Уйынсы карьераһын ҡалдырғас, Аня Андерсен кисекмәҫтән, Slagelse тигән клубҡа тренер эшенә күсә, был клуб Handball women’s Danish League сығыш яһай. Ул минимум программаһын үтәп, командаһын юғары лигаға сығара, ә һуңынан Champions League 2003/04, 2004/05 һәм 2006/07 йылдар миҙгелендә өс тапҡыр еңеүгә килтерә. Шулай уҡ 2006 йылда Андерсен Сербия йыйылма командаһының тренер урынын биләй.