与此同时，波希米亚新教派看准了神圣罗马帝国最微弱的时机，提出更多宗教自由的要求，鲁道夫在1609年签署文件（Majestätsbriefe）满足了他们的要求，赋予信奉新教的波希米亚和西里西亚贵族以宗教信仰自由和特权，这一举动成为了后来1618年开始的三十年战争导火索。
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