Junge und von wenigen Individuen gegründete Populationen zeigen im allgemeinen verminderten Polymorphismus (Vielgestaltigkeit), da sie nur einen Teil der Allelvielfalt der Elterngeneration mitnimmt.
Zur Untersuchung werden in der Regel Markerproteine (Enzyme) verwendet, deren Aktivität man durch chromogene (Farbstoff bildende) Substrate visuell verfolgen kann wie z. B. Alkoholdehydrogenase, Adenylatkinase, Asparattransaminase, 6-Phosphatdehydrogenase, Hexokinase, Peptidase, Phosphoglucoseisomerase, Triosephosphatisomerase oder Xanthindehydrogenase. Die Untersuchung von Alloenzymen dient vor allem der populationsgenetischen Forschung an nah verwandten Arten, Unterarten oder Populationsgruppen. Junge und von wenigen Individuen gegründete Populationen zeigen im allgemeinen verminderten Polymorphismus (Vielgestaltigkeit), da sie nur einen Teil der Allelvielfalt der Elterngeneration mitnimmt. Ebenso begrenzten Polymorphismus zeigen Populationen, deren Größe einmal reduziert wurde und dann wieder anstieg. Es dauert oft über 1000 Generationen, bis die Heterozygotie (Mischerbigkeit) wieder ansteigt und den mittleren Wert großer Populationen erreicht (Gründereffekt und Flaschenhalseffekt). Ein solcher Gründereffekt ist z. B. für die in Europa eingebürgerten Waschbären, ein Flaschenhalseffekt für südafrikanische Palmfarne der Gattung Encephalartos nachgewiesen. Aus Alloenzymdaten lassen sich auch evolutionäre oder genetische Distanzen nach einem standardisierten Verfahren abschätzen (standard genetic distance).