Spaces:
Sleeping
Sleeping
Update app.py
Browse files
app.py
CHANGED
@@ -3,21 +3,85 @@ import pandas as pd
|
|
3 |
import numpy as np
|
4 |
import pickle
|
5 |
import json
|
|
|
|
|
6 |
|
7 |
-
#
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
8 |
@st.cache_resource
|
9 |
def load_model():
|
10 |
with open('model.pkl', 'rb') as file:
|
11 |
model = pickle.load(file)
|
12 |
-
|
13 |
with open('scaler.pkl', 'rb') as file:
|
14 |
scaler = pickle.load(file)
|
15 |
-
|
16 |
with open('data.json', 'r', encoding='utf-8') as f:
|
17 |
data = json.load(f)
|
18 |
-
|
19 |
return model, scaler, data
|
20 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
21 |
model, scaler, data = load_model()
|
22 |
feature_list = data['features']
|
23 |
categorical_features = data['categorical_features']
|
@@ -27,91 +91,209 @@ group_names = data['group_names']
|
|
27 |
numeric_defaults = data['numeric_defaults']
|
28 |
categorical_defaults = data['categorical_defaults']
|
29 |
|
|
|
30 |
st.title('Классификатор пациентов')
|
31 |
|
32 |
-
#
|
33 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
34 |
input_data = {}
|
35 |
|
36 |
-
|
37 |
-
|
38 |
-
|
39 |
-
|
40 |
-
|
41 |
-
|
42 |
-
|
43 |
-
|
44 |
-
|
45 |
-
|
46 |
-
|
47 |
-
|
48 |
-
|
49 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
50 |
|
51 |
-
|
52 |
-
|
53 |
-
|
54 |
-
|
55 |
-
|
56 |
-
|
57 |
-
|
58 |
-
|
59 |
-
|
60 |
-
|
61 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
62 |
|
63 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
64 |
|
65 |
-
#
|
66 |
-
st.
|
67 |
-
|
68 |
-
Это приложение помогает классифицировать пациентов по группам на основе введенных параметров.
|
69 |
|
70 |
-
|
71 |
-
|
72 |
-
|
73 |
-
|
74 |
-
|
75 |
-
|
76 |
-
|
77 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
78 |
|
79 |
-
#
|
80 |
-
|
81 |
-
# Преобразование входных данных
|
82 |
-
input_df = pd.DataFrame([user_input])
|
83 |
|
84 |
-
#
|
85 |
-
|
|
|
|
|
|
|
86 |
|
87 |
-
|
88 |
-
|
89 |
-
|
|
|
|
|
|
|
90 |
|
91 |
-
|
92 |
-
|
93 |
-
|
94 |
-
|
|
|
|
|
95 |
|
96 |
-
|
97 |
-
X_pred = input_df_encoded[feature_list]
|
98 |
-
prediction = model.predict(X_pred)
|
99 |
-
probabilities = model.predict_proba(X_pred)[0]
|
100 |
|
101 |
-
#
|
102 |
-
st.
|
103 |
-
|
104 |
-
|
105 |
-
|
106 |
-
|
107 |
-
|
108 |
-
|
109 |
-
|
110 |
-
|
111 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
112 |
|
113 |
-
#
|
114 |
-
|
115 |
-
|
116 |
-
|
117 |
-
|
|
|
|
|
|
3 |
import numpy as np
|
4 |
import pickle
|
5 |
import json
|
6 |
+
import plotly.graph_objects as go
|
7 |
+
import plotly.express as px
|
8 |
|
9 |
+
# Настройка страницы
|
10 |
+
st.set_page_config(
|
11 |
+
page_title="Классификатор пациентов",
|
12 |
+
layout="wide",
|
13 |
+
initial_sidebar_state="expanded",
|
14 |
+
menu_items={
|
15 |
+
'About': "Классификатор пациентов для определения группы лечения"
|
16 |
+
}
|
17 |
+
)
|
18 |
+
|
19 |
+
# Применяем кастомный CSS
|
20 |
+
st.markdown("""
|
21 |
+
<style>
|
22 |
+
.stNumberInput input {
|
23 |
+
width: 150px;
|
24 |
+
}
|
25 |
+
.stSelectbox select {
|
26 |
+
width: 150px;
|
27 |
+
}
|
28 |
+
.main .block-container {
|
29 |
+
padding-top: 2rem;
|
30 |
+
padding-bottom: 2rem;
|
31 |
+
}
|
32 |
+
div[data-testid="stSidebarNav"] {
|
33 |
+
padding-top: 0rem;
|
34 |
+
}
|
35 |
+
.sidebar .sidebar-content {
|
36 |
+
width: 300px;
|
37 |
+
}
|
38 |
+
.metric-card {
|
39 |
+
background-color: #f0f2f6;
|
40 |
+
border-radius: 0.5rem;
|
41 |
+
padding: 1rem;
|
42 |
+
margin: 0.5rem 0;
|
43 |
+
}
|
44 |
+
.small-font {
|
45 |
+
font-size: 0.8rem;
|
46 |
+
}
|
47 |
+
</style>
|
48 |
+
""", unsafe_allow_html=True)
|
49 |
+
|
50 |
+
# Загрузка модели и данных
|
51 |
@st.cache_resource
|
52 |
def load_model():
|
53 |
with open('model.pkl', 'rb') as file:
|
54 |
model = pickle.load(file)
|
|
|
55 |
with open('scaler.pkl', 'rb') as file:
|
56 |
scaler = pickle.load(file)
|
|
|
57 |
with open('data.json', 'r', encoding='utf-8') as f:
|
58 |
data = json.load(f)
|
|
|
59 |
return model, scaler, data
|
60 |
|
61 |
+
def create_gauge_chart(value, title):
|
62 |
+
fig = go.Figure(go.Indicator(
|
63 |
+
mode = "gauge+number",
|
64 |
+
value = value * 100,
|
65 |
+
domain = {'x': [0, 1], 'y': [0, 1]},
|
66 |
+
title = {'text': title},
|
67 |
+
gauge = {
|
68 |
+
'axis': {'range': [None, 100]},
|
69 |
+
'bar': {'color': "darkblue"},
|
70 |
+
'steps': [
|
71 |
+
{'range': [0, 33], 'color': "lightgray"},
|
72 |
+
{'range': [33, 66], 'color': "gray"},
|
73 |
+
{'range': [66, 100], 'color': "darkgray"}
|
74 |
+
],
|
75 |
+
'threshold': {
|
76 |
+
'line': {'color': "red", 'width': 4},
|
77 |
+
'thickness': 0.75,
|
78 |
+
'value': value * 100
|
79 |
+
}
|
80 |
+
}
|
81 |
+
))
|
82 |
+
fig.update_layout(height=200)
|
83 |
+
return fig
|
84 |
+
|
85 |
model, scaler, data = load_model()
|
86 |
feature_list = data['features']
|
87 |
categorical_features = data['categorical_features']
|
|
|
91 |
numeric_defaults = data['numeric_defaults']
|
92 |
categorical_defaults = data['categorical_defaults']
|
93 |
|
94 |
+
# Основной заголовок
|
95 |
st.title('Классификатор пациентов')
|
96 |
|
97 |
+
# Описание в основной части
|
98 |
+
with st.container():
|
99 |
+
st.markdown("""
|
100 |
+
### О системе
|
101 |
+
Данная система помогает классифицировать пациентов по группам на основе введенных параметров.
|
102 |
+
|
103 |
+
#### Как использовать:
|
104 |
+
1. Заполните все поля в форме слева
|
105 |
+
2. Нажмите кнопку "Выполнить классификацию"
|
106 |
+
3. Получите результат с вероятностями принадлежности к каждой группе
|
107 |
+
|
108 |
+
#### Группы классификации:
|
109 |
+
- Контрольная группа
|
110 |
+
- Группа топирамата
|
111 |
+
- Группа леветирацетама
|
112 |
+
""")
|
113 |
+
|
114 |
+
# Боковая панель для ввода данных
|
115 |
+
with st.sidebar:
|
116 |
+
st.header('Ввод данных')
|
117 |
+
|
118 |
+
# Создаем вкладки для разных типов параметров
|
119 |
+
tab1, tab2 = st.tabs(["📊 Числовые", "📋 Категориальные"])
|
120 |
+
|
121 |
input_data = {}
|
122 |
|
123 |
+
with tab1:
|
124 |
+
# Числовые признаки
|
125 |
+
for i in range(0, len(numeric_features), 2):
|
126 |
+
col1, col2 = st.columns(2)
|
127 |
+
with col1:
|
128 |
+
if i < len(numeric_features):
|
129 |
+
feature = numeric_features[i]
|
130 |
+
default_value = float(numeric_defaults[feature])
|
131 |
+
input_data[feature] = st.number_input(
|
132 |
+
f'{feature}',
|
133 |
+
value=default_value,
|
134 |
+
format="%.2f",
|
135 |
+
help=f"Среднее: {default_value:.2f}"
|
136 |
+
)
|
137 |
+
with col2:
|
138 |
+
if i + 1 < len(numeric_features):
|
139 |
+
feature = numeric_features[i + 1]
|
140 |
+
default_value = float(numeric_defaults[feature])
|
141 |
+
input_data[feature] = st.number_input(
|
142 |
+
f'{feature}',
|
143 |
+
value=default_value,
|
144 |
+
format="%.2f",
|
145 |
+
help=f"Среднее: {default_value:.2f}"
|
146 |
+
)
|
147 |
|
148 |
+
with tab2:
|
149 |
+
# Категориальные признаки
|
150 |
+
for i in range(0, len(categorical_features), 2):
|
151 |
+
col1, col2 = st.columns(2)
|
152 |
+
with col1:
|
153 |
+
if i < len(categorical_features):
|
154 |
+
feature = categorical_features[i]
|
155 |
+
options = categorical_options[feature]
|
156 |
+
default_idx = options.index(categorical_defaults[feature]) if categorical_defaults[feature] in options else 0
|
157 |
+
input_data[feature] = st.selectbox(
|
158 |
+
f'{feature}',
|
159 |
+
options,
|
160 |
+
index=default_idx,
|
161 |
+
help=f"Типичное: {categorical_defaults[feature]}"
|
162 |
+
)
|
163 |
+
with col2:
|
164 |
+
if i + 1 < len(categorical_features):
|
165 |
+
feature = categorical_features[i + 1]
|
166 |
+
options = categorical_options[feature]
|
167 |
+
default_idx = options.index(categorical_defaults[feature]) if categorical_defaults[feature] in options else 0
|
168 |
+
input_data[feature] = st.selectbox(
|
169 |
+
f'{feature}',
|
170 |
+
options,
|
171 |
+
index=default_idx,
|
172 |
+
help=f"Типичное: {categorical_defaults[feature]}"
|
173 |
+
)
|
174 |
|
175 |
+
# Кнопка классификации
|
176 |
+
if st.button('Выполнить классификацию', use_container_width=True):
|
177 |
+
with st.spinner('Выполняется классификация...'):
|
178 |
+
# Преобразование входных данных
|
179 |
+
input_df = pd.DataFrame([input_data])
|
180 |
+
|
181 |
+
# One-hot encoding для категориальных признаков
|
182 |
+
input_df_encoded = pd.get_dummies(input_df, columns=categorical_features)
|
183 |
+
|
184 |
+
# Масштабирование числовых признаков
|
185 |
+
if numeric_features:
|
186 |
+
input_df_encoded[numeric_features] = scaler.transform(input_df_encoded[numeric_features])
|
187 |
+
|
188 |
+
# Убедитесь, что все необходимые столбцы присутствуют
|
189 |
+
for col in feature_list:
|
190 |
+
if col not in input_df_encoded.columns:
|
191 |
+
input_df_encoded[col] = 0
|
192 |
+
|
193 |
+
X_pred = input_df_encoded[feature_list]
|
194 |
+
prediction = model.predict(X_pred)
|
195 |
+
probabilities = model.predict_proba(X_pred)[0]
|
196 |
+
|
197 |
+
# Сохраняем результаты в session state
|
198 |
+
st.session_state['prediction'] = prediction[0]
|
199 |
+
st.session_state['probabilities'] = probabilities
|
200 |
+
st.session_state['input_data'] = input_df
|
201 |
|
202 |
+
# Отображение результатов в основной части
|
203 |
+
if 'prediction' in st.session_state:
|
204 |
+
st.header('Результаты классификации')
|
|
|
205 |
|
206 |
+
# Создаем контейнер для основных метрик
|
207 |
+
with st.container():
|
208 |
+
col1, col2, col3 = st.columns(3)
|
209 |
+
|
210 |
+
with col1:
|
211 |
+
st.markdown("""
|
212 |
+
<div class="metric-card">
|
213 |
+
<h3>Предсказанная группа</h3>
|
214 |
+
<h2 style="color: darkblue;">{}</h2>
|
215 |
+
</div>
|
216 |
+
""".format(group_names[str(st.session_state['prediction'])]), unsafe_allow_html=True)
|
217 |
+
|
218 |
+
with col2:
|
219 |
+
max_prob = max(st.session_state['probabilities'])
|
220 |
+
st.markdown("""
|
221 |
+
<div class="metric-card">
|
222 |
+
<h3>Уверенность модели</h3>
|
223 |
+
<h2 style="color: darkblue;">{:.1%}</h2>
|
224 |
+
</div>
|
225 |
+
""".format(max_prob), unsafe_allow_html=True)
|
226 |
+
|
227 |
+
with col3:
|
228 |
+
second_best_prob = sorted(st.session_state['probabilities'])[-2]
|
229 |
+
st.markdown("""
|
230 |
+
<div class="metric-card">
|
231 |
+
<h3>Вторая вероятная группа</h3>
|
232 |
+
<h2 style="color: darkblue;">{:.1%}</h2>
|
233 |
+
</div>
|
234 |
+
""".format(second_best_prob), unsafe_allow_html=True)
|
235 |
|
236 |
+
# Визуализация вероятностей
|
237 |
+
st.subheader('Распределение вероятностей по группам')
|
|
|
|
|
238 |
|
239 |
+
# График вероятностей
|
240 |
+
prob_df = pd.DataFrame({
|
241 |
+
'Группа': [group_names[str(i)] for i in range(len(group_names))],
|
242 |
+
'Вероятность': st.session_state['probabilities']
|
243 |
+
})
|
244 |
|
245 |
+
fig = px.bar(prob_df,
|
246 |
+
x='Группа',
|
247 |
+
y='Вероятность',
|
248 |
+
color='Вероятность',
|
249 |
+
color_continuous_scale='Blues',
|
250 |
+
text=prob_df['Вероятность'].apply(lambda x: f'{x:.1%}'))
|
251 |
|
252 |
+
fig.update_layout(
|
253 |
+
height=400,
|
254 |
+
yaxis_range=[0, 1],
|
255 |
+
yaxis_tickformat='.0%',
|
256 |
+
showlegend=False
|
257 |
+
)
|
258 |
|
259 |
+
st.plotly_chart(fig, use_container_width=True)
|
|
|
|
|
|
|
260 |
|
261 |
+
# Детальная информация
|
262 |
+
with st.expander("Детальная информация"):
|
263 |
+
tab1, tab2 = st.tabs(["📊 Введенные данные", "ℹ️ Пояснение"])
|
264 |
+
|
265 |
+
with tab1:
|
266 |
+
# Отображаем введенные данные в виде двух таблиц
|
267 |
+
col1, col2 = st.columns(2)
|
268 |
+
|
269 |
+
with col1:
|
270 |
+
st.subheader("Числовые параметры")
|
271 |
+
numeric_data = st.session_state['input_data'][numeric_features]
|
272 |
+
st.dataframe(numeric_data.T.style.format("{:.2f}"))
|
273 |
+
|
274 |
+
with col2:
|
275 |
+
st.subheader("Категориальные параметры")
|
276 |
+
categorical_data = st.session_state['input_data'][categorical_features]
|
277 |
+
st.dataframe(categorical_data.T)
|
278 |
+
|
279 |
+
with tab2:
|
280 |
+
st.markdown("""
|
281 |
+
### Как интерпретировать результаты:
|
282 |
+
|
283 |
+
- **Предсказанная группа** - основная рекомендованная группа для пациента
|
284 |
+
- **Уверенность модели** - вероятность принадлежности к предсказанной группе
|
285 |
+
- **Вторая вероятная группа** - вероятность принадлежности ко второй наиболее вероятной группе
|
286 |
+
|
287 |
+
### Примечания:
|
288 |
+
- Чем выше уверенность модели, тем надежнее предсказание
|
289 |
+
- При уверенности ниже 50% рекомендуется дополнительное обследование
|
290 |
+
- Результаты модели носят рекомендательный характер
|
291 |
+
""")
|
292 |
|
293 |
+
# Добавляем footer
|
294 |
+
st.markdown("""
|
295 |
+
---
|
296 |
+
<div class="small-font">
|
297 |
+
© 2023 Классификатор пациентов | Версия 1.0
|
298 |
+
</div>
|
299 |
+
""", unsafe_allow_html=True)
|