id
stringlengths 1
5
| tokens
sequence | ner_tags
sequence |
---|---|---|
2001 | [
"A",
"500",
"-",
"bp",
"fragment",
"encompassing",
"this",
"hypersensitive",
"site",
"(",
"nt",
"4481",
"to",
"4982",
")",
"exhibited",
"transcription",
"-",
"enhancing",
"activity",
"(",
"two",
"-",
"to",
"threefold",
")",
"when",
"it",
"was",
"cloned",
"in",
"its",
"natural",
"position",
"with",
"respect",
"to",
"the",
"HIV",
"-",
"1",
"promoter",
"after",
"transient",
"transfection",
"in",
"U937",
"and",
"CEM",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2002 | [
"Using",
"in",
"vitro",
"footprinting",
"and",
"gel",
"shift",
"assays",
",",
"we",
"have",
"identified",
"four",
"distinct",
"binding",
"sites",
"for",
"nuclear",
"proteins",
"within",
"this",
"positive",
"regulatory",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
2003 | [
"Site",
"B",
"(",
"nt",
"4519",
"to",
"4545",
")",
"specifically",
"bound",
"four",
"distinct",
"nuclear",
"protein",
"complexes",
":",
"a",
"ubiquitous",
"factor",
",",
"a",
"T",
"-",
"cell",
"-",
"specific",
"factor",
",",
"a",
"B",
"-",
"cell",
"-",
"specific",
"factor",
",",
"and",
"the",
"monocyte",
"/",
"macrophage",
"-",
"and",
"B",
"-",
"cell",
"-",
"specific",
"transcription",
"factor",
"PU",
".",
"1",
"/",
"Spi",
"-",
"1",
"."
] | [
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2004 | [
"In",
"most",
"HIV",
"-",
"1",
"isolates",
"in",
"which",
"this",
"PU",
"box",
"was",
"not",
"conserved",
",",
"it",
"was",
"replaced",
"by",
"a",
"binding",
"site",
"for",
"the",
"related",
"factor",
"Ets1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
2005 | [
"Factors",
"binding",
"to",
"site",
"C",
"(",
"nt",
"4681",
"to",
"4701",
")",
"had",
"a",
"DNA",
"-",
"binding",
"specificity",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"factors",
"binding",
"to",
"site",
"B",
",",
"except",
"for",
"PU",
".",
"1",
"/",
"Spi",
"-",
"1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2006 | [
"A",
"GC",
"box",
"containing",
"a",
"binding",
"site",
"for",
"Sp1",
"was",
"identified",
"(",
"nt",
"4623",
"to",
"4631",
")",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
2007 | [
"These",
"results",
"identify",
"a",
"transcriptional",
"regulatory",
"element",
"associated",
"with",
"a",
"nuclease",
"-",
"hypersensitive",
"site",
"in",
"the",
"pol",
"gene",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
"and",
"suggest",
"that",
"its",
"activity",
"may",
"be",
"controlled",
"by",
"a",
"complex",
"interplay",
"of",
"cis",
"-",
"regulatory",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
2008 | [
"Expression",
"of",
"v",
"-",
"src",
"in",
"T",
"cells",
"correlates",
"with",
"nuclear",
"expression",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2009 | [
"Protein",
"tyrosine",
"kinases",
"transmit",
"signals",
"from",
"cytokine",
"and",
"immune",
"receptors",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2010 | [
"Very",
"little",
"information",
"exists",
"linking",
"these",
"two",
"important",
"classes",
"of",
"signaling",
"molecules",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
2011 | [
"We",
"now",
"demonstrate",
"that",
"v",
"-",
"src",
"expression",
"correlates",
"with",
"nuclear",
"expression",
"of",
"a",
"kappa",
"B",
"binding",
"complex",
"similar",
"to",
"that",
"induced",
"by",
"phorbol",
"ester",
"and",
"ionomycin",
",",
"as",
"detected",
"by",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assay",
"using",
"a",
"variety",
"of",
"kappa",
"B",
"sites",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
2012 | [
"This",
"complex",
"was",
"blocked",
"by",
"the",
"tyrosine",
"kinase",
"inhibitor",
",",
"herbimycin",
"A",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2013 | [
"The",
"v",
"-",
"src",
"-",
"induced",
"complex",
"comprised",
"the",
"p50",
"and",
"p65",
"components",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
",",
"as",
"determined",
"by",
"supershift",
"and",
"immunoblot",
"analysis",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2014 | [
"As",
"a",
"functional",
"correlate",
"of",
"this",
"finding",
",",
"transient",
"co",
"-",
"transfection",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
"LTR",
"reporter",
"constructs",
"in",
"a",
"different",
"T",
"cell",
"line",
"demonstrated",
"that",
"v",
"-",
"src",
"activated",
"this",
"promoter",
"in",
"a",
"kappa",
"B",
"-",
"dependent",
"manner",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2015 | [
"We",
"found",
"that",
"transactivation",
"of",
"the",
"HIV",
"-",
"1",
"LTR",
"by",
"v",
"-",
"src",
"was",
"more",
"sensitive",
"to",
"mutations",
"of",
"the",
"proximal",
",",
"rather",
"than",
"the",
"distal",
",",
"kappa",
"B",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
2016 | [
"The",
"implications",
"for",
"T",
"cell",
"receptor",
"signaling",
"and",
"HIV",
"-",
"1",
"gene",
"expression",
"are",
"considered",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2017 | [
"trans",
"-",
"activation",
"of",
"the",
"HIV",
"promoter",
"by",
"a",
"cDNA",
"and",
"its",
"genomic",
"clones",
"of",
"human",
"herpesvirus",
"-",
"6",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2018 | [
"Co",
"-",
"infection",
"of",
"T",
"cells",
"by",
"HIV",
"-",
"1",
"and",
"HHV",
"-",
"6",
"can",
"lead",
"to",
"both",
"activation",
"of",
"the",
"HIV",
"-",
"1",
"promoter",
"and",
"acceleration",
"of",
"the",
"cytopathic",
"effects",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2019 | [
"An",
"HHV",
"-",
"6",
"(",
"GS",
")",
"cDNA",
"clone",
",",
"pCD41",
",",
"encoding",
"for",
"a",
"41",
"-",
"kDa",
"nuclear",
"protein",
"was",
"identified",
"and",
"characterized",
"previously",
"(",
"Chang",
"and",
"Balachandran",
",",
"J",
".",
"Virol",
".",
"65",
",",
"2884",
"-",
"2894",
"and",
"7085",
",",
"1991",
")",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2020 | [
"Using",
"this",
"cDNA",
"as",
"the",
"probe",
",",
"a",
"3",
".",
"8",
"-",
"kb",
"EcoRI",
"genomic",
"fragment",
"encoding",
"the",
"HHV",
"-",
"6",
"(",
"GS",
")",
"P41",
"was",
"cloned",
"and",
"designated",
"as",
"pGD41",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
2021 | [
"When",
"cotransfected",
"with",
"the",
"HIV",
"LTR",
"CAT",
"into",
"CV",
"-",
"1",
"cells",
",",
"both",
"the",
"pCD41",
"and",
"pGD41",
"clones",
"trans",
"-",
"activated",
"the",
"HIV",
"LTR",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
2022 | [
"Deletion",
"constructs",
"of",
"the",
"pCD41",
"clone",
"demonstrated",
"that",
"ORF",
"-",
"A",
"was",
"critical",
"for",
"the",
"HIV",
"LTR",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
2023 | [
"Deletion",
"analyses",
"of",
"the",
"pCD41",
"ORF",
"-",
"A",
"and",
"the",
"use",
"of",
"promoter",
"constructs",
"further",
"mapped",
"an",
"internal",
"functional",
"promoter",
"within",
"the",
"pCD41",
"sequence",
"that",
"can",
"direct",
"the",
"synthesis",
"of",
"the",
"trans",
"-",
"activating",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2024 | [
"By",
"using",
"HIV",
"LTR",
"deletion",
"mutants",
",",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"binding",
"sites",
"were",
"found",
"to",
"be",
"critical",
"for",
"response",
"to",
"the",
"pCD41",
"trans",
"-",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2025 | [
"During",
"the",
"course",
"of",
"serious",
"bacterial",
"infections",
",",
"lipopolysaccharide",
"(",
"LPS",
")",
"is",
"believed",
"to",
"interact",
"with",
"macrophage",
"receptors",
",",
"resulting",
"in",
"the",
"generation",
"of",
"inflammatory",
"mediators",
"and",
"systemic",
"symptoms",
"including",
"hemodynamic",
"instability",
"and",
"shock",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2026 | [
"CD14",
",",
"a",
"glycosylphosphatidyl",
"-",
"linked",
"antigen",
",",
"functions",
"as",
"an",
"LPS",
"signaling",
"receptor",
"."
] | [
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
2027 | [
"A",
"critical",
"issue",
"concerns",
"the",
"mechanism",
"by",
"which",
"CD14",
",",
"which",
"has",
"no",
"transmembrane",
"domain",
",",
"transduces",
"its",
"signal",
"following",
"LPS",
"binding",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2028 | [
"Recently",
",",
"investigators",
"have",
"hypothesized",
"that",
"CD14",
"-",
"mediated",
"signaling",
"is",
"effected",
"through",
"a",
"receptor",
"-",
"associated",
"tyrosine",
"kinase",
"(",
"TK",
")",
",",
"suggesting",
"a",
"multicomponent",
"receptor",
"model",
"of",
"LPS",
"signaling",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2029 | [
"Wild",
"-",
"type",
"Chinese",
"hamster",
"ovary",
"(",
"CHO",
")",
"-",
"K1",
"cells",
"can",
"be",
"activated",
"by",
"endotoxin",
"to",
"release",
"arachidonate",
"following",
"transfection",
"with",
"human",
"CD14",
"(",
"CHO",
"/",
"CD14",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
2030 | [
"We",
"sought",
"to",
"determine",
"if",
"this",
"pathway",
"were",
"present",
"in",
"CHO",
"/",
"CD14",
"cells",
"and",
"to",
"elucidate",
"the",
"relationship",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"activation",
"to",
"the",
"CD14",
"receptor",
"system",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O"
] |
2031 | [
"Protein",
"synthesis",
"inhibitors",
"and",
"corticosteroids",
",",
"which",
"suppress",
"arachidonate",
"release",
"and",
"the",
"synthesis",
"of",
"proinflammatory",
"cytokines",
",",
"had",
"no",
"effect",
"on",
"translocation",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"in",
"CHO",
"/",
"CD14",
"or",
"RAW",
"264",
".",
"7",
"cells",
",",
"demonstrating",
"that",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"translocation",
"is",
"an",
"early",
"event",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2032 | [
"Although",
"TK",
"activity",
"was",
"consistently",
"observed",
"by",
"immunoblotting",
"extracts",
"from",
"activated",
"RAW",
"264",
".",
"7",
"cells",
",",
"LPS",
"-",
"induced",
"phosphotyrosine",
"residues",
"were",
"not",
"observed",
"from",
"similarly",
"treated",
"CHO",
"/",
"CD14",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2033 | [
"Furthermore",
",",
"the",
"TK",
"inhibitors",
"herbimycin",
"A",
"and",
"genistein",
"failed",
"to",
"inhibit",
"translocation",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"in",
"CHO",
"/",
"CD14",
"or",
"RAW",
"264",
".",
"7",
"cells",
",",
"although",
"both",
"of",
"these",
"agents",
"inhibited",
"LPS",
"-",
"induced",
"TK",
"activity",
"in",
"RAW",
"264",
".",
"7",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2034 | [
"These",
"results",
"imply",
"that",
"TK",
"activity",
"is",
"not",
"obligatory",
"for",
"CD14",
"-",
"mediated",
"signal",
"transduction",
"to",
"occur",
"in",
"response",
"to",
"LPS",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2035 | [
"Signals",
"transduced",
"through",
"the",
"CD4",
"molecule",
"on",
"T",
"lymphocytes",
"activate",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2036 | [
"We",
"have",
"demonstrated",
"that",
"native",
"envelope",
"glycoproteins",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
",",
"gp160",
"can",
"induce",
"activation",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
",",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2037 | [
"The",
"gp160",
"-",
"induced",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"complex",
"consists",
"of",
"p65",
",",
"p50",
"and",
"c",
"-",
"rel",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2038 | [
"The",
"gp160",
"-",
"mediated",
"activation",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"in",
"CD4",
"positive",
"T",
"cells",
"may",
"be",
"involved",
"in",
"biological",
"effects",
",",
"e",
".",
"g",
".",
",",
"enhanced",
"HIV",
"replication",
",",
"hypergammaglobulinem",
",",
"increased",
"cytokine",
"secretion",
",",
"hypercellularity",
"in",
"bone",
"marrow",
"and",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2039 | [
"The",
"expression",
"of",
"the",
"progesterone",
"receptor",
"in",
"human",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"was",
"analysed",
",",
"using",
"an",
"enzyme",
"linked",
"immunosorbent",
"assay",
"(",
"Abbott",
"PgR",
"-",
"EIA",
"monoclonal",
")",
",",
"in",
"order",
"to",
"evaluate",
"its",
"prognostic",
"character",
"in",
"the",
"context",
"of",
"spontaneous",
"abortion",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2040 | [
"Cytosols",
"were",
"prepared",
"from",
"lymphocytes",
"of",
"24",
"healthy",
"pregnant",
"women",
"(",
"11",
"first",
",",
"10",
"second",
"and",
"three",
"third",
"trimester",
")",
",",
"seven",
"healthy",
"non",
"-",
"pregnant",
"women",
",",
"nine",
"women",
"with",
"recurrent",
"spontaneous",
"abortion",
",",
"and",
"six",
"healthy",
"men",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2041 | [
"In",
"addition",
",",
"a",
"human",
"breast",
"carcinoma",
"cell",
"line",
"(",
"ZR",
"-",
"75",
"-",
"1",
")",
",",
"which",
"expresses",
"the",
"progesterone",
"receptor",
",",
"was",
"analysed",
"throughout",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2042 | [
"The",
"ZR",
"-",
"75",
"-",
"1",
"cell",
"line",
"showed",
"an",
"expression",
"of",
"642",
"fmol",
"/",
"mg",
"whereas",
"lymphocytes",
"of",
"pregnant",
"women",
"showed",
"an",
"expression",
"<",
"or",
"=",
"4",
"fmol",
"/",
"mg",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2043 | [
"Lymphocytes",
"of",
"non",
"-",
"pregnant",
"women",
",",
"women",
"with",
"threatened",
"pre",
"-",
"term",
"delivery",
",",
"and",
"men",
"showed",
"equivalent",
"levels",
":",
"3",
"+",
"/",
"-",
"1",
",",
"3",
"+",
"/",
"-",
"2",
"and",
"5",
"+",
"/",
"-",
"4",
"fmol",
"/",
"mg",
"respectively",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2044 | [
"These",
"results",
"show",
"that",
"there",
"is",
"no",
"evidence",
"of",
"specific",
"expression",
"of",
"the",
"progesterone",
"receptor",
"in",
"pregnancy",
"and",
"exclude",
"any",
"prognostic",
"character",
"in",
"spontaneous",
"abortion",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2045 | [
"Tolerance",
"to",
"lipopolysaccharide",
"involves",
"mobilization",
"of",
"nuclear",
"factor",
"kappa",
"B",
"with",
"predominance",
"of",
"p50",
"homodimers",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
2046 | [
"Stimulation",
"of",
"the",
"human",
"monocytic",
"cell",
"line",
"Mono",
"Mac",
"6",
"with",
"lipopolysaccharide",
"(",
"LPS",
")",
"leads",
"to",
"rapid",
"and",
"transient",
"expression",
"of",
"cytokines",
"like",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"(",
"TNF",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
2047 | [
"When",
"such",
"cells",
"are",
"precultured",
"for",
"2",
"days",
"with",
"a",
"low",
"dose",
"of",
"LPS",
"(",
"20",
"ng",
"/",
"ml",
")",
"followed",
"by",
"stimulation",
"with",
"a",
"high",
"dose",
"of",
"LPS",
"(",
"1",
"microgram",
"/",
"ml",
")",
",",
"expression",
"of",
"the",
"TNF",
"gene",
"is",
"minimal",
",",
"i",
".",
"e",
".",
"the",
"cells",
"are",
"tolerant",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2048 | [
"Reporter",
"gene",
"analysis",
"reveals",
"that",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"complex",
"mobilized",
"in",
"tolerant",
"cells",
"is",
"functionally",
"inactive",
"in",
"that",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"-",
"dependent",
"luciferase",
"constructs",
"containing",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"long",
"terminal",
"repeat",
"or",
"the",
"TNF",
"5",
"'",
"-",
"region",
"show",
"only",
"minimal",
"transactivation",
"after",
"LPS",
"stimulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2049 | [
"Similar",
"to",
"Mono",
"Mac",
"6",
"cells",
",",
"primary",
"blood",
"monocytes",
",",
"when",
"precultured",
"with",
"a",
"low",
"dose",
"of",
"LPS",
",",
"also",
"become",
"tolerant",
"and",
"produce",
"little",
"TNF",
"after",
"LPS",
"stimulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2050 | [
"The",
"tolerant",
"blood",
"monocytes",
"also",
"up",
"-",
"regulate",
"CD14",
",",
"and",
"they",
"mobilize",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"with",
"a",
"predominance",
"of",
"p50",
"homodimers",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
2051 | [
"Taken",
"together",
",",
"these",
"results",
"demonstrate",
"that",
"tolerance",
"to",
"LPS",
"is",
"determined",
"by",
"post",
"-",
"receptor",
"mechanisms",
"that",
"involve",
"an",
"altered",
"composition",
"of",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"complex",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2052 | [
"The",
"frequency",
"of",
"Oct2",
"-",
"positive",
"clones",
"was",
"1",
"/",
"15",
",",
"000",
"in",
"both",
"libraries",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2053 | [
"Two",
"new",
"isoforms",
"were",
"found",
"that",
"generate",
"novel",
"amino",
"-",
"or",
"carboxy",
"-",
"terminal",
"sequences",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2054 | [
"An",
"isoform",
"lacking",
"exon",
"11",
"destroyed",
"the",
"carboxy",
"-",
"terminal",
"leucin",
"-",
"zipper",
"region",
"and",
"introduced",
"a",
"frame",
"shift",
"creating",
"a",
"novel",
",",
"proline",
"-",
"rich",
"carboxy",
"terminus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2055 | [
"This",
"exon",
"was",
"inserted",
"between",
"glutamine",
"-",
"rich",
"regions",
"2",
"and",
"3",
",",
"carboxy",
"terminal",
"of",
"a",
"tentative",
"leucine",
"-",
"zipper",
"structure",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2056 | [
"More",
"frequent",
"use",
"of",
"the",
"classical",
"Oct2a",
"and",
"Oct2b",
"isoforms",
"was",
"observed",
"in",
"the",
"lipopolysaccharide",
"-",
"stimulated",
"B",
"cells",
",",
"while",
"a",
"preference",
"for",
"the",
"Oct2ab",
"and",
"Oct2ba",
"isoforms",
"was",
"observed",
"in",
"lipopolysaccharide",
"plus",
"phorbol",
"-",
"di",
"-",
"butyrate",
"-",
"treated",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2057 | [
"The",
"zinc",
"finger",
"transcription",
"factor",
"GATA",
"-",
"1",
"is",
"a",
"major",
"regulator",
"of",
"gene",
"expression",
"in",
"erythroid",
",",
"megakaryocyte",
",",
"and",
"mast",
"cell",
"lineages",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2058 | [
"GATA",
"-",
"1",
"binds",
"to",
"WGATAR",
"consensus",
"motifs",
"in",
"the",
"regulatory",
"regions",
"of",
"virtually",
"all",
"erythroid",
"cell",
"-",
"specific",
"genes",
"."
] | [
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2059 | [
"Targeted",
"mutagenesis",
"of",
"the",
"GATA",
"-",
"1",
"gene",
"in",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"has",
"demonstrated",
"its",
"requirement",
"in",
"normal",
"erythroid",
"development",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2060 | [
"Efficient",
"rescue",
"of",
"the",
"defect",
"requires",
"an",
"intact",
"GATA",
"element",
"in",
"the",
"distal",
"promoter",
",",
"suggesting",
"autoregulatory",
"control",
"of",
"GATA",
"-",
"1",
"transcription",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
2061 | [
"To",
"examine",
"whether",
"GATA",
"-",
"1",
"expression",
"involves",
"additional",
"regulatory",
"factors",
"or",
"is",
"maintained",
"entirely",
"by",
"an",
"autoregulatory",
"loop",
",",
"we",
"have",
"used",
"a",
"transient",
"heterokaryon",
"system",
"to",
"test",
"the",
"ability",
"of",
"erythroid",
"factors",
"to",
"activate",
"the",
"GATA",
"-",
"1",
"gene",
"in",
"nonerythroid",
"nuclei",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2062 | [
"We",
"show",
"here",
"that",
"proerythroblasts",
"and",
"mature",
"erythroid",
"cells",
"contain",
"a",
"diffusible",
"activity",
"(",
"TAG",
")",
"capable",
"of",
"transcriptional",
"activation",
"of",
"GATA",
"-",
"1",
"and",
"that",
"this",
"activity",
"decreases",
"during",
"the",
"terminal",
"differentiation",
"of",
"erythroid",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2063 | [
"Nuclei",
"from",
"GATA",
"-",
"1",
"-",
"mutant",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"can",
"still",
"be",
"reprogrammed",
"to",
"express",
"their",
"globin",
"genes",
"in",
"erythroid",
"heterokaryons",
",",
"indicating",
"that",
"de",
"novo",
"induction",
"of",
"GATA",
"-",
"1",
"is",
"not",
"required",
"for",
"globin",
"gene",
"activation",
"following",
"cell",
"fusion",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2064 | [
"Role",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
"Nef",
"expression",
"in",
"activation",
"pathways",
"in",
"CD4",
"+",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2065 | [
"Secretion",
"of",
"IL",
"-",
"2",
"and",
"TNF",
"-",
"alpha",
",",
"surface",
"expression",
"of",
"IL",
"-",
"2R",
",",
"and",
"DNA",
"-",
"binding",
"activity",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"and",
"AP",
"-",
"1",
"(",
"Fos",
"/",
"Jun",
")",
"complex",
"in",
"response",
"to",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
",",
"TNF",
"-",
"alpha",
",",
"or",
"immobilized",
"antibodies",
"to",
"CD3",
"were",
"monitored",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O"
] |
2066 | [
"These",
"parameters",
"were",
"not",
"modified",
"by",
"Nef",
"expression",
"in",
"Jurkat",
"cells",
",",
"whereas",
"stimulation",
"with",
"the",
"same",
"stimuli",
"resulted",
"in",
"partial",
"inhibition",
"of",
"LTR",
"activation",
"in",
"Nef",
"+",
"Jurkat",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2067 | [
"This",
"inhibition",
"was",
"not",
"mediated",
"through",
"Nef",
"phosphorylation",
"on",
"Thr",
"-",
"15",
"or",
"GTP",
"-",
"binding",
"activity",
"because",
"mutations",
"in",
"critical",
"sites",
"did",
"not",
"alter",
"this",
"inhibition",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2068 | [
"Analysis",
"of",
"truncated",
"LTRs",
"confirmed",
"that",
"inhibition",
"of",
"LTR",
"activation",
"was",
"not",
"mediated",
"through",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"-",
"binding",
"activity",
"but",
"through",
"the",
"region",
"containing",
"the",
"negative",
"responding",
"elements",
"(",
"NREs",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
2069 | [
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"Nef",
"downmodulates",
"LTR",
"activation",
"without",
"significantly",
"inhibiting",
"the",
"capacity",
"of",
"T",
"cells",
"to",
"respond",
"to",
"immunological",
"activations",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2070 | [
"Tat",
"-",
"binding",
"protein",
"7",
"is",
"a",
"subunit",
"of",
"the",
"26S",
"protease",
"."
] | [
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
2071 | [
"Subunit",
"6",
"(",
"S6",
")",
",",
"an",
"integral",
"component",
"of",
"the",
"26S",
"protease",
"from",
"human",
"erythrocytes",
",",
"has",
"been",
"studied",
"by",
"SDS",
"-",
"PAGE",
",",
"peptide",
"mapping",
"and",
"sequence",
"analysis",
"."
] | [
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2072 | [
"S6",
"was",
"cleaved",
"with",
"CNBr",
"and",
"three",
"internal",
"peptides",
"were",
"sequenced",
"."
] | [
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2073 | [
"A",
"comparison",
"with",
"known",
"proteins",
"in",
"Genbank",
"revealed",
"that",
"all",
"three",
"S6",
"peptides",
"match",
"the",
"predicted",
"sequence",
"of",
"TBP7",
",",
"Tat",
"-",
"binding",
"protein",
"7",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2074 | [
"Based",
"on",
"peptide",
"matches",
"covering",
"more",
"than",
"10",
"%",
"of",
"the",
"TBP7",
"sequence",
",",
"and",
"the",
"fact",
"that",
"the",
"migration",
"of",
"S6",
"on",
"SDS",
"-",
"PAGE",
"is",
"consistent",
"with",
"the",
"estimated",
"molecular",
"mass",
"for",
"TBP7",
",",
"we",
"conclude",
"that",
"subunit",
"6",
"of",
"the",
"26S",
"protease",
"is",
"TBP7",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O"
] |
2075 | [
"Hypoxia",
"causes",
"the",
"activation",
"of",
"nuclear",
"factor",
"kappa",
"B",
"through",
"the",
"phosphorylation",
"of",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"on",
"tyrosine",
"residues",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2076 | [
"In",
"this",
"report",
",",
"we",
"show",
"that",
"exposure",
"of",
"cells",
"to",
"hypoxia",
"(",
"0",
".",
"02",
"%",
"O2",
")",
"results",
"in",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"degradation",
",",
"increased",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"DNA",
"binding",
"activity",
",",
"and",
"transactivation",
"of",
"a",
"reporter",
"gene",
"construct",
"containing",
"two",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"DNA",
"binding",
"sites",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2077 | [
"Pretreatment",
"of",
"cells",
"with",
"protein",
"tyrosine",
"kinase",
"inhibitors",
"and",
"the",
"dominant",
"negative",
"allele",
"of",
"c",
"-",
"Raf",
"-",
"1",
"(",
"Raf",
"301",
")",
"inhibited",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"degradation",
",",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"binding",
",",
"and",
"transactivation",
"of",
"kappa",
"B",
"reporter",
"constructs",
"by",
"hypoxia",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
2078 | [
"To",
"demonstrate",
"a",
"direct",
"link",
"between",
"changes",
"in",
"the",
"phosphorylation",
"pattern",
"of",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"with",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"activation",
",",
"we",
"immunoprecipitated",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"after",
"varying",
"times",
"of",
"hypoxic",
"exposure",
"and",
"found",
"that",
"its",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"status",
"increased",
"during",
"hypoxic",
"exposure",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2079 | [
"Inhibition",
"of",
"the",
"transfer",
"of",
"tyrosine",
"phosphoryl",
"groups",
"onto",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"prevented",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"degradation",
"and",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"binding",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
2080 | [
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"during",
"hypoxia",
"is",
"an",
"important",
"proximal",
"step",
"which",
"precedes",
"its",
"dissociation",
"and",
"degradation",
"from",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
2081 | [
"Overproduction",
"of",
"NFKB2",
"(",
"lyt",
"-",
"10",
")",
"and",
"c",
"-",
"Rel",
":",
"a",
"mechanism",
"for",
"HTLV",
"-",
"I",
"Tax",
"-",
"mediated",
"trans",
"-",
"activation",
"via",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"signalling",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
2082 | [
"The",
"Tax",
"protein",
"of",
"HTLV",
"-",
"I",
",",
"a",
"positive",
"transcriptional",
"activator",
"of",
"HTLV",
"-",
"I",
"gene",
"expression",
",",
"is",
"a",
"viral",
"oncogene",
"that",
"also",
"increases",
"transcription",
"of",
"cellular",
"genes",
"including",
"GM",
"-",
"CSF",
",",
"IL",
"-",
"2R",
"alpha",
"and",
"IL",
"-",
"2",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
2083 | [
"One",
"of",
"the",
"cellular",
"targets",
"of",
"the",
"trans",
"-",
"activating",
"effects",
"of",
"Tax",
"is",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"/",
"Rel",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
",",
"pleiotropic",
"regulators",
"of",
"immunoregulatory",
",",
"cytokine",
"and",
"viral",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2084 | [
"In",
"this",
"report",
",",
"we",
"demonstrate",
"that",
"NFKB2",
"(",
"lyt",
"-",
"10",
")",
"and",
"c",
"-",
"Rel",
"are",
"overexpressed",
"in",
"HTLV",
"-",
"I",
"infected",
"and",
"Tax",
"-",
"expressing",
"cells",
"and",
",",
"together",
",",
"account",
"for",
"the",
"majority",
"of",
"the",
"constitutive",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"binding",
"activity",
"in",
"these",
"cells",
"before",
"and",
"after",
"PMA",
"stimulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2085 | [
"Most",
"importantly",
",",
"we",
"show",
"a",
"Tax",
"-",
"dependent",
"correlation",
"between",
"expression",
"of",
"NFKB2",
"(",
"p100",
")",
"and",
"processing",
"to",
"the",
"DNA",
"binding",
"NFKB2",
"(",
"p52",
")",
"form",
",",
"induction",
"of",
"c",
"-",
"Rel",
",",
"and",
"trans",
"-",
"activation",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"-",
"mediated",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2086 | [
"We",
"propose",
"that",
"NFKB2",
"synthesis",
"and",
"processing",
"allows",
"continuous",
"nuclear",
"expression",
"of",
"an",
"otherwise",
"cytoplasmic",
"protein",
"and",
",",
"in",
"conjunction",
"with",
"overexpression",
"of",
"c",
"-",
"Rel",
",",
"NFKB2",
"alters",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"signalling",
"pathway",
"and",
"contributes",
"to",
"leukemic",
"transformation",
"of",
"T",
"cells",
"by",
"HTLV",
"-",
"I",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2087 | [
"Retinoic",
"acid",
"downmodulates",
"erythroid",
"differentiation",
"and",
"GATA1",
"expression",
"in",
"purified",
"adult",
"-",
"progenitor",
"culture",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2088 | [
"All",
"-",
"trans",
"retinoic",
"acid",
"(",
"RA",
")",
"is",
"an",
"important",
"morphogen",
"in",
"vertebrate",
"development",
",",
"a",
"normal",
"constituent",
"in",
"human",
"adult",
"blood",
"and",
"is",
"also",
"involved",
"in",
"the",
"control",
"of",
"cell",
"growth",
"and",
"differentiation",
"in",
"acute",
"promyelocytic",
"leukemia",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2089 | [
"In",
"clonogenetic",
"fetal",
"calf",
"serum",
"-",
"supplemented",
"(",
"FCS",
"+",
")",
"or",
"-",
"nonsupplemented",
"(",
"FCS",
"-",
")",
"culture",
"treated",
"with",
"saturating",
"levels",
"of",
"interleukin",
"-",
"3",
"(",
"IL",
"-",
"3",
")",
"granulocyte",
"-",
"macrophage",
"colony",
"-",
"stimulating",
"factor",
"(",
"GM",
"-",
"CSF",
")",
"and",
"erythropoietin",
"(",
"Ep",
")",
"(",
"combined",
"with",
"c",
"-",
"kit",
"ligand",
"in",
"FCS",
"(",
"-",
")",
"-",
"culture",
"conditions",
")",
",",
"RA",
"induces",
"a",
"dramatic",
"dose",
"-",
"dependent",
"shift",
"from",
"erythroid",
"to",
"granulomonocytic",
"colony",
"formation",
",",
"the",
"latter",
"colonies",
"being",
"essentially",
"represented",
"by",
"granulocytic",
"clones",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2090 | [
"This",
"shift",
"is",
"apparently",
"not",
"caused",
"by",
"a",
"recruitment",
"phenomenon",
",",
"because",
"in",
"FCS",
"+",
"culture",
",",
"the",
"total",
"number",
"of",
"colonies",
"is",
"not",
"significantly",
"modified",
"by",
"RA",
"addition",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2091 | [
"In",
"FCS",
"-",
"liquid",
"-",
"suspension",
"culture",
"supplemented",
"with",
"saturating",
"Ep",
"level",
"and",
"low",
"-",
"dose",
"IL",
"-",
"3",
"/",
"GM",
"-",
"CSF",
",",
"adult",
"HPC",
"undergo",
"unilineage",
"erythropoietic",
"differentiation",
":",
"Here",
"again",
",",
"treatment",
"with",
"high",
"-",
"dose",
"RA",
"induces",
"a",
"shift",
"from",
"the",
"erythroid",
"to",
"granulocytic",
"differentiation",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2092 | [
"Studies",
"on",
"RA",
"time",
"-",
"response",
"or",
"pulse",
"treatment",
"in",
"semisolid",
"or",
"liquid",
"culture",
"show",
"that",
"early",
"RA",
"addition",
"is",
"most",
"effective",
",",
"thus",
"indicating",
"that",
"early",
"but",
"not",
"late",
"HPC",
"are",
"sensitive",
"to",
"its",
"action",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2093 | [
"We",
"then",
"analyzed",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"master",
"GATA1",
"gene",
",",
"which",
"encodes",
"a",
"finger",
"transcription",
"factor",
"required",
"for",
"normal",
"erythroid",
"development",
";",
"addition",
"of",
"RA",
"to",
"HPC",
"stimulated",
"into",
"unilineage",
"erythropoietic",
"differentiation",
"in",
"liquid",
"culture",
"caused",
"a",
"virtually",
"complete",
"inhibition",
"of",
"GATA1",
"mRNA",
"induction",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
2094 | [
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"RA",
"directly",
"inhibits",
"the",
"erythroid",
"differentiation",
"program",
"at",
"the",
"level",
"of",
"early",
"adult",
"HPC",
",",
"and",
"may",
"lead",
"to",
"a",
"shift",
"from",
"the",
"erythroid",
"to",
"granulocytic",
"differentiation",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2095 | [
"Induction",
"of",
"phosphatidylinositol",
"turnover",
"and",
"EGR",
"-",
"1",
"mRNA",
"expression",
"by",
"crosslinking",
"of",
"surface",
"IgM",
"and",
"IgD",
"in",
"the",
"human",
"B",
"cell",
"line",
"B104",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2096 | [
"Here",
",",
"we",
"investigated",
"the",
"accumulation",
"of",
"cyclic",
"AMP",
"(",
"cAMP",
")",
",",
"the",
"hydrolysis",
"of",
"inositol",
"phosphates",
",",
"protein",
"kinase",
"C",
"(",
"PKC",
")",
"activity",
"and",
"the",
"induction",
"of",
"Egr",
"-",
"1",
"and",
"c",
"-",
"fos",
"mRNA",
"expression",
"by",
"sIgM",
"-",
"and",
"sIgD",
"-",
"crosslinking",
"to",
"examine",
"differences",
"in",
"the",
"signals",
"mediated",
"through",
"sIgM",
"and",
"sIgD",
"in",
"B104",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2097 | [
"Both",
"sIgM",
"-",
"and",
"sIgD",
"-",
"crosslinking",
"with",
"antibodies",
"induced",
"elevation",
"of",
"cAMP",
"levels",
",",
"phosphatidylinositol",
"turnover",
",",
"PKC",
"activation",
"and",
"expression",
"of",
"Egr",
"-",
"1",
"and",
"c",
"-",
"fos",
"mRNA",
",",
"although",
"sIgM",
"-",
"crosslinking",
"was",
"more",
"effective",
"than",
"sIgD",
"-",
"crosslinking",
",",
"presumably",
"due",
"to",
"the",
"higher",
"expression",
"of",
"sIgM",
"than",
"of",
"sIgD",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
2098 | [
"Egr",
"-",
"1",
"mRNA",
"expression",
"induced",
"by",
"sIgM",
"-",
"and",
"sIgD",
"-",
"crosslinking",
"was",
"inhibited",
"by",
"H7",
",",
"erbstatin",
"and",
"genistein",
",",
"but",
"not",
"by",
"HA1004",
"."
] | [
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2099 | [
"Erbstatin",
"and",
"genistein",
"inhibited",
"the",
"sIg",
"-",
"crosslinking",
"-",
"induced",
"Egr",
"-",
"1",
"mRNA",
"expression",
"in",
"a",
"dose",
"-",
"dependent",
"manner",
"parallel",
"to",
"that",
"observed",
"in",
"the",
"inhibition",
"of",
"sIg",
"-",
"crosslinking",
"-",
"induced",
"protein",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
2100 | [
"These",
"findings",
"suggest",
"that",
"the",
"Egr",
"-",
"1",
"mRNA",
"activating",
"signals",
"through",
"sIgM",
"and",
"sIgD",
"are",
"protein",
"tyrosine",
"kinase",
"-",
"and",
"PKC",
"-",
"dependent",
",",
"but",
"protein",
"kinase",
"A",
"-",
"independent",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits