蜜环菌从根状茎的表皮细胞侵入，但表皮层和中柱层之间有一个隔离抑菌区，称为空腔细胞区，阻止了菌丝的继续侵入，而且天麻含有天麻抗真菌蛋白（ GAFP），这种蛋白在蜜环菌等真菌侵染时能积累於根状茎的表皮细胞，对它们的侵染产生强烈的抑制作用，这样根状茎就不会腐烂，天麻就能很好的利用侵入表皮深层的蜜环菌菌丝来摄取营养。
qr ʁʑn ɬk ʝɣ^n ɣ^ɣk tsʁʑɣ^r ɬqɣ^k çɣr ɕqʑr qn khqr ɕʑk qk r çʑr ɕqʑr qn ʝɣɣ^n ʁɣn tsʁɣ^k tsʁr ʝɣɣ^n tsʁqk ɬqʑk tɕhr tɕhqk ɣ^ɣr ɣ^ɣn qn tɕhqr ɬk k ʝʁɣɣ^k thɣqr χɣ^k qʑɣ^k khqr ɕʑk k tsr tsʁqr ɣr ɬk qk çɣr ɬqr khr qk r ɣn qɣr qʑk ʑn ʁʑn tɕhr qʑk ʑn χʑɣ^r tsʁɣk ɬk çʑr ɕʑqn (en)ɡˈafp(cmn) tsʁɣr tsʁɣ^r çʑr ɕʑqn tsʑqr qr ʁʑn ɬk çɣɣ^r tsʁɣk ɬk qk ʑr ʁqn ɣɣ^n ɬqk ɣqr tɕhk ɣ^ɣk tsʁʑɣ^r ɬqɣ^k çɣr ɕqʑr qn khqr ɕʑk çqr ʑk ɣr çɣr qk ʑr ʝʁʑr ʁɣɣ^k qʑɣ^n qɣr çɣr tɕhqr tsʁqr tsr tɕhɣ^r tsʁɣr tɕhʑɣ^r ɣ^ɣk tsʁʑɣ^r ɬqɣ^k ɬqr ɕr ʁqr xr ʑr qʑk ʑn ɬqr ɣɣ^n ʁɣr ʁʑr çɣr qr tɕhɣ^r qk r ɕqʑr qn ʁɣk ʝɣɣ^n çɣr qr ʁʑn ɬk ɬk qk ʑqn ʁɣr r tɕhqɣ^n tɕhʑɣ^r