Die Restriktionsenzyme werden die DNA nur teilweise geschnitten haben.
Was in dieser Darstellung ebenfalls zu erkennen ist, ist der Fakt, dass die Banden der jeweils 2.ten Verdächtigenprobe nicht so weit gehen, wie bei den anderen. Hier liegt wahrscheinlich ein Anwendungsfehler vor. Die Restriktionsenzyme werden die DNA nur teilweise geschnitten haben. Dies kann passieren wenn in der Enzymlösung zu wenig Enzyme enthalten waren, die Temperatur zu niedrig war oder das Probengefäß zu zeitig aus dem Heizblock genommen worden ist.