dari hasil penyidikan kejagung, rahardi disangka menyalahgunakan wewenang sehingga menimbulkan kerugian keuangan negara sebesar rp 54,6 milyar.
semasa menjabat menperindag/kepala bulog (23 mei 1998-29 oktober 1999), rahardi mengeluarkan memo yang memerintahkan deputi keuangan bulog achmad ruskandar untuk mengeluarkan dana nonbudgeter bulog sebesar rp 54,6 milyar.
menurut peraturan, dana itu hanya bisa dikeluarkan untuk keperluan stabilitas harga, pembangunan gedung, atau pembelian peralatan.
namun, dalam pelaksanaannya, penggunaan dana tersebut tidak jelas dan tidak dapat dipertanggungjawabkan.