그러나 니체는 이성을 거부하는 것이 아니라 초월적 형이상학에서의 이성, 실재를 부정하는 독단적이고 협소한 이성, 이성 자신의 내적 규칙에 갇힌 폐쇄적 이성을 거부하는 것이다.
실재의 본질로서 힘에의 의지는 단수이면서 복수이다. 니체의 실재 개념은 전체성과 개별성, 통일성과 다양성을 포괄한다. 니체는 서구의 이성 중심주의에 대항하여 힘에의 의지를 유일한 근원적 실재로 전환한다. 그러나 니체는 이성을 거부하는 것이 아니라 초월적 형이상학에서의 이성, 실재를 부정하는 독단적이고 협소한 이성, 이성 자신의 내적 규칙에 갇힌 폐쇄적 이성을 거부하는 것이다. 니체는 논리주의이든, 반(反)계몽주의나 신비주의이든, 즉 극단적 이성 중심주의이든 극단적인 비이성의 옹호이든, 삶에 반하는 것, 실재에 적대적인 것을 거부한다. 니체의 철학적 작업은 이성에 대한 해체가 아니라, 반대로 오히려 이성의 정당한 위상을 재정립하기 위한 것이다. 니체에게 참된 이성이란 실재를 부정하는 이성이 아니라 실재를 긍정할 수 있는 이성이다. 니체의 이성 비판의 의의는 바로 여기에 있으며, 따라서 그것은 모종의 적극적인 의미를 획득한다. 니체는 이성을 초실재적인 영역에서 실재적 영역으로 가져온다. 이성은 실재 안에서 작동하는 것이며, 이런 의미에서 본능, 육체적 감각, 감정, 의지, 충동, 욕망 등은 이성과 결코 독립적으로 분리된 기제가 아니다. 힘에의 의지가 실재를 긍정하는 의지인가, 실재를 부정하는 의지인가에 따라서 힘에의 의지는 이성이라는 도구를 자신과 타자, 더 나아가 인류의 삶을 고양시키는 고귀한 목적을 위해서도 사용할 수 있고, 반대로 삶을 몰락시키는 부정한 목적을 위해서도 사용할 수 있다.