Вәкиллектең төп функциялары — Башҡортостан биләмәһендә урынлашҡан ғилми ойошмаларға методик ярҙам , тикшереү һөҙөмтәләре тураһында материалдар әҙерләү , экспертиза , Рәсәй Фәндәр Академияһы етәкселегенә республиканың фәнни-техник комплексын үҫтереү , ойошмаларҙың үҙ-ара эш итеү селтәрен камиллаштырыу тәҡдимдәрен әҙерләү .