O 5º Batalhão da Polícia Militar do Amapá, denominado de: Batalhão de Operações Especiais, foi criado através do Decreto Lei nº. 6803, de 06 de dezembro de 2002, com o objetivo de apoiar o Comando Geral da PMAP e as unidades de áreas em ocorrências de maior grau de complexidade, que requeiram a atuação de uma tropa dotada de técnicas e armamentos especiais.
O Bope divide-se em:
1ª CIA – ROTAM — RONDAS OSTENSIVAS TÁTICAS MOTORIZADAS têm a Missão de realizar o patrulhamento tático na capital e no interior do Estado, combatendo principalmente roubos a mão armada em estabelecimentos comerciais, bancários e residenciais. A ROTAM destaca-se na efetivação do maior número de prisões de criminosos de alta periculosidade, valendo-se de sua grande capacidade de perícia em motocicletas, mobilidade e das técnicas utilizadas por seus componentes.
2ª CIA – CHOQUE – responsável por ações de controle de distúrbios civis sendo também utilizada no policiamento de grandes eventos e em situações de crises em estabelecimentos prisionais. A tropa é altamente treinada para empregar armamento e munições não-letais, destacando-se pelo bom desempenho em suas ações e demonstrando alto grau de profissionalismo.
3ª CIA – COE – COMANDOS E OPERAÇÕES ESPECIAIS, destaca-se por sua aptidão em operações de alto risco em áreas urbana e rural, tais como: