sebelum rakernas berakhir, sempat terjadi beberapa kali interupsi seputar substansi maupun redaksional beberapa butir rekomendasi.
misalnya, utusan dari nusa tenggara timur berkeberatan atas rekomendasi yang menyebutkan pemerintah mengakomodasi aspirasi umat dalam menjalankan syariat islam sesuai dengan kondisi daerah masing-masing dalam bingkai nkri.