Specialisté v jeho oddělení pracují na výzkumu nových látek pro léčbu virových onemocnění, zejména HIV, ale také virové hepatitidy B a respiračních infekcí.
Ve společnosti Gilead Sciences je v současnosti Tomáš Cihlář viceprezidentem pro virologii a jeho tým čítá více než stovku vědců. Specialisté v jeho oddělení pracují na výzkumu nových látek pro léčbu virových onemocnění, zejména HIV, ale také virové hepatitidy B a respiračních infekcí. Vyvíjejí také další léky na ebolu, MERS, horečku dengue a řadu dalších.