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Task1_train_5600
Given this context: Chromosome 2, gene COL4A4 (collagen type IV alpha 4 chain) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Autosomal recessive Alport syndrome
TGTGCTATTCTTGTGATAGTGAATGAGTCTCACAAGATAATGGTTTTAAAAAATAGGAGTTTCCCTGTACAAACTCTCTCTTTGCCTGCTGCCATCCATGTAAGACGTGACTTGCTCCTTCTTGCCTTCTGCCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCACGTGGAACTGTAAGTCCATTTAACCTCTTTCTTTTGTAAATTGTCCAGTCTTGGATATGTCTTTATCAGCAACATGAAAAACAGACTAATGTAACAATTGAATAAAAAATTAACTGTATCTCTTCTAAAAATTACATTCTTGAATGATTCCTGGCAATACTTCTAAAAATAAATTAGATAATATTAAGGATATAAACTTTTATCAGGATATATTAAAATAGGCTCACTTTTTACCTTTGGGCCAATTAATCCAAATAGCCCAGGATCTCCAACCAGTCCTAGTTCTCCCTACAAACAAGCACAAACATGCCTTAAAAAAAAAAAGTGACTGGGTGACAAATTATCTCATTCTCATTTAATTTAAGCAACACATTGCCCACTGAGACCATGCAAAGTCTTAACACTGTTCATCAGTTGCATCAGACAATCTTGTGCTTCAATTTTTGCACCCACAGCTAAATCCTGCAATCCATAAAATGAATGTGTCTGCCTTCCTAATTACTGTGTTTGCACGCAACAGTACAACTTCTGAATTATACTAAATTGCATTTACTAATGAAATGTATTTATTATCTCTATAATGAGGTACATTTACCTTTAATCCTGGAAAACCTGGAGATCCATAGGAACCAGGATCCCCCTAATAAATTCACAAAAATCAGGATAAACAGAATTAAATCAGAATGCATTAACCAGCTCAGTGCATCATTTTTCACCTTATCAAATTGTTCCATGGATATTTGGTCCTGTTTGCAAAGCTAGCTGAATAAAAGGAAATAAATATAAAATAGATTCCATTTCTTTATAACATTTGCTACTTGAAGTGATCCTCAGTCTTATTCAAAAAATCCATGTCATTGCCAGTGTTTTAATTAAGAATGTATTTTTGTTGTCGTTGCTTTTCCAAATTTAATTTACTTAACTTAGTGCTTGCACTGGGCCAAATATCTTTAAAATCTCTGCAATATAATTTGCCTGGAAATTAATAGTTGCTCTGTGCATCATTAGCAATAAAAATGACCATGGAAACCAATATTTCCCCATTCAGTACTAAATCTAGAACCAAATAAACTCAATGCCCATGCCAGCTGCGGTCTGGCCTCCATGGTGACTCTATGAGTGGGCTTTCTATTAGTGACATGTGGTGATGTTTGGAGCTTAATATTGTACTTTTTTTCTAGCTCCTGCCCCTATATCACCATGTTGTTTCCTCAAATAGACTTAAATTAACTATTCCAAGCTACTTTCCTACTGGCACTGAGGTGCCAGACAAGAGATGGCACAATCCTGTCACTTTTCCCAAATTCTTCTATCTTTTGCTTGCCTGTTTTATCTAAATGATGTCAATGGAAGGATGCTCTGGGATATTTAGATATTCCATAATTCTCGTCCAAAATGTTTTGTTCTTACATGAGCTATTCTTCACTTTTGAGCTTGTGGGACTACTGACCTGGTTTTATAAAAACATGAAAGAGAAATATCTCCAAATTCACTGATGTTAACAGCAAATGATGCTTACCCGAGGCCCTGGAAATCCAGGAATACCTTTTTCTCCTTTTGCCCCAATACCAGATTCTCCCTTTAAGAGATGACAACATTTAGAGGGGTTCAAGCAACAATATTTCAGCAATAGGGAAAGCAATATTTCAGCAATAGGGAAAAAAAACAAAATGAGAAACAAAAATTATTGTCAGCAGCTTAAAGAAAACAACTACTTTAGAATAGAAGCTCTATAGTATTATGATAAGATAGTGAAAAATTCTGGTAATATATATTAGCACTTAAAGCAATGATAAAGACCATGAGAAATAACATTTTAAGTTAAGATAGTACATCACACAAATGAAAAAAAAAAAGGTACTTAAATAAACTACCTTGCGTCCTGGTGGTCCTGGCAGTCCAACCATTCCAGGAATTCCTTTTATACCCTAAAAATTACAATGAATATAATTTGGTCTATTCTTATTATTTAACATACTGAATTCCATCTCCTTCAGAAATCATCTCTTTTTACAATCTGTTTCACCTTAAAAAAAAAAATCTTAAGAGATTACTCTTCACCTGTTCTAATTAGCACACTTATAAACCAGATACTATTTGAGCCAGTTCTCTATGTGAGAGGTATATGGGATACCACAGTGGACCACGGAACCAGGCAGCAGATACAATTTGGGAATGCAGCCATTGAAAAAGTGGCTTATTTTGAGCAAAGTAAAGAAATTTAACCCAGCAATTGAAAAGCAACAATAGAATCTTCATGTGGCACCAATAATACCAGCACTGGTAGCTGACAGAGGAATTAATATTTGCCAAGAATCTATTACGGCCCAGTTCTATGCATTTGTTACCTTCTCAATTATCAAGACATCAAACTCATCTGTAACATCTAAAGGACAACTGGGCTTCCGGTGGTCTTTTCAATCCACACGTCAAAACAACATTAACAAGCACATGTCATAATTTAGCAGCCTGAGCTAGGTCTGCCACTCAGCAGCTGGGTAAACTTGAGAACACTGGGAACCTTCCAAGCCTCATTTTCAATGCCGCACGATGGGGCCAACAGTAGTACCAACTTATTAAAGTAGGTTTGAAACTAGTGCAGTGATGCATAGAAAGACCTCTATACTTTGCTGCCACAGATCCATGTCAAAAAATATTTTCTACTGCTACTTTCCAAGGTGACATATGGATTTGGGAATTACCTTTTCTCCTTTATAGAGACAAAAGTCAGGTGGCTCTACCAACAGGGTGGGTCCAGGAGAACCTTGCTGACCAACCTCACCCTTAAAAAAAAAAGCAAGATAATGAAAATTTCATATTAATTTATGTTTTGAAGGTTTTCACCCATGTATTGTGGTATAATGCTTCCAATCCTATGTGTCATGGATTTAAAATACAAGTTGTGGCAAGTACATCATAGAATATAAAAGGATATTTATTTTCTTATAAAAATTTAATACACACTTATTGTTAAAAATAAATTTAAAAAATGAAAATGATTCTTAATGCTACTATCCAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCGAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCAGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATCTCAATAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCTACTATCCAGAAGTAATCTCTATTAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCAATGACGCGATCTCGGCTCACAGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCGGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCTATTAAAACTTTGATATAATTTTTGGTGGTGTGTGTACATATGTGTATATATGTACATATATGTGTATATAGGTGAATAAACAATTTGTTTTATGTTTATGAAAATATAATCAGAATACTATAATAAATATATAAACATGATTTAAAATATACAGCATATTTTATTAAATTTTTAAATAATTTTATATTTTTCTTACAATATTTTGTGAGCCTTTTTCTATTATACTAAAATCTCTTCAGGATCCTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TGTGCTATTCTTGTGATAGTGAATGAGTCTCACAAGATAATGGTTTTAAAAAATAGGAGTTTCCCTGTACAAACTCTCTCTTTGCCTGCTGCCATCCATGTAAGACGTGACTTGCTCCTTCTTGCCTTCTGCCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCACGTGGAACTGTAAGTCCATTTAACCTCTTTCTTTTGTAAATTGTCCAGTCTTGGATATGTCTTTATCAGCAACATGAAAAACAGACTAATGTAACAATTGAATAAAAAATTAACTGTATCTCTTCTAAAAATTACATTCTTGAATGATTCCTGGCAATACTTCTAAAAATAAATTAGATAATATTAAGGATATAAACTTTTATCAGGATATATTAAAATAGGCTCACTTTTTACCTTTGGGCCAATTAATCCAAATAGCCCAGGATCTCCAACCAGTCCTAGTTCTCCCTACAAACAAGCACAAACATGCCTTAAAAAAAAAAAGTGACTGGGTGACAAATTATCTCATTCTCATTTAATTTAAGCAACACATTGCCCACTGAGACCATGCAAAGTCTTAACACTGTTCATCAGTTGCATCAGACAATCTTGTGCTTCAATTTTTGCACCCACAGCTAAATCCTGCAATCCATAAAATGAATGTGTCTGCCTTCCTAATTACTGTGTTTGCACGCAACAGTACAACTTCTGAATTATACTAAATTGCATTTACTAATGAAATGTATTTATTATCTCTATAATGAGGTACATTTACCTTTAATCCTGGAAAACCTGGAGATCCATAGGAACCAGGATCCCCCTAATAAATTCACAAAAATCAGGATAAACAGAATTAAATCAGAATGCATTAACCAGCTCAGTGCATCATTTTTCACCTTATCAAATTGTTCCATGGATATTTGGTCCTGTTTGCAAAGCTAGCTGAATAAAAGGAAATAAATATAAAATAGATTCCATTTCTTTATAACATTTGCTACTTGAAGTGATCCTCAGTCTTATTCAAAAAATCCATGTCATTGCCAGTGTTTTAATTAAGAATGTATTTTTGTTGTCGTTGCTTTTCCAAATTTAATTTACTTAACTTAGTGCTTGCACTGGGCCAAATATCTTTAAAATCTCTGCAATATAATTTGCCTGGAAATTAATAGTTGCTCTGTGCATCATTAGCAATAAAAATGACCATGGAAACCAATATTTCCCCATTCAGTACTAAATCTAGAACCAAATAAACTCAATGCCCATGCCAGCTGCGGTCTGGCCTCCATGGTGACTCTATGAGTGGGCTTTCTATTAGTGACATGTGGTGATGTTTGGAGCTTAATATTGTACTTTTTTTCTAGCTCCTGCCCCTATATCACCATGTTGTTTCCTCAAATAGACTTAAATTAACTATTCCAAGCTACTTTCCTACTGGCACTGAGGTGCCAGACAAGAGATGGCACAATCCTGTCACTTTTCCCAAATTCTTCTATCTTTTGCTTGCCTGTTTTATCTAAATGATGTCAATGGAAGGATGCTCTGGGATATTTAGATATTCCATAATTCTCGTCCAAAATGTTTTGTTCTTACATGAGCTATTCTTCACTTTTGAGCTTGTGGGACTACTGACCTGGTTTTATAAAAACATGAAAGAGAAATATCTCCAAATTCACTGATGTTAACAGCAAATGATGCTTACCCGAGGCCCTGGAAATCCAGGAATACCTTTTTCTCCTTTTGCCCCAATACCAGATTCTCCCTTTAAGAGATGACAACATTTAGAGGGGTTCAAGCAACAATATTTCAGCAATAGGGAAAGCAATATTTCAGCAATAGGGAAAAAAAACAAAATGAGAAACAAAAATTATTGTCAGCAGCTTAAAGAAAACAACTACTTTAGAATAGAAGCTCTATAGTATTATGATAAGATAGTGAAAAATTCTGGTAATATATATTAGCACTTAAAGCAATGATAAAGACCATGAGAAATAACATTTTAAGTTAAGATAGTACATCACACAAATGAAAAAAAAAAAGGTACTTAAATAAACTACCTTGCGTCCTGGTGGTCTTGGCAGTCCAACCATTCCAGGAATTCCTTTTATACCCTAAAAATTACAATGAATATAATTTGGTCTATTCTTATTATTTAACATACTGAATTCCATCTCCTTCAGAAATCATCTCTTTTTACAATCTGTTTCACCTTAAAAAAAAAAATCTTAAGAGATTACTCTTCACCTGTTCTAATTAGCACACTTATAAACCAGATACTATTTGAGCCAGTTCTCTATGTGAGAGGTATATGGGATACCACAGTGGACCACGGAACCAGGCAGCAGATACAATTTGGGAATGCAGCCATTGAAAAAGTGGCTTATTTTGAGCAAAGTAAAGAAATTTAACCCAGCAATTGAAAAGCAACAATAGAATCTTCATGTGGCACCAATAATACCAGCACTGGTAGCTGACAGAGGAATTAATATTTGCCAAGAATCTATTACGGCCCAGTTCTATGCATTTGTTACCTTCTCAATTATCAAGACATCAAACTCATCTGTAACATCTAAAGGACAACTGGGCTTCCGGTGGTCTTTTCAATCCACACGTCAAAACAACATTAACAAGCACATGTCATAATTTAGCAGCCTGAGCTAGGTCTGCCACTCAGCAGCTGGGTAAACTTGAGAACACTGGGAACCTTCCAAGCCTCATTTTCAATGCCGCACGATGGGGCCAACAGTAGTACCAACTTATTAAAGTAGGTTTGAAACTAGTGCAGTGATGCATAGAAAGACCTCTATACTTTGCTGCCACAGATCCATGTCAAAAAATATTTTCTACTGCTACTTTCCAAGGTGACATATGGATTTGGGAATTACCTTTTCTCCTTTATAGAGACAAAAGTCAGGTGGCTCTACCAACAGGGTGGGTCCAGGAGAACCTTGCTGACCAACCTCACCCTTAAAAAAAAAAGCAAGATAATGAAAATTTCATATTAATTTATGTTTTGAAGGTTTTCACCCATGTATTGTGGTATAATGCTTCCAATCCTATGTGTCATGGATTTAAAATACAAGTTGTGGCAAGTACATCATAGAATATAAAAGGATATTTATTTTCTTATAAAAATTTAATACACACTTATTGTTAAAAATAAATTTAAAAAATGAAAATGATTCTTAATGCTACTATCCAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCGAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCAGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATCTCAATAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCTACTATCCAGAAGTAATCTCTATTAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCAATGACGCGATCTCGGCTCACAGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCGGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCTATTAAAACTTTGATATAATTTTTGGTGGTGTGTGTACATATGTGTATATATGTACATATATGTGTATATAGGTGAATAAACAATTTGTTTTATGTTTATGAAAATATAATCAGAATACTATAATAAATATATAAACATGATTTAAAATATACAGCATATTTTATTAAATTTTTAAATAATTTTATATTTTTCTTACAATATTTTGTGAGCCTTTTTCTATTATACTAAAATCTCTTCAGGATCCTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
Task1_train_5601
A variant on Chromosome 2 in gene COL4A4 (collagen type IV alpha 4 chain) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Hematuria, benign familial, 1
AAATGAAATTCAAATAAAACATAAGTGGAGTTATAGAAGCAATAGCTGATCATGGGAATAATGAGATTGTTGTCATTTGAGAGACTATTTGCAGCCAGAGGAACTTAGTAAAGAGAAACCAGGAAAGTGGTTGTGATGAAAAGGATGACAGCGTCCTAGGTAAAGTGACACAGATGAAAACTTCACATTAAAGGAACCCTGAGAGATATTTCACAACACTGGAAACAGATCCGAACTTAGGAGTATCATACTTCCTCAAAACATAAAAGACATATTCCTTTAGTATCACAAGTTACATGATGAGAAAAAGGCAAGTACTGTTGAAACTACTCTTGATAAGTTTTTACAAAGAAATAAAACACTTTGGTTCTCAATGCTTCAAATTACAGTATATTAAAGAAATATTTAGTTTTTTCATTTCCTTATATAACTGGCAAAGTTTCTAATGTTTTAACAAAACATTTTAAAAGTCATGGGACAATATTAATTTTCTCATCAGTTGATAAGGTTTCTTTGCGTGGTTTTTAGCTTGCCTGGTCATTCTTACTTTACTGTGCAAAGTGAGGGGTGTCTGTATAGTAAATGAGTCAAGGGGAAGTTGGTTGCTTTGCAAAGAGACCATTATGACAAACTTCAGGATTGTGGCTGGTACTGCATGCTATGTTAAAGTTAAAACTGAGAACCCTTGCTCTCTTGAATGCTCATGAATCTGTAGAATGAGGTTTGGCCTGATTTGAGGAGCTTAATAAATGTGCATTCACCAGACTGCACTTGAGTTTTCAAATGGCTGAGTTTGAAAGTAAAGGATGGTTGAAAAACTTAACAATGAAAGGTGGTGGATGTTCTTATTTGATACCAGAAGAAAAATGTGAGTATGGAAAATTCTTTTTGAGTTTAGTGTTCAGATCAGTTCCTCTAGAATCTGGAGCAAAAGGAAGACTCGTGAGTGACAGCAGAATGAATGATTATGGTGGTCATGCTAAGAAAACTTTCTAGAAAGAAACTTGTGAAATGATATTTTATTAAGGAAGGGAGAAATGCTAAAAAAAAAAAAATCACAGAAAAACAATTTGGAAAGGTCAAATAATCTCTGATCTTTATTTAAGTGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAAAGAAAGGGAATATGGGGGGTAGCTCTTGCTCCAGTTATGTTTAAATGAAAGTCCAAAATTCTGAAGAAAAAAAAAGCTAAGAGCCGTAAGTTTTCCCCCAAGTGCTGGATACTATCAACTGTTGCTGGACATCCATTCCAAATCTTTTCTAATATATTTTTTTGCATTACAGGGGCTAGAAAGATAAAAACTACATTGCCCAGACTCCTTTATAGCTGGATGTGAATTAGGTTCCACCTAGGAGATGTGGAAGGCAGAAGTTTGGAAGAGATTCTCTTCCTGGTCTGTTGTTGCTGCCAAGCAGGAAAGCAGAAACTTGAGTGTTCTGTTTGCTAGTGTCTAGACGTGGGGTGACAGGCAGTGGTTACAGTGCAGTTACAGCTTCCTGACTCCGGATCTCAGCTAGCTGTGAACCTTTGAAATCAGTGGTCTCGTGTGGTCCTAAGTTTTACTCTTCCAACTATTATAATAAGTGCCAGAATCCCTGTAGCAGATCCCTTTCTGTTCAAAATACCTAGTGGGGTTTGTTTCTGCAATTAACCCTGAATGATAAACAATTTACATTTTGCTACCTGGTCTCTCTGCTCTTTTTTCCCTACTATCTATTCTCTTCACAGCAGCCAGAGACATCTTAATGAAACATCAATCAGATCATGTTGCTTCCTTCCTTAAAACCATCCAGTGCCTTTACCTAACATGGATAAGAAAATCTAGCCTCCTTCCATCATCCACAAAGTCCTGCATGTTCTAAGTCCTGCCTATCTCTCTGTCCTTATCCCCCAGCCACTCCCATTTGTTGACAATGCTCCAGGCACACTTGTATTAACTCTGTTTCTTGAATACATCAAGCCTGTTCCACCACAGGGCCTGTTCACTTAAGATTCCTGTTAAGATGAACTGTGGGTATCTTACTAGGGGGCCTCCTGGGCCAAGAGCTCCTCTTCCTCCTGGAAACCCTGGGTCACCTCTTGAGCCATTGTGGCCACTCATACCAGGTTTGCCTCTGGGTCCAGGAGGCCCTGGGTGCCCCTGCAGAAAACAAAATTATAAGTGAAGCATTTTTGCGAAAATATCATTACATAAAGGTTATGCAATATGAATACTCAAATTATGGCAATTGTGATTCACACATTTACTGTTTAGTTTTGTGAAACTTTCTCTTTACCCCAAAAGGCTACGTAGCATGTAAAAATAAAACCTAAATTTTTTTTAAGATAACAAATTTAAACTAATTTAGTTTGCAGTACTCTGGGAAATTGAGGAGGGGACCTTCCTTAAAATCCTTAGAAATACTATAATGAATTATAAAGCCCCCACATACCTCTTTTTTTTTTTCCATTCCATTTTCATATGAGAAATGGGAGTATTAAGCTCACTACAAATATTAGGACTCATCAGCAAATAAAAACATTCCTTATGAGTATGCATTAATTTCAAGAACATTGTACTTGACATAACAAGTATACCTAGCTCATATTTTGGAATTTTTTCTCTAACCTGTTAGAAAACGTTGCTTTCCAAGTAAAGTGTTTTGCTCTGGGAGTTATTGTACAAAATTTAAATGTAAACACCCTTTCATGCACTAAAATGAGAAAATATAAAAAGAGTTTGCTATGTATAATATATACCATGCACCATAACATATATATATCTTGCACCATATTTTATACATGTTATACAATATATAATTAACAGATATTATGATATATAAACTATATGTAAGATATAAGATACTATATAAAATATATGTAAGATAGCTATATATCGTATATACTATAGATTTTATATATGTAAAATATAAGATACATATTGTATAGTATACATACTATACATATCTTATATATACAATATATTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGGGATTGAAAGTAACAGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATGTATTCTATATCTTGTATATCTAATATATATCTTTTATATATGTAGATATATATTATGGTGAAAGATATATATATATTACGTTGCTTGTGGTATATATAGCAAATATTTGCTATATATAATATATATATTGTGGTTTCTATAAATATATATTTTATGTATATATACATGTGGTTTTAAGGATTTTGATGAGTACTTCTGCCTTTTTGAAAAAAGTGGAGAAAATTTAGGGATACTTACAGGTATGCCATCTAAACCTGGAAATCCAGGAACACCAGTTGGACCCTAAAATCCCAGAAAATAAAACAAAGAGATAAAAATTATTAAATTAATAAGCTGATTTACTTGAAAATAGTAACAATTAATTACTCATCTTTAAACATGCTGAGCAGTCATTGTCACCTATTTTTTACATGATGAGTCTAAAAGCCAACATTTAAGAACCAATTCTTGTGCTTTTCTTTTGTACTTGGGAAAACAGCCTAGCAGTACTGATTTAAGTAAATCATTCAACATGCTGTGAACAGAAATCTAACACTCCGAATCTCGATCCTAGAGTAACAAACCCTTAACTGTGAACACAGGCAATTGATAGGATTATTTTTGCACATCTGCACTACCCAAAGTTGGGGTAGAATCTCAAGTGCTCATCAACAGGGAATAAACTATAGTTTTATTCATACTATGGCATATTATACAATGTTTTTTCAGGAATAAGTTCAATCTACATAGCCTGATAAGGAATGGTCTCTAAGACATATTGTTGAGTGAAAAGAGAAAACTCAGTGTGATGCATATAATTAATGTCATGTAGGTTTTTTAAAAAGCCATGAAACAATATAACTTCTCACTGGGTACACACATGTATTTAAAGGTCCAGAAGAGCATGCTCCTCTGGAAAGGGGCCAAAAATGAGGATGAATTATTGCAGAGGAGTTCAGGGACTTCATTTATTATAAGGTTCAAGTATATACTACTCGTGGTTATAAAACTCCAGTGCTGGCCAGGCACAGTGGCCAACGCCTGTAATTACAGCATTTTGGGAG
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Task1_train_5602
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting COL4A4 (collagen type IV alpha 4 chain). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Autosomal recessive Alport syndrome
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Task1_train_5603
Here is a mutation in COL4A4 (collagen type IV alpha 4 chain) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Benign familial hematuria
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Task1_train_5604
This sequence variant lies in COL4A4 (collagen type IV alpha 4 chain) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Benign familial hematuria
GAAGCAATAGCTGATCATGGGAATAATGAGATTGTTGTCATTTGAGAGACTATTTGCAGCCAGAGGAACTTAGTAAAGAGAAACCAGGAAAGTGGTTGTGATGAAAAGGATGACAGCGTCCTAGGTAAAGTGACACAGATGAAAACTTCACATTAAAGGAACCCTGAGAGATATTTCACAACACTGGAAACAGATCCGAACTTAGGAGTATCATACTTCCTCAAAACATAAAAGACATATTCCTTTAGTATCACAAGTTACATGATGAGAAAAAGGCAAGTACTGTTGAAACTACTCTTGATAAGTTTTTACAAAGAAATAAAACACTTTGGTTCTCAATGCTTCAAATTACAGTATATTAAAGAAATATTTAGTTTTTTCATTTCCTTATATAACTGGCAAAGTTTCTAATGTTTTAACAAAACATTTTAAAAGTCATGGGACAATATTAATTTTCTCATCAGTTGATAAGGTTTCTTTGCGTGGTTTTTAGCTTGCCTGGTCATTCTTACTTTACTGTGCAAAGTGAGGGGTGTCTGTATAGTAAATGAGTCAAGGGGAAGTTGGTTGCTTTGCAAAGAGACCATTATGACAAACTTCAGGATTGTGGCTGGTACTGCATGCTATGTTAAAGTTAAAACTGAGAACCCTTGCTCTCTTGAATGCTCATGAATCTGTAGAATGAGGTTTGGCCTGATTTGAGGAGCTTAATAAATGTGCATTCACCAGACTGCACTTGAGTTTTCAAATGGCTGAGTTTGAAAGTAAAGGATGGTTGAAAAACTTAACAATGAAAGGTGGTGGATGTTCTTATTTGATACCAGAAGAAAAATGTGAGTATGGAAAATTCTTTTTGAGTTTAGTGTTCAGATCAGTTCCTCTAGAATCTGGAGCAAAAGGAAGACTCGTGAGTGACAGCAGAATGAATGATTATGGTGGTCATGCTAAGAAAACTTTCTAGAAAGAAACTTGTGAAATGATATTTTATTAAGGAAGGGAGAAATGCTAAAAAAAAAAAAATCACAGAAAAACAATTTGGAAAGGTCAAATAATCTCTGATCTTTATTTAAGTGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAAAGAAAGGGAATATGGGGGGTAGCTCTTGCTCCAGTTATGTTTAAATGAAAGTCCAAAATTCTGAAGAAAAAAAAAGCTAAGAGCCGTAAGTTTTCCCCCAAGTGCTGGATACTATCAACTGTTGCTGGACATCCATTCCAAATCTTTTCTAATATATTTTTTTGCATTACAGGGGCTAGAAAGATAAAAACTACATTGCCCAGACTCCTTTATAGCTGGATGTGAATTAGGTTCCACCTAGGAGATGTGGAAGGCAGAAGTTTGGAAGAGATTCTCTTCCTGGTCTGTTGTTGCTGCCAAGCAGGAAAGCAGAAACTTGAGTGTTCTGTTTGCTAGTGTCTAGACGTGGGGTGACAGGCAGTGGTTACAGTGCAGTTACAGCTTCCTGACTCCGGATCTCAGCTAGCTGTGAACCTTTGAAATCAGTGGTCTCGTGTGGTCCTAAGTTTTACTCTTCCAACTATTATAATAAGTGCCAGAATCCCTGTAGCAGATCCCTTTCTGTTCAAAATACCTAGTGGGGTTTGTTTCTGCAATTAACCCTGAATGATAAACAATTTACATTTTGCTACCTGGTCTCTCTGCTCTTTTTTCCCTACTATCTATTCTCTTCACAGCAGCCAGAGACATCTTAATGAAACATCAATCAGATCATGTTGCTTCCTTCCTTAAAACCATCCAGTGCCTTTACCTAACATGGATAAGAAAATCTAGCCTCCTTCCATCATCCACAAAGTCCTGCATGTTCTAAGTCCTGCCTATCTCTCTGTCCTTATCCCCCAGCCACTCCCATTTGTTGACAATGCTCCAGGCACACTTGTATTAACTCTGTTTCTTGAATACATCAAGCCTGTTCCACCACAGGGCCTGTTCACTTAAGATTCCTGTTAAGATGAACTGTGGGTATCTTACTAGGGGGCCTCCTGGGCCAAGAGCTCCTCTTCCTCCTGGAAACCCTGGGTCACCTCTTGAGCCATTGTGGCCACTCATACCAGGTTTGCCTCTGGGTCCAGGAGGCCCTGGGTGCCCCTGCAGAAAACAAAATTATAAGTGAAGCATTTTTGCGAAAATATCATTACATAAAGGTTATGCAATATGAATACTCAAATTATGGCAATTGTGATTCACACATTTACTGTTTAGTTTTGTGAAACTTTCTCTTTACCCCAAAAGGCTACGTAGCATGTAAAAATAAAACCTAAATTTTTTTTAAGATAACAAATTTAAACTAATTTAGTTTGCAGTACTCTGGGAAATTGAGGAGGGGACCTTCCTTAAAATCCTTAGAAATACTATAATGAATTATAAAGCCCCCACATACCTCTTTTTTTTTTTCCATTCCATTTTCATATGAGAAATGGGAGTATTAAGCTCACTACAAATATTAGGACTCATCAGCAAATAAAAACATTCCTTATGAGTATGCATTAATTTCAAGAACATTGTACTTGACATAACAAGTATACCTAGCTCATATTTTGGAATTTTTTCTCTAACCTGTTAGAAAACGTTGCTTTCCAAGTAAAGTGTTTTGCTCTGGGAGTTATTGTACAAAATTTAAATGTAAACACCCTTTCATGCACTAAAATGAGAAAATATAAAAAGAGTTTGCTATGTATAATATATACCATGCACCATAACATATATATATCTTGCACCATATTTTATACATGTTATACAATATATAATTAACAGATATTATGATATATAAACTATATGTAAGATATAAGATACTATATAAAATATATGTAAGATAGCTATATATCGTATATACTATAGATTTTATATATGTAAAATATAAGATACATATTGTATAGTATACATACTATACATATCTTATATATACAATATATTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGGGATTGAAAGTAACAGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATGTATTCTATATCTTGTATATCTAATATATATCTTTTATATATGTAGATATATATTATGGTGAAAGATATATATATATTACGTTGCTTGTGGTATATATAGCAAATATTTGCTATATATAATATATATATTGTGGTTTCTATAAATATATATTTTATGTATATATACATGTGGTTTTAAGGATTTTGATGAGTACTTCTGCCTTTTTGAAAAAAGTGGAGAAAATTTAGGGATACTTACAGGTATGCCATCTAAACCTGGAAATCCAGGAACACCAGTTGGACCCTAAAATCCCAGAAAATAAAACAAAGAGATAAAAATTATTAAATTAATAAGCTGATTTACTTGAAAATAGTAACAATTAATTACTCATCTTTAAACATGCTGAGCAGTCATTGTCACCTATTTTTTACATGATGAGTCTAAAAGCCAACATTTAAGAACCAATTCTTGTGCTTTTCTTTTGTACTTGGGAAAACAGCCTAGCAGTACTGATTTAAGTAAATCATTCAACATGCTGTGAACAGAAATCTAACACTCCGAATCTCGATCCTAGAGTAACAAACCCTTAACTGTGAACACAGGCAATTGATAGGATTATTTTTGCACATCTGCACTACCCAAAGTTGGGGTAGAATCTCAAGTGCTCATCAACAGGGAATAAACTATAGTTTTATTCATACTATGGCATATTATACAATGTTTTTTCAGGAATAAGTTCAATCTACATAGCCTGATAAGGAATGGTCTCTAAGACATATTGTTGAGTGAAAAGAGAAAACTCAGTGTGATGCATATAATTAATGTCATGTAGGTTTTTTAAAAAGCCATGAAACAATATAACTTCTCACTGGGTACACACATGTATTTAAAGGTCCAGAAGAGCATGCTCCTCTGGAAAGGGGCCAAAAATGAGGATGAATTATTGCAGAGGAGTTCAGGGACTTCATTTATTATAAGGTTCAAGTATATACTACTCGTGGTTATAAAACTCCAGTGCTGGCCAGGCACAGTGGCCAACGCCTGTAATTACAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTC
GAAGCAATAGCTGATCATGGGAATAATGAGATTGTTGTCATTTGAGAGACTATTTGCAGCCAGAGGAACTTAGTAAAGAGAAACCAGGAAAGTGGTTGTGATGAAAAGGATGACAGCGTCCTAGGTAAAGTGACACAGATGAAAACTTCACATTAAAGGAACCCTGAGAGATATTTCACAACACTGGAAACAGATCCGAACTTAGGAGTATCATACTTCCTCAAAACATAAAAGACATATTCCTTTAGTATCACAAGTTACATGATGAGAAAAAGGCAAGTACTGTTGAAACTACTCTTGATAAGTTTTTACAAAGAAATAAAACACTTTGGTTCTCAATGCTTCAAATTACAGTATATTAAAGAAATATTTAGTTTTTTCATTTCCTTATATAACTGGCAAAGTTTCTAATGTTTTAACAAAACATTTTAAAAGTCATGGGACAATATTAATTTTCTCATCAGTTGATAAGGTTTCTTTGCGTGGTTTTTAGCTTGCCTGGTCATTCTTACTTTACTGTGCAAAGTGAGGGGTGTCTGTATAGTAAATGAGTCAAGGGGAAGTTGGTTGCTTTGCAAAGAGACCATTATGACAAACTTCAGGATTGTGGCTGGTACTGCATGCTATGTTAAAGTTAAAACTGAGAACCCTTGCTCTCTTGAATGCTCATGAATCTGTAGAATGAGGTTTGGCCTGATTTGAGGAGCTTAATAAATGTGCATTCACCAGACTGCACTTGAGTTTTCAAATGGCTGAGTTTGAAAGTAAAGGATGGTTGAAAAACTTAACAATGAAAGGTGGTGGATGTTCTTATTTGATACCAGAAGAAAAATGTGAGTATGGAAAATTCTTTTTGAGTTTAGTGTTCAGATCAGTTCCTCTAGAATCTGGAGCAAAAGGAAGACTCGTGAGTGACAGCAGAATGAATGATTATGGTGGTCATGCTAAGAAAACTTTCTAGAAAGAAACTTGTGAAATGATATTTTATTAAGGAAGGGAGAAATGCTAAAAAAAAAAAAATCACAGAAAAACAATTTGGAAAGGTCAAATAATCTCTGATCTTTATTTAAGTGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAAAGAAAGGGAATATGGGGGGTAGCTCTTGCTCCAGTTATGTTTAAATGAAAGTCCAAAATTCTGAAGAAAAAAAAAGCTAAGAGCCGTAAGTTTTCCCCCAAGTGCTGGATACTATCAACTGTTGCTGGACATCCATTCCAAATCTTTTCTAATATATTTTTTTGCATTACAGGGGCTAGAAAGATAAAAACTACATTGCCCAGACTCCTTTATAGCTGGATGTGAATTAGGTTCCACCTAGGAGATGTGGAAGGCAGAAGTTTGGAAGAGATTCTCTTCCTGGTCTGTTGTTGCTGCCAAGCAGGAAAGCAGAAACTTGAGTGTTCTGTTTGCTAGTGTCTAGACGTGGGGTGACAGGCAGTGGTTACAGTGCAGTTACAGCTTCCTGACTCCGGATCTCAGCTAGCTGTGAACCTTTGAAATCAGTGGTCTCGTGTGGTCCTAAGTTTTACTCTTCCAACTATTATAATAAGTGCCAGAATCCCTGTAGCAGATCCCTTTCTGTTCAAAATACCTAGTGGGGTTTGTTTCTGCAATTAACCCTGAATGATAAACAATTTACATTTTGCTACCTGGTCTCTCTGCTCTTTTTTCCCTACTATCTATTCTCTTCACAGCAGCCAGAGACATCTTAATGAAACATCAATCAGATCATGTTGCTTCCTTCCTTAAAACCATCCAGTGCCTTTACCTAACATGGATAAGAAAATCTAGCCTCCTTCCATCATCCACAAAGTCCTGCATGTTCTAAGTCCTGCCTATCTCTCTGTCCTTATCCCCCAGCCACTCCCATTTGTTGACAATGCTCCAGGCACACTTGTATTAACTCTGTTTCTTGAATACATCAAGCCTGTTCCACCACAGGGCCTGTTCACTTAAGATTCCTGTTAAGATGAACTGTGGGTATCTTACTAGGGGGCCTCCTGGGCCAAGAGCTCCTCTTCCTCCTGGAAACACTGGGTCACCTCTTGAGCCATTGTGGCCACTCATACCAGGTTTGCCTCTGGGTCCAGGAGGCCCTGGGTGCCCCTGCAGAAAACAAAATTATAAGTGAAGCATTTTTGCGAAAATATCATTACATAAAGGTTATGCAATATGAATACTCAAATTATGGCAATTGTGATTCACACATTTACTGTTTAGTTTTGTGAAACTTTCTCTTTACCCCAAAAGGCTACGTAGCATGTAAAAATAAAACCTAAATTTTTTTTAAGATAACAAATTTAAACTAATTTAGTTTGCAGTACTCTGGGAAATTGAGGAGGGGACCTTCCTTAAAATCCTTAGAAATACTATAATGAATTATAAAGCCCCCACATACCTCTTTTTTTTTTTCCATTCCATTTTCATATGAGAAATGGGAGTATTAAGCTCACTACAAATATTAGGACTCATCAGCAAATAAAAACATTCCTTATGAGTATGCATTAATTTCAAGAACATTGTACTTGACATAACAAGTATACCTAGCTCATATTTTGGAATTTTTTCTCTAACCTGTTAGAAAACGTTGCTTTCCAAGTAAAGTGTTTTGCTCTGGGAGTTATTGTACAAAATTTAAATGTAAACACCCTTTCATGCACTAAAATGAGAAAATATAAAAAGAGTTTGCTATGTATAATATATACCATGCACCATAACATATATATATCTTGCACCATATTTTATACATGTTATACAATATATAATTAACAGATATTATGATATATAAACTATATGTAAGATATAAGATACTATATAAAATATATGTAAGATAGCTATATATCGTATATACTATAGATTTTATATATGTAAAATATAAGATACATATTGTATAGTATACATACTATACATATCTTATATATACAATATATTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGGGATTGAAAGTAACAGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATGTATTCTATATCTTGTATATCTAATATATATCTTTTATATATGTAGATATATATTATGGTGAAAGATATATATATATTACGTTGCTTGTGGTATATATAGCAAATATTTGCTATATATAATATATATATTGTGGTTTCTATAAATATATATTTTATGTATATATACATGTGGTTTTAAGGATTTTGATGAGTACTTCTGCCTTTTTGAAAAAAGTGGAGAAAATTTAGGGATACTTACAGGTATGCCATCTAAACCTGGAAATCCAGGAACACCAGTTGGACCCTAAAATCCCAGAAAATAAAACAAAGAGATAAAAATTATTAAATTAATAAGCTGATTTACTTGAAAATAGTAACAATTAATTACTCATCTTTAAACATGCTGAGCAGTCATTGTCACCTATTTTTTACATGATGAGTCTAAAAGCCAACATTTAAGAACCAATTCTTGTGCTTTTCTTTTGTACTTGGGAAAACAGCCTAGCAGTACTGATTTAAGTAAATCATTCAACATGCTGTGAACAGAAATCTAACACTCCGAATCTCGATCCTAGAGTAACAAACCCTTAACTGTGAACACAGGCAATTGATAGGATTATTTTTGCACATCTGCACTACCCAAAGTTGGGGTAGAATCTCAAGTGCTCATCAACAGGGAATAAACTATAGTTTTATTCATACTATGGCATATTATACAATGTTTTTTCAGGAATAAGTTCAATCTACATAGCCTGATAAGGAATGGTCTCTAAGACATATTGTTGAGTGAAAAGAGAAAACTCAGTGTGATGCATATAATTAATGTCATGTAGGTTTTTTAAAAAGCCATGAAACAATATAACTTCTCACTGGGTACACACATGTATTTAAAGGTCCAGAAGAGCATGCTCCTCTGGAAAGGGGCCAAAAATGAGGATGAATTATTGCAGAGGAGTTCAGGGACTTCATTTATTATAAGGTTCAAGTATATACTACTCGTGGTTATAAAACTCCAGTGCTGGCCAGGCACAGTGGCCAACGCCTGTAATTACAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTC
Task1_train_5605
Here’s a variant in COL4A4 (collagen type IV alpha 4 chain) located on Chromosome 2. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Hematuria, benign familial, 1
GAAGCAATAGCTGATCATGGGAATAATGAGATTGTTGTCATTTGAGAGACTATTTGCAGCCAGAGGAACTTAGTAAAGAGAAACCAGGAAAGTGGTTGTGATGAAAAGGATGACAGCGTCCTAGGTAAAGTGACACAGATGAAAACTTCACATTAAAGGAACCCTGAGAGATATTTCACAACACTGGAAACAGATCCGAACTTAGGAGTATCATACTTCCTCAAAACATAAAAGACATATTCCTTTAGTATCACAAGTTACATGATGAGAAAAAGGCAAGTACTGTTGAAACTACTCTTGATAAGTTTTTACAAAGAAATAAAACACTTTGGTTCTCAATGCTTCAAATTACAGTATATTAAAGAAATATTTAGTTTTTTCATTTCCTTATATAACTGGCAAAGTTTCTAATGTTTTAACAAAACATTTTAAAAGTCATGGGACAATATTAATTTTCTCATCAGTTGATAAGGTTTCTTTGCGTGGTTTTTAGCTTGCCTGGTCATTCTTACTTTACTGTGCAAAGTGAGGGGTGTCTGTATAGTAAATGAGTCAAGGGGAAGTTGGTTGCTTTGCAAAGAGACCATTATGACAAACTTCAGGATTGTGGCTGGTACTGCATGCTATGTTAAAGTTAAAACTGAGAACCCTTGCTCTCTTGAATGCTCATGAATCTGTAGAATGAGGTTTGGCCTGATTTGAGGAGCTTAATAAATGTGCATTCACCAGACTGCACTTGAGTTTTCAAATGGCTGAGTTTGAAAGTAAAGGATGGTTGAAAAACTTAACAATGAAAGGTGGTGGATGTTCTTATTTGATACCAGAAGAAAAATGTGAGTATGGAAAATTCTTTTTGAGTTTAGTGTTCAGATCAGTTCCTCTAGAATCTGGAGCAAAAGGAAGACTCGTGAGTGACAGCAGAATGAATGATTATGGTGGTCATGCTAAGAAAACTTTCTAGAAAGAAACTTGTGAAATGATATTTTATTAAGGAAGGGAGAAATGCTAAAAAAAAAAAAATCACAGAAAAACAATTTGGAAAGGTCAAATAATCTCTGATCTTTATTTAAGTGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAAAGAAAGGGAATATGGGGGGTAGCTCTTGCTCCAGTTATGTTTAAATGAAAGTCCAAAATTCTGAAGAAAAAAAAAGCTAAGAGCCGTAAGTTTTCCCCCAAGTGCTGGATACTATCAACTGTTGCTGGACATCCATTCCAAATCTTTTCTAATATATTTTTTTGCATTACAGGGGCTAGAAAGATAAAAACTACATTGCCCAGACTCCTTTATAGCTGGATGTGAATTAGGTTCCACCTAGGAGATGTGGAAGGCAGAAGTTTGGAAGAGATTCTCTTCCTGGTCTGTTGTTGCTGCCAAGCAGGAAAGCAGAAACTTGAGTGTTCTGTTTGCTAGTGTCTAGACGTGGGGTGACAGGCAGTGGTTACAGTGCAGTTACAGCTTCCTGACTCCGGATCTCAGCTAGCTGTGAACCTTTGAAATCAGTGGTCTCGTGTGGTCCTAAGTTTTACTCTTCCAACTATTATAATAAGTGCCAGAATCCCTGTAGCAGATCCCTTTCTGTTCAAAATACCTAGTGGGGTTTGTTTCTGCAATTAACCCTGAATGATAAACAATTTACATTTTGCTACCTGGTCTCTCTGCTCTTTTTTCCCTACTATCTATTCTCTTCACAGCAGCCAGAGACATCTTAATGAAACATCAATCAGATCATGTTGCTTCCTTCCTTAAAACCATCCAGTGCCTTTACCTAACATGGATAAGAAAATCTAGCCTCCTTCCATCATCCACAAAGTCCTGCATGTTCTAAGTCCTGCCTATCTCTCTGTCCTTATCCCCCAGCCACTCCCATTTGTTGACAATGCTCCAGGCACACTTGTATTAACTCTGTTTCTTGAATACATCAAGCCTGTTCCACCACAGGGCCTGTTCACTTAAGATTCCTGTTAAGATGAACTGTGGGTATCTTACTAGGGGGCCTCCTGGGCCAAGAGCTCCTCTTCCTCCTGGAAACCCTGGGTCACCTCTTGAGCCATTGTGGCCACTCATACCAGGTTTGCCTCTGGGTCCAGGAGGCCCTGGGTGCCCCTGCAGAAAACAAAATTATAAGTGAAGCATTTTTGCGAAAATATCATTACATAAAGGTTATGCAATATGAATACTCAAATTATGGCAATTGTGATTCACACATTTACTGTTTAGTTTTGTGAAACTTTCTCTTTACCCCAAAAGGCTACGTAGCATGTAAAAATAAAACCTAAATTTTTTTTAAGATAACAAATTTAAACTAATTTAGTTTGCAGTACTCTGGGAAATTGAGGAGGGGACCTTCCTTAAAATCCTTAGAAATACTATAATGAATTATAAAGCCCCCACATACCTCTTTTTTTTTTTCCATTCCATTTTCATATGAGAAATGGGAGTATTAAGCTCACTACAAATATTAGGACTCATCAGCAAATAAAAACATTCCTTATGAGTATGCATTAATTTCAAGAACATTGTACTTGACATAACAAGTATACCTAGCTCATATTTTGGAATTTTTTCTCTAACCTGTTAGAAAACGTTGCTTTCCAAGTAAAGTGTTTTGCTCTGGGAGTTATTGTACAAAATTTAAATGTAAACACCCTTTCATGCACTAAAATGAGAAAATATAAAAAGAGTTTGCTATGTATAATATATACCATGCACCATAACATATATATATCTTGCACCATATTTTATACATGTTATACAATATATAATTAACAGATATTATGATATATAAACTATATGTAAGATATAAGATACTATATAAAATATATGTAAGATAGCTATATATCGTATATACTATAGATTTTATATATGTAAAATATAAGATACATATTGTATAGTATACATACTATACATATCTTATATATACAATATATTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGGGATTGAAAGTAACAGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATGTATTCTATATCTTGTATATCTAATATATATCTTTTATATATGTAGATATATATTATGGTGAAAGATATATATATATTACGTTGCTTGTGGTATATATAGCAAATATTTGCTATATATAATATATATATTGTGGTTTCTATAAATATATATTTTATGTATATATACATGTGGTTTTAAGGATTTTGATGAGTACTTCTGCCTTTTTGAAAAAAGTGGAGAAAATTTAGGGATACTTACAGGTATGCCATCTAAACCTGGAAATCCAGGAACACCAGTTGGACCCTAAAATCCCAGAAAATAAAACAAAGAGATAAAAATTATTAAATTAATAAGCTGATTTACTTGAAAATAGTAACAATTAATTACTCATCTTTAAACATGCTGAGCAGTCATTGTCACCTATTTTTTACATGATGAGTCTAAAAGCCAACATTTAAGAACCAATTCTTGTGCTTTTCTTTTGTACTTGGGAAAACAGCCTAGCAGTACTGATTTAAGTAAATCATTCAACATGCTGTGAACAGAAATCTAACACTCCGAATCTCGATCCTAGAGTAACAAACCCTTAACTGTGAACACAGGCAATTGATAGGATTATTTTTGCACATCTGCACTACCCAAAGTTGGGGTAGAATCTCAAGTGCTCATCAACAGGGAATAAACTATAGTTTTATTCATACTATGGCATATTATACAATGTTTTTTCAGGAATAAGTTCAATCTACATAGCCTGATAAGGAATGGTCTCTAAGACATATTGTTGAGTGAAAAGAGAAAACTCAGTGTGATGCATATAATTAATGTCATGTAGGTTTTTTAAAAAGCCATGAAACAATATAACTTCTCACTGGGTACACACATGTATTTAAAGGTCCAGAAGAGCATGCTCCTCTGGAAAGGGGCCAAAAATGAGGATGAATTATTGCAGAGGAGTTCAGGGACTTCATTTATTATAAGGTTCAAGTATATACTACTCGTGGTTATAAAACTCCAGTGCTGGCCAGGCACAGTGGCCAACGCCTGTAATTACAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTC
GAAGCAATAGCTGATCATGGGAATAATGAGATTGTTGTCATTTGAGAGACTATTTGCAGCCAGAGGAACTTAGTAAAGAGAAACCAGGAAAGTGGTTGTGATGAAAAGGATGACAGCGTCCTAGGTAAAGTGACACAGATGAAAACTTCACATTAAAGGAACCCTGAGAGATATTTCACAACACTGGAAACAGATCCGAACTTAGGAGTATCATACTTCCTCAAAACATAAAAGACATATTCCTTTAGTATCACAAGTTACATGATGAGAAAAAGGCAAGTACTGTTGAAACTACTCTTGATAAGTTTTTACAAAGAAATAAAACACTTTGGTTCTCAATGCTTCAAATTACAGTATATTAAAGAAATATTTAGTTTTTTCATTTCCTTATATAACTGGCAAAGTTTCTAATGTTTTAACAAAACATTTTAAAAGTCATGGGACAATATTAATTTTCTCATCAGTTGATAAGGTTTCTTTGCGTGGTTTTTAGCTTGCCTGGTCATTCTTACTTTACTGTGCAAAGTGAGGGGTGTCTGTATAGTAAATGAGTCAAGGGGAAGTTGGTTGCTTTGCAAAGAGACCATTATGACAAACTTCAGGATTGTGGCTGGTACTGCATGCTATGTTAAAGTTAAAACTGAGAACCCTTGCTCTCTTGAATGCTCATGAATCTGTAGAATGAGGTTTGGCCTGATTTGAGGAGCTTAATAAATGTGCATTCACCAGACTGCACTTGAGTTTTCAAATGGCTGAGTTTGAAAGTAAAGGATGGTTGAAAAACTTAACAATGAAAGGTGGTGGATGTTCTTATTTGATACCAGAAGAAAAATGTGAGTATGGAAAATTCTTTTTGAGTTTAGTGTTCAGATCAGTTCCTCTAGAATCTGGAGCAAAAGGAAGACTCGTGAGTGACAGCAGAATGAATGATTATGGTGGTCATGCTAAGAAAACTTTCTAGAAAGAAACTTGTGAAATGATATTTTATTAAGGAAGGGAGAAATGCTAAAAAAAAAAAAATCACAGAAAAACAATTTGGAAAGGTCAAATAATCTCTGATCTTTATTTAAGTGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAAAGAAAGGGAATATGGGGGGTAGCTCTTGCTCCAGTTATGTTTAAATGAAAGTCCAAAATTCTGAAGAAAAAAAAAGCTAAGAGCCGTAAGTTTTCCCCCAAGTGCTGGATACTATCAACTGTTGCTGGACATCCATTCCAAATCTTTTCTAATATATTTTTTTGCATTACAGGGGCTAGAAAGATAAAAACTACATTGCCCAGACTCCTTTATAGCTGGATGTGAATTAGGTTCCACCTAGGAGATGTGGAAGGCAGAAGTTTGGAAGAGATTCTCTTCCTGGTCTGTTGTTGCTGCCAAGCAGGAAAGCAGAAACTTGAGTGTTCTGTTTGCTAGTGTCTAGACGTGGGGTGACAGGCAGTGGTTACAGTGCAGTTACAGCTTCCTGACTCCGGATCTCAGCTAGCTGTGAACCTTTGAAATCAGTGGTCTCGTGTGGTCCTAAGTTTTACTCTTCCAACTATTATAATAAGTGCCAGAATCCCTGTAGCAGATCCCTTTCTGTTCAAAATACCTAGTGGGGTTTGTTTCTGCAATTAACCCTGAATGATAAACAATTTACATTTTGCTACCTGGTCTCTCTGCTCTTTTTTCCCTACTATCTATTCTCTTCACAGCAGCCAGAGACATCTTAATGAAACATCAATCAGATCATGTTGCTTCCTTCCTTAAAACCATCCAGTGCCTTTACCTAACATGGATAAGAAAATCTAGCCTCCTTCCATCATCCACAAAGTCCTGCATGTTCTAAGTCCTGCCTATCTCTCTGTCCTTATCCCCCAGCCACTCCCATTTGTTGACAATGCTCCAGGCACACTTGTATTAACTCTGTTTCTTGAATACATCAAGCCTGTTCCACCACAGGGCCTGTTCACTTAAGATTCCTGTTAAGATGAACTGTGGGTATCTTACTAGGGGGCCTCCTGGGCCAAGAGCTCCTCTTCCTCCTGGAAACACTGGGTCACCTCTTGAGCCATTGTGGCCACTCATACCAGGTTTGCCTCTGGGTCCAGGAGGCCCTGGGTGCCCCTGCAGAAAACAAAATTATAAGTGAAGCATTTTTGCGAAAATATCATTACATAAAGGTTATGCAATATGAATACTCAAATTATGGCAATTGTGATTCACACATTTACTGTTTAGTTTTGTGAAACTTTCTCTTTACCCCAAAAGGCTACGTAGCATGTAAAAATAAAACCTAAATTTTTTTTAAGATAACAAATTTAAACTAATTTAGTTTGCAGTACTCTGGGAAATTGAGGAGGGGACCTTCCTTAAAATCCTTAGAAATACTATAATGAATTATAAAGCCCCCACATACCTCTTTTTTTTTTTCCATTCCATTTTCATATGAGAAATGGGAGTATTAAGCTCACTACAAATATTAGGACTCATCAGCAAATAAAAACATTCCTTATGAGTATGCATTAATTTCAAGAACATTGTACTTGACATAACAAGTATACCTAGCTCATATTTTGGAATTTTTTCTCTAACCTGTTAGAAAACGTTGCTTTCCAAGTAAAGTGTTTTGCTCTGGGAGTTATTGTACAAAATTTAAATGTAAACACCCTTTCATGCACTAAAATGAGAAAATATAAAAAGAGTTTGCTATGTATAATATATACCATGCACCATAACATATATATATCTTGCACCATATTTTATACATGTTATACAATATATAATTAACAGATATTATGATATATAAACTATATGTAAGATATAAGATACTATATAAAATATATGTAAGATAGCTATATATCGTATATACTATAGATTTTATATATGTAAAATATAAGATACATATTGTATAGTATACATACTATACATATCTTATATATACAATATATTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGGGATTGAAAGTAACAGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATGTATTCTATATCTTGTATATCTAATATATATCTTTTATATATGTAGATATATATTATGGTGAAAGATATATATATATTACGTTGCTTGTGGTATATATAGCAAATATTTGCTATATATAATATATATATTGTGGTTTCTATAAATATATATTTTATGTATATATACATGTGGTTTTAAGGATTTTGATGAGTACTTCTGCCTTTTTGAAAAAAGTGGAGAAAATTTAGGGATACTTACAGGTATGCCATCTAAACCTGGAAATCCAGGAACACCAGTTGGACCCTAAAATCCCAGAAAATAAAACAAAGAGATAAAAATTATTAAATTAATAAGCTGATTTACTTGAAAATAGTAACAATTAATTACTCATCTTTAAACATGCTGAGCAGTCATTGTCACCTATTTTTTACATGATGAGTCTAAAAGCCAACATTTAAGAACCAATTCTTGTGCTTTTCTTTTGTACTTGGGAAAACAGCCTAGCAGTACTGATTTAAGTAAATCATTCAACATGCTGTGAACAGAAATCTAACACTCCGAATCTCGATCCTAGAGTAACAAACCCTTAACTGTGAACACAGGCAATTGATAGGATTATTTTTGCACATCTGCACTACCCAAAGTTGGGGTAGAATCTCAAGTGCTCATCAACAGGGAATAAACTATAGTTTTATTCATACTATGGCATATTATACAATGTTTTTTCAGGAATAAGTTCAATCTACATAGCCTGATAAGGAATGGTCTCTAAGACATATTGTTGAGTGAAAAGAGAAAACTCAGTGTGATGCATATAATTAATGTCATGTAGGTTTTTTAAAAAGCCATGAAACAATATAACTTCTCACTGGGTACACACATGTATTTAAAGGTCCAGAAGAGCATGCTCCTCTGGAAAGGGGCCAAAAATGAGGATGAATTATTGCAGAGGAGTTCAGGGACTTCATTTATTATAAGGTTCAAGTATATACTACTCGTGGTTATAAAACTCCAGTGCTGGCCAGGCACAGTGGCCAACGCCTGTAATTACAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTC
Task1_train_5606
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting COL4A4 (collagen type IV alpha 4 chain). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Autosomal recessive Alport syndrome
GAAGCAATAGCTGATCATGGGAATAATGAGATTGTTGTCATTTGAGAGACTATTTGCAGCCAGAGGAACTTAGTAAAGAGAAACCAGGAAAGTGGTTGTGATGAAAAGGATGACAGCGTCCTAGGTAAAGTGACACAGATGAAAACTTCACATTAAAGGAACCCTGAGAGATATTTCACAACACTGGAAACAGATCCGAACTTAGGAGTATCATACTTCCTCAAAACATAAAAGACATATTCCTTTAGTATCACAAGTTACATGATGAGAAAAAGGCAAGTACTGTTGAAACTACTCTTGATAAGTTTTTACAAAGAAATAAAACACTTTGGTTCTCAATGCTTCAAATTACAGTATATTAAAGAAATATTTAGTTTTTTCATTTCCTTATATAACTGGCAAAGTTTCTAATGTTTTAACAAAACATTTTAAAAGTCATGGGACAATATTAATTTTCTCATCAGTTGATAAGGTTTCTTTGCGTGGTTTTTAGCTTGCCTGGTCATTCTTACTTTACTGTGCAAAGTGAGGGGTGTCTGTATAGTAAATGAGTCAAGGGGAAGTTGGTTGCTTTGCAAAGAGACCATTATGACAAACTTCAGGATTGTGGCTGGTACTGCATGCTATGTTAAAGTTAAAACTGAGAACCCTTGCTCTCTTGAATGCTCATGAATCTGTAGAATGAGGTTTGGCCTGATTTGAGGAGCTTAATAAATGTGCATTCACCAGACTGCACTTGAGTTTTCAAATGGCTGAGTTTGAAAGTAAAGGATGGTTGAAAAACTTAACAATGAAAGGTGGTGGATGTTCTTATTTGATACCAGAAGAAAAATGTGAGTATGGAAAATTCTTTTTGAGTTTAGTGTTCAGATCAGTTCCTCTAGAATCTGGAGCAAAAGGAAGACTCGTGAGTGACAGCAGAATGAATGATTATGGTGGTCATGCTAAGAAAACTTTCTAGAAAGAAACTTGTGAAATGATATTTTATTAAGGAAGGGAGAAATGCTAAAAAAAAAAAAATCACAGAAAAACAATTTGGAAAGGTCAAATAATCTCTGATCTTTATTTAAGTGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAAAGAAAGGGAATATGGGGGGTAGCTCTTGCTCCAGTTATGTTTAAATGAAAGTCCAAAATTCTGAAGAAAAAAAAAGCTAAGAGCCGTAAGTTTTCCCCCAAGTGCTGGATACTATCAACTGTTGCTGGACATCCATTCCAAATCTTTTCTAATATATTTTTTTGCATTACAGGGGCTAGAAAGATAAAAACTACATTGCCCAGACTCCTTTATAGCTGGATGTGAATTAGGTTCCACCTAGGAGATGTGGAAGGCAGAAGTTTGGAAGAGATTCTCTTCCTGGTCTGTTGTTGCTGCCAAGCAGGAAAGCAGAAACTTGAGTGTTCTGTTTGCTAGTGTCTAGACGTGGGGTGACAGGCAGTGGTTACAGTGCAGTTACAGCTTCCTGACTCCGGATCTCAGCTAGCTGTGAACCTTTGAAATCAGTGGTCTCGTGTGGTCCTAAGTTTTACTCTTCCAACTATTATAATAAGTGCCAGAATCCCTGTAGCAGATCCCTTTCTGTTCAAAATACCTAGTGGGGTTTGTTTCTGCAATTAACCCTGAATGATAAACAATTTACATTTTGCTACCTGGTCTCTCTGCTCTTTTTTCCCTACTATCTATTCTCTTCACAGCAGCCAGAGACATCTTAATGAAACATCAATCAGATCATGTTGCTTCCTTCCTTAAAACCATCCAGTGCCTTTACCTAACATGGATAAGAAAATCTAGCCTCCTTCCATCATCCACAAAGTCCTGCATGTTCTAAGTCCTGCCTATCTCTCTGTCCTTATCCCCCAGCCACTCCCATTTGTTGACAATGCTCCAGGCACACTTGTATTAACTCTGTTTCTTGAATACATCAAGCCTGTTCCACCACAGGGCCTGTTCACTTAAGATTCCTGTTAAGATGAACTGTGGGTATCTTACTAGGGGGCCTCCTGGGCCAAGAGCTCCTCTTCCTCCTGGAAACCCTGGGTCACCTCTTGAGCCATTGTGGCCACTCATACCAGGTTTGCCTCTGGGTCCAGGAGGCCCTGGGTGCCCCTGCAGAAAACAAAATTATAAGTGAAGCATTTTTGCGAAAATATCATTACATAAAGGTTATGCAATATGAATACTCAAATTATGGCAATTGTGATTCACACATTTACTGTTTAGTTTTGTGAAACTTTCTCTTTACCCCAAAAGGCTACGTAGCATGTAAAAATAAAACCTAAATTTTTTTTAAGATAACAAATTTAAACTAATTTAGTTTGCAGTACTCTGGGAAATTGAGGAGGGGACCTTCCTTAAAATCCTTAGAAATACTATAATGAATTATAAAGCCCCCACATACCTCTTTTTTTTTTTCCATTCCATTTTCATATGAGAAATGGGAGTATTAAGCTCACTACAAATATTAGGACTCATCAGCAAATAAAAACATTCCTTATGAGTATGCATTAATTTCAAGAACATTGTACTTGACATAACAAGTATACCTAGCTCATATTTTGGAATTTTTTCTCTAACCTGTTAGAAAACGTTGCTTTCCAAGTAAAGTGTTTTGCTCTGGGAGTTATTGTACAAAATTTAAATGTAAACACCCTTTCATGCACTAAAATGAGAAAATATAAAAAGAGTTTGCTATGTATAATATATACCATGCACCATAACATATATATATCTTGCACCATATTTTATACATGTTATACAATATATAATTAACAGATATTATGATATATAAACTATATGTAAGATATAAGATACTATATAAAATATATGTAAGATAGCTATATATCGTATATACTATAGATTTTATATATGTAAAATATAAGATACATATTGTATAGTATACATACTATACATATCTTATATATACAATATATTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGGGATTGAAAGTAACAGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATGTATTCTATATCTTGTATATCTAATATATATCTTTTATATATGTAGATATATATTATGGTGAAAGATATATATATATTACGTTGCTTGTGGTATATATAGCAAATATTTGCTATATATAATATATATATTGTGGTTTCTATAAATATATATTTTATGTATATATACATGTGGTTTTAAGGATTTTGATGAGTACTTCTGCCTTTTTGAAAAAAGTGGAGAAAATTTAGGGATACTTACAGGTATGCCATCTAAACCTGGAAATCCAGGAACACCAGTTGGACCCTAAAATCCCAGAAAATAAAACAAAGAGATAAAAATTATTAAATTAATAAGCTGATTTACTTGAAAATAGTAACAATTAATTACTCATCTTTAAACATGCTGAGCAGTCATTGTCACCTATTTTTTACATGATGAGTCTAAAAGCCAACATTTAAGAACCAATTCTTGTGCTTTTCTTTTGTACTTGGGAAAACAGCCTAGCAGTACTGATTTAAGTAAATCATTCAACATGCTGTGAACAGAAATCTAACACTCCGAATCTCGATCCTAGAGTAACAAACCCTTAACTGTGAACACAGGCAATTGATAGGATTATTTTTGCACATCTGCACTACCCAAAGTTGGGGTAGAATCTCAAGTGCTCATCAACAGGGAATAAACTATAGTTTTATTCATACTATGGCATATTATACAATGTTTTTTCAGGAATAAGTTCAATCTACATAGCCTGATAAGGAATGGTCTCTAAGACATATTGTTGAGTGAAAAGAGAAAACTCAGTGTGATGCATATAATTAATGTCATGTAGGTTTTTTAAAAAGCCATGAAACAATATAACTTCTCACTGGGTACACACATGTATTTAAAGGTCCAGAAGAGCATGCTCCTCTGGAAAGGGGCCAAAAATGAGGATGAATTATTGCAGAGGAGTTCAGGGACTTCATTTATTATAAGGTTCAAGTATATACTACTCGTGGTTATAAAACTCCAGTGCTGGCCAGGCACAGTGGCCAACGCCTGTAATTACAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTC
GAAGCAATAGCTGATCATGGGAATAATGAGATTGTTGTCATTTGAGAGACTATTTGCAGCCAGAGGAACTTAGTAAAGAGAAACCAGGAAAGTGGTTGTGATGAAAAGGATGACAGCGTCCTAGGTAAAGTGACACAGATGAAAACTTCACATTAAAGGAACCCTGAGAGATATTTCACAACACTGGAAACAGATCCGAACTTAGGAGTATCATACTTCCTCAAAACATAAAAGACATATTCCTTTAGTATCACAAGTTACATGATGAGAAAAAGGCAAGTACTGTTGAAACTACTCTTGATAAGTTTTTACAAAGAAATAAAACACTTTGGTTCTCAATGCTTCAAATTACAGTATATTAAAGAAATATTTAGTTTTTTCATTTCCTTATATAACTGGCAAAGTTTCTAATGTTTTAACAAAACATTTTAAAAGTCATGGGACAATATTAATTTTCTCATCAGTTGATAAGGTTTCTTTGCGTGGTTTTTAGCTTGCCTGGTCATTCTTACTTTACTGTGCAAAGTGAGGGGTGTCTGTATAGTAAATGAGTCAAGGGGAAGTTGGTTGCTTTGCAAAGAGACCATTATGACAAACTTCAGGATTGTGGCTGGTACTGCATGCTATGTTAAAGTTAAAACTGAGAACCCTTGCTCTCTTGAATGCTCATGAATCTGTAGAATGAGGTTTGGCCTGATTTGAGGAGCTTAATAAATGTGCATTCACCAGACTGCACTTGAGTTTTCAAATGGCTGAGTTTGAAAGTAAAGGATGGTTGAAAAACTTAACAATGAAAGGTGGTGGATGTTCTTATTTGATACCAGAAGAAAAATGTGAGTATGGAAAATTCTTTTTGAGTTTAGTGTTCAGATCAGTTCCTCTAGAATCTGGAGCAAAAGGAAGACTCGTGAGTGACAGCAGAATGAATGATTATGGTGGTCATGCTAAGAAAACTTTCTAGAAAGAAACTTGTGAAATGATATTTTATTAAGGAAGGGAGAAATGCTAAAAAAAAAAAAATCACAGAAAAACAATTTGGAAAGGTCAAATAATCTCTGATCTTTATTTAAGTGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAAAGAAAGGGAATATGGGGGGTAGCTCTTGCTCCAGTTATGTTTAAATGAAAGTCCAAAATTCTGAAGAAAAAAAAAGCTAAGAGCCGTAAGTTTTCCCCCAAGTGCTGGATACTATCAACTGTTGCTGGACATCCATTCCAAATCTTTTCTAATATATTTTTTTGCATTACAGGGGCTAGAAAGATAAAAACTACATTGCCCAGACTCCTTTATAGCTGGATGTGAATTAGGTTCCACCTAGGAGATGTGGAAGGCAGAAGTTTGGAAGAGATTCTCTTCCTGGTCTGTTGTTGCTGCCAAGCAGGAAAGCAGAAACTTGAGTGTTCTGTTTGCTAGTGTCTAGACGTGGGGTGACAGGCAGTGGTTACAGTGCAGTTACAGCTTCCTGACTCCGGATCTCAGCTAGCTGTGAACCTTTGAAATCAGTGGTCTCGTGTGGTCCTAAGTTTTACTCTTCCAACTATTATAATAAGTGCCAGAATCCCTGTAGCAGATCCCTTTCTGTTCAAAATACCTAGTGGGGTTTGTTTCTGCAATTAACCCTGAATGATAAACAATTTACATTTTGCTACCTGGTCTCTCTGCTCTTTTTTCCCTACTATCTATTCTCTTCACAGCAGCCAGAGACATCTTAATGAAACATCAATCAGATCATGTTGCTTCCTTCCTTAAAACCATCCAGTGCCTTTACCTAACATGGATAAGAAAATCTAGCCTCCTTCCATCATCCACAAAGTCCTGCATGTTCTAAGTCCTGCCTATCTCTCTGTCCTTATCCCCCAGCCACTCCCATTTGTTGACAATGCTCCAGGCACACTTGTATTAACTCTGTTTCTTGAATACATCAAGCCTGTTCCACCACAGGGCCTGTTCACTTAAGATTCCTGTTAAGATGAACTGTGGGTATCTTACTAGGGGGCCTCCTGGGCCAAGAGCTCCTCTTCCTCCTGGAAACACTGGGTCACCTCTTGAGCCATTGTGGCCACTCATACCAGGTTTGCCTCTGGGTCCAGGAGGCCCTGGGTGCCCCTGCAGAAAACAAAATTATAAGTGAAGCATTTTTGCGAAAATATCATTACATAAAGGTTATGCAATATGAATACTCAAATTATGGCAATTGTGATTCACACATTTACTGTTTAGTTTTGTGAAACTTTCTCTTTACCCCAAAAGGCTACGTAGCATGTAAAAATAAAACCTAAATTTTTTTTAAGATAACAAATTTAAACTAATTTAGTTTGCAGTACTCTGGGAAATTGAGGAGGGGACCTTCCTTAAAATCCTTAGAAATACTATAATGAATTATAAAGCCCCCACATACCTCTTTTTTTTTTTCCATTCCATTTTCATATGAGAAATGGGAGTATTAAGCTCACTACAAATATTAGGACTCATCAGCAAATAAAAACATTCCTTATGAGTATGCATTAATTTCAAGAACATTGTACTTGACATAACAAGTATACCTAGCTCATATTTTGGAATTTTTTCTCTAACCTGTTAGAAAACGTTGCTTTCCAAGTAAAGTGTTTTGCTCTGGGAGTTATTGTACAAAATTTAAATGTAAACACCCTTTCATGCACTAAAATGAGAAAATATAAAAAGAGTTTGCTATGTATAATATATACCATGCACCATAACATATATATATCTTGCACCATATTTTATACATGTTATACAATATATAATTAACAGATATTATGATATATAAACTATATGTAAGATATAAGATACTATATAAAATATATGTAAGATAGCTATATATCGTATATACTATAGATTTTATATATGTAAAATATAAGATACATATTGTATAGTATACATACTATACATATCTTATATATACAATATATTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGGGATTGAAAGTAACAGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATGTATTCTATATCTTGTATATCTAATATATATCTTTTATATATGTAGATATATATTATGGTGAAAGATATATATATATTACGTTGCTTGTGGTATATATAGCAAATATTTGCTATATATAATATATATATTGTGGTTTCTATAAATATATATTTTATGTATATATACATGTGGTTTTAAGGATTTTGATGAGTACTTCTGCCTTTTTGAAAAAAGTGGAGAAAATTTAGGGATACTTACAGGTATGCCATCTAAACCTGGAAATCCAGGAACACCAGTTGGACCCTAAAATCCCAGAAAATAAAACAAAGAGATAAAAATTATTAAATTAATAAGCTGATTTACTTGAAAATAGTAACAATTAATTACTCATCTTTAAACATGCTGAGCAGTCATTGTCACCTATTTTTTACATGATGAGTCTAAAAGCCAACATTTAAGAACCAATTCTTGTGCTTTTCTTTTGTACTTGGGAAAACAGCCTAGCAGTACTGATTTAAGTAAATCATTCAACATGCTGTGAACAGAAATCTAACACTCCGAATCTCGATCCTAGAGTAACAAACCCTTAACTGTGAACACAGGCAATTGATAGGATTATTTTTGCACATCTGCACTACCCAAAGTTGGGGTAGAATCTCAAGTGCTCATCAACAGGGAATAAACTATAGTTTTATTCATACTATGGCATATTATACAATGTTTTTTCAGGAATAAGTTCAATCTACATAGCCTGATAAGGAATGGTCTCTAAGACATATTGTTGAGTGAAAAGAGAAAACTCAGTGTGATGCATATAATTAATGTCATGTAGGTTTTTTAAAAAGCCATGAAACAATATAACTTCTCACTGGGTACACACATGTATTTAAAGGTCCAGAAGAGCATGCTCCTCTGGAAAGGGGCCAAAAATGAGGATGAATTATTGCAGAGGAGTTCAGGGACTTCATTTATTATAAGGTTCAAGTATATACTACTCGTGGTTATAAAACTCCAGTGCTGGCCAGGCACAGTGGCCAACGCCTGTAATTACAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTC
Task1_train_5607
A variant found in Chromosome 2 affects COL4A4 (collagen type IV alpha 4 chain). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Benign familial hematuria
TTTTTCCATTCCATTTTCATATGAGAAATGGGAGTATTAAGCTCACTACAAATATTAGGACTCATCAGCAAATAAAAACATTCCTTATGAGTATGCATTAATTTCAAGAACATTGTACTTGACATAACAAGTATACCTAGCTCATATTTTGGAATTTTTTCTCTAACCTGTTAGAAAACGTTGCTTTCCAAGTAAAGTGTTTTGCTCTGGGAGTTATTGTACAAAATTTAAATGTAAACACCCTTTCATGCACTAAAATGAGAAAATATAAAAAGAGTTTGCTATGTATAATATATACCATGCACCATAACATATATATATCTTGCACCATATTTTATACATGTTATACAATATATAATTAACAGATATTATGATATATAAACTATATGTAAGATATAAGATACTATATAAAATATATGTAAGATAGCTATATATCGTATATACTATAGATTTTATATATGTAAAATATAAGATACATATTGTATAGTATACATACTATACATATCTTATATATACAATATATTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGGGATTGAAAGTAACAGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATGTATTCTATATCTTGTATATCTAATATATATCTTTTATATATGTAGATATATATTATGGTGAAAGATATATATATATTACGTTGCTTGTGGTATATATAGCAAATATTTGCTATATATAATATATATATTGTGGTTTCTATAAATATATATTTTATGTATATATACATGTGGTTTTAAGGATTTTGATGAGTACTTCTGCCTTTTTGAAAAAAGTGGAGAAAATTTAGGGATACTTACAGGTATGCCATCTAAACCTGGAAATCCAGGAACACCAGTTGGACCCTAAAATCCCAGAAAATAAAACAAAGAGATAAAAATTATTAAATTAATAAGCTGATTTACTTGAAAATAGTAACAATTAATTACTCATCTTTAAACATGCTGAGCAGTCATTGTCACCTATTTTTTACATGATGAGTCTAAAAGCCAACATTTAAGAACCAATTCTTGTGCTTTTCTTTTGTACTTGGGAAAACAGCCTAGCAGTACTGATTTAAGTAAATCATTCAACATGCTGTGAACAGAAATCTAACACTCCGAATCTCGATCCTAGAGTAACAAACCCTTAACTGTGAACACAGGCAATTGATAGGATTATTTTTGCACATCTGCACTACCCAAAGTTGGGGTAGAATCTCAAGTGCTCATCAACAGGGAATAAACTATAGTTTTATTCATACTATGGCATATTATACAATGTTTTTTCAGGAATAAGTTCAATCTACATAGCCTGATAAGGAATGGTCTCTAAGACATATTGTTGAGTGAAAAGAGAAAACTCAGTGTGATGCATATAATTAATGTCATGTAGGTTTTTTAAAAAGCCATGAAACAATATAACTTCTCACTGGGTACACACATGTATTTAAAGGTCCAGAAGAGCATGCTCCTCTGGAAAGGGGCCAAAAATGAGGATGAATTATTGCAGAGGAGTTCAGGGACTTCATTTATTATAAGGTTCAAGTATATACTACTCGTGGTTATAAAACTCCAGTGCTGGCCAGGCACAGTGGCCAACGCCTGTAATTACAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCTGGACATGGTGGTATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCCCACCACTGCATTCTAGCCTGAGTGACAGAGTAAGACTGTCTAAAAAAAACAAAAACAAAAAATGGTGCAGTAGTGCTGGTGAGTCTTTCATGTGAATCTCCACATAAGATGTGGCTTACCTTATCTCCTTTGTCCCCTGCTGCTCCAGGAGGGCCGCGGTCCCCTCTCATTCCTTTCTCTCCTGAAAGCCCAATGGGTCCTGGGGCTCCCAGGGGTCCAATTGGACCCTGTGGCCCTGGTGGTCCTGGTGGACCCTGAGAAGGAAGATTAAAAAGAAATGGGGGTGCAATTCTTAATTACTGTCTTCTAACACAAACATATACTCATTCAGGCCTACAGAAGACTTGGAAATTAGATTTGCACAACTCTAATAATAGAAACAAATGGCTGGAGATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGACAACGAGGTTCACTCGAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCGTGGGCAACAAAGTGAGACCCCCCATCTCTACAGAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGGGCCTGTAGTCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGTGGAGAATCACTTGAGCCTAGGAAGCCGAGGTTGCAGTGAGCTGATCGCACCACTGCACTACAGCCTGGGTGACAGAGACAGACCCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGACAAGAAAAGATAAAAGGAAAAGGAAATGAAAGGAAAAACAAGACAAGAAAAGAAAATGATTGACTTAAAACATAAGAAATAGTGGCATTGCCCTTTTTAATCTGAATTAAGCTATATGATAAATTTCAATTACTGCACATGTGTATATGTATGTATGTGTGCAGTATGTATGTATGTGTGTGCACAGAAACACATATATCAAGTGATTATAGTTATCTTACTATTTTCATTCTGTCAATCAAATTTAGAGATCTTGGGCTTTTTAATGAAGCAAGAAACTAAAAAATCAAAGTTTTATTTACCTTTATGTTCGTGACACAAATAGAGTAAGGGAAACTGCCAGATCTTTTATTTACTTCAAATAACTAATGATTTGCCTGCCCTTTCGAAGGACAACATTTCTTTTTTGGCTGCTTTTATCTAATTTCTTAGTCATATTTTGGAATTAGTCTCCATGTCACATTAAATTTATGTAATCCAACTTTCCATGAATGAAAAGGCCACCTCTTGTTTTAAGTGAAGAAGCTTTATGGGGCTCCTACCTCAGAACCCATGTCTCAGGGCCCTGCCCCATCTCCCTTCTGGGGTCTGGGCCTGGCCAAGGCCAGCAGCACCATCTAAAGCGATATCCCGACCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGACTTGCAATATTTCATACCTCTCAAAATTTTTGCAAAGATTTAAGAAAAATTATTTTATAACTTCTTGCTTCACAAAACAGCATGGATGACTGCATTAAATAAGCAAGTAAGTCTTGATGTATGGACAGAAAAGCTTGGCAGGGTTTAGGAGATATCTGCTCAGATCAGATGTCTTAGGTCTCCAGGGCTAATACAGGGTTGCCCCTTGGGAATGCAGGGCCCTGAGCAAAATATTTCTTGCAGAGTCGCATCTATATAAAAACTGGAGTCACCCGAAATCAGCATGCCAGCCCTACTCTGGCAACCCAATGTTGTGCAGTCCCATCAAGGAAATACTTCATGGGCAAATGGAAGTGTTCTGCTAGGCAGCCACCCTCCAAAACCAGGGCTCAACCAAAGGGCCCCAGACAATCGCATAGCATGAAGGCCAGAGCTCCTCATGTGGTCAACCCCACATTGGGTAGAAGGTCAGAGAGCACCTTGACGAGAAGAAACAGTAACTAAGACCCACCTGGTCCTGATCCACACTTGGGGTGTCACTTTGTTTATTTTTATTTATTATTATTATTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCGCGGCTCACTGCAGCCTCCACCTCCCGAGTTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGTTGCATGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACTGGGTTTCAGTATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTTGCCTTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGTGTAAGCCACCATG
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Task1_train_5608
Gene COL4A3, LOC129935730 (collagen type IV alpha 3 chain| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12397), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_5609
A variant was discovered in gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; not provided
AACCACCACCTCCCGGATTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACACGCATGGGCCACCATGCCCTGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCAACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCAACACGCCCAGCCAATTAACCAGAATTATTTTAACTTAGTTCAGAATTATATGTAAAAATTCCTGGGTAGAGATGGGATATTTGCCTAAGTGAGTTTGAGGTGAGGCTGTTGAAATCCTGTATGGTGCGCTATCCTAACTGAGGATGTGAAGTTAGATTAGGAGCTGCAAAAAATGCAGAATGATGCAATTAGGAGCCATTATAGGCTTCTGAAAAGAGATGCAAGATATGATGGCTCTCGCTTTTTTGCTTAGAAAACATTTAAGAGTCCAGATGCTGAAGGCAGGGGATCCAGGAAGAAGAGATAATAGTAATCTGAGATATTGATACATTCTTTAAATGTGTATTGATTATCGTATATGTATTAGTCATTGTGATGATGCTGAAGATATAATGATGGTACATTTGATTACACAAGAAATATTTTTTACCTGCCAATTATGTGCTAGGGGCTATTTCTAGGCTCTAGGAATACAGTAGGGCATAAATCAGCCAAAATATAGATTTAAGGCTGGGCACAGTGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGCTGAAACTCCATCTCTACTAAAGACACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTAGTTCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCAGAGATCGTACCACTGCACTCCAGCCTGAGGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAGGTAGATAGATAAAAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATATTTAAAAATTGTATGAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAAAGCTGAGACAGGAAGGTCTCTTGAGCCTAGTTATAGGCCAGCCTGGGCAACACAGCAAGACCCAGTCTCTTAAAATATATATATATATTGCCTTCATAGAGCTTACATTCTCATGGGGGAAACAAAAGCGTGTAAATGAGTAACTCTATGGTGTGTGAGTAATAAATGCTAAAAGTAAAAATAATGCACGAAAGCAGGATAGGAAGTGTCTGGGTTGGAAGGTGGGTTACAACTTTGGATAAGCAGGAAGGCTTTATGGAAAGGATGACAATTGCATAAAGACAAGAAAAGGAAAAGGGAGTGAGTTATACTGATACCTGGGAAAAGGGGATTCTAGGCAGAGGGAGAGCAGGTGGCAGGCCCTAACGTAGGAGCATGCTTGGCCAAAATGAGAGAGAAAGGAAAAGGGAGAAGAAAAGAGGTGGGAAGAAAGAGAAAAGCAAAATTTTGAAACGTCTGAAGTAAAGCAACTACTTTGGTCATTTTAGAAATGTTATCGTCCAGTTGGTCCTGCCAGCCTGTTACACATGGCAACACTTTTTGATGTTTGTTATCATTAGCTGCAGCCACTGAAAGGGGAGGTGTTATGCTCTTCTGATTTTATTAAAATATTTTAATGCATTTAATTAATGGACATTGTTATTAAGTGAGAAGTAAATTTAAACTTACTCTTATTCTTCTCTCAATTTCAAGGGTTTGCCAGGCCCTCCAGGTTTTCCTGGGCCTGTTGGCCCACCTGGTCCTCCGGGATTCTTTGTGAGTATCAAGTCATCCTTGCTACAGACTCTGTCAACTAATAGATTCATTATTTATTATTAAAAAGTTATTAAAAGAATTTTTCTGGTTGGATGCATTTCCTGCTGTGATTTTCATTTGTGGATTTTTCTAGGGCTTTCCAGGAGCCATGGGACCTAGAGGACCTAAGGTAGACTACAGTTCATATGATGTAACAGCTAGCACACCCTACTCAATCTCAAAGCCAAACCTGGTCTGCTTCTTCATGTGGGTCACTGTTAGGCACCTCTCTGGAACTCACAAGGATCCCTAGCAGGGAAGAGCATGGCTAGCTGCTCTCACCTCTTTTCTCCTTGCATTTCAGTACCTTGATCCCTGATACAAAGAATCTTAATTCAATTTATAAGAAGCTACTTATCACGAAAAAAGGCAAGGATTCTTAATCCACAGGTTTTCCATTTCTGATCATCTCACACAGCACATTATCCTCTGAGTTTTTGTAGTGTGCTGCTTCACAAAGCCAACCTGGTCTTATGCTAGTAAGTAAAAGATGACTATTTGTGTGCTCATTACACAGGGTCTTGCATGCATTTCTGTTAAGACCAGCCCAGGCGCATTGGTTCACACCTGTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAATGTGATGAAATCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGGGGCTGAGGCAGGAAAATCGCTTGAACCTGGGAGTTGGAGTTTGCAGTGAGCCAAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAAGAGGCACCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAGTGCAATTGTTAGTTTAACTATAAAAATGTTGAGTGAGGCTGAGCCCCAACAGGAAATTGGTCCTAAACACAGTATCTCCTACTATCAGGTAGCCTTTTATTTTATTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCATCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGACTAAGTGGAATTACAGGTGTGCATCACCACTCCCAGCTAATGCTTTTGTATTTTTGGTAGAGACAGGGTCTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCGGCTTGGGTAGCCTTTTATATGAGGTATTTTCCAAGATACTTTCATATTTATTATCTCATTGATACACACAAATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACTCATGCATGCACGCACCCTGAGAGATGGATAGGTTCTGGTTAAGTGAATTTTCCAATAGACAGTACATGGCAGAGCTGAGGTTTAAAGTGTTTTGATCTAGCTTTGGTCTAACAAGGGGAAGATCTGCATACTCAGTGGTGAAAAAGCAAGCAGATATGAGTTGAAATGATGGATCAGCCATCATTAGTGAAGAAACTATTCGCATTAGACTCATGTCACTAAATTACTAGTGAAGTCGGTAGCTGGAATTCTATTCTTAGATTCTCTATTAAGTATTGAATTTCAGAATCCTGAAATGCAGCTACCCATTCTTATTTTTAAAACAAGAAAACAAGAGCATCAGGAAGTTAAGTAGCCGGCCAGTGGGATTAAAACTAGCTAATGCAGAGCCAGAAAAATATGCTCTGAGCTGGGCTCCTTTCCCTCCCCCACACCACTGCATGTCAGCATTTGCCATGTTAGGTAAATCCCTTAAGCTTTCTGCACCTTAAGAGCTCCTCCTTTAAAAGAAACATATCAATGCTCTTCTCTAAGAAATAGCTAAAATATGTATCATTCTAAAATGAAAGTTAAAATATAAATGCTCCCTTACAAATATTGGAACTTTGATGGGTTTAGACTATTTATTCATATTTATTTTTAGAAAATAATTTGGTTTTGTGTTTTCTTACAGGGTCACATGGGTGAAAGAGTGATAGGACATAAAGGAGAGCGGGTAATTTAAATACTATGTTTTATTAGCAGGCGAGATATTTTATGTCCCAGAGCATATCAGCCTATACCGTTTA
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Task1_train_5610
This is a variant in MFF-DT, COL4A3 (MFF divergent transcript| collagen type IV alpha 3 chain), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_5611
Located on Chromosome 2, this mutation impacts COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
CCACACTATATCTTTTATACATATATTTAAATATAGGCAGACCTGGGGTCCAAGGAATTACCAATATTTCAAATAAATAAATAAATGGACTGTAAACACCTTCCTTTTTCTAGGCTTCCTTATTTACTTCTCTGCCCAGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTTCCCTTCCAAGTTTAGAATGAACAGCATCAGCTCTAATTTAAGTTTGGCTGTTAATGTCCTTCCTTCCTTCTCTGACTTTCTCCAGTTTCCCATTCTGACTGGCTTCTGCTTTCCCTGGAAAGAGAGGGCCATTGTGTATTCTGTGGTTAATAGTTTTTCCTTCTAACACCTGGGTGAAGATCTTTACTCAGGCTTTTCATGCCTGAGGTCAAGAGGAGATGATCATATCACTTAAGATTTCCGTATTTGTAAAGTTAGCCATATTTATTACATTTCATGTTTTTGATTTGTTTTTGCTGTAGGGAAAACCCGGAAAAGATGGTGTTCCTGGCTTCCCTGGAAGTGAGGTATAGAGTTGATTTGGCCTATGGAGGTAGTAAAAATGTCAGTCCTACTAGCTGAAGAAGGATTTTTTAAAATCACTAAATAGTTATAAACAAACAAAAAGCTTACAGCTTTTAAAAACTGCATTTGGGAATCATAGTTTTACATCCCCACTGTGAAGAGAGATCATCTGAGCACATTCTTTTGTTTCAGAGGAGTTCAAATTGCACCTGCTCCCCCAGAAGAAGTTGGCTCCTGTGTCTTCTGACCCATTTCTTTTTGTTCTTTTCTTTAGGGAGTCAAGGGCAACAGGGGTTTCCCTGGGTTAATGGGTGAAGATGGCATTAAGGTAATCCTCTCCCTAATAGCCTATTTTAATAGGTTGGGTTTTGCCTGTGCTTTTACTTTTACCTCCAACCCTGGACCTAAGTACAAGGGATTACAATAACAGACTTCATTCAAATACCCTACTAGGTCTGTTAAGAAGAAAAGAGAGATGTGGCAACTTTACTTAAACATTTGAAGGGTGTTCTTGAGGAAAAGGTATTAAACTTGTACTGTGTACTTGAAGCTGTCTGACTTAGGACCAGTGAGAGTGCAGCTTCCCATGAGGAAGAGGTTGAAAAAATCCTACAATTGTAGGAAGTTTGTGGTTATTTGAGATCAAGCATAGGCTAGAGTTCATGAGTCTTAATCTGAGTCATGATACATTGAAAGGTCATGATCAATTAGTTGTGAACTGTATTCTGCCCTTCTGACAATATGTTACAAATATTTTCAAATCATGTGTAGTCATGTGTTGCTTCAAGATAGGGTTATGTCCTGAGAAATGCATCATTAGGTGATTCTGTCATTGTGTGAACATCATAGAGTGTACTCACACAAACCTAGATGGCAGAGACTGTTGCTCCTGGACTACAAACCTGCACAGCATGTTACTGTACTGAATAATGTAGGCAATTGTAACACAAAGGTGGGTATTTGTGTATCTAAACATAGAAAATATGTAGTAAAAATGTGATATTATAATTTTATGAGACCACTATCATATACACAGTCCATCACTGACCCAAACATTGTCATGTGGCACATGGCTATATATGTAGGTATATGTGCAGAGTCAAGATTTACCCTTTAATAGTATCACTTCCAGTAGAATTCTGAAATGACTTCTTGAAGGAAAGGGGGTTGGTTACAGCTGGGACACTTGGAAATGCATACACCCCACAGACTGATATTCCTGTGCCTCTGACCTGGGTGAGAACACAGGAACATGCAATGAACATGAACAAGCATTGCAGATGGTGTTGTGAAAGAAACCTGGAGAACCACCAGGGCAATAACTACTTCTGTACAACCTTGTAGATGGGATTCCTTACCCAGATACGCGCTCTCCAGGAAAATAATTTAAAGTCAGTGTCTCTTTAACTTTAATTTGGTTTGTACATGACATCTACATATCAATATATTGTTCATTTTAACTGTACATCTTGCTTTTTATATGTAAATACTTTGGGTGACCATATTCACAATTTGTAAATGTCTTTCACTGTAGGGACAGAAAGGGGACATTGGCCCTCCAGGATTTCGTGGTCCAGTAAGTGTGATTAAAGACAATATCAATGCTATGTTTGATCAAGTTCTTTAAAGTAGCAAGGAAATTTTGAATCAGTGTCTCTCATTAACTGTGTGAGAGAGATTATAACATTTACCTTGTTGTCAAACCAGGGCAGAAAATAGCTGGTCACTATGTGTCCCTTTGACCACGGGTAAATATTTCTATTTGGTCCCTGGAAGGCACTAGTGATGCCCATGATGGGCTATGGAAGAGAAGAAAAGCTTTGTCTAAGCAGCCCAGGCCCAAGGTGATCCTGCCCCTTCAGGGTAGAGGACAGTGAGACAACAAGGGATGAAGAAGTCAACTTCTCCTCCCTCCACCTGGGCCCGGGTTATGACAACGTGTTTAATACATGGTCAGCAAAAAGCAATCATTCCGGCCCAAGCTCTGTGTAGCAGGCAGTGCTCCCCTTCCCAGTGGACATGTATTTGATGTCAGCTCCTAACTGCAGAGCAGCCACATTTTATATTCTGTGACTCTGCAGCTGACGAAAAGGAGAAAGGGGACCCGGACTCTGAGTGCTGGTGTCCATTCATCTCCTACCTCAAAAAACAGTGGTTCTCACATTCAGTGCGCCAAGCAAGGCTGTCGTGAATGGTCATGCAGGTTAAACAAAACGGCACATGGTGGCAAAAGGGTCATGAGGGGAAGGGGTGTCCTGTTAAAAATGCAGTTCTCAGACCCCCATGCTCAGTAATGTAACTCAGGAATTGGAGTGGGGCCTGGAAATCTGCATCTTTACACTGGATGCATAGAGCCCCTGTCTTAGTCTGTTCTTTGCTGCTACAATAGAATACCTGAGACTGAGTAATTTGTAAAGAACAGAAATTTATTTTCACAGTTCTAGAGGCTGGGAAGTCCAAAATCAAGATGCTGACCCTTGGTCTGGTGAGGGCTTTTTTGGCTGCATCCTCACATGGCAGAAAGCAGAAGGGCAAGCTGACCTGAGGCTGCTCAAAGCCTCTTTTAATAGGGCCTTAATCCCATTAATGAGAGAGAAACACTCATGGCCTAATCACCTCCTACAGACCCTACCTCTTACTTCTATCACATTGATAACACCTGAATTTTGGAGGGAGCACATTCAAACTATAGCAGTTCCTAAATACTTTAGTGGAGTTGCCAGGAAGATTAAATAAGTATTTTGTGAAATCACTTAGCACTGTGCCCAACACTTGGTAGGTGCACGCATATCATTACAGATTTCATGGTGGACATTATTATGTTATATTATTAATATAATACTTTTGTGATTTTATATATATTGCTTAACCACAAGACTCTTGTTAAATAAGTCAACAAAGTAATTGATCCATCTAGCATATGAAAAAGCAAAGAGGTTTTTTTTTTTTCAAACCTTTGATATTTCCACCTTTTTTCCTTCAAGATAAATATACTGAATGCTAAATGAAATCTACCTTTTCATTACATTTCAGAGGAATTCTTAGCACTCTTCACTGTATATTTTCTTATATTCAATTCCATATAATTCTGTTTGCAGCTTCTACTAACCTCAAAAGAAGTTCCACTTAGGAAGGAAATGGTTAAGAACACCAGCAGTAGGTCCACTGAGCATGTCAGAAACAATATTCCTCGATTCTTGCAGGTCAAGGATTCCCTGGAATTTAAAGAAACAATAAATACAGTATTTTTTGATGTGTGGGTTCCATACACTTCCAAAATGGAAATAAGTTCAGTCCACCAGGACCAGCAATTTTGAAAAGTGAAGTAGAATAGAATAAAAAGTATCAGGGTTGATCATATGTTGTAATAATAAGTCATTATTTTGTGAAACTTTAATTTTTCTATACATATACACACATACATAGGTATGTATGAATGTGTACATATAAATGTGGGTGTGTAAACTGAGTCACATCATAAAATGTATTTCTAATTGAAAGCCCATAAAATATCTGATACTGTGATACCACAAAGGTCTACTTATTTAAATTTTTCCACCTACATTTACATGACTATCATATACCTGCTAAC
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Task1_train_5612
A genetic alteration is present in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Autosomal recessive Alport syndrome
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Task1_train_5613
Given this context: Chromosome 2, gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; not provided
GATACCTACATTACACTTTTTCTGTAAAGTTCTAAACTTTCGTCTCTGACTCATTAGAGTGTTTACCTTTTGAGAGAGGAAAAAGAGTTGGATCAGGGATGGTCCACAGGGACTCATCAAGTATAACTGTAGTGTGTTCTTTTTAACGAAAACAAAACTAAGAAAAAAGAGCAAAATTTGATAAACTACTGGGCATGTGCCCTGCCACTGATCATATTTTTCTCTATATGATGTTGTATATTATACTACTTCATAATTTTGAAAATTAATCAAAATAAAGCAGACTGCAGAACTATAAGTATACTATAATTTCACTATTAAAAAAATAGATACAGAAATGGATAAATATTATATGTACCTGAATATGCATGGAAAGATATACCTCAAACTGTTAATAGTAGATATCTCTTACAGTTAGAATGGGGCAAAAAGATATTTTAGAGCTCTGACATTAAGGAAGACCTCCTTCCCCCTGCCAGGCCCCTAAGTAAAAAAAACAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAAACAGGCTCCTTTAATAAGCCGATGAGAGGAAAACTACAAAGCTCTAATTCCAGAAGAATTTTAGGATAGTTTTTTCTGTTTCTGTGAAAAATGGCATTGGTATCTTGATAGGAATTGCACTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGGTCATTTTAACTAGATTAGTTCTTCTGATCCATGAGCATGGGATGTCTTTCCATTTGTTTGTGTGCTCTTCAATTTCTTTCACCAGTGTTTTATAGTTTTTCTTGCAGGGATCTTTCACCTTGTTGGTTAAATGTATTCCTAGGTATTTTATTGTGTGTGTGTGGCTACCGCAAATGGGATTGCCTTCTTGATTTCTTTTTTGGCTATTCCATTATTGGTGCATAAAAAATGCTACTGATTTTTGTATGTTGATTTCATGTCCTGCAATTTTACTGAATTTGTTTATCGGCTCTAAGAGTTTTTTTGATGGAGTTAGGGGTGAAGAGAGATTGGTTAATGGGTACAAGCATACAGCTAGATAGAAGGAATAAATTCTAATGTTTGATAGCACAGTAGGGTGACTATAGTTAACAACAATGTATTGTATATTTCAAATTAACTGGAAGAGAGGACATGAAATGTACTCAACACAGAAATGATAAATACTTGGGTCAAAGATACTCAAAAATACCCTGACATGATCATTACACTACACATTTGATACATGTAACAAAATCTTACATGTATCCCATAAATTAGTACAAATCTAATATGCCAAAGTAAAATATGATTAAAAAAATACAAAACTCTGAAATGGATGTCAATCAGAAGATTTTATCTTTGTGTTCAAATAATAGGACATAATCAGATATTACCCCGGCTGGTTTCTCAGTCCTTTGCTGGTGGCATCTCTCTTCTTAATAGTTAAACTGTTTGTGGGACAGAGATTTGAGACTGTCCCCTCCTCACATCCTCACCACTTTAAGATTAGGGTGGGGTTCGTGCCACCAGGCACGGCTCCTTTCCCAGGAGATGACTATCCCCCATCACAGCCTTTTATGTCTAAGACACTGGCAGGAATAAAGTCCACTTAACAACTTTCTCTCTTTCTCATTTTGCGCACTGGGGGCATCCTCTAGTCTCTAATAAAAAAAATCTACAAAGTAGCATATATGGAAGTATTCCTCACTTCCTTTTAAATAAAAAGACTATAGTGCATCCCAAACTCTGTTTCAGTTTCTTGTAATAAATTTTCTTGTGGGAATGGAATGTTCTGCACTTCACTGTACTGTGGTTATTTAACAAGGCCACAGATGAAAAAAGCAAGGATATTCACTTTTTTATTTTATATGTGTTATGTACCTCTCCATTGTGCAATTTTTATAAATAAAATTAAATCACTCTTGCAATTAAAAAATAAATTCGTATTAATCAGGAAAAAATGTAAAATACAAGAAATGATTATTTTCTCCAAGGATCATCAAGGCCTGGCCTCAGAGGAGCCCCTGGATGGCCAGGCCTGAAAGGAAGTAAAGGGGAACGAGGCCGCCCAGGAAAGGATGCCATGGGGACTCCTGGGTCCCCAGGTTGTGCTGGTTCACCAGGTCTTCCAGGATCACCGGGACCTCCAGGACCGCCAGGTAAAGATGTGGAAGGGGACCCCTTTTGTGCACAGTGCCAAATGACAGATGTGTGCAAACCACGGGCAACAAACCCTCCTCACAGCTTAGCCATCAGTCTGTGTGGTTTTTATGAGTTACCTTTCCAATGGTCTTCATTTCACTAACTGTCTGTGAAAGAAACTGATGCAATGACTAGTTAACAAATGCAGCAAAGTCTTAGCCCGAGTTTCCCAGAGAGCAGAGTAGGAGGCAGGGACAAAGAGAGTGATGTGGGGAAGGATGGGTGGCTATCAAGTTGGCCTTGACCAATTGCAACTGCCTGTTCAGCCCTGGAGACTATCTGTGCCAGGGGAGAAAGAGGCAAGAATTTATCCATTTGCTCCTAGTTCCCATGGGTCAAAGATTTCCCCCCAAGAGAGGAGCCGCCCCCCACCTCCCATCCTCCCACTTCCAGGCTGTGTCTGCATGGTTCCCAGGAAGTCCCATGCCTTGGCATCAGCAGGGAAGCCCCAGGACAGTAGGCCAGAGGTGTGCCGCATGGGTGTAAGGCAACATGCTATGAGGTAAAGGGGTCAGAGATGACAGAGATGTGGCCCAATGGACTTGAAGTGGTGCTCAGAGGTCCTGACACAGGGAGCCTTTCCTTCGCATCCCTCTAGAGAGCCACTTAGCATTCTGTGTTGGCTCATAGGTACAATAGGTCCTCACAAACATATAGATCACACTTTATATTTTAACATACCTTTTCTGGGGCCAGGTGTGGTGGTGTGCCTATAATCCCAGCTTCTTCCAAGTCTCTTTTAAGATGGAGGTTTAGTATCCTCTTTTTTTCTATGTCAAGGCTGACATACAGAGTTCACAGGGCTAATGAAGCTAAAGCTGGGATCTGGGCCCAGGTGCTTGCGGCTCTCTCCCGAAGGTGTCATGCTCCCTCTGTGCCTGCTACACTCTGTCCAGGGGTCTTTGCTTCCTACTTTCCCTTCGCTAAGCAACACCCATCTGTCCTTCAGACTTCAGCTTCAAGTTCAAGTCCAGCAGAAAGCTTTCAGTGAGTCCACATCCTGTAACCTCCAAGGTTATCCCAACTGTAGAAGTTTTCACATTGCCTTCTCTTTGTCTTTGTCAGTTTTTCTTACAAGAATCAAAGTATTTTGAGGTCAAAGACTGTGTCTTTTTGGCTGTTTAAGCCCAGTATGTAGCATGGGGAACACTGCAGGTACTCAGATATTTTTTGAATTAAGCATTAATTGAGTATGAAAATGTATAAGTATACAAAAATGTATGAATGTAGAAGTATTCATATAAGTCTACACTAAGTATTAAACTTTTATCAGATTGTACTATTTAAAGATGACCTTCCAGGTATTTTAAAGATGCAGAAAACTGATCACAAGATGGTCATTCTGTGTTCCAACAAAATTAAATGGTTCCAGTGGTACCTTGTTTTTCTGAAATTTGGGACAGCTATGGTAGTGTTTTTAAATATTTACTTTCATCACCATTGCCTTCAACCTGTAATTGAAATGGCAAAGCCAAAAATTAGATTACTGAACACAATTAACCAGTTTAAGAGAAGGAGCTGTTCATTGCAACATTACAGTAGCAGATAATGTGGAAGCTGAGAAGAGCTTTCTTAGAGACCTGCTTTAAGGATGACAACTCAATTGATGTGGACAAGCAACAAAGAGAAAACAGATGATACCCTGAGTCAGAATCCATTTTTCTTTTACTCAATATATATTAAGCATCTACAGTATATCAGGAAAATACAATGTATCCAAAAATATCCAGAATAAGAGTTGATCCTTTGCCTCAAGATGCTAAAGGGATTGTCTGTGTATTAGTCCATTCTCATGCTGCTAATAAAGGCATATCCGAGACTGGGTAATTTAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCACGGCTGGGGAGTCCTCAGTAAACTTACACTCGTGGCAGAAGCAGAAGCAAACATGTCC
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Task1_train_5614
Gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Alport syndrome
GTGAGCAGCTCACTGATGCTGACCACTTATTGCATTGTTGCATTTTCCATAGTTTCTCTACATTTGGCCTATCCAGGTGCAGCTCAAAGAAGATATGTAAGCAGTAAAATGGTTTGGATCACTATAAAAAGATACACCCCAGCTCAAGATCTTGCAAAAAATAGAATCTGAATAAATATGTGTTGATTAACTGACCAGAGACCCACCCAGAAGGTCATTTAAAGGGATCATCTTGATAGAGATATTTAAATACCTATGGGAAGTATAAAATTGTACAATAAAATGCAATTTGGCAAGAGACATTCAAAACCTTAGAAAAGTTTGAGACTATTTGGCTCTGCTATTACACTTTTAAAAATTTATTATAAAGGAAATAATTGGATAAATTTGGAGAGCTAAATACCCAGAGACATTTTTCAAAGCATTGTTCACAACAGCTAAAAGTTGAAAAATGTCTACCTAATGTCTAAATGTCTAAAAACAGCATTTAGCTAAATAAATGATGGCTCGCCAACACAATAGGCAGCATGCAGCCATTTAAAATGAAGCTATAAATTCATACTTATTGACATATGTATACTATAAATCCAAAATAGTGTGTCTACGAGTCCTATGCACTTATGGATATAAAAAATGTATCATTAATTTACATTAAACTTTGGCAAATATTATCTTCTGGTAGATTTATAGGTGATTTTTAGTCTCTTCTTTCTGCATAATTTTCTTATAATGAGCATATATTACTTTTAAAAGTAATATATACTCAGAAAAAATAAAGATATATTCTTAAAATTATGAAGATAAAATTTTAAGAAGCTAAGATCTGAGTTACTTTTTACATGATCTCTTGTTCTGTTATTTACTCCCATTCTCTTATTGCATTTATGTTTTATGATAGAAGTTGTCTTTCTTTCCCCACAAGGAAACACTCTATTTTCTTCATACATTGTATTACCCTGTCTACTTAGAGTTGGCGTTCAATGAGGAGTTAGTTAATAATTCGTTGATTTGCAGGAAGACAAGGCGCAGCTGGCTTGAAAGGAAGCCCAGGGTCCCCAGGAAATACAGGTCTTCCAGGATTTCCAGTAAGATTTCATGTTTTTAAATCTTTAGCTTCAATTTGACAAATTGCACACTCTAGAAATATGGTTGCAACACACTTACCAGTTTGGTGCCTTGCAAACAGTAGGCACTTAATAGATACCTGTTGATTAAATGAATAAATCTGTGACTGATTAAGTGAATGAGTCAATGAATTTATAAACAGTTTGAAATGGTATCAGAAACAGAAAGCAGATTAGTGGTTGCCTAGGGCTGAGAGTGGGAACAGAGGTTCATTGCAAATAGGTTTGAGGGAATTTGGGAGAGTGATGGAGATGTTTGAACGTGATTGTGGTGATTGTGGCATAATTCTATAAATTTACTAAAAATCATTGAATTGTACTCTTATAAAGGAGAAATTTTATGGTATGTAAATTATACCTCAATAAGTCCGTTAAAAATTAGAATCTTGACTGTCATAGTGAATCAAAAAGTTATAGATAAATATACTTAGATCAAACTATTCAAAGAGGCTTGTTAAAATTTACCAATATTCAAACATAACCTGTATTATGGTGATTGTTCTATGGTATTAAATTATATTATTGTCTGTATTGCTTTGAATTATACTATCTAACTGAATTATTTTTCAGTTTTGGAAGTTAACAACAAAGCAAAACAAACAAAATGCTTGTAATAATAGTTGTGGACCAAAGAGTGTGTTGAAAAAATTCATGTTAAAATTGAAAAGTTCTTGTCCACACTGTTTTTAAGATTGACAGAAGAAGAATTCTAACAAAATACAATACAGATTCATTTGTGTACTACCCTAGGGTTTCCCAGGTGCCCAGGGTGACCCAGGACTTAAAGGAGAAAAAGGTGAAACACTTCAGCCTGAGGGGCAAGTGGGTGTCCCAGGTGACCCGGGGCTCAGAGGCCAACCTGGGAGAAAGGGCTTGGATGGAATTCCTGGAACTCCGGGAGTGAAAGGATTACCAGGACCTAAAGGCGAACTGGTTGGTATTTAGCAACTTTACCCTCCCTATAAATGAAGTACTCTGAAGTTAAGAGATAAAGTGATTTCTTTTCCAAAAATGGTTGGCCGCTCAGCACAGTTCATCACTCTAACTGCAGAATGAAACATCTTCAAATTAGCAGGAATAACCCAAGCAAATAGTTATAGTATTTTGACAGAATAAATAGGTAGCATTCAGTGATTTCAACCAATCAAAATTCTACATTGATAATGACCCCATCTCATACACAAATTACAGTTCCATATTTGTATCAAATGAGTCTATGGAAAAGTTCAGAAAATGATGTATAGTAGAAAGTTTAGTAAATATTTTGGGGCGATGTCCATATTTTTAAATAAAAATAAATGCATAAGAAGACAGCATATTTAGGGGTATGGTAGTCAAATAAAGAGATTAAATGTTTTGTCATTCATTTAATTTTATGGAAATTTAATCCCTTTTCATGAGAGAGTTTCTCACATATTTAATTGAGGTAATACCTACCAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCTACTGCACCCAGACCTAAGATTTATTTTAAAATGTCACAGAGTGAGAGGGTGAGCACCTGTCATCATAATGTATTTACAAGAGGTTTGCAAGGGATGCTGCCCAAACTATTCTATGAAATACCAGTTTCTCCCAGGGCTAATCTGTGTTAGCCAATAAAACAGATCTTACCTCAAAGAGGTTTGGAGAAACTTGGTAAACAAATTTAAAGATTCATTTACAGACCCTTTAATATCAGAATATGAACTGTGAGTCTTCCACATGAAGATAAGCTATCTGGTCTTTCCTAAATGCTTCTGACTACAAAACCCTTTTTGGCTGGCAGCATCTATGGTGCCAGCAGTTCTCAGACCCTGCCTTGGCCAAGTCCCAGGTTGTTCACTTTGTGGTAGTTATGCTTATAAAGTGACAGTGCCAGAATTCTGATGGTCTAATATTAAGAGAATTTGTATGATGTCCCTACTTGCATCTCACTGATTTTTCTTTATAAGTTCTGGTAAAGATGCTCCATAAAGTAAATGAGAGAAAAATCAAGGTGGTGATTTGTTGAGTCTTACACCCTGTCATTAAAAAAGGAGACAGACCACTTAGCCATCTGATGATATTGAACAATGAAAAATTGAGTCAAATTTATTTCAGAGGGCCATGTTGGGAAGGAAGAGGGCTTAAATTATTTTGTCAAATTCAATTTCTTTTAAATCTACAAATCATTTTCAAGGTTATAGCATATGAAGATTTAAAAACTAGACAGTTTATGAGAGAAAATGGAAGTGGGAAATCCCCTTTGTCATGAAAATACCTGGTGAAACCAGAAATAAAGGTTTGCTGTGCTCATTTTATTTCAGAAATGTAACATTATCATGAATATCACCACTAAAGTCATTTGAACTATTGGTCAATTTGAACATAGTTTTAGTGGCTATTACCATATGGGAGACCCATCATTGTAAGATATCTCAAGTGGGACTCAAGACAGTTCCAAGTTCAAAAAATGTTGCTAAACTCCAAAGGACACAAAACGGAAGAAACCTGCAGTGCTCTTACTTTAGTAATAATTCTCATCAAATGCCAAATGCTTTTAATTCAAGATCTCAATGACAGCCTAACTGGTATTCATATTTGGAGGATGATTAACCTGTTGTAAGAATATACTGGAATGAAGCACGATTCAAACACATTCCTGTTGTCACAGGCTCTGAGTGGTGAGAAAGGGGACCAAGGTCCTCCAGGGGATC
GTGAGCAGCTCACTGATGCTGACCACTTATTGCATTGTTGCATTTTCCATAGTTTCTCTACATTTGGCCTATCCAGGTGCAGCTCAAAGAAGATATGTAAGCAGTAAAATGGTTTGGATCACTATAAAAAGATACACCCCAGCTCAAGATCTTGCAAAAAATAGAATCTGAATAAATATGTGTTGATTAACTGACCAGAGACCCACCCAGAAGGTCATTTAAAGGGATCATCTTGATAGAGATATTTAAATACCTATGGGAAGTATAAAATTGTACAATAAAATGCAATTTGGCAAGAGACATTCAAAACCTTAGAAAAGTTTGAGACTATTTGGCTCTGCTATTACACTTTTAAAAATTTATTATAAAGGAAATAATTGGATAAATTTGGAGAGCTAAATACCCAGAGACATTTTTCAAAGCATTGTTCACAACAGCTAAAAGTTGAAAAATGTCTACCTAATGTCTAAATGTCTAAAAACAGCATTTAGCTAAATAAATGATGGCTCGCCAACACAATAGGCAGCATGCAGCCATTTAAAATGAAGCTATAAATTCATACTTATTGACATATGTATACTATAAATCCAAAATAGTGTGTCTACGAGTCCTATGCACTTATGGATATAAAAAATGTATCATTAATTTACATTAAACTTTGGCAAATATTATCTTCTGGTAGATTTATAGGTGATTTTTAGTCTCTTCTTTCTGCATAATTTTCTTATAATGAGCATATATTACTTTTAAAAGTAATATATACTCAGAAAAAATAAAGATATATTCTTAAAATTATGAAGATAAAATTTTAAGAAGCTAAGATCTGAGTTACTTTTTACATGATCTCTTGTTCTGTTATTTACTCCCATTCTCTTATTGCATTTATGTTTTATGATAGAAGTTGTCTTTCTTTCCCCACAAGGAAACACTCTATTTTCTTCATACATTGTATTACCCTGTCTACTTAGAGTTGGCGTTCAATGAGGAGTTAGTTAATAATTCGTTGATTTGCAGGAAGACAAGGCGCAGCTGGCTTGAAAGGAAGCCCAGGGTCCCCAGGAAATACAGGTCTTCCAGGATTTCCAGTAAGATTTCATGTTTTTAAATCTTTAGCTTCAATTTGACAAATTGCACACTCTAGAAATATGGTTGCAACACACTTACCAGTTTGGTGCCTTGCAAACAGTAGGCACTTAATAGATACCTGTTGATTAAATGAATAAATCTGTGACTGATTAAGTGAATGAGTCAATGAATTTATAAACAGTTTGAAATGGTATCAGAAACAGAAAGCAGATTAGTGGTTGCCTAGGGCTGAGAGTGGGAACAGAGGTTCATTGCAAATAGGTTTGAGGGAATTTGGGAGAGTGATGGAGATGTTTGAACGTGATTGTGGTGATTGTGGCATAATTCTATAAATTTACTAAAAATCATTGAATTGTACTCTTATAAAGGAGAAATTTTATGGTATGTAAATTATACCTCAATAAGTCCGTTAAAAATTAGAATCTTGACTGTCATAGTGAATCAAAAAGTTATAGATAAATATACTTAGATCAAACTATTCAAAGAGGCTTGTTAAAATTTACCAATATTCAAACATAACCTGTATTATGGTGATTGTTCTATGGTATTAAATTATATTATTGTCTGTATTGCTTTGAATTATACTATCTAACTGAATTATTTTTCAGTTTTGGAAGTTAACAACAAAGCAAAACAAACAAAATGCTTGTAATAATAGTTGTGGACCAAAGAGTGTGTTGAAAAAATTCATGTTAAAATTGAAAAGTTCTTGTCCACACTGTTTTTAAGATTGACAGAAGAAGAATTCTAACAAAATACAATACAGATTCATTTGTGTACTACCCTAGGGTTTCCCAGGTGCCCAGGGTGACCCAGGACTTAAAGGAGAAAAAGGTGAAACACTTCAGCCTGAGGGGCAAGTGGGTGTCCCAGGTGACCCGGGGCTCAGAGGCCAACCTGGGAGAAAGGGCTTGGATGGAATTCCTGGAACTCCGGGAGTGAAAGGATTACCAGGACCTAAATGCGAACTGGTTGGTATTTAGCAACTTTACCCTCCCTATAAATGAAGTACTCTGAAGTTAAGAGATAAAGTGATTTCTTTTCCAAAAATGGTTGGCCGCTCAGCACAGTTCATCACTCTAACTGCAGAATGAAACATCTTCAAATTAGCAGGAATAACCCAAGCAAATAGTTATAGTATTTTGACAGAATAAATAGGTAGCATTCAGTGATTTCAACCAATCAAAATTCTACATTGATAATGACCCCATCTCATACACAAATTACAGTTCCATATTTGTATCAAATGAGTCTATGGAAAAGTTCAGAAAATGATGTATAGTAGAAAGTTTAGTAAATATTTTGGGGCGATGTCCATATTTTTAAATAAAAATAAATGCATAAGAAGACAGCATATTTAGGGGTATGGTAGTCAAATAAAGAGATTAAATGTTTTGTCATTCATTTAATTTTATGGAAATTTAATCCCTTTTCATGAGAGAGTTTCTCACATATTTAATTGAGGTAATACCTACCAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCTACTGCACCCAGACCTAAGATTTATTTTAAAATGTCACAGAGTGAGAGGGTGAGCACCTGTCATCATAATGTATTTACAAGAGGTTTGCAAGGGATGCTGCCCAAACTATTCTATGAAATACCAGTTTCTCCCAGGGCTAATCTGTGTTAGCCAATAAAACAGATCTTACCTCAAAGAGGTTTGGAGAAACTTGGTAAACAAATTTAAAGATTCATTTACAGACCCTTTAATATCAGAATATGAACTGTGAGTCTTCCACATGAAGATAAGCTATCTGGTCTTTCCTAAATGCTTCTGACTACAAAACCCTTTTTGGCTGGCAGCATCTATGGTGCCAGCAGTTCTCAGACCCTGCCTTGGCCAAGTCCCAGGTTGTTCACTTTGTGGTAGTTATGCTTATAAAGTGACAGTGCCAGAATTCTGATGGTCTAATATTAAGAGAATTTGTATGATGTCCCTACTTGCATCTCACTGATTTTTCTTTATAAGTTCTGGTAAAGATGCTCCATAAAGTAAATGAGAGAAAAATCAAGGTGGTGATTTGTTGAGTCTTACACCCTGTCATTAAAAAAGGAGACAGACCACTTAGCCATCTGATGATATTGAACAATGAAAAATTGAGTCAAATTTATTTCAGAGGGCCATGTTGGGAAGGAAGAGGGCTTAAATTATTTTGTCAAATTCAATTTCTTTTAAATCTACAAATCATTTTCAAGGTTATAGCATATGAAGATTTAAAAACTAGACAGTTTATGAGAGAAAATGGAAGTGGGAAATCCCCTTTGTCATGAAAATACCTGGTGAAACCAGAAATAAAGGTTTGCTGTGCTCATTTTATTTCAGAAATGTAACATTATCATGAATATCACCACTAAAGTCATTTGAACTATTGGTCAATTTGAACATAGTTTTAGTGGCTATTACCATATGGGAGACCCATCATTGTAAGATATCTCAAGTGGGACTCAAGACAGTTCCAAGTTCAAAAAATGTTGCTAAACTCCAAAGGACACAAAACGGAAGAAACCTGCAGTGCTCTTACTTTAGTAATAATTCTCATCAAATGCCAAATGCTTTTAATTCAAGATCTCAATGACAGCCTAACTGGTATTCATATTTGGAGGATGATTAACCTGTTGTAAGAATATACTGGAATGAAGCACGATTCAAACACATTCCTGTTGTCACAGGCTCTGAGTGGTGAGAAAGGGGACCAAGGTCCTCCAGGGGATC
Task1_train_5615
This sequence change occurs on Chromosome 2, altering COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Hematuria
GCAACTTTACCCTCCCTATAAATGAAGTACTCTGAAGTTAAGAGATAAAGTGATTTCTTTTCCAAAAATGGTTGGCCGCTCAGCACAGTTCATCACTCTAACTGCAGAATGAAACATCTTCAAATTAGCAGGAATAACCCAAGCAAATAGTTATAGTATTTTGACAGAATAAATAGGTAGCATTCAGTGATTTCAACCAATCAAAATTCTACATTGATAATGACCCCATCTCATACACAAATTACAGTTCCATATTTGTATCAAATGAGTCTATGGAAAAGTTCAGAAAATGATGTATAGTAGAAAGTTTAGTAAATATTTTGGGGCGATGTCCATATTTTTAAATAAAAATAAATGCATAAGAAGACAGCATATTTAGGGGTATGGTAGTCAAATAAAGAGATTAAATGTTTTGTCATTCATTTAATTTTATGGAAATTTAATCCCTTTTCATGAGAGAGTTTCTCACATATTTAATTGAGGTAATACCTACCAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCTACTGCACCCAGACCTAAGATTTATTTTAAAATGTCACAGAGTGAGAGGGTGAGCACCTGTCATCATAATGTATTTACAAGAGGTTTGCAAGGGATGCTGCCCAAACTATTCTATGAAATACCAGTTTCTCCCAGGGCTAATCTGTGTTAGCCAATAAAACAGATCTTACCTCAAAGAGGTTTGGAGAAACTTGGTAAACAAATTTAAAGATTCATTTACAGACCCTTTAATATCAGAATATGAACTGTGAGTCTTCCACATGAAGATAAGCTATCTGGTCTTTCCTAAATGCTTCTGACTACAAAACCCTTTTTGGCTGGCAGCATCTATGGTGCCAGCAGTTCTCAGACCCTGCCTTGGCCAAGTCCCAGGTTGTTCACTTTGTGGTAGTTATGCTTATAAAGTGACAGTGCCAGAATTCTGATGGTCTAATATTAAGAGAATTTGTATGATGTCCCTACTTGCATCTCACTGATTTTTCTTTATAAGTTCTGGTAAAGATGCTCCATAAAGTAAATGAGAGAAAAATCAAGGTGGTGATTTGTTGAGTCTTACACCCTGTCATTAAAAAAGGAGACAGACCACTTAGCCATCTGATGATATTGAACAATGAAAAATTGAGTCAAATTTATTTCAGAGGGCCATGTTGGGAAGGAAGAGGGCTTAAATTATTTTGTCAAATTCAATTTCTTTTAAATCTACAAATCATTTTCAAGGTTATAGCATATGAAGATTTAAAAACTAGACAGTTTATGAGAGAAAATGGAAGTGGGAAATCCCCTTTGTCATGAAAATACCTGGTGAAACCAGAAATAAAGGTTTGCTGTGCTCATTTTATTTCAGAAATGTAACATTATCATGAATATCACCACTAAAGTCATTTGAACTATTGGTCAATTTGAACATAGTTTTAGTGGCTATTACCATATGGGAGACCCATCATTGTAAGATATCTCAAGTGGGACTCAAGACAGTTCCAAGTTCAAAAAATGTTGCTAAACTCCAAAGGACACAAAACGGAAGAAACCTGCAGTGCTCTTACTTTAGTAATAATTCTCATCAAATGCCAAATGCTTTTAATTCAAGATCTCAATGACAGCCTAACTGGTATTCATATTTGGAGGATGATTAACCTGTTGTAAGAATATACTGGAATGAAGCACGATTCAAACACATTCCTGTTGTCACAGGCTCTGAGTGGTGAGAAAGGGGACCAAGGTCCTCCAGGGGATCCTGGCTCCCCTGGGTCCCCAGGACCTGCAGGACCAGCTGGACCACCTGGCTACGGACCCCAAGGAGAACCTGGTCTCCAGGGCACGCAAGGAGTTCCTGGAGCCCCCGGACCACCCGGAGAAGCCGGTTGGTTAGTTTTCTTTCCAGTCCTGTTTTCCGATGGAGTGGGTTGATGGTTTCTAGAGCTAACGAAGCTTCTCCAAGACTAAGGAAAATATAGAAACTTGCTTCTAACGAATAGAATATGTCAACTCACAGATACCAGGAAAGAATATGTAGGGTATGTTAGAGAAAACTCATTTTTTCTCCATTACTGGGCAATTCAACTGAAATTTCCTAGAATATTCTATATCTATTACATACATACATATATATATATGAAATGAATAGATCCTAAGCGTTATTGCAAATTTGTTTTTTGTGGTTTTCTAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATAATTATAGTTTACTGCATCCTCAAACTTCTGGGCTTAATAGATCCTCCTGCCTGGTCTCCTGAGTAGCTGGGGCTACAGGCACGTGTCACCACGACCAGCTAATATATATTTTATTTTTATTTTTTGTAGAGACAGGATGTTGCTGTGTTGTCCAGGCTGGTCTCCTACTCCCAACCCCAAACAATCCTTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCGCAGCCACAAATTTGTTGATTTTGATCCATAACTCCATAGGCAGGTTACAAATAAAACTTTAAAATATCTAAGACAAATGAAGGAAAATGGTCTGATAATAGTTTAAAAGTCCAGGTAACTTTTGGGATATACATATACTGGCCGTAGTTCTGGATTCAGGAGTGTGGCTGAAGGTCAGAATAGCATGCTACTGATAGTTTTGAGCAAATAATGCCAACATGGTCATGTTTTACTTCTAAAATCACCTTAGGCTGGGCACAGTGACTCACACCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCGGGTCAACATAGCGAACCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCACATACCCACAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGATTGAGATACTGTCTCAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTAAAAATCACTTTAAAGGGTAAGACCCAGTAAACCTCTAAATCATTTTGTAGTGTCTTCCCTCATCAGTAAAACTTTTTGAGTGCACAACCTTACATTATATGTTATAAATGTATGCATCATTTCTGTCCACACATGTATGTAAATCTTATTTTATGACTTTCTCTATATATTAAATAAACAAATAAATATTTATGTTTATCTGCACCTTACTTTGGAGCTGCTTTTTTTTTTTTTGTCTGAGATGGAATCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAATTCAAGTTACTCTCCTGTCTCATCCTCCCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCACCTGCCACCATGCCAGGCGAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCGAAGGAGGCTGCTGTTCTAATCCAGGTACTAGCAAACGGTGGTGGACCACAGTCCAAGACCAGCCCACTGCCTGATTTTGTATGATCCTCAAGCTAAGAATGGTTTTCACATTTTCAAATGATTGAAAAAAATGTTTAATGATATTTTGTGATGCATGAAAATTACATGAAATTCAAATTAGAGTATCCATAAATAAAGTTTCTTGGAACACAGCTGCACTCCTGTATGTACTGTCTCTGGCTGCTTTTATGCTACAATGG
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Task1_train_5616
This is a variant in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; not provided
GGTTGGCCGCTCAGCACAGTTCATCACTCTAACTGCAGAATGAAACATCTTCAAATTAGCAGGAATAACCCAAGCAAATAGTTATAGTATTTTGACAGAATAAATAGGTAGCATTCAGTGATTTCAACCAATCAAAATTCTACATTGATAATGACCCCATCTCATACACAAATTACAGTTCCATATTTGTATCAAATGAGTCTATGGAAAAGTTCAGAAAATGATGTATAGTAGAAAGTTTAGTAAATATTTTGGGGCGATGTCCATATTTTTAAATAAAAATAAATGCATAAGAAGACAGCATATTTAGGGGTATGGTAGTCAAATAAAGAGATTAAATGTTTTGTCATTCATTTAATTTTATGGAAATTTAATCCCTTTTCATGAGAGAGTTTCTCACATATTTAATTGAGGTAATACCTACCAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCTACTGCACCCAGACCTAAGATTTATTTTAAAATGTCACAGAGTGAGAGGGTGAGCACCTGTCATCATAATGTATTTACAAGAGGTTTGCAAGGGATGCTGCCCAAACTATTCTATGAAATACCAGTTTCTCCCAGGGCTAATCTGTGTTAGCCAATAAAACAGATCTTACCTCAAAGAGGTTTGGAGAAACTTGGTAAACAAATTTAAAGATTCATTTACAGACCCTTTAATATCAGAATATGAACTGTGAGTCTTCCACATGAAGATAAGCTATCTGGTCTTTCCTAAATGCTTCTGACTACAAAACCCTTTTTGGCTGGCAGCATCTATGGTGCCAGCAGTTCTCAGACCCTGCCTTGGCCAAGTCCCAGGTTGTTCACTTTGTGGTAGTTATGCTTATAAAGTGACAGTGCCAGAATTCTGATGGTCTAATATTAAGAGAATTTGTATGATGTCCCTACTTGCATCTCACTGATTTTTCTTTATAAGTTCTGGTAAAGATGCTCCATAAAGTAAATGAGAGAAAAATCAAGGTGGTGATTTGTTGAGTCTTACACCCTGTCATTAAAAAAGGAGACAGACCACTTAGCCATCTGATGATATTGAACAATGAAAAATTGAGTCAAATTTATTTCAGAGGGCCATGTTGGGAAGGAAGAGGGCTTAAATTATTTTGTCAAATTCAATTTCTTTTAAATCTACAAATCATTTTCAAGGTTATAGCATATGAAGATTTAAAAACTAGACAGTTTATGAGAGAAAATGGAAGTGGGAAATCCCCTTTGTCATGAAAATACCTGGTGAAACCAGAAATAAAGGTTTGCTGTGCTCATTTTATTTCAGAAATGTAACATTATCATGAATATCACCACTAAAGTCATTTGAACTATTGGTCAATTTGAACATAGTTTTAGTGGCTATTACCATATGGGAGACCCATCATTGTAAGATATCTCAAGTGGGACTCAAGACAGTTCCAAGTTCAAAAAATGTTGCTAAACTCCAAAGGACACAAAACGGAAGAAACCTGCAGTGCTCTTACTTTAGTAATAATTCTCATCAAATGCCAAATGCTTTTAATTCAAGATCTCAATGACAGCCTAACTGGTATTCATATTTGGAGGATGATTAACCTGTTGTAAGAATATACTGGAATGAAGCACGATTCAAACACATTCCTGTTGTCACAGGCTCTGAGTGGTGAGAAAGGGGACCAAGGTCCTCCAGGGGATCCTGGCTCCCCTGGGTCCCCAGGACCTGCAGGACCAGCTGGACCACCTGGCTACGGACCCCAAGGAGAACCTGGTCTCCAGGGCACGCAAGGAGTTCCTGGAGCCCCCGGACCACCCGGAGAAGCCGGTTGGTTAGTTTTCTTTCCAGTCCTGTTTTCCGATGGAGTGGGTTGATGGTTTCTAGAGCTAACGAAGCTTCTCCAAGACTAAGGAAAATATAGAAACTTGCTTCTAACGAATAGAATATGTCAACTCACAGATACCAGGAAAGAATATGTAGGGTATGTTAGAGAAAACTCATTTTTTCTCCATTACTGGGCAATTCAACTGAAATTTCCTAGAATATTCTATATCTATTACATACATACATATATATATATGAAATGAATAGATCCTAAGCGTTATTGCAAATTTGTTTTTTGTGGTTTTCTAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATAATTATAGTTTACTGCATCCTCAAACTTCTGGGCTTAATAGATCCTCCTGCCTGGTCTCCTGAGTAGCTGGGGCTACAGGCACGTGTCACCACGACCAGCTAATATATATTTTATTTTTATTTTTTGTAGAGACAGGATGTTGCTGTGTTGTCCAGGCTGGTCTCCTACTCCCAACCCCAAACAATCCTTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCGCAGCCACAAATTTGTTGATTTTGATCCATAACTCCATAGGCAGGTTACAAATAAAACTTTAAAATATCTAAGACAAATGAAGGAAAATGGTCTGATAATAGTTTAAAAGTCCAGGTAACTTTTGGGATATACATATACTGGCCGTAGTTCTGGATTCAGGAGTGTGGCTGAAGGTCAGAATAGCATGCTACTGATAGTTTTGAGCAAATAATGCCAACATGGTCATGTTTTACTTCTAAAATCACCTTAGGCTGGGCACAGTGACTCACACCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCGGGTCAACATAGCGAACCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCACATACCCACAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGATTGAGATACTGTCTCAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTAAAAATCACTTTAAAGGGTAAGACCCAGTAAACCTCTAAATCATTTTGTAGTGTCTTCCCTCATCAGTAAAACTTTTTGAGTGCACAACCTTACATTATATGTTATAAATGTATGCATCATTTCTGTCCACACATGTATGTAAATCTTATTTTATGACTTTCTCTATATATTAAATAAACAAATAAATATTTATGTTTATCTGCACCTTACTTTGGAGCTGCTTTTTTTTTTTTTGTCTGAGATGGAATCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAATTCAAGTTACTCTCCTGTCTCATCCTCCCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCACCTGCCACCATGCCAGGCGAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCGAAGGAGGCTGCTGTTCTAATCCAGGTACTAGCAAACGGTGGTGGACCACAGTCCAAGACCAGCCCACTGCCTGATTTTGTATGATCCTCAAGCTAAGAATGGTTTTCACATTTTCAAATGATTGAAAAAAATGTTTAATGATATTTTGTGATGCATGAAAATTACATGAAATTCAAATTAGAGTATCCATAAATAAAGTTTCTTGGAACACAGCTGCACTCCTGTATGTACTGTCTCTGGCTGCTTTTATGCTACAATGGCAGAATTGAGTAGTTGGGTAGATTTCAATCACGAAGCCTAAATTTCTTACTATCTGGCCCTTTACAGCA
GGTTGGCCGCTCAGCACAGTTCATCACTCTAACTGCAGAATGAAACATCTTCAAATTAGCAGGAATAACCCAAGCAAATAGTTATAGTATTTTGACAGAATAAATAGGTAGCATTCAGTGATTTCAACCAATCAAAATTCTACATTGATAATGACCCCATCTCATACACAAATTACAGTTCCATATTTGTATCAAATGAGTCTATGGAAAAGTTCAGAAAATGATGTATAGTAGAAAGTTTAGTAAATATTTTGGGGCGATGTCCATATTTTTAAATAAAAATAAATGCATAAGAAGACAGCATATTTAGGGGTATGGTAGTCAAATAAAGAGATTAAATGTTTTGTCATTCATTTAATTTTATGGAAATTTAATCCCTTTTCATGAGAGAGTTTCTCACATATTTAATTGAGGTAATACCTACCAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCTACTGCACCCAGACCTAAGATTTATTTTAAAATGTCACAGAGTGAGAGGGTGAGCACCTGTCATCATAATGTATTTACAAGAGGTTTGCAAGGGATGCTGCCCAAACTATTCTATGAAATACCAGTTTCTCCCAGGGCTAATCTGTGTTAGCCAATAAAACAGATCTTACCTCAAAGAGGTTTGGAGAAACTTGGTAAACAAATTTAAAGATTCATTTACAGACCCTTTAATATCAGAATATGAACTGTGAGTCTTCCACATGAAGATAAGCTATCTGGTCTTTCCTAAATGCTTCTGACTACAAAACCCTTTTTGGCTGGCAGCATCTATGGTGCCAGCAGTTCTCAGACCCTGCCTTGGCCAAGTCCCAGGTTGTTCACTTTGTGGTAGTTATGCTTATAAAGTGACAGTGCCAGAATTCTGATGGTCTAATATTAAGAGAATTTGTATGATGTCCCTACTTGCATCTCACTGATTTTTCTTTATAAGTTCTGGTAAAGATGCTCCATAAAGTAAATGAGAGAAAAATCAAGGTGGTGATTTGTTGAGTCTTACACCCTGTCATTAAAAAAGGAGACAGACCACTTAGCCATCTGATGATATTGAACAATGAAAAATTGAGTCAAATTTATTTCAGAGGGCCATGTTGGGAAGGAAGAGGGCTTAAATTATTTTGTCAAATTCAATTTCTTTTAAATCTACAAATCATTTTCAAGGTTATAGCATATGAAGATTTAAAAACTAGACAGTTTATGAGAGAAAATGGAAGTGGGAAATCCCCTTTGTCATGAAAATACCTGGTGAAACCAGAAATAAAGGTTTGCTGTGCTCATTTTATTTCAGAAATGTAACATTATCATGAATATCACCACTAAAGTCATTTGAACTATTGGTCAATTTGAACATAGTTTTAGTGGCTATTACCATATGGGAGACCCATCATTGTAAGATATCTCAAGTGGGACTCAAGACAGTTCCAAGTTCAAAAAATGTTGCTAAACTCCAAAGGACACAAAACGGAAGAAACCTGCAGTGCTCTTACTTTAGTAATAATTCTCATCAAATGCCAAATGCTTTTAATTCAAGATCTCAATGACAGCCTAACTGGTATTCATATTTGGAGGATGATTAACCTGTTGTAAGAATATACTGGAATGAAGCACGATTCAAACACATTCCTGTTGTCACAGGCTCTGAGTGGTGAGAAAGGGGACCAAGGTCCTCCAGGGGATCCTGGCTCCCCTGGGTCCCCAGGACCTGCAGGACCAGCTGGACCACCTGGCTACGGACCCCAAGGAGAACCTGGTCTCCAGGGCACGCAAAGAGTTCCTGGAGCCCCCGGACCACCCGGAGAAGCCGGTTGGTTAGTTTTCTTTCCAGTCCTGTTTTCCGATGGAGTGGGTTGATGGTTTCTAGAGCTAACGAAGCTTCTCCAAGACTAAGGAAAATATAGAAACTTGCTTCTAACGAATAGAATATGTCAACTCACAGATACCAGGAAAGAATATGTAGGGTATGTTAGAGAAAACTCATTTTTTCTCCATTACTGGGCAATTCAACTGAAATTTCCTAGAATATTCTATATCTATTACATACATACATATATATATATGAAATGAATAGATCCTAAGCGTTATTGCAAATTTGTTTTTTGTGGTTTTCTAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATAATTATAGTTTACTGCATCCTCAAACTTCTGGGCTTAATAGATCCTCCTGCCTGGTCTCCTGAGTAGCTGGGGCTACAGGCACGTGTCACCACGACCAGCTAATATATATTTTATTTTTATTTTTTGTAGAGACAGGATGTTGCTGTGTTGTCCAGGCTGGTCTCCTACTCCCAACCCCAAACAATCCTTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCGCAGCCACAAATTTGTTGATTTTGATCCATAACTCCATAGGCAGGTTACAAATAAAACTTTAAAATATCTAAGACAAATGAAGGAAAATGGTCTGATAATAGTTTAAAAGTCCAGGTAACTTTTGGGATATACATATACTGGCCGTAGTTCTGGATTCAGGAGTGTGGCTGAAGGTCAGAATAGCATGCTACTGATAGTTTTGAGCAAATAATGCCAACATGGTCATGTTTTACTTCTAAAATCACCTTAGGCTGGGCACAGTGACTCACACCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCGGGTCAACATAGCGAACCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCACATACCCACAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGATTGAGATACTGTCTCAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTAAAAATCACTTTAAAGGGTAAGACCCAGTAAACCTCTAAATCATTTTGTAGTGTCTTCCCTCATCAGTAAAACTTTTTGAGTGCACAACCTTACATTATATGTTATAAATGTATGCATCATTTCTGTCCACACATGTATGTAAATCTTATTTTATGACTTTCTCTATATATTAAATAAACAAATAAATATTTATGTTTATCTGCACCTTACTTTGGAGCTGCTTTTTTTTTTTTTGTCTGAGATGGAATCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAATTCAAGTTACTCTCCTGTCTCATCCTCCCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCACCTGCCACCATGCCAGGCGAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCGAAGGAGGCTGCTGTTCTAATCCAGGTACTAGCAAACGGTGGTGGACCACAGTCCAAGACCAGCCCACTGCCTGATTTTGTATGATCCTCAAGCTAAGAATGGTTTTCACATTTTCAAATGATTGAAAAAAATGTTTAATGATATTTTGTGATGCATGAAAATTACATGAAATTCAAATTAGAGTATCCATAAATAAAGTTTCTTGGAACACAGCTGCACTCCTGTATGTACTGTCTCTGGCTGCTTTTATGCTACAATGGCAGAATTGAGTAGTTGGGTAGATTTCAATCACGAAGCCTAAATTTCTTACTATCTGGCCCTTTACAGCA
Task1_train_5617
A genomic change on Chromosome 2 affects COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Hematuria, benign familial, 2
TGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAACATTAGCCGGGTGTGGTGGCATGTGGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCACAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAATGTTTTCCAAGAGCCACAAATGGAAAAAAATCTTATAATAATGTTAGGTGAATTAATTGAATTTTTTAAAACACAGAGAAAACAACTAGAAGGAAACTCACCAAAATGGTAATAGTGAATCTTGATTGTCAGATTTTAAAGACATTTTTGATACTTCTCAGTAAATGCCTGCACATTTCACATGTATACATTTCTTTTTTTTTTAATAAGAAAGGAACTATTAAATCACAAATGGCTGATTTTCCCATAAACTCCAAAATAAATTATGGAAATTATTTTCCTTTAGGGAAAAAAATGCTGTTTCCCCTCAAAGAGGAAACACTCCAAAAAAATCTAGACGCTGAGAGCTCACACAATGACATAAGCCTGCCCACTGACAAGTACATGAAAGTCCTGTCCAGGATGGCATATGAGTAACCTGAGTCCCTGGATTCTCACATAGAACTGCAAGTTTTATGACAATTTCATGTTTGTTACAATATTCTTTAAAATGTTTGTCAAAAATAGCATCCTTGTTTTGGTGTTTCAGCTCTTGGATTAGTATGTCATCAGTGTTTATTATACATTAATTTTGCCCAAATATGAGAATATTGATTTCAATTTATGAGTATTTGAAATGGAAAACATAATCTCATTTCTCCTGGAGTCTTAAGAATGGCTTTGAGTCCAATTTCTTGGTTTTCTTCCTAATGATCTGTGAAGTAAGGGAGTCTGCCTCACATTTGTACTTCATTCTTCTTGGACCCTGCATTAATAAATTACATCCCTACTTTGTAACTCTAGGTATTGACTCTCTGGAAGAAGACTGTTGACTGTGGGAACCAGAACTAGCCCAAGAGCTCCTTGAAAGTGGAGATTTACAATTTCACAATTGAATCTAATGAATCCCATGAACTAACTGCAAATTAAATATTGGTCAAATTAGGGTATGAAGGAACTCCCTGAATGCAGCCTTGCTTCACCGTGGCTTCCTCTTCTGAACCAGAGATCACAGAAAGTGTGTTGACCCCTTTCTCAAGTCACCTACTATAAATGCATAAGAAGTTAATCCCTTGCATGCAATGGATGCTATAGGGCATTAAGACTTAATTCTCTTAAGCAACCCCTGTTGAGAAAGGCTACCTGGGGTGCTGAAAACGTTCTATATCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTTTCGCTTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAATTGGCACTATCTCAGCTCAACACAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGTGCCACCATGCCTGGCTAGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAGTCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCATCATGCCCAGCCAAAAGCTTTGTATCTTAATCTAGGTCATGCTTACATGAATATATCCATATATAAAAATCCACTTACCTGTACACTGTATGTAAAAAATACTTCAAAAACAAAGTCAAATGGTCAACCAGCATCAGTGGTTTGAAGAATTGCTGAATCAAAATCATGGCCCTACTAAACAACAAAATAGAGAAAGTTATTTTTTCAAATAGGAACCAATGTAATTTGATTTGGAACTTTTAAAAAATTGCTAATTTATCAGTTGGTTTTATTATCATTTAAATTTTCATAAAAGCATCTCTAGCTGGTTGAGAGATAAGAGAGTTACTGCTCAGAATATTTCAATAAGACTAATCCTACAACAATGTTTATTGTTTTTTCTCTGTAGGAGACCAAGGTTTTCCAGGTACAAAAGGATCACTGGGTTGTCCTGGAAAAATGGGAGAGCCTGGGTTACCTGGAAAGCCAGGCCTCCCAGGAGCCAAGGTATGCAAAAATTCAAGCTATCACAGAAGAGAGGGTGGGTGACCATTAACTGGCCAGTTTGTATGCACTTATCTGGCAGAGCACTCTAGATGTAGAAATGATCAATATATTTGTAGATGATGAAGATATTAAATTTTTTAAATGTTTCTCTGGATCATCTTCCATTTTAGAAAGGAAAACATAAGGTGTCAGAATGCAGATTTCATCGTGATATCATCTTTAATGGTTTCATAAATAATCAGAGTATTTAAAATGGGACAACTCTAGAAAGAAATGTGGTTAGCTATAAGAAAAACTATCAAAAGTAAAAACATCTAGATTTTTCTCTTTATAGACAATCCCACAGTCTTCTGAAAAAGTGGAGGCTACATATCCTGAAGTATTATTAAACATAATCTTACAGAAAAGTCAGCAACTAGAGCTCAAAAAGGAAAGTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATAC
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Task1_train_5618
This variant affects the gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) found on Chromosome 2. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
TGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAACATTAGCCGGGTGTGGTGGCATGTGGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCACAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAATGTTTTCCAAGAGCCACAAATGGAAAAAAATCTTATAATAATGTTAGGTGAATTAATTGAATTTTTTAAAACACAGAGAAAACAACTAGAAGGAAACTCACCAAAATGGTAATAGTGAATCTTGATTGTCAGATTTTAAAGACATTTTTGATACTTCTCAGTAAATGCCTGCACATTTCACATGTATACATTTCTTTTTTTTTTAATAAGAAAGGAACTATTAAATCACAAATGGCTGATTTTCCCATAAACTCCAAAATAAATTATGGAAATTATTTTCCTTTAGGGAAAAAAATGCTGTTTCCCCTCAAAGAGGAAACACTCCAAAAAAATCTAGACGCTGAGAGCTCACACAATGACATAAGCCTGCCCACTGACAAGTACATGAAAGTCCTGTCCAGGATGGCATATGAGTAACCTGAGTCCCTGGATTCTCACATAGAACTGCAAGTTTTATGACAATTTCATGTTTGTTACAATATTCTTTAAAATGTTTGTCAAAAATAGCATCCTTGTTTTGGTGTTTCAGCTCTTGGATTAGTATGTCATCAGTGTTTATTATACATTAATTTTGCCCAAATATGAGAATATTGATTTCAATTTATGAGTATTTGAAATGGAAAACATAATCTCATTTCTCCTGGAGTCTTAAGAATGGCTTTGAGTCCAATTTCTTGGTTTTCTTCCTAATGATCTGTGAAGTAAGGGAGTCTGCCTCACATTTGTACTTCATTCTTCTTGGACCCTGCATTAATAAATTACATCCCTACTTTGTAACTCTAGGTATTGACTCTCTGGAAGAAGACTGTTGACTGTGGGAACCAGAACTAGCCCAAGAGCTCCTTGAAAGTGGAGATTTACAATTTCACAATTGAATCTAATGAATCCCATGAACTAACTGCAAATTAAATATTGGTCAAATTAGGGTATGAAGGAACTCCCTGAATGCAGCCTTGCTTCACCGTGGCTTCCTCTTCTGAACCAGAGATCACAGAAAGTGTGTTGACCCCTTTCTCAAGTCACCTACTATAAATGCATAAGAAGTTAATCCCTTGCATGCAATGGATGCTATAGGGCATTAAGACTTAATTCTCTTAAGCAACCCCTGTTGAGAAAGGCTACCTGGGGTGCTGAAAACGTTCTATATCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTTTCGCTTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAATTGGCACTATCTCAGCTCAACACAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGTGCCACCATGCCTGGCTAGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAGTCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCATCATGCCCAGCCAAAAGCTTTGTATCTTAATCTAGGTCATGCTTACATGAATATATCCATATATAAAAATCCACTTACCTGTACACTGTATGTAAAAAATACTTCAAAAACAAAGTCAAATGGTCAACCAGCATCAGTGGTTTGAAGAATTGCTGAATCAAAATCATGGCCCTACTAAACAACAAAATAGAGAAAGTTATTTTTTCAAATAGGAACCAATGTAATTTGATTTGGAACTTTTAAAAAATTGCTAATTTATCAGTTGGTTTTATTATCATTTAAATTTTCATAAAAGCATCTCTAGCTGGTTGAGAGATAAGAGAGTTACTGCTCAGAATATTTCAATAAGACTAATCCTACAACAATGTTTATTGTTTTTTCTCTGTAGGAGACCAAGGTTTTCCAGGTACAAAAGGATCACTGGGTTGTCCTGGAAAAATGGGAGAGCCTGGGTTACCTGGAAAGCCAGGCCTCCCAGGAGCCAAGGTATGCAAAAATTCAAGCTATCACAGAAGAGAGGGTGGGTGACCATTAACTGGCCAGTTTGTATGCACTTATCTGGCAGAGCACTCTAGATGTAGAAATGATCAATATATTTGTAGATGATGAAGATATTAAATTTTTTAAATGTTTCTCTGGATCATCTTCCATTTTAGAAAGGAAAACATAAGGTGTCAGAATGCAGATTTCATCGTGATATCATCTTTAATGGTTTCATAAATAATCAGAGTATTTAAAATGGGACAACTCTAGAAAGAAATGTGGTTAGCTATAAGAAAAACTATCAAAAGTAAAAACATCTAGATTTTTCTCTTTATAGACAATCCCACAGTCTTCTGAAAAAGTGGAGGCTACATATCCTGAAGTATTATTAAACATAATCTTACAGAAAAGTCAGCAACTAGAGCTCAAAAAGGAAAGTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATAC
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Task1_train_5619
This sequence variant lies in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Alport syndrome 3b, autosomal recessive
TGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAACATTAGCCGGGTGTGGTGGCATGTGGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCACAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAATGTTTTCCAAGAGCCACAAATGGAAAAAAATCTTATAATAATGTTAGGTGAATTAATTGAATTTTTTAAAACACAGAGAAAACAACTAGAAGGAAACTCACCAAAATGGTAATAGTGAATCTTGATTGTCAGATTTTAAAGACATTTTTGATACTTCTCAGTAAATGCCTGCACATTTCACATGTATACATTTCTTTTTTTTTTAATAAGAAAGGAACTATTAAATCACAAATGGCTGATTTTCCCATAAACTCCAAAATAAATTATGGAAATTATTTTCCTTTAGGGAAAAAAATGCTGTTTCCCCTCAAAGAGGAAACACTCCAAAAAAATCTAGACGCTGAGAGCTCACACAATGACATAAGCCTGCCCACTGACAAGTACATGAAAGTCCTGTCCAGGATGGCATATGAGTAACCTGAGTCCCTGGATTCTCACATAGAACTGCAAGTTTTATGACAATTTCATGTTTGTTACAATATTCTTTAAAATGTTTGTCAAAAATAGCATCCTTGTTTTGGTGTTTCAGCTCTTGGATTAGTATGTCATCAGTGTTTATTATACATTAATTTTGCCCAAATATGAGAATATTGATTTCAATTTATGAGTATTTGAAATGGAAAACATAATCTCATTTCTCCTGGAGTCTTAAGAATGGCTTTGAGTCCAATTTCTTGGTTTTCTTCCTAATGATCTGTGAAGTAAGGGAGTCTGCCTCACATTTGTACTTCATTCTTCTTGGACCCTGCATTAATAAATTACATCCCTACTTTGTAACTCTAGGTATTGACTCTCTGGAAGAAGACTGTTGACTGTGGGAACCAGAACTAGCCCAAGAGCTCCTTGAAAGTGGAGATTTACAATTTCACAATTGAATCTAATGAATCCCATGAACTAACTGCAAATTAAATATTGGTCAAATTAGGGTATGAAGGAACTCCCTGAATGCAGCCTTGCTTCACCGTGGCTTCCTCTTCTGAACCAGAGATCACAGAAAGTGTGTTGACCCCTTTCTCAAGTCACCTACTATAAATGCATAAGAAGTTAATCCCTTGCATGCAATGGATGCTATAGGGCATTAAGACTTAATTCTCTTAAGCAACCCCTGTTGAGAAAGGCTACCTGGGGTGCTGAAAACGTTCTATATCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTTTCGCTTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAATTGGCACTATCTCAGCTCAACACAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGTGCCACCATGCCTGGCTAGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAGTCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCATCATGCCCAGCCAAAAGCTTTGTATCTTAATCTAGGTCATGCTTACATGAATATATCCATATATAAAAATCCACTTACCTGTACACTGTATGTAAAAAATACTTCAAAAACAAAGTCAAATGGTCAACCAGCATCAGTGGTTTGAAGAATTGCTGAATCAAAATCATGGCCCTACTAAACAACAAAATAGAGAAAGTTATTTTTTCAAATAGGAACCAATGTAATTTGATTTGGAACTTTTAAAAAATTGCTAATTTATCAGTTGGTTTTATTATCATTTAAATTTTCATAAAAGCATCTCTAGCTGGTTGAGAGATAAGAGAGTTACTGCTCAGAATATTTCAATAAGACTAATCCTACAACAATGTTTATTGTTTTTTCTCTGTAGGAGACCAAGGTTTTCCAGGTACAAAAGGATCACTGGGTTGTCCTGGAAAAATGGGAGAGCCTGGGTTACCTGGAAAGCCAGGCCTCCCAGGAGCCAAGGTATGCAAAAATTCAAGCTATCACAGAAGAGAGGGTGGGTGACCATTAACTGGCCAGTTTGTATGCACTTATCTGGCAGAGCACTCTAGATGTAGAAATGATCAATATATTTGTAGATGATGAAGATATTAAATTTTTTAAATGTTTCTCTGGATCATCTTCCATTTTAGAAAGGAAAACATAAGGTGTCAGAATGCAGATTTCATCGTGATATCATCTTTAATGGTTTCATAAATAATCAGAGTATTTAAAATGGGACAACTCTAGAAAGAAATGTGGTTAGCTATAAGAAAAACTATCAAAAGTAAAAACATCTAGATTTTTCTCTTTATAGACAATCCCACAGTCTTCTGAAAAAGTGGAGGCTACATATCCTGAAGTATTATTAAACATAATCTTACAGAAAAGTCAGCAACTAGAGCTCAAAAAGGAAAGTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATAC
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Task1_train_5620
This sequence variant lies in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
GTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATACACACACACATGCGCACGCATGCGTAAGTGTGCAGTTACCCCAAATCACAAAGCTAAATATTTACAGCCATAAAATATTTCTAAAGTGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAACTTAGCTATGCATTATGGTGCACGCCTGTAGTCCCAGCTATTTGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGCGGAGGGTACAGTGAGCCGAAATCGCCCCACTGCAATCCAGCCTAGAAGACAGAGGGAGATTCCATCTTAAAAATATATATATATATATATATATATATTTCTGAAGTTAGTAGGGGAAAGCATTTGTGGGTTAATTAATTCATTCATTTATTCGTACACAGGCAGAAGAGGTAAAACGGGGCCAAAGGGAGACCCAGGAATTCCAGGCTTGGATAGATCAGGATTTCCTGGAGAAACTGGATCACCAGGAATTCCAGGTCATCAAGGTGAAATGGGACCACTGGGTCAAAGAGGATATCCAGGAAATCCGGGAATTTTAGGGCCACCAGGTATCCTTTTGTGTGTTTCTATTTTTCTTCTTATTTCTTCTTCTTCTTAAGGTGGCTCTGTCAACTGTACATAGGCATACGCTTTTTACTCTATGCTTTTACTTAATATAAGGTTTTCCTTCTAAATTATTTGTAAGAAACCAGGGGCCATGGTGCAGGGAAACGGTGGCGGCAGGATGAACAATTACCCAGAATGTGGCTATTTTTGCTGTGTAATCCTTTTTATATACGACTACTATAATATACTTGCTAGTATTTTGTTGAGAATTTTTGCATTTATATTGAGAAGGGATATTGGTCTGTAGCGTTCTTGTGATGTCTTTGGTGTTGGTGTCAGAGTAATGCTGGTCTGATGGAACAAGCTGGGAAGTGTTTCCTCCTCTTGTATTTTCTGGAACAGTTTGTGAAGAATCGACGCTCTTTAAACATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGTTATCTGGGTCTGGGCATTTCTTTTTGGGAAGTCTCTAAATGACTAATTCAATCTCTTCATTTCTTATAGGTATATTCAGGTTTTCTATTTCTTCTGGAGTCAGTTTTGGTATTCTGTTTCTCTAGAAACTTGTCCATTTTTATAAGTTATCTGATTTGTTGTTGTTGTTCATCATATTTCTGTATAATTGTTTTAATTTCATGGCTATGTTTATTGTTTATATGTTTGGGGAGAATATTCTGTTCCCTCATGGCATAAGGACCTCACCGATCTCCCCTCTGGAAAAGAGCCTAAAACAACTTAATCGACACATTATCCTTTCATTCATGTTATTGGGCTACTATCACATGCCAGCATTCTTCTAGGCCCTAGAGACACATCAGTCAGTGGACAAGTCTCCCCTTCTCATAGTAGAGGATCAATAATAGAAATATTTAAAATCTAAGTTCAATTTGAGACAAGTGTTATGAAGAAAATAAAGTGAAGGGATAGAATAGAAAGTGACTGGTCAGGGGCTGGGAGGATGGAATGCTCCAAAACTTCCACATATGCTATCCTCATCCATGAATATGATTTGCTACCAATCACTTCCACATAGGTGAGTTTAAAAGACCACTTACCGACCCATCTCCTAGACTAATACAGTAATTGTACTATGTACAGAGGCCATTTTTTCAACTCCCAATCTCTGCTTCTAAGTATAATTTATTTTAGTATATGGAATATTTTGCTTTTCTCACTCTGTACAACACGTGCTGCTTTGTGTTAATTTGTTTCCATAGGTGAAGATGGAGTGATTGGGATGATGGGCTTTCCTGGAGCCATTGGCCCTCCAGGGCCCCCTGGGAACCCAGGCACACCAGGGCAGAGGGGTAAGTGATAGAGTGTCTTTCTAAATAGCAGGAAGCATAAACAATGTTCATTTATTTTGCAGCAAAAAAAGTTATGTTTCATTGGAGGGAAAAATAGTTCTGAGAGAGCAACAGTATTTGATTTTGCTGTTTTCTATGTTCCTTTTCTCCATTTGAATGGAATCCTGTTTTCTGTAGGCTTACACCACTACCCTTATGAGGCTGCCTGCCTGGGGAAACTATTTATCAAGTTCTCAGCACTGTTAGCCTTTTTTGTTTGATTTGTTCTGTTTTATAGTAAGCACTGCCAACTTTTTAATCCCTATGAACTACCTGAAGAATTAAGGACCTGATGTTGTTACTCCTGTCTGTTAGGGAGCCCTGGAATTCCAGGAGTAAAGGGCCAGAGAGGAACCCCAGGAGCCAAGGGGGAACAAGGAGATAAAGGAAATCCCGGGCCTTCAGAGATATCCCACGTAATAGGGGACAAAGGAGAACCAGGTCTCAAAGGTAAAGAATTGCTTGTTTGGAATCAGGACATCAGAGCTGATTCTCAGGCTAATAAATTATCCAGGCAAATCCGTT
GTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATACACACACACATGCGCACGCATGCGTAAGTGTGCAGTTACCCCAAATCACAAAGCTAAATATTTACAGCCATAAAATATTTCTAAAGTGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAACTTAGCTATGCATTATGGTGCACGCCTGTAGTCCCAGCTATTTGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGCGGAGGGTACAGTGAGCCGAAATCGCCCCACTGCAATCCAGCCTAGAAGACAGAGGGAGATTCCATCTTAAAAATATATATATATATATATATATATATTTCTGAAGTTAGTAGGGGAAAGCATTTGTGGGTTAATTAATTCATTCATTTATTCGTACACAGGCAGAAGAAGTAAAACGGGGCCAAAGGGAGACCCAGGAATTCCAGGCTTGGATAGATCAGGATTTCCTGGAGAAACTGGATCACCAGGAATTCCAGGTCATCAAGGTGAAATGGGACCACTGGGTCAAAGAGGATATCCAGGAAATCCGGGAATTTTAGGGCCACCAGGTATCCTTTTGTGTGTTTCTATTTTTCTTCTTATTTCTTCTTCTTCTTAAGGTGGCTCTGTCAACTGTACATAGGCATACGCTTTTTACTCTATGCTTTTACTTAATATAAGGTTTTCCTTCTAAATTATTTGTAAGAAACCAGGGGCCATGGTGCAGGGAAACGGTGGCGGCAGGATGAACAATTACCCAGAATGTGGCTATTTTTGCTGTGTAATCCTTTTTATATACGACTACTATAATATACTTGCTAGTATTTTGTTGAGAATTTTTGCATTTATATTGAGAAGGGATATTGGTCTGTAGCGTTCTTGTGATGTCTTTGGTGTTGGTGTCAGAGTAATGCTGGTCTGATGGAACAAGCTGGGAAGTGTTTCCTCCTCTTGTATTTTCTGGAACAGTTTGTGAAGAATCGACGCTCTTTAAACATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGTTATCTGGGTCTGGGCATTTCTTTTTGGGAAGTCTCTAAATGACTAATTCAATCTCTTCATTTCTTATAGGTATATTCAGGTTTTCTATTTCTTCTGGAGTCAGTTTTGGTATTCTGTTTCTCTAGAAACTTGTCCATTTTTATAAGTTATCTGATTTGTTGTTGTTGTTCATCATATTTCTGTATAATTGTTTTAATTTCATGGCTATGTTTATTGTTTATATGTTTGGGGAGAATATTCTGTTCCCTCATGGCATAAGGACCTCACCGATCTCCCCTCTGGAAAAGAGCCTAAAACAACTTAATCGACACATTATCCTTTCATTCATGTTATTGGGCTACTATCACATGCCAGCATTCTTCTAGGCCCTAGAGACACATCAGTCAGTGGACAAGTCTCCCCTTCTCATAGTAGAGGATCAATAATAGAAATATTTAAAATCTAAGTTCAATTTGAGACAAGTGTTATGAAGAAAATAAAGTGAAGGGATAGAATAGAAAGTGACTGGTCAGGGGCTGGGAGGATGGAATGCTCCAAAACTTCCACATATGCTATCCTCATCCATGAATATGATTTGCTACCAATCACTTCCACATAGGTGAGTTTAAAAGACCACTTACCGACCCATCTCCTAGACTAATACAGTAATTGTACTATGTACAGAGGCCATTTTTTCAACTCCCAATCTCTGCTTCTAAGTATAATTTATTTTAGTATATGGAATATTTTGCTTTTCTCACTCTGTACAACACGTGCTGCTTTGTGTTAATTTGTTTCCATAGGTGAAGATGGAGTGATTGGGATGATGGGCTTTCCTGGAGCCATTGGCCCTCCAGGGCCCCCTGGGAACCCAGGCACACCAGGGCAGAGGGGTAAGTGATAGAGTGTCTTTCTAAATAGCAGGAAGCATAAACAATGTTCATTTATTTTGCAGCAAAAAAAGTTATGTTTCATTGGAGGGAAAAATAGTTCTGAGAGAGCAACAGTATTTGATTTTGCTGTTTTCTATGTTCCTTTTCTCCATTTGAATGGAATCCTGTTTTCTGTAGGCTTACACCACTACCCTTATGAGGCTGCCTGCCTGGGGAAACTATTTATCAAGTTCTCAGCACTGTTAGCCTTTTTTGTTTGATTTGTTCTGTTTTATAGTAAGCACTGCCAACTTTTTAATCCCTATGAACTACCTGAAGAATTAAGGACCTGATGTTGTTACTCCTGTCTGTTAGGGAGCCCTGGAATTCCAGGAGTAAAGGGCCAGAGAGGAACCCCAGGAGCCAAGGGGGAACAAGGAGATAAAGGAAATCCCGGGCCTTCAGAGATATCCCACGTAATAGGGGACAAAGGAGAACCAGGTCTCAAAGGTAAAGAATTGCTTGTTTGGAATCAGGACATCAGAGCTGATTCTCAGGCTAATAAATTATCCAGGCAAATCCGTT
Task1_train_5621
A variant has been detected on Chromosome 2 in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Hematuria, benign familial, 2
GTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATACACACACACATGCGCACGCATGCGTAAGTGTGCAGTTACCCCAAATCACAAAGCTAAATATTTACAGCCATAAAATATTTCTAAAGTGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAACTTAGCTATGCATTATGGTGCACGCCTGTAGTCCCAGCTATTTGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGCGGAGGGTACAGTGAGCCGAAATCGCCCCACTGCAATCCAGCCTAGAAGACAGAGGGAGATTCCATCTTAAAAATATATATATATATATATATATATATTTCTGAAGTTAGTAGGGGAAAGCATTTGTGGGTTAATTAATTCATTCATTTATTCGTACACAGGCAGAAGAGGTAAAACGGGGCCAAAGGGAGACCCAGGAATTCCAGGCTTGGATAGATCAGGATTTCCTGGAGAAACTGGATCACCAGGAATTCCAGGTCATCAAGGTGAAATGGGACCACTGGGTCAAAGAGGATATCCAGGAAATCCGGGAATTTTAGGGCCACCAGGTATCCTTTTGTGTGTTTCTATTTTTCTTCTTATTTCTTCTTCTTCTTAAGGTGGCTCTGTCAACTGTACATAGGCATACGCTTTTTACTCTATGCTTTTACTTAATATAAGGTTTTCCTTCTAAATTATTTGTAAGAAACCAGGGGCCATGGTGCAGGGAAACGGTGGCGGCAGGATGAACAATTACCCAGAATGTGGCTATTTTTGCTGTGTAATCCTTTTTATATACGACTACTATAATATACTTGCTAGTATTTTGTTGAGAATTTTTGCATTTATATTGAGAAGGGATATTGGTCTGTAGCGTTCTTGTGATGTCTTTGGTGTTGGTGTCAGAGTAATGCTGGTCTGATGGAACAAGCTGGGAAGTGTTTCCTCCTCTTGTATTTTCTGGAACAGTTTGTGAAGAATCGACGCTCTTTAAACATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGTTATCTGGGTCTGGGCATTTCTTTTTGGGAAGTCTCTAAATGACTAATTCAATCTCTTCATTTCTTATAGGTATATTCAGGTTTTCTATTTCTTCTGGAGTCAGTTTTGGTATTCTGTTTCTCTAGAAACTTGTCCATTTTTATAAGTTATCTGATTTGTTGTTGTTGTTCATCATATTTCTGTATAATTGTTTTAATTTCATGGCTATGTTTATTGTTTATATGTTTGGGGAGAATATTCTGTTCCCTCATGGCATAAGGACCTCACCGATCTCCCCTCTGGAAAAGAGCCTAAAACAACTTAATCGACACATTATCCTTTCATTCATGTTATTGGGCTACTATCACATGCCAGCATTCTTCTAGGCCCTAGAGACACATCAGTCAGTGGACAAGTCTCCCCTTCTCATAGTAGAGGATCAATAATAGAAATATTTAAAATCTAAGTTCAATTTGAGACAAGTGTTATGAAGAAAATAAAGTGAAGGGATAGAATAGAAAGTGACTGGTCAGGGGCTGGGAGGATGGAATGCTCCAAAACTTCCACATATGCTATCCTCATCCATGAATATGATTTGCTACCAATCACTTCCACATAGGTGAGTTTAAAAGACCACTTACCGACCCATCTCCTAGACTAATACAGTAATTGTACTATGTACAGAGGCCATTTTTTCAACTCCCAATCTCTGCTTCTAAGTATAATTTATTTTAGTATATGGAATATTTTGCTTTTCTCACTCTGTACAACACGTGCTGCTTTGTGTTAATTTGTTTCCATAGGTGAAGATGGAGTGATTGGGATGATGGGCTTTCCTGGAGCCATTGGCCCTCCAGGGCCCCCTGGGAACCCAGGCACACCAGGGCAGAGGGGTAAGTGATAGAGTGTCTTTCTAAATAGCAGGAAGCATAAACAATGTTCATTTATTTTGCAGCAAAAAAAGTTATGTTTCATTGGAGGGAAAAATAGTTCTGAGAGAGCAACAGTATTTGATTTTGCTGTTTTCTATGTTCCTTTTCTCCATTTGAATGGAATCCTGTTTTCTGTAGGCTTACACCACTACCCTTATGAGGCTGCCTGCCTGGGGAAACTATTTATCAAGTTCTCAGCACTGTTAGCCTTTTTTGTTTGATTTGTTCTGTTTTATAGTAAGCACTGCCAACTTTTTAATCCCTATGAACTACCTGAAGAATTAAGGACCTGATGTTGTTACTCCTGTCTGTTAGGGAGCCCTGGAATTCCAGGAGTAAAGGGCCAGAGAGGAACCCCAGGAGCCAAGGGGGAACAAGGAGATAAAGGAAATCCCGGGCCTTCAGAGATATCCCACGTAATAGGGGACAAAGGAGAACCAGGTCTCAAAGGTAAAGAATTGCTTGTTTGGAATCAGGACATCAGAGCTGATTCTCAGGCTAATAAATTATCCAGGCAAATCCGTT
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Task1_train_5622
This gene mutation involves COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Alport syndrome 3b, autosomal recessive
GTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATACACACACACATGCGCACGCATGCGTAAGTGTGCAGTTACCCCAAATCACAAAGCTAAATATTTACAGCCATAAAATATTTCTAAAGTGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAACTTAGCTATGCATTATGGTGCACGCCTGTAGTCCCAGCTATTTGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGCGGAGGGTACAGTGAGCCGAAATCGCCCCACTGCAATCCAGCCTAGAAGACAGAGGGAGATTCCATCTTAAAAATATATATATATATATATATATATATTTCTGAAGTTAGTAGGGGAAAGCATTTGTGGGTTAATTAATTCATTCATTTATTCGTACACAGGCAGAAGAGGTAAAACGGGGCCAAAGGGAGACCCAGGAATTCCAGGCTTGGATAGATCAGGATTTCCTGGAGAAACTGGATCACCAGGAATTCCAGGTCATCAAGGTGAAATGGGACCACTGGGTCAAAGAGGATATCCAGGAAATCCGGGAATTTTAGGGCCACCAGGTATCCTTTTGTGTGTTTCTATTTTTCTTCTTATTTCTTCTTCTTCTTAAGGTGGCTCTGTCAACTGTACATAGGCATACGCTTTTTACTCTATGCTTTTACTTAATATAAGGTTTTCCTTCTAAATTATTTGTAAGAAACCAGGGGCCATGGTGCAGGGAAACGGTGGCGGCAGGATGAACAATTACCCAGAATGTGGCTATTTTTGCTGTGTAATCCTTTTTATATACGACTACTATAATATACTTGCTAGTATTTTGTTGAGAATTTTTGCATTTATATTGAGAAGGGATATTGGTCTGTAGCGTTCTTGTGATGTCTTTGGTGTTGGTGTCAGAGTAATGCTGGTCTGATGGAACAAGCTGGGAAGTGTTTCCTCCTCTTGTATTTTCTGGAACAGTTTGTGAAGAATCGACGCTCTTTAAACATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGTTATCTGGGTCTGGGCATTTCTTTTTGGGAAGTCTCTAAATGACTAATTCAATCTCTTCATTTCTTATAGGTATATTCAGGTTTTCTATTTCTTCTGGAGTCAGTTTTGGTATTCTGTTTCTCTAGAAACTTGTCCATTTTTATAAGTTATCTGATTTGTTGTTGTTGTTCATCATATTTCTGTATAATTGTTTTAATTTCATGGCTATGTTTATTGTTTATATGTTTGGGGAGAATATTCTGTTCCCTCATGGCATAAGGACCTCACCGATCTCCCCTCTGGAAAAGAGCCTAAAACAACTTAATCGACACATTATCCTTTCATTCATGTTATTGGGCTACTATCACATGCCAGCATTCTTCTAGGCCCTAGAGACACATCAGTCAGTGGACAAGTCTCCCCTTCTCATAGTAGAGGATCAATAATAGAAATATTTAAAATCTAAGTTCAATTTGAGACAAGTGTTATGAAGAAAATAAAGTGAAGGGATAGAATAGAAAGTGACTGGTCAGGGGCTGGGAGGATGGAATGCTCCAAAACTTCCACATATGCTATCCTCATCCATGAATATGATTTGCTACCAATCACTTCCACATAGGTGAGTTTAAAAGACCACTTACCGACCCATCTCCTAGACTAATACAGTAATTGTACTATGTACAGAGGCCATTTTTTCAACTCCCAATCTCTGCTTCTAAGTATAATTTATTTTAGTATATGGAATATTTTGCTTTTCTCACTCTGTACAACACGTGCTGCTTTGTGTTAATTTGTTTCCATAGGTGAAGATGGAGTGATTGGGATGATGGGCTTTCCTGGAGCCATTGGCCCTCCAGGGCCCCCTGGGAACCCAGGCACACCAGGGCAGAGGGGTAAGTGATAGAGTGTCTTTCTAAATAGCAGGAAGCATAAACAATGTTCATTTATTTTGCAGCAAAAAAAGTTATGTTTCATTGGAGGGAAAAATAGTTCTGAGAGAGCAACAGTATTTGATTTTGCTGTTTTCTATGTTCCTTTTCTCCATTTGAATGGAATCCTGTTTTCTGTAGGCTTACACCACTACCCTTATGAGGCTGCCTGCCTGGGGAAACTATTTATCAAGTTCTCAGCACTGTTAGCCTTTTTTGTTTGATTTGTTCTGTTTTATAGTAAGCACTGCCAACTTTTTAATCCCTATGAACTACCTGAAGAATTAAGGACCTGATGTTGTTACTCCTGTCTGTTAGGGAGCCCTGGAATTCCAGGAGTAAAGGGCCAGAGAGGAACCCCAGGAGCCAAGGGGGAACAAGGAGATAAAGGAAATCCCGGGCCTTCAGAGATATCCCACGTAATAGGGGACAAAGGAGAACCAGGTCTCAAAGGTAAAGAATTGCTTGTTTGGAATCAGGACATCAGAGCTGATTCTCAGGCTAATAAATTATCCAGGCAAATCCGTT
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Task1_train_5623
This variant affects the gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) found on Chromosome 2. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
GTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATACACACACACATGCGCACGCATGCGTAAGTGTGCAGTTACCCCAAATCACAAAGCTAAATATTTACAGCCATAAAATATTTCTAAAGTGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAACTTAGCTATGCATTATGGTGCACGCCTGTAGTCCCAGCTATTTGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGCGGAGGGTACAGTGAGCCGAAATCGCCCCACTGCAATCCAGCCTAGAAGACAGAGGGAGATTCCATCTTAAAAATATATATATATATATATATATATATTTCTGAAGTTAGTAGGGGAAAGCATTTGTGGGTTAATTAATTCATTCATTTATTCGTACACAGGCAGAAGAGGTAAAACGGGGCCAAAGGGAGACCCAGGAATTCCAGGCTTGGATAGATCAGGATTTCCTGGAGAAACTGGATCACCAGGAATTCCAGGTCATCAAGGTGAAATGGGACCACTGGGTCAAAGAGGATATCCAGGAAATCCGGGAATTTTAGGGCCACCAGGTATCCTTTTGTGTGTTTCTATTTTTCTTCTTATTTCTTCTTCTTCTTAAGGTGGCTCTGTCAACTGTACATAGGCATACGCTTTTTACTCTATGCTTTTACTTAATATAAGGTTTTCCTTCTAAATTATTTGTAAGAAACCAGGGGCCATGGTGCAGGGAAACGGTGGCGGCAGGATGAACAATTACCCAGAATGTGGCTATTTTTGCTGTGTAATCCTTTTTATATACGACTACTATAATATACTTGCTAGTATTTTGTTGAGAATTTTTGCATTTATATTGAGAAGGGATATTGGTCTGTAGCGTTCTTGTGATGTCTTTGGTGTTGGTGTCAGAGTAATGCTGGTCTGATGGAACAAGCTGGGAAGTGTTTCCTCCTCTTGTATTTTCTGGAACAGTTTGTGAAGAATCGACGCTCTTTAAACATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGTTATCTGGGTCTGGGCATTTCTTTTTGGGAAGTCTCTAAATGACTAATTCAATCTCTTCATTTCTTATAGGTATATTCAGGTTTTCTATTTCTTCTGGAGTCAGTTTTGGTATTCTGTTTCTCTAGAAACTTGTCCATTTTTATAAGTTATCTGATTTGTTGTTGTTGTTCATCATATTTCTGTATAATTGTTTTAATTTCATGGCTATGTTTATTGTTTATATGTTTGGGGAGAATATTCTGTTCCCTCATGGCATAAGGACCTCACCGATCTCCCCTCTGGAAAAGAGCCTAAAACAACTTAATCGACACATTATCCTTTCATTCATGTTATTGGGCTACTATCACATGCCAGCATTCTTCTAGGCCCTAGAGACACATCAGTCAGTGGACAAGTCTCCCCTTCTCATAGTAGAGGATCAATAATAGAAATATTTAAAATCTAAGTTCAATTTGAGACAAGTGTTATGAAGAAAATAAAGTGAAGGGATAGAATAGAAAGTGACTGGTCAGGGGCTGGGAGGATGGAATGCTCCAAAACTTCCACATATGCTATCCTCATCCATGAATATGATTTGCTACCAATCACTTCCACATAGGTGAGTTTAAAAGACCACTTACCGACCCATCTCCTAGACTAATACAGTAATTGTACTATGTACAGAGGCCATTTTTTCAACTCCCAATCTCTGCTTCTAAGTATAATTTATTTTAGTATATGGAATATTTTGCTTTTCTCACTCTGTACAACACGTGCTGCTTTGTGTTAATTTGTTTCCATAGGTGAAGATGGAGTGATTGGGATGATGGGCTTTCCTGGAGCCATTGGCCCTCCAGGGCCCCCTGGGAACCCAGGCACACCAGGGCAGAGGGGTAAGTGATAGAGTGTCTTTCTAAATAGCAGGAAGCATAAACAATGTTCATTTATTTTGCAGCAAAAAAAGTTATGTTTCATTGGAGGGAAAAATAGTTCTGAGAGAGCAACAGTATTTGATTTTGCTGTTTTCTATGTTCCTTTTCTCCATTTGAATGGAATCCTGTTTTCTGTAGGCTTACACCACTACCCTTATGAGGCTGCCTGCCTGGGGAAACTATTTATCAAGTTCTCAGCACTGTTAGCCTTTTTTGTTTGATTTGTTCTGTTTTATAGTAAGCACTGCCAACTTTTTAATCCCTATGAACTACCTGAAGAATTAAGGACCTGATGTTGTTACTCCTGTCTGTTAGGGAGCCCTGGAATTCCAGGAGTAAAGGGCCAGAGAGGAACCCCAGGAGCCAAGGGGGAACAAGGAGATAAAGGAAATCCCGGGCCTTCAGAGATATCCCACGTAATAGGGGACAAAGGAGAACCAGGTCTCAAAGGTAAAGAATTGCTTGTTTGGAATCAGGACATCAGAGCTGATTCTCAGGCTAATAAATTATCCAGGCAAATCCGTT
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Task1_train_5624
Here is a variant affecting COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; not specified
GTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATACACACACACATGCGCACGCATGCGTAAGTGTGCAGTTACCCCAAATCACAAAGCTAAATATTTACAGCCATAAAATATTTCTAAAGTGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAACTTAGCTATGCATTATGGTGCACGCCTGTAGTCCCAGCTATTTGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGCGGAGGGTACAGTGAGCCGAAATCGCCCCACTGCAATCCAGCCTAGAAGACAGAGGGAGATTCCATCTTAAAAATATATATATATATATATATATATATTTCTGAAGTTAGTAGGGGAAAGCATTTGTGGGTTAATTAATTCATTCATTTATTCGTACACAGGCAGAAGAGGTAAAACGGGGCCAAAGGGAGACCCAGGAATTCCAGGCTTGGATAGATCAGGATTTCCTGGAGAAACTGGATCACCAGGAATTCCAGGTCATCAAGGTGAAATGGGACCACTGGGTCAAAGAGGATATCCAGGAAATCCGGGAATTTTAGGGCCACCAGGTATCCTTTTGTGTGTTTCTATTTTTCTTCTTATTTCTTCTTCTTCTTAAGGTGGCTCTGTCAACTGTACATAGGCATACGCTTTTTACTCTATGCTTTTACTTAATATAAGGTTTTCCTTCTAAATTATTTGTAAGAAACCAGGGGCCATGGTGCAGGGAAACGGTGGCGGCAGGATGAACAATTACCCAGAATGTGGCTATTTTTGCTGTGTAATCCTTTTTATATACGACTACTATAATATACTTGCTAGTATTTTGTTGAGAATTTTTGCATTTATATTGAGAAGGGATATTGGTCTGTAGCGTTCTTGTGATGTCTTTGGTGTTGGTGTCAGAGTAATGCTGGTCTGATGGAACAAGCTGGGAAGTGTTTCCTCCTCTTGTATTTTCTGGAACAGTTTGTGAAGAATCGACGCTCTTTAAACATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGTTATCTGGGTCTGGGCATTTCTTTTTGGGAAGTCTCTAAATGACTAATTCAATCTCTTCATTTCTTATAGGTATATTCAGGTTTTCTATTTCTTCTGGAGTCAGTTTTGGTATTCTGTTTCTCTAGAAACTTGTCCATTTTTATAAGTTATCTGATTTGTTGTTGTTGTTCATCATATTTCTGTATAATTGTTTTAATTTCATGGCTATGTTTATTGTTTATATGTTTGGGGAGAATATTCTGTTCCCTCATGGCATAAGGACCTCACCGATCTCCCCTCTGGAAAAGAGCCTAAAACAACTTAATCGACACATTATCCTTTCATTCATGTTATTGGGCTACTATCACATGCCAGCATTCTTCTAGGCCCTAGAGACACATCAGTCAGTGGACAAGTCTCCCCTTCTCATAGTAGAGGATCAATAATAGAAATATTTAAAATCTAAGTTCAATTTGAGACAAGTGTTATGAAGAAAATAAAGTGAAGGGATAGAATAGAAAGTGACTGGTCAGGGGCTGGGAGGATGGAATGCTCCAAAACTTCCACATATGCTATCCTCATCCATGAATATGATTTGCTACCAATCACTTCCACATAGGTGAGTTTAAAAGACCACTTACCGACCCATCTCCTAGACTAATACAGTAATTGTACTATGTACAGAGGCCATTTTTTCAACTCCCAATCTCTGCTTCTAAGTATAATTTATTTTAGTATATGGAATATTTTGCTTTTCTCACTCTGTACAACACGTGCTGCTTTGTGTTAATTTGTTTCCATAGGTGAAGATGGAGTGATTGGGATGATGGGCTTTCCTGGAGCCATTGGCCCTCCAGGGCCCCCTGGGAACCCAGGCACACCAGGGCAGAGGGGTAAGTGATAGAGTGTCTTTCTAAATAGCAGGAAGCATAAACAATGTTCATTTATTTTGCAGCAAAAAAAGTTATGTTTCATTGGAGGGAAAAATAGTTCTGAGAGAGCAACAGTATTTGATTTTGCTGTTTTCTATGTTCCTTTTCTCCATTTGAATGGAATCCTGTTTTCTGTAGGCTTACACCACTACCCTTATGAGGCTGCCTGCCTGGGGAAACTATTTATCAAGTTCTCAGCACTGTTAGCCTTTTTTGTTTGATTTGTTCTGTTTTATAGTAAGCACTGCCAACTTTTTAATCCCTATGAACTACCTGAAGAATTAAGGACCTGATGTTGTTACTCCTGTCTGTTAGGGAGCCCTGGAATTCCAGGAGTAAAGGGCCAGAGAGGAACCCCAGGAGCCAAGGGGGAACAAGGAGATAAAGGAAATCCCGGGCCTTCAGAGATATCCCACGTAATAGGGGACAAAGGAGAACCAGGTCTCAAAGGTAAAGAATTGCTTGTTTGGAATCAGGACATCAGAGCTGATTCTCAGGCTAATAAATTATCCAGGCAAATCCGTT
GTTGATGACATGGTAGTGGCTGTGCAACAGGGACTTAGAGCCTCCATAACAGAGAGTCAATATCAGTGAAGATTTGGAAGCACTATATAGTAATAACACAATTTCTATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATACACACACACATGCGCACGCATGCGTAAGTGTGCAGTTACCCCAAATCACAAAGCTAAATATTTACAGCCATAAAATATTTCTAAAGTGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAACTTAGCTATGCATTATGGTGCACGCCTGTAGTCCCAGCTATTTGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGCGGAGGGTACAGTGAGCCGAAATCGCCCCACTGCAATCCAGCCTAGAAGACAGAGGGAGATTCCATCTTAAAAATATATATATATATATATATATATATTTCTGAAGTTAGTAGGGGAAAGCATTTGTGGGTTAATTAATTCATTCATTTATTCGTACACAGGCAGAAGAAGTAAAACGGGGCCAAAGGGAGACCCAGGAATTCCAGGCTTGGATAGATCAGGATTTCCTGGAGAAACTGGATCACCAGGAATTCCAGGTCATCAAGGTGAAATGGGACCACTGGGTCAAAGAGGATATCCAGGAAATCCGGGAATTTTAGGGCCACCAGGTATCCTTTTGTGTGTTTCTATTTTTCTTCTTATTTCTTCTTCTTCTTAAGGTGGCTCTGTCAACTGTACATAGGCATACGCTTTTTACTCTATGCTTTTACTTAATATAAGGTTTTCCTTCTAAATTATTTGTAAGAAACCAGGGGCCATGGTGCAGGGAAACGGTGGCGGCAGGATGAACAATTACCCAGAATGTGGCTATTTTTGCTGTGTAATCCTTTTTATATACGACTACTATAATATACTTGCTAGTATTTTGTTGAGAATTTTTGCATTTATATTGAGAAGGGATATTGGTCTGTAGCGTTCTTGTGATGTCTTTGGTGTTGGTGTCAGAGTAATGCTGGTCTGATGGAACAAGCTGGGAAGTGTTTCCTCCTCTTGTATTTTCTGGAACAGTTTGTGAAGAATCGACGCTCTTTAAACATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGTTATCTGGGTCTGGGCATTTCTTTTTGGGAAGTCTCTAAATGACTAATTCAATCTCTTCATTTCTTATAGGTATATTCAGGTTTTCTATTTCTTCTGGAGTCAGTTTTGGTATTCTGTTTCTCTAGAAACTTGTCCATTTTTATAAGTTATCTGATTTGTTGTTGTTGTTCATCATATTTCTGTATAATTGTTTTAATTTCATGGCTATGTTTATTGTTTATATGTTTGGGGAGAATATTCTGTTCCCTCATGGCATAAGGACCTCACCGATCTCCCCTCTGGAAAAGAGCCTAAAACAACTTAATCGACACATTATCCTTTCATTCATGTTATTGGGCTACTATCACATGCCAGCATTCTTCTAGGCCCTAGAGACACATCAGTCAGTGGACAAGTCTCCCCTTCTCATAGTAGAGGATCAATAATAGAAATATTTAAAATCTAAGTTCAATTTGAGACAAGTGTTATGAAGAAAATAAAGTGAAGGGATAGAATAGAAAGTGACTGGTCAGGGGCTGGGAGGATGGAATGCTCCAAAACTTCCACATATGCTATCCTCATCCATGAATATGATTTGCTACCAATCACTTCCACATAGGTGAGTTTAAAAGACCACTTACCGACCCATCTCCTAGACTAATACAGTAATTGTACTATGTACAGAGGCCATTTTTTCAACTCCCAATCTCTGCTTCTAAGTATAATTTATTTTAGTATATGGAATATTTTGCTTTTCTCACTCTGTACAACACGTGCTGCTTTGTGTTAATTTGTTTCCATAGGTGAAGATGGAGTGATTGGGATGATGGGCTTTCCTGGAGCCATTGGCCCTCCAGGGCCCCCTGGGAACCCAGGCACACCAGGGCAGAGGGGTAAGTGATAGAGTGTCTTTCTAAATAGCAGGAAGCATAAACAATGTTCATTTATTTTGCAGCAAAAAAAGTTATGTTTCATTGGAGGGAAAAATAGTTCTGAGAGAGCAACAGTATTTGATTTTGCTGTTTTCTATGTTCCTTTTCTCCATTTGAATGGAATCCTGTTTTCTGTAGGCTTACACCACTACCCTTATGAGGCTGCCTGCCTGGGGAAACTATTTATCAAGTTCTCAGCACTGTTAGCCTTTTTTGTTTGATTTGTTCTGTTTTATAGTAAGCACTGCCAACTTTTTAATCCCTATGAACTACCTGAAGAATTAAGGACCTGATGTTGTTACTCCTGTCTGTTAGGGAGCCCTGGAATTCCAGGAGTAAAGGGCCAGAGAGGAACCCCAGGAGCCAAGGGGGAACAAGGAGATAAAGGAAATCCCGGGCCTTCAGAGATATCCCACGTAATAGGGGACAAAGGAGAACCAGGTCTCAAAGGTAAAGAATTGCTTGTTTGGAATCAGGACATCAGAGCTGATTCTCAGGCTAATAAATTATCCAGGCAAATCCGTT
Task1_train_5625
Here is a variant affecting COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
ATGCTGTAGGGAGAACCAGCAGTAGCCATGCCTGGAGGACCAGGAACACCAGGTTTTCCAGGAGAAAGAGGCAATTCTGGGGAACATGGAGAAATTGGACTCCCTGGACTTCCAGGTCTCCCTGGAACTCCAGGAAATGAAGGGCTTGATGGACCACGAGGTACAATAGCAAGTGTCATTACTTTTCTCCACTGTGAGCTCTGCTAAAATGCAGCAAACTGAATGTGAAGGTGTTCTAGGCATGAAGAATTCTCCCATCCAATGTTCCTGCCCTACCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCTTCCTTCTTTTTTAATGAGTGCCCTCTAGAAAAGGCATATTAATGGCAGTAAATATAGATCTGATTTAGGTGGAAAAAAAGTTAACAGAAGAATGACTGGTACAGCAATACCAAGACCTTAAGTTCTAGCACCTGGGTATATACTTGTGCTTTCTTTTGCAGGAGATCCAGGGCAGCCTGGACCACCTGGAGAACAAGGACCCCCAGGAAGGTGCATAGAGGGTCCCAGGGGAGCCCAAGGACTTCCAGGCTTAAATGGATTGAAAGGGCAACAAGGTAGGAGGAGGGCCTCAAAACTGGCCACCAGAAGGGCAGGAGACATGAGACTCCTGCTCTGTGCTTTGCTGCTTAACATGGGAACTGTCCAGCCACAAGTCCTGACCACTGTTCAATGAGAAATACTTCAGAAGTGTAAACCTTGCTGTTATGGGTTTGTTGCACACAGTAGTGTGTACCACCTATAAAGGAAGAAACTTGAAGTTAATATAGTGAGTTGCTTTGTGTCTTTTATGCAAGAAAAATATGAATGCTGAAGACAGAGATTGGTGTGTGTTTACATATATTTATATACATATTAAATTCTCAGAAAACATTTTACCTTTAATATTTTCATAAATATATTAAAGTGGTAAGTTTATCCTTATTATTAAAATAGGGTAAATGTATGCAATGATACCAGTTTAAAAACTTATAAACTAAAATATGTAGTTGATTGTTTTACATACAATATAAAAGAAAAAACATGAAAATAAATCTAAATGATGCAGGCTAGATGTTCCAGATGATGGAAAACTTTGTTTTTGGATCCTCTCCTCATCAGATCTGATGAACTGTTCCTGGAAAAATGTATTTAGAAATCAGTTAATGTCTGTGGTCTATCATACTGCTTATATGTTCACAAATAAATTTTTGACCAAGACCTTAACTGTTACAGTGGCATTATTATTTTTTCCAGAGGCATCCAGTGGCTTACCTCTATGCGAACGGCTCTGTATGTCTTCTGCAGGAAACAGAGTGAGCAGCACTCATAAGGTGCAGTCCCAGAATGTGTCTGCAGGACTAGAAAATAGATATAAAGACTACACTTGTATTACTGCATAAATCATTGGAGCAGAGAATGTTAGAGCCAGAAGGGAGCTCAGAAATTTTACAGAGGGGACATTAAATACATACACACACACATGCGCACGCATGCGTAAGTGTGCAGTTACCCCAAATCACAAAGCTAAATATTTACAGCCATAAAATATTTCTAAAGTGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAACTTAGCTATGCATTATGGTGCACGCCTGTAGTCCCAGCTATTTGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGCGGAGGGTACAGTGAGCCGAAATCGCCCCACTGCAATCCAGCCTAGAAGACAGAGGGAGATTCCATCTTAAAAATATATATATATATATATATATATATTTCTGAAGTTAGTAGGGGAAAGCATTTGTGGGTTAATTAATTCATTCATTTATTCGTACACAGGCAGAAGAGGTAAAACGGGGCCAAAGGGAGACCCAGGAATTCCAGGCTTGGATAGATCAGGATTTCCTGGAGAAACTGGATCACCAGGAATTCCAGGTCATCAAGGTGAAATGGGACCACTGGGTCAAAGAGGATATCCAGGAAATCCGGGAATTTTAGGGCCACCAGGTATCCTTTTGTGTGTTTCTATTTTTCTTCTTATTTCTTCTTCTTCTTAAGGTGGCTCTGTCAACTGTACATAGGCATACGCTTTTTACTCTATGCTTTTACTTAATATAAGGTTTTCCTTCTAAATTATTTGTAAGAAACCAGGGGCCATGGTGCAGGGAAACGGTGGCGGCAGGATGAACAATTACCCAGAATGTGGCTATTTTTGCTGTGTAATCCTTTTTATATACGACTACTATAATATACTTGCTAGTATTTTGTTGAGAATTTTTGCATTTATATTGAGAAGGGATATTGGTCTGTAGCGTTCTTGTGATGTCTTTGGTGTTGGTGTCAGAGTAATGCTGGTCTGATGGAACAAGCTGGGAAGTGTTTCCTCCTCTTGTATTTTCTGGAACAGTTTGTGAAGAATCGACGCTCTTTAAACATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGTTATCTGGGTCTGGGCATTTCTTTTTGGGAAGTCTCTAAATGACTAATTCAATCTCTTCATTTCTTATAGGTATATTCAGGTTTTCTATTTCTTCTGGAGTCAGTTTTGGTATTCTGTTTCTCTAGAAACTTGTCCATTTTTATAAGTTATCTGATTTGTTGTTGTTGTTCATCATATTTCTGTATAATTGTTTTAATTTCATGGCTATGTTTATTGTTTATATGTTTGGGGAGAATATTCTGTTCCCTCATGGCATAAGGACCTCACCGATCTCCCCTCTGGAAAAGAGCCTAAAACAACTTAATCGACACATTATCCTTTCATTCATGTTATTGGGCTACTATCACATGCCAGCATTCTTCTAGGCCCTAGAGACACATCAGTCAGTGGACAAGTCTCCCCTTCTCATAGTAGAGGATCAATAATAGAAATATTTAAAATCTAAGTTCAATTTGAGACAAGTGTTATGAAGAAAATAAAGTGAAGGGATAGAATAGAAAGTGACTGGTCAGGGGCTGGGAGGATGGAATGCTCCAAAACTTCCACATATGCTATCCTCATCCATGAATATGATTTGCTACCAATCACTTCCACATAGGTGAGTTTAAAAGACCACTTACCGACCCATCTCCTAGACTAATACAGTAATTGTACTATGTACAGAGGCCATTTTTTCAACTCCCAATCTCTGCTTCTAAGTATAATTTATTTTAGTATATGGAATATTTTGCTTTTCTCACTCTGTACAACACGTGCTGCTTTGTGTTAATTTGTTTCCATAGGTGAAGATGGAGTGATTGGGATGATGGGCTTTCCTGGAGCCATTGGCCCTCCAGGGCCCCCTGGGAACCCAGGCACACCAGGGCAGAGGGGTAAGTGATAGAGTGTCTTTCTAAATAGCAGGAAGCATAAACAATGTTCATTTATTTTGCAGCAAAAAAAGTTATGTTTCATTGGAGGGAAAAATAGTTCTGAGAGAGCAACAGTATTTGATTTTGCTGTTTTCTATGTTCCTTTTCTCCATTTGAATGGAATCCTGTTTTCTGTAGGCTTACACCACTACCCTTATGAGGCTGCCTGCCTGGGGAAACTATTTATCAAGTTCTCAGCACTGTTAGCCTTTTTTGTTTGATTTGTTCTGTTTTATAGTAAGCACTGCCAACTTTTTAATCCCTATGAACTACCTGAAGAATTAAGGACCTGATGTTGTTACTCCTGTCTGTTAGGGAGCCCTGGAATTCCAGGAGTAAAGGGCCAGAGAGGAACCCCAGGAGCCAAGGGGGAACAAGGAGATAAAGGAAATCCCGGGCCTTCAGAGATATCCCACGTAATAGGGGACAAAGGAGAACCAGGTCTCAAAGGTAAAGAATTGCTTGTTTGGAATCAGGACATCAGAGCTGATTCTCAGGCTAATAAATTATCCAGGCAAATCCGTTTGGTTGACAAATAAGGACAGTGAGGGCCAGTGTTTAGTTACCTGCCCATCACACAGCCGGTTGGTGGCTGAGCAGGCCTTAGAACTGAGTCACCTTCCACGACATG
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Task1_train_5626
An alteration has been detected in MFF-DT, COL4A3 (MFF divergent transcript| collagen type IV alpha 3 chain) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_5627
A variant on Chromosome 2 in gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
CCCATACAATCAGATAGGACAGTGGGTTTTTTCTTGTGATACAAAGTGGCCCATTTCTGCTGTACTCATCTCAGACTTATAAAAATAAATTTCCAAACCTTCTAATAAAAAACACTTGTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGACGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCTTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTTTTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGAGACACAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACACTTGTCTTACAAAGACTAACAAAAGATACAAAATAAAATAACTTTACAGCATCATTAGAAAGCGAACAAAATCCTAAGATAGATACATTTATCTTTCTTGTTTTAGAACTTTTTCTGTGTAATGGAATGGAAATGCTTAATCTTGTTTCAATGTTTTCAGTGTTTGTGCTTTGTCAAATTGAGGTTGGATGTTAAAGCCCTTACTACTGTATTATACAAAGCAGCAACCAGATGTTTCAATAGGGCTTGGCTGCTTTCTTAGGTTTATTCTCTTCCCAATTATCTGAGTACAGCTCTCACACTAAAAGCCAGAGATAGACCACTAGAGAATGATTAATAGAAGTTCCTATAAGCAGAAGTTGCTAACGTGGGATTCCATGGACCACTGGGAAAATCTATGGGATCCCAAGAAGCCCAGCAACCTCTTGAAACTAAATGCAAAATGTTTGAAAATGTTTTTGTAGGGTAGAGTCTATTTTTCAGATTTAGATTTTTAGATTTTCAACAGTATATGTATGACTCCAATATATAAAAAGTATTACTTAGGGAACCTTCTCCCTCTTTTTGGAGACAATAAAATACCACCTTTCCTAAATATTTCCACCAGCTATAGTCTCCAGTAGTAACTGCTAAAACAAGAAAAAAATTTAGACACTACACAGACCCAAGAAAGCAACTGTTTACTACTTGGAGCACAGACAAATGTCTTTGTTCTTTATATTTAGATTAAGTCCTCAGAAAACCTGAGATTGCTTCCACTGAGATATTTGCTCAACGAAAAATCCTATTTGACTTCACACTCAATTAACTGATAGTTTCATTTAGATTTAAAGTTTTCACAGGTAACCACCAGAATAAATTTTTAGAACTGTGCATTGAACACAAAATGAGCTGGTTTTATCATGTCAGCAAAATGAGAGTAACAGAGTAGTATATTTTAATTGGCTACCATAGAAATTTTGTAAATCTTTATCAAACCTATATGTTCGGGTTTGTCGTAAAACTGAAGTGAAGATTTAATGAACACTAAATCATTGGAAGGTTTTTAAAACATGTGATTGACATATGTGCATGCATAGCATTTGTAGGATACATCTTTATTTAGTCTATTTCTTTCTTACTCCCAGCTACTCATCACAATTTGTAACTATATATTTGTGTGATTATTTAATATCTATCTCCTTACTGGTCTCTGAAGCTCCATGAAGGCAGGGACTGTGTATGTCATAAATCTATATAGGTTACCATTATATCCTGGTAAAAGCTGGCTTCCTGGGTATGCTACCAGTGCAGTCACAGAAATCCTGTGCTAAGAAGGGCCTCCACACTTGGTCTGACGCTATGCTGTTGCTGTCTTGAAATTCACTTTAAAAAGTTTTAAGGGAAACTGCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATT
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Task1_train_5628
Consider a variant on Chromosome 2 in gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; not provided
ATCAGATAGGACAGTGGGTTTTTTCTTGTGATACAAAGTGGCCCATTTCTGCTGTACTCATCTCAGACTTATAAAAATAAATTTCCAAACCTTCTAATAAAAAACACTTGTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGACGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCTTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTTTTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGAGACACAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACACTTGTCTTACAAAGACTAACAAAAGATACAAAATAAAATAACTTTACAGCATCATTAGAAAGCGAACAAAATCCTAAGATAGATACATTTATCTTTCTTGTTTTAGAACTTTTTCTGTGTAATGGAATGGAAATGCTTAATCTTGTTTCAATGTTTTCAGTGTTTGTGCTTTGTCAAATTGAGGTTGGATGTTAAAGCCCTTACTACTGTATTATACAAAGCAGCAACCAGATGTTTCAATAGGGCTTGGCTGCTTTCTTAGGTTTATTCTCTTCCCAATTATCTGAGTACAGCTCTCACACTAAAAGCCAGAGATAGACCACTAGAGAATGATTAATAGAAGTTCCTATAAGCAGAAGTTGCTAACGTGGGATTCCATGGACCACTGGGAAAATCTATGGGATCCCAAGAAGCCCAGCAACCTCTTGAAACTAAATGCAAAATGTTTGAAAATGTTTTTGTAGGGTAGAGTCTATTTTTCAGATTTAGATTTTTAGATTTTCAACAGTATATGTATGACTCCAATATATAAAAAGTATTACTTAGGGAACCTTCTCCCTCTTTTTGGAGACAATAAAATACCACCTTTCCTAAATATTTCCACCAGCTATAGTCTCCAGTAGTAACTGCTAAAACAAGAAAAAAATTTAGACACTACACAGACCCAAGAAAGCAACTGTTTACTACTTGGAGCACAGACAAATGTCTTTGTTCTTTATATTTAGATTAAGTCCTCAGAAAACCTGAGATTGCTTCCACTGAGATATTTGCTCAACGAAAAATCCTATTTGACTTCACACTCAATTAACTGATAGTTTCATTTAGATTTAAAGTTTTCACAGGTAACCACCAGAATAAATTTTTAGAACTGTGCATTGAACACAAAATGAGCTGGTTTTATCATGTCAGCAAAATGAGAGTAACAGAGTAGTATATTTTAATTGGCTACCATAGAAATTTTGTAAATCTTTATCAAACCTATATGTTCGGGTTTGTCGTAAAACTGAAGTGAAGATTTAATGAACACTAAATCATTGGAAGGTTTTTAAAACATGTGATTGACATATGTGCATGCATAGCATTTGTAGGATACATCTTTATTTAGTCTATTTCTTTCTTACTCCCAGCTACTCATCACAATTTGTAACTATATATTTGTGTGATTATTTAATATCTATCTCCTTACTGGTCTCTGAAGCTCCATGAAGGCAGGGACTGTGTATGTCATAAATCTATATAGGTTACCATTATATCCTGGTAAAAGCTGGCTTCCTGGGTATGCTACCAGTGCAGTCACAGAAATCCTGTGCTAAGAAGGGCCTCCACACTTGGTCTGACGCTATGCTGTTGCTGTCTTGAAATTCACTTTAAAAAGTTTTAAGGGAAACTGCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTT
ATCAGATAGGACAGTGGGTTTTTTCTTGTGATACAAAGTGGCCCATTTCTGCTGTACTCATCTCAGACTTATAAAAATAAATTTCCAAACCTTCTAATAAAAAACACTTGTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGACGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCTTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTTTTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGAGACACAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACACTTGTCTTACAAAGACTAACAAAAGATACAAAATAAAATAACTTTACAGCATCATTAGAAAGCGAACAAAATCCTAAGATAGATACATTTATCTTTCTTGTTTTAGAACTTTTTCTGTGTAATGGAATGGAAATGCTTAATCTTGTTTCAATGTTTTCAGTGTTTGTGCTTTGTCAAATTGAGGTTGGATGTTAAAGCCCTTACTACTGTATTATACAAAGCAGCAACCAGATGTTTCAATAGGGCTTGGCTGCTTTCTTAGGTTTATTCTCTTCCCAATTATCTGAGTACAGCTCTCACACTAAAAGCCAGAGATAGACCACTAGAGAATGATTAATAGAAGTTCCTATAAGCAGAAGTTGCTAACGTGGGATTCCATGGACCACTGGGAAAATCTATGGGATCCCAAGAAGCCCAGCAACCTCTTGAAACTAAATGCAAAATGTTTGAAAATGTTTTTGTAGGGTAGAGTCTATTTTTCAGATTTAGATTTTTAGATTTTCAACAGTATATGTATGACTCCAATATATAAAAAGTATTACTTAGGGAACCTTCTCCCTCTTTTTGGAGACAATAAAATACCACCTTTCCTAAATATTTCCACCAGCTATAGTCTCCAGTAGTAACTGCTAAAACAAGAAAAAAATTTAGACACTACACAGACCCAAGAAAGCAACTGTTTACTACTTGGAGCACAGACAAATGTCTTTGTTCTTTATATTTAGATTAAGTCCTCAGAAAACCTGAGATTGCTTCCACTGAGATATTTGCTCAACGAAAAATCCTATTTGACTTCACACTCAATTAACTGATAGTTTCATTTAGATTTAAAGTTTTCACAGGTAACCACCAGAATAAATTTTTAGAACTGTGCATTGAACACAAAATGAGCTGGTTTTATCATGTCAGCAAAATGAGAGTAACAGAGTAGTATATTTTAATTGGCTACCATAGAAATTTTGTAAATCTTTATCAAACCTATATGTTCGGGTTTGTCGTAAAACTGAAGTGAAGATTTAATGAACACTAAATCATTGGAAGGTTTTTAAAACATGTGATTGACATATGTGCATGCATAGCATTTGTAGGATACATCTTTATTTAGTCTATTTCTTTCTTACTCCCAGCTACTCATCACAATTTGTAACTATATATTTGTGTGATTATTTAATATCTATCTCCTTACTGGTCTCTGAAGCTCCATGAAGGCAGGGACTGTGTATGTCATAAATCTATATAGGTTACCATTATATCCTGGTAAAAGCTGGCTTCCTGGGTATGCTACCAGTGCAGTCACAGAAATCCTGTGCTAAGAAGGGCCTCCACACTTGGTCTGACGCTATGCTGTTGCTGTCTTGAAATTCACTTTAAAAAGTTTTAAGGGAAACTGCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGAGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTT
Task1_train_5629
Gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
TGATACAAAGTGGCCCATTTCTGCTGTACTCATCTCAGACTTATAAAAATAAATTTCCAAACCTTCTAATAAAAAACACTTGTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGACGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCTTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTTTTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGAGACACAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACACTTGTCTTACAAAGACTAACAAAAGATACAAAATAAAATAACTTTACAGCATCATTAGAAAGCGAACAAAATCCTAAGATAGATACATTTATCTTTCTTGTTTTAGAACTTTTTCTGTGTAATGGAATGGAAATGCTTAATCTTGTTTCAATGTTTTCAGTGTTTGTGCTTTGTCAAATTGAGGTTGGATGTTAAAGCCCTTACTACTGTATTATACAAAGCAGCAACCAGATGTTTCAATAGGGCTTGGCTGCTTTCTTAGGTTTATTCTCTTCCCAATTATCTGAGTACAGCTCTCACACTAAAAGCCAGAGATAGACCACTAGAGAATGATTAATAGAAGTTCCTATAAGCAGAAGTTGCTAACGTGGGATTCCATGGACCACTGGGAAAATCTATGGGATCCCAAGAAGCCCAGCAACCTCTTGAAACTAAATGCAAAATGTTTGAAAATGTTTTTGTAGGGTAGAGTCTATTTTTCAGATTTAGATTTTTAGATTTTCAACAGTATATGTATGACTCCAATATATAAAAAGTATTACTTAGGGAACCTTCTCCCTCTTTTTGGAGACAATAAAATACCACCTTTCCTAAATATTTCCACCAGCTATAGTCTCCAGTAGTAACTGCTAAAACAAGAAAAAAATTTAGACACTACACAGACCCAAGAAAGCAACTGTTTACTACTTGGAGCACAGACAAATGTCTTTGTTCTTTATATTTAGATTAAGTCCTCAGAAAACCTGAGATTGCTTCCACTGAGATATTTGCTCAACGAAAAATCCTATTTGACTTCACACTCAATTAACTGATAGTTTCATTTAGATTTAAAGTTTTCACAGGTAACCACCAGAATAAATTTTTAGAACTGTGCATTGAACACAAAATGAGCTGGTTTTATCATGTCAGCAAAATGAGAGTAACAGAGTAGTATATTTTAATTGGCTACCATAGAAATTTTGTAAATCTTTATCAAACCTATATGTTCGGGTTTGTCGTAAAACTGAAGTGAAGATTTAATGAACACTAAATCATTGGAAGGTTTTTAAAACATGTGATTGACATATGTGCATGCATAGCATTTGTAGGATACATCTTTATTTAGTCTATTTCTTTCTTACTCCCAGCTACTCATCACAATTTGTAACTATATATTTGTGTGATTATTTAATATCTATCTCCTTACTGGTCTCTGAAGCTCCATGAAGGCAGGGACTGTGTATGTCATAAATCTATATAGGTTACCATTATATCCTGGTAAAAGCTGGCTTCCTGGGTATGCTACCAGTGCAGTCACAGAAATCCTGTGCTAAGAAGGGCCTCCACACTTGGTCTGACGCTATGCTGTTGCTGTCTTGAAATTCACTTTAAAAAGTTTTAAGGGAAACTGCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTTCAGGTTTATTGAGGGCCCCTCCAGGCCC
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Task1_train_5630
The gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Benign familial hematuria
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Task1_train_5631
This sequence variant lies in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
CTTGAAATTCACTTTAAAAAGTTTTAAGGGAAACTGCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTTCAGGTTTATTGAGGGCCCCTCCAGGCCCAAGAGGGAACCCTGGTGCTCAAGGTAAGCAGTTCTTCTTCCCTGTCCTAATGTACACATTTTCAAGGAGAGAAAGCAGTTGAATATGCTTGAAATATAAAGTAAGCTTAACCTAGTGAATTAAAGATGTTCCAATAGTAATACAGGATATTTATCATCTTGGTCTTCAATTTAAAATGTTTAATTATTACCATCACAACAAATGGAATGAATTAGAAACTGTGATTCAATTTTGGAATTTCCTACTAAGAAAGTCTTGAAAAGTAAAAAGGATTCTTCTGTATATGTCTTGCTGTTGTTAGCATGGTTTAAAGATACCACCTCCTAAAAGGTGAAGGTGGAACTGATGGGTTCTCAGTAAGCATCTGTCCCTGCTGTTCTGAGACACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGA
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Task1_train_5632
This sequence change occurs on Chromosome 2, altering COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Autosomal recessive Alport syndrome
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Task1_train_5633
This variant affects gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Benign familial hematuria
CTTGAAATTCACTTTAAAAAGTTTTAAGGGAAACTGCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTTCAGGTTTATTGAGGGCCCCTCCAGGCCCAAGAGGGAACCCTGGTGCTCAAGGTAAGCAGTTCTTCTTCCCTGTCCTAATGTACACATTTTCAAGGAGAGAAAGCAGTTGAATATGCTTGAAATATAAAGTAAGCTTAACCTAGTGAATTAAAGATGTTCCAATAGTAATACAGGATATTTATCATCTTGGTCTTCAATTTAAAATGTTTAATTATTACCATCACAACAAATGGAATGAATTAGAAACTGTGATTCAATTTTGGAATTTCCTACTAAGAAAGTCTTGAAAAGTAAAAAGGATTCTTCTGTATATGTCTTGCTGTTGTTAGCATGGTTTAAAGATACCACCTCCTAAAAGGTGAAGGTGGAACTGATGGGTTCTCAGTAAGCATCTGTCCCTGCTGTTCTGAGACACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGA
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Task1_train_5634
A variant has been detected on Chromosome 2 in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Autosomal recessive Alport syndrome
GCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTTCAGGTTTATTGAGGGCCCCTCCAGGCCCAAGAGGGAACCCTGGTGCTCAAGGTAAGCAGTTCTTCTTCCCTGTCCTAATGTACACATTTTCAAGGAGAGAAAGCAGTTGAATATGCTTGAAATATAAAGTAAGCTTAACCTAGTGAATTAAAGATGTTCCAATAGTAATACAGGATATTTATCATCTTGGTCTTCAATTTAAAATGTTTAATTATTACCATCACAACAAATGGAATGAATTAGAAACTGTGATTCAATTTTGGAATTTCCTACTAAGAAAGTCTTGAAAAGTAAAAAGGATTCTTCTGTATATGTCTTGCTGTTGTTAGCATGGTTTAAAGATACCACCTCCTAAAAGGTGAAGGTGGAACTGATGGGTTCTCAGTAAGCATCTGTCCCTGCTGTTCTGAGACACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGT
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Task1_train_5635
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Hematuria, benign familial, 2
GCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTTCAGGTTTATTGAGGGCCCCTCCAGGCCCAAGAGGGAACCCTGGTGCTCAAGGTAAGCAGTTCTTCTTCCCTGTCCTAATGTACACATTTTCAAGGAGAGAAAGCAGTTGAATATGCTTGAAATATAAAGTAAGCTTAACCTAGTGAATTAAAGATGTTCCAATAGTAATACAGGATATTTATCATCTTGGTCTTCAATTTAAAATGTTTAATTATTACCATCACAACAAATGGAATGAATTAGAAACTGTGATTCAATTTTGGAATTTCCTACTAAGAAAGTCTTGAAAAGTAAAAAGGATTCTTCTGTATATGTCTTGCTGTTGTTAGCATGGTTTAAAGATACCACCTCCTAAAAGGTGAAGGTGGAACTGATGGGTTCTCAGTAAGCATCTGTCCCTGCTGTTCTGAGACACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGT
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Task1_train_5636
A variant on Chromosome 2 in gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Alport syndrome 3b, autosomal recessive
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Task1_train_5637
A variant on Chromosome 2 in gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
GCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTTCAGGTTTATTGAGGGCCCCTCCAGGCCCAAGAGGGAACCCTGGTGCTCAAGGTAAGCAGTTCTTCTTCCCTGTCCTAATGTACACATTTTCAAGGAGAGAAAGCAGTTGAATATGCTTGAAATATAAAGTAAGCTTAACCTAGTGAATTAAAGATGTTCCAATAGTAATACAGGATATTTATCATCTTGGTCTTCAATTTAAAATGTTTAATTATTACCATCACAACAAATGGAATGAATTAGAAACTGTGATTCAATTTTGGAATTTCCTACTAAGAAAGTCTTGAAAAGTAAAAAGGATTCTTCTGTATATGTCTTGCTGTTGTTAGCATGGTTTAAAGATACCACCTCCTAAAAGGTGAAGGTGGAACTGATGGGTTCTCAGTAAGCATCTGTCCCTGCTGTTCTGAGACACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGT
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Task1_train_5638
Gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Alport syndrome
GCATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTTCAGGTTTATTGAGGGCCCCTCCAGGCCCAAGAGGGAACCCTGGTGCTCAAGGTAAGCAGTTCTTCTTCCCTGTCCTAATGTACACATTTTCAAGGAGAGAAAGCAGTTGAATATGCTTGAAATATAAAGTAAGCTTAACCTAGTGAATTAAAGATGTTCCAATAGTAATACAGGATATTTATCATCTTGGTCTTCAATTTAAAATGTTTAATTATTACCATCACAACAAATGGAATGAATTAGAAACTGTGATTCAATTTTGGAATTTCCTACTAAGAAAGTCTTGAAAAGTAAAAAGGATTCTTCTGTATATGTCTTGCTGTTGTTAGCATGGTTTAAAGATACCACCTCCTAAAAGGTGAAGGTGGAACTGATGGGTTCTCAGTAAGCATCTGTCCCTGCTGTTCTGAGACACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGT
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Task1_train_5639
This mutation is located in gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
CATTTTCATTTTGCACTGGGCCCCATAAACCATGTGGCCGTCTTATTCCCAGCACCTATCACAGTGCTGGCAGATAGCAGATACTAATATGAATTGATGAATGAATGAAAAAATTAGTGAATAAAGTTTATGCTGAATTCTTACCACATATCCTGCTTATATGAGAATTTTAAAGGTATTTGACTACATTTAAGGGGGATCCAGGACTGCCGGGTGATATGGGAAAGAAAGGAGAAATGGGGCAACCTGGCCCACCTGGACATTTGGGGCCTGCTGGACCTGAGGGAGCCCCTGGAAGTCCTGGAAGTCCTGGCCTCCCAGGTAAGGCTTGAGTTTACAATTCTAAAAGCTGGAAGCATTACTCAGAGTATAGCCCTCCTGAAATCATTGTGGTAAACAGAAAGCTATTTATACTTTTATGCTGCAGTTGCTTTTATTCAACTTTGAACTTCAAATTCTAACACACTAAGAGAATTCATTAAGAGAGCCCAATTTTACTAATCAGCCCATTTGGACTGAAATACAAAAATATGTTCCTATAAAAAACACTTTTGAAGAACTGCCTCAACAAATTCAGCCCAAGGATACAAAATGTTAGCCGTTATACAATCATAATGTTTGTATTAGTTTGTCCAGGCTTCCATAGTGAATTCCACAGACTAGGTGGCTTAAACTACACTTGATGTTAGCCAAAAGGCTGAGAAGTGATTAGGTGGCTTAAACTACAGATGTTTATTTTCTCACAGTTCCAGCAGCTCCGAGTCTGTGATCAAGCTGTCGGCAGCGTTGGTTTCTTGTGGGGCCCCTGTTCTTGGCTTGTGGATGGCTATCTTCTTCCAGTGTTTTCCAAGTGTCTGAATCTTCTTTTCTTATAAAGACACCACTCACATTGGATTAGGGCCCACCCTACTGACCTCATTTTAATTTAATTACCTGTTTACCAGCCCTATCCCCAAATACAGAGTCATGTTCCGAAGTACTGAAGGTTAGGACTTCAGCATATGAATTTGGGGACAACACAATTCAAACTACAACACTGTGCTGTGACTCTTTTTCGAACCCATTTCTGGATTGAATTTTGGCTTTCTGGCTTATTAGCTTACAATTCAGGTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAAAACAACTGTGAAACTATCGGGTTGCAGATTCAGGTCTTACTTAAATACAATAAACTACCTGTTCAAATACAGAAAGTTTCAATAAATTTGCATTTAACTCGCAATTAAAATAAAATCGCATATTGAGTGGTGCTTGTGGTTGGTGTACACACATCTTTGAAAGTGATTAGACACATCTCTGCACTGGTTCTCCAGGAAAATTGCAGCCTGGACAAAATCATGGGGTGACCTTGCAACAAGAGAGCTTCCTTAAGGCCAGCGTGAGCATGGTTGACTATAAAAACAGACCGTTTCAGTCACTGTTGTAATCATTTATCTTTTGGTGATCTTTTTTCTTCCTTCCCCTCTCTTCATTTCCAGGAAAGCCAGGTCCTCATGGTGATTTGGGTTTTAAAGGAATCAAAGGCCTCCTGGGCCCTCCAGGAATCAGAGGCCCTCCAGGTTTCATTTTTGTACTTTCTCTTTTTCCTTTTCATGTGGGAGACACATTTTCTCCTGAGGTTTGGATTTCTGTAAACCTACTACTCTATAGAAGGTAGCTCCTAGTTACTCAGTATCCAGACAAAAATGCAAAAAAAATGGGGTTAGATATTTCTATCTATTTAATTCAAATATTTGGCAACCTATTCCAAACTGATAATCCTCATGATAATAGTAATCTGTATGTGGTTTTCCCTGGGAACATAGCTTCACATAGCTACAGTTCTGAAAAACAGCCTGTTTAACACAATTCCACACATCTCCCTGGTATTCCCATTAGGCCACTGGCAAGAAATAAATCCTCTTTTTGTATACCATAGTTTGGGGTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCTTCCAGGATTTCCAGGATCTCCTGGACCAATGGGTATAAGAGGTGACCAAGGACGTGATGGAATTCCTGGTCCAGCCGGAGAAAAGGGAGAAACGGGTACAACTTGCTCATTATCTTTGATCCGTTAGTTTTATTTTGGATAGAATCATTAGTAACAGTGTAATCCTTTGCTGCTCTAAAGATTTTTCTCTGATAGAACTGATTATCTTTAACATGTTTTCGGTGTGTACTAAACTTTTCTCATAGACATATAATGTAATGAAATTGACCAATTATTAACATGCCAAGATTATCTCTTTCAGGTTTATTGAGGGCCCCTCCAGGCCCAAGAGGGAACCCTGGTGCTCAAGGTAAGCAGTTCTTCTTCCCTGTCCTAATGTACACATTTTCAAGGAGAGAAAGCAGTTGAATATGCTTGAAATATAAAGTAAGCTTAACCTAGTGAATTAAAGATGTTCCAATAGTAATACAGGATATTTATCATCTTGGTCTTCAATTTAAAATGTTTAATTATTACCATCACAACAAATGGAATGAATTAGAAACTGTGATTCAATTTTGGAATTTCCTACTAAGAAAGTCTTGAAAAGTAAAAAGGATTCTTCTGTATATGTCTTGCTGTTGTTAGCATGGTTTAAAGATACCACCTCCTAAAAGGTGAAGGTGGAACTGATGGGTTCTCAGTAAGCATCTGTCCCTGCTGTTCTGAGACACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGTA
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Task1_train_5640
Here is a genetic alteration in MFF-DT, COL4A3 (MFF divergent transcript| collagen type IV alpha 3 chain) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
ACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGTATTCCTATTATGGGGAATGTGTGGGGAAGTTAACTAAAGGACAGAATAAAGACTGCAATTTTGTTGCTCCTTTGTCTGGATTTAGCTGGATAATACTTCAAATGCACACATCAGTGCTACGCAGTTTAGCTTCTTATGCTCTAATGAATTATCAGTGACTCAACAATGTCAACATGACTAAGTTAATCAGCTGATAATAACTGGCTTATATTTATATAACACTTTAGAGCTTACACCATGCTTTTATGTCTGTATGTTATCTCACTTGATCTGAAAGAATTAGCTAGAACAGGTATTACCTTCATTTTTTAAAATAAGAAAATCAAAATTTGTAATAGTAGGTAAATCTGAAGTGACTTTGCCAAGATCAGACAGCTAGTTGGAGACAGACTGAGTCTCAACTCAGTTTTTGTAGCTCTATATTGCATTTACCAGCAATATATTATAAAATATATATTTTAGAAACATATATTCTGAATCTGAACACTTTTAAGCAAAGTACCTACATTATTAAAGATAGTCAAGAACTCTAACCCAAGCATATGGGCATTAAAGAAACTTATTAAGCCTTCTTCTTTGCAGGAGCCAAAGGAGACAGGGGAGCCCCAGGTTTTCCTGGCCTCCCGGGCAGAAAAGGGGCCATGGGAGATGCTGGACCTCGAGGACCCACAGGCATAGAAGGATTCCCAGGGCCACCAGGTCTGCCCGGTGCAATTATCCCTGGCCAGACAGGAAATCGTGGTCCACCAGGCTCAAGAGGAAGCCCAGGTAAAGGGTTTACTTTTAAACAGCATAAAATAACAAAAATCATGTTTGACCTCAAAAGTTTTCAACCTCCTCCTCATGTTACCTTGTTGCTTCTTCTTTCCCTGTGGTCATCTCCATTCCCCCACTACCTGTGGTTCCCATACCCAGCAGTTGTCAAGGCAAGGTAGCCTGTTTGAGGGATGCATAGTTAATAAATTAACGAGCCTGGCTGGACGCAGTGGCTCACACCCGTAATCCCAGCACTTTGGTAGGCCAAGGCAGACGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGTCTTGCTTGGTGGTGCATGCCTGTAATACCGGCAACTCAGGAGGCTGAGATGGGAGAACCTCTTAAACCTGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAACAAAACTGTATCAAAAAAAAATAATTAGCCTAAAAGACAGTGATGCATTCATTCAACTCTATTTGTTGAATCCCTAGAGCTGGGCTAGGCTCTAGGGAAGCAGGCACAGACCCTGCTGTAACAGACCCTCACTGGGGAGAAGCAGATCCTGCTGGTGGGTGCCAGGTGCTTCGCTGGCATCATCTTCTCCTGTCTTTACCACAATCCCATCACATGCTCCAGGGGAAAGAATGTTTGTGGCAATGCTAAGTGAAGGGTTTATACTTCATTAGAAACAATCACTGATAAATAGAACCTTCCAAGCTCCCTGGCTGGCAATACTGACAGACTTTTCATGAATTCAGGTGCGCCTGGTCCCCCTGGACCTCCAGGGAGTCATGTAATAGGCATAAAAGGAGACAAAGGGTCTATGGGCCACCCTGGCCCAAAAGGTCCACCTGGAACTGCAGGAGACATGGGACCACCAGGTCGTCTGGTGAGTATGGATAATTATTTTGACTCATTATTAATTCAATATCAACTTATAATTATTCTTATATTGTATATTATATCATATATTGTTGATGTTAACTGTATTAGTCCATTCTCATGATGTTAATAAAGACATACCCGAGACTGGGTAATTTATAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAATTCTACATGGCTGGGGAGACCTCAAGAAACTTATAATCATGGCAGAAGGCACCTCTTCACACTGCAACAGGAGAGAGAATGAGTGCCAAGCAAAAGGGGAAGCCCCTTATAAAACCATCAGATCGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGAGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCAAAACAAACAAACAAACAAAACCATCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTACCATGAGAATGGCATGGGGGAAACCACCCCCATGATTCAATTACCTCCCACTGGGTCCTTCCCAGGACATGTGGGGATTATAGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGCCAAACCATATCATTAACATTGACTTATCGTTAGTACAAGAGTACTATTATACTCTTATAAATTAATTGCCAGATCAGATGGGCCTGGAGGCAGCAAAAATTTACAATTTTTGATGCATCTGTGCAGTGTGCCTAAGGGAACACAGTCCAGAAGTTTCTGAAAATCAAAAAATCTTCAGAGTTGGAATGATTTGGCCTCTAAGAGGCCTC
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Task1_train_5641
Consider this mutation in MFF-DT, COL4A3 (MFF divergent transcript| collagen type IV alpha 3 chain) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Hematuria, benign familial, 2
ACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGTATTCCTATTATGGGGAATGTGTGGGGAAGTTAACTAAAGGACAGAATAAAGACTGCAATTTTGTTGCTCCTTTGTCTGGATTTAGCTGGATAATACTTCAAATGCACACATCAGTGCTACGCAGTTTAGCTTCTTATGCTCTAATGAATTATCAGTGACTCAACAATGTCAACATGACTAAGTTAATCAGCTGATAATAACTGGCTTATATTTATATAACACTTTAGAGCTTACACCATGCTTTTATGTCTGTATGTTATCTCACTTGATCTGAAAGAATTAGCTAGAACAGGTATTACCTTCATTTTTTAAAATAAGAAAATCAAAATTTGTAATAGTAGGTAAATCTGAAGTGACTTTGCCAAGATCAGACAGCTAGTTGGAGACAGACTGAGTCTCAACTCAGTTTTTGTAGCTCTATATTGCATTTACCAGCAATATATTATAAAATATATATTTTAGAAACATATATTCTGAATCTGAACACTTTTAAGCAAAGTACCTACATTATTAAAGATAGTCAAGAACTCTAACCCAAGCATATGGGCATTAAAGAAACTTATTAAGCCTTCTTCTTTGCAGGAGCCAAAGGAGACAGGGGAGCCCCAGGTTTTCCTGGCCTCCCGGGCAGAAAAGGGGCCATGGGAGATGCTGGACCTCGAGGACCCACAGGCATAGAAGGATTCCCAGGGCCACCAGGTCTGCCCGGTGCAATTATCCCTGGCCAGACAGGAAATCGTGGTCCACCAGGCTCAAGAGGAAGCCCAGGTAAAGGGTTTACTTTTAAACAGCATAAAATAACAAAAATCATGTTTGACCTCAAAAGTTTTCAACCTCCTCCTCATGTTACCTTGTTGCTTCTTCTTTCCCTGTGGTCATCTCCATTCCCCCACTACCTGTGGTTCCCATACCCAGCAGTTGTCAAGGCAAGGTAGCCTGTTTGAGGGATGCATAGTTAATAAATTAACGAGCCTGGCTGGACGCAGTGGCTCACACCCGTAATCCCAGCACTTTGGTAGGCCAAGGCAGACGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGTCTTGCTTGGTGGTGCATGCCTGTAATACCGGCAACTCAGGAGGCTGAGATGGGAGAACCTCTTAAACCTGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAACAAAACTGTATCAAAAAAAAATAATTAGCCTAAAAGACAGTGATGCATTCATTCAACTCTATTTGTTGAATCCCTAGAGCTGGGCTAGGCTCTAGGGAAGCAGGCACAGACCCTGCTGTAACAGACCCTCACTGGGGAGAAGCAGATCCTGCTGGTGGGTGCCAGGTGCTTCGCTGGCATCATCTTCTCCTGTCTTTACCACAATCCCATCACATGCTCCAGGGGAAAGAATGTTTGTGGCAATGCTAAGTGAAGGGTTTATACTTCATTAGAAACAATCACTGATAAATAGAACCTTCCAAGCTCCCTGGCTGGCAATACTGACAGACTTTTCATGAATTCAGGTGCGCCTGGTCCCCCTGGACCTCCAGGGAGTCATGTAATAGGCATAAAAGGAGACAAAGGGTCTATGGGCCACCCTGGCCCAAAAGGTCCACCTGGAACTGCAGGAGACATGGGACCACCAGGTCGTCTGGTGAGTATGGATAATTATTTTGACTCATTATTAATTCAATATCAACTTATAATTATTCTTATATTGTATATTATATCATATATTGTTGATGTTAACTGTATTAGTCCATTCTCATGATGTTAATAAAGACATACCCGAGACTGGGTAATTTATAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAATTCTACATGGCTGGGGAGACCTCAAGAAACTTATAATCATGGCAGAAGGCACCTCTTCACACTGCAACAGGAGAGAGAATGAGTGCCAAGCAAAAGGGGAAGCCCCTTATAAAACCATCAGATCGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGAGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCAAAACAAACAAACAAACAAAACCATCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTACCATGAGAATGGCATGGGGGAAACCACCCCCATGATTCAATTACCTCCCACTGGGTCCTTCCCAGGACATGTGGGGATTATAGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGCCAAACCATATCATTAACATTGACTTATCGTTAGTACAAGAGTACTATTATACTCTTATAAATTAATTGCCAGATCAGATGGGCCTGGAGGCAGCAAAAATTTACAATTTTTGATGCATCTGTGCAGTGTGCCTAAGGGAACACAGTCCAGAAGTTTCTGAAAATCAAAAAATCTTCAGAGTTGGAATGATTTGGCCTCTAAGAGGCCTC
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Task1_train_5642
The gene MFF-DT, COL4A3 (MFF divergent transcript| collagen type IV alpha 3 chain) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Alport syndrome 3b, autosomal recessive
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Task1_train_5643
Mutation context: Chromosome 2, Gene MFF-DT, COL4A3 (MFF divergent transcript| collagen type IV alpha 3 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
ACAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGTATTCCTATTATGGGGAATGTGTGGGGAAGTTAACTAAAGGACAGAATAAAGACTGCAATTTTGTTGCTCCTTTGTCTGGATTTAGCTGGATAATACTTCAAATGCACACATCAGTGCTACGCAGTTTAGCTTCTTATGCTCTAATGAATTATCAGTGACTCAACAATGTCAACATGACTAAGTTAATCAGCTGATAATAACTGGCTTATATTTATATAACACTTTAGAGCTTACACCATGCTTTTATGTCTGTATGTTATCTCACTTGATCTGAAAGAATTAGCTAGAACAGGTATTACCTTCATTTTTTAAAATAAGAAAATCAAAATTTGTAATAGTAGGTAAATCTGAAGTGACTTTGCCAAGATCAGACAGCTAGTTGGAGACAGACTGAGTCTCAACTCAGTTTTTGTAGCTCTATATTGCATTTACCAGCAATATATTATAAAATATATATTTTAGAAACATATATTCTGAATCTGAACACTTTTAAGCAAAGTACCTACATTATTAAAGATAGTCAAGAACTCTAACCCAAGCATATGGGCATTAAAGAAACTTATTAAGCCTTCTTCTTTGCAGGAGCCAAAGGAGACAGGGGAGCCCCAGGTTTTCCTGGCCTCCCGGGCAGAAAAGGGGCCATGGGAGATGCTGGACCTCGAGGACCCACAGGCATAGAAGGATTCCCAGGGCCACCAGGTCTGCCCGGTGCAATTATCCCTGGCCAGACAGGAAATCGTGGTCCACCAGGCTCAAGAGGAAGCCCAGGTAAAGGGTTTACTTTTAAACAGCATAAAATAACAAAAATCATGTTTGACCTCAAAAGTTTTCAACCTCCTCCTCATGTTACCTTGTTGCTTCTTCTTTCCCTGTGGTCATCTCCATTCCCCCACTACCTGTGGTTCCCATACCCAGCAGTTGTCAAGGCAAGGTAGCCTGTTTGAGGGATGCATAGTTAATAAATTAACGAGCCTGGCTGGACGCAGTGGCTCACACCCGTAATCCCAGCACTTTGGTAGGCCAAGGCAGACGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGTCTTGCTTGGTGGTGCATGCCTGTAATACCGGCAACTCAGGAGGCTGAGATGGGAGAACCTCTTAAACCTGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAACAAAACTGTATCAAAAAAAAATAATTAGCCTAAAAGACAGTGATGCATTCATTCAACTCTATTTGTTGAATCCCTAGAGCTGGGCTAGGCTCTAGGGAAGCAGGCACAGACCCTGCTGTAACAGACCCTCACTGGGGAGAAGCAGATCCTGCTGGTGGGTGCCAGGTGCTTCGCTGGCATCATCTTCTCCTGTCTTTACCACAATCCCATCACATGCTCCAGGGGAAAGAATGTTTGTGGCAATGCTAAGTGAAGGGTTTATACTTCATTAGAAACAATCACTGATAAATAGAACCTTCCAAGCTCCCTGGCTGGCAATACTGACAGACTTTTCATGAATTCAGGTGCGCCTGGTCCCCCTGGACCTCCAGGGAGTCATGTAATAGGCATAAAAGGAGACAAAGGGTCTATGGGCCACCCTGGCCCAAAAGGTCCACCTGGAACTGCAGGAGACATGGGACCACCAGGTCGTCTGGTGAGTATGGATAATTATTTTGACTCATTATTAATTCAATATCAACTTATAATTATTCTTATATTGTATATTATATCATATATTGTTGATGTTAACTGTATTAGTCCATTCTCATGATGTTAATAAAGACATACCCGAGACTGGGTAATTTATAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAATTCTACATGGCTGGGGAGACCTCAAGAAACTTATAATCATGGCAGAAGGCACCTCTTCACACTGCAACAGGAGAGAGAATGAGTGCCAAGCAAAAGGGGAAGCCCCTTATAAAACCATCAGATCGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGAGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCAAAACAAACAAACAAACAAAACCATCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTACCATGAGAATGGCATGGGGGAAACCACCCCCATGATTCAATTACCTCCCACTGGGTCCTTCCCAGGACATGTGGGGATTATAGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGCCAAACCATATCATTAACATTGACTTATCGTTAGTACAAGAGTACTATTATACTCTTATAAATTAATTGCCAGATCAGATGGGCCTGGAGGCAGCAAAAATTTACAATTTTTGATGCATCTGTGCAGTGTGCCTAAGGGAACACAGTCCAGAAGTTTCTGAAAATCAAAAAATCTTCAGAGTTGGAATGATTTGGCCTCTAAGAGGCCTC
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Task1_train_5644
Given this context: Chromosome 2, gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
CAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGTATTCCTATTATGGGGAATGTGTGGGGAAGTTAACTAAAGGACAGAATAAAGACTGCAATTTTGTTGCTCCTTTGTCTGGATTTAGCTGGATAATACTTCAAATGCACACATCAGTGCTACGCAGTTTAGCTTCTTATGCTCTAATGAATTATCAGTGACTCAACAATGTCAACATGACTAAGTTAATCAGCTGATAATAACTGGCTTATATTTATATAACACTTTAGAGCTTACACCATGCTTTTATGTCTGTATGTTATCTCACTTGATCTGAAAGAATTAGCTAGAACAGGTATTACCTTCATTTTTTAAAATAAGAAAATCAAAATTTGTAATAGTAGGTAAATCTGAAGTGACTTTGCCAAGATCAGACAGCTAGTTGGAGACAGACTGAGTCTCAACTCAGTTTTTGTAGCTCTATATTGCATTTACCAGCAATATATTATAAAATATATATTTTAGAAACATATATTCTGAATCTGAACACTTTTAAGCAAAGTACCTACATTATTAAAGATAGTCAAGAACTCTAACCCAAGCATATGGGCATTAAAGAAACTTATTAAGCCTTCTTCTTTGCAGGAGCCAAAGGAGACAGGGGAGCCCCAGGTTTTCCTGGCCTCCCGGGCAGAAAAGGGGCCATGGGAGATGCTGGACCTCGAGGACCCACAGGCATAGAAGGATTCCCAGGGCCACCAGGTCTGCCCGGTGCAATTATCCCTGGCCAGACAGGAAATCGTGGTCCACCAGGCTCAAGAGGAAGCCCAGGTAAAGGGTTTACTTTTAAACAGCATAAAATAACAAAAATCATGTTTGACCTCAAAAGTTTTCAACCTCCTCCTCATGTTACCTTGTTGCTTCTTCTTTCCCTGTGGTCATCTCCATTCCCCCACTACCTGTGGTTCCCATACCCAGCAGTTGTCAAGGCAAGGTAGCCTGTTTGAGGGATGCATAGTTAATAAATTAACGAGCCTGGCTGGACGCAGTGGCTCACACCCGTAATCCCAGCACTTTGGTAGGCCAAGGCAGACGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGTCTTGCTTGGTGGTGCATGCCTGTAATACCGGCAACTCAGGAGGCTGAGATGGGAGAACCTCTTAAACCTGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAACAAAACTGTATCAAAAAAAAATAATTAGCCTAAAAGACAGTGATGCATTCATTCAACTCTATTTGTTGAATCCCTAGAGCTGGGCTAGGCTCTAGGGAAGCAGGCACAGACCCTGCTGTAACAGACCCTCACTGGGGAGAAGCAGATCCTGCTGGTGGGTGCCAGGTGCTTCGCTGGCATCATCTTCTCCTGTCTTTACCACAATCCCATCACATGCTCCAGGGGAAAGAATGTTTGTGGCAATGCTAAGTGAAGGGTTTATACTTCATTAGAAACAATCACTGATAAATAGAACCTTCCAAGCTCCCTGGCTGGCAATACTGACAGACTTTTCATGAATTCAGGTGCGCCTGGTCCCCCTGGACCTCCAGGGAGTCATGTAATAGGCATAAAAGGAGACAAAGGGTCTATGGGCCACCCTGGCCCAAAAGGTCCACCTGGAACTGCAGGAGACATGGGACCACCAGGTCGTCTGGTGAGTATGGATAATTATTTTGACTCATTATTAATTCAATATCAACTTATAATTATTCTTATATTGTATATTATATCATATATTGTTGATGTTAACTGTATTAGTCCATTCTCATGATGTTAATAAAGACATACCCGAGACTGGGTAATTTATAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAATTCTACATGGCTGGGGAGACCTCAAGAAACTTATAATCATGGCAGAAGGCACCTCTTCACACTGCAACAGGAGAGAGAATGAGTGCCAAGCAAAAGGGGAAGCCCCTTATAAAACCATCAGATCGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGAGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCAAAACAAACAAACAAACAAAACCATCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTACCATGAGAATGGCATGGGGGAAACCACCCCCATGATTCAATTACCTCCCACTGGGTCCTTCCCAGGACATGTGGGGATTATAGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGCCAAACCATATCATTAACATTGACTTATCGTTAGTACAAGAGTACTATTATACTCTTATAAATTAATTGCCAGATCAGATGGGCCTGGAGGCAGCAAAAATTTACAATTTTTGATGCATCTGTGCAGTGTGCCTAAGGGAACACAGTCCAGAAGTTTCTGAAAATCAAAAAATCTTCAGAGTTGGAATGATTTGGCCTCTAAGAGGCCTCC
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Task1_train_5645
Assess the clinical impact of this variant on gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Autosomal recessive Alport syndrome
CAGGAGTAATCCGAATCCTTTCCCACCTGTATCTTCATAGGTCTGACTCCAACCCCCAGATCCAGCTTGCGGTCCATGCTATTGTTTATTAAAGGCGACCCAGAGAGTCTCTCAACATCTCAGACATGGCAGTTTACTGAACATGTCATTCAGAGTATTTACAAGTTTTTTGTTTGGCAGGCCACAGATCTGGATTTCTCATGTCAGTGCTTTACAAGATAAACAGCTTCTTTTAACTCTTTTCCATTTTCTAGTCAAACCTTCCAGGAGAAACATCAGATTGTTTGCACATTTCATTGACCCGTCTCAGCCACGCGTCCTATGAATGGGAGCATTTCATTAGCAAAGAGGCCTAACACACTGAAGGGCTCTAGTTATTGATGTTCACGCAAACCAGCAAAGAGCAGCTGGATGCCAATGAGAAACTCAGTTGGGCAGGAACCACCTCTTGACAAAACAGTTAAAGTGTAAAAGTAGACAAGAGCTGTTCTCTCCCATTTGTTTCTTACTGGTTTGATTGTTCTTTCGGTTGAGCTCAGTCTTCCCACATCTCTCAGACCTCTCCTTTCCCAATGAGGATGAAGGCTCTTCCTGTTCCACAGTGTAGCTTTAGAATTTTGGTCAAAAGGAGAGTTGCTCTTCATGTTCCCAGGGTAACTCACAGTTTAACCATTTGGAATGAGAACACTAGCTTTTAACTGGAAATAAAATTTGGTATAAAACGGTCATACCTTAGGTTTAAAAGCCTTAAAACTAACAAATAGCCTAATTATGTAAGTGAATGATTATGCACCTCAATCCCTCTAGGATAACTAAATATGGAGAAGAGTTCATTGAGACTTGGAAGGTATGAATCCTTTTAATTAGTTTATTCTCCCAAATCCTAAAAAGAAATCATATTGCAGAGCATGTAATCATTTTAATGAACATGAAATATATAATCCAAGCCATCTTGGTACTTCAGGTCATTGCCATGCAAATACAGTATTACAAAGCTTGGAGTGAACTGAAGTCATCTAAGCACTTTCTTTTAAAAGCATAAATTACAGGCATTAAAAAGCTAAAGGATGTGAATAGACATAGGGCTAGATCGTCAATATTCATCAATTTTATTTTCATTGTAAGTCTTTACTATATAATAACTCCCCAAGCCCTCCCCTGAGCTATTAGCCTCCCTCTCCTTCTCCCTCTCCTTCTGCACATCTATCTTCCGTTTTCATGCCATTTACTGCTGCTAGAATAACACAGAGATGGGAGAGCAGAGGGAGACATTATTTGCAATTCATACAATATTTTTCATTCATGAATGTCAAAGCACAATTTCTTGAAGGTTTTCTAAGATGAAAAATATTAGTATTAACCTGTGACCTTTTTGGAGGGTCTTTGGTAAATCCAAACCTCCTGCCACTAGTATTCCTATTATGGGGAATGTGTGGGGAAGTTAACTAAAGGACAGAATAAAGACTGCAATTTTGTTGCTCCTTTGTCTGGATTTAGCTGGATAATACTTCAAATGCACACATCAGTGCTACGCAGTTTAGCTTCTTATGCTCTAATGAATTATCAGTGACTCAACAATGTCAACATGACTAAGTTAATCAGCTGATAATAACTGGCTTATATTTATATAACACTTTAGAGCTTACACCATGCTTTTATGTCTGTATGTTATCTCACTTGATCTGAAAGAATTAGCTAGAACAGGTATTACCTTCATTTTTTAAAATAAGAAAATCAAAATTTGTAATAGTAGGTAAATCTGAAGTGACTTTGCCAAGATCAGACAGCTAGTTGGAGACAGACTGAGTCTCAACTCAGTTTTTGTAGCTCTATATTGCATTTACCAGCAATATATTATAAAATATATATTTTAGAAACATATATTCTGAATCTGAACACTTTTAAGCAAAGTACCTACATTATTAAAGATAGTCAAGAACTCTAACCCAAGCATATGGGCATTAAAGAAACTTATTAAGCCTTCTTCTTTGCAGGAGCCAAAGGAGACAGGGGAGCCCCAGGTTTTCCTGGCCTCCCGGGCAGAAAAGGGGCCATGGGAGATGCTGGACCTCGAGGACCCACAGGCATAGAAGGATTCCCAGGGCCACCAGGTCTGCCCGGTGCAATTATCCCTGGCCAGACAGGAAATCGTGGTCCACCAGGCTCAAGAGGAAGCCCAGGTAAAGGGTTTACTTTTAAACAGCATAAAATAACAAAAATCATGTTTGACCTCAAAAGTTTTCAACCTCCTCCTCATGTTACCTTGTTGCTTCTTCTTTCCCTGTGGTCATCTCCATTCCCCCACTACCTGTGGTTCCCATACCCAGCAGTTGTCAAGGCAAGGTAGCCTGTTTGAGGGATGCATAGTTAATAAATTAACGAGCCTGGCTGGACGCAGTGGCTCACACCCGTAATCCCAGCACTTTGGTAGGCCAAGGCAGACGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGTCTTGCTTGGTGGTGCATGCCTGTAATACCGGCAACTCAGGAGGCTGAGATGGGAGAACCTCTTAAACCTGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTGCAGCCTGGGCAACAGAACAAAACTGTATCAAAAAAAAATAATTAGCCTAAAAGACAGTGATGCATTCATTCAACTCTATTTGTTGAATCCCTAGAGCTGGGCTAGGCTCTAGGGAAGCAGGCACAGACCCTGCTGTAACAGACCCTCACTGGGGAGAAGCAGATCCTGCTGGTGGGTGCCAGGTGCTTCGCTGGCATCATCTTCTCCTGTCTTTACCACAATCCCATCACATGCTCCAGGGGAAAGAATGTTTGTGGCAATGCTAAGTGAAGGGTTTATACTTCATTAGAAACAATCACTGATAAATAGAACCTTCCAAGCTCCCTGGCTGGCAATACTGACAGACTTTTCATGAATTCAGGTGCGCCTGGTCCCCCTGGACCTCCAGGGAGTCATGTAATAGGCATAAAAGGAGACAAAGGGTCTATGGGCCACCCTGGCCCAAAAGGTCCACCTGGAACTGCAGGAGACATGGGACCACCAGGTCGTCTGGTGAGTATGGATAATTATTTTGACTCATTATTAATTCAATATCAACTTATAATTATTCTTATATTGTATATTATATCATATATTGTTGATGTTAACTGTATTAGTCCATTCTCATGATGTTAATAAAGACATACCCGAGACTGGGTAATTTATAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAATTCTACATGGCTGGGGAGACCTCAAGAAACTTATAATCATGGCAGAAGGCACCTCTTCACACTGCAACAGGAGAGAGAATGAGTGCCAAGCAAAAGGGGAAGCCCCTTATAAAACCATCAGATCGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGAGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCAAAACAAACAAACAAACAAAACCATCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTACCATGAGAATGGCATGGGGGAAACCACCCCCATGATTCAATTACCTCCCACTGGGTCCTTCCCAGGACATGTGGGGATTATAGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGCCAAACCATATCATTAACATTGACTTATCGTTAGTACAAGAGTACTATTATACTCTTATAAATTAATTGCCAGATCAGATGGGCCTGGAGGCAGCAAAAATTTACAATTTTTGATGCATCTGTGCAGTGTGCCTAAGGGAACACAGTCCAGAAGTTTCTGAAAATCAAAAAATCTTCAGAGTTGGAATGATTTGGCCTCTAAGAGGCCTCC
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Task1_train_5646
A mutation on Chromosome 2 affecting COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Benign familial hematuria
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Task1_train_5647
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_5648
This sequence change occurs on Chromosome 2, altering COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Alport syndrome 3b, autosomal recessive
TTGTCTCTCTCCTTTTTTAACAACACTTTATCCAAGCAATCAGATGGTTCCTTCTTTGGTCTTCTTGCTCCAAAGATAGCTGGTTCAAGGCCAGTTTTATCCTTGGCACTTTTCATGACCTTCAAAGCACATTATTCTCAGGTAATAGCATTATCTCAATTCACATGGACAGTATGAAAGTAGATTTAGCATACATTTTGACAAATAGCTCTTTCCAGAAGCCCTGCTCCCTCCTCCCTCCTTCTATGGCTTTGCTTGAGCATCTCCTGGCTATAAGACCAGTTCATGTGAGCCTCACAAGAAGAGAGCACCTCGTTCCTGCTTAGATTATTGCATCCTTGTCAAATATGCCTGTCAAATACTCTCTCTTGACAACTCCTGTACACTCCCATCCCTAGACATTACTTCTCCTACCATCATGATCAAGTGTAATTTATGGCTCTGCTAGCTTAGTGAGAATGAAGCTTAGGTGCTGTAACTCAACAACGGTTTTGTTGTCTTTGCAGCAATTATAAATACAGATTATAATTTTCATTCTGGGCCAGGCATGGTAGCTCACTACTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCATTTGAGGTCAGGAGGTCGAGACCAGCTGGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCATGACAATTACTTGAATGTGGGAAGCAGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGTCTGGAGGACAAAACGAGACTCTTTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTCTGGCAGTACTGGGCTACTCCATTTAGGACACAGAATATCCAGTTGAATCCAATACTAAAACAACATACACCAACATTAGAAGGTATGTTTGCTGTTGGGCTTAAGGGAAGCTTTTGTTTTACTTTTAAAACGATAGTCCTAAGGAAAGGTTCTAAGTGGCCAGAGGAGTTATAGCCTTGATTGAAAGATAAAAATGATGTCTGCTAACTTCAGCTTATTCTCACCCAACATAATATTATACCCTATTTGCATTTTTAAAAAACTGCTGTGAATTGAGTGATTTTAAAAATTTGTTTTGGTTCTGCTCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGGACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAA
TTGTCTCTCTCCTTTTTTAACAACACTTTATCCAAGCAATCAGATGGTTCCTTCTTTGGTCTTCTTGCTCCAAAGATAGCTGGTTCAAGGCCAGTTTTATCCTTGGCACTTTTCATGACCTTCAAAGCACATTATTCTCAGGTAATAGCATTATCTCAATTCACATGGACAGTATGAAAGTAGATTTAGCATACATTTTGACAAATAGCTCTTTCCAGAAGCCCTGCTCCCTCCTCCCTCCTTCTATGGCTTTGCTTGAGCATCTCCTGGCTATAAGACCAGTTCATGTGAGCCTCACAAGAAGAGAGCACCTCGTTCCTGCTTAGATTATTGCATCCTTGTCAAATATGCCTGTCAAATACTCTCTCTTGACAACTCCTGTACACTCCCATCCCTAGACATTACTTCTCCTACCATCATGATCAAGTGTAATTTATGGCTCTGCTAGCTTAGTGAGAATGAAGCTTAGGTGCTGTAACTCAACAACGGTTTTGTTGTCTTTGCAGCAATTATAAATACAGATTATAATTTTCATTCTGGGCCAGGCATGGTAGCTCACTACTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCATTTGAGGTCAGGAGGTCGAGACCAGCTGGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCATGACAATTACTTGAATGTGGGAAGCAGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGTCTGGAGGACAAAACGAGACTCTTTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTCTGGCAGTACTGGGCTACTCCATTTAGGACACAGAATATCCAGTTGAATCCAATACTAAAACAACATACACCAACATTAGAAGGTATGTTTGCTGTTGGGCTTAAGGGAAGCTTTTGTTTTACTTTTAAAACGATAGTCCTAAGGAAAGGTTCTAAGTGGCCAGAGGAGTTATAGCCTTGATTGAAAGATAAAAATGATGTCTGCTAACTTCAGCTTATTCTCACCCAACATAATATTATACCCTATTTGCATTTTTAAAAAACTGCTGTGAATTGAGTGATTTTAAAAATTTGTTTTGGTTCTGCTCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGAACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAA
Task1_train_5649
An alteration has been detected in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
TTGTCTCTCTCCTTTTTTAACAACACTTTATCCAAGCAATCAGATGGTTCCTTCTTTGGTCTTCTTGCTCCAAAGATAGCTGGTTCAAGGCCAGTTTTATCCTTGGCACTTTTCATGACCTTCAAAGCACATTATTCTCAGGTAATAGCATTATCTCAATTCACATGGACAGTATGAAAGTAGATTTAGCATACATTTTGACAAATAGCTCTTTCCAGAAGCCCTGCTCCCTCCTCCCTCCTTCTATGGCTTTGCTTGAGCATCTCCTGGCTATAAGACCAGTTCATGTGAGCCTCACAAGAAGAGAGCACCTCGTTCCTGCTTAGATTATTGCATCCTTGTCAAATATGCCTGTCAAATACTCTCTCTTGACAACTCCTGTACACTCCCATCCCTAGACATTACTTCTCCTACCATCATGATCAAGTGTAATTTATGGCTCTGCTAGCTTAGTGAGAATGAAGCTTAGGTGCTGTAACTCAACAACGGTTTTGTTGTCTTTGCAGCAATTATAAATACAGATTATAATTTTCATTCTGGGCCAGGCATGGTAGCTCACTACTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCATTTGAGGTCAGGAGGTCGAGACCAGCTGGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCATGACAATTACTTGAATGTGGGAAGCAGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGTCTGGAGGACAAAACGAGACTCTTTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTCTGGCAGTACTGGGCTACTCCATTTAGGACACAGAATATCCAGTTGAATCCAATACTAAAACAACATACACCAACATTAGAAGGTATGTTTGCTGTTGGGCTTAAGGGAAGCTTTTGTTTTACTTTTAAAACGATAGTCCTAAGGAAAGGTTCTAAGTGGCCAGAGGAGTTATAGCCTTGATTGAAAGATAAAAATGATGTCTGCTAACTTCAGCTTATTCTCACCCAACATAATATTATACCCTATTTGCATTTTTAAAAAACTGCTGTGAATTGAGTGATTTTAAAAATTTGTTTTGGTTCTGCTCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGGACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAA
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Task1_train_5650
A change on Chromosome 2 affects gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Hematuria, benign familial, 2
TTGTCTCTCTCCTTTTTTAACAACACTTTATCCAAGCAATCAGATGGTTCCTTCTTTGGTCTTCTTGCTCCAAAGATAGCTGGTTCAAGGCCAGTTTTATCCTTGGCACTTTTCATGACCTTCAAAGCACATTATTCTCAGGTAATAGCATTATCTCAATTCACATGGACAGTATGAAAGTAGATTTAGCATACATTTTGACAAATAGCTCTTTCCAGAAGCCCTGCTCCCTCCTCCCTCCTTCTATGGCTTTGCTTGAGCATCTCCTGGCTATAAGACCAGTTCATGTGAGCCTCACAAGAAGAGAGCACCTCGTTCCTGCTTAGATTATTGCATCCTTGTCAAATATGCCTGTCAAATACTCTCTCTTGACAACTCCTGTACACTCCCATCCCTAGACATTACTTCTCCTACCATCATGATCAAGTGTAATTTATGGCTCTGCTAGCTTAGTGAGAATGAAGCTTAGGTGCTGTAACTCAACAACGGTTTTGTTGTCTTTGCAGCAATTATAAATACAGATTATAATTTTCATTCTGGGCCAGGCATGGTAGCTCACTACTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCATTTGAGGTCAGGAGGTCGAGACCAGCTGGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCATGACAATTACTTGAATGTGGGAAGCAGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGTCTGGAGGACAAAACGAGACTCTTTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTCTGGCAGTACTGGGCTACTCCATTTAGGACACAGAATATCCAGTTGAATCCAATACTAAAACAACATACACCAACATTAGAAGGTATGTTTGCTGTTGGGCTTAAGGGAAGCTTTTGTTTTACTTTTAAAACGATAGTCCTAAGGAAAGGTTCTAAGTGGCCAGAGGAGTTATAGCCTTGATTGAAAGATAAAAATGATGTCTGCTAACTTCAGCTTATTCTCACCCAACATAATATTATACCCTATTTGCATTTTTAAAAAACTGCTGTGAATTGAGTGATTTTAAAAATTTGTTTTGGTTCTGCTCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGGACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAA
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Task1_train_5651
A variant affecting Chromosome 2, within the gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Autosomal recessive Alport syndrome
TTGTCTCTCTCCTTTTTTAACAACACTTTATCCAAGCAATCAGATGGTTCCTTCTTTGGTCTTCTTGCTCCAAAGATAGCTGGTTCAAGGCCAGTTTTATCCTTGGCACTTTTCATGACCTTCAAAGCACATTATTCTCAGGTAATAGCATTATCTCAATTCACATGGACAGTATGAAAGTAGATTTAGCATACATTTTGACAAATAGCTCTTTCCAGAAGCCCTGCTCCCTCCTCCCTCCTTCTATGGCTTTGCTTGAGCATCTCCTGGCTATAAGACCAGTTCATGTGAGCCTCACAAGAAGAGAGCACCTCGTTCCTGCTTAGATTATTGCATCCTTGTCAAATATGCCTGTCAAATACTCTCTCTTGACAACTCCTGTACACTCCCATCCCTAGACATTACTTCTCCTACCATCATGATCAAGTGTAATTTATGGCTCTGCTAGCTTAGTGAGAATGAAGCTTAGGTGCTGTAACTCAACAACGGTTTTGTTGTCTTTGCAGCAATTATAAATACAGATTATAATTTTCATTCTGGGCCAGGCATGGTAGCTCACTACTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCATTTGAGGTCAGGAGGTCGAGACCAGCTGGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCATGACAATTACTTGAATGTGGGAAGCAGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGTCTGGAGGACAAAACGAGACTCTTTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTCTGGCAGTACTGGGCTACTCCATTTAGGACACAGAATATCCAGTTGAATCCAATACTAAAACAACATACACCAACATTAGAAGGTATGTTTGCTGTTGGGCTTAAGGGAAGCTTTTGTTTTACTTTTAAAACGATAGTCCTAAGGAAAGGTTCTAAGTGGCCAGAGGAGTTATAGCCTTGATTGAAAGATAAAAATGATGTCTGCTAACTTCAGCTTATTCTCACCCAACATAATATTATACCCTATTTGCATTTTTAAAAAACTGCTGTGAATTGAGTGATTTTAAAAATTTGTTTTGGTTCTGCTCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGGACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAA
TTGTCTCTCTCCTTTTTTAACAACACTTTATCCAAGCAATCAGATGGTTCCTTCTTTGGTCTTCTTGCTCCAAAGATAGCTGGTTCAAGGCCAGTTTTATCCTTGGCACTTTTCATGACCTTCAAAGCACATTATTCTCAGGTAATAGCATTATCTCAATTCACATGGACAGTATGAAAGTAGATTTAGCATACATTTTGACAAATAGCTCTTTCCAGAAGCCCTGCTCCCTCCTCCCTCCTTCTATGGCTTTGCTTGAGCATCTCCTGGCTATAAGACCAGTTCATGTGAGCCTCACAAGAAGAGAGCACCTCGTTCCTGCTTAGATTATTGCATCCTTGTCAAATATGCCTGTCAAATACTCTCTCTTGACAACTCCTGTACACTCCCATCCCTAGACATTACTTCTCCTACCATCATGATCAAGTGTAATTTATGGCTCTGCTAGCTTAGTGAGAATGAAGCTTAGGTGCTGTAACTCAACAACGGTTTTGTTGTCTTTGCAGCAATTATAAATACAGATTATAATTTTCATTCTGGGCCAGGCATGGTAGCTCACTACTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCATTTGAGGTCAGGAGGTCGAGACCAGCTGGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCATGACAATTACTTGAATGTGGGAAGCAGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGTCTGGAGGACAAAACGAGACTCTTTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTCTGGCAGTACTGGGCTACTCCATTTAGGACACAGAATATCCAGTTGAATCCAATACTAAAACAACATACACCAACATTAGAAGGTATGTTTGCTGTTGGGCTTAAGGGAAGCTTTTGTTTTACTTTTAAAACGATAGTCCTAAGGAAAGGTTCTAAGTGGCCAGAGGAGTTATAGCCTTGATTGAAAGATAAAAATGATGTCTGCTAACTTCAGCTTATTCTCACCCAACATAATATTATACCCTATTTGCATTTTTAAAAAACTGCTGTGAATTGAGTGATTTTAAAAATTTGTTTTGGTTCTGCTCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGAACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAA
Task1_train_5652
Gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Alport syndrome 3b, autosomal recessive
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Task1_train_5653
A genomic change on Chromosome 2 affects COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
TCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGGACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAAATGGTAAAGACTATAGACTTAAATTTTTAAAAATTCAAATATGATGTTAATATAATACTAATTGCATAACTACATGTGATTTAATATTGTCATAGGTGCACAGTAGAGTGCTATTAATCATTCAACTTTCCTTAAAGTGTGGTTTTTGAAGTGATAAACCATTCTTATTAAGAATTCTATTAATTTAAAAATTTTAATGACCAAGGCTTTAATGCCCTAAGAATGGGGCAACAGCAAGAGCAAGGGCACTGCAATATAAATTTTGTAGAGAACTAATTAGCAAGTAGACAGTTCAATGCTATGGAGGCCTCACAAGAATGACAAAGGGATCTAAGAGTCAAACTGCACTGGCATAAACTGATAGCCCTGGCCCCTTTCTTGGAGATACAGAAATGCATTGGATATCACACATTTGTATAAAAGCTCACTTCCAGTTCCTGCCCTGCTCAGCTAATCACTTCCCAATTCCTGTGCAGAGATGAGGAGACATCTTTTGTTTGGGGCCAACTATAGCTCCCTCTGAATGAGGGCAGGGGTTAGGAAAAGAGAAAAATGTGTCTCCCCAATATATTAAAACCATGGCAACTTGGATTTTTCAAGTAAGACATCAGACCGGAGAATTTGGATGTGGCCTATTTTTAATTTCAAAAAACCACTCAAGGTCCCTGGAGGAGACAAGAGTGGGCAGAATTCAGAGAAAATTGAAAAAATGCATAATATTGGGGCTTTTACAAATTTCTGAGGAAAGTCCTGACTTCCGAGTCAGGACTAAACTGTGACCCTGCCTGACTCCCAGGGGCACGGATGTCCCAGGGGCAACAAAACTAATTCCTGTGATGATGTAGGCCCAAAGTCTAACCATCGCTGTTTTCTCTGTGATTCCTTAGGACCCTAGAGAACCATGGCCCAAGTCTGGTTGGGGAGGGAGTCAGCGTACAGTGGCAGCAGAAATGGATGGGAGTGAGGAAGTGGTAGCCAATGCCAATACCATAAATAATAGCCGTTCAATGAAAGAAAGGAGAAGGAAGTTAAAGAGGAATGGAAGAGAGGATAGCTCACTGGTTCTCATCTAGAACACGACAAGTGTGGATTAGCCTTGTCCAAATCCATACTCCAAAGTATAGAAAGTTTTTCTCCACAGAGAGAAAAATGTACAGAAACG
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Task1_train_5654
A genetic alteration is present in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Benign familial hematuria
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Task1_train_5655
A change on Chromosome 2 affects gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
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Task1_train_5656
A genomic change on Chromosome 2 affects COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
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Task1_train_5657
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Hematuria, benign familial, 2
TCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGGACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAAATGGTAAAGACTATAGACTTAAATTTTTAAAAATTCAAATATGATGTTAATATAATACTAATTGCATAACTACATGTGATTTAATATTGTCATAGGTGCACAGTAGAGTGCTATTAATCATTCAACTTTCCTTAAAGTGTGGTTTTTGAAGTGATAAACCATTCTTATTAAGAATTCTATTAATTTAAAAATTTTAATGACCAAGGCTTTAATGCCCTAAGAATGGGGCAACAGCAAGAGCAAGGGCACTGCAATATAAATTTTGTAGAGAACTAATTAGCAAGTAGACAGTTCAATGCTATGGAGGCCTCACAAGAATGACAAAGGGATCTAAGAGTCAAACTGCACTGGCATAAACTGATAGCCCTGGCCCCTTTCTTGGAGATACAGAAATGCATTGGATATCACACATTTGTATAAAAGCTCACTTCCAGTTCCTGCCCTGCTCAGCTAATCACTTCCCAATTCCTGTGCAGAGATGAGGAGACATCTTTTGTTTGGGGCCAACTATAGCTCCCTCTGAATGAGGGCAGGGGTTAGGAAAAGAGAAAAATGTGTCTCCCCAATATATTAAAACCATGGCAACTTGGATTTTTCAAGTAAGACATCAGACCGGAGAATTTGGATGTGGCCTATTTTTAATTTCAAAAAACCACTCAAGGTCCCTGGAGGAGACAAGAGTGGGCAGAATTCAGAGAAAATTGAAAAAATGCATAATATTGGGGCTTTTACAAATTTCTGAGGAAAGTCCTGACTTCCGAGTCAGGACTAAACTGTGACCCTGCCTGACTCCCAGGGGCACGGATGTCCCAGGGGCAACAAAACTAATTCCTGTGATGATGTAGGCCCAAAGTCTAACCATCGCTGTTTTCTCTGTGATTCCTTAGGACCCTAGAGAACCATGGCCCAAGTCTGGTTGGGGAGGGAGTCAGCGTACAGTGGCAGCAGAAATGGATGGGAGTGAGGAAGTGGTAGCCAATGCCAATACCATAAATAATAGCCGTTCAATGAAAGAAAGGAGAAGGAAGTTAAAGAGGAATGGAAGAGAGGATAGCTCACTGGTTCTCATCTAGAACACGACAAGTGTGGATTAGCCTTGTCCAAATCCATACTCCAAAGTATAGAAAGTTTTTCTCCACAGAGAGAAAAATGTACAGAAACG
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Task1_train_5658
Here is a variant affecting COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Alport syndrome 3b, autosomal recessive
TCCCTTTATTTGAAATATAGGGAGCACCAGGTACTCCAGGTCTTCCAGGACCCAGAGGTGATCCTGGATTCCAGGGGTTTCCAGGCGTGAAAGGTACTGTTTTTGTGCATTGCTCTTTATATGCAAATACCATAACCTCAATTCATATTTTAGGGCACACAAGTGTTTGCTGAAGTACAGACAGCTGGGGTTAGTACAAATAGGACCTCAATACGAGTGAAGTAGGAAGGCTCCACTACACTATTTCAAGATTCTTTGAAATAGAGTATTTCTTCAGATCAATGGCTCTCGGTAACCTTCTTTTATTTGTGTAAAAGACTGTGATTGGAAGAGAAGTCTTACCACTTTATTAGTTCACATCAAAGCAAATATTCTCTATGTGCTGAAAAGAACTCCTAACGTAACTAACTCTAGGCTATTAGTAAAGCTAGAGTAATAAGCTGAGAAAGTAGGTAACTATGACAACCAAGCAATATAATTCACCACATGGTAGAACAGGTTTTAATGTGACTTTGTATGTTACCGTAAATATCAAATTGGTTTCTGAACTCAAAAAGTGGACTCTTAGGGACCCTTCCCCTTCAATGTTAAAATACAAGTTCTTAATGCCTACTTCTGGAATATATTTCTTTACAGACTCATTAAGCATGACCTACTGGGTCCCAGTGACATGCCAAAACCTATGTGAACAAAATGAAATTGTAGCCCTTGTGACAGAACCCATAGGACAGAGCCTCCAGGCACACTTCTAGTATTTGTCCTTAGAGTCAATCATCAACCTGAAGAACTAGGAAACCCATTGATCTAAGTGGAATCACACTGTGTCTTTGTTTGTTTTTAGGAGAAAAGGGTAATCCTGGATTTCTAGGATCCATTGGACCTCCAGGACCAATTGGGCCAAAAGGACCACCTGGTAAATAAACGTCCTTACTATTGCTGTCAATGAAGAAAGGTAACACATCCGTGAGGCCATCATCTTCTTCTTATGTTTATGTCAACAGGTGTACGTGGAGACCCTGGCACACTTAAGATTATCTCCCTTCCAGGAAGCCCAGGGCCACCTGGCACACCTGGAGAACCAGGGATGCAGGGAGAACCTGGGCCACCAGGGCCACCTGGAAACCTAGGTGTGGGACTGGCAGCATTGACTTGGATCACTAGGAAGTGGTTGAACCAAAATACCTGTAAACTGCTTTGGAAACAGCTGATACAACTTCACAGAAAATGTTGAACATGATAGTGGTTTTCACAATCAGTCTTAGGATTGAGCTCATTTTACCCTTGACCAGCAAATAAAAGACCTTGGAATCTATTGAAAGCAGTTGTTCATAGTATAACTTGAACAAATACACTTTAGGGCAGCATGTTTTTTTTATTATTTTTTATTAAGGTAAAGGTATGTCTATCTCCTCTGACAACTGTCAGTCTCGGGGCTCTATTTCTAAATGATTGTCTGAATATACCTGAGTTCTGTGAATTTATACTTTTCTAACATTTGGTACAGCAAAGTATTAGGAAAAAATGATTTAGAAATCTTTTCAAAATACTGGTGTTTGGAAATTGAACTAACCCCTCTACATATGCACAGCATATCGTAATAGGCTTCTGAATGGAATGATTATGCCTTAAGTTTGTCTGAATCACCTGGGAGATAAAGATATTACTTATTTGTTTGATCAATTCAGGGACATAGTGAATTCTGGAAGAACATAAATAAAAATTGCAGCACAATTTTAAACTGCTGCATTTAGTATCCTCATAGTTCATTTTCGAGAGTCTTATTTTCTGGGAAGTGGGGCTAACAAGTTAGGTGACTAATCATCCTAGCTTGCCCAGGACTGAGGATCTTCCCAGGATGCAGGACTTTCATTCCTGAAACTGAGAAAGTCCTGGGTTAACGGGATGGTTGGCCACCTTACTTTTCATCCTATATGATAAAATGCAATACAATGTTGGTTTTTGCCTAGGACCCTGTGGGCCAAGAGGTAAGCCAGGCAAGGATGGAAAACCAGGAACTCCTGGACCAGCTGGAGAAAAAGGCAACAAAGGTTCTAAAGGAGAGCCAGGTAAACCCCCAGCTTGTTTCCTCACCGAAGAAGTGCTATTTCGACATACAGAGAAGTCTTGTTCGAGTGGGTGACTATATGAGTTATCTAGGCCTTTGAGTTTATGTTGTTCAGATCAGACCAAAGGCCAAGGATCAAATGTTCATTTGGAAGATGAGAATCAAGAATTATTGGAACACAGTATTTTTCCGACCTCTTAGCTGGTCAGATGGGCTCCAAACTGATGCACAGTTTAGCCTGAGGACAAATAGAACTAATAAGTCCTATGGGTGTTCTTTCAAAAAGGCCAATACCTGTTTTTAATAACTTATAGGAGTTGTTAGTTAATAATTATTTATAGGAGCAGTACATAAGTATGTAGCTAGAAAAATATTACCTTGGTATGAGTAGAAGAGCAACTGAGTATCCTTTTTTAAGAAAGCCATCTTTTAAAAATGCCATTCTTCATGGTGGTGGGTGCCTGTAATCGCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGGGAGCCAAGATCACACCACCGCACTCCAACCTGGGTGACAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCATTCTTGAATAGAATTCAACAATTCATGCGTGTCCTGAAAAGGGAACTCTTAAGTATAGTGTTTTATTCTGAACATATGCTGTATGTGTCAGTTTGATACCTGGATCAACATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAAATGGTAAAGACTATAGACTTAAATTTTTAAAAATTCAAATATGATGTTAATATAATACTAATTGCATAACTACATGTGATTTAATATTGTCATAGGTGCACAGTAGAGTGCTATTAATCATTCAACTTTCCTTAAAGTGTGGTTTTTGAAGTGATAAACCATTCTTATTAAGAATTCTATTAATTTAAAAATTTTAATGACCAAGGCTTTAATGCCCTAAGAATGGGGCAACAGCAAGAGCAAGGGCACTGCAATATAAATTTTGTAGAGAACTAATTAGCAAGTAGACAGTTCAATGCTATGGAGGCCTCACAAGAATGACAAAGGGATCTAAGAGTCAAACTGCACTGGCATAAACTGATAGCCCTGGCCCCTTTCTTGGAGATACAGAAATGCATTGGATATCACACATTTGTATAAAAGCTCACTTCCAGTTCCTGCCCTGCTCAGCTAATCACTTCCCAATTCCTGTGCAGAGATGAGGAGACATCTTTTGTTTGGGGCCAACTATAGCTCCCTCTGAATGAGGGCAGGGGTTAGGAAAAGAGAAAAATGTGTCTCCCCAATATATTAAAACCATGGCAACTTGGATTTTTCAAGTAAGACATCAGACCGGAGAATTTGGATGTGGCCTATTTTTAATTTCAAAAAACCACTCAAGGTCCCTGGAGGAGACAAGAGTGGGCAGAATTCAGAGAAAATTGAAAAAATGCATAATATTGGGGCTTTTACAAATTTCTGAGGAAAGTCCTGACTTCCGAGTCAGGACTAAACTGTGACCCTGCCTGACTCCCAGGGGCACGGATGTCCCAGGGGCAACAAAACTAATTCCTGTGATGATGTAGGCCCAAAGTCTAACCATCGCTGTTTTCTCTGTGATTCCTTAGGACCCTAGAGAACCATGGCCCAAGTCTGGTTGGGGAGGGAGTCAGCGTACAGTGGCAGCAGAAATGGATGGGAGTGAGGAAGTGGTAGCCAATGCCAATACCATAAATAATAGCCGTTCAATGAAAGAAAGGAGAAGGAAGTTAAAGAGGAATGGAAGAGAGGATAGCTCACTGGTTCTCATCTAGAACACGACAAGTGTGGATTAGCCTTGTCCAAATCCATACTCCAAAGTATAGAAAGTTTTTCTCCACAGAGAGAAAAATGTACAGAAACG
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Task1_train_5659
This variant affects gene COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
CATCTACCTTCTGCAGATGTTTCAAAGCACTCTTCTGGAAACTACCTCGATATCCAAATCTTCTATTTTTAGGATTGCTGACTTTGTTAAAGCAAGAAAAAATTCTAAATGTGCTTTCTGAATTTACTGACATATATCATGCTCAGATCTACTATATTAAAATGGTAAAGACTATAGACTTAAATTTTTAAAAATTCAAATATGATGTTAATATAATACTAATTGCATAACTACATGTGATTTAATATTGTCATAGGTGCACAGTAGAGTGCTATTAATCATTCAACTTTCCTTAAAGTGTGGTTTTTGAAGTGATAAACCATTCTTATTAAGAATTCTATTAATTTAAAAATTTTAATGACCAAGGCTTTAATGCCCTAAGAATGGGGCAACAGCAAGAGCAAGGGCACTGCAATATAAATTTTGTAGAGAACTAATTAGCAAGTAGACAGTTCAATGCTATGGAGGCCTCACAAGAATGACAAAGGGATCTAAGAGTCAAACTGCACTGGCATAAACTGATAGCCCTGGCCCCTTTCTTGGAGATACAGAAATGCATTGGATATCACACATTTGTATAAAAGCTCACTTCCAGTTCCTGCCCTGCTCAGCTAATCACTTCCCAATTCCTGTGCAGAGATGAGGAGACATCTTTTGTTTGGGGCCAACTATAGCTCCCTCTGAATGAGGGCAGGGGTTAGGAAAAGAGAAAAATGTGTCTCCCCAATATATTAAAACCATGGCAACTTGGATTTTTCAAGTAAGACATCAGACCGGAGAATTTGGATGTGGCCTATTTTTAATTTCAAAAAACCACTCAAGGTCCCTGGAGGAGACAAGAGTGGGCAGAATTCAGAGAAAATTGAAAAAATGCATAATATTGGGGCTTTTACAAATTTCTGAGGAAAGTCCTGACTTCCGAGTCAGGACTAAACTGTGACCCTGCCTGACTCCCAGGGGCACGGATGTCCCAGGGGCAACAAAACTAATTCCTGTGATGATGTAGGCCCAAAGTCTAACCATCGCTGTTTTCTCTGTGATTCCTTAGGACCCTAGAGAACCATGGCCCAAGTCTGGTTGGGGAGGGAGTCAGCGTACAGTGGCAGCAGAAATGGATGGGAGTGAGGAAGTGGTAGCCAATGCCAATACCATAAATAATAGCCGTTCAATGAAAGAAAGGAGAAGGAAGTTAAAGAGGAATGGAAGAGAGGATAGCTCACTGGTTCTCATCTAGAACACGACAAGTGTGGATTAGCCTTGTCCAAATCCATACTCCAAAGTATAGAAAGTTTTTCTCCACAGAGAGAAAAATGTACAGAAACGATTTACTTTGTTTTTAACTCATATAAATAAACTAACCCTTATTACAGTGAAAAAAAAAGCCTTCTCTTCTTACTTGACTTACAAATTGATCAAAACTTCCTTGAAGTTTGAACCTTTAAAAAGAGCTTTCAATGTTTTCTGCAATTGTTTATTGTAGACAATGTTGCAATAATTTGTGAATTTATCAAAACCATAAGTAATTTTTGTTATCTACTCGAATAGACTAAGTTGTAGATATTTGATTTTTCCCCCATCACATTGTAGGAGGATTCATTCATTTATTCATAAAAAACATACATAAGACCTACCAGATGCAGGCAGGCCACTGTGCCAGGCCTCACAGAGGAATTCAAAGATAAAGACCTGATCTCAAAAAACGCATCAAATATACACAAACATTGATAAGAAGAGGCACTGTGTGATAAACTGCTTAACATTTAATAATACTGTTTGGCCATTTTTATAAGCCACTCTTCTCTAGGATTGCTTTCAATTTATGGGCTCAACATATATAAAATATATTTAAATTAGTACTTTGAAAAAACGAGTTTAAGATTTTTGTGTATGTTGCAACATTTAGAATGTGTTTTTTGAAGGACCAGCTGGATCAGATGGATTGCCAGGTTTGAAAGGAAAACGTGGAGACAGTGGATCACCTGCAACCTGGACAACGAGAGGCTTTGTCTTCACCCGACACAGTCAAACCACAGCAATTCCTTCATGTCCAGAGGGGACAGTGCCACTCTACAGTGGGTTTTCTTTTCTTTTTGTACAAGGAAATCAACGAGCCCACGGACAAGACCTTGGTAATGTCCCAGTCCCAGTTGCCAGTTGTGCTGTTCCACATGCAGATTGTAAATCTTTATAGCCTAGGATGCTTCCCTCTGAAGTTAAGTGTAAATAACCTTGAGTGTCTCCTGATACATTTTAAAGAGAGCAAATAAAACACTGGCCTGTCTAATTTTCATTCTGGAATGTAAAATGGTGGAAGGAGCCTAGCTCAGGAATGCTAGCCTAGCTCCTCCCATTCAGTGCAAACAATTTGCCCCTAAAACTCCCTAAACCACCTGTCTGCATTTATCTTTTTGGTGCTTTTTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTCACACAGGGTCTCACTTTCATCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAGCCTCCACATCCTAGGCTCAAGCCATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATGGCTGGGACTACAGGCACACACCACTATACCAAGCTAATTTTTTTGATTTTCAGTAGAGATGAGGTCTGGCTATGCTGTCAAGGTTTCTCTCAAACTCTTGAACTCAAGCAATCCTCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCAGCCCACCCATTTGCTTTTCAATCTCACAAATAACTGCTTTTCTAAACCTTTATTTGGTTATTAGCTATTATGTACATATGAATAAGTGGGAATACTTTGAAGCAAAAACACTATCCCAACTGATCTATGCTAGCCCCCATGTTCTAAATCGATTAGAAAGAGCCACCGGAAGTATTAAAGGTGGGAGAAAGAAGATTTGTTTGCCTATTGGATCTTTGATTTCTATCAGTATGAAAACTTTTCAATACTACATTTTGCAGATAACTCTTTTGTGTTGTCTTTGTCCAGCTTTTGCTGCAGGTTACATTTAAATTAGCTTCTCTCTAGTAACGATGCTGAAAATAACTTTAACTTACTGAAAGTGATACTCAGTCTGATGTTTCATTAGGAACTCTTGGCAGCTGCCTGCAGCGATTTACCACAATGCCATTCTTATTCTGCAATGTCAATGATGTATGTAATTTTGCATCTCGAAATGATTATTCATACTGGCTGTCAACACCAGCTCTGATGCCAATGAACATGGCTCCCATTACTGGCAGAGCCCTTGAGCCTTATATAAGCAGGTAAAAATCCAATCCCCTAGTTTTACAATGGGACCAAGTGAATCACTTCCCTTGTAATGGAATGAAAGGCAGCACATGACAGTGCAGAAAGTGGCAATGCCGCCATAGTCTTTGTTTCATGTTACAGATGCACTGTTTGTGAAGGTCCTGCGATCGCCATAGCCGTTCACAGCCAAACCACTGACATTCCTCCATGTCCTCACGGCTGGATTTCTCTCTGGAAAGGATTTTCATTCATCATGGTGAGGAGAAAAGGAACAGGAGGTTTAGGGTAAAGACTACCTGTAGAATGTTACATTGTGCTGGGTAAAATGTGATTCCCAGGGTCGATGCTGCCTGCTGTCCGTGTGTGCAACATGCCATAGACATTTCCTTGAAAATCTACAAACAGACTTTTTTTTTTTACTTTTGGTAAATAATGGAGTACTAAAAAAGACTTCTCAGGAGGAGATTACCTACAAATTCTATTATGAAATTTAGGTGAATAGTAGCTGCGTTTTATTGATAATGGAATGTCTCTTTTTATTATTTTTTTTATCTTTTGAGACAGATTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGAGTGATTTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTGCTGAGTAGCTGAGATTGCAGGTCTGTGCTACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTTTTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACTGGGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCCAGTGATCTGCCCAACTCAGCCTCCC
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Task1_train_5660
Here is a genetic alteration in COL4A3, MFF-DT (collagen type IV alpha 3 chain| MFF divergent transcript) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Autosomal dominant Alport syndrome
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Task1_train_5661
Gene SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; not provided
ATTGGGGATTACACTTCAACGTGAGATTTGGTGGGGACACAGATCCAAACCATATCAAAATCCAATTAAAAATTTTTTTGTTTGTTTTAGACACAGGGTCTTGCTATATTGGCCAAGATGGTCTCATACCCCTACCCTCAAATTAACCTCTCACTTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGCTTCCAGCCTTAATATAAATCTTGACTCAGCATTCTTTATTCTCACTGTCAGACTGCTCAATGCATCCCTTATTGAAGTTTCTTGAAGTTTCGAAAAACAGGTATGTTCAGATAATTTTCAGCAGAATTCATCAAAAAATGTTAACAACTCTTTAAAATTTTTACACATTTTATTTAGCACAATTGCTACCATTTAAAAATCAGGTGTTTTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCTCTTTGGGAGGCCGAGGCAGACAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATTGTGAAACCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGTGCACCCATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATGGCTTGAACTCAGGAGGTGAAGTTTGCAGTGAGCCAAGATCACGCCATTGCATTCCAGCCTGGGTGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAAACCAAAACAAAACAAAATCAGGTGTTTTATTCCACTCCCCCCATCAGTGTTTTCTTATTTCTAATACTTCTAGAAACCTCCTTTAAGTTTTCCTATTTTAGACAGACACCACACAGGTGCTCTTTTTTGGGAGGAGGGGGATGAGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCATAGCTCACTGTAGCCTCTGACTCCTGTGCTCAACCCATCCTCCCACCATGGCCTCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGCACACACCACGCTGCCCAGCTAATTTTTTAATTTTTTAGTAGAGTCAGGTGTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACCTCTGGCCTCAAGCAAAACTCCCACCTTGGCCTCCCAAATTGCTCGGATTACAGGAGTGAGCCACTGCACCTGGCCCATAGATGCATTAACACCTGTCTATGGTGGTGGAGAGAAGGCTCACTGCCTCTCCCAGGCCACTGGGAAATGACCTTGTGTATTCTGCAAATACACAAGAGGATCTGAAGCTATTCTTGAGGGAGACTTTCAACAGCAAAACTCAGAGCACAAAATGGAAAATAATCATAAAAAAATTAAATAATAATACTATCAAATCATAACGTGAATAATGCTGTTATTAGAGTTGAAGAGAAGCCCTTAGAAATGGGACAAACATTGTAATTCTCTTAGAGAACTGTAACTTAAACAGAAATACACTTAATAGAAGAGGAAAGAAAATGGTTCATGTGACACAAAGGTCCCATGTGTTGACTTCTTTGGTAAGATCAAATAAGTATTTAAGCCTAGCAATAGGGTCAGTCCAGTTAGTATTTCTCCTCACAAATGGTGAATATCAACTCCAGGATGGCTGGAGTTTTCTCATGGTTTGGTTCCACGCCATCTGCATGTCTTTACAAGTGATAAAAACCAGAATTTTCCAGCTGCTACTAGTCACAGGGGGTCCCCAATATGGGTTGTTTAATTATGATGACGGGTCCTGTCAATTGCATCCAGTAAAATTGGTCACATAGAGAACTCATCTAAAACTGAGGTTTTGTTGTGGTTTTGAAAGGTCCATTGGAATCCAGATTTGCAAAGCATGTCAAGTTATGGCAAAACATATGCCACCCATCTCAAAATCTTTCCTTATTATTGCATAACTTTGAAAGCCACTGTTGCGTTTGTTGCGATGAGGTTAGAGTTTTGTTGACATGATGATATTACTCTCTTCCTCTGGGTGAGACACATCTGGATTCTCACTTGGAGCAGGGCTCTGTACATCCTTCTGGGATTTGGTTGAGTAGGTAATATACATGCTTCTCATTAGGAAAATTCCAGCAATTACTGCAAAATAGCTCCCATAAACTAAAAACTGGAGAAAAACAAATAATTAGCCACATATAAAATATGACCATCTATGTCAATGATAATACATCCTAATACTGTTGGTTTGCTTGGATTATGGGGTAACTGAGACCCAGGTTTTTAATATGGGTCATTTAGGTTGAACAATACTCTCCTATCAAGTAAGAAATCAAGATCAAGTAAGAAGGTGTAAGCAATACGGTGACTAAGAGTCTTGGCTTTAGAGCAGGTTGCTTGGGTTAAAATCATAGTTACTATCATCAATAGTAAAAAACAAAACAAAACAAACCCAAAAAAACACTAAAACTCATTGACCTGTCTCTATGTCTTTGTTTGGAGGCTGGTGCAATGCTACATTCAATGTCTCCAAGAATAAATTTAAGCATTGAGGTTACTTCTTACCTGCCTTATCCATGTAAATGTTGTCCTAGTTGCAATTATTGCTCAAAACCTACTTGGTGTGTTATAATATGATAATGAAGGAATTATGTATTTTTTAATTGCTTAACCAAGGAACTCAAGAAATTTAAATATTGCTTGTTGTAAGGTTGAGAAATTTTTGAGGTTACCTAGTTGAAAACAGAAGTATTGCAGCTTACCTGAATGCTGACTGGCAAGTTGAGCCCTCTCTGATCTACTACAATCACAGTCATGATGGTCTGAATCACCAAGGCAATAAAGGTGTTGATTCCAAATACCAAGGCATAGCGTTCCACATTCAGATTAACTGCAATCTGAAATCTATCATTAAACATAAATAAGCATTTTAACTATAATATACATGGATGGAAGTCTTAAAAAGATAGAACATATTGGCCACAGGGGTATTTGTGTCACCCACCTCCAGCTCCAGGTAGTCCAGCAAAGAGAGAGAGAGACTGTCTGGAAGAAAGTAAAGGAAAAGAACAAGTGTCTCTGTCTGGTAATCCAGAGAATTCTTCTGGATCTTATCCAAGACCACCAAAGCAGTAGCTCTAAGAGTCTGCTAGAACCACAGTGTTACTGGGCTTGGGGTGCTCCCTAATGTAGATACAGTTTAGATCACAACACCCAAATCCTTCTGAATACCTGGAAAGCCTTCCCACGGAGGACAGGTACAAAAAAGCCCAGACAGCAAAGACTACAATAAATACAACTCTTCAATACCCTGACACTGATGAACATCCATAAGCATCAAGATCATCCAGGAAAACGTTCTCACCAAACAAACTAAATAAGGCACCAGGGACCAATCCTGGAGAAACATATACGACCTTTTAGACACAGAATTCAAAATAGCTGTGTTAAGAAAACGCAAAGAAATTCAAGATAACACAAAGAAGGAATTCAGAATTCTGTCAGATAAATTTAATAAAGAGATTGAAATAATTAAAAAGAATCAAGCAGAAATGCTGTGGTTGAAAAATGCAATTGACATACTGAGAATGCATCAGAATCTCATACCAGCAGAACTGATCAAGCAGAAGAAATAATTAGCAAGCTTGAAGACAAGCTATTTAAAAATACAGTCAGGAGACAACAGAAAAAAGAAGAATGAGGCACACCTACAATACCTAGAAAACAGCCTCAAAAAGGAAAATCTAAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGTAAAGAAATAGATAGAGGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATATCAGAGAGCTTCCCAAACCTAAAGAGATCAATATCCAAGGACAAGGTTACAGAACACCAAGCAGATTTAACCCAAAGAAGACTACTTAGAGGTATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGTTAAGGATAAAGAAAGGATTCTAAAAGGAGCAAGAGAAAGGAAATAAATAACATACAAGAGAGCTCCAATGTCTGGCAGCAGTCTTTTCAGTAGAAATTTTAGAACCAGGGAGTGGCATGACATATTTAAAGTGCTGAAGGAGAAAAACTTTTACCCTAGAATAGTATATCCAGTGAAAATATCAAACCCGAAGGAGAAATAAAGACCATCCCAGACAAATAGAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAGACCTGTCCTACAAGAAATGCT
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Task1_train_5662
A mutation found in SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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GCCTGGGTGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAAACCAAAACAAAACAAAATCAGGTGTTTTATTCCACTCCCCCCATCAGTGTTTTCTTATTTCTAATACTTCTAGAAACCTCCTTTAAGTTTTCCTATTTTAGACAGACACCACACAGGTGCTCTTTTTTGGGAGGAGGGGGATGAGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCATAGCTCACTGTAGCCTCTGACTCCTGTGCTCAACCCATCCTCCCACCATGGCCTCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGCACACACCACGCTGCCCAGCTAATTTTTTAATTTTTTAGTAGAGTCAGGTGTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACCTCTGGCCTCAAGCAAAACTCCCACCTTGGCCTCCCAAATTGCTCGGATTACAGGAGTGAGCCACTGCACCTGGCCCATAGATGCATTAACACCTGTCTATGGTGGTGGAGAGAAGGCTCACTGCCTCTCCCAGGCCACTGGGAAATGACCTTGTGTATTCTGCAAATACACAAGAGGATCTGAAGCTATTCTTGAGGGAGACTTTCAACAGCAAAACTCAGAGCACAAAATGGAAAATAATCATAAAAAAATTAAATAATAATACTATCAAATCATAACGTGAATAATGCTGTTATTAGAGTTGAAGAGAAGCCCTTAGAAATGGGACAAACATTGTAATTCTCTTAGAGAACTGTAACTTAAACAGAAATACACTTAATAGAAGAGGAAAGAAAATGGTTCATGTGACACAAAGGTCCCATGTGTTGACTTCTTTGGTAAGATCAAATAAGTATTTAAGCCTAGCAATAGGGTCAGTCCAGTTAGTATTTCTCCTCACAAATGGTGAATATCAACTCCAGGATGGCTGGAGTTTTCTCATGGTTTGGTTCCACGCCATCTGCATGTCTTTACAAGTGATAAAAACCAGAATTTTCCAGCTGCTACTAGTCACAGGGGGTCCCCAATATGGGTTGTTTAATTATGATGACGGGTCCTGTCAATTGCATCCAGTAAAATTGGTCACATAGAGAACTCATCTAAAACTGAGGTTTTGTTGTGGTTTTGAAAGGTCCATTGGAATCCAGATTTGCAAAGCATGTCAAGTTATGGCAAAACATATGCCACCCATCTCAAAATCTTTCCTTATTATTGCATAACTTTGAAAGCCACTGTTGCGTTTGTTGCGATGAGGTTAGAGTTTTGTTGACATGATGATATTACTCTCTTCCTCTGGGTGAGACACATCTGGATTCTCACTTGGAGCAGGGCTCTGTACATCCTTCTGGGATTTGGTTGAGTAGGTAATATACATGCTTCTCATTAGGAAAATTCCAGCAATTACTGCAAAATAGCTCCCATAAACTAAAAACTGGAGAAAAACAAATAATTAGCCACATATAAAATATGACCATCTATGTCAATGATAATACATCCTAATACTGTTGGTTTGCTTGGATTATGGGGTAACTGAGACCCAGGTTTTTAATATGGGTCATTTAGGTTGAACAATACTCTCCTATCAAGTAAGAAATCAAGATCAAGTAAGAAGGTGTAAGCAATACGGTGACTAAGAGTCTTGGCTTTAGAGCAGGTTGCTTGGGTTAAAATCATAGTTACTATCATCAATAGTAAAAAACAAAACAAAACAAACCCAAAAAAACACTAAAACTCATTGACCTGTCTCTATGTCTTTGTTTGGAGGCTGGTGCAATGCTACATTCAATGTCTCCAAGAATAAATTTAAGCATTGAGGTTACTTCTTACCTGCCTTATCCATGTAAATGTTGTCCTAGTTGCAATTATTGCTCAAAACCTACTTGGTGTGTTATAATATGATAATGAAGGAATTATGTATTTTTTAATTGCTTAACCAAGGAACTCAAGAAATTTAAATATTGCTTGTTGTAAGGTTGAGAAATTTTTGAGGTTACCTAGTTGAAAACAGAAGTATTGCAGCTTACCTGAATGCTGACTGGCAAGTTGAGCCCTCTCTGATCTACTACAATCACAGCCATGATGGTCTGAATCACCAAGGCAATAAAGGTGTTGATTCCAAATACCAAGGCATAGCGTTCCACATTCAGATTAACTGCAATCTGAAATCTATCATTAAACATAAATAAGCATTTTAACTATAATATACATGGATGGAAGTCTTAAAAAGATAGAACATATTGGCCACAGGGGTATTTGTGTCACCCACCTCCAGCTCCAGGTAGTCCAGCAAAGAGAGAGAGAGACTGTCTGGAAGAAAGTAAAGGAAAAGAACAAGTGTCTCTGTCTGGTAATCCAGAGAATTCTTCTGGATCTTATCCAAGACCACCAAAGCAGTAGCTCTAAGAGTCTGCTAGAACCACAGTGTTACTGGGCTTGGGGTGCTCCCTAATGTAGATACAGTTTAGATCACAACACCCAAATCCTTCTGAATACCTGGAAAGCCTTCCCACGGAGGACAGGTACAAAAAAGCCCAGACAGCAAAGACTACAATAAATACAACTCTTCAATACCCTGACACTGATGAACATCCATAAGCATCAAGATCATCCAGGAAAACGTTCTCACCAAACAAACTAAATAAGGCACCAGGGACCAATCCTGGAGAAACATATACGACCTTTTAGACACAGAATTCAAAATAGCTGTGTTAAGAAAACGCAAAGAAATTCAAGATAACACAAAGAAGGAATTCAGAATTCTGTCAGATAAATTTAATAAAGAGATTGAAATAATTAAAAAGAATCAAGCAGAAATGCTGTGGTTGAAAAATGCAATTGACATACTGAGAATGCATCAGAATCTCATACCAGCAGAACTGATCAAGCAGAAGAAATAATTAGCAAGCTTGAAGACAAGCTATTTAAAAATACAGTCAGGAGACAACAGAAAAAAGAAGAATGAGGCACACCTACAATACCTAGAAAACAGCCTCAAAAAGGAAAATCTAAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGTAAAGAAATAGATAGAGGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATATCAGAGAGCTTCCCAAACCTAAAGAGATCAATATCCAAGGACAAGGTTACAGAACACCAAGCAGATTTAACCCAAAGAAGACTACTTAGAGGTATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGTTAAGGATAAAGAAAGGATTCTAAAAGGAGCAAGAGAAAGGAAATAAATAACATACAAGAGAGCTCCAATGTCTGGCAGCAGTCTTTTCAGTAGAAATTTTAGAACCAGGGAGTGGCATGACATATTTAAAGTGCTGAAGGAGAAAAACTTTTACCCTAGAATAGTATATCCAGTGAAAATATCAAACCCGAAGGAGAAATAAAGACCATCCCAGACAAATAGAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAGACCTGTCCTACAAGAAATGCTGAAGGGAGTACTTCCATCTCTAAGAAAAGGACGTTCATGCGCAATAAGAAAACATGTAAAGGCACAAAACTCACTTGTAATAATAGGTACATAGAACAACACAGAATATTATCACACTGTAACTGGGGTATGTAAACTACTCTCATAAGTAGAAAGACTAAAAGATGAACCAATCAAAAATAGTAACTACAAATTTTCAAGACAAATAGTACAATAAGATATAAAGAGAAACAACAAAAAGTTAAAAAGCAGGAGGACAAAGCTACACTGTAGAGTTTTTATTAGTTTTCTTTTTGCTTGTTTGTTTATGCAAATAGTCTTAAGTTGTTATCAGCTTAAAATAATGGGTTATAAGATAGTATTGCAAGCCTCATGGTAATCTCAAATTGAAAAACATGCAATGGATACCCAAAAAGTAAAAAAGAAATTAAATTATATCACCAGAGAAAATCACCTTCACTAAAAGGAAGAAAGAAAAGGAAAAACACTGCAAAACCAGAAAAGAAATAACAAAATAACAGGAGTAAGTCCTTACTTATCAATCTAAACTCTTCAAAAGAGAGTGGTTGAATGGATTTTTAAAAAGACCCAATGACCTGTTGCCTACAAGAAAGACATTTTACCTATAGAGACATACATAGACTGAAAATGAAGGGATGG
Task1_train_5663
A change on Chromosome 2 affects gene SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Biotin-responsive basal ganglia disease
GCCTGGGTGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAAACCAAAACAAAACAAAATCAGGTGTTTTATTCCACTCCCCCCATCAGTGTTTTCTTATTTCTAATACTTCTAGAAACCTCCTTTAAGTTTTCCTATTTTAGACAGACACCACACAGGTGCTCTTTTTTGGGAGGAGGGGGATGAGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCATAGCTCACTGTAGCCTCTGACTCCTGTGCTCAACCCATCCTCCCACCATGGCCTCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGCACACACCACGCTGCCCAGCTAATTTTTTAATTTTTTAGTAGAGTCAGGTGTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACCTCTGGCCTCAAGCAAAACTCCCACCTTGGCCTCCCAAATTGCTCGGATTACAGGAGTGAGCCACTGCACCTGGCCCATAGATGCATTAACACCTGTCTATGGTGGTGGAGAGAAGGCTCACTGCCTCTCCCAGGCCACTGGGAAATGACCTTGTGTATTCTGCAAATACACAAGAGGATCTGAAGCTATTCTTGAGGGAGACTTTCAACAGCAAAACTCAGAGCACAAAATGGAAAATAATCATAAAAAAATTAAATAATAATACTATCAAATCATAACGTGAATAATGCTGTTATTAGAGTTGAAGAGAAGCCCTTAGAAATGGGACAAACATTGTAATTCTCTTAGAGAACTGTAACTTAAACAGAAATACACTTAATAGAAGAGGAAAGAAAATGGTTCATGTGACACAAAGGTCCCATGTGTTGACTTCTTTGGTAAGATCAAATAAGTATTTAAGCCTAGCAATAGGGTCAGTCCAGTTAGTATTTCTCCTCACAAATGGTGAATATCAACTCCAGGATGGCTGGAGTTTTCTCATGGTTTGGTTCCACGCCATCTGCATGTCTTTACAAGTGATAAAAACCAGAATTTTCCAGCTGCTACTAGTCACAGGGGGTCCCCAATATGGGTTGTTTAATTATGATGACGGGTCCTGTCAATTGCATCCAGTAAAATTGGTCACATAGAGAACTCATCTAAAACTGAGGTTTTGTTGTGGTTTTGAAAGGTCCATTGGAATCCAGATTTGCAAAGCATGTCAAGTTATGGCAAAACATATGCCACCCATCTCAAAATCTTTCCTTATTATTGCATAACTTTGAAAGCCACTGTTGCGTTTGTTGCGATGAGGTTAGAGTTTTGTTGACATGATGATATTACTCTCTTCCTCTGGGTGAGACACATCTGGATTCTCACTTGGAGCAGGGCTCTGTACATCCTTCTGGGATTTGGTTGAGTAGGTAATATACATGCTTCTCATTAGGAAAATTCCAGCAATTACTGCAAAATAGCTCCCATAAACTAAAAACTGGAGAAAAACAAATAATTAGCCACATATAAAATATGACCATCTATGTCAATGATAATACATCCTAATACTGTTGGTTTGCTTGGATTATGGGGTAACTGAGACCCAGGTTTTTAATATGGGTCATTTAGGTTGAACAATACTCTCCTATCAAGTAAGAAATCAAGATCAAGTAAGAAGGTGTAAGCAATACGGTGACTAAGAGTCTTGGCTTTAGAGCAGGTTGCTTGGGTTAAAATCATAGTTACTATCATCAATAGTAAAAAACAAAACAAAACAAACCCAAAAAAACACTAAAACTCATTGACCTGTCTCTATGTCTTTGTTTGGAGGCTGGTGCAATGCTACATTCAATGTCTCCAAGAATAAATTTAAGCATTGAGGTTACTTCTTACCTGCCTTATCCATGTAAATGTTGTCCTAGTTGCAATTATTGCTCAAAACCTACTTGGTGTGTTATAATATGATAATGAAGGAATTATGTATTTTTTAATTGCTTAACCAAGGAACTCAAGAAATTTAAATATTGCTTGTTGTAAGGTTGAGAAATTTTTGAGGTTACCTAGTTGAAAACAGAAGTATTGCAGCTTACCTGAATGCTGACTGGCAAGTTGAGCCCTCTCTGATCTACTACAATCACAGTCATGATGGTCTGAATCACCAAGGCAATAAAGGTGTTGATTCCAAATACCAAGGCATAGCGTTCCACATTCAGATTAACTGCAATCTGAAATCTATCATTAAACATAAATAAGCATTTTAACTATAATATACATGGATGGAAGTCTTAAAAAGATAGAACATATTGGCCACAGGGGTATTTGTGTCACCCACCTCCAGCTCCAGGTAGTCCAGCAAAGAGAGAGAGAGACTGTCTGGAAGAAAGTAAAGGAAAAGAACAAGTGTCTCTGTCTGGTAATCCAGAGAATTCTTCTGGATCTTATCCAAGACCACCAAAGCAGTAGCTCTAAGAGTCTGCTAGAACCACAGTGTTACTGGGCTTGGGGTGCTCCCTAATGTAGATACAGTTTAGATCACAACACCCAAATCCTTCTGAATACCTGGAAAGCCTTCCCACGGAGGACAGGTACAAAAAAGCCCAGACAGCAAAGACTACAATAAATACAACTCTTCAATACCCTGACACTGATGAACATCCATAAGCATCAAGATCATCCAGGAAAACGTTCTCACCAAACAAACTAAATAAGGCACCAGGGACCAATCCTGGAGAAACATATACGACCTTTTAGACACAGAATTCAAAATAGCTGTGTTAAGAAAACGCAAAGAAATTCAAGATAACACAAAGAAGGAATTCAGAATTCTGTCAGATAAATTTAATAAAGAGATTGAAATAATTAAAAAGAATCAAGCAGAAATGCTGTGGTTGAAAAATGCAATTGACATACTGAGAATGCATCAGAATCTCATACCAGCAGAACTGATCAAGCAGAAGAAATAATTAGCAAGCTTGAAGACAAGCTATTTAAAAATACAGTCAGGAGACAACAGAAAAAAGAAGAATGAGGCACACCTACAATACCTAGAAAACAGCCTCAAAAAGGAAAATCTAAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGTAAAGAAATAGATAGAGGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATATCAGAGAGCTTCCCAAACCTAAAGAGATCAATATCCAAGGACAAGGTTACAGAACACCAAGCAGATTTAACCCAAAGAAGACTACTTAGAGGTATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGTTAAGGATAAAGAAAGGATTCTAAAAGGAGCAAGAGAAAGGAAATAAATAACATACAAGAGAGCTCCAATGTCTGGCAGCAGTCTTTTCAGTAGAAATTTTAGAACCAGGGAGTGGCATGACATATTTAAAGTGCTGAAGGAGAAAAACTTTTACCCTAGAATAGTATATCCAGTGAAAATATCAAACCCGAAGGAGAAATAAAGACCATCCCAGACAAATAGAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAGACCTGTCCTACAAGAAATGCTGAAGGGAGTACTTCCATCTCTAAGAAAAGGACGTTCATGCGCAATAAGAAAACATGTAAAGGCACAAAACTCACTTGTAATAATAGGTACATAGAACAACACAGAATATTATCACACTGTAACTGGGGTATGTAAACTACTCTCATAAGTAGAAAGACTAAAAGATGAACCAATCAAAAATAGTAACTACAAATTTTCAAGACAAATAGTACAATAAGATATAAAGAGAAACAACAAAAAGTTAAAAAGCAGGAGGACAAAGCTACACTGTAGAGTTTTTATTAGTTTTCTTTTTGCTTGTTTGTTTATGCAAATAGTCTTAAGTTGTTATCAGCTTAAAATAATGGGTTATAAGATAGTATTGCAAGCCTCATGGTAATCTCAAATTGAAAAACATGCAATGGATACCCAAAAAGTAAAAAAGAAATTAAATTATATCACCAGAGAAAATCACCTTCACTAAAAGGAAGAAAGAAAAGGAAAAACACTGCAAAACCAGAAAAGAAATAACAAAATAACAGGAGTAAGTCCTTACTTATCAATCTAAACTCTTCAAAAGAGAGTGGTTGAATGGATTTTTAAAAAGACCCAATGACCTGTTGCCTACAAGAAAGACATTTTACCTATAGAGACATACATAGACTGAAAATGAAGGGATGG
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Task1_train_5664
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Thiamine metabolism dysfunction syndrome 2 (biotin/thiamine-responsive basal ganglia disease type)
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Task1_train_5665
This is a variant in SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Biotin-responsive basal ganglia disease
CAAGAAATTGAAATAATTGACAGTAATTAGGGTTAGCACTTTTGTGTGGTTCTCTTTAACAAAGGTAAAAGGTATTTAGGGCTGGGGACAGTGGCGCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGGGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTAGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCCAGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGCATGGTGGCGGGCACCTGCAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGAGGCAGAGTTTGCAATGAGCTGAAATCATGCCACTGCAATCCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGACTCTGTCTAAAATAAATAAATAAACAAAAGGTATTTAGATTTCAAATTACTACATTGACATATGACTAACTTTCCCACATGTGATCATGACCACAGAGGAAAAAAAAAATAACTATTTTTCCCCCCATGGATTTGGAATGTAGGAGCAATAATTTCAGTGAAGCAATTCTGGCACAGTCCTGGTTTCCAGGAGTTAAACTGAAGCTTCCCAAAAGGGAGATAATAATAAAATAGAGGTCACACGGGTTTTCTAAAACTTTTTGTAAATGAGGGTGGGGCGAATTCTCACTTCCTAAAAAATATCTTCAAAGTCTCATTTGACATTTAAGCTTCCAGTTACTAGGAAATAAACATTTATTGTAGATTAAACTTCAAAGACAGATTTCCCTCTGATATTAAAATCCTGACTTTCACATCTCTTCCAGCCCTCATTTAAATACCATGAGAAAGCTGCTTTTGAAAGTTGTTGGTGTATAGCCTAGAATTGTTATAGGTGCATGCTAGCTAGTTCAAATCCTGTATTAACAAAACCCTCAGTGAGAATTTGGAATCCTTAATTTATTTTCTAAAATAATGAAAACATATACACATATATGTATATATTTTGATATTAAAAATAATCCTAAAAGAACAGGGCATGTTATTAACCTTTGTGCTAATGATGAATTGGAATCTTAGGGATTCAACTAGAATTTCATTGTTTGGTGCTAATCCCTGAGCTCCTAAGAGTTACTTCTTGTGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCTGAGGCGGGTAGATCATGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCATTCCAGCTTGGTGACAGAGTGAGGCTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGTTACTTGTAACTACAACACAATAGAAAGTCACAGTATTCTTATTTTTCCAGTGACTTTCATTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGAGAGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCATGACCGGCTAATTTCTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGTCCTCGTGATTCGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGCCTACCTATTTTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGCATTAGCCAGGATGGTCTCGACCTCCTGAAATCGTGATCCACGCGTCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACCATGCCCGGCCGTGACTTTCATTCTTGACTGAAAAAAGTTATGCTTCCTTCTGAACAGAGCTAATTCGCTGCCATGAAGTTCGGTACCTGGAGGAATGGACTTAAGCGGGTAAAGCCAACAAAGGAAGATTAAGTGACATTTGCTTACCTCCAAAGGTTGCAATAGCTTCTACGGCCCCATTATAGATGGAAGAATCTTGGGATGGCGCCTTGTAATCCCACAGGATTTGAACATAGTTCAAAACCTGGTTAAAACCTGCTGTGGCGAAAGCCCACCATAGAGACCAGTAGAAAAGACGTTTTGAGGAGTAGCACTCCTTCAAATCTTGGAACCACTGCACAAAAACGTCCACAGTCACATTGCTTGGTTTCAGGCTGTTCAGCTGGCCCTTATTCAGCTTCCCTGAAGTGCTGAGTATTTCTGATGTGGGTTTCTGCTCTTCACAGCCTGGTGCTTCACCTTCGTGAGTTTCCTCTAATACTGGATTCACGCTTGATGACTTCTTTATTTCTCTGCTGGGTTTTGCATGAAAAAACATGCTTTTCTTGGGCATTGGTAGGAAAAGTGAGAAAAGGAAAGCCACGGAGACAGAGGCCAAGGATATGACGTTGAGGTAAAAGTACGACATGTTCGCCAGGGATACCAAGAGTTGAGCCAGCACCGACCCTGCTGTGTAGGCGGCCAGCGTGACGCTCCTGCAGTAGCCGCTCACTCTCTGGTAGTGCTCGGGGCTGACCACGCTGTATATGTAGGCGTAGTAGGCCACCTCGGCGGCGGTGACCATCCCATAGAAGAACTCTACAACCTGCATGGTCTTCACTCCTTGGCCAAACAACAGCAGCAGCCAGGTAATGATGAAACTGATACCTTGCAAGATGATGACTGGCTTGTAGCGGACATAATCGGTGAGGACAAACACAGGCAGCAGCAGCACCAGGTAGGAGTATGTCCAAACGGGGAAGATCTCATTTGTTATCTGCAAAGTTGGTAAATTGCATGACCACGAAGCACCGGTACTTTACTAAGGTACCTGTGGTTTGTATCTCAAATTCTGCCTCCAATTGGAAATTATTCGCATTACGGAGAAACATAATGAGAAAACTGATTTTCAAGGAAATCACAAGAAAAGATAGTCTCCTTTCCCATTGGTAAAAACCAATGTACACACTTAGATAAACCCCGGCAGAAAAATATATTGGCTTATTGTGCAATCTGAATTATGTATTAAGTTTAGATAGTATGTACAGTTGAGTAGATGAGTTAAAAAGTTTTTGGACACTTCTAAGATTTTCCGATTCTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTGCTCAGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCGATCTTCGCTGACTGCAACCACCATCTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCCATCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTAGAAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGTTGATCTTGAACTCCTGAACTTAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCAAGATTCTTAAAAAATATAATTTCCTTCTTGTTTGAATATTAACATTAGACAAGTAGACCACAATGTTAAAAGAATCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTACAACTAAAAACACAAAAATTAGCCATGAATGGTGGCAGACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGAGAGCCGAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTGAACAACAACAACAAAAAGAATCCAACAGCCTTTATTTTCATGTGATCTATCACTACATCAAATATTTCAGCCCTTCCAACATCTGGAAAGATATGGGAAAATAGGGAAAGAGTAAATAACTTTGCCACATTATAGAGTGGAAGCAAATAATGTATCTCATTTTCCTTCATGGGCAAATTTGCTAGGTTCCCAACCTTCCCCCTGCTCCCCCTAACAATTCTGCTGATTTGTTTATGGCTCAATTTAATATGGATCATCTCACA
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Task1_train_5666
This gene mutation involves SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) on Chromosome 2. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Biotin-responsive basal ganglia disease
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Task1_train_5667
Here’s a variant in SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) located on Chromosome 2. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Biotin-responsive basal ganglia disease
GCACTTTGGGAGGCTGAAGGGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTAGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCCAGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGCATGGTGGCGGGCACCTGCAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGAGGCAGAGTTTGCAATGAGCTGAAATCATGCCACTGCAATCCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGACTCTGTCTAAAATAAATAAATAAACAAAAGGTATTTAGATTTCAAATTACTACATTGACATATGACTAACTTTCCCACATGTGATCATGACCACAGAGGAAAAAAAAAATAACTATTTTTCCCCCCATGGATTTGGAATGTAGGAGCAATAATTTCAGTGAAGCAATTCTGGCACAGTCCTGGTTTCCAGGAGTTAAACTGAAGCTTCCCAAAAGGGAGATAATAATAAAATAGAGGTCACACGGGTTTTCTAAAACTTTTTGTAAATGAGGGTGGGGCGAATTCTCACTTCCTAAAAAATATCTTCAAAGTCTCATTTGACATTTAAGCTTCCAGTTACTAGGAAATAAACATTTATTGTAGATTAAACTTCAAAGACAGATTTCCCTCTGATATTAAAATCCTGACTTTCACATCTCTTCCAGCCCTCATTTAAATACCATGAGAAAGCTGCTTTTGAAAGTTGTTGGTGTATAGCCTAGAATTGTTATAGGTGCATGCTAGCTAGTTCAAATCCTGTATTAACAAAACCCTCAGTGAGAATTTGGAATCCTTAATTTATTTTCTAAAATAATGAAAACATATACACATATATGTATATATTTTGATATTAAAAATAATCCTAAAAGAACAGGGCATGTTATTAACCTTTGTGCTAATGATGAATTGGAATCTTAGGGATTCAACTAGAATTTCATTGTTTGGTGCTAATCCCTGAGCTCCTAAGAGTTACTTCTTGTGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCTGAGGCGGGTAGATCATGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCATTCCAGCTTGGTGACAGAGTGAGGCTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGTTACTTGTAACTACAACACAATAGAAAGTCACAGTATTCTTATTTTTCCAGTGACTTTCATTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGAGAGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCATGACCGGCTAATTTCTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGTCCTCGTGATTCGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGCCTACCTATTTTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGCATTAGCCAGGATGGTCTCGACCTCCTGAAATCGTGATCCACGCGTCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACCATGCCCGGCCGTGACTTTCATTCTTGACTGAAAAAAGTTATGCTTCCTTCTGAACAGAGCTAATTCGCTGCCATGAAGTTCGGTACCTGGAGGAATGGACTTAAGCGGGTAAAGCCAACAAAGGAAGATTAAGTGACATTTGCTTACCTCCAAAGGTTGCAATAGCTTCTACGGCCCCATTATAGATGGAAGAATCTTGGGATGGCGCCTTGTAATCCCACAGGATTTGAACATAGTTCAAAACCTGGTTAAAACCTGCTGTGGCGAAAGCCCACCATAGAGACCAGTAGAAAAGACGTTTTGAGGAGTAGCACTCCTTCAAATCTTGGAACCACTGCACAAAAACGTCCACAGTCACATTGCTTGGTTTCAGGCTGTTCAGCTGGCCCTTATTCAGCTTCCCTGAAGTGCTGAGTATTTCTGATGTGGGTTTCTGCTCTTCACAGCCTGGTGCTTCACCTTCGTGAGTTTCCTCTAATACTGGATTCACGCTTGATGACTTCTTTATTTCTCTGCTGGGTTTTGCATGAAAAAACATGCTTTTCTTGGGCATTGGTAGGAAAAGTGAGAAAAGGAAAGCCACGGAGACAGAGGCCAAGGATATGACGTTGAGGTAAAAGTACGACATGTTCGCCAGGGATACCAAGAGTTGAGCCAGCACCGACCCTGCTGTGTAGGCGGCCAGCGTGACGCTCCTGCAGTAGCCGCTCACTCTCTGGTAGTGCTCGGGGCTGACCACGCTGTATATGTAGGCGTAGTAGGCCACCTCGGCGGCGGTGACCATCCCATAGAAGAACTCTACAACCTGCATGGTCTTCACTCCTTGGCCAAACAACAGCAGCAGCCAGGTAATGATGAAACTGATACCTTGCAAGATGATGACTGGCTTGTAGCGGACATAATCGGTGAGGACAAACACAGGCAGCAGCAGCACCAGGTAGGAGTATGTCCAAACGGGGAAGATCTCATTTGTTATCTGCAAAGTTGGTAAATTGCATGACCACGAAGCACCGGTACTTTACTAAGGTACCTGTGGTTTGTATCTCAAATTCTGCCTCCAATTGGAAATTATTCGCATTACGGAGAAACATAATGAGAAAACTGATTTTCAAGGAAATCACAAGAAAAGATAGTCTCCTTTCCCATTGGTAAAAACCAATGTACACACTTAGATAAACCCCGGCAGAAAAATATATTGGCTTATTGTGCAATCTGAATTATGTATTAAGTTTAGATAGTATGTACAGTTGAGTAGATGAGTTAAAAAGTTTTTGGACACTTCTAAGATTTTCCGATTCTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTGCTCAGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCGATCTTCGCTGACTGCAACCACCATCTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCCATCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTAGAAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGTTGATCTTGAACTCCTGAACTTAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCAAGATTCTTAAAAAATATAATTTCCTTCTTGTTTGAATATTAACATTAGACAAGTAGACCACAATGTTAAAAGAATCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTACAACTAAAAACACAAAAATTAGCCATGAATGGTGGCAGACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGAGAGCCGAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTGAACAACAACAACAAAAAGAATCCAACAGCCTTTATTTTCATGTGATCTATCACTACATCAAATATTTCAGCCCTTCCAACATCTGGAAAGATATGGGAAAATAGGGAAAGAGTAAATAACTTTGCCACATTATAGAGTGGAAGCAAATAATGTATCTCATTTTCCTTCATGGGCAAATTTGCTAGGTTCCCAACCTTCCCCCTGCTCCCCCTAACAATTCTGCTGATTTGTTTATGGCTCAATTTAATATGGATCATCTCACAGATTTAGTCAGAAATGCATGGGATCTCAATTTTCACAGTTGGAAGGACTGGAGTTGCTGATCTGTAGGGATGGGTGAGTGCCGCAGCCTCTCAAATCACTGAACGTACCCAC
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Task1_train_5668
Chromosome 2 houses a mutation in gene SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Biotin-responsive basal ganglia disease
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Task1_train_5669
Here’s a variant in SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) located on Chromosome 2. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; not specified
AATAATTTCAGTGAAGCAATTCTGGCACAGTCCTGGTTTCCAGGAGTTAAACTGAAGCTTCCCAAAAGGGAGATAATAATAAAATAGAGGTCACACGGGTTTTCTAAAACTTTTTGTAAATGAGGGTGGGGCGAATTCTCACTTCCTAAAAAATATCTTCAAAGTCTCATTTGACATTTAAGCTTCCAGTTACTAGGAAATAAACATTTATTGTAGATTAAACTTCAAAGACAGATTTCCCTCTGATATTAAAATCCTGACTTTCACATCTCTTCCAGCCCTCATTTAAATACCATGAGAAAGCTGCTTTTGAAAGTTGTTGGTGTATAGCCTAGAATTGTTATAGGTGCATGCTAGCTAGTTCAAATCCTGTATTAACAAAACCCTCAGTGAGAATTTGGAATCCTTAATTTATTTTCTAAAATAATGAAAACATATACACATATATGTATATATTTTGATATTAAAAATAATCCTAAAAGAACAGGGCATGTTATTAACCTTTGTGCTAATGATGAATTGGAATCTTAGGGATTCAACTAGAATTTCATTGTTTGGTGCTAATCCCTGAGCTCCTAAGAGTTACTTCTTGTGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCTGAGGCGGGTAGATCATGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCATTCCAGCTTGGTGACAGAGTGAGGCTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGTTACTTGTAACTACAACACAATAGAAAGTCACAGTATTCTTATTTTTCCAGTGACTTTCATTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGAGAGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCATGACCGGCTAATTTCTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGTCCTCGTGATTCGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGCCTACCTATTTTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGCATTAGCCAGGATGGTCTCGACCTCCTGAAATCGTGATCCACGCGTCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACCATGCCCGGCCGTGACTTTCATTCTTGACTGAAAAAAGTTATGCTTCCTTCTGAACAGAGCTAATTCGCTGCCATGAAGTTCGGTACCTGGAGGAATGGACTTAAGCGGGTAAAGCCAACAAAGGAAGATTAAGTGACATTTGCTTACCTCCAAAGGTTGCAATAGCTTCTACGGCCCCATTATAGATGGAAGAATCTTGGGATGGCGCCTTGTAATCCCACAGGATTTGAACATAGTTCAAAACCTGGTTAAAACCTGCTGTGGCGAAAGCCCACCATAGAGACCAGTAGAAAAGACGTTTTGAGGAGTAGCACTCCTTCAAATCTTGGAACCACTGCACAAAAACGTCCACAGTCACATTGCTTGGTTTCAGGCTGTTCAGCTGGCCCTTATTCAGCTTCCCTGAAGTGCTGAGTATTTCTGATGTGGGTTTCTGCTCTTCACAGCCTGGTGCTTCACCTTCGTGAGTTTCCTCTAATACTGGATTCACGCTTGATGACTTCTTTATTTCTCTGCTGGGTTTTGCATGAAAAAACATGCTTTTCTTGGGCATTGGTAGGAAAAGTGAGAAAAGGAAAGCCACGGAGACAGAGGCCAAGGATATGACGTTGAGGTAAAAGTACGACATGTTCGCCAGGGATACCAAGAGTTGAGCCAGCACCGACCCTGCTGTGTAGGCGGCCAGCGTGACGCTCCTGCAGTAGCCGCTCACTCTCTGGTAGTGCTCGGGGCTGACCACGCTGTATATGTAGGCGTAGTAGGCCACCTCGGCGGCGGTGACCATCCCATAGAAGAACTCTACAACCTGCATGGTCTTCACTCCTTGGCCAAACAACAGCAGCAGCCAGGTAATGATGAAACTGATACCTTGCAAGATGATGACTGGCTTGTAGCGGACATAATCGGTGAGGACAAACACAGGCAGCAGCAGCACCAGGTAGGAGTATGTCCAAACGGGGAAGATCTCATTTGTTATCTGCAAAGTTGGTAAATTGCATGACCACGAAGCACCGGTACTTTACTAAGGTACCTGTGGTTTGTATCTCAAATTCTGCCTCCAATTGGAAATTATTCGCATTACGGAGAAACATAATGAGAAAACTGATTTTCAAGGAAATCACAAGAAAAGATAGTCTCCTTTCCCATTGGTAAAAACCAATGTACACACTTAGATAAACCCCGGCAGAAAAATATATTGGCTTATTGTGCAATCTGAATTATGTATTAAGTTTAGATAGTATGTACAGTTGAGTAGATGAGTTAAAAAGTTTTTGGACACTTCTAAGATTTTCCGATTCTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTGCTCAGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCGATCTTCGCTGACTGCAACCACCATCTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCCATCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTAGAAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGTTGATCTTGAACTCCTGAACTTAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCAAGATTCTTAAAAAATATAATTTCCTTCTTGTTTGAATATTAACATTAGACAAGTAGACCACAATGTTAAAAGAATCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTACAACTAAAAACACAAAAATTAGCCATGAATGGTGGCAGACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGAGAGCCGAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTGAACAACAACAACAAAAAGAATCCAACAGCCTTTATTTTCATGTGATCTATCACTACATCAAATATTTCAGCCCTTCCAACATCTGGAAAGATATGGGAAAATAGGGAAAGAGTAAATAACTTTGCCACATTATAGAGTGGAAGCAAATAATGTATCTCATTTTCCTTCATGGGCAAATTTGCTAGGTTCCCAACCTTCCCCCTGCTCCCCCTAACAATTCTGCTGATTTGTTTATGGCTCAATTTAATATGGATCATCTCACAGATTTAGTCAGAAATGCATGGGATCTCAATTTTCACAGTTGGAAGGACTGGAGTTGCTGATCTGTAGGGATGGGTGAGTGCCGCAGCCTCTCAAATCACTGAACGTACCCACCTTGACACCTGGATCACTGAGGTTGCTGGAGAAAGCAGGAGGCCACAGAGCAAAGACCACACAACTGAGCTGCTCCTTGGAGGGAAGGTCTGTTAACTGGTCCACAGTGGCTCGAGAAGCAGAACCCAGTGGATTCATTGAGTTGCTTCTGACCCTGCATCTGTCCTTTGTTGTCTTAATTGTGGCATGCTTCAACCTGAGCAACTCGGAAACAGGGTTGTCCCTAAGTGATCTGATGCTACAGAAGAAGCTTGCCTTTCTGTCTTTGCCACCTCACCACCCGAGGCACCCATCAGCCTTGCAGGCGAAGCCACACACTTTACACAGTGTTTTCAAGGCTAAGGCTGGAGATTGTAAAATCAGCCCAGGGTAATTTTGCAGTTAGG
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Task1_train_5670
This variant affects gene SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; not specified
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Task1_train_5671
Here is a variant affecting SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Biotin-responsive basal ganglia disease
ATAAACATTTATTGTAGATTAAACTTCAAAGACAGATTTCCCTCTGATATTAAAATCCTGACTTTCACATCTCTTCCAGCCCTCATTTAAATACCATGAGAAAGCTGCTTTTGAAAGTTGTTGGTGTATAGCCTAGAATTGTTATAGGTGCATGCTAGCTAGTTCAAATCCTGTATTAACAAAACCCTCAGTGAGAATTTGGAATCCTTAATTTATTTTCTAAAATAATGAAAACATATACACATATATGTATATATTTTGATATTAAAAATAATCCTAAAAGAACAGGGCATGTTATTAACCTTTGTGCTAATGATGAATTGGAATCTTAGGGATTCAACTAGAATTTCATTGTTTGGTGCTAATCCCTGAGCTCCTAAGAGTTACTTCTTGTGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCTGAGGCGGGTAGATCATGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCATTCCAGCTTGGTGACAGAGTGAGGCTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGTTACTTGTAACTACAACACAATAGAAAGTCACAGTATTCTTATTTTTCCAGTGACTTTCATTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGAGAGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCATGACCGGCTAATTTCTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGTCCTCGTGATTCGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGCCTACCTATTTTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGCATTAGCCAGGATGGTCTCGACCTCCTGAAATCGTGATCCACGCGTCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACCATGCCCGGCCGTGACTTTCATTCTTGACTGAAAAAAGTTATGCTTCCTTCTGAACAGAGCTAATTCGCTGCCATGAAGTTCGGTACCTGGAGGAATGGACTTAAGCGGGTAAAGCCAACAAAGGAAGATTAAGTGACATTTGCTTACCTCCAAAGGTTGCAATAGCTTCTACGGCCCCATTATAGATGGAAGAATCTTGGGATGGCGCCTTGTAATCCCACAGGATTTGAACATAGTTCAAAACCTGGTTAAAACCTGCTGTGGCGAAAGCCCACCATAGAGACCAGTAGAAAAGACGTTTTGAGGAGTAGCACTCCTTCAAATCTTGGAACCACTGCACAAAAACGTCCACAGTCACATTGCTTGGTTTCAGGCTGTTCAGCTGGCCCTTATTCAGCTTCCCTGAAGTGCTGAGTATTTCTGATGTGGGTTTCTGCTCTTCACAGCCTGGTGCTTCACCTTCGTGAGTTTCCTCTAATACTGGATTCACGCTTGATGACTTCTTTATTTCTCTGCTGGGTTTTGCATGAAAAAACATGCTTTTCTTGGGCATTGGTAGGAAAAGTGAGAAAAGGAAAGCCACGGAGACAGAGGCCAAGGATATGACGTTGAGGTAAAAGTACGACATGTTCGCCAGGGATACCAAGAGTTGAGCCAGCACCGACCCTGCTGTGTAGGCGGCCAGCGTGACGCTCCTGCAGTAGCCGCTCACTCTCTGGTAGTGCTCGGGGCTGACCACGCTGTATATGTAGGCGTAGTAGGCCACCTCGGCGGCGGTGACCATCCCATAGAAGAACTCTACAACCTGCATGGTCTTCACTCCTTGGCCAAACAACAGCAGCAGCCAGGTAATGATGAAACTGATACCTTGCAAGATGATGACTGGCTTGTAGCGGACATAATCGGTGAGGACAAACACAGGCAGCAGCAGCACCAGGTAGGAGTATGTCCAAACGGGGAAGATCTCATTTGTTATCTGCAAAGTTGGTAAATTGCATGACCACGAAGCACCGGTACTTTACTAAGGTACCTGTGGTTTGTATCTCAAATTCTGCCTCCAATTGGAAATTATTCGCATTACGGAGAAACATAATGAGAAAACTGATTTTCAAGGAAATCACAAGAAAAGATAGTCTCCTTTCCCATTGGTAAAAACCAATGTACACACTTAGATAAACCCCGGCAGAAAAATATATTGGCTTATTGTGCAATCTGAATTATGTATTAAGTTTAGATAGTATGTACAGTTGAGTAGATGAGTTAAAAAGTTTTTGGACACTTCTAAGATTTTCCGATTCTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTGCTCAGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCGATCTTCGCTGACTGCAACCACCATCTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCCATCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTAGAAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGTTGATCTTGAACTCCTGAACTTAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCAAGATTCTTAAAAAATATAATTTCCTTCTTGTTTGAATATTAACATTAGACAAGTAGACCACAATGTTAAAAGAATCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTACAACTAAAAACACAAAAATTAGCCATGAATGGTGGCAGACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGAGAGCCGAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTGAACAACAACAACAAAAAGAATCCAACAGCCTTTATTTTCATGTGATCTATCACTACATCAAATATTTCAGCCCTTCCAACATCTGGAAAGATATGGGAAAATAGGGAAAGAGTAAATAACTTTGCCACATTATAGAGTGGAAGCAAATAATGTATCTCATTTTCCTTCATGGGCAAATTTGCTAGGTTCCCAACCTTCCCCCTGCTCCCCCTAACAATTCTGCTGATTTGTTTATGGCTCAATTTAATATGGATCATCTCACAGATTTAGTCAGAAATGCATGGGATCTCAATTTTCACAGTTGGAAGGACTGGAGTTGCTGATCTGTAGGGATGGGTGAGTGCCGCAGCCTCTCAAATCACTGAACGTACCCACCTTGACACCTGGATCACTGAGGTTGCTGGAGAAAGCAGGAGGCCACAGAGCAAAGACCACACAACTGAGCTGCTCCTTGGAGGGAAGGTCTGTTAACTGGTCCACAGTGGCTCGAGAAGCAGAACCCAGTGGATTCATTGAGTTGCTTCTGACCCTGCATCTGTCCTTTGTTGTCTTAATTGTGGCATGCTTCAACCTGAGCAACTCGGAAACAGGGTTGTCCCTAAGTGATCTGATGCTACAGAAGAAGCTTGCCTTTCTGTCTTTGCCACCTCACCACCCGAGGCACCCATCAGCCTTGCAGGCGAAGCCACACACTTTACACAGTGTTTTCAAGGCTAAGGCTGGAGATTGTAAAATCAGCCCAGGGTAATTTTGCAGTTAGGTCAGTGCATTTTCTTGTTGTACTTCTTATAAAGAAATGCGAGGCCGGTGGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCTCTTGAGGCCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGAGCATGGTGGCTCATGCC
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Task1_train_5672
Here is a genetic alteration in SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Biotin-responsive basal ganglia disease
ATCTCTTCCAGCCCTCATTTAAATACCATGAGAAAGCTGCTTTTGAAAGTTGTTGGTGTATAGCCTAGAATTGTTATAGGTGCATGCTAGCTAGTTCAAATCCTGTATTAACAAAACCCTCAGTGAGAATTTGGAATCCTTAATTTATTTTCTAAAATAATGAAAACATATACACATATATGTATATATTTTGATATTAAAAATAATCCTAAAAGAACAGGGCATGTTATTAACCTTTGTGCTAATGATGAATTGGAATCTTAGGGATTCAACTAGAATTTCATTGTTTGGTGCTAATCCCTGAGCTCCTAAGAGTTACTTCTTGTGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCTGAGGCGGGTAGATCATGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCATTCCAGCTTGGTGACAGAGTGAGGCTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGTTACTTGTAACTACAACACAATAGAAAGTCACAGTATTCTTATTTTTCCAGTGACTTTCATTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGAGAGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCATGACCGGCTAATTTCTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGTCCTCGTGATTCGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGCCTACCTATTTTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGCATTAGCCAGGATGGTCTCGACCTCCTGAAATCGTGATCCACGCGTCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACCATGCCCGGCCGTGACTTTCATTCTTGACTGAAAAAAGTTATGCTTCCTTCTGAACAGAGCTAATTCGCTGCCATGAAGTTCGGTACCTGGAGGAATGGACTTAAGCGGGTAAAGCCAACAAAGGAAGATTAAGTGACATTTGCTTACCTCCAAAGGTTGCAATAGCTTCTACGGCCCCATTATAGATGGAAGAATCTTGGGATGGCGCCTTGTAATCCCACAGGATTTGAACATAGTTCAAAACCTGGTTAAAACCTGCTGTGGCGAAAGCCCACCATAGAGACCAGTAGAAAAGACGTTTTGAGGAGTAGCACTCCTTCAAATCTTGGAACCACTGCACAAAAACGTCCACAGTCACATTGCTTGGTTTCAGGCTGTTCAGCTGGCCCTTATTCAGCTTCCCTGAAGTGCTGAGTATTTCTGATGTGGGTTTCTGCTCTTCACAGCCTGGTGCTTCACCTTCGTGAGTTTCCTCTAATACTGGATTCACGCTTGATGACTTCTTTATTTCTCTGCTGGGTTTTGCATGAAAAAACATGCTTTTCTTGGGCATTGGTAGGAAAAGTGAGAAAAGGAAAGCCACGGAGACAGAGGCCAAGGATATGACGTTGAGGTAAAAGTACGACATGTTCGCCAGGGATACCAAGAGTTGAGCCAGCACCGACCCTGCTGTGTAGGCGGCCAGCGTGACGCTCCTGCAGTAGCCGCTCACTCTCTGGTAGTGCTCGGGGCTGACCACGCTGTATATGTAGGCGTAGTAGGCCACCTCGGCGGCGGTGACCATCCCATAGAAGAACTCTACAACCTGCATGGTCTTCACTCCTTGGCCAAACAACAGCAGCAGCCAGGTAATGATGAAACTGATACCTTGCAAGATGATGACTGGCTTGTAGCGGACATAATCGGTGAGGACAAACACAGGCAGCAGCAGCACCAGGTAGGAGTATGTCCAAACGGGGAAGATCTCATTTGTTATCTGCAAAGTTGGTAAATTGCATGACCACGAAGCACCGGTACTTTACTAAGGTACCTGTGGTTTGTATCTCAAATTCTGCCTCCAATTGGAAATTATTCGCATTACGGAGAAACATAATGAGAAAACTGATTTTCAAGGAAATCACAAGAAAAGATAGTCTCCTTTCCCATTGGTAAAAACCAATGTACACACTTAGATAAACCCCGGCAGAAAAATATATTGGCTTATTGTGCAATCTGAATTATGTATTAAGTTTAGATAGTATGTACAGTTGAGTAGATGAGTTAAAAAGTTTTTGGACACTTCTAAGATTTTCCGATTCTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTGCTCAGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCGATCTTCGCTGACTGCAACCACCATCTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCCATCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTAGAAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGTTGATCTTGAACTCCTGAACTTAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCAAGATTCTTAAAAAATATAATTTCCTTCTTGTTTGAATATTAACATTAGACAAGTAGACCACAATGTTAAAAGAATCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTACAACTAAAAACACAAAAATTAGCCATGAATGGTGGCAGACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGAGAGCCGAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTGAACAACAACAACAAAAAGAATCCAACAGCCTTTATTTTCATGTGATCTATCACTACATCAAATATTTCAGCCCTTCCAACATCTGGAAAGATATGGGAAAATAGGGAAAGAGTAAATAACTTTGCCACATTATAGAGTGGAAGCAAATAATGTATCTCATTTTCCTTCATGGGCAAATTTGCTAGGTTCCCAACCTTCCCCCTGCTCCCCCTAACAATTCTGCTGATTTGTTTATGGCTCAATTTAATATGGATCATCTCACAGATTTAGTCAGAAATGCATGGGATCTCAATTTTCACAGTTGGAAGGACTGGAGTTGCTGATCTGTAGGGATGGGTGAGTGCCGCAGCCTCTCAAATCACTGAACGTACCCACCTTGACACCTGGATCACTGAGGTTGCTGGAGAAAGCAGGAGGCCACAGAGCAAAGACCACACAACTGAGCTGCTCCTTGGAGGGAAGGTCTGTTAACTGGTCCACAGTGGCTCGAGAAGCAGAACCCAGTGGATTCATTGAGTTGCTTCTGACCCTGCATCTGTCCTTTGTTGTCTTAATTGTGGCATGCTTCAACCTGAGCAACTCGGAAACAGGGTTGTCCCTAAGTGATCTGATGCTACAGAAGAAGCTTGCCTTTCTGTCTTTGCCACCTCACCACCCGAGGCACCCATCAGCCTTGCAGGCGAAGCCACACACTTTACACAGTGTTTTCAAGGCTAAGGCTGGAGATTGTAAAATCAGCCCAGGGTAATTTTGCAGTTAGGTCAGTGCATTTTCTTGTTGTACTTCTTATAAAGAAATGCGAGGCCGGTGGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCTCTTGAGGCCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGAGCATGGTGGCTCATGCCCGTAGTCCCAGCTACTCGGGATGCTGAGGTAGGACAATTGTTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGT
ATCTCTTCCAGCCCTCATTTAAATACCATGAGAAAGCTGCTTTTGAAAGTTGTTGGTGTATAGCCTAGAATTGTTATAGGTGCATGCTAGCTAGTTCAAATCCTGTATTAACAAAACCCTCAGTGAGAATTTGGAATCCTTAATTTATTTTCTAAAATAATGAAAACATATACACATATATGTATATATTTTGATATTAAAAATAATCCTAAAAGAACAGGGCATGTTATTAACCTTTGTGCTAATGATGAATTGGAATCTTAGGGATTCAACTAGAATTTCATTGTTTGGTGCTAATCCCTGAGCTCCTAAGAGTTACTTCTTGTGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCTGAGGCGGGTAGATCATGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCATTCCAGCTTGGTGACAGAGTGAGGCTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGTTACTTGTAACTACAACACAATAGAAAGTCACAGTATTCTTATTTTTCCAGTGACTTTCATTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGAGAGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATCCGCCACCATGACCGGCTAATTTCTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGTCCTCGTGATTCGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGCCTACCTATTTTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGCATTAGCCAGGATGGTCTCGACCTCCTGAAATCGTGATCCACGCGTCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACCATGCCCGGCCGTGACTTTCATTCTTGACTGAAAAAAGTTATGCTTCCTTCTGAACAGAGCTAATTCGCTGCCATGAAGTTCGGTACCTGGAGGAATGGACTTAAGCGGGTAAAGCCAACAAAGGAAGATTAAGTGACATTTGCTTACCTCCAAAGGTTGCAATAGCTTCTACGGCCCCATTATAGATGGAAGAATCTTGGGATGGCGCCTTGTAATCCCACAGGATTTGAACATAGTTCAAAACCTGGTTAAAACCTGCTGTGGCGAAAGCCCACCATAGAGACCAGTAGAAAAGACGTTTTGAGGAGTAGCACTCCTTCAAATCTTGGAACCACTGCACAAAAACGTCCACAGTCACATTGCTTGGTTTCAGGCTGTTCAGCTGGCCCTTATTCAGCTTCCCTGAAGTGCTGAGTATTTCTGATGTGGGTTTCTGCTCTTCACAGCCTGGTGCTTCACCTTCGTGAGTTTCCTCTAATACTGGATTCACGCTTGATGACTTCTTTATTTCTCTGCTGGGTTTTGCATGAAAAAACATGCTTTTCTTGGGCATTGGTAGGAAAAGTGAGAAAAGGAAAGCCACGGAGACAGAGGCCAAGGATATGACGTTGAGGTAAAAGTACGACATGTTCGCCAGGGATACCAAGAGTTGAGCCAGCACCGACCCTGCTGTGTAGGCGGCCAGCGTGACGCTCCTGCAGTAGCCGCTCACTCTCTGGTAGTGCTCGGGGCTGACCACGCTGTATATGTAGGCGTAGTAGGCCACCTCGGCGGCGGTGACCATCCCATAGAAGAACTCTACAACCTGCATGGTCTTCACTCCTTGGCCAAACAACAGCAGCAGCCAGGTAATGATGAAACTGATACCTTGCAAGATGATGACTGGCTTGTAGCGGACATAATCGGTGAGGACAAACACAGGCAGCAGCGGCACCAGGTAGGAGTATGTCCAAACGGGGAAGATCTCATTTGTTATCTGCAAAGTTGGTAAATTGCATGACCACGAAGCACCGGTACTTTACTAAGGTACCTGTGGTTTGTATCTCAAATTCTGCCTCCAATTGGAAATTATTCGCATTACGGAGAAACATAATGAGAAAACTGATTTTCAAGGAAATCACAAGAAAAGATAGTCTCCTTTCCCATTGGTAAAAACCAATGTACACACTTAGATAAACCCCGGCAGAAAAATATATTGGCTTATTGTGCAATCTGAATTATGTATTAAGTTTAGATAGTATGTACAGTTGAGTAGATGAGTTAAAAAGTTTTTGGACACTTCTAAGATTTTCCGATTCTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTGCTCAGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCGATCTTCGCTGACTGCAACCACCATCTCCCAGGTTCAAGCCATTCTCCCATCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTAGAAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGATCAGGTTGATCTTGAACTCCTGAACTTAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCAAGATTCTTAAAAAATATAATTTCCTTCTTGTTTGAATATTAACATTAGACAAGTAGACCACAATGTTAAAAGAATCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTACAACTAAAAACACAAAAATTAGCCATGAATGGTGGCAGACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGAGAGCCGAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTGAACAACAACAACAAAAAGAATCCAACAGCCTTTATTTTCATGTGATCTATCACTACATCAAATATTTCAGCCCTTCCAACATCTGGAAAGATATGGGAAAATAGGGAAAGAGTAAATAACTTTGCCACATTATAGAGTGGAAGCAAATAATGTATCTCATTTTCCTTCATGGGCAAATTTGCTAGGTTCCCAACCTTCCCCCTGCTCCCCCTAACAATTCTGCTGATTTGTTTATGGCTCAATTTAATATGGATCATCTCACAGATTTAGTCAGAAATGCATGGGATCTCAATTTTCACAGTTGGAAGGACTGGAGTTGCTGATCTGTAGGGATGGGTGAGTGCCGCAGCCTCTCAAATCACTGAACGTACCCACCTTGACACCTGGATCACTGAGGTTGCTGGAGAAAGCAGGAGGCCACAGAGCAAAGACCACACAACTGAGCTGCTCCTTGGAGGGAAGGTCTGTTAACTGGTCCACAGTGGCTCGAGAAGCAGAACCCAGTGGATTCATTGAGTTGCTTCTGACCCTGCATCTGTCCTTTGTTGTCTTAATTGTGGCATGCTTCAACCTGAGCAACTCGGAAACAGGGTTGTCCCTAAGTGATCTGATGCTACAGAAGAAGCTTGCCTTTCTGTCTTTGCCACCTCACCACCCGAGGCACCCATCAGCCTTGCAGGCGAAGCCACACACTTTACACAGTGTTTTCAAGGCTAAGGCTGGAGATTGTAAAATCAGCCCAGGGTAATTTTGCAGTTAGGTCAGTGCATTTTCTTGTTGTACTTCTTATAAAGAAATGCGAGGCCGGTGGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCTCTTGAGGCCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGAGCATGGTGGCTCATGCCCGTAGTCCCAGCTACTCGGGATGCTGAGGTAGGACAATTGTTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGT
Task1_train_5673
This alteration occurs within gene SLC19A3 (solute carrier family 19 member 3) located on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Biotin-responsive basal ganglia disease
TGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCAAGATTCTTAAAAAATATAATTTCCTTCTTGTTTGAATATTAACATTAGACAAGTAGACCACAATGTTAAAAGAATCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTACAACTAAAAACACAAAAATTAGCCATGAATGGTGGCAGACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGAGAGCCGAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTGAACAACAACAACAAAAAGAATCCAACAGCCTTTATTTTCATGTGATCTATCACTACATCAAATATTTCAGCCCTTCCAACATCTGGAAAGATATGGGAAAATAGGGAAAGAGTAAATAACTTTGCCACATTATAGAGTGGAAGCAAATAATGTATCTCATTTTCCTTCATGGGCAAATTTGCTAGGTTCCCAACCTTCCCCCTGCTCCCCCTAACAATTCTGCTGATTTGTTTATGGCTCAATTTAATATGGATCATCTCACAGATTTAGTCAGAAATGCATGGGATCTCAATTTTCACAGTTGGAAGGACTGGAGTTGCTGATCTGTAGGGATGGGTGAGTGCCGCAGCCTCTCAAATCACTGAACGTACCCACCTTGACACCTGGATCACTGAGGTTGCTGGAGAAAGCAGGAGGCCACAGAGCAAAGACCACACAACTGAGCTGCTCCTTGGAGGGAAGGTCTGTTAACTGGTCCACAGTGGCTCGAGAAGCAGAACCCAGTGGATTCATTGAGTTGCTTCTGACCCTGCATCTGTCCTTTGTTGTCTTAATTGTGGCATGCTTCAACCTGAGCAACTCGGAAACAGGGTTGTCCCTAAGTGATCTGATGCTACAGAAGAAGCTTGCCTTTCTGTCTTTGCCACCTCACCACCCGAGGCACCCATCAGCCTTGCAGGCGAAGCCACACACTTTACACAGTGTTTTCAAGGCTAAGGCTGGAGATTGTAAAATCAGCCCAGGGTAATTTTGCAGTTAGGTCAGTGCATTTTCTTGTTGTACTTCTTATAAAGAAATGCGAGGCCGGTGGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCTCTTGAGGCCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGAGCATGGTGGCTCATGCCCGTAGTCCCAGCTACTCGGGATGCTGAGGTAGGACAATTGTTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCACCCCGTTGCACTCTAGCCTGCACAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAACAAAAACAATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGAAAGGCGTTGCTCTTTTAAGTAAGAGAAACTGGCATTCCAGAGAAGGAGGCAAGGGCTGGGAGATAAAGCTGTTAATGGCTCACCTGCTGGCAAACAGTGTCATAAAGAAATACCACAATTTTTTATGAGATCCTGCTTATCCCTCAGCAGCCTGAGAGTTTATTTAGATCTAGATCCTGTGCCTGCCAGTGATGCTATTTTAGGATTAGTATAATAGAATCAACGGAGACCTGAAAGTCTCCTATCATTAACACAAATGTTAGGACTCTATGCAAGTTAAAAATTTGTTAACACATGTAATATGTTTTGGCTGCAATTTTTTGCAAGTAAGAAGAGGAAATAGTTTGAAAAGTTCTATATGGGACACATATTATGAAAATCAGGCTCACTGAGTTTAATGTGTTCATCTTATATCAAGTTGAGGGAAGCCCTGTATCCTTGTTCAAGTCCCATAAAATTTAAAAAACCACATTAAGATATGTATGTATGTTAACTTACCTCTGCACTGGTCAGGTTTTTATCTGGTCCAGATAAATATGGGATAAGGAATGGTTCTGAGGGTCTCATCATGGAGAAAAAACCAAATAAGCAGAGGATCACAGTGGGGTAAATCCAGGAACTGCTTAGTGAAGTTCTGTAACAATCCATGGCTGATCAAATGGAAACAAAGAGAAAATTAAGTGATGCTTATTCTTTTTAGCATCCTTGATGCGATGAAAACCTGATTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGGGTCGCTCTGTTGTCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCCCATTGCAACCTGTGCCTCCCGGGCTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGACTGGATAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGAGTGAGGAAATTGCTTGAAATGCAAGCTTTAGACATAAAGCCCAATAGAGGATCTCATTTGTCACTGCACAGAAGAAACAAAAAACAAAAAACAATCATTGTATGGCAGCTATATTTGAAAACATCTTGCTATCTCATGTGAATTATCATGTGCACAGGAAAATTCACTAATTCCTCCACATTTTAGCTCAAGCTTTGCCTTATTGTAATGTTTATAGATTTTTGATGGTCCTGCATGTGGCTAAGTTCTCTGAGATACATTTATAGGAAGGAAACTAATTTGTTGTATGATGCTTTTCTGCATACTATCTCCTTAAATCTACATAATAACTGTAAGACAGATATCATTTCCCCACATTCCCAGAGGAGCATATGGAAGATCCAAGATGCCCAAACACTGGCTTCAAACCACATGATCAAGATCTGAATCCAGGTCTCCCTACTCCCATCAGGAATCTTTCACCCACTCCACTCTCCCTCATTCTGGAGGCCCCCTCAGCTACTGGTATTAACCTAATGACAACCACAGTGAGGGAAAAAACGTGTATTTATAAACACATTCACACTAAAGATTATGGTTACATATATAGAGCTTTTAGGGTCAATTGCAGTTTGAAAGCAGACGAGAGAGAAGGAAAAGCATTCTCATTCCGGAATAGCAAGTCTTACCTGGGTGGAATTCCAGGTATCCAGTGGGTGGGGAGCTTTACTAGGGGTTGGGGAGGTAGGAAGGACCTACTAGGTCACATCATTGCGGCTTGCCACTCACCCTACCCTTTCCCAAGGTGACCCCGACAGCTGCATAATTCCTCTCTTAAGTTCAATAGGGTAAACACTGTTTATGTCAACAAAGCCCTTGATTAAGCAGTGGAGAGACAAGAGCGATCAGATTTTGAAACTAGGATTACAGCATCAGTGAGCAATGCTGACAATGTGAAAATTTTGCCAAAGGCAAATTACAGTGACTGTTAACCTACTCCCTTAGTCCAGAAAACAGGGCTTTCTCTTCTTCCTGGAATGCTGCTGGGTTTGCTGGTGCTTTCTGTCTTCGTTGTTAATGATCTTATAGAAATGGCTGTCCTGGACAGGTGATCACTGAGGCTTGGTCATCTTCTGAAGAGTGGTCTTGCTGGGGTAGCATCTGCTGGCTCTATATCCAGAGCCTCCTCTCCACCTTTGCTGACCACGGATTTGTTCTCTAAATCCAGGTCATCATCTTCTCTGTGCATCTGAGACCTAGGACTATGCCACAGTGATCCACAGGCTGCTAAAAGCCTGCTGGATTATCTATCTTTTTATTTCTTTAGGTTTCTAATACAGCTGTCCAAATCGATTTAGTTGGGATGGTCAAGCAGAAAAAAACCTATAATAAGACATGCCCTACTAAAGTACAAGCCCAGGAGGGCAGGGCGTATTGCCTGGTCCACCACATTGTCTTAAGTGCCTAGCATAGCACCTAATACATAGCACTCAAGGAAGATGCTGAATGAATTGAATAAACAAACCACTACAGTCTACTTGAAGAAGGGTAAGGGTGAAAAGAGAGAAGTGTCAGGAACAGGCAAGAATCCAGGAGTTAGGGAAGACAATCTTATAGAAGGAAGGGCAT
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Task1_train_5674
Located on Chromosome 2, this mutation impacts DAW1 (dynein assembly factor with WD repeats 1). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Ciliary dyskinesia, primary, 52
CAAAATGTATTGTGTCACAGTTGGGGAGGTTAGAGGTCAGAGGTCAAGGTGTCATCAGGGTCAGTTCCTTCTGAGGCCTTGGGAAAGAAGCTGTTCCACAGCTCCTGTAGCTTCTGGTGGTTTGCTGGCAATCTTTGGTGTGGAGAAGCATCACCCTGAGCTCTGCCCTCATCTTCACATGGTTTTCCCTGTGCATGTCTGTGCCTATATGGCCTGTTCTTATAAGGATGTATTGAACTAGGGCCCACCCTACTGCGGCATGATCTCATCCTAACTTAATAATTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCTCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCAGCTCTAGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGCAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACACCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAACTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCGTAACTTAACTATTAATAATTATATCTGCAAGATCTTATTTCCAAATACATTCACATTCTAAGGTTCTGGGGGATTATGACTTCAACATATAAATTTTGAGGGCATATATTTCAACCCATAAAGTATCTATAGTATATATGTGTATAGTTGCAAATGCGAGTTTGCATCTGTCCAAAGGTAGAAGAAGTCTGTGGGAGAAGATGGTAGAAGGAAAATACCTAGGAGAGAATCAAAGATACCTTGTCTTGTCAACCTGCCTGTTTAGTTGAGTTTCGCTATTAGACTTTTCTTCACCTTTTCTTGTTACCACTTGACATTCAGACTGGCTTTTCAATTTTGTGGGTTGTTTTCTGTGCTGGGGAAATATATTTTTGTTATACTTTTGAAGCAATATTTTGATTTCAGAGATATTTTAGAAAGAAAGTCTCTTTCTTAATTGAATATTGAAGGAATGATTAAGATGCTGCTATTTTACATTACACTCTATTCACTATTCCTGTAGGAGAATAGCTATGTTAAAGGAACCATTCATTTGTTTATTAAACAGAATATAGGCCAGGTGTGGTGGCGCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAAAAAATTAGACAGGCATGGTGGCGCACCTCTAATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGATAATCGCTTGAACCCCGGAGGCAGAGGTGGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCGGGGGTGGGGTGGGGGTTGGGGGAGGGAACAATGGAATATATCCCAATTTAGACATTGTTCTCAATTTAACTTTTTGTTCTGCACACATGATTTCCATTGTAAAAAGCATAATAGGCCAGGCGTGGTGTGTCACACCTGTAACCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGGTCACTTAAGGTCAGTAGTTCAAGACCAGTCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTGCTAAAAACACACACAAAAAATATAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATTGCTTGAACCTGTGAGGTAGAGGTTGCAGTGCGCCGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGACTCCCTCTTAAACAAACAAACAAACAAACAAACAGCATAATAAATAGAGTTATTATCCTACAGGTAAAACATGAAGTCTTTATTAACACACTGCCATTCTTCCCTGCAACGTGTTTATATTCCTTGTGTTAGCTTTATCACAGGAAGCTATGATCGGACGTGCAAGCTCTGGGACACTGCGTCTGGAGAGGAGCTGAACACGCTGGAGGGCCACAGGAATGTGGTTTATGCCATAGCATTCAACAATCCTTACGGGTGTGTTCATCCCTTCACTTATTTGTTTATTAATTCATTTATTCATCCCTCCATCTGCTTGGGGAGAAAGGGAAGAAGACAAGAGGTCTAAATTTATTGAGTGCTTGGTATGTGCTTTGGAAGCCTTTTAAATACCTCCTTCAAAGCTTAAAAGGGTCTTTGGGTTAGCTATCACTATCCGCATATAGAATACAAGGTTTAAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGTGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCTAATGTATGTAATGTATGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGGGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCGCACCATTGCACTCCAGTCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTTAAAAAAAAAAGAATACAAGGTTCAAATATGCTTCCAAGGATCGCACGGTAGTAAAGAGGAGAGCTGGAGTTCGTGCTCAGGCAAGACTTGACTCTCAATCCTTGGGAGTTCCGACAGGCACTGCCTATTGATGTTCACAGCTCTGGGCTGGTGCCTCTGGGGGAATGTGACAGACACACACAGCATGGTTTACTTCATTTAGAAGTTAATTTACAGTCTTGCCAGGCAGGAAAAAAATGTGTGTGGTAACATGCTAAATAACAATACCAAGTACAACAGAAGTATTTTTAAACCAACCTCTAGATAATGAACAGGAGATTGCACAGTGTCTTCTATTCTTCCTCATGACACACTGCTGATTCCCATGGCACCCTGAACATCTATAGCAGTGAACATACCCGCCGGAATGGGCATCCTCCTCCTGCTGGTTAGGTTCTAAGCTGATCAAGAGTTAGTTGTATTTGTCAACCAATGCGCTTATGTTGGTTGTACTTTCAATTGTAATTGTGTAACATAACGTGTAATTTAACTAAATATTACATAAACCAATAAAATATGAGTGTGAAAAGAAAGCTGGTCTTTTCTAGGGAAGCATAAATAAGGCAAATCTTTGAAAAATTGTTTCACAACTAAATGAAGTTGTGGAGGAGATCAATGTTCAATTGGAAATCACACTGTCAAAATCTAGAAAAATTCTGTACTCAGATTGTTCTGCACGTATGTTTAAGTTCTTTAAGTTCTCATTCCACTTGCAAGAAAAGAAAACTAGATATTGTAGAGGTTTGATACGATTTCTGAAAGACAGATGGTGAACTCCACTTAGCTGACACACAGTCAAAGAAAGACAGTGGCCTCTTGTGAAAAGATTGGCAAATAAATATATATTTATATCTAATGGAATATACCTTTTTTAGACAAGCAAGTATTTTTTCATGATTGCACATGCTAAATGAATTTTTCCATAAAGGAAGCTGGTTCTATAAATATGGTTCATTTACTATAGTGTTATGATGACTAGAACAAAACAGTAAATGATTTAACAATTAAGACAAGAAAGTGATCACTGTGATTTCTCCTGGTAAGAGTCTTTGGAGATGGTGTGAGCCGAAAGAAGATGCCAGAAGGATGGAGGGTGGTGAGCAGTGGAGAGGACACACGGGGCAAAGAGACCTCAGCAGCTCAGTGTCTCCAGGAGGGGATTCATCGGGCACACTCAGTGGCCAGTCTCTGTAGTGACTCAGTGGCCAGTCTCTGCAGTGAGCATTTCATGTTGAAAAACAGAAGTGCGTGAGGTCAGAGCATTCAGTGGAGTTTAAACTCTGTCCTGTGGGACCAAGTTGCCATCAAGGATTTGGGAACAAAAAGGGGAAAAATGAAAGTGATGTTTTAAATAGAAGGATAGCTCTGGCAGACAGAAGAGGTCAGAGGGTTTGGATGTGAGAAGAAACAAGACACAAGGAGGTCATTTAGGATGCAGATATGACAATACACTCATGATACCATAATACACTCATTGCTTGGGAAGGGGCAGGAAGA
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Task1_train_5675
A mutation found in DAW1 (dynein assembly factor with WD repeats 1) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Primary ciliary dyskinesia
CAAAATGTATTGTGTCACAGTTGGGGAGGTTAGAGGTCAGAGGTCAAGGTGTCATCAGGGTCAGTTCCTTCTGAGGCCTTGGGAAAGAAGCTGTTCCACAGCTCCTGTAGCTTCTGGTGGTTTGCTGGCAATCTTTGGTGTGGAGAAGCATCACCCTGAGCTCTGCCCTCATCTTCACATGGTTTTCCCTGTGCATGTCTGTGCCTATATGGCCTGTTCTTATAAGGATGTATTGAACTAGGGCCCACCCTACTGCGGCATGATCTCATCCTAACTTAATAATTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCTCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCAGCTCTAGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGCAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACACCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAACTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCGTAACTTAACTATTAATAATTATATCTGCAAGATCTTATTTCCAAATACATTCACATTCTAAGGTTCTGGGGGATTATGACTTCAACATATAAATTTTGAGGGCATATATTTCAACCCATAAAGTATCTATAGTATATATGTGTATAGTTGCAAATGCGAGTTTGCATCTGTCCAAAGGTAGAAGAAGTCTGTGGGAGAAGATGGTAGAAGGAAAATACCTAGGAGAGAATCAAAGATACCTTGTCTTGTCAACCTGCCTGTTTAGTTGAGTTTCGCTATTAGACTTTTCTTCACCTTTTCTTGTTACCACTTGACATTCAGACTGGCTTTTCAATTTTGTGGGTTGTTTTCTGTGCTGGGGAAATATATTTTTGTTATACTTTTGAAGCAATATTTTGATTTCAGAGATATTTTAGAAAGAAAGTCTCTTTCTTAATTGAATATTGAAGGAATGATTAAGATGCTGCTATTTTACATTACACTCTATTCACTATTCCTGTAGGAGAATAGCTATGTTAAAGGAACCATTCATTTGTTTATTAAACAGAATATAGGCCAGGTGTGGTGGCGCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAAAAAATTAGACAGGCATGGTGGCGCACCTCTAATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGATAATCGCTTGAACCCCGGAGGCAGAGGTGGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCGGGGGTGGGGTGGGGGTTGGGGGAGGGAACAATGGAATATATCCCAATTTAGACATTGTTCTCAATTTAACTTTTTGTTCTGCACACATGATTTCCATTGTAAAAAGCATAATAGGCCAGGCGTGGTGTGTCACACCTGTAACCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGGTCACTTAAGGTCAGTAGTTCAAGACCAGTCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTGCTAAAAACACACACAAAAAATATAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATTGCTTGAACCTGTGAGGTAGAGGTTGCAGTGCGCCGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGACTCCCTCTTAAACAAACAAACAAACAAACAAACAGCATAATAAATAGAGTTATTATCCTACAGGTAAAACATGAAGTCTTTATTAACACACTGCCATTCTTCCCTGCAACGTGTTTATATTCCTTGTGTTAGCTTTATCACAGGAAGCTATGATCGGACGTGCAAGCTCTGGGACACTGCGTCTGGAGAGGAGCTGAACACGCTGGAGGGCCACAGGAATGTGGTTTATGCCATAGCATTCAACAATCCTTACGGGTGTGTTCATCCCTTCACTTATTTGTTTATTAATTCATTTATTCATCCCTCCATCTGCTTGGGGAGAAAGGGAAGAAGACAAGAGGTCTAAATTTATTGAGTGCTTGGTATGTGCTTTGGAAGCCTTTTAAATACCTCCTTCAAAGCTTAAAAGGGTCTTTGGGTTAGCTATCACTATCCGCATATAGAATACAAGGTTTAAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGTGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCTAATGTATGTAATGTATGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGGGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCGCACCATTGCACTCCAGTCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTTAAAAAAAAAAGAATACAAGGTTCAAATATGCTTCCAAGGATCGCACGGTAGTAAAGAGGAGAGCTGGAGTTCGTGCTCAGGCAAGACTTGACTCTCAATCCTTGGGAGTTCCGACAGGCACTGCCTATTGATGTTCACAGCTCTGGGCTGGTGCCTCTGGGGGAATGTGACAGACACACACAGCATGGTTTACTTCATTTAGAAGTTAATTTACAGTCTTGCCAGGCAGGAAAAAAATGTGTGTGGTAACATGCTAAATAACAATACCAAGTACAACAGAAGTATTTTTAAACCAACCTCTAGATAATGAACAGGAGATTGCACAGTGTCTTCTATTCTTCCTCATGACACACTGCTGATTCCCATGGCACCCTGAACATCTATAGCAGTGAACATACCCGCCGGAATGGGCATCCTCCTCCTGCTGGTTAGGTTCTAAGCTGATCAAGAGTTAGTTGTATTTGTCAACCAATGCGCTTATGTTGGTTGTACTTTCAATTGTAATTGTGTAACATAACGTGTAATTTAACTAAATATTACATAAACCAATAAAATATGAGTGTGAAAAGAAAGCTGGTCTTTTCTAGGGAAGCATAAATAAGGCAAATCTTTGAAAAATTGTTTCACAACTAAATGAAGTTGTGGAGGAGATCAATGTTCAATTGGAAATCACACTGTCAAAATCTAGAAAAATTCTGTACTCAGATTGTTCTGCACGTATGTTTAAGTTCTTTAAGTTCTCATTCCACTTGCAAGAAAAGAAAACTAGATATTGTAGAGGTTTGATACGATTTCTGAAAGACAGATGGTGAACTCCACTTAGCTGACACACAGTCAAAGAAAGACAGTGGCCTCTTGTGAAAAGATTGGCAAATAAATATATATTTATATCTAATGGAATATACCTTTTTTAGACAAGCAAGTATTTTTTCATGATTGCACATGCTAAATGAATTTTTCCATAAAGGAAGCTGGTTCTATAAATATGGTTCATTTACTATAGTGTTATGATGACTAGAACAAAACAGTAAATGATTTAACAATTAAGACAAGAAAGTGATCACTGTGATTTCTCCTGGTAAGAGTCTTTGGAGATGGTGTGAGCCGAAAGAAGATGCCAGAAGGATGGAGGGTGGTGAGCAGTGGAGAGGACACACGGGGCAAAGAGACCTCAGCAGCTCAGTGTCTCCAGGAGGGGATTCATCGGGCACACTCAGTGGCCAGTCTCTGTAGTGACTCAGTGGCCAGTCTCTGCAGTGAGCATTTCATGTTGAAAAACAGAAGTGCGTGAGGTCAGAGCATTCAGTGGAGTTTAAACTCTGTCCTGTGGGACCAAGTTGCCATCAAGGATTTGGGAACAAAAAGGGGAAAAATGAAAGTGATGTTTTAAATAGAAGGATAGCTCTGGCAGACAGAAGAGGTCAGAGGGTTTGGATGTGAGAAGAAACAAGACACAAGGAGGTCATTTAGGATGCAGATATGACAATACACTCATGATACCATAATACACTCATTGCTTGGGAAGGGGCAGGAAGA
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Task1_train_5676
Here is a genetic alteration in DAW1 (dynein assembly factor with WD repeats 1) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Ciliary dyskinesia, primary, 52
AACAGCATTCGCCTCCACTGTCAGCAAAAGATTTAGTTAGCTGAAGATATTTAATATGGCAATTTAAGGAGCGTGTAAACTGCTTTTCCTGGTTCCGGTAAACACATAAGTTTATGTTGTGCGAAAAATATGCTGGGCAGCAAGTATCAAGTGTTCTGTAAGTTAGATGCAATTGAGGAAGTAGTTCCTGGAAATATGTAAAATTATAATTAAAATTAAATTATAAAATTATCCATTTTGAAACTACAAAGCTGTGTTTTAGGATTTTGTATAAACTTCCCCCAAAGGATCATTCACGGAGCAGGCCCACCCAGTCAGTGATCTGAAGTTTAGATGTGTCATCAGAACTTCGTAGAGTAGGCTAGGATTGGTGGCTCTCACCTCCCAGCTCAGCACAATCCCTTGGTTCCCTGTCTGAGATCAGATTTGTTCCTGCTTTGCAAAATATCAGCTTGATGATTTTAGGTTTCTAAAGGCCCCTTCTAGACCCTGGAACTCCGCCCCAGGCTGTACTCTCGGCCTTTCTGCTTCTGCACCTACAGCTGGTGATCATTGCCCTCTGGCTGGTCAGTGGTGGTCTCCAGGGCATGCAGACTATGGCCTCTTCATAAGCTGGGAGGCTTATGGATGGCAGGAGGGGATGGAAAAGTGGGGTGTGGGAGGCAGGATGAGGAGGAAGCCTGGCCCATGTTTCTGAGTGTCTGGCTAGGTAGCTATTGAGACATCTGTGTGTCTCCTCCATAAGTAAACATCTATTTTCATGAATGAGTGAATACAAAGAATTCTCTAGTGCTATTTTATTACATTTTATGCTTTTTAAATGAACATATTACTTATTGAATTGGCATCTGGTAAGGGCATTTCTATGGGGTGCAAAGCTAAAGTATTCACTCATTCAACAAACACTTTTAGAGAGTGTCCACTGTGCTGGGCATTGCACAGCCACTGGTAACAGAGTGATAAAAACAGATACGGCCCTGCCCTCCTCAAACCTTCAGTCATTGAGGAGATGGCCCGAATCTCTGTCTTCTGGTGATTAGAGGGGGATGTAAGTGTGACACCCAAAGGGATGCAGGACTAACAGGTTCCTTTGATGGTCACTCAGATGCCAGTTGGCAACACCTGGCACACGGGAGGCACAGAAGCGTATTTATGGAAAATGCTATACTTGGGGTGGCAGTAGATGAGAACATCCTTTCTTGTAGGTTCTACATTCACTTATTCTATGGCACAGATTAGAGAAGGATCTGTGTGCTTTTTAAAAAATTTTTATTTATTTATTTTTATTTTTTATTATTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGAATTACAGGTGTGTGCCACCATCCATGCCAAGCTAAATTTGTATTTTTAGTAGCGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGTCCTGAGCCACCGCCCCTGGCCCGGATCTGTGTGCTTTTGACCACAAAGATGACACCAGGGTTTGGCTACGAAGGATCCTGACTCGTGTGTTCATCCACACCAGGGCCCTGCATCTTTGCACAGAGAAGGGCATCGTGCATCTTTGGAAAGAAGCTGGGTGGGGAATACTCAAATTATAAGGATGCTTTGGTCTTTATTCTTAGAAATGTGAGGAGTAGGCAATTACATTTTCTCTCTGGATTTTAGTTTCCATGTACTAGTCCCTGCAATATTTTTTTCCATTATGAAGAAATTGTTCTATGCAAGAATAAATACCAGACTAGGAAGGTGACATGTGCTGTAATGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGATAAGAAATGTTTTGGGAACCATTACACAAAGCTGTGATCATTTTTCTTTCTCTTTTGCAGATTTCTTTCAACCCTCAAGGGAACCATCTTCTAACTGGCAGCTCTGACAAAACGGCTAGAATCTGGGATGCTCAGACTGGCCAGTGCCTCCAGGTTCTTGAGGGGCACACTGATGAAATCTTTTCATGTGCTTTCAACTATAAAGGCAACATAGTCATTACAGGTATGGAAGACATCAACACCATAGACTCATTTTTTCTTGATTGGCTGTTAGAGTTCCCAAGCTGAATACTAACAGGAGTTCATCCCCATTCCCTACCTCTTTTCTGGAGTCACTAGCTCATCTTGGCCTGCCCTCATATTTTCATTATTTAATTTTAGTTTTATGAGGACCCACAGGAGTGAGCGCTGCCATTGACTGTAGTAAGCCTTTGTGAACTTTGAATTTTATTTGCTCTAGATAAGGTAACAATTTGATAGCCTGCCTTACAGGTTACTAAATTTCCCCAGGTGTTTTCTATCAATTGAATGGTTAATATTTAGTCAGCCAGGCGCATTGGCTCATGCCAACAATCTCAGTGCTTTGAGAGGCTGAGGCAGAAAAAATGCTTGAGGCCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCGTCTCTACAAAAAAAATAGAGCATTAGCTGGGCATGGTGGCGTACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGGAGCACTTGAGCCAAGGAGTTGGAGGCTTCAGTGAGCTATGATCAGGCCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTAAGACCCTGTCTCAAGAAAAAAGTTGAGTTTATGTCAGTAAGTGTTAGTAACCAAAACAAGTCAGGATCAAAATTCTCCCCAGTTGGCTTTACAGCCCATTAGAGATTTATTCTTTGAGCAGAGTTGTTTTCTCCCCTGCTAAAGCACTAATGTCTGGGGGGAAAGAACATGTATTAACCATTTTTCAACCGTTAACAGTTTATGGTGAATTAATAATATTAGCAACATTTCATAAGAAAAGGGTAGTTTAGATCGTGGAAAGGGGAGAAAAATGACAAGATGATGGTATCATGTTAGTGGAGTGCCTCGAGGGGAGGCCTTGGCAGGGAATGGGTGCCACAATAGTGTGGAGTAGGGCACCCTAAGTGAGCACAGAAGACCAGATCTGCCTAAGTACCAGTGATTCTCATCATGTTGAGCAAATTTAAAAATTACTAGTCTAATAAGTTAAATGCCACAGGCCCAAGGCTGGCTTTACATATTGGCCAATTAGGTGGTTTCCTTGTCAGATAACTTCAGGGGTGCTGAGAATTATCTCCCCTTACCACCTAAAATGCCTCCCCAGTCTACTTAATGATGGACAGTTTCCGAAATCACAGGGCTTACGATCTTCAAAATCTTTGGGCTTATGATTTTCAAGTGTTAACTAAGATGTAGGTACTTTGAAAGCACTGGGAAAACAAGCCATAGATTTTTGTTGTGAACACAATATCAAATCCTTCTCCTTGATGAGAAAAGAGGTGAGGGGCTATGATGGAGGGCACAGGGCGCTCCTGCAGGGAGTGAGAAAGAAGGAAGACCAGCCTTTCCTAGTCCACATGGCCTCATATGAGGCTGGCTCTGCAGTACTTCTTCCCTCAACCAGTTTTCACAGAAGACCCTGGAGAGTTTAGCAAAAGAATTTTTGTTATTGTGCCTTGCGTTGGTGCCAGCACATACATTCCTGAGCTCTTTGAAGATACCACTGATTAATTTAGTGTATCCCAAAGCACCAAAGTGCTTAACATTGGCTCACTAGACAACAGAGCTTATTAGATTGGGGTGACACTTTTCTCTTGCCATCGATGGAGCAGTCACTTTATTTGAAAGAATCTACTCTATTTTCCGAGTGGACCCTGGTGTGATAAACTGCAGGCATTTTGTAGTGGCCTACCTGAGGCTGGATTTAGAATCACAAAGTAAATGGCAGAAAAATAGCTGGCATGACCGTTACATTTGTTAAAACATGAAGTGTCATTTTGTGGGATATGGTTTTTATAGGCTTTCCTAATTCCTAAGGCACTCACACTTCTTATATTGATGTTATGTGCCTGGTCCCTGAAGGTGAGAAAACCAGTAGTGCCCAC
AACAGCATTCGCCTCCACTGTCAGCAAAAGATTTAGTTAGCTGAAGATATTTAATATGGCAATTTAAGGAGCGTGTAAACTGCTTTTCCTGGTTCCGGTAAACACATAAGTTTATGTTGTGCGAAAAATATGCTGGGCAGCAAGTATCAAGTGTTCTGTAAGTTAGATGCAATTGAGGAAGTAGTTCCTGGAAATATGTAAAATTATAATTAAAATTAAATTATAAAATTATCCATTTTGAAACTACAAAGCTGTGTTTTAGGATTTTGTATAAACTTCCCCCAAAGGATCATTCACGGAGCAGGCCCACCCAGTCAGTGATCTGAAGTTTAGATGTGTCATCAGAACTTCGTAGAGTAGGCTAGGATTGGTGGCTCTCACCTCCCAGCTCAGCACAATCCCTTGGTTCCCTGTCTGAGATCAGATTTGTTCCTGCTTTGCAAAATATCAGCTTGATGATTTTAGGTTTCTAAAGGCCCCTTCTAGACCCTGGAACTCCGCCCCAGGCTGTACTCTCGGCCTTTCTGCTTCTGCACCTACAGCTGGTGATCATTGCCCTCTGGCTGGTCAGTGGTGGTCTCCAGGGCATGCAGACTATGGCCTCTTCATAAGCTGGGAGGCTTATGGATGGCAGGAGGGGATGGAAAAGTGGGGTGTGGGAGGCAGGATGAGGAGGAAGCCTGGCCCATGTTTCTGAGTGTCTGGCTAGGTAGCTATTGAGACATCTGTGTGTCTCCTCCATAAGTAAACATCTATTTTCATGAATGAGTGAATACAAAGAATTCTCTAGTGCTATTTTATTACATTTTATGCTTTTTAAATGAACATATTACTTATTGAATTGGCATCTGGTAAGGGCATTTCTATGGGGTGCAAAGCTAAAGTATTCACTCATTCAACAAACACTTTTAGAGAGTGTCCACTGTGCTGGGCATTGCACAGCCACTGGTAACAGAGTGATAAAAACAGATACGGCCCTGCCCTCCTCAAACCTTCAGTCATTGAGGAGATGGCCCGAATCTCTGTCTTCTGGTGATTAGAGGGGGATGTAAGTGTGACACCCAAAGGGATGCAGGACTAACAGGTTCCTTTGATGGTCACTCAGATGCCAGTTGGCAACACCTGGCACACGGGAGGCACAGAAGCGTATTTATGGAAAATGCTATACTTGGGGTGGCAGTAGATGAGAACATCCTTTCTTGTAGGTTCTACATTCACTTATTCTATGGCACAGATTAGAGAAGGATCTGTGTGCTTTTTAAAAAATTTTTATTTATTTATTTTTATTTTTTATTATTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGAATTACAGGTGTGTGCCACCATCCATGCCAAGCTAAATTTGTATTTTTAGTAGCGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGTCCTGAGCCACCGCCCCTGGCCCGGATCTGTGTGCTTTTGACCACAAAGATGACACCAGGGTTTGGCTACGAAGGATCCTGACTCGTGTGTTCATCCACACCAGGGCCCTGCATCTTTGCACAGAGAAGGGCATCGTGCATCTTTGGAAAGAAGCTGGGTGGGGAATACTCAAATTATAAGGATGCTTTGGTCTTTATTCTTAGAAATGTGAGGAGTAGGCAATTACATTTTCTCTCTGGATTTTAGTTTCCATGTACTAGTCCCTGCAATATTTTTTTCCATTATGAAGAAATTGTTCTATGCAAGAATAAATACCAGACTAGGAAGGTGACATGTGCTGTAATGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGATAAGAAATGTTTTGGGAACCATTACACAAAGCTGTGATCATTTTTCTTTCTCTTTTGCAGATTTCTTTCAACCCTCAAGGGAACCATCTTCTAACTGGCACCTCTGACAAAACGGCTAGAATCTGGGATGCTCAGACTGGCCAGTGCCTCCAGGTTCTTGAGGGGCACACTGATGAAATCTTTTCATGTGCTTTCAACTATAAAGGCAACATAGTCATTACAGGTATGGAAGACATCAACACCATAGACTCATTTTTTCTTGATTGGCTGTTAGAGTTCCCAAGCTGAATACTAACAGGAGTTCATCCCCATTCCCTACCTCTTTTCTGGAGTCACTAGCTCATCTTGGCCTGCCCTCATATTTTCATTATTTAATTTTAGTTTTATGAGGACCCACAGGAGTGAGCGCTGCCATTGACTGTAGTAAGCCTTTGTGAACTTTGAATTTTATTTGCTCTAGATAAGGTAACAATTTGATAGCCTGCCTTACAGGTTACTAAATTTCCCCAGGTGTTTTCTATCAATTGAATGGTTAATATTTAGTCAGCCAGGCGCATTGGCTCATGCCAACAATCTCAGTGCTTTGAGAGGCTGAGGCAGAAAAAATGCTTGAGGCCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCGTCTCTACAAAAAAAATAGAGCATTAGCTGGGCATGGTGGCGTACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGGAGCACTTGAGCCAAGGAGTTGGAGGCTTCAGTGAGCTATGATCAGGCCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTAAGACCCTGTCTCAAGAAAAAAGTTGAGTTTATGTCAGTAAGTGTTAGTAACCAAAACAAGTCAGGATCAAAATTCTCCCCAGTTGGCTTTACAGCCCATTAGAGATTTATTCTTTGAGCAGAGTTGTTTTCTCCCCTGCTAAAGCACTAATGTCTGGGGGGAAAGAACATGTATTAACCATTTTTCAACCGTTAACAGTTTATGGTGAATTAATAATATTAGCAACATTTCATAAGAAAAGGGTAGTTTAGATCGTGGAAAGGGGAGAAAAATGACAAGATGATGGTATCATGTTAGTGGAGTGCCTCGAGGGGAGGCCTTGGCAGGGAATGGGTGCCACAATAGTGTGGAGTAGGGCACCCTAAGTGAGCACAGAAGACCAGATCTGCCTAAGTACCAGTGATTCTCATCATGTTGAGCAAATTTAAAAATTACTAGTCTAATAAGTTAAATGCCACAGGCCCAAGGCTGGCTTTACATATTGGCCAATTAGGTGGTTTCCTTGTCAGATAACTTCAGGGGTGCTGAGAATTATCTCCCCTTACCACCTAAAATGCCTCCCCAGTCTACTTAATGATGGACAGTTTCCGAAATCACAGGGCTTACGATCTTCAAAATCTTTGGGCTTATGATTTTCAAGTGTTAACTAAGATGTAGGTACTTTGAAAGCACTGGGAAAACAAGCCATAGATTTTTGTTGTGAACACAATATCAAATCCTTCTCCTTGATGAGAAAAGAGGTGAGGGGCTATGATGGAGGGCACAGGGCGCTCCTGCAGGGAGTGAGAAAGAAGGAAGACCAGCCTTTCCTAGTCCACATGGCCTCATATGAGGCTGGCTCTGCAGTACTTCTTCCCTCAACCAGTTTTCACAGAAGACCCTGGAGAGTTTAGCAAAAGAATTTTTGTTATTGTGCCTTGCGTTGGTGCCAGCACATACATTCCTGAGCTCTTTGAAGATACCACTGATTAATTTAGTGTATCCCAAAGCACCAAAGTGCTTAACATTGGCTCACTAGACAACAGAGCTTATTAGATTGGGGTGACACTTTTCTCTTGCCATCGATGGAGCAGTCACTTTATTTGAAAGAATCTACTCTATTTTCCGAGTGGACCCTGGTGTGATAAACTGCAGGCATTTTGTAGTGGCCTACCTGAGGCTGGATTTAGAATCACAAAGTAAATGGCAGAAAAATAGCTGGCATGACCGTTACATTTGTTAAAACATGAAGTGTCATTTTGTGGGATATGGTTTTTATAGGCTTTCCTAATTCCTAAGGCACTCACACTTCTTATATTGATGTTATGTGCCTGGTCCCTGAAGGTGAGAAAACCAGTAGTGCCCAC
Task1_train_5677
The gene DAW1 (dynein assembly factor with WD repeats 1), on Chromosome 2, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Primary ciliary dyskinesia
AACAGCATTCGCCTCCACTGTCAGCAAAAGATTTAGTTAGCTGAAGATATTTAATATGGCAATTTAAGGAGCGTGTAAACTGCTTTTCCTGGTTCCGGTAAACACATAAGTTTATGTTGTGCGAAAAATATGCTGGGCAGCAAGTATCAAGTGTTCTGTAAGTTAGATGCAATTGAGGAAGTAGTTCCTGGAAATATGTAAAATTATAATTAAAATTAAATTATAAAATTATCCATTTTGAAACTACAAAGCTGTGTTTTAGGATTTTGTATAAACTTCCCCCAAAGGATCATTCACGGAGCAGGCCCACCCAGTCAGTGATCTGAAGTTTAGATGTGTCATCAGAACTTCGTAGAGTAGGCTAGGATTGGTGGCTCTCACCTCCCAGCTCAGCACAATCCCTTGGTTCCCTGTCTGAGATCAGATTTGTTCCTGCTTTGCAAAATATCAGCTTGATGATTTTAGGTTTCTAAAGGCCCCTTCTAGACCCTGGAACTCCGCCCCAGGCTGTACTCTCGGCCTTTCTGCTTCTGCACCTACAGCTGGTGATCATTGCCCTCTGGCTGGTCAGTGGTGGTCTCCAGGGCATGCAGACTATGGCCTCTTCATAAGCTGGGAGGCTTATGGATGGCAGGAGGGGATGGAAAAGTGGGGTGTGGGAGGCAGGATGAGGAGGAAGCCTGGCCCATGTTTCTGAGTGTCTGGCTAGGTAGCTATTGAGACATCTGTGTGTCTCCTCCATAAGTAAACATCTATTTTCATGAATGAGTGAATACAAAGAATTCTCTAGTGCTATTTTATTACATTTTATGCTTTTTAAATGAACATATTACTTATTGAATTGGCATCTGGTAAGGGCATTTCTATGGGGTGCAAAGCTAAAGTATTCACTCATTCAACAAACACTTTTAGAGAGTGTCCACTGTGCTGGGCATTGCACAGCCACTGGTAACAGAGTGATAAAAACAGATACGGCCCTGCCCTCCTCAAACCTTCAGTCATTGAGGAGATGGCCCGAATCTCTGTCTTCTGGTGATTAGAGGGGGATGTAAGTGTGACACCCAAAGGGATGCAGGACTAACAGGTTCCTTTGATGGTCACTCAGATGCCAGTTGGCAACACCTGGCACACGGGAGGCACAGAAGCGTATTTATGGAAAATGCTATACTTGGGGTGGCAGTAGATGAGAACATCCTTTCTTGTAGGTTCTACATTCACTTATTCTATGGCACAGATTAGAGAAGGATCTGTGTGCTTTTTAAAAAATTTTTATTTATTTATTTTTATTTTTTATTATTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGAATTACAGGTGTGTGCCACCATCCATGCCAAGCTAAATTTGTATTTTTAGTAGCGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGTCCTGAGCCACCGCCCCTGGCCCGGATCTGTGTGCTTTTGACCACAAAGATGACACCAGGGTTTGGCTACGAAGGATCCTGACTCGTGTGTTCATCCACACCAGGGCCCTGCATCTTTGCACAGAGAAGGGCATCGTGCATCTTTGGAAAGAAGCTGGGTGGGGAATACTCAAATTATAAGGATGCTTTGGTCTTTATTCTTAGAAATGTGAGGAGTAGGCAATTACATTTTCTCTCTGGATTTTAGTTTCCATGTACTAGTCCCTGCAATATTTTTTTCCATTATGAAGAAATTGTTCTATGCAAGAATAAATACCAGACTAGGAAGGTGACATGTGCTGTAATGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGATAAGAAATGTTTTGGGAACCATTACACAAAGCTGTGATCATTTTTCTTTCTCTTTTGCAGATTTCTTTCAACCCTCAAGGGAACCATCTTCTAACTGGCAGCTCTGACAAAACGGCTAGAATCTGGGATGCTCAGACTGGCCAGTGCCTCCAGGTTCTTGAGGGGCACACTGATGAAATCTTTTCATGTGCTTTCAACTATAAAGGCAACATAGTCATTACAGGTATGGAAGACATCAACACCATAGACTCATTTTTTCTTGATTGGCTGTTAGAGTTCCCAAGCTGAATACTAACAGGAGTTCATCCCCATTCCCTACCTCTTTTCTGGAGTCACTAGCTCATCTTGGCCTGCCCTCATATTTTCATTATTTAATTTTAGTTTTATGAGGACCCACAGGAGTGAGCGCTGCCATTGACTGTAGTAAGCCTTTGTGAACTTTGAATTTTATTTGCTCTAGATAAGGTAACAATTTGATAGCCTGCCTTACAGGTTACTAAATTTCCCCAGGTGTTTTCTATCAATTGAATGGTTAATATTTAGTCAGCCAGGCGCATTGGCTCATGCCAACAATCTCAGTGCTTTGAGAGGCTGAGGCAGAAAAAATGCTTGAGGCCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCGTCTCTACAAAAAAAATAGAGCATTAGCTGGGCATGGTGGCGTACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGGAGCACTTGAGCCAAGGAGTTGGAGGCTTCAGTGAGCTATGATCAGGCCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTAAGACCCTGTCTCAAGAAAAAAGTTGAGTTTATGTCAGTAAGTGTTAGTAACCAAAACAAGTCAGGATCAAAATTCTCCCCAGTTGGCTTTACAGCCCATTAGAGATTTATTCTTTGAGCAGAGTTGTTTTCTCCCCTGCTAAAGCACTAATGTCTGGGGGGAAAGAACATGTATTAACCATTTTTCAACCGTTAACAGTTTATGGTGAATTAATAATATTAGCAACATTTCATAAGAAAAGGGTAGTTTAGATCGTGGAAAGGGGAGAAAAATGACAAGATGATGGTATCATGTTAGTGGAGTGCCTCGAGGGGAGGCCTTGGCAGGGAATGGGTGCCACAATAGTGTGGAGTAGGGCACCCTAAGTGAGCACAGAAGACCAGATCTGCCTAAGTACCAGTGATTCTCATCATGTTGAGCAAATTTAAAAATTACTAGTCTAATAAGTTAAATGCCACAGGCCCAAGGCTGGCTTTACATATTGGCCAATTAGGTGGTTTCCTTGTCAGATAACTTCAGGGGTGCTGAGAATTATCTCCCCTTACCACCTAAAATGCCTCCCCAGTCTACTTAATGATGGACAGTTTCCGAAATCACAGGGCTTACGATCTTCAAAATCTTTGGGCTTATGATTTTCAAGTGTTAACTAAGATGTAGGTACTTTGAAAGCACTGGGAAAACAAGCCATAGATTTTTGTTGTGAACACAATATCAAATCCTTCTCCTTGATGAGAAAAGAGGTGAGGGGCTATGATGGAGGGCACAGGGCGCTCCTGCAGGGAGTGAGAAAGAAGGAAGACCAGCCTTTCCTAGTCCACATGGCCTCATATGAGGCTGGCTCTGCAGTACTTCTTCCCTCAACCAGTTTTCACAGAAGACCCTGGAGAGTTTAGCAAAAGAATTTTTGTTATTGTGCCTTGCGTTGGTGCCAGCACATACATTCCTGAGCTCTTTGAAGATACCACTGATTAATTTAGTGTATCCCAAAGCACCAAAGTGCTTAACATTGGCTCACTAGACAACAGAGCTTATTAGATTGGGGTGACACTTTTCTCTTGCCATCGATGGAGCAGTCACTTTATTTGAAAGAATCTACTCTATTTTCCGAGTGGACCCTGGTGTGATAAACTGCAGGCATTTTGTAGTGGCCTACCTGAGGCTGGATTTAGAATCACAAAGTAAATGGCAGAAAAATAGCTGGCATGACCGTTACATTTGTTAAAACATGAAGTGTCATTTTGTGGGATATGGTTTTTATAGGCTTTCCTAATTCCTAAGGCACTCACACTTCTTATATTGATGTTATGTGCCTGGTCCCTGAAGGTGAGAAAACCAGTAGTGCCCAC
AACAGCATTCGCCTCCACTGTCAGCAAAAGATTTAGTTAGCTGAAGATATTTAATATGGCAATTTAAGGAGCGTGTAAACTGCTTTTCCTGGTTCCGGTAAACACATAAGTTTATGTTGTGCGAAAAATATGCTGGGCAGCAAGTATCAAGTGTTCTGTAAGTTAGATGCAATTGAGGAAGTAGTTCCTGGAAATATGTAAAATTATAATTAAAATTAAATTATAAAATTATCCATTTTGAAACTACAAAGCTGTGTTTTAGGATTTTGTATAAACTTCCCCCAAAGGATCATTCACGGAGCAGGCCCACCCAGTCAGTGATCTGAAGTTTAGATGTGTCATCAGAACTTCGTAGAGTAGGCTAGGATTGGTGGCTCTCACCTCCCAGCTCAGCACAATCCCTTGGTTCCCTGTCTGAGATCAGATTTGTTCCTGCTTTGCAAAATATCAGCTTGATGATTTTAGGTTTCTAAAGGCCCCTTCTAGACCCTGGAACTCCGCCCCAGGCTGTACTCTCGGCCTTTCTGCTTCTGCACCTACAGCTGGTGATCATTGCCCTCTGGCTGGTCAGTGGTGGTCTCCAGGGCATGCAGACTATGGCCTCTTCATAAGCTGGGAGGCTTATGGATGGCAGGAGGGGATGGAAAAGTGGGGTGTGGGAGGCAGGATGAGGAGGAAGCCTGGCCCATGTTTCTGAGTGTCTGGCTAGGTAGCTATTGAGACATCTGTGTGTCTCCTCCATAAGTAAACATCTATTTTCATGAATGAGTGAATACAAAGAATTCTCTAGTGCTATTTTATTACATTTTATGCTTTTTAAATGAACATATTACTTATTGAATTGGCATCTGGTAAGGGCATTTCTATGGGGTGCAAAGCTAAAGTATTCACTCATTCAACAAACACTTTTAGAGAGTGTCCACTGTGCTGGGCATTGCACAGCCACTGGTAACAGAGTGATAAAAACAGATACGGCCCTGCCCTCCTCAAACCTTCAGTCATTGAGGAGATGGCCCGAATCTCTGTCTTCTGGTGATTAGAGGGGGATGTAAGTGTGACACCCAAAGGGATGCAGGACTAACAGGTTCCTTTGATGGTCACTCAGATGCCAGTTGGCAACACCTGGCACACGGGAGGCACAGAAGCGTATTTATGGAAAATGCTATACTTGGGGTGGCAGTAGATGAGAACATCCTTTCTTGTAGGTTCTACATTCACTTATTCTATGGCACAGATTAGAGAAGGATCTGTGTGCTTTTTAAAAAATTTTTATTTATTTATTTTTATTTTTTATTATTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGAATTACAGGTGTGTGCCACCATCCATGCCAAGCTAAATTTGTATTTTTAGTAGCGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGTCCTGAGCCACCGCCCCTGGCCCGGATCTGTGTGCTTTTGACCACAAAGATGACACCAGGGTTTGGCTACGAAGGATCCTGACTCGTGTGTTCATCCACACCAGGGCCCTGCATCTTTGCACAGAGAAGGGCATCGTGCATCTTTGGAAAGAAGCTGGGTGGGGAATACTCAAATTATAAGGATGCTTTGGTCTTTATTCTTAGAAATGTGAGGAGTAGGCAATTACATTTTCTCTCTGGATTTTAGTTTCCATGTACTAGTCCCTGCAATATTTTTTTCCATTATGAAGAAATTGTTCTATGCAAGAATAAATACCAGACTAGGAAGGTGACATGTGCTGTAATGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGATAAGAAATGTTTTGGGAACCATTACACAAAGCTGTGATCATTTTTCTTTCTCTTTTGCAGATTTCTTTCAACCCTCAAGGGAACCATCTTCTAACTGGCACCTCTGACAAAACGGCTAGAATCTGGGATGCTCAGACTGGCCAGTGCCTCCAGGTTCTTGAGGGGCACACTGATGAAATCTTTTCATGTGCTTTCAACTATAAAGGCAACATAGTCATTACAGGTATGGAAGACATCAACACCATAGACTCATTTTTTCTTGATTGGCTGTTAGAGTTCCCAAGCTGAATACTAACAGGAGTTCATCCCCATTCCCTACCTCTTTTCTGGAGTCACTAGCTCATCTTGGCCTGCCCTCATATTTTCATTATTTAATTTTAGTTTTATGAGGACCCACAGGAGTGAGCGCTGCCATTGACTGTAGTAAGCCTTTGTGAACTTTGAATTTTATTTGCTCTAGATAAGGTAACAATTTGATAGCCTGCCTTACAGGTTACTAAATTTCCCCAGGTGTTTTCTATCAATTGAATGGTTAATATTTAGTCAGCCAGGCGCATTGGCTCATGCCAACAATCTCAGTGCTTTGAGAGGCTGAGGCAGAAAAAATGCTTGAGGCCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCGTCTCTACAAAAAAAATAGAGCATTAGCTGGGCATGGTGGCGTACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGGAGCACTTGAGCCAAGGAGTTGGAGGCTTCAGTGAGCTATGATCAGGCCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTAAGACCCTGTCTCAAGAAAAAAGTTGAGTTTATGTCAGTAAGTGTTAGTAACCAAAACAAGTCAGGATCAAAATTCTCCCCAGTTGGCTTTACAGCCCATTAGAGATTTATTCTTTGAGCAGAGTTGTTTTCTCCCCTGCTAAAGCACTAATGTCTGGGGGGAAAGAACATGTATTAACCATTTTTCAACCGTTAACAGTTTATGGTGAATTAATAATATTAGCAACATTTCATAAGAAAAGGGTAGTTTAGATCGTGGAAAGGGGAGAAAAATGACAAGATGATGGTATCATGTTAGTGGAGTGCCTCGAGGGGAGGCCTTGGCAGGGAATGGGTGCCACAATAGTGTGGAGTAGGGCACCCTAAGTGAGCACAGAAGACCAGATCTGCCTAAGTACCAGTGATTCTCATCATGTTGAGCAAATTTAAAAATTACTAGTCTAATAAGTTAAATGCCACAGGCCCAAGGCTGGCTTTACATATTGGCCAATTAGGTGGTTTCCTTGTCAGATAACTTCAGGGGTGCTGAGAATTATCTCCCCTTACCACCTAAAATGCCTCCCCAGTCTACTTAATGATGGACAGTTTCCGAAATCACAGGGCTTACGATCTTCAAAATCTTTGGGCTTATGATTTTCAAGTGTTAACTAAGATGTAGGTACTTTGAAAGCACTGGGAAAACAAGCCATAGATTTTTGTTGTGAACACAATATCAAATCCTTCTCCTTGATGAGAAAAGAGGTGAGGGGCTATGATGGAGGGCACAGGGCGCTCCTGCAGGGAGTGAGAAAGAAGGAAGACCAGCCTTTCCTAGTCCACATGGCCTCATATGAGGCTGGCTCTGCAGTACTTCTTCCCTCAACCAGTTTTCACAGAAGACCCTGGAGAGTTTAGCAAAAGAATTTTTGTTATTGTGCCTTGCGTTGGTGCCAGCACATACATTCCTGAGCTCTTTGAAGATACCACTGATTAATTTAGTGTATCCCAAAGCACCAAAGTGCTTAACATTGGCTCACTAGACAACAGAGCTTATTAGATTGGGGTGACACTTTTCTCTTGCCATCGATGGAGCAGTCACTTTATTTGAAAGAATCTACTCTATTTTCCGAGTGGACCCTGGTGTGATAAACTGCAGGCATTTTGTAGTGGCCTACCTGAGGCTGGATTTAGAATCACAAAGTAAATGGCAGAAAAATAGCTGGCATGACCGTTACATTTGTTAAAACATGAAGTGTCATTTTGTGGGATATGGTTTTTATAGGCTTTCCTAATTCCTAAGGCACTCACACTTCTTATATTGATGTTATGTGCCTGGTCCCTGAAGGTGAGAAAACCAGTAGTGCCCAC
Task1_train_5678
This sequence variant lies in DAW1 (dynein assembly factor with WD repeats 1) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Ciliary dyskinesia, primary, 52
AAAAGATTTAGTTAGCTGAAGATATTTAATATGGCAATTTAAGGAGCGTGTAAACTGCTTTTCCTGGTTCCGGTAAACACATAAGTTTATGTTGTGCGAAAAATATGCTGGGCAGCAAGTATCAAGTGTTCTGTAAGTTAGATGCAATTGAGGAAGTAGTTCCTGGAAATATGTAAAATTATAATTAAAATTAAATTATAAAATTATCCATTTTGAAACTACAAAGCTGTGTTTTAGGATTTTGTATAAACTTCCCCCAAAGGATCATTCACGGAGCAGGCCCACCCAGTCAGTGATCTGAAGTTTAGATGTGTCATCAGAACTTCGTAGAGTAGGCTAGGATTGGTGGCTCTCACCTCCCAGCTCAGCACAATCCCTTGGTTCCCTGTCTGAGATCAGATTTGTTCCTGCTTTGCAAAATATCAGCTTGATGATTTTAGGTTTCTAAAGGCCCCTTCTAGACCCTGGAACTCCGCCCCAGGCTGTACTCTCGGCCTTTCTGCTTCTGCACCTACAGCTGGTGATCATTGCCCTCTGGCTGGTCAGTGGTGGTCTCCAGGGCATGCAGACTATGGCCTCTTCATAAGCTGGGAGGCTTATGGATGGCAGGAGGGGATGGAAAAGTGGGGTGTGGGAGGCAGGATGAGGAGGAAGCCTGGCCCATGTTTCTGAGTGTCTGGCTAGGTAGCTATTGAGACATCTGTGTGTCTCCTCCATAAGTAAACATCTATTTTCATGAATGAGTGAATACAAAGAATTCTCTAGTGCTATTTTATTACATTTTATGCTTTTTAAATGAACATATTACTTATTGAATTGGCATCTGGTAAGGGCATTTCTATGGGGTGCAAAGCTAAAGTATTCACTCATTCAACAAACACTTTTAGAGAGTGTCCACTGTGCTGGGCATTGCACAGCCACTGGTAACAGAGTGATAAAAACAGATACGGCCCTGCCCTCCTCAAACCTTCAGTCATTGAGGAGATGGCCCGAATCTCTGTCTTCTGGTGATTAGAGGGGGATGTAAGTGTGACACCCAAAGGGATGCAGGACTAACAGGTTCCTTTGATGGTCACTCAGATGCCAGTTGGCAACACCTGGCACACGGGAGGCACAGAAGCGTATTTATGGAAAATGCTATACTTGGGGTGGCAGTAGATGAGAACATCCTTTCTTGTAGGTTCTACATTCACTTATTCTATGGCACAGATTAGAGAAGGATCTGTGTGCTTTTTAAAAAATTTTTATTTATTTATTTTTATTTTTTATTATTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGAATTACAGGTGTGTGCCACCATCCATGCCAAGCTAAATTTGTATTTTTAGTAGCGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGTCCTGAGCCACCGCCCCTGGCCCGGATCTGTGTGCTTTTGACCACAAAGATGACACCAGGGTTTGGCTACGAAGGATCCTGACTCGTGTGTTCATCCACACCAGGGCCCTGCATCTTTGCACAGAGAAGGGCATCGTGCATCTTTGGAAAGAAGCTGGGTGGGGAATACTCAAATTATAAGGATGCTTTGGTCTTTATTCTTAGAAATGTGAGGAGTAGGCAATTACATTTTCTCTCTGGATTTTAGTTTCCATGTACTAGTCCCTGCAATATTTTTTTCCATTATGAAGAAATTGTTCTATGCAAGAATAAATACCAGACTAGGAAGGTGACATGTGCTGTAATGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGATAAGAAATGTTTTGGGAACCATTACACAAAGCTGTGATCATTTTTCTTTCTCTTTTGCAGATTTCTTTCAACCCTCAAGGGAACCATCTTCTAACTGGCAGCTCTGACAAAACGGCTAGAATCTGGGATGCTCAGACTGGCCAGTGCCTCCAGGTTCTTGAGGGGCACACTGATGAAATCTTTTCATGTGCTTTCAACTATAAAGGCAACATAGTCATTACAGGTATGGAAGACATCAACACCATAGACTCATTTTTTCTTGATTGGCTGTTAGAGTTCCCAAGCTGAATACTAACAGGAGTTCATCCCCATTCCCTACCTCTTTTCTGGAGTCACTAGCTCATCTTGGCCTGCCCTCATATTTTCATTATTTAATTTTAGTTTTATGAGGACCCACAGGAGTGAGCGCTGCCATTGACTGTAGTAAGCCTTTGTGAACTTTGAATTTTATTTGCTCTAGATAAGGTAACAATTTGATAGCCTGCCTTACAGGTTACTAAATTTCCCCAGGTGTTTTCTATCAATTGAATGGTTAATATTTAGTCAGCCAGGCGCATTGGCTCATGCCAACAATCTCAGTGCTTTGAGAGGCTGAGGCAGAAAAAATGCTTGAGGCCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCGTCTCTACAAAAAAAATAGAGCATTAGCTGGGCATGGTGGCGTACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGGAGCACTTGAGCCAAGGAGTTGGAGGCTTCAGTGAGCTATGATCAGGCCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTAAGACCCTGTCTCAAGAAAAAAGTTGAGTTTATGTCAGTAAGTGTTAGTAACCAAAACAAGTCAGGATCAAAATTCTCCCCAGTTGGCTTTACAGCCCATTAGAGATTTATTCTTTGAGCAGAGTTGTTTTCTCCCCTGCTAAAGCACTAATGTCTGGGGGGAAAGAACATGTATTAACCATTTTTCAACCGTTAACAGTTTATGGTGAATTAATAATATTAGCAACATTTCATAAGAAAAGGGTAGTTTAGATCGTGGAAAGGGGAGAAAAATGACAAGATGATGGTATCATGTTAGTGGAGTGCCTCGAGGGGAGGCCTTGGCAGGGAATGGGTGCCACAATAGTGTGGAGTAGGGCACCCTAAGTGAGCACAGAAGACCAGATCTGCCTAAGTACCAGTGATTCTCATCATGTTGAGCAAATTTAAAAATTACTAGTCTAATAAGTTAAATGCCACAGGCCCAAGGCTGGCTTTACATATTGGCCAATTAGGTGGTTTCCTTGTCAGATAACTTCAGGGGTGCTGAGAATTATCTCCCCTTACCACCTAAAATGCCTCCCCAGTCTACTTAATGATGGACAGTTTCCGAAATCACAGGGCTTACGATCTTCAAAATCTTTGGGCTTATGATTTTCAAGTGTTAACTAAGATGTAGGTACTTTGAAAGCACTGGGAAAACAAGCCATAGATTTTTGTTGTGAACACAATATCAAATCCTTCTCCTTGATGAGAAAAGAGGTGAGGGGCTATGATGGAGGGCACAGGGCGCTCCTGCAGGGAGTGAGAAAGAAGGAAGACCAGCCTTTCCTAGTCCACATGGCCTCATATGAGGCTGGCTCTGCAGTACTTCTTCCCTCAACCAGTTTTCACAGAAGACCCTGGAGAGTTTAGCAAAAGAATTTTTGTTATTGTGCCTTGCGTTGGTGCCAGCACATACATTCCTGAGCTCTTTGAAGATACCACTGATTAATTTAGTGTATCCCAAAGCACCAAAGTGCTTAACATTGGCTCACTAGACAACAGAGCTTATTAGATTGGGGTGACACTTTTCTCTTGCCATCGATGGAGCAGTCACTTTATTTGAAAGAATCTACTCTATTTTCCGAGTGGACCCTGGTGTGATAAACTGCAGGCATTTTGTAGTGGCCTACCTGAGGCTGGATTTAGAATCACAAAGTAAATGGCAGAAAAATAGCTGGCATGACCGTTACATTTGTTAAAACATGAAGTGTCATTTTGTGGGATATGGTTTTTATAGGCTTTCCTAATTCCTAAGGCACTCACACTTCTTATATTGATGTTATGTGCCTGGTCCCTGAAGGTGAGAAAACCAGTAGTGCCCACTGATGATGAGAAAAACCCCCTAAAA
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Task1_train_5679
Given this context: Chromosome 2, gene DAW1 (dynein assembly factor with WD repeats 1) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Primary ciliary dyskinesia
AAAAGATTTAGTTAGCTGAAGATATTTAATATGGCAATTTAAGGAGCGTGTAAACTGCTTTTCCTGGTTCCGGTAAACACATAAGTTTATGTTGTGCGAAAAATATGCTGGGCAGCAAGTATCAAGTGTTCTGTAAGTTAGATGCAATTGAGGAAGTAGTTCCTGGAAATATGTAAAATTATAATTAAAATTAAATTATAAAATTATCCATTTTGAAACTACAAAGCTGTGTTTTAGGATTTTGTATAAACTTCCCCCAAAGGATCATTCACGGAGCAGGCCCACCCAGTCAGTGATCTGAAGTTTAGATGTGTCATCAGAACTTCGTAGAGTAGGCTAGGATTGGTGGCTCTCACCTCCCAGCTCAGCACAATCCCTTGGTTCCCTGTCTGAGATCAGATTTGTTCCTGCTTTGCAAAATATCAGCTTGATGATTTTAGGTTTCTAAAGGCCCCTTCTAGACCCTGGAACTCCGCCCCAGGCTGTACTCTCGGCCTTTCTGCTTCTGCACCTACAGCTGGTGATCATTGCCCTCTGGCTGGTCAGTGGTGGTCTCCAGGGCATGCAGACTATGGCCTCTTCATAAGCTGGGAGGCTTATGGATGGCAGGAGGGGATGGAAAAGTGGGGTGTGGGAGGCAGGATGAGGAGGAAGCCTGGCCCATGTTTCTGAGTGTCTGGCTAGGTAGCTATTGAGACATCTGTGTGTCTCCTCCATAAGTAAACATCTATTTTCATGAATGAGTGAATACAAAGAATTCTCTAGTGCTATTTTATTACATTTTATGCTTTTTAAATGAACATATTACTTATTGAATTGGCATCTGGTAAGGGCATTTCTATGGGGTGCAAAGCTAAAGTATTCACTCATTCAACAAACACTTTTAGAGAGTGTCCACTGTGCTGGGCATTGCACAGCCACTGGTAACAGAGTGATAAAAACAGATACGGCCCTGCCCTCCTCAAACCTTCAGTCATTGAGGAGATGGCCCGAATCTCTGTCTTCTGGTGATTAGAGGGGGATGTAAGTGTGACACCCAAAGGGATGCAGGACTAACAGGTTCCTTTGATGGTCACTCAGATGCCAGTTGGCAACACCTGGCACACGGGAGGCACAGAAGCGTATTTATGGAAAATGCTATACTTGGGGTGGCAGTAGATGAGAACATCCTTTCTTGTAGGTTCTACATTCACTTATTCTATGGCACAGATTAGAGAAGGATCTGTGTGCTTTTTAAAAAATTTTTATTTATTTATTTTTATTTTTTATTATTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTTAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGAATTACAGGTGTGTGCCACCATCCATGCCAAGCTAAATTTGTATTTTTAGTAGCGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGTCCTGAGCCACCGCCCCTGGCCCGGATCTGTGTGCTTTTGACCACAAAGATGACACCAGGGTTTGGCTACGAAGGATCCTGACTCGTGTGTTCATCCACACCAGGGCCCTGCATCTTTGCACAGAGAAGGGCATCGTGCATCTTTGGAAAGAAGCTGGGTGGGGAATACTCAAATTATAAGGATGCTTTGGTCTTTATTCTTAGAAATGTGAGGAGTAGGCAATTACATTTTCTCTCTGGATTTTAGTTTCCATGTACTAGTCCCTGCAATATTTTTTTCCATTATGAAGAAATTGTTCTATGCAAGAATAAATACCAGACTAGGAAGGTGACATGTGCTGTAATGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGATAAGAAATGTTTTGGGAACCATTACACAAAGCTGTGATCATTTTTCTTTCTCTTTTGCAGATTTCTTTCAACCCTCAAGGGAACCATCTTCTAACTGGCAGCTCTGACAAAACGGCTAGAATCTGGGATGCTCAGACTGGCCAGTGCCTCCAGGTTCTTGAGGGGCACACTGATGAAATCTTTTCATGTGCTTTCAACTATAAAGGCAACATAGTCATTACAGGTATGGAAGACATCAACACCATAGACTCATTTTTTCTTGATTGGCTGTTAGAGTTCCCAAGCTGAATACTAACAGGAGTTCATCCCCATTCCCTACCTCTTTTCTGGAGTCACTAGCTCATCTTGGCCTGCCCTCATATTTTCATTATTTAATTTTAGTTTTATGAGGACCCACAGGAGTGAGCGCTGCCATTGACTGTAGTAAGCCTTTGTGAACTTTGAATTTTATTTGCTCTAGATAAGGTAACAATTTGATAGCCTGCCTTACAGGTTACTAAATTTCCCCAGGTGTTTTCTATCAATTGAATGGTTAATATTTAGTCAGCCAGGCGCATTGGCTCATGCCAACAATCTCAGTGCTTTGAGAGGCTGAGGCAGAAAAAATGCTTGAGGCCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCGTCTCTACAAAAAAAATAGAGCATTAGCTGGGCATGGTGGCGTACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGGAGCACTTGAGCCAAGGAGTTGGAGGCTTCAGTGAGCTATGATCAGGCCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTAAGACCCTGTCTCAAGAAAAAAGTTGAGTTTATGTCAGTAAGTGTTAGTAACCAAAACAAGTCAGGATCAAAATTCTCCCCAGTTGGCTTTACAGCCCATTAGAGATTTATTCTTTGAGCAGAGTTGTTTTCTCCCCTGCTAAAGCACTAATGTCTGGGGGGAAAGAACATGTATTAACCATTTTTCAACCGTTAACAGTTTATGGTGAATTAATAATATTAGCAACATTTCATAAGAAAAGGGTAGTTTAGATCGTGGAAAGGGGAGAAAAATGACAAGATGATGGTATCATGTTAGTGGAGTGCCTCGAGGGGAGGCCTTGGCAGGGAATGGGTGCCACAATAGTGTGGAGTAGGGCACCCTAAGTGAGCACAGAAGACCAGATCTGCCTAAGTACCAGTGATTCTCATCATGTTGAGCAAATTTAAAAATTACTAGTCTAATAAGTTAAATGCCACAGGCCCAAGGCTGGCTTTACATATTGGCCAATTAGGTGGTTTCCTTGTCAGATAACTTCAGGGGTGCTGAGAATTATCTCCCCTTACCACCTAAAATGCCTCCCCAGTCTACTTAATGATGGACAGTTTCCGAAATCACAGGGCTTACGATCTTCAAAATCTTTGGGCTTATGATTTTCAAGTGTTAACTAAGATGTAGGTACTTTGAAAGCACTGGGAAAACAAGCCATAGATTTTTGTTGTGAACACAATATCAAATCCTTCTCCTTGATGAGAAAAGAGGTGAGGGGCTATGATGGAGGGCACAGGGCGCTCCTGCAGGGAGTGAGAAAGAAGGAAGACCAGCCTTTCCTAGTCCACATGGCCTCATATGAGGCTGGCTCTGCAGTACTTCTTCCCTCAACCAGTTTTCACAGAAGACCCTGGAGAGTTTAGCAAAAGAATTTTTGTTATTGTGCCTTGCGTTGGTGCCAGCACATACATTCCTGAGCTCTTTGAAGATACCACTGATTAATTTAGTGTATCCCAAAGCACCAAAGTGCTTAACATTGGCTCACTAGACAACAGAGCTTATTAGATTGGGGTGACACTTTTCTCTTGCCATCGATGGAGCAGTCACTTTATTTGAAAGAATCTACTCTATTTTCCGAGTGGACCCTGGTGTGATAAACTGCAGGCATTTTGTAGTGGCCTACCTGAGGCTGGATTTAGAATCACAAAGTAAATGGCAGAAAAATAGCTGGCATGACCGTTACATTTGTTAAAACATGAAGTGTCATTTTGTGGGATATGGTTTTTATAGGCTTTCCTAATTCCTAAGGCACTCACACTTCTTATATTGATGTTATGTGCCTGGTCCCTGAAGGTGAGAAAACCAGTAGTGCCCACTGATGATGAGAAAAACCCCCTAAAA
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Task1_train_5680
This is a variant in TRIP12 (thyroid hormone receptor interactor 12), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Clark-Baraitser syndrome
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Task1_train_5681
Consider a variant on Chromosome 2 in gene ECEL1 (endothelin converting enzyme like 1). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Distal arthrogryposis type 5D
CGTCTGAAAAAGCAGTTTGGGAACTAGCAGGTGACACACAGTGCTGCTGGGCATCAGGCCACTTGCTCTGGACCAGCCTGGAAGCCAGGAACCTCATGTCTTGTCCCAGGCACCTCCCTGCACCCGTCCTCACTGCATCCTCAGCAGGACACAGAGAGAAGGGGCCTGGCCCCAGGAGTGTCCCAGCCTCATTGCATTTCCTGAGCTGGGCAGAAGGGACCCCTGTCTGTTGGCTTTGCTGGCTGCTCACCCCACAGGCTCCCCTGATGCTGAGGCCTCCCCTAAGCCGGTGTGGACACAGGAGGGATTGGTGGTGGGTAAAGCTGGGAAACTGCAGGAGCCCGGGGTGAGGGCAAGAGGGCTGGGCCTGCAGATCCCAGTTCCAACCAGGATCCCAGATCAGAGGGGCGGGGTGGGCCTCGGGGTATGGAGGGTCCCAGACACCAGGCCCCACCCAGGAGGGTGGCAGGAAGAGGACTGTTGTACTGCTCCAGCTGCCCAAGGGACACGTGTGTGCCCAGCTCAGGATGAAAGGTCTGGAAACGGCACCTCCATGGGGCCTGGGGTCCTCCAAGGAGCACGCTGTGAAGGAGCCCTTGACAGGCAGCTCTGAGCCGGGCTCGGTGCCCAGGACTGAGCCTCTGCAGTCTTCCCTGACACCTCGGAACCCAGTGTCAGCTGCCTGCAGACTGCGAGGAAGGGCCCCGCCCCATCCCGGACTGGCCACTCCCGTGGGTATCCTTCTCAGTTCCAGCCTCCTCCGCAGGGCCACGCATGGCTGTCCTGCCCAAGGCTCCAATAAGAAGGACTTTTTAAAGGTCTCTCAAGGCTGGGGACAGGGTGCAGGCAGGCGTTGTCTGAGCAGAATGACAAGAGCTGGGCTGGCAAGAGATTTGCCACTTCCATTCATGAGATGGGGATGGCCACACCGGGCGGTGCCCAGGGAGGGGTTAACCCCTCTAGGCCACCCCCAAAGGAAGAATAACAGACCTGGGAGGAAGGGCAGGTGCCTGCTGGTCCCCCTCAATTCAGACTCGGGATCCCTGAGTGGGGCTGCCCAGTAGGATAATCCCCCCACCCCTGCCGCCCCTCCATGATCAGGCAGGGCCAGCCGGCAGCCTCCAGCCTGGGCAGCACTCCCTGCCTCTGTCCACCCTCCTCATGCCAGGAGCCTACCATTCCTACCAGTCCTCTCCTTTCTGCACCCCAGAAGCCTGTCTCCACACTGGAGGAGAGGCTGAGATGTCCTGTGGGTCAGCCTCACCTCCATGTAAGTGTGGATCGCTATCCCCTTCTCCAGGGAGGCTGAGGCCAAGGGCCAGGCTAAGACAAGGCAGAAGTTTCTCCTACTTCAGACTTGCAGGGGTCATAAGCCCCAGCATCACCCTGGAATGCGGGTCACCAGGCCATGAGGCTGAACTAGGGGTGCCCCAGAACTGGGCAAGAAGCCCTGGGCGAGGCTTTGGGGGAGGGCGGCTGGGCCAGGGAAGTACTGTCGGTTGGTGGAAAAGATAGAAGAGTCCAGGAAGGCTGGACACAGGCGGCCAAGCCAGGGCGACCAGGAGACAAGAAGGTCCTCTCCAGGGTCCCGGTTGTGCTAAGTGCCCTAGCCTCCCTGCAGAGGGCTCTCTCCAGCTCCGCCTGCCCTGGGGACCCGTGAAGAGGCCAAGGCAACAGTGCAGTGATTTATTGACCAGACTTTGCAGCAAGAACACAGCGAAGGTGGGGCCCGTACAATCCAGCCTGGCAGAGGGTCTGGCCCCCTTAGAGCAGAATCTGGGGACCCCAGTATATTTCCCTCACAGCCCCCCAAAGTCCAGCCTCACCCTGCTCCAGGCCCCTCCTGAAGTGAGGGGCAGCAGGGGGACCGGGTCCTGGAGGGGCTGGAAGGCAGGTGGTGCCCAGAGCGGGGCTGGCACCGGGTGCATGCCTGCCCCGGTAGCCAGCAGGAGGTGATTCGTGCGGGGGCAGTGGGGGCGTGCAGGCGGGCAGCCAGGCTCACCACACGGAACACTTGTGGGCAGGGTTCATGGGTGAGTCCTTGGGACAGTGGAAAGCCCGGCCAAACTCCTCAAACTGGGACACACTGCCCAGCACCCTGGGGTGGGGAGAGACCCACACAGTGTTGGGCCCTGCAGCCACTCCAGCCCCAGCAACCAGGGGTGACTTTTATTCCTTCCCATGCCCCCTGATCCCACCCCAAACACAAGGAGTGGACAAGGCCAGGCGGGCAGGTGGGCATACCTGTAGTGCTCAGGGGCATGCTTGTCAGTCAGCACCTGCAGGTAGATGGACTGCGACCGCCGCTTGATGCACCAGTTCTGGGTCCAGGAGCGGGGTGGAGGGGAGGAGGGGGAGATGAAGCCAGGCATCCGCCCCCTTGCCCCCCACCCAGCACACAAGGCGGTAGGCCCCCTCAGCACCACAGGACCATCACCTCTGACGGGACAGGTGATGACAGACAGGCTGTCCATGCGAAGCCTGGGCAAGGCAGGACTGGGACTGACCCTGGATGCCGTGTCCCCACCCCAAGGCTCCCAGTCCAATCCCCCACCCAGCCCACCTGGGCAAAGGCAATGAAGAAGAGCTGGTCATGTGTGTACTTGAGCCGGGGAAGTGGGTGCTCTGGGCCGTGCTCCCGCACCCACTTCTGATAGGCCTGGGGACACAGAGAGCATGGACCTGCTATGCCCGCCCACCCTGGGCACCGCTTCTTCTCTGTCCTCCATCTAGGTAGCCCTCCCTGCTCTCCCTGTGAAGGGGGGCCCGTGAATCCTTCCTCTTCCAGTGGACCGTGGCCCCAGCACATGCCCTGCCCCACCCCAGGCCAGAGCTCAGCAGGGTGGGCAGGGAGAGGCAGCTCTGTCCCTCATCTGGAGTCCTCATCAGCCCCCGTCCCTCCTGCAGCAGGGGTGGAGCACAGGCAGGCCGCTCACGTGGTAGGCCAGCTTGAGGCCGCCCATATCTGCGATGTTCTCCCCAAGCGTGTGTTTCCCGTTCACCTGCCGGGAAGGGAAGAGGCCAGGGGGCTGCTTGGGGCCCAGCTGGCCTCCCTCAGGCATTGATACCCTGGGCCCCAGCCCCTAATTCCTACCACCCCTCTCCTTCCCTTGCCCAGAGAGTTTGAGGGGGGGCTCCAACCCTACTCTTTCCTCCCAACCCCCTTGTCCTCCGTAAGTCTGCGGACACTCATTATCTGTCCACGTGAGTGTGCGTGGGAACCGAATGTGTGTGCAGGGACCTGGGCACAGGTTTTGTTTGGACATGTGCACGTGCGCAAGGGTGTGCGTGATGCTCCCGGCCCGTGCCCCACCAGGCCTGAGGGGCACAAGGGGCAGGTGGGGGTCTCACCCGCTGGTTGTAGACAGTGAAGTTGTCATAGAGACGGACGATGCACTCAGCCTTTCGCAGGAAGCGGCTGTAGGAGGCCTCCGTCCACCAGTGCAGCAGGTTCCCTGAGCGGTCATACTGGCCCCCTGTGGGCAGTGCAGCAGGCTGAGACCCACCCTCACCTGAGCCCCCTCCCCTCCCCACCCACCAGCCCCAGTTAGGCCATCCCCTACCCTGCCTCTCCACTGCCTGTCCTGCCCCCTCCGGGCCATCCCCTGGGGCCCCAACAGGCCTCACCCCAGTCGTCGTAGCCGTGGGTCAGCTCATGTCCAATGATGGTGCCGATGCCCCCGTAGTTGAGAGACCTGGGCCCACAGCAGCAGCATCAGGCCCTAGCCCTCCACCCTCTGAGAGCCCCATGCTGCTGCCCAGGCCCCAGATGTCCCCTGGCCGGGCCAGGAGGTGGCACAGGGAGGCCACAGAGGCATCCGTGCGGTCCAGGGGCACATGTGCCTCAGCTTCCTCATGCGCTATGTGAATGCCAGTGGAACCTATCCAGCTTCTTTTAGGAAATCACATCTAACAGAGCTGGCTGGGCAGTGAAACAGGGCTGGAGGAGACAGGAGGGAAACGGAGGCACCTACGTAGGGGTTTCTCCTCCTACCTCATCATTAGTGTTGCGCCACCTTTGAAACATCAAAATGAGCCTCAAACAAGTAAAGAAGACCCCAGGAAGTTACAAATAACAAACCTACACATTTTTCTA
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Task1_train_5682
Assess the clinical impact of this variant on gene ECEL1 (endothelin converting enzyme like 1), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Distal arthrogryposis type 5D
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Task1_train_5683
A variant was discovered in gene ECEL1 (endothelin converting enzyme like 1), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Distal arthrogryposis type 5D
GAGGGAAACGGAGGCACCTACGTAGGGGTTTCTCCTCCTACCTCATCATTAGTGTTGCGCCACCTTTGAAACATCAAAATGAGCCTCAAACAAGTAAAGAAGACCCCAGGAAGTTACAAATAACAAACCTACACATTTTTCTAAATAACCAAGGATGTAGTGGGGAGCCAGGGTCCACAGCTGTCCTGACTCCTGAACCCAGCTGGGTCTGGGGCGATTGGAGCCACAGTACGCCGACACACACCTGGTAGACAAGGTCTGCAATGCCAGCCCTGCCCTCAGCCACAAACAGGGCAAGCTATGTACTCACTGTGGGAAGTCAGGGTCGTACAGGGTGGGCTGCAGGATGCCCGCGGGGAACACTACAAGAAGGGGGTGCTCAGTGGGAAACCCATCCACTTTCGGACCCTGCCCCGCCCGGCGTAGGGACACATCCCCTTACCCATCTGGTTCTTGTTGGGTAGATAGTAGGCATTGAGCGCCTGTGGGGGGAGCAGCCACCTGTGGAGGGATGCTGGGGTGAATGGGGGGAACACACTCCCTCCCCCGCTACCCTCACATCACAGCTTCCTCGTCAGCCATCTCCTGACAGTCTGGGGGTCACCCTGCCGGCCCCCACCCCATGCCCTGTGCTGGCGTGTGTGCCCCCCATATCTGCATGGCTGTGAGACGATTTGCCCTACCAGCTCCTGCCCTTTCCCCACAACCCTTCCCTGACCCCCAGCTCTGGGCCAGGCACCCACGTGGACTTGTCCACCTCCTGCCGAATCTTCTTAACTGAGAGCTGGATGCTGAAGCGGATGCTGTTCAAGATGTTCTTGAAGTAGGTCTTCTCATGGACCTCAAACTGCAGGAGGCACGGGCGACACTCAGCGGCAGGCCAGGGCAGGGCTACCTGCAGACTGGGCAACAACCTGGCCGTGCAGGCCACCTGCCCTCCTGAGTGCCGTTAGTAGAGGGGCTGTGGACAGGCTGGGCAGGCAGGGTCAGGGCCCACCTCATACTCCTTGTCCACAGCATCGGGTTTCAGCAGGAAGTCCGGGTAGCCGACCATCACCATCATGTACTGGAGCTGCGGGCCGAGGGCAGGTGAAGGTGGCACCAGGCCTCGGGAGACAGCCCCCCGCCCCCCACCCTACCCACCAAGGAAGGGAGCACTAGGCCAGCCTGGGAGTGGGCTTCACAGTGGGGGAGGCAGGCCTGGTCAACTCCACGAAGGCCTCTTTGTCCCTTTTGTTCTCTTTCGCTGGTACACAGTAGGTGCTCAATATATATGGGACCAACCAATGACACTGGGTCCCCCCTCACCTTGGCCCGAGCAGCAGCCCTGGTCTCGGCGTCCATCCAGTCCAGCTCCTCCAGGCGCTGGCCCAGGATGTACTTGATGTCTTCCACTAGCTGCTGCACCTGCAGGGTCAGGGGTCAGGGAGCAAGGGTCAACCCAGCAGCCTGGTCTATCACTCCTGGCAGGAGGGGTACCCCTGCCTTTAAGCACCACTTTCTAAGCCCAAACCTCATTTCTGAACACCAAGAGGATACTTTGGAGGTGAGGATCCAGGCCCTGCACCCCCGAGGGCTCACAAGATAGAGGAGGAAACTGCCCCAGCAATGACCACAGACATCCCTAAGGCCACGCCTCCCGAGCATGCCTGAGAAGGTGGGCTGGGGCCTGGCAGGGAGGTCTGCCTGCAGTTGATAGTCCACATAAGCTTCCTGGAGGAGGAGGCCTGTGGAGGAGCAGCCTGGGGCCTCAGAATCGGCTGAGTACTTAGCAGGGCCTGGTCCCCCTGCCTGCAGGGGACATGTGGGGCTCCCCATATTAGGACCATGGCCTCGGGAGGGCTCCACCCTCAGTTCAGCACCATCCTCCTCTCTCAAACAAGGGCAACCCACCTTGGCTTTGCTGGCAGCTGAGAAGTGCTCATGTACAAAGAGGGCGCCAAGCGCCATGCCAAAGTGGCGATTGGCCTGGCCCAAGCAGACCCGGGCCAGCTCCTGTGGCTTGTCGCTGCCCTCCATCTCCTGTGCCAGCTCGTGCAGTGCCTCACGGAATGGCGGGGACAGGTGTTCACTCAGGACCACCACCACGCGCCACACCAGGTAGTTGTGCAGGACCCTGGGGACCAGGTGAAGCCAGTGGGTGTCCAGACGGACATGCATGTGGGCCACCAAGGGCACCACCCCTACCTGTGCCCGCCAACCTGTGGCTGGACCCAGGACCCAGACAGCCCCACAAAGAAGGGACAGGGGGTCATCCCAGCTATGCAGAGCAGAAAATGTAAAGCCCACCCAGCAGAGAGGTCCAGGGTGCAGGGGAAGGACCTAGTGACCGCTGGGCAGAAAATGCCAGATCTGCAGCCATACCGGTGGGGTGTGGAGCGGATGAGCTGCGACACCTGCTGCATGTAGTCTGTCGCCAGCAGCACCACCTCCTCTTCCTCTGAGAAGTCCTCCTGGAAGATCTGGTCTAGCAGCCACTTCCACCGCAACTGTGAGACCAAGGACAGGGACAGTGAGGCTAGGGTTGGCAGGGGCCACAGAAGACAGGGAGGGGGCAGAGAGAGGCAGCGAGGGGACATGAGAGTCCATGGCCAAGGAACGGTTTGCCCATCTCTGGGGAGAGATGACCCTGTAGTCCCAGCAGCAGCATTGCCCTCAACCCTGCCTGCCCACGAGGACTGGGCCACACTCACGTGGGGGGTGATCTTCTGCAGCTGCCCCAGCGTCACCTTGTTGTACATGGAGCTGACATCTCGCCGTAGGTCGTCATGCTCTGACACAGTGATCTGTGGGGAGAGATCACAGCTGACCCAGCCCTGCTCCATGATGCCCTCCCTCAAGCCCAGGGCAGCCTCCAGTCCTGGTCTGCTCACGTTGGCCAGCTGCTGCTCCACTTGCAGGATCTCTTGGGCCTTCTGTTCCACAGCGTCTGCACCCAGGAGGCTGAGCACTCGCTCCATGAACACCCTGTATGCTGCCAGGATCTGCACCAGGGGAGGGGGCTCACCCAGGGACAGGGACAGGCCTAGCCTGGATCCACCCCTCCTGGGGCCCCAGGCCTTCCCTGCCTCCCCATCCCATGCCCCAGCACCTTCTCACTGTCCTCATCCTGAGCGAGGTACAGGGTCCTCTCTGGCAGGGTGAGCCCATCCTGGTCAATCTGGGGAGGGAGACAGGGGCCACAGGTCAGAGGCCCACACCTCAGGTTCCCTAAACAGAGGGAATTCCCACTCCAATGCCCAGAGAGCAACCAGACATCCATGAGTACAGCCACAGAAGCACGCAGACCCCAGCTCCTCTTTCCACCCAGACGAGATGGCCAAAGCCCCATCCCTGACTGTCCCAGCCTGCGGATGCCCAATCTTACCCCTGTACGTCTGCACTTTCCTTATCTGTCCGGGGCATTCGTAGGTCCCCCACTGACAGTTGGGACCCCTAGCTTTGGGGCCAGCTCCAGACCTCGCGGAGACGTCAACCCAGCCCGCCGGCGCGCCTCTCCCTCCTGGCCCTCACTGCCTGCCAGAGGGCTGGGAAATTGCGGCTCCCGCGGCTCCTCTAAACACCGCAATTACCCCAGGGAAATTACTTGCGCCCTCCTCCCGCGCTCTGCCTCTGTGCGCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTGCTCGTCTCTTCCCTCCTCTCCTCTCACGCACCCGCCTCCCGCGCGCAGGGACCCCTGGGCAAGGCCACTGCGCCCCGGATCCGCGGCCGCTGGCAGGGCGCTCAGGGGGCGCACTCACGCGGATGACGTAGCGCGAGGAGTTCCTGTCGTCCAGGCTGACCGTGAGCGAGAAGAGCGCGGCGGCGCTGTACACGCCCTGCGCCTTGTACAGCAGCCGGTTGAGGTCCCATCGCGCCGCGACCCCCGGACGCTCCTCCGCGCCGCCCAGGTCCCAGCCCCCGCAGTCCTCGATGACCTCTAGCATGGGTCGCGGGCCCAGTCGCTCGATCTCGCGCATGTCGAGGCACGAGCGGAAGAAGGCGCGCACCTTGCGCTGGGCCGCGCCGCCAGGCCCACCCCCGGGCCGCGCCAGCAGGCGCCGTAGGCGCTCCTCGTTTTGCTCGCCGATGGCCGC
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Task1_train_5684
The gene ECEL1 (endothelin converting enzyme like 1) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Distal arthrogryposis type 5D
AAGTCAGGGTCGTACAGGGTGGGCTGCAGGATGCCCGCGGGGAACACTACAAGAAGGGGGTGCTCAGTGGGAAACCCATCCACTTTCGGACCCTGCCCCGCCCGGCGTAGGGACACATCCCCTTACCCATCTGGTTCTTGTTGGGTAGATAGTAGGCATTGAGCGCCTGTGGGGGGAGCAGCCACCTGTGGAGGGATGCTGGGGTGAATGGGGGGAACACACTCCCTCCCCCGCTACCCTCACATCACAGCTTCCTCGTCAGCCATCTCCTGACAGTCTGGGGGTCACCCTGCCGGCCCCCACCCCATGCCCTGTGCTGGCGTGTGTGCCCCCCATATCTGCATGGCTGTGAGACGATTTGCCCTACCAGCTCCTGCCCTTTCCCCACAACCCTTCCCTGACCCCCAGCTCTGGGCCAGGCACCCACGTGGACTTGTCCACCTCCTGCCGAATCTTCTTAACTGAGAGCTGGATGCTGAAGCGGATGCTGTTCAAGATGTTCTTGAAGTAGGTCTTCTCATGGACCTCAAACTGCAGGAGGCACGGGCGACACTCAGCGGCAGGCCAGGGCAGGGCTACCTGCAGACTGGGCAACAACCTGGCCGTGCAGGCCACCTGCCCTCCTGAGTGCCGTTAGTAGAGGGGCTGTGGACAGGCTGGGCAGGCAGGGTCAGGGCCCACCTCATACTCCTTGTCCACAGCATCGGGTTTCAGCAGGAAGTCCGGGTAGCCGACCATCACCATCATGTACTGGAGCTGCGGGCCGAGGGCAGGTGAAGGTGGCACCAGGCCTCGGGAGACAGCCCCCCGCCCCCCACCCTACCCACCAAGGAAGGGAGCACTAGGCCAGCCTGGGAGTGGGCTTCACAGTGGGGGAGGCAGGCCTGGTCAACTCCACGAAGGCCTCTTTGTCCCTTTTGTTCTCTTTCGCTGGTACACAGTAGGTGCTCAATATATATGGGACCAACCAATGACACTGGGTCCCCCCTCACCTTGGCCCGAGCAGCAGCCCTGGTCTCGGCGTCCATCCAGTCCAGCTCCTCCAGGCGCTGGCCCAGGATGTACTTGATGTCTTCCACTAGCTGCTGCACCTGCAGGGTCAGGGGTCAGGGAGCAAGGGTCAACCCAGCAGCCTGGTCTATCACTCCTGGCAGGAGGGGTACCCCTGCCTTTAAGCACCACTTTCTAAGCCCAAACCTCATTTCTGAACACCAAGAGGATACTTTGGAGGTGAGGATCCAGGCCCTGCACCCCCGAGGGCTCACAAGATAGAGGAGGAAACTGCCCCAGCAATGACCACAGACATCCCTAAGGCCACGCCTCCCGAGCATGCCTGAGAAGGTGGGCTGGGGCCTGGCAGGGAGGTCTGCCTGCAGTTGATAGTCCACATAAGCTTCCTGGAGGAGGAGGCCTGTGGAGGAGCAGCCTGGGGCCTCAGAATCGGCTGAGTACTTAGCAGGGCCTGGTCCCCCTGCCTGCAGGGGACATGTGGGGCTCCCCATATTAGGACCATGGCCTCGGGAGGGCTCCACCCTCAGTTCAGCACCATCCTCCTCTCTCAAACAAGGGCAACCCACCTTGGCTTTGCTGGCAGCTGAGAAGTGCTCATGTACAAAGAGGGCGCCAAGCGCCATGCCAAAGTGGCGATTGGCCTGGCCCAAGCAGACCCGGGCCAGCTCCTGTGGCTTGTCGCTGCCCTCCATCTCCTGTGCCAGCTCGTGCAGTGCCTCACGGAATGGCGGGGACAGGTGTTCACTCAGGACCACCACCACGCGCCACACCAGGTAGTTGTGCAGGACCCTGGGGACCAGGTGAAGCCAGTGGGTGTCCAGACGGACATGCATGTGGGCCACCAAGGGCACCACCCCTACCTGTGCCCGCCAACCTGTGGCTGGACCCAGGACCCAGACAGCCCCACAAAGAAGGGACAGGGGGTCATCCCAGCTATGCAGAGCAGAAAATGTAAAGCCCACCCAGCAGAGAGGTCCAGGGTGCAGGGGAAGGACCTAGTGACCGCTGGGCAGAAAATGCCAGATCTGCAGCCATACCGGTGGGGTGTGGAGCGGATGAGCTGCGACACCTGCTGCATGTAGTCTGTCGCCAGCAGCACCACCTCCTCTTCCTCTGAGAAGTCCTCCTGGAAGATCTGGTCTAGCAGCCACTTCCACCGCAACTGTGAGACCAAGGACAGGGACAGTGAGGCTAGGGTTGGCAGGGGCCACAGAAGACAGGGAGGGGGCAGAGAGAGGCAGCGAGGGGACATGAGAGTCCATGGCCAAGGAACGGTTTGCCCATCTCTGGGGAGAGATGACCCTGTAGTCCCAGCAGCAGCATTGCCCTCAACCCTGCCTGCCCACGAGGACTGGGCCACACTCACGTGGGGGGTGATCTTCTGCAGCTGCCCCAGCGTCACCTTGTTGTACATGGAGCTGACATCTCGCCGTAGGTCGTCATGCTCTGACACAGTGATCTGTGGGGAGAGATCACAGCTGACCCAGCCCTGCTCCATGATGCCCTCCCTCAAGCCCAGGGCAGCCTCCAGTCCTGGTCTGCTCACGTTGGCCAGCTGCTGCTCCACTTGCAGGATCTCTTGGGCCTTCTGTTCCACAGCGTCTGCACCCAGGAGGCTGAGCACTCGCTCCATGAACACCCTGTATGCTGCCAGGATCTGCACCAGGGGAGGGGGCTCACCCAGGGACAGGGACAGGCCTAGCCTGGATCCACCCCTCCTGGGGCCCCAGGCCTTCCCTGCCTCCCCATCCCATGCCCCAGCACCTTCTCACTGTCCTCATCCTGAGCGAGGTACAGGGTCCTCTCTGGCAGGGTGAGCCCATCCTGGTCAATCTGGGGAGGGAGACAGGGGCCACAGGTCAGAGGCCCACACCTCAGGTTCCCTAAACAGAGGGAATTCCCACTCCAATGCCCAGAGAGCAACCAGACATCCATGAGTACAGCCACAGAAGCACGCAGACCCCAGCTCCTCTTTCCACCCAGACGAGATGGCCAAAGCCCCATCCCTGACTGTCCCAGCCTGCGGATGCCCAATCTTACCCCTGTACGTCTGCACTTTCCTTATCTGTCCGGGGCATTCGTAGGTCCCCCACTGACAGTTGGGACCCCTAGCTTTGGGGCCAGCTCCAGACCTCGCGGAGACGTCAACCCAGCCCGCCGGCGCGCCTCTCCCTCCTGGCCCTCACTGCCTGCCAGAGGGCTGGGAAATTGCGGCTCCCGCGGCTCCTCTAAACACCGCAATTACCCCAGGGAAATTACTTGCGCCCTCCTCCCGCGCTCTGCCTCTGTGCGCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTGCTCGTCTCTTCCCTCCTCTCCTCTCACGCACCCGCCTCCCGCGCGCAGGGACCCCTGGGCAAGGCCACTGCGCCCCGGATCCGCGGCCGCTGGCAGGGCGCTCAGGGGGCGCACTCACGCGGATGACGTAGCGCGAGGAGTTCCTGTCGTCCAGGCTGACCGTGAGCGAGAAGAGCGCGGCGGCGCTGTACACGCCCTGCGCCTTGTACAGCAGCCGGTTGAGGTCCCATCGCGCCGCGACCCCCGGACGCTCCTCCGCGCCGCCCAGGTCCCAGCCCCCGCAGTCCTCGATGACCTCTAGCATGGGTCGCGGGCCCAGTCGCTCGATCTCGCGCATGTCGAGGCACGAGCGGAAGAAGGCGCGCACCTTGCGCTGGGCCGCGCCGCCAGGCCCACCCCCGGGCCGCGCCAGCAGGCGCCGTAGGCGCTCCTCGTTTTGCTCGCCGATGGCCGCGATGGTGCCATAGGTGAGCTTGTCGTCGGGGATGGCGTGGCGCCGCAGCCAACCGCCGCAGGCGAACGAGTAGAAGTCCTGGCATGGGTCGATGCTGGCGTCCAGGTTGGCGGCCAGGAAGCGAGCGGCGCGCGCGAAGGCCTTGCGCTCAGGGCAGCCCTCGGGACAGGCGCCGCCGCCGGCCGCGACCGGGCCCAGGTACTTGAGGGCCAGCATAGCCGCCAGAATGGCGCAGAGGCCGGCGGCGAACACCAGCCCCGACAGCAGGCACACCTCGCGCCGGTTCCAGCGCGGCAGCCCGGACCGGGCCCCGGTG
AAGTCAGGGTCGTACAGGGTGGGCTGCAGGATGCCCGCGGGGAACACTACAAGAAGGGGGTGCTCAGTGGGAAACCCATCCACTTTCGGACCCTGCCCCGCCCGGCGTAGGGACACATCCCCTTACCCATCTGGTTCTTGTTGGGTAGATAGTAGGCATTGAGCGCCTGTGGGGGGAGCAGCCACCTGTGGAGGGATGCTGGGGTGAATGGGGGGAACACACTCCCTCCCCCGCTACCCTCACATCACAGCTTCCTCGTCAGCCATCTCCTGACAGTCTGGGGGTCACCCTGCCGGCCCCCACCCCATGCCCTGTGCTGGCGTGTGTGCCCCCCATATCTGCATGGCTGTGAGACGATTTGCCCTACCAGCTCCTGCCCTTTCCCCACAACCCTTCCCTGACCCCCAGCTCTGGGCCAGGCACCCACGTGGACTTGTCCACCTCCTGCCGAATCTTCTTAACTGAGAGCTGGATGCTGAAGCGGATGCTGTTCAAGATGTTCTTGAAGTAGGTCTTCTCATGGACCTCAAACTGCAGGAGGCACGGGCGACACTCAGCGGCAGGCCAGGGCAGGGCTACCTGCAGACTGGGCAACAACCTGGCCGTGCAGGCCACCTGCCCTCCTGAGTGCCGTTAGTAGAGGGGCTGTGGACAGGCTGGGCAGGCAGGGTCAGGGCCCACCTCATACTCCTTGTCCACAGCATCGGGTTTCAGCAGGAAGTCCGGGTAGCCGACCATCACCATCATGTACTGGAGCTGCGGGCCGAGGGCAGGTGAAGGTGGCACCAGGCCTCGGGAGACAGCCCCCCGCCCCCCACCCTACCCACCAAGGAAGGGAGCACTAGGCCAGCCTGGGAGTGGGCTTCACAGTGGGGGAGGCAGGCCTGGTCAACTCCACGAAGGCCTCTTTGTCCCTTTTGTTCTCTTTCGCTGGTACACAGTAGGTGCTCAATATATATGGGACCAACCAATGACACTGGGTCCCCCCTCACCTTGGCCCGAGCAGCAGCCCTGGTCTCGGCGTCCATCCAGTCCAGCTCCTCCAGGCGCTGGCCCAGGATGTACTTGATGTCTTCCACTAGCTGCTGCACCTGCAGGGTCAGGGGTCAGGGAGCAAGGGTCAACCCAGCAGCCTGGTCTATCACTCCTGGCAGGAGGGGTACCCCTGCCTTTAAGCACCACTTTCTAAGCCCAAACCTCATTTCTGAACACCAAGAGGATACTTTGGAGGTGAGGATCCAGGCCCTGCACCCCCGAGGGCTCACAAGATAGAGGAGGAAACTGCCCCAGCAATGACCACAGACATCCCTAAGGCCACGCCTCCCGAGCATGCCTGAGAAGGTGGGCTGGGGCCTGGCAGGGAGGTCTGCCTGCAGTTGATAGTCCACATAAGCTTCCTGGAGGAGGAGGCCTGTGGAGGAGCAGCCTGGGGCCTCAGAATCGGCTGAGTACTTAGCAGGGCCTGGTCCCCCTGCCTGCAGGGGACATGTGGGGCTCCCCATATTAGGACCATGGCCTCGGGAGGGCTCCACCCTCAGTTCAGCACCATCCTCCTCTCTCAAACAAGGGCAACCCACCTTGGCTTTGCTGGCAGCTGAGAAGTGCTCATGTACAAAGAGGGCGCCAAGCGCCATGCCAAAGTGGCGATTGGCCTGGCCCAAGCAGACCCGGGCCAGCTCCTGTGGCTTGTCGCTGCCCTCCATCTCCTGTGCCAGCTCGTGCAGTGCCTCACGGAATGGCGGGGACAGGTGTTCACTCAGGACCACCACCACGCGCCACACCAGGTAGTTGTGCAGGACCCTGGGGACCAGGTGAAGCCAGTGGGTGTCCAGACGGACATGCATGTGGGCCACCAAGGGCACCACCCCTACCTGTGCCCGCCAACCTGTGGCTGGACCCAGGACCCAGACAGCCCCACAAAGAAGGGACAGGGGGTCATCCCAGCTATGCAGAGCAGAAAATGTAAAGCCCACCCAGCAGAGAGGTCCAGGGTGCAGGGGAAGGACCTAGTGACCGCTGGGCAGAAAATGCCAGATCTGCAGCCATACTGGTGGGGTGTGGAGCGGATGAGCTGCGACACCTGCTGCATGTAGTCTGTCGCCAGCAGCACCACCTCCTCTTCCTCTGAGAAGTCCTCCTGGAAGATCTGGTCTAGCAGCCACTTCCACCGCAACTGTGAGACCAAGGACAGGGACAGTGAGGCTAGGGTTGGCAGGGGCCACAGAAGACAGGGAGGGGGCAGAGAGAGGCAGCGAGGGGACATGAGAGTCCATGGCCAAGGAACGGTTTGCCCATCTCTGGGGAGAGATGACCCTGTAGTCCCAGCAGCAGCATTGCCCTCAACCCTGCCTGCCCACGAGGACTGGGCCACACTCACGTGGGGGGTGATCTTCTGCAGCTGCCCCAGCGTCACCTTGTTGTACATGGAGCTGACATCTCGCCGTAGGTCGTCATGCTCTGACACAGTGATCTGTGGGGAGAGATCACAGCTGACCCAGCCCTGCTCCATGATGCCCTCCCTCAAGCCCAGGGCAGCCTCCAGTCCTGGTCTGCTCACGTTGGCCAGCTGCTGCTCCACTTGCAGGATCTCTTGGGCCTTCTGTTCCACAGCGTCTGCACCCAGGAGGCTGAGCACTCGCTCCATGAACACCCTGTATGCTGCCAGGATCTGCACCAGGGGAGGGGGCTCACCCAGGGACAGGGACAGGCCTAGCCTGGATCCACCCCTCCTGGGGCCCCAGGCCTTCCCTGCCTCCCCATCCCATGCCCCAGCACCTTCTCACTGTCCTCATCCTGAGCGAGGTACAGGGTCCTCTCTGGCAGGGTGAGCCCATCCTGGTCAATCTGGGGAGGGAGACAGGGGCCACAGGTCAGAGGCCCACACCTCAGGTTCCCTAAACAGAGGGAATTCCCACTCCAATGCCCAGAGAGCAACCAGACATCCATGAGTACAGCCACAGAAGCACGCAGACCCCAGCTCCTCTTTCCACCCAGACGAGATGGCCAAAGCCCCATCCCTGACTGTCCCAGCCTGCGGATGCCCAATCTTACCCCTGTACGTCTGCACTTTCCTTATCTGTCCGGGGCATTCGTAGGTCCCCCACTGACAGTTGGGACCCCTAGCTTTGGGGCCAGCTCCAGACCTCGCGGAGACGTCAACCCAGCCCGCCGGCGCGCCTCTCCCTCCTGGCCCTCACTGCCTGCCAGAGGGCTGGGAAATTGCGGCTCCCGCGGCTCCTCTAAACACCGCAATTACCCCAGGGAAATTACTTGCGCCCTCCTCCCGCGCTCTGCCTCTGTGCGCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTGCTCGTCTCTTCCCTCCTCTCCTCTCACGCACCCGCCTCCCGCGCGCAGGGACCCCTGGGCAAGGCCACTGCGCCCCGGATCCGCGGCCGCTGGCAGGGCGCTCAGGGGGCGCACTCACGCGGATGACGTAGCGCGAGGAGTTCCTGTCGTCCAGGCTGACCGTGAGCGAGAAGAGCGCGGCGGCGCTGTACACGCCCTGCGCCTTGTACAGCAGCCGGTTGAGGTCCCATCGCGCCGCGACCCCCGGACGCTCCTCCGCGCCGCCCAGGTCCCAGCCCCCGCAGTCCTCGATGACCTCTAGCATGGGTCGCGGGCCCAGTCGCTCGATCTCGCGCATGTCGAGGCACGAGCGGAAGAAGGCGCGCACCTTGCGCTGGGCCGCGCCGCCAGGCCCACCCCCGGGCCGCGCCAGCAGGCGCCGTAGGCGCTCCTCGTTTTGCTCGCCGATGGCCGCGATGGTGCCATAGGTGAGCTTGTCGTCGGGGATGGCGTGGCGCCGCAGCCAACCGCCGCAGGCGAACGAGTAGAAGTCCTGGCATGGGTCGATGCTGGCGTCCAGGTTGGCGGCCAGGAAGCGAGCGGCGCGCGCGAAGGCCTTGCGCTCAGGGCAGCCCTCGGGACAGGCGCCGCCGCCGGCCGCGACCGGGCCCAGGTACTTGAGGGCCAGCATAGCCGCCAGAATGGCGCAGAGGCCGGCGGCGAACACCAGCCCCGACAGCAGGCACACCTCGCGCCGGTTCCAGCGCGGCAGCCCGGACCGGGCCCCGGTG
Task1_train_5685
A mutation found in ECEL1 (endothelin converting enzyme like 1) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Distal arthrogryposis type 5D
GCAGGCCACCTGCCCTCCTGAGTGCCGTTAGTAGAGGGGCTGTGGACAGGCTGGGCAGGCAGGGTCAGGGCCCACCTCATACTCCTTGTCCACAGCATCGGGTTTCAGCAGGAAGTCCGGGTAGCCGACCATCACCATCATGTACTGGAGCTGCGGGCCGAGGGCAGGTGAAGGTGGCACCAGGCCTCGGGAGACAGCCCCCCGCCCCCCACCCTACCCACCAAGGAAGGGAGCACTAGGCCAGCCTGGGAGTGGGCTTCACAGTGGGGGAGGCAGGCCTGGTCAACTCCACGAAGGCCTCTTTGTCCCTTTTGTTCTCTTTCGCTGGTACACAGTAGGTGCTCAATATATATGGGACCAACCAATGACACTGGGTCCCCCCTCACCTTGGCCCGAGCAGCAGCCCTGGTCTCGGCGTCCATCCAGTCCAGCTCCTCCAGGCGCTGGCCCAGGATGTACTTGATGTCTTCCACTAGCTGCTGCACCTGCAGGGTCAGGGGTCAGGGAGCAAGGGTCAACCCAGCAGCCTGGTCTATCACTCCTGGCAGGAGGGGTACCCCTGCCTTTAAGCACCACTTTCTAAGCCCAAACCTCATTTCTGAACACCAAGAGGATACTTTGGAGGTGAGGATCCAGGCCCTGCACCCCCGAGGGCTCACAAGATAGAGGAGGAAACTGCCCCAGCAATGACCACAGACATCCCTAAGGCCACGCCTCCCGAGCATGCCTGAGAAGGTGGGCTGGGGCCTGGCAGGGAGGTCTGCCTGCAGTTGATAGTCCACATAAGCTTCCTGGAGGAGGAGGCCTGTGGAGGAGCAGCCTGGGGCCTCAGAATCGGCTGAGTACTTAGCAGGGCCTGGTCCCCCTGCCTGCAGGGGACATGTGGGGCTCCCCATATTAGGACCATGGCCTCGGGAGGGCTCCACCCTCAGTTCAGCACCATCCTCCTCTCTCAAACAAGGGCAACCCACCTTGGCTTTGCTGGCAGCTGAGAAGTGCTCATGTACAAAGAGGGCGCCAAGCGCCATGCCAAAGTGGCGATTGGCCTGGCCCAAGCAGACCCGGGCCAGCTCCTGTGGCTTGTCGCTGCCCTCCATCTCCTGTGCCAGCTCGTGCAGTGCCTCACGGAATGGCGGGGACAGGTGTTCACTCAGGACCACCACCACGCGCCACACCAGGTAGTTGTGCAGGACCCTGGGGACCAGGTGAAGCCAGTGGGTGTCCAGACGGACATGCATGTGGGCCACCAAGGGCACCACCCCTACCTGTGCCCGCCAACCTGTGGCTGGACCCAGGACCCAGACAGCCCCACAAAGAAGGGACAGGGGGTCATCCCAGCTATGCAGAGCAGAAAATGTAAAGCCCACCCAGCAGAGAGGTCCAGGGTGCAGGGGAAGGACCTAGTGACCGCTGGGCAGAAAATGCCAGATCTGCAGCCATACCGGTGGGGTGTGGAGCGGATGAGCTGCGACACCTGCTGCATGTAGTCTGTCGCCAGCAGCACCACCTCCTCTTCCTCTGAGAAGTCCTCCTGGAAGATCTGGTCTAGCAGCCACTTCCACCGCAACTGTGAGACCAAGGACAGGGACAGTGAGGCTAGGGTTGGCAGGGGCCACAGAAGACAGGGAGGGGGCAGAGAGAGGCAGCGAGGGGACATGAGAGTCCATGGCCAAGGAACGGTTTGCCCATCTCTGGGGAGAGATGACCCTGTAGTCCCAGCAGCAGCATTGCCCTCAACCCTGCCTGCCCACGAGGACTGGGCCACACTCACGTGGGGGGTGATCTTCTGCAGCTGCCCCAGCGTCACCTTGTTGTACATGGAGCTGACATCTCGCCGTAGGTCGTCATGCTCTGACACAGTGATCTGTGGGGAGAGATCACAGCTGACCCAGCCCTGCTCCATGATGCCCTCCCTCAAGCCCAGGGCAGCCTCCAGTCCTGGTCTGCTCACGTTGGCCAGCTGCTGCTCCACTTGCAGGATCTCTTGGGCCTTCTGTTCCACAGCGTCTGCACCCAGGAGGCTGAGCACTCGCTCCATGAACACCCTGTATGCTGCCAGGATCTGCACCAGGGGAGGGGGCTCACCCAGGGACAGGGACAGGCCTAGCCTGGATCCACCCCTCCTGGGGCCCCAGGCCTTCCCTGCCTCCCCATCCCATGCCCCAGCACCTTCTCACTGTCCTCATCCTGAGCGAGGTACAGGGTCCTCTCTGGCAGGGTGAGCCCATCCTGGTCAATCTGGGGAGGGAGACAGGGGCCACAGGTCAGAGGCCCACACCTCAGGTTCCCTAAACAGAGGGAATTCCCACTCCAATGCCCAGAGAGCAACCAGACATCCATGAGTACAGCCACAGAAGCACGCAGACCCCAGCTCCTCTTTCCACCCAGACGAGATGGCCAAAGCCCCATCCCTGACTGTCCCAGCCTGCGGATGCCCAATCTTACCCCTGTACGTCTGCACTTTCCTTATCTGTCCGGGGCATTCGTAGGTCCCCCACTGACAGTTGGGACCCCTAGCTTTGGGGCCAGCTCCAGACCTCGCGGAGACGTCAACCCAGCCCGCCGGCGCGCCTCTCCCTCCTGGCCCTCACTGCCTGCCAGAGGGCTGGGAAATTGCGGCTCCCGCGGCTCCTCTAAACACCGCAATTACCCCAGGGAAATTACTTGCGCCCTCCTCCCGCGCTCTGCCTCTGTGCGCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTGCTCGTCTCTTCCCTCCTCTCCTCTCACGCACCCGCCTCCCGCGCGCAGGGACCCCTGGGCAAGGCCACTGCGCCCCGGATCCGCGGCCGCTGGCAGGGCGCTCAGGGGGCGCACTCACGCGGATGACGTAGCGCGAGGAGTTCCTGTCGTCCAGGCTGACCGTGAGCGAGAAGAGCGCGGCGGCGCTGTACACGCCCTGCGCCTTGTACAGCAGCCGGTTGAGGTCCCATCGCGCCGCGACCCCCGGACGCTCCTCCGCGCCGCCCAGGTCCCAGCCCCCGCAGTCCTCGATGACCTCTAGCATGGGTCGCGGGCCCAGTCGCTCGATCTCGCGCATGTCGAGGCACGAGCGGAAGAAGGCGCGCACCTTGCGCTGGGCCGCGCCGCCAGGCCCACCCCCGGGCCGCGCCAGCAGGCGCCGTAGGCGCTCCTCGTTTTGCTCGCCGATGGCCGCGATGGTGCCATAGGTGAGCTTGTCGTCGGGGATGGCGTGGCGCCGCAGCCAACCGCCGCAGGCGAACGAGTAGAAGTCCTGGCATGGGTCGATGCTGGCGTCCAGGTTGGCGGCCAGGAAGCGAGCGGCGCGCGCGAAGGCCTTGCGCTCAGGGCAGCCCTCGGGACAGGCGCCGCCGCCGGCCGCGACCGGGCCCAGGTACTTGAGGGCCAGCATAGCCGCCAGAATGGCGCAGAGGCCGGCGGCGAACACCAGCCCCGACAGCAGGCACACCTCGCGCCGGTTCCAGCGCGGCAGCCCGGACCGGGCCCCGGTGGCGCTGCGCGCAGCGCCCAACGGGAAGCCCGGGGGCAGGGAGGCCCCGCGCGCGCCCCCCGCGCCGCAGCGGCTCACGTACTTGACCTCTTGGAACTCATCGTAGTGCGCCGTCAGCGAATACGGGGGCTCCATGGCGCCGAGGCCGCCGCGGTGCAGACCTGGGCCACCTGGGCTACGGGATGCGCGTGGCCGCCGGCCTCCTCGTGGGCCTCCGCATGGCCCTGGGGCCGCAGCTGCGGGAAGGGCGGAAGCAGGCTCAGGAGGCGCCGCAGCCGGATGGGGCTCAGGGTCACCGCGAGGAGGGACACAGGCCTGGGTGCAGAGGCCCCAGCCGCGGGCCTCATTCACTGCGGAAACCAGGGACTATGAGGGTTCGGCGGGGCCACCACCCCCGGGTGCACAGTGGAGTCTTCCCCCCTGTCCCCTCCCTGCACACACTTGAGGGCCGCAGGGTTGGGAGGGCTCTTATTGGAAGCAAGAGGCGCCAGGCAAGGGGCCTGGCACGTAGTGGGCCTTCATTGAAAGGTCGTCCCTCTTCCCCTTCGCCTTTCTCTTCCACGACCTGCCCCAGCCAAGGCCGGGTGGAGTGGGGGAAGAAGCGGAG
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Task1_train_5686
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting ECEL1 (endothelin converting enzyme like 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Distal arthrogryposis type 5D
AAGCGCCATGCCAAAGTGGCGATTGGCCTGGCCCAAGCAGACCCGGGCCAGCTCCTGTGGCTTGTCGCTGCCCTCCATCTCCTGTGCCAGCTCGTGCAGTGCCTCACGGAATGGCGGGGACAGGTGTTCACTCAGGACCACCACCACGCGCCACACCAGGTAGTTGTGCAGGACCCTGGGGACCAGGTGAAGCCAGTGGGTGTCCAGACGGACATGCATGTGGGCCACCAAGGGCACCACCCCTACCTGTGCCCGCCAACCTGTGGCTGGACCCAGGACCCAGACAGCCCCACAAAGAAGGGACAGGGGGTCATCCCAGCTATGCAGAGCAGAAAATGTAAAGCCCACCCAGCAGAGAGGTCCAGGGTGCAGGGGAAGGACCTAGTGACCGCTGGGCAGAAAATGCCAGATCTGCAGCCATACCGGTGGGGTGTGGAGCGGATGAGCTGCGACACCTGCTGCATGTAGTCTGTCGCCAGCAGCACCACCTCCTCTTCCTCTGAGAAGTCCTCCTGGAAGATCTGGTCTAGCAGCCACTTCCACCGCAACTGTGAGACCAAGGACAGGGACAGTGAGGCTAGGGTTGGCAGGGGCCACAGAAGACAGGGAGGGGGCAGAGAGAGGCAGCGAGGGGACATGAGAGTCCATGGCCAAGGAACGGTTTGCCCATCTCTGGGGAGAGATGACCCTGTAGTCCCAGCAGCAGCATTGCCCTCAACCCTGCCTGCCCACGAGGACTGGGCCACACTCACGTGGGGGGTGATCTTCTGCAGCTGCCCCAGCGTCACCTTGTTGTACATGGAGCTGACATCTCGCCGTAGGTCGTCATGCTCTGACACAGTGATCTGTGGGGAGAGATCACAGCTGACCCAGCCCTGCTCCATGATGCCCTCCCTCAAGCCCAGGGCAGCCTCCAGTCCTGGTCTGCTCACGTTGGCCAGCTGCTGCTCCACTTGCAGGATCTCTTGGGCCTTCTGTTCCACAGCGTCTGCACCCAGGAGGCTGAGCACTCGCTCCATGAACACCCTGTATGCTGCCAGGATCTGCACCAGGGGAGGGGGCTCACCCAGGGACAGGGACAGGCCTAGCCTGGATCCACCCCTCCTGGGGCCCCAGGCCTTCCCTGCCTCCCCATCCCATGCCCCAGCACCTTCTCACTGTCCTCATCCTGAGCGAGGTACAGGGTCCTCTCTGGCAGGGTGAGCCCATCCTGGTCAATCTGGGGAGGGAGACAGGGGCCACAGGTCAGAGGCCCACACCTCAGGTTCCCTAAACAGAGGGAATTCCCACTCCAATGCCCAGAGAGCAACCAGACATCCATGAGTACAGCCACAGAAGCACGCAGACCCCAGCTCCTCTTTCCACCCAGACGAGATGGCCAAAGCCCCATCCCTGACTGTCCCAGCCTGCGGATGCCCAATCTTACCCCTGTACGTCTGCACTTTCCTTATCTGTCCGGGGCATTCGTAGGTCCCCCACTGACAGTTGGGACCCCTAGCTTTGGGGCCAGCTCCAGACCTCGCGGAGACGTCAACCCAGCCCGCCGGCGCGCCTCTCCCTCCTGGCCCTCACTGCCTGCCAGAGGGCTGGGAAATTGCGGCTCCCGCGGCTCCTCTAAACACCGCAATTACCCCAGGGAAATTACTTGCGCCCTCCTCCCGCGCTCTGCCTCTGTGCGCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTGCTCGTCTCTTCCCTCCTCTCCTCTCACGCACCCGCCTCCCGCGCGCAGGGACCCCTGGGCAAGGCCACTGCGCCCCGGATCCGCGGCCGCTGGCAGGGCGCTCAGGGGGCGCACTCACGCGGATGACGTAGCGCGAGGAGTTCCTGTCGTCCAGGCTGACCGTGAGCGAGAAGAGCGCGGCGGCGCTGTACACGCCCTGCGCCTTGTACAGCAGCCGGTTGAGGTCCCATCGCGCCGCGACCCCCGGACGCTCCTCCGCGCCGCCCAGGTCCCAGCCCCCGCAGTCCTCGATGACCTCTAGCATGGGTCGCGGGCCCAGTCGCTCGATCTCGCGCATGTCGAGGCACGAGCGGAAGAAGGCGCGCACCTTGCGCTGGGCCGCGCCGCCAGGCCCACCCCCGGGCCGCGCCAGCAGGCGCCGTAGGCGCTCCTCGTTTTGCTCGCCGATGGCCGCGATGGTGCCATAGGTGAGCTTGTCGTCGGGGATGGCGTGGCGCCGCAGCCAACCGCCGCAGGCGAACGAGTAGAAGTCCTGGCATGGGTCGATGCTGGCGTCCAGGTTGGCGGCCAGGAAGCGAGCGGCGCGCGCGAAGGCCTTGCGCTCAGGGCAGCCCTCGGGACAGGCGCCGCCGCCGGCCGCGACCGGGCCCAGGTACTTGAGGGCCAGCATAGCCGCCAGAATGGCGCAGAGGCCGGCGGCGAACACCAGCCCCGACAGCAGGCACACCTCGCGCCGGTTCCAGCGCGGCAGCCCGGACCGGGCCCCGGTGGCGCTGCGCGCAGCGCCCAACGGGAAGCCCGGGGGCAGGGAGGCCCCGCGCGCGCCCCCCGCGCCGCAGCGGCTCACGTACTTGACCTCTTGGAACTCATCGTAGTGCGCCGTCAGCGAATACGGGGGCTCCATGGCGCCGAGGCCGCCGCGGTGCAGACCTGGGCCACCTGGGCTACGGGATGCGCGTGGCCGCCGGCCTCCTCGTGGGCCTCCGCATGGCCCTGGGGCCGCAGCTGCGGGAAGGGCGGAAGCAGGCTCAGGAGGCGCCGCAGCCGGATGGGGCTCAGGGTCACCGCGAGGAGGGACACAGGCCTGGGTGCAGAGGCCCCAGCCGCGGGCCTCATTCACTGCGGAAACCAGGGACTATGAGGGTTCGGCGGGGCCACCACCCCCGGGTGCACAGTGGAGTCTTCCCCCCTGTCCCCTCCCTGCACACACTTGAGGGCCGCAGGGTTGGGAGGGCTCTTATTGGAAGCAAGAGGCGCCAGGCAAGGGGCCTGGCACGTAGTGGGCCTTCATTGAAAGGTCGTCCCTCTTCCCCTTCGCCTTTCTCTTCCACGACCTGCCCCAGCCAAGGCCGGGTGGAGTGGGGGAAGAAGCGGAGGCTGGAGTGAGGAGGTGCGGTCAGGGGCGCGTCTATGCGACACTTTCAGCTCTCCGCGCTGGACCCAGACAGACGCTCCGCAAAGCGGCCAAAGAACCAAACTTTGTCCTCGCGGAAGTCCGCGGGATCGACCACGCCAACCCCGCTCCCTGGCTCCTTCTGCTCGGTGGCCCGACGGCCCACTCGCCCCTTCCCTAGGGGCGCGCGCCAACGCCCCAGGGTGGCGGACACACAACCCACCCACTGGACGGCCCTGATGGAGAACCCGAGACGGGTTCCCTCCCCCCACTCCCACCATCTCTGTCCCCGCCCCGAGCCACTCCTGGCTTCAACAGGTTCTCCCCAGAACCCAAACTTGGGCGAAGTTTCACCCCCGGCGGGGAGCGAGCTGGCTGGCGACCCCCGAGCCCCGGCGCCGTGCGGCGCAGTCCGCGGAGCCCGAGAGCCGAGCCCGGGAGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCCGGAGCCGCAGCCGAGAGGACGCAGACAAAGCCGGGAGGCTCCGCGCAGTGGCGGCGGCGGCGACGGAAGTGGCCGCGGTGGTGGCCTCAGCGGCAGGGACTCGGGCGCCACTTACCCGGCAGGTGCGCGCCCGAGCCGGCGGTGACCGAGCGGGTCGGGCCCGAGCGGGGGCCTGAGCCGCAGCGCAGCCGAGCGGGCGTCCGGTGTCTCCCAGCGCCCGCCGCCTCCTCTGCCGCCGCGCCGAGCCCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCGGCCCGAGGGAGGGGGCGCGCCGGCGGCTCCACCCTCCTCCGCCCGCCCCGCGCGCCCCTCCTTCCTCCTGCATCTCTCGGGCCACCTGGCAGTGGGGCGGCAGCGCGGACGTGGGTCGGCGGCCGCGGAGACAGGCTCCCGGGGGTCGTGCGCGGGCTGCGGTCGGGGACTCCGGGTCCAGCCGCGTTCCGAGACGAGTGAGGGCAGCGAGTACTCCCGTGAAGGGTCCCCTCCGATCCAGTGTCCCCACTCCCAGCCGCCCACCAGCCGGCT
AAGCGCCATGCCAAAGTGGCGATTGGCCTGGCCCAAGCAGACCCGGGCCAGCTCCTGTGGCTTGTCGCTGCCCTCCATCTCCTGTGCCAGCTCGTGCAGTGCCTCACGGAATGGCGGGGACAGGTGTTCACTCAGGACCACCACCACGCGCCACACCAGGTAGTTGTGCAGGACCCTGGGGACCAGGTGAAGCCAGTGGGTGTCCAGACGGACATGCATGTGGGCCACCAAGGGCACCACCCCTACCTGTGCCCGCCAACCTGTGGCTGGACCCAGGACCCAGACAGCCCCACAAAGAAGGGACAGGGGGTCATCCCAGCTATGCAGAGCAGAAAATGTAAAGCCCACCCAGCAGAGAGGTCCAGGGTGCAGGGGAAGGACCTAGTGACCGCTGGGCAGAAAATGCCAGATCTGCAGCCATACCGGTGGGGTGTGGAGCGGATGAGCTGCGACACCTGCTGCATGTAGTCTGTCGCCAGCAGCACCACCTCCTCTTCCTCTGAGAAGTCCTCCTGGAAGATCTGGTCTAGCAGCCACTTCCACCGCAACTGTGAGACCAAGGACAGGGACAGTGAGGCTAGGGTTGGCAGGGGCCACAGAAGACAGGGAGGGGGCAGAGAGAGGCAGCGAGGGGACATGAGAGTCCATGGCCAAGGAACGGTTTGCCCATCTCTGGGGAGAGATGACCCTGTAGTCCCAGCAGCAGCATTGCCCTCAACCCTGCCTGCCCACGAGGACTGGGCCACACTCACGTGGGGGGTGATCTTCTGCAGCTGCCCCAGCGTCACCTTGTTGTACATGGAGCTGACATCTCGCCGTAGGTCGTCATGCTCTGACACAGTGATCTGTGGGGAGAGATCACAGCTGACCCAGCCCTGCTCCATGATGCCCTCCCTCAAGCCCAGGGCAGCCTCCAGTCCTGGTCTGCTCACGTTGGCCAGCTGCTGCTCCACTTGCAGGATCTCTTGGGCCTTCTGTTCCACAGCGTCTGCACCCAGGAGGCTGAGCACTCGCTCCATGAACACCCTGTATGCTGCCAGGATCTGCACCAGGGGAGGGGGCTCACCCAGGGACAGGGACAGGCCTAGCCTGGATCCACCCCTCCTGGGGCCCCAGGCCTTCCCTGCCTCCCCATCCCATGCCCCAGCACCTTCTCACTGTCCTCATCCTGAGCGAGGTACAGGGTCCTCTCTGGCAGGGTGAGCCCATCCTGGTCAATCTGGGGAGGGAGACAGGGGCCACAGGTCAGAGGCCCACACCTCAGGTTCCCTAAACAGAGGGAATTCCCACTCCAATGCCCAGAGAGCAACCAGACATCCATGAGTACAGCCACAGAAGCACGCAGACCCCAGCTCCTCTTTCCACCCAGACGAGATGGCCAAAGCCCCATCCCTGACTGTCCCAGCCTGCGGATGCCCAATCTTACCCCTGTACGTCTGCACTTTCCTTATCTGTCCGGGGCATTCGTAGGTCCCCCACTGACAGTTGGGACCCCTAGCTTTGGGGCCAGCTCCAGACCTCGCGGAGACGTCAACCCAGCCCGCCGGCGCGCCTCTCCCTCCTGGCCCTCACTGCCTGCCAGAGGGCTGGGAAATTGCGGCTCCCGCGGCTCCTCTAAACACCGCAATTACCCCAGGGAAATTACTTGCGCCCTCCTCCCGCGCTCTGCCTCTGTGCGCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTGCTCGTCTCTTCCCTCCTCTCCTCTCACGCACCCGCCTCCCGCGCGCAGGGACCCCTGGGCAAGGCCACTGCGCCCCGGATCCGCGGCCGCTGGCAGGGCGCTCAGGGGGCGCACTCACGCGGATGACGTAGCGCGAGGAGTTCCTGTCGTCCAGGCTGACCGTGAGCGAGAAGAGCGCGGCGGCGCTGTACACGCCCTGCGCCTTGTACAGCAGCCGGTTGAGGTCCCATCGCGCCGCGACCCCCGGACGCTCCTCCGCGCCGCCCAGGTCCCAGCCCCCGCAGTCCTCGATGACCTCTAGCATGGGTCGCGGGCCCAGTCGCTCGATCTCGCGCATGTCGAGGCACCAGCGGAAGAAGGCGCGCACCTTGCGCTGGGCCGCGCCGCCAGGCCCACCCCCGGGCCGCGCCAGCAGGCGCCGTAGGCGCTCCTCGTTTTGCTCGCCGATGGCCGCGATGGTGCCATAGGTGAGCTTGTCGTCGGGGATGGCGTGGCGCCGCAGCCAACCGCCGCAGGCGAACGAGTAGAAGTCCTGGCATGGGTCGATGCTGGCGTCCAGGTTGGCGGCCAGGAAGCGAGCGGCGCGCGCGAAGGCCTTGCGCTCAGGGCAGCCCTCGGGACAGGCGCCGCCGCCGGCCGCGACCGGGCCCAGGTACTTGAGGGCCAGCATAGCCGCCAGAATGGCGCAGAGGCCGGCGGCGAACACCAGCCCCGACAGCAGGCACACCTCGCGCCGGTTCCAGCGCGGCAGCCCGGACCGGGCCCCGGTGGCGCTGCGCGCAGCGCCCAACGGGAAGCCCGGGGGCAGGGAGGCCCCGCGCGCGCCCCCCGCGCCGCAGCGGCTCACGTACTTGACCTCTTGGAACTCATCGTAGTGCGCCGTCAGCGAATACGGGGGCTCCATGGCGCCGAGGCCGCCGCGGTGCAGACCTGGGCCACCTGGGCTACGGGATGCGCGTGGCCGCCGGCCTCCTCGTGGGCCTCCGCATGGCCCTGGGGCCGCAGCTGCGGGAAGGGCGGAAGCAGGCTCAGGAGGCGCCGCAGCCGGATGGGGCTCAGGGTCACCGCGAGGAGGGACACAGGCCTGGGTGCAGAGGCCCCAGCCGCGGGCCTCATTCACTGCGGAAACCAGGGACTATGAGGGTTCGGCGGGGCCACCACCCCCGGGTGCACAGTGGAGTCTTCCCCCCTGTCCCCTCCCTGCACACACTTGAGGGCCGCAGGGTTGGGAGGGCTCTTATTGGAAGCAAGAGGCGCCAGGCAAGGGGCCTGGCACGTAGTGGGCCTTCATTGAAAGGTCGTCCCTCTTCCCCTTCGCCTTTCTCTTCCACGACCTGCCCCAGCCAAGGCCGGGTGGAGTGGGGGAAGAAGCGGAGGCTGGAGTGAGGAGGTGCGGTCAGGGGCGCGTCTATGCGACACTTTCAGCTCTCCGCGCTGGACCCAGACAGACGCTCCGCAAAGCGGCCAAAGAACCAAACTTTGTCCTCGCGGAAGTCCGCGGGATCGACCACGCCAACCCCGCTCCCTGGCTCCTTCTGCTCGGTGGCCCGACGGCCCACTCGCCCCTTCCCTAGGGGCGCGCGCCAACGCCCCAGGGTGGCGGACACACAACCCACCCACTGGACGGCCCTGATGGAGAACCCGAGACGGGTTCCCTCCCCCCACTCCCACCATCTCTGTCCCCGCCCCGAGCCACTCCTGGCTTCAACAGGTTCTCCCCAGAACCCAAACTTGGGCGAAGTTTCACCCCCGGCGGGGAGCGAGCTGGCTGGCGACCCCCGAGCCCCGGCGCCGTGCGGCGCAGTCCGCGGAGCCCGAGAGCCGAGCCCGGGAGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCCGGAGCCGCAGCCGAGAGGACGCAGACAAAGCCGGGAGGCTCCGCGCAGTGGCGGCGGCGGCGACGGAAGTGGCCGCGGTGGTGGCCTCAGCGGCAGGGACTCGGGCGCCACTTACCCGGCAGGTGCGCGCCCGAGCCGGCGGTGACCGAGCGGGTCGGGCCCGAGCGGGGGCCTGAGCCGCAGCGCAGCCGAGCGGGCGTCCGGTGTCTCCCAGCGCCCGCCGCCTCCTCTGCCGCCGCGCCGAGCCCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCGGCCCGAGGGAGGGGGCGCGCCGGCGGCTCCACCCTCCTCCGCCCGCCCCGCGCGCCCCTCCTTCCTCCTGCATCTCTCGGGCCACCTGGCAGTGGGGCGGCAGCGCGGACGTGGGTCGGCGGCCGCGGAGACAGGCTCCCGGGGGTCGTGCGCGGGCTGCGGTCGGGGACTCCGGGTCCAGCCGCGTTCCGAGACGAGTGAGGGCAGCGAGTACTCCCGTGAAGGGTCCCCTCCGATCCAGTGTCCCCACTCCCAGCCGCCCACCAGCCGGCT
Task1_train_5687
A variant was discovered on Chromosome 2, affecting PRSS56 (serine protease 56). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Isolated microphthalmia 6
GGACTCCGAGGAGGAGAGAGGACAGGGGTCTCTCACCCCAGCTCCTGGTCACCATGCTGCTGGCTGTGCTGCTGCTGCTACCCCTCCCAAGCTCATGGTTTGCCCACGGGCACCCACTGTACACACGCCTGCCCCCCAGCGCCCTGCAAGGTAAGTCCAGGCTGGCCCGAGAGCCGCGGGGTTGGGAGGAATGTAGAGGAAGTGGGACCCTGGGCGGGCGGGGACAGAAGAGCTTGTCACCCCCACTCATAAGGACCTTTGGCTCCTTCTGCCCACCCTGCTGCGAGAAGGGGCCAAGAACTGAGATATAGGTGGGAGAGGAGGGGTGTGGCGGGAAAGGGAAGGGGAGCTGTTGAGCATGCCGAAAGGAATGGAGAGAAGGCCCCAAGAAGCAGAGAGAAACGGCCCGGGGCAGCACCCTGCCCTTGGCTGTCCCGGCCGAAGGTGGGCCACTCAAACACAGCTACTTTCAGTCAATAAAGCTGAGTTCTGCGATGTCTGTATCTTTGGGGTGGTGTCTTTAAAAAAAATTGTTAAGGAAAAGCACCTTTCAAAGATCCCAGTCCAGCTCAGTTGAATTAGGGAGACATCTTGGGCTGAGAACCTGGGAGCACGGGCTCTGAGTGCTGGGCCCAGCGTCCCCGGGGCTCACTTGCCTCCTCATTCTGTCCCAGGCTGGTGGGTCTCCCGAGGCAGGGCTCAGGGCTGGGGCCAGGAGGATGAGGCTGAGGCTCTTCCCCAACCACGCATGATTGTGTGCCCCCTGTCCCAGCAGTTCTGTCGGCCCAGGGGACTCAGGCGTTGCAGGCAGCCCAGAGGAGCGCCCAGTGGGCAATAAACCGAGTGGCGATGGAGATCCAGCACAGATCGCACGAGTGCCGAGGTGCCCACCCTGCCCCCCGTGCCCCAGTGAGCTTGCTGCCTACCCTGGGCCCATTCTGCTGCCTCTGTCCCTTCCCTTCAGTCTTCACTCTCCTCTTGGGGGCAGAGACTGTGTTGGGCCGCAACCTAGACTACGTTTGTGAAGGTCTGTCTCTCCGAGTGGAAAGGACACGCTAGGCTTGGGGCATGGCCTGTGCAAAGGCAGGGAGGCGGAAACACTCTGGGCTCCTGTGGTGACCAGGAGAAGTTCATGGTTGCTGAAATAGAACCCGTGTGGGCTGGAGGGCTGAGCGCGAAAGGAGAGATGGGGAGAGAGAGGCTCGGCCCAGCCTGGGGTGAGGACAGGCGAGAGGGCAGCAGTGAGACTCAAAGGTCTGTTTCTCTGCAGGATCTGGGCGCCCCAGGCCTCAAGCTCTCCTCCAGGACCCACCTGAGCCAGGTGAGGTTGAAAAGGCTCGAGGGGGCAGGCCTGAGAGCCGGGTGGGCCTCGAAGGCGAGGATGGCCAGAACATGTCCCTCGTGACACCCCTTGCCCCTTTCTAGGGCCGTGCGGCGAGAGGCGTCCGAGCACTGCCAATGTGACGCGGGCCCACGGCCGCATCGTGGGGGGCAGCGCGGCGCCGCCCGGGGCCTGGCCCTGGCTGGTGAGGCTGCAGCTCGGCGGGCAGCCTCTGTGCGGCGGCGTCCTGGTAGCGGCCTCCTGGGTGCTCACGGCAGCGCACTGCTTTGTAGGGTAAGTAGGACCCCCAGGCCTTGCCCAGCTGGGGTCCCCGGCGCTGGGCCCCGCACCTGCCGGGTTGTCCGGCGGGCGACGCGCGGGAAAGGTGGTCTCTGCTGCCCCCTGGCGGCGGCCGGCCCCGGGCTTCCCCATCTCAAGGCGCCGCGCCCGCCCCGCCAGGATGCCAGCCCGGAGGGGGTGGCACGGCCGGGCGAGTTCGCCCCCTCTGGGACGGGACCCCTCCCCGGCCCGCCCTCCGTGCCCCCAGGTGGAGAAAGCCCGGCATGCGGGCGGAGGGGCAGGGTCTCCGAGGGGCCTGCGGGGTGTGCCCCTGTCCTTCCTGCGTCTCAGCTGCCGCTCGACCCGCAGCGCCCCGAATGAGCTTCTGTGGACTGTGACGCTGGCAGAGGGGTCCCGGGGGGAGCAAGCGGAGGAGGTGCCAGTGAACCGCATCCTGCCCCACCCCAAGGTGAGAAGGCAGTCCCCAGGCCCCCAAGGCTGGGCACCGCACCCCCACCCGTGCTTCCTTGACCCTGCGCCGCCTCCCCCTCCTCAGTTTGACCCGCGGACCTTCCACAACGACCTGGCCCTGGTGCAGCTGTGGACGCCGGTGAGCCCGGGGGGATCGGCGCGCCCCGTGTGCCTGCCCCAGGAGCCCCAGGAGCCCCCTGCCGGAACCGCCTGCGCCATCGCGGGCTGGGGCGCCCTCTTCGAAGGTACTGGGCGTGGGTGAGCCGGCGCGTGGTGGGAAGAACTGGGGGTCCGAGGTAATAGAGTGTAGGGAGGCCGGGTTGCCTTGGAAAAATGCTGCCTGCTCTTTCAAAGGGGGAGGAATCAAGGGGGGTGGTGGGAAGGGGACCCTCAAGGCGGGGCTCTTGCCCTCCAAACCTGAGCCTTCCACCCCTTCCCTGCAGACGGGCCTGAGGCTGAAGCAGTGAGAGAGGCCCGTGTTCCCCTGCTCAGCACCGACACCTGCCGAAGAGCCCTGGGGCCCGGGCTGCGCCCCAGCACCATGCTCTGCGCCGGGTACCTGGCGGGGGGCGTTGACTCGTGCCAGGTATGAACCCAGTCTGATGAGAAAAGGCCGGCTGAGCCTTCCCAGGGCCACTACGGCCTCTTTTCCTTCCACGTCTGTCTGTCACTCGACTTCTCTGAGCCTCTCTGTCCTCATCCCTAAAATGGACACAAGTGGCAAGCTCACACCTGCCAGGCGTAAGGCAGGCGTCATAGGGGGCAGGTGAATGCAGCGTCCTCTCTCTTGGCCCCGCAGGGTGACTCGGGAGGCCCCCTGACCTGTTCTGAGCCTGGCCCCCGCCCTAGAGAGGTCCTGTTCGGAGTCACCTCCTGGGGGGACGGCTGCGGGGAGCCAGGGAAGCCCGGGGTCTACACCCGCGTGGCAGTGTTCAAGGACTGGCTCCAGGAGCAGATGAGCGGTGAGCGCCCTCTTTCCAATGCCCCGTCCCCAGTGCCCCAACGGACAACCGTGGGACAAGCCCGTTTCCACCCGGCCCATGCCCATTCCCAGCTCCCTTCTGCCTCGGGAAAGCCTGTCTCCTTCCGGGGAAGGAGTGAGGGGGCTAGGGCCCCAAACAGAGGGTGAGCTGACCCCTGTCCCGCCCGCAGCAGCCTCCTCCAGCCGCGAGCCCAGCTGCAGGGAGCTTCTGGCCTGGGACCCCCCCCAGGAGCTGCAGGCAGACGCCGCCCGGCTCTGCGCCTTCTATGCCCGCCTGTGCCCGGGGTCCCAGGGCGCCTGTGCGCGCCTGGCGCACCAGCAGTGCCTGCAGCGCCGGCGGCGATGCGGTCAGTTCTGTTCACCCGGACCCGGACGGGGGGCAGAGGGGAGGGGGCCTGGCCAGCCTCTGACCGCCGCTCCGACTCCTGTCCGGTCCGCAGAGCTGCGCTCGCTGGCGCACACGCTGCTGGGCCTGCTGCGGAACGCGCAGGAGCTGCTCGGGCCTCGTCCGGGACTGCGGCGCCTGGCCCCCGCCCTGGCTCTCCCCGCTCCAGCGCTCAGGGAGTCTCCTCTGCACCCCGCCCGGGAGCTGCGGCTTCACTCAGGTACCCCGCGCCCTCCAGCCCAGCCCAGCCCTGGCCCGGCCCCACCCGCGCGGCACAGCCACTTTCTCCGCCGAGGCGGTACCCTAACCCTGTGCCTCCCCAGGATCGCGGGCTGCAGGCACTCGGTTCCCGAAGCGGAGGCCGGAGCCGCGCGGAGAAGCCAACGGTAATGACGCCCCCTGCCGACCTTCAGGAGGGGATAGGCTGAGGGCCTGGACGAGGTCGGAAGCGCTTCTACTGCAGCTCCGGAAAGGGCTTACCCCATGGGGCAACAGGGTGGACTCGTTCTCCCCTCCCCGCCATAGAGCGTATGACTCTTTTGGAGTACTTGTGGTTTTAGCTCTCATCAGTGTCAAACAGAGATGCTTTGCCTGGTGTTACTGCTTAACTTCTCCGAGCCTCAGTTTCCCCACCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGT
GGACTCCGAGGAGGAGAGAGGACAGGGGTCTCTCACCCCAGCTCCTGGTCACCATGCTGCTGGCTGTGCTGCTGCTGCTACCCCTCCCAAGCTCATGGTTTGCCCACGGGCACCCACTGTACACACGCCTGCCCCCCAGCGCCCTGCAAGGTAAGTCCAGGCTGGCCCGAGAGCCGCGGGGTTGGGAGGAATGTAGAGGAAGTGGGACCCTGGGCGGGCGGGGACAGAAGAGCTTGTCACCCCCACTCATAAGGACCTTTGGCTCCTTCTGCCCACCCTGCTGCGAGAAGGGGCCAAGAACTGAGATATAGGTGGGAGAGGAGGGGTGTGGCGGGAAAGGGAAGGGGAGCTGTTGAGCATGCCGAAAGGAATGGAGAGAAGGCCCCAAGAAGCAGAGAGAAACGGCCCGGGGCAGCACCCTGCCCTTGGCTGTCCCGGCCGAAGGTGGGCCACTCAAACACAGCTACTTTCAGTCAATAAAGCTGAGTTCTGCGATGTCTGTATCTTTGGGGTGGTGTCTTTAAAAAAAATTGTTAAGGAAAAGCACCTTTCAAAGATCCCAGTCCAGCTCAGTTGAATTAGGGAGACATCTTGGGCTGAGAACCTGGGAGCACGGGCTCTGAGTGCTGGGCCCAGCGTCCCCGGGGCTCACTTGCCTCCTCATTCTGTCCCAGGCTGGTGGGTCTCCCGAGGCAGGGCTCAGGGCTGGGGCCAGGAGGATGAGGCTGAGGCTCTTCCCCAACCACGCATGATTGTGTGCCCCCTGTCCCAGCAGTTCTGTCGGCCCAGGGGACTCAGGCGTTGCAGGCAGCCCAGAGGAGCGCCCAGTGGGCAATAAACCGAGTGGCGATGGAGATCCAGCACAGATCGCACGAGTGCCGAGGTGCCCACCCTGCCCCCCGTGCCCCAGTGAGCTTGCTGCCTACCCTGGGCCCATTCTGCTGCCTCTGTCCCTTCCCTTCAGTCTTCACTCTCCTCTTGGGGGCAGAGACTGTGTTGGGCCGCAACCTAGACTACGTTTGTGAAGGTCTGTCTCTCCGAGTGGAAAGGACACGCTAGGCTTGGGGCATGGCCTGTGCAAAGGCAGGGAGGCGGAAACACTCTGGGCTCCTGTGGTGACCAGGAGAAGTTCATGGTTGCTGAAATAGAACCCGTGTGGGCTGGAGGGCTGAGCGCGAAAGGAGAGATGGGGAGAGAGAGGCTCGGCCCAGCCTGGGGTGAGGACAGGCGAGAGGGCAGCAGTGAGACTCAAAGGTCTGTTTCTCTGCAGGATCTGGGCGCCCCAGGCCTCAAGCTCTCCTCCAGGACCCACCTGAGCCAGGTGAGGTTGAAAAGGCTCGAGGGGGCAGGCCTGAGAGCCGGGTGGGCCTCGAAGGCGAGGATGGCCAGAACATGTCCCTCGTGACACCCCTTGCCCCTTTCTAGGGCCGTGCGGCGAGAGGCGTCCGAGCACTGCCAATGTGACGCGGGCCCACGGCCGCATCGTGGGGGGCAGCGCGGCGCCGCCCGGGGCCTGGCCCTGGCTGGTGAGGCTGCAGCTCGGCGGGCAGCCTCTGTGCGGCGGCGTCCTGGTAGCGGCCTCCTGGGTGCTCACGGCAGCGCACTGCTTTGTAGGGTAAGTAGGACCCCCAGGCCTTGCCCAGCTGGGGTCCCCGGCGCTGGGCCCCGCACCTGCCGGGTTGTCCGGCGGGCGACGCGCGGGAAAGGTGGTCTCTGCTGCCCCCTGGCGGCGGCCGGCCCCGGGCTTCCCCATCTCAAGGCGCCGCGCCCGCCCCGCCAGGATGCCAGCCCGGAGGGGGTGGCACGGCCGGGCGAGTTCGCCCCCTCTGGGACGGGACCCCTCCCCGGCCCGCCCTCCGTGCCCCCAGGTGGAGAAAGCCCGGCATGCGGGCGGAGGGGCAGGGTCTCCGAGGGGCCTGCGGGGTGTGCCCCTGTCCTTCCTGCGTCTCAGCTGCCGCTCGACCCGCAGCGCCCCGAATGAGCTTCTGTGGACTGTGACGCTGGCAGAGGGGTCCCGGGGGGAGCAAGCGGAGGAGGTGCCAGTGAACGGCATCCTGCCCCACCCCAAGGTGAGAAGGCAGTCCCCAGGCCCCCAAGGCTGGGCACCGCACCCCCACCCGTGCTTCCTTGACCCTGCGCCGCCTCCCCCTCCTCAGTTTGACCCGCGGACCTTCCACAACGACCTGGCCCTGGTGCAGCTGTGGACGCCGGTGAGCCCGGGGGGATCGGCGCGCCCCGTGTGCCTGCCCCAGGAGCCCCAGGAGCCCCCTGCCGGAACCGCCTGCGCCATCGCGGGCTGGGGCGCCCTCTTCGAAGGTACTGGGCGTGGGTGAGCCGGCGCGTGGTGGGAAGAACTGGGGGTCCGAGGTAATAGAGTGTAGGGAGGCCGGGTTGCCTTGGAAAAATGCTGCCTGCTCTTTCAAAGGGGGAGGAATCAAGGGGGGTGGTGGGAAGGGGACCCTCAAGGCGGGGCTCTTGCCCTCCAAACCTGAGCCTTCCACCCCTTCCCTGCAGACGGGCCTGAGGCTGAAGCAGTGAGAGAGGCCCGTGTTCCCCTGCTCAGCACCGACACCTGCCGAAGAGCCCTGGGGCCCGGGCTGCGCCCCAGCACCATGCTCTGCGCCGGGTACCTGGCGGGGGGCGTTGACTCGTGCCAGGTATGAACCCAGTCTGATGAGAAAAGGCCGGCTGAGCCTTCCCAGGGCCACTACGGCCTCTTTTCCTTCCACGTCTGTCTGTCACTCGACTTCTCTGAGCCTCTCTGTCCTCATCCCTAAAATGGACACAAGTGGCAAGCTCACACCTGCCAGGCGTAAGGCAGGCGTCATAGGGGGCAGGTGAATGCAGCGTCCTCTCTCTTGGCCCCGCAGGGTGACTCGGGAGGCCCCCTGACCTGTTCTGAGCCTGGCCCCCGCCCTAGAGAGGTCCTGTTCGGAGTCACCTCCTGGGGGGACGGCTGCGGGGAGCCAGGGAAGCCCGGGGTCTACACCCGCGTGGCAGTGTTCAAGGACTGGCTCCAGGAGCAGATGAGCGGTGAGCGCCCTCTTTCCAATGCCCCGTCCCCAGTGCCCCAACGGACAACCGTGGGACAAGCCCGTTTCCACCCGGCCCATGCCCATTCCCAGCTCCCTTCTGCCTCGGGAAAGCCTGTCTCCTTCCGGGGAAGGAGTGAGGGGGCTAGGGCCCCAAACAGAGGGTGAGCTGACCCCTGTCCCGCCCGCAGCAGCCTCCTCCAGCCGCGAGCCCAGCTGCAGGGAGCTTCTGGCCTGGGACCCCCCCCAGGAGCTGCAGGCAGACGCCGCCCGGCTCTGCGCCTTCTATGCCCGCCTGTGCCCGGGGTCCCAGGGCGCCTGTGCGCGCCTGGCGCACCAGCAGTGCCTGCAGCGCCGGCGGCGATGCGGTCAGTTCTGTTCACCCGGACCCGGACGGGGGGCAGAGGGGAGGGGGCCTGGCCAGCCTCTGACCGCCGCTCCGACTCCTGTCCGGTCCGCAGAGCTGCGCTCGCTGGCGCACACGCTGCTGGGCCTGCTGCGGAACGCGCAGGAGCTGCTCGGGCCTCGTCCGGGACTGCGGCGCCTGGCCCCCGCCCTGGCTCTCCCCGCTCCAGCGCTCAGGGAGTCTCCTCTGCACCCCGCCCGGGAGCTGCGGCTTCACTCAGGTACCCCGCGCCCTCCAGCCCAGCCCAGCCCTGGCCCGGCCCCACCCGCGCGGCACAGCCACTTTCTCCGCCGAGGCGGTACCCTAACCCTGTGCCTCCCCAGGATCGCGGGCTGCAGGCACTCGGTTCCCGAAGCGGAGGCCGGAGCCGCGCGGAGAAGCCAACGGTAATGACGCCCCCTGCCGACCTTCAGGAGGGGATAGGCTGAGGGCCTGGACGAGGTCGGAAGCGCTTCTACTGCAGCTCCGGAAAGGGCTTACCCCATGGGGCAACAGGGTGGACTCGTTCTCCCCTCCCCGCCATAGAGCGTATGACTCTTTTGGAGTACTTGTGGTTTTAGCTCTCATCAGTGTCAAACAGAGATGCTTTGCCTGGTGTTACTGCTTAACTTCTCCGAGCCTCAGTTTCCCCACCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGT
Task1_train_5688
A variant has been detected on Chromosome 2 in PRSS56 (serine protease 56). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Isolated microphthalmia 6
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Task1_train_5689
A variant on Chromosome 2 in gene PRSS56 (serine protease 56) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Isolated microphthalmia 6
CCCGTGCCCCAGTGAGCTTGCTGCCTACCCTGGGCCCATTCTGCTGCCTCTGTCCCTTCCCTTCAGTCTTCACTCTCCTCTTGGGGGCAGAGACTGTGTTGGGCCGCAACCTAGACTACGTTTGTGAAGGTCTGTCTCTCCGAGTGGAAAGGACACGCTAGGCTTGGGGCATGGCCTGTGCAAAGGCAGGGAGGCGGAAACACTCTGGGCTCCTGTGGTGACCAGGAGAAGTTCATGGTTGCTGAAATAGAACCCGTGTGGGCTGGAGGGCTGAGCGCGAAAGGAGAGATGGGGAGAGAGAGGCTCGGCCCAGCCTGGGGTGAGGACAGGCGAGAGGGCAGCAGTGAGACTCAAAGGTCTGTTTCTCTGCAGGATCTGGGCGCCCCAGGCCTCAAGCTCTCCTCCAGGACCCACCTGAGCCAGGTGAGGTTGAAAAGGCTCGAGGGGGCAGGCCTGAGAGCCGGGTGGGCCTCGAAGGCGAGGATGGCCAGAACATGTCCCTCGTGACACCCCTTGCCCCTTTCTAGGGCCGTGCGGCGAGAGGCGTCCGAGCACTGCCAATGTGACGCGGGCCCACGGCCGCATCGTGGGGGGCAGCGCGGCGCCGCCCGGGGCCTGGCCCTGGCTGGTGAGGCTGCAGCTCGGCGGGCAGCCTCTGTGCGGCGGCGTCCTGGTAGCGGCCTCCTGGGTGCTCACGGCAGCGCACTGCTTTGTAGGGTAAGTAGGACCCCCAGGCCTTGCCCAGCTGGGGTCCCCGGCGCTGGGCCCCGCACCTGCCGGGTTGTCCGGCGGGCGACGCGCGGGAAAGGTGGTCTCTGCTGCCCCCTGGCGGCGGCCGGCCCCGGGCTTCCCCATCTCAAGGCGCCGCGCCCGCCCCGCCAGGATGCCAGCCCGGAGGGGGTGGCACGGCCGGGCGAGTTCGCCCCCTCTGGGACGGGACCCCTCCCCGGCCCGCCCTCCGTGCCCCCAGGTGGAGAAAGCCCGGCATGCGGGCGGAGGGGCAGGGTCTCCGAGGGGCCTGCGGGGTGTGCCCCTGTCCTTCCTGCGTCTCAGCTGCCGCTCGACCCGCAGCGCCCCGAATGAGCTTCTGTGGACTGTGACGCTGGCAGAGGGGTCCCGGGGGGAGCAAGCGGAGGAGGTGCCAGTGAACCGCATCCTGCCCCACCCCAAGGTGAGAAGGCAGTCCCCAGGCCCCCAAGGCTGGGCACCGCACCCCCACCCGTGCTTCCTTGACCCTGCGCCGCCTCCCCCTCCTCAGTTTGACCCGCGGACCTTCCACAACGACCTGGCCCTGGTGCAGCTGTGGACGCCGGTGAGCCCGGGGGGATCGGCGCGCCCCGTGTGCCTGCCCCAGGAGCCCCAGGAGCCCCCTGCCGGAACCGCCTGCGCCATCGCGGGCTGGGGCGCCCTCTTCGAAGGTACTGGGCGTGGGTGAGCCGGCGCGTGGTGGGAAGAACTGGGGGTCCGAGGTAATAGAGTGTAGGGAGGCCGGGTTGCCTTGGAAAAATGCTGCCTGCTCTTTCAAAGGGGGAGGAATCAAGGGGGGTGGTGGGAAGGGGACCCTCAAGGCGGGGCTCTTGCCCTCCAAACCTGAGCCTTCCACCCCTTCCCTGCAGACGGGCCTGAGGCTGAAGCAGTGAGAGAGGCCCGTGTTCCCCTGCTCAGCACCGACACCTGCCGAAGAGCCCTGGGGCCCGGGCTGCGCCCCAGCACCATGCTCTGCGCCGGGTACCTGGCGGGGGGCGTTGACTCGTGCCAGGTATGAACCCAGTCTGATGAGAAAAGGCCGGCTGAGCCTTCCCAGGGCCACTACGGCCTCTTTTCCTTCCACGTCTGTCTGTCACTCGACTTCTCTGAGCCTCTCTGTCCTCATCCCTAAAATGGACACAAGTGGCAAGCTCACACCTGCCAGGCGTAAGGCAGGCGTCATAGGGGGCAGGTGAATGCAGCGTCCTCTCTCTTGGCCCCGCAGGGTGACTCGGGAGGCCCCCTGACCTGTTCTGAGCCTGGCCCCCGCCCTAGAGAGGTCCTGTTCGGAGTCACCTCCTGGGGGGACGGCTGCGGGGAGCCAGGGAAGCCCGGGGTCTACACCCGCGTGGCAGTGTTCAAGGACTGGCTCCAGGAGCAGATGAGCGGTGAGCGCCCTCTTTCCAATGCCCCGTCCCCAGTGCCCCAACGGACAACCGTGGGACAAGCCCGTTTCCACCCGGCCCATGCCCATTCCCAGCTCCCTTCTGCCTCGGGAAAGCCTGTCTCCTTCCGGGGAAGGAGTGAGGGGGCTAGGGCCCCAAACAGAGGGTGAGCTGACCCCTGTCCCGCCCGCAGCAGCCTCCTCCAGCCGCGAGCCCAGCTGCAGGGAGCTTCTGGCCTGGGACCCCCCCCAGGAGCTGCAGGCAGACGCCGCCCGGCTCTGCGCCTTCTATGCCCGCCTGTGCCCGGGGTCCCAGGGCGCCTGTGCGCGCCTGGCGCACCAGCAGTGCCTGCAGCGCCGGCGGCGATGCGGTCAGTTCTGTTCACCCGGACCCGGACGGGGGGCAGAGGGGAGGGGGCCTGGCCAGCCTCTGACCGCCGCTCCGACTCCTGTCCGGTCCGCAGAGCTGCGCTCGCTGGCGCACACGCTGCTGGGCCTGCTGCGGAACGCGCAGGAGCTGCTCGGGCCTCGTCCGGGACTGCGGCGCCTGGCCCCCGCCCTGGCTCTCCCCGCTCCAGCGCTCAGGGAGTCTCCTCTGCACCCCGCCCGGGAGCTGCGGCTTCACTCAGGTACCCCGCGCCCTCCAGCCCAGCCCAGCCCTGGCCCGGCCCCACCCGCGCGGCACAGCCACTTTCTCCGCCGAGGCGGTACCCTAACCCTGTGCCTCCCCAGGATCGCGGGCTGCAGGCACTCGGTTCCCGAAGCGGAGGCCGGAGCCGCGCGGAGAAGCCAACGGTAATGACGCCCCCTGCCGACCTTCAGGAGGGGATAGGCTGAGGGCCTGGACGAGGTCGGAAGCGCTTCTACTGCAGCTCCGGAAAGGGCTTACCCCATGGGGCAACAGGGTGGACTCGTTCTCCCCTCCCCGCCATAGAGCGTATGACTCTTTTGGAGTACTTGTGGTTTTAGCTCTCATCAGTGTCAAACAGAGATGCTTTGCCTGGTGTTACTGCTTAACTTCTCCGAGCCTCAGTTTCCCCACCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGTCCCCTGGGAGGCCATCCTGAGGTGCTGGTGGGAGTGCCACCCCCAGTTCCATACCGCAACCGTTCATTATTCCCGGGGCCTCTCCTCTTCCTCCAGGCTGCCCTGGGCTGGAGCCCCTGCGACAGAAGTTGGCTGCCCTGCAGGGGGCCCATGCCTGGATCCTGCAGGTCCCCTCGGAGCACCTGGCCATGAACTTTCATGAGGTAGGTCCCCAGGCTTCCAGACTCCTTCACGATGGCCTGGGAAGGCTGAGACCCAGCCCAGGGAAGATGCAGAGGGCCCAGCCCAGATACCCTCCCAGCAGCCTGGGGTCGCCTCTGCCCCAGCTCTGGGGGTAGGTAGAGGGTCCGAGGGGAAGGGAGTGGGGCCTGCGGAGTGTGAGCCAGGCCACTGGGGGTGGTGGTGGGGAGAGTGAGTAGAGGGGTGGGTGGGAGTGTCCACATGAGCGGGAAATGAGCAGGGTTTCCAGGTCTAGGTGAGAGTTTCTGGGGCCCAGGGGGAGAGGGGGTGACCTCTGGGGTTTCAACTCAGGAGTGAGTTTCTGGGCCCCTGATCCCCACTCCTCCATCTGTAGGTCCTGGCAGATCTGGGCTCCAAGACACTGACCGGGCTTTTCAGAGCCTGGGTGCGGGCAGGCTTGGGGGGCCGGCATGTGGCCTTCAGCGGCCTGGTGGGCCTGGAGCCGGCCACACTGGCTCGCAGCCTCCCCCGGCTGCTGGTGCAGGCCCTGCAGGCCTTCCGCGTGGCTGCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGAC
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Task1_train_5690
Chromosome 2 houses a mutation in gene PRSS56 (serine protease 56). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Isolated microphthalmia 6
GGCCTGAGAGCCGGGTGGGCCTCGAAGGCGAGGATGGCCAGAACATGTCCCTCGTGACACCCCTTGCCCCTTTCTAGGGCCGTGCGGCGAGAGGCGTCCGAGCACTGCCAATGTGACGCGGGCCCACGGCCGCATCGTGGGGGGCAGCGCGGCGCCGCCCGGGGCCTGGCCCTGGCTGGTGAGGCTGCAGCTCGGCGGGCAGCCTCTGTGCGGCGGCGTCCTGGTAGCGGCCTCCTGGGTGCTCACGGCAGCGCACTGCTTTGTAGGGTAAGTAGGACCCCCAGGCCTTGCCCAGCTGGGGTCCCCGGCGCTGGGCCCCGCACCTGCCGGGTTGTCCGGCGGGCGACGCGCGGGAAAGGTGGTCTCTGCTGCCCCCTGGCGGCGGCCGGCCCCGGGCTTCCCCATCTCAAGGCGCCGCGCCCGCCCCGCCAGGATGCCAGCCCGGAGGGGGTGGCACGGCCGGGCGAGTTCGCCCCCTCTGGGACGGGACCCCTCCCCGGCCCGCCCTCCGTGCCCCCAGGTGGAGAAAGCCCGGCATGCGGGCGGAGGGGCAGGGTCTCCGAGGGGCCTGCGGGGTGTGCCCCTGTCCTTCCTGCGTCTCAGCTGCCGCTCGACCCGCAGCGCCCCGAATGAGCTTCTGTGGACTGTGACGCTGGCAGAGGGGTCCCGGGGGGAGCAAGCGGAGGAGGTGCCAGTGAACCGCATCCTGCCCCACCCCAAGGTGAGAAGGCAGTCCCCAGGCCCCCAAGGCTGGGCACCGCACCCCCACCCGTGCTTCCTTGACCCTGCGCCGCCTCCCCCTCCTCAGTTTGACCCGCGGACCTTCCACAACGACCTGGCCCTGGTGCAGCTGTGGACGCCGGTGAGCCCGGGGGGATCGGCGCGCCCCGTGTGCCTGCCCCAGGAGCCCCAGGAGCCCCCTGCCGGAACCGCCTGCGCCATCGCGGGCTGGGGCGCCCTCTTCGAAGGTACTGGGCGTGGGTGAGCCGGCGCGTGGTGGGAAGAACTGGGGGTCCGAGGTAATAGAGTGTAGGGAGGCCGGGTTGCCTTGGAAAAATGCTGCCTGCTCTTTCAAAGGGGGAGGAATCAAGGGGGGTGGTGGGAAGGGGACCCTCAAGGCGGGGCTCTTGCCCTCCAAACCTGAGCCTTCCACCCCTTCCCTGCAGACGGGCCTGAGGCTGAAGCAGTGAGAGAGGCCCGTGTTCCCCTGCTCAGCACCGACACCTGCCGAAGAGCCCTGGGGCCCGGGCTGCGCCCCAGCACCATGCTCTGCGCCGGGTACCTGGCGGGGGGCGTTGACTCGTGCCAGGTATGAACCCAGTCTGATGAGAAAAGGCCGGCTGAGCCTTCCCAGGGCCACTACGGCCTCTTTTCCTTCCACGTCTGTCTGTCACTCGACTTCTCTGAGCCTCTCTGTCCTCATCCCTAAAATGGACACAAGTGGCAAGCTCACACCTGCCAGGCGTAAGGCAGGCGTCATAGGGGGCAGGTGAATGCAGCGTCCTCTCTCTTGGCCCCGCAGGGTGACTCGGGAGGCCCCCTGACCTGTTCTGAGCCTGGCCCCCGCCCTAGAGAGGTCCTGTTCGGAGTCACCTCCTGGGGGGACGGCTGCGGGGAGCCAGGGAAGCCCGGGGTCTACACCCGCGTGGCAGTGTTCAAGGACTGGCTCCAGGAGCAGATGAGCGGTGAGCGCCCTCTTTCCAATGCCCCGTCCCCAGTGCCCCAACGGACAACCGTGGGACAAGCCCGTTTCCACCCGGCCCATGCCCATTCCCAGCTCCCTTCTGCCTCGGGAAAGCCTGTCTCCTTCCGGGGAAGGAGTGAGGGGGCTAGGGCCCCAAACAGAGGGTGAGCTGACCCCTGTCCCGCCCGCAGCAGCCTCCTCCAGCCGCGAGCCCAGCTGCAGGGAGCTTCTGGCCTGGGACCCCCCCCAGGAGCTGCAGGCAGACGCCGCCCGGCTCTGCGCCTTCTATGCCCGCCTGTGCCCGGGGTCCCAGGGCGCCTGTGCGCGCCTGGCGCACCAGCAGTGCCTGCAGCGCCGGCGGCGATGCGGTCAGTTCTGTTCACCCGGACCCGGACGGGGGGCAGAGGGGAGGGGGCCTGGCCAGCCTCTGACCGCCGCTCCGACTCCTGTCCGGTCCGCAGAGCTGCGCTCGCTGGCGCACACGCTGCTGGGCCTGCTGCGGAACGCGCAGGAGCTGCTCGGGCCTCGTCCGGGACTGCGGCGCCTGGCCCCCGCCCTGGCTCTCCCCGCTCCAGCGCTCAGGGAGTCTCCTCTGCACCCCGCCCGGGAGCTGCGGCTTCACTCAGGTACCCCGCGCCCTCCAGCCCAGCCCAGCCCTGGCCCGGCCCCACCCGCGCGGCACAGCCACTTTCTCCGCCGAGGCGGTACCCTAACCCTGTGCCTCCCCAGGATCGCGGGCTGCAGGCACTCGGTTCCCGAAGCGGAGGCCGGAGCCGCGCGGAGAAGCCAACGGTAATGACGCCCCCTGCCGACCTTCAGGAGGGGATAGGCTGAGGGCCTGGACGAGGTCGGAAGCGCTTCTACTGCAGCTCCGGAAAGGGCTTACCCCATGGGGCAACAGGGTGGACTCGTTCTCCCCTCCCCGCCATAGAGCGTATGACTCTTTTGGAGTACTTGTGGTTTTAGCTCTCATCAGTGTCAAACAGAGATGCTTTGCCTGGTGTTACTGCTTAACTTCTCCGAGCCTCAGTTTCCCCACCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGTCCCCTGGGAGGCCATCCTGAGGTGCTGGTGGGAGTGCCACCCCCAGTTCCATACCGCAACCGTTCATTATTCCCGGGGCCTCTCCTCTTCCTCCAGGCTGCCCTGGGCTGGAGCCCCTGCGACAGAAGTTGGCTGCCCTGCAGGGGGCCCATGCCTGGATCCTGCAGGTCCCCTCGGAGCACCTGGCCATGAACTTTCATGAGGTAGGTCCCCAGGCTTCCAGACTCCTTCACGATGGCCTGGGAAGGCTGAGACCCAGCCCAGGGAAGATGCAGAGGGCCCAGCCCAGATACCCTCCCAGCAGCCTGGGGTCGCCTCTGCCCCAGCTCTGGGGGTAGGTAGAGGGTCCGAGGGGAAGGGAGTGGGGCCTGCGGAGTGTGAGCCAGGCCACTGGGGGTGGTGGTGGGGAGAGTGAGTAGAGGGGTGGGTGGGAGTGTCCACATGAGCGGGAAATGAGCAGGGTTTCCAGGTCTAGGTGAGAGTTTCTGGGGCCCAGGGGGAGAGGGGGTGACCTCTGGGGTTTCAACTCAGGAGTGAGTTTCTGGGCCCCTGATCCCCACTCCTCCATCTGTAGGTCCTGGCAGATCTGGGCTCCAAGACACTGACCGGGCTTTTCAGAGCCTGGGTGCGGGCAGGCTTGGGGGGCCGGCATGTGGCCTTCAGCGGCCTGGTGGGCCTGGAGCCGGCCACACTGGCTCGCAGCCTCCCCCGGCTGCTGGTGCAGGCCCTGCAGGCCTTCCGCGTGGCTGCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCC
GGCCTGAGAGCCGGGTGGGCCTCGAAGGCGAGGATGGCCAGAACATGTCCCTCGTGACACCCCTTGCCCCTTTCTAGGGCCGTGCGGCGAGAGGCGTCCGAGCACTGCCAATGTGACGCGGGCCCACGGCCGCATCGTGGGGGGCAGCGCGGCGCCGCCCGGGGCCTGGCCCTGGCTGGTGAGGCTGCAGCTCGGCGGGCAGCCTCTGTGCGGCGGCGTCCTGGTAGCGGCCTCCTGGGTGCTCACGGCAGCGCACTGCTTTGTAGGGTAAGTAGGACCCCCAGGCCTTGCCCAGCTGGGGTCCCCGGCGCTGGGCCCCGCACCTGCCGGGTTGTCCGGCGGGCGACGCGCGGGAAAGGTGGTCTCTGCTGCCCCCTGGCGGCGGCCGGCCCCGGGCTTCCCCATCTCAAGGCGCCGCGCCCGCCCCGCCAGGATGCCAGCCCGGAGGGGGTGGCACGGCCGGGCGAGTTCGCCCCCTCTGGGACGGGACCCCTCCCCGGCCCGCCCTCCGTGCCCCCAGGTGGAGAAAGCCCGGCATGCGGGCGGAGGGGCAGGGTCTCCGAGGGGCCTGCGGGGTGTGCCCCTGTCCTTCCTGCGTCTCAGCTGCCGCTCGACCCGCAGCGCCCCGAATGAGCTTCTGTGGACTGTGACGCTGGCAGAGGGGTCCCGGGGGGAGCAAGCGGAGGAGGTGCCAGTGAACCGCATCCTGCCCCACCCCAAGGTGAGAAGGCAGTCCCCAGGCCCCCAAGGCTGGGCACCGCACCCCCACCCGTGCTTCCTTGACCCTGCGCCGCCTCCCCCTCCTCAGTTTGACCCGCGGACCTTCCACAACGACCTGGCCCTGGTGCAGCTGTGGACGCCGGTGAGCCCGGGGGGATCGGCGCGCCCCGTGTGCCTGCCCCAGGAGCCCCAGGAGCCCCCTGCCGGAACCGCCTGCGCCATCGCGGGCTGGGGCGCCCTCTTCGAAGGTACTGGGCGTGGGTGAGCCGGCGCGTGGTGGGAAGAACTGGGGGTCCGAGGTAATAGAGTGTAGGGAGGCCGGGTTGCCTTGGAAAAATGCTGCCTGCTCTTTCAAAGGGGGAGGAATCAAGGGGGGTGGTGGGAAGGGGACCCTCAAGGCGGGGCTCTTGCCCTCCAAACCTGAGCCTTCCACCCCTTCCCTGCAGACGGGCCTGAGGCTGAAGCAGTGAGAGAGGCCCGTGTTCCCCTGCTCAGCACCGACACCTGCCGAAGAGCCCTGGGGCCCGGGCTGCGCCCCAGCACCATGCTCTGCGCCGGGTACCTGGCGGGGGGCGTTGACTCGTGCCAGGTATGAACCCAGTCTGATGAGAAAAGGCCGGCTGAGCCTTCCCAGGGCCACTACGGCCTCTTTTCCTTCCACGTCTGTCTGTCACTCGACTTCTCTGAGCCTCTCTGTCCTCATCCCTAAAATGGACACAAGTGGCAAGCTCACACCTGCCAGGCGTAAGGCAGGCGTCATAGGGGGCAGGTGAATGCAGCGTCCTCTCTCTTGGCCCCGCAGGGTGACTCGGGAGGCCCCCTGACCTGTTCTGAGCCTGGCCCCCGCCCTAGAGAGGTCCTGTTCGGAGTCACCTCCTGGGGGGACGGCTGCGGGGAGCCAGGGAAGCCCGGGGTCTACACCCGCGTGGCAGTGTTCAAGGACTGGCTCCAGGAGCAGATGAGCGGTGAGCGCCCTCTTTCCAATGCCCCGTCCCCAGTGCCCCAACGGACAACCGTGGGACAAGCCCGTTTCCACCCGGCCCATGCCCATTCCCAGCTCCCTTCTGCCTCGGGAAAGCCTGTCTCCTTCCGGGGAAGGAGTGAGGGGGCTAGGGCCCCAAACAGAGGGTGAGCTGACCCCTGTCCCGCCCGCAGCAGCCTCCTCCAGCCGCGAGCCCAGCTGCAGGGAGCTTCTGGCCTGGGACCCCCCCCAGGAGCTGCAGGCAGACGCCGCCCGGCTCTGCGCCTTCTATGCCCGCCTGTGCCCGGGGTCCCAGGGCGCCTGTGCGCGCCTGGCGCACCAGCAGTGCCTGCAGCGCCGGCGGCGACGCGGTCAGTTCTGTTCACCCGGACCCGGACGGGGGGCAGAGGGGAGGGGGCCTGGCCAGCCTCTGACCGCCGCTCCGACTCCTGTCCGGTCCGCAGAGCTGCGCTCGCTGGCGCACACGCTGCTGGGCCTGCTGCGGAACGCGCAGGAGCTGCTCGGGCCTCGTCCGGGACTGCGGCGCCTGGCCCCCGCCCTGGCTCTCCCCGCTCCAGCGCTCAGGGAGTCTCCTCTGCACCCCGCCCGGGAGCTGCGGCTTCACTCAGGTACCCCGCGCCCTCCAGCCCAGCCCAGCCCTGGCCCGGCCCCACCCGCGCGGCACAGCCACTTTCTCCGCCGAGGCGGTACCCTAACCCTGTGCCTCCCCAGGATCGCGGGCTGCAGGCACTCGGTTCCCGAAGCGGAGGCCGGAGCCGCGCGGAGAAGCCAACGGTAATGACGCCCCCTGCCGACCTTCAGGAGGGGATAGGCTGAGGGCCTGGACGAGGTCGGAAGCGCTTCTACTGCAGCTCCGGAAAGGGCTTACCCCATGGGGCAACAGGGTGGACTCGTTCTCCCCTCCCCGCCATAGAGCGTATGACTCTTTTGGAGTACTTGTGGTTTTAGCTCTCATCAGTGTCAAACAGAGATGCTTTGCCTGGTGTTACTGCTTAACTTCTCCGAGCCTCAGTTTCCCCACCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGTCCCCTGGGAGGCCATCCTGAGGTGCTGGTGGGAGTGCCACCCCCAGTTCCATACCGCAACCGTTCATTATTCCCGGGGCCTCTCCTCTTCCTCCAGGCTGCCCTGGGCTGGAGCCCCTGCGACAGAAGTTGGCTGCCCTGCAGGGGGCCCATGCCTGGATCCTGCAGGTCCCCTCGGAGCACCTGGCCATGAACTTTCATGAGGTAGGTCCCCAGGCTTCCAGACTCCTTCACGATGGCCTGGGAAGGCTGAGACCCAGCCCAGGGAAGATGCAGAGGGCCCAGCCCAGATACCCTCCCAGCAGCCTGGGGTCGCCTCTGCCCCAGCTCTGGGGGTAGGTAGAGGGTCCGAGGGGAAGGGAGTGGGGCCTGCGGAGTGTGAGCCAGGCCACTGGGGGTGGTGGTGGGGAGAGTGAGTAGAGGGGTGGGTGGGAGTGTCCACATGAGCGGGAAATGAGCAGGGTTTCCAGGTCTAGGTGAGAGTTTCTGGGGCCCAGGGGGAGAGGGGGTGACCTCTGGGGTTTCAACTCAGGAGTGAGTTTCTGGGCCCCTGATCCCCACTCCTCCATCTGTAGGTCCTGGCAGATCTGGGCTCCAAGACACTGACCGGGCTTTTCAGAGCCTGGGTGCGGGCAGGCTTGGGGGGCCGGCATGTGGCCTTCAGCGGCCTGGTGGGCCTGGAGCCGGCCACACTGGCTCGCAGCCTCCCCCGGCTGCTGGTGCAGGCCCTGCAGGCCTTCCGCGTGGCTGCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCC
Task1_train_5691
This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene PRSS56 (serine protease 56). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Isolated microphthalmia 6
GTGACGCGGGCCCACGGCCGCATCGTGGGGGGCAGCGCGGCGCCGCCCGGGGCCTGGCCCTGGCTGGTGAGGCTGCAGCTCGGCGGGCAGCCTCTGTGCGGCGGCGTCCTGGTAGCGGCCTCCTGGGTGCTCACGGCAGCGCACTGCTTTGTAGGGTAAGTAGGACCCCCAGGCCTTGCCCAGCTGGGGTCCCCGGCGCTGGGCCCCGCACCTGCCGGGTTGTCCGGCGGGCGACGCGCGGGAAAGGTGGTCTCTGCTGCCCCCTGGCGGCGGCCGGCCCCGGGCTTCCCCATCTCAAGGCGCCGCGCCCGCCCCGCCAGGATGCCAGCCCGGAGGGGGTGGCACGGCCGGGCGAGTTCGCCCCCTCTGGGACGGGACCCCTCCCCGGCCCGCCCTCCGTGCCCCCAGGTGGAGAAAGCCCGGCATGCGGGCGGAGGGGCAGGGTCTCCGAGGGGCCTGCGGGGTGTGCCCCTGTCCTTCCTGCGTCTCAGCTGCCGCTCGACCCGCAGCGCCCCGAATGAGCTTCTGTGGACTGTGACGCTGGCAGAGGGGTCCCGGGGGGAGCAAGCGGAGGAGGTGCCAGTGAACCGCATCCTGCCCCACCCCAAGGTGAGAAGGCAGTCCCCAGGCCCCCAAGGCTGGGCACCGCACCCCCACCCGTGCTTCCTTGACCCTGCGCCGCCTCCCCCTCCTCAGTTTGACCCGCGGACCTTCCACAACGACCTGGCCCTGGTGCAGCTGTGGACGCCGGTGAGCCCGGGGGGATCGGCGCGCCCCGTGTGCCTGCCCCAGGAGCCCCAGGAGCCCCCTGCCGGAACCGCCTGCGCCATCGCGGGCTGGGGCGCCCTCTTCGAAGGTACTGGGCGTGGGTGAGCCGGCGCGTGGTGGGAAGAACTGGGGGTCCGAGGTAATAGAGTGTAGGGAGGCCGGGTTGCCTTGGAAAAATGCTGCCTGCTCTTTCAAAGGGGGAGGAATCAAGGGGGGTGGTGGGAAGGGGACCCTCAAGGCGGGGCTCTTGCCCTCCAAACCTGAGCCTTCCACCCCTTCCCTGCAGACGGGCCTGAGGCTGAAGCAGTGAGAGAGGCCCGTGTTCCCCTGCTCAGCACCGACACCTGCCGAAGAGCCCTGGGGCCCGGGCTGCGCCCCAGCACCATGCTCTGCGCCGGGTACCTGGCGGGGGGCGTTGACTCGTGCCAGGTATGAACCCAGTCTGATGAGAAAAGGCCGGCTGAGCCTTCCCAGGGCCACTACGGCCTCTTTTCCTTCCACGTCTGTCTGTCACTCGACTTCTCTGAGCCTCTCTGTCCTCATCCCTAAAATGGACACAAGTGGCAAGCTCACACCTGCCAGGCGTAAGGCAGGCGTCATAGGGGGCAGGTGAATGCAGCGTCCTCTCTCTTGGCCCCGCAGGGTGACTCGGGAGGCCCCCTGACCTGTTCTGAGCCTGGCCCCCGCCCTAGAGAGGTCCTGTTCGGAGTCACCTCCTGGGGGGACGGCTGCGGGGAGCCAGGGAAGCCCGGGGTCTACACCCGCGTGGCAGTGTTCAAGGACTGGCTCCAGGAGCAGATGAGCGGTGAGCGCCCTCTTTCCAATGCCCCGTCCCCAGTGCCCCAACGGACAACCGTGGGACAAGCCCGTTTCCACCCGGCCCATGCCCATTCCCAGCTCCCTTCTGCCTCGGGAAAGCCTGTCTCCTTCCGGGGAAGGAGTGAGGGGGCTAGGGCCCCAAACAGAGGGTGAGCTGACCCCTGTCCCGCCCGCAGCAGCCTCCTCCAGCCGCGAGCCCAGCTGCAGGGAGCTTCTGGCCTGGGACCCCCCCCAGGAGCTGCAGGCAGACGCCGCCCGGCTCTGCGCCTTCTATGCCCGCCTGTGCCCGGGGTCCCAGGGCGCCTGTGCGCGCCTGGCGCACCAGCAGTGCCTGCAGCGCCGGCGGCGATGCGGTCAGTTCTGTTCACCCGGACCCGGACGGGGGGCAGAGGGGAGGGGGCCTGGCCAGCCTCTGACCGCCGCTCCGACTCCTGTCCGGTCCGCAGAGCTGCGCTCGCTGGCGCACACGCTGCTGGGCCTGCTGCGGAACGCGCAGGAGCTGCTCGGGCCTCGTCCGGGACTGCGGCGCCTGGCCCCCGCCCTGGCTCTCCCCGCTCCAGCGCTCAGGGAGTCTCCTCTGCACCCCGCCCGGGAGCTGCGGCTTCACTCAGGTACCCCGCGCCCTCCAGCCCAGCCCAGCCCTGGCCCGGCCCCACCCGCGCGGCACAGCCACTTTCTCCGCCGAGGCGGTACCCTAACCCTGTGCCTCCCCAGGATCGCGGGCTGCAGGCACTCGGTTCCCGAAGCGGAGGCCGGAGCCGCGCGGAGAAGCCAACGGTAATGACGCCCCCTGCCGACCTTCAGGAGGGGATAGGCTGAGGGCCTGGACGAGGTCGGAAGCGCTTCTACTGCAGCTCCGGAAAGGGCTTACCCCATGGGGCAACAGGGTGGACTCGTTCTCCCCTCCCCGCCATAGAGCGTATGACTCTTTTGGAGTACTTGTGGTTTTAGCTCTCATCAGTGTCAAACAGAGATGCTTTGCCTGGTGTTACTGCTTAACTTCTCCGAGCCTCAGTTTCCCCACCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGTCCCCTGGGAGGCCATCCTGAGGTGCTGGTGGGAGTGCCACCCCCAGTTCCATACCGCAACCGTTCATTATTCCCGGGGCCTCTCCTCTTCCTCCAGGCTGCCCTGGGCTGGAGCCCCTGCGACAGAAGTTGGCTGCCCTGCAGGGGGCCCATGCCTGGATCCTGCAGGTCCCCTCGGAGCACCTGGCCATGAACTTTCATGAGGTAGGTCCCCAGGCTTCCAGACTCCTTCACGATGGCCTGGGAAGGCTGAGACCCAGCCCAGGGAAGATGCAGAGGGCCCAGCCCAGATACCCTCCCAGCAGCCTGGGGTCGCCTCTGCCCCAGCTCTGGGGGTAGGTAGAGGGTCCGAGGGGAAGGGAGTGGGGCCTGCGGAGTGTGAGCCAGGCCACTGGGGGTGGTGGTGGGGAGAGTGAGTAGAGGGGTGGGTGGGAGTGTCCACATGAGCGGGAAATGAGCAGGGTTTCCAGGTCTAGGTGAGAGTTTCTGGGGCCCAGGGGGAGAGGGGGTGACCTCTGGGGTTTCAACTCAGGAGTGAGTTTCTGGGCCCCTGATCCCCACTCCTCCATCTGTAGGTCCTGGCAGATCTGGGCTCCAAGACACTGACCGGGCTTTTCAGAGCCTGGGTGCGGGCAGGCTTGGGGGGCCGGCATGTGGCCTTCAGCGGCCTGGTGGGCCTGGAGCCGGCCACACTGGCTCGCAGCCTCCCCCGGCTGCTGGTGCAGGCCCTGCAGGCCTTCCGCGTGGCTGCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCCGCCTCCGAGCTGCGGGGAGTCCCAGCCTGGGATCTTTGCCTCATGTCCTTGGGCTCCTGCCCTGGCTGGCCCGTCCCCCACCGCCATGAGGTGTCAGATTGTGTTTCCGGCT
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Task1_train_5692
This sequence change occurs on Chromosome 2, altering PRSS56 (serine protease 56). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Isolated microphthalmia 6
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Task1_train_5693
Mutation context: Chromosome 2, Gene CHRND (cholinergic receptor nicotinic delta subunit). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Lethal multiple pterygium syndrome
TCTGCACCCCGCCCGGGAGCTGCGGCTTCACTCAGGTACCCCGCGCCCTCCAGCCCAGCCCAGCCCTGGCCCGGCCCCACCCGCGCGGCACAGCCACTTTCTCCGCCGAGGCGGTACCCTAACCCTGTGCCTCCCCAGGATCGCGGGCTGCAGGCACTCGGTTCCCGAAGCGGAGGCCGGAGCCGCGCGGAGAAGCCAACGGTAATGACGCCCCCTGCCGACCTTCAGGAGGGGATAGGCTGAGGGCCTGGACGAGGTCGGAAGCGCTTCTACTGCAGCTCCGGAAAGGGCTTACCCCATGGGGCAACAGGGTGGACTCGTTCTCCCCTCCCCGCCATAGAGCGTATGACTCTTTTGGAGTACTTGTGGTTTTAGCTCTCATCAGTGTCAAACAGAGATGCTTTGCCTGGTGTTACTGCTTAACTTCTCCGAGCCTCAGTTTCCCCACCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGTCCCCTGGGAGGCCATCCTGAGGTGCTGGTGGGAGTGCCACCCCCAGTTCCATACCGCAACCGTTCATTATTCCCGGGGCCTCTCCTCTTCCTCCAGGCTGCCCTGGGCTGGAGCCCCTGCGACAGAAGTTGGCTGCCCTGCAGGGGGCCCATGCCTGGATCCTGCAGGTCCCCTCGGAGCACCTGGCCATGAACTTTCATGAGGTAGGTCCCCAGGCTTCCAGACTCCTTCACGATGGCCTGGGAAGGCTGAGACCCAGCCCAGGGAAGATGCAGAGGGCCCAGCCCAGATACCCTCCCAGCAGCCTGGGGTCGCCTCTGCCCCAGCTCTGGGGGTAGGTAGAGGGTCCGAGGGGAAGGGAGTGGGGCCTGCGGAGTGTGAGCCAGGCCACTGGGGGTGGTGGTGGGGAGAGTGAGTAGAGGGGTGGGTGGGAGTGTCCACATGAGCGGGAAATGAGCAGGGTTTCCAGGTCTAGGTGAGAGTTTCTGGGGCCCAGGGGGAGAGGGGGTGACCTCTGGGGTTTCAACTCAGGAGTGAGTTTCTGGGCCCCTGATCCCCACTCCTCCATCTGTAGGTCCTGGCAGATCTGGGCTCCAAGACACTGACCGGGCTTTTCAGAGCCTGGGTGCGGGCAGGCTTGGGGGGCCGGCATGTGGCCTTCAGCGGCCTGGTGGGCCTGGAGCCGGCCACACTGGCTCGCAGCCTCCCCCGGCTGCTGGTGCAGGCCCTGCAGGCCTTCCGCGTGGCTGCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCCGCCTCCGAGCTGCGGGGAGTCCCAGCCTGGGATCTTTGCCTCATGTCCTTGGGCTCCTGCCCTGGCTGGCCCGTCCCCCACCGCCATGAGGTGTCAGATTGTGTTTCCGGCTGCCTCTTCCCGTTGACCCCCTCCTCCCCCAACACCTGTCCCCTCTCCCGCCCACCCTCATTCCACAGCCCTGTAGACAGGAGGGGCAGATGCACGTCCCAGTCAGAGGGATGGGATGGAGGGGCCAGTGCTGACACTGGGGCTGCTGGCTGCCCTGGCGGTGTGTGGTAAGGGAAGACACCCTCCCCACCCTGGGGTCCCCCGTGATGCTTACCCAGGCCCCACACCGCATGGCTCCTCACTCACTCCACTCCCACTCTGCCATCTCTCCCTGTGGGGGGCCGCCTTCTGGGGTCCCCACTCCCAGGGAGTGGTTGGGTTCCCCCCTGCTCATCCCAACCTCATGGTCCAGCAGGACCTCAGGGCAGCTTCCTTCCTGAGTCCCCTGCCCAGGGCCCCATTCAGTCCTTGTCGCTGACCCTCCCCAGGCAGCTGGGGGCTGAACGAGGAGGAGCGGCTGATCCGGCACCTGTTTCAAGAGAAGGGCTACAACAAGGAGCTCCGGCCCGTGGCACACAAAGAGGAGAGTGTGGACGTTGCCCTGGCCCTCACACTCTCCAACCTCATCTCCCTGGTGAGAGGCCCTCCGGTGCTGGGTTGGGAGGGAGGGCAGGGATGGCTTTCCAGTACCAGGATAGCCATGGAGGAAGCTAGAAGCCCCCACCTGGCCTATGGCCACTCCCTTCCTGGGAAACGTGCTGCGGCTGCTCTGTGCCCTGAGAGGCTGCTGTCCTGCCCCTCCAGTGTCAGCTCTGCGGTGTCCCCCAACCACACCCATAGCATGCCCCATCTGTGACACACTTCAGAGGCCACTGGTCCTCTCTGCTCCCTGGCGGCCTACCCACTCCTGACTGCGAGTGATCAGGGCCCAGATGCCACGGTTTCCCTGGGTGCCAATTGACAGTGGGTGAATGTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCTGATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGATGGTGTGGGCCTATAATCCCAGCTACTAGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGGTTGCAGTGAGCCAAGCTCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAATTGAGCAAGACCCTGGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGAATGTGTGCGGATAAAAGAATGATATGGCCCTGAAGGATGGCCCTACCGTCTAATTACAGAAAGAAGTTGAGGAGACCCTCACTACCAATGTGTGGATAGAGCACGTAAGAATGCCCCTCCCAGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGGGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCTTGGCTGACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTTGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACGCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAACAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAGAATGCCCCGCCCAGAGCCGGTGGGGTCGGGGAGGGAATGCAGGGCACCAGATTGCTTCTGCATGGAGATCCCGTCTGCCTTGGACACTGTTCTCCAGGAGGGGTTGGTGCCTCCCTACAGGGAAGCCCCAGGCCCAACTGTCCTTCCCCCACCTAGTGCCCTCACCAGCCCTGATGTCACCTTCAAGTGGATTAGGATTCACATGTTGGAAAATTGCCACTTTATCTTGATGTTTATTAGAAAACATTCTCTTCCTGCCTGTCAAAAGTCCACAGTACAGACACAAATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGC
TCTGCACCCCGCCCGGGAGCTGCGGCTTCACTCAGGTACCCCGCGCCCTCCAGCCCAGCCCAGCCCTGGCCCGGCCCCACCCGCGCGGCACAGCCACTTTCTCCGCCGAGGCGGTACCCTAACCCTGTGCCTCCCCAGGATCGCGGGCTGCAGGCACTCGGTTCCCGAAGCGGAGGCCGGAGCCGCGCGGAGAAGCCAACGGTAATGACGCCCCCTGCCGACCTTCAGGAGGGGATAGGCTGAGGGCCTGGACGAGGTCGGAAGCGCTTCTACTGCAGCTCCGGAAAGGGCTTACCCCATGGGGCAACAGGGTGGACTCGTTCTCCCCTCCCCGCCATAGAGCGTATGACTCTTTTGGAGTACTTGTGGTTTTAGCTCTCATCAGTGTCAAACAGAGATGCTTTGCCTGGTGTTACTGCTTAACTTCTCCGAGCCTCAGTTTCCCCACCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGTCCCCTGGGAGGCCATCCTGAGGTGCTGGTGGGAGTGCCACCCCCAGTTCCATACCGCAACCGTTCATTATTCCCGGGGCCTCTCCTCTTCCTCCAGGCTGCCCTGGGCTGGAGCCCCTGCGACAGAAGTTGGCTGCCCTGCAGGGGGCCCATGCCTGGATCCTGCAGGTCCCCTCGGAGCACCTGGCCATGAACTTTCATGAGGTAGGTCCCCAGGCTTCCAGACTCCTTCACGATGGCCTGGGAAGGCTGAGACCCAGCCCAGGGAAGATGCAGAGGGCCCAGCCCAGATACCCTCCCAGCAGCCTGGGGTCGCCTCTGCCCCAGCTCTGGGGGTAGGTAGAGGGTCCGAGGGGAAGGGAGTGGGGCCTGCGGAGTGTGAGCCAGGCCACTGGGGGTGGTGGTGGGGAGAGTGAGTAGAGGGGTGGGTGGGAGTGTCCACATGAGCGGGAAATGAGCAGGGTTTCCAGGTCTAGGTGAGAGTTTCTGGGGCCCAGGGGGAGAGGGGGTGACCTCTGGGGTTTCAACTCAGGAGTGAGTTTCTGGGCCCCTGATCCCCACTCCTCCATCTGTAGGTCCTGGCAGATCTGGGCTCCAAGACACTGACCGGGCTTTTCAGAGCCTGGGTGCGGGCAGGCTTGGGGGGCCGGCATGTGGCCTTCAGCGGCCTGGTGGGCCTGGAGCCGGCCACACTGGCTCGCAGCCTCCCCCGGCTGCTGGTGCAGGCCCTGCAGGCCTTCCGCGTGGCTGCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCCGCCTCCGAGCTGCGGGGAGTCCCAGCCTGGGATCTTTGCCTCATGTCCTTGGGCTCCTGCCCTGGCTGGCCCGTCCCCCACCGCCATGAGGTGTCAGATTGTGTTTCCGGCTGCCTCTTCCCGTTGACCCCCTCCTCCCCCAACACCTGTCCCCTCTCCCGCCCACCCTCATTCCACAGCCCTGTAGACAGGAGGGGCAGATGCACGTCCCAGTCAGAGGGATGGGACGGAGGGGCCAGTGCTGACACTGGGGCTGCTGGCTGCCCTGGCGGTGTGTGGTAAGGGAAGACACCCTCCCCACCCTGGGGTCCCCCGTGATGCTTACCCAGGCCCCACACCGCATGGCTCCTCACTCACTCCACTCCCACTCTGCCATCTCTCCCTGTGGGGGGCCGCCTTCTGGGGTCCCCACTCCCAGGGAGTGGTTGGGTTCCCCCCTGCTCATCCCAACCTCATGGTCCAGCAGGACCTCAGGGCAGCTTCCTTCCTGAGTCCCCTGCCCAGGGCCCCATTCAGTCCTTGTCGCTGACCCTCCCCAGGCAGCTGGGGGCTGAACGAGGAGGAGCGGCTGATCCGGCACCTGTTTCAAGAGAAGGGCTACAACAAGGAGCTCCGGCCCGTGGCACACAAAGAGGAGAGTGTGGACGTTGCCCTGGCCCTCACACTCTCCAACCTCATCTCCCTGGTGAGAGGCCCTCCGGTGCTGGGTTGGGAGGGAGGGCAGGGATGGCTTTCCAGTACCAGGATAGCCATGGAGGAAGCTAGAAGCCCCCACCTGGCCTATGGCCACTCCCTTCCTGGGAAACGTGCTGCGGCTGCTCTGTGCCCTGAGAGGCTGCTGTCCTGCCCCTCCAGTGTCAGCTCTGCGGTGTCCCCCAACCACACCCATAGCATGCCCCATCTGTGACACACTTCAGAGGCCACTGGTCCTCTCTGCTCCCTGGCGGCCTACCCACTCCTGACTGCGAGTGATCAGGGCCCAGATGCCACGGTTTCCCTGGGTGCCAATTGACAGTGGGTGAATGTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCTGATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGATGGTGTGGGCCTATAATCCCAGCTACTAGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGGTTGCAGTGAGCCAAGCTCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAATTGAGCAAGACCCTGGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGAATGTGTGCGGATAAAAGAATGATATGGCCCTGAAGGATGGCCCTACCGTCTAATTACAGAAAGAAGTTGAGGAGACCCTCACTACCAATGTGTGGATAGAGCACGTAAGAATGCCCCTCCCAGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGGGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCTTGGCTGACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTTGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACGCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAACAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAGAATGCCCCGCCCAGAGCCGGTGGGGTCGGGGAGGGAATGCAGGGCACCAGATTGCTTCTGCATGGAGATCCCGTCTGCCTTGGACACTGTTCTCCAGGAGGGGTTGGTGCCTCCCTACAGGGAAGCCCCAGGCCCAACTGTCCTTCCCCCACCTAGTGCCCTCACCAGCCCTGATGTCACCTTCAAGTGGATTAGGATTCACATGTTGGAAAATTGCCACTTTATCTTGATGTTTATTAGAAAACATTCTCTTCCTGCCTGTCAAAAGTCCACAGTACAGACACAAATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGC
Task1_train_5694
Given this variant in gene CHRND (cholinergic receptor nicotinic delta subunit) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Congenital myasthenic syndrome 3B
CCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGTCCCCTGGGAGGCCATCCTGAGGTGCTGGTGGGAGTGCCACCCCCAGTTCCATACCGCAACCGTTCATTATTCCCGGGGCCTCTCCTCTTCCTCCAGGCTGCCCTGGGCTGGAGCCCCTGCGACAGAAGTTGGCTGCCCTGCAGGGGGCCCATGCCTGGATCCTGCAGGTCCCCTCGGAGCACCTGGCCATGAACTTTCATGAGGTAGGTCCCCAGGCTTCCAGACTCCTTCACGATGGCCTGGGAAGGCTGAGACCCAGCCCAGGGAAGATGCAGAGGGCCCAGCCCAGATACCCTCCCAGCAGCCTGGGGTCGCCTCTGCCCCAGCTCTGGGGGTAGGTAGAGGGTCCGAGGGGAAGGGAGTGGGGCCTGCGGAGTGTGAGCCAGGCCACTGGGGGTGGTGGTGGGGAGAGTGAGTAGAGGGGTGGGTGGGAGTGTCCACATGAGCGGGAAATGAGCAGGGTTTCCAGGTCTAGGTGAGAGTTTCTGGGGCCCAGGGGGAGAGGGGGTGACCTCTGGGGTTTCAACTCAGGAGTGAGTTTCTGGGCCCCTGATCCCCACTCCTCCATCTGTAGGTCCTGGCAGATCTGGGCTCCAAGACACTGACCGGGCTTTTCAGAGCCTGGGTGCGGGCAGGCTTGGGGGGCCGGCATGTGGCCTTCAGCGGCCTGGTGGGCCTGGAGCCGGCCACACTGGCTCGCAGCCTCCCCCGGCTGCTGGTGCAGGCCCTGCAGGCCTTCCGCGTGGCTGCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCCGCCTCCGAGCTGCGGGGAGTCCCAGCCTGGGATCTTTGCCTCATGTCCTTGGGCTCCTGCCCTGGCTGGCCCGTCCCCCACCGCCATGAGGTGTCAGATTGTGTTTCCGGCTGCCTCTTCCCGTTGACCCCCTCCTCCCCCAACACCTGTCCCCTCTCCCGCCCACCCTCATTCCACAGCCCTGTAGACAGGAGGGGCAGATGCACGTCCCAGTCAGAGGGATGGGATGGAGGGGCCAGTGCTGACACTGGGGCTGCTGGCTGCCCTGGCGGTGTGTGGTAAGGGAAGACACCCTCCCCACCCTGGGGTCCCCCGTGATGCTTACCCAGGCCCCACACCGCATGGCTCCTCACTCACTCCACTCCCACTCTGCCATCTCTCCCTGTGGGGGGCCGCCTTCTGGGGTCCCCACTCCCAGGGAGTGGTTGGGTTCCCCCCTGCTCATCCCAACCTCATGGTCCAGCAGGACCTCAGGGCAGCTTCCTTCCTGAGTCCCCTGCCCAGGGCCCCATTCAGTCCTTGTCGCTGACCCTCCCCAGGCAGCTGGGGGCTGAACGAGGAGGAGCGGCTGATCCGGCACCTGTTTCAAGAGAAGGGCTACAACAAGGAGCTCCGGCCCGTGGCACACAAAGAGGAGAGTGTGGACGTTGCCCTGGCCCTCACACTCTCCAACCTCATCTCCCTGGTGAGAGGCCCTCCGGTGCTGGGTTGGGAGGGAGGGCAGGGATGGCTTTCCAGTACCAGGATAGCCATGGAGGAAGCTAGAAGCCCCCACCTGGCCTATGGCCACTCCCTTCCTGGGAAACGTGCTGCGGCTGCTCTGTGCCCTGAGAGGCTGCTGTCCTGCCCCTCCAGTGTCAGCTCTGCGGTGTCCCCCAACCACACCCATAGCATGCCCCATCTGTGACACACTTCAGAGGCCACTGGTCCTCTCTGCTCCCTGGCGGCCTACCCACTCCTGACTGCGAGTGATCAGGGCCCAGATGCCACGGTTTCCCTGGGTGCCAATTGACAGTGGGTGAATGTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCTGATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGATGGTGTGGGCCTATAATCCCAGCTACTAGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGGTTGCAGTGAGCCAAGCTCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAATTGAGCAAGACCCTGGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGAATGTGTGCGGATAAAAGAATGATATGGCCCTGAAGGATGGCCCTACCGTCTAATTACAGAAAGAAGTTGAGGAGACCCTCACTACCAATGTGTGGATAGAGCACGTAAGAATGCCCCTCCCAGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGGGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCTTGGCTGACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTTGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACGCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAACAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAGAATGCCCCGCCCAGAGCCGGTGGGGTCGGGGAGGGAATGCAGGGCACCAGATTGCTTCTGCATGGAGATCCCGTCTGCCTTGGACACTGTTCTCCAGGAGGGGTTGGTGCCTCCCTACAGGGAAGCCCCAGGCCCAACTGTCCTTCCCCCACCTAGTGCCCTCACCAGCCCTGATGTCACCTTCAAGTGGATTAGGATTCACATGTTGGAAAATTGCCACTTTATCTTGATGTTTATTAGAAAACATTCTCTTCCTGCCTGTCAAAAGTCCACAGTACAGACACAAATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGCTGGACAGACAACCGGCTGAAGTGGAATGCTGAAGAATTTGGAAACATCAGTGTCCTGCGCCTCCCCCCGGACATGGTGTGGCTCCCAGAGATTGTGCTGGAGAACAAGTTGAGCCAAGCCCTCCCTGACCTCCCCTCTGTCACCCTGCCTCCTTTCCTTAAGCCTCCTCTGCCTCCCCCAACTCTGCCAGTCGTGAGTGGCCAGAGCTCACTATGGTTCTTGTCCCTGTCCCCCAGCAATGACGGCTCCTTCCAGATCTCCTACTCCTGCAACGTGCTTGTCTACCACTACGGCTTCGTGTACTGGCTGCCACCTGCCATCTTCCGCTCCTCCTGCCCCATCTCTGTCACCTATTTCCCCTTCGACTGGCAGAACTGCTCCCTCAAGTTCAGGTGTGCCCTTTTCTCCAGCCACCCCTCACCCCAAAGCACCCTGCCAGAGGCCAAA
CCTATAGCATAAGAGGATAAGTGTGTCCCCTGGGAGGCCATCCTGAGGTGCTGGTGGGAGTGCCACCCCCAGTTCCATACCGCAACCGTTCATTATTCCCGGGGCCTCTCCTCTTCCTCCAGGCTGCCCTGGGCTGGAGCCCCTGCGACAGAAGTTGGCTGCCCTGCAGGGGGCCCATGCCTGGATCCTGCAGGTCCCCTCGGAGCACCTGGCCATGAACTTTCATGAGGTAGGTCCCCAGGCTTCCAGACTCCTTCACGATGGCCTGGGAAGGCTGAGACCCAGCCCAGGGAAGATGCAGAGGGCCCAGCCCAGATACCCTCCCAGCAGCCTGGGGTCGCCTCTGCCCCAGCTCTGGGGGTAGGTAGAGGGTCCGAGGGGAAGGGAGTGGGGCCTGCGGAGTGTGAGCCAGGCCACTGGGGGTGGTGGTGGGGAGAGTGAGTAGAGGGGTGGGTGGGAGTGTCCACATGAGCGGGAAATGAGCAGGGTTTCCAGGTCTAGGTGAGAGTTTCTGGGGCCCAGGGGGAGAGGGGGTGACCTCTGGGGTTTCAACTCAGGAGTGAGTTTCTGGGCCCCTGATCCCCACTCCTCCATCTGTAGGTCCTGGCAGATCTGGGCTCCAAGACACTGACCGGGCTTTTCAGAGCCTGGGTGCGGGCAGGCTTGGGGGGCCGGCATGTGGCCTTCAGCGGCCTGGTGGGCCTGGAGCCGGCCACACTGGCTCGCAGCCTCCCCCGGCTGCTGGTGCAGGCCCTGCAGGCCTTCCGCGTGGCTGCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCCGCCTCCGAGCTGCGGGGAGTCCCAGCCTGGGATCTTTGCCTCATGTCCTTGGGCTCCTGCCCTGGCTGGCCCGTCCCCCACCGCCATGAGGTGTCAGATTGTGTTTCCGGCTGCCTCTTCCCGTTGACCCCCTCCTCCCCCAACACCTGTCCCCTCTCCCGCCCACCCTCATTCCACAGCCCTGTAGACAGGAGGGGCAGATGCACGTCCCAGTCAGAGGGATGGGATGGAGGGGCCAGTGCTGACACTGGGGCTGCTGGCTGCCCTGGCGGTGTGTGGTAAGGGAAGACACCCTCCCCACCCTGGGGTCCCCCGTGATGCTTACCCAGGCCCCACACCGCATGGCTCCTCACTCACTCCACTCCCACTCTGCCATCTCTCCCTGTGGGGGGCCGCCTTCTGGGGTCCCCACTCCCAGGGAGTGGTTGGGTTCCCCCCTGCTCATCCCAACCTCATGGTCCAGCAGGACCTCAGGGCAGCTTCCTTCCTGAGTCCCCTGCCCAGGGCCCCATTCAGTCCTTGTCGCTGACCCTCCCCAGGCAGCTGGGGGCTGAACGAGGAGGAGCGGCTGATCCGGCACCTGTTTCAAGAGAAGGGCTACAACAAGGAGCTCCGGCCCGTGGCACACAAAGAGGAGAGTGTGGACGTTGCCCTGGCCCTCACACTCTCCAACCCCATCTCCCTGGTGAGAGGCCCTCCGGTGCTGGGTTGGGAGGGAGGGCAGGGATGGCTTTCCAGTACCAGGATAGCCATGGAGGAAGCTAGAAGCCCCCACCTGGCCTATGGCCACTCCCTTCCTGGGAAACGTGCTGCGGCTGCTCTGTGCCCTGAGAGGCTGCTGTCCTGCCCCTCCAGTGTCAGCTCTGCGGTGTCCCCCAACCACACCCATAGCATGCCCCATCTGTGACACACTTCAGAGGCCACTGGTCCTCTCTGCTCCCTGGCGGCCTACCCACTCCTGACTGCGAGTGATCAGGGCCCAGATGCCACGGTTTCCCTGGGTGCCAATTGACAGTGGGTGAATGTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCTGATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGATGGTGTGGGCCTATAATCCCAGCTACTAGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGGTTGCAGTGAGCCAAGCTCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAATTGAGCAAGACCCTGGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGAATGTGTGCGGATAAAAGAATGATATGGCCCTGAAGGATGGCCCTACCGTCTAATTACAGAAAGAAGTTGAGGAGACCCTCACTACCAATGTGTGGATAGAGCACGTAAGAATGCCCCTCCCAGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGGGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCTTGGCTGACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTTGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACGCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAACAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAGAATGCCCCGCCCAGAGCCGGTGGGGTCGGGGAGGGAATGCAGGGCACCAGATTGCTTCTGCATGGAGATCCCGTCTGCCTTGGACACTGTTCTCCAGGAGGGGTTGGTGCCTCCCTACAGGGAAGCCCCAGGCCCAACTGTCCTTCCCCCACCTAGTGCCCTCACCAGCCCTGATGTCACCTTCAAGTGGATTAGGATTCACATGTTGGAAAATTGCCACTTTATCTTGATGTTTATTAGAAAACATTCTCTTCCTGCCTGTCAAAAGTCCACAGTACAGACACAAATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGCTGGACAGACAACCGGCTGAAGTGGAATGCTGAAGAATTTGGAAACATCAGTGTCCTGCGCCTCCCCCCGGACATGGTGTGGCTCCCAGAGATTGTGCTGGAGAACAAGTTGAGCCAAGCCCTCCCTGACCTCCCCTCTGTCACCCTGCCTCCTTTCCTTAAGCCTCCTCTGCCTCCCCCAACTCTGCCAGTCGTGAGTGGCCAGAGCTCACTATGGTTCTTGTCCCTGTCCCCCAGCAATGACGGCTCCTTCCAGATCTCCTACTCCTGCAACGTGCTTGTCTACCACTACGGCTTCGTGTACTGGCTGCCACCTGCCATCTTCCGCTCCTCCTGCCCCATCTCTGTCACCTATTTCCCCTTCGACTGGCAGAACTGCTCCCTCAAGTTCAGGTGTGCCCTTTTCTCCAGCCACCCCTCACCCCAAAGCACCCTGCCAGAGGCCAAA
Task1_train_5695
A sequence alteration has been identified in CHRND (cholinergic receptor nicotinic delta subunit) on Chromosome 2. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Lethal multiple pterygium syndrome
GCCCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCCGCCTCCGAGCTGCGGGGAGTCCCAGCCTGGGATCTTTGCCTCATGTCCTTGGGCTCCTGCCCTGGCTGGCCCGTCCCCCACCGCCATGAGGTGTCAGATTGTGTTTCCGGCTGCCTCTTCCCGTTGACCCCCTCCTCCCCCAACACCTGTCCCCTCTCCCGCCCACCCTCATTCCACAGCCCTGTAGACAGGAGGGGCAGATGCACGTCCCAGTCAGAGGGATGGGATGGAGGGGCCAGTGCTGACACTGGGGCTGCTGGCTGCCCTGGCGGTGTGTGGTAAGGGAAGACACCCTCCCCACCCTGGGGTCCCCCGTGATGCTTACCCAGGCCCCACACCGCATGGCTCCTCACTCACTCCACTCCCACTCTGCCATCTCTCCCTGTGGGGGGCCGCCTTCTGGGGTCCCCACTCCCAGGGAGTGGTTGGGTTCCCCCCTGCTCATCCCAACCTCATGGTCCAGCAGGACCTCAGGGCAGCTTCCTTCCTGAGTCCCCTGCCCAGGGCCCCATTCAGTCCTTGTCGCTGACCCTCCCCAGGCAGCTGGGGGCTGAACGAGGAGGAGCGGCTGATCCGGCACCTGTTTCAAGAGAAGGGCTACAACAAGGAGCTCCGGCCCGTGGCACACAAAGAGGAGAGTGTGGACGTTGCCCTGGCCCTCACACTCTCCAACCTCATCTCCCTGGTGAGAGGCCCTCCGGTGCTGGGTTGGGAGGGAGGGCAGGGATGGCTTTCCAGTACCAGGATAGCCATGGAGGAAGCTAGAAGCCCCCACCTGGCCTATGGCCACTCCCTTCCTGGGAAACGTGCTGCGGCTGCTCTGTGCCCTGAGAGGCTGCTGTCCTGCCCCTCCAGTGTCAGCTCTGCGGTGTCCCCCAACCACACCCATAGCATGCCCCATCTGTGACACACTTCAGAGGCCACTGGTCCTCTCTGCTCCCTGGCGGCCTACCCACTCCTGACTGCGAGTGATCAGGGCCCAGATGCCACGGTTTCCCTGGGTGCCAATTGACAGTGGGTGAATGTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCTGATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGATGGTGTGGGCCTATAATCCCAGCTACTAGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGGTTGCAGTGAGCCAAGCTCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAATTGAGCAAGACCCTGGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGAATGTGTGCGGATAAAAGAATGATATGGCCCTGAAGGATGGCCCTACCGTCTAATTACAGAAAGAAGTTGAGGAGACCCTCACTACCAATGTGTGGATAGAGCACGTAAGAATGCCCCTCCCAGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGGGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCTTGGCTGACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTTGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACGCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAACAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAGAATGCCCCGCCCAGAGCCGGTGGGGTCGGGGAGGGAATGCAGGGCACCAGATTGCTTCTGCATGGAGATCCCGTCTGCCTTGGACACTGTTCTCCAGGAGGGGTTGGTGCCTCCCTACAGGGAAGCCCCAGGCCCAACTGTCCTTCCCCCACCTAGTGCCCTCACCAGCCCTGATGTCACCTTCAAGTGGATTAGGATTCACATGTTGGAAAATTGCCACTTTATCTTGATGTTTATTAGAAAACATTCTCTTCCTGCCTGTCAAAAGTCCACAGTACAGACACAAATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGCTGGACAGACAACCGGCTGAAGTGGAATGCTGAAGAATTTGGAAACATCAGTGTCCTGCGCCTCCCCCCGGACATGGTGTGGCTCCCAGAGATTGTGCTGGAGAACAAGTTGAGCCAAGCCCTCCCTGACCTCCCCTCTGTCACCCTGCCTCCTTTCCTTAAGCCTCCTCTGCCTCCCCCAACTCTGCCAGTCGTGAGTGGCCAGAGCTCACTATGGTTCTTGTCCCTGTCCCCCAGCAATGACGGCTCCTTCCAGATCTCCTACTCCTGCAACGTGCTTGTCTACCACTACGGCTTCGTGTACTGGCTGCCACCTGCCATCTTCCGCTCCTCCTGCCCCATCTCTGTCACCTATTTCCCCTTCGACTGGCAGAACTGCTCCCTCAAGTTCAGGTGTGCCCTTTTCTCCAGCCACCCCTCACCCCAAAGCACCCTGCCAGAGGCCAAAGAAGGTGACTGAAGCACCCTCAGACAGAGGCCCCTGCCCTGTCTGGATTAGTGCTGCCCTCCCCACAATGGTCCTCCCTTACCAGCCCTTCCCCACTCTGTGGCCCCAGCCACTGGCCGAGTGTCACTCTCTGCCCATTGCCCTCCCCAGTTCCCTCAAGTATACGGCCAAAGAGATCACCCTGAGCCTGAAACAGGATGCCAAGGAGAACCGCACCTACCCCGTGGAGTGGATCATCATTGATCCTGAAGGCTTCACAGGTGCTGGGAACAGCCGCCAGTGGGTGGGCAGGTCCCTCAGACACACACAGACACACTGGCCCTGTCCACCCCAGAGACACACACGTGCACACACACACACACTTAGGACACCAATACACAGCTCCTCACACACGCAGCTAGACACAGAAGGGCAGACACATATCCGCCCACAGAGGAGCACACAGACACTCACACTTCCTGAATGCAAAGCTATCCCAAAGGCAGAGAGAGAAGGTGCCAGGGCCCTCCCCATGCCTCTGCCCAGGCCCGGAAGTCATGCTTCTCCCACATGAGATGCCTGTGGCTGACAGGGGTTTAGTCTTTCCTGTGCCTGGTGAGCCCAGGGGTGTGGTTGGCATGAGGGCTGTGTTATCCTGATGGGGGTGTCTGCCACCCCTCCTGACATCCTCATCCCCGATCTGTACCCAGGCTCGGATCCTCCATGGGGCCTACCACTTGCCCTGTCCATCAGAAGGGACCCTGTCTCACTGTCTCAGGCTGGCACATCATGGCA
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Task1_train_5696
A sequence alteration has been identified in CHRND (cholinergic receptor nicotinic delta subunit) on Chromosome 2. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Congenital myasthenic syndrome 3B
CCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCCGCCTCCGAGCTGCGGGGAGTCCCAGCCTGGGATCTTTGCCTCATGTCCTTGGGCTCCTGCCCTGGCTGGCCCGTCCCCCACCGCCATGAGGTGTCAGATTGTGTTTCCGGCTGCCTCTTCCCGTTGACCCCCTCCTCCCCCAACACCTGTCCCCTCTCCCGCCCACCCTCATTCCACAGCCCTGTAGACAGGAGGGGCAGATGCACGTCCCAGTCAGAGGGATGGGATGGAGGGGCCAGTGCTGACACTGGGGCTGCTGGCTGCCCTGGCGGTGTGTGGTAAGGGAAGACACCCTCCCCACCCTGGGGTCCCCCGTGATGCTTACCCAGGCCCCACACCGCATGGCTCCTCACTCACTCCACTCCCACTCTGCCATCTCTCCCTGTGGGGGGCCGCCTTCTGGGGTCCCCACTCCCAGGGAGTGGTTGGGTTCCCCCCTGCTCATCCCAACCTCATGGTCCAGCAGGACCTCAGGGCAGCTTCCTTCCTGAGTCCCCTGCCCAGGGCCCCATTCAGTCCTTGTCGCTGACCCTCCCCAGGCAGCTGGGGGCTGAACGAGGAGGAGCGGCTGATCCGGCACCTGTTTCAAGAGAAGGGCTACAACAAGGAGCTCCGGCCCGTGGCACACAAAGAGGAGAGTGTGGACGTTGCCCTGGCCCTCACACTCTCCAACCTCATCTCCCTGGTGAGAGGCCCTCCGGTGCTGGGTTGGGAGGGAGGGCAGGGATGGCTTTCCAGTACCAGGATAGCCATGGAGGAAGCTAGAAGCCCCCACCTGGCCTATGGCCACTCCCTTCCTGGGAAACGTGCTGCGGCTGCTCTGTGCCCTGAGAGGCTGCTGTCCTGCCCCTCCAGTGTCAGCTCTGCGGTGTCCCCCAACCACACCCATAGCATGCCCCATCTGTGACACACTTCAGAGGCCACTGGTCCTCTCTGCTCCCTGGCGGCCTACCCACTCCTGACTGCGAGTGATCAGGGCCCAGATGCCACGGTTTCCCTGGGTGCCAATTGACAGTGGGTGAATGTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCTGATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGATGGTGTGGGCCTATAATCCCAGCTACTAGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGGTTGCAGTGAGCCAAGCTCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAATTGAGCAAGACCCTGGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGAATGTGTGCGGATAAAAGAATGATATGGCCCTGAAGGATGGCCCTACCGTCTAATTACAGAAAGAAGTTGAGGAGACCCTCACTACCAATGTGTGGATAGAGCACGTAAGAATGCCCCTCCCAGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGGGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCTTGGCTGACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTTGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACGCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAACAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAGAATGCCCCGCCCAGAGCCGGTGGGGTCGGGGAGGGAATGCAGGGCACCAGATTGCTTCTGCATGGAGATCCCGTCTGCCTTGGACACTGTTCTCCAGGAGGGGTTGGTGCCTCCCTACAGGGAAGCCCCAGGCCCAACTGTCCTTCCCCCACCTAGTGCCCTCACCAGCCCTGATGTCACCTTCAAGTGGATTAGGATTCACATGTTGGAAAATTGCCACTTTATCTTGATGTTTATTAGAAAACATTCTCTTCCTGCCTGTCAAAAGTCCACAGTACAGACACAAATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGCTGGACAGACAACCGGCTGAAGTGGAATGCTGAAGAATTTGGAAACATCAGTGTCCTGCGCCTCCCCCCGGACATGGTGTGGCTCCCAGAGATTGTGCTGGAGAACAAGTTGAGCCAAGCCCTCCCTGACCTCCCCTCTGTCACCCTGCCTCCTTTCCTTAAGCCTCCTCTGCCTCCCCCAACTCTGCCAGTCGTGAGTGGCCAGAGCTCACTATGGTTCTTGTCCCTGTCCCCCAGCAATGACGGCTCCTTCCAGATCTCCTACTCCTGCAACGTGCTTGTCTACCACTACGGCTTCGTGTACTGGCTGCCACCTGCCATCTTCCGCTCCTCCTGCCCCATCTCTGTCACCTATTTCCCCTTCGACTGGCAGAACTGCTCCCTCAAGTTCAGGTGTGCCCTTTTCTCCAGCCACCCCTCACCCCAAAGCACCCTGCCAGAGGCCAAAGAAGGTGACTGAAGCACCCTCAGACAGAGGCCCCTGCCCTGTCTGGATTAGTGCTGCCCTCCCCACAATGGTCCTCCCTTACCAGCCCTTCCCCACTCTGTGGCCCCAGCCACTGGCCGAGTGTCACTCTCTGCCCATTGCCCTCCCCAGTTCCCTCAAGTATACGGCCAAAGAGATCACCCTGAGCCTGAAACAGGATGCCAAGGAGAACCGCACCTACCCCGTGGAGTGGATCATCATTGATCCTGAAGGCTTCACAGGTGCTGGGAACAGCCGCCAGTGGGTGGGCAGGTCCCTCAGACACACACAGACACACTGGCCCTGTCCACCCCAGAGACACACACGTGCACACACACACACACTTAGGACACCAATACACAGCTCCTCACACACGCAGCTAGACACAGAAGGGCAGACACATATCCGCCCACAGAGGAGCACACAGACACTCACACTTCCTGAATGCAAAGCTATCCCAAAGGCAGAGAGAGAAGGTGCCAGGGCCCTCCCCATGCCTCTGCCCAGGCCCGGAAGTCATGCTTCTCCCACATGAGATGCCTGTGGCTGACAGGGGTTTAGTCTTTCCTGTGCCTGGTGAGCCCAGGGGTGTGGTTGGCATGAGGGCTGTGTTATCCTGATGGGGGTGTCTGCCACCCCTCCTGACATCCTCATCCCCGATCTGTACCCAGGCTCGGATCCTCCATGGGGCCTACCACTTGCCCTGTCCATCAGAAGGGACCCTGTCTCACTGTCTCAGGCTGGCACATCATGGCAGG
CCTGGCAGAAGGGGAGCCCGAGGGACCCTGGATGGATGTAGGGCAGGGGCCCGGGCTGGAGAGGAAGGGGCACCACCCACTCAACCCTCAGGTACCCCCCGCCAGGCAACCCTGAGCCATGTCTGGGCCCCCAGCCCCTGGGGAGGACCTACTGCTCCCAGGGGCTGAGAGGGGTTCGGGAGCATAATGACAAACTGTCGCTGCCCCAGTGGCTGGGTGTGTGTGGGTGGGATGGGGTGGGGGTCCTGGGCCCCCCGTGTCTTCCCAGGTTTACAATCAGAGAATCACAGCTGCTTTAATAAATGTTATTTATAATACACGGAAACAACTCTGGAGCTTTCTTGGGATGGGACCTGGTGGGTGGACATTCAGTCTCAGGGGTGGGGCCCAGGCAGGGCTGCCTCTGGAAGCAGTTGGCAAGGGTAACAGATGCTGGAAAGGGGCTGTAAGGCCCCTATCTGAGCCTATCTCCTGCCTCCTGAGAAGCAGCAGCAGCTGGCCTGCCTGTTGCCCCGCCCCCGTGCATGGCTGCCCAGCGCTGGCCCCAGTGCCCAGCGTCTCCGCCCAGCACCCCCCCGGCCCTCCCTCCCCACCCCCCGCCTCCGAGCTGCGGGGAGTCCCAGCCTGGGATCTTTGCCTCATGTCCTTGGGCTCCTGCCCTGGCTGGCCCGTCCCCCACCGCCATGAGGTGTCAGATTGTGTTTCCGGCTGCCTCTTCCCGTTGACCCCCTCCTCCCCCAACACCTGTCCCCTCTCCCGCCCACCCTCATTCCACAGCCCTGTAGACAGGAGGGGCAGATGCACGTCCCAGTCAGAGGGATGGGATGGAGGGGCCAGTGCTGACACTGGGGCTGCTGGCTGCCCTGGCGGTGTGTGGTAAGGGAAGACACCCTCCCCACCCTGGGGTCCCCCGTGATGCTTACCCAGGCCCCACACCGCATGGCTCCTCACTCACTCCACTCCCACTCTGCCATCTCTCCCTGTGGGGGGCCGCCTTCTGGGGTCCCCACTCCCAGGGAGTGGTTGGGTTCCCCCCTGCTCATCCCAACCTCATGGTCCAGCAGGACCTCAGGGCAGCTTCCTTCCTGAGTCCCCTGCCCAGGGCCCCATTCAGTCCTTGTCGCTGACCCTCCCCAGGCAGCTGGGGGCTGAACGAGGAGGAGCGGCTGATCCGGCACCTGTTTCAAGAGAAGGGCTACAACAAGGAGCTCCGGCCCGTGGCACACAAAGAGGAGAGTGTGGACGTTGCCCTGGCCCTCACACTCTCCAACCTCATCTCCCTGGTGAGAGGCCCTCCGGTGCTGGGTTGGGAGGGAGGGCAGGGATGGCTTTCCAGTACCAGGATAGCCATGGAGGAAGCTAGAAGCCCCCACCTGGCCTATGGCCACTCCCTTCCTGGGAAACGTGCTGCGGCTGCTCTGTGCCCTGAGAGGCTGCTGTCCTGCCCCTCCAGTGTCAGCTCTGCGGTGTCCCCCAACCACACCCATAGCATGCCCCATCTGTGACACACTTCAGAGGCCACTGGTCCTCTCTGCTCCCTGGCGGCCTACCCACTCCTGACTGCGAGTGATCAGGGCCCAGATGCCACGGTTTCCCTGGGTGCCAATTGACAGTGGGTGAATGTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCTGATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGATGGTGTGGGCCTATAATCCCAGCTACTAGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGGTTGCAGTGAGCCAAGCTCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAATTGAGCAAGACCCTGGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGAATGTGTGCGGATAAAAGAATGATATGGCCCTGAAGGATGGCCCTACCGTCTAATTACAGAAAGAAGTTGAGGAGACCCTCACTACCAATGTGTGGATAAAGCACGTAAGAATGCCCCTCCCAGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGGGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCTTGGCTGACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTTGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACGCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAACAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAGAATGCCCCGCCCAGAGCCGGTGGGGTCGGGGAGGGAATGCAGGGCACCAGATTGCTTCTGCATGGAGATCCCGTCTGCCTTGGACACTGTTCTCCAGGAGGGGTTGGTGCCTCCCTACAGGGAAGCCCCAGGCCCAACTGTCCTTCCCCCACCTAGTGCCCTCACCAGCCCTGATGTCACCTTCAAGTGGATTAGGATTCACATGTTGGAAAATTGCCACTTTATCTTGATGTTTATTAGAAAACATTCTCTTCCTGCCTGTCAAAAGTCCACAGTACAGACACAAATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGCTGGACAGACAACCGGCTGAAGTGGAATGCTGAAGAATTTGGAAACATCAGTGTCCTGCGCCTCCCCCCGGACATGGTGTGGCTCCCAGAGATTGTGCTGGAGAACAAGTTGAGCCAAGCCCTCCCTGACCTCCCCTCTGTCACCCTGCCTCCTTTCCTTAAGCCTCCTCTGCCTCCCCCAACTCTGCCAGTCGTGAGTGGCCAGAGCTCACTATGGTTCTTGTCCCTGTCCCCCAGCAATGACGGCTCCTTCCAGATCTCCTACTCCTGCAACGTGCTTGTCTACCACTACGGCTTCGTGTACTGGCTGCCACCTGCCATCTTCCGCTCCTCCTGCCCCATCTCTGTCACCTATTTCCCCTTCGACTGGCAGAACTGCTCCCTCAAGTTCAGGTGTGCCCTTTTCTCCAGCCACCCCTCACCCCAAAGCACCCTGCCAGAGGCCAAAGAAGGTGACTGAAGCACCCTCAGACAGAGGCCCCTGCCCTGTCTGGATTAGTGCTGCCCTCCCCACAATGGTCCTCCCTTACCAGCCCTTCCCCACTCTGTGGCCCCAGCCACTGGCCGAGTGTCACTCTCTGCCCATTGCCCTCCCCAGTTCCCTCAAGTATACGGCCAAAGAGATCACCCTGAGCCTGAAACAGGATGCCAAGGAGAACCGCACCTACCCCGTGGAGTGGATCATCATTGATCCTGAAGGCTTCACAGGTGCTGGGAACAGCCGCCAGTGGGTGGGCAGGTCCCTCAGACACACACAGACACACTGGCCCTGTCCACCCCAGAGACACACACGTGCACACACACACACACTTAGGACACCAATACACAGCTCCTCACACACGCAGCTAGACACAGAAGGGCAGACACATATCCGCCCACAGAGGAGCACACAGACACTCACACTTCCTGAATGCAAAGCTATCCCAAAGGCAGAGAGAGAAGGTGCCAGGGCCCTCCCCATGCCTCTGCCCAGGCCCGGAAGTCATGCTTCTCCCACATGAGATGCCTGTGGCTGACAGGGGTTTAGTCTTTCCTGTGCCTGGTGAGCCCAGGGGTGTGGTTGGCATGAGGGCTGTGTTATCCTGATGGGGGTGTCTGCCACCCCTCCTGACATCCTCATCCCCGATCTGTACCCAGGCTCGGATCCTCCATGGGGCCTACCACTTGCCCTGTCCATCAGAAGGGACCCTGTCTCACTGTCTCAGGCTGGCACATCATGGCAGG
Task1_train_5697
This alteration in CHRND (cholinergic receptor nicotinic delta subunit) on Chromosome 2 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Lethal multiple pterygium syndrome
CCCTGGCGGTGTGTGGTAAGGGAAGACACCCTCCCCACCCTGGGGTCCCCCGTGATGCTTACCCAGGCCCCACACCGCATGGCTCCTCACTCACTCCACTCCCACTCTGCCATCTCTCCCTGTGGGGGGCCGCCTTCTGGGGTCCCCACTCCCAGGGAGTGGTTGGGTTCCCCCCTGCTCATCCCAACCTCATGGTCCAGCAGGACCTCAGGGCAGCTTCCTTCCTGAGTCCCCTGCCCAGGGCCCCATTCAGTCCTTGTCGCTGACCCTCCCCAGGCAGCTGGGGGCTGAACGAGGAGGAGCGGCTGATCCGGCACCTGTTTCAAGAGAAGGGCTACAACAAGGAGCTCCGGCCCGTGGCACACAAAGAGGAGAGTGTGGACGTTGCCCTGGCCCTCACACTCTCCAACCTCATCTCCCTGGTGAGAGGCCCTCCGGTGCTGGGTTGGGAGGGAGGGCAGGGATGGCTTTCCAGTACCAGGATAGCCATGGAGGAAGCTAGAAGCCCCCACCTGGCCTATGGCCACTCCCTTCCTGGGAAACGTGCTGCGGCTGCTCTGTGCCCTGAGAGGCTGCTGTCCTGCCCCTCCAGTGTCAGCTCTGCGGTGTCCCCCAACCACACCCATAGCATGCCCCATCTGTGACACACTTCAGAGGCCACTGGTCCTCTCTGCTCCCTGGCGGCCTACCCACTCCTGACTGCGAGTGATCAGGGCCCAGATGCCACGGTTTCCCTGGGTGCCAATTGACAGTGGGTGAATGTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCTGATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGATGGTGTGGGCCTATAATCCCAGCTACTAGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGGTTGCAGTGAGCCAAGCTCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAATTGAGCAAGACCCTGGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGAATGTGTGCGGATAAAAGAATGATATGGCCCTGAAGGATGGCCCTACCGTCTAATTACAGAAAGAAGTTGAGGAGACCCTCACTACCAATGTGTGGATAGAGCACGTAAGAATGCCCCTCCCAGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGGGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCTTGGCTGACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTTGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACGCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAACAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAGAATGCCCCGCCCAGAGCCGGTGGGGTCGGGGAGGGAATGCAGGGCACCAGATTGCTTCTGCATGGAGATCCCGTCTGCCTTGGACACTGTTCTCCAGGAGGGGTTGGTGCCTCCCTACAGGGAAGCCCCAGGCCCAACTGTCCTTCCCCCACCTAGTGCCCTCACCAGCCCTGATGTCACCTTCAAGTGGATTAGGATTCACATGTTGGAAAATTGCCACTTTATCTTGATGTTTATTAGAAAACATTCTCTTCCTGCCTGTCAAAAGTCCACAGTACAGACACAAATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGCTGGACAGACAACCGGCTGAAGTGGAATGCTGAAGAATTTGGAAACATCAGTGTCCTGCGCCTCCCCCCGGACATGGTGTGGCTCCCAGAGATTGTGCTGGAGAACAAGTTGAGCCAAGCCCTCCCTGACCTCCCCTCTGTCACCCTGCCTCCTTTCCTTAAGCCTCCTCTGCCTCCCCCAACTCTGCCAGTCGTGAGTGGCCAGAGCTCACTATGGTTCTTGTCCCTGTCCCCCAGCAATGACGGCTCCTTCCAGATCTCCTACTCCTGCAACGTGCTTGTCTACCACTACGGCTTCGTGTACTGGCTGCCACCTGCCATCTTCCGCTCCTCCTGCCCCATCTCTGTCACCTATTTCCCCTTCGACTGGCAGAACTGCTCCCTCAAGTTCAGGTGTGCCCTTTTCTCCAGCCACCCCTCACCCCAAAGCACCCTGCCAGAGGCCAAAGAAGGTGACTGAAGCACCCTCAGACAGAGGCCCCTGCCCTGTCTGGATTAGTGCTGCCCTCCCCACAATGGTCCTCCCTTACCAGCCCTTCCCCACTCTGTGGCCCCAGCCACTGGCCGAGTGTCACTCTCTGCCCATTGCCCTCCCCAGTTCCCTCAAGTATACGGCCAAAGAGATCACCCTGAGCCTGAAACAGGATGCCAAGGAGAACCGCACCTACCCCGTGGAGTGGATCATCATTGATCCTGAAGGCTTCACAGGTGCTGGGAACAGCCGCCAGTGGGTGGGCAGGTCCCTCAGACACACACAGACACACTGGCCCTGTCCACCCCAGAGACACACACGTGCACACACACACACACTTAGGACACCAATACACAGCTCCTCACACACGCAGCTAGACACAGAAGGGCAGACACATATCCGCCCACAGAGGAGCACACAGACACTCACACTTCCTGAATGCAAAGCTATCCCAAAGGCAGAGAGAGAAGGTGCCAGGGCCCTCCCCATGCCTCTGCCCAGGCCCGGAAGTCATGCTTCTCCCACATGAGATGCCTGTGGCTGACAGGGGTTTAGTCTTTCCTGTGCCTGGTGAGCCCAGGGGTGTGGTTGGCATGAGGGCTGTGTTATCCTGATGGGGGTGTCTGCCACCCCTCCTGACATCCTCATCCCCGATCTGTACCCAGGCTCGGATCCTCCATGGGGCCTACCACTTGCCCTGTCCATCAGAAGGGACCCTGTCTCACTGTCTCAGGCTGGCACATCATGGCAGGGATAGTTTTACTGTCACTGGCTCATTATCCCCAAGGCCCAGGCCGAGGAGTGGCTCAATTAATGTCCAGGAGGCTTTTCTTTGTTACTCAGGAAGACAGGCTCAATGTCTGAGAGCATTTGTTTGACTTGGTGTCTTAATCTGCAATACCTGTTTTTGGCTCGTGTATCTTTTGAGCCAAAAGATACTCCTTATTTGAGTCCTGTATGGCCTCAGCTTCTATTTTTTCCGAAAAGATAAAAAAGAAATCAGTCACAGAGGAAGATTTCCCCTCACAGATGGAAACTTCCATCCCGACCCCCCAGGGAACGACACCCACCAACGGGACCCCGTAGACAGCCCATCTGCGTCTCTGGACTGGCTTGCCCTGCCCAGCCCCTCATTCTGTCCCCAGGCCCTGCCTAGCCCCCTTGGCCTGGCCTGACCCTAAGATGTCCATGTGCCGCCCTCAGAGAACGGGGAGTGGGAGATAGTCCACCGGCCGGCCAGGGTCAACGTGGACCCCAGAGCCCCTCTGGACAGCCCCAGCCGCCAGGACATCACCTTCTACCTCATCATCCGCCGCAAGCCCCTCTTCTACATCATCAACATCCTGGTGCCCTGCGTGCTCATCTCCTTCATGGTCAACCTGGTCTTCTACCTACCGGCTGACAGTGAGCCTCCAGGCCCCGTCCCCTGCTCCCCCTCCCCAAGCCCACCTGAGCACAGCCAGCCCCAGCCCTGCCCCCTCACTTCCTCCTGGGAGCCACCTGGGGTCTCCATTCCTGGAGCTCCCTGCCTGGATCCAGGTGTGAGGGCCAGGTGGCCACCCAGAGGGAGGGCTGTATGATTCTGGGCAACATCCCCAAATGGACAGGGCAGG
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Task1_train_5698
Given this context: Chromosome 2, gene CHRND (cholinergic receptor nicotinic delta subunit) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Lethal multiple pterygium syndrome
AATCGTCTATGCTCACAGTAGAAATAATGCTCCCTTAGTTGTGCAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGCTGGACAGACAACCGGCTGAAGTGGAATGCTGAAGAATTTGGAAACATCAGTGTCCTGCGCCTCCCCCCGGACATGGTGTGGCTCCCAGAGATTGTGCTGGAGAACAAGTTGAGCCAAGCCCTCCCTGACCTCCCCTCTGTCACCCTGCCTCCTTTCCTTAAGCCTCCTCTGCCTCCCCCAACTCTGCCAGTCGTGAGTGGCCAGAGCTCACTATGGTTCTTGTCCCTGTCCCCCAGCAATGACGGCTCCTTCCAGATCTCCTACTCCTGCAACGTGCTTGTCTACCACTACGGCTTCGTGTACTGGCTGCCACCTGCCATCTTCCGCTCCTCCTGCCCCATCTCTGTCACCTATTTCCCCTTCGACTGGCAGAACTGCTCCCTCAAGTTCAGGTGTGCCCTTTTCTCCAGCCACCCCTCACCCCAAAGCACCCTGCCAGAGGCCAAAGAAGGTGACTGAAGCACCCTCAGACAGAGGCCCCTGCCCTGTCTGGATTAGTGCTGCCCTCCCCACAATGGTCCTCCCTTACCAGCCCTTCCCCACTCTGTGGCCCCAGCCACTGGCCGAGTGTCACTCTCTGCCCATTGCCCTCCCCAGTTCCCTCAAGTATACGGCCAAAGAGATCACCCTGAGCCTGAAACAGGATGCCAAGGAGAACCGCACCTACCCCGTGGAGTGGATCATCATTGATCCTGAAGGCTTCACAGGTGCTGGGAACAGCCGCCAGTGGGTGGGCAGGTCCCTCAGACACACACAGACACACTGGCCCTGTCCACCCCAGAGACACACACGTGCACACACACACACACTTAGGACACCAATACACAGCTCCTCACACACGCAGCTAGACACAGAAGGGCAGACACATATCCGCCCACAGAGGAGCACACAGACACTCACACTTCCTGAATGCAAAGCTATCCCAAAGGCAGAGAGAGAAGGTGCCAGGGCCCTCCCCATGCCTCTGCCCAGGCCCGGAAGTCATGCTTCTCCCACATGAGATGCCTGTGGCTGACAGGGGTTTAGTCTTTCCTGTGCCTGGTGAGCCCAGGGGTGTGGTTGGCATGAGGGCTGTGTTATCCTGATGGGGGTGTCTGCCACCCCTCCTGACATCCTCATCCCCGATCTGTACCCAGGCTCGGATCCTCCATGGGGCCTACCACTTGCCCTGTCCATCAGAAGGGACCCTGTCTCACTGTCTCAGGCTGGCACATCATGGCAGGGATAGTTTTACTGTCACTGGCTCATTATCCCCAAGGCCCAGGCCGAGGAGTGGCTCAATTAATGTCCAGGAGGCTTTTCTTTGTTACTCAGGAAGACAGGCTCAATGTCTGAGAGCATTTGTTTGACTTGGTGTCTTAATCTGCAATACCTGTTTTTGGCTCGTGTATCTTTTGAGCCAAAAGATACTCCTTATTTGAGTCCTGTATGGCCTCAGCTTCTATTTTTTCCGAAAAGATAAAAAAGAAATCAGTCACAGAGGAAGATTTCCCCTCACAGATGGAAACTTCCATCCCGACCCCCCAGGGAACGACACCCACCAACGGGACCCCGTAGACAGCCCATCTGCGTCTCTGGACTGGCTTGCCCTGCCCAGCCCCTCATTCTGTCCCCAGGCCCTGCCTAGCCCCCTTGGCCTGGCCTGACCCTAAGATGTCCATGTGCCGCCCTCAGAGAACGGGGAGTGGGAGATAGTCCACCGGCCGGCCAGGGTCAACGTGGACCCCAGAGCCCCTCTGGACAGCCCCAGCCGCCAGGACATCACCTTCTACCTCATCATCCGCCGCAAGCCCCTCTTCTACATCATCAACATCCTGGTGCCCTGCGTGCTCATCTCCTTCATGGTCAACCTGGTCTTCTACCTACCGGCTGACAGTGAGCCTCCAGGCCCCGTCCCCTGCTCCCCCTCCCCAAGCCCACCTGAGCACAGCCAGCCCCAGCCCTGCCCCCTCACTTCCTCCTGGGAGCCACCTGGGGTCTCCATTCCTGGAGCTCCCTGCCTGGATCCAGGTGTGAGGGCCAGGTGGCCACCCAGAGGGAGGGCTGTATGATTCTGGGCAACATCCCCAAATGGACAGGGCAGGGCATCTCCAAGATGCTACTTCCCACGGACTCTCAGAAGAACTGCTAAACTGTCCCTCTGTCAGGGCAGAGACCAAGTCCCTCACGGTCACCAGTGTGTGACCGTGGGCCTGGCACACAGGAGGCCCTCAACTGTTGAACCAGTGGGTGAATAACAGGGTCTCTAGGACAGTAGGGTGTGAGGCAGAAAACCCATCTATGCTCACCTGACTCTATGAGGCAGTGGTTTACAAGTTCAGAGTATTTACTATGAGCAGGGCATAGTGAGTCCCAGGGTCAAAGGCCACCCAGCCCCTGCCCCCGGCAGGACTTGAGGAGGGAGAAGTGGGGCACCTTCCATCTGCAGTGGGGTTGGGAGGGCTTCTAGAGGAGGTGGAGTTTGAATGGACTTGAGCAGGATTGGGTGGGGCTACCACAGGCAGGAGGAGCAATGCCAATAAGGAGGGGGCCAGGCAGGGGCTGAAGGGACCTCAGCAGGGGAGCCCCCCTTCCCGCCCTTGCCATCACGTGCAGGAGCTCAGGTGGGAAGAGCAAGACAGCACTGGGCTGGGGTCTCTGAGTGAGGGGCTGGGAGTTGAGGTGTTATCCTGGTTCTACAAGGACAACCTGGCACTTTCTAAGCGGGGAGTAACGCACGCAGGTCTGTGCTCCAGGAGGGTTCAGTGGCGTGGGTGGGTTGTGACAGCTGATTTTCATGAGCACTTACCCAGTGCCAGGCAGAGTGATGCGTGTTAAACACACTCTGTCACCACATTTAACAGTTGAGAAAACTGATGCACAGAGAGGTTGGGCTACTTGCCCAAGGTCACCCAGCTAGTAAGTGGCAGAGCTGATATTTGCACCCAGGCACTCTAGCTCCATAACCCGTAATTTTCATCAGGGTATGATGGTACTACAGAGGTGCCAGGGGCCACAGCGGGACCCTCTAGGACCGGTGCCCCAAGGTCACAGCTGGACCCTCTAGGACCGGTGCCCCAAGGTCACAGCTAAGTCTGGCTTCCCCAGGTGGTGAGAAGACATCAGTGGCCATCTCGGTGCTCCTGGCTCAGTCTGTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGCGTCTGCCTGCCACATCCATGGCCATCCCCCTTATCGGCAAGTGAGTGACGCTCAAGCCCGGCCTCACCCTGCTTGCCAGCCCAGCCCTGGGAGCTCCAAGCTGAGTGTTTGCCCACAGGTTCCTGCTCTTCGGCATGGTGCTGGTCACCATGGTTGTGGTGATCTGTGTCATCGTGCTCAACATCCACTTCCGAACACCCAGCACCCATGTGCTGTCTGAGGGGGTCAAGAAGGTGAGTACTTGGCCCGGCGCAAAAGCTCACCACTGTAATCCTGGCATTTCAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATCTCTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGACACCCCTGTCTCTATAAACAATCAAAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGCGCATGCTTGTATTCCCAGCTACTCAAGAGGCTGAGGTGGATCACTTGAGCCTGGGAGGTCAAAGCTGCAGTGAGCTGTGATCGCGCCAGGGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATGAGCACTCTCAATAGCCAAAAGCTGGAGACTAAGCCAGGTACAGTGGCTCACACCTGGAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCCCTGGAACCCAGGAGTTGGAGGTTGCAATGTACTATGATCACAGTTGCACCCCAGTCTGGGC
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Task1_train_5699
A variant was discovered in gene CHRND (cholinergic receptor nicotinic delta subunit), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Congenital myasthenic syndrome 3B
CAGTGAGCATCCTGCACAGCTGTCCATGACAGACCTGAATCCGCACTCTGTACCTGCCTTCCCCAAACCTCTTTTGTCACAGCTCTCAGACCCTGTTCAGTCTTCTCTCAGGGAAGTGGGGGGAGCCAGGAGCCTGGATGGCTGCAGAGTGCACTGGTGACATGCCTTTGGGATTCCAGGGCTGGACAGACAACCGGCTGAAGTGGAATGCTGAAGAATTTGGAAACATCAGTGTCCTGCGCCTCCCCCCGGACATGGTGTGGCTCCCAGAGATTGTGCTGGAGAACAAGTTGAGCCAAGCCCTCCCTGACCTCCCCTCTGTCACCCTGCCTCCTTTCCTTAAGCCTCCTCTGCCTCCCCCAACTCTGCCAGTCGTGAGTGGCCAGAGCTCACTATGGTTCTTGTCCCTGTCCCCCAGCAATGACGGCTCCTTCCAGATCTCCTACTCCTGCAACGTGCTTGTCTACCACTACGGCTTCGTGTACTGGCTGCCACCTGCCATCTTCCGCTCCTCCTGCCCCATCTCTGTCACCTATTTCCCCTTCGACTGGCAGAACTGCTCCCTCAAGTTCAGGTGTGCCCTTTTCTCCAGCCACCCCTCACCCCAAAGCACCCTGCCAGAGGCCAAAGAAGGTGACTGAAGCACCCTCAGACAGAGGCCCCTGCCCTGTCTGGATTAGTGCTGCCCTCCCCACAATGGTCCTCCCTTACCAGCCCTTCCCCACTCTGTGGCCCCAGCCACTGGCCGAGTGTCACTCTCTGCCCATTGCCCTCCCCAGTTCCCTCAAGTATACGGCCAAAGAGATCACCCTGAGCCTGAAACAGGATGCCAAGGAGAACCGCACCTACCCCGTGGAGTGGATCATCATTGATCCTGAAGGCTTCACAGGTGCTGGGAACAGCCGCCAGTGGGTGGGCAGGTCCCTCAGACACACACAGACACACTGGCCCTGTCCACCCCAGAGACACACACGTGCACACACACACACACTTAGGACACCAATACACAGCTCCTCACACACGCAGCTAGACACAGAAGGGCAGACACATATCCGCCCACAGAGGAGCACACAGACACTCACACTTCCTGAATGCAAAGCTATCCCAAAGGCAGAGAGAGAAGGTGCCAGGGCCCTCCCCATGCCTCTGCCCAGGCCCGGAAGTCATGCTTCTCCCACATGAGATGCCTGTGGCTGACAGGGGTTTAGTCTTTCCTGTGCCTGGTGAGCCCAGGGGTGTGGTTGGCATGAGGGCTGTGTTATCCTGATGGGGGTGTCTGCCACCCCTCCTGACATCCTCATCCCCGATCTGTACCCAGGCTCGGATCCTCCATGGGGCCTACCACTTGCCCTGTCCATCAGAAGGGACCCTGTCTCACTGTCTCAGGCTGGCACATCATGGCAGGGATAGTTTTACTGTCACTGGCTCATTATCCCCAAGGCCCAGGCCGAGGAGTGGCTCAATTAATGTCCAGGAGGCTTTTCTTTGTTACTCAGGAAGACAGGCTCAATGTCTGAGAGCATTTGTTTGACTTGGTGTCTTAATCTGCAATACCTGTTTTTGGCTCGTGTATCTTTTGAGCCAAAAGATACTCCTTATTTGAGTCCTGTATGGCCTCAGCTTCTATTTTTTCCGAAAAGATAAAAAAGAAATCAGTCACAGAGGAAGATTTCCCCTCACAGATGGAAACTTCCATCCCGACCCCCCAGGGAACGACACCCACCAACGGGACCCCGTAGACAGCCCATCTGCGTCTCTGGACTGGCTTGCCCTGCCCAGCCCCTCATTCTGTCCCCAGGCCCTGCCTAGCCCCCTTGGCCTGGCCTGACCCTAAGATGTCCATGTGCCGCCCTCAGAGAACGGGGAGTGGGAGATAGTCCACCGGCCGGCCAGGGTCAACGTGGACCCCAGAGCCCCTCTGGACAGCCCCAGCCGCCAGGACATCACCTTCTACCTCATCATCCGCCGCAAGCCCCTCTTCTACATCATCAACATCCTGGTGCCCTGCGTGCTCATCTCCTTCATGGTCAACCTGGTCTTCTACCTACCGGCTGACAGTGAGCCTCCAGGCCCCGTCCCCTGCTCCCCCTCCCCAAGCCCACCTGAGCACAGCCAGCCCCAGCCCTGCCCCCTCACTTCCTCCTGGGAGCCACCTGGGGTCTCCATTCCTGGAGCTCCCTGCCTGGATCCAGGTGTGAGGGCCAGGTGGCCACCCAGAGGGAGGGCTGTATGATTCTGGGCAACATCCCCAAATGGACAGGGCAGGGCATCTCCAAGATGCTACTTCCCACGGACTCTCAGAAGAACTGCTAAACTGTCCCTCTGTCAGGGCAGAGACCAAGTCCCTCACGGTCACCAGTGTGTGACCGTGGGCCTGGCACACAGGAGGCCCTCAACTGTTGAACCAGTGGGTGAATAACAGGGTCTCTAGGACAGTAGGGTGTGAGGCAGAAAACCCATCTATGCTCACCTGACTCTATGAGGCAGTGGTTTACAAGTTCAGAGTATTTACTATGAGCAGGGCATAGTGAGTCCCAGGGTCAAAGGCCACCCAGCCCCTGCCCCCGGCAGGACTTGAGGAGGGAGAAGTGGGGCACCTTCCATCTGCAGTGGGGTTGGGAGGGCTTCTAGAGGAGGTGGAGTTTGAATGGACTTGAGCAGGATTGGGTGGGGCTACCACAGGCAGGAGGAGCAATGCCAATAAGGAGGGGGCCAGGCAGGGGCTGAAGGGACCTCAGCAGGGGAGCCCCCCTTCCCGCCCTTGCCATCACGTGCAGGAGCTCAGGTGGGAAGAGCAAGACAGCACTGGGCTGGGGTCTCTGAGTGAGGGGCTGGGAGTTGAGGTGTTATCCTGGTTCTACAAGGACAACCTGGCACTTTCTAAGCGGGGAGTAACGCACGCAGGTCTGTGCTCCAGGAGGGTTCAGTGGCGTGGGTGGGTTGTGACAGCTGATTTTCATGAGCACTTACCCAGTGCCAGGCAGAGTGATGCGTGTTAAACACACTCTGTCACCACATTTAACAGTTGAGAAAACTGATGCACAGAGAGGTTGGGCTACTTGCCCAAGGTCACCCAGCTAGTAAGTGGCAGAGCTGATATTTGCACCCAGGCACTCTAGCTCCATAACCCGTAATTTTCATCAGGGTATGATGGTACTACAGAGGTGCCAGGGGCCACAGCGGGACCCTCTAGGACCGGTGCCCCAAGGTCACAGCTGGACCCTCTAGGACCGGTGCCCCAAGGTCACAGCTAAGTCTGGCTTCCCCAGGTGGTGAGAAGACATCAGTGGCCATCTCGGTGCTCCTGGCTCAGTCTGTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGCGTCTGCCTGCCACATCCATGGCCATCCCCCTTATCGGCAAGTGAGTGACGCTCAAGCCCGGCCTCACCCTGCTTGCCAGCCCAGCCCTGGGAGCTCCAAGCTGAGTGTTTGCCCACAGGTTCCTGCTCTTCGGCATGGTGCTGGTCACCATGGTTGTGGTGATCTGTGTCATCGTGCTCAACATCCACTTCCGAACACCCAGCACCCATGTGCTGTCTGAGGGGGTCAAGAAGGTGAGTACTTGGCCCGGCGCAAAAGCTCACCACTGTAATCCTGGCATTTCAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATCTCTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGACACCCCTGTCTCTATAAACAATCAAAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGCGCATGCTTGTATTCCCAGCTACTCAAGAGGCTGAGGTGGATCACTTGAGCCTGGGAGGTCAAAGCTGCAGTGAGCTGTGATCGCGCCAGGGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATGAGCACTCTCAATAGCCAAAAGCTGGAGACTAAGCCAGGTACAGTGGCTCACACCTGGAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCCCTGGAACCCAGGAGTTGGAGGTTGCAATGTACTATGATCACAGTTGCACCCCAGTCTGGGCAACAGATCGAGACCCCATCTCTAAAAAAATAAAATAAAATGAA
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