De kerk is gratis toegankelijk, maar voor de grootste trekpleister moet u betalen: het Museum van het Heilige Bloed. Volgens de overlevering nam graaf Diederik van Elzas in 1150 uit Jeruzalem een stukje stof mee met het bloed van Jezus. Hij zou dat hebben gekregen van de patriarch van Jeruzalem na de tweede Kruistocht. Vervolgens gaf hij opdracht om de Basiliuskerk te bouwen om het reliek in onder te brengen. Het is niet helemaal zeker of dit verhaal waar is. Waarschijnlijker is dat de latere graaf Boudewijn IX het bij een kruistocht in 1203 meenam uit Constantinopel.
Het reliek wordt bewaard in een uitbundig versierd schrijn dat in 1817 gemaakt werd door de Brugse goudsmid Jan Crabbe. Hij verwerkte zo'n 30 kilo goud en zilver en meer dan 100 edelstenen. Dit schrijn wordt ieder jaar op Hemelvaartsdag tijdens een processie door Brugge gedragen. In het Museum wordt de geschiedenis van het reliek en de basiliek uit de doeken gedaan en verder zie je er onder meer een zilveren kroontje uit de 15e eeuw dat werd geschonken door Maria van Bourgondië en enkele schilderijen.