1935 йылда СССР Халыҡ Комиссарҙары советы ҡарары менән хәрби-ветеринария факультеты Хәрби-ветеринария институты итеп үҙгәртелә. 1938 йылда Хәрби-ветеринария институты базаһында РККА-ның Хәрби- ветеринария академияһы ойошторола, ул СССР-ҙың алдынғы ветеринария юғары хәрби белм биреү учреждениеһы булараҡ, хәрби-ветеринар табиптарын әҙерләү һәм хәрби ветеринарияның клиник һәм теоретик проблемалары өлкәһендәге мәсьәләләрҙе әҙерләү менән шөғөлләнә. Академияның уҡыу структураһында 29 профилле кафедра һәм хәрби ветеринария табибтарының белемен камиллаштырыу курстары була. Профессор-уҡытыусылар составын егерме бер докторы һәм ҡырҡ ете фән кандидаты тәшкил итә. Академияла К. И. Скрябин, М. Б. Оливков, В. Г. Домрачев, Н. А. Сошественский, С. Н. Вышелесский, И. Е. Мозгов, Н. Ф. Попов; атҡаҙанған фән эшмәкәрҙәре А. Ф. Климов һәм Я. Е. Коляков кеүек билдәле ҡалимдар эшләй. Бөйөк Ватан һуғышы башланғас, академия Аральск ҡалаһына, һуңынан,1942 йылда Сәмәрҡәндҡа эвакуациялана. 1941—1945 йылдарҙа академия 1179-ҙан ашыу хәрби-ветеринар табип сығара, ә академияның уҡытыусылар составынан 70-тән ашыу офицер ғәскәрҙәргә етәксе вазифаһына ебәрелә.