O INPA, numa parceria com os órgãos de justiça estaduais e federais, oferece no Bosque da Ciência uma oportunidade de aplicação das medidas previstas na Justiça Restaurativa. Considerada como uma forma de resolução de conflitos, a Justiça Restaurativa foi incorporada na legislação de muitos países, após recomendações da Organização das Nações Unidas (ONU), como uma solução mais efetiva, objetivando a reparação do dano ambiental e a restauração de interesses por meio da tomada de responsabilidade voluntária.
Entre 2000 e 2018 o Bosque da Ciência recebeu 170 infratores ambientais, que realizam diversas atividades no Bosque, desde manutenção, até receptivo público, ou trabalhos mais especializados dentro das capacidades de cada um. Por meio da Justiça Restaurativa, se busca uma forma de educar e conscientizar o infrator do mal que causou e não apenas reprimi-lo, levando o mesmo a refletir sobre a responsabilidade que possui perante o meio ambiente.