Por conta da prática consciente da respiração durante a execução dos exercícios, o corpo passa por um processo de introspecção durante a aula, que estimula o controle da liberação dos níveis de cortisol - enzima responsável pela reação do estresse e depressão no organismo, causando sensação de bem-estar no organismo e na mente.
Além disso, outro fator determinante para redução do estresse com o método de Joseph Pilates é a utilização apenas dos músculos necessários para a realização dos movimentos, evitando que outros músculos fiquem fadigados com esforços sem necessidade.