Een zonneboiler, hoe duurzaam ook, heeft een nadeel: hij produceert warm water. Niks meer niks minder. In de zomer is er teveel warm water en in de winter te weinig. Als je in der zomer met vakantie van huis bent loopt het voorraadvat vol met heet water en dat blijft dan zo. De elektriciteit uit zonnepanelen kan overal voor ingezet worden, en als men met vakantie is blijven zonnepanelen rustig doorgaan met (terug)leveren. Zodra de salderingsregel is uitgefaseerd wordt het heel interessant om geen zonnestroom meer terug te leveren maar er o.a. tapwater mee te verwarmen. De terugkeer van de (slimme) elektrische boiler! Bovendien hebben zonnepanelen veel minder onderhoud nodig dan een zonneboiler.
Het klopt dat een zonneboiler in de zomer meer produceert dan in de winter. Het proces stopt inderdaad als het voorraadvat op temperatuur is. Dit seizoen probleem hebben PV panelen ook. Die produceren ook weinig in de winterperiode, maar de opbrengst van PV panelen loopt inderdaad door in de zomer, omdat de niet direct gebruikte elektriciteit dan aan het net wordt terug geleverd.
Een zonneboiler haalt tot wel 40-50% van de thermische energie uit ingestraald zonlicht. Een PV paneel heeft een typisch rendement voor de omzetting van zonlicht naar elektriciteit van 14-17%. Het omzetten van door PV opgewekte elektriciteit in warm water is dus 3 keer minder energie-efficiënt dan warm water direct opwekken met een zonneboiler.