Allori nasceu em Florença e recebeu as primeiras aulas de pintura de seu pai, Alessandro Allori, mas ficando insatisfeito com o desenho anatômico duro e a coloração fria deste último, entrou no ateliê de Gregorio Pagani, um dos dirigentes do escola florentina tardia, que buscava unir o colorido rico dos venezianos com a atenção florentina ao desenho.
ˌɐluɾˈi nɐsˈeʊ ˈeɪŋ flˌuɾˈeɪŋsɐ i ʁˌesɨbˈeʊ ɐʃ pɹˌimˈeɪɾɐz ˈaʊlɐʒ dɨ pˌiŋtˈuɾɐ dɨ seʊ pˈaɪ, ˌɐlɨsˈɐ̃ŋdɹw ˌɐluɾˈi, mɐʃ fˌikˈɐ̃ŋdw ˌiŋsɐtiʃfˈeɪtʊ kˈom ʊ dˌɨzˈeɲw ɐnɐtˈomikʊ dˈuɾw i ɐ kˌuluɾɐsˈɐ̃ʊ̃ fɹˈiɐ dˈeʃtɨ ˈultimʊ, eɪŋtɹˈow nʊ ˌɐtɨljˈe dɨ ɡɹˌeɡuɾˈiʊ pˌɐɡɐ̃nˈi, ũŋ dʊʒ dˌiɾiʒˈeɪŋtɨʒ dʊ ʃkˈɔlɐ flˌuɾeɪŋtˈinɐ tˌɐɾədˈiɐ, kɨ bˌuʃkˈavɐ unˈiɹ ʊ kˌuluɾˈidʊ ʁˈikʊ dʊʒ vˌenɨziˈɐ̃nʊʃ kˈom ɐ ˌɐteɪŋsˈɐ̃ʊ̃ flˌuɾeɪŋtˈinɐ aʊ dˌɨzˈeɲʊ.