2004/05 йылдар миҙгелендә Иньеста 38 уйындан 37 тапҡыр уйнап, төп команда составында үҙ урынын нығыта. Һөжүм итеүсе ярымһаҡсы булараҡ, команданың төп бомбардирҙары Самюэль Это’О һәм Роналдиньоны һөҙөмтәле пастар менән тәьмин итә, үҙе ике тапҡыр гол индерә. Хатта 2004 йылдың йәйендә командаға Декуҙың килеүенә ҡарамаҫтан, Иньестеға команда составында урын табыла, ә йәрәхәтләнгән Хави булмағанда Иньестаға һөжүм менән командалыҡ итеүҙә төп роль тура килә. Шул мәлдә Иньеста Европала иң өмөтлө ярымһаҡсыларҙың береһе була. 2006 йылда Германияла үтәсәк Донъя чемпионатына Испания йыйылма командаһына саҡырыла. 2006 йылдың 22 авгусында, "Бавария"ны 4:0 иҫәбенә еңгәндән һуң, баш өҫтөнә, команда капитаны булараҡ, Жон Гампер кубогының иптәштәрсә уйыны трофейын күтәрә.