Рәсәй таможня академияһында юғары белем биреүҙең күп кимәлле системаһы бар: бакалавриат — 4 йыл, специалитет — 5 йыл, магистратура — 2 йыл, аспирантура — 3-4 йыл (уҡытыу йүнәлешенә бәйле). Бакалавриат йүнәлеше: «Иҡтисад», «Менеджмент», «Юриспруденция»; специалитеттыҡы: «Таможня эше»; магистратура: «Юриспруденция», «Иҡтисад», «Менеджмент»; аспирантура — «Иҡтисад», «Юриспруденция», «Информатика һәм иҫәпләү техникаһы», «Сәйәси фәндәр һәм төбәкте өйрәнеү», «Тарих фәне һәм археология».