بقعهٔ امامزاده جعفر در زمان سلطنت شاه طهماسب صفوی ساخته شد و محراب داخلی حرم در قسمت جنوب بنای بقعه قرار دارد؛ ازارهٔ داخلی مقبره تا ارتفاع ۱٫۵ متری با کاشی‌های معرق فیروزه‌ای، مشکی، زرد و سفید بر زمینهٔ لاجوردی با نقوش تزیینی اسلامی تزئین شده و در اواخر دوران پهلوی، بالای ازارهٔ داخل حرم و گنبد نیز کاملاً آینه‌کاری شده‌است .
boq1ˈeje ˌemɑmzˈɑdeː dʒˈaʔfar dˈar zamˈɑn saltˈanat ʃˈɑːh tahmˈɑsb safˈavi sˈɑxteː ʃˈod vˈa mˈehrɑb dˈɑxelˌi hˈaram dˈar q1ˈesmat dʒˈonuːb banˈɑje bˈoq1e q1arˈɑr dˈɑrad ˈaːzˈɑreːjˌe dˈɑxelˌi maq1bˈareː tɑː ˌertefˈɑʔ jˈek vˈirɡul pˈandʒ mˈetri bɑ kˈɑʃihˈɑje moʔˈarraq1 firˈuːzeːˈiː mˈeʃki zˈard vˈa sˈefid bar zˌaminˈeːje lˌɑdʒevˈardi bɑ nˈoq1uʃ tazˈiːni eslˈɑmi tˈazʔin ʃˈodeː vˈa dˈar avˈɑxer dˈoːrɑn pahlˈavi bˈɑlɑjˌe ˈaːzˈɑreːjˌe dˈɑxel hˈaram vˈa ɡˈonbad nˈiz kˈɑmelˌan ɑjˈeneːkˈɑri ʃˈodeːˈast .