Sauli Niinistö
Niinistön ensimmäinen puoliso oli Marja-Leena Niinistö (o.s. Alanko). He menivät naimisiin 1974 ja heillä on kaksi poikaa (Nuutti, s. 1975 ja Matias, s. 1980). Marja-Leena Niinistö kuoli liikenneonnettomuudessa tammikuussa 1995. Niinistö kirjoitti vaimonsa kuoleman jälkeisestä ajasta kirjassaan "Viiden vuoden yksinäisyys".
Lauri Niinistö
Lauri Salomon Niinistö (s. 1. lokakuuta 1941 Helsinki) on suomalainen kemisti ja Teknillisen korkeakoulun epäorgaanisen kemian emeritusprofessori. Hänen puolisonsa on lääketieteen ja kirurgian tohtori, lääkintöneuvos Leena Niinistö (o.s. "Alarmo"). Heidän poikiaan ovat historiantutkija ja perussuomalaisten, sittemmin sinisten kansanedustaja, puolustusministeri Jussi Niinistö ja Vantaan apulaiskaupunginjohtaja, tekniikan tohtori Jaakko Niinistö.