<s>[INST]Hangi kodlama SNP'leri sıralayarak bir veri kümesinin heterojenliğini azaltır?[/INST]Genetik sıkıştırma algoritmaları, hem geleneksel sıkıştırma algoritmaları hem de spesifik veri tipine uyarlanmış genetik algoritmalar kullanılarak verileri (tipik olarak nükleotitlerin sekansları) sıkıştıran en son nesil kayıpsız algoritmalardır. 2012'de Johns Hopkins Üniversitesi'nden bir bilim adamı ekibi, sıkıştırma için referans genom kullanmayan bir genetik sıkıştırma algoritması yayınladı. HAPZIPPER, HapMap verileri için uyarlandı ve önde gelen genel amaçlı sıkıştırma araçlarından 2-4 kat daha iyi sıkıştırma ve çok daha hızlı sürede 20 kat sıkıştırma (dosya boyutunda% 95 azalma) elde etti. Bunun için Chanda, Elhaik ve Bader, SNP'leri küçük alel frekanslarına göre sıralayarak ve böylece veri setini homojenize ederek veri setinin heterojenliğini azaltan MAF bazlı kodlamayı (MAFE) tanıttı. 2009 ve 2013'teki diğer algoritmalar (DNAZip ve GenomeZip) 1200 kat'a kadar sıkıştırma oranlarına sahiptir - 6 milyar bazepair diploid insan genomunun 2.5 megabaytta depolanmasına izin verir (bir referans genomuna göre veya birçok genomun ortalaması alınarak).</s>