Segundo Von Martius, célebre botânico alemão do século XIX, a palavra Oiapoque vem do tupi Oyapok e significa «[águas] que saltam por diversas partes», teoria que é corroborada pelo historiador João Barbosa Rodrigues, o qual também acredita na interpretação «águas que se arrebentam» ou «rio das corredeiras, encachoeirado».
sˌeɡˈũŋdʊ fɔn mɐɾətˈiʊʃ, sˈɛlɨbɹɨ bˌutˈɐ̃nikw ˌɐlɨmˈɐ̃ʊ̃ dʊ sˈɛkulʊ dˌɨzɐnˈɔvɨ, ɐ pˌɐlˈavɹɐ ˌoɪɐpˈɔkɨ vˈeɪŋ dʊ tupˈi ˌɔɪɐpˈok i sˌiɡnifˈikɐ «ˈaɡwɐʃ kɨ sˈɑltɐ̃ʊ̃ puɹ dˌivˈɛɾəsɐʃ pˈaɾətɨʃ», tˈiuɾˈiɐ kɨ ɛ kˌuʁubuɾˈadɐ pˈelw ˌiʃtuɾˌiɐdˈoɹ ʒuˈɐ̃ʊ̃ bˌɐɾəbˈɔzɐ ʁˌudɹˈiɡɨʃ, ʊ kwˈɑl tɐ̃mbˈeɪŋ ˌɐkɹɨdˈitɐ nɐ ˌiŋtɨɾəpɹˌetɐsˈɐ̃ʊ̃ «ˈaɡwɐʃ kɨ sɨ ˌɐʁɨbˈeɪŋtɐ̃ʊ̃» ˈow «ʁˈiʊ dɐʃ kˌuʁɨdˈeɪɾɐʃ, ˌeɪŋkɐʃˌueɪɾˈadʊ».