V dalším ročníku ji po podzimu v Lize mistrů opustil trenér Vrba, který přijal nabídku trénovat reprezentaci.
Hned následující rok si Plzeň dokráčela pro první mistrovský titul v historii. Obhájit se jí nepodařilo, ale v sezóně 2012/13 získala druhý triumf. V dalším ročníku ji po podzimu v Lize mistrů opustil trenér Vrba, který přijal nabídku trénovat reprezentaci. Dušan Uhrin mladší však na předchozí práci nenavázal a po krachu v evropských pohárech v následující sezóně byl nahrazen trenérem Koubkem. Ten mužstvo nastartoval a dovedl k třetímu titulu.