Bolsa 17/04270-3 - Análise de sequência de RNA - BV FAPESP
Estudo do transcriptoma de tecido muscular de bovinos da raça Nelore divergentes para qualidade de carne
Processo: 17/04270-3
Beneficiário: Maria Malane Magalhães Muniz
Bolsa(s) vinculada(s): 18/11154-2 - Identificação de genes de co-expressão em tecido muscular de bovinos Nelore divergente para fenótipos de marmoreio e índice de fragmentação miofibrilar, usando dados de RNA-seq, BE.EP.DR
As características de qualidade de carne são de difícil mensuração e raramente contempladas em programas de melhoramento genético, por isso, a importância de aumentar o conhecimento sobre os genes e os mecanismos moleculares que controlam essas características. Objetiva-se com esse projeto encontrar e analisar genes e isoformas diferencialmente expressos em bovinos da raça Nelore, fenotipicamente divergentes para qualidade de carne. Para isso, o projeto utilizará dados de sequenciamento RNA-Seq, o que possibilitará o estudo do transcriptoma, ou seja, a identificação dos genes que são expressos em cada grupo de animais. A partir deste conhecimento espera-se ser possível correlacionar a expressão destes genes com as características de qualidade de carne, fato este que irá produzir um maior entendimento sobre os mecanismos moleculares envolvidos. Serão utilizados dois grupos de animais divergentes para cada uma das características estudadas e cada grupo terá 10 bovinos Nelore divergentes para as seguintes características: índice de fragmentação miofibrilar (MFI) e marmoreio. Os procedimentos laboratoriais para a extração de RNA e sequenciamento já foram realizados. O software SOAPsplice e bases de dados públicas de informações genômicas serão utilizados para análises dos dados. Espera-se com esse projeto fornecer suporte genômico aos trabalhos quantitativos que já estão sendo realizados pelo grupo de pesquisa em genética e melhoramento animal da UNESP/Jaboticabal e parceiros, gerando maiores informações e esclarecimentos sobre os mecanismos de controle da expressão gênica relacionados com as características de qualidade de carne em bovinos Nelore. Consequentemente, irá auxiliar os programas de melhoramento genético brasileiros.