XVII  быуаттың беренсе яртыһында Ренессансҡа алмашҡа сәнғәттә барокко килә. Итальян оҫталарының ҡулы менән барокко стилендә ҡәлғәләр һәм сиркәүҙәр төҙөлә. Барокко ҡомартҡылары араһында иң мәшһүрҙәре — Леопольд, Комарно ҡәлғәләре, Трнаваның  университет сиркәүе.  1604 йылда Трансильвания феодалы Иштван Бочкаи етәкселегендә ихтилал башлана, ул 1605 йылда Словакия өлөшөн биләй.  Ихтилал  Вена солохо килешеүе менән тамамлана, ул феодалдарға  һәм король ҡалаларына  дин тотоу иреклеген гарантиялай.  1619 йылда Трансильвания кенәзлеге хакимы Г. Бетлен   Утыҙ йыллыҡ һуғыш  барышында Габсбургтарға ҡаршы поход ойоштора,  Кошице, Трнава, Братиславаны яулай. 1622 йылда Микуловола Бетлен һәм император араһында солох килешеүе төҙөлә. 1635 йылда  Трнава университетына нигеҙ һалына, ул эшен  теология һәм философия уҡытыуҙан башлай. 1642 йылда Мостафа Нитра комитатында өс көн эсендә 11  ауылды юҡ итә, ике  йөҙ кешене үлтерә, меңдән ашыу кешене ҡол итеп ала.  1663 йылда   австро-төрөк һуғышы барышында төрөктәр баҫымы аҫтында Нове-Замки   ҡәлғәһе бирелә, ул Грон һәм Ваг йылғалары араһында урынлашҡан эйялет үҙәгенә әйләндерелә.  1664 йылда төрөктәр Нитра һәм Левочанан ҡыуып сығарыла. 1670 йылда төньяҡ-көнсығыш Словакияла Габсбургтар власына ҡаршы заговорсыларҙың ихтилалы баҫтырыла. 1672 йылда лютеран крәҫтиәндәр ихтилалы була, улар Орава замогын ала.  1680 йылда  Имре Тёкёли ихтилалы башлана: куруцтар армияһы Ваг үҙәненә баҫып инә.  1682 йылда  куруцтар Кошице, Филяково һәм тау-сәнәғәт ҡалаларын баҫып ала. 1684 йылдың февраль аҙағына тиклем 12 король ҡалаһы император  Леопольд I яғына күсә. 1685 йылда Нове-Замки ҡәлғәһе төрөктәрҙән азат ителә. 1703 йылда  Ракоци ихтилалы барышында  куруцтар  бөтә  тиерлек ерҙәрҙе баҫып ала. 1708 йылдың  3 авгусында Тренчин янындағы алышта Габсбургтар ғәскәре куруцтарҙың   көсөн ҡыйрата, артабанғы өс ай дауамында урта һәм Словакияның урта һәм  көнбайыш өлкәләренән  баш күтәреүселәр  ҡыҫырыҡлап сығарыла.  80 меңгә яҡын ғүмерҙе өҙгән һигеҙ йыллыҡ куруцтар һуғышы 1711 йылда Сатмар солохон төҙөү менән тамамлана. Был тынысһыҙ ваҡытта словак ерҙәрендә   юлбаҫарҙар хужа була, улар араһында словак тынысһыҙ ваҡытта, улар араһында 1713 йылда язалап үлтерелгән словак «Робин Гуды» — Юрай Яношик та була.