ZNF548
துத்தநாக விரல் புரதம் 548 (ZNF548) என்பது குரோமோசோம் 19 இல் அமைந்துள்ள ZNF548 மரபணுவால் குறியிடப்பட்ட ஒரு மனித புரதமாகும். இது அணுக்கருவில் காணப்படுகிறது மற்றும் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II மூலம் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனை ஒழுங்குபடுத்துவதில் பங்கு வகிக்கிறது என்று கருதப்படுகிறது. இது க்ரூப்பல் C2H2-வகை துத்தநாகம்-விரல் புரதக் குடும்பத்தைச் சேர்ந்தது, ஏனெனில் இதில் பல துத்தநாகம்-விரல் மீள்நிகழ்வுகள் உள்ளன. இந்த புரதக் குறியீட்டு மரபணு 4987 பிபி நீளம் கொண்டது மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மாறுபாடு 1 ஐ குறியாக்கம் செய்கிறது, இது மிக நீளமான ZNF548 ஐசோஃபார்ம் ஆகும். இது குரோமோசோம் 19 இல் காணப்படுகிறது; பிளஸ் ஸ்ட்ராண்டில் அதன் சரியான நிலை 19q13.43 ஆகும். இந்த மரபணுவில் 4 எக்ஸான்கள் உள்ளன, அவை ஒரு க்ரூபெல் தொடர்புடைய பெட்டிக்கு (KRAB களம்) குறியீடு செய்கின்றன மற்றும் 11 துத்தநாக விரல் மீள்நிகழ்வுகள் உள்ளன. ZNF548 மரபணுவின் ஊக்குவிப்பாளர் 1198 காரங்கள் நீளமானது மற்றும் குரோமோசோம் 19 இல் 57388850-57390047 இல் அமைந்துள்ளது. ஊக்குவிக்கும் பகுதி 6 ஆர்த்தோலாக்களில் பாதுகாக்கப்படுகிறதுஃ ரீசஸ் மக்காக் (ரீசஸ் குரங்கு), பான் ட்ரொக்ளோடைட்ஸ் (சிம்பன்சி), ஒரிக்டோலகஸ் கியூனிகுலஸ் (ஐரோப்பிய முயல்), ஈக்வஸ் கபல்லஸ் (குதிரை), கேனிஸ் லூபஸ் ஃபேமிலாரிஸ் (நாய்) மற்றும் சுஸ் ஸ்க்ரோபா (பன்றி). டிரான்ஸ்கிரிப்ட் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மாறுபாடு 1 மிக நீளமான டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மற்றும் 545 அமினோ அமிலங்கள் நீளமுள்ள மிக நீளமான புரத ஐசோஃபார்ம் (ZNF548 ஐசோஃபார்ம் 1) ஐ குறியாக்கம் செய்கிறது. டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மாறுபாடு 2 இல் எக்ஸான் 2 இல்லை மற்றும் 533 அமினோ அமிலங்கள் நீளமுள்ள ZNF548 ஐசோஃபார்ம் 2 ஐ குறியாக்கம் செய்கிறது. புரதம் ZNF548 க்ரூப்பல் C2H2-வகை துத்தநாக விரல் புரதக் குடும்பத்தைச் சேர்ந்தது, ஏனெனில் இதில் 11 Cys2His2-வகை துத்தநாக விரல் மீள்நிகழ்வுகள் உள்ளன. ஒவ்வொரு துத்தநாக விரலும் ஒரு பாதுகாக்கப்பட்ட ββα கட்டமைப்பைக் கொண்டுள்ளது, அங்கு ஒரு துத்தநாக அணு C2H2 எச்சங்களால் சரி செய்யப்படுகிறது. ZNF548 அதன் C2H2 Zn மையக்கருத்துக்கள் மூலம் 44 பிபி நீண்ட வரிசையில் டிஎன்ஏவுடன் இணைக்க முடியும், ஒவ்வொன்றும் 4 டிஎன்ஏ தளங்களுடன் பிணைக்கப்படுகின்றன. புரதத்தில் ஒரு க்ரூபெல்-தொடர்புடைய பெட்டி (KRAB) உள்ளது, இது N முனையத்தில் காணப்படும் ஒரு களமாகும் மற்றும் பல சார்ஜ் செய்யப்பட்ட அமினோ அமிலங்களைக் கொண்டுள்ளது. இந்த களம் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனில் ஒரு பங்கைக் கொண்டுள்ளது; இது கேஏபி-1/டிஐஎஃப்-1 பீட்டா கோ-ரெப்ரெசரின் ரிங்-பி பாக்ஸ்-சுருள் சுருள் (ஆர்பிசிசி) களத்துடன் பிணைக்கிறது. ZNF548 இன் மூன்றாம் நிலை அமைப்பு I-Tasser ஐப் பயன்படுத்தி கணிக்கப்பட்டது. ZNF548 இன் மூலக்கூறு எடை 64 kDa ஆகவும், கணிக்கப்பட்ட ஐசோ எலக்ட்ரிக் புள்ளி 8,21 ஆகவும் உள்ளது. ZNF548 இன் கலவை பகுப்பாய்வு அலனைன் எதிர்பார்த்ததை விட குறைந்த சதவீதத்தில் கண்டறியப்பட்டது, அதே நேரத்தில் ஹிஸ்டிடின் மனித ZNF548 இல் எதிர்பார்த்ததை விட மிக அதிக சதவீதத்தில் கண்டறியப்பட்டது. சப் செல்லுலார் வெளிப்பாடு புரதம் அணுக்கருவில் காணப்படுகிறது மற்றும் சைட்டோபிளாஸம் அல்லது மைட்டோகாண்ட்ரியாவிலும் கண்டறியப்படலாம். திசு வெளிப்பாடு ZNF548 மனிதர்களில் வெளிப்பாடு மற்ற புரதங்களுடன் ஒப்பிடும்போது ஒப்பீட்டளவில் குறைவாக உள்ளது. இது குறைந்த திசு தனித்துவத்தைக் கொண்டுள்ளது; இது அனைத்து மனித திசுக்களிலும் வெளிப்படுத்தப்பட்டு கண்டறியப்படுகிறது. மனித ZNF548 புரதத்தின் மற்ற புரதங்களுடனான தொடர்புகள் நியூக்ளியர் டிஸ்ட்ரிபியூஷன் புரதமான நுட்இ-லைக் 1 (NDEL1) மற்றும் டிஸ்ரப்டட் இன் ஸ்கிசோஃப்ரினியா 1 (DISC1) புரதங்களுடன் மனித ZNF548 புரதத்தின் தொடர்புகள் இரண்டு கலப்பின துண்டு தொகுப்பு அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி சோதனை ரீதியாக சரிபார்க்கப்பட்டுள்ளன. 36 (எல். ஆர். ஆர். சி. 36), மையோடுபுலரின் 1 (எம். டி. எம். 1), மையோடுபுலரின் தொடர்பான புரதம் 4 (எம். டி. எம். ஆர். 4) மற்றும் ஆர். என். ஏ பிணைப்பு மையக்கருத்து புரதம் 39 (ஆர். பி. எம். 39) ஆகியவற்றைக் கொண்ட லியூசின் ரிச் ரிபீட், அஃபினிட்டி கேப்சர்-மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி மூலம் இசட். என். எஃப். 548 புரதத்துடன் தொடர்பு கொள்வதும் கண்டறியப்பட்டுள்ளது. நியூக்ளிக் அமிலங்கள் மற்றும் துத்தநாக அயனிகளுடன் பிணைக்க முடியும் என்பதால் செயல்பாடு ZNF548 மரபணு வெளிப்பாட்டுடன் தொடர்புடையது. மற்ற KRAB-ZNF புரதங்களின் செயல்பாட்டின் அடிப்படையில், RNA பாலிமரேஸ் II ஆல் படியெடுத்த புரத-குறியீட்டு மரபணுக்களின் படியெடுத்தலை ஒழுங்குபடுத்துவதில் இது ஒரு பங்கைக் கொண்டுள்ளது என்று கருதப்படுகிறது. குறிப்பாக இது டிஎன்ஏ-பிணைப்பு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணியாகும், இது ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II ஆல் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் செய்யப்பட்ட சில மரபணுக்களின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனை மேம்படுத்துகிறது அல்லது தடுக்கிறது. இது அதன் துத்தநாக விரல்கள் வழியாக டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் தொடக்க தளத்தின் அதே இழையில் (சிஸ்) இருக்கும் ஒரு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி அங்கீகார வரிசையுடன் பிணைக்கும் திறனைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் நியூக்ளியோபிளாஸத்தில் உள்ள கேஆர்ஏபி-இசட்என்எஃப்/கேஏபி வளாகத்தின் ஒரு பகுதியாக மாறும். KRAB-ZNF புரதங்கள் ஒடுக்கிகளாக அறியப்படுகின்றன. எனவே, ZNF548 போன்ற ஒரு KRAB-ZNF புரதம் டிஎன்ஏவுடன் பிணைக்கப்பட்டு, ஒரே நேரத்தில் அதன் KRAB களத்தின் மூலம் கேஏபி1 இணை-ஒடுக்கியுடன் பிணைக்கப்படும்போது, ஹிஸ்டோன் டீஅசிட்டிலேஸ்கள், ஹிஸ்டோன் மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ்கள் மற்றும் ஹெட்டோரோக்ரோமாட்டின் புரதங்கள் போன்ற பல்வேறு என்சைம்கள் குரோமாட்டின் கட்டமைப்பை சுருக்கவும், அதன் விளைவாக டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனைத் தடுக்கவும் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. ZNF548 புரதத்தின் ஆர்த்தலாக்ஸ் பாலூட்டிகளின் வெவ்வேறு வரிசைகளில் மட்டுமே பாதுகாக்கப்படுவது கண்டறியப்பட்டுள்ளது. பாலூட்டி டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகளில் C2H2 போன்ற மடிப்பு குழுக்கள் மிகவும் பொதுவானவை என்ற உண்மையுடன் இது ஒத்துப்போகிறது. KRAB களம் மற்றும் துத்தநாக விரல் மீள்நிகழ்வுகள் ஆர்த்தோலாக்களில் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்டுள்ளன. பின்வரும் அட்டவணையில் காணப்படுவது போல் ZNF548 மாதிரிகள் மனிதனில் 25 ஒத்த புரதங்களைக் கொண்டுள்ளன. மருத்துவ முக்கியத்துவம் ZNF548 மெட்டா-வைரஸ் கையொப்பத்தில் (MVS) ஒரு மரபணுவாக அடையாளம் காணப்பட்டது, இது வைரஸ் நோய்த்தொற்றுகள் உள்ள நபர்களை பாக்டீரியா நோய்த்தொற்றுகள் உள்ளவர்களிடமிருந்தும் ஆரோக்கியமான நபர்களிடமிருந்தும் வேறுபடுத்த பயன்படுத்தப்படலாம். ZNF548 மைக்ரோஆர்என்ஏ வெளிப்பாடு கருப்பை புற்றுநோயைக் கண்டறிய ஒரு குறிப்பானாக செயல்பட முடியும். ZNF548 இரத்த மரபணு வெளிப்பாடு பயோமார்க்கர் தற்கொலைக்கான ஒரு குறிப்பானாக பயன்படுத்தப்படலாம். மனித குரோமோசோம் 19 துத்தநாக விரல் புரதங்களில் மனித புரதங்களின் மரபணுக்கள் பற்றிய குறிப்புகள்