臺廈郊諸紳見天后宮殘破，終於於1919年（大正八年）間決議鳩資修建，期間先向時任媽宮街長上瀧宇太郎申請獲得同意，並從福建延攬大批匠師；臺澎第一古碑「沈有容諭退紅毛番韋麻郎等」便是在此次整修過程中被挖掘出土，此碑一出，便奠定澎湖天后宮為台澎第一古廟的歷史地位。
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