Spisak endofita
Endofite  su mikro-organizmi koji žive u tkivima  biljaka kao endosimbionti, bez izazivanja simptoma  bolesti.  Neke od njih su  mutualistički simbionti sa povoljnim efektima na domaćina, kao što su poboljšan rast ili otpor protiv bolesti ili okolišni stres, a koriste se kao mikrobni inokulanti. Međutim, patogen i saprofitni mogu biti endofiti u nekom dijelu svog životnog ciklusa. Endofiti se razlikuju od mikoriznih gljiva ili rizosfere mikroba koji žive u potpunosti unutar biljakaa. Većina poznatih endofita su bakterije ili gljive, iako postoje i neke endofitske alge i Oomycetes.

Ova lista sadrži rodova sa endofitskim vrstama (ali koje mogu imati  i ne-endofitske vrste). Vrste su navedeni samo u značajnim slučajevima. Gdje su samo specifične varijante ili kultivari jedne vrste endofiti, to je detaljno opisano na stranici  datog taksona. Raspon domaćina je "širok" kada se ne uključuje samo određene biljne  loze; u tom slučaju, data je  loza.

Bakterije
Također pogledajte: Rhizobia   za leguminoze koje fiksiraju azot (Fabaceae'').'

Gljive

Alge i Oomycete

Povezano 
Spisak simbiotskih organizama
Spisak simbiotskih međuodnosa
Patologija biljaka

Biota
Bakterije