Vì coenzyme A, về mặt hóa học, là một thiol, nó có thể phản ứng với axit cacboxylic để tạo thành thioester, do đó hoạt động như một chất mang nhóm acyl. Nó hỗ trợ chuyển các axit béo từ tế bào chất đến ti thể. Một phân tử coenzyme A mang nhóm acetyl còn được gọi là acetyl-CoA.oenzyme A cũng là nguồn gốc của nhóm phosphopantetheine được thêm vào như một nhóm giả cho các protein như như protein mang acyl và formyltetrahydrofolate dehydrogenase.