日本的一些佛教寺院如京都府的大德寺、天龙寺、一休寺，静冈县的大福寺以及附近的民间企业也生产在宋代由中国学来的豆豉，叫做寺纳豆或盐辛纳豆，這就是納豆的辭源，不過传统制法的鹽味豆豉並沒有黏性而且味苦，後來日本人在偶然間發現了一種黏稠的大豆，現在納豆被用來描述這種方法製作的發酵品，於是成為了日本的獨有菜色。
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