ˈotɾos ˌelemˈɛntos kˌaɾakteɾˈistikos ðe los xenˈomas ðe las aɾkˈeas sˈon la ˌoɾɣanˌiθaθjˈon de xˈenes ðe funθjˈon rˌelaθjonˈaða, tˈales kˌomo las enθˈimas ke kˌatalˈiθan las etˈapas ðe la mˈisma rˈuta mˌetaβˈolika, nwˈeβos ˌopeɾˈones i ɣɾˈandes ðˌifeɾˈɛnθjas eŋ xˈenes ˈaɾnt i sus ˌaminˌoaθˈil ˈaɾnt sˌintetˈasas.
Otros elementos característicos de los genomas de las arqueas son la organización de genes de función relacionada, tales como las enzimas que catalizan las etapas de la misma ruta metabólica, nuevos operones y grandes diferencias en genes ARNt y sus aminoacil ARNt sintetasas.