Problémy se začaly nabalovat až nakonec byly přeřazeni do třetí nejvyšší soutěže.
Nejvýraznější stopu zanechal klub 1. FK Drnovice, který zanikl v roce 2006. Za úspěchem nejmenší vesnice, která kdy hrála nejvyšší českou soutěž, stál jejich boss Jan Gottvald, který do klubu nasypal obrovské množství peněz a Drnovice si tak dokonce zahráli i Pohár UEFA (dnešní Evropská liga). Sezóna 1999/00 byla jejich nejúspěšnější v historii, jelikož na konci sezóny skončili třetí. Ani v Evropě si nevedli nejhůř – přes FK Budućnost Banovići postoupili, ale stopku jim vystavil TSV 1860 Mnichov, který v odvetě vstřelil jedinou branku. Krach generálního sponzora Chemapol pomohl k tomu, že se Drnovice dostaly do finančních potíží. 9 hráčů z klubů odešlo a sestupu se tak nevyhnuli. Problémy se začaly nabalovat až nakonec byly přeřazeni do třetí nejvyšší soutěže. I když se jim podařilo dva roky na to vrátit zpátky mezi českou smetánku, potíže s penězi přetrvaly, a tak musel 1.FK Drnovice skončit. Tento klub sice zanikl, ale stále existuje klub FKD (Fotbalový klub Drnovice), ten hraje pouze nižší krajské soutěže.