O antigo prédio, que hospedava o museu, foi originalmente construído para a EXPO, exposição internacional do Japão em 1970. Devido às deteriorações do prédio provisório e ao crescimento da coleção do museu, decidiu-se mudar o museu pra um novo prédio, cuja construção começou em 1999, e a inauguração está prevista para 20 de novembro de 2004 (projeto de Cesar Pelli).