id
stringlengths 1
5
| tokens
sequence | ner_tags
sequence |
---|---|---|
12901 | [
"The",
"29",
"-",
"kDa",
"proteins",
"were",
"confirmed",
"to",
"be",
"phosphorylated",
"forms",
"of",
"HSP27",
"by",
"immunoprecipitation",
"studies",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12902 | [
"Thus",
",",
"the",
"`",
"`",
"estrogen",
"receptor",
"-",
"related",
"protein",
"'",
"'",
"is",
"HSP27",
",",
"and",
"the",
"three",
"major",
"29",
"-",
"kDa",
"proteins",
"phosphorylated",
"in",
"thrombin",
"-",
"activated",
"platelets",
"are",
"forms",
"of",
"HSP27",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
12903 | [
"These",
"data",
"suggest",
"a",
"role",
"for",
"HSP27",
"in",
"the",
"signal",
"transduction",
"events",
"of",
"platelet",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12904 | [
"Isolation",
"of",
"a",
"candidate",
"repressor",
"/",
"activator",
",",
"NF",
"-",
"E1",
"(",
"YY",
"-",
"1",
",",
"delta",
")",
",",
"that",
"binds",
"to",
"the",
"immunoglobulin",
"kappa",
"3",
"'",
"enhancer",
"and",
"the",
"immunoglobulin",
"heavy",
"-",
"chain",
"mu",
"E1",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12905 | [
"We",
"have",
"determined",
"that",
"the",
"developmental",
"control",
"of",
"immunoglobulin",
"kappa",
"3",
"'",
"enhancer",
"(",
"kappa",
"E3",
"'",
")",
"activity",
"is",
"the",
"result",
"of",
"the",
"combined",
"influence",
"of",
"positive",
"-",
"and",
"negative",
"-",
"acting",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12906 | [
"We",
"show",
"that",
"a",
"central",
"core",
"in",
"the",
"kappa",
"E3",
"'",
"enhancer",
"is",
"active",
"at",
"the",
"pre",
"-",
"B",
"-",
"cell",
"stage",
"but",
"is",
"repressed",
"by",
"flanking",
"negative",
"-",
"acting",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12907 | [
"The",
"negative",
"-",
"acting",
"sequences",
"repress",
"enhancer",
"activity",
"in",
"a",
"position",
"-",
"and",
"orientation",
"-",
"independent",
"manner",
"at",
"the",
"pre",
"-",
"B",
"-",
"cell",
"stage",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12908 | [
"NF",
"-",
"E1",
"is",
"encoded",
"by",
"the",
"same",
"gene",
"as",
"the",
"YY",
"-",
"1",
"protein",
",",
"which",
"binds",
"to",
"the",
"adeno",
"-",
"associated",
"virus",
"P5",
"promoter",
"."
] | [
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12909 | [
"The",
"predicted",
"amino",
"acid",
"sequence",
"of",
"this",
"protein",
"contains",
"features",
"characteristic",
"of",
"transcriptional",
"activators",
"as",
"well",
"as",
"transcriptional",
"repressors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
12910 | [
"A",
"human",
"putative",
"lymphocyte",
"G0",
"/",
"G1",
"switch",
"gene",
"containing",
"a",
"CpG",
"-",
"rich",
"island",
"encodes",
"a",
"small",
"basic",
"protein",
"with",
"the",
"potential",
"to",
"be",
"phosphorylated",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12911 | [
"Genes",
"actively",
"involved",
"in",
"the",
"G0",
"/",
"G1",
"switch",
"(",
"G0S",
"genes",
")",
"may",
"be",
"differentially",
"expressed",
"during",
"the",
"lectin",
"-",
"induced",
"switch",
"of",
"lymphocytes",
"from",
"the",
"G0",
"to",
"the",
"G1",
"phases",
"of",
"the",
"cell",
"cycle",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12912 | [
"This",
"paper",
"presents",
"studies",
"of",
"G0S2",
",",
"a",
"member",
"of",
"a",
"set",
"of",
"putative",
"G0S",
"genes",
",",
"for",
"which",
"cDNAs",
"were",
"cloned",
"and",
"selected",
"on",
"the",
"basis",
"of",
"differential",
"cDNA",
"hybridization",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12913 | [
"G0S2",
"mRNA",
"increases",
"transiently",
"within",
"1",
"-",
"2",
"hr",
"of",
"the",
"addition",
"of",
"lectin",
"or",
"cycloheximide",
"to",
"cultured",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"."
] | [
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12914 | [
"Comparison",
"of",
"a",
"nearly",
"full",
"-",
"length",
"cDNA",
"sequence",
"with",
"the",
"corresponding",
"genomic",
"sequence",
"reveals",
"one",
"small",
"intron",
"and",
"an",
"open",
"reading",
"frame",
"in",
"the",
"second",
"exon",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
12915 | [
"The",
"derived",
"103",
"-",
"amino",
"-",
"acid",
"basic",
"protein",
"has",
"two",
"potential",
"alpha",
"-",
"helical",
"domains",
"separated",
"by",
"a",
"hydrophobic",
"region",
"with",
"the",
"potential",
"to",
"generate",
"turns",
"and",
"assume",
"a",
"beta",
"-",
"sheet",
"conformation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12916 | [
"Consistent",
"with",
"involvement",
"in",
"the",
"G0",
"/",
"G1",
"switch",
",",
"the",
"protein",
"contains",
"potential",
"sites",
"for",
"phosphorylation",
"by",
"protein",
"kinase",
"C",
"and",
"casein",
"kinase",
"II",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
12917 | [
"The",
"gene",
"contains",
"a",
"CpG",
"-",
"rich",
"island",
"suggesting",
"expression",
"in",
"the",
"germ",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12918 | [
"Potential",
"sites",
"for",
"transcription",
"factors",
"AP1",
",",
"AP2",
",",
"and",
"AP3",
"are",
"consistent",
"with",
"rapid",
"transcriptional",
"activation",
"in",
"response",
"to",
"inducing",
"agents",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12919 | [
"USF",
"-",
"related",
"transcription",
"factor",
",",
"HIV",
"-",
"TF1",
",",
"stimulates",
"transcription",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"-",
"1",
"."
] | [
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12920 | [
"The",
"transcription",
"factor",
"HIV",
"-",
"TF1",
",",
"which",
"binds",
"to",
"a",
"region",
"about",
"60",
"bp",
"upstream",
"from",
"the",
"enhancer",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"-",
"1",
"(",
"HIV",
"-",
"1",
")",
",",
"was",
"purified",
"from",
"human",
"B",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12921 | [
"Binding",
"of",
"HIV",
"-",
"TF1",
"to",
"the",
"HIV",
"long",
"terminal",
"repeat",
"(",
"LTR",
")",
"activated",
"transcription",
"from",
"the",
"HIV",
"promoter",
"in",
"vitro",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
12922 | [
"The",
"HIV",
"-",
"TF1",
"-",
"binding",
"site",
"in",
"HIV",
"LTR",
"was",
"similar",
"to",
"the",
"site",
"recognized",
"by",
"upstream",
"stimulatory",
"factor",
"(",
"USF",
")",
"in",
"the",
"adenovirus",
"major",
"late",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12923 | [
"DNA",
"-",
"binding",
"properties",
"of",
"HIV",
"-",
"TF1",
"suggested",
"that",
"HIV",
"-",
"TF1",
"might",
"be",
"identical",
"or",
"related",
"to",
"USF",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
12924 | [
"Interestingly",
",",
"treatment",
"of",
"purified",
"HIV",
"-",
"TF1",
"by",
"phosphatase",
"greatly",
"reduced",
"its",
"DNA",
"-",
"binding",
"activity",
",",
"suggesting",
"that",
"phosphorylation",
"of",
"HIV",
"-",
"TF1",
"was",
"essential",
"for",
"DNA",
"binding",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12925 | [
"The",
"disruption",
"of",
"HIV",
"-",
"TF1",
"-",
"binding",
"site",
"induced",
"a",
"60",
"%",
"decrease",
"in",
"the",
"level",
"of",
"transcription",
"from",
"the",
"HIV",
"promoter",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
12926 | [
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"HIV",
"-",
"TF1",
"is",
"involved",
"in",
"transcriptional",
"regulation",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12927 | [
"Severe",
"5",
"-",
"fluorouracil",
"toxicity",
"secondary",
"to",
"dihydropyrimidine",
"dehydrogenase",
"deficiency",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
12928 | [
"This",
"study",
"describes",
"the",
"inheritance",
"of",
"a",
"defect",
"in",
"pyrimidine",
"catabolism",
"and",
"its",
"association",
"with",
"drug",
"-",
"induced",
"toxicity",
"in",
"a",
"patient",
"receiving",
"5",
"-",
"fluorouracil",
"(",
"FUra",
")",
"as",
"adjuvant",
"chemotherapy",
"for",
"breast",
"carcinoma",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12929 | [
"The",
"study",
"population",
"included",
"the",
"affected",
"patient",
"(",
"proband",
")",
",",
"nine",
"of",
"her",
"blood",
"relatives",
",",
"and",
"seven",
"healthy",
"volunteers",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12930 | [
"The",
"proband",
"had",
"no",
"detectable",
"DPD",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
12931 | [
"When",
"enzyme",
"levels",
"in",
"the",
"proband",
"and",
"relatives",
"were",
"compared",
"with",
"that",
"in",
"controls",
",",
"an",
"autosomal",
"recessive",
"pattern",
"of",
"inheritance",
"was",
"demonstrated",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12932 | [
"This",
"is",
"the",
"third",
"patient",
"with",
"severe",
"FUra",
"toxicity",
"secondary",
"to",
"an",
"alteration",
"in",
"pyrimidine",
"catabolism",
"and",
"the",
"second",
"from",
"our",
"clinic",
"population",
"suggesting",
"that",
"the",
"frequency",
"of",
"this",
"genetic",
"defect",
"may",
"be",
"greater",
"than",
"previously",
"thought",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12933 | [
"Transactivation",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"promoter",
"by",
"human",
"herpesvirus",
"6",
"(",
"HHV",
"-",
"6",
")",
"strains",
"GS",
"and",
"Z",
"-",
"29",
"in",
"primary",
"human",
"T",
"lymphocytes",
"and",
"identification",
"of",
"transactivating",
"HHV",
"-",
"6",
"(",
"GS",
")",
"gene",
"fragments",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12934 | [
"Human",
"herpesvirus",
"6",
"(",
"HHV",
"-",
"6",
")",
"can",
"activate",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"HIV",
")",
"promoter",
"and",
"accelerate",
"cytopathic",
"effects",
"in",
"HIV",
"-",
"infected",
"human",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12935 | [
"This",
"study",
"examines",
"the",
"regions",
"of",
"the",
"HIV",
"promoter",
"required",
"for",
"HHV",
"-",
"6",
"transactivation",
"in",
"a",
"heterogeneous",
"population",
"of",
"primary",
"human",
"T",
"lymphocytes",
"with",
"or",
"without",
"antigenic",
"stimulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12936 | [
"Two",
"different",
"strains",
"of",
"HHV",
"-",
"6",
",",
"GS",
"and",
"Z29",
",",
"transactivated",
"the",
"HIV",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
12937 | [
"The",
"GS",
"strain",
"transactivated",
"the",
"promoter",
"in",
"both",
"stimulated",
"and",
"resting",
"T",
"cells",
",",
"while",
"the",
"Z29",
"strain",
"increased",
"HIV",
"promoter",
"activity",
"only",
"in",
"stimulated",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12938 | [
"Three",
"DNA",
"clones",
"containing",
"HHV",
"-",
"6",
"(",
"GS",
")",
"genomic",
"fragments",
"transactivated",
"the",
"HIV",
"promoter",
"in",
"cotransfected",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12939 | [
"A",
"21",
".",
"4",
"-",
"kb",
"DNA",
"clone",
",",
"pZVB70",
",",
"showed",
"the",
"highest",
"transactivating",
"ability",
",",
"while",
"two",
"other",
"DNA",
"fragments",
",",
"pZVB10",
"(",
"6",
".",
"2",
"kb",
")",
"and",
"pZVH14",
"(",
"8",
".",
"7",
"kb",
")",
",",
"showed",
"lower",
"activity",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12940 | [
"One",
"of",
"these",
"clones",
",",
"pZVH14",
",",
"activated",
"the",
"HIV",
"promoter",
"construct",
"containing",
"a",
"mutation",
"in",
"the",
"NF",
"kappa",
"B",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12941 | [
"However",
",",
"this",
"mutated",
"NF",
"kappa",
"B",
"promoter",
"was",
"not",
"transactivated",
"during",
"HHV",
"-",
"6",
"(",
"GS",
")",
"infection",
"or",
"after",
"cotransfection",
"with",
"pZVB70",
"or",
"pZVB10",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O"
] |
12942 | [
"These",
"data",
"indicate",
"that",
"the",
"NF",
"kappa",
"B",
"sites",
"of",
"the",
"HIV",
"promoter",
"are",
"essential",
"for",
"its",
"transactivation",
"during",
"HHV",
"-",
"6",
"(",
"GS",
")",
"infection",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12943 | [
"By",
"increasing",
"HIV",
"promoter",
"activity",
"in",
"primary",
"T",
"lymphocytes",
",",
"HHV",
"-",
"6",
"may",
"consequently",
"increase",
"HIV",
"replication",
",",
"leading",
"to",
"an",
"increase",
"in",
"the",
"cytopathic",
"effect",
"on",
"coinfected",
"human",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12944 | [
"Inhibition",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
"replication",
"and",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"activity",
"by",
"cysteine",
"and",
"cysteine",
"derivatives",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12945 | [
"HIV",
"-",
"1",
"proviral",
"DNA",
"contains",
"two",
"binding",
"sites",
"for",
"the",
"transcription",
"factor",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"."
] | [
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12946 | [
"HIV",
"-",
"1",
"-",
"infected",
"individuals",
"have",
",",
"on",
"average",
",",
"abnormally",
"high",
"levels",
"of",
"tumour",
"necrosis",
"factor",
"alpha",
"(",
"TNF",
"alpha",
")",
"and",
"abnormally",
"low",
"plasma",
"cysteine",
"levels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12947 | [
"We",
"therefore",
"investigated",
"the",
"effects",
"of",
"cysteine",
"and",
"related",
"thiols",
"on",
"HIV",
"-",
"1",
"replication",
"and",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
12948 | [
"The",
"experiments",
"in",
"this",
"report",
"show",
"that",
"cysteine",
"or",
"N",
"-",
"acetylcysteine",
"(",
"NAC",
")",
"raise",
"the",
"intracellular",
"glutathione",
"(",
"GSH",
")",
"level",
"and",
"inhibit",
"HIV",
"-",
"1",
"replication",
"in",
"persistently",
"infected",
"Molt",
"-",
"4",
"and",
"U937",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12949 | [
"However",
",",
"inhibition",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
"replication",
"appears",
"not",
"to",
"be",
"directly",
"correlated",
"with",
"GSH",
"levels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12950 | [
"Cysteine",
"and",
"NAC",
"also",
"inhibit",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"activity",
"as",
"determined",
"by",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
"and",
"chloramphenicol",
"acetyl",
"-",
"transferase",
"(",
"CAT",
")",
"gene",
"expression",
"under",
"control",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"binding",
"sites",
"in",
"uninfected",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12951 | [
"This",
"suggests",
"that",
"the",
"cysteine",
"deficiency",
"in",
"HIV",
"-",
"1",
"-",
"infected",
"individuals",
"may",
"cause",
"an",
"over",
"-",
"expression",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"-",
"dependent",
"genes",
"and",
"enhance",
"HIV",
"-",
"1",
"replication",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12952 | [
"NAC",
"may",
"be",
"considered",
"for",
"the",
"treatment",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
"-",
"infected",
"individuals",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12953 | [
"Using",
"amino",
"acid",
"sequence",
"information",
"derived",
"from",
"the",
"DNA",
"affinity",
"-",
"purified",
"protein",
",",
"we",
"have",
"now",
"isolated",
"cDNA",
"clones",
"encoding",
"TCF",
"-",
"1",
"alpha",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12954 | [
"The",
"TCF",
"-",
"1",
"alpha",
"cDNA",
"contains",
"a",
"single",
"68",
"-",
"amino",
"-",
"acid",
"domain",
"that",
"is",
"homologous",
"to",
"a",
"region",
"conserved",
"among",
"high",
"-",
"mobility",
"group",
"(",
"HMG",
")",
"and",
"nonhistone",
"chromosomal",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
12955 | [
"Expression",
"of",
"full",
"-",
"length",
"and",
"mutant",
"cDNA",
"clones",
"in",
"bacteria",
"reveal",
"that",
"the",
"single",
"HMG",
"motif",
",",
"which",
"is",
"predicted",
"to",
"contain",
"two",
"extended",
"alpha",
"-",
"helical",
"segments",
",",
"is",
"sufficient",
"to",
"direct",
"the",
"sequence",
"-",
"specific",
"binding",
"of",
"TCF",
"-",
"1",
"alpha",
"to",
"DNA",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
12956 | [
"Northern",
"blot",
"experiments",
"demonstrate",
"further",
"that",
"TCF",
"-",
"1",
"alpha",
"mRNA",
"is",
"highly",
"tissue",
"specific",
",",
"found",
"primarily",
"in",
"the",
"thymus",
"or",
"T",
"cell",
"lines",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12957 | [
"The",
"immature",
"CEM",
"T",
"cell",
"line",
"expresses",
"relatively",
"low",
"levels",
"of",
"TCF",
"-",
"1",
"alpha",
"mRNA",
",",
"which",
"are",
"increased",
"upon",
"activation",
"of",
"these",
"cells",
"by",
"phorbol",
"esters",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12958 | [
"Interestingly",
",",
"the",
"cloned",
"TCF",
"-",
"1",
"alpha",
"protein",
"is",
"a",
"potent",
"transcriptional",
"activator",
"of",
"the",
"human",
"TCR",
"alpha",
"enhancer",
"in",
"nonlymphoid",
"cell",
"lines",
",",
"whereas",
"the",
"activity",
"of",
"the",
"endogenous",
"protein",
"in",
"T",
"cell",
"lines",
"is",
"strongly",
"dependent",
"on",
"an",
"additional",
"T",
"cell",
"-",
"specific",
"protein",
"that",
"interacts",
"with",
"the",
"core",
"enhancer",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12959 | [
"A",
"novel",
"HIV",
"-",
"1",
"isolate",
"containing",
"alterations",
"affecting",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12960 | [
"Three",
"molecular",
"clones",
"of",
"HIV",
"-",
"1",
",",
"derived",
"from",
"a",
"single",
"isolate",
"(",
"AL1",
")",
",",
"exhibited",
"distinct",
"replicative",
"and",
"cytopathic",
"properties",
"during",
"propagation",
"in",
"a",
"human",
"T",
"cell",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12961 | [
"The",
"phenotypic",
"differences",
"observed",
"were",
"attributable",
",",
"in",
"large",
"part",
",",
"to",
"changes",
"affecting",
"the",
"viral",
"LTR",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
12962 | [
"Nucleotide",
"sequence",
"and",
"PCR",
"analyses",
"demonstrated",
"the",
"presence",
"of",
"novel",
"duplications",
"or",
"deletions",
"involving",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"motif",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12963 | [
"These",
"changes",
"in",
"the",
"enhancer",
"element",
"were",
"identified",
"in",
"the",
"original",
"AL1",
"virus",
"stock",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12964 | [
"Subcloning",
"of",
"the",
"variant",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"segments",
"into",
"LTR",
"-",
"driven",
"CAT",
"expression",
"vectors",
"confirmed",
"a",
"correlation",
"between",
"promoter",
"activity",
"and",
"replicative",
"/",
"cytopathic",
"capacity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12965 | [
"Multiple",
"Oct2",
"isoforms",
"are",
"generated",
"by",
"alternative",
"splicing",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12966 | [
"The",
"interaction",
"of",
"the",
"Oct2",
"transcription",
"factor",
"with",
"the",
"cognate",
"octamer",
"motif",
"ATGCAAAT",
"is",
"a",
"critical",
"determinant",
"of",
"the",
"lymphoid",
"-",
"specific",
"expression",
"of",
"immunoglobulin",
"genes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
12967 | [
"All",
"the",
"isoforms",
"retain",
"the",
"previously",
"characterized",
"POU",
"-",
"domain",
"and",
"are",
"therefore",
"able",
"to",
"bind",
"to",
"the",
"octamer",
"motif",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
12968 | [
"Finally",
",",
"we",
"show",
"that",
"one",
"of",
"the",
"isoforms",
"encodes",
"the",
"previously",
"described",
"lymphoid",
"-",
"specific",
"Oct2B",
"protein",
"which",
"has",
"been",
"suggested",
"to",
"be",
"involved",
"in",
"the",
"function",
"of",
"the",
"octamer",
"motif",
"in",
"the",
"context",
"of",
"the",
"immunoglobulin",
"heavy",
"-",
"chain",
"(",
"IgH",
")",
"enhancer",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12969 | [
"The",
"cells",
"of",
"hyperlipidemic",
"patients",
"had",
"lowered",
"levels",
"of",
"glucocorticoid",
"receptors",
"concomitantly",
"with",
"a",
"partial",
"loss",
"of",
"their",
"sensitivity",
"to",
"glucocorticoids",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12970 | [
"In",
"fibroblasts",
"from",
"patients",
"with",
"hereditary",
"hypercholesteremia",
"of",
"homozygous",
"type",
"the",
"number",
"of",
"glucocorticoid",
"receptors",
"did",
"not",
"exceed",
"10",
"%",
"of",
"their",
"content",
"in",
"normal",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12971 | [
"Negative",
"regulation",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"expression",
"in",
"monocytes",
":",
"role",
"of",
"the",
"65",
"-",
"kDa",
"plus",
"50",
"-",
"kDa",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"dimer",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12972 | [
"Although",
"monocytic",
"cells",
"can",
"provide",
"a",
"reservoir",
"for",
"viral",
"production",
"in",
"vivo",
",",
"their",
"regulation",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"HIV",
"-",
"1",
")",
"transcription",
"can",
"be",
"either",
"latent",
",",
"restricted",
",",
"or",
"productive",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12973 | [
"In",
"THP",
"-",
"1",
"cells",
"with",
"restricted",
"HIV",
"expression",
",",
"there",
"is",
"an",
"absence",
"of",
"DNA",
"-",
"protein",
"binding",
"complex",
"formation",
"with",
"the",
"HIV",
"-",
"1",
"promoter",
"-",
"enhancer",
"associated",
"with",
"markedly",
"less",
"viral",
"RNA",
"production",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
12974 | [
"This",
"absence",
"of",
"binding",
"was",
"localized",
"to",
"the",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"region",
"of",
"the",
"HIV",
"-",
"1",
"enhancer",
";",
"the",
"65",
"-",
"kDa",
"plus",
"50",
"-",
"kDa",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"heterodimer",
"was",
"preferentially",
"lost",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12975 | [
"Adding",
"purified",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"protein",
"to",
"nuclear",
"extracts",
"from",
"cells",
"with",
"restricted",
"expression",
"overcomes",
"this",
"lack",
"of",
"binding",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12976 | [
"In",
"addition",
",",
"treatment",
"of",
"these",
"nuclear",
"extracts",
"with",
"sodium",
"deoxycholate",
"restored",
"their",
"ability",
"to",
"form",
"the",
"heterodimer",
",",
"suggesting",
"the",
"presence",
"of",
"an",
"inhibitor",
"of",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
12977 | [
"Furthermore",
",",
"treatment",
"of",
"nuclear",
"extracts",
"from",
"these",
"cells",
"that",
"had",
"restricted",
"expression",
"with",
"lipopolysaccharide",
"increased",
"viral",
"production",
"and",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
12978 | [
"Antiserum",
"specific",
"for",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"binding",
"proteins",
",",
"but",
"not",
"c",
"-",
"rel",
"-",
"specific",
"antiserum",
",",
"disrupted",
"heterodimer",
"complex",
"formation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
12979 | [
"Glucocorticoid",
"receptors",
"in",
"normal",
"leukocytes",
":",
"effects",
"of",
"age",
",",
"gender",
",",
"season",
",",
"and",
"plasma",
"cortisol",
"concentrations",
"."
] | [
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12980 | [
"We",
"measured",
"glucocorticoid",
"receptors",
"(",
"GR",
")",
"in",
"mononuclear",
"leukocytes",
"(",
"MNL",
")",
"isolated",
"from",
"peripheral",
"blood",
"of",
"145",
"apparently",
"healthy",
"volunteers",
"(",
"86",
"men",
"and",
"59",
"women",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12981 | [
"Gender",
"difference",
"in",
"the",
"number",
"of",
"GR",
"was",
"not",
"significant",
",",
"although",
"women",
"showed",
"slightly",
"fewer",
"GR",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
12982 | [
"The",
"number",
"of",
"GR",
"in",
"MNL",
"from",
"these",
"patients",
"was",
"significantly",
"decreased",
"one",
"month",
"after",
"the",
"initiation",
"of",
"prednisolone",
"therapy",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12983 | [
"However",
",",
"in",
"normal",
"subjects",
",",
"the",
"GR",
"in",
"MNL",
"did",
"not",
"demonstrate",
"circadian",
"variation",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"concentrations",
"of",
"plasma",
"cortisol",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12984 | [
"Synergism",
"between",
"two",
"distinct",
"elements",
"of",
"the",
"HTLV",
"-",
"I",
"enhancer",
"during",
"activation",
"by",
"the",
"trans",
"-",
"activator",
"of",
"HTLV",
"-",
"I",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12985 | [
"We",
"have",
"conducted",
"functional",
"studies",
"of",
"the",
"enhancer",
"elements",
"of",
"human",
"T",
"-",
"cell",
"leukemia",
"virus",
"type",
"I",
"(",
"HTLV",
"-",
"I",
")",
"using",
"the",
"human",
"T",
"-",
"cell",
"lines",
"Jurkat",
"and",
"MOLT",
"4",
",",
"which",
"are",
"negative",
"for",
"HTLV",
"-",
"I",
",",
"and",
"MT",
"-",
"2",
"and",
"TL",
"-",
"Mor",
",",
"which",
"carry",
"the",
"proviral",
"genome",
"of",
"HTLV",
"-",
"I",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12986 | [
"Two",
"distinct",
"elements",
"have",
"been",
"implicated",
"in",
"function",
"of",
"the",
"HTLV",
"-",
"I",
"enhancer",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12987 | [
"One",
"is",
"the",
"21",
"-",
"base",
"-",
"pair",
"(",
"bp",
")",
"core",
"element",
"that",
"is",
"responsible",
"for",
"trans",
"-",
"activation",
"by",
"the",
"HTLV",
"-",
"I",
"trans",
"-",
"activator",
"p40tax",
"and",
"that",
"has",
"the",
"ability",
"to",
"bind",
"to",
"cyclic",
"-",
"AMP",
"responsive",
"element",
"binding",
"factor",
"(",
"CREB",
")",
"-",
"like",
"factor",
"(",
"s",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12988 | [
"The",
"other",
"is",
"a",
"region",
"interposed",
"between",
"the",
"21",
"-",
"bp",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12989 | [
"In",
"this",
"study",
"we",
"demonstrate",
"that",
"a",
"subfragment",
"(",
"C26",
")",
"in",
"the",
"region",
"between",
"the",
"21",
"-",
"bp",
"elements",
"is",
"involved",
"in",
"trans",
"-",
"activation",
"by",
"p40tax",
",",
"possibly",
"through",
"binding",
"to",
"an",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"-",
"like",
"nuclear",
"factor",
"or",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
12990 | [
"The",
"C26",
"element",
"conferred",
"partial",
"responsiveness",
"to",
"p40tax",
"when",
"linked",
"to",
"one",
"copy",
"of",
"the",
"21",
"-",
"bp",
"element",
"that",
",",
"by",
"itself",
",",
"showed",
"little",
"activation",
"in",
"response",
"to",
"p40tax",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
12991 | [
"However",
",",
"the",
"C26",
"element",
"alone",
",",
"even",
"when",
"repeated",
",",
"could",
"not",
"be",
"activated",
"by",
"p40tax",
",",
"unlike",
"other",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"-",
"binding",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
12992 | [
"In",
"contrast",
",",
"the",
"C26",
"element",
"itself",
"was",
"profoundly",
"activated",
"upon",
"stimulation",
"with",
"12",
"-",
"O",
"-",
"tetradecanoylphorbol",
"-",
"13",
"-",
"acetate",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12993 | [
"These",
"findings",
"therefore",
"suggest",
"that",
"the",
"HTLV",
"-",
"I",
"enhancer",
"contains",
"multiple",
"functional",
"elements",
",",
"including",
"binding",
"sites",
"for",
"at",
"least",
"CREB",
"-",
"and",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"-",
"like",
"factors",
",",
"which",
"synergistically",
"cooperate",
"in",
"activation",
"of",
"the",
"HTLV",
"-",
"I",
"enhancer",
"in",
"response",
"to",
"p40tax",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
12994 | [
"Our",
"results",
"also",
"demonstrate",
"that",
"TPA",
"-",
"dependent",
"activation",
"of",
"the",
"HTLV",
"-",
"I",
"enhancer",
"may",
"be",
"mediated",
"through",
"the",
"C26",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
12995 | [
"The",
"minimal",
"region",
"of",
"the",
"human",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"alpha",
"(",
"TNF",
"-",
"alpha",
")",
"gene",
"promoter",
"necessary",
"for",
"its",
"transcriptional",
"induction",
"by",
"phorbol",
"esters",
"(",
"PMA",
")",
"in",
"human",
"T",
"and",
"B",
"lymphocyte",
"cell",
"lines",
"has",
"been",
"localized",
"between",
"-",
"52",
"and",
"+",
"89",
"nucleotides",
"(",
"nt",
")",
"relative",
"to",
"the",
"gene",
"'",
"s",
"transcriptional",
"start",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
12996 | [
"Comparison",
"of",
"these",
"sequences",
"to",
"those",
"required",
"to",
"mediate",
"virus",
"or",
"lipopolysaccharide",
"(",
"LPS",
")",
"induction",
"of",
"the",
"gene",
"reveal",
"significant",
"differences",
",",
"and",
"thus",
",",
"the",
"sequence",
"requirements",
"for",
"PMA",
"induction",
"are",
"distinct",
"from",
"those",
"that",
"mediate",
"induction",
"by",
"virus",
"or",
"LPS",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12997 | [
"Although",
"three",
"sites",
"in",
"the",
"TNF",
"-",
"alpha",
"promoter",
"(",
"kappa",
"1",
",",
"kappa",
"2",
",",
"and",
"kappa",
"3",
")",
"specifically",
"bind",
"the",
"transcription",
"factor",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"in",
"lymphoid",
"nuclear",
"extracts",
",",
"TNF",
"-",
"alpha",
"mRNA",
"induction",
"by",
"PMA",
"does",
"not",
"correlate",
"with",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"binding",
"activities",
"displayed",
"by",
"different",
"T",
"and",
"B",
"cell",
"lines",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
12998 | [
"Therefore",
",",
"TNF",
"-",
"alpha",
"mRNA",
"induction",
"by",
"PMA",
",",
"like",
"its",
"induction",
"by",
"virus",
"and",
"LPS",
",",
"is",
"not",
"primarily",
"mediated",
"by",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
",",
"but",
"rather",
"is",
"mediated",
"through",
"other",
"sequences",
"and",
"protein",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
12999 | [
"Surprisingly",
",",
"multimers",
"of",
"kappa",
"1",
"-",
"kappa",
"3",
"can",
"confer",
"PMA",
"inducibility",
"on",
"a",
"heterologous",
"promoter",
"in",
"a",
"B",
"(",
"Raji",
")",
",",
"but",
"not",
"a",
"T",
"(",
"HUT78",
")",
"cell",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
13000 | [
"However",
"they",
"are",
"not",
"functional",
"on",
"a",
"truncated",
"TNF",
"-",
"alpha",
"promoter",
",",
"indicating",
"that",
"promoter",
"context",
"and",
"cell",
"type",
"specificity",
"influence",
"the",
"PMA",
"inducible",
"function",
"of",
"these",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"binding",
"sites",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.