BEAST 2
ಬೀಸ್ಟ್ 2 ಎಂಬುದು ಆಣ್ವಿಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಬಯೇಸಿಯನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಕ್ರಾಸ್-ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಪರ್ಯಾಯ ಮತ್ತು ಗಡಿಯಾರ ಮಾದರಿಗಳ ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಬೇರೂರಿರುವ, ಸಮಯದ ಫೈಲೋಜೆನಿಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ಮರಗಳ ಪ್ರಿಯರ್ಗಳನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲು (ಇವುಗಳನ್ನು ಎಕ್ಸ್ಎಂಎಲ್ ಬಳಸಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ) ಬಿಇಎಯುಟಿಐ ಎಂಬ ಸಂಬಂಧಿತ ಸಾಧನವಿದೆ. ಬೀಸ್ಟ್ 2 ಹಿಂದಿನ (ಇನ್ನೂ ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾದ) ಬೀಸ್ಟ್ ಕಾರ್ಯಕ್ರಮದ ಸಂಪೂರ್ಣ ಮರು-ಬರವಣಿಗೆಯಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಕೆಲಸದ ಮೇಲೆ ಸೆಳೆಯುತ್ತದೆ. ಹೊಸ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಅನುಷ್ಠಾನಗೊಳಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಸರಳಗೊಳಿಸಿದ ಪ್ಯಾಕೇಜಿಂಗ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಬೀಸ್ಟ್ 2ರ ಒಂದು ಗಮನಾರ್ಹ ಲಕ್ಷಣವಾಗಿದೆ. ಬೀಸ್ಟ್ ಅನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುವುದು ಸಮುದಾಯ ಚಾಲಿತ ಸಂಪನ್ಮೂಲವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಬೀಸ್ಟ್ 2 ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ನ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಕಲಿಸುತ್ತದೆ. ಬಿಯೌಟಿ ಬಿಯೌಟಿ ಎಂದರೆ "ಬಯೇಸಿಯನ್ ಎವಲ್ಯೂಷನರಿ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಯುಟಿಲಿಟಿ". ಇದು ಗ್ರಾಫಿಕ್ ಯೂಸರ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ (ಜಿ. ಯು. ಐ) ಆಗಿದ್ದು, ಇದನ್ನು ಬೀಸ್ಟ್ 2 ಗಾಗಿ ಇನ್ಪುಟ್ ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಡೇಟಾ ಫೈಲ್, ಆಣ್ವಿಕ ವಿಕಾಸದ ಮಾದರಿ ಮತ್ತು ಮಾದರಿ ನಿಯತಾಂಕಗಳ ಪೂರ್ವ ವಿತರಣೆಗಳಂತಹ ತಮ್ಮ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ವಿವಿಧ ಆಯ್ಕೆಗಳು ಮತ್ತು ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್ಗಳನ್ನು ಸುಲಭವಾಗಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸಲು ಇದು ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಸರಪಳಿಯ ಉದ್ದ ಮತ್ತು ಮಾದರಿ ಆವರ್ತನದಂತಹ ಎಂಸಿಎಂಸಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟಪಡಿಸಲು ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಬಿಇಎಯುಟಿಐ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಇದು ಬೀಸ್ಟ್ 2 ಅನ್ನು ಚಲಾಯಿಸಲು ಬಳಕೆದಾರ ಸ್ನೇಹಿ ಮಾರ್ಗವನ್ನಾಗಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಬಳಕೆದಾರರು XML ಇನ್ಪುಟ್ ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಹಸ್ತಚಾಲಿತವಾಗಿ ಸಂಪಾದಿಸುವ ಅಗತ್ಯವನ್ನು ನಿವಾರಿಸುತ್ತದೆ. ಆಣ್ವಿಕ ವಿಕಾಸದ ಮಾದರಿಗಳು ಅಥವಾ ಒಗ್ಗೂಡಿಸುವ ಮಾದರಿಗಳಂತಹ ವಿವಿಧ ಪ್ಯಾಕೇಜುಗಳನ್ನು ಸುಲಭವಾಗಿ ಸ್ಥಾಪಿಸಲು ಮತ್ತು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಬ್ಯುಟೀ ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ಯಾಕೇಜುಗಳನ್ನು ನೇರವಾಗಿ ಬಿ. ಇ. ಎ. ಯು. ಟಿ ಯಿಂದ ಸ್ಥಾಪಿಸಬಹುದು. ಇದು ಪ್ಯಾಕೇಜುಗಳನ್ನು ಕೈಯಿಂದ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ ಸ್ಥಾಪಿಸುವ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲದೇ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಹೊಸ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದನ್ನು ಸುಲಭಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಸಿಬಿಎಎನ್ ಸಮಗ್ರ ಬೀಸ್ಟ್ ಆರ್ಕೈವ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ (ಸಿಬಿಎಎನ್) ಬೀಸ್ಟ್ 2 ಪ್ಯಾಕೇಜ್ಗಳ ಅಧಿಕೃತ ಭಂಡಾರವಾಗಿದೆ. ಸಿ. ಬಿ. ಎ. ಎನ್. ನಲ್ಲಿರುವ ಪ್ಯಾಕೇಜುಗಳನ್ನು ಬಾಕ್ಸ್ನ ಹೊರಗೆ ಬಿ. ಇ. ಎ. ಯು. ಟಿ. ಐ ಮೂಲಕ ಅಳವಡಿಸಬಹುದು. ಲಿಂಗ್ವಾಫೈಲೋ ಎ ಸಂಬಂಧಿತ ಯೋಜನೆಯು ಲಿಂಗ್ವಾಫೈಲೋ (ಎಲ್ಪಿಐ) ಆಗಿದೆ. ಎಲ್ಪಿಐ ಎಂಬುದು ಓಪನ್ ಬಗ್ಸ್ನಂತೆಯೇ ವಾಕ್ಯರಚನೆಯೊಂದಿಗೆ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುವ ಸಂಭವನೀಯ ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಭಾಷೆಯಾಗಿದೆ. ಇದು ಕೈಯಿಂದ ಎಕ್ಸ್ಎಂಎಲ್ ಅನ್ನು ಬರೆಯುವ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲದೇ ಬೀಸ್ಟ್ 2 ಎಕ್ಸ್ಎಂಎಲ್ ಕಡತಗಳನ್ನು (ಮತ್ತು ಇತರ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಪ್ಯಾಕೇಜ್ಗಳಿಗೆ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಮಾದರಿ ವಿಶೇಷಣಗಳು) ಉತ್ಪಾದಿಸುವ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್