Planarian secretory cell nidovirus
பிளானேரியன் சுரக்கும் செல் நிடோவைரஸ் (பி. எஸ். சி. என். வி) என்பது பிளானிடோவைரஸ் 1 இனத்தின் ஒரு வைரஸ் ஆகும், இது ஒரு நிடோவைரஸ் அதன் மிகப் பெரிய மரபணுவிற்கு குறிப்பிடத்தக்கது. 41. 1 கிலோபேஸ்களில், இது ஒரு ஆர்என்ஏ வைரஸின் மிகப்பெரிய அறியப்பட்ட மரபணு ஆகும். இது பிளானேரியன் பிளாட்வார்ம் ஷ்மிட்டியா மெடிடெரேனியாவின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்களை ஆய்வு செய்வதன் மூலம் கண்டுபிடிக்கப்பட்டது, மேலும் இது பிளானேரியர்களைப் பாதிக்கும் முதல் அறியப்பட்ட ஆர்என்ஏ வைரஸ் ஆகும். இது முதன்முதலில் 2018 இல் விவரிக்கப்பட்டது. மரபணு மற்றும் வெளிப்பாடு பி. எஸ். சி. என். வி மரபணு 41.1 கிலோபேஸ்கள் நீளமானது, இது ஒரு ஆர்என்ஏ வைரஸில் அறியப்பட்ட மிகப்பெரிய மரபணு ஆகும். இது கரோனாவைரஸ்களை விட கணிசமாக பெரியது, பெரிய மரபணுக்களுக்கு அறியப்பட்ட நிடோ வைரஸ்களின் மற்றொரு குழு, அவை பொதுவாக 27-32 kb வரம்பில் உள்ளன. பி. எஸ். சி. என். வி ஒரு அசாதாரண மரபணு அமைப்பைக் கொண்டுள்ளது, இது ஒரு மிகப் பெரிய திறந்த வாசிப்பு சட்டகத்தைக் (ஓஆர்எஃப்) கொண்டுள்ளது, இது 13,556 அமினோ அமிலங்களின் பாலிப்ரோடைனை குறியாக்கம் செய்கிறது-இது ஒரு ஆர்என்ஏ வைரஸால் குறியிடப்பட்டதாக அறியப்படும் மிகப்பெரிய புரதமாகும். மரபணுவின் உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு இது நியதிசார் நிடோவைரஸ் மரபணுக்களைப் போலவே ஒழுங்கமைக்கப்பட்டுள்ளதாகக் கூறுகிறது, இதில் ORF1a மற்றும் ORF1b ஆகியவை வைரஸ் அல்லாத கட்டமைப்பு புரதங்களையும், மரபணுவின் 3 'முனையில் உள்ள கூடுதல் ORF களும் வைரஸ் கட்டமைப்பு புரதங்களையும் குறியாக்கம் செய்கின்றன; இருப்பினும், PSCNV இல், இந்த ORF கள் இணைக்கப்பட்டு, அதன் விளைவாக பாலிப்ரோடைன் புரோட்டியோலிடிகல் முறையில் செயலாக்கப்படுகிறது. மற்ற நிடோ வைரஸ்கள் இரண்டு ORF களால் குறியிடப்பட்ட புரதங்களின் ஸ்டோக்கியோமெட்ரியை ஒழுங்குபடுத்த ORF1a ஐ ORF1b இலிருந்து பிரிக்கும் ஒரு திட்டமிடப்பட்ட ரைபோசோமல் பிரேம்ஷிஃப்ட்டைப் பயன்படுத்தும் போது, PSCNV மரபணு ஒப்பீட்டு புரத வெளிப்பாட்டைக் கட்டுப்படுத்த ஒரு மாற்று பிரேம்ஷிஃப்ட் பொறிமுறையைக் கொண்டிருக்கும் என்று கணிக்கப்பட்டுள்ளது. மற்ற நிடோவைரஸ் மரபணுக்களுடன் ஒப்பிடுகையில், ORF1b உடன் தொடர்புடைய பகுதி-இது முக்கிய வைரஸ் பிரதி கூறுகளை குறியாக்கம் செய்கிறது-PSCNV மரபணுவில் மிகவும் விரிவடைந்துள்ளது. புரதக் கூறுகள் பாதுகாக்கப்பட்டவை பி. எஸ். சி. என். வி மரபணு அடையாளம் காணக்கூடிய புரதக் களங்களை குறியாக்கம் செய்கிறது, அவை நிடோ வைரஸ்களிடையே பாதுகாக்கப்பட்டுள்ளன-அதாவது முக்கிய புரோட்டீஸ் (3 சி. எல் போன்ற புரோட்டீஸ்) இரு முனைகளிலும் டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் களங்களால் சூழப்பட்டுள்ளது, ஒரு நியூக்ளியோடிடைல் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் களம் நீரான், ஆர்என்ஏ-சார்ந்த ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் (ஆர்டிஆர்பி), ஒரு துத்தநாக-பிணைப்பு களம் மற்றும் ஒரு ஹெலிகேஸ். இது மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ்களையும் கொண்டுள்ளது-பெரிய மரபணுக்களைக் கொண்ட மற்ற நிடோ வைரஸ்களைப் போலவே-ஒரு பெரிய மரபணுவைப் பிரதிபலிக்க போதுமான பிரதி நம்பகத்தன்மைக்கு அவசியமான ஒரு ப்ரூஃப் ரீடிங் எக்ஸோரிபோநியூக்ளீஸ் (எக்ஸோஎன்). இருப்பினும், எக்ஸோஎன் அமைப்பு மற்றும் செயலில் உள்ள தள எச்சங்கள் மற்ற நிடோவைரல் எடுத்துக்காட்டுகளிலிருந்து வேறுபடுகின்றன, மேலும் 3சிஎல் போன்ற புரோட்டீஸ் மற்ற நிடோவைரஸ்களின் வழக்கமான சிஸ்டைன் நியூக்ளியோஃபைலுக்கு மாறாக, ஒரு செரின்-ஹிஸ்டிடின்-அஸ்பார்டேட் வினையூக்கி முக்கோணத்தைப் பயன்படுத்துவதாகத் தெரிகிறது. அறியப்பட்ட நிடோ வைரஸ்களில் தனித்துவமானது, பி. எஸ். சி. என். வி பல அடையாளம் காணக்கூடிய புரத களங்களையும் குறியாக்கம் செய்கிறது, இது புரவலனிடமிருந்து பெறப்பட்டிருக்கலாம். பி. எஸ். சி. என். வி ரிபோநியூக்ளியேஸ் டி 2, இரண்டு ஃபைப்ரொனெக்டின் வகை II களங்கள் மற்றும் மூன்று ஆன்கிரின் மீள்நிகழ்வுகளை குறியாக்கம் செய்கிறது. புரவலன் பி. எஸ். சி. என். வி பாலியல் ரீதியாக இனப்பெருக்கம் மற்றும் பாலியல் விகாரங்கள் உட்பட ஷ்மிடியா மெடிடெரேனியா இனத்தின் பிளேனேரியன்களின் சுரக்கும் உயிரணுக்களைப் பாதிக்க சோதனை ரீதியாகக் காட்டப்பட்டுள்ளது. இந்த உயிரினங்களின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்களை ஒரு கரோனாவைரஸ் மரபணுவைப் போன்ற காட்சிகளுக்காகத் தேடுவதன் மூலம் இது கண்டுபிடிக்கப்பட்டது. இது போன்ற பல டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் தரவுத்தொகுப்புகளில் இது இருப்பதாகத் தோன்றுகிறது, இது ஆய்வக எஸ். மெடிடெரேனியாவின் தொற்று பொதுவானது, குறிப்பாக பாலியல் விகாரங்களில். வகைப்பாடு பி. எஸ். சி. என். வி மரபணு அனைத்து நிடோ வைரஸ்களிலும் பாதுகாக்கப்பட்ட ஐந்து தனித்துவமான புரத களங்களைக் கொண்டுள்ளது. அதன் மரபணுவின் பைலோஜெனெடிக் பகுப்பாய்வின் அடிப்படையில், இது முதுகெலும்பற்ற புரவலன்களைப் பாதிக்கும் பிற நிடோ வைரஸ்களுடன் தொகுகிறது. பி. எஸ். சி. என். வி என்பது டுமேடிவைரஸ் துணை இனத்தின் ஒரே உறுப்பினர், இது அல்பமோனோனிவைரஸ் இனத்தின் ஒரே உறுப்பினர் ஆகும். ஆர்என்ஏ-சார்ந்த ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் (ஆர். டி. ஆர். பி) வரிசைகளின் அடிப்படையில் ஆர்என்ஏ வைரஸ் மரபணுக்களின் பெரிய குழுக்களின் மேலும் பகுப்பாய்வுகள் நிடோ வைரஸ்களை "பிகோர்னாவைரஸ் சூப்பர் குரூப்" என்று அழைக்கப்படுகின்றன, இது மிகப் பெரிய அளவிலான மரபணு அளவுகளில் பரவியுள்ள வைரஸ்களின் மிகவும் மாறுபட்ட குழுவாகும்-பி. எஸ். சி. என். வி, மிகப்பெரிய ஆர்என்ஏ வைரஸ், சிறிய ஆர்என்ஏ வைரஸ்களில் சோபெமோவைரஸ்கள் வரை-மற்றும் ஆர். டி. ஆர். பி தவிர வேறு பொதுவான மரபணுக்களைப் பகிர்ந்து கொள்ளவில்லை. குறிப்புகள் நிடோவிரேல்ஸ் அகச்சிவப்பு வைரஸ் வகை