与此同时，地位上升的萨利安人与中世纪教会发生了一场重大冲突，史称 "叙任权斗争（Investiture Controversy）"。
奥托家族，即奥托王朝或撒克逊王朝，一直统治帝国到公元 1024 年。他们将波希米亚公国并入帝国。不久之后，奥托王朝被萨利安王朝取代。萨利安人将中法兰克的另一部分，勃艮第王国纳入神圣罗马帝国。因此将帝国变成了一个由德意志、意大利、波希米亚和勃艮第组成的复合君主制国家。与此同时，地位上升的萨利安人与中世纪教会发生了一场重大冲突，史称 "叙任权斗争（Investiture Controversy）"。11 世纪日益强大的帝国势力提出了一个问题：在拉丁基督教世界中谁是至高无上的统治者：教皇还是皇帝？经过多次争论和流血，最终达成了妥协：1122 年的《沃姆斯协约》限制了皇帝的宗教影响力。然而，神圣罗马帝国的下一个王朝斯陶芬（Staufers）王朝却将皇帝在世俗（非宗教）事务中的权力推到了顶峰。