGTAGTAGCAGATGTGAAAGGCATGAACCTAGGAGGCATCTCAAGAAGACATACTTGCATCAGTACTCCCTCTTTGAAACTTTAGCCAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGTACTGTGCTCTTAAAAAGATAACTACTTTTGTCTCCTACCATTATAACTAATCTGAATTATATATTGATTCTACTAACTCGACCTAATAATATATACCTTAATATGGAACTTTCGTAAAAATAAAATTCCAATGAGCTAATTGGCCTACATAAGGTGCAATGTGCACAATCCCTCATTATACATGACTTTTTCACTATTAAAACTACTACTAAGAAAAAAAATCTATTTTTTTCTTTTTGAATGCAGATGTACATAATATGAAGTTCTCTAATACCACAGTAACTAAAAAACCTTTTCATTTTCAAAAGCTCTTTACCAAGAGGCTATTAACTACTAGTGAACTCAAACAACTCACCAATGCTGGGTGGGCTACCATAGTTAACTGGTGACTCAGGTGGTCTTCCACAGTGCAACGCAGCCAGAGCAGATCCTTTCCACACAACATGCTTGCAGCCTATTAAACACATGTATTTTTATGCATACAAAGAACACAAAAACAAAAGTGAGATAAATAATGTCTAAATCCTATGAGAAAATTTTCATACTTTTATTTGTGCGTAGTAAAGACTGTCTTCCAGCTCCTAATAAAGTTTGTACTCCAGGAACACTTTGAGGAATTTCTTGTTCAAGAAGAGGTCCTAGTCGATGACATATTTGCAGCAAGTGATCAGGTGCTAAGTGTCTGTAATACTTCACCTATTATGTAAAAGACAAATATAGTAGGTTTCAGTTTATCATTTTAATTTTCAAAATCTTTGAGCAACAATAAAAAAATTCATCCAAGTATAAAATATTTTGTTTTGCGTCTTTGATGTAAAGTAAATCTCCAGAATAATTAAGAATTAAGAACTGATAGTTTGTTATTAAAAAATTTAAGAACACTTAACATCTATGCTGAATTTCATAATTTACCAAAAACCTTACAGAGAGAAAGGCAAAATTCCAACTGCTGCTTTAAATATCTTTCAATCATAAAATAAAGCTACCCACTATAAAAAGTTTGAGCACTTTTGGAACAACTTCAAAATACTGCTTAATTTATACCGGCATTTGAAACCATGACATGAAATGCTAATATTTTTATTAGTCTTTCAGTAAATAAACAATATTCACTATCTAAATAAAATTATATTGGAAAAAAATACTATTGTATTACTTCATAATTAGCTATCAAGTTAGAAAAAAATTTCCACAGTAGTATCTAGTTCAGCTATTCTCAAAGTATGTTTTGGGAACCCCTGGAGGTCCCTCAGATAAAACTTATGAATAACACTATATTAGTTGTTTTTCACTTTTTCTCATGAATGCACGGTGGAGGTTTCCACAGGACACATAACATGTGATGTCTTAACAGACTGAATGCAGAAGCAGATAGGAAAATGTCTCCTCTATTAAGCCAGATATTAAAGATTCACAGAAATGTAAAACAATGCCACGCTTCTCACAAATTTGTTTTGTTTGGGAATAATTATTATAAAAATGTTACTTATATTAAAATAAGATTAGTTTATTAGTATTATTTAATAGGTCTCCAATATGTTAAATGCTAAGTTTCTAATATGGTAAATACCAATAGATTATAAGCTACACAAATAAAGGAACTTCAATACATTTTAGTAAGTGTAAAGGGGTCCTAAGACCAAGAAATTTGAAAATTGTTCCTCAAGTTTACCAAGTAATGGCAACTTTAACATGAATTCCTTTTGATAAGACTGATGTGGGGGGAGGTGAGGATTTAAATCATCTCATTCCATCTTGCAATATCTGCTATACTCTTAACTGCAGAAATCCATGAATGATATGTTTTTAAAGGTAGCTAATACCCATCTAAACTGAAGCCAATAGGAGAAACCTACCTTACTCTTTATCAAAATACACTCCTTCTTTCACAAAGATAACATGGAGCCATACTGCCACCAAATAATCTTTGGTAAGATTATTTAAAACAGCAGTTTGGCATACAGTAGGTGATAAGCCAGTAAAATGAGTATTTTTGGAAAAAGGAGTTCTAATACAGTTTGTATCATATGAATTATACATATTACCTCCTTGTTTTGCAGTCAAAAAGCACACTGACATTGAAGTCTCTGAAAAATCCTGAGATTATTTCCCAAACTCATTTAGCTACAGAATCCCTTTTTTCCCTAATAATATCTATCATATTCACTCAGAACATACTTTAGGAAACACTAGTATGATTAGCTAAATTAAAAAGCATTTAAAAGAAAACTTACCAAAATGAGTTTTTAAAATCGTATACTTTTCTTTAATCTTCCCCAAAATAATTTACTCAAAAATAAAATTTAGAAGTCTAGAATACTTGTAAGGTTGCTTCCAGTTCTAAGCTTGCAAATGATTATTTTAATGTGACTTAATTGATCAAAATTCCTTTTAAAAATTTTACTTTAAAGAAGATGGAAGTTCATTACTTATTAACTTCAGATGTGTGATGATCCTGTTTTAGTATCCTCTGGCAAAATATATTTTCAGGTAGTGAAACTGAAAATCCTTACTGTAATATTCTATCTTTCAATAAAATATTATGAATCCACTCTGACTCAAGCTTTCTTTGGTGATTTAGAATGTTTGAATTTTTCAAAATCAA
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Here is a mutation in LOC129996745, PHIP (ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 17346| PHIP subunit of CUL4-Ring ligase complex) on Chromosome 6. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; PHIP-related behavioral problems-intellectual disability-obesity-dysmorphic features syndrome
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This gene mutation involves LCA5 (lebercilin LCA5) on Chromosome 6. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Leber congenital amaurosis 1
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Gene LCA5 (lebercilin LCA5) on Chromosome 6 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Leber congenital amaurosis 5
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Task1_train_10581
The gene LCA5 (lebercilin LCA5) is located on Chromosome 6, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; not provided
CATCCACCAAAAAAATCAAGATATGTTAATATTATTGAAAAAACAAATAATGGAATAATATATAATAAATGAACATGTATAACCAAAACTTATTAAATTTTACCATGAAAAATTTTGATACTGCATGAATTTTATGCAAAAAAAAGTAAAGTATGCTGAAAATTAAGGAAGGGGAAGGAAGAATATGCTATCAAACACGCAAACCCGAAAATTCGTTTAAAATGCTGTTTGAATCACATTTGTTTTGTCCCTAGGTTAGTCTATACTGATTGCAATTTAGTGTTTACAGAAACGTATCAGTTTGGTCTTGTTACTTGGTCTAAGGCAGACTAATTACCACAGATTTTAATTCAAAGGACAGTGTAAAACAGAAAACGGTACAAGTCAAATTGAAGGAAATAATTGAAATTTTCTGGCTGATGCTGGAACTGTTTTTCACAGCTTTTCTCAATTACCTTCTCAAATAAGGTAAGGCTTACAAAGTTCAGACTCCTTAATTGGGTGGCCTCCTAAGTTGTTTCTGGGGAATGAAGAAAAAAATTAAAGTATTCCTTACCAATACTACCCTAGGTATTTCTTGAGACTAACAGGCATTTTCTAAGGTTCAACCTTAAGATCTGTTTTGTTAGTTCTTAATTATACAGCAAAAGTTTAATAAGAGATCATGCTCTCAACTACAAAATTATAACAAGCTCCTCACTGAGACAGATTTGGAGAAAGAGACCAAAATAACAACAACAACAAAGCATTGTACTTACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGGTTCCCAATTGTTATAAATGGTTAGAAGTATGGAAATCCCTGAGGAGCTAGACTGGGGATCCATGAAAGGGTTTCTTTCAAAAGGAATACATATTCTTTGCAGTTTTTAATAAGCGAATATTATTTTTTGAAGTAAAAATTTATAAAGACAAACTTAATTATGTCCTTGCTTAAATCCTTTCAATGGCTAACTATTCGCCACAAAAACAGAGTCAATACATTAGCACAGGATGCAAGGCATTTCATAATGTGGTCCCTTGTTTCCCTTTTCCACCCACAATTTTACCACTCCTGGCCTTGCAATCTAAACTCTCACCATTTTAAGCTACTGCTGTGCTACTTTTATTAATGGGTACTGTAATTACCTCATTTGCCTTATTTTTCTATGCTGTACTTGTAAACCTTACATATTTTGTTACTAACTACAATGGGGTTTTCTTGACCAGAGATTTATTGAGATGAAGATATTTGTAGAATATTACATAGTCAAATATGTATGAAGGCCTATTTCCATTCTAGTAACATTTTAATAACAAAAATGACTTCTAATGATTAATCCAGTTTCCATTATAACACACTTCAAAAGAAAGCAAATTAGACCAAAGGCCCCAATTCCATTCCTAGGTTTAATTTGAATTTTTACAGTAAATACTGTATTACCTACAGTAAGTAATTTTACTCAATCTATTAAAAAGTCCCTTAACCACTTTATGTCGATGCTTTTTCTACTTTCAAAAAATGAAGATACAAAAAGGTACATATGATTTATAAACTTTTTTGCCTTTACAGTACCTCAGAAACCCCAAGACAAGCATTTATTTAGGAAAAAGAAAAAACAAACTGAGAAGGCTTAGCTATGTTTCCTTCTGTATACTGTATGACTTTGAATATAACAAATTTAATAGTACCATCAAGCAACATTTATATATACTTATAAGTATATAACCTATAAAACGTAAATCAGCCCACTTCCATGTATACAACAACATATATACTAATAAAAGAGTATCATGCACACACATTTTCCTTAAGCACTCAAAATGAGTCTTCTAGGTCCACCAGACTCTTTTAAAGAATGCTTACCTTGGTGATGTACTTGGCCATCTGAAGTTTGTCTTTTAGGATTTTTTCTCCTAACACTTGCAGGTGAAGAACTGACCAGCGATGATCGGCCAGAAGACTGTGGCGTTTCAAAATCAGATAAGTAAGAATAATGGTGTTTGCCTGCCTTTCTTTCTTGATCAGTACCTGGACTTCCTGCTCTTTCCCCCATTGTTTTGAAAAATGGTCTCTATTCACATAATTTCACAGATTATTTTCTCCAGAGGAGACTATGACAATACTGAAAAACATTTTCACAGTCTTCAGATCCTGATAATATTCATTTCTGTGCAATCTATTTTCTCCACAATGTATTTGTAGACCACAATTCACATTGGCATCCAGAAGATAAACTTTTTTGCCCTGAAATTAAGGAAGGGGAAAGGAGACTTATCATACAGTCTCTACAGTTTCTACAGTTAATTACAATGAAAGACACTAAAAGCAAAATAATATATAGCTTACAATTTTTAAAAGAGGCTACAATTTATCTATATTTTCACAGATAAGTTACTTACAGTATTTGGAGAAAATACAGACTGTCATAGCCTAGATAGATAATAAGTACCTGACATACAACTACTTCTGAATAAATGTTAACTGAAGTTGACTGTTTAATTTTAAGAGTTATACTAGAGGCAAATGCTGAATTTTAATGGACAATAATGATCAAATCACCAGTTTTTTCTTTTTTAGGCAGGGAGGCAGTGGGAGTGGAAGTAGTGGTGATAGTAAAGAACAAACCTGCTAATAAGAATAAATACACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCATGAGGTCAAGAAACCAACAAGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTCGAACCCAGGAGGCCGAGGTTGCAGTTAGCCAAGATGGCGCCACTGAACTCCAGCCTGGTGACAGAATGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATAAAGAATAAAAATATCCAAGATTGACCACACAAAAAATGTATAACTAAAGTACATTTTTTAAAAACTAAAAGAAAAAATACTTGATGAGAAACATTTGCAAACATGACAAAAAATTGTTATCATCTTCAATACATAAATATATCATCCTTTGAGAAAAATATGAGGTAAAACAATTAAATGGGCAAAATATATAAGACTCCAAAAAGGCAACATAAATTATTAAAGATTTTTCGAAATAATAACACTCAATGCTGTCAGAGTTGCTATCAGAAAAAGATCCCTAGAGTTTTTTTGGAAAAACACTGGCAAAATGTATTGTCACTTTAATTATGCTTTAACCTTTGATACAATAATTTCTGGACTCCAATAAAATAATGCTAAAATTAGGAGAAAAGTTATGTGCAAATATTTAATGTAGTACAGTACTTTTTTTTTAATGGAAGCAAATTAAATGCCTAATCATTGAGGAATAATTAAGTATTTTATAAATCCATACAGCAAAATATCATGAAGCTACTGATAATGTTTACAAAAAGTCTGTATTTAAGGAAAATGCTTATACTATTATCATAAAGAAAAAATTCAAATTAGTGCATACAGTATGATCTCAACTACACACATTCATTAAAAAAATACTGAAAATACTATTATCCCTATCTGAATTCAGAAACTGAAAACATTTTCCAAGCAAGGAATACAAGAACACCAAAATAGTCCCTGCCTGACAACATGGATTTTAGATAATTTTATCTCTCCATTAACATATTCTGGTTTTCTAACACAACAAAATTGGATTACTTTTATAATCCAATTTAGAAGAAACAAACATCTCTGATGAAATTAGTATTAAAAGTATCGTTCTTCTAGTAATAACATATGAAAGGACATGCACAAGGCAGCACTATTTATTGTAGCACTATTGTAAGTAGAAAACTAAAACAATAAAATGACCAATAAGAACTGGTCTTACAAACTATAAACATCCACACAATGAAGTATATGTAATACTATGAAGCTATTAAAGGAATGAAGACTATCTCTGTGTATTGCTCATAGTCTGGCATAATCTCTAGGATATACAGAGAAAAGAAAGATGGAAAAAAGCCTGCAGTATGCTACCATTTATCAAGGAAGAAGGGTAACATACATAATTTTTATATATTTAAGTAGAAGGAGAAATCAAATAATTAAGAAAAATAAA
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Task1_train_10582
A variant was discovered on Chromosome 6, affecting LCA5 (lebercilin LCA5). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_10583
Gene ELOVL4 (ELOVL fatty acid elongase 4), found on Chromosome 6, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; not provided
AGACAGTTTACATTATAATAAACTGATTAACAAAAAAAAATCATATTTTTCCCACAGCAGAAGTATATTTATTGTGCTGAAATCAGGTAGCAGGGAATGAATAGCTCTTGGGAACCAGTACAGAATGTTCACAAAGATTTACAAATCTCAGTCATTACACACTGAGCAACAAAACAAAGGTGTTGAATCCTCTTAGATCAAACTACTTTATATGTTGCAAATTTTCTGTAATTCTCATGACTGCATGCCTTTGGGGAAAAAGTATTTAATTTTAATGCACAATAAATATGTTATAGCTTACAAAATATTCTGAAATAGTTTGTACAAACAGCATACATCCTACACATGCAGCTTTGACATGTTGTTGAGATACTTAAGAAATATTCATGCTTTTTTTTGGTCACATTTTGTCTTTCTCTAGTAATCCCTTTGCAACATCCCTTAAAAAATTAACCTATGTAGTAAAACATGATACAAATTCTTTCCTACTTTATTTCCAGTTGTTCACTTATATTACATGAAATACTTCATTTGTAAATAGCAAATTGAATGTTATAGTTCTGACTACTCTCACTTTTATTCATTTTGTGTTTTAACAACACCTTGTAACATCAAGCATTGAATTTAACAATCTTTAGCACCAAGGAGTCAAGAATATTGCACCAAAATGGGTTTATACTTCATACCTAGTTAATAAATAAGATCTTGCAACTTAGTCACAAGGAAAACGTTACTCCAAAATTAAACACATTGAAAGAGAAGGATAGTTTCACAGAAATGTTTGGTGTATGCTATTTGTCATAAAAGCAAAAAAAATACTAGTGGATTTGAAAGTTAACATTAAAATTTACATTAGAAGACTCCTTGATTTTTTAATTAAAATTTATTTAATTTTAAATGTTCTTTCCAACGGAAGAGGTAGGTATATTTCCACATATGAAAAATCAGGAACAGCCATAAATCAAAACAAGGAAAGCCTGATAAAAATCAACATATTCTAACAGCACATAAATGTAACTATCTTATGATGTTACTAATAAAGACATGAGTTGTTTCATGTTTCAATCAGACAATAATCTTAATTTTCATAATATATTTCTGCTACTAACAGGAGTATTCAAATGCTGCCTTTTCATCACAAAAAATTGTTTCCCCACAGTGATTTGTGCCTCAAGTCATGGTGATCTCTGGGTCACCAGACAAGACTTTACTGCAATTCTTTCTTATTTTCACCAACACCATCATCATCAAGCCTCTAAGATTCTACAGAGATCAGCAGATTTTAAAAATTTAATTACAACCAAAATTATACTCTGACTAGAGGTGGAGAGATTTGACCATTCCGGTCAGCAAATGAATTCAAATGTGCAAGTTTAAGTGTATACACATTTTCAGCTTTGGACAAGAAAATGTAACACCACTGATTTCAGTCAGTAGATAAGATAATTAGTAATTTATCAAAATAATTCATAAAGACCGTTTCTGTGATCGTCTAAAATTCAGACCGAAGAATGAGTGACTATAAGATACATGAAAAATCTCATCCTTTAGACAACTGGATGTGAACAGGGGGAGAATCCCCAAAGTCACTTAATGATTGCTTTGGTCTGGAGAATATCAAGGCTAATTTTTAAAAAAAATGTTTAAAATAAAAACTTCATAAATAAAACATCTGGGTATGGTATTAACACTTTACTCAGTCTAAGAGTTACTAGGACATAGAGCACATTTGTCTTTTCTCCCCACCCCCAAGCTCTCCTTTGCTTCTGTTTTCCCTGAAATTTTATATGATATGGGAGTTTTTCCTCACTGTCAACAACAGTTAAGGCCCAGTTCAATTTAATCTCCTTTTGCTTTTCCATTTTTCTGCTTTTTTCCATTTTCTATCATGAGTTGTTTTTCTGATTTGCTCACACCATTTGCTGAAATACCATTCATGGCTGTTTTTCCAGCTTTTGGTTTCTTAGGCTCTTTGTATGTCCGAATGTAGAAGTTAAGAAAGAGAAATATGAAGCTGATTGCATAGGCAATTAGAGCCCAGTGCATCCATTTGGGGAAGGGGCAGTCAGTGTAAAGAGACAGTGCCGTGTGCCCAATGGTCACATGGAATTGAATCTGAAAAACAGAAATGACAGCACAAAACATTTAATCTGAATAGTAAACAACTTTTAACAACATCGGCATCTTCTACATAGCTATCACAGGCCCAAATTTTGCCACACTGTGCAAAATTTATTGTTTTCTGGCTCCCATGGCTAGCTCCTCATTCACAACTCAAATGCCATCTCCTCAGTAAGGACTCTCTGACAAGACTTCAATTTCAATTGGCCCTCCCAATCCCATTAACCAAAGAGCTTTCTGCATTTTTTTTAAGGAGAATTATACCTATTTGAAATTGTCTTCTGTATTTGTTATTTCTTTATTGCCTATCTTTCCACTAGAAAATGACTCTAGAAGGCAGGGCTTTGTCTTGCCCATCGGTGATTCTTGAGTCCTCAGCACAGCATCAGGATCAATGAATATGTGTTGAATAATGTTATCTGATGAAAGGGAATCAATGGCCTAGGAGAGTAAAGTAATAGTATTGTAGGCTCTTCAATTTTGTTTTCCTCCCACATTTTACATTGGTTTCTTTCTATCAAATTGTCAGCAAGCAGATACACATACTTAAAATGAGCTTATCAAAATGGCTCATTTATTTCTTACAGATAGTAGGCAGGTAAATTTTTATTTGAACGAACACTATCCTTTAAAAACTAATATTTTGATGGCCAGGTGCGATGGCTCATGCCTGCAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCAACTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCCCATTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTCCATGACTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGAAGAATAGCTTGAACCCAGGAGGCGGAAGTTACAGTGAGCCCAGACTGCACCATTGCACTCCAACTTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCCCAAAAAAAGAAAAAAATAATATTTGGATAAAATTTAGTAGATATTTCAGAATAAATACAAAAAGAATCACTTTCAACTTTAAGAATTTTTAAAAGGAAAAAAGCCCAAAGTGAGATGATTAAAATGAAATAGATTCTGATGTATCAATAAAAGAATGGGTCAAGACATAATGTTAACAAGGGTTAACTTTTTATACAATTAACTTATATGACTAACTGTTGTGGGAACTTCTGGCTTGGAAATACAAACTCAACATCCTGTTTGAAATGGACAATTGTGGTTTCTCTTTTAAGGATAGCATTGTTCTTAAAATATTAATTATTGATTAAAATAATCAGTATTACTTATTTTAAATATTAAAATAATGTATGCCATGTAAGCTAAAAATTTATACTATATTAAACTTTTATAATTTTCCTTGGCAAATATTTTAATTTGAAGAACTTGTGGTTTCACAATGGTTTTTAGAAGCTGCATCACCAAAAAGGGTGTGTATAAGGGTGTGATTGGGTATGGCATCACTCAAGGAGAGCCAGGTGTAGGCTCCAACAAACCAGATAGGACTAATTCACATGATTTTGATCACCTCTTCATTTTCTTAGGTCCATTTACTACTTACTGAGAGAAATGAATTACACAAACTGTGTTAACAGCTTTTACACAAAAACTGGAGGAAGCTTCCTATACCACTCCGGTTACAAATGAATCCTTCGCACCCAGCATTTCCCAAAAGTTGTGCTTCCTGTTTGGTTAGCCAGCTGTTTAGCAACTTAAAGCAAAGATGAATATTATTTCCAAATGTGATTCCACTGATAAAATTGTGCACATGCTATGATTAAAGCAAATTATAATAAATTCTAAAGCTTGAAAAATAGTTACCAGGTTGGCTTTGAATTTCCAGTTTGATTACAGGCTAGTGCCTAGCATCTGAAAGGTACACTAATGCACACACTCAGATTGCCACAAACAGTCTTACTAGCGGGATGTGCTGAAAACTGTCTGGACTAAAGACCACCATTTGAAAATATCTGTCTCTGCTCTCTT
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Task1_train_10584
An alteration has been detected in ELOVL4 (ELOVL fatty acid elongase 4) on Chromosome 6. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Stargardt disease 3
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Task1_train_10585
This mutation occurs in ELOVL4 (ELOVL fatty acid elongase 4) on Chromosome 6. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Congenital ichthyosis-intellectual disability-spastic quadriplegia syndrome
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Task1_train_10586
A genetic alteration is present in ELOVL4 (ELOVL fatty acid elongase 4) on Chromosome 6. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Spinocerebellar ataxia type 34
TACAATAAATGAATACACATTATTTTTTAATATTTAATCTTGAGTACAGATTAGAAATGAAAAATATAAAGTAGTACTAATGAAAAAGTTTTCCCTTCAGATTAAGCTAGATATTTTTAAAGTTTAGATTTGAGGTTTTACCATATAAATAAAAATGTATGTTCAAATGCAAAGGACTTTCACAGTTGTAGGTTTTCAAATGGAGTACTCCAGTGAGCTTAAATAGGCCCTTAGAACTGTTGCCTATGTTACTTTTAATTCTACTATTCTTGCCTTTAGATGTGCCAATATATATATCTGCAACAAAACAGTACTTATTTCTTAGGTTTCTAAATAGTTTAAAATATGACAGCACTACACACATTGAATAATTCATTTAATATAGATAAATCTACAGAGATATTCCAGTCAGTCAAACTCAATGACATTCTTTCTTTTCAGAATATTAATTTAATCAAGGTATAGATGTAATAATAATTAATTTTTGTCATAAAGTGATCTAAGTCAGTTCAGATTTACTAATTTTCTTTTAAAATTACAGAAGTTGCCTTTAACTGTATTGTTTTAAACTGGGCCCCCAATAATATATGTATGAATTCCTAAGCTGCCAATTATCATAATATGACAATGGAAAGCAGCAAGGTGAACTATACTATAATGACTTGTACCCTGGATCCTCCTCAGAGGAATAATCTGCATCAAGCTCAACAATGTGAATCATCCTTAATCTACAGGCATCTGAAAAGACAGGAGGCAGATCTTGGCCAAGCTATGAATTTAGATCCTCTTTAACATTAACAAGGCTATATAAAATTTCCTTTGAATAAGAACCAACAAGACCTATACAGGCTGAGTATTCCTTATCCAAAATGCTCAGGACCAGATGTGTTTCTGATTTCAGATTTTTTTAAACTTTGGAATATTTGCATAGACATAATGATGTGTCTTGGGGATAGGACTCAGGTCTAAATCCAAAACTTCATATACACCTTATACATGTATCCTGAAGGTAATTTTATAAAATTTTAAAATAATTTTATGCATTAAACAAAGTTTGTGTACTCTGAACATCAGAAAGCAAAGATGTCACCCGTGTGGACATTATCTGTGGTTGTTTGGCATCAACATTATGCTGTACATGGAAAAGGGCTAAGAGGGTCTTTTTTCCCTTAGGTATACTGAATAAAGTGTGTTCTGCACTTGTGTTTTGACTGTGACCCATCACATGAGGTCAGGTGTGTAATTTTCCACCTGTGGTATCATGCTGGTGCTCAAAAAGTTTTGAATTTTGGAGCATTTGGATTTCAGATGTTTAGATTAGGGATGTTCAATCTGTATTAGGGCAGGAGTGAGCTATGGGCTAAGATGGAAATCTTCAGATTTGAGGGGCTGTGTCTTGGTATTCTTTGGATCAGAACTACTAGACCCGTTCCCCATCAAAATATTGTTTTCTACCTTTAGTCTTGGTTTATGCTCATCTCTGGGGCAAATCTTTAGGTATTAAAGTAGTCACAGATAAAAAGCAAAAGTTATACTTGCCTCAAATTTTTTAAAAAATGAAATGATGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCGAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTAGGCGTGGTGGTGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTGGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATGAACATGGAAATGATTAACCATGAAAGCAAGTTAAATGGTAGATCAAGTCAAAGTCCTAGGTTCTCATTGCTTTCCACTGAACACATATATGCAATTAAACGCAAGCAGTATATTCCTGAAAATGCTCACCTTGTCCTCCTGCAACCCACTTAATTCCAATCCACCACAAGGTAAACATCGTACAGTGATGATACACATGAAGGAAAGAAACTTGGTTGTTTTTCTTTCTCAGAATAAAAAACACTGTGTCCAAATACTCAACTCCTTTAGATACAAAGTACCACCACAGAGCAGCAGCTATCTGTAAAAAGGGAAAGCGTGTTATAAACACCAAAATGACACTATTGTATGGGTTTATACTCATTGTAAGTAAGTCCAAAATAAACATTTGTATATTGCACAAAATGTACAAGGCATGGAATCATTAATGGCTAAGTAGGTTTGAAAAACCTAAGCATCTCTCCATGGGGAAAAATAGAAAAGAAAGAGTCCAAAGCTCTATCTATACAGTGCCAATAAGTTAGAGAACATTTTCTGTCTATTCCATAGGTAGATGTTACATAGTGTCAAACTGCTGAATACAGAGCTGGAAGCACATTCAGACTGCTGTGCTTTTCAACTTGGTAGAGGAACTAAGATGTTTACTTTGTAAAATGATTTTAGTTGTTCATGCTTAGCCTACATTATACTACCTCAGAAAAACTTGCAAGTAAGTTCATGTAGCAACTGGTCTCTACAAGTGTCTGCCTGTCTGCCCACCCTCTCCCCTCACCTCCCTCTCTCCCTCACCTCTCCGACTGCACCAATATGTGCAACAACATAAATATCCAATCACAGCAGTTTGTATTAGGTATTAAATCTTTAAAATAAAAAATTGGAATGAACAAACAAATATTTCCCAGGTCATAAATATAATCCTGCTTACATGAATAAGTCTTTTCTTTTCCTGGGCTCTAATTAAGGCACCAGATGGTACAGAAAGATTACATTACATACTGAGATTAAGGATCCAGTGAGAGGTGACCTCTGTATGTTTTAAAATGTTTTACAAGAATCCTACTGTAACAGTAAACCAAACTTAATTTTTTATGTCAAGTATTTTCTATGATAAGCATCCTATGTGCAAATAACAATTAAGGCAGTACATAACTAAAATCTATTTATAAGCTTTCATGTGTTAGGGCCCTGTCAGATTCATTCACAGACAGGCTTAGGTGTTTTAGAGTTGAAGGATCCCTTTGCATTTTATACCTGCACCTGGTATATGTCATGAGATTTTTGTTTGTTTTGGCTTTTGCATTTGAAAAACAAAATTATAATTTTAAAGTATGGGGAAAGAAGAAACAGAAAGCATATAAGAAACAAAGTATTTACAAACTGAGAATTATTTACTGAATTTACTTGAAAAATATCATTAAAAATGATATGAATTGGTTGAAAATAAGCTTGAAATAGTTAACTACTCCCAGCAACACTATAGTTAATATTCACTATTATATTAGTTCTTTAAAATAAAGTAACTGTCACCATTTTGGCATCGTAACCTTTAACTAGAAGGAAAGATACAATCTCTTATTTCTCCTCTATCTGGACCTCTACATTTGCCACAATTCACATAAAATAACAACAAATAAGTCTGCTTAGTTTGCAAACTGCACTAGATATCTTTAAATAAACTACACCAAAAAGTGATACTTCTTGGCTACGTAACAATGAATACAGAAATGAGTCTCTGCGTAAAATATTCACTCTATTGCATCCCATATTAGAGAGGAGAAGAGAGCACGAGGAAGATTTCAAATGAAATCTGTTGCAAATCTCAGGTTCTTTATCCTCCTAGATTACAGTTCTCATAATAGCTCATTTTTTAAAGACTTGAAAATTTACATCTGTAAGTGAGAGTGGTATTTTTAAACCTTTATCCTAAAAATAGTAATATGTTGCCCCACCCAAGGGTTTTTCTATGCATACTCCCAGAAGTCAGTCAGTCAAACACTTATCCCTGTTCCCTTCCCTACGGCAAGCAAGAAGTCAGCCCTCCAACTGAAGAGATTCTTTGGCAATAGTTATCAGAAGAAAATTTTTCATAGCCAATACATCTGAGTAGTCTCTCATTTTCTCTCAGTCACCTTCTAGGTTTTATTTCCTCCTTAGTCATTTGTTTACATGGCTGCTGTCTGCCTTCTCACCCTCACTAAAATGCCAGCCCCACAA
TACAATAAATGAATACACATTATTTTTTAATATTTAATCTTGAGTACAGATTAGAAATGAAAAATATAAAGTAGTACTAATGAAAAAGTTTTCCCTTCAGATTAAGCTAGATATTTTTAAAGTTTAGATTTGAGGTTTTACCATATAAATAAAAATGTATGTTCAAATGCAAAGGACTTTCACAGTTGTAGGTTTTCAAATGGAGTACTCCAGTGAGCTTAAATAGGCCCTTAGAACTGTTGCCTATGTTACTTTTAATTCTACTATTCTTGCCTTTAGATGTGCCAATATATATATCTGCAACAAAACAGTACTTATTTCTTAGGTTTCTAAATAGTTTAAAATATGACAGCACTACACACATTGAATAATTCATTTAATATAGATAAATCTACAGAGATATTCCAGTCAGTCAAACTCAATGACATTCTTTCTTTTCAGAATATTAATTTAATCAAGGTATAGATGTAATAATAATTAATTTTTGTCATAAAGTGATCTAAGTCAGTTCAGATTTACTAATTTTCTTTTAAAATTACAGAAGTTGCCTTTAACTGTATTGTTTTAAACTGGGCCCCCAATAATATATGTATGAATTCCTAAGCTGCCAATTATCATAATATGACAATGGAAAGCAGCAAGGTGAACTATACTATAATGACTTGTACCCTGGATCCTCCTCAGAGGAATAATCTGCATCAAGCTCAACAATGTGAATCATCCTTAATCTACAGGCATCTGAAAAGACAGGAGGCAGATCTTGGCCAAGCTATGAATTTAGATCCTCTTTAACATTAACAAGGCTATATAAAATTTCCTTTGAATAAGAACCAACAAGACCTATACAGGCTGAGTATTCCTTATCCAAAATGCTCAGGACCAGATGTGTTTCTGATTTCAGATTTTTTTAAACTTTGGAATATTTGCATAGACATAATGATGTGTCTTGGGGATAGGACTCAGGTCTAAATCCAAAACTTCATATACACCTTATACATGTATCCTGAAGGTAATTTTATAAAATTTTAAAATAATTTTATGCATTAAACAAAGTTTGTGTACTCTGAACATCAGAAAGCAAAGATGTCACCCGTGTGGACATTATCTGTGGTTGTTTGGCATCAACATTATGCTGTACATGGAAAAGGGCTAAGAGGGTCTTTTTTCCCTTAGGTATACTGAATAAAGTGTGTTCTGCACTTGTGTTTTGACTGTGACCCATCACATGAGGTCAGGTGTGTAATTTTCCACCTGTGGTATCATGCTGGTGCTCAAAAAGTTTTGAATTTTGGAGCATTTGGATTTCAGATGTTTAGATTAGGGATGTTCAATCTGTATTAGGGCAGGAGTGAGCTATGGGCTAAGATGGAAATCTTCAGATTTGAGGGGCTGTGTCTTGGTATTCTTTGGATCAGAACTACTAGACCCGTTCCCCATCAAAATATTGTTTTCTACCTTTAGTCTTGGTTTATGCTCATCTCTGGGGCAAATCTTTAGGTATTAAAGTAGTCACAGATAAAAAGCAAAAGTTATACTTGCCTCAAATTTTTTAAAAAATGAAATGATGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCGAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTAGGCGTGGTGGTGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTGGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATGAACATGGAAATGATTAACCATGAAAGCAAGTTAAATGGTAGATCAAGTCAAAGTCCTAGGTTCTCATTGCTTTCCACTGAACACATATATGCAATTAAACGCAAGCAGTATATTCCTGAAAATGCTCACCTTGTCCTCCTGCAACCCACTTAATTCCAATCCACCAGAAGGTAAACATCGTACAGTGATGATACACATGAAGGAAAGAAACTTGGTTGTTTTTCTTTCTCAGAATAAAAAACACTGTGTCCAAATACTCAACTCCTTTAGATACAAAGTACCACCACAGAGCAGCAGCTATCTGTAAAAAGGGAAAGCGTGTTATAAACACCAAAATGACACTATTGTATGGGTTTATACTCATTGTAAGTAAGTCCAAAATAAACATTTGTATATTGCACAAAATGTACAAGGCATGGAATCATTAATGGCTAAGTAGGTTTGAAAAACCTAAGCATCTCTCCATGGGGAAAAATAGAAAAGAAAGAGTCCAAAGCTCTATCTATACAGTGCCAATAAGTTAGAGAACATTTTCTGTCTATTCCATAGGTAGATGTTACATAGTGTCAAACTGCTGAATACAGAGCTGGAAGCACATTCAGACTGCTGTGCTTTTCAACTTGGTAGAGGAACTAAGATGTTTACTTTGTAAAATGATTTTAGTTGTTCATGCTTAGCCTACATTATACTACCTCAGAAAAACTTGCAAGTAAGTTCATGTAGCAACTGGTCTCTACAAGTGTCTGCCTGTCTGCCCACCCTCTCCCCTCACCTCCCTCTCTCCCTCACCTCTCCGACTGCACCAATATGTGCAACAACATAAATATCCAATCACAGCAGTTTGTATTAGGTATTAAATCTTTAAAATAAAAAATTGGAATGAACAAACAAATATTTCCCAGGTCATAAATATAATCCTGCTTACATGAATAAGTCTTTTCTTTTCCTGGGCTCTAATTAAGGCACCAGATGGTACAGAAAGATTACATTACATACTGAGATTAAGGATCCAGTGAGAGGTGACCTCTGTATGTTTTAAAATGTTTTACAAGAATCCTACTGTAACAGTAAACCAAACTTAATTTTTTATGTCAAGTATTTTCTATGATAAGCATCCTATGTGCAAATAACAATTAAGGCAGTACATAACTAAAATCTATTTATAAGCTTTCATGTGTTAGGGCCCTGTCAGATTCATTCACAGACAGGCTTAGGTGTTTTAGAGTTGAAGGATCCCTTTGCATTTTATACCTGCACCTGGTATATGTCATGAGATTTTTGTTTGTTTTGGCTTTTGCATTTGAAAAACAAAATTATAATTTTAAAGTATGGGGAAAGAAGAAACAGAAAGCATATAAGAAACAAAGTATTTACAAACTGAGAATTATTTACTGAATTTACTTGAAAAATATCATTAAAAATGATATGAATTGGTTGAAAATAAGCTTGAAATAGTTAACTACTCCCAGCAACACTATAGTTAATATTCACTATTATATTAGTTCTTTAAAATAAAGTAACTGTCACCATTTTGGCATCGTAACCTTTAACTAGAAGGAAAGATACAATCTCTTATTTCTCCTCTATCTGGACCTCTACATTTGCCACAATTCACATAAAATAACAACAAATAAGTCTGCTTAGTTTGCAAACTGCACTAGATATCTTTAAATAAACTACACCAAAAAGTGATACTTCTTGGCTACGTAACAATGAATACAGAAATGAGTCTCTGCGTAAAATATTCACTCTATTGCATCCCATATTAGAGAGGAGAAGAGAGCACGAGGAAGATTTCAAATGAAATCTGTTGCAAATCTCAGGTTCTTTATCCTCCTAGATTACAGTTCTCATAATAGCTCATTTTTTAAAGACTTGAAAATTTACATCTGTAAGTGAGAGTGGTATTTTTAAACCTTTATCCTAAAAATAGTAATATGTTGCCCCACCCAAGGGTTTTTCTATGCATACTCCCAGAAGTCAGTCAGTCAAACACTTATCCCTGTTCCCTTCCCTACGGCAAGCAAGAAGTCAGCCCTCCAACTGAAGAGATTCTTTGGCAATAGTTATCAGAAGAAAATTTTTCATAGCCAATACATCTGAGTAGTCTCTCATTTTCTCTCAGTCACCTTCTAGGTTTTATTTCCTCCTTAGTCATTTGTTTACATGGCTGCTGTCTGCCTTCTCACCCTCACTAAAATGCCAGCCCCACAA
Task1_train_10587
The gene ELOVL4 (ELOVL fatty acid elongase 4) on Chromosome 6 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; ELOVL4-related disorder
TACAATAAATGAATACACATTATTTTTTAATATTTAATCTTGAGTACAGATTAGAAATGAAAAATATAAAGTAGTACTAATGAAAAAGTTTTCCCTTCAGATTAAGCTAGATATTTTTAAAGTTTAGATTTGAGGTTTTACCATATAAATAAAAATGTATGTTCAAATGCAAAGGACTTTCACAGTTGTAGGTTTTCAAATGGAGTACTCCAGTGAGCTTAAATAGGCCCTTAGAACTGTTGCCTATGTTACTTTTAATTCTACTATTCTTGCCTTTAGATGTGCCAATATATATATCTGCAACAAAACAGTACTTATTTCTTAGGTTTCTAAATAGTTTAAAATATGACAGCACTACACACATTGAATAATTCATTTAATATAGATAAATCTACAGAGATATTCCAGTCAGTCAAACTCAATGACATTCTTTCTTTTCAGAATATTAATTTAATCAAGGTATAGATGTAATAATAATTAATTTTTGTCATAAAGTGATCTAAGTCAGTTCAGATTTACTAATTTTCTTTTAAAATTACAGAAGTTGCCTTTAACTGTATTGTTTTAAACTGGGCCCCCAATAATATATGTATGAATTCCTAAGCTGCCAATTATCATAATATGACAATGGAAAGCAGCAAGGTGAACTATACTATAATGACTTGTACCCTGGATCCTCCTCAGAGGAATAATCTGCATCAAGCTCAACAATGTGAATCATCCTTAATCTACAGGCATCTGAAAAGACAGGAGGCAGATCTTGGCCAAGCTATGAATTTAGATCCTCTTTAACATTAACAAGGCTATATAAAATTTCCTTTGAATAAGAACCAACAAGACCTATACAGGCTGAGTATTCCTTATCCAAAATGCTCAGGACCAGATGTGTTTCTGATTTCAGATTTTTTTAAACTTTGGAATATTTGCATAGACATAATGATGTGTCTTGGGGATAGGACTCAGGTCTAAATCCAAAACTTCATATACACCTTATACATGTATCCTGAAGGTAATTTTATAAAATTTTAAAATAATTTTATGCATTAAACAAAGTTTGTGTACTCTGAACATCAGAAAGCAAAGATGTCACCCGTGTGGACATTATCTGTGGTTGTTTGGCATCAACATTATGCTGTACATGGAAAAGGGCTAAGAGGGTCTTTTTTCCCTTAGGTATACTGAATAAAGTGTGTTCTGCACTTGTGTTTTGACTGTGACCCATCACATGAGGTCAGGTGTGTAATTTTCCACCTGTGGTATCATGCTGGTGCTCAAAAAGTTTTGAATTTTGGAGCATTTGGATTTCAGATGTTTAGATTAGGGATGTTCAATCTGTATTAGGGCAGGAGTGAGCTATGGGCTAAGATGGAAATCTTCAGATTTGAGGGGCTGTGTCTTGGTATTCTTTGGATCAGAACTACTAGACCCGTTCCCCATCAAAATATTGTTTTCTACCTTTAGTCTTGGTTTATGCTCATCTCTGGGGCAAATCTTTAGGTATTAAAGTAGTCACAGATAAAAAGCAAAAGTTATACTTGCCTCAAATTTTTTAAAAAATGAAATGATGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCGAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTAGGCGTGGTGGTGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTGGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATGAACATGGAAATGATTAACCATGAAAGCAAGTTAAATGGTAGATCAAGTCAAAGTCCTAGGTTCTCATTGCTTTCCACTGAACACATATATGCAATTAAACGCAAGCAGTATATTCCTGAAAATGCTCACCTTGTCCTCCTGCAACCCACTTAATTCCAATCCACCACAAGGTAAACATCGTACAGTGATGATACACATGAAGGAAAGAAACTTGGTTGTTTTTCTTTCTCAGAATAAAAAACACTGTGTCCAAATACTCAACTCCTTTAGATACAAAGTACCACCACAGAGCAGCAGCTATCTGTAAAAAGGGAAAGCGTGTTATAAACACCAAAATGACACTATTGTATGGGTTTATACTCATTGTAAGTAAGTCCAAAATAAACATTTGTATATTGCACAAAATGTACAAGGCATGGAATCATTAATGGCTAAGTAGGTTTGAAAAACCTAAGCATCTCTCCATGGGGAAAAATAGAAAAGAAAGAGTCCAAAGCTCTATCTATACAGTGCCAATAAGTTAGAGAACATTTTCTGTCTATTCCATAGGTAGATGTTACATAGTGTCAAACTGCTGAATACAGAGCTGGAAGCACATTCAGACTGCTGTGCTTTTCAACTTGGTAGAGGAACTAAGATGTTTACTTTGTAAAATGATTTTAGTTGTTCATGCTTAGCCTACATTATACTACCTCAGAAAAACTTGCAAGTAAGTTCATGTAGCAACTGGTCTCTACAAGTGTCTGCCTGTCTGCCCACCCTCTCCCCTCACCTCCCTCTCTCCCTCACCTCTCCGACTGCACCAATATGTGCAACAACATAAATATCCAATCACAGCAGTTTGTATTAGGTATTAAATCTTTAAAATAAAAAATTGGAATGAACAAACAAATATTTCCCAGGTCATAAATATAATCCTGCTTACATGAATAAGTCTTTTCTTTTCCTGGGCTCTAATTAAGGCACCAGATGGTACAGAAAGATTACATTACATACTGAGATTAAGGATCCAGTGAGAGGTGACCTCTGTATGTTTTAAAATGTTTTACAAGAATCCTACTGTAACAGTAAACCAAACTTAATTTTTTATGTCAAGTATTTTCTATGATAAGCATCCTATGTGCAAATAACAATTAAGGCAGTACATAACTAAAATCTATTTATAAGCTTTCATGTGTTAGGGCCCTGTCAGATTCATTCACAGACAGGCTTAGGTGTTTTAGAGTTGAAGGATCCCTTTGCATTTTATACCTGCACCTGGTATATGTCATGAGATTTTTGTTTGTTTTGGCTTTTGCATTTGAAAAACAAAATTATAATTTTAAAGTATGGGGAAAGAAGAAACAGAAAGCATATAAGAAACAAAGTATTTACAAACTGAGAATTATTTACTGAATTTACTTGAAAAATATCATTAAAAATGATATGAATTGGTTGAAAATAAGCTTGAAATAGTTAACTACTCCCAGCAACACTATAGTTAATATTCACTATTATATTAGTTCTTTAAAATAAAGTAACTGTCACCATTTTGGCATCGTAACCTTTAACTAGAAGGAAAGATACAATCTCTTATTTCTCCTCTATCTGGACCTCTACATTTGCCACAATTCACATAAAATAACAACAAATAAGTCTGCTTAGTTTGCAAACTGCACTAGATATCTTTAAATAAACTACACCAAAAAGTGATACTTCTTGGCTACGTAACAATGAATACAGAAATGAGTCTCTGCGTAAAATATTCACTCTATTGCATCCCATATTAGAGAGGAGAAGAGAGCACGAGGAAGATTTCAAATGAAATCTGTTGCAAATCTCAGGTTCTTTATCCTCCTAGATTACAGTTCTCATAATAGCTCATTTTTTAAAGACTTGAAAATTTACATCTGTAAGTGAGAGTGGTATTTTTAAACCTTTATCCTAAAAATAGTAATATGTTGCCCCACCCAAGGGTTTTTCTATGCATACTCCCAGAAGTCAGTCAGTCAAACACTTATCCCTGTTCCCTTCCCTACGGCAAGCAAGAAGTCAGCCCTCCAACTGAAGAGATTCTTTGGCAATAGTTATCAGAAGAAAATTTTTCATAGCCAATACATCTGAGTAGTCTCTCATTTTCTCTCAGTCACCTTCTAGGTTTTATTTCCTCCTTAGTCATTTGTTTACATGGCTGCTGTCTGCCTTCTCACCCTCACTAAAATGCCAGCCCCACAA
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Task1_train_10588
A genetic alteration is present in BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) on Chromosome 6. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Maple syrup urine disease
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Task1_train_10589
This sequence change occurs on Chromosome 6, altering BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Maple syrup urine disease
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Task1_train_10590
A genomic change on Chromosome 6 affects BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Maple syrup urine disease
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CCCTACACCCTGAATCTAGAAGCACCAAGCTATTTTCTCTTCCTGGAATGCACTGTGCTCTTCATGCCTATCAGCCTTTATACAGGTTTCTTCTTAGTTTGGAATGCCATTTTCTCCCTAGTCTGCCTGGTAACTTCTAGTCATCTTTTAGGTCTAGCTCAGAGTTATATCTGGAAACACTTGACTTTCAAATAAGAGTTTATTGCTCTTTTTGTGTTTCACTTTGTTTGCACTATTCTAGGACTCCTATCACATTGGATTGTAGTTGCCTAATCTGTCTCTTTTCTCTACCACCTTGGACATTTTAGAAGTAAAACTATGCCTTGATCTTATTTGTCTCAATGGTGGCTTGTCATTGGGTTGTACGTAGCAGAGGTTCAATAAAATTCTCATCAGTTATTATTTTTCTCTTTTTCTCCCCGACCTAAATAATCTCAGTACCCCCAGCTCCCTAAACTATCAACAAATAGAAAAAAAGCTCTATTCATTTTTATCCTTGTTCTTTACTCTCCTTAGTTTAAACCCAAATTTGACTATGTAAATGTAATTTCATTTTGTTACCCCTTCCTTCATTAAAACAAAAATACCCTTCATGCACATGCAAAACACTCTACCCCACACTATTAAAACAGCAGAAATGAACACTAACAAAAGCCAAGATAAAAAATTTCCCCAATGTTGAATTTTTGGACTTAGTGTGGGGGTAGGAAAAATGGAGACATAATTCTGGTTCTCCCTTTGGCAGTTTTCAATTGCTGTTTCTTAATCTCAGTCAGAAAACACATTTCTCTGCCTCTCCTTTTGCCCCATTTCTACCCTCTCCTCCCTTGCCCCTGTGCAAAACCAAAGATGGGTTAAGAGGCAAGGCATAATGGAAGAGGAATGTTCTTTTCCTCCACTCCCACTTTCTTCTTCAAATTCTGTTTTGGGACCATCCTTCCCCACCCTCCCATTTTCATCTGATGGACACACTGTCTCTGTTGTCTCTTGTCATATTTGATTTTATGATATTTCATGTTTTATGTGCTTTTTTTTTTTTTTAGTAAATTCATGGACAGAGAATGTATCCTGGTAAACACTTAGATTAAAACAAATTTACATAGTTGATTACTATAAATGAAAATTAGTGACTCAAATTCTCCAGGTTTCTAAGCTACTTAGACTAAGCCAATCAGGTAATTTTTGCTACTTCTGGGCAAAATGTATCTGAATTCCTATTCAGTGGATTTGCAGGATGAAATCTAAGTTTACCTCTTTCATCTCTCATTTAAATGTGGAAAAACGAAATCAATAAAAATCTATATATGCTTATTAAGCATTTTAAGGAGGGTGTGAATAAGGAGTGAAAGCTTTGAGCAGTGACTACAGCAGTTTTTCGAAAGTCAAAACAATAACCAATGCCAATCAGTAGCTCTCTTCACCTCTCACACAATAATAGAGACAGGACAGGATAAAAAAGGGTTACATTTAAAAAAAAGTATGGATGTTAAACCATTGGAAATGGCACTGTAAATGACACCGGAAAAGATCGCCTCCAGGCACTGTGTGGAACTTTGCAAACTCGGGTCCTCACCCGAGGACCGCACGGCCGACCTCGGGGAGGCTCCACCCCAGAAACTATTTCATTGGCGCCACCTCTAGCCCACACTTCCCCTCTTCCGCATGCGCACAAGGAGCAGAAGCCGACCAGCTCGTCACGTCGCCTTCCCCGCCCCTAAATTTCCAGTTCCGATTGGTCTGTTTCATGGGACCGCCCCTCTGGCCCGACCAATGTGGAAGCCTCCTCGGGTGCTCCGCCCTCCCCGCAGGCGGCGTGCGGCTGCATAGCCTGAGAATCCCGGTGGTGAGCGGGGATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGCCGGCTGGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTGGCGTCGGCTTCCTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCCCAGAGGCGGCAGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACCGTGAGCCCTGGGACTGCCCACTCGGTCCCGCTGCAGCCCGGACTCCCAGGCTCGCAGGCGCCCGCGAGGGGCAGGGGCCGGCAGGCTGCAATCCTTGCATCCCAGCTTATTAACTTCCTGACTCTCTGGAACCTCCTTGCCTCAGGGTCTAACTGTGGTTCACTTCTTGCTCTATTTTTGTGACTGTTCAGCCCTCGAGACGCAGTCCCCCCTCCCCCGCAACTTTGAGATGGGTGAGAGGGCATACTGCCACCTGGAAGAGCCTGAGGGTGGAGGGGTGGTGCCCAGGGAACGCCTCCCTTTTCTCTGTCCTCCGTCCTTGCTTTCTCAACCCAGGCCTTAGGTGTTGTTCCAGCCTGGCCAGGACTGGGCCACTAGCTTAGGTAGAGGCATTTAAAAGATATATATATATGTTTATATATATATATTTTAAATGTATATTATATATATTATATATAAAATATATATATGTATATAAAATCAATTCAGTTACTCAGTCCCTTGGTTTCTTCTTACATACAGAAATTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATCCACACACATATATATATGTGTGGATATATATACGCGCATATATATGCATATATATGTGCGCATATATATATATATGCATATATATATATGCACACATATATATGCATATATATATGCATATATGTATATATGTCCCTTGGTTTCTTCTTACCTACAGAATTCTGAGTAATTGAACTGATTTTCCCAAGGTCACAGAACAGGTCCTTCCTAGAGATGTGAAAGAATTCAGACTTTCTACTTGAGCTTAGTACTGAGCTTGTCCTGGGCTATGCTGCCACTTAGCCAAGGAGGTGAAGGGGATGAGAGGAGGAAGCCATAGGAAGGGCATGTAGCAAACTCCTCATAGTATGACTGTTGCATGATTTTTACCATTTCTGCAAGTTTCATGTAATGTCTCTCATCAGAATATCAGATCCAGTGTCTCTCTTCAGAATATCAGGAAACTGTAGGGAAACATGTATTGCTTCCTTGTCTAATAACTTCTCATGTGCATGCTAGAGCTGACATTTTTGGAAGTGTGTCTTGTGGATAAGAATGAACAGTTATTGAGTGCTTACCAGGGTCAGGTGCTGTGTGTATGTTTCATCATCTCATTTAAGGGTTAGGACAACCTTAAAAGGTTAGTAAAGTTTTTATTCCCATTTTGCAGTTAGGTTAATGGAGTCTTGAGACAGTTTGACCAAGATTACACAGGTAAGTTAGTGGTAGCTCCAAAGCTCCAGCTTTGGAATCTAATTGATCAGATTCCAGAGCTTCCATTCTAAACAATGTACTAAGATGCGTGTAGATATAATTTACTTGGAGGGCGTCCCAGTATTGTGAAACAGTAGGTACCATAAAGGTTAATAGTAGGTGTTTTTTTTTTTTTTTCCACCACCAAGATGAGCCCTCAATTCTGTCTTCAAAGCAAATTCTGTCTTCAAAGCAAAGAAATTTTGGTCTAATACTTGAGAAATAGTCCAACTTTCCATAGTTGTAAACTTACTAAAATCTAAGTAAAATGATATCATGTTATCATGATATATATCATGATATATATAAACTTGTTCTTATTTTAAAAATAATACAAACATATTAACAGATAATTTGGATAATGGATAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGCCGGGCGCAGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCAGGCGGATCACCAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCGGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGCAGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGATATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAACCCCAAAAAACCAAAAAACAAAAATCACCACCCACTGCAGTAAATATTGCTAACATTTTGGGTGTATCCTT
Task1_train_10591
A variant on Chromosome 6 in gene BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Maple syrup urine disease
CCCTACACCCTGAATCTAGAAGCACCAAGCTATTTTCTCTTCCTGGAATGCACTGTGCTCTTCATGCCTATCAGCCTTTATACAGGTTTCTTCTTAGTTTGGAATGCCATTTTCTCCCTAGTCTGCCTGGTAACTTCTAGTCATCTTTTAGGTCTAGCTCAGAGTTATATCTGGAAACACTTGACTTTCAAATAAGAGTTTATTGCTCTTTTTGTGTTTCACTTTGTTTGCACTATTCTAGGACTCCTATCACATTGGATTGTAGTTGCCTAATCTGTCTCTTTTCTCTACCACCTTGGACATTTTAGAAGTAAAACTATGCCTTGATCTTATTTGTCTCAATGGTGGCTTGTCATTGGGTTGTACGTAGCAGAGGTTCAATAAAATTCTCATCAGTTATTATTTTTCTCTTTTTCTCCCCGACCTAAATAATCTCAGTACCCCCAGCTCCCTAAACTATCAACAAATAGAAAAAAAGCTCTATTCATTTTTATCCTTGTTCTTTACTCTCCTTAGTTTAAACCCAAATTTGACTATGTAAATGTAATTTCATTTTGTTACCCCTTCCTTCATTAAAACAAAAATACCCTTCATGCACATGCAAAACACTCTACCCCACACTATTAAAACAGCAGAAATGAACACTAACAAAAGCCAAGATAAAAAATTTCCCCAATGTTGAATTTTTGGACTTAGTGTGGGGGTAGGAAAAATGGAGACATAATTCTGGTTCTCCCTTTGGCAGTTTTCAATTGCTGTTTCTTAATCTCAGTCAGAAAACACATTTCTCTGCCTCTCCTTTTGCCCCATTTCTACCCTCTCCTCCCTTGCCCCTGTGCAAAACCAAAGATGGGTTAAGAGGCAAGGCATAATGGAAGAGGAATGTTCTTTTCCTCCACTCCCACTTTCTTCTTCAAATTCTGTTTTGGGACCATCCTTCCCCACCCTCCCATTTTCATCTGATGGACACACTGTCTCTGTTGTCTCTTGTCATATTTGATTTTATGATATTTCATGTTTTATGTGCTTTTTTTTTTTTTTAGTAAATTCATGGACAGAGAATGTATCCTGGTAAACACTTAGATTAAAACAAATTTACATAGTTGATTACTATAAATGAAAATTAGTGACTCAAATTCTCCAGGTTTCTAAGCTACTTAGACTAAGCCAATCAGGTAATTTTTGCTACTTCTGGGCAAAATGTATCTGAATTCCTATTCAGTGGATTTGCAGGATGAAATCTAAGTTTACCTCTTTCATCTCTCATTTAAATGTGGAAAAACGAAATCAATAAAAATCTATATATGCTTATTAAGCATTTTAAGGAGGGTGTGAATAAGGAGTGAAAGCTTTGAGCAGTGACTACAGCAGTTTTTCGAAAGTCAAAACAATAACCAATGCCAATCAGTAGCTCTCTTCACCTCTCACACAATAATAGAGACAGGACAGGATAAAAAAGGGTTACATTTAAAAAAAAGTATGGATGTTAAACCATTGGAAATGGCACTGTAAATGACACCGGAAAAGATCGCCTCCAGGCACTGTGTGGAACTTTGCAAACTCGGGTCCTCACCCGAGGACCGCACGGCCGACCTCGGGGAGGCTCCACCCCAGAAACTATTTCATTGGCGCCACCTCTAGCCCACACTTCCCCTCTTCCGCATGCGCACAAGGAGCAGAAGCCGACCAGCTCGTCACGTCGCCTTCCCCGCCCCTAAATTTCCAGTTCCGATTGGTCTGTTTCATGGGACCGCCCCTCTGGCCCGACCAATGTGGAAGCCTCCTCGGGTGCTCCGCCCTCCCCGCAGGCGGCGTGCGGCTGCATAGCCTGAGAATCCCGGTGGTGAGCGGGGATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGCCGGCTGGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTGGCGTCGGCTTCCTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCCCAGAGGCGGCAGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACGGTGAGCCCTGGGACTGCCCACTCGGTCCCGCTGCAGCCCGGACTCCCAGGCTCGCAGGCGCCCGCGAGGGGCAGGGGCCGGCAGGCTGCAATCCTTGCATCCCAGCTTATTAACTTCCTGACTCTCTGGAACCTCCTTGCCTCAGGGTCTAACTGTGGTTCACTTCTTGCTCTATTTTTGTGACTGTTCAGCCCTCGAGACGCAGTCCCCCCTCCCCCGCAACTTTGAGATGGGTGAGAGGGCATACTGCCACCTGGAAGAGCCTGAGGGTGGAGGGGTGGTGCCCAGGGAACGCCTCCCTTTTCTCTGTCCTCCGTCCTTGCTTTCTCAACCCAGGCCTTAGGTGTTGTTCCAGCCTGGCCAGGACTGGGCCACTAGCTTAGGTAGAGGCATTTAAAAGATATATATATATGTTTATATATATATATTTTAAATGTATATTATATATATTATATATAAAATATATATATGTATATAAAATCAATTCAGTTACTCAGTCCCTTGGTTTCTTCTTACATACAGAAATTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATCCACACACATATATATATGTGTGGATATATATACGCGCATATATATGCATATATATGTGCGCATATATATATATATGCATATATATATATGCACACATATATATGCATATATATATGCATATATGTATATATGTCCCTTGGTTTCTTCTTACCTACAGAATTCTGAGTAATTGAACTGATTTTCCCAAGGTCACAGAACAGGTCCTTCCTAGAGATGTGAAAGAATTCAGACTTTCTACTTGAGCTTAGTACTGAGCTTGTCCTGGGCTATGCTGCCACTTAGCCAAGGAGGTGAAGGGGATGAGAGGAGGAAGCCATAGGAAGGGCATGTAGCAAACTCCTCATAGTATGACTGTTGCATGATTTTTACCATTTCTGCAAGTTTCATGTAATGTCTCTCATCAGAATATCAGATCCAGTGTCTCTCTTCAGAATATCAGGAAACTGTAGGGAAACATGTATTGCTTCCTTGTCTAATAACTTCTCATGTGCATGCTAGAGCTGACATTTTTGGAAGTGTGTCTTGTGGATAAGAATGAACAGTTATTGAGTGCTTACCAGGGTCAGGTGCTGTGTGTATGTTTCATCATCTCATTTAAGGGTTAGGACAACCTTAAAAGGTTAGTAAAGTTTTTATTCCCATTTTGCAGTTAGGTTAATGGAGTCTTGAGACAGTTTGACCAAGATTACACAGGTAAGTTAGTGGTAGCTCCAAAGCTCCAGCTTTGGAATCTAATTGATCAGATTCCAGAGCTTCCATTCTAAACAATGTACTAAGATGCGTGTAGATATAATTTACTTGGAGGGCGTCCCAGTATTGTGAAACAGTAGGTACCATAAAGGTTAATAGTAGGTGTTTTTTTTTTTTTTTCCACCACCAAGATGAGCCCTCAATTCTGTCTTCAAAGCAAATTCTGTCTTCAAAGCAAAGAAATTTTGGTCTAATACTTGAGAAATAGTCCAACTTTCCATAGTTGTAAACTTACTAAAATCTAAGTAAAATGATATCATGTTATCATGATATATATCATGATATATATAAACTTGTTCTTATTTTAAAAATAATACAAACATATTAACAGATAATTTGGATAATGGATAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGCCGGGCGCAGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCAGGCGGATCACCAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCGGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGCAGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGATATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAACCCCAAAAAACCAAAAAACAAAAATCACCACCCACTGCAGTAAATATTGCTAACATTTTGGGTGTATCCTT
CCCTACACCCTGAATCTAGAAGCACCAAGCTATTTTCTCTTCCTGGAATGCACTGTGCTCTTCATGCCTATCAGCCTTTATACAGGTTTCTTCTTAGTTTGGAATGCCATTTTCTCCCTAGTCTGCCTGGTAACTTCTAGTCATCTTTTAGGTCTAGCTCAGAGTTATATCTGGAAACACTTGACTTTCAAATAAGAGTTTATTGCTCTTTTTGTGTTTCACTTTGTTTGCACTATTCTAGGACTCCTATCACATTGGATTGTAGTTGCCTAATCTGTCTCTTTTCTCTACCACCTTGGACATTTTAGAAGTAAAACTATGCCTTGATCTTATTTGTCTCAATGGTGGCTTGTCATTGGGTTGTACGTAGCAGAGGTTCAATAAAATTCTCATCAGTTATTATTTTTCTCTTTTTCTCCCCGACCTAAATAATCTCAGTACCCCCAGCTCCCTAAACTATCAACAAATAGAAAAAAAGCTCTATTCATTTTTATCCTTGTTCTTTACTCTCCTTAGTTTAAACCCAAATTTGACTATGTAAATGTAATTTCATTTTGTTACCCCTTCCTTCATTAAAACAAAAATACCCTTCATGCACATGCAAAACACTCTACCCCACACTATTAAAACAGCAGAAATGAACACTAACAAAAGCCAAGATAAAAAATTTCCCCAATGTTGAATTTTTGGACTTAGTGTGGGGGTAGGAAAAATGGAGACATAATTCTGGTTCTCCCTTTGGCAGTTTTCAATTGCTGTTTCTTAATCTCAGTCAGAAAACACATTTCTCTGCCTCTCCTTTTGCCCCATTTCTACCCTCTCCTCCCTTGCCCCTGTGCAAAACCAAAGATGGGTTAAGAGGCAAGGCATAATGGAAGAGGAATGTTCTTTTCCTCCACTCCCACTTTCTTCTTCAAATTCTGTTTTGGGACCATCCTTCCCCACCCTCCCATTTTCATCTGATGGACACACTGTCTCTGTTGTCTCTTGTCATATTTGATTTTATGATATTTCATGTTTTATGTGCTTTTTTTTTTTTTTAGTAAATTCATGGACAGAGAATGTATCCTGGTAAACACTTAGATTAAAACAAATTTACATAGTTGATTACTATAAATGAAAATTAGTGACTCAAATTCTCCAGGTTTCTAAGCTACTTAGACTAAGCCAATCAGGTAATTTTTGCTACTTCTGGGCAAAATGTATCTGAATTCCTATTCAGTGGATTTGCAGGATGAAATCTAAGTTTACCTCTTTCATCTCTCATTTAAATGTGGAAAAACGAAATCAATAAAAATCTATATATGCTTATTAAGCATTTTAAGGAGGGTGTGAATAAGGAGTGAAAGCTTTGAGCAGTGACTACAGCAGTTTTTCGAAAGTCAAAACAATAACCAATGCCAATCAGTAGCTCTCTTCACCTCTCACACAATAATAGAGACAGGACAGGATAAAAAAGGGTTACATTTAAAAAAAAGTATGGATGTTAAACCATTGGAAATGGCACTGTAAATGACACCGGAAAAGATCGCCTCCAGGCACTGTGTGGAACTTTGCAAACTCGGGTCCTCACCCGAGGACCGCACGGCCGACCTCGGGGAGGCTCCACCCCAGAAACTATTTCATTGGCGCCACCTCTAGCCCACACTTCCCCTCTTCCGCATGCGCACAAGGAGCAGAAGCCGACCAGCTCGTCACGTCGCCTTCCCCGCCCCTAAATTTCCAGTTCCGATTGGTCTGTTTCATGGGACCGCCCCTCTGGCCCGACCAATGTGGAAGCCTCCTCGGGTGCTCCGCCCTCCCCGCAGGCGGCGTGCGGCTGCATAGCCTGAGAATCCCGGTGGTGAGCGGGGATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGCCGGCTGGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTGGCGTCGGCTTCCTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCCCAGAGGCGGCAGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACTGTGAGCCCTGGGACTGCCCACTCGGTCCCGCTGCAGCCCGGACTCCCAGGCTCGCAGGCGCCCGCGAGGGGCAGGGGCCGGCAGGCTGCAATCCTTGCATCCCAGCTTATTAACTTCCTGACTCTCTGGAACCTCCTTGCCTCAGGGTCTAACTGTGGTTCACTTCTTGCTCTATTTTTGTGACTGTTCAGCCCTCGAGACGCAGTCCCCCCTCCCCCGCAACTTTGAGATGGGTGAGAGGGCATACTGCCACCTGGAAGAGCCTGAGGGTGGAGGGGTGGTGCCCAGGGAACGCCTCCCTTTTCTCTGTCCTCCGTCCTTGCTTTCTCAACCCAGGCCTTAGGTGTTGTTCCAGCCTGGCCAGGACTGGGCCACTAGCTTAGGTAGAGGCATTTAAAAGATATATATATATGTTTATATATATATATTTTAAATGTATATTATATATATTATATATAAAATATATATATGTATATAAAATCAATTCAGTTACTCAGTCCCTTGGTTTCTTCTTACATACAGAAATTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATCCACACACATATATATATGTGTGGATATATATACGCGCATATATATGCATATATATGTGCGCATATATATATATATGCATATATATATATGCACACATATATATGCATATATATATGCATATATGTATATATGTCCCTTGGTTTCTTCTTACCTACAGAATTCTGAGTAATTGAACTGATTTTCCCAAGGTCACAGAACAGGTCCTTCCTAGAGATGTGAAAGAATTCAGACTTTCTACTTGAGCTTAGTACTGAGCTTGTCCTGGGCTATGCTGCCACTTAGCCAAGGAGGTGAAGGGGATGAGAGGAGGAAGCCATAGGAAGGGCATGTAGCAAACTCCTCATAGTATGACTGTTGCATGATTTTTACCATTTCTGCAAGTTTCATGTAATGTCTCTCATCAGAATATCAGATCCAGTGTCTCTCTTCAGAATATCAGGAAACTGTAGGGAAACATGTATTGCTTCCTTGTCTAATAACTTCTCATGTGCATGCTAGAGCTGACATTTTTGGAAGTGTGTCTTGTGGATAAGAATGAACAGTTATTGAGTGCTTACCAGGGTCAGGTGCTGTGTGTATGTTTCATCATCTCATTTAAGGGTTAGGACAACCTTAAAAGGTTAGTAAAGTTTTTATTCCCATTTTGCAGTTAGGTTAATGGAGTCTTGAGACAGTTTGACCAAGATTACACAGGTAAGTTAGTGGTAGCTCCAAAGCTCCAGCTTTGGAATCTAATTGATCAGATTCCAGAGCTTCCATTCTAAACAATGTACTAAGATGCGTGTAGATATAATTTACTTGGAGGGCGTCCCAGTATTGTGAAACAGTAGGTACCATAAAGGTTAATAGTAGGTGTTTTTTTTTTTTTTTCCACCACCAAGATGAGCCCTCAATTCTGTCTTCAAAGCAAATTCTGTCTTCAAAGCAAAGAAATTTTGGTCTAATACTTGAGAAATAGTCCAACTTTCCATAGTTGTAAACTTACTAAAATCTAAGTAAAATGATATCATGTTATCATGATATATATCATGATATATATAAACTTGTTCTTATTTTAAAAATAATACAAACATATTAACAGATAATTTGGATAATGGATAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGCCGGGCGCAGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCAGGCGGATCACCAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCGGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGCAGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGATATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAACCCCAAAAAACCAAAAAACAAAAATCACCACCCACTGCAGTAAATATTGCTAACATTTTGGGTGTATCCTT
Task1_train_10592
This genomic variant is located on Chromosome 6, within the BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Maple syrup urine disease type 1B
GGCATGAGCTGAGAGGTGGTGAAACGTCAAGTGAGAATTGAATTATACGCTAATAAAATTGTACCTAGTGGTTCGAATGGATCGTCTAAAGGGTTTATCAAACTTCTCTAATTTGAAGGGTCTCAAACTCCAAAATCTGCCTCCTTGTTGGTGGGCACAGCTCTTTTAACTGGGAGAGATTATTTGCTGCTGGGCTTTTGGAGTGTCCTGTGGGCACAAGTGTTGGCAAGGATTTGATCAGTTTTTGCACAGATTTTGGGGCTCCTCCATGCTGTGCCCTTCTTTTAGGGATTTAGTCTCTCAATTTTCAACCACTGGTAGCCACAGACTATTTTCTGACACCTCAGATCAACCAGACTGAGTCTATTTGTTTGAATTTTAGCTGTCCTGACTCATAGACTGGGGAGTCCTTTTGCAGGACAAGGCTTATGAACGTCATGGTCATCCACTGGGCTTAATTTCTTTCAAGAGTCAAGACTCCAGTTTATGCCTACTTTTGGCCCTTCAATGCCTTTAAATAGTTGTTTGTTTTATTTTGCCCAGAGTTTATAATCATTAAATGTGGAAAGGATAGTCTGAAAAACGCAACTCTGACATTACGTTCAGAACCTCAATAAGATATTTTGTATAGTTTTTTCATTATTATTCAATTTAAAATACCACTTTCTAATTTTCATTATAGTTTCTTCTTTGAGCTGTGAGTTACTTAGCTATTTATTAAAAAAAATTTCTAGCCAGGCCCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACCGTGGGAGGTCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTTTCCTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTAGTGGTGGGCGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACTCAGGAGTCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCATTGCACTCTAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAATTCTAACATAAGAATTTTTTGAATGATCTTTTTATTGATTTCTAACTTAATTACACTATGGTCAGAGAATATATGTAATTTTCATCTTTTAAAATTTGTTGAGATTGGATTTGTAGTCCAGTATATGGTCAATTGATGTCAGTGTTTTCTGTTTAATTGAAAAGGATTTGTATTCTTTGCTTCTGGGTGCAGTGTCCTTTGTATGTCAGTTAGGCCATGTTTGTTGAACATGTTTAAATCATCTCTATTTTTCACACTCCCTCCTTTTTTTTGGTATGCCTTTTTTGTCAGTTATTAAGACTAGTACATTAAAAAATCATCTCCCACTATGTGGTGATTTTGTCCATTTGTCCTTTTAGTTGTGTTGCTTTTTTCCATTTATTTGGAGCCCATTGTTAGATAAGTATAGATTTAGAATTATTTATTTCTTGTGAATTGAACCCTTTAACAGTATGCGTTTTCCCTCTTTATCTCTGGTATGTTTTTTTCCTGAAAGTCTACTTTGCCTGCTATTAATATAGTGACATCAACTTTCTTTTGGTTAGGTTTTTTATTGTCTATTTTTTCCTTCTTTTTTCTTTTTTTTAACAACCTTTCTCTGTCTTTAGAGTTTGTGTTTCCTTTCAAATAGTTGGGTTTTCCTTTCTTTTAAATTAGTGTGACAGTTTTTATTTTCATTGAAACATTAGATTACTTACAATTAATACAATTATTAATTGGATTTAAATAATTCACCTTACTATTTTTTTTTAATAGAGACAGGTTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTGTTGAACTCCTGGTCTCAAGTAATCCTCTTGCCTTGGCCTCCCAAACTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGGCTAGCCATACTCTTTATTTTCTGTTTCCTCTACCTGTTCTATACTTCTCCATCCCATTATTAGTTTACTGAATTTTTAAATGTATTATGCATGACATTACTCTCATTTGCCACATTAACCTTTTTTTCTTTTCTATTTTAAGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCATTGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAGTTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGGTAAGTGAATGAACATTTCTAAGGTTGTTCATTCATTGAAATATTCAAGTATTGCCGCTACCCTTCCACCCACCCTTACCTGCATTCTAAACATTTTATTATCCTTTTACTAATGTATTACAATTATAATTTTGTTATGAGCATATATTTAAAGATCTAATAGAATAGTTTAAGCAGATAGATTGGGATTGGGTGAAGTGGCTCACATCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCAACACCATCCTGGGCAACATAATGATAATGAGAACCCATATCTACAAAAACTACAAAAATTAGCCCAGTGTGGTGGCACATACCTGTCATCCCAGTTACTCTGGTGGCTGAGGCAGGAGGATAACTTAAACCAGGAGTCCAAGGCTACAATGAACTGTGATCGCAGCACTGCACTCCCTGGGTGACAGAATGAGACCCTTTCTCAAAAAGAAAAGAAGAGAGAAAGAAAGAAAGAGCGAGAGAGAGGGGAGAGGGAAGAAGGGAGAGGGGAGAGAGGAGAGGAGAGAGGAAGGGAAAGACAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAGAAGGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAAGGAAGAAAAGGAAGAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGTGATGGGATCCTGTCTCAAGAAAGAAAGGAAAGGAGGGAGGGAAAAGCTCATTGTGCTATGGGAAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGACTCATTGTGCCATGGGAAAGGAAGGAAGAAAGGAAGGAAGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGACGAGACCCTGTCTTAAGAAAGAAAGGAAGGGAGGGAAAGACTTATTGTGCTATGGGAAAGAAAGGCAGGCAGGCAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGGGGGAGGGAGGCAGGGAGGGAGGGAAAGACTCATTGTGCCTTGGGAAGGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGAACGGAAGGAGATTGGAAGGGAAGGACTCATTGTGCCATGCCCCGTCTTTCTTTCTGACCCTCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGATCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTCAGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTATGTTCATTTATGTACTTTATTTGATTTCTATTTGATGTTTCCATTTTGATTCATTCTATTTAATATCTATGCTTATCTAGAGGAAAGAAAACAAACAGGATTCTTGGAATTTATGTGAACTTAACTGTATTTAAGAAGGGGAGGTTAGCAGTTCTTTTAAGTATGCTATCCAATGCCCAGTTTTACAGCAAGTTCTTTTTGAAGGAGGACTGGTTTTATAAACTCTGGCATTGATTAATTTTATAGACTTCAAAGAATAAGACCAAGAACATAGTTGGTTTACCTCCCCTCTCTTTCAAAGCTTTATATTTCTTTCTAACTTAAGTCTTTCTCACTTAACTGATGATGGGGTGATTTTAATAAATCTTTTGTTTAGTCTGTATTTACCTCAAAGTCACAGGGATAACACTTTTGCTTTTAATGTATTTCTTACTTGTTAAAAAGACTAAGAGAAGACTGTTACCTAGATTTTTTTTTTCTGTTTAAAGTTAGGTAATACTTGCTCAACCAATTAATTTTGAAGCATCTCCTTTTTATAACCTGTCTTTCACAAAAGCTTAGGTCTTTTGATGGTAAAAATATTTTGAGTTTTTTATGTCTTAATTTTTTGTATTATCTTTTCTGTTTCTGTTTACTGAATAAGCTTTTCAGGGGATCATTGTAGAAACCCATAGATGTGTGAATCCAGAGATGTATATTTGTTT
GGCATGAGCTGAGAGGTGGTGAAACGTCAAGTGAGAATTGAATTATACGCTAATAAAATTGTACCTAGTGGTTCGAATGGATCGTCTAAAGGGTTTATCAAACTTCTCTAATTTGAAGGGTCTCAAACTCCAAAATCTGCCTCCTTGTTGGTGGGCACAGCTCTTTTAACTGGGAGAGATTATTTGCTGCTGGGCTTTTGGAGTGTCCTGTGGGCACAAGTGTTGGCAAGGATTTGATCAGTTTTTGCACAGATTTTGGGGCTCCTCCATGCTGTGCCCTTCTTTTAGGGATTTAGTCTCTCAATTTTCAACCACTGGTAGCCACAGACTATTTTCTGACACCTCAGATCAACCAGACTGAGTCTATTTGTTTGAATTTTAGCTGTCCTGACTCATAGACTGGGGAGTCCTTTTGCAGGACAAGGCTTATGAACGTCATGGTCATCCACTGGGCTTAATTTCTTTCAAGAGTCAAGACTCCAGTTTATGCCTACTTTTGGCCCTTCAATGCCTTTAAATAGTTGTTTGTTTTATTTTGCCCAGAGTTTATAATCATTAAATGTGGAAAGGATAGTCTGAAAAACGCAACTCTGACATTACGTTCAGAACCTCAATAAGATATTTTGTATAGTTTTTTCATTATTATTCAATTTAAAATACCACTTTCTAATTTTCATTATAGTTTCTTCTTTGAGCTGTGAGTTACTTAGCTATTTATTAAAAAAAATTTCTAGCCAGGCCCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACCGTGGGAGGTCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTTTCCTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTAGTGGTGGGCGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACTCAGGAGTCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCATTGCACTCTAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAATTCTAACATAAGAATTTTTTGAATGATCTTTTTATTGATTTCTAACTTAATTACACTATGGTCAGAGAATATATGTAATTTTCATCTTTTAAAATTTGTTGAGATTGGATTTGTAGTCCAGTATATGGTCAATTGATGTCAGTGTTTTCTGTTTAATTGAAAAGGATTTGTATTCTTTGCTTCTGGGTGCAGTGTCCTTTGTATGTCAGTTAGGCCATGTTTGTTGAACATGTTTAAATCATCTCTATTTTTCACACTCCCTCCTTTTTTTTGGTATGCCTTTTTTGTCAGTTATTAAGACTAGTACATTAAAAAATCATCTCCCACTATGTGGTGATTTTGTCCATTTGTCCTTTTAGTTGTGTTGCTTTTTTCCATTTATTTGGAGCCCATTGTTAGATAAGTATAGATTTAGAATTATTTATTTCTTGTGAATTGAACCCTTTAACAGTATGCGTTTTCCCTCTTTATCTCTGGTATGTTTTTTTCCTGAAAGTCTACTTTGCCTGCTATTAATATAGTGACATCAACTTTCTTTTGGTTAGGTTTTTTATTGTCTATTTTTTCCTTCTTTTTTCTTTTTTTTAACAACCTTTCTCTGTCTTTAGAGTTTGTGTTTCCTTTCAAATAGTTGGGTTTTCCTTTCTTTTAAATTAGTGTGACAGTTTTTATTTTCATTGAAACATTAGATTACTTACAATTAATACAATTATTAATTGGATTTAAATAATTCACCTTACTATTTTTTTTTAATAGAGACAGGTTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTGTTGAACTCCTGGTCTCAAGTAATCCTCTTGCCTTGGCCTCCCAAACTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGGCTAGCCATACTCTTTATTTTCTGTTTCCTCTACCTGTTCTATACTTCTCCATCCCATTATTAGTTTACTGAATTTTTAAATGTATTATGCATGACATTACTCTCATTTGCCACATTAACCTTTTTTTCTTTTCTATTTTAAGGAAAAGATAGAGGTTTTAATACCCCATTGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAGTTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGGTAAGTGAATGAACATTTCTAAGGTTGTTCATTCATTGAAATATTCAAGTATTGCCGCTACCCTTCCACCCACCCTTACCTGCATTCTAAACATTTTATTATCCTTTTACTAATGTATTACAATTATAATTTTGTTATGAGCATATATTTAAAGATCTAATAGAATAGTTTAAGCAGATAGATTGGGATTGGGTGAAGTGGCTCACATCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCAACACCATCCTGGGCAACATAATGATAATGAGAACCCATATCTACAAAAACTACAAAAATTAGCCCAGTGTGGTGGCACATACCTGTCATCCCAGTTACTCTGGTGGCTGAGGCAGGAGGATAACTTAAACCAGGAGTCCAAGGCTACAATGAACTGTGATCGCAGCACTGCACTCCCTGGGTGACAGAATGAGACCCTTTCTCAAAAAGAAAAGAAGAGAGAAAGAAAGAAAGAGCGAGAGAGAGGGGAGAGGGAAGAAGGGAGAGGGGAGAGAGGAGAGGAGAGAGGAAGGGAAAGACAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAGAAGGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAAGGAAGAAAAGGAAGAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGTGATGGGATCCTGTCTCAAGAAAGAAAGGAAAGGAGGGAGGGAAAAGCTCATTGTGCTATGGGAAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGACTCATTGTGCCATGGGAAAGGAAGGAAGAAAGGAAGGAAGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGACGAGACCCTGTCTTAAGAAAGAAAGGAAGGGAGGGAAAGACTTATTGTGCTATGGGAAAGAAAGGCAGGCAGGCAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGGGGGAGGGAGGCAGGGAGGGAGGGAAAGACTCATTGTGCCTTGGGAAGGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGAACGGAAGGAGATTGGAAGGGAAGGACTCATTGTGCCATGCCCCGTCTTTCTTTCTGACCCTCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGATCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTCAGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTATGTTCATTTATGTACTTTATTTGATTTCTATTTGATGTTTCCATTTTGATTCATTCTATTTAATATCTATGCTTATCTAGAGGAAAGAAAACAAACAGGATTCTTGGAATTTATGTGAACTTAACTGTATTTAAGAAGGGGAGGTTAGCAGTTCTTTTAAGTATGCTATCCAATGCCCAGTTTTACAGCAAGTTCTTTTTGAAGGAGGACTGGTTTTATAAACTCTGGCATTGATTAATTTTATAGACTTCAAAGAATAAGACCAAGAACATAGTTGGTTTACCTCCCCTCTCTTTCAAAGCTTTATATTTCTTTCTAACTTAAGTCTTTCTCACTTAACTGATGATGGGGTGATTTTAATAAATCTTTTGTTTAGTCTGTATTTACCTCAAAGTCACAGGGATAACACTTTTGCTTTTAATGTATTTCTTACTTGTTAAAAAGACTAAGAGAAGACTGTTACCTAGATTTTTTTTTTCTGTTTAAAGTTAGGTAATACTTGCTCAACCAATTAATTTTGAAGCATCTCCTTTTTATAACCTGTCTTTCACAAAAGCTTAGGTCTTTTGATGGTAAAAATATTTTGAGTTTTTTATGTCTTAATTTTTTGTATTATCTTTTCTGTTTCTGTTTACTGAATAAGCTTTTCAGGGGATCATTGTAGAAACCCATAGATGTGTGAATCCAGAGATGTATATTTGTTT
Task1_train_10593
The gene BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) on Chromosome 6 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Maple syrup urine disease
ATTGAATTATACGCTAATAAAATTGTACCTAGTGGTTCGAATGGATCGTCTAAAGGGTTTATCAAACTTCTCTAATTTGAAGGGTCTCAAACTCCAAAATCTGCCTCCTTGTTGGTGGGCACAGCTCTTTTAACTGGGAGAGATTATTTGCTGCTGGGCTTTTGGAGTGTCCTGTGGGCACAAGTGTTGGCAAGGATTTGATCAGTTTTTGCACAGATTTTGGGGCTCCTCCATGCTGTGCCCTTCTTTTAGGGATTTAGTCTCTCAATTTTCAACCACTGGTAGCCACAGACTATTTTCTGACACCTCAGATCAACCAGACTGAGTCTATTTGTTTGAATTTTAGCTGTCCTGACTCATAGACTGGGGAGTCCTTTTGCAGGACAAGGCTTATGAACGTCATGGTCATCCACTGGGCTTAATTTCTTTCAAGAGTCAAGACTCCAGTTTATGCCTACTTTTGGCCCTTCAATGCCTTTAAATAGTTGTTTGTTTTATTTTGCCCAGAGTTTATAATCATTAAATGTGGAAAGGATAGTCTGAAAAACGCAACTCTGACATTACGTTCAGAACCTCAATAAGATATTTTGTATAGTTTTTTCATTATTATTCAATTTAAAATACCACTTTCTAATTTTCATTATAGTTTCTTCTTTGAGCTGTGAGTTACTTAGCTATTTATTAAAAAAAATTTCTAGCCAGGCCCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACCGTGGGAGGTCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTTTCCTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTAGTGGTGGGCGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACTCAGGAGTCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCATTGCACTCTAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAATTCTAACATAAGAATTTTTTGAATGATCTTTTTATTGATTTCTAACTTAATTACACTATGGTCAGAGAATATATGTAATTTTCATCTTTTAAAATTTGTTGAGATTGGATTTGTAGTCCAGTATATGGTCAATTGATGTCAGTGTTTTCTGTTTAATTGAAAAGGATTTGTATTCTTTGCTTCTGGGTGCAGTGTCCTTTGTATGTCAGTTAGGCCATGTTTGTTGAACATGTTTAAATCATCTCTATTTTTCACACTCCCTCCTTTTTTTTGGTATGCCTTTTTTGTCAGTTATTAAGACTAGTACATTAAAAAATCATCTCCCACTATGTGGTGATTTTGTCCATTTGTCCTTTTAGTTGTGTTGCTTTTTTCCATTTATTTGGAGCCCATTGTTAGATAAGTATAGATTTAGAATTATTTATTTCTTGTGAATTGAACCCTTTAACAGTATGCGTTTTCCCTCTTTATCTCTGGTATGTTTTTTTCCTGAAAGTCTACTTTGCCTGCTATTAATATAGTGACATCAACTTTCTTTTGGTTAGGTTTTTTATTGTCTATTTTTTCCTTCTTTTTTCTTTTTTTTAACAACCTTTCTCTGTCTTTAGAGTTTGTGTTTCCTTTCAAATAGTTGGGTTTTCCTTTCTTTTAAATTAGTGTGACAGTTTTTATTTTCATTGAAACATTAGATTACTTACAATTAATACAATTATTAATTGGATTTAAATAATTCACCTTACTATTTTTTTTTAATAGAGACAGGTTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTGTTGAACTCCTGGTCTCAAGTAATCCTCTTGCCTTGGCCTCCCAAACTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGGCTAGCCATACTCTTTATTTTCTGTTTCCTCTACCTGTTCTATACTTCTCCATCCCATTATTAGTTTACTGAATTTTTAAATGTATTATGCATGACATTACTCTCATTTGCCACATTAACCTTTTTTTCTTTTCTATTTTAAGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCATTGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAGTTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGGTAAGTGAATGAACATTTCTAAGGTTGTTCATTCATTGAAATATTCAAGTATTGCCGCTACCCTTCCACCCACCCTTACCTGCATTCTAAACATTTTATTATCCTTTTACTAATGTATTACAATTATAATTTTGTTATGAGCATATATTTAAAGATCTAATAGAATAGTTTAAGCAGATAGATTGGGATTGGGTGAAGTGGCTCACATCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCAACACCATCCTGGGCAACATAATGATAATGAGAACCCATATCTACAAAAACTACAAAAATTAGCCCAGTGTGGTGGCACATACCTGTCATCCCAGTTACTCTGGTGGCTGAGGCAGGAGGATAACTTAAACCAGGAGTCCAAGGCTACAATGAACTGTGATCGCAGCACTGCACTCCCTGGGTGACAGAATGAGACCCTTTCTCAAAAAGAAAAGAAGAGAGAAAGAAAGAAAGAGCGAGAGAGAGGGGAGAGGGAAGAAGGGAGAGGGGAGAGAGGAGAGGAGAGAGGAAGGGAAAGACAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAGAAGGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAAGGAAGAAAAGGAAGAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGTGATGGGATCCTGTCTCAAGAAAGAAAGGAAAGGAGGGAGGGAAAAGCTCATTGTGCTATGGGAAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGACTCATTGTGCCATGGGAAAGGAAGGAAGAAAGGAAGGAAGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGACGAGACCCTGTCTTAAGAAAGAAAGGAAGGGAGGGAAAGACTTATTGTGCTATGGGAAAGAAAGGCAGGCAGGCAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGGGGGAGGGAGGCAGGGAGGGAGGGAAAGACTCATTGTGCCTTGGGAAGGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGAACGGAAGGAGATTGGAAGGGAAGGACTCATTGTGCCATGCCCCGTCTTTCTTTCTGACCCTCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGATCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTCAGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTATGTTCATTTATGTACTTTATTTGATTTCTATTTGATGTTTCCATTTTGATTCATTCTATTTAATATCTATGCTTATCTAGAGGAAAGAAAACAAACAGGATTCTTGGAATTTATGTGAACTTAACTGTATTTAAGAAGGGGAGGTTAGCAGTTCTTTTAAGTATGCTATCCAATGCCCAGTTTTACAGCAAGTTCTTTTTGAAGGAGGACTGGTTTTATAAACTCTGGCATTGATTAATTTTATAGACTTCAAAGAATAAGACCAAGAACATAGTTGGTTTACCTCCCCTCTCTTTCAAAGCTTTATATTTCTTTCTAACTTAAGTCTTTCTCACTTAACTGATGATGGGGTGATTTTAATAAATCTTTTGTTTAGTCTGTATTTACCTCAAAGTCACAGGGATAACACTTTTGCTTTTAATGTATTTCTTACTTGTTAAAAAGACTAAGAGAAGACTGTTACCTAGATTTTTTTTTTCTGTTTAAAGTTAGGTAATACTTGCTCAACCAATTAATTTTGAAGCATCTCCTTTTTATAACCTGTCTTTCACAAAAGCTTAGGTCTTTTGATGGTAAAAATATTTTGAGTTTTTTATGTCTTAATTTTTTGTATTATCTTTTCTGTTTCTGTTTACTGAATAAGCTTTTCAGGGGATCATTGTAGAAACCCATAGATGTGTGAATCCAGAGATGTATATTTGTTTTTTGACCACATGAATTGATTGTGAGCATGTGTCTAT
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This gene mutation involves BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) on Chromosome 6. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Maple syrup urine disease type 1B
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Task1_train_10595
Gene BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) on Chromosome 6 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Maple syrup urine disease type 1A
ATTGAATTATACGCTAATAAAATTGTACCTAGTGGTTCGAATGGATCGTCTAAAGGGTTTATCAAACTTCTCTAATTTGAAGGGTCTCAAACTCCAAAATCTGCCTCCTTGTTGGTGGGCACAGCTCTTTTAACTGGGAGAGATTATTTGCTGCTGGGCTTTTGGAGTGTCCTGTGGGCACAAGTGTTGGCAAGGATTTGATCAGTTTTTGCACAGATTTTGGGGCTCCTCCATGCTGTGCCCTTCTTTTAGGGATTTAGTCTCTCAATTTTCAACCACTGGTAGCCACAGACTATTTTCTGACACCTCAGATCAACCAGACTGAGTCTATTTGTTTGAATTTTAGCTGTCCTGACTCATAGACTGGGGAGTCCTTTTGCAGGACAAGGCTTATGAACGTCATGGTCATCCACTGGGCTTAATTTCTTTCAAGAGTCAAGACTCCAGTTTATGCCTACTTTTGGCCCTTCAATGCCTTTAAATAGTTGTTTGTTTTATTTTGCCCAGAGTTTATAATCATTAAATGTGGAAAGGATAGTCTGAAAAACGCAACTCTGACATTACGTTCAGAACCTCAATAAGATATTTTGTATAGTTTTTTCATTATTATTCAATTTAAAATACCACTTTCTAATTTTCATTATAGTTTCTTCTTTGAGCTGTGAGTTACTTAGCTATTTATTAAAAAAAATTTCTAGCCAGGCCCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACCGTGGGAGGTCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTTTCCTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTAGTGGTGGGCGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACTCAGGAGTCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCATTGCACTCTAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAATTCTAACATAAGAATTTTTTGAATGATCTTTTTATTGATTTCTAACTTAATTACACTATGGTCAGAGAATATATGTAATTTTCATCTTTTAAAATTTGTTGAGATTGGATTTGTAGTCCAGTATATGGTCAATTGATGTCAGTGTTTTCTGTTTAATTGAAAAGGATTTGTATTCTTTGCTTCTGGGTGCAGTGTCCTTTGTATGTCAGTTAGGCCATGTTTGTTGAACATGTTTAAATCATCTCTATTTTTCACACTCCCTCCTTTTTTTTGGTATGCCTTTTTTGTCAGTTATTAAGACTAGTACATTAAAAAATCATCTCCCACTATGTGGTGATTTTGTCCATTTGTCCTTTTAGTTGTGTTGCTTTTTTCCATTTATTTGGAGCCCATTGTTAGATAAGTATAGATTTAGAATTATTTATTTCTTGTGAATTGAACCCTTTAACAGTATGCGTTTTCCCTCTTTATCTCTGGTATGTTTTTTTCCTGAAAGTCTACTTTGCCTGCTATTAATATAGTGACATCAACTTTCTTTTGGTTAGGTTTTTTATTGTCTATTTTTTCCTTCTTTTTTCTTTTTTTTAACAACCTTTCTCTGTCTTTAGAGTTTGTGTTTCCTTTCAAATAGTTGGGTTTTCCTTTCTTTTAAATTAGTGTGACAGTTTTTATTTTCATTGAAACATTAGATTACTTACAATTAATACAATTATTAATTGGATTTAAATAATTCACCTTACTATTTTTTTTTAATAGAGACAGGTTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTGTTGAACTCCTGGTCTCAAGTAATCCTCTTGCCTTGGCCTCCCAAACTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGGCTAGCCATACTCTTTATTTTCTGTTTCCTCTACCTGTTCTATACTTCTCCATCCCATTATTAGTTTACTGAATTTTTAAATGTATTATGCATGACATTACTCTCATTTGCCACATTAACCTTTTTTTCTTTTCTATTTTAAGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCATTGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAGTTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGGTAAGTGAATGAACATTTCTAAGGTTGTTCATTCATTGAAATATTCAAGTATTGCCGCTACCCTTCCACCCACCCTTACCTGCATTCTAAACATTTTATTATCCTTTTACTAATGTATTACAATTATAATTTTGTTATGAGCATATATTTAAAGATCTAATAGAATAGTTTAAGCAGATAGATTGGGATTGGGTGAAGTGGCTCACATCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCAACACCATCCTGGGCAACATAATGATAATGAGAACCCATATCTACAAAAACTACAAAAATTAGCCCAGTGTGGTGGCACATACCTGTCATCCCAGTTACTCTGGTGGCTGAGGCAGGAGGATAACTTAAACCAGGAGTCCAAGGCTACAATGAACTGTGATCGCAGCACTGCACTCCCTGGGTGACAGAATGAGACCCTTTCTCAAAAAGAAAAGAAGAGAGAAAGAAAGAAAGAGCGAGAGAGAGGGGAGAGGGAAGAAGGGAGAGGGGAGAGAGGAGAGGAGAGAGGAAGGGAAAGACAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAGAAGGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAAGGAAGAAAAGGAAGAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGTGATGGGATCCTGTCTCAAGAAAGAAAGGAAAGGAGGGAGGGAAAAGCTCATTGTGCTATGGGAAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGACTCATTGTGCCATGGGAAAGGAAGGAAGAAAGGAAGGAAGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGACGAGACCCTGTCTTAAGAAAGAAAGGAAGGGAGGGAAAGACTTATTGTGCTATGGGAAAGAAAGGCAGGCAGGCAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGGGGGAGGGAGGCAGGGAGGGAGGGAAAGACTCATTGTGCCTTGGGAAGGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGAACGGAAGGAGATTGGAAGGGAAGGACTCATTGTGCCATGCCCCGTCTTTCTTTCTGACCCTCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGATCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTCAGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTATGTTCATTTATGTACTTTATTTGATTTCTATTTGATGTTTCCATTTTGATTCATTCTATTTAATATCTATGCTTATCTAGAGGAAAGAAAACAAACAGGATTCTTGGAATTTATGTGAACTTAACTGTATTTAAGAAGGGGAGGTTAGCAGTTCTTTTAAGTATGCTATCCAATGCCCAGTTTTACAGCAAGTTCTTTTTGAAGGAGGACTGGTTTTATAAACTCTGGCATTGATTAATTTTATAGACTTCAAAGAATAAGACCAAGAACATAGTTGGTTTACCTCCCCTCTCTTTCAAAGCTTTATATTTCTTTCTAACTTAAGTCTTTCTCACTTAACTGATGATGGGGTGATTTTAATAAATCTTTTGTTTAGTCTGTATTTACCTCAAAGTCACAGGGATAACACTTTTGCTTTTAATGTATTTCTTACTTGTTAAAAAGACTAAGAGAAGACTGTTACCTAGATTTTTTTTTTCTGTTTAAAGTTAGGTAATACTTGCTCAACCAATTAATTTTGAAGCATCTCCTTTTTATAACCTGTCTTTCACAAAAGCTTAGGTCTTTTGATGGTAAAAATATTTTGAGTTTTTTATGTCTTAATTTTTTGTATTATCTTTTCTGTTTCTGTTTACTGAATAAGCTTTTCAGGGGATCATTGTAGAAACCCATAGATGTGTGAATCCAGAGATGTATATTTGTTTTTTGACCACATGAATTGATTGTGAGCATGTGTCTAT
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Task1_train_10596
This variant affects gene BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) located on Chromosome 6. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Maple syrup urine disease
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Task1_train_10597
Given this context: Chromosome 6, gene BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_10598
With a mutation on Chromosome 6 in gene BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Maple syrup urine disease
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Task1_train_10599
Here is a mutation in BCKDHB (branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) on Chromosome 6. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Maple syrup urine disease type 1B
TCTGGGTGCAGTGTCCTTTGTATGTCAGTTAGGCCATGTTTGTTGAACATGTTTAAATCATCTCTATTTTTCACACTCCCTCCTTTTTTTTGGTATGCCTTTTTTGTCAGTTATTAAGACTAGTACATTAAAAAATCATCTCCCACTATGTGGTGATTTTGTCCATTTGTCCTTTTAGTTGTGTTGCTTTTTTCCATTTATTTGGAGCCCATTGTTAGATAAGTATAGATTTAGAATTATTTATTTCTTGTGAATTGAACCCTTTAACAGTATGCGTTTTCCCTCTTTATCTCTGGTATGTTTTTTTCCTGAAAGTCTACTTTGCCTGCTATTAATATAGTGACATCAACTTTCTTTTGGTTAGGTTTTTTATTGTCTATTTTTTCCTTCTTTTTTCTTTTTTTTAACAACCTTTCTCTGTCTTTAGAGTTTGTGTTTCCTTTCAAATAGTTGGGTTTTCCTTTCTTTTAAATTAGTGTGACAGTTTTTATTTTCATTGAAACATTAGATTACTTACAATTAATACAATTATTAATTGGATTTAAATAATTCACCTTACTATTTTTTTTTAATAGAGACAGGTTTTCACTATGTTGGCCAGGTTGGTGTTGAACTCCTGGTCTCAAGTAATCCTCTTGCCTTGGCCTCCCAAACTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGGCTAGCCATACTCTTTATTTTCTGTTTCCTCTACCTGTTCTATACTTCTCCATCCCATTATTAGTTTACTGAATTTTTAAATGTATTATGCATGACATTACTCTCATTTGCCACATTAACCTTTTTTTCTTTTCTATTTTAAGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCATTGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAGTTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGGTAAGTGAATGAACATTTCTAAGGTTGTTCATTCATTGAAATATTCAAGTATTGCCGCTACCCTTCCACCCACCCTTACCTGCATTCTAAACATTTTATTATCCTTTTACTAATGTATTACAATTATAATTTTGTTATGAGCATATATTTAAAGATCTAATAGAATAGTTTAAGCAGATAGATTGGGATTGGGTGAAGTGGCTCACATCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCAACACCATCCTGGGCAACATAATGATAATGAGAACCCATATCTACAAAAACTACAAAAATTAGCCCAGTGTGGTGGCACATACCTGTCATCCCAGTTACTCTGGTGGCTGAGGCAGGAGGATAACTTAAACCAGGAGTCCAAGGCTACAATGAACTGTGATCGCAGCACTGCACTCCCTGGGTGACAGAATGAGACCCTTTCTCAAAAAGAAAAGAAGAGAGAAAGAAAGAAAGAGCGAGAGAGAGGGGAGAGGGAAGAAGGGAGAGGGGAGAGAGGAGAGGAGAGAGGAAGGGAAAGACAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAGAAGGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAAGGAAGAAAAGGAAGAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGTGATGGGATCCTGTCTCAAGAAAGAAAGGAAAGGAGGGAGGGAAAAGCTCATTGTGCTATGGGAAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGACTCATTGTGCCATGGGAAAGGAAGGAAGAAAGGAAGGAAGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGACGAGACCCTGTCTTAAGAAAGAAAGGAAGGGAGGGAAAGACTTATTGTGCTATGGGAAAGAAAGGCAGGCAGGCAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGGGGGAGGGAGGCAGGGAGGGAGGGAAAGACTCATTGTGCCTTGGGAAGGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGAACGGAAGGAGATTGGAAGGGAAGGACTCATTGTGCCATGCCCCGTCTTTCTTTCTGACCCTCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGATCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTCAGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTATGTTCATTTATGTACTTTATTTGATTTCTATTTGATGTTTCCATTTTGATTCATTCTATTTAATATCTATGCTTATCTAGAGGAAAGAAAACAAACAGGATTCTTGGAATTTATGTGAACTTAACTGTATTTAAGAAGGGGAGGTTAGCAGTTCTTTTAAGTATGCTATCCAATGCCCAGTTTTACAGCAAGTTCTTTTTGAAGGAGGACTGGTTTTATAAACTCTGGCATTGATTAATTTTATAGACTTCAAAGAATAAGACCAAGAACATAGTTGGTTTACCTCCCCTCTCTTTCAAAGCTTTATATTTCTTTCTAACTTAAGTCTTTCTCACTTAACTGATGATGGGGTGATTTTAATAAATCTTTTGTTTAGTCTGTATTTACCTCAAAGTCACAGGGATAACACTTTTGCTTTTAATGTATTTCTTACTTGTTAAAAAGACTAAGAGAAGACTGTTACCTAGATTTTTTTTTTCTGTTTAAAGTTAGGTAATACTTGCTCAACCAATTAATTTTGAAGCATCTCCTTTTTATAACCTGTCTTTCACAAAAGCTTAGGTCTTTTGATGGTAAAAATATTTTGAGTTTTTTATGTCTTAATTTTTTGTATTATCTTTTCTGTTTCTGTTTACTGAATAAGCTTTTCAGGGGATCATTGTAGAAACCCATAGATGTGTGAATCCAGAGATGTATATTTGTTTTTTGACCACATGAATTGATTGTGAGCATGTGTCTATGTTTTATTCTTTTTTTCTTATTTGTTTTTTCTACCAGATCAAAGTTATAAGCTTATCTTAGTTGAGTAGATGTTGCCTGATTTTTGAATGTGAGCTAGAAGTTGTAGACTGGGAAAGAAGCCATGTGCGAGGCAAGTTATTTTTGTGCTTGAGCTAAACATTAATTCACATTTAATATTTATAACATTATATTGTTTTTAAGAACAGATCTTTTCTGTCTGTCCCCTGCCTTCTCTTTTCCTCCTTCATTTTCTTTCTTCCTCTTCCTTTTTCCTTTTTTTTTCAGCTGAAATGAAAATATACTTAAAGTACAAAAGGCTAATATGAAGAAAGCAGATGAAGGGAACTTAAAAAGTAGGAACATAAGATAAAGACATTGTGTGATATGGTTATTAATGTGTTCAGAGGTCCAGAACAGAAAATAAAATTTTTTATACAGAAAATAGTGACATTTTTGCTGCTCTTTTATTTTTAAAATAAAACCCTTCAATAAAAATGGCATAAAAATGGCTTTGAAAGCCAAATATAGTTTGCCTCAGGGAATCTTAAGTCTTTGTGGTAAGTTCAGGTTTATTTTAATAACTCTTCCTATATAATATTTGTCTTTAAACAATTATAATCATTTAAAATTAGACAAAGTTTGTGATTTAAGTCAACATTAGATAGAAGTTAAGAGCTTGAGCTTTGGTATCAGTGGGAATTGGGTGAGACTCTTTGATCAAGCAAGTCGTGTGACCTTAGGCAAGCTACTTGTTCTCTCTAAACCTCAGTGTCTATTTCTAAAATGAGGAACATTATAATAGCTACCTAGTGGGGTTGCTATGAACAGATGAATTAATTCACAGAGTGCTTGGCCAAGTTTACACGTGTACTTCCTACTGTCATTATCATCTTCCTTGTCATCACCCTCATTCTCGAGAAGGTCCTGGAGCCCTTTCCTGTGAGTGGAAGTGTGGACTATCCACACTTTTGTTTTTGCTTTGCTATATAACTGGACACTATGGTGCCTGGACTGTAAAACTCAGTGGACTAATTTTTCACTTATGAAATGAAGACCATATTTTTTTTCATGGGAAAAGAAGATTTTGACATGTTAAAACTGGAGAAGAGAGTTGCATGTACTTTGAAAGTAGAAACAGATTATTAGTAGAAGAGATTTCTTCATAGATAAACA
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