O Governo Municipal de Caucaia é constituído por treze secretarias, uma Assessoria de Comunicação Social, uma Procuradoria, uma Ouvidoria, uma Controladoria Geral município, dois Institutos (IMAC e IPM), uma Agência Pública (ADECA) e uma Autarquia Municipal de Trânsito de Caucaia (AMT).
Existem atualmente no município seis Conselhos Setoriais de Políticas Públicas, sete Conselhos de Direitos e um Gabinete de Segurança Municipal.