Die Kapillarelektrophorese ist eine analytische Trenntechnik der Elektrophorese. Die Kapillarelektrophorese ist eine hochauflösende Trenntechnik. Die Trennung von Ionen basiert auf der elektrophoretischen Mobilität von Ionen unter einer angelegten Spannung. Die Kapillarelektrophorese ist eine einfache Methode und kann für kleine Ionen bis hin zu Makromolekülen wie Proteinen, Peptiden, chiralen Verbindungen, Nukleinsäuren verwendet werden. Die Elektrophorese beinhaltet die Wanderung von Ionen und die entgegengesetzt geladenen Ionen werden von den entgegengesetzt geladenen Elektroden angezogen.