BglII
BglII என்பது பேசிலஸ் குளோபிகியின் சில விகாரங்களிலிருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்ட ஒரு வகை II கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்லீஸ் ஆகும். கட்டுப்பாட்டு நொதிகளின் முக்கிய செயல்பாடு வெளிநாட்டு டி. என். ஏவிலிருந்து புரவலன் மரபணுவைப் பாதுகாப்பதாகும், ஆனால் அவை மறுசீரமைப்பு மற்றும் இடமாற்றத்திலும் சில ஈடுபாட்டைக் கொண்டிருக்கலாம். பெரும்பாலான வகை II கட்டுப்பாடு என்சைம்களைப் போலவே, BglII இரண்டு ஒத்த துணை அலகுகளைக் கொண்டுள்ளது, அவை டிஎன்ஏ இரட்டை ஹெலிக்ஸைச் சுற்றி ஒரு ஹோமோடைமரை உருவாக்குகின்றன. ஒவ்வொரு மோனோமரும் 223 அமினோ அமிலங்கள் மற்றும் தனித்துவமான பாலிண்ட்ரோமிக் நியூக்ளியோடைடு வரிசை AGATCT இன் இரு பக்கங்களையும் சமச்சீராக பிணைக்கிறது, டிஎன்ஏ மூலக்கூறின் இரு இழைகளிலும் முதல் அடினைன் மற்றும் குவானைன் நியூக்ளியோடைடுகளுக்கு இடையிலான சிசைல் பாஸ்போடிஸ்டர் பிணைப்பை பிளவுபடுத்தி, 5 'முனை ஓவர்ஹாங்குகளுடன் ஒட்டும் முனைகளை உருவாக்குகிறது. வகை II கட்டுப்பாடு நொதியாக இருப்பதால், BglII க்கு அதன் நொதி செயல்பாட்டிற்கு ATP (அடினோசின் ட்ரைபாஸ்பேட்) தேவையில்லை, ஆனால் ஒரு இரும உலோக நேர்மின் அயனியுடன் மட்டுமே தொடர்பு தேவைப்படுகிறது, பெரும்பாலும் Mg2 +. அதன் வகுப்பின் பிற கட்டுப்பாட்டு என்சைம்களைப் போலல்லாமல், BglII ஒரு β-சாண்ட்விச் துணை டொமைன் போன்ற சில தனித்துவமான கட்டமைப்பு பண்புகளைக் கொண்டிருப்பதாகக் காட்டப்பட்டுள்ளது, மேலும் டைமெரைசேஷனில் ஒரு தனித்துவமான இணக்க மாற்றத்திற்கு உட்படுத்தப்படுவதாகத் தெரிகிறது, ஆனால் அதன் ஒட்டுமொத்த கட்டமைப்பும் வினையூக்கத்தின் பொறிமுறையும் மற்ற வகை II கட்டுப்பாட்டு என்சைம்களுடன் ஒத்துப்போகின்றன. நவீன மூலக்கூறு குளோனிங் நுட்பங்களில் கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்ளியேஸ்கள் மிக முக்கியமான பங்கைக் கொண்டுள்ளன. அவற்றின் தனித்துவமான அங்கீகாரம்/வெட்டு தளங்கள் காரணமாக, குறிப்பிட்ட இடங்களில் டி. என். ஏவை துல்லியமாக வெட்டுவதற்கு கட்டுப்பாடு என்சைம்களைப் பயன்படுத்தலாம். வெட்டப்பட்டவுடன், டிஎன்ஏ (வழக்கமாக) "ஒட்டும் முனைகள்" என்று அழைக்கப்படுகிறது, இது டிஎன்ஏ துண்டு ஒரு டிஎன்ஏ திசையனாக கலக்கப்பட அனுமதிக்கும். அடுத்தடுத்த டிஎன்ஏ குளோனிங்கிற்காக விரும்பிய துண்டுகளை திசையனுடன் சகப்பிணைப்புடன் இணைக்க லிகேட்டிங் என்சைம்கள் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. பொறிமுறை BglII தண்ணீருக்கு ஒரு பாஸ்பரில் பரிமாற்றத்தின் மூலம் டிஎன்ஏ முதுகெலும்பு மீது பாஸ்போடிஸ்டர் பிணைப்பு பிளவுகளை ஊக்குவிக்கிறது. கட்டுப்பாட்டு நொதிகளின் பொறிமுறை குறித்த ஆய்வுகள் கிட்டத்தட்ட அனைத்து நிகழ்வுகளிலும் உண்மையாகத் தோன்றும் பல பொதுவான அம்சங்களை வெளிப்படுத்தியுள்ளன, இருப்பினும் ஒவ்வொரு நொதிக்கும் உண்மையான வழிமுறை பெரும்பாலும் இந்த பொதுவான பொறிமுறையின் சில மாறுபாடுகளாகும். இந்த செயல்முறைக்கு தண்ணீரிலிருந்து ஹைட்ராக்சைடு அயனியை உருவாக்க ஒரு காரம் தேவைப்படுகிறது, இது நியூக்ளியோஃபைலாக செயல்படும் மற்றும் பாஸ்போடிஸ்டர் பிணைப்பில் உள்ள பாஸ்பரஸைத் தாக்கும். பென்டாகோஆர்டினேட்டட் ட்ரான்ஸிஷன் ஸ்டேட் பாஸ்பரஸின் கூடுதல் எதிர்மறை மின்னூட்டத்தை உறுதிப்படுத்த ஒரு லூயிஸ் அமிலமும், அதே போல் வெளியேறும் குழுவை (3 '-O−) நிலைநிறுத்தும் ஒரு பொதுவான அமிலம் அல்லது உலோக அயனியும் தேவைப்படுகிறது. கட்டமைப்பு கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்ளியேஸ்கள் சிறிய வரிசை ஒற்றுமையைக் காட்டுகின்றன என்றாலும், படிக கட்டமைப்புகள் அவை அனைத்தும் மிகவும் ஒத்த α/β மையத்தைப் பகிர்ந்து கொள்கின்றன என்பதை வெளிப்படுத்துகின்றன, இதில் ஆறு இழைகள் கொண்ட β-தாள் ஐந்து α-ஹீலிச்களால் சூழப்பட்டுள்ளது, அவற்றில் இரண்டு டைமெரைசேஷனை மத்தியஸ்தம் செய்கின்றன. இந்த மையப்பகுதி செயலில் உள்ள தளம் (வினையூக்கி மையம்) மற்றும் முக்கிய பள்ளத்தில் டி. என். ஏவைத் தொடர்பு கொள்ளும் எச்சங்களைக் கொண்டுள்ளது. பி. ஜி. எல். ஐ. ஐ தனித்துவமானது, அதன் α/β கோர் ஒரு β-சாண்ட்விச் துணை டொமைனால் அதிகரிக்கப்படுகிறது, இது டிஎன்ஏவைப் பிடிக்க வெளிப்புறமாக நீட்டிக்கும் பல கணிப்புகளைக் கொண்டுள்ளது, இது பி. ஜி. எல். ஐ. ஐ டிஎன்ஏ மூலக்கூறை முழுமையாகச் சுற்றி வர அனுமதிக்கிறது. BglII இன் இந்த வித்தியாசமான அம்சம் டிஎன்ஏ பிணைப்பு மற்றும் வெளியீட்டிற்கான ஒரு தனித்துவமான கீல் இயக்கத்தை பரிந்துரைக்கிறது. இலவச நொதி மற்றும் பி. ஜி. எல். ஐ. ஐ-டி. என். ஏ வளாகத்தின் ஒப்பீட்டு கட்டமைப்பு ஆய்வுகள், நொதி ஒரு வியத்தகு கத்தரிக்கோல் போன்ற இயக்கத்தால் திறக்கிறது என்பதைக் காட்டுகிறது, அதனுடன் டைமர் இடைமுகத்தில் α-ஹெலிச்களின் முழுமையான மறுசீரமைப்பும் உள்ளது. இந்த கட்டமைப்பு ஆய்வுகள் ஒவ்வொரு மோனோமருக்கும்ள் எச்சங்களின் தொகுப்பு குறைகிறது அல்லது மாற்றாக பிரிக்கப்படுகிறது அல்லது செயலில் உள்ள தள எச்சங்களை அம்பலப்படுத்துகிறது என்பதையும் வெளிப்படுத்தியது. இலவச மற்றும் பிணைக்கப்பட்ட நொதியின் கட்டமைப்பில் உள்ள இந்த வியத்தகு வேறுபாடுகள் வேறு எந்த கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்லீஸிலும் இன்னும் காணப்படவில்லை, மேலும் டிஎன்ஏவைச் சுற்றி வரும் பிற புரதங்களுக்கு நீட்டிக்கக்கூடிய டிஎன்ஏவைப் பிடிப்பதற்கான ஒரு புதிய பொறிமுறையைக் குறிக்கலாம். ஆக்டிவ் சைட் எண்டோநியூக்ளியேஸ்களின் கட்டமைப்பு ஆய்வுகள் பலவீனமான ஒருமித்த வரிசையான Glu/ASP-(X) 9-20-Glu/ASP/Ser-X-Lys/Glu ஐப் பின்பற்றும் எச்சங்களுடன் ஆக்டிவ் சைட்டிற்கான ஒத்த கட்டமைப்பை வெளிப்படுத்தியுள்ளன. BglII இன் செயலில் உள்ள தளம் பிற எண்டோநியூக்ளியேஸ்களைப் போலவே உள்ளது, இது ASP-(X) 9-Glu-X-Gln வரிசையைப் பின்பற்றுகிறது. அதன் செயலில் உள்ள இடத்தில் ஒரு இரும உலோக நேர்மின் அயனி உள்ளது, பெரும்பாலும் Mg2 +, இது ஆஸ்ப்-84, வால்-94, ஒரு பாஸ்பரில் ஆக்ஸிஜன் மற்றும் மூன்று நீர் மூலக்கூறுகளுடன் தொடர்பு கொள்கிறது. இந்த நீர் மூலக்கூறுகளில் ஒன்று, சிசைல் பாஸ்பரிலுக்கு அருகாமையில் இருப்பதால் (அதன் நோக்குநிலை ஜி. எல். என்-95 இன் பக்க சங்கிலி அமைடு ஆக்ஸிஜனுடன் ஹைட்ரஜன் பிணைப்பால் சரி செய்யப்படுகிறது) மற்றும் உலோக நேர்மின் அயனியுடன் அதன் தொடர்பு (இது அதன் பி. கே. ஏ ஐ குறைக்கிறது, இது நீரின் நியூக்ளியோஃபிலிசிட்டியை ஊக்குவிக்கிறது) காரணமாக ஒரு நியூக்ளியோஃபைலாக செயல்பட முடியும். பாசிலஸ் அமிலோலிக்விஃபேசியன்ஸ் ஃபோக்ஐ-இன் நியூக்ளியேஸ் என்சைமான பாம்ஐஐ-ஐயும் பார்க்கவும், ஃபிளாவோபாக்டீரியம் ஒகெனோகோயிட்ஸ் ஈகோஆர்ஐ-இன் நியூக்ளியேஸ் என்சைம், ஈ. கோலி குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் என்சைம் தரவுத்தளம் என்சிபிஐ புரோட்டீன் தரவுத்தளம் நுழைவு அமைப்பு சுருக்கம், எம்எம்டிபி பிஜிஎல்ஐஐ, மூலக்கூறு உயிரியல் பாக்டீரியா என்சைம்கள் கட்டுப்பாடு என்சைம்கள்