Ela descobriu, praticou e comprovou a eficácia do método de cura da Ciência Cristã, que atua exclusivamente no pensamento, corrigindo as crenças errôneas da pessoa, eliminando seus medos e suprindo-a com uma compreensão espiritual a respeito de si mesma. Essa prática mental resulta na cura do corpo. Isso porque o que chamamos de corpo é na verdade pensamento exteriorizado.
Em seu livro Ciência e Saúde com a Chave das Escrituras, Eddy escreve que o homem “possui esse corpo e o torna harmonioso ou discordante, segundo as imagens de pensamento que nele imprime” (p.208). Por isso, a Ciência Cristã ensina a acalentar pensamentos de saúde, que se manifestam num corpo saudável. Mas isso não é simplesmente pensamento positivo. É o pensamento fundamentado na compreensão espiritual de Deus, e do homem feito à imagem e semelhança de Deus. É o pensamento fundamentado na realidade divina, que é totalmente harmoniosa.
Na química e na física quântica, os cientistas pesquisaram a fundo a matéria decompondo-a a seu grau mínimo, e descobriram que o átomo é composto de um núcleo, que tem 0,01% de sua massa, e de elétrons que giram em torno do resto de sua massa, composta 99,9% de espaço vazio. Ou seja, a matéria é basicamente um espaço vazio.
Então se perguntaram: o que nos dá a aparência de que a matéria é sólida e substancial? E concluíram que é o pensamento que nos dá essa impressão de solidez, pois na verdade a matéria não tem substância em si mesma. Ou seja, descobriram exatamente o que Mary Baker Eddy descobrira muitos anos antes. E ela ainda descobriu como curar o corpo somente através do pensamento, algo que os cientistas de hoje ainda não descobriram.