Outros protistas incluem espécies patogênicas, como o cinetoplastídeo Trypanosoma brucei, que causa a doença do sono e espécies de Plasmodium apicomplexa que causam malária. Alguns protistas, às vezes chamados de protistas ambiregnais, foram considerados protozoários e algas ou fungos (por exemplo, fungos viscosos e algas flageladas), e os nomes dessas foram publicados em um ou ambos do ICN e do ICZN.