Los dos tipos de lisosomas son los peroxisomas, que es una vesícula que contiene oxidasas y catalasa. Se encuentra junto al RE liso de la célula animal. El segundo tipo de lisosma es el proteasoma, que es una pequeña estructura en forma de barril que contiene proteasas. Los lisosomas se distribuyen entre diferentes tipos de células eucariotas según su nivel de nutrientes. Las células que procesan una gran cantidad de nutrientes más grandes generalmente tendrán más lisosomas que otras células.