bˌoʊθɹəkˈɑːɹɹə wʌz fˈɜːst pɹəpˈoʊzd æz ɐ mˌɑːnoʊspɪsˈɪfɪk dʒˈɛnəs ɪn wˈʌn θˈaʊzənd ˈeɪthˈʌndɹɪd nˈaɪnti baɪ ðɪ ɐmˈɛɹɪkən ˌɪkθɪˈɑːlədʒˌɪst tˈɑːɹɹəltən hˈɑːfmən bˈiːn wɛn hiː dᵻskɹˈaɪbd bˌoʊθɹəkˈɑːɹɹə mˈɑːliz fɹʌm kˈeɪp sənt. dʒˈeɪmz, ɪn hˈeɪdə ɡwˈaɪi, bɹˈɪɾɪʃ kəlˈʌmbiə.
Bothrocara was first proposed as a monospecific genus in 1890 by the American ichthyologist Tarleton Hoffman Bean when he described Bothrocara mollis from Cape St. James, in Haida Gwaii, British Columbia.