Datasets:

---

siddharthtumre

/

JNLPBA-Processed

like 0

[ "Aims", "of", "the", "study", "were", "to", "(", "1", ")", "assess", "the", "potential", "role", "of", "the", "expression", "of", "these", "genes", "in", "the", "maintenance", "and", "expansion", "of", "the", "neoplastic", "clones", "and", "(", "2", ")", "search", "for", "constitutional", "losses", "or", "rearrangements", "of", "one", "allele", "followed", "by", "a", "deletion", "of", "the", "second", "allele", "of", "the", "same", "genes", "in", "the", "leukemic", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "latter", "issue", "was", "investigated", "by", "comparing", ",", "in", "8", "cases", ",", "constitutive", "DNA", "from", "skin", "fibroblasts", "with", "leukemic", "DNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Eleven", "of", "the", "17", "patients", "had", "abnormal", "karyotypes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "M", "-", "CSF", "gene", "was", "expressed", "in", "6", "cases", "and", "the", "FMS", "and", "the", "EGR", "-", "1", "genes", "were", "expressed", "in", "2", "of", "the", "latter", "cases", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "autocrine", "mechanism", "of", "growth", "could", "be", "hypothesized", "only", "for", "the", "2", "patients", "whose", "cells", "expressed", "both", "the", "M", "-", "CSF", "and", "FMS", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "No", "germline", "changes", "or", "rearrangements", "were", "observed", "in", "any", "of", "the", "genes", "studied", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "deregulation", "of", "genes", "encoding", "for", "certain", "hemopoietic", "growth", "factors", "or", "receptors", "does", "not", "seem", "to", "represent", "a", "major", "mechanism", "of", "MDS", "progression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "novel", "human", "homeobox", "gene", "distantly", "related", "to", "proboscipedia", "is", "expressed", "in", "lymphoid", "and", "pancreatic", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "novel", "human", "homeobox", "gene", ",", "HB9", ",", "was", "isolated", "from", "a", "cDNA", "library", "prepared", "from", "in", "vitro", "stimulated", "human", "tonsil", "B", "lymphocytes", "and", "from", "a", "human", "genomic", "library", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "The", "HB9", "gene", "is", "composed", "of", "3", "exons", "spread", "over", "6", "kilobases", "of", "DNA", "." ]

[ "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "open", "reading", "frame", "of", "1206", "nucleotides", "is", "in", "frame", "with", "a", "diverged", "homeodomain", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "The", "predicted", "HB9", "protein", "has", "a", "molecular", "mass", "of", "41", "kilodaltons", "and", "is", "enriched", "for", "alanine", ",", "glycine", ",", "and", "leucine", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "HB9", "homeodomain", "is", "most", "similar", "to", "that", "of", "the", "Drosophila", "melanogaster", "homeobox", "gene", "proboscipedia", "." ]

[ "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "B", "O" ]

[ "Northern", "blot", "analysis", "of", "poly", "(", "A", ")", "RNA", "purified", "from", "the", "human", "B", "cell", "line", "RPMI", "8226", "and", "from", "activated", "T", "cells", "revealed", "a", "major", "mRNA", "transcript", "of", "2", ".", "2", "kilobases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Reverse", "transcriptase", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "was", "used", "to", "examine", "HB9", "RNA", "transcripts", "in", "hematopoietic", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "HB9", "RNA", "transcripts", "were", "most", "prevalent", "in", "several", "human", "B", "cell", "lines", "and", "K562", "cells", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "transcripts", "were", "detected", "in", "RNA", "prepared", "from", "tonsil", "B", "cells", "and", "in", "situ", "hybridization", "studies", "localized", "them", "in", "the", "germinal", "center", "region", "of", "adult", "tonsil", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "suggest", "the", "involvement", "of", "HB9", "in", "regulating", "gene", "transcription", "in", "lymphoid", "and", "pancreatic", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "immunodeficiency", "virus", "type", "1", "Tat", "upregulates", "interleukin", "-", "2", "secretion", "in", "activated", "T", "cells", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dysregulation", "of", "cytokines", "secreted", "by", "T", "cells", "may", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "pathogenesis", "of", "AIDS", "." ]

[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "investigate", "the", "effects", "of", "human", "immunodeficiency", "virus", "type", "1", "(", "HIV", "-", "1", ")", "Tat", "on", "interleukin", "-", "2", "(", "IL", "-", "2", ")", "expression", ",", "we", "used", "IL", "-", "2", "promoter", "-", "chloramphenicol", "acetyltransferase", "constructs", "and", "IL", "-", "2", "-", "secreting", "Jurkat", "T", "cells", "as", "a", "model", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transient", "expression", "of", "HIV", "-", "1", "Tat", "induced", "a", "five", "-", "to", "eightfold", "increase", "in", "IL", "-", "2", "promoter", "activity", "in", "Jurkat", "T", "cells", "stimulated", "with", "phytohemagglutinin", "and", "phorbol", "myristate", "acetate", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL", "-", "2", "secretion", "was", "increased", "more", "than", "twofold", "in", "both", "Jurkat", "T", "cells", "and", "primary", "T", "cells", "stimulated", "by", "extracellular", "HIV", "-", "1", "Tat", "protein", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Analysis", "of", "mRNA", "suggested", "that", "Tat", "exerts", "its", "effect", "on", "IL", "-", "2", "primarily", "at", "the", "transcriptional", "level", "." ]

[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "NF", "-", "kappa", "B", "site", "at", "positions", "-", "206", "to", "-", "195", "of", "the", "IL", "-", "2", "promoter", "was", "required", "but", "not", "sufficient", "for", "the", "Tat", "effect", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

[ "The", "Tat", "-", "mediated", "increase", "in", "IL", "-", "2", "promoter", "activity", "could", "selectively", "be", "blocked", "by", "antisense", "tat", "or", "-", "unlike", "the", "analogous", "effect", "of", "human", "T", "-", "cell", "lymphotropic", "virus", "type", "1", "Tax", "-", "by", "cyclosporin", "A", "." ]

[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "it", "might", "contribute", "to", "the", "hypergammaglobulinem", "or", ",", "together", "with", "other", "cytokines", "found", "to", "be", "dysregulated", ",", "the", "T", "-", "helper", "cell", "dysfunctions", "observed", "in", "AIDS", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activation", "of", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "in", "human", "lymphoblastoid", "cells", "by", "low", "-", "dose", "ionizing", "radiation", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF", "-", "kappa", "B", ")", "is", "a", "pleiotropic", "transcription", "factor", "which", "is", "involved", "in", "the", "transcriptional", "regulation", "of", "several", "specific", "genes", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "are", "in", "a", "dose", "range", "where", "the", "viability", "of", "the", "cells", "remains", "very", "high", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "exposure", "to", "137Cs", "gamma", "rays", "at", "a", "dose", "rate", "of", "1", ".", "17", "Gy", "/", "min", ",", "a", "maximum", "in", "expression", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "was", "seen", "at", "8", "h", "after", "a", "0", ".", "5", "-", "Gy", "exposure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Time", "-", "course", "studies", "revealed", "a", "biphasic", "time", "-", "dependent", "expression", "after", "0", ".", "5", "-", ",", "1", "-", "and", "2", "-", "Gy", "exposures", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "for", "each", "time", "examined", ",", "the", "expression", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "was", "maximum", "after", "the", "0", ".", "5", "-", "Gy", "exposure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Alternative", "splicing", "of", "RNA", "transcripts", "encoded", "by", "the", "murine", "p105", "NF", "-", "kappa", "B", "gene", "generates", "I", "kappa", "B", "gamma", "isoforms", "with", "different", "inhibitory", "activities", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "gene", "encoding", "the", "105", "-", "kDa", "protein", "(", "p105", ")", "precursor", "of", "the", "p50", "subunit", "of", "transcription", "factor", "NF", "-", "kappa", "B", "also", "encodes", "a", "p70", "I", "kappa", "B", "protein", ",", "I", "kappa", "B", "gamma", ",", "which", "is", "identical", "to", "the", "C", "-", "terminal", "607", "amino", "acids", "of", "p105", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O" ]

[ "Here", "we", "show", "that", "alternative", "RNA", "splicing", "generates", "I", "kappa", "B", "gamma", "isoforms", "with", "properties", "different", "from", "those", "of", "p70", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

[ "One", "63", "-", "kDa", "isoform", ",", "termed", "I", "kappa", "B", "gamma", "-", "1", ",", "which", "lacks", "59", "amino", "acids", "C", "-", "terminal", "to", "ankyrin", "repeat", "7", ",", "has", "a", "novel", "35", "-", "amino", "acid", "C", "terminus", "encoded", "by", "an", "alternative", "reading", "frame", "of", "the", "p105", "gene", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "A", "55", "-", "kDa", "isoform", ",", "I", "kappa", "B", "gamma", "-", "2", ",", "lacks", "the", "190", "C", "-", "terminal", "amino", "acids", "of", "p70", "I", "kappa", "B", "gamma", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "p70", "I", "kappa", "B", "gamma", ",", "which", "is", "a", "cytoplasmic", "protein", ",", "I", "kappa", "B", "gamma", "-", "1", "is", "found", "in", "both", "the", "cytoplasm", "and", "nucleus", ",", "whereas", "I", "kappa", "B", "gamma", "-", "2", "is", "predominantly", "nuclear", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "I", "kappa", "B", "gamma", "isoforms", "also", "display", "differences", "in", "specificity", "and", "affinity", "for", "Rel", "/", "NF", "-", "kappa", "B", "proteins", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "While", "p70", "I", "kappa", "B", "gamma", "inhibits", "p50", "-", ",", "p65", "-", ",", "and", "c", "-", "Rel", "-", "mediated", "transactivation", "and", "/", "or", "DNA", "binding", ",", "both", "I", "kappa", "B", "gamma", "-", "1", "and", "I", "kappa", "B", "gamma", "-", "2", "are", "specific", "for", "p50", "and", "have", "different", "affinities", "for", "this", "subunit", "." ]

[ "O", "B", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "absence", "in", "I", "kappa", "B", "gamma", "-", "1", "and", "I", "kappa", "B", "gamma", "-", "2", "of", "a", "protein", "kinase", "A", "site", "whose", "phosphorylation", "modulates", "p70", "I", "kappa", "B", "gamma", "inhibitory", "activity", "suggests", "that", "alternative", "RNA", "splicing", "may", "be", "used", "to", "generate", "I", "kappa", "B", "gamma", "isoforms", "that", "respond", "differently", "to", "intracellular", "signals", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Structure", "and", "expression", "of", "the", "human", "GATA3", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "GATA3", ",", "a", "member", "of", "the", "GATA", "family", "that", "is", "abundantly", "expressed", "in", "the", "T", "-", "lymphocyte", "lineage", ",", "is", "thought", "to", "participate", "in", "T", "-", "cell", "receptor", "gene", "activation", "through", "binding", "to", "enhancers", "." ]

[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

[ "To", "understand", "GATA3", "gene", "regulation", ",", "we", "cloned", "the", "human", "gene", "and", "the", "5", "'", "end", "of", "the", "mouse", "GATA3", "gene", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "We", "show", "that", "the", "human", "GATA3", "gene", "contains", "six", "exons", "distributed", "over", "17", "kb", "of", "DNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "promoter", "sequence", "analysis", "of", "these", "two", "genes", "revealed", "that", "they", "are", "embedded", "within", "a", "CpG", "island", "and", "share", "structural", "features", "often", "found", "in", "the", "promoters", "of", "housekeeping", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Finally", ",", "we", "show", "that", "a", "DNA", "fragment", "containing", "the", "human", "GATA3", "transcription", "unit", ",", "3", "kb", "upstream", "from", "the", "initiation", "site", "and", "4", "kb", "downstream", "from", "the", "polyadenylation", "site", ",", "displays", "T", "-", "cell", "specificity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Characterization", "of", "the", "human", "gene", "encoding", "LBR", ",", "an", "integral", "protein", "of", "the", "nuclear", "envelope", "inner", "membrane", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "characterized", "the", "human", "gene", "encoding", "LBR", ",", "an", "integral", "protein", "of", "the", "nuclear", "envelope", "inner", "membrane", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Restriction", "mapping", "shows", "that", "the", "transcription", "unit", "spans", "approximately", "35", "kilobases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "transcription", "start", "site", "is", "located", "approximately", "4", "kilobases", "5", "'", "to", "the", "translation", "initiation", "codon", ",", "and", "an", "RNA", "splice", "of", "3863", "bases", "occurs", "in", "the", "5", "'", "-", "untranslated", "region", "to", "generate", "mature", "HeLa", "cell", "mRNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "5", "'", "to", "the", "identified", "transcription", "start", "site", "are", "two", "CCAAT", "sequences", "and", "potential", "recognition", "sites", "for", "several", "transcription", "factors", "including", "Sp1", ",", "AP", "-", "1", ",", "AP", "-", "2", ",", "and", "NF", "-", "kB", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "There", "are", "13", "protein", "coding", "exons", "in", "the", "LBR", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "LBR", "'", "s", "nucleoplasmic", "domain", "is", "encoded", "by", "exons", "1", "-", "4", ",", "and", "its", "hydrophobic", "domain", ",", "with", "eight", "putative", "transmembrane", "segments", ",", "is", "encoded", "by", "exons", "5", "-", "13", "." ]

[ "B", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "The", "hydrophobic", "domain", "is", "homologous", "to", "three", "yeast", "polypeptides", ",", "suggesting", "that", "this", "higher", "eukaryotic", "gene", "could", "have", "evolved", "from", "recombination", "between", "a", "gene", "that", "encoded", "a", "soluble", "nuclear", "protein", "and", "a", "membrane", "protein", "gene", "similar", "to", "those", "in", "yeast", "." ]

[ "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "are", "the", "first", "to", "demonstrate", "the", "structural", "organization", "of", "a", "vertebrate", "gene", "encoding", "an", "integral", "membrane", "protein", "of", "the", "nuclear", "envelope", "that", "may", "be", "a", "member", "of", "a", "family", "of", "polypeptides", "conserved", "in", "evolution", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Virtually", "no", "information", "is", "available", "on", "regulation", "and", "functions", "of", "CD38", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

[ "Recently", "we", "reported", "that", "all", "-", "trans", "-", "retinoic", "acid", "(", "ATRA", ")", "is", "a", "potent", "and", "highly", "specific", "inducer", "of", "CD38", "expression", "in", "human", "promyelocytic", "leukemia", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "report", "that", "ATRA", "-", "induced", "expression", "of", "CD38", "antigen", "in", "myeloid", "cells", "is", "mediated", "through", "retinoic", "acid", "-", "alpha", "receptor", "(", "RAR", "alpha", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O" ]

[ "ATRA", "failed", "to", "induce", "CD38", "expression", "in", "a", "mutant", "subclone", "of", "the", "HL", "-", "60", "myeloid", "leukemia", "cell", "line", "(", "designated", "HL", "-", "60R", ")", "that", "is", "relatively", "resistant", "to", "ATRA", "-", "induced", "granulocytic", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Retroviral", "vector", "-", "mediated", "transduction", "of", "RA", "receptor", "(", "RAR", "alpha", ")", "into", "this", "HL", "-", "60R", "subclone", "completely", "restored", "the", "sensitivity", "of", "these", "cells", "to", "ATRA", "in", "terms", "of", "their", "ability", "to", "express", "CD38", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "CD38", "expression", "was", "not", "inducible", "by", "ATRA", "in", "HL", "-", "60R", "cells", ",", "transfected", "with", "a", "functional", "RAR", "beta", ",", "RAR", "gamma", ",", "or", "RXR", "alpha", "receptor", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Induction", "of", "CD38", "in", "acute", "promyelocytic", "and", "acute", "myeloblastic", "leukemia", "cells", "was", "independent", "of", "ATRA", "-", "induced", "cytodifferentiation", "." ]

[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Following", "culture", "with", "ATRA", ",", "increased", "CD38", "protein", "levels", "were", "also", "observed", "in", "normal", "CD34", "+", "bone", "marrow", "cells", ",", "but", "not", "on", "normal", "circulating", "granulocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "From", "these", "results", ",", "we", "conclude", "that", "CD38", "is", "ATRA", "inducible", "in", "myeloid", "leukemia", "cells", "and", "normal", "CD34", "+", "bone", "marrow", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "effect", "is", "independent", "of", "differentiation", "and", "is", "mediated", "by", "RAR", "alpha", "in", "HL", "-", "60", "cells", ",", "suggesting", "a", "similar", "role", "for", "RAR", "alpha", "in", "CD38", "expression", "in", "other", "hematopoietic", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Some", "antioxidants", ",", "including", "butylated", "hydroxyanisole", "(", "BHA", ")", ",", "tetrahydropapaveroli", "(", "THP", ")", ",", "nordihydroguiauretic", "acid", ",", "and", "10", ",", "11", "-", "dihydroxyaporphine", "(", "DHA", ")", ",", "were", "found", "to", "be", "potent", "inhibitors", "of", "the", "production", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "(", "TNF", ")", "-", "alpha", ",", "IL", "-", "1", "beta", ",", "and", "IL", "-", "6", "by", "human", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "PBMC", ")", "stimulated", "by", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "(", "IC50s", "in", "the", "low", "micromolar", "range", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Inhibition", "of", "cytokine", "production", "by", "PBMC", "was", "observed", "also", "when", "other", "inducers", "were", "used", "(", "staphylococci", ",", "silica", ",", "zymosan", ")", "." ]

[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "active", "compounds", "did", "not", "inhibit", "IL", "-", "1", "-", "induced", "production", "of", "IL", "-", "6", "in", "fibroblasts", ",", "showing", "the", "cell", "selectivity", "of", "the", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Antioxidant", "-", "mediated", "inhibition", "of", "cytokine", "production", "was", "correlated", "with", "low", "levels", "of", "the", "corresponding", "messenger", "RNAs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Nuclear", "run", "-", "on", "experiments", "showed", "that", "THP", "inhibited", "transcription", "of", "the", "IL", "-", "1", "beta", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "THP", "decreased", "the", "concentration", "of", "the", "transcription", "factors", "NF", "-", "kappa", "B", "and", "AP", "-", "1", "detected", "in", "nuclear", "extracts", "of", "PBMC", "cultured", "in", "the", "presence", "or", "absence", "of", "LPS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "THP", "and", "DHA", "markedly", "decreased", "the", "levels", "of", "TNF", "-", "alpha", "and", "IL", "-", "1", "beta", "in", "the", "circulation", "of", "mice", "following", "LPS", "injection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Coordinate", "inhibition", "of", "the", "transcription", "of", "genes", "for", "inflammatory", "cytokines", "could", "provide", "a", "strategy", "for", "therapy", "of", "diseases", "with", "inflammatory", "pathogenesis", "and", "for", "septic", "shock", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "interleukin", "-", "4", "-", "induced", "transcription", "factor", ":", "IL", "-", "4", "Stat", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Interleukin", "-", "4", "(", "IL", "-", "4", ")", "is", "an", "immunomodulatory", "cytokine", "secreted", "by", "activated", "T", "lymphocytes", ",", "basophils", ",", "and", "mast", "cells", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "plays", "an", "important", "role", "in", "modulating", "the", "balance", "of", "T", "helper", "(", "Th", ")", "cell", "subsets", ",", "favoring", "expansion", "of", "the", "Th2", "lineage", "relative", "to", "Th1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Imbalance", "of", "these", "T", "lymphocyte", "subsets", "has", "been", "implicated", "in", "immunological", "diseases", "including", "allergy", ",", "inflammation", ",", "and", "autoimmune", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL", "-", "4", "may", "mediate", "its", "biological", "effects", ",", "at", "least", "in", "part", ",", "by", "activating", "a", "tyrosine", "-", "phosphorylated", "DNA", "binding", "protein", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Study", "of", "the", "inhibitory", "activities", "of", "phosphotyrosine", "-", "containing", "peptides", "derived", "from", "the", "intracellular", "domain", "of", "the", "IL", "-", "4", "receptor", "provided", "evidence", "for", "direct", "coupling", "of", "receptor", "and", "transcription", "factor", "during", "the", "IL", "-", "4", "Stat", "activation", "cycle", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O" ]

[ "Evaluation", "of", "the", "respiratory", "epithelium", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "cystic", "fibrosis", "for", "the", "presence", "of", "adenovirus", "E1a", "sequences", "relevant", "to", "the", "use", "of", "E1a", "-", "adenovirus", "vectors", "for", "gene", "therapy", "for", "the", "respiratory", "manifestations", "of", "cystic", "fibrosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "safety", "reasons", ",", "the", "Ad", "vectors", "are", "rendered", "replication", "deficient", "by", "deletion", "of", "the", "E1a", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Because", "there", "is", "the", "theoretical", "possibility", "of", "an", "E1a", "-", "replication", "-", "deficient", "vector", "replicating", "as", "a", "result", "of", "recombination", "or", "complementation", "with", "Ad", "2", "/", "5", "E1a", "sequences", "present", "in", "the", "target", "cell", ",", "this", "study", "is", "directed", "toward", "evaluating", "respiratory", "epithelium", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "CF", "for", "the", "presence", "of", "E1a", "sequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "Ad", "2", "/", "5", "E1a", "-", "specific", "primers", "and", "the", "polymerase", "chain", "reaction", "to", "evaluate", "DNA", "recovered", "from", "freshly", "isolated", "nasal", "and", "bronchial", "epithelium", "recovered", "by", "brushing", ",", "E1a", "sequences", "were", "detected", "in", "respiratory", "epithelium", "of", "19", "of", "91", "normals", "(", "21", "%", ")", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "CF", "individuals", ",", "7", "of", "52", "(", "13", "%", ")", "had", "detectable", "E1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", ",", "with", "E1a", "copy", "number", "in", "the", "positive", "samples", "of", "80", "+", "/", "-", "21", "/", "10", "(", "3", ")", "recovered", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "demonstrate", "that", "there", "are", "detectable", "Ad", "2", "/", "5", "E1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", "of", "a", "small", "percentage", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "CF", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Because", "of", "the", "theoretical", "potential", "of", "such", "sequences", "supporting", "replication", "of", "E1a", "-", "Ad", "vectors", ",", "human", "gene", "therapy", "protocols", "for", "CF", "utilizing", "such", "vectors", "should", "consider", "evaluating", "study", "individuals", "for", "the", "presence", "of", "Ad", "2", "/", "5", "E1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Leiomyosarcoma", "of", "the", "vulva", ":", "report", "of", "a", "case", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "52", "-", "year", "-", "old", "female", "presented", "with", "a", "progressively", "enlarging", "vulvar", "mass", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pathological", "evaluation", "revealed", "a", "high", "-", "grade", "vulvar", "leiomyosarcoma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immunohistochemical", "and", "ultrastructural", "studies", "were", "performed", "to", "support", "the", "diagnosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "an", "effort", "to", "better", "understand", "the", "biology", "of", "this", "tumor", "additional", "immunohistochemical", "studies", "for", "the", "protein", "product", "of", "p53", "tumor", "suppressor", "gene", "and", "estrogen", "receptor", "expression", "by", "tumor", "cells", ",", "as", "well", "as", "the", "type", "of", "immune", "cells", "infiltrating", "the", "tumor", "were", "performed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Macrophages", "and", "T", "and", "B", "lymphocytes", "infiltrated", "the", "tumor", "in", "moderate", "numbers", "with", "occasional", "lymphoid", "aggregate", "formation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "is", "the", "first", "attempt", "to", "better", "understand", "the", "biology", "of", "these", "tumors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Stimulation", "of", "HIV", "replication", "in", "mononuclear", "phagocytes", "by", "leukemia", "inhibitory", "factor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "This", "study", "examined", "the", "effects", "of", "leukemia", "inhibitory", "factor", "(", "LIF", ")", "on", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "HIV", ")", "replication", "in", "mononuclear", "phagocytes", "(", "MNP", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "LIF", "induced", "a", "dose", "-", "dependent", "increase", "in", "p24", "antigen", "production", "in", "the", "chronically", "infected", "promonocytic", "cell", "line", "U1", "." ]

[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "LIF", "increased", "steady", "-", "state", "levels", "of", "HIV", "mRNA", "at", "2", ".", "0", ",", "4", ".", "3", ",", "and", "9", ".", "2", "kB", "." ]

[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "was", "detectable", "by", "24", "h", "and", "persisted", "until", "72", "h", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]