그러나 1995년 이츠하크 라빈 이스라엘 총리가 자국 극우파에 의해 암살되고, 하마스의 자살폭탄 테러 가 재발하면서 분쟁이 계속됐다.
이스라엘과 이슬람 갈등은 이후 팔레스타인과 이란 쪽으로 기울어졌다. 팔레스타인은 이스라엘이 주변 국가와 전쟁을 치를 때마다 상대편에 가담해 번번이 큰 피해를 입었다. 자치지역 영토도 지속적으로 빼앗겼다. 팔레스타인은 무차별 테러 공격 등으로 저항해왔고, 서로 피해를 주고 받은 끝에 1993년 오슬로 협정으로 이스라엘이 팔레스타인 자치정부를 공식적으로 인정했다. 그러나 1995년 이츠하크 라빈 이스라엘 총리가 자국 극우파에 의해 암살되고, 하마스의 자살폭탄 테러 가 재발하면서 분쟁이 계속됐다. 유엔 팔레스타인난민기구(UNRWA)에 따르면 거듭된 전쟁 과정에서 가자지구와 요르단강 서안, 요르단, 시리아, 레바논 등으로 쫓겨난 팔레스타인 주민은 530만명에 달한다.