pemilihan calon wapres berlangsung dalam rapat paripurna ke-5 sidang istimewa mpr yang dipimpin ketua mpr amien rais, rabu, didampingi lengkap para wakilnya.
dalam putaran pertama pemilihan, dari lima calon wapres, yakni agum gumelar yang dicalonkan fraksi perserikatan daulatul ummat, susilo bambang yudhoyono yang dicalonkan fraksi kesatuan kebangsaan indonesia dan 80 anggota mpr, akbar tandjung yang diajukan fraksi partai golkar, hamzah haz dari fraksi partai persatuan pembangunan dan dicalonkan pula oleh fraksi reformasi, serta siswono yudo husodo yang dicalonkan secara lintas fraksi oleh 78 anggota mpr, tersingkir dua nama yaitu siswono dan agum.
sementara dalam putaran kedua yang tersingkir yudhoyono.