Һуңғы ваҡытта Онега күле экосистемаһына  тәьҫир  йылдам үҫә, бигерәк тә бысрата торған факторҙар буйынса. Иң юғары баҫымды күлдең төньяҡ-көнбайыш һәм төньяҡ өлөштәре кисерә, унда Петрозаводск,  Кондопож һәм Медвежьегор сәнәғәт үҙәктәре урынлашҡан. Бында халыҡтың  80 %-тан ашыуы һәм бассейндың 90 % сәнәғәт потенциалы тупланған. Атмосфераға өс сәнәғәт үҙәгенән иҫәпкә алынған бысраныу  йылына 190 млн м³ самаһы ағынты-дренаж һыуҙары һәм  150 мең тонна ташланты тәшкил итә.  Онега күленең бассейнында техноген ағынтылар йылына  315 млн м³ самаһы тәшкил итә,   шуларҙың 46 %  производство-хужалыҡҡа, 25 %  — ямғыр һыуҙары  аҡмаһы һәм 16 % — дренаж-һыу мелиорация һыуҙары тәшкил итә. Күлгә биоген  элементтар: фосфор — 810 т, дөйөм азот — йылына 17 мең тонна инә, ә күлдән Свирь йылғаһы һыуҙары менән  280 т фосфор һәм  11,8 мең т. азот сығарыла, йәғни күлдә  68 % фосфор һәм 31 % азот туплана. Флот һәм моторлы кәмәләр (8000 тирәһе берәмек), һыу  мөхитенә   башлыса нефть продукттары (830 т тирәһе), фенол (0,5 т), ҡурғаш (0,1 т), оксидтар көкөрт, азот һәм углеродтың һарҡышы менән бысрата.