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import os | |
import sys | |
import json | |
import tempfile | |
import pandas as pd | |
import gradio as gr | |
# 1) Ajuste de path ANTES de importar smi_ted_light | |
BASE_DIR = os.path.dirname(os.path.abspath(__file__)) | |
INFERENCE_PATH = os.path.join(BASE_DIR, "smi-ted", "inference") | |
sys.path.insert(0, INFERENCE_PATH) | |
from smi_ted_light.load import load_smi_ted | |
# 2) Carrega o modelo | |
MODEL_DIR = os.path.join(INFERENCE_PATH, "smi_ted_light") | |
model = load_smi_ted( | |
folder=MODEL_DIR, | |
ckpt_filename="smi-ted-Light_40.pt", | |
vocab_filename="bert_vocab_curated.txt", | |
) | |
# 3) Função que retorna STRING JSON + gr.update para o CSV | |
def gerar_embedding_e_csv(smiles: str): | |
smiles = smiles.strip() | |
if not smiles: | |
erro = {"erro": "digite uma sequência SMILES primeiro"} | |
return json.dumps(erro), gr.update(visible=False) | |
try: | |
vetor = model.encode(smiles, return_torch=True)[0].tolist() | |
# monta CSV | |
df = pd.DataFrame([vetor]) | |
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(suffix=".csv", delete=False) | |
df.to_csv(tmp.name, index=False) | |
tmp.close() | |
# retorna JSON-string e torna o link visível | |
return json.dumps(vetor), gr.update(value=tmp.name, visible=True) | |
except Exception as e: | |
erro = {"erro": str(e)} | |
return json.dumps(erro), gr.update(visible=False) | |
# 4) Interface Blocks | |
with gr.Blocks() as demo: | |
gr.Markdown( | |
""" | |
## SMI-TED Embedding Generator | |
Cole uma sequência SMILES e receba: | |
1. Uma **string JSON** com o vetor (Textbox) | |
2. Um link para **baixar o CSV** (File) | |
""" | |
) | |
with gr.Row(): | |
inp_smiles = gr.Textbox(label="SMILES", placeholder="Ex.: CCO") | |
btn = gr.Button("Gerar Embedding") | |
with gr.Row(): | |
out_text = gr.Textbox( | |
label="Embedding (JSON)", | |
interactive=False, | |
lines=4, | |
placeholder='Vai aparecer aqui o vetor como JSON...' | |
) | |
out_file = gr.File(label="Download do CSV", visible=False) | |
btn.click( | |
fn=gerar_embedding_e_csv, | |
inputs=inp_smiles, | |
outputs=[out_text, out_file] | |
) | |
if __name__ == "__main__": | |
demo.launch() | |