Auf diese Regionen hat es auch das Fingerprinting abgesehen.
Trotz dieser hohen Übereinstimmung, gibt es in jeder DNA einen für das Individuum spezifischen Bereich. Es kann vorkommen, dass drei benachbarte Basen keine Aminosäure codieren. Diese uncodierten Bereiche werden Intronregionen genannt. Auf diese Regionen hat es auch das Fingerprinting abgesehen. Denn was nützt es wenn man den riesigen identischen Bereich der DNA vergleicht ?? Die genaue Funktion dieser Bereich ist bis heute immer noch nicht geklärt.