Um DNA-Sequenzen identifizieren und bewerten zu können, werden Vergleiche mit bekannten Sequenzen des gleichen Typs durchgeführt.
Das durch eine PCR angereicherte Fragment kann nun in einer Sequenzierung eingesetzt werden. Hier wird die Reihenfolge der Nukleotide des Teilstücks entschlüsselt. Das Resultat einer Sequenzierung ist eine digitalisierte Buchstabenabfolge, die DNA-Sequenz, die nun mit Hilfe von Computerprogrammen weiter analysiert werden kann. Um DNA-Sequenzen identifizieren und bewerten zu können, werden Vergleiche mit bekannten Sequenzen des gleichen Typs durchgeführt. Nationale und internationale Datenbanken halten unzählige DNA-Sequenzen sowie wertvolle Zusatzinformationen für die DNA Analyse bereit.