
# Portuguese NER- TempClinBr - BioBERTpt(bio)

Treinado com BioBERTpt(bio), com o corpus TempClinBr.

Metricas:

```
        precision    recall  f1-score   support

           0       0.44      0.29      0.35        28
           1       0.75      0.60      0.66       420
           2       0.57      0.40      0.47        10
           3       0.57      0.36      0.44        11
           4       0.70      0.85      0.77       124
           5       0.72      0.67      0.69       291
           6       0.84      0.90      0.87      2236
           7       0.78      0.77      0.77       112
           8       0.85      0.75      0.80       503
           9       0.64      0.56      0.60        78
          10       0.81      0.82      0.81        71
          11       0.82      1.00      0.90        33

    accuracy                           0.81      3917
   macro avg       0.71      0.66      0.68      3917
weighted avg       0.81      0.81      0.80      3917

```

Parâmetros:

```
device = cuda (Colab)
nclasses = len(tag2id)
nepochs = 50 => parou na 16
batch_size = 16
batch_status = 32
learning_rate = 3e-5

early_stop = 5
max_length = 256
write_path = 'model'
```

Eval no conjunto de teste - TempClinBr
OBS: Avaliação com tag "O" (label 7), se necessário fazer a média sem essa tag.

```
tag2id ={'I-Ocorrencia': 0,
 'I-Problema': 1,
 'I-DepartamentoClinico': 2,
 'B-DepartamentoClinico': 3,
 'B-Ocorrencia': 4,
 'B-Tratamento': 5,
 'O': 6,
 'B-Teste': 7,
 'B-Problema': 8,
 'I-Tratamento': 9,
 'B-Evidencia': 10,
 'I-Teste': 11,
 '<pad>': 12}

              precision    recall  f1-score   support

           0       0.59      0.20      0.29        51
           1       0.77      0.69      0.73       645
           2       0.67      0.71      0.69        14
           3       0.87      0.43      0.58        30
           4       0.71      0.80      0.75       146
           5       0.79      0.77      0.78       261
           6       0.84      0.93      0.88      2431
           7       0.80      0.66      0.73       194
           8       0.87      0.83      0.85       713
           9       0.83      0.62      0.71       146
          10       0.98      0.91      0.94       128
          11       0.54      0.21      0.30        99

    accuracy                           0.83      4858
   macro avg       0.77      0.65      0.69      4858
weighted avg       0.82      0.83      0.82      4858
 ```


Como citar: **em breve**
{"language": "pt", "datasets": ["TempClinBr"], "widget": [{"text": "Dispneia importante aos esfor\u00e7os + dor tipo peso no peito no esfor\u00e7o."}, {"text": "Obeso, has, icc  c # cintilografia miocardica para avaliar angina. Discreto edema mmii pricn a esquerda."}, {"text": "Plastia Mitral ( Insuficiencia ), CRM Saf-2Mg e e Saf-3MG ).(09/03/16). Nega palpita\u00e7\u00e3o."}, {"text": "Uso: AAS 100  -1xd; Metoprolol  25 -1xd; FSM -1xd ; Levotiroxina 175  -1xd; Sinva 40 -1xd; Fluoxetina 20-1xd."}, {"text": "Refere melhora da dispneia depois da cx porem mantem aos mdoeardos-leves esfor\u00e7o."}]}
transformers pytorch bert token-classification pt dataset:TempClinBr autotrain_compatible endpoints_compatible region:us
TAGS
#transformers #pytorch #bert #token-classification #pt #dataset-TempClinBr #autotrain_compatible #endpoints_compatible #region-us 


# Portuguese NER- TempClinBr - BioBERTpt(bio)

Treinado com BioBERTpt(bio), com o corpus TempClinBr.

Metricas:



Parâmetros:



Eval no conjunto de teste - TempClinBr
OBS: Avaliação com tag "O" (label 7), se necessário fazer a média sem essa tag.




Como citar: em breve
# Portuguese NER- TempClinBr - BioBERTpt(bio)

Treinado com BioBERTpt(bio), com o corpus TempClinBr.

Metricas:



Parâmetros:



Eval no conjunto de teste - TempClinBr
OBS: Avaliação com tag "O" (label 7), se necessário fazer a média sem essa tag.




Como citar: em breve
TAGS
#transformers #pytorch #bert #token-classification #pt #dataset-TempClinBr #autotrain_compatible #endpoints_compatible #region-us 
 # Portuguese NER- TempClinBr - BioBERTpt(bio)

Treinado com BioBERTpt(bio), com o corpus TempClinBr.

Metricas:



Parâmetros:



Eval no conjunto de teste - TempClinBr
OBS: Avaliação com tag "O" (label 7), se necessário fazer a média sem essa tag.




Como citar: em breve
passage: TAGS
#transformers #pytorch #bert #token-classification #pt #dataset-TempClinBr #autotrain_compatible #endpoints_compatible #region-us 
# Portuguese NER- TempClinBr - BioBERTpt(bio)

Treinado com BioBERTpt(bio), com o corpus TempClinBr.

Metricas:



Parâmetros:



Eval no conjunto de teste - TempClinBr
OBS: Avaliação com tag "O" (label 7), se necessário fazer a média sem essa tag.




Como citar: em breve