산림청,수목원의 운영,지방자치단체,식품부,농림축산식품부
현행법에 따라 시·도지사에게 등록한 수목원[등록수목원]은 연간 농림축산식품부령으로 정하는 일수 이상을 일반인이 이용할 수 있도록 개원하여야 하며, 만일 6개월 이상 계속 휴원하려면 미리 시·도지사에게 이를 신고하여야 하는 등 일정한 의무를 부담하기도 하나, 다른 한편으로는 국가 또는 지방자치단체로부터 수목원의 수목유전자원을 무상 또는 유상으로 우선적으로 제공받거나 운영에 필요한 경비를 예산의 범위에서 보조받을 수 있으며, 특히 산림청장 또는 지방자치단체의 장으로부터 정보교류 등을 위한 사업을 우선적으로 지원받을 수도 있다.