<s>[INST]İkincil teori nerede genlerin tutulduğunu söylüyor?[/INST]CpDNA'da, birkaç A → G deamination gradyanı vardır. DNA tek sarmallı olduğunda deaminasyon olaylarına duyarlı hale gelir. Çoğaltma çatalları oluştuğunda, kopyalanamayan iplik tek ipliklidir ve bu nedenle A → G deamination için risk altındadır. Bu nedenle, deaminasyondaki gradyanlar, çoğaltma çatallarının büyük olasılıkla mevcut olduğunu ve başlangıçta açılma yönlerini gösterir (en yüksek gradyan, en uzun süre tek telli olduğu için başlangıç ​​bölgesine en yakındır). Bu mekanizma bugün hala lider teoridir; bununla birlikte, ikinci bir teori, cpDNA'nın çoğunun aslında lineer olduğunu ve homolog rekombinasyon yoluyla kopyalandığını göstermektedir. Ayrıca, genetik materyalin sadece az bir kısmının dairesel kromozomlarda tutulduğu, geri kalanının ise dallanmış, doğrusal veya diğer karmaşık yapılarda bulunduğu iddia edilmektedir.</s>