In de 13e eeuw werd bij de uithof "Hof te Zande" van de cisterciënzer abdij Ter Duinen in België een kapel gebouwd. Deze uithof werd in 1348 samen met de andere uithoven van de abdij Ter Duinen door de inwoners van Gent verwoest, waarna de monniken echter hun gebouwen weer herstelden.
Tijdens de Tachtigjarige oorlog raakte "Hof te Zande" opnieuw zwaar beschadigd. Het verwoeste schip van de kapel werd in 1609 opnieuw opgebouwd met kloostermoppen van de niet meer herbouwde uithof.
De Hervormde Gemeente van Hontenisse (Kloosterzande) besloot in 1841 een kerkorgel aan te schaffen. De Middelburgse orgelmakers Preuninger & Mennes boden aan voor f1100,- een nieuw orgel te maken, waar de gemeente niet op in ging. Men besloot namelijk een 'groot huisorgel' aan een zekere timmerman Willems uit Middelburg aan te kopen. Muziekonderwijzer J.W. Schuurmans, 'muziekkenner' Snijders en orgelmaker Lohman onderzochten dit orgel en keurden het goed, waarna Preuninger & Mennes het te Kloosterzande plaatsten. Hierbij maakten zij een nieuwe orgelkas met houten imitatiepijpen. Volgens de dispositie-opgave van Broekhuyzen was het orgel 'fraay van toon en zeer goed tot deze kerk ingericht'. Maker en jaartal van bouw zijn onbekend. Er zijn geen vermeldingen van wijzigen van de dispositie bij het plaatsen in Kloosterzande. In de zomer van 1842 werd het in gebruik genomen.
Preuninger stemde, getuige potloodaantekeningen in de kas, het orgel tot 1850. Daarna kreeg J.F. Klein het instrument in onderhoud. In 1855 heeft hij het front geverfd en de frontpijpen gefolied en verguld. Ook de registerknoppen werd gelakt. Tot 1874 hadden J.C. Klein en J.J. Klein het onderhoud. De laatstgenoemde stemde het orgel tot minimaal 1881.
Dit instrument werd in 1927 vervangen door een nieuw pneumatisch orgel van de firma Standaart, waarbij het oude front werd gebruikt.
In 1927 bouwde de firma A. Standaart een nieuw orgel achter het oude front van Preuninger & Mennes uit 1842.
In 1965 heeft A. Nijsse de Flute 2' veranderd tot een Octaaf 2' en de Viola di Gamba 8' werd gewijzigd in een Octaaf 4'.
Nadat het Standaart-orgel gebreken begon te vertonen, werd besloten achter het front van de orgelbouwers Preuninger & Mennes opnieuw een nieuw orgel te bouwen. De firma Nijsse uit Oud-Sabbinge voerde de werkzaamheden uit. Dit was het eerste orgel dat deze orgelbouwer vervaardigde onder toezicht van de Orgelcommissie van de Nederlands Hervormde Kerk. Adviseur was Aart van Beek.