Damit sind Alloenzyme ein Spezialfall der sogenannten Isoenzyme, worunter man Enzyme von gleicher oder fast gleicher Substrat- oder Wirkungsspezifität versteht, die jedoch in den Primärstrukturen mehr oder weniger große Unterschiede aufweisen.
Unter Alloenzymen versteht man Enzyme, die von einem Genort (Locus) kodiert werden, für den es mehrere Allele gibt. Damit sind Alloenzyme ein Spezialfall der sogenannten Isoenzyme, worunter man Enzyme von gleicher oder fast gleicher Substrat- oder Wirkungsspezifität versteht, die jedoch in den Primärstrukturen mehr oder weniger große Unterschiede aufweisen.