Spaces:
Running
Running
Update app.py
Browse files
app.py
CHANGED
@@ -73,13 +73,13 @@ modelGlinerBio=None
|
|
73 |
num_cores_Gliner_forDemo = 0 # 0 means use the GPU for Gliner !
|
74 |
tokenizerGliner = AutoTokenizer.from_pretrained('microsoft/deberta-v3-large')
|
75 |
|
76 |
-
POSSIBLE_KGchoices_List = ["AEO", "BFO", "BIM", "BCGO", "CL", "CHIRO", "CHEBI", "DCM", "FMA", "GO", "GENO",
|
77 |
"GeoSPARQL", "HL7", "DOID", "HP", "HP_O", "IDO", "IAO", "ICD10", "LOINC", "MESH",
|
78 |
"MONDO", "NCIT", "NCBITAXON", "NCBITaxon_", "NIFCELL", "NIFSTD", "GML", "OBCS", "OCHV", "OHPI",
|
79 |
"OPB", "TRANS", "PLOSTHES", "RADLEX", "RO", "STY", "SO", "SNOMED", "STATO",
|
80 |
"SYMP", "FoodOn", "UBERON", "VO", "OGMS", "EuroSciVoc"]
|
81 |
|
82 |
-
ONLY_Ontologies_OnBIOPORTAL = ["AEO", "BCGO", "BFO", "BIM", "CHEBI", "CHIRO", "CL", "DCM", "DOID", "FMA", "FOODON", "GENO", "GML", "GO", "GEOSPARQL", "HL7", "HP", "HP_O", "IAO", "ICD10", "IDO", "LOINC", "MESH", "MONDO", "NCBITAXON", "NCIT", "NIFCELL", "NIFSTD", "OBCS", "OCHV", "OHPI", "OPB", "PLOSTHES", "RADLEX", "OBOREL", "SNOMEDCT", "SO", "STATO", "STY", "SYMP", "PTRANS", "UBERON", "VO", "OGMS"]
|
83 |
|
84 |
encod = encoding_getter('microsoft/deberta-v3-large')
|
85 |
text_splitter = TokenTextSplitter(
|
|
|
73 |
num_cores_Gliner_forDemo = 0 # 0 means use the GPU for Gliner !
|
74 |
tokenizerGliner = AutoTokenizer.from_pretrained('microsoft/deberta-v3-large')
|
75 |
|
76 |
+
POSSIBLE_KGchoices_List = ["AI", "AIO", "AEO", "BFO", "BIM", "BCGO", "CL", "CHIRO", "CHEBI", "DCM", "FMA", "GO", "GENO",
|
77 |
"GeoSPARQL", "HL7", "DOID", "HP", "HP_O", "IDO", "IAO", "ICD10", "LOINC", "MESH",
|
78 |
"MONDO", "NCIT", "NCBITAXON", "NCBITaxon_", "NIFCELL", "NIFSTD", "GML", "OBCS", "OCHV", "OHPI",
|
79 |
"OPB", "TRANS", "PLOSTHES", "RADLEX", "RO", "STY", "SO", "SNOMED", "STATO",
|
80 |
"SYMP", "FoodOn", "UBERON", "VO", "OGMS", "EuroSciVoc"]
|
81 |
|
82 |
+
ONLY_Ontologies_OnBIOPORTAL = ["AI", "AIO", "AEO", "BCGO", "BFO", "BIM", "CHEBI", "CHIRO", "CL", "DCM", "DOID", "FMA", "FOODON", "GENO", "GML", "GO", "GEOSPARQL", "HL7", "HP", "HP_O", "IAO", "ICD10", "IDO", "LOINC", "MESH", "MONDO", "NCBITAXON", "NCIT", "NIFCELL", "NIFSTD", "OBCS", "OCHV", "OHPI", "OPB", "PLOSTHES", "RADLEX", "OBOREL", "SNOMEDCT", "SO", "STATO", "STY", "SYMP", "PTRANS", "UBERON", "VO", "OGMS"]
|
83 |
|
84 |
encod = encoding_getter('microsoft/deberta-v3-large')
|
85 |
text_splitter = TokenTextSplitter(
|