Төп бинаны төҙөү йәрминкәнең пландағы буласаҡ йорто артында алып барылырға тейеш була. Бина үҙе ташып һалынған ер өҫтөнә һалынған, шунлыҡтан ваҡыт үтеү менән грунт һыуҙары һәм яҙғы һыу баҫыу грунтты йыуып ағыҙған, бина сүгеп, стеналарында ярыҡтар барлыҡҡа килгән. XIX быуат аҙағында бина архитектор Р. Я. Килевейндың (эштәр етәксеһе П. С. Бойцов) проекты буйынса капиталь ремонтланған.. Реставрациянан һуң, 1888 йылдың 31 июлендә ғибәҙәтхана яңынан изгеләндерелә. 1899 йылда ғибәҙәтхана янындағы ҡыңғырау манараһы ҡорамға ҡолап төшөү хәлендә тора. Яңы манара 1906 йылда архитекторҙар П. П. Малиновский һәм Е. М. Мичурин тарафынан иҫке стилен һаҡлап төҙөлә.