UNIVERSIDADE DO ESTADO DE SANTA CATARINA UDESC CENTRO DE CIÊNCIAS AGROVETERINÁRIAS CAV MESTRADO EM CIÊNCIA ANIMAL CLAUDIA PIES BIFFI - PDF
UNIVERSIDADE DO ESTADO DE SANTA CATARINA UDESC CENTRO DE CIÊNCIAS AGROVETERINÁRIAS CAV MESTRADO EM CIÊNCIA ANIMAL CLAUDIA PIES BIFFI
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Washington Brunelli Quintão
1 UNIVERSIDADE DO ESTADO DE SANTA CATARINA UDESC CENTRO DE CIÊNCIAS AGROVETERINÁRIAS CAV MESTRADO EM CIÊNCIA ANIMAL CLAUDIA PIES BIFFI PERFIL FENOTÍPICO E GENOTÍPICO DE ISOLADOS DE Salmonella Enteritidis E Salmonella Typhimurium DE ORIGEM AVÍCOLA FRENTE AOS ANTIMICROBIANOS CEFTIOFUR, GENTAMICINA E ENROFLOXACINA LAGES, SC 2012
2 CLAUDIA PIES BIFFI PERFIL FENOTÍPICO E GENOTÍPICO DE ISOLADOS DE Salmonella Enteritidis E Salmonella Typhimurium DE ORIGEM AVÍCOLA FRENTE AOS ANTIMICROBIANOS CEFTIOFUR, GENTAMICINA E ENROFLOXACINA Dissertação apresentada ao curso de Pós- Graduação em Ciência Animal do Centro de Ciências Agroveterinárias, da Universidade do Estado de Santa Catarina como requisito parcial para obtenção do título de Mestre em Ciência Animal. Orientadora: Prof. PhD. Lenita Moura Stefani Co-Orientador: Prof. Dr. Luiz Claudio Miletti LAGES, SC 2012
3 Ficha catalográfica elaborada pela Bibliotecária Renata Weingärtner Rosa CRB 228/14ª Região (Biblioteca Setorial do CAV/UDESC) Biffi, Claudia Pies Perfil fenotípico e genotípico de isolados de Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium de origem avícola frente aos antimicrobianos ceftiofur, gentamicina e enrofloxacina. / Claudia Pies Biffi; orientadora: Lenita Moura Stefani. Lages, f. Inclui referências. Dissertação (mestrado) Centro de Ciências Agroveterinárias / UDESC. 1. Antimicrobiano. 2. Genes de Resistência. 3. Salmonella. 4. Saúde Pública. I. Título.. CDD
5 Amor incondicional. À minha família, dedico.
6 AGRADECIMENTOS Muitas pessoas foram fundamentais para a realização desse projeto. Agradeço primeiramente ao nosso bom Deus, que me deu força para mais esta jornada e por ter permitido a realização de um sonho. Aos meus pais, Antonio e Eleni e meus irmãos Ana Paula e Luiz Antonio, por serem exemplo de amor, dedicação e solidariedade, agradeço por ter essa família maravilhosa. Ao amor da minha vida, Leonardo, pelo carinho, compreensão, companheirismo e toda ajuda dispensada para a elaboração desse trabalho. À minha orientadora, Lenita, pelo apoio, amizade e ensinamentos repassados nessa caminhada, obrigada por tudo. Aos meus queridos professores Eliana Vaz e Luiz Claudio Miletti, a ajuda e os ensinamentos repassados por vocês foram fundamentais para que esse projeto fosse realizado. Ao laboratório Mercolab, pelo fornecimento das amostras e por ter me proporcionado imenso aprendizado ao permitir que acompanhasse suas atividades de rotina. Aos laboratórios FIOCRUZ e de Protozoologia da UFSC pela sorotipagem e sequenciamento das amostras. Aos professores Glaucia Amorim e Marcos Cordeiro pela ajuda na análise estatística. A todos os mestres que contribuem continuamente para o meu aprendizado. Aos estagiários dos laboratórios CEDIMA e Hemoparasitas e Vetores, do CAV, por toda a ajuda dispensada na análise das amostras. Em especial as minhas professoras de biologia molecular Cícera e Mariana, vocês foram muito importantes para o meu aprendizado, obrigada pela bela amizade que construímos. À minha fiel companheira e amiga Cecília, o que teria sido de mim sem a sua preciosa ajuda, você é muito especial. Ao meu colega João Zuffo pela ajuda e disponibilidade de materiais necessários para a realização das análises, muito obrigada. Aos meus grandes e velhos amigos Daniela, Valquer, Ana, Cristina, Soraia e Debóra, que mesmo estando distantes sempre torcemos uns pelos outros, amizade como a nossa é eterna. Às minhas amigas Fernanda, Franciane, Patrícia, Tiffany, Juliana e ao amigo Rodrigo, obrigada por fazerem parte desta jornada. A Todos que contribuíram de uma forma ou outra, muito obrigada!
7 RESUMO As salmoneloses são responsáveis por significativas perdas econômicas na avicultura e por sérios danos à saúde pública, pois estão envolvidas na maioria dos casos de infecções alimentares. Estudos destes surtos em humanos indicam que produtos de origem animal, especialmente avícola, participam de forma significativa como fontes de contaminação. Observa-se que entre os isolados de Salmonella a resistência aos antimicrobianos utilizados rotineiramente na avicultura está aumentando significativamente, além da presença de multirresistência. O objetivo deste trabalho foi verificar o perfil fenotípico e genotípico de resistência antimicrobiana em isolados de Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium de origem avícola frente à Gentamicina, Enrofloxacina e Ceftiofur, através do teste de discodifusão, concentração inibitória mínima (MIC) e pesquisa de genes de resistência por PCR. Amostras de diversas origens avícolas foram isoladas em um laboratório privado no estado do Paraná, o isolamento foi realizado de acordo com o preconizado pela normativa do MAPA. Os isolados identificados como Salmonella sp. foram enviados para o laboratório FIOCRUZ onde foram sorotipados. Destas amostras, duas foram identificadas como S Enteritidis e onze como S Typhimurium. Após esta etapa as amostras foram avaliadas quanto a sua sensibilidade fenotípica, para isto foram realizados os testes de concentração inibitória mínima e antibiograma. Os resultados desta avaliação mostraram diferentes níveis de resistência nas duas metodologias para os antimicrobianos testados. No antibiograma os isolados de S. Enteritidis foram 100% sensíveis aos antimicrobianos Gentamicina e Enrofloxacina e apresentaram resistência de 50% ao Ceftiofur. Já a S. Typhimurium apresentou resistência em graus variados aos três antimicrobianos testados, 18,1% para o Ceftiofur, 45,4% para Gentamicina e 18,1% para Enrofloxacina. No MIC os isolados de S. Typhimurium apresentaram resistência de 27,2% ao Ceftiofur, 54,5% à Gentamicina e 18,1% à Enrofloxacina, resultados esses muito semelhantes aos observados no antibiograma. Já as amostras de S. Enteritidis tiveram 100% de resistência à Gentamicina e 50% para a Enrofloxacina e Ceftiofur. Na análise genotípica observou-se que as amostras de S. Typhimurium e S. Enteritidis, independente de serem resistentes ou sensíveis fenotipicamente à Enrofloxacina, apresentaram senão os quatro, mas três dos genes responsáveis pela resistência. Com relação à Gentamicina e ao Ceftiofur, os genes de resistência foram encontrados principalmente nas amostras que apresentaram resistência fenotípica. Porém também foram encontradas amostras resistentes fenotipicamente mas que não tinham o gene de resistência, assim como amostras sensíveis que apresentavam o gene. Esses resultados demonstram o elevado grau de resistência das cepas isoladas aos antimicrobianos testados, assim como a presença de multirresistência. Soma-se a isso o fato de amostras possuírem o gene de resistência e não estarem expressando fenotipicamente, salientando que os antimicrobianos rotineiramente utilizados podem tornar-se ineficientes dentro de um curto período de tempo. Palavras-chave: Antimicrobiano. Genes de Resistência. Salmonella. Saúde Pública.
8 ABSTRACT Salmonellosis is responsible for significant economic losses in poultry and serious harm to public health because they are involved in most cases of foodborne illness. Studies of these outbreaks in humans indicate that animal products, in particular poultry, are significant sources of contamination. It is observed that among isolates of Salmonella resistance to antimicrobial agents used routinely in poultry is increasing significantly, including the presence of multidrug resistance. The objective of this study was to investigate the genotypic and phenotypic profile of antimicrobial resistance of Salmonella Enteritidis and Salmonella Typhimurium from poultry products to Gentamicin, Ceftiofur and Enrofloxacin by the disk diffusion test, minimum inhibitory concentration (MIC) and search for resistance genes by PCR. Salmonella sp. from poultry samples were isolated in a private laboratory from the state of Parana. The isolation was performed as recommended by the Brazilian official methods. Isolates identified as Salmonella sp. were sent to the FIOCRUZ laboratory where they were serotyped. Of these samples, two were identified as S. Enteritidis and eleven as S. Typhimurium. Different levels of resistance were verified when compared diffusion test and MIC. S. Enteritidis was 100% sensitive for Enrofloxacin and Gentamicin and 50% resistant to Ceftiofur according to the diffusion test. As for S. Typhimurium there was resistance to all three antibiotics tested (18.1% for Ceftiofur, 45.4% for gentamicin and 18.1% for Enrofloxacin). In the MIC the isolates of S. Typhimurium were resistant to Ceftiofur (27.2%), Gentamicin (54.5%), and to Enrofloxacin (18.1%). These results were very similar to those observed in the diffusion test. However, the samples of S. Enteritidis had 100% resistance to Gentamicin and 50% for Enrofloxacin and Ceftiofur in the MIC test. Genotypic analysis by PCR showed that S. Typhimurium and S. Enteritidis, either resistant or susceptible to Enrofloxacin, presented at least three (out of four) of the genes responsible for resistance. Regarding Gentamicin and Ceftiofur, resistance genes were found mainly in samples with phenotypic resistance. Interestingly phenotypically resistant strains did not presented the resistance gene, as well as sensitive strains present the gene. These results demonstrate the high degree of resistance to the antibiotics routinely used in poultry, as well as the presence of multidrug resistance. In addition, the fact that some isolates already contain the resistance gene but are not phenotypically expressing it, stress out the possibility that these antimicrobials may become ineffective within a short period of time. Key-words: Antimicrobial. Public Health. Resistance Gene. Salmonella.
9 LISTA DE FIGURAS Figura 1 Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene AmpC (1226 pb) Figura 2 - Gel de agarose 2% mostrando a presença da banda para o gene BlaCMY (354 pb) Figura 3 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene GyrA (251 pb) Figura 4 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene GyrB (181 pb) Figura 5 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene ParC (260 pb) Figura 6 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene ParE (237 pb) Figura 7 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene AadA (526 pb) Figura 8 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene AadB (700 pb) Figura 9 - Sequência do gene GyrA depositado no banco de dados públicos do Centro Nacional de Informação Biotecnológica, NCBI, similaridade de 99% Figura 10 - Sequência do gene AadA depositado no banco de dados públicos do Centro Nacional de Informação Biotecnológica, NCBI, similaridade de 98%
10 LISTA DE TABELAS Tabela 1- Soluções de antimicrobianos Tabela 2 - Genes de resistência para cada antimicrobiano testado, primers específicos, tamanho dos pares de bases e trabalhos de referência para protocolos de amplificação Tabela 3 Sorotipos de Salmonella sp. identificados através da técnica de sorotipificação realizada pelo laboratório FIOCRUZ Tabela 4 Perfis de susceptibilidade no antibiograma dos isolados de S. Enteritidis e S. Typhimurium aos antimicrobianos Ceftiofur, Gentamicina e Enrofloxacina Tabela 5 Perfis de susceptibilidade no MIC dos isolados de S. Enteritidis e S. Typhimurium aos antimicrobianos Ceftiofur, Gentamicina e Enrofloxacina Tabela 6 - Presença dos genes de resistência aos antimicrobianos Enrofloxacina, Gentamicina e Ceftiofur para os isolados de S. Typhimurium e S. Enteritidis Tabela 7 - Análise de sensibilidade e especificidade das metodologias MIC e Antibiograma para os antimicrobianos Ceftiofur, Gentamicina e Enrofloxacina Tabela 8 - Tamanho dos halos de inibição dos antimicrobianos testados Tabela 9 Concentrações dos reagentes e condições do termociclador para a realização da PCR para os genes testados Tabela 10 Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do MIC com a presença ou ausência dos genes de resistência à Enrofloxacina. 64 Tabela 11 Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do Antibiograma com a presença ou ausência dos genes de resistência à Enrofloxacina Tabela 12 - Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do MIC com a presença ou ausência dos genes de resistência ao Ceftiofur Tabela 13 - Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do Antibiograma com a presença ou ausência dos genes de resistência ao Ceftiofur Tabela 14 - Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do MIC com a presença ou ausência dos genes de resistência à Gentamicina... 65
11 9 Tabela 15 - Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do Antibiograma com a presença ou ausência dos genes de resistência à Gentamicina
12 LISTA DE ABREVIATURAS µg: Microgramas µl: Microlitros ANVISA: Agência Nacional de Vigilância Sanitária BHI: Infusão de cérebro e coração BLAST: Basic Local Alignment Search Tool CDC: Centers for Disease Control and Prevention CEDIMA: Centro de Diagnóstico de Microbiologia Animal DNA: Ácido desoxirribonucleotídeo dntps: Desoxirribonucleotídeos fosfatados DTA: Doenças Transmitidas por Alimentos FIOCRUZ: Fundação Osvaldo Cruz LPS: Lipopolissacarídeos MAPA: Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento MIC: Concentração Inibitória Mínima ml: Mililitros mm: Milímetros NCCLS: National Committee for Clinical Laboratory Standards pb: Pares de base PCR: Reação da Polimerase em Cadeia PNSA: Plano Nacional de Sanidade Avícola SPI: Salmonella Pathogenicity Islands TSA: Ágar triptona de soja UBABEF: União Brasileira de Avicultura WHO: World Health Organization
13 SUMÁRIO 1 INTRODUÇÃO REVISÃO BIBLIOGRÁFICA GÊNERO SALMONELLA Características morfológicas, bioquímicas e nomenclatura Fatores de virulência Fímbrias Flagelos Lipopolissacarídeos (LPS) Ilhas de patogenicidade SALMONELOSE NAS AVES IMPORTÂNCIA NA SAÚDE PÚBLICA Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium USO DE ANTIMICROBIANOS NA AVICULTURA Resistência Bacteriana aos Antimicrobianos Resistência Bacteriana as Fluorquinolonas Resistência Bacteriana aos Aminoglicosídeos Resistência Bacteriana as Cefalosporinas ARTIGO INTRODUÇÃO MATERIAL E MÉTODOS Isolamento Antibiograma Concentração Inibitória Mínima (MIC) Reação da Polimerase em Cadeia (PCR) Extração do DNA Pesquisa dos genes de resistência Sequenciamento Análise Estatística RESULTADOS Sorotipificação Antibiograma Concentração Inibitória Mínima (MIC) Comparativo Antibiograma e MIC PCR Análise Estatística Sequenciamento DISCUSSÃO... 41
14 12 4 CONCLUSÃO REFERÊNCIAS REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS DO ARTIGO REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS APÊNDICES... 57
15 13 1 INTRODUÇÃO A crescente demanda pelo consumo de carne de origem avícola em todo o mundo fez com que o Brasil se tornasse um dos maiores produtores mundiais de frangos de corte. Atualmente o Brasil é o terceiro maior produtor, ficando atrás somente dos Estados Unidos e da China, no entanto é o maior exportador mundial, totalizando mil/ton de carne exportada, principalmente para países como o Oriente Médio e Ásia. Além da grande quantidade exportada, em torno de 69% da produção é destinada ao mercado interno (UBABEF, 2011). Os hábitos alimentares dos brasileiros têm mudado nos últimos tempos, aliado ao aumento do poder aquisitivo das classes mais baixas e ao preço mais acessível da carne de frango, fizeram com que o consumo per capita anual da população chegasse a patamares de 47,4 kg, valores esses que já ultrapassaram o consumo de países como os Estados Unidos, onde o consumo foi em torno de 44,4 kg (UBABEF, 2011). Com o intuito de manter sua competitividade no mercado e garantir a qualidade dos produtos ofertados aos consumidores, o Brasil trabalha persistentemente em seus programas de biosseguridade. Grande exemplo é o PNSA (Plano Nacional de Sanidade Avícola), instituído pelo Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA) através da Portaria Ministerial número 193 de 19 de setembro de Este programa visa manter a saúde do plantel avícola brasileiro através de monitorias contra as doenças de Newcastle, Influenza Aviária, Micoplasmoses e Salmoneloses, sendo esta última responsável por grandes perdas econômicas relacionadas tanto a produtividade do plantel, como à saúde pública. As salmoneloses são ocasionadas por bactérias do gênero Salmonella, bacilos Gram negativos, pertencentes à família das Enterobacteriaceae que podem ser encontradas nos mais variados ambientes. As perdas econômicas na avicultura mundial são elevadas em função das contaminações por Salmonellas sp. O prejuízo ocasionado pela salmonelose é causado pela alta mortalidade que as Salmonelas, principalmente Salmonella Gallinarum e Salmonella Pullorum, podem ocasionar nas aves, além da queda na produção de ovos e perda de peso devido à baixa conversão alimentar (RISTOW, 2010). Para diminuir essa incidência, Andreatti Filho (2006) comenta que os cuidados preventivos devem estar presentes em todas as fases de criação, desde o planejamento do aviário até o abate do lote. Ainda, de acordo com Sesti (2004) um programa efetivo de biosseguridade é a única maneira de manter os sistemas de produção livres ou controlados, no que diz respeito à presença de doenças de impacto econômico e risco à saúde pública.
16 14 Deve-se salientar que esta bactéria é um dos mais importantes agentes patogênicos de interesse em saúde pública, segundo Amson et al. (2006), em um trabalho conduzido entre 1978 a 2000 no Estado do Paraná, verificou-se que em doenças transmitidas por alimentos a Salmonella sp. estava presente em 33,8% dos surtos deste período, número inferior apenas aos registrados por Staphyloccocus aureus que representou 41,2% dos casos. Os produtos de origem avícola apresentam importante papel na disseminação desses agentes, Nadvorny et al. (2004), investigando surtos de Salmoneloses causadas por alimentos, verificaram que 74,7% dos casos intoxicação alimentar foram ocasionados por Salmonella sp. Estes autores investigaram ainda a origem dos surtos e identificaram que 83,6% dos casos tiveram origem avícola, destacando assim a importância deste setor na saúde pública. Dentre os mais de 2600 sorotipos já identificados, os sorotipos entéricos com maior patogenicidade para humanos são a Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium, sendo estes isolados com frequência em amostras avícolas. No ano de 2010, 12,5% dos isolados de Salmonella sp. em um laboratório no Paraná foram de S. Enteritidis (BACK, 2012). 1 Observa-se também o aparecimento de cepas de Salmonella sp. resistentes aos antimicrobianos rotineiramente utilizados, Guerra et al. (2002) verificaram que 51% das cepas analisadas eram multirresistentes, e essa resistência variava de dois a nove tipos de antimicrobianos. Alguns autores consideram como responsável direto pelo aumento na incidência de casos de cepas resistentes a antibióticos o uso de medicamentos como promotores de crescimento na ração animal (MACDONALD et al., 1987; KELLEY et al.,1998; GUERRA, et al., 2002; MOLBAK et al., 2002). Ainda segundo Threlfall (2002) a exposição continuada a antibióticos desenvolve resistência nas cepas expostas após um determinado período de tempo. Soma-se a isso o uso de forma indiscriminada na terapêutica dos animais. O objetivo deste trabalho foi averiguar o perfil fenotípico e genotípico de resistência antimicrobiana de amostras de Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium de origem avícola frente à Gentamicina, Enrofloxacina e Ceftiofur, através do teste de disco-difusão, concentração inibitória mínima e pesquisa de genes de resistência por PCR. 1 Comunicação pessoal
17 15 2 REVISÃO BIBLIOGRÁFICA 2.1 GÊNERO SALMONELLA Características morfológicas, bioquímicas e nomenclatura O gênero Salmonella pertence à família das Enterobacteriaceae, recebeu esse nome em homenagem ao seu descobridor, Daniel E. Salmon, médico veterinário do Departamento de Agricultura dos Estados Unidos da América (USDA), (SNOEYENBOS; WILLIAMS, 1991). São bacilos Gram-negativos que infectam todos os animais, inclusive as aves e o homem. Neste gênero estão incluídos mais de 2500 sorotipos (BACK, 2002). Essas bactérias são bacilos não esporulados, que possuem flagelos na sua maioria, aeróbios ou anaeróbios facultativos, fermentam glicose e outros açúcares e descarboxilam aminoácidos. As reações bioquímicas são importantes para a caracterização de gênero e diferenciação de alguns biotipos. Salmonella Gallinarum e Salmonella Pullorum estão entre os poucos que não possuem flagelos, sendo imóveis (BERCHIERI; OLIVEIRA, 2006). Dentre os 2600 sorotipos, menos de 50 são os responsáveis pela maioria dos casos de infecção em animais e humanos. Os demais sorotipos vivem nos chamados animais de sangue frios, principalmente répteis e no ambiente (LIBBY et al., 2004). Todas as salmonelas tem o potencial de patogenicidade, causando salmonelose ou gastrenterite por Salmonella (TORTORA et al., 2012). Dentro do gênero Salmonella, a classificação é feita de acordo com o esquema de Kauffmann-White, no qual a divisão entre os sorotipos é baseada nos antígenos H (flagelares), O (somáticos) e menos frequentemente capsulares (K), também conhecidos como Vi, a partir disto os sorotipos podem ser diferenciados sorologicamente (POPOFF et al., 2003). Quando essa bactéria entra em contato com o organismo animal, seus flagelos, cápsulas e paredes celulares, atuam como antígenos e induzem o animal a produzir anticorpos, e que são específicos para cada uma dessas estruturas, portanto os meios sorológicos são utilizados para sua diferenciação (TORTORA et al., 2012). A realização da classificação sorológica pelo esquema de Kauffmann-White segue uma tabela antigênica baseada nos seus antígenos O, Vi e H. Os antígenos O são designados por números arábicos e caracterizam os sorogrupos de Salmonella. Por esta razão o mesmo antígeno O é comum a vários sorotipos de Salmonella. Só existe um tipo sorológico de
18 16 antígeno Vi, e este é encontrado apenas nas Salmonellas Typhi, Paratyphi C e Dublin. Os antígenos flagelares podem ocorrer em duas fases, denominadas 1 e 2. Uma Salmonella portadora de um antígeno flagelar, ao proliferar, pode dar origem a um clone que expressa outro antígeno flagelar. Por isso em uma cultura, parte das células apresentam com flagelos de fase 1 e parte com fase 2. Os antígenos são designados pelas letras minúsculas do alfabeto (fase 1) e por números arábicos (fase 2). Para exemplificar, a fórmula antigênica para Salmonella Typhi é: 9,12[Vi]:d:-, onde primeiramente se leem os antígenos somáticos, seguidos ou não pelos capsulares, entre colchetes e após os antígenos flagelares, na fase 1 ou 2, sendo que se não houver representar com um traço (CAMPOS, 2005). O esquema ainda divide o gênero em 2 espécies: S. enterica e S. bongori. A S. enterica por sua vez se divide em 6 subespécies, sendo essas a enterica, salamae, arizonae, diarizonae, houtenae e indica. A espécie S. bongori por sua vez se divide unicamente na subespécie bongori (POPOFF et al., 2003). Ainda de acordo com Brenner et al. (2000) novas metodologias podem ser utilizadas para a identificação dos diferentes sorotipos, como análise de DNA através de estudos de hibridização. A nomenclatura para Salmonella é frequentemente confusa e difere da nomenclatura binomial (gênero e espécie) das outras bactérias, entretanto a padronização é necessária para adequada comunicação entre microbiologistas, órgãos oficiais, profissionais da saúde e população em geral (BRENNER et al., 2000). Para ter uma nomenclatura de forma clara e correta, esta deve conter a espécie, a subespécie e o sorotipo sendo que este não deve estar em itálico, por exemplo, Salmonella enterica sorotipo Typhimurium, é usado como primeira citação, posteriormente pode ser referenciado utilizando somente Salmonella Typhimurium (LIBBY et al., 2004) Fatores de virulência Os microrganismos patogênicos se distinguem de outros da mesma espécie pelo fato de possuírem e expressarem genes que codificam fatores de virulência, isto é, fatores que propiciam a colonização e ocorrência de diversos eventos que subvertem a fisiologia hospedeira, ocasionando o aparecimento de sinais e sintomas anormais, que irão, finalmente, definir o estado de doença. Além dos fatores de virulência a aquisição de genes que permitem a resistência a drogas antimicrobianas tornou-se um elemento adicional no arsenal de virulência das bactérias (VIEIRA, 2009).
19 Fímbrias Caracteriza-se por serem estruturas mais curtas, retas e finas que os flagelos, têm função relacionada mais a fixação e transferência de DNA que à motilidade (TORTORA et al., 2012). Estão associadas à adesão em diferentes células epiteliais e possivelmente à matriz extracelular. São encontradas em praticamente todos os sorotipos de Salmonela, sua distribuição é variável o que dificulta entender seu real papel na virulência (CAMPOS, 2005) e os mecanismos de aderência podem variar de acordo com o hospedeiro (LIBBY et al., 2004). As fímbrias podem estar localizadas tanto no cromossomo como nos plasmídeos (LIBBY et al., 2004) Flagelos Os flagelos são longos apêndices filamentosos que propelem as bactérias (TORTORA et al., 2012). Conferem dessa forma motilidade à bactéria, as regras para a virulência ocasionada pelos flagelos ainda não são bem conhecidas, mas estão relacionados na invasão intestinal (LIBBY et al., 2004) Lipopolissacarídeos (LPS) Compõem a membrana externa das bactérias Gram-negativas (TORTORA et al., 2012). São os maiores componentes de membrana e é uma importante toxina que interage com o sistema imune do hospedeiro induzindo inflamação, choque septicêmico, febre e morte. LPS consiste de 3 componentes: cadeia de polissacarídeos (antígeno O), oligossacarídeos (região do core) e molécula lipídica (lipídeo A) (LIBBY et al., 2004). O lipídeo A é a porção lipídica do LPS, quando as bactérias morrem liberam o lipídeo A que atua como uma endotoxina. É ele o responsável por ocasionar febre, choque e formação de coágulos. Os oligossacarídeos estão ligados ao lipídeo A, contém açúcares e responde pela função estrutural. Já o polissacarídeo O tem a função de antígeno (TORTORA et al., 2012) Ilhas de patogenicidade
20 18 São grandes regiões localizadas no DNA cromossômico e são referidas como SPIs (Salmonella Pathogenicity Islands) (BLUM et al., 1994). Cinco ilhas de patogenicidade são identificadas nas S. Typhimurium e na S. Typhi (WONG et al.,1998), no entanto três ilhas são consideradas como sendo as mais importantes (VIEIRA, 2009). A capacidade de invasão da S. Typhimurium está codificada em genes localizados em uma SPI denominada SPI-1. Além de codificar proteínas que capacitam à invasão de células do hospedeiro, existem na SPI-1, genes que codificam uma série de proteínas para o sistema de secreção. Através desse sistema de secreção passam proteínas efetoras que, uma vez dentro da célula intestinal, atuam na célula hospedeira, causando modificações no citoesqueleto e, consequentemente no arcabouço celular, possibilitando desse modo a entrada da bactéria (GRASSL; FINLAY, 2008). Após a entrada da bactéria na célula do hospedeiro, esta sobrevive nos macrófagos, e assim promove sua distribuição sistêmica no organismo (HENSEL et al. 1995). Essa capacidade de sobrevivência e multiplicação se deve a proteínas codificadas em outra SPI, denominada SPI-2 (VIEIRA, 2009). Outra ilha, SPI-3, embora menor, também codifica elementos que permitem a sobrevivência da Salmonella no meio intracelular (VIEIRA, 2009). Essa ilha codifica o operon mgtcb possibilitando a sobrevivência intracelular da bactéria em condições limitadas de magnésio (SMITH et al., 1998). As outras SPIs da Salmonella não possuem seu próprio sistema de secreção e realizam suas funções por meio de um consórcio, utilizando os sistemas codificados em SPI-1 e SPI-2 (VIEIRA, 2009). O mecanismo de patogenicidade e a invasão das células epiteliais ocorrem quando a salmonela invade primeiramente a mucosa intestinal e ali se multiplica. Ocasionalmente ela dirige a passagem através da mucosa intestinal, nas células M, para penetrar nos sistemas linfático e cardiovascular, e dali se disseminar para muitos órgãos. Elas se replicam rapidamente dentro dos macrófagos. A salmonelose tem um período de incubação que varia de 12 a 36 horas. Até 1 bilhão de salmonelas por grama podem ser encontradas nas fezes de uma pessoa na fase aguda da doença (TORTORA et al., 2012). 2.2 SALMONELOSE NAS AVES O termo Salmonelose é utilizado para designar os quadros de doenças ocasionados por bactérias do gênero Salmonella sp. (SNOEYENBOS; WILLIAMS, 1991).
21 19 Essas bactérias são responsáveis pelo aparecimento de 3 formas da doença nas aves: Pulorose, Tifo Aviário e Paratifo (POMEROY; NAGARAJA, 1991; BACK, 2002; ANDREATTI FILHO, 2006). A Pulorose é ocasionada pela Salmonella Pullorum, que assim como a Salmonella Gallinarum é extremamente adaptada às aves. Acomete principalmente aves jovens, com menos de três semanas de vida, ocasionando alta mortalidade e aumento de aves debilitadas. A sintomatologia se caracteriza principalmente pela presença de diarreia esbranquiçada e empastamento cloacal. Aves adultas acometidas geralmente não manifestam sintomatologia clínica, tornam-se portadoras e disseminadoras sãs, o que se pode observar é queda de produção de ovos que pode chegar a 30%. A transmissão do agente ocorre tanto por via vertical como horizontal (POMEROY; NAGARAJA, 1991; SNOEYENBOS; WILLIAMS, 1991; BERCHIERI JUNIOR, 2000; BACK, 2002; ANDREATTI FILHO, 2007). Salmonella Gallinarum é o agente causador do Tifo Aviário, sendo que este acomete principalmente as aves adultas. As aves podem apresentar mortalidade súbita, que pode variar de 10 a 80%, além de diarreia esverdeada, prostração e queda de produção. Na necropsia se observa um fígado com coloração bronzeada. A principal forma de transmissão é a horizontal, mas a forma vertical também pode ocorrer (POMEROY; NAGARAJA, 1991; SNOEYENBOS; WILLIAMS, 1991; BERCHIERI JUNIOR, 2000; BACK, 2002; ANDREATTI FILHO, 2007). Esses dois agentes foram considerados responsáveis por grandes perdas econômicas na avicultura mundial por muitos anos, em função principalmente da mortalidade, refugagem e perdas de carcaça no abate. No entanto, de acordo com Snoeyenbos; Williams (1991) e Pomeroy; Nagaraja (1991), esses agentes foram praticamente erradicados nos Estados Unidos e em outros países. No Brasil, através do PNSA com os programas de controle e erradicação, também se observou significativa diminuição desses agentes, porém não a sua completa erradicação, pois de acordo com Back (2012) 2 há isolados de S. Pullorum e S. Gallinarum nos plantéis avícolas brasileiros. Alguns autores comentam que na tentativa de erradicação desses dois agentes, abriu-se um nicho principalmente para Salmonella Enteritidis e outras do grupo paratífico (BAUMLER et al., 2000). Ainda de acordo com Back (2012)², tem-se observado significativo aumento dos isolados de Salmonella Heidelberg, assim como de Salmonella Enteritidis. 2 Comunicação pessoal
22 20 O Paratifo é ocasionado pelas salmonelas que não são adaptadas às aves, representado principalmente pela Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium. Esses sorotipos além das perdas econômicas para a avicultura são responsáveis pelos casos de intoxicações alimentares em humanos. A sintomatologia é mais exacerbada nas aves jovens, que podem apresentar mortalidade principalmente até as 3 primeiras semanas de vida, podem apresentar diarreia, prostração, desuniformidade e sonolência. As aves adultas dificilmente manifestam sinais, mas atuam como portadoras e disseminadoras. As formas de transmissão do agente ocorrem tanto na via vertical, por contaminação no oviduto ou no momento da postura via casca do ovo, como horizontal (POMEROY; NAGARAJA, 1991; SNOEYENBOS; WILLIAMS, 1991; BERCHIERI JUNIOR, 2000; BACK, 2002; ANDREATTI FILHO, 2006). As aves portadoras podem no momento do abate, contaminar as carcaças, assim como as poedeiras podem contaminar os ovos no momento da postura ou da sua formação, e assim contaminar os seres humanos levando ao aparecimento dos quadros de toxinfecções alimentares (POMEROY; NAGARAJA, 1991; SNOEYENBOS; WILLIAMS, 1991; BERCHIERI JUNIOR, 2000; BACK, 2002; ANDREATTI FILHO, 2006; CARRASCO et al., 2012). 2.3 IMPORTÂNCIA NA SAÚDE PÚBLICA A Salmonelose é uma das principais doenças entéricas em humanos em todo o mundo (CDC, 2012). Em função da alta prevalência da Salmonella sp. em aves, os produtos de origem aviária, como carne e ovos quando consumidos sem passarem pelo processo de cozimento, atuam como fontes de veiculação e transmissão da bactéria para os humanos (POPPE et al., 1998). Outros alimentos como pratos prontos e saladas também atuam como disseminadores da Salmonella sp. (WELKER et al., 2010). De acordo com o Centers for Disease Control and Prevention-EUA (CDC, 2012) a cada ano, em torno de casos de salmonelose são relatados nos Estados Unidos. No entanto esses números podem ser 29 vezes maiores, pois muitos casos considerados leves não são diagnosticados ou notificados. O sorotipo prevalente nos Estados Unidos é a Salmonella Typhimurium. Ainda de acordo com estimativas anuais do CDC (2012) para o período de 2000 a 2008, em torno de 1 milhão de pessoas foram acometidas pela salmonelose, dessas foram hospitalizados e 380 pessoas morreram. Esses números só não são maiores que os ocasionados pelo Norovírus.
23 21 No Brasil, de acordo com dados da Secretaria de Vigilância em Saúde (BRASIL, 2012), entre os anos de 2000 a 2011 foram notificados 1600 surtos de salmonelose, sendo que nos anos de 2010 e 2011 esses surtos não chegaram a 50. A maioria das pessoas infectadas desenvolve febre, diarreia e cólicas abdominais de 12 a 72 horas a pós a infecção. A doença geralmente dura de 4 a 7 dias e grande parte das pessoas se recuperam sem tratamento. No entanto, em alguns casos, a diarreia pode ser tão severa que o paciente precisa ser hospitalizado, pode ocorrer septicemia e a morte se o mesmo não for medicado rapidamente (CDC, 2012). Idosos, crianças e imunocomprometidos são mais suscetíveis a ter uma doença grave. De acordo com dados da Agência Nacional de Vigilância Sanitária (BRASIL, 2012), o ovo é apontado como principal alimento envolvido em surtos de doenças transmitidas por alimentos no país se considerado como agente causador a Salmonella sp. Dados apontam que, entre 1999 e 2007, o consumo de ovos crus ou mal cozidos foi responsável por 22,6% dos casos desse tipo de doença notificados ao Ministério da Saúde. O estudo demonstra, ainda, que as residências são os locais com maior ocorrência desses surtos, com 48,5% do total, seguidas de restaurantes (18,8%) e escolas (11,6%). A legislação vigente para comercialização e estocagem dos ovos para consumo é antiga, necessitando de melhorias para garantir a qualidade do produto ao consumidor (BRASIL, 2012). Durante os anos de 2006 e 2007 foram realizadas análises nos alimentos envolvidos em surtos de DTA (Doenças Transmitidas por Alimentos) no Estado do Rio Grande do Sul, foi constatado que a Salmonella sp. estava envolvida em 37% dos casos, sendo a carne de frango responsável por 30% das contaminações e as saladas de maionese feitas com ovos crus responsável por 51% das amostras contaminadas (WELKER et al., 2010). No Estado de Santa Catarina, dados da Vigilância Epidemiológica Estadual (SANTA CATARINA, 2012), mostram que entre os anos de 2006 a 2009, 45% dos surtos de DTA foram ocasionados pela Salmonella sp. e os ovos e/ou maionese estavam envolvidos em 100% dos casos. No entanto, deve-se salientar que a salmonelose em seres humanos é influenciada por uma série de fatores para que ocorra o desenvolvimento da sintomatologia, dentre os quais pode-se citar o sorovar de Salmonella envolvido, a idade e dose infectante, tipo de alimento contaminado e predisposição para doenças (POPPE, 1999). Além dos fatores do organismo humano que contribuem para a resistência como a acidez gástrica, microbiota intestinal normal, imunidade intestinal local e motilidade do trato gastrointestinal (TORTORA et al., 2012).
24 Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium Durante os últimos anos, o aumento da prevalência de S. Enteritidis em humanos teve um incremento significativo, começando pelos países da Europa e alcançando todo o mundo. O isolamento desse sorotipo ultrapassou o de S. Typhimurium. Geralmente o consumo de ovos, ou produtos contendo esse alimento está associado aos casos de contaminação (POPPE, 1999). Enquanto a S. Enteritidis está associada principalmente ao consumo de carne de aves e ovos, a S. Typhimurium está relacionada ao processo produtivo dos alimentos, tanto para aves como suínos e bovinos (CARRASCO et al., 2012). A contaminação dos ovos pela bactéria pode ocorrer no ovário e/ou oviduto da ave, assim como no momento da postura através da contaminação da casca com as fezes ou ambiente contaminado (BACK, 2002; ANDREATTI FILHO, 2006). De acordo com De Buck et al. (2004), as células da camada granulosa dos folículos pré-ovulatórios seriam o local de eleição para colonização e invasão do ovário pela S. Enteritidis. Já a contaminação da carne pode ocorrer principalmente através da contaminação cruzada no momento do abate dessas aves (CARRASCO et al., 2012). Dados do World Health Organization (WHO, 1992), mostram que 25% das contaminações estão associadas a contaminação cruzada, envolvendo principalmente práticas de higiene deficientes, equipamentos contaminados, contaminação dos funcionários que manipulam esses produtos e estocagem inadequada. Os cinco sorotipos de Salmonella mais frequentes ocorridos em humanos no ano de 2009 na União Européia, de acordo com a Community Summary Report, foram S. Enteritidis (53%), S. Typhimurium (24%), S. Infantis (1,6%), S. Newport, S. Virchow e S. Derby (0,7%) respectivamente, sendo que S. Enteritidis e S. Typhimurium foram responsáveis por 77% dos casos (LETTINI; RICCI, 2010). S. Enteritidis passou a ser problema de saúde pública no Brasil a partir de 1993, até então era pouco isolada de infecções humanas. A partir desse momento sua prevalência tem aumentado e passou a corresponder a mais de 60% dos sorovares isolados no Instituto Adolfo Lutz, a partir de 1995 (SILVA; DUARTE, 2002). Isto é demonstrado através da avaliação de 4581 isolamentos de fontes não humanas, realizados entre janeiro de 1996 e dezembro de 2000, no estado de São Paulo, onde foram identificados 123 sorotipos de Salmonella, sendo que S. Enteritidis estava presente em 32,7%, seguida por S. Senftenberg (10,3%), S. Hadar (6,8%), S. Agona (5,1%) e S.Typhimurium (2,4%) (TAVECCHIO et al., 2002).
25 23 De acordo com Kanashiro et al. (2005), há uma alta incidência de S. Enteritidis nos lotes de frangos de corte (84%) e nas granjas de matrizes (57,5%), o que demonstra ser esse o sorotipo frequentemente responsável por surtos e casos esporádicos de salmonelose em humanos no Brasil. Para que se obtenha o controle das salmonelas devem-se ter programas de controles eficazes que permitam a rastreabilidade dentro da cadeia alimentar, possibilitando a investigação epidemiológica dos surtos (OLSEN et al., 2003). Ainda, de acordo com Nascimento (2012), pode-se afirmar que o controle da presença de patógenos em alimentos de origem animal é um dos grandes desafios da indústria, tanto em nível nacional quanto internacional. Cada vez mais os países importadores irão demandar a redução do risco de contaminação de produtos, devendo os países exportadores como o Brasil responder á altura a estas exigências, como forma de atender adequadamente seus mercados. 2.5 USO DE ANTIMICROBIANOS NA AVICULTURA Os antimicrobianos têm sido utilizados na produção animal há várias décadas, principalmente com objetivo preventivo ou terapêutico. Além disso, os antimicrobianos, também chamados de promotores de crescimento podem ser utilizados com a finalidade de melhorar o desempenho de crescimento das aves, e assim, aumentar a produtividade (ROSTAGNO, 2012). Logo após sua descoberta, os antimicrobianos e quimioterápicos utilizados em medicina veterinária para o tratamento de doenças foram incorporados em alimentos para animais como promotores de crescimento. Assim, desde a década de 1950, os antimicrobianos e quimioterápicos têm se tornado parte integrante da alimentação animal, em grandes quantidades, gerando preocupações sobre as resistências das bactérias aos mesmos, transmitidas dos animais para os seres humanos (SANTANA et al., 2011). De acordo com Rostagno (2012), na Europa, onde a pressão por parte dos consumidores e de grupos ativistas é grande, o uso de antimicrobianos como agentes promotores de crescimento na produção animal foi proibido nos últimos anos. Em função disso, nos demais países produtores de aves no mundo (incluindo os EUA e o Brasil) vêm ocorrendo discussões sobre a necessidade de se regulamentar ou, até mesmo, proibir a utilização destes compostos na produção animal. Porém, isto implica em prejuízos para a produção animal, pois estudos realizados indicam que a simples retirada dos antimicrobianos promotores de crescimento da dieta das aves levaria a uma redução média no desempenho de
26 24 3% a 7%, além do impacto negativo sobre a saúde animal e aumento da mortalidade (SANTANA et al., 2011). A proibição da utilização destas substâncias na Europa tem restringido a importação dos produtos originados destes animais. Como este bloco comercial tem grande influência na formação de opinião, pode influenciar importantes importadores como a Ásia e Oriente Médio. O que o Brasil tem feito é buscar se adaptar às exigências internacionais de exportação e atender às legislações vigentes (SANTANA et al., 2011). Dentre os muitos antimicrobianos utilizados na avicultura industrial, destaca-se a Gentamicina e Ceftiofur, utilizados na injeção in ovo no momento da transferência dos ovos das incubadoras para os nascedouros, como forma preventiva de contaminação do pintinho no momento do alojamento. Além disso, destaca-se o uso da Enrofloxacina no tratamento das aves positivas para salmoneloses paratíficas, conforme especificado na Instrução Normativa 78 do MAPA (BRASIL, 2003). Em função disso, esses antimicrobianos foram os escolhidos, pois são rotineiramente utilizados na avicultura industrial Resistência Bacteriana aos Antimicrobianos A resistência microbiana pode ser conceituada como a habilidade de um microrganismo continuar a multiplicar-se ou persistir na presença de níveis terapêuticos de determinado agente antimicrobiano (TORTORA et al., 2012). As bactérias podem apresentar resistência microbiana em função de três mecanismos principais: inativação enzimática da molécula do antimicrobiano, alteração do alvo celular deste agente e redução do nível intracelular do antimicrobiano (ALEKSHUN; LEVY, 2007). Na inativação enzimática ocorre ação das enzimas bacterianas sobre o princípio ativo do antimicrobiano, como ocorre em Staphylococcus aureus produtores de enzimas β- lactamases que hidrolisam o anel β-lactâmico. O segundo mecanismo consiste em alterar a estrutura da molécula-alvo do antimicrobiano. Exemplo é o que ocorre com os Enterococos sp. resistentes à vancomicina que substituem o resíduo de alanina por lactato, reduzindo a afinidade da vancomicina pelo seu alvo bacteriano. Também pode ocorrer a resistência quando as bactérias possuem mecanismos para reduzir a concentração intracelular do antimicrobiano, com bombas de efluxo. Este mecanismo é utilizado por Staphylococcus sp. resistentes a antibióticos macrolídios, como a eritromicina (WALSH, 2000; BYARUGABA, 2009).
27 25 A resistência aos antimicrobianos pode ser de dois tipos: intrínseca ou adquirida. A resistência intrínseca é baseada em genes presentes no cromossomo, que tipicamente não são transferíveis e incluem resistência às penicilinas semi-sintéticas, cefalosporinas, baixo nível de resistência aos aminoglicosídeos e baixo nível de resistência à clindamicina, lincomicina, fluorquinolonas e trimetoprim-sulfametoxazol. A resistência adquirida normalmente resulta de uma mutação no DNA ou pela aquisição de um novo gene. Esta aquisição pode ocorrer por transformação, transdução, conjugação ou transposição (ALTERTHUM, 2005; TORTORA et al., 2012). Ainda de acordo com esses autores, a resistência a antimicrobianos geralmente decorre da aquisição de genes de virulência carreados por plasmídeos ou transposons, trocados entre linhagens da mesma espécie ou entre diferentes espécies. Na transformação ocorre a transferência genética na qual um DNA puro passa de uma célula para outra, alterando o genótipo da bactéria receptora. Já na transdução o DNA de um plasmídeo é incorporado por um bacteriófago e então transferido para outra bactéria. A conjugação se caracteriza por um processo comum de transferência genética. Uma bactéria doadora sintetiza uma fímbria sexual, que se liga a uma bactéria receptora em um processo de acasalamento e transfere cópias de genes plasmidiais para as células bacterianas receptoras. Por fim, na transposição sequências curtas de DNA, conhecidas como transposons, podem transpor de um plasmídeo para um cromossomo e vice-versa (QUINN et al., 2005; VAZ, 2009; TORTORA et al., 2012). A resistência a um agente antibacteriano frequentemente resulta em resistência cruzada com outros agentes da mesma classe. Este tipo de resistência pode ser transferido rapidamente entre diferentes gêneros e espécies de bactérias, sendo comum entre os membros da família Enterobacteriaceae (QUINN et al.,2005). A presença de bactérias multirresistentes se deve a presença de genes de resistência, para diferentes antimicrobianos, em um só plasmídeo ou ainda amostras com resistência múltipla diante da presença de dois ou mais plasmídeos diferentes em uma mesma bactéria (ALTERTHUM, 2005). O aparecimento de cepas bacterianas multirresistentes tem sido relatado por diversos autores, e isso ocorre não só na avicultura, mas em todos os segmentos agropecuários, além é claro da resistência humana aos antimicrobianos (POPPE, 1999; SCHWARZ et al., 2001; THRELFALL, 2002; PEIRANO et al., 2006; RIBEIRO et al., 2011). A seleção de bactérias resistentes pode ocorrer através do uso inadequado de antimicrobianos não só em animais, mas também em humanos (SCHWARZ et al., 2001). A pressão seletiva na produção animal, através da profilaxia, promoção de crescimento e
28 26 tratamentos, pode ser um fator de estímulo da seleção de linhagens resistentes (MOLBAK, 2002). De acordo com Quinn (2005), a resistência antibacteriana está amplamente difundida e medidas de controle em determinado país podem ser ineficazes, devido à importação de bactérias resistentes nos alimentos ou presentes na microbiota normal de animais ou humanos de países com controle menos rigoroso. Por isso, para evitar o aparecimento de cepas bacterianas resistentes aos antimicrobianos é necessária a realização de análise de sensibilidade e dessa forma prescrever o medicamento aos quais as cepas apresentam maior sensibilidade Resistência Bacteriana as Fluorquinolonas São antimicrobianos de amplo espectro e são efetivos no tratamento de uma grande variedade de infecções em humanos e animais. Em muitos locais do mundo são os antimicrobianos de eleição para o tratamento de gastroenterites em humanos (HOPKINS et al., 2005). O mecanismo de ação das fluorquinolonas consiste na ligação específica do agente antimicrobiano ao complexo DNA-enzima, bloqueando sua atividade após a clivagem dos filamentos e antes do religação do DNA. Consequentemente, forma-se uma barreira física que impedirá a duplicação do material genético, necessário para a multiplicação bacteriana (HOOPER, 2001). Em Salmonella sp. são encontradas quatro topoisomerases, enzimas que agem tornando a replicação do DNA mais eficiente (HOPKINS et al., 2005). São classificadas em dois grupos de acordo com seu mecanismo de ação. As do Tipo I, representadas pelas topoisomerases I e III, e as do Tipo II, representada pela topoisomerases II, também denominada DNA-girase, e IV. A DNA- girase é composta por duas subunidades A (GyrA) e duas B (GyrB), codificadas pelos genes GyrA e GyrB, respectivamente. A topoisomerase IV, consiste em duas subunidades C (ParC) e duas E (ParE), codificadas pelos genes ParC e ParE, respectivamente. O alvo primário da ação de quinolonas em Gram-negativos é a DNA-girase, enquanto a topoisomerase IV é o alvo secundário (HOOPER, 2001). Diversos estudos demonstraram que a resistência às quinolonas surgiu devido a mutações cromossômicas nos genes que codificam as enzimas DNA-girase e topoisomerase
29 27 IV, que são os alvos da ação destes antimicrobianos (HAKANEN et al., 2005; HOPKINS et al., 2005; GIRAUD et al.,1999). Além das mutações nos genes que codificam a enzima DNA-girase, podem ocorrer redução do acúmulo do antimicrobiano no interior da célula bacteriana devido à hiperexpressão das bombas de efluxo e ou alterações nas porinas presentes na membrana externa, que reduzem a permeabilidade (SOTO et al., 2003; SAN-MARTÍN et al., 2005). Em Salmonella sp. a resistência às quinolonas se deve principalmente à alterações no sítio de ligação do antimicrobiano com a DNA-girase, devido à mutações em uma região específica do gene GyrA, entre os aminoácidos 67 e 106, denominada Região Determinante de Resistência à Quinolona (QRDR) (SOTO et al., 2003; SAN MARTÍN et al., 2005; GIRAUD et al., 1999). Os genes qnr codificam pentapeptideos repetidos que protegem a enzima DNA-girase da ação dos antibióticos, ligando-se ao sítio ativo da enzima em vez do DNA. Essa ligação entre proteínas do tipo Qnr e a enzima DNA-girase ocorre independentemente do complexo enzima-dna, DNA livre ou concentração de quinolonas (ROBICSEK et al., 2006). Elementos móveis que carreiam o gene qnr também têm sido descritos como responsáveis por conferir resistência às quinolonas, sendo que estes apresentam um agravante, o fato de terem o potencial de transferir de forma horizontal os genes de resistência (RUIZ, 2003). Mutações no gene ParC das topoisomerases IV ocorrem menos frequentemente e as mutações nos genes GyrB e ParE tem sido consideradas raras em Salmonellas (GIRAUD et al., 1999; EAVES et al., 2004; HOPKINS et al., 2005 ) Resistência Bacteriana aos Aminoglicosídeos Esse grupo de antimicrobianos tem espectro de ação relativamente curto, com atividade predominante sobre microrganismos Gram-negativos (WEBSTER, 2005; SPINOSA, 2006). Os aminoglicosídeos interferem na síntese protéica bacteriana, promovendo a formação de proteínas defeituosas. Ligam-se a subunidade 30S do ribossomo, provocando a leitura incorreta do código genético e, consequentemente permitindo a incorporação de aminoácidos incorretos na cadeia polipeptídica que está sendo formada no ribossomo (WEBSTER, 2005; SPINOSA, 2006).
30 28 A resistência bacteriana é relativamente comum entre os aminoglicosídeos (SPINOSA, 2006). Essa resistência pode ser intrínseca, devido à falta de receptores específicos na subunidade 30S, ou extrínseca que é conferida por plasmídeos que podem codificar um número de enzimas que promovem modificações na molécula do aminoglicosídeo impedindo sua entrada na célula (QUINN, 2005; WEBSTER, 2005; SPINOSA, 2006). A Gentamicina tem o maior espectro de ação entre os aminoglicosídeos, no entanto as bactérias adquirem rapidamente resistência plasmídeo-mediada a esse princípio na presença de pressão seletiva (WEBSTER, 2005). No entanto, nos últimos anos, um novo grupo de elementos genéticos que podem conter um ou mais genes de resistência inseridos por meio de um sistema de recombinação sítio-específica foram identificadas em bactérias Gram-negativas. Estes elementos são denominados integrons, pelo menos nove classes de integrons têm sido descritos entre isolados clínicos de bactérias, sendo a classe 1 a mais prevalente e responsável pela emergência da resistência, nessa classe se encontram os genes de resistência AadA e AadB (FONSECA;VICENTE, 2010; RIBEIRO et al., 2011). Os integrons são caracterizados pela capacidade de inserir, excisar e rearranjar cassetes gênicos através da recombinação sítioespecífica mediada por uma integrase (FONSECA;VICENTE, 2010). Os integrons são considerados sistema de expressão devido à presença de um promotor que controla a transcrição dos cassetes capturados. Os cassetes seriam estruturas desprovidas de região promotora, portanto a transcrição só ocorreria na presença de um promotor (FONSECA;VICENTE, 2010). Estudos realizados por Peirano et al.(2006) avaliando a sensibilidade de isolados de Salmonella sp. frente a aminoglicosídeos, demonstraram através da PCR que o gene AadA estava localizado nos integrons, o que não aconteceu com os demais genes pesquisados para outros antimicrobianos, os quais estavam localizados em plasmídeos. No Brasil integrons de classe 1 carreando genes de resistência tem sido relatados em diversos sorotipos de Salmonella sp., demonstrando a disseminação dessa estrutura gênica em sorovares não reportados anteriormente (RIBEIRO et al., 2011). A resistência aos aminoglicosídeos, especialmente a Gentamicina, pode ser atribuída principalmente à presença dos genes AadA (SILVA, 2011) Resistência Bacteriana as Cefalosporinas
31 29 As cefalosporinas fazem parte do grupo dos antibióticos β-lactâmicos. Atuam inibindo a síntese da parede bacteriana através da inibição da transpeptidase, proteína ligante da penicilina que catalisa a formação de polímeros peptidoglicanos da parede celular bacteriana (QUINN, 2005; WEBSTER, 2005). De acordo com a cronologia de descoberta, espectro de ação e estrutura química, as cefalosporinas são divididas em quatro gerações (WEBSTER, 2005). As de primeira geração são ativas principalmente contra bactérias Gram-positivas e algumas Gram-negativas, já as de segunda geração são mais resistentes à ação das β-lactmases produzidas pelas Gramnegativas. As cefalosporinas de terceira geração são ainda mais resistentes as β-lactmases das bactérias Gram-negativas. Finalmente as cefalosporinas de quarta geração, apresentam o mesmo espectro de ação das anteriores, além de agir sobre alguns cocos Gram-positivos e bactérias anaeróbias. As de primeira e segunda gerações são mais estáveis frente a produção das β-lactmases (QUINN, 2005; WEBSTER, 2005; ALTERTHUM, 2005). O Ceftiofur cefalosporina de terceira geração, é a única aprovada para animais de produção (WEBSTER, 2005). O desenvolvimento da resistência aos β-lactâmicos está associada à produção de enzimas bacterianas denominadas β-lactamases, as quais clivam o anel β-lactâmico tornando o antimicrobiano ineficaz (QUINN, 2005; WEBSTER, 2005). Essas enzimas podem ser mediadas por plasmídeos, ou codificadas por cromossomos, como ocorre em várias bactérias Gram-negativas (QUINN, 2005). Outro grupo de enzimas com sítio ativo de serina e capazes de hidrolisar cefalosporinas são as β-lactamases do tipo AmpC, as quais são resistentes aos inibidores clavulanato, sulbactam e tazobactam e, portanto, não são classificadas como ESBL (βlactamases de espectro estendido). Essas enzimas podem ser cromossomais ou plasmidiais (JACOBY, 2009). Organismos que superexpressam as β-lactamases do tipo AmpC são uma grande preocupação clínica, pois são geralmente resistentes a todos os antimicrobianos β-lactâmicos. A superexpressão ocorre tanto por desregulação do gene cromossômico AmpC ou por aquisição desse gene através de plasmídeo, sendo então chamados de β-lactamases AmpC plasmídeo-mediadas (PÉREZ-PÉREZ; HANSON, 2002). O gene BlaCMY tem relação muito próxima ao gene cromossomal AmpC encontrado em Citrobacter freundii, e também tem sido encontrado em plasmídeos carreados por diferentes sorotipos de Salmonella sp. e outras bactérias gastrointestinais (ALCAINE et al., 2005).
32 30 A resistência das cepas de Salmonella sp. ao Ceftiofur tem sido predominantemente associadas ao gene BlaCMY-2 codificado por plasmídeos. Dados de estudos realizado por Frye e Cray (2007) sugerem que a aquisição de plasmídeos de resistência e a disseminação dos sorotipos específicos que abrigam estes plasmídeos estão impulsionando a resistência observada para Ceftiofur em isolados de Salmonella sp. de origem animal. Além dos genes BlaCMY e AmpC, outros genes variantes incluindo BlaTEM, BlaSHV, BlaCTX-M também tem sido relacionados como responsáveis pelo aparecimento de resistência as cefalosporinas de terceira geração (DONALDSON et al., 2006; FRYE; CRAY, 2007).
33 31 3 ARTIGO Perfil fenotípico e genotípico de isolados de Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium de Origem Avícola frente aos Antimicrobianos Ceftiofur, Gentamicina e Enrofloxacina
34 INTRODUÇÃO A salmonelose é considerada uma causa comum de doença transmitida por alimentos em humanos, representando um significativo problema de saúde pública em muitos países. Estudos mostram que os produtos de origem avícola têm sido reconhecidos como grandes transmissores desta bactéria, assumindo assim um papel importante nesta doença (CARRASCO et al., 2012). Devido ao aumento na incidência de toxinfecções por Salmonella sp., e os relatos cada vez mais frequentes de cepas multirresistentes a antimicrobianos, torna-se necessária a investigação dos mecanismos de resistência utilizados por este microrganismo. Segundo Guerra (2000) a disseminação de genes que conferem resistência aos microrganismos deriva em função da utilização indiscriminada de antibióticos na medicina veterinária. O mesmo autor verificou em seu estudo que 31% das cepas analisadas eram resistentes a todos os antimicrobianos avaliados, sendo que a espécie com maior resistência foi a S. Typhimurium (96% dos antibióticos testados). Os objetivos deste trabalho foram fazer a avaliação fenotípica de isolados de Salmonella Enteritidis e Salmonella Typhimurium através das técnicas de antibiograma e concentração inibitória mínima sendo que os antimicrobianos testados foram a Gentamicina, Enrofloxacina e Ceftiofur, os quais são rotineiramente utilizados na avicultura industrial. Além disso, realizar a identificação dos genes relacionados à resistência a estes antimicrobianos através da Reação da Polimerase em Cadeia (PCR). 3.2 MATERIAL E MÉTODOS Isolamento Foram utilizados 104 amostras de isolados de Salmonella sp. Esses materiais eram provenientes de um laboratório privado no estado do Paraná, o qual é credenciado pelo MAPA para a realização de monitorias oficiais para atender ao PNSA. Para a pesquisa e isolamento, materiais de diversas origens avícolas foram utilizados, tais como suabes de cloaca, de arrasto e das instalações, forro de caixas de transporte de pintinhos, ovos bicados, mecônio, fezes frescas, órgãos, farinhas e rações.
35 33 A metodologia utilizada para a pesquisa e isolamento da bactéria foi realizada de acordo com a Instrução Normativa 62 (BRASIL, 2003). Após a etapa de isolamento, as cepas positivas para Salmonella sp. foram encaminhadas em ágar nutriente e refrigeradas para o Laboratório de Microbiologia da UDESC em Lages (CEDIMA). As cepas foram repicadas em ágar TSA e enviadas para a sorotipificação no laboratório FIOCRUZ. Uma alíquota dessas amostras foi congelada em BHI e glicerol para posteriormente ser utilizada para a realização dos testes de antibiograma, MIC (Concentração Inibitória Mínima) e PCR (Reação da Polimerase em Cadeia) Antibiograma A técnica para a realização do antibiograma se baseou em testes de disco-difusão com a presença ou ausência de um halo de inibição. A metodologia que foi utilizada é aprovada pelo NCCLS (National Committee for Clinical Laboratory Standarts) e pela ANVISA (Agência Nacional de Vigilância Sanitária), onde consta a instrução normativa M-2 A-8 de Padronização dos Testes de Sensibilidade aos Antimicrobianos por disco-difusão (BRASIL, 2003). Os antimicrobianos utilizados para verificar a sensibilidade das cepas de S. Enteritidis e S. Typhimurium são uns dos mais utilizados na avicultura industrial: Enrofloxacina (5 µg), Gentamicina (10 µg) e Ceftiofur (30 µg). As placas foram analisadas quanto à presença de um halo confluente. Com o auxílio de uma régua os halos foram medidos e analisados de acordo com dados de uma tabela específica (Apêndice A). Esses valores mostraram se os microrganismos foram sensíveis ou resistentes aos antimicrobianos Concentração Inibitória Mínima (MIC) Para a realização do MIC foram seguidos os mesmos padrões estabelecidos pela Instrução Normativa M-2 A-8 (BRASIL, 2003) e o inóculo utilizado para a avaliação da resistência também foi o mesmo utilizado na realização do antibiograma. Os antimicrobianos testados, assim como suas concentrações, dosagens recomendadas de acordo com o fabricante e diluições testadas estão descritos na Tabela 1.
36 34 Tabela 1- Soluções de antimicrobianos. Nome Forma física Dose recomendada (mg/kg) Enrofloxacina Líquido 10 mg/kg PV Gentamicina Líquido 5 mg/kg PV Ceftiofur Líquido 5 mg/kg PV Fonte: o autor Concentração 1 ml contém 100 mg de Enrofloxacina 1mL contém 40 mg de Gentamicina 1 ml contém 48,75 mg de Ceftiofur Concentrações para teste (mg/ml) ,5 1,25 0, ,5 1,25 0,625 0, ,5 1,25 0,625 0,3125
37 Reação da Polimerase em Cadeia (PCR) Após a realização do antibiograma e do MIC as amostras foram encaminhadas para a pesquisa dos genes de resistência através da PCR. Nesta reação é possível amplificar exponencialmente o DNA criando múltiplas cópias in vitro Extração do DNA A extração do DNA foi realizada através da técnica de fervura-centrifugação, conforme já descrito por Borsoi et al., (2009). As amostras de DNA foram então armazenadas em freezer a -20 ºC até sua utilização Pesquisa dos genes de resistência Através da técnica de PCR foram pesquisados os oito genes relacionados à resistência para os antimicrobianos Enrofloxacina (GyrA, GyrB, ParC e ParE), Gentamicina (AadA e AadB) e Ceftiofur (BlaCMY-2 e AmpC). A pesquisa destes genes foi feita para as onze amostras de S. Typhimurium e para duas amostras de S. Enteritidis. Os protocolos para preparo dos reagentes e para amplificação dos fragmentos foram adaptados a partir de estudos anteriores (Tabela 2) e estão descritos no apêndice B Sequenciamento Após a observação em luz ultravioleta das amplificações das bandas, dois genes (GyrA e AadA) foram utilizados para a realização do sequenciamento. As bandas desses genes foram excisadas do gel com o auxílio de um bisturi estéril e posteriormente o DNA contido na banda foi purificado com o auxílio do kit Qiaquick Gel Extraction (Qiagen ). Com a extração do DNA da banda, o mesmo foi inserido no plasmídeo para dessa forma poder ser sequenciado. Para a realização da transformação foram utilizadas cepas de Escherichia coli transformadas em cálcio-competentes e a metodologia seguida foi a descrita por Tavares (2011). Os materiais após terem passado pela transformação e extraído seu DNA plasmidial, foram enviados para o Laboratório de Protozoologia da UFSC onde foram sequenciados.
38 36 Tabela 2 - Genes de resistência para cada antimicrobiano testado, primers específicos, tamanho dos pares de bases e trabalhos de referência para protocolos de amplificação. Genes resistência GyrA GyrB ParC ParE AadA AadB BlaCMY-2 AmpC Fonte: o autor Primers 5 -CGTTGGTGACGTAATCGG-3 (F) 5 -CCGTACCGTCATAGTTAT-3 (R) 5 -GCGCTGTCCGAACTGTACCT-3 (F) 5 -CGGTGATCAGCGTCGCCACTTCC-3 (R) 5 -CTATGCGATGTCAGAGCTGG-3 (F) 5 -TAACAGCAGCTCGGCGTATT-3 (R) 5 -TCTCTTCCGATGAAGTGCTG-3 (F) 5 -ATACGGTATAGCGGCGGTAG-3 (R) 5 - GTGGATGGCGGCCTGAAGCC-3 (F) 5 - ATTGCCCAGTCGGCAGCG-3 (R) 5 - TCCAGAACCTTGACCGAAC-3 (F) 5 - GCAAGACCTCAACCTTTTCC-3 (R) 5 -TGGCC GAACTGACAGGCAAA-3 (F) 5 -TTTCTCCTGAACGTGGCTGGC-3 (R) 5 -AACACACTGATTGCGTCTGAC-3 (F) 5 -CTGGGCCTCATCGTCAGTTA-3 (R) Tamanho (pb) Referência 251 Randall et al.(2005) 181 Eaves et al.(2004) 260 Randall et al.(2005) 237 Randall et al.(2005) 526 Ribeiro et al.(2011) 700 Ribeiro et al.(2011) 354 Alcaine et al.(2005) 1226 Alcaine et al.(2005) Pérez-Pérez;Hanson (2002) Análise Estatística O teste estatístico para avaliação dos antimicrobianos testados foi o teste exato de Fisher, com nível de significância de 0,05, em função do número de amostras ser menor do que 20. (SIEGEL, 1975 apud ANDRADE; OGLIARI, 2007). Para avaliação das metodologias utilizadas, MIC e antibiograma foram avaliadas a sensibilidade e especificidade dos testes (GIOLO, 2012). 3.3 RESULTADOS Sorotipificação A avaliação inicial das 104 amostras identificadas como Salmonella sp., permitiu através da sorotipificação, a identificação dos sorotipos descritos na Tabela 3.
39 37 Após a realização da sorotipificação as amostras identificadas como S. Enteritidis (2/104) e S. Typhimurium (11/104) foram submetidas às avaliações de susceptibilidade frente aos antimicrobianos, através das técnicas de Antibiograma por Disco-Difusão e Concentração Inibitória Mínima (MIC). Tabela 3 Sorotipos de Salmonella sp. identificados através da técnica de sorotipificação realizada pelo laboratório FIOCRUZ. Sorotipo Amostras Sorotipo Amostras S. Heidelberg 1/104 S. Tennessee 2/104 S. Kentucky 1/104 S. Corvallis 3/104 S. Muenster 1/104 S. Livingstone 3/104 S. Ohio 1/104 S. Newport 3/104 S. Oranienburg 1/104 S. Minnesota 4/104 S. Orion 1/104 S. Seftenberg 4/104 S. Rissen 1/104 S. Mbandaka 6/104 S. Bredeney 1/104 S. Agona 6/104 S. Anatum 2/104 S. Saintpaul 6/104 S. Enteritidis 2/104 S. Infantis 7/104 S. Give 2/104 S. Enterica subspécie enterica 9/104 S. Havana 2/104 S. Schwarzengrund 9/104 S. Montevideo 2/104 S. Typhimurium 11/104 S. Panama 2/104 Contaminadas 11/104 Fonte: FIOCRUZ, Antibiograma O antibiograma para os dois sorotipos de Salmonella sp. mostrou diferentes perfis de susceptibilidade (Tabela 4). Tabela 4 Perfis de susceptibilidade no antibiograma dos isolados de S. Enteritidis e S. Typhimurium aos antimicrobianos Ceftiofur, Gentamicina e Enrofloxacina. S.Typhimurium S. Enteritidis Total S (%) R (%) S (%) R (%) S (%) R (%) Ceftiofur 9 (81,8) 2 (18,1) 1 (50) 1 (50) 10 (76,9) 3 (23,0) Gentamicina 6 (54,5) 5 (45,4) 2 (100) 0 8 (61,5) 5 (38,4) Enrofloxacina 9 (81,8) 2 (18,1) 2 (100) 0 11 (84,6) 2 (15,3) Legenda: S Sensível; R Resistente Fonte: o autor
40 Concentração Inibitória Mínima (MIC) Com relação a avaliação da susceptibilidade através do MIC, os perfis de resistência estão demonstrados na Tabela 5, resultados esses muito semelhantes aos observados no antibiograma. Tabela 5 Perfis de susceptibilidade no MIC dos isolados de S. Enteritidis e S. Typhimurium aos antimicrobianos Ceftiofur, Gentamicina e Enrofloxacina. S.Typhimurium S. Enteritidis Total S (%) R (%) S (%) R (%) S (%) R (%) Ceftiofur 8 (72,7) 3 (27,2) 1 (50) 1 (50) 9 (69,2) 4 (30,7) Gentamicina 5 (45,4) 6 (54,5) 0 2 (100) 5 (38,4) 8 (61,5) Enrofloxacina 9 (81,8) 2 (18,1) 1 (50) 1 (50) 10 (76,9) 3 (23,0) Legenda: S Sensível; R Resistente Fonte: o autor Comparativo Antibiograma e MIC As duas metodologias de análise fenotípica foram comparadas frente aos isolados e aos antimicrobianos testados, com exceção à Gentamicina que apresentou perfil de resistência de 61,5% no MIC e 38,4% no antibiograma, os demais antimicrobianos apresentaram resultados muito semelhantes nas duas metodologias PCR Os resultados genotípicos obtidos nos isolados de S. Typhimurium e S. Enteritidis estão demonstrados na Tabela 6, sendo que os géis demonstrando a presença dos genes está no apêndice C Análise Estatística No teste exato de Fisher podem-se observar para os antimicrobianos Enrofloxacina e Ceftiofur resultados diferentes aos observados para a Gentamicina.
41 39 Tabela 6 - Presença dos genes de resistência aos antimicrobianos Enrofloxacina, Gentamicina e Ceftiofur para os isolados de S. Typhimurium e S. Enteritidis. Origem Amostra Sorotipos MIC ATB Gene ParC ENROFLOXACINA GENTAMICINA CEFTIOFUR Gene Gene Gene MIC ATB Gene Gene MIC ATB Gene ParE GyrA GyrB AadA AadB AmpC RM/SC 3927 S.Typhimurium S S P P P P S S N N S S P N SA/PR 4950 S.Typhimurium S S P P P P R R N P R R P N SA/PR S.Typhimurium S S P P P P R R N N S S N N SA/PR S.Typhimurium S S P N P P R R P N S S N N SA/PR S.Typhimurium S S P P P P R R P N S S N P Gene BlaCMY SA/PR S.Typhimurium S S P P P P S S N N S S N P SA/PR S.Typhimurium S S N P P P S S N N S S P N SA/PR S.Typhimurium S S P P P P R R P N R R P N RM/PR S. Enteritidis S S P P P P R S N N S S P N SC/PR S.Typhimurium R R P P P P S S N N R S P P RI/PR S. Enteritidis R S P P P P R S P N R R P N SA/SC S.Typhimurium S S P P N P R S N N S S P N SA/PR S.Typhimurium R R P P P P S S N N S S N N Legenda: RM Ração matriz; SA- Suabe de arrasto; SC Suabe de cloaca; RI Resíduo de incubação; SC Santa Catarina; PR Paraná; S Amostras sensíveis; R Amostras resistentes; P Presença do gene; N Ausência do gene. Fonte: o autor
42 40 Os resultados de p-valor para Enrofloxacina foram de 1, para o MIC e Antibiograma. Já o Ceftiofur teve p-valor de 0,2937 para o MIC e p-valor 0,4196 no Antibiograma. Os p- valores obtidos foram maiores do que o valor de significância α que era de 0,05, mostrando que a presença ou ausência do gene de resistência não interfere na resposta fenotípica para o MIC e Antibiograma. Isso significa que os desvios não são significativos e as variáveis são independentes, se há associação entre as variáveis isso é devido ao acaso. Para Gentamicina os p-valores observados foram de 0,043 para o MIC e de 0,031 para o Antibiograma. Valores esses menores que a significância α de 0,05, demonstrando que os desvios são significativos, e as variáveis são dependentes entre si. A análise estatística completa para o teste exato de Fisher está no apêndice D. Já com relação à análise de sensibilidade e especificidade dos testes, os resultados estão demonstrados na Tabela 7. Pôde-se observar que os resultados obtidos com o antimicrobiano Gentamicina estão próximos ao esperado, pois estes testes devem ser altamente sensíveis e específicos. O que não se observa na Enrofloxacina e Ceftiofur. Tabela 7 - Análise de sensibilidade e especificidade das metodologias MIC e Antibiograma para os antimicrobianos Ceftiofur, Gentamicina e Enrofloxacina. MIC Antibiograma Sensibilidade Especificidade Sensibilidade Especificidade Ceftiofur 0,4 1 0,3 1 Gentamicina 1 0,62 0,8 0,87 Enrofloxacina 0,23 0 0,15 0 Fonte: o autor Sequenciamento A confirmação da identidade dos fragmentos foi realizada através do programa de bioinformática BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), as sequencias obtidas tiveram 99% de identidade para o gene GyrA da Enrofloxacina e 98% para o gene AadA da Gentamicina conforme está demonstrado no apêndice E. Os resultados obtidos demonstram a fidelidade da transcrição e a especificidade dos oligonucleotídeos utilizados como iniciadores (primers).
43 DISCUSSÃO As bactérias de origem animal podem atingir a população humana e outros animais de várias formas: contaminação de fontes hídricas, contaminações no abate, efluentes de granjas e outros. Isto se torna particularmente importante com bactérias entéricas (VAZ, 2009). As Salmonellas sp. podem ser isoladas dos mais diferentes locais, como carcaças, ambiente, suabes de arrasto, alimentos, entre muitos outros (RIBEIRO et al., 2008). O surgimento da resistência antimicrobiana nas bactérias zoonóticas tem importante implicação na saúde pública. Dados de diversos pesquisadores sugerem que a seleção inadequada e o abuso no uso dos antimicrobianos pode levar a resistência a várias bactérias, que podem atingir o consumidor através de produtos de origem animal (RIBEIRO et al., 2011). Estudos realizados por Johnson et al. (2007) em Minnesota e Wisconsin, demonstraram através de análise filogenética em isolados de E. coli oriundos de humanos e aves, que os isolados humanos resistentes aos antimicrobianos testados, provavelmente tiveram origem aviária, ou de reservatórios semelhantes que não humanos. Dessa forma, o monitoramento da resistência fenotípica e genotípica aos antibióticos em espécies de Salmonella sp. isoladas de animais produtores de alimentos é importante para a proteção da saúde humana e animal (SAN MARTIN, et al., 2005; RIBEIRO et al., 2011). As cefalosporinas de terceira geração, além de serem utilizadas para o tratamento de infecções por Salmonella sp. em animais, também são utilizadas para o tratamento dessas principalmente em crianças (FRYE; CRAY, 2007). Esses mesmos autores relatam a crescente preocupação global em função do aparecimento de cepas multirresistentes. Frye e Cray (2007) avaliaram isolados de Salmonella sp. por um período de cinco anos, observaram que a resistência ao Ceftiofur passou de 4% em 1999 para 18% em No entanto o Ceftriaxone, uma cefalosporina de terceira geração para o tratamento de humanos, manteve-se em 0,3% de resistência. Os isolados de S. Typhimurium foram responsáveis por 23,5% das resistências observadas, valores esses muito próximos aos encontrados neste estudo, onde observamos 27,2% de resistência no MIC e 18,1% no antibiograma. Já os isolados de S. Enteritidis tiveram apenas 2,1% de resistência, muito diferente do que encontramos, 50% de resistência (Tabela 4 e Tabela 5). O elemento genético responsável pela maior parte da resistência ao Ceftiofur em Salmonellas sp. isoladas a partir de animais nos EUA parece ser o gene BlaCMY, pois de acordo com Frye e Cray (2007), eles conseguiram isolar esse gene dos plasmídeos das cepas de Salmonella sp. resistentes, inferindo dessa forma que o aumento da resistência está
44 42 relacionado a passagem do gene através do plasmídeo entre os diferentes sorotipos de Salmonella sp. Essa mesma constatação foi relatada por Alcaine et al. (2005), onde os dezenove isolados resistentes ao Ceftiofur carreavam o gene BlaCMY. No entanto, dos isolados estudados por Frye e Cray (2007), 17% dos resistentes não tiveram o gene BlaCMY ou algum dos outros genes β-lactamases resistentes detectado através do PCR, levantando uma preocupação de que outros mecanismos não detectados estão associados a resistência ao Ceftiofur. Os resultados obtidos neste estudo, no entanto, mostraram que todas as amostras resistentes, tanto no MIC como no antibiograma, apresentaram pelo menos um dos genes de resistência (Tabela 6). Rodríguez et al. (2009) demonstrou que nos isolados alemães de Salmonella, a presença de resistência aos β-lactâmicos ainda foi reduzida, apenas 26 amostras apresentaram resistência, sendo que destas apenas 6 amostras tinham o gene BlaCMY, as demais apresentaram outros dos genes que podem ser responsáveis pela resistência a antimicrobianos. Resultados semelhantes foram encontrados por Allen e Poppe (2002) no Canadá, de 8426 isolados apenas 8 (0,1%) apresentaram produção de β-lactamases resistentes, sendo que todos os isolados apresentaram resistência ao Ceftiofur e tiveram a presença do gene BlaCMY detectada em seu plasmídeo. No entanto estudos realizados por Peirano et al. (2006) no Brasil, mostram que o número de isolados de Salmonella sp. resistentes ao Ceftiofur foi de 16,3%, sendo que destes apenas 13,6% apresentavam o gene BlaCMY, os demais tinham outros genes que podem ser responsáveis pela resistência. Com relação aos isolados de S. Typhimurium nenhum apresentou resistência ao Ceftiofur. Resultados esses semelhantes aos encontrados por Borsoi (2005), porém com isolados de S. Enteritidis, onde 100% dos isolados foram sensíveis ao Cetiofur. De acordo com Winokur et al.(2000) a identificação de dois isolados de Salmonella sp.resistentes a cefalosporinas, carreavam o gene BlaCMY no plasmídeo. Desses isolados um era de humano e outro de bovino e através de avaliação epidemiológica e PFGE, observaram padrões semelhantes sugerindo que a resistência da Salmonella foi transmitida a partir de alimentos de origem animal para humanos. Essa preocupação também é relatada por Allen e Poppe (2002) que através de seus estudos sugerem que reservatórios microbianos contendo o gene BlaCMY podem ser selecionados e mantidos através da utilização de Ceftiofur. No entanto, não foi possível
45 43 determinar se a utilização de Ceftiofur ou pressões de seleção foram os responsáveis para o aparecimento da resistência nos estudos realizados por eles. Rodríguez et al. (2009) levantam a mesma preocupação, dos isolados encontrados que carreavam o gene BlaCMY, o mesmo estava localizado nos plasmídeos, sugerindo o aparecimento de novas cepas resistentes, haja visto que este foi encontrado tanto em isolados de animais saudáveis como doentes, além de casos clínicos de humanos. Com relação aos isolados sensíveis mas que apresentam o gene, Alberts et al. (2007) comentam que só porque uma bactéria tem o gene de resistência a um antibiótico, não significa que o gene irá se expressar. Além da preocupação com a emergência da resistência às cefalosporinas, outro ponto importante é a resistência aos aminoglicosídeos, especialmente à Gentamicina. Ribeiro et al. (2008) comparando amostras de S. Enteritidis isoladas de aves ou de ambiente, entre os anos de 1999 e 2001, observaram um aumento de 15,6% para 42,1% de resistência à Gentamicina na região sul do Brasil. Resultados que diferem dos encontrados neste estudo, onde não foi detectado resistência no antibiograma, mas foi observado 100% de resistência no MIC (Tabela 4 e Tabela 5). Cardoso et al. (2006) também não detectaram resistência de cepas de S. Enteritidis isoladas de carcaça de frangos à Gentamicina, assim como Borsoi (2005) também não detectou presença de resistência em isolados de Salmonella sp. Porém, Silva e Duarte (2002) demonstraram que os isolados de S. Enteritidis apresentaram resistência de 63,5% a pelo menos um ou dois antimicrobianos, sendo a resistência à Gentamicina de 2,1%. Valores muito semelhantes aos encontrados por Vaz (2007) onde os isolados provenientes de órgãos de aves apresentaram 5,2% de resistência. As diferenças entre os resultados nos mais diversos estudos, podem ser explicadas devido a vários fatores, como diferenças de origem, período de tempo de coleta e procedimentos de amostragem (CARDOSO et al., 2006). Com relação às cepas de S. Typhimurium, Medeiros (2006) encontrou em isolados principalmente de alimentos e animais, 12,4% de resistência à Gentamicina, resultados esses que diferem dos encontrados neste estudo onde foi verificado 45,4% de resistência no antibiograma e 54,5% no MIC (Tabela 4 e Tabela 5). Akhtar et al. (2010) avaliando isolados de S. Enteritidis de humanos e aves, observou no antibiograma 78,5% de resistência a Gentamicina (10 µg), já na avaliação de diferentes concentrações desse antimicrobiano, a resistência para 50 µg foi de 7,1%.
46 44 A análise genotípica dos isolados resistentes à Gentamicina mostrou a presença do gene AadA em praticamente todos, exceto uma amostra que apresentou o gene AadB, porém duas amostras resistentes no MIC não possuíam nenhum dos genes de resistência pesquisados, assim como uma amostra sensível no antibiograma possuía o gene de resistência (Tabela 6). Esses resultados são semelhantes aos observados por Peirano et al. (2006), onde dos 116 isolados resistentes a pelo menos um dos seis aminoglicosídeos testados, 44 apresentavam o gene AadA. Além desse gene também foram detectados os genes aac(3)-iia, aac(3)-iv e ant(2)-ia, que podem conferir resistência à Gentamicina. Porém, três isolados resistentes à Gentamicina não apresentavam nenhum dos quatro genes citados acima. Ainda de acordo com esses autores, genes responsáveis pela resistência à Vancomicina, poderiam estar codificando resistência a Gentamicina. Ribeiro et al.(2011) obteve resultados semelhantes aos encontrados nestes estudo e por Peirano et al. (2006), onde não se conseguiu relacionar fenótipo e genótipo. Isolados de S. Typhimurium carreavam o gene AadA, mas eram susceptíveis aos aminoglicosídeos, o que de acordo com esses autores mostra que a falta de expressão destes genes sugere que, para além do ambiente e do genótipo, a expressão é dependente de um promotor a montante. Já a ausência do gene e apresentando resistência fenotípica, pode estar relacionada a outros mecanismos que precisam ser melhor estudados. Silva (2011) avaliando a resistência de 44 cepas de Salmonella sp. oriundas de produtos avícolas, observou que a resistência apresentada pelos aminoglicosídeos testados, tinha como principais responsáveis a presença dos genes AadA e AadA1. A presença e a preocupação com a multirresistência aos antimicrobianos também foi relatada por Ribeiro et al. (2011), onde a presença dos genes AadA-Sul1-Sul2- BlaTEM-1, conferindo resistência aos aminoglicosídeos, sulfanamidas e cefalosporinas foi encontrada com frequência nos isolados de Salmonella sp. pesquisados. Essa mesma preocupação foi levantada por Silva (2011) onde foi verificado que dentre as 47 cepas de Salmonella sp. resistentes a fluoroquinolonas, 31 apresentavam co-resistência a cefalosporinas de amplo espectro, caracterizando fenótipos multirresistentes. Os resultados obtidos neste estudo também apresentarem multirresistência aos três antimicrobianos testados, sendo que a resistência à Enrofloxacina no MIC e antibiograma mostrou-se relativamente um pouco mais baixa que os demais (23% e 15,3%). No entanto o que chama atenção é a presença dos genes de resistência presentes em todas as amostras, tanto nas resistentes como nas sensíveis aos testes fenotípicos (Tabela 6).
47 45 O percentual de resistência à Enrofloxacina para isolados de S. Enteritidis encontrado por Ribeiro et al. (2008) foi de 5,9%, muito semelhantes aos relatados por Cardoso et al. (2006) que obtiveram resultados e 3,7%. Os resultados obtidos nesta pesquisa, no entanto, mostraram 50% no MIC e no antibiograma não houve resistência (Tabela 4 e Tabela 5). No entanto, Borsoi (2005) encontrou em cepas de Salmonella sp. isoladas de carcaças de frango, valores de resistência bastante altos, 69,2%, assim como os encontrados por Ribeiro et al. (2011) que foram de 15%, sendo que estes ainda detectaram que nesses isolados, 55% apresentaram mutações no gene GyrA. Constatação que também foi feita por Giraud et al., (1999) onde analisando S. Typhimurium altamente resistente às fluorquinolonas, encontraram alterações somente no gene GyrA. San Martin et al.(2005) avaliando 39 amostras de Salmonella sp., não encontraram resistência à Enrofloxacina. De acordo com esses autores a resistência fenotípica para este antimicrobiano só ocorre quando há mutação dupla no gene GyrA, mutações simples conferem resistência somente ao Ácido Nalidíxico, o que pode ser uma explicação para os isolados deste estudo que possuem o gene GyrA, porém não manifestam fenotipicamente (Tabela 6). A presença de amostras resistentes sem a presença do gene GyrA, GyrB, ParA e ParC, pode estar relacionada a outros mecanismos, como a superexpressão das bombas de efluxo ou pela modificação da permeabilidade da membrana através de alterações nas porinas (SAN MARTIN et al., 2005; ROBICSEK et al., 2006). O que não é demonstrado nesse estudo, pois todas as amostras que apresentaram resistência fenotípica possuíam os genes de resistência. Há hipóteses de que a introdução de fluorquinolonas na terapêutica veterinária pode ter contribuído para o surgimento de resistências em bactérias que também causam infecções humanas. Poucos casos de falha no tratamento de salmonelose devido à resistência às fluoroquinolonas tem sido relatada, mas o número crescente de cepas resistentes é uma preocupação. Os animais podem constituir um reservatório de cepas resistentes com mutações iniciais no gene GyrA que poderia persistir e adquirir mecanismos de resistência adicionais sobre exposição posterior à fluorquinolonas (GIRAUD et al., 1999). Com relação aos resultados da análise através do teste exato de Fisher observou-se que para a Enrofloxacina e Ceftiofur, os valores não eram os esperados, pois a dependência entre as variáveis (sensível, resistente, presença ou ausência do gene) deveria existir. No entanto esses resultados vão de encontro ao que Alberts et al. (2007) comentam sobre a presença do gene e a não expressão pelas bactérias.
48 46 Todavia, essa afirmação não ocorre com o antimicrobiano Gentamicina, nesse caso os valores mostram que a presença ou ausência do gene de resistência interfere na resposta fenotípica para o MIC e Antibiograma. Na análise de sensibilidade e especificidade das metodologias, pode-se observar que os resultados obtidos com o antimicrobiano Gentamicina estão próximos ao que se espera, testes devem ser altamente sensíveis e específicos (GIOLO,2012). O que não se observa na Enrofloxacina e muito pouco no Ceftiofur (Tabela 7). Esses resultados vão de encontro ao que foi observado no teste exato de Fisher, demonstrando que o antimicrobiano Gentamicina foi o que obteve resultados próximos ao esperado. Com relação ao sequenciamento os resultados obtidos que posteriormente foram analisados no BLAST, demonstram a fidelidade da transcrição e a especificidade, esses resultados foram fidedignos tanto para os genes GyrA como AadA. A preocupação com relação ao crescente número de cepas de Salmonella sp. multirresistentes é problemática, haja visto que muitos dos antimicrobianos utilizados na avicultura também são utilizados para o tratamento em humanos. Além disso, há a preocupação com o próprio controle medicamentoso na avicultura industrial, pois esse aumento de multirresistência levanta o questionamento de que em breve os princípios ativos disponíveis não serão mais eficientes para o controle dessas bactérias. Uma alternativa para a redução dos lotes positivos para S. Enteritidis é o uso de vacinas inativadas em reprodutoras e poedeiras comerciais, que tem se mostrado uma ferramenta importante no controle de S. Enteritidis. No entanto, o procedimento mais indicado para o controle de S. Enteritidis e S. Typhimurium na avicultura está na aquisição e produção de lotes livres do agente. Code e Duarte (2002) comentam que a grande resistência com relação ao controle dessas salmoneloses é porque elas têm pouco ou nenhum impacto na produtividade das granjas, os programas de erradicação são complexos e tem custo elevado e também porque há pouca consciência de que a erradicação nas granjas causará redução dos surtos humanos.
49 47 4 CONCLUSÃO É possível concluir com os resultados obtidos neste trabalho que para Gentamicina foi observada uma correlação entre o caráter fenotípico e genotípico, mas o mesmo não pode ser dito em relação à Enrofloxacina e Ceftiofur uma vez que nem sempre foi observada a resistência fenotípica, mesmo as amostras apresentando o gene de resistência. De forma prática, estes resultados indicam ainda a necessidade de cautela na hora de decidir qual o tratamento a ser adotado, devendo-se avaliar os resultados das análises fenotípicas, principalmente o MIC por ser considerado mais específico, do que os resultados genotípicos. No entanto os resultados genotípicos também possuem relevância pois os resultados obtidos mostram que as Salmonelas de origem avícola apresentam a informação genética necessária para tornarem-se resistentes aos três antimicrobianos mais utilizados na avicultura brasileira no futuro, apresentando um risco para a área veterinária, e em menor grau para a área humana. Vale salientar a necessidade de pesquisas e desenvolvimento de novas drogas e de medidas regulatórias para evitar o uso indiscriminado dos antimicrobianos.
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59 6 APÊNDICES 57
60 58 APÊNDICE A - Tamanho dos halos dos antimicrobianos Tabela 8 - Tamanho dos halos de inibição dos antimicrobianos testados. Antimicrobiano Resistente (mm) Intermediário (mm) Sensível (mm) Ceftiofur Enrofloxacina Gentamicina Fonte: CLSI, 2008.
61 59 APÊNDICE B - Condições para a reação da PCR Tabela 9 Concentrações dos reagentes e condições do termociclador para a realização da PCR para os genes testados. Genes Concentrações de reagentes Condições do termociclador Ciclos AadA 1µL Tampão 10x, 0,8µL dntps (2,5mM), 1µL cada primer (20pmol), 0,15µL Taq Polimerase, 0,5µL MgCl2 (4mM), 2µL DNA 95 C-5min;95ºC-60s; 62 C-60s; 72 C-60s; 72ºC-15min 35 AadB 1µL Tampão 10x, 0,8µL dntps (2,5mM), 1µL cada primer (20pmol), 0,15µL Taq Polimerase, 0,5µL MgCl2 (4mM), 4µL DNA 95 C-5min;95ºC-60s; 62 C-60s; 72 C-60s; 72ºC-15min 35 GyrA 1µL Tampão 10x, 0,8µL dntps (2,5mM), 1µL cada primer (20pmol), 0,15µL Taq Polimerase, 0,5µL MgCl2 (4mM), 2µL DNA 95 C-5min;95ºC-60s; 54 C-60s; 72 C-60s; 72ºC-15min 35 GyrB 1µL Tampão 10x, 0,8µL dntps (2,5mM), 1µL cada primer (20pmol), 0,15µL Taq Polimerase, 0,5µL MgCl2 (4mM), 2µL DNA 95 C-5min;95ºC-60s; 54 C-60s; 72 C-60s; 72ºC-15min 35 ParC 1µL Tampão 10x, 0,8µL dntps (2,5mM), 1µL cada primer (20pmol), 0,15µL Taq Polimerase, 0,5µL MgCl2 (4mM), 2µL DNA 95 C-5min;95ºC-60s; 54 C-60s; 72 C-60s; 72ºC-15min 35 ParE 1µL Tampão 10x, 0,8µL dntps (2,5mM), 1µL cada primer (20pmol), 0,15µL Taq Polimerase, 0,5µL MgCl2 (4mM), 2µL DNA 95 C-5min;95ºC-60s; 54 C-60s; 72 C-60s; 72ºC-15min 35 BlaCMY-2 1µL Tampão 10x, 0,8µL dntps (2,5mM), 1µL cada primer (20pmol), 0,15µL Taq Polimerase, 0,5µL MgCl2 (4mM), 2µL DNA 95 C-9,5min;95ºC-45s; 59 C-45s; 72 C-60s; 72ºC-7min 40 AmpC 1µL Tampão 10x, 0,8µL dntps (2,5mM), 1µL cada primer (20pmol), 0,15µL Taq Polimerase, 0,5µL MgCl2 (4mM), 2µL DNA 95 C-9,5min;95ºC-45s; 59 C-45s; 72 C-60s; 72ºC-7min 40 Fonte: o autor
62 60 APÊNDICE C - Leitura dos géis de agarose 1- Resultados da PCR para o antimicrobiano Ceftiofur. Figura 1 Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene AmpC (1226 pb). M pb 1000 pb 1226 pb 500 pb 100 pb Legenda: M Marcador peso molecular de 100 pb. Amostras 1, 7 e 9 com presença do gene AmpC. Figura 2 - Gel de agarose 2% mostrando a presença da banda para o gene BlaCMY (354 pb) M pb 1000 pb 500 pb 354 pb 100 pb Legenda: M Marcador peso molecular de 100 pb. Amostra 8 com presença do gene BlaCMY.
63 Resultados da PCR para o antimicrobiano Enrofloxacina Figura 3 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene GyrA (251 pb). M pb 1000 pb 500 pb 251 pb 100 pb Legenda: M Marcador peso molecular de 100 pb. Amostras 1, 3,4, 5, 6, 7 e 8 com presença do gene GyrA. Figura 4 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene GyrB (181 pb). M pb 1000 pb 500 pb 100 pb 181 pb Legenda: M Marcador peso molecular de 100 pb. Amostras 1, 2, 3,4, 5, 6, 7 e 8 com presença do gene GyrB.
64 62 Figura 5 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene ParC (260 pb). M pb 1000 pb 500 pb 100 pb 260 pb Legenda: M Marcador peso molecular de 100 pb. Amostras 1, 2, 3,4, 6, 7 e 8 com presença do gene ParC. Figura 6 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene ParE (237 pb). M pb 1000 pb 500 pb 100 pb 237 pb Legenda: M Marcador peso molecular de 100 pb. Amostras 1, 2, 3,4, 5, 7 e 8 com presença do gene ParE.
65 Resultados da PCR para o antimicrobiano Gentamicina Figura 7 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene AadA (526 pb). M pb 1000 pb 500 pb 526 pb 100 pb Legenda: M Marcador peso molecular de 100 pb. Amostras 1,2, e 3com presença do gene AadA. Figura 8 - Gel de agarose 1,5% mostrando a presença da banda para o gene AadB (700 pb). M pb 1000 pb 700 pb 500 pb 100 pb Legenda: M Marcador peso molecular de 100 pb. Amostra 2 com presença do gene AadB.
66 64 APÊNDICE D - Resultados teste exato de Fisher através do programa estatístico R. Tabela 10 Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do MIC com a presença ou ausência dos genes de resistência à Enrofloxacina. MIC Presença (Resistente) Expressão Gênica Ausência (Sensível) Total Resistente Sensível Total p - valor 1,000 Valores maiores que o p-valor de 0,05 (nível de significância de 5%) não se rejeita a hipótese nula (H 0 ), onde as variáveis analisadas são independentes. Tabela 11 Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do Antibiograma com a presença ou ausência dos genes de resistência à Enrofloxacina. Antibiograma Presença (Resistente) Expressão Gênica Ausência (Sensível) Total Resistente Sensível Total p - valor 1,000 Valores maiores que o p-valor de 0,05 (nível de significância de 5%) não se rejeita a hipótese nula (H 0 ), onde as variáveis analisadas são independentes. Tabela 12 - Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do MIC com a presença ou ausência dos genes de resistência ao Ceftiofur. MIC Presença (Resistente) Expressão Gênica Ausência (Sensível) Total Resistente Sensível Total p - valor 0,2937 Valores maiores que o p-valor de 0,05 (nível de significância de 5%) não se rejeita a hipótese nula (H 0 ), onde as variáveis analisadas são independentes.
67 65 Tabela 13 - Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do Antibiograma com a presença ou ausência dos genes de resistência ao Ceftiofur. Antibiograma Presença (Resistente) Expressão Gênica Ausência (Sensível) Total Resistente Sensível Total p - valor 0,4196 Valores maiores que o p-valor de 0,05 (nível de significância de 5%) não se rejeita a hipótese nula (H 0 ), onde as variáveis analisadas são independentes. Tabela 14 - Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do MIC com a presença ou ausência dos genes de resistência à Gentamicina. MIC Presença (Resistente) Expressão Gênica Ausência (Sensível) Total Resistente Sensível Total p - valor 0,0435 Valores maiores que o p-valor de 0,05 (nível de significância de 5%) não se rejeita a hipótese nula (H 0 ), onde as variáveis analisadas são independentes. Tabela 15 - Análise do teste exato de Fisher para verificar dependência dos resultados do Antibiograma com a presença ou ausência dos genes de resistência à Gentamicina. Antibiograma Presença (Resistente) Expressão Gênica Ausência (Sensível) Total Resistente Sensível Total p - valor 0,0319 Valores maiores que o p-valor de 0,05 (nível de significância de 5%) não se rejeita a hipótese nula (H 0 ), onde as variáveis analisadas são independentes.
68 66 APÊNDICE E - Sequência dos genes no BLAST Figura 9 - Sequência do gene GyrA depositado no banco de dados públicos do Centro Nacional de Informação Biotecnológica, NCBI, similaridade de 99%. Fonte: NCBI, Figura 10 - Sequência do gene AadA depositado no banco de dados públicos do Centro Nacional de Informação Biotecnológica, NCBI, similaridade de 98%. Fonte: NCBI, 2012.