O controlo negativo é utilizado em apenas algumas técnicas e consiste num corte de tecido onde não existe a substância/estrutura ou esta foi retirada por processos químicos/físicos e que irá demonstrar se existe coloração inespecíficas, ou seja, estruturas que não devem corar por uma técnica, coram.
ʊ kˌuŋtɹˈolʊ nˌeɡɐtˈivw ɛ ˌutilizˈadw ˈeɪŋ ˌɐpˈenɐz ˌɑlɡˈumɐʃ tˈɛknikɐz i kˌuŋsˈiʃtɨ nũŋ kˈɔɾətɨ dɨ tˌesˈidw ˈoŋdɨ nˌɐ̃ʊ̃ ˌezˈiʃtɨ ɐ sˌubstˈɐ̃ŋsjɐ ʃtɹˌutˈuɾɐ ˈow ˈɛʃtɐ foɪ ʁˌetiɾˈadɐ puɹ pɹˌusˈɛsʊʃ kˈimikʊʃ fˈizikʊz i kɨ iɾˈa dˌɨmuŋstɹˈaɹ sɨ ˌezˈiʃtɨ kˌuluɾɐsˈɐ̃ʊ̃ ˌinɨʃpɨsˈifikɐʃ, ˈow sˈeʒɐ, ʃtɹˌutˈuɾɐʃ kɨ nˌɐ̃ʊ̃ dˈɛveɪŋ kuɾˈaɹ puɹ ˌumɐ tˈɛknikɐ, kˈɔɾɐ̃ʊ̃.