Desde o início de sua gestão, em março de 2001, o governo Alckmin anda experimentando políticas para a Febem, sem êxito. Nos últimos quatro anos, a entidade já esteve subordinada à Secretaria de Assistência e Desenvolvimento Social, à Secretaria da Segurança Pública, à Secretaria da Juventude, Esporte e Lazer, à Secretaria da Educação e à Secretaria da Justiça. Além disso, o governador perdeu tempo valioso testando diferentes dirigentes à frente da instituição. Até hoje, ele já nomeou seis presidentes e, em média, cada um deles passou menos de um ano no cargo.
Com essa dança de vinculações e de presidentes, cada reforma anunciada acabou mal realizada e malsucedida. Por isso, embora tenha investido muito na construção de novas unidades, o governo fracassou na definição de um novo modelo de atendimento a menores carentes e na seleção e treinamento adequado de recursos humanos para atuar com competência na ressocialização de adolescentes infratores. Como conseqüência dessa acumulação de problemas e tensões as rebeliões e fugas passaram a se suceder em progressão geométrica.
Além disso, temendo a explosão de motins, os prefeitos resistem à construção de novas unidades no interior. Essa é, aliás, uma das dificuldades que o governo está enfrentando para implementar as medidas exigidas pela Corte Interamericana de Justiça. Para resolver o problema da superlotação do Complexo Tatuapé, ele tem de expandir o número de unidades no interior capazes de abrigar jovens da própria região, pondo fim à prática de transferi-los para a capital. Mas as prefeituras se negam a ceder áreas para esse fim.