ˌɛfˌɛftˌɛvˈu vˌɨkɔʒɨstˈujɛ pˈɔza stˌandardɔvˈɨmi vˌarjantˈami ˌalɡɔrˈɨtmu ˌɛfˌɛftˈɛ tsɔˈɔlɛjtukˈɛja dˈɔbrɨ dla pˈɔtɛŋɡ dvˈa, rˈuvɲʲɛʃ ˌalɡɔrˈɨtmɨ pʃɨdˈatnɛ dla pˈɔtɛŋɡ dˈuʒɨx lˈitʃp pʲˈɛrʃɨx tˈakʲɛ jˈak alɡˈɔrɨtm ˌɛfˌɛftˈɛ radˈɛra ˌɔras alɡˈɔrɨtm ˌɛfˌɛftˈɛ blˌuɛʃtˈajna.
FFTW wykorzystuje poza standardowymi wariantami algorytmu FFT Cooley-Tukeya (dobry dla potęg 2), również algorytmy przydatne dla potęg dużych liczb pierwszych – takie jak algorytm FFT Radera oraz algorytm FFT Bluesteina.