Este vírus também pertence à família do vírus do herpes e é uma infecção extremamente comum. Os pacientes geralmente têm menos sintomas quando infectados com esse vírus, portanto, eles não estão cientes de sua condição. Com o sistema imunológico fraco, sintomas como dor de garganta, febre baixa e hepatomegalia leve estão presentes. O citomegalovírus aumenta o risco de desenvolver diabetes tipo 1, miocardite, esclerose múltipla e síndrome de Guillian-Barre.
Este vírus está associado à ceratite estromal herpética (HSK) que pode levar à cegueira. Os sintomas da HSK são aliviados pelos imunossupressores, indicando o envolvimento do sistema imunológico. No entanto, a maioria dos estudos é feita em amostras murinas devido à dificuldade em estudar em humanos.
Este vírus está principalmente associado a miocardite infecciosa, já que o RNA viral foi isolado do coração do paciente. No entanto, estes são estudados em camundongos infectados e há incerteza sobre a patologia da doença em humanos. O Coxsackievirus B também está associado ao desenvolvimento de autoimunidade no diabetes tipo 1.
A infecção estreptocócica é uma infecção muito comum, principalmente associada à faringite estreptocócica que apresenta sintomas de dor de garganta, febre e linfadenopatia cervical. Embora, dor de garganta é uma infecção viral, mas os pacientes podem ter infecção bacteriana secundária por estreptococos. A infecção por estreptococos também está associada à doença autoimune da febre reumática que envolve articulações (artrite), coração (miocardite), pele (erupções cutâneas) e cérebro (coreia de Sydenham em que há movimento involuntário dos músculos faciais, braços, pernas e tronco). Streptococcus também é considerado um gatilho para glomerulonefrite auto-imune, síndrome de Tourette e transtorno neuropsiquiátrico autoimune pediátrico associado a infecções estreptocócicas (PANDAS).
Esta espiroqueta transmitida por carrapatos é responsável pela doença de Lyme nos Estados Unidos e 60% dos casos não tratados podem desenvolver artrite e progredir para artrite crônica de Lyme que pode ser resistente a antibióticos e até mesmo desenvolver complicações do Sistema Nervoso Central.