그러나 회군 요청이 받아들여지지 않자 이성계와 조민수는 1388년 음력 5월 20일 군사를 수도로 돌려 쿠데타를 일으켰다( 위화도 회군).
그 무렵 고려 조정은 철령위 문제로 밖으로는 명나라와, 안으로는 친원파와 친명파가 대립하고 있었다. 그에 따라 고려는 요동 을 정벌하기 위해 최영 을 중심으로 요동 정벌군을 편성하였다. 이때 우군 도통사를 맡았던 이성계는 좌군 도통사 조민수 "조민수 (고려)") 와 상의하여 평양 에 있던 최영에게 회군을 청했다. 그러나 회군 요청이 받아들여지지 않자 이성계와 조민수는 1388년 음력 5월 20일 군사를 수도로 돌려 쿠데타를 일으켰다( 위화도 회군). 이성계는 쿠데타로 정권을 잡아 최영 세력을 숙청하고 우왕 을 폐위한 뒤 창왕 을 왕위에 올렸다. 동시에 정도전 등 신진 사대부들과 손잡고 과전법 과 같은 전제 개혁 등 여러 가지 개혁을 단행하였다.