No turno diurno, a equipe e as instalações do Colégio Santo Inácio recebem cerca de 3 mil alunos da Educação Básica. Em coerência com o Projeto Educativo Comum (PEC) e com o Sistema de Qualidade na Gestão Escolar (SQGE) e tendo a formação integral como fim de todo o trabalho educativo, as aprendizagens a serem desenvolvidas pelos estudantes no CSI são determinadas em três dimensões: cognitiva, socioemocional e espiritual-religiosa. Tais dimensões são trabalhadas de maneira articulada, como parte da atividade pedagógica. Elas estão voltadas não apenas ao aprimoramento acadêmico dos estudantes, mas também à interação e à ação do sujeito sobre o mundo segundo os valores inacianos, como a busca pela Justiça, o serviço aos demais e a solidariedade.
O Colégio Santo Inácio, como entidade filantrópica, oferece à comunidade Ensino de Jovens e Adultos e cursos técnicos profissionalizantes em Enfermagem, Administração, Análises Clínicas e Informática. Esses cursos acontecem nos mesmos espaços e laboratórios utilizados pelos alunos da Educação Básica no turno diurno. São quase mil alunos carentes que, graças ao alto nível dos cursos e à qualidade das aulas, conseguem boa inserção no mercado de trabalho.