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シェルスクリプトとRを使って、フォルダ配下のcsvファイルに対して統計処理をしたいと考えています。  
Input.csvという固定の名前ではなく、$hoge.csvのような名前で読み込めるようにするには、  
どうすればいいでしょうか。

StartR.sh

[code]

    #Rを起動する
    
    
    
    #!/bin/bash
    r --vanilla --slave < csv.R
    
[/code]

csv.R

[code]

    #CSVファイルを読み込む
    a <- read.csv("Input.csv")
    #CSVファイルを書き出す
    write.csv(result, file='Output.csv')
    
[/code]


CC BY-SA 3.0
2015-03-12T06:22:35.387
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2015-03-12T08:35:30.837
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question
macos bash r
RでCSVファイルの読み込みをする際にファイル名に引数を使う方法


## 使う関数

`commandArgs(trailingOnly = T)`

これでコマンドライン引数を取得できます.

## 準備

test.R を以下の内容で作成します.

[code]

    arguments<- commandArgs(trailingOnly = T)
    print(arguments[1])
    print(arguments[2])
    print(arguments[3])
    
[/code]

## 実行の仕方

`$ R --vanilla --slave --args foo bar baz < test.R`

## 実行結果

> [1] "foo"  
>  [1] "bar"  
>  [1] "baz"

* * *

これでいかがでしょうか？


CC BY-SA 3.0
2015-03-12T08:35:30.837
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answer