H3S28P
H3S28P ಯು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ಯಾಕೇಜಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ H3 ಗೆ ಒಂದು ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಪಾಡಾಗಿದೆ. ಇದು ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಎಚ್3 ಪ್ರೋಟೀನ್ನ 28ನೇ ಸೆರಿನ್ ಶೇಷವಾದ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ಸೂಚಿಸುವ ಗುರುತು. H3S10 ಮತ್ತು H3S28 ಗಾಗಿ ಆರಂಭಿಕ ಮಿಟೋಸಿಸ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಮಾದರಿಗಳು ಸಾಕಷ್ಟು ಹೋಲುತ್ತವೆ, ಇದು ಪ್ರೋಫೇಸ್ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮಲ್ ಸಾಂದ್ರೀಕರಣದ ಪ್ರಾರಂಭದಿಂದ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ. H3S28ನ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಇತರ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳನ್ನು ಅಸಿಟೈಲೇಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ನಾಮಕರಣ ಈ ಬದಲಾವಣೆಯ ಹೆಸರು ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಎಚ್3 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉಪಘಟಕದಲ್ಲಿ ಸೆರಿನ್ 28ನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆಃ ಸೆರಿನ್/ಥ್ರೆಯೊನಿನ್/ಟೈರೋಸಿನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಋಣಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಗುಂಪಿನ ಸೇರ್ಪಡೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ನ ಉತ್ತಮ ಪಾತ್ರಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಯಾವ ರಚನಾತ್ಮಕ ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡಾಗಿ ಸ್ಪಷ್ಟ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಮಾರ್ಪಾಡಿನ ಪರಿಣಾಮ ಗಣನೀಯ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಅವಶೇಷಗಳು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ. ಕುತೂಹಲಕಾರಿಯಾಗಿ, ಇವು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಪ್ರಸರಣಶೀಲ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ನಿಯಂತ್ರಣಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ. ಎಚ್3ಯ ಸೆರಿನ್ 10 ಮತ್ತು 28 ಮತ್ತು ಎಚ್2ಬಿಯ ಸೆರಿನ್ 32ರ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಎಪಿಡರ್ಮಲ್ ಗ್ರೋತ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ (ಇಜಿಎಫ್)-ರೆಸ್ಪಾನ್ಸಿವ್ ಜೀನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ನ ನಿಯಂತ್ರಣದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ಇದು ಸಂಭವಿಸುವ ಪರಿಸರವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ, ಅದೇ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಅವಶೇಷವು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆಯ ಮೇಲೆ ತೀವ್ರವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನ ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ಬೀರಬಹುದು. H3S10 ಮತ್ತು H3S28 ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಈ ದ್ವಂದ್ವತೆಯ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಉದಾಹರಣೆಯಾಗಿದೆಃ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಅವಶೇಷಗಳೆರಡೂ ಮೈಟೋಸಿಸ್ ಮತ್ತು ಅರೆವಿದಳನದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸಂಕೋಚನದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ, ಜೊತೆಗೆ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯ ನಂತರ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ವಿಶ್ರಾಂತಿ. ಈ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಘಟನೆಗಳು ವಹಿಸುವ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪಾತ್ರಗಳಿಂದಾಗಿ, ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಅವಶೇಷ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಜೀವಕೋಶದ ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ಇತರ ಸಿಸ್ ಅಥವಾ ಟ್ರಾನ್ಸ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯಿಂದ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪರಿಣಾಮ H3S10 ಮತ್ತು H3S28 ಗಾಗಿ ಆರಂಭಿಕ ಮಿಟೋಸಿಸ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಮಾದರಿಗಳು ಸಾಕಷ್ಟು ಹೋಲುತ್ತವೆ, ಇದು ಪ್ರೋಫೇಸ್ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ವರ್ಣತಂತು ಸಾಂದ್ರೀಕರಣದ ಪ್ರಾರಂಭದಿಂದ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀನ್ ಪ್ರವರ್ತಕರಲ್ಲಿ, H3S28 ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ನಿಂದ ಪಾಲಿಕೊಂಬ್ ನಿರ್ಬಂಧಿತ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುವ ನಿರೀಕ್ಷೆಯಿದೆ, ಇದು ಹತ್ತಿರದ K27 ಅವಶೇಷಗಳ ಡಿಮೀಥೈಲೇಷನ್ ಮತ್ತು ಅಸಿಟೈಲೇಷನ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪರಿವರ್ತನೆಯು H3K27ರ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿರುವ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ H3S28ನ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಮೂಲಕ ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಸಿ-ಫಾಸ್ ಮತ್ತು-ಗ್ಲೋಬಿನ್ನಂತಹ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಪ್ರವರ್ತಕರಲ್ಲಿ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟಿಂಗ್ ಎಚ್3ಎಸ್28 ಅವುಗಳ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಅಸಿಟೈಲೇಷನ್ ಪರಿಣಾಮಗಳು H3K27ac ಜೊತೆಗೆ, H3S28p ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ. H3S28p H3K27me3 ಶೇಖರಣೆಯಾಗುವುದನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ, ಇದು H3K27 ಅಸಿಟೈಲೇಷನ್ ಸಂಭವಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಅಂತೆಯೇ, H3S28ನ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ K9 ಅಸಿಟೈಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. UVB ವಿಕಿರಣ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟ್ಗಳು H3S10 ಮತ್ತು H3S28 ಅನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸಲು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕೈನೇಸ್ಗಳು, ಆದರೆ H3S28 ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ ಕೈನೇಸ್ಗಳಾದ MSK1, ERK1, p38, FYN, MLTK, ERK2, ಮತ್ತು ಸ್ವಲ್ಪ ಮಟ್ಟಿಗೆ JNK1 ಮತ್ತು JNK2 ನಿಂದ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಕೋಶಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್ಎ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ವಿಶೇಷ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣುಗಳ ಸುತ್ತಲೂ ಸುತ್ತುತ್ತದೆ. ಡಿಎನ್ಎಯ ಲೂಪಿಂಗ್ನಿಂದ ರೂಪುಗೊಂಡ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ನಂತಹ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವ ಮೂಲಕ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆಃ ಡಿಎನ್ಎ ಅಥವಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ಃ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಭಾಷಾಂತರದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸುತ್ತವೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಹಾನಿಗೆ ಜೀವಕೋಶದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಂತ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ, ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಎಚ್ 2 ಎ ಡಿಎನ್ಎ ಒಡೆಯುವ ಸ್ಥಳದ ಸುತ್ತ ದೊಡ್ಡ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ನಿರ್ದೇಶಿತ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಮೇಲೆ ನೇರವಾಗಿ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆಯೇ ಎಂದು ಸಂಶೋಧಕರು ತನಿಖೆ ನಡೆಸಿದರು. ಸಂಶೋಧಕರು ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಮೇಲೆ ಅವುಗಳ ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡುತ್ತಾರೆ ಮತ್ತು ಒತ್ತಡ-ಪ್ರೇರಿತ ಕೈನೇಸ್, ಎಂಎಸ್ಕೆ1, ಆರ್ಎನ್ಎ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದಾರೆ. ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ನಲ್ಲಿರುವಾಗ ಎಂ. ಎಸ್. ಕೆ. 1 ನಿಂದ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಪ್ರತಿಬಂಧವು ಅತ್ಯಂತ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿತ್ತು, ಏಕೆಂದರೆ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ನಲ್ಲಿಲ್ಲದ ಡಿ. ಎನ್. ಎ ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ಗಳು ಎಂ. ಎಸ್. ಕೆ. 1 ರ ಪರಿಣಾಮಗಳಿಗೆ ನಿರೋಧಕವಾಗಿದ್ದವು. ಸೆರಿನ್ 1ರ ಮೇಲೆ ಎಂ. ಎಸ್. ಕೆ. 1 ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಎಚ್2ಎ ಮತ್ತು ಸೆರಿನ್ 1ನಿಂದ ಅಲನೈನ್ಗೆ ರೂಪಾಂತರಗೊಳ್ಳುವುದು ಎಂ. ಎಸ್. ಕೆ. 1ರ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಪ್ರತಿಬಂಧವನ್ನು ನಿರ್ಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹೀಗಾಗಿ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳ ಅಸಿಟೈಲೇಷನ್ ಎಂ. ಎಸ್. ಕೆ. 1 ಎಂದು ಕೈನೇಸ್ನಿಂದ ಪ್ರತಿಬಂಧಕ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ಸೂಚಿಸಿವೆ. ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ವಿಧಾನ ಮತ್ತು ಮಾರ್ಪಾಡಿನ ಕಾರ್ಯವು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಯಲ್ಲಿ ಚಾರ್ಜ್ ಮಾಡಲಾದ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಗುಂಪನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸುತ್ತದೆ, ಬಹುಶಃ ಹತ್ತಿರದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ರಚನೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ಪಿ53 ನಂತಹ ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅನೇಕ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಸಂಕೀರ್ಣ, ಬಹು-ಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಸುಲಭವಾಗಿ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಮತ್ತು ಡಿಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಮಾಡಬಹುದಾದ್ದರಿಂದ, ಈ ರೀತಿಯ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಸಂಕೇತಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಲು ಜೀವಕೋಶಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಕೈನಾಸ್ಗಳು ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಫಾಸ್ಫೇಟೇಸ್ಗಳು ಡಿಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು. ಅನೇಕ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮತ್ತು ಗ್ರಾಹಕಗಳನ್ನು ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಮತ್ತು ಡಿಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಮೂಲಕ "ಆನ್" ಅಥವಾ "ಆಫ್" ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ರಿವರ್ಸಿಬಲ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅನೇಕ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮತ್ತು ಗ್ರಾಹಕಗಳಲ್ಲಿನ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಅವುಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ಅಥವಾ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಸೆರಿನ್, ಥ್ರೆಯೊನಿನ್, ಟೈರೋಸಿನ್ ಮತ್ತು ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ಅವಶೇಷಗಳ ಮೇಲೆ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಟೈರೋಸಿನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಸೆರಿನ್, ಥ್ರೆಯೊನಿನ್, ಟೈರೋಸಿನ್, ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ಅಥವಾ ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಅಥವಾ ಲೈಸಿನ್ ಅವಶೇಷಗಳ ಮೇಲೆ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷದ ಧ್ರುವೀಯವಲ್ಲದ ಆರ್ ಗುಂಪಿಗೆ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ (ಪಿಒ43-) ಅಣುವನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದರಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಭಾಗವನ್ನು ಅಣುವಿನ ಧ್ರುವೀಯ ಮತ್ತು ಅತ್ಯಂತ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಭಾಗವಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು. ಈ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿನ ಇತರ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಅವಶೇಷಗಳೊಂದಿಗೆ ದೀರ್ಘ-ಶ್ರೇಣಿಯ ಅಲೋಸ್ಟರಿ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ. ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಪರಿಣಾಮಗಳು ಹಿಸ್ಟೋನ್-ಮಾರ್ಪಡಿಸುವ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳು ಅಥವಾ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಮರುರೂಪಿಸುವ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳಿಂದ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಬಾಲಗಳ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಜೀವಕೋಶವು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣ, ಸಂಯೋಜಿತ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಉತ್ಪಾದನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಸಂಕೇತವು ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರದೇಶದ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಕೀರ್ಣ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿರ್ದೇಶಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳ ಪ್ರಸ್ತುತ ತಿಳುವಳಿಕೆ ಮತ್ತು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವು ಎರಡು ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಯೋಜನೆಗಳಿಂದ ಬರುತ್ತದೆಃ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮತ್ತು ಎಪಿಜೆನೊಮಿಕ್ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿ. ಎಪಿಜೆನೊಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನದ ಉದ್ದೇಶವು ಇಡೀ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡುವುದು. ಇದು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸ್ಥಿತಿಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಯಿತು, ಇದು ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು/ಅಥವಾ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವ ಮೂಲಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುತ್ತದೆ. ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಬಂಧಿಸುವ ಸ್ಥಳವನ್ನು ನೋಡುವ ಮೂಲಕ ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಚಿಐಪಿ-ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ನ ಬಳಕೆಯು ವಿಭಿನ್ನ ಬ್ಯಾಂಡಿಂಗ್ನಿಂದ ನಿರೂಪಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು. ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾದಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಹಂತಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡು ಪ್ರಸ್ತುತತೆಗೆ ಒತ್ತು ನೀಡಲಾಗಿದೆ. ಪಡೆದ ದತ್ತಾಂಶದ ಪರಿಶೀಲನೆಯು ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸ್ಥಿತಿಗಳ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಯಿತು. ಕೆಲವು ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ನಕ್ಷೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಪುಷ್ಟೀಕರಣವು ಸ್ಥಳೀಯವಾಗಿರುವುದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಮಾನವನ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸ್ಥಿತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ಹೊಸ ಮಾರ್ಗಗಳಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಈ ಸ್ವಾತಂತ್ರ್ಯವು ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಸ್ವರೂಪವನ್ನು ಜಾರಿಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ವರ್ಧಕಗಳಂತಹ ಯಾವುದೇ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರದ ನಿಯಂತ್ರಕ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸ್ಥಿತಿಗಳು ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಿವೆ. ಈ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಮಟ್ಟದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ವಿವರಣೆಯು ಜೀವಕೋಶದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವಂಶವಾಹಿ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಬಗ್ಗೆ ಆಳವಾದ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ವಿಧಾನಗಳು ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಗುರುತುಗಳನ್ನು ವಿವಿಧ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಹುದುಃ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ಚಿಐಪಿ-ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್) ಡಿಎನ್ಎ ಪುಷ್ಟೀಕರಣದ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಒಮ್ಮೆ ಉದ್ದೇಶಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗೆ ಬಂಧಿಸಿ ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಟೆಡ್ ಅನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ಇದು ಉತ್ತಮ ಆಪ್ಟಿಮೈಸೇಶನ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಡಿಎನ್ಎ-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಬಂಧವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ವಿವೋದಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶದ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ವಿವಿಧ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳಿಗಾಗಿ ವಿವಿಧ ಡಿಎನ್ಎ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಮತ್ತು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲು ಚಿಪ್-ಸೆಕ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. 2. ಮೈಕ್ರೊಕೊಕಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ಎಮ್ಎನ್ಎಎಸ್-ಸೆಕ್) ಅನ್ನು ಉತ್ತಮ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿರುವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಸೋಮ್ಗಳಿಂದ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಸೋಮ್ ಸ್ಥಾನವನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಮೈಕ್ರೊಕೊಕಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಸ್ ಕಿಣ್ವದ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಉತ್ತಮ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿರುವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಸೋಮ್ಗಳು ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಪುಷ್ಟೀಕರಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದು ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. 3. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಸೋಮ್ ಮುಕ್ತ (ಓಪನ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್) ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ನೋಡಲು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೊಸೇಸ್ ಆಕ್ಸೆಸ್ಸಿಬಲ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ಎಟಿಎಸಿ-ಸೆಕ್) ಗಾಗಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಸೋಮ್ ಸ್ಥಳೀಕರಣವನ್ನು ಹೈಲೈಟ್ ಮಾಡಲು ಹೈಪರ್ಆಕ್ಟಿವ್ ಟಿಎನ್5 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡು