kiθˈa la pɾimˈeɾa menθjˈon ekstˈɛnsa ðe la kwˈeβa ðe ˌatapwˈeɾka se ˈaʎe en la kɾˈonika βuɾlˈeska ðel ˌempeɾaðˈoɾ kˈaɾlos ˈuβe, de ðˈom fɾanθˈes ðe θˈuɲiɣa, kjen dˌokumˈɛnta ˈampliamˈente ˈuna βisˈita a la mˈisma "aðˌonde fwˈe ˈuna βatˈaʎa ðel rˈeɪ ðˈon sˈantʃo ðe kastˈiʎa i el rˈeɪ ðˈoŋ ɡaɾθˈia ðe naβˈara", rˌealiθˈaða en mˈil kinjˈɛntos βˌeɪntisjˈete poɾ βˈaɾjos nˈoβles ðe la kˈoɾte kon motˈiβo ðe leʝˈɛndas rˌefeɾˈiðas a la ˌeksistˈɛnθja ðe fantˈasmas en la mˈisma.
Quizá la primera mención extensa de la cueva de Atapuerca se halle en la Crónica burlesca del emperador Carlos V, de don Francés de Zúñiga, quien documenta ampliamente una visita a la misma "adonde fue una batalla del rey don Sancho de Castilla y el rey don García de Navarra", realizada en 1527 por varios nobles de la corte con motivo de leyendas referidas a la existencia de fantasmas en la misma.