Datasets:

---

siddharthtumre

/

JNLPBA-Processed

like 0

[ "The", "evolutionarily", "conserved", "N", "-", "terminal", "half", "of", "IBR", "/", "F", "harbors", "the", "DNA", "-", "binding", "/", "dimerization", "domain", "(", "outer", "limits", ",", "127", "to", "283", ")", ",", "one", "or", "several", "casein", "kinase", "II", "sites", "(", "37", "to", "67", ")", ",", "and", "a", "bipartite", "nuclear", "localization", "signal", "(", "89", "to", "106", ")", "which", "appears", "to", "be", "necessary", "for", "nuclear", "targeting", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Binding", "site", "selection", "revealed", "that", "the", "alternating", "RCGCRYGCGY", "consensus", "constitutes", "high", "-", "affinity", "IBR", "/", "F", "binding", "sites", "and", "that", "the", "direct", "-", "repeat", "palindrome", "TGCGCATGCGCA", "is", "the", "optimal", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "A", "survey", "of", "genes", "potentially", "regulated", "by", "this", "family", "of", "factors", "primarily", "revealed", "genes", "involved", "in", "growth", "-", "related", "metabolism", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Triggering", "of", "the", "human", "interleukin", "-", "6", "gene", "by", "interferon", "-", "gamma", "and", "tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "in", "monocytic", "cells", "involves", "cooperation", "between", "interferon", "regulatory", "factor", "-", "1", ",", "NF", "kappa", "B", ",", "and", "Sp1", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "B", "I", "O" ]

[ "We", "investigated", "the", "molecular", "basis", "of", "the", "synergistic", "induction", "by", "interferon", "-", "gamma", "(", "IFN", "-", "gamma", ")", "/", "tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "of", "human", "interleukin", "-", "6", "(", "IL", "-", "6", ")", "gene", "in", "THP", "-", "1", "monocytic", "cells", ",", "and", "compared", "it", "with", "the", "basis", "of", "this", "induction", "by", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Functional", "studies", "with", "IL", "-", "6", "promoter", "demonstrated", "that", "three", "regions", "are", "the", "targets", "of", "the", "IFN", "-", "gamma", "and", "/", "or", "TNF", "-", "alpha", "action", ",", "whereas", "only", "one", "of", "these", "regions", "seemed", "to", "be", "implicated", "in", "LPS", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "three", "regions", "concerned", "are", ":", "1", ")", "a", "region", "between", "-", "73", "and", "-", "36", ",", "which", "is", "the", "minimal", "element", "inducible", "by", "LPS", "or", "TNF", "-", "alpha", ";", "2", ")", "an", "element", "located", "between", "-", "181", "and", "-", "73", ",", "which", "appeared", "to", "regulate", "the", "response", "to", "IFN", "-", "gamma", "and", "TNF", "-", "alpha", "negatively", ";", "and", "3", ")", "a", "distal", "element", "upstream", "of", "-", "224", ",", "which", "was", "inducible", "by", "IFN", "-", "gamma", "alone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

[ "LPS", "signaling", "was", "found", "to", "involve", "NF", "kappa", "B", "activation", "by", "the", "p50", "/", "p65", "heterodimers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Synergistic", "induction", "of", "the", "IL", "-", "6", "gene", "by", "IFN", "-", "gamma", "and", "TNF", "-", "alpha", ",", "in", "monocytic", "cells", ",", "involved", "cooperation", "between", "the", "IRF", "-", "1", "and", "NF", "kappa", "B", "p65", "homodimers", "with", "concomitant", "removal", "of", "the", "negative", "effect", "of", "the", "retinoblastoma", "control", "element", "present", "in", "the", "IL", "-", "6", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "This", "removal", "occurred", "by", "activation", "of", "the", "constitutive", "Sp1", "factor", ",", "whose", "increased", "binding", "activity", "and", "phosphorylation", "were", "mediated", "by", "IFN", "-", "gamma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Males", "with", "X", "-", "linked", "severe", "combined", "immunodeficiency", "(", "XSCID", ")", "have", "defects", "in", "the", "common", "cytokine", "receptor", "gamma", "chain", "(", "gamma", "c", ")", "gene", "that", "encodes", "a", "shared", ",", "essential", "component", "of", "the", "receptors", "of", "interleukin", "-", "2", "(", "IL", "-", "2", ")", ",", "IL", "-", "4", ",", "IL", "-", "7", ",", "IL", "-", "9", ",", "and", "IL", "-", "15", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "The", "Janus", "family", "tyrosine", "kinase", "Jak3", "is", "the", "only", "signaling", "molecule", "known", "to", "be", "associated", "with", "gamma", "c", ",", "so", "it", "was", "hypothesized", "that", "defects", "in", "Jak3", "might", "cause", "an", "XSCID", "-", "like", "phenotype", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "Epstein", "-", "Barr", "virus", "(", "EBV", ")", "-", "transformed", "cell", "line", "derived", "from", "her", "lymphocytes", "had", "normal", "gamma", "c", "expression", "but", "lacked", "Jak3", "protein", "and", "had", "greatly", "diminished", "Jak3", "messenger", "RNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Sequencing", "revealed", "a", "different", "mutation", "on", "each", "allele", ":", "a", "single", "nucleotide", "insertion", "resulting", "in", "a", "frame", "shift", "and", "premature", "termination", "in", "the", "Jak3", "JH4", "domain", "and", "a", "nonsense", "mutation", "in", "the", "Jak3", "JH2", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O" ]

[ "Constitutive", "overexpression", "of", "the", "L", "-", "selectin", "gene", "in", "fresh", "leukemic", "cells", "of", "adult", "T", "-", "cell", "leukemia", "that", "can", "be", "transactivated", "by", "human", "T", "-", "cell", "lymphotropic", "virus", "type", "1", "Tax", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "To", "understand", "the", "mechanism", "of", "leukemic", "cell", "infiltration", "into", "organs", ",", "we", "studied", "the", "expression", "and", "regulation", "of", "L", "-", "selectin", "mRNA", "in", "fresh", "leukemic", "cells", "of", "adult", "T", "-", "cell", "leukemia", "(", "ATL", ")", "patients", "and", "investigated", "the", "response", "of", "the", "L", "-", "selectin", "promoter", "to", "human", "T", "-", "cell", "lymphotropic", "virus", "type", "1", "(", "HTLV", "-", "1", ")", "Tax", ",", "which", "is", "a", "viral", "transcriptional", "transactivator", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Flow", "cytometry", "showed", "that", "L", "-", "selectin", "was", "expressed", "on", "fresh", "ATL", "cells", "along", "with", "other", "activation", "antigens", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Northern", "blot", "analysis", "showed", "that", "ATL", "cells", "overexpressed", "that", "L", "-", "selectin", "mRNA", "and", "that", "the", "level", "was", "aberrantly", "upregulated", "after", "PMA", "stimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Studies", "using", "in", "situ", "hybridization", "showed", "expression", "of", "the", "L", "-", "selectin", "mRNA", "in", "the", "infiltrating", "leukemic", "cells", "in", "the", "liver", "of", "two", "ATL", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Intravenous", "injection", "of", "a", "rat", "T", "-", "cell", "line", "that", "overexpresses", "L", "-", "selectin", "showed", "increased", "organ", "infiltration", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chloramphenicol", "acetyltransferase", "(", "CAT", ")", "assay", "after", "transient", "cotransfection", "showed", "about", "a", "fivefold", "transactivation", "of", "the", "L", "-", "selectin", "promoter", "by", "Tax", "." ]

[ "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O" ]

[ "The", "serum", "level", "of", "the", "shed", "form", "of", "L", "-", "selectin", "was", "significantly", "increased", "in", "ATL", "patients", "(", "mean", "+", "/", "-", "SD", ",", "4", ",", "215", ".", "4", "+", "/", "-", "4", ",", "111", "ng", "/", "mL", ")", "compared", "with", "those", "of", "asymptomatic", "carriers", "and", "healthy", "blood", "donors", "(", "mean", "+", "/", "-", "SD", ",", "1", ",", "148", ".", "0", "+", "/", "-", "269", ".", "0", "ng", "/", "mL", "and", "991", ".", "9", "+", "/", "-", "224", "ng", "/", "mL", ",", "respectively", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "overexpression", "of", "L", "-", "selectin", ",", "as", "well", "as", "of", "inflammatory", "cytokines", ",", "by", "ATL", "cells", "may", "provide", "a", "basis", "for", "ATL", "cells", "to", "attach", "the", "vascular", "endothelium", ",", "leading", "to", "transmigration", "and", "organ", "infitration", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "herpesvirus", "6", "variant", "A", ",", "but", "not", "variant", "B", ",", "infects", "EBV", "-", "positive", "B", "lymphoid", "cells", ",", "activating", "the", "latent", "EBV", "genome", "through", "a", "BZLF", "-", "1", "-", "dependent", "mechanism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "only", "exception", "is", "represented", "by", "the", "P3HR1", "cells", ",", "in", "which", ",", "however", ",", "the", "infection", "by", "the", "variant", "B", "does", "not", "determine", "induction", "of", "EBV", "antigens", ";", "(", "2", ")", "the", "presence", "of", "the", "EBV", "genome", "contributes", "to", "the", "susceptibility", "of", "the", "B", "cell", "lines", "to", "HHV", "-", "6", "infection", ",", "increasing", "the", "binding", "sites", "and", "the", "percentage", "of", "infectable", "cells", ",", "as", "detected", "by", "immunoelectron", "microscopy", ";", "and", "(", "3", ")", "HHV", "-", "6", "infected", "T", "cells", ",", "transfected", "with", "plasmids", "bearing", "the", "promoter", "regions", "of", "the", "EBV", "early", "genes", "BZLF1", "and", "BMRF1", ",", "show", "a", "strong", "transactivation", "of", "these", "promoters", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

[ "Absorptive", "hypercalciuria", "(", "a", "stone", "-", "forming", "condition", ")", "is", "characterized", "by", "gut", "hyperabsorption", "of", "calcium", ",", "hypercalciuria", ",", "and", "reduced", "bone", "density", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Inasmuch", "as", "these", "features", "implicate", "enhanced", "calcitriol", "action", "in", "gut", "and", "bone", ",", "we", "analyzed", "the", "vitamin", "D", "receptor", "(", "VDR", ")", "gene", "to", "ascertain", "whether", "an", "abnormality", "of", "this", "gene", "marks", "patients", "with", "intestinal", "hyperabsorption", "of", "calcium", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "compared", "the", "frequency", "of", "a", "restriction", "fragment", "length", "polymorphism", "(", "Bsm", "I", ")", "associated", "with", "different", "alleles", "of", "the", "VDR", "gene", "in", "a", "group", "of", "33", "well", "characterized", "absorptive", "hypercalciuric", "patients", "and", "a", "group", "of", "36", "normal", "race", "-", "and", "age", "-", "matched", "control", "subjects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "coding", "region", "of", "VDR", "messenger", "RNA", "was", "also", "normal", ",", "as", "determined", "by", "both", "DNA", "sequence", "analysis", "and", "chemical", "mismatch", "cleavage", "analysis", "of", "copy", "DNA", "from", "11", "index", "absorptive", "hypercalciuric", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "the", "basis", "of", "these", "results", ",", "we", "propose", "that", "the", "enhanced", "intestinal", "calcium", "absorption", "invariably", "seen", "in", "absorptive", "hypercalciuria", "and", "attendant", "symptoms", "of", "this", "disorder", "are", "not", "attributable", "to", "mutations", "of", "the", "VDR", "and", "are", "not", "linked", "to", "a", "common", "VDR", "genotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Transcriptional", "regulation", "of", "the", "gene", "encoding", "the", "human", "C", "-", "type", "lectin", "leukocyte", "receptor", "AIM", "/", "CD69", "and", "functional", "characterization", "of", "its", "tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "-", "responsive", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "The", "human", "activation", "antigen", "CD69", "is", "a", "member", "of", "the", "C", "-", "type", "animal", "lectin", "superfamily", "that", "functions", "as", "a", "signal", "-", "transmitting", "receptor", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Although", "the", "expression", "of", "CD69", "can", "be", "induced", "in", "vitro", "on", "cells", "of", "most", "hematopoietic", "lineages", "with", "a", "wide", "variety", "of", "stimuli", ",", "in", "vivo", "it", "is", "mainly", "expressed", "by", "T", "-", "lymphocytes", "located", "in", "the", "inflammatory", "infiltrates", "of", "several", "human", "diseases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "elucidate", "the", "mechanisms", "that", "regulate", "the", "constitutive", "and", "inducible", "expression", "of", "CD69", "by", "leukocytes", ",", "we", "isolated", "the", "promoter", "region", "of", "the", "CD69", "gene", "and", "carried", "out", "its", "functional", "characterization", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transient", "expression", "of", "CD69", "promoter", "-", "based", "reporter", "gene", "constructs", "in", "K562", "cells", "indicated", "that", "the", "proximal", "promoter", "region", "spanning", "positions", "-", "78", "to", "+", "16", "contained", "the", "cis", "-", "acting", "sequences", "necessary", "for", "basal", "and", "phorbol", "12", "-", "myristate", "13", "-", "acetate", "-", "inducible", "transcription", "of", "the", "CD69", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Removal", "of", "the", "upstream", "sequences", "located", "between", "positions", "-", "78", "and", "-", "38", "resulted", "in", "decreased", "promoter", "strength", "and", "abolished", "the", "response", "to", "phorbol", "12", "-", "myristate", "13", "-", "acetate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "found", "that", "tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "is", "capable", "of", "inducing", "the", "surface", "expression", "of", "the", "CD69", "molecule", "as", "well", "as", "the", "promoter", "activity", "of", "fusion", "plasmids", "that", "contain", "5", "'", "-", "flanking", "sequences", "of", "the", "CD69", "gene", ",", "suggesting", "that", "this", "cytokine", "may", "regulate", "in", "vivo", "the", "expression", "of", "CD69", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

[ "Characterization", "of", "5", "'", "end", "of", "human", "thromboxane", "receptor", "gene", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Organizational", "analysis", "and", "mapping", "of", "protein", "kinase", "C", "-", "-", "responsive", "elements", "regulating", "expression", "in", "platelets", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Platelet", "thromboxane", "receptors", "are", "acutely", "and", "reversibly", "upregulated", "after", "acute", "myocardial", "infarction", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "determine", "if", "platelet", "thromboxane", "receptors", "are", "under", "transcriptional", "control", ",", "we", "isolated", "and", "characterized", "human", "genomic", "DNA", "clones", "containing", "the", "5", "'", "flanking", "region", "of", "the", "thromboxane", "receptor", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "A", "major", "transcription", "initiation", "site", "was", "located", "in", "three", "human", "tissues", "approximately", "560", "bp", "upstream", "from", "the", "translation", "initiation", "codon", "and", "380", "bp", "upstream", "from", "any", "previously", "identified", "transcription", "initiation", "site", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "The", "thromboxane", "receptor", "gene", "has", "neither", "a", "TATA", "nor", "a", "CAAT", "consensus", "site", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Thromboxane", "receptor", "promoter", "activity", ",", "as", "assessed", "by", "CAT", "expression", ",", "was", "relatively", "weak", "but", "was", "significantly", "enhanced", "by", "phorbol", "ester", "treatment", "." ]

[ "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Functional", "analysis", "of", "5", "'", "deletion", "constructs", "in", "transfected", "K562", "cells", "and", "gel", "mobility", "shift", "localized", "the", "major", "phorbol", "ester", "-", "responsive", "motifs", "in", "the", "thromboxane", "receptor", "gene", "promoter", "to", "a", "cluster", "of", "activator", "protein", "-", "2", "(", "AP", "-", "2", ")", "binding", "consensus", "sites", "located", "approximately", "1", ".", "8", "kb", "5", "'", "from", "the", "transcription", "initiation", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "These", "findings", "strongly", "suggest", "that", "the", "mechanism", "for", "previously", "described", "upregulation", "of", "platelet", "thromboxane", "receptors", "after", "acute", "myocardial", "infarction", "is", "increased", "thromboxane", "receptor", "gene", "transcription", "in", "platelet", "-", "progenitor", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Estrogen", "receptor", "concentration", "and", "social", "factors", "as", "predictors", "of", "natural", "killer", "cell", "activity", "in", "early", "-", "stage", "breast", "cancer", "patients", "." ]

[ "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Confirmation", "of", "a", "model", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Previous", "work", "of", "ours", "has", "demonstrated", "that", "a", "significant", "amount", "of", "natural", "killer", "(", "NK", ")", "activity", "variance", "after", "surgery", "in", "stage", "I", "and", "II", "breast", "cancer", "patients", "could", "be", "accounted", "for", "by", "both", "the", "estrogen", "receptor", "(", "ER", ")", "status", "of", "the", "tumor", "and", "by", "social", "factors", ",", "namely", ",", "perceived", "social", "support", "and", "seeking", "social", "support", "as", "a", "general", "coping", "strategy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "considerable", "evidence", "has", "accumulated", "that", "social", "support", "in", "both", "animal", "and", "human", "populations", "may", "have", "survival", "value", ",", "we", "sought", "to", "test", "the", "reliability", "of", "this", "regression", "model", ",", "using", "coping", "and", "perceived", "support", "factor", "values", "obtained", "at", "3", "months", "after", "surgery", "to", "account", "for", "concurrent", "follow", "-", "up", "NK", "activity", "in", "this", "serially", "assessed", "group", "of", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "was", "found", "that", "the", "most", "significant", "variable", "predicting", "NK", "activity", "at", "follow", "-", "up", "was", "tumor", "ER", "concentration", ",", "with", "higher", "NK", "activity", "associated", "with", "ER", "-", "status", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "seeking", "social", "support", "as", "a", "coping", "strategy", ",", "as", "well", "as", "the", "perceived", "quality", "of", "support", ",", "also", "entered", "the", "model", "to", "account", "for", "a", "significant", "amount", "of", "NK", "activity", "variance", "(", "multivariate", "F", "=", "5", ".", "25", ",", "p", "less", "than", "0", ".", "001", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "If", ",", "as", "the", "literature", "suggests", ",", "NK", "activity", "is", "relevant", "to", "breast", "cancer", "control", ",", "and", "since", "ER", "-", "tumors", "have", "a", "worse", "prognosis", ",", "we", "suggest", "here", "that", "perhaps", "such", "tumors", "are", "resistant", "to", "control", "by", "NK", "cells", "because", "they", "lack", "the", "ability", "to", "attract", "an", "accumulation", "of", "effector", "cells", "to", "the", "tumor", "site", ",", "or", "because", "blocking", "factors", "at", "the", "site", "of", "the", "tumor", "prevent", "local", "tumor", "control", "at", "the", "site", "of", "action", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "finding", "related", "to", "social", "support", "also", "replicates", "results", "from", "an", "independent", "sample", "of", "breast", "cancer", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "finding", ",", "taken", "together", "with", "other", "evidence", "that", "this", "social", "variable", "is", "associated", "with", "longer", "survival", "in", "breast", "cancer", "populations", ",", "underscores", "the", "potential", "importance", "of", "this", "social", "support", "variable", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "findings", "also", "suggest", "one", "possible", "immunological", "variable", "involved", ",", "with", "potential", "clinical", "significance", ",", "for", "this", "patient", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Solution", "structure", "of", "the", "sequence", "-", "specific", "HMG", "box", "of", "the", "lymphocyte", "transcriptional", "activator", "Sox", "-", "4", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Two", "groups", "of", "HMG", "box", "proteins", "are", "distinguished", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]

[ "Proteins", "in", "the", "second", "group", "carry", "a", "single", "HMG", "box", "with", "affinity", "for", "the", "minor", "groove", "of", "the", "heptamer", "motif", "AACAAAG", "or", "variations", "thereof", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "solution", "structure", "for", "the", "non", "-", "sequence", "-", "specific", "C", "-", "terminal", "HMG", "box", "of", "HMG", "-", "1", "has", "recently", "been", "proposed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Now", ",", "we", "report", "the", "solution", "structure", "of", "the", "sequence", "-", "specific", "HMG", "-", "box", "of", "the", "SRY", "-", "related", "protein", "Sox", "-", "4", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "B", "I", "I", "O" ]

[ "NMR", "analysis", "demonstrated", "the", "presence", "of", "three", "alpha", "-", "helices", "(", "Val10", "-", "Gln22", ",", "Glu30", "-", "Leu41", "and", "Phe50", "-", "Tyr65", ")", "connected", "by", "loop", "regions", "(", "Ser23", "-", "Ala49", "and", "Leu42", "-", "Pro49", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

[ "Helices", "I", "and", "II", "are", "positioned", "in", "an", "antiparallel", "mode", "and", "form", "one", "arm", "of", "the", "HMG", "box", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Helix", "III", "is", "less", "rigid", ",", "makes", "an", "average", "angle", "of", "about", "90", "degrees", "with", "helices", "I", "and", "II", ",", "and", "constitutes", "the", "other", "arm", "of", "the", "molecule", "." ]

[ "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Nuclear", "factor", "-", "IL6", "activates", "the", "human", "IL", "-", "4", "promoter", "in", "T", "cells", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Positive", "regulatory", "element", "I", "(", "PRE", "-", "I", ")", "is", "a", "strong", "enhancer", "element", "essential", "for", "expression", "of", "the", "human", "IL", "-", "4", "gene", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "To", "identify", "transcription", "factors", "binding", "to", "PRE", "-", "I", ",", "we", "screened", "a", "cDNA", "expression", "library", "from", "Jurkat", "T", "cells", "and", "isolated", "a", "cDNA", "encoding", "nuclear", "factor", "(", "NF", ")", "-", "IL6", "(", "also", "known", "as", "C", "/", "EBP", "beta", ")", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]

[ "NF", "-", "IL6", "mRNA", "was", "found", "in", "human", "Jurkat", "T", "cells", "and", "in", "the", "mouse", "Th2", "clone", "D10", ",", "but", "not", "in", "Th1", "clone", "29", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "rNF", "-", "IL6", "expressed", "in", "bacteria", "was", "shown", "to", "specifically", "bind", "to", "PRE", "-", "I", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "PRE", "-", "I", "forms", "multiple", "DNA", "-", "protein", "complexes", "with", "nuclear", "extracts", "from", "Jurkat", "cells", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Some", "of", "these", "complexes", "were", "demonstrated", "to", "contain", "NF", "-", "IL6", "by", "using", "anti", "-", "C", "/", "EBP", "beta", "Abs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Overexpression", "of", "NF", "-", "IL6", "enhanced", "expression", "of", "the", "chloramphenicol", "acetyl", "transferase", "reporter", "gene", "linked", "to", "the", "PRE", "-", "I", "-", "thymidine", "kinase", "or", "the", "human", "IL", "-", "4", "promoter", "more", "than", "10", "-", "fold", "in", "Jurkat", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Promoter", "deletion", "studies", "revealed", "two", "additional", "NF", "-", "IL6", "binding", "sites", "located", "at", "positions", "-", "44", "to", "-", "36", "(", "C", "/", "EBP", "proximal", ")", "and", "-", "87", "to", "-", "79", "(", "C", "/", "EBP", "medial", ")", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "demonstrate", "that", "NF", "-", "IL6", "is", "involved", "in", "transcriptional", "activation", "of", "the", "human", "IL", "-", "4", "promoter", "in", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identification", "of", "an", "I", "kappa", "B", "alpha", "-", "associated", "protein", "kinase", "in", "a", "human", "monocytic", "cell", "line", "and", "determination", "of", "its", "phosphorylation", "sites", "on", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Stimulation", "of", "cells", "leads", "to", "a", "rapid", "phosphorylation", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", ",", "which", "is", "presumed", "to", "be", "important", "for", "the", "subsequent", "degradation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "have", "identified", "a", "kinase", "in", "cell", "extracts", "from", "the", "LPS", "-", "stimulated", "human", "monocytic", "cell", "line", ",", "THP", "-", "1", ",", "that", "specifically", "binds", "and", "phosphorylates", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "LPS", "stimulation", "transiently", "enhanced", "the", "I", "kappa", "B", "alpha", "-", "bound", "kinase", "activity", "in", "THP", "-", "1", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutational", "analyses", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "and", "competition", "experiments", "with", "the", "synthetic", "peptides", "identified", "major", "phosphorylation", "sites", "by", "the", "bound", "kinase", "as", "Ser", "and", "Thr", "residues", "in", "the", "C", "-", "terminal", "acidic", "domain", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Moreover", ",", "we", "show", "that", "the", "peptide", ",", "corresponding", "to", "the", "C", "-", "terminal", "acidic", "domain", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", ",", "blocked", "the", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappa", "B", "activation", "as", "well", "as", "inducible", "phosphorylation", "of", "endogenous", "I", "kappa", "B", "alpha", "in", "a", "cell", "-", "free", "system", "using", "THP", "-", "1", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggested", "that", "the", "bound", "kinase", "is", "involved", "in", "the", "signaling", "pathway", "of", "LPS", "by", "inducing", "the", "phosphorylation", "of", "the", "C", "-", "terminal", "region", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "and", "subsequent", "dissociation", "of", "the", "NF", "-", "kappa", "B", ".", "I", "kappa", "B", "alpha", "complex", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Bik", ",", "a", "novel", "death", "-", "inducing", "protein", "shares", "a", "distinct", "sequence", "motif", "with", "Bcl", "-", "2", "family", "proteins", "and", "interacts", "with", "viral", "and", "cellular", "survival", "-", "promoting", "proteins", "." ]

[ "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "The", "survival", "-", "promoting", "activity", "of", "the", "Bcl", "-", "2", "family", "of", "proteins", "appears", "to", "be", "modulated", "by", "interactions", "between", "various", "cellular", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "We", "have", "identified", "a", "novel", "cellular", "protein", ",", "Bik", ",", "that", "interacts", "with", "the", "cellular", "survival", "-", "promoting", "proteins", ",", "Bcl", "-", "2", "and", "Bcl", "-", "xL", ",", "as", "well", "as", "the", "viral", "survival", "-", "promoting", "proteins", ",", "Epstein", "Barr", "virus", "-", "BHRF1", "and", "adenovirus", "E1B", "-", "19", "kDa", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "In", "transient", "transfection", "assays", ",", "Bik", "promotes", "cell", "death", "in", "a", "manner", "similar", "to", "the", "death", "-", "promoting", "members", "of", "the", "Bcl", "-", "2", "family", ",", "Bax", "and", "Bak", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "B", "O" ]

[ "While", "Bik", "does", "not", "show", "overt", "homology", "to", "the", "BH1", "and", "BH2", "conserved", "domains", "characteristic", "of", "the", "Bcl", "-", "2", "family", ",", "it", "does", "share", "a", "9", "amino", "acid", "domain", "(", "BH3", ")", "with", "Bax", "and", "Bak", "which", "may", "be", "a", "critical", "determinant", "for", "the", "death", "-", "promoting", "activity", "of", "these", "proteins", "." ]

[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "human", "TCF", "-", "1", "gene", "encodes", "a", "nuclear", "DNA", "-", "binding", "protein", "uniquely", "expressed", "in", "normal", "and", "neoplastic", "T", "-", "lineage", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "TCF", "-", "1", "gene", "encodes", "a", "putative", "transcription", "factor", "with", "affinity", "for", "a", "sequence", "motif", "occurring", "in", "a", "number", "of", "T", "-", "cell", "enhancers", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "We", "have", "now", "raised", "a", "monoclonal", "antibody", "to", "document", "expression", "and", "biochemistry", "of", "the", "human", "TCF", "-", "1", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "As", "expected", ",", "the", "TCF", "-", "1", "protein", "was", "detectable", "only", "in", "cell", "lines", "of", "T", "lineage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Its", "expression", "was", "always", "restricted", "to", "the", "nucleus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Western", "blotting", "yielded", "a", "set", "of", "bands", "ranging", "from", "25", "kD", "to", "55", "kD", ",", "resulting", "from", "extensive", "alternative", "splicing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "TCF", "-", "1", "protein", "was", "detectable", "in", "all", "samples", "of", "a", "set", "of", "22", "T", "-", "cell", "malignancies", "of", "various", "stages", "of", "maturation", ",", "but", "was", "absent", "from", "a", "large", "number", "of", "other", "hematologic", "neoplasms", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "observations", "imply", "a", "T", "cell", "-", "specific", "function", "for", "TCF", "-", "1", ",", "a", "notion", "corroborated", "by", "recent", "observations", "on", "Tcf", "-", "1", "knock", "-", "out", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "these", "results", "indicate", "that", "nuclear", "TCF", "-", "1", "expression", "can", "serve", "as", "a", "pan", "-", "T", "-", "lineage", "marker", "in", "the", "diagnosis", "of", "lymphoid", "malignancies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cross", "-", "linking", "of", "Fc", "gamma", "receptors", "activates", "HIV", "-", "1", "long", "terminal", "repeat", "-", "driven", "transcription", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Elevation", "of", "the", "levels", "of", "circulating", "immune", "complexes", "frequently", "accompanies", "HIV", "-", "1", "infection", "and", "is", "a", "prognostic", "indicator", "of", "clinical", "progression", "from", "asymptomatic", "infection", "to", "AIDS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "report", "that", "cross", "-", "linking", "of", "Fc", "gamma", "RI", "or", "Fc", "gamma", "RII", "by", "adherent", "human", "IgG", "or", "by", "specific", "anti", "-", "Fc", "gamma", "R", "mAb", "activates", "HIV", "-", "1", "gene", "expression", "in", "the", "human", "monocytic", "cell", "line", "BF24", "and", "increased", "HIV", "RNA", "expression", "in", "monocytes", "from", "HIV", "infected", "patients", "as", "assayed", "by", "reverse", "transcription", "-", "PCR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "THP", "-", "1", "cells", ",", "Fc", "gamma", "R", "cross", "-", "linking", "induced", "NF", "-", "kappa", "B", ",", "which", "is", "known", "to", "bind", "to", "the", "regulatory", "region", "of", "the", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", "of", "HIV", "-", "1", "and", "to", "activate", "HIV", "-", "1", "transcription", ".", "Anti", "-", "TNF", "-", "alpha", "antibody", "but", "not", "anti", "-", "IL", "-", "1", "beta", "antibody", "strongly", "inhibited", "both", "the", "induction", "of", "HIV", "-", "1", "-", "LTR", "-", "driven", "transcription", "and", "the", "induction", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "by", "Fc", "gamma", "R", "cross", "-", "linking", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "indicate", "that", "Fc", "gamma", "R", "can", "mediate", "a", "TNF", "-", "alpha", "-", "dependent", "induction", "of", "HIV", "-", "1", "gene", "transcription", "and", "suggest", "that", "immune", "complexes", "may", "contribute", "to", "the", "pathophysiology", "of", "HIV", "-", "1", "infection", "by", "augmenting", "viral", "replication", "in", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]