ja'far umar thalib (41) ditangkap 4 mei 2002 karena kasus penghasutan dan penghinaan secara sengaja kepada presiden dalam ceramah-ceramahnya di ambon, maluku.
sedangkan ba'asyir (64) ditangkap 5 november 2002 dalam kaitannya dengan tuduhan rencana pembunuhan presiden megawati dan peledakan bom natal tahun 2000.