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Enzo Reis de Oliveira
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1
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2af5b7d
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app.py
CHANGED
@@ -1,46 +1,54 @@
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import os
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import sys
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# 1) Ajusta o path para o inference do SMI-TED **antes** de importar anything
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BASE_DIR = os.path.dirname(__file__)
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INFERENCE_DIR = os.path.join(BASE_DIR, "smi-ted", "inference")
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sys.path.append(INFERENCE_DIR)
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# Agora o python já sabe onde achar smi_ted_light
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import tempfile
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import pandas as pd
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import gradio as gr
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-
from smi_ted_light.load import load_smi_ted
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# 2) Caminho onde estão pesos e vocabulário
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MODEL_DIR = os.path.join("smi-ted", "inference", "smi_ted_light")
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model = load_smi_ted(
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folder=MODEL_DIR,
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ckpt_filename="smi-ted-Light_40.pt",
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21 |
vocab_filename="bert_vocab_curated.txt",
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22 |
)
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24 |
def gerar_embedding(smiles: str):
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25 |
smiles = smiles.strip()
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26 |
if not smiles:
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-
return {"erro": "digite uma sequência SMILES primeiro"}
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28 |
try:
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30 |
-
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31 |
-
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32 |
-
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv", prefix="emb_")
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33 |
-
df.to_csv(tmp.name, index=False)
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34 |
-
tmp.close()
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35 |
-
return emb, tmp.name
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except Exception as e:
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37 |
-
return {"erro": str(e)}
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demo = gr.Interface(
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40 |
fn=gerar_embedding,
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41 |
inputs=gr.Textbox(label="SMILES", placeholder="Ex.: CCO"),
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42 |
-
outputs=
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title="SMI
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)
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45 |
if __name__ == "__main__":
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46 |
-
demo.launch(
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1 |
+
import os, sys
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2 |
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3 |
BASE_DIR = os.path.dirname(__file__)
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4 |
INFERENCE_DIR = os.path.join(BASE_DIR, "smi-ted", "inference")
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5 |
+
sys.path.append(INFERENCE_DIR)
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6 |
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7 |
import gradio as gr
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8 |
+
from smi_ted_light.load import load_smi_ted
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9 |
+
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10 |
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11 |
# 2) Caminho onde estão pesos e vocabulário
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12 |
MODEL_DIR = os.path.join("smi-ted", "inference", "smi_ted_light")
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+
# 3) Carrega o modelo SMI‑TED (Light)
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15 |
+
# Se você renomeou o .pt ou o vocab, ajuste aqui.
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16 |
model = load_smi_ted(
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17 |
folder=MODEL_DIR,
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18 |
ckpt_filename="smi-ted-Light_40.pt",
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19 |
vocab_filename="bert_vocab_curated.txt",
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20 |
)
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22 |
+
# 4) Função utilizada pela interface
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def gerar_embedding(smiles: str):
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+
"""
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+
Recebe uma string SMILES e devolve o embedding (lista de 768 floats).
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26 |
+
Em caso de erro, devolve um dicionário com a mensagem.
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27 |
+
"""
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28 |
smiles = smiles.strip()
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29 |
if not smiles:
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30 |
+
return {"erro": "digite uma sequência SMILES primeiro"}
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31 |
+
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try:
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33 |
+
# model.encode devolve tensor shape (1, 768) quando return_torch=True
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34 |
+
vetor_torch = model.encode(smiles, return_torch=True)[0]
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35 |
+
return vetor_torch.tolist() # JSON‑serializável
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except Exception as e:
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37 |
+
return {"erro": str(e)}
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+
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40 |
+
# 5) Define a interface Gradio
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41 |
demo = gr.Interface(
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42 |
fn=gerar_embedding,
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43 |
inputs=gr.Textbox(label="SMILES", placeholder="Ex.: CCO"),
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44 |
+
outputs=gr.JSON(label="Embedding (lista de floats)"),
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45 |
+
title="SMI‑TED Embedding Generator",
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46 |
+
description=(
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47 |
+
"Cole uma sequência SMILES e receba o embedding gerado pelo modelo "
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48 |
+
"SMI‑TED Light treinado pela IBM Research."
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49 |
+
),
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50 |
)
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51 |
+
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+
# 6) Roda localmente ou no Hugging Face Space
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53 |
if __name__ == "__main__":
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54 |
+
demo.launch()
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