Вологда өлкәһе Шексна районы территорияһының майҙаны 2,53 мең квадрат километға тиң (район өлкә территорияһының 1,7%-ын тәшкил итә, райондар араһында территорияһының ҙурлығы буйынса 24-се урынды биләй). Шексна районы көнсығышта Вологда өлкәһендәге Волгда районы менән сиктәш, көнбайышта -Череповецкий районы, төньяҡта-Кирилловский районы менән сиктәш.