juwono mencatat sukses ali alatas dalam menyelesaikan tiga konflik, yakni konflik kamboja, konflik moro di filipina selatan, dan persengketaan di laut cina selatan.
di moro, alatas menawarkan model penyelesaian otonomi khusus, dan di laut cina selatan dengan menyelenggarakan serangkaian lokakarya untuk mencari penyelesaian atas tumpang tindih klaim.