پژوهشکده‌ها می‌توانند غیردولتی و مستقل باشند و هم‌اکنون بیش از دویست مؤسسه پژوهشی غیردولتی از وزارت علوم مجوز دریافت کرده‌اند
pˌaʒuheʃkˈadehɑ mitˈavɑnˌand q1ˈejredˈolatˌi vˈa mostˈaq1el bˈɑʃand vˈa hˈamˈaːknuːn bˈiʃ az dˈevist mˌoʔassˈeseː pˌaʒuhˈeʃi q1ˈejredˈolatˌi az vezˈɑrat ˈoluːm modʒˈavvez dˈarjɑft kˈardeːˈand