Una FSA proporciona varios beneficios a un empleador. La contribución antes de impuestos del empleado a la FSA reduce la obligación tributaria FICA del empleador. Además, los empleadores que ofrecen FSA a los empleados podrían ahorrar en impuestos federales de desempleo (FUTA), impuestos estatales de desempleo (SUTA) e impuestos de compensación de trabajadores.