بنا به اظهار دادستان محاکمه عمال شهربانی، فرخی در بیمارستان زندان، به وسیله تزریق آمپول هوا توسط پزشک احمدی کشته شد، اگرچه گواهی رئیس زندان حاکی از فوت فرخی بر اثر ابتلا به مالاریا و نفریت است .
bˈanɑ beː ˈezhɑr dˈɑdsetˌɑn mˌohɑkˈemeː ʔˈommɑl ʃahrbˈɑni farrˈoxi dˈar bimˈɑrestˌɑn zendˈɑn beː vasˈileː tˈazriq1 ˈɑmpuːl hˈavɑ tˌavassˈote pˈezeʃk ˈaːhmadˌi kˈoʃteː ʃˈod ˌaɡˈartʃe ɡavˈɑhi rˈaiːs zendˈɑn hˈɑki az fˈuːt farrˈoxi bar ˈaːsar ebtˈelɑ beː mˈɑlˈɑriˈɑ vˈa nˈefrit ˈast .