jattokatarratto commited on
Commit
8102060
·
verified ·
1 Parent(s): cb615a2

Update app.py

Browse files
Files changed (1) hide show
  1. app.py +2 -2
app.py CHANGED
@@ -73,13 +73,13 @@ modelGlinerBio=None
73
  num_cores_Gliner_forDemo = 0 # 0 means use the GPU for Gliner !
74
  tokenizerGliner = AutoTokenizer.from_pretrained('microsoft/deberta-v3-large')
75
 
76
- POSSIBLE_KGchoices_List = ["AEO", "BFO", "BIM", "BCGO", "CL", "CHIRO", "CHEBI", "DCM", "FMA", "GO", "GENO",
77
  "GeoSPARQL", "HL7", "DOID", "HP", "HP_O", "IDO", "IAO", "ICD10", "LOINC", "MESH",
78
  "MONDO", "NCIT", "NCBITAXON", "NCBITaxon_", "NIFCELL", "NIFSTD", "GML", "OBCS", "OCHV", "OHPI",
79
  "OPB", "TRANS", "PLOSTHES", "RADLEX", "RO", "STY", "SO", "SNOMED", "STATO",
80
  "SYMP", "FoodOn", "UBERON", "VO", "OGMS", "EuroSciVoc"]
81
 
82
- ONLY_Ontologies_OnBIOPORTAL = ["AEO", "BCGO", "BFO", "BIM", "CHEBI", "CHIRO", "CL", "DCM", "DOID", "FMA", "FOODON", "GENO", "GML", "GO", "GEOSPARQL", "HL7", "HP", "HP_O", "IAO", "ICD10", "IDO", "LOINC", "MESH", "MONDO", "NCBITAXON", "NCIT", "NIFCELL", "NIFSTD", "OBCS", "OCHV", "OHPI", "OPB", "PLOSTHES", "RADLEX", "OBOREL", "SNOMEDCT", "SO", "STATO", "STY", "SYMP", "PTRANS", "UBERON", "VO", "OGMS"]
83
 
84
  encod = encoding_getter('microsoft/deberta-v3-large')
85
  text_splitter = TokenTextSplitter(
 
73
  num_cores_Gliner_forDemo = 0 # 0 means use the GPU for Gliner !
74
  tokenizerGliner = AutoTokenizer.from_pretrained('microsoft/deberta-v3-large')
75
 
76
+ POSSIBLE_KGchoices_List = ["AI", "AIO", "AEO", "BFO", "BIM", "BCGO", "CL", "CHIRO", "CHEBI", "DCM", "FMA", "GO", "GENO",
77
  "GeoSPARQL", "HL7", "DOID", "HP", "HP_O", "IDO", "IAO", "ICD10", "LOINC", "MESH",
78
  "MONDO", "NCIT", "NCBITAXON", "NCBITaxon_", "NIFCELL", "NIFSTD", "GML", "OBCS", "OCHV", "OHPI",
79
  "OPB", "TRANS", "PLOSTHES", "RADLEX", "RO", "STY", "SO", "SNOMED", "STATO",
80
  "SYMP", "FoodOn", "UBERON", "VO", "OGMS", "EuroSciVoc"]
81
 
82
+ ONLY_Ontologies_OnBIOPORTAL = ["AI", "AIO", "AEO", "BCGO", "BFO", "BIM", "CHEBI", "CHIRO", "CL", "DCM", "DOID", "FMA", "FOODON", "GENO", "GML", "GO", "GEOSPARQL", "HL7", "HP", "HP_O", "IAO", "ICD10", "IDO", "LOINC", "MESH", "MONDO", "NCBITAXON", "NCIT", "NIFCELL", "NIFSTD", "OBCS", "OCHV", "OHPI", "OPB", "PLOSTHES", "RADLEX", "OBOREL", "SNOMEDCT", "SO", "STATO", "STY", "SYMP", "PTRANS", "UBERON", "VO", "OGMS"]
83
 
84
  encod = encoding_getter('microsoft/deberta-v3-large')
85
  text_splitter = TokenTextSplitter(