Zodiac Killer
Vuonna 1971 nousi pääepäillyksi Arthur Leigh Allen (syntynyt 1933). Allenin tuttava Don Cheney oli lukenut sanomalehdistä Zodiacin tekemistä murhista ja kertoi San Franciscon poliisille (SFPD) keskustelustaan Allenin kanssa, joka oli käyty uudenvuodenpäivänä 1969. Tällöin Allen oli kertonut suunnittelevansa romaania, jonka päähenkilö tappoi ihmisiä ja pilkkasi poliisia kirjeissä, joissa kuvaili rikostensa yksityiskohtia ja jotka allekirjoitti Zodiacin nimellä. Seuranneissa kuulusteluissa Allen väitti Cheneyn muuntaneen totuutta. SFPD teki joitakin tutkimuksia, mutta ei onnistunut löytämään riittävän raskauttavia todisteita Allenia vastaan. Hänen kantamansa Zodiac-merkkinen rannekello tai sama kengännumero Zodiacin saappaiden jättämien jälkien kanssa eivät riittäneet osoittamaan häntä syylliseksi. Myös Cheneyn esittämä kertomus Allenin kuvailemasta romaanista muuttui lukuisia kertoja ja menetti uskottavuutensa. Cheneyn syytösten takana saattoi olla kosto siitä, että Allen oli vuosia aiemmin kosketellut sopimattomasti hänen nuorta tytärtään.
Arthur Leigh Allen
Helmikuussa 1991 Vallejon poliisi suoritti kotietsinnän Allenin kellariasuntoon, jota myöhemmissä FBI:n kirjoittamissa raporteissa verrattiin pimeään museoon. He löysivät materiaalia, joka kertoi Allenin seksuaalisista taipumuksista. Lisäksi talosta löytyi asekokoelma, johon kuului revolvereita, pistooleja, kiikaritähtäimellä varustettu kivääri ja kaksi haulikkoa, sekä räjähteitä ja tupellinen metsästyspuukko. Löydöt eivät riittäneet pitävästi yhdistämään asunnon omistajaa Zodiacin tekemiin rikoksiin. Luvattomat aseet ja räjähteet antoivat poliisille kuitenkin riittävän syyn pidättää Allenin. Kotietsinnän jälkeisissä kuulusteluissa pidätetty käyttäytyi rauhallisesti. Hän oli yhteistyöhaluinen, mutta kielsi useaan otteeseen olevansa sarjamurhaaja Zodiac. Poliisin painostuksen alla Allen suostui toiseen kertaan valheenpaljastustestiin. Testiä ei kuitenkaan koskaan järjestetty, sillä elokuun lopulla 1992 Allen kuoli sydänkohtaukseen 58-vuotiaana. Diabetes, vaikea munuaissairaus, nopeasti etenevä sokeutuminen ja epäilyjen varjot olivat uuvuttaneet hänet.