माली की चार मुख्य नदियाँ नाइजर, बाफिंग, बकाये और सेनेगल हैं। माली में वनस्पति बहुत अधिक नहीं है। चूंकि यह सहारा रेगिस्तान का एक हिस्सा है, इस क्षेत्र में झाड़ियाँ और छोटी घास आम हैं। माली के अधिकांश लोग नाइजर नदी के किनारे रहते हैं। वह नाइजर नदी फौटा जललोन क्षेत्र में माली के लिए पानी का मुख्य स्रोत है। नाइजर नदी के पानी का उपयोग पीने, सिंचाई और औद्योगिक उपयोग के लिए किया जाता है।