археологик тикшеренеүҙәр бүлеге; этнология бүлеге; Башҡортостан тарихы бүлеге; Башҡортостандың яңы тарихы бүлеге; тел белеме бүлеге (лингвистика һәм мәғлүмәт технологиялары лабораторияһы менән); фольклористика бүлеге; әҙәбиәт ғилеме бүлеге.