Según la versión oficial del Gobierno cubano, su muerte es debida a una pancreatitis, pero según la disidencia interna cubana, la muerte de Juan Soto fue debida a una paliza de la policía del régimen comunista castrista.
Secondo il resoconto ufficiale del governo cubano, Juan Soto è morto di pancreatite; tuttavia, secondo i dissidenti che vivono a Cuba, la sua morte è stata causata dalle percosse della polizia del regime comunista di Castro.