Bolsa 00/10004-3 - Bacteriófagos, Genomas - BV FAPESP
Processo: 00/10004-3
Assunto(s): Bacteriófagos Genomas Leifsonia xyli Virulência Xylella fastidiosa
Este projeto é uma continuação ao trabalho iniciado durante o Seqüenciamento do Genoma da Xylella fastidiosa, com relação à participação no seqüenciamento e anotação de genomas de organismos importantes para a agricultura, mais especificamente: Xanthomonas axonopodis pv. citri, Xylella fastidiosa (isolado de videira) e Leifsonia xyli, subsp. xyli. As atividades envolverão desde a produção das bibliotecas, preparação dos moldes de DNA e seqüenciamento até a análise das seqüências, montagem dos contigs, fechamento de gaps e anotação do genoma com ênfase na comparação destes genomas com o de Xylella fastidiosa (citrus). Neste sentido vale ressaltar que Xylella e Xanthomonas citri apresentam o mesmo hospedeiro e Xylella e Leifsonia habitam o xilema de diferentes plantas hospedeiras. Objetiva-se analisar regiões da genoma que incluam ORFs que possam estar envolvidas na adesão desta bactéria ao xilema, como por exemplo adesinas e hemaglutininas. A anotação comparativa entre os genomas também terá como foco central a presença de profagos. (AU)