Datasets:

---

siddharthtumre

/

JNLPBA-Processed

like 0

[ "Peripheral", "blood", "T", "cells", "and", "monocytes", "and", "B", "cell", "lines", "derived", "from", "patients", "with", "lupus", "express", "estrogen", "receptor", "transcripts", "similar", "to", "those", "of", "normal", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "METHODS", ":", "Peripheral", "blood", "monocytes", "and", "T", "cells", "were", "prepared", "from", "patients", "with", "SLE", "(", "n", "=", "6", ")", "and", "healthy", "donors", "(", "n", "=", "8", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "T", "cells", "were", "separated", "into", "CD4", "and", "CD8", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Some", "monocytes", "and", "T", "cells", "were", "stimulated", "with", "estradiol", ",", "PMA", ",", "and", "ionomycin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Epstein", "-", "Barr", "virus", "-", "transformed", "B", "cell", "lines", "(", "n", "=", "7", ")", "and", "B", "cell", "hybridomas", "(", "n", "=", "2", ")", "established", "from", "patients", "with", "SLE", "and", "a", "healthy", "individual", "were", "used", "as", "a", "B", "cell", "source", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "cells", "were", "examined", "for", "ER", "mRNA", "by", "reverse", "transcription", "nested", "polymerase", "chain", "reaction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Amplified", "cDNA", "were", "sequenced", "by", "standard", "methods", "." ]

[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RESULTS", ":", "In", "all", "cells", "tested", ",", "ER", "mRNA", "was", "expressed", "without", "prior", "in", "vitro", "stimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Partial", "sequences", "from", "exons", "1", "-", "8", "were", "nearly", "identical", "to", "the", "published", "sequence", "of", "the", "human", "ER", "mRNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Precise", "deletion", "of", "the", "exons", "suggests", "that", "they", "are", "alternatively", "spliced", "transcripts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vitro", "stimulation", "did", "not", "affect", "ER", "mRNA", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O" ]

[ "The", "presence", "of", "variants", "did", "not", "correlate", "with", "disease", "activity", "or", "medication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CONCLUSION", ":", "Monocytes", ",", "T", "cells", ",", "and", "B", "cells", "in", "patients", "express", "transcripts", "of", "the", "normal", "wild", "type", "ER", "and", "the", "hormone", "binding", "domain", "variants", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "damaging", "agents", "induce", "expression", "of", "Fas", "ligand", "and", "subsequent", "apoptosis", "in", "T", "lymphocytes", "via", "the", "activation", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "and", "AP", "-", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Apoptosis", "induced", "by", "DNA", "damage", "and", "other", "stresses", "can", "proceed", "via", "expression", "of", "Fas", "ligand", "(", "FasL", ")", "and", "ligation", "of", "its", "receptor", ",", "Fas", "(", "CD95", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "report", "that", "activation", "of", "the", "two", "transcription", "factors", "NF", "-", "kappa", "B", "and", "AP", "-", "1", "is", "crucially", "involved", "in", "FasL", "expression", "induced", "by", "etoposide", ",", "teniposide", ",", "and", "UV", "irradiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "1", ".", "2", "kb", "FasL", "promoter", "responded", "to", "DNA", "damage", ",", "as", "well", "as", "coexpression", "with", "p65", "Rel", "or", "Fos", "/", "Jun", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Mutations", "in", "the", "relevant", "NF", "-", "kappa", "B", "and", "AP", "-", "1", "binding", "sites", "eliminated", "these", "responses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "activation", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "and", "AP", "-", "1", "contributes", "to", "stress", "-", "induced", "apoptosis", "via", "the", "expression", "of", "FasL", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

[ "A", "small", ",", "nonpeptidyl", "mimic", "of", "granulocyte", "-", "colony", "-", "stimulating", "factor", "[", "see", "commetns", "]" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "nonpeptidyl", "small", "molecule", "SB", "247464", ",", "capable", "of", "activating", "granulocyte", "-", "colony", "-", "stimulating", "factor", "(", "G", "-", "CSF", ")", "signal", "transduction", "pathways", ",", "was", "identified", "in", "a", "high", "-", "throughput", "assay", "in", "cultured", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Like", "G", "-", "CSF", ",", "SB", "247464", "induced", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "multiple", "signaling", "proteins", "and", "stimulated", "primary", "murine", "bone", "marrow", "cells", "to", "form", "granulocytic", "colonies", "in", "vitro", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "also", "elevated", "peripheral", "blood", "neutrophil", "counts", "in", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "extracellular", "domain", "of", "the", "murine", "G", "-", "CSF", "receptor", "was", "required", "for", "the", "activity", "of", "SB", "247464", ",", "suggesting", "that", "the", "compound", "acts", "by", "oligomerizing", "receptor", "chains", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "The", "results", "indicate", "that", "a", "small", "molecule", "can", "activate", "a", "receptor", "that", "normally", "binds", "a", "relatively", "large", "protein", "ligand", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Minimal", "residual", "disease", "in", "acute", "myelogenous", "leukemia", "with", "PML", "/", "RAR", "alpha", "or", "AML1", "/", "ETO", "mRNA", "and", "phenotypic", "analysis", "of", "possible", "T", "and", "natural", "killer", "cells", "in", "bone", "marrow", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "studied", "minimal", "residual", "disease", "(", "MRD", ")", "of", "patients", "with", "acute", "myeloid", "leukemia", "(", "AML", ")", "who", "have", "PML", "/", "RAR", "alpha", "or", "AML1", "/", "ETO", "as", "well", "as", "the", "phenotypic", "analysis", "of", "lymphocyte", "subsets", "involved", "in", "antitumor", "immunity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Eight", "patients", "in", "long", "-", "term", "(", "LT", ";", "3", "to", "15", "years", ")", "and", "15", "patients", "in", "short", "-", "term", "(", "ST", ";", "up", "to", "3", "years", ")", "remission", "were", "studied", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "the", "reverse", "transcription", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT", ")", "assay", ",", "the", "limit", "of", "detection", "was", "10", "(", "-", "5", ")", "to", "10", "(", "-", "6", ")", "for", "PML", "/", "RAR", "alpha", "transcript", "and", "10", "(", "-", "4", ")", "to", "10", "(", "-", "5", ")", "for", "the", "AML1", "/", "ETO", "transcript", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Although", "all", "MRD", "-", "positive", "patients", "in", "LT", "remission", "are", "still", "until", "now", "event", "-", "free", ",", "3", "of", "the", "7", "MRD", "-", "positive", "(", "MRD", "+", ")", "patients", "in", "ST", "remission", "soon", "relapsed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "total", "populations", "of", "CD4", "+", ",", "CD8", "+", "and", "CD56", "+", "[", "possible", "T", "-", "cell", "and", "natural", "killer", "(", "T", "/", "NK", ")", "populations", "]", "in", "the", "BM", "of", "ST", "patients", "and", "MRD", "+", "/", "LT", "patients", "were", "significantly", "(", "p", "<", ".", "01", ")", "low", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "CD8", "+", "CD28", "+", "population", "showed", "the", "same", "tendency", "(", "p", "<", ".", "01", "-", ".", "02", ")", "." ]

[ "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "T", "/", "NK", "subsets", "in", "the", "BM", "of", "MRD", "-", "negative", "(", "MRD", "-", ")", "LT", "(", "MRD", "-", "/", "LT", ")", "patients", "showed", "similar", "numbers", "of", "cells", "as", "normal", "volunteers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Basically", ",", "the", "total", "percentage", "of", "the", "CD4", "+", ",", "CD8", "+", "and", "CD56", "+", "cell", "populations", "in", "the", "BM", "was", "increased", "and", "in", "the", "following", "order", ":", "MRD", "-", "/", "LT", "patients", ",", "normal", "volunteers", ",", "MRD", "+", "/", "LT", "patients", "and", "MRD", "+", "or", "-", "/", "ST", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "percentages", "of", "the", "T", "/", "NK", "-", "cell", "subsets", "in", "the", "PB", "were", "not", "significantly", "different", "among", "these", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "still", "remain", "to", "be", "confirmed", "by", "further", "studies", "of", "the", "functional", "anti", "-", "tumor", "immunity", "of", "T", "/", "NK", "cells", "of", "AML", "in", "remission", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mycobacterium", "tuberculosis", "mannose", "-", "capped", "lipoarabinomannan", "can", "induce", "NF", "-", "kappaB", "-", "dependent", "activation", "of", "human", "immunodeficiency", "virus", "type", "1", "long", "terminal", "repeat", "in", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Tuberculosis", "has", "emerged", "as", "an", "epidemic", ",", "extended", "by", "the", "large", "number", "of", "individuals", "infected", "with", "human", "immunodeficiency", "virus", "type", "1", "(", "HIV", "-", "1", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "major", "goal", "of", "this", "study", "was", "to", "determine", "whether", "the", "mycobacterial", "cell", "wall", "component", "mannose", "-", "capped", "lipoarabinomannan", "(", "ManLAM", ")", "of", "Mycobacterium", "tuberculosis", "(", "M", ".", "tuberculosis", ")", "could", "activate", "transcription", "of", "HIV", "-", "1", "in", "T", "cells", "with", "the", "use", "of", "an", "in", "vitro", "cell", "culture", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "experiments", "are", "of", "prime", "importance", "considering", "that", "CD4", "-", "expressing", "T", "lymphocytes", "represent", "the", "major", "virus", "reservoir", "in", "the", "peripheral", "blood", "of", "infected", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "the", "1G5", "cell", "line", "harbouring", "the", "luciferase", "reporter", "gene", "under", "the", "control", "of", "the", "HIV", "-", "1", "LTR", ",", "it", "was", "first", "found", "that", "culture", "protein", "filtrates", "(", "CFP", ")", "from", "M", ".", "tuberculosis", "or", "purified", "ManLAM", "could", "activate", "HIV", "-", "1", "LTR", "-", "dependent", "gene", "expression", "unlike", "similarly", "prepared", "CFP", "extracts", "devoid", "of", "ManLAM", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "was", "also", "determined", ",", "using", "electrophoresis", "mobility", "shift", "assays", ",", "that", "M", ".", "tuberculosis", "ManLAM", "led", "to", "the", "nuclear", "translocation", "of", "the", "transcription", "factor", "NF", "-", "kappaB", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "M", ".", "tuberculosis", "ManLAM", "resulted", "in", "clear", "induction", "of", "the", "luciferase", "gene", "placed", "under", "the", "control", "of", "the", "wild", "-", "type", ",", "but", "not", "the", "kappaB", "-", "mutated", ",", "HIV", "-", "1", "LTR", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Finally", ",", "the", "ManLAM", "-", "mediated", "activation", "of", "HIV", "-", "1", "LTR", "transcription", "was", "found", "to", "be", "independent", "of", "the", "autocrine", "or", "paracrine", "action", "of", "endogenous", "TNF", "-", "alpha", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "The", "results", "suggest", "that", "M", ".", "tuberculosis", "can", "upregulate", "HIV", "-", "1", "expression", "in", "T", "cells", "and", "could", "thus", "have", "the", "potential", "to", "influence", "the", "pathogenesis", "of", "HIV", "-", "1", "infection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "immunodeficiency", "virus", "type", "1", "long", "terminal", "repeat", "quasispecies", "differ", "in", "basal", "transcription", "and", "nuclear", "factor", "recruitment", "in", "human", "glial", "cells", "and", "lymphocytes", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "generation", "of", "genomic", "diversity", "during", "the", "course", "of", "infection", "has", "the", "potential", "to", "affect", "all", "aspects", "of", "HIV", "-", "1", "replication", ",", "including", "expression", "of", "the", "proviral", "genome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "To", "gain", "a", "better", "understanding", "of", "the", "impact", "of", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", "sequence", "diversity", "on", "LTR", "-", "directed", "gene", "expression", "in", "cells", "of", "the", "central", "nervous", "system", "(", "CNS", ")", "and", "immune", "system", ",", "we", "amplified", "and", "cloned", "LTRs", "from", "proviral", "DNA", "in", "HIV", "-", "1", "-", "infected", "peripheral", "blood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Sequence", "analysis", "of", "nineteen", "LTRs", "cloned", "from", "2", "adult", "and", "3", "pediatric", "patients", "revealed", "an", "average", "of", "33", "nucleotide", "changes", "(", "with", "respect", "to", "the", "sequence", "of", "the", "LAI", "LTR", ")", "within", "the", "455", "-", "bp", "U3", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Transient", "expression", "analyses", "in", "cells", "of", "neuroglial", "and", "lymphocytic", "origin", "demonstrated", "that", "some", "of", "these", "LTRs", "had", "activities", "which", "varied", "significantly", "from", "the", "LAI", "LTR", "in", "U", "-", "373", "MG", "cells", "(", "an", "astrocytoma", "cell", "line", ")", "as", "well", "as", "in", "Jurkat", "cells", "(", "a", "CD4", "-", "positive", "lymphocyte", "cell", "line", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "LTRs", "which", "demonstrated", "the", "highest", "activities", "in", "U", "-", "373", "MG", "cells", "also", "yielded", "high", "activities", "in", "Jurkat", "cells", ",", "the", "LTRs", "were", "generally", "more", "active", "in", "Jurkat", "cells", "when", "compared", "to", "the", "LAI", "LTR", "." ]

[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Differences", "in", "LTR", "sequence", "also", "resulted", "in", "differences", "in", "transcription", "factor", "recruitment", "to", "cis", "-", "acting", "sites", "within", "the", "U3", "region", "of", "the", "LTR", ",", "as", "demonstrated", "by", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "particular", ",", "naturally", "occurring", "sequence", "variation", "impacted", "transcription", "factor", "binding", "to", "an", "activating", "transcription", "factor", "/", "cAMP", "response", "element", "binding", "(", "ATF", "/", "CREB", ")", "binding", "site", "(", "located", "between", "the", "LEF", "-", "1", "and", "distal", "NF", "-", "kappaB", "transcription", "factor", "binding", "sites", ")", "that", "we", "identified", "in", "previous", "studies", "of", "the", "HIV", "-", "1", "LTR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "HMG", "box", "containing", "transcription", "factors", "in", "lymphocyte", "differentiation", "." ]

[ "B", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "identification", "of", "the", "mammalian", "sex", "-", "determining", "gene", "Sry", "has", "led", "to", "the", "discovery", "of", "a", "large", "family", "of", "related", "(", "'", "HMG", "box", "'", ")", "transcription", "factors", "that", "control", "developmental", "events", "in", "yeast", ",", "C", ".", "elegans", ",", "Drosophila", "and", "vertebrates", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "lymphocyte", "differentiation", ",", "several", "HMG", "box", "proteins", "play", "a", "decisive", "role", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Sox", "-", "4", "is", "important", "for", "very", "early", "B", "-", "cell", "differentiation", ",", "while", "TCF", "-", "1", "/", "LEF", "-", "1", "play", "a", "crucial", "role", "in", "early", "thymocyte", "development", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "TCF", "/", "LEF", "proteins", "have", "recently", "been", "found", "to", "constitute", "a", "downstream", "component", "of", "the", "Wingless", "/", "Wnt", "signal", "transduction", "pathway", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "flies", ",", "this", "pathway", "controls", "segment", "polarity", ";", "in", "Xenopus", "it", "controls", "the", "definition", "of", "the", "body", "axis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Deregulation", "of", "the", "pathway", "occurs", "in", "several", "human", "tumors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Single", "strand", "conformation", "polymorphism", "analysis", "of", "androgen", "receptor", "gene", "mutations", "in", "patients", "with", "androgen", "insensitivity", "syndromes", ":", "application", "for", "diagnosis", ",", "genetic", "counseling", ",", "and", "therapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recent", "studies", "indicate", "that", "mutations", "in", "the", "androgen", "receptor", "gene", "are", "associated", "with", "androgen", "insensitivity", "syndromes", ",", "a", "heterogeneous", "group", "of", "related", "disorders", "involving", "defective", "sexual", "differentiation", "in", "karyotypic", "males", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "report", ",", "we", "address", "the", "possibility", "of", "rapid", "mutational", "analysis", "of", "the", "androgen", "receptor", "gene", "for", "initial", "diagnosis", ",", "genetic", "counseling", ",", "and", "molecular", "subclassification", "of", "affected", "patients", "and", "their", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "from", "peripheral", "blood", "leukocytes", "of", "six", "patients", "from", "five", "families", "with", "various", "degrees", "of", "androgen", "insensitivity", "was", "studied", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Exons", "2", "to", "8", "of", "the", "androgen", "receptor", "gene", "were", "analyzed", "using", "a", "combination", "of", "single", "strand", "conformation", "polymorphism", "analysis", "and", "direct", "DNA", "sequencing", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Female", "family", "members", "were", "also", "studied", "to", "identify", "heterozygote", "carriers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Point", "mutations", "in", "the", "AR", "gene", "were", "identified", "in", "all", "six", "patients", ",", "and", "all", "mutations", "caused", "amino", "acid", "substitutions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "patient", "with", "incomplete", "androgen", "insensitivity", "was", "a", "mosaic", "for", "the", "mutation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Four", "of", "the", "five", "mothers", ",", "as", "well", "as", "a", "young", "sister", "of", "one", "patient", ",", "were", "carriers", "of", "the", "mutation", "present", "in", "the", "affected", "child", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "show", "that", "new", "mutations", "may", "occur", "in", "the", "androgen", "receptor", "gene", "leading", "to", "sporadic", "androgen", "insensitivity", "syndrome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "identification", "of", "carriers", "is", "of", "substantial", "clinical", "importance", "for", "genetic", "counseling", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Proliferation", "index", "as", "a", "prognostic", "marker", "in", "breast", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "BACKGROUND", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "The", "proliferative", "activity", "of", "tumors", "has", "been", "extensively", "investigated", "with", "different", "approaches", ",", "among", "which", "the", "use", "of", "the", "monoclonal", "antibody", "Ki", "-", "67", "represents", "an", "easy", "and", "reliable", "means", "of", "assessing", "cell", "proliferation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "METHODS", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "Tumor", "samples", ",", "obtained", "from", "129", "patients", "who", "underwent", "surgery", "between", "January", "1987", "and", "December", "1988", ",", "were", "processed", "for", "staining", "by", "an", "immunohistochemical", "procedure", "(", "avidin", "-", "biotin", "complex", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]

[ "The", "median", "time", "of", "observation", "was", "42", "months", "(", "range", ",", "31", "-", "55", "months", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Life", "-", "table", "analysis", "(", "Mantel", "-", "Cox", ")", "was", "used", "to", "assess", "the", "probability", "of", "disease", "-", "free", "survival", "(", "DFS", ")", "and", "overall", "survival", "(", "OS", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Tumors", "with", "high", "Ki", "-", "67", "proliferation", "indices", "(", ">", "20", "%", ")", "were", "associated", "with", "a", "higher", "4", "-", "year", "probability", "of", "relapse", "of", "disease", "(", "55", ".", "3", "%", "versus", "79", ".", "1", "%", ";", "P", "=", "0", ".", "003", ")", "and", "death", "(", "71", "%", "versus", "95", ".", "6", "%", ";", "P", "=", "0", ".", "00005", ")", "when", "compared", "with", "tumors", "with", "low", "Ki", "-", "67", "values", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "this", "proliferative", "parameter", "maintained", "its", "prognostic", "significance", "when", "the", "patients", "were", "stratified", "according", "to", "lymph", "node", "involvement", ",", "menopausal", "status", ",", "and", "nuclear", "estrogen", "receptor", "content", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

[ "CONCLUSIONS", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "Tumor", "proliferative", "activity", "as", "evaluated", "by", "the", "monoclonal", "antibody", "Ki", "-", "67", "seems", "to", "be", "an", "effective", "indicator", "of", "prognosis", "in", "breast", "cancer", "for", "DFS", "and", "OS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Regulation", "of", "the", "Ets", "-", "related", "transcription", "factor", "Elf", "-", "1", "by", "binding", "to", "the", "retinoblastoma", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "The", "retinoblastoma", "gene", "product", "(", "Rb", ")", "is", "a", "nuclear", "phosphoprotein", "that", "regulates", "cell", "cycle", "progression", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Elf", "-", "1", "is", "a", "lymphoid", "-", "specific", "Ets", "transcription", "factor", "that", "regulates", "inducible", "gene", "expression", "during", "T", "cell", "activation", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "report", ",", "it", "is", "demonstrated", "that", "Elf", "-", "1", "contains", "a", "sequence", "motif", "that", "is", "highly", "related", "to", "the", "Rb", "binding", "sites", "of", "several", "viral", "oncoproteins", "and", "binds", "to", "the", "pocket", "region", "of", "Rb", "both", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Co", "-", "immunoprecipitation", "experiments", "demonstrated", "an", "association", "between", "Elf", "-", "1", "and", "Rb", "in", "resting", "normal", "human", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "T", "cell", "activation", ",", "the", "phosphorylation", "of", "Rb", "results", "in", "the", "release", "of", "Elf", "-", "1", ",", "which", "is", "correlated", "temporally", "with", "the", "activation", "of", "Elf", "-", "1", "-", "mediated", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Overexpression", "of", "a", "phosphorylation", "-", "defective", "form", "of", "Rb", "inhibited", "Elf", "-", "1", "-", "dependent", "transcription", "during", "T", "cell", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "demonstrate", "that", "Rb", "interacts", "specifically", "with", "a", "lineage", "-", "restricted", "Ets", "transcription", "factor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "This", "regulated", "interaction", "may", "be", "important", "for", "the", "coordination", "of", "lineage", "-", "specific", "effector", "functions", "such", "as", "lymphokine", "production", "with", "cell", "cycle", "progression", "in", "activated", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "CD3", "-", "CD16", "+", "natural", "killer", "cells", "express", "the", "hGATA", "-", "3", "T", "cell", "transcription", "factor", "and", "an", "unrearranged", "2", ".", "3", "-", "kb", "TcR", "delta", "transcript", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Multiple", "TcR", "delta", "transcripts", "deriving", "from", "an", "unrearranged", "TcR", "delta", "gene", "were", "detected", "in", "both", "polyclonal", "and", "clonal", "CD3", "-", "CD16", "+", "natural", "killer", "(", "NK", ")", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "unrearranged", "TcR", "delta", "transcripts", "had", "a", "size", "similar", "to", "that", "of", "the", "functional", "TcR", "delta", "mRNA", "(", "2", ".", "3", "and", "1", ".", "3", "kb", ")", "found", "in", "TcR", "gamma", "/", "delta", "+", "T", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "cDNA", "were", "2343", "bp", "long", "and", "their", "transcription", "initiation", "site", "was", "located", "814", "bp", "upstream", "from", "the", "J", "delta", "1", "segment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "The", "sequence", "located", "upstream", "of", "the", "J", "delta", "1", "segment", "corresponded", "to", "the", "previously", "reported", "germ", "-", "line", "sequence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "J", "delta", "1", "segment", "was", "correctly", "spliced", "to", "C", "delta", ";", "in", "addition", "the", "four", "C", "delta", "exons", "were", "found", "to", "be", "already", "assembled", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "polyadenylation", "sites", "were", "present", "in", "the", "fourth", "C", "delta", "exon", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "The", "expression", "of", "hGATA", "-", "3", ",", "a", "T", "cell", "-", "specific", "factor", "known", "to", "be", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "the", "transcription", "of", "TcR", "delta", "locus", ",", "was", "analyzed", "by", "Northern", "blot", ",", "in", "cultured", "NK", "cell", "population", "and", "clones", "(", "but", "not", "in", "freshly", "derived", "cell", "populations", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "no", "transcription", "of", "the", "RAG", "-", "1", "gene", "could", "be", "detected", "in", "all", "NK", "cell", "lines", "or", "clones", "analyzed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]