कनामाइसिन तीन मुख्य घटकों का मिश्रण है: कनामाइसिन ए, बी, और सी। कनामाइसिन ए कानामाइसिन का प्रमुख घटक है। प्रोकैरियोटिक और यूकेरियोटिक कोशिकाओं के खिलाफ उपयोग किए जाने पर इन घटकों के प्रभावों का व्यापक रूप से व्यक्तिगत यौगिकों के रूप में अध्ययन नहीं किया जाता है। केनामाइसिन प्रतिरोध जीन वाले प्लास्मिड के साथ परिवर्तित किए गए बैक्टीरिया को केनामाइसिन (50-100 ug/ml) पर चढ़ाया जाता है जिसमें अगर होता है। प्लेटों या मीडिया में केनामाइसिन (50-100 ug/ml) युक्त उगाए जाते हैं।