乾隆五十一年十一月底（1787年1月）臺灣發生林爽文事件，福建巡撫徐嗣曾命蔡攀龍前往支援，蔡攀龍遂於該年十二月十四日（1787年2月1日）率師七百前往臺灣府城，協助平定事件，期間因在收復鳳山一事上立功，被任為臺灣北路協副將。
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