Apesar da função semelhante entre o BBB e o BCSFB, cada um facilita o transporte de diferentes substâncias para o cérebro devido às características estruturais distintas de cada um dos dois sistemas de barreira.
ˌɐpɨzˈaɹ dɐ fũŋsˈɐ̃ʊ̃ sˌemɨʎˈɐ̃ŋtɨ ˈeɪŋtɹɨ ʊ bˌebˌebˈe i ʊ bˌesˌeˈɛsʲˌɛfbˈe, kˈadɐ ũŋ fˌɐsilˈitɐ ʊ tɹˌɐ̃ŋspˈɔɾətɨ dɨ dˌifɨɾˈeɪŋtɨʃ sˌubstˈɐ̃ŋsjɐʃ pˌɐɾɐ ʊ sˈɛɾɨbɹʊ dˌevˈidw ɐɐʃ kˌɐɾɐtɨɾˈiʃtikɐz ʃtɹˌutuɾˈaɪʒ dˌiʃtˈiŋtɐʒ dɨ kˈadɐ ũŋ dʊʒ dˈoɪʃ sˌiʃtˈemɐʒ dɨ bˌɐʁˈeɪɾɐ.