Ҡалаға испандар тарафынан 1538 йылдың 6 авгусында, христиандарҙың Хоҙайҙы Преображенский байрамы көнөндә, чибча индеецтары Баката тип атаған районда нигеҙ һалына. Шунан ҡаланың тәүге исеме — Санта-Фе-де-Богота, унда Санта-Фе — "Хоҙай Тәғәләнең үҙгәреүе " (һүҙмә-һүҙ — «изге иман»),ә Богота — райондың боҙолған автохтон атамаһы. Киң ҡулланылышта атаманың һуңғы өлөшө генә ҡулланыла — «Богота»[5].