Haviam diversos clãs ninja. Só em Koga haviam cerca de 53 famílias. Entretanto, o conhecimento ninja sempre foi envolto em bastante mistério e tradição, o que dificultava muito sua disseminação. Isso mudou com o grão mestre Toshitsugu Takamatsu (高松 寿嗣). Takamatasu pode ser considerado o último dguerreiro ninja, era herdeiro de 9 escolas de ninjutsu. Ele também se envolveu em divesos combates reais na China, na Coreia e no Japão, sendo na época conhecido como Moku no Torah ( Tigre da Mongólica).