Лос-Аламос Санта-Фе штатының баш ҡалаһынан төньяҡ-көнбайышҡа ҡарай яҡынса 56 км алыҫлыҡта урынлашҡан. Баш ҡала менән Лос-Аламос заманса шоссе менән бәйләнгән. Диңгеҙ кимәленән бейеклеге 2231 метр тәшкил итә. Майҙаны 28,1 км². Ҡаланың үҙәк өлөшөндә ҙур булмаған Эшли  (Ashley) быуаһы бар.