अधिकांश एचपीवी उपभेद वास्तव में कोई ध्यान देने योग्य लक्षण उत्पन्न नहीं करते हैं जबकि अन्य उपभेद कुछ लोगों में लक्षण उत्पन्न कर सकते हैं या नहीं भी कर सकते हैं। आप इसके बारे में जागरूक हुए बिना एचपीवी से संक्रमित हो सकते हैं क्योंकि इसके कोई स्पष्ट लक्षण नहीं हो सकते हैं। एचपीवी का सबसे आम लक्षण मौसा है; ये वायरस के कुछ उपभेदों द्वारा निर्मित हो सकते हैं। कुछ एचपीवी उपभेद भी हैं जो कुछ कैंसर में विकसित हो सकते हैं, मुख्य रूप से जननांग कैंसर।