O Departamento de Química da UEPG originou-se do Departamento de Físico-Química criado em 06 de maio de 1966 na então Faculdade Estadual de Farmácia e Bioquímica de Ponta Grossa.
Em 31 de agosto de 1967 passou a ser denominado Departamento de Química na mesma Faculdade e sob a Chefia do Professor Alfredo Berger.
A UEPG foi criada pela LEI Estadual nº. 6.034 de 06/11/69. Pelo Decreto nº. 1.811 de 28/01/1970 incorporou as Faculdades Estaduais até então existentes em Ponta Grossa, dentre as quais a Faculdade Estadual de Farmácia e Bioquímica.
Em 1972 foi implantada na UEPG a reforma universitária que veio para reformular todo o Ensino Superior no Brasil. Aproveitando esse acontecimento e ainda pelo fato da UEPG passar a ter três setores de conhecimento, houve necessidade de se alocar o Departamento de Química no Setor de Ciências Exatas e Naturais.
Em 14/01/1972, o Grupo de implantação da Reforma Universitária na UEPG reuniu todos os Departamentos de Ensino das Faculdades existentes e os distribuiu em grupos visando a planificação de cada um atravésde seus respectivos componentes.
Na citada data, na sala nº. 23 do Bloco A foram iniciados os trabalhos do agora Departamento de Química da UEPG com a presença dos Professoeres Alfredo Berger, Jesuan Henrique Rupel, Alberto Tammenhain, Alcione Borges de Andrade, Carlos Roberto Emílio, Maria Lúcia Wambier e Odeni Vallaca Mongruel. Este último, além de Professor do Departamento de Química foi nomeado como primeiro Vice-Reitor da UEPG. Foram traçados planos de ação entre os quais a departamentalização das disciplinas de química e também foi eleito por unanimidade como Chefe dessa nova unidade departamental o Professor Alfredo Berger. O Professor Alfredo Berger convidou o Professor Jesuan Henrique Rupel para exercer o cargo de secretário do Departamento, o que foi aceito. No início, por falta de espaço físico o Departamento de Química da UEPG passou a funcionar no Laboratório de Análises Clínicas dos Professores Alfredo Berger e Jesuan Henrique Rupel, situado na Av.Vicenete Machado nº. 181 nesta cidade, onde inclusive as primeiras reuniões foram realizadas. Posteriormente, foi designada uma sala anexa ao Departamento de Farmáciano Bloco A.
Nesses mais de 30 anos de atividades o Departamento de Química passou por inúmeras dificuldades porém sempre pautou para contar com um quadro docente qualificado. Teve a preocupação de enviar professores para qualificação em outras IES, porém no início, apenas anível de Especialização mesmo como bolsistas da CAPES/FUNDAÇÃO FORD. Atualmente a situação é bem diferente pois o quadro Docente é um dos mais qualificados da UEPG. Desenvolve uma série de Linhas de Pesquisa com diversos Projetos de Pesquisa em andamento que contam inclusive copm alunos de Iniciação Científica. Tem também Projetos de Extensão. Anualmenete são realizadas as chamadas "SEMANAS DE QUÍMICA" que procuram traças um intercâmbio com outras IES,integrando acadêmicos, professores e profissionais da área de Química.