tim penyelidik independen nasional untuk konflik maluku tersebut akan bertugas mencari hubungan atau keterkaitan berbagai peristiwa dan issue yang diduga menjadi penyebab kerusuhan.
ada sembilan issue dan peristiwa yang harus diselidiki, seperti peristiwa 19 januari 1999, issue tentang republik maluku selatan (rms), issue laskar kristus, issue forum kedaulatan maluku, issue laskar jihad, issue tentang pengalihan agama secara paksa, issue tentang pelanggaran hak asasi manusia, dan berbagai peristiwa pelanggaran hukum yang terkait erat dengan kerusuhan maluku.