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app.py
CHANGED
@@ -17,10 +17,6 @@ model = genai.GenerativeModel("gemini-2.0-flash-thinking-exp-1219")
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17 |
# PharmKG 데이터셋 로드
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18 |
pharmkg_dataset = load_dataset("vinven7/PharmKG")
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-
# FDA_Pharmaceuticals_FAQ 데이터셋 로드
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-
fda_dataset = load_dataset("Jaymax/FDA_Pharmaceuticals_FAQ")
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-
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-
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24 |
# 문장 임베딩 모델 로드
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25 |
embedding_model = SentenceTransformer('sentence-transformers/all-MiniLM-L6-v2')
|
26 |
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@@ -39,7 +35,7 @@ def format_chat_history(messages: list) -> list:
|
|
39 |
})
|
40 |
return formatted_history
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41 |
|
42 |
-
def find_most_similar_data(query
|
43 |
"""
|
44 |
주어진 쿼리와 가장 유사한 데이터 찾기
|
45 |
"""
|
@@ -47,10 +43,10 @@ def find_most_similar_data(query, dataset):
|
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47 |
most_similar = None
|
48 |
highest_similarity = -1
|
49 |
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50 |
-
for split in
|
51 |
-
for item in
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52 |
-
if '
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53 |
-
item_text = f"
|
54 |
item_embedding = embedding_model.encode(item_text, convert_to_tensor=True)
|
55 |
similarity = util.pytorch_cos_sim(query_embedding, item_embedding).item()
|
56 |
|
@@ -60,7 +56,6 @@ def find_most_similar_data(query, dataset):
|
|
60 |
|
61 |
return most_similar
|
62 |
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63 |
-
|
64 |
def stream_gemini_response(user_message: str, messages: list) -> Iterator[list]:
|
65 |
"""
|
66 |
대화 기록 지원을 통해 생각과 응답을 스트리밍합니다(텍스트 입력만 해당).
|
@@ -78,14 +73,13 @@ def stream_gemini_response(user_message: str, messages: list) -> Iterator[list]:
|
|
78 |
chat_history = format_chat_history(messages)
|
79 |
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80 |
# 유사 데이터 검색
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81 |
-
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82 |
-
most_similar_fda_data = find_most_similar_data(user_message, fda_dataset)
|
83 |
|
84 |
system_message = "사용자 질문에 대해 의약품 정보를 제공하는 전문 약학 어시스턴트입니다."
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85 |
system_prefix = """
|
86 |
반드시 한글로 답변하십시오. 너의 이름은 'PharmAI'이다.
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87 |
-
당신은 '의약품 지식 그래프(PharmKG) 데이터 100만 건
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88 |
-
입력된 질문에 대해 PharmKG
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89 |
답변은 다음 구조를 따르십시오:
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90 |
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91 |
1. **정의 및 개요:** 질문과 관련된 약물의 정의, 분류, 또는 개요를 간략하게 설명합니다.
|
@@ -95,8 +89,7 @@ def stream_gemini_response(user_message: str, messages: list) -> Iterator[list]:
|
|
95 |
5. **부작용 및 주의사항 (Adverse Effects and Precautions):** 가능한 부작용과 사용 시 주의해야 할 사항을 상세히 설명합니다.
|
96 |
6. **약물 상호작용 (Drug Interactions):** 다른 약물과의 상호작용 가능성을 제시하고, 그로 인한 영향을 설명합니다.
|
97 |
7. **약동학적 특성 (Pharmacokinetics):** 약물의 흡수, 분포, 대사, 배설 과정에 대한 정보를 제공합니다.
|
98 |
-
8.
|
99 |
-
9. **참고 문헌 (References):** 답변에 사용된 과학적 자료나 관련 연구를 인용합니다.
|
100 |
|
101 |
* 답변은 가능하면 전문적인 용어와 설명을 사용하십시오.
|
102 |
* 모든 답변은 한국어로 제공하며, 대화 내용을 기억해야 합니다.
|
@@ -115,12 +108,10 @@ def stream_gemini_response(user_message: str, messages: list) -> Iterator[list]:
|
|
115 |
"""
|
116 |
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117 |
# 시스템 프롬프트 및 관련 컨텍스트를 사용자 메시지 앞에 추가
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118 |
-
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119 |
-
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120 |
-
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121 |
-
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122 |
-
prefixed_message += f" FDA 가이드 및 연관 정보: {most_similar_fda_data}"
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123 |
-
prefixed_message += f"\n\n 사용자 질문:{user_message}"
|
124 |
|
125 |
# Gemini 채팅 시작
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126 |
chat = model.start_chat(history=chat_history)
|
@@ -215,20 +206,18 @@ with gr.Blocks(
|
|
215 |
theme=gr.themes.Soft(primary_hue="teal", secondary_hue="slate", neutral_hue="neutral"),
|
216 |
) as demo:
|
217 |
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218 |
-
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219 |
-
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220 |
-
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221 |
-
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222 |
-
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223 |
-
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224 |
-
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225 |
-
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226 |
-
|
227 |
-
|
228 |
-
|
229 |
-
|
230 |
-
}
|
231 |
-
""")
|
232 |
|
233 |
gr.Markdown("# 💭 PharmAI: 추론 기반 약리학 전문 AI 서비스 💭")
|
234 |
|
@@ -267,8 +256,10 @@ with gr.Blocks(
|
|
267 |
["고혈압 관리에서 ACE 억제제와 ARB의 작용 메커니즘을 비교하고 대조하여 레닌-안지오텐신-알도스테론 시스템에 미치는 영향을 고려하십시오."],
|
268 |
["제2형 당뇨병의 병태 생리학을 설명하고 메트포르민이 어떻게 혈당 강하 효과를 달성하는지, 신장 장애 환자에 대한 주요 고려 사항을 포함하여 설명하십시오."],
|
269 |
["심부전 치료에서 베타 차단제의 작용 메커니즘과 임상적 중요성에 대해 논의하고, 특정 베타 수용체 아형과 심혈관계에 미치는 영향에 대해 참조하십시오."],
|
270 |
-
["알츠하이머병의 병태생리학적 기전을 설명하고, 현재 사용되는 약물들이 작용하는 주요 타겟을 상세히 기술하십시오. 특히, 아세틸콜린에스테라제 억제제와 NMDA 수용체 길항제의 작용 방식과 임상적 의의를 비교 분석해 주십시오."]
|
271 |
-
|
|
|
|
|
272 |
]
|
273 |
|
274 |
gr.Examples(
|
@@ -309,7 +300,7 @@ with gr.Blocks(
|
|
309 |
"""
|
310 |
## PharmAI: 당신의 전문 약리학 어시스턴트
|
311 |
|
312 |
-
PharmAI에 오신 것을 환영합니다. PharmAI는 광범위한 약학 지식 데이터("PharmKG")
|
313 |
|
314 |
**주요 기능:**
|
315 |
|
@@ -350,6 +341,143 @@ with gr.Blocks(
|
|
350 |
)
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351 |
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352 |
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353 |
# Launch the interface
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354 |
if __name__ == "__main__":
|
355 |
demo.launch(debug=True)
|
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17 |
# PharmKG 데이터셋 로드
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18 |
pharmkg_dataset = load_dataset("vinven7/PharmKG")
|
19 |
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20 |
# 문장 임베딩 모델 로드
|
21 |
embedding_model = SentenceTransformer('sentence-transformers/all-MiniLM-L6-v2')
|
22 |
|
|
|
35 |
})
|
36 |
return formatted_history
|
37 |
|
38 |
+
def find_most_similar_data(query):
|
39 |
"""
|
40 |
주어진 쿼리와 가장 유사한 데이터 찾기
|
41 |
"""
|
|
|
43 |
most_similar = None
|
44 |
highest_similarity = -1
|
45 |
|
46 |
+
for split in pharmkg_dataset.keys():
|
47 |
+
for item in pharmkg_dataset[split]:
|
48 |
+
if 'Input' in item and 'Output' in item:
|
49 |
+
item_text = f"입력: {item['Input']} 출력: {item['Output']}"
|
50 |
item_embedding = embedding_model.encode(item_text, convert_to_tensor=True)
|
51 |
similarity = util.pytorch_cos_sim(query_embedding, item_embedding).item()
|
52 |
|
|
|
56 |
|
57 |
return most_similar
|
58 |
|
|
|
59 |
def stream_gemini_response(user_message: str, messages: list) -> Iterator[list]:
|
60 |
"""
|
61 |
대화 기록 지원을 통해 생각과 응답을 스트리밍합니다(텍스트 입력만 해당).
|
|
|
73 |
chat_history = format_chat_history(messages)
|
74 |
|
75 |
# 유사 데이터 검색
|
76 |
+
most_similar_data = find_most_similar_data(user_message)
|
|
|
77 |
|
78 |
system_message = "사용자 질문에 대해 의약품 정보를 제공하는 전문 약학 어시스턴트입니다."
|
79 |
system_prefix = """
|
80 |
반드시 한글로 답변하십시오. 너의 이름은 'PharmAI'이다.
|
81 |
+
당신은 '의약품 지식 그래프(PharmKG) 데이터 100만 건 이상을 학습한 전문적인 의약품 정보 AI 조언자입니다.'
|
82 |
+
입력된 질문에 대해 PharmKG 데이터셋에서 가장 관련성이 높은 정보를 찾고, 이를 바탕으로 상세하고 체계적인 답변을 제공합니다.
|
83 |
답변은 다음 구조를 따르십시오:
|
84 |
|
85 |
1. **정의 및 개요:** 질문과 관련된 약물의 정의, 분류, 또는 개요를 간략하게 설명합니다.
|
|
|
89 |
5. **부작용 및 주의사항 (Adverse Effects and Precautions):** 가능한 부작용과 사용 시 주의해야 할 사항을 상세히 설명합니다.
|
90 |
6. **약물 상호작용 (Drug Interactions):** 다른 약물과의 상호작용 가능성을 제시하고, 그로 인한 영향을 설명합니다.
|
91 |
7. **약동학적 특성 (Pharmacokinetics):** 약물의 흡수, 분포, 대사, 배설 과정에 대한 정보를 제공합니다.
|
92 |
+
8. **참고 문헌 (References):** 답변에 사용된 과학적 자료나 관련 연구를 인용합니다.
|
|
|
93 |
|
94 |
* 답변은 가능하면 전문적인 용어와 설명을 사용하십시오.
|
95 |
* 모든 답변은 한국어로 제공하며, 대화 내용을 기억해야 합니다.
|
|
|
108 |
"""
|
109 |
|
110 |
# 시스템 프롬프트 및 관련 컨텍스트를 사용자 메시지 앞에 추가
|
111 |
+
if most_similar_data:
|
112 |
+
prefixed_message = f"{system_prefix} {system_message} 관련 정보: {most_similar_data}\n\n 사용자 질문:{user_message}"
|
113 |
+
else:
|
114 |
+
prefixed_message = f"{system_prefix} {system_message}\n\n 사용자 질문:{user_message}"
|
|
|
|
|
115 |
|
116 |
# Gemini 채팅 시작
|
117 |
chat = model.start_chat(history=chat_history)
|
|
|
206 |
theme=gr.themes.Soft(primary_hue="teal", secondary_hue="slate", neutral_hue="neutral"),
|
207 |
) as demo:
|
208 |
|
209 |
+
demo.load(lambda: None, _js="""
|
210 |
+
() => {
|
211 |
+
const style = document.createElement('style');
|
212 |
+
style.textContent = `
|
213 |
+
.chatbot-wrapper .message {
|
214 |
+
white-space: pre-wrap;
|
215 |
+
word-wrap: break-word;
|
216 |
+
}
|
217 |
+
`;
|
218 |
+
document.head.appendChild(style);
|
219 |
+
}
|
220 |
+
""")
|
|
|
|
|
221 |
|
222 |
gr.Markdown("# 💭 PharmAI: 추론 기반 약리학 전문 AI 서비스 💭")
|
223 |
|
|
|
256 |
["고혈압 관리에서 ACE 억제제와 ARB의 작용 메커니즘을 비교하고 대조하여 레닌-안지오텐신-알도스테론 시스템에 미치는 영향을 고려하십시오."],
|
257 |
["제2형 당뇨병의 병태 생리학을 설명하고 메트포르민이 어떻게 혈당 강하 효과를 달성하는지, 신장 장애 환자에 대한 주요 고려 사항을 포함하여 설명하십시오."],
|
258 |
["심부전 치료에서 베타 차단제의 작용 메커니즘과 임상적 중요성에 대해 논의하고, 특정 베타 수용체 아형과 심혈관계에 미치는 영향에 대해 참조하십시오."],
|
259 |
+
["알츠하이머병의 병태생리학적 기전을 설명하고, 현재 사용되는 약물들이 작용하는 주요 타겟을 상세히 기술하십시오. 특히, 아세틸콜린에스테라제 억제제와 NMDA 수용체 길항제의 작용 방식과 임상적 의의를 비교 분석해 주십시오."],
|
260 |
+
["FDA에서 승인한 간경변 치료제와 그 작용 기전을 설명해주세요.", "FDA에서 승인한 고혈압 치료제에 대해 알려주세요."]
|
261 |
+
|
262 |
+
|
263 |
]
|
264 |
|
265 |
gr.Examples(
|
|
|
300 |
"""
|
301 |
## PharmAI: 당신의 전문 약리학 어시스턴트
|
302 |
|
303 |
+
PharmAI에 오신 것을 환영합니다. PharmAI는 Google의 Gemini 2.0 Flash 모델로 구동되는 전문 챗봇입니다. PharmAI는 광범위한 약학 지식 데이터 세트("PharmKG")를 활용하여 약리학 주제에 대한 전문가 수준의 정보를 제공하도록 설계되었습니다.
|
304 |
|
305 |
**주요 기능:**
|
306 |
|
|
|
341 |
)
|
342 |
|
343 |
|
344 |
+
# Launch the interface
|
345 |
+
if __name__ == "__main__":
|
346 |
+
with gr.Blocks() as demo:
|
347 |
+
demo.load(lambda: None, _js="""
|
348 |
+
() => {
|
349 |
+
const style = document.createElement('style');
|
350 |
+
style.textContent = `
|
351 |
+
.chatbot-wrapper .message {
|
352 |
+
white-space: pre-wrap;
|
353 |
+
word-wrap: break-word;
|
354 |
+
}
|
355 |
+
`;
|
356 |
+
document.head.appendChild(style);
|
357 |
+
}
|
358 |
+
""")
|
359 |
+
|
360 |
+
gr.Markdown("# 💭 PharmAI: 추론 기반 약리학 전문 AI 서비스 💭")
|
361 |
+
|
362 |
+
gr.HTML("""<a href="https://visitorbadge.io/status?path=https%3A%2F%2Faiqcamp-Gemini2-Flash-Thinking.hf.space">
|
363 |
+
<img src="https://api.visitorbadge.io/api/visitors?path=https%3A%2F%2Faiqcamp-Gemini2-Flash-Thinking.hf.space&countColor=%23263759" />
|
364 |
+
</a>""")
|
365 |
+
|
366 |
+
with gr.Tabs() as tabs:
|
367 |
+
with gr.TabItem("대화", id="chat_tab"):
|
368 |
+
chatbot = gr.Chatbot(
|
369 |
+
type="messages",
|
370 |
+
label="PharmAI 챗봇 (스트리밍 출력)", # 스트리밍임을 나타내는 레이블
|
371 |
+
render_markdown=True,
|
372 |
+
scale=1,
|
373 |
+
avatar_images=(None,"https://lh3.googleusercontent.com/oxz0sUBF0iYoN4VvhqWTmux-cxfD1rxuYkuFEfm1SFaseXEsjjE4Je_C_V3UQPuJ87sImQK3HfQ3RXiaRnQetjaZbjJJUkiPL5jFJ1WRl5FKJZYibUA=w214-h214-n-nu"),
|
374 |
+
elem_classes="chatbot-wrapper" # 사용자 정의 스타일용 클래스 추가
|
375 |
+
)
|
376 |
+
|
377 |
+
with gr.Row(equal_height=True):
|
378 |
+
input_box = gr.Textbox(
|
379 |
+
lines=1,
|
380 |
+
label="대화 메시지",
|
381 |
+
placeholder="여기에 메시지를 입력하세요...",
|
382 |
+
scale=4
|
383 |
+
)
|
384 |
+
|
385 |
+
clear_button = gr.Button("대화 초기화", scale=1)
|
386 |
+
|
387 |
+
# 예제 프롬프트 추가 - 파일 업로드 예제 제거. 텍스트 중심 예제 유지.
|
388 |
+
example_prompts = [
|
389 |
+
["CYP450 효소와 약물 대사 간의 상호 작용을 설명하고, 특히 효소 유도 또는 억제가 와파린과 같은 약물의 치료 효능에 어떻게 영향을 미칠 수 있는지에 중점을 두십시오."],
|
390 |
+
["만성 신장 질환 환자에서 빈혈 치료를 위해 사용하는 에리스로포이에틴 제제의 약동학적 및 약력학적 특성을 상세히 분석하고, 투여 용량 및 투여 간격 결정에 영향을 미치는 요인들을 설명해 주십시오."],
|
391 |
+
["간경변 치료(간 섬유화 해소)를 위한 신약 개발을 위한 '천연 식물'들을 추출하고 이에 대한 구체적인 약리기전과 그 이유, 그리고 어떻게 조합해야 최상의 효과가 있을지 추론하여 한방(한의학)적 관점에서 최적의 답변을 하라"],
|
392 |
+
["알츠하이머병 치료에 효과적인 천연 식물 물질과 약리기전 등을 한방(한의학)적 관점에서 설명하고 알려줘"],
|
393 |
+
["고혈압 치료 및 증상 완화에 효과적인 신약 개발을 위해 가능성이 매우 높은 천연 식물 물질과 약리기전 등을 한방(한의학)적 관점에서 설명하고 알려줘"],
|
394 |
+
["고혈압 관리에서 ACE 억제제와 ARB의 작용 메커니즘을 비교하고 대조하여 레닌-안지오텐신-알도스테론 시스템에 미치는 영향을 고려하십시오."],
|
395 |
+
["제2형 당뇨병의 병태 생리학을 설명하고 메트포르민이 어떻게 혈당 강하 효과를 달성하는지, 신장 장애 환자에 대한 주요 고려 사항을 포함하여 설명하십시오."],
|
396 |
+
["심부전 치료에서 베타 차단제의 작용 메커니즘과 임상적 중요성에 대해 논의하고, 특정 베타 수용체 아형과 심혈관계에 미치는 영향에 대해 참조하십시오."],
|
397 |
+
["알츠하이머병의 병태생리학적 기전을 설명하고, 현재 사용되는 약물들이 작용하는 주요 타겟을 상세히 기술하십시오. 특히, 아세틸콜린에스테라제 억제제와 NMDA 수용체 길항제의 작용 방식과 임상적 의의를 비교 분석해 주십시오."],
|
398 |
+
["FDA에서 승인한 간경변 치료제와 그 작용 기전을 설명해주세요.", "FDA에서 승인한 고혈압 치료제에 대해 알려주세요."]
|
399 |
+
|
400 |
+
|
401 |
+
]
|
402 |
+
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403 |
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gr.Examples(
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examples=example_prompts,
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inputs=input_box,
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label="예제: Gemini의 생각을 보려면 다음 프롬프트를 사용해 보세요!",
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examples_per_page=3 # 필요에 따라 조정
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)
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+
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410 |
+
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# 이벤트 핸들러 설정
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msg_store = gr.State("") # 사용자 메시지를 보존하기 위한 저장소
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+
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input_box.submit(
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lambda msg: (msg, msg, ""), # 메시지를 저장하고 입력을 지웁니다.
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inputs=[input_box],
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outputs=[msg_store, input_box, input_box],
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+
queue=False
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+
).then(
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user_message, # 사용자 메시지를 대화에 추가합니다.
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421 |
+
inputs=[msg_store, chatbot],
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outputs=[input_box, chatbot],
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+
queue=False
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424 |
+
).then(
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+
stream_gemini_response, # 응답을 생성하고 스트리밍합니다.
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426 |
+
inputs=[msg_store, chatbot],
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427 |
+
outputs=chatbot
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428 |
+
)
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+
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430 |
+
clear_button.click(
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+
lambda: ([], "", ""),
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+
outputs=[chatbot, input_box, msg_store],
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433 |
+
queue=False
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+
)
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+
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with gr.TabItem("사용 방법", id="instructions_tab"):
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gr.Markdown(
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"""
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## PharmAI: 당신의 전문 약리학 어시스턴트
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PharmAI에 오신 것을 환영합니��. PharmAI는 Google의 Gemini 2.0 Flash 모델로 구동되는 전문 챗봇입니다. PharmAI는 광범위한 약학 지식 데이터 세트("PharmKG")를 활용하여 약리학 주제에 대한 전문가 수준의 정보를 제공하도록 설계되었습니다.
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**주요 기능:**
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* **고급 약리학 통찰력**: PharmAI는 광범위한 약리학 지식 그래프를 기반으로 구조화되고 상세한 답변을 제공합니다.
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* **추론 및 추론**: 챗봇은 복잡하고 다면적인 질문을 처리하여 사용 가능한 정보로부터 추론하고 추론하는 능력을 보여줍니다.
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* **구조화된 응답**: 응답은 정의, 작용 메커니즘, 적응증, 투여량, 부작용, 약물 상호 작용, 약동학 및 해당되는 경우 참조 문헌을 포함하도록 논리적으로 구성됩니다.
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* **사고 과정 표시**: 모델이 응답을 생성할 때 모델의 사고 과정을 관찰할 수 있습니다(실험적 기능).
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* **대화 기록**: PharmAI는 이전 대화 부분을 기억하여 여러 번에 걸쳐 더 정확하고 관련성 있는 정보를 제공합니다.
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* **스트리밍 출력**: 챗봇은 대화형 경험을 위해 응답을 스트리밍합니다.
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**PharmAI 사용 방법:**
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1. **대화 시작**: "대화" 탭 아래의 입력 상자에 약리학 질문을 입력합니다. 챗봇은 특히 복잡한 약리학 질문을 처리하도록 설계되었습니다.
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2. **예제 프롬프트 사용**: 제공된 예제 질문을 사용하여 모델 작동 방식을 확인할 수 있습니다. 이러한 예제는 챗봇이 전문 지식을 보여주도록 하기 위해 고안되었습니다.
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3. **예제 프롬프트 지침**:
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* **작용 메커니즘**: 특정 약물이 분자 수준에서 어떻게 작용하는지 물어보세요. 예: "메트포르민의 작용 메커니즘을 설명하십시오."
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* **약물 대사**: 신체가 약물을 어떻게 처리하는지 문의하십시오. 예: "CYP450 효소와 약물 대사 간의 상호 작용을 설명하십시오..."
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* **임상적 의미**: 특정 질병을 치료하는 데 있어 약물의 임상적 사용에 대한 질문을 제기하십시오. 예: "심부전 치료에서 베타 차단제의 작용 메커니즘과 임상적 중요성에 대해 논의하십시오..."
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* **병태생리학 및 약물 표적**: 질병, 원인 및 약물이 질병을 치료할 수 있는 방법에 대해 문의하십시오. 예: "제2형 당뇨병의 병태 생리학을 설명하고 메트포르민이 어떻게 작용하는지 설명하십시오..."
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* **복합 다중 약물 상호 작용**: 신체에서 하나의 약물이 다른 약물에 어떻게 영향을 미칠 수 있는지에 대한 질문을 제기하십시오.
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* **전통 의학 관점**: 질병 및 치료에 대한 전통 의학(한방과 같은) 접근 방식에 대해 문의하십시오. 예: "한방적 관점에서 알츠하이머병 치료에 효과적인 천연 식물 물질과 그 메커니즘을 설명하십시오."
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4. **응답 검토**: 챗봇은 내부 처리 과정을 보여주는 "생각 중" 섹션과 함께 응답을 제시합니다. 그런 다음 정의, 작용 메커니즘, 적응증 등을 포함한 섹션과 함께 보다 구조화된 응답을 제공합니다.
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5. **대화 초기화**: "대화 초기화" 버튼을 사용하여 새 세션을 시작합니다.
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**주의 사항:**
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* '생각 중' 기능은 실험적이지만 응답을 생성할 때 모델이 수행한 단계를 보여줍니다.
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* 응답의 품질은 사용자 프롬프트에 따라 크게 달라집니다. 최상의 결과를 얻으려면 질문할 때 가능한 한 자세하게 설명하십시오.
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* 이 모델은 특히 약리학 정보에 초점을 맞추고 있으므로 이 범위를 벗어난 질문에는 관련성 있는 답변을 얻지 못할 수 있습니다.
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* 이 챗봇은 정보 제공용 리소스로 제공되며 의료 진단 또는 치료 권장 사항에 사용해서는 안 됩니다. 의료 상담이 필요한 경우 항상 의료 전문가와 상담하십시오.
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"""
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)
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# Launch the interface
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if __name__ == "__main__":
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demo.launch(debug=True)
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