Města zřizovala infekční špitály a leprosária a nařizovala v nich izolaci nemocných.
Ve 13. století zasáhly naše území dvě velké epidemie, obě spojené s neúrodou a hladomorem. V té době byla zcela nemožná celoplošná opatření a tak přišla snaha alespoň o zlepšení hygieny a zároveň byly zřizovány útulky pro nemocné. Středověká medicína vycházela z děl a poznatků antických lékařů. Ve 13. století se v Praze objevují první snahy o budoucí vysoké školství. Kolem roku 1350 zahubila epidemie dýmějového moru téměř polovinu obyvatel. V době epidemií se města uzavírala a u příchozích se kontrolovalo místo, odkud přicházejí. Města zřizovala infekční špitály a leprosária a nařizovala v nich izolaci nemocných.