A TV turca chegou a citar fontes policiais que diziam que o sequestro do avião era um protesto contra a viagem do papa Bento XVI à Turquia, prevista para novembro. O papa ofendeu muitos muçulmanos no mês passado com um discurso em que vinculou a disseminação da fé islâmica à violência.
Mas depois se descobriu que o sequestrador é um católico convertido que queria escapar do serviço militar na Turquia, e que tinha escrito para o papa há vários meses pedindo ajuda para não ter de servir num exército muçulmano. Um funcionário do Vaticano afirmou que o sequestro não deve alterar os planos de viagem do papa.
Amato afirmou que Ekinci viajou para a Albânia em maio e pediu asilo lá, pois se considerava desertor do exército turco, e achava que seria punido se voltasse para casa.