Há dúvidas quanto à origem do nome da cidade, alguns estudiosos afirmam que a expressão "São Sebastião" foi devido à exigência de uma capela, erguida por uma família feita em homenagem ao Santo.
ɐ dˈuvidɐʃ kwˈɐ̃ŋtw ˌaː ˌɔɾˈiʒeɪŋ dʊ nˈomɨ dɐ sˌidˈadɨ, ˌɑlɡˈũŋʃ ʃtˌudiˈɔzʊz ˌɐfˈiɾəmɐ̃ʊ̃ kɨ ɐ ˌespɹɨsˈɐ̃ʊ̃ "sɐ̃ʊ̃ sˌebɐʃtiˈɐ̃ʊ̃" foɪ dˌevˈidw ˌaː ˌeziʒˈeɪŋsjɐ dɨ ˌumɐ kˌɐpˈɛlɐ, ˌeɾəɡˈidɐ puɹ ˌumɐ fɐmˈiljɐ fˈeɪtɐ ˈeɪŋ ˌumɨnˈaʒeɪŋ aʊ sˈɐ̃ŋtʊ.