Aminohapot
Aminohapot ovat orgaanisia yhdisteitä, joissa on sekä amino- (-NH) että karboksyyliryhmä (-COOH) liittyneenä samaan molekyyliin. Aminoryhmä on emäksinen ja karboksyyliryhmä hapan. Aminohapot polymeroituvat polypeptideiksi. Polypeptidiketjun pituuden ylittäessä 50 sitä aletaan yleensä kutsua proteiiniksi. Ihmiselle välttämättömiä aminohappoja on 20, joista 11 elimistö osaa itse valmistaa. Loput yhdeksän välttämätöntä aminohappoa on saatava ravinnosta. Soluissa aminohapot valmistetaan entsyymien ohjaamana.
Kymotrypsiini
Kymotrypsiinin alkuperäisessä ei-aktiivisessa kymotrypsinogeenissä on 245 aminohappoa. Siinä on viisi rikkisiltaa, jotka syntyvät 10 rikkipitoisen aminohapon takia. Kun kymotrypsiinia tuotetaan geenistä, sen ensimmäinen vaihe on kymotrypsinogeeni.
Kymotrypsinogeeni muuttuu pii-kymotrypsiiniksi ja lopulta alfa-kymotrypsiiniksi. Tällöin aminohapot 14-15 ja 147-148 katoavat trypsiinin vaikutuksesta ja polypeptidiketjun "itsekatalyysin" ansiosta.
Kymotrypsiinin aktiivinen kohta on asparagiinihappo numero 102, histidiini 57 ja seriini 195, varsinkin seriini 195 ja histidiini 57.