No ano de 1946, o papa Pio XII elevou essa igreja à condição de basílica menor, e Nossa Senhora da Conceição da Praia foi então proclamada Padroeira da Bahia, sendo homenageada sempre no dia 08 de dezembro (declarado feriado) com diversas missas e procissões.
No ano de 1992, em uma das capelas lateiras (do Santo Cristo), foi sepultada a Irmã Dulce. Posteriormente, seus restos mortais foram transladados para o santuário dedicado à obra dela, mas ainda hoje a lápide original permanece ali, em memória desta grande religiosa baiana.
É a partir dessa basílica que sai, todos os anos, a procissão marítima do Bom Jesus dos Navegantes, que segue pela baía de Todos os Santos até a Ponta de Montserrat, na Igreja de Nossa Senhora da Boa Viagem.