Ethan mora na Colônia dos Guardians com sua irmã Lumia. Seu pai, Olson Waber, era um Guardian que morreu durante uma missão, deixando Ethan e sua mulher grávida. Ao dar a luz a Lumia, a mãe de Ethan morre, e os dois acabam sendo criados pelos tios. Desde então, Ethan tem odiado os Guardians, pois eles arruinaram com sua família. Um dia, Mirei Mikuna, a Donzela Divina, estava na Colônia dos Guardians para celebrar o aniversário de 100 anos da "Tríplice Aliança", quando ouve um ataque dos SEED. Ao evacuar, Lumia fica presa em destroços, e Ethan sai para pedir ajuda. Ele encontra Leogini Santosa Berafort, um Guardian. Leo (como Leogini gosta de ser chamado) se fere ao ataque de um SEED e Ethan pega seu equipamento para tentar salvar Lumia. Após o acontecido, Ethan decide se tornar um Guardian.
Um Guardian que frequentou a Escola dos Guardians ao mesmo tempo que Ethan. Ele e Ethan são rivais, freqüentemente competindo pelo primeiro lugar no Torneio da Colônia. Ele é um pouco conquistador, mas também um seguidor devoto da Fé de Gurhal. Ele é fã assumido da Donzela Divina e diz que todas as garotas que ele conheceu vieram a ele por intervenção divina. No fundo, ele é um prodígio muito diligente.
Ela e Karen são como irmãs uma para a outra. Sua aparência sensual pode ser enganosa, pois sua personalidade é um pouco pateta. Ela é capaz de lançar técnicas que ajudam as pessoas com quem ela está, com grande facilidade. Ela gosta de ter companhia e faz parte do time de Desenvolvimento Tecnológico dos Guardians. Durante o jogo, ela desenvolve rações para os Guardians se alimentarem no meio das missões, mas não parece algo muito saboroso, segundo Ethan e Hyuga. É a única Force entre todos os NPCs.
Tonnio parece ser uma criança de 12 anos, mas na verdade ele é um pequeno beast com seus 26 anos. Ele foi criado num orfanato e era o líder de uma gangue de rua, mas Leo o levou para os Guardians. Tonnio é reconhecido pelo seu jeito de falar e por usar constantemente o Nanoblast Adaka Val, que o transforma em uma criatura gigante e de força extrema. Após conhecer Leo, ele mudou de vida e se juntou aos Guardians. Mesmo assim, ele é áspero, se irrita facilmente e às vezes não sabe se controlar.
Um professor assistente no departamento de engenharia da Universidade de Rozenom City, em Parum. Kou originalmente se especializou em Photons, mas mudou sua especialidade para A-Photons. Maya Shidow foi uma de suas alunas durante seus dias de pesquisa sobre Photons.
É o décimo sétimo presidente dos Guardians. Ele tem muitas expectativas de si mesmo, assim como de seus subordinados. À primeira vista, ele parece quieto e reservado, mas quem o conhece bem sabe que ele é falante e faz muitas piadas.
O Chefe Mestre de Photons, e líder da Comunhão de Gurhal. Seu comportamento gentil rapidamente deixa as pessoas à vontade.
Dizem que ele é um dos pesquisadores que descobriu os A-Photons. Ele está afiliado aos Guardians no momento, procurando por uma carta na manga para usar contra os SEED.
Um capitão e líder do pelotão da 177ª Unidade Contra-SEED. Sem saber nada sobre a vida fora do exército, ele obedece as ordens de seus superiores sem questionar. Um apoiador vitalício da supremacia CAST, ele acredita que os CASTs são superiores às outras raças. Após muitas missões em uqe passou lidando com disputas, ele cresceu sendo desconfiado dos não-CASTs.