Dies wird oft als viraler Eintrag bezeichnet. Die Infektion von Pflanzen- und Pilzzellen unterscheidet sich von der von tierischen Zellen. Pflanzen haben eine starre Zellwand aus Zellulose und Pilze eine aus Chitin, so dass die meisten Viren erst nach einem Trauma der Zellwand in diese Zellen eindringen können. Einige Viren verursachen keine sichtbaren Veränderungen an der infizierten Zelle. Zellen, in denen das Virus latent und inaktiv ist, zeigen wenige Anzeichen einer Infektion und funktionieren oft normal. Dies führt zu anhaltenden Infektionen und das Virus ruht oft für viele Monate oder Jahre.